JP2022516207A - マイオスタチンシグナル阻害剤 - Google Patents
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Abstract
Description
[1]野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部もしくは全部をコードする配列の一部が存在しない変異型アクチビン受容体2B型(ACVR2B)mRNAを標的細胞が産生することを可能にすることができる化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[2]野生型ACVR2Bの前記細胞内領域が野生型ACVR2Bのエクソン5~11によってコードされる、[1]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[3]野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部を欠く切断型ACVR2Bタンパク質を標的細胞に産生させることができる、[1]または[2]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[4]切断型ACVR2Bタンパク質が、ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択される少なくとも1つのエクソンによってコードされる細胞内領域の全部または一部を欠いている、[3]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[5]ACVR2Bの細胞内領域の一部をコードするエクソンのスキップを誘導することができるアンチセンスオリゴマーである、[1]~[3]のいずれか一つに記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[6]スキップされる前記エクソンが、ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択される、[5]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[7]10~50個の核酸塩基を含む、[5]または[6]に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[8]ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択されるエクソンの10~50個の連続するヌクレオチドに相補的な配列を含む、[5]~[7]のいずれか一つに記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[9]エクソンが、配列番号1~6からなる群から選択される配列を含む、[5]~[8]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[10]配列番号12~36および43~111からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、[5]~[9]のいずれか一つに記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[11]配列番号12~36および43~111からなる群から選択されるヌクレオチド配列からなる、[5]~[10]のいずれか一つに記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[12]アンチセンスオリゴマーがオリゴヌクレオチドである、[5]~[11]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[13]オリゴヌクレオチドにおける少なくとも1つの糖部分および/または少なくとも1つのリン酸結合部分が修飾されている、[12]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[14]修飾された糖部分が、2’位の-OH基が、OR、R、R’OR、SH、SR、NH2、NHR、NR2、N3、CN、F、Cl、BrおよびI(Rはアルキルまたはアリールを表し、R’はアルキレンを表す)からなる群から選択されるいずれかの基で置換されているリボースである、[13]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[15]修飾されたリン酸結合部分が、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合およびボラノホスフェート結合からなる群から選択される、[13]または[14]に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[16]アンチセンスオリゴマーが少なくとも1つのモルホリノ環を含む、[5]~[11]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[17]モルホリノオリゴマーまたはホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、[16]に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[18]下記の化学式(1)~(3)
[19][1]~[18]のいずれか一つに記載の化合物に細胞浸透性ペプチドが結合されたコンジュゲートである化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
[20][1]~[19]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物を含む医薬組成物。
[21]少なくとも1つの薬学的に許容される担体または添加剤をさらに含む、[20]に記載の医薬組成物。
[22]凍結乾燥されている、[20]または[21]に記載の医薬組成物。
[23]対象における療法に使用するための、[1]~[19]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは[20]~[22]のいずれか一つに記載の医薬組成物。
[24]療法は、対象における筋萎縮性疾患、筋肉消耗性疾患もしくはサルコペニア性疾患の予防または治療である、[23]に記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは[23]に記載の使用のための医薬組成物。
[25]筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、[24]に記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは[24]に記載の使用のための医薬組成物。
[26]対象がヒトである、[23]~[25]のいずれか一つに記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは[23]~[25]のいずれか一つに記載の使用のための医薬組成物。
[27]対象における筋萎縮性疾患、筋消耗性疾患またはサルコペニア性疾患を治療する方法であって、[1]~[19]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物の治療有効量、あるいは[20]~[22]のいずれか一つに記載の医薬組成物の治療有効量を前記対象に投与することを含む方法。
[28]筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、[27]に記載の方法。
[29]対象がヒトである、[27]または[28]に記載の方法。
[30]対象における筋萎縮性疾患、筋消耗性疾患、またはサルコペニア性疾患を予防または治療するための医薬の製造における、[1]~[19]のいずれか一つに記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物の使用。
[31]筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、[30]に記載の使用。
[32]対象がヒトである、[30]または[31]に記載の使用。
[33]野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部または全部をコードする配列の一部が存在しない、変異型アクチビン受容体2B型(ACVR2B)mRNAを発現する遺伝子操作された動物。
本発明は、野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部もしくは全部をコードするmRNA配列の一部が存在しない変異型アクチビン受容体型2B(ACVR2B)mRNAを標的細胞が産生することを可能にすることができる化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物を提供する。
変異型ACVR2B mRNAはまた、細胞を、タンパク質の細胞内領域をコードする1つ以上のACVR2Bエクソンのエクソンスキップを誘導することができるアンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)に接触させることによって細胞内で産生され得る。
温度:25℃~40℃、35℃~38℃、36℃~38℃、または37℃;
pH:pH5~8、pH6~8、pH7~8、またはpH7.4;および
塩濃度:100~200mM、130~170mM、140~160mM、または150mMの塩化ナトリウム濃度。
別の実施形態では、本発明は、機能性ペプチド、例えば細胞浸透性ペプチド(CPP)が本発明のアンチセンスオリゴマーに結合しているコンジュゲートを提供する。公知の機能性ペプチドまたは市販の機能性ペプチドを本発明において使用することができる。本発明で使用することができる機能性ペプチドには、例えば、国際公開第2008/036127号パンフレットに開示されているアルギニンリッチペプチド;または国際公開第2009/005793号パンフレットに開示されている臓器を標的とするペプチド、例えば、RXR、RBRなど;または国際公開第2012/150960号パンフレットに開示されているアミノ酸サブユニットを含むペプチドが含まれる。細胞浸透性ペプチド(CPP)は、哺乳動物細胞の細胞膜を通過することができ、したがって、細胞ドラッグデリバリーを改善することができる10~約30アミノ酸の短いペプチド配列を表す(例えば、Hum Mol Genet. 2011 Aug 15; 20(16): 3151-3160; Pharmacology & Therapeutics 154 (2015) 78-86を参照されたい)。公知のCPPまたは市販のCPPを本発明において使用することができる。本発明において使用することができるCPPは、例えば、Pharmacology & Therapeutics 154 (2015) 78-86の80頁の表1に列挙されたCPPが含まれ、例えば、TAT(48-60)、ペネトラチン、ポリアルギニン、Oct4、WT1-pTj、DPV3、トランスポータン、MAP、VP22、Rep1、KW、KFGF、FGF12、インテフリンβ3ペプチド、C105Y、TP2;特表2017-500856明細書(国際公開第2015/089487号パンフレット)の段落[0085]、表1に列挙されるCPP、例えばDPV10/6、DPV15b、YM-3、Tat、LR11、C45D18、Lyp-1、Lyp-2、BMV GAG、hLF1-22、C45D18、LR20などが挙げられる。CPPは、例えば、Funakoshi,Co.,Ltd.から市販されている。TAT(Funakoshi,Co.,Ltd.)、ペネトラチン(Funakoshi,Co.,Ltd.)などの市販のCPP、または公知のCPP、例えばR8などを本発明において使用することができる。本発明において用いることができる好ましいCPPは、例えば、hLIMK、TAT、ペネトラチン、R8などを含む(国際公開第2016/187425号パンフレット、国際公開第2018/118662号パンフレット、国際公開第2018/118599号パンフレット、国際公開第2018/118627号パンフレット、EBioMedicine 45 (2019) 630-645などを参照されたい)。CPPは、本発明のアンチセンスオリゴマーに直接結合することができ、またはCPPをアンチセンスオリゴマーに結合することができるリンカーを介して結合することができる。公知のリンカーを本発明において使用することができる。このようなリンカーには、例えば、特表2017-500856明細書(国際公開第2015/089487号パンフレット)、国際公開第2015/089487号パンフレット、国際公開第2009/073809号パンフレット、国際公開第2013/075035号パンフレット、国際公開第2015/105083号パンフレット、国際公開第2014/179620号パンフレット、国際公開第2015/006740号パンフレット、国際公開第2017/010575号パンフレットなどに記載されるものが含まれる。本発明において使用することができる好ましいリンカーは、例えば、4-マレイミド酪酸、ジスルフィド結合を介して本発明の機能性ペプチドまたはアンチセンスオリゴマーに結合することができるリンカーなどを含む。本発明のコンジュゲートは、当業者に公知の方法によって調製することができる。
特定のオリゴマーが、ACVR2B遺伝子中のエクソンまたは複数のエクソンのスキッピングをもたらし得るか否かは、ACVR2Bを発現する細胞(例えば、ヒト横紋筋肉腫細胞)に本発明のアンチセンスオリゴマーを導入し、RT-PCRまたはPCR増幅産物に関する配列分析により、ACVR2B発現細胞の総RNAからACVR2Bの細胞内領域をコードするACVR2B mRNAの領域を増幅することによって評価または確認することができる。
スキッピング効率(%)={A/(A+B)}×100
本発明のアンチセンスオリゴマーは、オリゴヌクレオチド、モルホリノオリゴマーまたはペプチド核酸(PNA)オリゴマーであり得、各々は、本発明のアンチセンスオリゴマーの例示的な長さの範囲、または本発明のアンチセンスオリゴマーの例示的な長さである。
R1は、Hまたはアルキルを表し;
R2およびR3は、同一であるかまたは異なることができ、各々が、H、アルキル、シクロアルキルまたはアリールを表し;
Y1は、O、S、CH2またはNR1を表し;
Y2は、O、SまたはNR1を表し;および
Zは、OまたはSを表す)
のいずれかで表される基を表す)
で表される基である、本発明によるアンチセンスオリゴマーである。
モルホリノオリゴマーは、好ましくは、構成単位が以下の式:
PMOの一実施形態として、以下の一般式(I):
で表される化合物(以下、PMO(I)と称する)が、例として与えられ得る。
これは、以下の一般式(II)で表される化合物(以下、化合物(II)と称する)を酸で処理して、以下の一般式(III):
各BPは、独立して、保護され得る核酸塩基を表し;
Tは、トリチル基、モノメトキシトリチル基またはジメトキシトリチル基を表し;
Lは、水素、アシルまたは以下の一般式(IV)で表される基(以下、基(IV)と称する):
これは、以下の一般式(V)で表される化合物をアシル化剤で処理して、以下の一般式(VI):
R4は、ヒドロキシル基、ハロゲン、カルボキシル基またはアミノを表す]
で表される化合物(以下、化合物(VI)と称する)を調製するステップである。
これは、化合物(VI)を、縮合剤などで処理して固体担体と反応させ、化合物(IIa)を調製するステップである。
n’は、1~98を表す(特定の実施形態では、n’は、1~28、1~27、1~26、1~25、または1~24を表す)]
によって表される化合物は、本明細書に開示されるPMOを調製するためのプロセスのステップAおよびBを所望の回数繰り返すことにより化合物(IIa)から開始して調製することができる。
これは、化合物(III)を塩基の存在下でモルホリノモノマー化合物で処理して、以下の一般式(VII):
これは、ステップBで調製された化合物(VII)から保護基を除去するために脱保護剤を使用し、それによって一般式(IX):
これは、ステップCで調製された化合物(IX)を酸で処理してPMO(I)を調製するステップである:
1)P. E. Nielsen, M. Egholm, R. H. Berg, O. Buchardt, Science, 254, 1497 (1991)
2)M. Egholm, O. Buchardt, P. E. Nielsen, R. H. Berg, Jacs., 114, 1895 (1992)
3)K. L. Dueholm, M. Egholm, C. Behrens, L. Christensen, H. F. Hansen, T. Vulpius, K. H. Petersen, R. H. Berg, P. E. Nielsen, O. Buchardt, J. Org. Chem., 59, 5767 (1994)
4)L. Christensen, R. Fitzpatrick, B. Gildea, K. H. Petersen, H. F. Hansen, T. Koch, M. Egholm, O. Buchardt, P. E. Nielsen, J. Coull, R. H. Berg, J. Pept. Sci., 1, 175 (1995)
5)T. Koch, H. F. Hansen, P. Andersen, T. Larsen, H. G. Batz, K. Otteson, H. Orum, J. Pept. Res., 49, 80 (1997)
本発明の化合物(例えば、アンチセンスオリゴマー)の薬学的に許容される塩の例としては、アルカリ金属塩(例えば、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩);アルカリ土類金属塩(例えば、カルシウム塩、マグネシウム塩);金属塩(例えば、アルミニウム塩、鉄塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩);アンモニウム塩;有機アミン塩(例えば、t-オクチルアミン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレンジアミン塩、N-メチルグルカミン塩、グアニジン塩、ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキシルアミン塩、N,N’-ジベンジルエチレンジアミン塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノールアミン塩、N-ベンジル-フェネチルアミン塩、ピペラジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン塩);ハロゲン化水素酸塩(例えば、フッ化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩);無機酸性塩(すなわち、硝酸塩、過塩素酸塩、硫酸塩、リン酸塩);低級アルカンスルホン酸塩(例えば、メタンスルホン酸塩、トリフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩);アリールスルホン酸塩(例えば、ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩);有機酸塩(例えば、酢酸塩、リンゴ酸塩、フマル酸塩、コハク酸塩、クエン酸塩、酒石酸塩、シュウ酸塩、マレイン酸塩);アミノ酸塩(例えば、グリシン塩、リジン塩、アルギニン塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩)などが挙げられる。これらの塩は、任意の既知の方法で調製することができる。
本発明のアンチセンスオリゴマーは、例えば、本発明のアンチセンスオリゴマーの例示的な長さ範囲の長さまたは本発明のアンチセンスオリゴマーの例示的な長さを有するオリゴヌクレオチド、モルホリノオリゴマーまたはPNAを含む。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つの糖部分および/または少なくとも1つのリン酸結合部分が修飾されているアンチセンスオリゴマーである。
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合およびボラノホスフェート結合からなる群から選択される少なくとも1つの修飾されたリン酸結合部分を含む。
さらなる実施形態では、アンチセンスオリゴマーは、下記に示される化学式(1)~(3)で表される基のいずれか1つをその5’末端に有する。
上述されるように、機能性ペプチド(例えば、CPP(細胞浸透性ペプチド))は、リンカーなしでまたはリンカーを介してアンチセンスオリゴマーに結合され得る。機能性ペプチドがリンカーを介してアンチセンスオリゴマーに結合される場合、さらなるアミノ酸が機能性ペプチドに結合され得る。好ましい実施形態では、機能性ペプチドは、ホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(「PMO」)に5’末端または3’末端で結合され得る。
本発明の第2の態様によれば、本発明の化合物(例えば、本発明のアンチセンスオリゴマー)またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物を活性成分として含む医薬組成物(以下、「本発明の医薬組成物」と称する)が提供される。
特定の実施形態では、医薬組成物は、前述のオリゴマーまたはオリゴヌクレオチドのいずれか、またはその薬学的な塩もしくは水和物、ならびに少なくとも1つの薬学的に許容される添加剤および/または担体を含む。
本発明において使用するのに適した製剤は、Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Philadelphia, Pa., 17th ed., 1985に見出される。ドラッグデリバリーのための方法の簡単な概説については、例えば、Langer (Science 249:1527-1533, 1990)を参照されたい。
本発明の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、またはこれらを含む本発明の医薬組成物(以下、「本発明の治療薬」と称する)は、療法、例えばヒトの治療に使用することができる。
本発明の特定の実施形態では、筋萎縮性疾患または筋消耗性疾患の予防または治療のための医薬組成物の製造における本発明の化合物(例えば、アンチセンスオリゴマー)またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物の使用が提供される。
前記療法は、上記に列挙された疾患の予防または治療であり得る。
一実施形態では、療法は、対象における筋萎縮性疾患、筋消耗性疾患またはサルコペニア性疾患の予防または治療であり得る。一実施形態では、筋萎縮性疾患はデュシェンヌ型筋ジストロフィーであり得る。対象はヒト対象であり得る。
本発明はまた、ACVR2Bの細胞内領域の一部を欠くACVR2Bタンパク質の切断型バージョンを産生する遺伝子操作された動物(以下、「本発明のGM動物」と称する)を提供する。本明細書で使用される場合、動物は、ヒトを除く任意の種であり得る。特に適した動物は、魚(例えば、マグロ)、ウシ、ヒツジ、ヤギまたはブタなどの家畜である。
当業者は、標準的な技術を用いて、このような遺伝子操作された動物を作製することができる。例えば、本発明のGM動物は、本発明の化合物または本発明の医薬組成物を投与することによって生成することができる。例えば、本発明のGM動物は、CRISPR-CAS9、siRNA、loxPノックアウトシステム、TALEN、亜鉛フィンガー(ZFN)またはアンチセンスオリゴマーによって生成することができる。
あるいは、イントロンは、CRISPR-CAS9によって標的化され得る。例えば、エクソン8をサンドイッチするイントロン7および8を切断することができる。切断された部位が修復される場合、エクソン8が欠損し、エクソン8欠損変異型mRNAが生成され得る。同様に、イントロン4および5、またはイントロン5および6、またはイントロン6および7、またはイントロン8および9、またはイントロン9および10、またはイントロン10および11を切断するために標的化することができる。
アミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸
ステップ1:4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸の調製
アルゴン雰囲気下で、1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオン(41.11g)および4-ジメチルアミノピリジン(4-DMAP)(15.58g)をジクロロメタン(850mL)に懸濁し、次に、無水コハク酸(12.76g)をそこに添加し、続いて室温で3.5時間撹拌した。反応溶液をジクロロメタンおよび1Mリン酸二水素ナトリウム水溶液で抽出した。得られた有機層を1Mリン酸二水素ナトリウム水溶液および飽和塩化ナトリウム水溶液で連続して洗浄した。得られた有機層を硫酸ナトリウム上で脱水し、減圧下で濃縮した。得られた固体にジクロロメタン(600mL)を添加して結晶化させ、続いて濾過した。追加のジクロロメタン(300mL)を添加した後、結晶を5分間撹拌し、次に濾過し、減圧下で一晩乾燥させて所望の製造物(50.2g)を得た。
4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(50.2g)をピリジン(脱水)(600mL)に溶解し、続いて4-DMAP(12.4g)および1-(3-ジメチルアミノプロピル)-3-エチルカルボジイミド塩酸塩(77.6g)を添加した。アミノポリスチレンレジンであるアミノメチルレジン(Watanabe Chemical Industries,Ltd.,Japanの製品、A00673、200~400メッシュ、1mmol/g、1%DVB)(40.5g)およびトリエチルアミン(69.6mL)をこの混合物に添加し、次に室温で4日間振とうした。反応後、レジンを濾過により回収した。得られたレジンをピリジン、メタノールおよびジクロロメタンで連続して洗浄し、次に減圧下で乾燥させた。得られたレジンに、テトラヒドロフラン(無水)(500mL)、無水酢酸(104mL)および2,6-ルチジン(128mL)を添加し、次に室温で4時間振とうした。レジンを濾過により回収し、ピリジン、メタノールおよびジクロロメタンで連続して洗浄し、次に減圧下で乾燥させて、59.0gの所望の製造物を得た。
UV測定条件
機器:U-2910(Hitachi,Ltd.,Japan)
溶媒:メタンスルホン酸
波長:409nm
ε値:45000
アミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸
参考実施例1に示されるのと同じ手順を繰り返して、参考実施例1のステップ1で使用した1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオンを、このステップではN-{1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-2-オキソ-1,2-ジヒドロピリミジン-4-イル}ベンズアミドで置き換えたことを除いて、表題化合物を調製した。
アミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(6-ベンズアミドプリン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸
参考実施例1に示されたのと同じ手順を繰り返して、参考実施例1のステップ1で使用した1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオンを、このステップではN-{9-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]プリン-6-イル}ベンズアミドで置き換えたことを除いて、表題化合物を調製した。
アミノポリスチレンレジンにローディングした4-{(2S,6R)-6-{6-(2-シアノエトキシ)-2-[(2-フェノキシアセチル)アミノ]プリン-9-イル}-4-トリチルモルホリン-2-イル}メトキシ}-4-オキソブタン酸
参考実施例1に示されたのと同じ手順を繰り返して、参考実施例1のステップ1で使用した1-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオンを、このステップではN-{6-(2-シアノエトキシ)-9-[(2R,6S)-6-(ヒドロキシメチル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]プリン-2-イル}-2-フェノキシアセトアミドで置き換えたことを除いて、表題化合物を調製した。
アミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(5-メチル-2,4-ジオキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(参考実施例1)、またはアミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(4-ベンズアミド-2-オキソピリミジン-1-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(参考実施例2)、またはアミノポリスチレンレジンにローディングした4-{[(2S,6R)-6-(6-ベンズアミドプリン-9-イル)-4-トリチルモルホリン-2-イル]メトキシ}-4-オキソブタン酸(参考実施例3)、またはアミノポリスチレンレジンにローディングした4-{{(2S、6R)-6-{6-(2-シアノエトキシ)-2-[(2-フェノキシアセチル)アミノ]プリン-9-イル}-4-トリチルモルホリン-2-イル}メトキシ}-4-オキソブタン酸(参考実施例4)は、各々5’末端塩基に対応し、ペプチドシンセサイザー(FOCUS)を使用して次の合成サイクルを開始するために、フィルターを備えた反応容器に0.1gの量で充填させた。表1に指示される各化合物のヌクレオチド配列を与えるために、所望のモルホリノモノマー化合物を各カップリングサイクルに添加した(下記の表2を参照されたい)。
アンチセンスオリゴマー-ペプチドコンジュゲート(PMO-ペプチドコンジュゲート)の合成
アンチセンスオリゴマーのスキッピング活性の評価
細胞内へのPMOのトランスフェクション
3×105個のRD細胞(ヒト横紋筋肉腫細胞株)に、表1に示されるアンチセンスオリゴマーを各々、10または30μMで、Nucleofector II(Lonza)およびAmaxa Cell Line Nucleofector Kitを用いてトランスフェクトした。使用したパルスプログラムはT-030であった。
トランスフェクション後、細胞を、10%ウシ胎児血清(FBS)(Sigma-Aldrich)を含むダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)(Sigma-Aldrich)中で5%CO2下、6ウェルプレートのウェルで培養した。トランスフェクションの3日後、培地を0.4ng/mLの組換えマイオスタチン(R&D Systems)を含む無血清DMEMに置換し、細胞をさらに2時間、37℃にて5%CO2下で培養した。
トランスフェクションの前日に、RD細胞を3×104細胞/ウェルの密度で24ウェルプレートに播種し、10%FBS(Sigma-Aldrich)を含むDMEM(Sigma-Aldrich)中、5%CO2下で培養した。翌日、表8に示される2’-O-メチルホスホロチオエート(PS)オリゴヌクレオチド(JbioS)のアンチセンスオリゴマーを各々、10または30nMで、リポフェクタミン3000トランスフェクション試薬(Thermo Scientific)を用いてトランスフェクトした。トランスフェクション後の3日間、細胞を培養した。
トランスフェクションの前日に、RD細胞を4×104細胞/ウェルの密度で24ウェルプレートに播種し、10%FBS(Sigma-Aldrich)を含むDMEM(Sigma-Aldrich)中、5%CO2下で培養した。翌日、実施例2で合成されたアンチセンスオリゴマー-ペプチドコンジュゲート(PMO-ペプチドコンジュゲート)を培地に添加した。細胞をPMO-ペプチドコンジュゲートの添加後の3日間培養した。
細胞をPBS(Nissui Pharmaceutical)で1回洗浄し、次に、1%の2-メルカプトエタノール(Nacalai Tesque)を含む350μLの緩衝液RLT(Qiagen)を細胞に添加し、細胞を室温で数分間放置することにより溶解させた。細胞溶解物をQIAshredderホモジナイザー(Qiagen)に回収し、20,400×gで2分間、遠心分離してホモジネートを調製した。RNeasy Mini Kit(Qiagen)の製造者の指示に従って全RNAを抽出した。抽出された全RNAの濃度をNanoDrop ND-1000分光光度計(Thermo Fisher Scientific)を用いて測定した。
抽出された全RNA(150ng)を鋳型として用い、QIAGEN OneStep RT-PCR Kit(Qiagen)を用いたワンステップRT-PCRを行った。キットに添付されたプロトコルに従って反応溶液を調製した。使用したサーマルサイクラーは、TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(TaKaRa Bio)であった。使用したRT-PCRプログラムは、以下に示される通りである。
50℃で30分間:逆転写反応
95℃で15分間:ポリメラーゼ活性化、逆転写酵素不活性化
[94℃で30秒間;62℃で30秒間;72℃で50秒間]×32サイクル:PCR
72℃で7分間:最終伸長反応
エクソン5のスキッピングの検出用:
フォワードプライマー:5’-TGCTACGATAGGCAGGAGTG-3’(配列番号37)
リバースプライマー:5’-AGCAGGTTCTCGTGCTTCAT-3’(配列番号38)
エクソン6、7、または8のスキッピングの検出用:
フォワードプライマー:5’-CATGTGGACATCCATGAGGA-3’(配列番号39)
リバースプライマー:5’-GAGACACAAGCTCCCACAGC-3’(配列番号40)
エクソン9または10のスキッピングの検出用:
フォワードプライマー:5’-TCTATTGCCCACAGGGACTT-3’(配列番号41)
リバースプライマー:5’-GAGCCTCTGCATCATGGTC-3’(配列番号42)
た。
スキッピング効率(%)=A/(A+B)×100
得られた結果を図1a~dに示す。図1a~dは、本発明のアンチセンスオリゴマーおよびアンチセンスオリゴマー-ペプチドコンジュゲートがエクソンスキッピングを引き起こすことを示した。
ドミナントネガティブ活性の測定
8×103個のHEK-293細胞(ヒト胚性腎細胞株)を96ウェル白色プレート(Thermo Fisher Scientific)に播種し、10%FBSを含む最小必須培地イーグル(Sigma-Aldrich)中で37℃にて5%CO2下で培養した。翌日、各エクソン(エクソン5、6、7、8、9または10)スキッピング生成物(Eurofins GenomicsをコードするDNAを有する10ngのpBApo-CMV(Takara Bio)、および14ngのルシフェラーゼレポーターDNA(Cignal SMAD Reporter Assay Kit、Qiagen)をリポフェクタミンLTX(Thermo Fisher Scientific)を用いて細胞に同時トランスフェクトした。トランスフェクションの2日後、無血清最小必須培地イーグルで希釈された組換えマイオスタチン(R&D Systems)を10ng/mLの最終濃度で培地に添加した。さらに24時間の培養後、ルシフェラーゼレポーターアッセイを、製造者の指示に従ってDual-Gloルシフェラーゼアッセイシステム(Promega)を用いて行った。ルシフェラーゼ活性をルミノメーター、Tecan infinite F200 PRO(Tecan)を用いて測定した。
マイオスタチンシグナルの測定
抽出された全RNA(360ng)を鋳型として使用し、高容量cDNA逆転写キット(Thermo Fisher Scientific)を用いてRT反応を行った。反応溶液の調製および熱条件は、キットの製造者の指示に従った。使用したサーマルサイクラーは、TaKaRa PCR Thermal Cycler Dice Touch(TaKaRa Bio)であった。
RT反応溶液(0.6μL)を鋳型として使用し、TaqMan遺伝子発現マスターミックス(Thermo Fisher Scientific)、ならびにSMAD7およびPPIBのTaqMan遺伝子発現アッセイ(Thermo Fisher Scientific)を用いてqPCRを行った。qPCRに使用した機器は、QuantStudio 6 Flex Systems(Thermo Fisher Scientific)であった。
図3に示されるように、SMAD7遺伝子の発現は、マイオスタチンによる刺激により6倍増加した。本発明のアンチセンスオリゴマーは、SMAD7遺伝子の発現増加を抑制した。
これらのアンチセンスオリゴマーは、BLAST分析においてSMAD7遺伝子に相同性を示さない。したがって、これらのSMAD7遺伝子発現阻害活性は、マイオスタチンシグナル阻害活性に特異的である。
Claims (33)
- 野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部もしくは全部をコードする配列の一部が存在しない変異型アクチビン受容体2B型(ACVR2B)mRNAを標的細胞が産生することを可能にすることができる化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 野生型ACVR2Bの前記細胞内領域が野生型ACVR2Bのエクソン5~11によってコードされる、請求項1に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 野生型ACVR2Bの前記細胞内領域の一部を欠く切断型ACVR2Bタンパク質を前記標的細胞に産生させることができる、請求項1または2に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記切断型ACVR2Bタンパク質が、ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択される少なくとも1つのエクソンによってコードされる前記細胞内領域の全部または一部を欠いている、請求項3に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- ACVR2Bの細胞内領域の一部をコードするエクソンのスキップを誘導することができるアンチセンスオリゴマーである、請求項1~3のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- スキップされる前記エクソンが、ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択される、請求項5に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 10~50個の核酸塩基を含む、請求項5または6に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- ACVR2Bのエクソン5、6、7、8、9および10からなる群から選択されるエクソンの10~50個の連続するヌクレオチドに相補的な配列を含む、請求項5~7のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記エクソンが、配列番号1~6からなる群から選択される配列を含む、請求項5~8のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 配列番号12~36および43~111からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む、請求項5~9のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 配列番号12~36および43~111からなる群から選択されるヌクレオチド配列からなる、請求項5~10のいずれか一項に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記アンチセンスオリゴマーがオリゴヌクレオチドである、請求項5~11のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記オリゴヌクレオチドにおける少なくとも1つの糖部分および/または少なくとも1つのリン酸結合部分が修飾されている、請求項12に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記修飾された糖部分が、2’位の-OH基が、OR、R、R’OR、SH、SR、NH2、NHR、NR2、N3、CN、F、Cl、BrおよびI(Rはアルキルまたはアリールを表し、R’はアルキレンを表す)からなる群から選択されるいずれかの基で置換されているリボースである、請求項13に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記修飾されたリン酸結合部分が、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、アルキルホスホネート結合、ホスホロアミデート結合およびボラノホスフェート結合からなる群から選択される、請求項13または14に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 前記アンチセンスオリゴマーが少なくとも1つのモルホリノ環を含む、請求項5~11のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- モルホリノオリゴマーまたはホスホロジアミデートモルホリノオリゴマーである、請求項16に記載の化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 請求項1~18のいずれか一項に記載の化合物に細胞浸透性ペプチドが結合されたコンジュゲートである化合物、またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物。
- 請求項1~19のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物を含む医薬組成物。
- 少なくとも1つの薬学的に許容される担体または添加剤をさらに含む、請求項20に記載の医薬組成物。
- 凍結乾燥されている、請求項20または21に記載の医薬組成物。
- 対象における療法に使用するための、請求項1~19のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは請求項20~22のいずれか一項に記載の医薬組成物。
- 前記療法が、対象における筋萎縮性疾患、筋肉消耗性疾患もしくはサルコペニア性疾患の予防または治療である、請求項23に記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは請求項23に記載の使用のための医薬組成物。
- 前記筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、請求項24に記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは請求項24に記載の使用のための医薬組成物。
- 前記対象がヒトである、請求項23~25のいずれか一項に記載の使用のための化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物、あるいは請求項23~25のいずれか一項に記載の使用のための医薬組成物。
- 対象における筋萎縮性疾患、筋消耗性疾患またはサルコペニア性疾患を治療する方法であって、請求項1~19のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物の治療有効量、あるいは請求項20~22のいずれか一項に記載の医薬組成物の治療有効量を前記対象に投与することを含む方法。
- 前記筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、請求項27に記載の方法。
- 前記対象がヒトである、請求項27または28に記載の方法。
- 対象における筋萎縮性疾患、筋消耗性疾患、またはサルコペニア性疾患を予防または治療するための医薬の製造における、請求項1~19のいずれか一項に記載の化合物またはその薬学的に許容される塩もしくは水和物の使用。
- 前記筋萎縮性疾患がデュシェンヌ型筋ジストロフィーである、請求項30に記載の使用。
- 前記対象がヒトである、請求項30または31に記載の使用。
- 野生型ACVR2Bの細胞内領域の一部または全部をコードする配列の一部が存在しない、変異型アクチビン受容体2B型(ACVR2B)mRNAを発現する遺伝子操作された動物。
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