JP2021123624A - 蛍光色素及びその利用 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】ローダミン類の基本骨格におけるキサンテン環の酸素原子がケイ素原子に置換された骨格を有する蛍光色素において、ケイ素原子をスピロ原子とするスピロ環構造を付与することにより、超解像顕微鏡法にも利用可能な新規な蛍光色素を得て、上記の課題を解決した。
【選択図】図1
Description
Aは、置換基を有していてもよいSiを含むC4〜C7の複素環を示し、
Xは、ヒドロキシ又は−NR1R2を示し、
Y1は、=O又は=N+R3R4を示し、
R1、R2、R3、R4、R5及びR6は、独立して、H、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル、又は置換基を有していてもよいC1〜C6のヘテロアルキルを示し、R1とR2、R3とR4、R1とR5、及びR3とR6の組み合わせの少なくとも一つは、それらが結合するNと一緒になって、置換基を有していてもよいNを含む複素環を形成していてもよく、
R7、R8、R9、R10及びR11は、独立して、H、ハロゲン、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルコキシ、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキルチオ、置換基を有していてもよいアミノ、置換基を有していてもよいアリール、置換基を有していてもよいヘテロアリール、−CO2H、−CO2 -、−SO3H、−SO3 -、及び−L−Rからなる群から選択され;
Lは、1〜16個の非水素原子を有する、直鎖、分岐鎖、環又はこれらの任意の組み合わせ構造の2価のリンカーであり、ここで、リンカー中に1以上のヘテロ原子が存在する場合、当該ヘテロ原子はエステル、アミン、アミド、エーテル、チオエーテル、カルボニルからなる群から独立して選択される1以上の基として含まれ;
Rは反応基であり;及び
R7、R8、R9、R10及びR11のうち隣り合う2つの基の1以上の組み合わせは共に環を形成していてもよい;
ただし、R1とR5、及びR3とR6の組み合わせの少なくとも一つが、それらが結合するNと一緒になって、置換基を有していてもよいNを含む複素環を形成し、かつR2及びR4が置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキルである化合物及びその互変異性体並びにその塩を除く。
本明細書で使用される略号は、当業者に周知の慣用的な略号である。本明細書では、下記の略号を使用する。
(A−taPhos)2PdCl2:ビス[ジ−tert−ブチル(4−ジメチルアミノフェニル)ホスフィン]ジクロロパラジウム(II)
1H−NMR:プロトン核磁気共鳴スペクトルメトリー
Bn:ベンジル
Boc:tert−ブトキシカルボニル
Bu:ブチル
DAST:三フッ化N,N−ジエチルアミノ硫黄
DCM:ジクロロメタン
DDQ:2,3−ジクロロ−5,6−ジシアノ−p−ベンゾキノン
DIPEA:N,N−ジイソプロピルエチルアミン
DMAP:N,N−ジメチル−4−アミノピリジン
DME:ジメトキシエタン
DMF:N,N−ジメチルホルムアミド
DMSO:ジメチルスルホキシド
HPLC:高速液体クロマトグラフィー
LC−MS:液体クロマトグラフィー−マススペクトルメトリー
MS:マススペクトルメトリー
m−:メタ
n−:ノルマル
NBS:N−ブロモスクシンイミド
NMP:N−メチル−2−ピロリドン
o−:オルト
p−:パラ
PPTS:ピリジニウムパラトルエンスルホナート
PyBOP:ヘキサフルオロリン酸(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウム
sec:セカンダリー
t−:ターシャリー
tert:ターシャリー
TBAF:フッ化テトラ−n−ブチルアンモニウム
TBS:ターシャリーブチルジメチルシリル
TEA:トリエチルアミン
Tf:トリフルオロメチルスルホニル
TFA:トリフルオロ酢酸
THF:テトラヒドロフラン
XPhos:2−ジシクロヘキシルホスフィノ−2’,4’,6’−トリイソプロピルビフェニル
本発明者らは、Siローダミン骨格を有する蛍光色素において、Si原子をスピロ原子とするスピロ環構造を付与すると、当該蛍光色素のデューティサイクル(duty cycle)が低下することを見出した。デューティサイクルとは、実験例2で述べるように、蛍光色素の明滅持続時間に対する発光時間の合計の比率をいう。デューティサイクルが小さいと、蛍光色素はより散発的に発光するので、当該蛍光色素の1分子発光を検出しやすくなる。よって、デューティサイクルの小さい蛍光色素は、超解像顕微鏡法に適している。本発明者らは、このようなSiローダミン骨格を有する蛍光色素のデューティサイクルを低下させる技術により、上記の式(I)で示される化合物もしくはその互変異性体、又はその塩からなる本実施形態の蛍光色素を得た。
次に、式(I)の化合物又はその塩の合成法について説明する。
スキーム3−3
本発明の範囲には、本実施形態の蛍光色素と複合化物質が結合した標識複合化物質も含まれる。ここで、複合化物質とは、本実施形態の蛍光色素と共有結合的に結合できる物質をいう。複合化物質としては、例えば、表面(例えばビーズ、固体担体、樹脂、粒子又はアッセイプレート)、生物学的分子もしくは生体分子(例えばタンパク質、ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、DNA及びRNAを含む核酸、酵素の基質、抗体、ナノボディ、ポリペプチド、ポリペプチド系毒素、アミノ酸、脂質、炭水化物、ハプテン、金属キレート剤等のイオン錯体化剤、微粒子、合成ポリマーもしくは天然ポリマー、細胞、ウイルス、他の蛍光分子もしくは表面)、小分子(例えば薬剤、薬剤化合物)、又は例えばクロロアルカンもしくはシアノベンゾチアゾール等の他の関心ある部分である。他の好適な複合化物質には、ランタニド錯体化グループ;ニッケル錯体化グループ;コバルト錯体化グループ;エチレンジアミン四酢酸;ニトリロ三酢酸;ヌクレオチド;酵素の基質;酵素の阻害剤、好ましくは酵素と共有結合を形成する不可逆性の酵素の阻害剤;受容体のアゴニスト;10μM以上のKDで核酸に結合するリガンド;10μM以上のKDでタンパク質に結合するリガンド;SNAP−タグの基質;CLIP−タグの基質;Halo−タグの基質、ジヒドロ葉酸還元酵素に結合するリガンド;メトトレキサート;トリメトプリム;ビオチンリガーゼの基質;リンペプチド転移酵素の基質;リポ酸リガーゼの基質;ビオチン;ストレプトアビジン、アビジン又はニュートラアビジンに結合するリガンド;酵素の補助因子;ホルモン;毒素;フルオロフォア;核酸ポリマー;ハプテン;抗原;薬剤;脂質;脂質アセンブリ;非生物有機ポリマー;ポリマー微粒子;動物細胞、植物細胞;細菌、酵母;ウイルス;及び原生生物が含まれるが、これらに限定されない。好ましい実施形態では、複合化物質はタンパク質又は核酸である。
本発明の範囲には、本実施形態の蛍光色素又は標識複合化物質を含む組成物も含まれる(以下、単に組成物ともいう)。本実施形態の組成物は、超解像顕微鏡法に用いられる試薬組成物であってもよい。超解像顕微鏡法とは、光の回折限界を超えた分解能を有する顕微鏡である超解像顕微鏡を用いたイメージング技術であり、当該技術分野において公知である。
本発明の範囲には、本実施形態の蛍光色素又は標識複合化物質を被検物質と結合させ、超解像顕微鏡法により該被検物質に関する情報を取得する方法も含まれる(以下、情報取得方法ともいう)。この方法では、公知の超解像顕微鏡を用いることができる。例えば、HM-1000 (シスメックス株式会社)などが挙げられる。上述のように、本実施形態の蛍光色素は自発的に明滅する性質を有するので、本実施形態の情報取得方法は、超解像顕微鏡法のうち、局在化顕微鏡法に適している。
s:シングレット、d:ダブレット、t:トリプレット、q:カルテット、quin:クインテット、m:マルチプレット、br.s.:ブロードシングレット。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.61(s,9H),1.61(s,9H),7.70(s,1H),7.94(s,1H).
4−メチル−2−(トリフルオロメチル)安息香酸(1.36g,6.66mmol,CAS No.120985−64−0)の硫酸(7.10mL,133mmol)溶液にNBS(1.19g,6.66mmol)を加え、室温で一晩撹拌した。氷浴下、反応混合物に氷を加え反応を停止させた。発生した固体を回収することで標記化合物の粗生成物(2.49g)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):2.47(s,3H),7.86(s,1H),8.02(s,1H).
製造例2−(1)で得た化合物(2.29g)、ピリジン(13.7mL,170mmol)及び水(45.8mL)の混合物に過マンガン酸カリウム(3.84g,24.3mmol)を加え、50℃で2.3時間撹拌した。さらに水(100mL)を加え50℃で4.2時間撹拌した。さらに過マンガン酸カリウム(10.8g,68.4mmol)を加え、50℃で4.5時間撹拌した。室温まで冷却した後、不溶物を濾過した。不溶物を希ピリジン水溶液で洗浄し、溶出物にジメチルスルフィドを加えた。新たに発生した不溶物を濾過し、溶出物を減圧下50℃で濃縮した。得られた残渣を水(10.0mL)に溶解し、氷浴下濃塩酸を加えた。発生した固体を回収することで標記化合物の粗生成物(2.74g)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):8.12(s,1H),8.15(s,1H).
製造例2−(2)で得た化合物(2.74g)、二炭酸ジ−tert−ブチル(7.64g,35.0mmol)、DMAP(214mg,1.75mmol)、トルエン(28.0mL)及びDMF(2.80mL)の混合物を80℃で2時間撹拌した。さらにDMAP(214mg,1.75mmol)と二炭酸ジ−tert−ブチル(7.64g,35.0mmol)を加え、80℃で3.5時間撹拌した。さらに二炭酸ジ−tert−ブチル(3.00g,13.8mmol)加え、80℃で1.5時間撹拌した。室温まで冷却した後、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(1.66g,3.90mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.58(s,9H),1.62(s,9H),7.95(s,1H),7.98(s,1H).
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.59(s,9H),1.61(s,9H),7.42(d,J=10.54Hz,1H),8.07(d,J=6.64Hz,1H).
ビス(2−ブロモ−4−((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)フェニル)メタン(4.95g,8.44mmol,CAS No.1383118−97−5)のTHF(49.8mL,608mmol)溶液にsec−ブチルリチウム(1.05Mシクロヘキサン−ヘキサン溶液,22.9mL,24.1mmol)を−78℃で20分かけて滴下した。同温で1時間撹拌した後、シクロペンタメチレンジクロロシラン(2.71g,16.0mmol, CAS No. 2406−34−0)のTHF(19.5mL)溶液を10分かけて滴下した。室温にて1時間30分間撹拌した後、氷及び飽和塩化アンモニウム水溶液を加え、反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(3.68g,7.01mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):0.22(s,12H),1.01(s,18H),1.02−1.06(m,4H),1.66(br.s.,2H),1.92−2.03(m,4H),3.95(s,2H),6.79(dd,J=8.40,2.54Hz,2H),7.15−7.20(m,4H).
製造例4−(1)の方法で得た化合物(10.1g,19.2mmol)のアセトン(505mL)溶液を13mm試験管101本に分注した。氷浴下、各試験管に過マンガン酸カリウム(81.3mg,514μmol、合計8.21g,51.9mmol)を加えた。室温で一晩撹拌した後、各試験管にDCMを加えた。生じた不溶物を濾過し、溶出物を一つのナスフラスコに集めた。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで、標記化合物(1.97g,6.35mmol)を得た。
ESI−MS m/z 311[M+H]+
製造例4−(2)で得た化合物(590mg,1.90mmol)のDMF(10.0mL)溶液に、イミダゾール(776mg,11.4mmol)及びtert−ブチルジメチルシリルクロリド(859mg,5.70mmol)を加えた。室温で一晩撹拌した後、氷を加えて反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で3回洗浄した。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することにより標記化合物(954mg,1.77mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):0.27(s,12H),1.02(s,18H),0.99−1.05(m,4H),1.71(br.s.,2H),1.96−2.07(m,4H),6.99(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),7.22(d,J=2.73Hz,2H),8.36(d,J=8.59Hz,2H).
tert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート及び10−オキソ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−3,7−ジイルビス(トリフルオロメタンスルホナート)の合成
窒素雰囲気下、ジ−tert−ブチル 2−ブロモテレフタラート(1.54g,4.31mmol,CAS No.1456885−46−3)のTHF(20.0mL)/n−ヘキサン(10.0mL)混合溶液に、内温−95℃以下でn−ブチルリチウム(2.65Mヘキサン溶液、1.62mL,4.31mmol)を滴下した。同温で10分間撹拌した後、製造例4−(3)で得られた3,7−ビス((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(580mg,1.08mmol)のTHF(10.0mL)溶液を内温−95℃以下で滴下した。同温で5分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体(273μL,2.15mmol)を滴下した。反応混合物を徐々に室温まで昇温させ、室温で6時間撹拌撹拌した。氷浴下、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を留去することで付加体を含む混合物を得た。得られた混合物にTHF(10.0mL)及びテトラブチルアンモニウムフルオリド(1.00M THF溶液,5.38mL,5.38mmol)を加え、室温で7時間撹拌した。氷浴下、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を減圧下濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物を、3,7−ジヒドロキシ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オンとの混合物(670mg)として得た。
ESI−MS m/z 515[M+H]+ (保持時間 1.48分)
ESI−MS m/z 311[M+H]+ (保持時間 1.18分)
製造例5−(1)で得られた混合物(670mg)のDCM(10.0mL)溶液に、氷浴下ピリジン(1.05mL,13.0mmol)及びトリフルオロメタンスルホン酸無水物(1.09mL,6.51mmol)を加えた。室温で一晩撹拌した後、氷水を加えて反応を停止させた。水層をDCMで抽出し、有機層を1N塩酸及び水で洗浄した。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで、tert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(472mg,606μmol)及び10−オキソ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−3,7−ジイルビス(トリフルオロメタンスルホナート)(197mg,343μmol)を得た。
tert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.27−1.31(m,2H),1.32−1.39(m,2H),1.58(s,9H).1.79(br.s.,2H),2.05−2.18(m,4H),7.19−7.24(m,2H),7.28−7.35(m,2H),7.73(d,J=2.73Hz,2H),7.92(s,1H),8.03(d,J=7.42Hz,1H),8.21(dd,J=8.20,1.17Hz,1H).
10−オキソ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−3,7−ジイルビス(トリフルオロメタンスルホナート)
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.06−1.17(m,4H),1.76(br.s.,2H),2.04(br.s.,4H),7.48(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),7.70(d,J=2.73Hz,2H),8.53(d,J=8.59Hz,2H).
tert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキシラートの合成
窒素雰囲気下、ジ−tert−ブチル 4−ブロモイソフタラート(374mg,1.05mmol,CAS No.1431377−56−8)のTHF(10.0mL)/n−ヘキサン(5.00mL)混合溶液に、内温−95℃以下でn−ブチルリチウム(2.65M ヘキサン溶液、395μL,1.05mmol)を滴下した。同温で10分間撹拌した後、製造例4−(3)で得られた3,7−ビス((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(94.0mg,174μmol)のTHF(5.00mL)溶液を内温−95℃以下で滴下した。同温で10分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体(44.0μL,349μmol)を滴下した。反応混合物を−78℃に昇温させ、同温で2時間撹拌した。反応混合物を−45℃に昇温させ、同温で1時間20分撹拌した。反応混合物を−20℃に昇温させ、同温で30分間撹拌した。反応混合物を0℃に昇温させ、同温で30分間撹拌した。原料の消失を確認した後、氷水と飽和塩化アンモニウム水溶液を加えて反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で洗浄した。溶媒を留去することで付加体を含む混合物を得た。得られた混合物をTHF(5.00mL)に溶解し、氷浴下テトラブチルアンモニウムフルオリド(1.00M THF溶液,872μL,872μmol)を加えた。反応混合物を室温で4時間撹拌した。氷浴下、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を飽和塩化アンモニウム水溶液、水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(62.0mg,120μmol)を得た。
ESI−MS m/z 515[M+H]+
製造例5−(2)に準じ、製造例6−(1)で得た化合物(62.0mg,120μmol)から標記化合物(31.0mg,40.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.26−1.33(m,4H),1.63(s,9H),1.78(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.16(br.s.,2H),7.16−7.20(m,4H),7.42−7.47(m,1H),7.73(d,J=2.34Hz,2H),8.40(dd,J=8.20,1.56Hz,1H),8.59−8.64(m,1H).
tert−ブチル 5−クロロ−3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートの合成
窒素雰囲気下、製造例1で得たジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−クロロテレフタラート(945mg,2.41mmol)のTHF(20.0mL)/n−ヘキサン(10.0mL)混合溶液に、内温−95℃以下でn−ブチルリチウム(2.65Mヘキサン溶液、910μL,2.41mmol)を滴下した。同温で10分間撹拌した後、製造例4−(3)で得た3,7−ビス((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(130mg,241μmol)のTHF(10.0mL)溶液を内温−95℃以下で滴下した。同温で5分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体(61.0μL,482μmol)を滴下した。反応混合物を徐々に室温まで昇温させ、室温で一晩撹拌した。氷を加えて反応を停止させ、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を留去することで付加体を含む混合物を得た。得られた混合物にTHF(10.0mL)及びテトラブチルアンモニウムフルオリド(1.00M THF溶液,1.21mL,1.21mmol)を加え、室温で一晩撹拌した。氷及び飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で洗浄した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(119mg,217μmol)を得た。
ESI−MS m/z 549[M+H]+
製造例7−(1)で得た化合物(119mg,217μmol)、DCM(5.00mL)及びピリジン(140μL,1.73mmol)の混合物に、氷浴下トリフルオロメタンスルホン酸無水物(142μL,867μmol)を滴下した。室温に昇温し、2.5時間撹拌した。氷を加えて反応を停止し、水層をDCMで抽出した。有機層を希塩酸及び水で洗浄し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(128mg,157μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.22−1.33(m,4H),1.60(s,9H),1.78(br.s.,2H),2.03(br.s.,2H),2.08−2.19(m,2H),7.22−7.25(m,4H),7.64(s,1H),7.73(d,J=2.34Hz,2H),8.04(s,1H).
tert−ブチル 5−メチル−3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートの合成
窒素雰囲気下、製造例1の方法で得たジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−クロロテレフタラート(4.27g,10.9mmol)のTHF(50.0mL)/n−ヘキサン(25.0mL)混合溶液に、内温−95℃以下でn−ブチルリチウム(2.65Mヘキサン溶液、4.11mL,10.9mmol)を滴下した。同温で10分間撹拌した後、製造例4−(3)で得た3,7−ビス((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(587mg,1.09mmol)のTHF(25.0mL)溶液を内温−95℃以下で滴下した。同温で5分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体(276μL,2.18mmol)を滴下した。反応混合物を徐々に室温まで昇温させ、室温で5.5時間撹拌撹拌した。氷及び飽和塩化アンモニウム水溶液を加えて反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で洗浄した。溶媒を留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(純度53%,1.58g,1.08mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):0.21(s,12H),0.98(s,18H),1.16−1.23(m,4H),1.61(s,9H),1.73(br.s.,2H),2.00(br.s.,2H),2.07−2.18(m,2H),6.72(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.90(d,J=8.59Hz,2H),7.29(d,J=2.73Hz,2H),7.57(s,1H),7.98(s,1H).
窒素雰囲気下、製造例8−(1)で得た化合物(純度53%,100mg,68.0μmol)、トリメチルボロキシン(48.0μL,341μmol)、(A−taPhos)2PdCl2(19.3mg,27.0μmol)、1N炭酸カリウム水溶液(341μL,341μmol)及び1,4−ジオキサン(3.00mL)の混合物を、マイクロ波照射装置にて180℃で10分間撹拌した。室温まで冷却し、酢酸エチルで希釈した。有機層を水及び飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去することで中間体を得た。この中間体をTHF(5.00mL)に溶解し、テトラブチルアンモニウムフルオリド(1M THF溶液、341μL,341μmol)を加えた。反応混合物を室温で1.5時間撹拌した後、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で二回洗浄した。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(19.0mg,36.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 529[M+H]+
製造例5−(2)に準じ、製造例8−(2)の方法で得られる化合物(97.0mg,183μmol)から標記化合物(80.0mg,101μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.28−1.34(m,4H),1.58(s,9H),1.78(br.s.,2H),2.04(br.s.,2H),2.13(br.s.,2H),2.67(s,3H),7.18−7.23(m,2H),7.27−7.31(m,2H),7.72(d,J=2.73Hz,2H),7.73(s,1H),7.85(s,1H).
ESI−MS m/z 449[M+H]+
4,4’−メチレンビス(3−ブロモ−N,N−ジメチルアニリン)(500mg,1.21mmol,CAS No.63594−70−7)のTHF(15.0mL)溶液にsec−ブチルリチウム(1.00Mシクロヘキサン−ヘキサン溶液,3.46mL,3.46mmol)を−78℃で20分かけて滴下した。同温で30分間撹拌した後、シクロペンタメチレンジクロロシラン(390mg,2.31mmol)のTHF溶液を滴下した。室温で3.5時間撹拌した後、氷及び飽和塩化アンモニウム水溶液を加え反応を停止させた。水層をDCMで抽出し、有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(292mg,833μmol)を得た。
ESI−MS m/z 351[M+H]+
製造例10−(1)で得られた化合物(232mg,662μmol)のアセトン(20.0mL)溶液に、氷浴下過マンガン酸カリウム(282mg,1.79mmol)を30分間かけて加えた。同温で1時間撹拌した後、DCMで希釈した。生じた不溶物をセライト濾過で除いた。溶出物を室温以下で減圧下濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(82.0mg,225μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):0.98−1.10(m,4H),1.72(br.s.,2H),2.00−2.10(m,4H),3.11(s,12H),6.85(dd,J=9.18,2.93Hz,2H),6.98(d,J=2.73,2H),8.40(d,J=9.37Hz,2H).
ESI−MS m/z 365[M+H]+
製造例10−(1)に準じ、4,4’−メチレンビス(3−ブロモ−N,N−ジメチルアニリン)(500mg,1.21mmol)とシクロテトラメチレンジクロロシラン(357mg,2.31mmol, CAS No. 2406−33−9)から、標記化合物(286mg,850μmol)を得た。
ESI−MS m/z 337[M+H]+
製造例10−(2)に準じ、製造例11−(1)で得た化合物(276mg,820μmol)から、標記化合物(115mg,328μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.04−1.11(m,4H),1.91−2.00(m,4H),3.09(s,12H),6.75(d,J=3.12Hz,2H),6.85(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),8.40(d,J=8.98Hz,2H).
ESI−MS m/z 351[M+H]+
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.06−1.21(m,16H),1.46−1.58(m,2H),1.74−1.85(m,4H),3.32(q,J=7.03Hz,8H),6.69(ddd,J=8.30,2.83,0.98Hz,2H),6.81−6.91(m,4H),7.20(dd,J=8.40,7.22Hz,2H).
ESI−MS m/z 395[M+H]+
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.13−1.23(m,4H),1.46−1.56(m,2H),1.74−1.85(m,4H),1.94−2.04(m,8H),3.22−3.32(m,8H),6.54−6.62(m,2H),6.78(d,J=2.34Hz,2H),6.85(d,J=7.03Hz,2H),7.21(dd,J=8.20,7.03Hz,2H).
7−ブロモ−1,2,3,4−テトラヒドロキノリン(10.6g,50.0mmol,CAS No.114744−51−3)、炭酸カリウム(27.6g,200mmol)、アリルブロミド(12.1g,100mmol)及びDMF(20.0mL)の混合物を室温で24時間撹拌した。反応混合物に水を加えて反応を停止させ、酢酸エチル及び飽和食塩水を加えた。分取した有機層を合わせ、水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し標記化合物(12.4g,49.2mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.89−1.98(m,2H),2.69(t,J=6.25Hz,2H),3.24−3.29(m,2H),3.83(dt,J=4.88,1.66Hz,2H),5.15(t,J=1.56Hz,1H),5.17−5.21(m,1H),5.74−5.89(m,1H),6.60−6.68(m,2H),6.77(d,J=7.81Hz,1H).
製造例12に準じ、製造例14−(1)で得た化合物(5.04g,20.0mmol)から標記化合物(2.30g,5.20mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.03−1.14(m,4H),1.43−1.53(m,2H),1.67−1.84(m,4H),1.88−2.01(m,4H),2.75(t,J=6.44Hz,4H),3.19−3.31(m,4H),3.84(dt,J=5.47,1.56Hz,4H),5.06−5.21(m,4H),5.81(ddt,J=17.13,10.30,5.22Hz,2H),6.70−6.81(m,4H),6.92(d,J=7.42Hz,2H).
ジ−tert−ブチル 2−ブロモテレフタラート(3.57g,10.0mmol)、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)(1.16g,1.00mmol)、トリ−n−ブチル(1−プロペニル)チン(4.30g,13.0mmol)及びNMP(10.0mL)の混合物を120℃で4時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製しジ−tert−ブチル 2−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(2.90g,9.11mmol)を幾何異性体の混合物として得た。
ジ−tert−ブチル 2−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(2.87g,9.00mmol)、1,4−ジオキサン(80.0mL),水(20.0mL)、2,6−ルチジン(2.09mL,18.0mmol)及び四酸化オスミウム(4%水溶液、1.43mL,225μmol)の混合物に、過ヨウ素酸ナトリウム(5.78g,27.0mmol)を加え、室温で18時間撹拌した。反応混合物に水及びDCMを加え、室温で5分間撹拌した。フェーズセパレーターで有機層を分取し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し標記化合物(1.45g,4.73mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.62(s,9H),1.62(s,9H),7.91(d,J=8.59Hz,1H),8.17−8.25(m,1H),8.43(d,J=1.17Hz,1H),10.56(s,1H).
製造例15−(1)で得た化合物(1.38g,4.50mmol)のDCM(20.0mL)溶液にTFA(3.47mL)を加え、室温で18時間撹拌した。溶媒を減圧留去することで標記化合物(874mg,4.50mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.67(s,1H),7.96(d,J=8.20Hz,1H),8.12−8.16(m,1H),8.19(dd,J=8.01,1.37Hz,1H).
ESI−MS m/z 193[M−H]-
製造例15−(1)に準じ、ジ−tert−ブチル 4−ブロモイソフタラート(1.18g,3.30mmol)からジ−tert−ブチル 4−(プロパ−1−エン−1−イル)イソフタラート(1.05g,3.30mmol)を幾何異性体の混合物として得た。製造例15−(1)に準じ、ジ−tert−ブチル 4−(プロパ−1−エン−1−イル)イソフタラート(955mg,3.00mmol)から標記化合物(610mg,1.99mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.62(s,9H),1.64(s,9H),7.90(d,J=8.20Hz,1H),8.16−8.21(m,1H),8.49(d,J=1.17Hz,1H),10.63(d,J=0.78Hz,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例16−(1)で得た化合物(582mg,1.90mmol)から標記化合物(369mg,1.90mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.68−6.77(m,1H),7.76−7.86(m,1H),8.20−8.27(m,1H),8.29−8.37(m,2H),13.53(br.s.,1H).
ESI−MS m/z 193[M−H]-
製造例15−(1)に準じ、製造例3の方法で得られるジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−フルオロテレフタラート(2.26g,6.02mmol)から標記化合物(935mg,2.88mmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.63(s,9H),1.65(s,9H),7.60(d,J=10.54Hz,1H),8.40(d,J=7.03Hz,1H),10.53(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例17−(1)の方法で得られる化合物(163mg,503μmol)から標記化合物の粗生成物(119mg)を得た。
ESI−MS m/z 211[M−H]-
製造例15−(1)に準じ、製造例1の方法で得られるジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−クロロテレフタラート(568mg,1.45mmol)からジ−tert−ブチル 2−クロロ−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(405mg,1.15mmol)を幾何異性体の混合物として得た。
製造例15−(1)に準じ、2−クロロ−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(388mg,1.10mmol)から標記化合物(330mg,968μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.61(s,9H),1.63(s,9H),7.91(s,1H),8.18(s,1H),10.54(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例18−(1)で得た化合物(324mg,950μmol)から標記化合物(217mg,949μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.66(br.s.,1H),7.94(s,1H),8.31(br.s.,1H).
ESI−MS m/z 227[M−H]-
ジ−tert−ブチル 2,5−ジブロモテレフタラート(872mg,2.00mmol,CAS#868158−34−3)、トリ−n−ブチル(1−プロペニル)チン(728mg,2.20mmol)、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)(231mg,200μmol)及びNMP(4.00mL)の混合物を、120℃で3時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することでジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(710mg,1.79mmol)を幾何異性体の混合物として得た。
製造例15−(1)に準じ、ジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(695mg,1.75mmol)から標記化合物(220mg,571μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.62(s,9H),1.63(s,9H),8.12(s,2H),10.54(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例19−(1)で得た化合物(212mg,550μmol)から標記化合物(150mg,549μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.68(br.s,1H),7.92(br.s.,1H),8.13(s,1H),8.35(br.s.,1H).
ESI−MS m/z 271[M−H]-
製造例19−(1)で得られたジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−ホルミルテレフタラート(308mg,800μmol)のDCM(3.00mL)溶液に、氷浴下DAST(262μL,2.00mmol)を滴下した。反応混合物を室温で12時間撹拌した後、氷浴下、飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加えることで反応停止させた。混合物にジクロロメタン及び飽和炭酸水素ナトリウム水溶液を加え、室温で5分撹拌した。有機層をフェーズセパレーターで分取し、溶出物を減圧下濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(301mg,739μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.61(s,9H),1.62(s,9H),7.39(t,J=55.45Hz,1H),8.00(s,1H),8.15(s,1H).
製造例15−(1)に準じ、製造例20−(1)の方法で得られる化合物(326mg,800μmol)から標記化合物(132mg,370μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.52(s,9H),1.55(s,9H),7.38(t,J=55.06Hz,1H),8.17(s,1H),8.26(s,1H),10.50(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例20−(2)で得た化合物(128mg,360μmol)から標記化合物(88.0mg,360μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.78(d,J=8.20Hz,1H),7.62(t,J=54.87Hz,1H),8.07(s,1H),8.17(s,1H),8.43(d,J=8.20Hz,1H).
製造例19−(1)で得たジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−ホルミルテレフタラート(385mg,1.00mmol)のTHF(5.00mL)溶液に、氷浴下水素化ホウ素ナトリウム(37.8mg,1.00mmol)を加えた。反応混合物を同温で1時間撹拌した後、飽和塩化アンモニウム水溶液とジクロロメタンを加え、5分間撹拌した。有機層をフェーズセパレーターで分取し、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(287mg,741μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.61(s,9H),1.61(s,9H),3.62(t,J=7.22Hz,1H),4.73(d,J=7.42Hz,2H),7.72(s,1H),8.10(s,1H).
製造例21−(1)で得た化合物(271mg,700μmol)のDCM(5.00mL)溶液に、氷浴下トリフェニルホスフィン(275mg,1.05mmol)及び四臭化炭素(464mg,1.40mmol)を加えた。同温で2時間撹拌した後、反応混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し、標記化合物(230mg,511μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.62(s,9H),1.63(s,9H),4.85(s,2H),7.68(s,1H),8.08(s,1H).
製造例21−(2)で得た化合物(221mg,490μmol)のジクロロメタン(3.00mL)溶液に、氷浴下ナトリウムメトキシド(28%メタノール溶液、177μL,735μmol)を滴下した。同温で2時間撹拌した後、反応混合物にTHF(3.00mL)を加え、同温でさらに3時間撹拌した。反応混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(46.0mg,115μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.59(s,9H),1.61(s,9H),3.46(s,3H),4.74(s,2H),7.86(s,1H),8.04(s,1H).
製造例15−(1)に準じ、製造例21−(3)で得た化合物(45.0mg,112μmol)からジ−tert−ブチル 2−(メトキシメチル)−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(32.0mg,88.0μmol)を幾何異性体の混合物として得た。
製造例15−(1)に準じ、ジ−tert−ブチル 2−(メトキシメチル)−5−(プロパ−1−エン−1−イル)テレフタラート(30.0mg,83.0μmol)から標記化合物(28.0mg,80.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.61(s,9H),1.63(s,9H),3.51(s,3H),4.87(s,2H),8.12(s,1H),8.32(s,1H),10.53(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例21−(4)で得た化合物(27.0mg,77.0μmol)から標記化合物(18.0mg,76.0μmol)を、互変異性体の混合物として得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):3.37(s,3H),4.78(s,2H),6.70(d,J=8.20Hz,1H),7.93(s,1H),7.99(s,1H),8.27(d,J=8.20Hz,1H),13.59(br.s.,1H).
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):3.40(s,3H),4.83(s,2H),8.10(s,1H),8.22(s,1H),10.45(s,1H),13.59(br.s.,1H).
製造例15−(1)に準じ、製造例2−(3)の方法で得られるジ−tert−ブチル 2−ブロモ−5−(トリフルオロメチル)テレフタラート(205mg,482μmol)から標記化合物(165mg,441μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.55(s,9H),1.59(s,9H),8.13(s,1H),8.23(s,1H),10.63(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例22−(1)で得た化合物(165mg,441μmol)から、標記化合物(125mg,453μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):3.59(s,3H),6.67(s,1H),8.13(s,1H),8.26(s,1H).
ESI−MS m/z 275[M−H]-
製造例22−(2)で得た化合物(125mg,453μmol)のメタノール(1.00mL)溶液に5N塩酸(10.0mL,50.0mmol)を加え、110℃で2.5時間撹拌した。室温に戻したのち、溶媒を減圧留去することで標記化合物(103mg,393μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):6.81(br.s.,1H),8.06(s,1H),8.21(s,1H).
ESI−MS m/z 261[M−H]-
製造例17−(1)で得たジ−tert−ブチル 2−フルオロ−5−ホルミルテレフタラート(120mg,370μmol)のTHF(3.00mL)溶液に、氷浴下ナトリウムメトキシド(5.4Mメタノール溶液、72.0μL,388μmol)を加えた。同温で2時間撹拌した後、室温で1時間撹拌した。少量の酢酸を加えて反応を停止させ、酢酸エチルで希釈した。混合物を水で洗浄し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(27.0mg,92.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.59(s,9H),3.63(s,3H),3.95(s,3H),6.26(s,1H),7.38(s,1H),7.78(s,1H).
製造例22−(3)に準じ、製造例23−(1)で得た化合物(27.0mg,92.0μmol)から標記化合物を含む混合物(19.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 225[M+H]+
製造例17−(1)で得たジ−tert−ブチル 2−フルオロ−5−ホルミルテレフタラート(120mg,370μmol)のTHF(5.00mL)溶液にナトリウムメタンチオラート(31.3mg,444μmol)を加え、室温で一晩撹拌した。反応混合物を酢酸エチルで希釈し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥し、溶媒を減圧留去することで標記化合物の粗生成物(139mg)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.62(s,9H),1.63(s,9H),2.53(s,3H),7.68(s,1H),8.42(s,1H),10.47(s,1H).
製造例15−(2)に準じ、製造例24−(1)で得た化合物(137mg)から標記化合物の粗生成物(132mg)を互変異性体の混合物として得た。
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):2.51(s,3H),6.67(s,1H),7.72(s,1H),8.03(s,1H).
1H−NMR(400MHz,DMSO−d6)δ(ppm):2.50(s,3H),7.65(s,1H),8.31(s,1H),10.35(s,1H).
ESI−MS m/z 239[M−H]-
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
製造例5−(2)で得られたtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(100mg,128μmol)、アゼチジン(20.5mg,360μmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(11.8mg,13.0μmol)、XPhos(18.4mg,39.0μmol)、炭酸セシウム(117mg,360μmol)及び1,4−ジオキサン(5.00mL)の混合液を、窒素雰囲気下、封管中110℃で4.5時間撹拌した。不溶物を濾過し、ろ液を濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(62.0mg,105μmol)を得た。
ESI−MS m/z 593[M+H]+
実施例1−(1)で得た化合物(62.0mg,105μmol)のDCM(2.00mL)溶液に、TFA(200μL)を加え、室温で一晩撹拌した。溶媒を減圧留去し、残存のTFAをメタノールで共沸除去することで標記化合物の粗生成物(70.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 537[M+H]+
実施例1−(2)の方法で得られる化合物(15.0mg)のDMF(1.00mL)溶液に、TEA(19.0μL,138μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(13.5mg,53.0μmol)及びPyBOP(18.0mg,35.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した後、混合物を直接逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。目的物を含むフラクションを回収し、余剰のアセトニトリルを減圧留去した。残渣の水層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(10.3mg,16.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.16−1.26(m,4H),1.71(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.10(br.s.,2H),2.31−2.44(m,4H),3.61−3.69(m,2H),3.76−3.84(m,2H),3.90(t,J=7.42Hz,8H),6.25(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.72(s,2H),6.75−6.80(m,1H),6.77(d,J=8.59Hz,2H),6.84(d,J=2.73Hz,2H),7.74(s,1H),7.84(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.97−8.02(m,1H).
ESI−MS m/z 659[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ビス(3−フルオロアゼチジン−1−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
窒素雰囲気下、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(19.0mg,24.0μmol)、3−フルオロアゼチジン塩酸塩(7.62mg,68.0μmol,CAS No. 617718−46−4)、炭酸セシウム(47.7mg,146μmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(2.23mg,2.44μmol)、XPhos(3.49mg,7.32μmol)及び1,4−ジオキサン(3.00mL)の混合物を、封管中100℃で4時間撹拌した。室温まで冷却した後、DCMで希釈した。不溶物を濾過し、溶出物を濃縮した。残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し標記化合物(7.00mg,11.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 629[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例2−(1)で得た化合物(7.00mg,11.0μmol)から標記化合物の粗生成物(8.00mg)を得た。
ESI−MS m/z 573[M+H]+
実施例2−(2)で得た化合物(8.00mg)のDMF(1.00mL)溶液に、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(6.81mg,27.0μmol)、TEA(9.74μL,70.0μmol)及びPyBOP(9.09mg,17.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で一晩撹拌した後、直接逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。得られた粗生成物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(2.40mg,3.45μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.14−1.24(m,4H),1.73(br.s.,2H),1.99(br.s.,2H),2.11(br.s.,2H),3.60−3.68(m,2H),3.77−3.86(m,2H),3.92−4.06(m,4H),4.15−4.27(m,4H),5.31−5.54(m,2H),6.30(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.72(s,2H),6.81−6.83(m,1H),6.82(d,J=8.59Hz,2H),6.87(d,J=2.73Hz,2H),7.75(d,J=0.78Hz,1H),7.82−7.88(m,1H),8.01(d,J=8.20Hz,1H).
ESI−MS m/z 695[M+H]+
3’,7’−ビス(3,3−ジフルオロアゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(19.0mg,24.0μmol)と3,3−ジフルオロアゼチジン塩酸塩(8.85mg,68.0μmol,CAS No. 288315−03−7)から標記化合物(14.0mg,21.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 665[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例3−(1)で得た化合物(14.0mg,21.0μmol)から標記化合物の粗生成物(16.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 609[M+H]+
実施例1−(3)に準じ、実施例3−(2)で得た化合物(16.0mg)から標記化合物の粗生成物を得た。さらにシリカゲル薄層クロマトグラフィー(DCM/ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(6.20mg,8.48μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.25(m,4H),1.74(br.s.,2H),1.99(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),3.61−3.67(m,2H),3.80−3.85(m,2H),4.25(t,J=11.7Hz,8H),6.34(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.73(s,2H),6.80−6.86(m,1H),6.87(d,J=8.59Hz,2H),6.90(d,J=2.73Hz,2H),7.77(s,1H),7.84(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.00−8.04(m,1H).
ESI−MS m/z 731[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ビス(3−メトキシアゼチジン−1−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(19.0mg,24.0μmol)と3−メトキシアゼチジン塩酸塩(8.44mg,68.0μmol,CAS No. 148644−09−1)から標記化合物の粗生成物(18.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 653[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例4−(1)で得た化合物(18.0mg)から標記化合物の粗生成物(20.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 597[M+H]+
実施例1−(3)に準じ、実施例4−(2)で得た化合物(20.0mg)から標記化合物(8.40mg,12.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15−1.26(m,4H),1.72(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),3.33(s,6H),3.61−3.67(m,2H),3.69−3.78(m,4H),3.78−3.84(m,2H),4.11(t,J=7.42Hz,4H),4.30−4.37(m,2H),6.28(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.71(s,2H),6.75−6.81(m,1H),6.78(d,J=8.59Hz,2H),6.86(d,J=2.73Hz,2H),7.73(s,1H),7.84(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.99(d,J=8.59Hz,1H).
ESI−MS m/z 719[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ビス(3−メチルアゼチジン−1−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(19.0mg,24.0μmol)と3−メチルアゼチジン塩酸塩(7.35mg,68.0μmol,CAS No. 935669−28−6)から標記化合物(10.0mg,16.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 621[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例5−(1)で得た化合物(10.0mg,16.0μmol)から標記化合物の粗生成物(11.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 565[M+H]+
実施例3−(3)に準じ、実施例5−(2)で得た化合物(11.0mg)から標記化合物の粗生成物を得た。得られた粗生成物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(2.00mg,2.91μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.23(m,4H),1.26(s,3H),1.28(s,3H),1.71(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.10(br.s.,2H),2.76−2.91(m,2H),3.40−3.52(m,4H),3.59−3.69(m,2H),3.76−3.85(m,2H),3.98−4.07(m,4H),6.24(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.72(s,2H),6.72−6.77(m,1H),6.76(d,J=8.59Hz,2H),6.82(d,J=2.73Hz,2H),7.73(s,1H),7.83(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.99(d,J=7.42Hz,1H).
ESI−MS m/z 687[M+H]+
3’,7’−ビス(3,3−ジメチルアゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(20.0mg,26.0μmol)と3,3−ジメチルアゼチジン塩酸塩(8.74mg,72.0μmol,CAS No. 89381−03−3)から標記化合物(14.0mg,22.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.25(m,4H),1.31(s,12H),1.55(s,9H),1.72(br.s.,2H),1.97−2.18(m,4H),3.60(s,8H),6.29(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.82(d,J=2.73Hz,2H),6.86(d,J=8.59Hz,2H),7.83(s,1H),7.94(d,J=7.81Hz,1H),8.10(dd,J=8.20,1.17Hz,1H).
実施例1−(2)に準じ、実施例6−(1)で得た化合物(14.0mg,22.0μmol)から標記化合物の粗生成物(16.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 593[M+H]+
実施例2−(3)に準じ、実施例6−(2)で得た化合物(16.0mg)から標記化合物の粗生成物を得た。さらにシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(5.00mg,6.99μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.16−1.25(m,4H),1.31(s,12H),1.71(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.10(br.s.,2H),3.59(s,8H),3.61−3.67(m,2H),3.78−3.84(m,2H),6.24(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.72(s,2H),6.73−6.78(m,3H),6.82(d,J=2.73Hz,2H),7.71(s,1H),7.82(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.99(d,J=7.81Hz,1H).
ESI−MS m/z 715[M+H]+
3’,7’−ジ(7−アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン−7−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
窒素雰囲気下、製造例5−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(12.0mg,15.0μmol)、7−アザビシクロ[2.2.1]ヘプタン(4.19mg,43.0μmol,CAS No. 279−40−3)、炭酸セシウム(14.1mg,43.0μmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(1.41mg,1.54μmol)、XPhos(2.20mg,4.62μmol)及び1,4−ジオキサン(2.00mL)の混合物を、封管中100℃で2時間撹拌した。室温まで冷却した後、DCMで希釈した。不溶物を濾過し、溶出物を濃縮した。残渣をNHシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し、標記化合物の粗生成物(13.0mg)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15−1.23(m,4H),1.56(s,9H),1.57−1.63(m,8H),1.74−1.82(m,10H),2.03(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),4.20(br.s.,4H),6.72(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.83(d,J=8.98Hz,2H),7.31(d,J=2.73Hz,2H),7.84(d,J=0.78Hz,1H),7.93−7.97(m,1H),8.12(dd,J=8.01,1.37Hz,1H).
実施例1−(2)に準じ、実施例7−(1)で得た化合物(13.0mg)から標記化合物の粗生成物(15.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 617[M+H]+
実施例1−(3)に準じ、実施例7−(2)で得た化合物(15.0mg)から標記化合物(2.10mg,2.84μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.14−1.25(m,4H),1.39−1.47(m,8H),1.73−1.81(m,10H),1.99(br.s.,2H),2.14(br.s.,2H),3.61−3.67(m,2H),3.78−3.85(m,2H),4.19(br.s.,4H),6.64−6.70(m,2H),6.72(s,2H),6.72−6.75(m,2H),6.80(t,J=5.27Hz,1H),7.31(d,J=2.73Hz,2H),7.74(d,J=0.78Hz,1H),7.85(dd,J=8.20,1.56Hz,1H),7.98−8.03(m,1H).
ESI−MS m/z 739[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3’,7’−ジ(ピペリジン−1−イル)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
窒素雰囲気下、製造例5−(2)で得られたtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(25.0mg,32.0μmol)、ピペリジン(13.7mg,161μmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(5.88mg,6.42μmol)、XPhos(6.12mg,13.0μmol)、炭酸セシウム(29.3mg,90.0μmol)及び1,4−ジオキサン(2.00mL)の混合物を、封管中110℃で3時間撹拌した。室温まで冷却した後、DCMで希釈した。不溶物を濾過し、ろ液を濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで中間体を得た。得られた中間体をDCM(4.00mL)に溶解させ、TFA(1.00mL)を加えた。反応混合物を室温で一晩撹拌した後、溶媒を減圧留去した。残渣を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和し、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を水で洗浄し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(7.20mg,12.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 593[M+H]+
実施例8−(1)で得た化合物(7.00mg,12.0μmol)、PyBOP(7.37mg,14.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(3.60mg,14.0μmol)、トリエチルアミン(9.88μL,71.0μmol)及びDMF(1.00mL)の混合物を室温で2時間撹拌した。氷を加えて反応を停止させ、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で3回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し、粗精製物を得た。得られた粗精製物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(DCM/MeOH)で精製することで標記化合物(2.20mg,3.08μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.23−1.30(m,4H),1.56−1.63(m,4H),1.65−1.78(m,10H),1.95−2.05(m,2H),2.08−2.21(m,2H),3.14−3.24(m,8H),3.59−3.69(m,2H),3.77−3.86(m,2H),6.72(s,2H),6.72−6.77(m,3H),6.80−6.86(m,2H),7.36(d,J=2.73Hz,2H),7.72(s,1H),7.82(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.97−8.02(m,1H).
ESI−MS m/z 715[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ジ(1,4−オキサゼパン−4−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得られたtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(20.0mg,26.0μmol)と1,4−オキサゼパン(7.27mg,72.0μmol)から標記化合物(9.00mg,13.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.20−1.31(m,4H),1.57(s,9H),1.74(br.s.,2H),1.97−2.06(m,6H),2.11(br.s.,2H),3.59−3.72(m,12H),3.80−3.86(m,4H),6.57(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.84(d,J=8.59Hz,2H),7.14(d,J=2.73Hz,2H),7.90(d,J=1.17Hz,1H),7.97(dd,J=7.81,0.78Hz,1H),8.14(dd,J=8.01,1.37Hz,1H).
ESI−MS m/z 681[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例9−(1)で得た化合物(9.00mg,13.0μmol)から標記化合物の粗生成物(10.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 625[M+H]+
実施例9−(2)で得た化合物(10.0mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(11.0μL,81.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(4.13mg,16.0μmol)及びPyBOP(8.45mg,16.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で3時間撹拌した後、氷を加え反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を飽和食塩水で3回洗浄した。有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで粗生成物を得た。さらに粗生成物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(DCM/MeOH)で精製することで標記化合物(4.05mg,5.42μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15−1.30(m,4H),1.73(br.s.,2H),1.91−2.07(m,6H),2.11(br.s.,2H),3.56−3.72(m,14H),3.77−3.88(m,6H),6.53(dd,J=8.79,2.93Hz,2H),6.72(s,2H),6.76(d,J=8.98Hz,2H),6.79−6.85(m,1H),7.14(d,J=3.12Hz,2H),7.77(s,1H),7.85(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.01(d,J=7.81Hz,1H).
ESI−MS m/z 747[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ビス(ジプロピルアミノ)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例5−(2)で得られたtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(20.0mg,26.0μmol)とジプロピルアミン(7.28mg,72.0μmol)から標記化合物(3.00mg,4.41μmol)を得た。
ESI−MS m/z 681[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例10−(1)で得た化合物(3.00mg,4.41μmol)から標記化合物の粗生成物(7.00mg)を得た。
ESI−MS m/z 625[M+H]+
実施例10−(2)で得た化合物(7.00mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(7.92μL,57.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(2.89mg,11.0μmol)及びPyBOP(5.92mg,11.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で4.5時間撹拌した後、氷を加え反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で3回洗浄した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(2.36mg,3.16μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):0.92(t,J=7.42Hz,12H),1.17−1.24(m,4H),1.56−1.66(m,8H),1.72(br.s.,2H),1.99(br.s.,2H),2.14(br.s.,2H),3.21−3.29(m,8H),3.62−3.69(m,2H),3.79−3.84(m,2H),6.43(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.70(d,J=8.98Hz,2H),6.71(s,2H),6.73(br.s.,1H),7.05(d,J=2.73Hz,2H),7.75(s,1H),7.84(dd,J=7.81,1.56Hz,1H),7.99(d,J=7.81Hz,1H).
ESI−MS m/z 747[M+H]+
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−N−(2−(2−(2−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(2)で得られる化合物(70.0mg)、13−アミノ−5,8,11−トリオキサ−2−アザトリデカノイックアシッド 1,1−ジメチルエチルエステル(37.7mg,129μmol, CAS No. 101187−40−0)、PyBop(84.0mg,161μmol)、TEA(90.0μL,645μmol)及びDMF(2.00mL)の混合物を室温で一晩撹拌した。反応混合物に氷を加え反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を飽和食塩水で3回洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(67.0mg,83.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 811[M+H]+
実施例11−(1)で得た化合物(67.0mg,83.0μmol)のDCM(4.00mL)溶液にTFA(800μL)を加え、室温で1時間撹拌した。溶媒を減圧留去することにより標記化合物の粗生成物(80.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 711[M+H]+
実施例11−(2)で得た化合物(80.0mg)、THF(3.03mL)及び飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(3.03mL)の混合物に、メチル 2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボキシラート(79.0mg,511μmol,CAS No. 55750−48−6)を加えた。反応混合物を室温で一晩撹拌した後、酢酸エチルで希釈した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(酢酸エチル)で精製することで標記化合物(23.0mg,29.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15−1.29(m,4H),1.71(br.s.,2H),1.97(br.s.,2H),2.11(br.s.,2H),2.37(quin,J=7.22Hz,4H),3.45−3.54(m,6H),3.55−3.63(m,6H),3.63−3.68(m,4H),3.90(t,J=7.22Hz,8H),6.24(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.60(s,2H),6.75(d,J=8.59Hz,2H),6.82(d,J=2.73Hz,2H),7.03−7.09(m,1H),7.75−7.80(m,1H),7.96−8.00(m,2H).
ESI−MS m/z 791[M+H]+
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキサミドの合成
実施例2−(1)に準じ、製造例6−(2)で得たtert−ブチル 3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキシラート(31.0mg,40.0μmol)から標記化合物(6.00mg,10.1μmol)を得た。
ESI−MS m/z 593[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例12−(1)の方法で得られる化合物(15.0mg,25.0μmol)から標記化合物の粗生成物(17.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 537[M+H]+
実施例3−(3)に準じ、実施例12−(2)で得た化合物(17.0mg)から標記化合物(1.50mg,2.28μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.26(m,4H),1.72(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),2.32−2.43(m,4H),3.68−3.75(m,2H),3.83−3.88(m,2H),3.90(t,J=7.22Hz,8H),6.24(dd,J=8.59,2.34Hz,2H),6.74(d,J=8.59Hz,2H),6.76(s,2H),6.78−6.84(m,1H),6.84(d,J=2.73Hz,2H),7.39(d,J=8.20Hz,1H),8.11(dd,J=8.01,1.76Hz,1H),8.25(s,1H).
ESI−MS m/z 659[M+H]+
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−5−クロロ−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
窒素雰囲気下、製造例7−(2)で得たtert−ブチル 5−クロロ−3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(128mg,157μmol)、アゼチジン(25.2mg,441μmol)、炭酸セシウム(144mg,441μmol)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)(14.4mg,16.0μmol)、XPhos(22.5mg,47.0μmol)及びトルエン(2.00mL)の混合物を封管中110℃で4.5時間撹拌した。室温まで冷却した後、不溶物を濾過した。溶出物を濃縮し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することでtert−ブチル 3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−5−クロロ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートを得た。
ESI−MS m/z 627[M+H]+
また、副生成物として、tert−ブチル 3’,5,7’−トリ(アゼチジン−1−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートを得た。
ESI−MS m/z 648[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例13−(1)で得たtert−ブチル 3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−5−クロロ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートから標記化合物の粗生成物(15.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 571[M+H]+
実施例10−(3)に準じ、実施例13−(2)で得た化合物(15.0mg)から標記化合物の粗生成物を得た。さらに、シリカゲル薄層クロマトグラフィー(DCM/MeOH)で精製することで標記化合物(1.10mg,1.59μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.13−1.21(m,4 H),1.71(br.s.,2H),1.97(br.s.,2H),2.10(br.s.,2H),2.32−2.43(m,4H),3.64−3.72(m,2H),3.76−3.83(m,2H),3.91(t,J=7.22Hz,8H),6.28(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.44(br.s.,1H),6.68(s,2H),6.76(d,J=8.59Hz,2H),6.83(d,J=2.34Hz,2H),7.45(s,1H),7.95(s,1H).
ESI−MS m/z 693[M+H]+
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−メチル−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例8−(3)で得たtert−ブチル 5−メチル−3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(40.0mg,50.0μmol)から標記化合物の粗生成物(35.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 607[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例14−(1)で得た化合物(35.0mg)から標記化合物の粗生成物(42.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 551[M+H]+
実施例14−(2)で得た化合物(42.0mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(44.0μL,316μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(19.3mg,76.0μmol)及びPyBOP(49.3mg,95.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で1.5時間撹拌した後、酢酸エチルで希釈した。有機層を水で3回洗浄し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製した。得られた粗生成物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製した。得られた粗生成物を、さらにシリカゲル薄層クロマトグラフィー(DCM/MeOH)で精製することで標記化合物(16.0mg,24.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.18−1.25(m,4H),1.72(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),2.37−2.43(m,4H),2.55(s,3H),3.62−3.67(m,2H),3.77−3.81(m,2H),3.92(t,J=7.22Hz,8H),6.22(br.s.,1H),6.28(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.69(s,2H),6.79(d,J=8.59Hz,2H),6.85(d,J=2.34Hz,2H),7.28(s,1H),7.80(s,1H).
ESI−MS m/z 673[M+H]+
3’,7’−ジ(アゼチジン−1−イル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−((3−ヒドロキシプロピル)アミノ)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例13−(1)で副生成物として得られたtert−ブチル 3’,5,7’−トリ(アゼチジン−1−イル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラートのDCM/TFA(2:1)溶液を室温で3時間撹拌した。溶媒を減圧留去することで標記化合物を含む混合物(9.00mg)を得た。得られた混合物はさらに精製することなく次の反応に用いた。
ESI−MS m/z 610[M+H]+
実施例10−(3)に準じ、実施例15−(1)で得られた混合物(9.00mg)から標記化合物(1.22mg,1.67μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.25(m,4H),1.70(br.s.,2H),1.86−2.00(m,4H),2.13(br.s.,2H),2.32−2.43(m,4H),3.33−3.41(m,2H),3.54−3.60(m,2H),3.77(dd,J=6.44,4.49Hz,2H),3.85(t,J=5.86Hz,2H),3.91(t,J=7.22Hz,8H),6.23−6.30(m,2H),6.55(br.s.,1H),6.67(s,2H),6.84(d,J=5.47Hz,2H),6.85(s,2H),7.17(s,1H),7.33(s,1H).
ESI−MS m/z 732[M+H]+
3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−メチル−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例1−(1)に準じ、製造例8−(3)で得られたtert−ブチル 5−メチル−3−オキソ−3’,7’−ビス(((トリフルオロメチル)スルホニル)オキシ)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキシラート(40.0mg,50.0μmol)とジメチルアミン(2M THF溶液、71.0μL,141μmol)から標記化合物(10.0mg,17.0μmol)を得た。
ESI−MS m/z 583[M+H]+
実施例1−(2)に準じ、実施例16−(1)で得た化合物(10.0mg,17.0μmol)から標記化合物の粗生成物(15.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 527[M+H]+
実施例16−(2)で得た化合物(15.0mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(16.0μL,117μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(7.14mg,28.0μmol)及びPyBOP(18.3mg,35.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で1.5時間撹拌した後、酢酸エチルで希釈した。混合物を水で3回洗浄し、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し、粗生成物を得た。さらにシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(10.0mg,15.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.21−1.29(m,4H),1.75(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.17(br.s.,2H),2.55(s,3H),3.00(s,12H),3.60−3.68(m,2H),3.75−3.83(m,2H),6.19(br.s.,1H),6.58(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.69(s,2H),6.82(d,J=8.98Hz,2H),7.16(d,J=2.73Hz,2H),7.27(s,1H),7.81(s,1H).
ESI−MS m/z 649[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ジモルホリノ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
2,2’−(2−ブロモ−1,4−フェニレン)ビス(4,4−ジメチル−4,5−ジヒドロオキサゾール)(1.56g,4.43mmol,CAS No.115580−69−3)のTHF(20.0mL)溶液に、−78℃でtert−ブチルリチウム(1.62M n−ペンタン溶液、2.74mL、4.43mmol)を20分間かけて滴下した。同温でさらに1時間撹拌した後、製造例9で得た3,7−ジモルホリノ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(51.0mg,114μmol)のTHF(2.00mL)溶液を滴下した。反応混合物を−40度まで昇温し、同温で3時間撹拌した。反応混合物を徐々に室温まで昇温させ、3日間撹拌した。氷浴下、酢酸(5.00mL)を加えることで反応を停止させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣に5N塩酸(50.0mL)を加え、80℃で4時間撹拌した。室温まで冷却した後、混合物を飽和炭酸ナトリウム水溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル(→酢酸エチル/メタノール))で精製することで標記化合物を含む混合物(48.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 597[M+H]+
実施例17−(1)で得た化合物(48.0mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(67.0μL,483μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(24.5mg,97.0μmol)及びPyBOP(50.2mg,97.0μmol)を加えた。反応混合物を室温で3.5時間撹拌した後、混合物を直接逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製し粗生成物を得た。得られた粗生成物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(13.6mg,19.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.19−1.32(m,4H),1.74(br.s.,2H),2.01(br.s.,2H),2.14(br.s.,2H),3.14−3.22(m,8H),3.61−3.67(m,2H),3.78−3.84(m,2H),3.84−3.89(m,8H),6.73(s,2H),6.73−6.76(m,2H),6.79(s,1H),6.90(d,J=8.59Hz,2H),7.34(d,J=2.73Hz,2H),7.74(s,1H),7.82(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.01(d,J=8.20Hz,1H).
ESI−MS m/z 719[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ジモルホリノ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキサミドの合成
実施例17−(1)に準じ、製造例9で得た3,7−ジモルホリノ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(51.0mg,114μmol)と2,2’−(4−ブロモ−1,3−フェニレン)ビス(4,4−ジメチル−4,5−ジヒドロオキサゾール)(1.56g,4.43mmol,CAS No.1426090−01−8)から標記化合物を含む混合物(44.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 597[M+H]+
実施例17−(2)に準じ、18−(1)で得た化合物(44.0mg)から標記化合物(13.7mg,19.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.19−1.31(m,4H),1.76(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.15(br.s.,2H),3.17−3.22(m,8H),3.68−3.74(m,2H),3.84−3.92(m,10H),6.75(dd,J=8.79,2.54Hz,2H),6.77(s,2H),6.84(s,1H),6.86−6.90(m,2H),7.35(d,J=3.12Hz,2H),7.38(d,J=7.81Hz,1H),8.12(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.28(s,1H).
ESI−MS m/z 719[M+H]+
3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例17−(1)に準じ、製造例10−(2)で得た3,7−ビス(ジメチルアミノ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(200mg,549μmol)から標記化合物(270mg,527μmol)を得た。
ESI−MS m/z 513[M+H]+
実施例19−(1)の方法で得られる化合物(25.0mg,49.0μmol)のDMF(2.00mL)溶液に、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(28.5mg,112μmol)、PyBOP(38.1mg,73.0μmol)及びTEA(41.0μL,293μmol)を加えた。反応混合物を室温で3日間撹拌した後、反応混合物を直接逆相クロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。目的物を含むフラクションを回収し、余剰のアセトニトリルを減圧留去した後、残渣の水層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和した。水層をDCMで抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル(→酢酸エチル))で精製することで標記化合物(2.07mg,3.26μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.24−1.33(m,4H),1.73(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.16(br.s.,2H),2.97(s,12H),3.61−3.68(m,2H),3.77−3.85(m,2H),6.55(dd,J=8.79,2.93Hz,2H),6.72(s,2H),6.74(s,1H),6.80(d,J=8.98Hz,2H),7.14(d,J=2.73Hz,2H),7.72(s,1H),7.83(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.00(d,J=7.81Hz,1H).
ESI−MS m/z 635[M+H]+
3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−N−(2−(2−(2−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エトキシ)エトキシ)エトキシ)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例11−(1)に準じ、実施例19−(1)の方法で得られる3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボン酸(270mg,527μmol)から標記化合物(178mg,226μmol)を得た。
ESI−MS m/z 787[M+H]+
実施例11−(2)に準じ、実施例20−(1)で得た化合物(178mg,226μmol)から標記化合物の粗生成物(210mg)を得た。
ESI−MS m/z 687[M+H]+
実施例20−(2)で得た化合物(210mg)、メチル 2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−カルボキシラート(214mg,1.38mmol)、THF(8.20mL)および飽和炭酸水素ナトリウム水溶液(8.20mL)の混合物を室温で3.5時間撹拌した。酢酸エチルで希釈し、有機層を分取した。有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで粗精製物を得た。この粗精製物をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(酢酸エチル)で精製することで粗精製物を得た。この粗精製物を逆相クロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。目的物を含むフラクションを回収し、余剰のアセトニトリルを減圧留去した後、残渣の水層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去することで標記化合物(89.0mg,116μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17−1.26(m,4H),1.73(br.s.,2H),2.00(br.s.,2H),2.16(br.s.,2H),2.97(s,12H),3.43−3.53(m,6H),3.54−3.62(m,6H),3.64−3.66(m,4H),6.54(dd,J=8.79,2.93Hz,2H),6.60(s,2H),6.78(d,J=8.59Hz,2H),7.01−7.07(m,1H),7.13(d,J=2.73Hz,2H),7.76(s,1H),7.95−8.03(m,2H).
ESI−MS m/z 767[M+H]+
3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキサミドの合成
実施例18−(1)に準じ、製造例10−(2)で得た3,7−ビス(ジメチルアミノ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(50.0mg,137μmol)から標記化合物を含む混合物(47.7mg)を得た。
ESI−MS m/z 513[M+H]+
実施例21−(1)で得た化合物(47.0mg,92.0μmol)のDMF(1.00mL)溶液に、ジイソプロピルエチルアミン(96.0μL,550μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(53.6mg,211μmol)及びPyBOP(71.6mg,138μmol)を加えた。反応混合物を室温で一晩撹拌した後、水を加えて反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し、粗生成物を得た。得られた粗生成物を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。目的物を含むフラクションを回収し、余剰のアセトニトリルを減圧留去した。水層を炭酸水素ナトリウム水溶液で中和し、酢酸エチルで抽出した。有機層を硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を減圧留去した。残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(5.00mg,7.88μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.18−1.30(m,4H),1.74(br.s.,2H),2.01(br.s.,2H),2.16(br.s.,2H),2.98(s,12H),3.67−3.76(m,2H)、3.82−3.92(m,2H),6.54(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.73−6.83(m,3H),6.76(s,2H),7.14(d,J=3.12Hz,2H),7.37(d,J=8.20Hz,1H),8.10(dd,J=8.01,1.76Hz,1H),8.26(d,J=0.78Hz,1H).
ESI−MS m/z 635[M+H]+
3’,7’−ビス(ジメチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シロラン]−6−カルボキサミドの合成
実施例17−(1)に準じ、製造例11−(2)で得た3,7−ビス(ジメチルアミノ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シロラン]−10−オン(40.0mg,114μmol)から、標記化合物を含む混合物(27.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 499[M+H]+
実施例22−(1)で得た化合物(27.0mg)、PyBOP(43.8mg,84.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(32.8mg,129μmol)、TEA(47.0μL,337μmol)およびDMF(2.00mL)の混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を直接逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。目的物を含むフラクションを回収し、余剰のアセトニトリルを0度以下で減圧留去した。残渣の水層を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和し、水層を酢酸エチルで抽出した。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(ジエチルエーテル)で精製することで標記化合物(3.68mg,5.93μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.21(t,J=7.03Hz,2H),1.25−1.32(m,2H),1.95−2.06(m,4H),2.95(s,12H),3.56−3.64(m,2H),3.76−3.83(m,2H),6.61(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.65(br.s.,1H),6.71(s,2H),6.94(d,J=3.12Hz,2H),7.00(d,J=8.98Hz,2H),7.67(d,J=0.78Hz,1H),7.70−7.75(m,1H),7.93−7.97(m,1H).
ESI−MS m/z 621[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(99.0mg,250μmol)、製造例15−(2)で得た3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(146mg,750μmol)、臭化第二銅(16.8mg,75.0μmol)及び酢酸(215μL,3.75mmol)の混合物を140℃で8時間撹拌した。室温まで冷却した後、混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し標記化合物(40.0mg,70.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.04−1.19(m,12H),1.20−1.32(m,4H),1.65−1.85(m,2H),1.95−2.06(m,2H),2.09−2.21(m,2H),3.25−3.42(m,8H),6.49(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.73(d,J=8.98Hz,2H),7.11(d,J=3.12Hz,2H),8.00−8.09(m,2H),8.24(dd,J=8.01,1.37Hz,1H).
ESI−MS m/z 569[M+H]+
実施例23−(1)で得た化合物(9.67mg,17.0μmol)のDMF(500μL)溶液に、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(9.94mg,39.0μmol)、PyBOP(13.3mg,26.0μmol)及びTEA(14.0μL,102μmol)を加えた。反応混合物を室温で18時間撹拌した後、反応混合物を直接シリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製し標記化合物(2.00mg,2.89μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.14−1.21(m,12H),1.21−1.32(m,4H),1.74(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.11−2.21(m,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),3.61−3.71(m,2H),3.78−3.88(m,2H),6.49(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.69−6.80(m,3H),6.73(s,2H),7.11(d,J=2.73Hz,2H),7.76(dd,J=1.56,0.78Hz,1H),7.86(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.01(dd,J=7.81,0.78Hz,1H).
ESI−MS m/z 691[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−5−カルボキサミドの合成
実施例23−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(99.0mg,250μmol)と製造例16−(2)で得た1−ヒドロキシ−3−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(146mg,750μmol)から標記化合物(49.0mg,86.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.10−1.27(m,16H),1.73(br.s.,2H),1.96−2.07(m,2H),2.09−2.22(m,2H),3.37(q,J=7.03Hz,8H),6.49(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.72(d,J=8.98Hz,2H),7.10(d,J=2.73Hz,2H),7.42(d,J=8.20Hz,1H),8.35(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.69(d,J=0.78Hz,1H).
ESI−MS m/z 569[M+H]+
実施例23−(2)に準じ、実施例24−(1)で得た化合物(10.2mg,18.0μmol)から標記化合物(3.00mg,4.34μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.17(t,J=7.03Hz,12H),1.20−1.30(m,4H),1.74(br.s.,2H),1.94−2.05(m,2H),2.11−2.21(m,2H),3.37(q,J=6.77Hz,8H),3.67−3.77(m,2H),3.82−3.90(m,2H),6.47(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.67−6.77(m,4H),6.91(t,J=5.27Hz,1H),7.10(d,J=2.73Hz,2H),7.43(d,J=8.20Hz,1H),8.14(dd,J=8.20,1.56Hz,1H),8.28(d,J=0.78Hz,1H).
ESI−MS m/z 691[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−フルオロ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(70.0mg,177μmol)、製造例17−(2)で得た6−フルオロ−3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(125mg)、臭化第二銅(11.9mg,53.0μmol)及び酢酸(2.00mL)の混合物を140度で4時間撹拌した。溶媒を減圧留去し、残渣を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去することで、標記化合物の粗生成物(96.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 587[M+H]+
実施例25−(1)で得た化合物(76.0mg)、PyBOP(81.0mg,155μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(39.5mg,155μmol)、トリエチルアミン(90.0μL,648μmol)及びDMF(1.00mL,12.9mmol)の混合物を室温で2.5時間撹拌した。氷を加えて反応を停止させ、水層を酢酸エチルで抽出した。有機層を飽和食塩水で3回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥させた。溶媒を減圧留去し、得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(5.70mg,8.04μmol)を得た。
ESI−MS m/z 709[M+H]+
5−クロロ−3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例23−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(39.5mg,100μmol)と、製造例18−(2)で得た6−クロロ−3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(68.6mg,300μmol)から標記化合物(8.00mg,13.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.03−1.35(m,16H),1.69(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.02−2.15(m,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),6.60(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.83(d,J=8.98Hz,2H),7.19(d,J=2.73Hz,2H),7.79(s,1H),7.99(s,1H).
ESI−MS m/z 603[M+H]+
実施例23−(2)に準じ、実施例26−(1)で得た化合物(7.84mg,13.0μmol)から標記化合物の粗精製物を得た。得られた粗精製物を逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製し、標記化合物(1.60mg,2.21μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.18(t,J=7.03Hz,12H),1.19−1.24(m,4H),1.73(br.s.,2H),1.99(br.s.,2H),2.14(br.s.,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),3.63−3.72(m,2H),3.75−3.84(m,2H),6.42(br.s.,1H),6.51(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.68(s,2H),6.73(d,J=8.98Hz,2H),7.08(d,J=3.12Hz,2H),7.46(s,1H),7.96(s,1H).
ESI−MS m/z 725[M+H]+
5−ブロモ−3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(150mg,380μmol)、製造例19−(2)で得た6−ブロモ−3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(208mg,760μmol)、臭化第二銅(25.5mg,114μmol)及び酢酸(1.09mL)の混合物を、140℃で6時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応混合物を直接逆相クロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製することで標記化合物(105mg,162μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.10−1.23(m,16H),1.68(br.s.,2H),1.91−2.12(m,4H),3.40(q,J=7.29Hz,8H),6.67(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.88(d,J=8.98Hz,2H),7.25(d,J=2.73Hz,2H),7.71(s,1H),8.19(s,1H).
ESI−MS m/z 649[M+H]+
実施例23−(2)に準じ、実施例27−(1)で得た化合物(9.72mg,15.0μmol)から標記化合物(4.20mg,5.46μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.10−1.24(m,16H),1.72(br.s.,2H),1.99(br.s.,2H),2.12(br.s.,2H),3.37(q,J=7.29Hz,8H),3.62−3.72(m,2H),3.73−3.82(m,2H),6.31(t,J=5.66Hz,1H),6.51(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.67(s,2H),6.73(d,J=8.98Hz,2H),7.08(d,J=2.73Hz,2H),7.35(s,1H),8.14(s,1H).
ESI−MS m/z 769,771[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−5−(ジフルオロメチル)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例27−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(70.0mg,177μmol)と、製造例20−(3)で得た6−(ジフルオロメチル)−3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(87.0mg,355μmol)から標記化合物(22.0mg,36.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.11−1.23(m,16H),1.74(br.s.,2H),2.00(br.s.,2H),2.10(br.s.,2H),3.47(q,J=7.03Hz,8H),6.59(dd,J=9.18,2.93Hz,2H),6.78(d,J=9.37Hz,2H),7.17(d,J=2.73Hz,2H),7.57(t,J=55.84Hz,1H),7.80(s,1H),8.32(s,1H).
ESI−MS m/z 619[M+H]+
実施例28−(1)で得た化合物(27.8mg,45.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(26.3mg,104μmol)、PyBOP(35.1mg,68.0μmol)、トリエチルアミン(38.0μL,270μmol)及びDMF(500μL)の混合物を室温で2時間撹拌した。反応混合物を直接逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製することで標記化合物(11.8mg,16.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.16(t,J=7.03Hz,12H),1.19−1.26(m,4H),1.73(br.s.,2H),1.94−2.06(m,2H),2.11−2.17(m,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),3.50(dd,J=6.44,4.49Hz,2H),3.65−3.73(m,2H),6.52(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.66(s,2H),6.68(d,J=8.98Hz,2H),7.09(d,J=3.12Hz,2H),7.12(t,J=55.26Hz,1H),7.38(s,1H),7.58(s,1H),8.22(s,1H).
ESI−MS m/z 741[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−(メトキシメチル)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例27−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(14.6mg,37.0μmol)と、製造例21−(5)で得た3−ヒドロキシ−6−(メトキシメチル)−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(17.6mg,74.0μmol)から標記化合物(7.00mg,11.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.16(t,J=7.03Hz,12H),1.20−1.29(m,4H),1.72(br.s.,2H),2.00(br.s.,2H),2.14(br.s.,2H),3.37(q,J=7.03Hz,8H),3.54(s,3H),4.89(s,2H),6.50(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.75(d,J=8.98Hz,2H),7.11(d,J=2.73Hz,2H),8.00(s,1H),8.20(s,1H).
ESI−MS m/z 613[M+H]+
実施例28−(2)に準じ、実施例29−(1)で得た化合物(6.13mg,10.0μmol)から標記化合物(1.00mg,1.36μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.18(t,J=7.03Hz,12H),1.21−1.26(m,4H),1.74(br.s.,2H),2.02(br.s.,2H),2.15(br.s.,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),3.48(s,3H),3.60−3.71(m,2H),3.73−3.84(m,2H),4.64(s,2H),6.50(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.68(s,2H),6.75(d,J=8.98Hz,2H),7.10(d,J=2.34Hz,2H),7.38−7.43(m,1H),7.60(s,1H),7.97(s,1H).
ESI−MS m/z 735[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−5−(トリフルオロメチル)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例25−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(50.0mg,127μmol)及び製造例22−(3)で得た3−ヒドロキシ−1−オキソ−6−(トリフルオロメチル)−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(100mg,380μmol)から、標記化合物の粗生成物(61.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 637[M+H]+
実施例30−(1)で得た化合物(61.0mg)のDMF(3.00mL)溶液に、TEA(40.0μL,287μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(29.2mg,115μmol)及びPyBOP(74.8mg,144μmol)を加えた。反応混合物を室温で一晩撹拌した後、混合物を直接逆相クロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製した。得られた粗精製物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(15.0mg,20.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.18(t,J=7.03Hz,12H),1.21(br.s.,2H),1.26(br.s.,2H),1.73(br.s.,2H),2.01(br.s.,2H),2.09−2.19(m,2H),3.38(q,J=7.03Hz,8H),3.61−3.69(m,2H),3.73−3.80(m,2H),6.18−6.24(m,1H),6.53(dd,J=8.98,3.12Hz,2H),6.65(s,2H),6.69(d,J=8.98Hz,2H),7.09(d,J=3.12Hz,2H),7.40(s,1H),8.27(s,1H).
ESI−MS m/z 759[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−メトキシ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(20.0mg,51.0μmol)、製造例23−(2)で得た3−ヒドロキシ−6−メトキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(34.1mg,152μmol)、臭化第二銅(3.40mg,15.0μmol)及び酢酸(2.00mL)の混合物を140℃で20時間撹拌した。溶媒を減圧留去し、残渣を飽和炭酸水素ナトリウム水溶液で中和した。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で洗浄した。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル(→酢酸エチル/メタノール))で精製することで標記化合物を含む混合物(13.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 599[M+H]+
実施例9−(2)に準じ、実施例31−(1)で得た化合物(13.0mg)から標記化合物(1.93mg,2.68μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15(t,J=7.03Hz,12H),1.26(br.s.,4H),1.71(br.s.,2H),1.98(br.s.,2H),2.15(br.s.,2H),3.35(q,J=6.77Hz,8H),3.65−3.73(m,2H),3.80−3.87(m,2H),4.11(s,3H),6.44(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.72(s,2H),6.75(d,J=8.59Hz,2H),7.09(d,J=2.73Hz,2H),7.49(s,1H),8.18(t,J=5.08Hz,1H),8.22(s,1H).
ESI−MS m/z 721[M+H]+
3’,7’−ビス(ジエチルアミノ)−N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−5−(メチルチオ)−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例31−(1)に準じ、製造例12で得た3,3’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(N,N−ジエチルアニリン)(70.0mg,177μmol)と、製造例24−(2)で得た3−ヒドロキシ−6−(メチルチオ)−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(128mg)から、標記化合物を含む混合物(38.0mg)を得た。
ESI−MS m/z 615[M+H]+
実施例32−(1)で得た化合物(38.0mg)のDMF(2.00mL)溶液に、TEA(13.0μL,93.0μmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミド TFA塩(18.9mg,74.0μmol)及びPyBOP(38.6mg,74.0μmol)を加え、室温で1.5時間撹拌した。反応混合物に酢酸エチルと水を加えて反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水で2回洗浄した。溶媒を減圧留去し、残渣をシリカゲル薄層クロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(21.5mg,29.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.07(t,J=7.03Hz,12H),1.09−1.15(m,4H),1.62(br.s.,2H),1.87(br.s.,2H),2.05(br.s.,2H),2.47(s,3H),3.27(q,J=7.03Hz,8H),3.54−3.61(m,2H),3.65−3.72(m,2H),6.38−6.41(m,1H),6.40(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.56(s,2H),6.65(d,J=8.98Hz,2H),7.00(d,J=3.12Hz,2H),7.31(s,1H),7.68(s,1H).
ESI−MS m/z 737[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−3’,7’−ジ(ピロリジン−1−イル)−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例23−(1)に準じ、製造例13で得た1,1’−(シリナン−1,1−ジイルビス(3,1−フェニレン))ジピロリジン(98.0mg,250μmol)と、製造例15−(2)で得た3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(146mg,750μmol)から標記化合物(28.0mg,50.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.15−1.31(m,4H),1.74(br.s.,4H),1.93−2.06(m,8H),2.14(d,J=17.18Hz,2H),3.22−3.36(m,8H),6.41(dd,J=8.98,2.73Hz,2H),6.79(d,J=8.98Hz,2H),6.99(d,J=2.73Hz,2H),7.97−8.06(m,2H),8.17−8.25(m,1H).
ESI−MS m/z 565[M+H]+
実施例23−(2)に準じ、実施例33−(1)で得た化合物(9.60mg,17.0μmol)から標記化合物(4.00mg,5.82μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.16−1.35(m,4H),1.73(br.s.,2H),1.89−2.07(m,10H),2.09−2.23(m,2H),3.19−3.38(m,8H),3.57−3.70(m,2H),3.74−3.85(m,2H),6.38(dd,J=8.59,2.73Hz,2H),6.66−6.82(m,3H),6.71(s,2H),6.97(d,J=2.73Hz,2H),7.70(s,1H),7.83(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),7.99(d,J=7.81Hz,1H).
ESI−MS m/z 687[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−1’,2’,3’,4’,8’,9’,10’,11’−オクタヒドロ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,6’−シリノ[3,2−g:5,6−g’]ジキノリン−13’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
実施例23−(1)に準じ、製造例14−(2)で得た7,7’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(1−アリル−1,2,3,4−テトラヒドロキノリン)(885mg,2.00mmol)と製造例15−(2)で得た3−ヒドロキシ−1−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(1.17g,6.00mmol)から粗生成物を得た。さらにシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(98.0mg,159μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.04−1.21(m,4H),1.69(br.s.,2H),1.80−1.93(m,4H),1.93−2.13(m,4H),2.43−2.66(m,4H),3.18−3.34(m,4H),3.85−4.02(m,4H),5.14−5.28(m,4H),5.81−5.96(m,2H),6.50(s,2H),6.93(s,2H),7.90(d,J=0.78Hz,1H),8.00(dd,J=7.81,0.78Hz,1H),8.18(dd,J=8.01,1.37Hz,1H).
ESI−MS m/z 617[M+H]+
実施例34−(1)で得た化合物(30.8mg,50.0μmol)、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)(11.6mg,10.0μmol)、1,3−ジメチルバルビツール酸(46.8mg,300μmol)及びDCM(5.00mL)の混合物を室温で10時間撹拌した。反応混合物を直接逆相クロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製することで標記化合物(15.0mg,28.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.03−1.10(m,2H),1.10−1.17(m,2H),1.67(br.s.,2H),1.75−1.87(m,4H),1.92−2.01(m,2H),2.07(br.s.,2H),2.50(t,J=6.05Hz,4H),3.22−3.30(m,4H),6.47(s,2H),6.97(s,2H),7.88(s,1H),8.00(d,J=8.20Hz,1H),8.18(d,J=8.20Hz,1H).
ESI−MS m/z 537[M+H]+
実施例28−(2)に準じ、実施例34−(2)で得た化合物(13.4mg,25.0μmol)から標記化合物(2.60mg,3.95μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.11(dt,J=18.35,6.83Hz,4H),1.73(br.s.,2H),1.79−1.91(m,4H),1.95−2.08(m,2H),2.13(br.s.,2H),2.52(t,J=6.25Hz,4H),3.31−3.37(m,4H),3.51−3.59(m,2H),3.73(dd,J=6.25,4.69Hz,2H),6.51(s,2H),6.75(s,2H),7.06(s,2H),7.56(d,J=1.17Hz,1H),7.93(dd,J=7.81,1.56Hz,1H),8.04(d,J=7.81Hz,1H),8.28(br.s.,1H).
ESI−MS m/z 659[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3−オキソ−1’,2’,3’,4’,8’,9’,10’,11’−オクタヒドロ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,6’−シリノ[3,2−g:5,6−g’]ジキノリン−13’,1’’−シリナン]−5−カルボキサミドの合成
実施例27−(1)に準じ、製造例14−(2)で得た7,7’−(シリナン−1,1−ジイル)ビス(1−アリル−1,2,3,4−テトラヒドロキノリン)(102mg,230μmol)と、製造例16−(2)で得た1−ヒドロキシ−3−オキソ−1,3−ジヒドロイソベンゾフラン−5−カルボン酸(134mg,690μmol)から標記化合物(42.0mg,68.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.05−1.17(m,4H),1.69(br.s.,2H),1.79−1.93(m,4H),1.94−2.12(m,4H),2.45−2.67(m,4H),3.18−3.34(m,4H),3.88−3.98(m,4H),5.14−5.30(m,4H),5.88(ddt,J=16.99,10.35,4.88,4.88Hz,2H),6.48(s,2H),6.94(s,2H),7.30(d,J=7.81Hz,1H),8.28(dd,J=8.01,1.37Hz,1H),8.68(d,J=0.78Hz,1H).
ESI−MS m/z 617[M+H]+
実施例34−(2)に準じ、実施例35−(1)で得た化合物(40.1mg,65.0μmol)から標記化合物(21.0mg,39.0μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.00−1.15(m,4H),1.66(br.s.,2H),1.81(quin,J=5.86Hz,4H),1.95(br.s.,2H),2.07(br.s.,2H),2.49(t,J=6.05Hz,4H),3.22−3.30(m,4H),6.43(s,2H),6.96(s,2H),7.33(d,J=7.81Hz,1H),8.30(d,J=7.81Hz,1H),8.62(s,1H).
ESI−MS m/z 537[M+H]+
実施例28−(2)に準じ、実施例35−(2)で得た化合物(19.0mg,35.0μmol)から粗生成物を得た。さらに逆相シリカゲルカラムクロマトグラフィー(水/アセトニトリル、0.1%ギ酸)で精製することで標記化合物(2.60mg,3.95μmol)を得た。
1H−NMR(400MHz,CDCl3)δ(ppm):1.06−1.20(m,4H),1.67(br.s.,2H),1.78−1.89(m,4H),1.95(br.s.,2H),2.09(br.s.,2H),2.48−2.63(m,4H),3.21−3.34(m,4H),3.64−3.76(m,2H),3.81−3.89(m,2H),6.48(s,2H),6.76(s,2H),6.87(s,2H),7.32−7.36(m,1H),8.02(br.s.,1H),8.07(dd,J=8.20,1.56Hz,1H),8.26(d,J=1.17Hz,1H).
ESI−MS m/z 659[M+H]+
N−(2−(2,5−ジオキソ−2,5−ジヒドロ−1H−ピロール−1−イル)エチル)−3’,7’−ジヒドロキシ−3−オキソ−3H−ジスピロ[イソベンゾフラン−1,10’−ジベンゾ[b,e]シリン−5’,1’’−シリナン]−6−カルボキサミドの合成
窒素雰囲気下、ジ−tert−ブチル2−ブロモテレフタラート(1.00g,2.80mmol)のTHF(14.0mL)/n−ヘキサン(7mL)混合溶液に、内温−95℃以下でn−ブチルリチウム(2.76Mヘキサン溶液、1.014mL,2.80mmol)を滴下した。同温で10分間撹拌した後、製造例4−(3)で得られた3,7−ビス((tert−ブチルジメチルシリル)オキシ)−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オン(377mg,0.70mmol)のTHF(7mL)溶液を内温−95℃以下で滴下した。同温で5分間撹拌した後、三フッ化ホウ素ジエチルエーテル錯体(178μL,1.40mmol)を滴下した。反応混合物を徐々に室温まで昇温させ、室温で12時間撹拌撹拌した。氷浴下、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を水及び飽和食塩水で洗浄した。混合物を無水硫酸マグネシウムで乾燥させ、溶媒を留去することで付加体を含む混合物を得た。得られた混合物にTHF(7.0mL)及びテトラブチルアンモニウムフルオリド(1.00M THF溶液,3.5mL,3.5mmol)を加え、室温で7時間撹拌した。氷浴下、飽和塩化アンモニウム水溶液を加えることで反応を停止させた。水層を酢酸エチルで抽出し、有機層を減圧下濃縮した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(n−ヘプタン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物を、3,7−ジヒドロキシ−10H−スピロ[ジベンゾ[b,e]シリン−5,1’−シリナン]−10−オンとの混合物(300mg)として得た。
実施例36−(1)で得た化合物(104.9mg,0.20mmol)のDCM(4.00mL)溶液に、TFA(400μL)を加え、室温で一晩撹拌した。溶媒を減圧留去し、残存のTFAをメタノールで共沸除去することで標記化合物の粗生成物を得た。
実施例36−(2)の方法で得た化合物のDMF(10.0mL)溶液に、TEA(170μL,1.22mmol)、N−(2−アミノエチル)マレイミドTFA塩(118.7mg,0.47mmol)及びPyBOP(158.7mg,0.30mmol)を加えた。反応混合物を室温で2時間撹拌した後、混合物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル)で精製することで標記化合物(15.7mg,27.0μmol)を得た。
1H−NMR(500MHz,MeOH−d4)δ(ppm):1.16−1.19(m,2H),1.25−1.28(m,2H),1.73−1.78(m,2H),2.00−.2.08(m,2H),2.13−2.23(m,2H),3.50−3.58(m,2H),3.68−3.73(m,2H),6.68(dd,J=8.80,2.75Hz,2H),6.72(s,2H),6.76−6.79(m,2H),7.32(d,J=2.70Hz,2H),7.65(br.s.,1H),7.93(dd,J=8.05,1.35Hz,1H),7.98−8.01(m,1H).
ESI−MS m/z 581[M+H]+
量子化学計算ソフトGaussian09(Gaussian社)を用いて、各実施例の化合物の開環体の構造最適化を実施し、9位炭素(図1参照。なお、図1では、一例として実施例19が示される)の原子電荷をマリケン電荷法によって算出した。(計算条件:APFD/6-311G+(2d, p)、IEFPCM/Ethanol)
各実施例の化合物に対応する比較例として、Si原子を含むスピロ環構造(以下、Siスピロ環部位と呼ぶ)に代えて、置換基として2つのメチル基を有するSi原子としたこと以外は同じ構造を有する化合物についても、実験例1と同様の操作で9位炭素のマリケン電荷を算出した。
図2に示すように、Siスピロ環部位を有する化合物においてマリケン電荷が上昇した。マリケン電荷が上昇することにより、開環体から閉環体に平衡が移動しやすくなり、デューティサイクルが低下すると考えられる。
<化合物での抗体の標識>
〔2-メルカプトエチルアミン(MEA)による抗体の還元〕
はじめにエチレンジアミン四酢酸二ナトリウム塩(EDTA・2Na)を超純水に混合してエチレンジアミン四酢酸(EDTA) 0.10M、pH 6.0の溶液(以下、EDTA溶液)を調製した。次に、NaH2PO4・2H2O、EDTA・2Naを超純水に混合して0.10 M NaH2PO4、1.0 mM EDTA、pH 6.0の溶液(以下、反応溶液と呼ぶ)を調製した。続いて、反応溶液とMEAを混合し0.35 M MEAの溶液(以下、MEA溶液)を調製した。最後に、抗アミロイドβ抗体6E10溶液(Biolegend社)を、体積比でアミロイドβ抗体6E10溶液:EDTA溶液:MEA溶液=体積比で100:1:10となるように混合し、ヒートブロックを用いて37℃で90分間加温した(以下、抗体溶液1と呼ぶ)。
Amicon Filters 10kDa(Merck Millipore社)を用いて、14k×gで遠心することにより未反応のMEAを除去した溶液を得た(以下、抗体溶液2と呼ぶ)。
抗体溶液2の抗体濃度を吸光度に基づいて定量した。次に、抗体溶液2と実施例1及び実施例19で合成した化合物を、モル比で抗体:化合物=1:50になるように混合し、ヒートブロックを用いて37℃で1時間加温した。
Amicon Filters 10kDa(Merck Millipore社)を用いて、標識反応後の抗体溶液を添加し、総量が0.50 mLとなるようPhosphate buffered saline(Sigama社)(以下、PBSと呼ぶ)を添加して14k×gで遠心することにより未反応の化合物を除去し、化合物で標識された抗体の溶液を得た(以下、抗体溶液3と呼ぶ)。以下、各化合物で標識された抗体を「標識抗体」と呼ぶ。
はじめに、アセトニトリル及びトリフルオロ酢酸を超純水に混合して30%アセトニトリル及び0.10%トリフルオロ酢酸に調製した溶液(以下、TA30溶液と呼ぶ)を調製した。シナピン酸1.0 mgに対してTA30溶液を0.10 mL加え、10分間超音波をかけた。その後、遠心分離してその上清をマトリックスとして用いた。抗体溶液3を10μLとり、0.20%トリフルオロ酢酸の水溶液を用いて2倍に希釈した。マイクロピペッターにZipTip U-C18(Merck Millipore社)を装着し、10μLのTA30溶液で先端のレジンを洗浄したのち、標識抗体をレジンに吸着させた。その後、シナピン酸のマトリックスを3.0μL吸い取り、MALDIプレート(Bruker社)上に標識抗体を溶出させた。サンプルがプレート上で乾燥したのち、Ultraflex MALDI-TOF MS(Bruker社)を用いて標識数の測定を行い、それぞれ1〜3分子の化合物で抗体が標識されていることを確認した。
〔1分子測定に用いるガラスの作製〕
カバーガラス(松浪硝子工業株式会社)を、UVオゾンクリーナーUV-1(Samco社)を用いて1分間洗浄した(以下、UVオゾン洗浄ガラスと呼ぶ)。測定には洗浄後12時間以上経たガラスを用いた。
PBSを超純水に混合して調製したpH 7.4のPBS溶液を用いて抗体溶液3を1分子発光の輝点同士が重ならずに検出できる濃度に希釈した。UVオゾン洗浄ガラス上に100μL滴下し、遮光・室温環境で10分間静置した。超純水1.0 mLを用いて、希釈した抗体溶液3を3回洗い流し、標識抗体を表面に保持したガラス試料を得た(以下、標識抗体保持ガラス試料と呼ぶ)。
トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンとNaClを超純水に混合して、50 mMトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン、10 mM NaCl、pH 7.4のトリス緩衝生理食塩水(以下、TBS溶液と呼ぶ)を調製した。TBS溶液を用いて表1の条件で観察溶液を調整した(以下、観察溶液と呼ぶ)。
蛍光顕微鏡IX81(Olympus社)、レーザー発振器OBIS(Coherent社、レーザー波長640 nm)、EMCCDカメラiXon(Andor社)からなる顕微鏡システムを使用して観察を行った。標識抗体保持ガラス試料をステージに載せ、観察溶液を50μL滴下した。表2の撮像条件で観察を行った。
観察された輝点それぞれに対して、輝度の時間変化を解析した。蛍光色素である各化合物1分子は、発光状態と消光状態を繰り返す明滅現象を示す。励起光の照射開始時から最後に発光状態から消光状態へと変化するまでの時間を明滅持続時間と定義し、各化合物1分子の明滅時間を算出した。さらに、発光時間の積算(ON時間)を算出したのち、デューティサイクルを「ON時間/明滅持続時間」として算出した。その後、各化合物1分子のデューティーサイクルを平均して算出したものを、各化合物のデューティーサイクルとした(Tynan C.J.ら, PLoS one, 2012, Vol.7,e36265参照)。一般に、デューティサイクルが小さいほど、蛍光色素の1分子発光を検出しやすくなる。よって、デューティサイクルの小さい蛍光色素は、超解像イメージングに適しているとされる。
図3に示す化合物A(実施例19の比較例)及び化合物B(実施例1の比較例)を用いた点以外は実験例2と同様の操作でデューティサイクルを測定した。その結果、図4に示すように、Siスピロ環部位を導入した実施例19及び実施例1の化合物は、それぞれ化合物A及び化合物Bと比べて低いデューティサイクルであることが確認された。
実験例2と同様の操作で実施例1から実施例36のデューティサイクルを測定した。その結果を図5に示す。なお、実施例36の化合物は、Si置換キサンテン骨格の3位と6位にヒドロキシ、或いはケトンを有しており、吸収極大波長が実施例1から実施例35の化合物とは異なるため、研究用1分子蛍光顕微鏡HM-1000(シスメックス株式会社)を使用し、観察溶媒にProlong(商標) Live(Thermo Fisher Scientific社)を用いて、表2の条件で評価を行った。それらの点以外は実験例2と同様の操作でデューティサイクルを測定した。
〈固定細胞における微小管の超解像イメージング〉
4%パラホルムアルデヒド含有PBS溶液を用いて固定化したHeLa細胞に対して、0.5% Triton X-100含有PBS溶液を添加して透過処理を行った。続いて、3% BSA/0.5% Triton X-100含有PBS溶液を添加して、細胞をブロッキング処理したのち、一次抗体として抗チューブリン抗体(T5201, Thermo Fisher Scientific社)を0.2% BSA/0.1% TritonX-100含有PBS溶液で10μg/mLに希釈して添加した場合と、添加しない場合の2種類の細胞を用意した。さらに、二次抗体として、マレイミド基を介して実施例7及び実施例36の化合物で標識した抗マウスIgG抗体(ab6708, Abcam社)をそれぞれ作製し、0.2% BSA/0.1% TritonX-100含有PBS溶液で10 μg/mLに希釈して添加した。最後に、観察溶媒としてPBSで希釈したProlong(商標) Liveを添加し、HM-1000(シスメックス社)にて透過光像と蛍光像を撮像した。蛍光像の撮像条件を表3に示す。
Claims (22)
- 以下の式(I)で示される化合物もしくはその互変異性体、又はその塩からなる蛍光色素:
Aは、置換基を有していてもよいSiを含むC4〜C7の複素環を示し、
Xは、ヒドロキシ又は−NR1R2を示し、
Y1は、=O又は=N+R3R4を示し、
R1、R2、R3、R4、R5及びR6は、独立して、H、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル、又は置換基を有していてもよいC1〜C6のヘテロアルキルを示し、R1とR2、R3とR4、R1とR5、及びR3とR6の組み合わせの少なくとも一つは、それらが結合するNと一緒になって、置換基を有していてもよいNを含む複素環を形成していてもよく、
R7、R8、R9、R10及びR11は、独立して、H、ハロゲン、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルコキシ、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキルチオ、置換基を有していてもよいアミノ、置換基を有していてもよいアリール、置換基を有していてもよいヘテロアリール、−CO2H、−CO2 -、−SO3H、−SO3 -、及び−L−Rからなる群から選択され;
Lは、1〜16個の非水素原子を有する、直鎖、分岐鎖、環又はこれらの任意の組み合わせ構造の2価のリンカーであり、ここで、リンカー中に1以上のヘテロ原子が存在する場合、当該ヘテロ原子はエステル、アミン、アミド、エーテル、チオエーテル、カルボニルからなる群から独立して選択される1以上の基として含まれ;
Rは反応基であり;及び
R7、R8、R9、R10及びR11のうち隣り合う2つの基の1以上の組み合わせは共に環を形成していてもよい;
ただし、R1とR5、及びR3とR6の組み合わせの少なくとも一つが、それらが結合するNと一緒になって、置換基を有していてもよいNを含む複素環を形成し、かつR2及びR4が置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキルである化合物及びその互変異性体並びにその塩を除く。) - Xは−NR1R2であり、Y1は=N+R3R4である、請求項1に記載の蛍光色素。
- R1、R2、R3及びR4は、独立して、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル又は置換基を有していてもよいC1〜C6のOを含むヘテロアルキルである、請求項2に記載の蛍光色素。
- R1とR2、及びR3とR4の組み合わせはいずれも、それらが結合するNと一緒になって、置換基を有していてもよいNを含む複素環を形成する、請求項3に記載の蛍光色素。
- Xはヒドロキシであり、Y1は=Oである、請求項1に記載の蛍光色素。
- Aは、ハロゲン、C1〜C6のアルキル、C1〜C6のハロアルキル、C1〜C6のアルコキシ、C1〜C6のアルキルチオ、アミノ、アリール、ヘテロアリール、−CO2H及び−SO3Hから独立して選択される1以上の置換基により置換されていてもよいSiを含むC4〜C7の複素環である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の蛍光色素。
- R1、R2、R3、R4、R5、R6、R7、R8、R9、R10及びR11において、
置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキル、置換基を有していてもよいC1〜C6のヘテロアルキル、置換基を有していてもよいC1〜C6のアルコキシ、及び置換基を有していてもよいC1〜C6のアルキルチオの置換基は、いずれも、独立して、ハロゲン、C1〜C6のアルコキシ、C1〜C6のアルキルチオ、アミノ、アリール、ヘテロアリール、−CO2H及び−SO3Hから選択され、
置換基を有していてもよいアミノ、置換基を有していてもよいNを含む複素環、置換基を有していてもよいアリール、及び置換基を有していてもよいヘテロアリールの置換基は、いずれも、独立して、ハロゲン、C1〜C6のアルキル、C1〜C6のヒドロキシアルキル、C1〜C6のアルコキシ、C1〜C6のアルキルチオ、アミノ、アリール、ヘテロアリール、−CO2H及び−SO3Hから選択される、請求項1〜7のいずれか一項に記載の蛍光色素。 - R8及びR11はHである、請求項1〜8のいずれか一項に記載の蛍光色素。
- Rが、ヒドロキシ、カルボキシル、スルホン酸、不飽和イミド、不飽和アミド、不飽和エステル、カルボン酸の活性化エステル、アミン、アルコール、ニトリル、メルカプタン、ボロナート、ホスホラミダイト、ハロゲン化アルキル、ハロゲン化スルホニル、アルファ位にハロゲンを有するアミド又はエステル、イソシアナート、イソチオシアナート、アジド、アルデヒド、アシルニトリル、及び光活性化可能な基から選択される、請求項1〜10のいずれか一項に記載の蛍光色素。
- −L−Rが、−CONH−L’−Rであり、ここで、L’は1〜13個の非水素原子を有する、直鎖、分岐鎖、環又はこれらの任意の組み合わせ構造の2価のリンカーであり、ここで、リンカー中に1つ以上のヘテロ原子が存在する場合、当該ヘテロ原子はエステル、アミン、アミド、エーテル、チオエーテル、及びカルボニルからなる群から独立して選択される1つ以上の基として含まれている、請求項1〜11のいずれか一項に記載の蛍光色素。
- 請求項1〜14のいずれか一項に記載の蛍光色素と複合化物質が結合した標識複合化物質。
- 複合化物質がタンパク質又は核酸である請求項15に記載の標識複合化物質。
- 請求項1〜14のいずれかに記載の蛍光色素、又は請求項15もしくは16に記載の標識複合化物質を含む、組成物。
- 超解像顕微鏡法に用いられる試薬組成物である、請求項17に記載の組成物。
- 前記超解像顕微鏡法が局在化顕微鏡法である、請求項18に記載の組成物。
- 請求項1〜14のいずれかに記載の蛍光色素、又は請求項15もしくは16に記載の標識複合化物質を被検物質と結合させ、超解像顕微鏡法により前記被検物質に関する情報を取得する方法。
- 前記被検物質に関する情報が、前記被検物質の構造に関する情報である、請求項20に記載の方法。
- 前記被検物質の構造に関する情報が、前記被検物質の大きさ、形態及び凝集度から選択される少なくとも1つの情報である、請求項21に記載の方法。
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