JP2021525282A - 抗体ライブラリーの構築方法およびその使用 - Google Patents

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Abstract

本願は、抗体ライブラリーの構築方法およびその使用を提供し、前記方法は、第１エレメントおよび第２エレメントを同一のベクターまたは異なるベクターに挿入し、前記ベクターを細胞内にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーである抗体ライブラリーを取得することを含み、前記第１エレメントは、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含み、前記第２エレメントは、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインを含む。【選択図】図２

Description

本願は、バイオテクノロジー分野に関し、抗体ライブラリーの構築方法およびその使用に関する。
抗体は、Ｂ細胞により発現され、特定の抗原と結合する免疫グロブリンである。多くの動物において、抗体は、１対となる重鎖および軽鎖から構成される。各鎖は、可変領域（Ｆｖ）と定常領域（Ｆｃ）との２種の異なる領域から構成される。ここで、重鎖および軽鎖のＦｖ領域は、標的抗原との結合を担当し、抗原結合決定クラスターと呼ばれる。抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域で１５〜２０個のアミノ酸の短いペプチド（ｌｉｎｋｅｒ）を介して連結された抗体は、一本鎖抗体（ｓｃＦｖ）と呼ばれる。抗体薬剤は、腫瘍および自己免疫疾患という２つの分野で支配地位を占めている。特に、腫瘍治療の分野で、モノクローナル抗体、モノクローナル抗体に基づく抗体薬剤カップリング、二重特異的抗体、キメラ抗原受容体Ｔ（ＣＡＲ−Ｔ）細胞等の免疫治療は、現在最も人気のある腫瘍治療手段となる。現在、抗体または抗体断片の各種のスクリーニング技術は、主にＢ細胞モノクローナル技術、タンパク質ディスプレイ法に基づいて発展している。
ハイブリドーマ技術は、マウスＢ細胞のモノクローナル化を確立するための最も早い技術である。所定の抗原を免疫した後の動物の脾臓細胞と、体外で培養されて無限に成長可能な骨髄腫細胞とを融合し、Ｂハイブリドーマ細胞を得る。このようなハイブリドーマ細胞は、骨髄腫細胞のように、体外で培養されて無限に増殖できるとともに、Ｂリンパ球のように特異的抗体を合成して分泌することができる。モノクローナル化により単一のハイブリドーマ細胞の細胞系を取得し、それが産生する抗体は同一の抗原エピトープのみに対するものであり、このような抗体は、いわゆるモノクローナル抗体である。しかし、マウス由来抗体がヒトにとって「異種」タンパク質に属しているため、これらのモノクローナル抗体が人体に入ると、これらの抗体に対する抗体（すなわち、ヒト抗マウス抗体）を生成するように人体を誘発する。ヒト抗マウス抗体は、マウス由来抗体を中和し、マウス由来抗体薬剤を無効にする。マウス由来抗体のＦｃ断片をヒト由来抗体のＦｃ断片に置換してヒトマウスキメラ抗体を得て、更にキメラ抗体のＦｖ領域のＦＲ断片をヒト化してヒト化抗体を得ることにより、マウス由来モノクローナル抗体の免疫原性を低減する。完全ヒト由来のモノクローナル抗体は、更に、ヒトの遺伝情報を完全に用いて抗体をコードし、抗異種タンパク質反応を回避する。ヒトＢ細胞と、ｍＩＬ−６およびｈＴＥＲＴを発現したマウス骨髄腫細胞とを融合してなるヒトマウスハイブリドーマ細胞、およびＥＢＶでヒトＢ細胞を形質転換して不死化させることは、いずれも完全ヒト由来のモノクローナル抗体を開発する有効な手段である。
Ｂ細胞のモノクローナル化技術は、時間がかかって手間がかかり、効率が低く、抗体の高スループットのスクリーニングを行うことができない。タンパク質ディスプレイ法は、ハイブリドーマ技術の高スループットのスクリーニングを行うことができない欠点を克服し、１つの巨大なライブラリー（１０１０個を超えた独立したクローン）からターゲットクローンをスクリーニングすることができる。常用のタンパク質ディスプレイ法は、ファージディスプレイ法、細菌ディスプレイ法、リボソームディスプレイ法、酵母ディスプレイ法、および哺乳動物細胞ディスプレイ法を含み、既に新しい抗体のスクリーニングおよび抗体親和性の改良に広く適用されている。
ファージディスプレイ法は、大きなヒト抗体ライブラリーを相対的に簡単、安定、容易に構築する等の利点により、これまで最も広く適用されるディスプレイ法となる。ファージディスプレイ法は、ポリペプチドまたはタンパク質のコード遺伝子をファージのコートタンパク質構造遺伝子の適当な位置に挿入し、他のコートタンパク質の正常な機能に影響しない場合、外因性ポリペプチドまたはタンパク質とコートタンパク質とを融合発現させ、外因性ポリペプチドまたはタンパク質とコートタンパク質とをファージの表面にディスプレイさせる。ファージの表面にディスプレイされたポリペプチドまたはタンパク質は、相対的に独立した空間構造および生物活性を保持し、標的分子を認識して結合することができる。ファージがディスプレイしたペプチドライブラリーまたはタンパク質ライブラリーは、固定された標的分子と結合し、結合していないファージを洗い落とした後、酸塩基または競合する分子で結合したファージを溶出し、中和後のファージは、大腸菌に対する感染が増幅し、３〜５ラウンドの濃縮を経て、標的分子を特異的に認識できるファージの割合を徐々に高め、最終的に標的分子を認識するポリペプチドまたはタンパク質を取得する。抗体の可変領域の遺伝子をファージゲノムに挿入し、発現した抗体をファージの表面にディスプレイし、ファージディスプレイ抗体ライブラリーを構築し、様々な抗原に対する抗体をスクリーニングすることができる。ハイブリドーマ技術と比べ、ファージディスプレイ抗体ライブラリー技術により抗体をスクリーニングすることは、免疫を経なくてもよく、抗体生産の周期を短縮する。体内免疫原性が弱く、または毒性のある抗原の抗体をスクリーニングすることもでき、適用範囲が広い。ファージディスプレイ抗体ライブラリー技術は、属・種に制限されず、様々な種の抗体ライブラリーを構築することができる。ヒト天然ライブラリーからスクリーニングされた抗体は、ヒト化を経ずに直接抗体薬剤の研究に用いることができる。ファージディスプレイ法および細菌ディスプレイ法は、ディスプレイシステムの小容量に制限され、小さいペプチドのディスプレイにより適する。そのため、抗体ライブラリーのディスプレイに用いると、抗体の断片しかディスプレイできず、完全な抗体のディスプレイを行うことができない。また、抗体が真核細胞タンパク質であり、ファージおよび細菌は、真核タンパク質を完全に効果的に発現することを確保できない。
酵母ディスプレイ法は、既にヒト抗体ライブラリーおよび抗体親和性成熟をスクリーニングする最も有力なツールの１つとなっている。酵母ディスプレイに最も広く使用されるシステムは、サッカロミセス・セレビシエＡｇａ１ｐ／２ｐα−レクチンシステムであり、ジスルフィド結合に依存してＧＰＩによりアンカーされたＡｇａ１ｐタンパク質とディスプレイされた抗体とを連結する。ファージディスプレイ法と比べ、酵母ディスプレイ法は多くの利点を有する。マルチカラーフローサイトメータを用いて酵母表面の抗体発現強度および蛍光でマークされた抗原との結合強度を定量することを含む。酵母は、分泌型の抗体を発現でき、より高い発現され、より良く折り畳まれ、適当に分泌されるクローンのスクリーニングに寄与する。酵母ディスプレイは、全ての形式の抗体および抗体断片を収容することができ、ドメイン抗体（ｄＡｂｓ）、ｓｃＦｖ、Ｆａｂｓ、更にＩｇＧを含む。しかし、形質転換効率およびフロー分析技術の制限により、酵母ディスプレイのヒト抗体ライブラリーの容量の大きさは限られている（１０７〜１０９個の独立したクローン）。しかし、最近改良された酵母エレクトロポレーション形質転換技術は、形質転換効率を１．５×１０８個の形質転換体／μｇのＤＮＡまで向上させ、これにより、１０１０個と多い独立したクローンの抗体ライブラリーを構築することができる。
哺乳動物細胞ディスプレイ法は、ヒト由来抗体の開発に最も重要な技術となる。哺乳動物細胞におけるタンパク質の折り畳み、分泌および翻訳後修飾は、人体に最も近い。哺乳動物細胞ディスプレイシステムは、ヒト抗体を発現して分泌する最も自然なシステムであり、抗体の自然な折り畳み、安定、凝集の減少に寄与する。哺乳動物細胞ディスプレイ法は、酵母ディスプレイ法に類似する利点を有し、フローサイトメータ技術により哺乳動物細胞表面の抗体状況を分析し、最適な抗体発現シグナルの細胞を選別することができる。哺乳動物細胞ディスプレイ法は、完全長ヒト由来抗体をディスプレイすることができ、Ｆｃ断片の完全抗体を含む抗体ライブラリーを構築するために用いられる。しかし、哺乳動物細胞ディスプレイ法には、トランスフェクション効率が低く、ライブラリー容量を高めにくいという問題が常に存在する。これらの制限により、哺乳動物細胞ディスプレイ法の最初の用途は、比較的小さいライブラリーの抗体の最適化に用いることである。一方、近年、技術の進歩に伴い、大量の哺乳動物細胞に基づくライブラリーは確立されて抗体のスクリーニングに用いられる。
これらの主流の抗体スクリーニング技術のほか、成長シグナル体に基づく抗体スクリーニング技術（Ｇｒｏｗｔｈ Ｓｉｇｎａｌｏｂｏｄｙ）、キメラ抗原受容体に基づく抗体スクリーニング技術（ＣＡＲｂｏｄｉｅｓ）、ディープシーケンシング抗体発見技術のような鮮明な特徴を持つ抗体スクリーニング技術が更にあり、いずれも巨大な潜在力を示している。
様々な抗体スクリーニング技術の進歩、人々の疾患に対する更なる認識、および多くの抗原標的点の発見により、抗体薬剤の開発は急速に発展している。抗体および抗体に基づく薬剤の腫瘍に対する治療効果は、選択された抗原標的点に密接に関連し、現在、ＦＤＡに承認された抗体薬剤標的点の数は限られ、これらの標的点に対する抗体は、いずれもモノクローナル抗体であるか、または複数のモノクローナル抗体で混合された多様性が限られたポリクローナル抗体である。
抗体薬剤は、腫瘍治療で良好な治療効果を得たが、現在、腫瘍治療の問題を完全に解決できるモノクローナル抗体は未だになく、主な原因は以下のとおりである。（１）現在究明された腫瘍標的点のうち、ある腫瘍を完全に被覆可能な標的点がない。腫瘍細胞において、ある腫瘍抗原を高発現する可能性があるが、この腫瘍抗原が全ての腫瘍細胞でいずれも高発現されるとは限らず、この腫瘍抗原を発現しないかまたは低発現する一部の腫瘍細胞は、抗体薬剤に薬剤耐性を生じるため、腫瘍の治療中に腫瘍の迅速な反発をもたらす。（２）腫瘍細胞のみに発現され、正常な細胞に発現されない標的点は少ない。ほとんどの腫瘍抗原がヒトのある正常な組織にも発現されるため、抗体薬剤は正常な組織の損傷に大きな薬剤副作用を有する。（３）腫瘍細胞の抗原は極めて高い変異負荷を有し、すなわち、抗原は多様性を有し、且つ変異率が高い。腫瘍細胞は、大量のそれぞれ異なる腫瘍の新たな抗原を有し、これらの新たな抗原は、同一種の腫瘍でも異なり、確定された腫瘍抗原があっても、変異が起こって抗体薬剤が無効となる可能性がある。（４）既に究明された標的点は限られ、多くの腫瘍に対して使用可能な有効な標的点または標的点の組み合わせがなく、大量の未知の腫瘍標的点は究明されていない。従来の抗体スクリーニング技術は、ほとんどモノクローナル抗体のスクリーニングに用いられる。モノクローナル抗体は、単一の腫瘍抗原標的点の１つの抗原エピトープのみを認識し、複数のモノクローナル抗体で混合されたポリクローナル抗体であっても、認識する抗原エピトープも限られ、腫瘍細胞の複雑な抗原エピトープを被覆することはできない。多くの抗体スクリーニング技術は、ポリクローナル抗体のスクリーニングにも使用できるが、そのスクリーニング操作の利便性、抗体のスクリーニング成功率、得られた抗体特異性等の面では、いずれも大きなチャレンジに直面している。
そのため、複雑な抗原に対するポリクローナル抗体をスクリーニングする技術に用いられる抗体ライブラリーの構築方法を開発し、腫瘍抗原が複雑かつ多様であり、変化しやすく、使用可能な標的点が限られているという問題を解決し、広い応用の見通し及び巨大な市場価値を有する。
従来技術の不足および実際のニーズに対し、本願は、抗体ライブラリーの構築方法および使用を提供し、前記方法は、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御する原理に基づいて設計され、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムの細胞外認識ドメインを細胞外抗体ライブラリーコーディング領域に変え、調整制御されたターゲット遺伝子をスクリーニングマーカー遺伝子に変えることで、抗原により活性化された抗体スクリーニングシステムを得て、複雑な抗原に対するポリクローナル抗体をスクリーニングする技術を得て、腫瘍抗原が複雑かつ多様であり、変化しやすく、使用可能な標的点が限られているという問題を解決し、広い応用の見通し及び巨大な市場価値を有する。
この目的を達成するために、本願は以下の技術案を採用する。
第１態様において、本願は、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御することを原理とし、第１エレメントおよび第２エレメントを同一のベクターまたは異なるベクターに挿入し、細胞内にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーである抗体ライブラリーを取得する抗体ライブラリーの構築方法であって、
前記第１エレメントは、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含み、前記第２エレメントは、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインを含む抗体ライブラリーの構築方法を提供する。
具体的には、
（１）ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を有するベクターを細胞にトランスフェクションするステップと、
（２）Ｎ端からＣ端まで順に細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、細胞内転写ドメインを担持するベクターを、ステップ（１）の細胞内にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーである抗体ライブラリーを取得するステップと、
を含む。
ステップ（１）およびステップ（２）の２つのベクターは、１つのベクターに合わせることができ、このベクターを用いて抗体ライブラリーを構築することも可能である。一方、２つのベクターに分けて２ステップのトランスフェクションを行うことは、トランスフェクション効率を向上させ、大容量の抗体ライブラリーをより容易に構築することができ、前記ベクターは発現ベクターを含む。
本願は、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御する原理に基づいて設計され、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムは、天然の細胞間シグナル伝達受容体Ｎｏｔｃｈのコア調節ドメインを含むとともに、合成性の細胞外認識ドメインおよび合成性の細胞内転写ドメインを含み、合成性の細胞外認識ドメインは一本鎖抗体であり、一本鎖抗体が抗原を認識して結合すると、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが誘導性膜貫通領域のせん断を発生し、細胞内転写ドメインは放出されて細胞核に入り、上流ｃｉｓアクティベーターと結合して調整制御されたターゲット遺伝子の発現を活性化させるため、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが改造した細胞は、特定の抗原認識結合によりある特定の遺伝子の発現を駆動し、Ｔ細胞を改造するために用いることができ、Ｔ細胞は、抗原によってサイトカインを調整制御して発現させることにより標的細胞を殺傷することができ、またはＴ細胞は、抗原によってＣＡＲを調整制御して発現させることにより、ＣＡＲ−Ｔ細胞の標的細胞に対する認識精度を向上させることができる。
本願において、出願人は、従来技術の抗体のスクリーニングの欠点を解決するために、簡潔で効率的な抗体ライブラリーの構築方法を提供し、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御することを基本原理とし、大量の実験により、スキームのフロー全体を最適化し、繰り返し設計して検証し、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムの細胞外認識ドメインを細胞外抗体ライブラリーコーディング領域に変え、調整制御されたターゲット遺伝子をスクリーニングマーカー遺伝子に変えることで、抗原により活性化された抗体スクリーニングシステムを得る。抗体ライブラリーの構築方法は、まず、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を有するベクターを細胞にトランスフェクションし、その後、Ｎ端からＣ端までそれぞれ細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、細胞内転写ドメインを担持するベクターをこの細胞にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーを得る。
好ましくは、前記スクリーニングマーカー遺伝子は、薬剤耐性遺伝子、自殺遺伝子、蛍光タンパク質遺伝子、および分子タグのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
抗体のポジティブスクリーニングを行うためにスクリーニングマーカー遺伝子を薬剤耐性遺伝子に設計する場合、活性化された細胞は、スクリーニング薬剤を有する培地で生存することができるが、残りの細胞は死亡することにより、ターゲット抗原に対する抗体発現細胞をスクリーニングする。抗体のネガティブスクリーニングを行うためにスクリーニングマーカー遺伝子を自殺遺伝子に設計する場合、活性化された細胞はスクリーニング薬剤を有する培地でアポトーシスし、残りの細胞は生存することにより、ターゲット抗原に対する抗体発現細胞を除去する。
本願の薬剤によりポジティブスクリーニングを行うことができるスクリーニングマーカー遺伝子は、ピューロマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ブラストサイジン耐性遺伝子、ハイグロマイシンＢ耐性遺伝子等であってもよいが、これらに限定されず、それぞれピューロマイシン、Ｇ４１８、ブラストサイジン、ハイグロマイシンＢという薬剤でスクリーニングされ、薬剤によりネガティブスクリーニングを行うことができるスクリーニングマーカー遺伝子は、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ＨＳＶ−ＴＫ）遺伝子、シトシンデアミナーゼ（ＣＤ）遺伝子、ｉＣａｓｐ９自殺システム遺伝子であってもよいが、これらに限定されず、それぞれガンシクロビルまたはＦＩＡＵ、５−フルオロシトシン、ＡＰ１９０３またはＡＰ２０１８７という薬剤でスクリーニングされる。
好ましくは、前記薬剤耐性遺伝子は、ピューロマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ブラストサイジン耐性遺伝子、およびハイグロマイシンＢ耐性遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記自殺遺伝子は、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ（ＨＳＶ−ＴＫ）遺伝子、シトシンデアミナーゼ（ＣＤ）遺伝子、およびｉＣａｓｐ９自殺システム遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記蛍光タンパク質遺伝子は、ＥＧＦＰ、ＹＦＰ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ＤｓＲｅｄ、およびＢＦＰのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記分子タグは、Ｈｉｓ−ｔａｇ、Ｆｌａｇ−ｔａｇ、ＨＡ−ｔａｇ、Ｍｙｃ−ｔａｇ、およびＳｔｒｅｐ−ｔａｇのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
本願のスクリーニングマーカー遺伝子は、ＥＧＦＰ、ＹＦＰ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ＤｓＲｅｄ、ＢＦＰという蛍光タンパク質遺伝子を含んでもよいが、これらに限定されない。分子タグ、すなわち、タンパク質／ポリペプチドタグは、Ｈｉｓ−ｔａｇ、Ｆｌａｇ−ｔａｇ、ＨＡ−ｔａｇ、Ｍｙｃ−ｔａｇ、Ｓｔｒｅｐ−ｔａｇを含んでもよいが、これらに限定されない。フローサイトメータで蛍光または抗タグ抗体を検出することは、ポジティブスクリーニングを行ってもよいし、ネガティブスクリーニングを行ってもよい。
前記スクリーニングマーカー遺伝子のスクリーニング方法は、薬剤スクリーニング、フローサイトメータによる検出と選別、および磁気ビーズ選別のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記薬剤耐性遺伝子のスクリーニング薬剤は、ピューロマイシン、Ｇ４１８、ブラストサイジン、およびハイグロマイシンＢのうちのいずれか１種を含む。
好ましくは、前記自殺遺伝子のスクリーニング薬剤は、ガンシクロビルまたはＦＩＡＵ、５−フルオロシトシン、ＡＰ１９０３、およびＡＰ２０１８７のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記蛍光タンパク質遺伝子の検出と選別方法は、フローサイトメータによる検出と選別を含む。
好ましくは、前記分子タグの検出と選別方法は、フローサイトメータによる検出と選別を含む。
好ましくは、前記マーカー遺伝子の選別は磁気ビーズ選別を含む。
好ましくは、前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域は、（完全抗体、抗体を構成する鎖または抗体断片）抗体配列、抗体重鎖配列、抗体軽鎖配列、抗体可変領域配列、一本鎖抗体配列、単一ドメイン抗体配列、およびＦａｂ断片配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
本願において、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域部分は、完全な抗体、抗体を構成する鎖（重鎖または軽鎖）、抗体の断片（抗体可変領域、一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、Ｆａｂ断片）からなるライブラリーを含んでもよいが、これらに限定されない。細胞外抗体ライブラリーコーディング領域の由来は、免疫動物、患者、健康者、ワクチン接種者、人工合成を含んでもよいが、これらに限定されない。
好ましくは、前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域の由来は、免疫動物、患者、健康者、ワクチン接種者、および人工合成のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記Ｎｏｔｃｈコアドメインは、ヒトのＮｏｔｃｈ、マウスのＮｏｔｃｈ、またはヒトのＮｏｔｃｈもしくはマウスのＮｏｔｃｈとの類似性が８５％以上の配列を含む。
好ましくは、前記Ｎｏｔｃｈコアドメインは、ヒトのＰ１３９１−Ｒ１７６３断片、マウスのＰ１３９０−Ｒ１７５２断片、これらの断片の前または後から±２００個のアミノ酸以内の断片、またはこれらの断片との類似性が８５％以上の配列を含む。
好ましくは、前記ヒトのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１に示すとおりである。
好ましくは、前記マウスのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２に示すとおりである。
本願のＮｏｔｃｈコアドメインは、ヒトのＮｏｔｃｈ、マウスのＮｏｔｃｈ、およびそれらとの類似性が８５％以上の配列に由来してもよいが、これらに限定されない。Ｎｏｔｃｈコアドメインは、Ｐ１３９１−Ｒ１７６３断片（ヒト）、Ｐ１３９０−Ｒ１７５２断片（マウス）、これらの断片の前または後から±２００個のアミノ酸以内の断片、およびこれらの断片との類似性が８５％以上の配列であってもよい。
好ましくは、前記転写ドメインは、ｔＴＡおよび／またはＧａｌ４−ＶＰ６４を含んでもよいが、これらに限定されない。
好ましくは、前記ｃｉｓアクティベーターは、ｐＴｅｔおよび／またはＵＡＳ−ｐＳＶ４０を含む。
好ましくは、前記転写ドメインは、ｔＴＡおよび／またはＧａｌ４−ＶＰ６４を含む。
好ましくは、前記トランスフェクションの方法は、ウイルストランスフェクション、化学トランスフェクション、試薬トランスフェクション、および電撃トランスフェクションのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
好ましくは、前記コーディング領域、ドメイン、または遺伝子は、コーディングタンパク質のアミノ酸配列、コーディングタンパク質のＤＮＡ配列、およびコーディングタンパク質のＲＮＡ配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む。
第２態様において、本願は、第１態様に記載の方法で構築された抗体ライブラリーを提供する。
第３態様において、本願は、
（１）抗体ライブラリーと抗原とを接触するステップと、
（２）スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングするステップと、
を含む第２態様に記載の抗体ライブラリーを用いてスクリーニングを行う抗体のスクリーニング方法であって、
前記抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を含み、
前記抗原は、野生型細胞、特定の抗原遺伝子をトランスフェクションした細胞、特定の抗原を結合した細胞、培地に溶解した抗原、培養皿に被覆された抗原、マイクロビーズに被覆された抗原、および培養足場に被覆された抗原のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む抗体のスクリーニング方法を提供する。
本願において、抗体のスクリーニング方法は、抗体発現細胞ライブラリーと抗原とを接触し、抗原を認識可能な抗体発現細胞だけが細胞内のスクリーニングマーカー遺伝子の発現を活性化し、スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングする。
第４態様において、本願は、第３態様に記載の方法でスクリーニングされた抗体を提供する。
別の態様において、本発明は、
ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、
細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントと、
を含む抗体をスクリーニングするためのシステムを更に提供する。
前記ｃｉｓアクティベーター、スクリーニングマーカー遺伝子、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインは上述したように定義される。
別の態様において、本発明は、
ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントとを細胞にトランスフェクションすることと、
前記細胞に前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域を発現させることと、
前記細胞と抗原とを接触することと、
前記スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングすることにより、ターゲット抗体をスクリーニングすることと、
を含む上記システムを用いて抗体をスクリーニングする方法を更に提供する。
前記ｃｉｓアクティベーター、スクリーニングマーカー遺伝子、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインは上述したように定義される。
従来技術と比べ、本願は、以下のような有益な効果を有する。
１、本願に係る方法は、モノクローナル抗体をスクリーニングすることができ、ポリクローナル抗体をスクリーニングすることもできる。従来の抗体スクリーニング技術は、モノクローナル抗体のスクリーニングに適し、ポリクローナル抗体のスクリーニングに使用されても、スクリーニングした抗体の多様性、特異性、および安定性も確保しにくい。本願の抗体スクリーニング技術は、抗原に対してスクリーニングしたポリクローナル抗体がより大きな多様性を有し、且つ、スクリーニング条件を変更することにより特異性がより良く、親和性がより高い抗体を得ることができ、シーケンシングによって大量のモノクローナル抗体のコード配列を得ることができ、従来のモノクローナルスクリーニング技術よりもより簡単である。
２、本願に係る方法は、抗原を発現して精製する必要がない。従来の抗体スクリーニング技術は、抗体のスクリーニングを行う場合、免疫動物、プレートで抗体をＥＬＩＳＡによりスクリーニングすること、結合抗体で抗体をフロースクリーニングすることに用いられる抗原タンパク質または抗原エピトープのペプチド断片を発現して精製する必要があり、これらの抗原タンパク質またはペプチド断片は、精製しにくいか、または元の抗原タンパク質修飾と異なるか、または元の空間構造ではないか、これらはいずれもスクリーニングした抗体の特異性、親和性に影響を及ぼす。本願の抗体スクリーニング技術は、ターゲット抗原を細胞の表面にディスプレイすれば、抗体のスクリーニングを行うことができ、ターゲット抗原をディスプレイする細胞を得るために、ターゲット抗原の遺伝子を細胞にトランスフェクションするか、またはターゲット抗原の発現が確定された野生型細胞を直接用いれば良く、非常に便利である。
３、本願に係る方法は、抗原を予め設定する必要がない。従来の抗体スクリーニング技術は、抗原を予め究明してから、抗原に対して抗体をスクリーニングする必要があるが、腫瘍細胞は極めて複雑であり、大量の究明されていない抗原があり、明確された腫瘍の抗原標的点は非常に限られ、限られた抗原標的点に対してスクリーニングされた抗体は、腫瘍治療のニーズを満たすことができない。本願は、抗原を予め設定する必要がなく、腫瘍細胞全体を抗原とすることができ、抗体ライブラリーからスクリーニングされたポリクローナル抗体は、腫瘍細胞表面の各種の抗原標的点を認識することができ、既知の抗原標的点が限られているという問題を回避する。
４、本願に係る方法は、ネガティブスクリーニングを容易に行うことができる。抗体のネガティブスクリーニングの目的は、不要な抗体を除去することであり、例えば、正常な細胞を認識する可能性のある抗体を除去し、腫瘍細胞と正常な細胞とが大量の同じ抗原を有するため、腫瘍細胞に対してスクリーニングされた抗体は、腫瘍細胞を認識できるほか、正常な細胞を認識する可能性もあることで、開発された抗体薬剤は正常な組織を傷害する副作用を有し、従来の抗体スクリーニング技術でモノクローナル抗体をスクリーニングする場合、スクリーニングされた抗体の正常な細胞に対する作用を１つずつ検証し、不要な抗体を除去することができるが、このような方法の効率が低く、ポリクローナル抗体のスクリーニングに適しない。本願の抗体スクリーニング技術は、ネガティブスクリーニングマーカー遺伝子を用いることにより、ネガティブスクリーニング薬剤またはフローサイトメータによる陰性選別等の方式で、ネガティブスクリーニングを容易に行うことができる。
５、本願に係る方法は、スクリーニング方式が多様である。本願に係る抗体スクリーニング技術は、薬剤でポジティブ・ネガティブスクリーニングを行ってもよく、フローサイトメータでスクリーニングを行ってもよく、薬剤によるスクリーニングとフローサイトメータによるスクリーニングとを組み合わせて行ってもよく、自分の研究条件および研究経験に基づいて自由に選択して組み合わせ、ターゲット抗体の取得により寄与する。
本願のｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御する原理図である。 本願のｓｙｎＮｏｔｃｈに基づく抗体スクリーニングシステムである。 本願のｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子のベクターの模式図である。 本願のｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターで蛍光タンパク質とピューロマイシン耐性遺伝子との融合を調整制御するベクターの模式図である。 本願のｔＴＡ発現ベクターの模式図である。 本願の蛍光顕微鏡で撮影したｔＴＡがｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターを活性化して緑色蛍光タンパク質を発現した図である。 本願の蛍光顕微鏡で撮影したｔＴＡがｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターを活性化して赤色蛍光タンパク質を発現した図である。 本願の抗体ライブラリーの汎用発現ベクターの模式図である。 本願の抗ＣＤ１９一本鎖抗体の発現ベクターの模式図である。 本願の抗ＧＰＣ３一本鎖抗体の発現ベクターの模式図である。 本願のＣＤ１９およびＧＦＰＣ３抗原発現ベクターの模式図である。 本願のフローサイトメータでＣＤ１９およびＧＦＰＣ３の抗原のＫ５６２細胞における発現を検出した図である。 本願の抗体スクリーニングシステムを用いて混合した抗体発現細胞ライブラリーからＣＤ１９抗体発現細胞をスクリーニングした結果図である。 本願の抗体スクリーニングシステムを用いて混合した抗体発現細胞ライブラリーからＧＰＣ３抗体発現細胞をスクリーニングした結果図である。 本願のｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターで緑色蛍光タンパク質を調整制御するベクターの模式図である。 本願の抗Ｒａｊｉ一本鎖抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターの模式図である。 本願のネガティブスクリーニングに用いられる抗原発現ベクターの模式図である。 本願のフローサイトメータでＣＤ１９抗原発現ベクターおよびネガティブスクリーニング抗原発現ベクターのＫ５６２細胞における発現を検出した結果図である。 本願のフローサイトメータで検出してスクリーニングする前の抗体発現細胞ライブラリーの活性化誘導状況の図である。 本願のフローサイトメータで検出してスクリーニングした後の抗体発現細胞ライブラリーの活性化誘導状況の図である。 本願のｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターで蛍光タンパク質とポジティブ・ネガティブスクリーニング遺伝子との融合を調整制御するベクターの模式図である。 本願の薬剤の初期スクリーニングが可能な一本鎖抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターの模式図である。 本願の抗体スクリーニングシステムを用いて薬剤のポジティブスクリーニングを行う原理図である。 本願のフローサイトメータでポジティブスクリーニングを行う抗体発現細胞を検出した結果図である。 本願の抗体スクリーニングシステムを用いて薬剤のネガティブスクリーニングを行う原理図である。 本願のフローサイトメータでネガティブスクリーニングを行う抗体発現細胞を検出した結果図である。 本願の一本鎖抗体と抗体の定常領域とを融合した発現ベクターの模式図である。 本願のフローサイトメータで本願の抗体スクリーニング方法によりスクリーニングした抗体の抗原との結合効率の結果図である。
本願に使用される技術的手段およびその効果を更に説明するために、以下、図面および具体的な実施形態を参照しながら本願の技術案について更に説明するが、本願は実施例の範囲内に限定されるものではない。
実施例１．既知のＣＤ１９およびＧＰＣ３抗体をスクリーニングする
ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御する原理図は図１に示すように、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムの細胞外の一本鎖抗体が抗原を認識して結合する場合、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムは誘導性膜貫通領域のせん断を発生し、細胞内転写ドメインが放出されて細胞核に入り、上流ｃｉｓアクティベーターと結合して調整制御されたターゲット遺伝子の発現を活性化させた。
ｓｙｎＮｏｔｃｈに基づく抗体スクリーニングシステムの原理図は図２に示すように、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムの基に、細胞外認識ドメインを細胞外抗体ライブラリーコーディング領域に変え、調整制御されたターゲット遺伝子をスクリーニングマーカー遺伝子に変えることで、抗原により活性化された抗体スクリーニングシステムを得た。
既知のＣＤ１９とＧＰＣ３との混合した抗体ライブラリーからＣＤ１９およびＧＰＣ３に対する特異的抗体をそれぞれスクリーニングした。
（１）ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系を構築した。
本実施例において、ｃｉｓアクティベーターはｐＴｅｔ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３）を採用し、ｐＴｅｔがｔＴＡシグナルを受信すれば、スクリーニング遺伝子の発現を開始することができ、スクリーニングマーカーは蛍光タンパク質を用いてピューロマイシン耐性遺伝子（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４）と融合し、両者の間は自動的に破断可能な２Ａ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．５）配列で連結され、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子のベクターの模式図は図３に示すとおりである。
本実施例は、それぞれ２種の蛍光タンパク質であるＥＧＦＰ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．６）およびｍＣｈｅｒｒｙ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．７）を用いてピューロマイシン耐性遺伝子と融合して２種のスクリーニングマーカーを構築し、ターミネーターはＳＶ４０ポリＡ（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．８）を採用し、人工合成により配列全体（図４）のコード遺伝子を直接合成し、レンチウイルスベクターに構築し、レンチウイルスを包装し、それぞれ２９３Ｔ細胞にトランスフェクションし、３日間後にトランスフェクションした細胞をモノクローナル化した。
モノクローナルの細胞系をスクリーニングして正確なモノクローナル細胞を取得するために、ｔＴＡ発現ベクター（図５）を構築する必要があり、ｔＴＡ発現ベクターは、ｅｆ１−αプロモーター（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．９）、ｔＴＡ遺伝子（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１０）、ターミネーターから構成され、ｔＴＡ発現ベクターをレンチウイルスベクターに構築し、レンチウイルスとして包装した。
スクリーニング待ちのモノクローナル細胞から、それぞれ一部の細胞を取り出してｔＴＡを発現したレンチウイルスをトランスフェクションし、２〜３日間後、蛍光顕微鏡で観察し、ＥＧＦＰ（図６は、ｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターを安定してトランスフェクションして緑色蛍光タンパク質とピューロマイシン耐性遺伝子との融合を調整制御するモノクローナル細胞をスクリーニングする場合、顕微鏡で観察した緑色蛍光の発現状況である。）またはｍＣｈｅｒｒｙ（図７は、ｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターを安定してトランスフェクションして赤色蛍光タンパク質とピューロマイシン耐性遺伝子との融合を調整制御するモノクローナル細胞をスクリーニングする場合、顕微鏡で観察した赤色蛍光発現状況である。）の発現があるがトランスフェクションの前に蛍光の発現がない細胞系は、いずれもｐＴｅｔ ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系であった。
（２）抗体発現細胞ライブラリーを構築した。まず、後続に細胞外抗体ライブラリーコーディング領域遺伝子（図８は、抗体ライブラリーの汎用発現ベクターの模式図である）を挿入するように、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターにおける細胞外抗体ライブラリーコーディング領域遺伝子以外の中間ベクターを構築し、中間ベクターの各構成部分の配列を人工合成し、Ｎ端からＣ端まで順に直列連結された部分は、それぞれｍＰＧＫ１プロモーター（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１１）、ＣＤ８αシグナルペプチド（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１２）コード配列、抗体遺伝子ライブラリーコーディング領域（β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）のＮ端のα断片を有するコード領域の配列であり、前はＡｓｃ Ｉ制限酵素部位で、後ろはＮｏｔ Ｉ制限酵素部位であり、抗体ライブラリー配列を挿入しやすく、且つ、青白斑で断片の挿入状況を示すことができる）、ＮＯＴＣＨ１断片（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２に膜貫通領域のＰ１３９０−Ｒ１７５２断片が含まれる）コード配列、ｔＴＡコード配列、ターミネーターであり、合成した配列をレンチウイルスベクターに構築し、抗体遺伝子配列を更に挿入するように準備した。
既知の抗ヒトＣＤ１９一本鎖抗体（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１３）および抗ヒトＧＰＣ３一本鎖抗体（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１４）のコード配列を合成し、両端にＡｓｃ ＩおよびＮｏｔ Ｉ制限酵素部位があり、それぞれ中間ベクターのＡｓｃ ＩとＮｏｔ Ｉ制限酵素部位との間に挿入され、抗ヒトＣＤ１９一本鎖抗体遺伝子が挿入されたベクター（図９）をレンチウイルスに包装し、ＥＧＦＰスクリーニングマーカーを有するモノクローナル細胞系にトランスフェクションし、ＣＤ１９一本鎖抗体発現細胞を得た。
抗ヒトＧＰＣ３一本鎖抗体遺伝子が挿入されたベクター（図１０）をレンチウイルスに包装し、ｍＣｈｅｒｒｙスクリーニングマーカーを有するモノクローナル細胞系にトランスフェクションし、ＧＰＣ３一本鎖抗体発現細胞を得た。
（３）ＣＤ１９およびＧＦＰＣ３の抗原発現細胞を構築した。ＣＤ１９（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１５）およびＧＰＣ３（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１６）抗原のコード配列を合成し、それぞれ発現ベクターに構築し、ベクターの発現中に、２つの２Ａ配列により、ＣＤ１９またはＧＰＣ３、青色蛍光タンパク質（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１７）、ピューロマイシン耐性遺伝子という３者を融合した（図１１）。
構築した発現ベクターをレンチウイルスに包装し、ウイルスによりＫ５６２細胞にトランスフェクションし、トランスフェクションしてから２日間後に、培地に１μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えてスクリーニングし、ＣＤ１９またはＧＰＣ３を安定して発現したＫ５６２細胞を得た。フローサイトメータにより青色蛍光タンパク質の発現がほぼ１００％に達したことを検出し（図１２）、抗原がＫ５６２細胞で安定して発現していることを示した。
（４）混合した抗体発現細胞ライブラリーからＣＤ１９抗体発現細胞をスクリーニングした。ＣＤ１９一本鎖抗体発現細胞とＧＰＣ３一本鎖抗体発現細胞と１：１で混合してから、混合細胞とＣＤ１９抗原発現細胞とを１：１で混合し、混合細胞を２日間培養した後、培地に１μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えてスクリーニングし、８〜１０日間のスクリーニングを経て、抗体発現細胞は、ほとんどＣＤ１９抗体が緑色蛍光を有することを発現した細胞であり（図１３）、ＣＤ１９一本鎖抗体と緑色蛍光とを共に発現した細胞と、ＧＰＣ３一本鎖抗体と赤色蛍光とを共に発現した細胞とを１：１で混合し、ＣＤ１９抗原発現細胞と混合してピューロマイシンを加えてスクリーニングし、ほとんどＣＤ１９抗体が緑色蛍光を有することを発現した細胞を得た。
（５）混合した細胞から抗ＧＰＣ３抗体を発現した細胞をスクリーニングした。ＣＤ１９抗体発現細胞とＧＰＣ３抗体発現細胞とを１：１で混合してから、混合細胞とＧＰＣ３抗原発現細胞とを１：１で混合し、混合細胞を２日間培養した後、培地に１μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えてスクリーニングし、８〜１０日間のスクリーニングを経て、抗体発現細胞は、ほとんどＧＰＣ３抗体が赤色蛍光を有することを発現した細胞であり（図１４）、ＣＤ１９一本鎖抗体と緑色蛍光とを共に発現した細胞と、ＧＰＣ３一本鎖抗体と赤色蛍光とを共に発現した細胞とを１：１で混合し、ＧＰＣ３抗原発現細胞と混合してピューロマイシンを加えてスクリーニングし、ほとんどＧＰＣ３抗体が赤色蛍光を有することを発現した細胞を得た。
上記実験結果により、本抗体スクリーニング方法により、既知の抗体ライブラリーからターゲット抗原に対する一本鎖抗体をスクリーニングすることができることが示された。
実施例２．抗体ライブラリーを調製し、フローサイトメータでＣＤ１９抗体発現細胞をスクリーニングする
（１）ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系を構築した。
本実施例は、ｃｉｓアクティベーターｐＴｅｔを採用し、ｐＴｅｔがｔＴＡシグナルを受信すれば、スクリーニングマーカーである緑色蛍光タンパク質遺伝子の発現を開始し、人工合成により配列全体を合成し（図１５）、レンチウイルスベクターに構築した。レンチウイルスを包装し、２９３Ｔ細胞にトランスフェクションし、３日間後にトランスフェクションした細胞をモノクローナル化し、スクリーニング待ちのモノクローナル細胞から、それぞれ一部の細胞を取り出してｔＴＡを発現したレンチウイルスをトランスフェクションし、２〜３日間後、蛍光顕微鏡で観察し、緑色蛍光の発現があるがトランスフェクションの前に蛍光の発現がない細胞系を選択し、トランスフェクションｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系であった。
（２）抗体発現細胞ライブラリーを構築した。
ＣＤ１９陽性のＲａｊｉ細胞でＣ５７ＢＬ／６Ｊマウスを免疫し、２週目に免疫を１回強化し、４週目に免疫を再度強化し、３日間後にマウスを殺し、マウスの脾臓リンパ球を分離し、ＲＮＡ抽出精製キットで脾臓リンパ球のＲＮＡを抽出した。
抽出したＲＮＡを逆転写キットでそれぞれ軽鎖の逆転写プライマー（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１８）および重鎖の逆転写プライマー（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１９）により逆転写し、縮重プライマーで重鎖および軽鎖をそれぞれ増幅してから、ＰＣＲを重ねる方法で軽鎖と重鎖とを連結し、軽鎖−Ｌｉｎｋｅｒ−重鎖のｓｃＦｖライブラリーを形成し、ｓｃＦｖライブラリーのＤＮＡ断片をＡｓｃ ＩおよびＮｏｔ Ｉにより二重酵素切断し、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターの中間ベクターのＡｓｃ ＩとＮｏｔ Ｉ制限酵素部位との間に挿入し、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクター（図１６）を取得し、Ｒａｊｉ細胞免疫マウスで調製した一本鎖抗体を抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターにクローンした。
抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターをレンチウイルスに包装し、ステップ（１）のｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーを得た。
（３）抗原発現細胞を構築した。
ＣＤ１９を発現した抗原発現細胞の調製は実施例１を参照し、この抗原発現細胞は抗ＣＤ１９抗体のポジティブスクリーニングに用いられ、１つの膜貫通ドメイン（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２０）のコード遺伝子を合成し、ポジティブスクリーニングベクターにおけるＣＤ１９抗原遺伝子を置換し、ネガティブスクリーニングに用いられる抗原発現ベクター（図１７）を得た。
構築した抗原発現ベクターをそれぞれレンチウイルスに包装し、ウイルスによりＫ５６２細胞にトランスフェクションし、トランスフェクションしてから２日間後に、培地に１μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えてスクリーニングし、ポジティブスクリーニング抗原発現細胞系およびネガティブスクリーニング抗原発現細胞系をそれぞれ得た。フローサイトメータにより青色蛍光タンパク質の発現がほぼ１００％に達したことを検出し（図１８）、抗原がＫ５６２細胞で安定して発現していることを示した。
（４）フローサイトメータでＣＤ１９抗体を発現した細胞をスクリーニングした。
抗体発現細胞ライブラリーとＣＤ１９抗原を発現したポジティブスクリーニング細胞とを１：１で混合し、混合細胞を２日間培養した後、抗体発現細胞ライブラリーに緑色蛍光タンパク質を発現した細胞が少量現れ（図１９）、抗体発現細胞ライブラリーとＣＤ１９抗原を発現したポジティブスクリーニング細胞とを混合して２日間培養した後、抗体発現細胞ライブラリーに緑色蛍光タンパク質を発現した細胞が少量現れ、選別型フローサイトメータで緑色蛍光タンパク質を発現した細胞を選別し、大部分の緑色蛍光が消えたまで培養し続けた。
更に、選別した抗体発現細胞ライブラリーとネガティブスクリーニング抗原発現細胞とを１：１で混合し、３日間後に、選別型フローサイトメータで緑色蛍光タンパク質と青色蛍光タンパク質との両方が陰性である細胞を選別し、すなわち、ＣＤ１９抗体を発現した細胞であり、この時の抗体発現細胞は、ネガティブスクリーニング抗原発現細胞と共培養する場合、緑色蛍光タンパク質の発現がなく、ＣＤ１９抗原発現細胞と共培養する場合、緑色蛍光タンパク質の発現があり（図２０）、ポジティブ・ネガティブスクリーニングを経た後の抗体発現細胞は、ネガティブスクリーニング抗原発現細胞と共培養する場合、緑色蛍光タンパク質の発現がなく、ＣＤ１９抗原発現細胞と共培養する場合、緑色蛍光タンパク質発現があった。
実施例３．抗体ライブラリーを調製し、薬剤でＣＤ１９抗体発現細胞をスクリーニングする
（１）ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系を構築した。
本実施例において、ｃｉｓアクティベーターはｐＴｅｔを用い、スクリーニングマーカーはｉＣａｓｐ９ネガティブスクリーニングシステム（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２１）、緑色蛍光タンパク質、ピューロマイシン耐性遺伝子を用い、３者の間は、自動的に破断可能な２Ａ配列で連結された。
人工合成によりコード配列全体を合成し（図２１）、レンチウイルスベクターに構築し、レンチウイルスを包装し、２９３Ｔ細胞にトランスフェクションし、３日間後にトランスフェクションした細胞をモノクローナル化し、スクリーニング待ちのモノクローナル細胞から、一部の細胞をそれぞれ取り出して実施例１におけるｔＴＡを発現したレンチウイルスをトランスフェクションし、２〜３日間後、蛍光顕微鏡で観察し、緑色蛍光の発現があるがトランスフェクションの前に蛍光の発現がない細胞系を選択し、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系であった。
（２）抗体発現細胞ライブラリーを構築した。
まず、後続に細胞外抗体ライブラリー遺伝子（図２２）を挿入するように、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターにおける細胞外抗体ライブラリーコーディング領域遺伝子以外の中間ベクターを構築し、中間ベクターの各構成部分の配列を人工合成し、Ｎ端からＣ端まで順に直列連結された部分は、それぞれｍＰＧＫ１プロモーター、ＣＤ８αシグナルペプチドコード配列、抗体遺伝子ライブラリーコーディング領域（β−ガラクトシダーゼ（ｌａｃＺ）のＮ端のα断片を有するコード領域配列であり、前はＡｓｃ Ｉ制限酵素部位で、後ろはＮｏｔ Ｉ制限酵素部位であり、抗体ライブラリー配列を挿入しやすく、且つ、青白斑で断片の挿入状況を示すことができる）、ＮＯＴＣＨ１断片のコード配列、ｔＴＡコード配列、ターミネーター、ＥＦＳプロモーター（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２２）、ブラストサイジン抗性（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２３）遺伝子、ターミネーターであった。
合成した配列をレンチウイルスベクターに構築し、抗体遺伝子ライブラリー配列を更に挿入するように準備した。Ｒａｊｉ細胞免疫マウスのｓｃＦｖライブラリーのＤＮＡ断片を、Ａｓｃ ＩおよびＮｏｔ Ｉにより二重酵素切断し、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターの中間ベクターのＡｓｃ ＩとＮｏｔ Ｉ制限酵素部位との間に挿入し、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターを取得し、抗体遺伝子ライブラリーの発現ベクターをレンチウイルスに包装し、ステップ（１）におけるｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を安定してトランスフェクションしたモノクローナル細胞系にトランスフェクションし、２日間後に、培地に１０μｇ／ｍＬのブラストサイジンを加えて初期スクリーニングを行い、抗体発現細胞ライブラリーを得た。
（３）薬剤でＣＤ１９抗体を発現した細胞をスクリーニングした。
抗体発現細胞ライブラリーとＣＤ１９抗原を発現したポジティブスクリーニング細胞とを１：１で混合し、混合細胞を２日間培養した後、培地に１μｇ／ｍＬのピューロマイシンを加えてスクリーニングし、６〜８日間のポジティブスクリーニングを経て、（ポジティブスクリーニングの原理図は図２３を参照する）、抗体ライブラリー発現細胞は、ほとんど緑色蛍光タンパク質を発現した細胞（図２４）であり、抗体ライブラリー発現細胞とＣＤ１９抗原を発現したポジティブスクリーニング細胞との混合細胞をピューロマイシンでポジティブスクリーニングし、抗体発現細胞は、ほとんど緑色蛍光タンパク質を発現した細胞であった。
更に、青色蛍光のポジティブスクリーニング抗原細胞が完全に消えたまで混合細胞の培地に１０μｇ／ｍＬのブラストサイジンを加え、ポジティブスクリーニングを経た後の抗体ライブラリー発現細胞を培養し続け、緑色蛍光タンパク質がほとんど発現しないまでになると、抗体ライブラリーの発現細胞とネガティブスクリーニング抗原の発現細胞とを１：１で混合し、培養した抗体発現細胞に緑色蛍光タンパク質（図２６）が発現しないまで、培地に１０ｎＭのＡＰ１９０３を加えてネガティブスクリーニング（ネガティブスクリーニングの原理図は図２５を参照する）を行い、抗体ライブラリー発現細胞とネガティブスクリーニング細胞との混合細胞をＡＰ１９０３でネガティブスクリーニングし、抗体発現細胞は、ほとんど緑色蛍光タンパク質を発現しない細胞であった。
最後に、青色蛍光のネガティブスクリーニング抗原細胞が完全に消えたまで混合細胞の培地に１０μｇ／ｍＬのブラストサイジンを加え、この場合、抗体ライブラリー発現細胞は、ＣＤ１９抗体を発現した細胞であった。
実施例４． 抗体結合性質の同定
（１）スクリーニングしたＣＤ１９抗体発現細胞の抗体コード配列をクローンした。
スクリーニングしたＣＤ１９抗体発現細胞を、ＤＮｅａｓｙ Ｂｌｏｏｄ ＆ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔゲノム抽出キット（Ｑｉａｇｅｎ）で、キットの操作マニュアルに従って細胞のゲノムを抽出し、抽出したゲノムをテンプレートとし、プライマーで（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２４、ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２５）に対してｓｃＦｖのコード遺伝子を増幅し、Ａｓｃ ＩおよびＮｏｔ Ｉで二重酵素切断した後、Ａｓｃ ＩおよびＮｏｔ Ｉで二重酵素切断した発現ベクターに挿入し、ヒトのＩｇＧ１定常領域（ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２６）と融合した（図２７）。
連結したベクターをコンピテント細胞にトランスフェクションし、１００ｍｇ／Ｌのアンピシリンを含むＬＢ固体培地のシャーレに塗り、翌日、シャーレから２０個程度のモノクローナルを選択し、それぞれ１００ｍｇ／Ｌアンピシリンを含むＬＢ液体培地に接種して振盪培養し、シャーレ上の残りのコロニーをＬＢ培地で溶出し、プラスミド抽出キットでキットの明細書に従ってポリクローナルのｓｃＦｖ発現プラスミドを抽出し、振盪培養したモノクローナル菌を一晩培養した後も、それぞれモノクローナルのｓｃＦｖ発現プラスミドを抽出した。
（２）抗体を発現して精製した。
それぞれポリクローナルのｓｃＦｖ発現プラスミドおよびモノクローナルのｓｃＦｖ発現プラスミドをＰＥＩで２９３Ｔ細胞にトランスフェクションし、トランスフェクションしてから７２時間後に、培養上清を収集し、培養上清と結合緩衝液とを１：１で混合し、濾過した後に使用に備え、まず、５〜１０倍体積の結合緩衝液でＰｔｅｏｅｉｎ Ａカラムをバランスさせ、次に、準備した培養上清のサンプルをサンプリングし、その後、結合液にタンパク質が含まれないまで結合緩衝液でカラムを洗い流し、最後に、溶出液に対してカラムクロマトグラフィーを行い、溶出液にタンパク質が含まれないまで溶出液を収集し、収集した抗体を透析して濃縮した。
（３）フローサイトメータで抗体の結合を検出した。
１００μＬのＣＤ１９を発現したおよびＣＤ１９を発現しないＫ５６２細胞懸濁液を、Ｖ型細胞プレートに敷き、５００ｇで３ｍｉｎ遠心し、細胞を沈積させ、上清を捨てて１００μＬの精製した抗体溶液（ＩｇＧの濃度を０．５μｇ／ｍＬと定量する）を加え、４℃で３０ｍｉｎインキュベートし、５００ｇで３ｍｉｎ遠心し、２００μＬのＰＢＳで３回洗浄した。
実験に従って孔を設計し、孔ごとに８０μｌのＦＩＴＣでマークされたヤギ抗ヒト二次抗体（１：１５０で希釈）を加え、４℃で３０ｍｉｎインキュベートし、５００ｇで３ｍｉｎ遠心し、上清を捨て、２００μＬのＰＢＳで３回洗浄し、最後の洗浄が終わった後、２００μＬのＰＢＳ懸濁細胞を加え、懸濁細胞を濾過メッシュで濾過した後、フローサイトメータで検出した結果、ポリクローナルのｓｃＦｖでもモノクローナルのｓｃＦｖでも、ＣＤ１９抗原を発現したＫ５６２細胞と異なる程度で特異的結合することができ（図２８）、スクリーニングにより得られたポリクローナルのｓｃＦｖでもモノクローナルのｓｃＦｖでも、ＣＤ１９抗原を発現したＫ５６２細胞と異なる程度で特異的結合することができ、ＣＤ１９抗原の発現がないＫ５６２細胞と結合しないことが示された。
以上をまとめ、本願は、抗体ライブラリーの構築方法およびその使用を提供し、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムが細胞内の遺伝子発現を制御する原理に基づいて設計され、大量の実験により、スキームのフロー全体を最適化し、繰り返し設計して検証し、ｓｙｎＮｏｔｃｈシステムの細胞外認識ドメインを抗体ライブラリーに変え、調整制御されたターゲット遺伝子をスクリーニングマーカー遺伝子に変えることで、複雑な抗原に対するポリクローナル抗体をスクリーニングする技術を得て、腫瘍抗原が複雑かつ多様であり、変化しやすく、使用可能な標的点が限られているという問題を解決し、広い応用の見通し及び巨大な市場価値を有する。
本願は、上記実施例により本願の詳細な方法について説明したが、本願は上記詳細な方法に限定されるものではなく、すなわち、本願は上記実施例に依存して実施しなければならないことを意味するものではないことを、出願人より声明する。当業者であれば、本願に対するいかなる改良、本本願の製品の各原料に対する等価的な置換および補助成分の追加、具体的な形態の選択等は、全て本願の保護範囲および開示範囲内に含まれることを理解すべきである。
（付記）
（付記１）
第１エレメントおよび第２エレメントを同一のベクターまたは異なるベクターに挿入し、前記ベクターを細胞内にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーである抗体ライブラリーを取得することを含む抗体ライブラリーの構築方法であって、
前記第１エレメントは、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含み、前記第２エレメントは、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインを含む、抗体ライブラリーの構築方法。
（付記２）
前記スクリーニングマーカー遺伝子は、薬剤耐性遺伝子、自殺遺伝子、蛍光タンパク質遺伝子、および分子タグのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１に記載の方法。
（付記３）
前記薬剤耐性遺伝子は、ピューロマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ブラストサイジン耐性遺伝子、およびハイグロマイシンＢ耐性遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
前記自殺遺伝子は、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ遺伝子、シトシンデアミナーゼ遺伝子、およびｉＣａｓｐ９自殺システム遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
前記蛍光タンパク質遺伝子は、ＥＧＦＰ、ＹＦＰ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ＤｓＲｅｄ、およびＢＦＰのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
前記分子タグは、Ｈｉｓ−ｔａｇ、Ｆｌａｇ−ｔａｇ、ＨＡ−ｔａｇ、Ｍｙｃ−ｔａｇ、およびＳｔｒｅｐ−ｔａｇのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記２に記載の方法。
（付記４）
前記スクリーニングマーカー遺伝子のスクリーニング方法は、薬剤スクリーニング、フローサイトメータによる検出と選別、および磁気ビーズ選別のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１〜３のいずれか１つに記載の方法。
（付記５）
前記薬剤耐性遺伝子のスクリーニング薬剤は、ピューロマイシン、Ｇ４１８、ブラストサイジン、およびハイグロマイシンＢのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
前記自殺遺伝子のスクリーニング薬剤は、ガンシクロビルまたはＦＩＡＵ、５−フルオロシトシン、ＡＰ１９０３、およびＡＰ２０１８７のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記３に記載の方法。
（付記６）
前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域は、抗体配列、抗体重鎖配列、抗体軽鎖配列、抗体可変領域配列、一本鎖抗体配列、単一ドメイン抗体配列、およびＦａｂ断片配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１〜５のいずれか１つに記載の方法。
（付記７）
前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域の由来は、免疫動物、患者、健康者、ワクチン接種者、および人工合成のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１〜６のいずれか１つに記載の方法。
（付記８）
前記Ｎｏｔｃｈコアドメインは、ヒトのＮｏｔｃｈ、マウスのＮｏｔｃｈ、またはヒトのＮｏｔｃｈもしくはマウスのＮｏｔｃｈとの類似性が８５％以上の配列を含み、
前記ヒトのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１に示すとおりであり、
前記マウスのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２に示すとおりである、付記１〜７のいずれか１つに記載の方法。
（付記９）
前記ｃｉｓアクティベーターは、ｐＴｅｔおよび／またはＵＡＳ−ｐＳＶ４０を含む、付記１〜８のいずれか１つに記載の方法。
（付記１０）
前記細胞内転写ドメインは、ｔＴＡおよび／またはＧａｌ４−ＶＰ６４を含む、付記１〜９のいずれか１つに記載の方法。
（付記１１）
前記トランスフェクションの方法は、ウイルストランスフェクション、化学トランスフェクション、試薬トランスフェクション、および電撃トランスフェクションのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１〜１０のいずれか１つに記載の方法。
（付記１２）
前記コーディング領域、ドメイン、または遺伝子は、コーディングタンパク質のアミノ酸配列、コーディングタンパク質のＤＮＡ配列、またはコーディングタンパク質のＲＮＡ配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、付記１〜１１のいずれか１つに記載の方法。
（付記１３）
付記１〜１２のいずれか１つに記載の方法で構築された抗体ライブラリー。
（付記１４）
（１）前記抗体ライブラリーと抗原とを接触するステップと、
（２）スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングするステップと、
を含む付記１３に記載の抗体ライブラリーを用いることで抗体をスクリーニングする方法であって、
前記抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を含み、
前記抗原は、野生型細胞、特定の抗原遺伝子をトランスフェクションした細胞、特定の抗原を結合した細胞、培地に溶解した抗原、培養皿に被覆された抗原、マイクロビーズに被覆された抗原、および培養足場に被覆された抗原のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、方法。
（付記１５）
付記１４に記載の方法でスクリーニングされた抗体。
（付記１６）
ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、
細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントと、
を含む、抗体をスクリーニングするためのシステム。
（付記１７）
ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントとを細胞にトランスフェクションすることと、
前記細胞に前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域を発現させることと、
前記細胞と抗原とを接触することと、
前記スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングすることにより、ターゲット抗体をスクリーニングすることと、
を含む、付記１６に記載のシステムを用いて抗体をスクリーニングする方法。

Claims (17)

  1. 第１エレメントおよび第２エレメントを同一のベクターまたは異なるベクターに挿入し、前記ベクターを細胞内にトランスフェクションし、抗体発現細胞ライブラリーである抗体ライブラリーを取得することを含む抗体ライブラリーの構築方法であって、
    前記第１エレメントは、ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含み、前記第２エレメントは、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域、Ｎｏｔｃｈコアドメイン、および細胞内転写ドメインを含む、抗体ライブラリーの構築方法。
  2. 前記スクリーニングマーカー遺伝子は、薬剤耐性遺伝子、自殺遺伝子、蛍光タンパク質遺伝子、および分子タグのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１に記載の方法。
  3. 前記薬剤耐性遺伝子は、ピューロマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子、ブラストサイジン耐性遺伝子、およびハイグロマイシンＢ耐性遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
    前記自殺遺伝子は、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ遺伝子、シトシンデアミナーゼ遺伝子、およびｉＣａｓｐ９自殺システム遺伝子のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
    前記蛍光タンパク質遺伝子は、ＥＧＦＰ、ＹＦＰ、ｍＣｈｅｒｒｙ、ＤｓＲｅｄ、およびＢＦＰのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
    前記分子タグは、Ｈｉｓ−ｔａｇ、Ｆｌａｇ−ｔａｇ、ＨＡ−ｔａｇ、Ｍｙｃ−ｔａｇ、およびＳｔｒｅｐ−ｔａｇのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項２に記載の方法。
  4. 前記スクリーニングマーカー遺伝子のスクリーニング方法は、薬剤スクリーニング、フローサイトメータによる検出と選別、および磁気ビーズ選別のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１〜３のいずれか１項に記載の方法。
  5. 前記薬剤耐性遺伝子のスクリーニング薬剤は、ピューロマイシン、Ｇ４１８、ブラストサイジン、およびハイグロマイシンＢのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含み、
    前記自殺遺伝子のスクリーニング薬剤は、ガンシクロビルまたはＦＩＡＵ、５−フルオロシトシン、ＡＰ１９０３、およびＡＰ２０１８７のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項３に記載の方法。
  6. 前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域は、抗体配列、抗体重鎖配列、抗体軽鎖配列、抗体可変領域配列、一本鎖抗体配列、単一ドメイン抗体配列、およびＦａｂ断片配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１〜５のいずれか１項に記載の方法。
  7. 前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域の由来は、免疫動物、患者、健康者、ワクチン接種者、および人工合成のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の方法。
  8. 前記Ｎｏｔｃｈコアドメインは、ヒトのＮｏｔｃｈ、マウスのＮｏｔｃｈ、またはヒトのＮｏｔｃｈもしくはマウスのＮｏｔｃｈとの類似性が８５％以上の配列を含み、
    前記ヒトのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１に示すとおりであり、
    前記マウスのＮｏｔｃｈのアミノ酸配列はＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２に示すとおりである、請求項１〜７のいずれか１項に記載の方法。
  9. 前記ｃｉｓアクティベーターは、ｐＴｅｔおよび／またはＵＡＳ−ｐＳＶ４０を含む、請求項１〜８のいずれか１項に記載の方法。
  10. 前記細胞内転写ドメインは、ｔＴＡおよび／またはＧａｌ４−ＶＰ６４を含む、請求項１〜９のいずれか１項に記載の方法。
  11. 前記トランスフェクションの方法は、ウイルストランスフェクション、化学トランスフェクション、試薬トランスフェクション、および電撃トランスフェクションのうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１〜１０のいずれか１項に記載の方法。
  12. 前記コーディング領域、ドメイン、または遺伝子は、コーディングタンパク質のアミノ酸配列、コーディングタンパク質のＤＮＡ配列、またはコーディングタンパク質のＲＮＡ配列のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の方法。
  13. 請求項１〜１２のいずれか１項に記載の方法で構築された抗体ライブラリー。
  14. （１）前記抗体ライブラリーと抗原とを接触するステップと、
    （２）スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングするステップと、
    を含む請求項１３に記載の抗体ライブラリーを用いることで抗体をスクリーニングする方法であって、
    前記抗体は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体を含み、
    前記抗原は、野生型細胞、特定の抗原遺伝子をトランスフェクションした細胞、特定の抗原を結合した細胞、培地に溶解した抗原、培養皿に被覆された抗原、マイクロビーズに被覆された抗原、および培養足場に被覆された抗原のうちのいずれか１種または少なくとも２種の組み合わせを含む、方法。
  15. 請求項１４に記載の方法でスクリーニングされた抗体。
  16. ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、
    細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントと、
    を含む、抗体をスクリーニングするためのシステム。
  17. ｃｉｓアクティベーターおよびスクリーニングマーカー遺伝子を含む第１エレメントと、細胞外抗体ライブラリーコーディング領域をコードする遺伝子、Ｎｏｔｃｈコアドメインをコードする遺伝子、および細胞内転写ドメインをコードする遺伝子を含む第２エレメントとを細胞にトランスフェクションすることと、
    前記細胞に前記細胞外抗体ライブラリーコーディング領域を発現させることと、
    前記細胞と抗原とを接触することと、
    前記スクリーニングマーカー遺伝子の発現状況に応じ、ターゲット抗体を発現した細胞をスクリーニングすることにより、ターゲット抗体をスクリーニングすることと、
    を含む、請求項１６に記載のシステムを用いて抗体をスクリーニングする方法。
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