JP2021098732A - Ｎｋｇ２ｄ、ｃｄ１６、およびｅｇｆｒ、ｃｃｒ４、またはｐｄ−ｌ１に結合するタンパク質 - Google Patents

Ｎｋｇ２ｄ、ｃｄ１６、およびｅｇｆｒ、ｃｃｒ４、またはｐｄ−ｌ１に結合するタンパク質 Download PDF

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Abstract

【課題】１種類を超えるＮＫ活性化受容体と会合することができ、ＮＫＧ２Ｄへの天然のリガンドの結合を遮断し得るタンパク質を提供する。【解決手段】タンパク質であって、（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；（ｂ）ＥＧＦＲ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する第２の抗原結合部位；および（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位を含む、タンパク質である。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本出願は、２０１７年８月１６日出願の米国特許仮出願第６２／５４６，３００号；２０１７年８月１６日出願の米国特許仮出願第６２／５４６，２９７号；２０１７年８月３０日出願の米国特許仮出願第６２／５５２，１５２号；および２０１７年９月７日出願の米国特許仮出願第６２／５５５，１１４号（その各々の内容全体が全ての目的のために本明細書によって参考として援用される）の利益および優先権を主張する。
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩ形式で電子的に提出された配列表を含み、この配列表は、その全体が本明細書によって参考として援用される。２０１８年８月１５日に作成された前記ＡＳＣＩＩコピーの名称はＤＦＹ−０３３ＷＯ＿ＳＬ．ｔｘｔであり、サイズは２１４，４１３バイトである。
本発明は、ＮＫＧ２Ｄ、ＣＤ１６、ならびにＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する多特異性結合タンパク質に関する。
がんは、この疾患を処置するための文献に報告されている膨大な研究成果および科学の進歩をもってしても依然として深刻な健康上の問題である。血液および骨髄のがんは、頻繁に診断されるがん型であり、これには多発性骨髄腫、白血病、およびリンパ腫が挙げられる。これらのがんのための現状の処置の選択肢では、全ての患者に有効という訳ではなく、そして／または非常に有害な副作用を有し得る。他のがん型もまた、既存の治療選択肢を使用した処置は依然として困難である。
がん免疫療法は、特異性が高く、患者自身の免疫系を使用してがん細胞の破壊を促進することができるので望ましい。二重特異性Ｔ細胞エンゲージャーなどの融合タンパク質は、腫瘍細胞および腫瘍細胞の破壊を容易にするＴ細胞に結合する文献に記載のがん免疫療法である。ある特定の腫瘍−関連抗原およびある特定の免疫細胞に結合する抗体が文献に記載されている。例えば、ＷＯ２０１６／１３４３７１号およびＷＯ２０１５／０９５４１２号を参照のこと。
ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞は、先天性免疫系の構成要素であり、およそ１５％の循環リンパ球で構成されている。ＮＫ細胞は、実質的に全ての組織に浸潤し、事前感作を必要とせずに腫瘍細胞を有効に死滅させる能力が最初に特徴づけられた。活性化ＮＫ細胞は、細胞傷害性Ｔ細胞と類似の手段によって（すなわち、パーフォリンおよびグランザイムを含む細胞溶解性顆粒ならびにデスレセプター経路を介して）標的細胞を死滅させる。活性化ＮＫ細胞はまた、他の白血球の標的組織への動員を促進するＩＦＮ−γなどの炎症性サイトカインおよびケモカインを分泌する。
ＮＫ細胞は、その表面上の種々の活性化受容体および抑制性受容体を通してシグナルに応答する。例えば、ＮＫ細胞が健康な自己細胞と遭遇したとき、キラー細胞免疫グロブリン様受容体（ＫＩＲ）の活性化によってその活性が抑制される。あるいは、ＮＫ細胞が外来細胞またはがん細胞に遭遇したとき、ＮＫ細胞は、その活性化受容体（例えば、ＮＫＧ２Ｄ、ＮＣＲ、ＤＮＡＭ１）を介して活性化される。ＮＫ細胞はまた、その表面上のＣＤ１６受容体を通じていくつかの免疫グロブリンの定常領域によって活性化される。ＮＫ細
胞の活性化に対する全体的な感受性は、刺激シグナルと抑制シグナルとの合計に依存する。
上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ；ＥｒｂＢ−１；ＨＥＲ１）は、細胞外タンパク質リガンドの上皮成長因子ファミリー（ＥＧＦファミリー）のメンバーのための受容体である膜貫通タンパク質である。その特異的リガンド（上皮成長因子およびトランスフォーミング成長因子α（ＴＧＦα）が含まれる）の結合の際に、ＥＧＦＲは、不活性な単量体形態から他のＥｒｂＢファミリー受容体との活性なホモ二量体またはヘテロ二量体に移行する。二量体化はその内因性の細胞内タンパク質−チロシンキナーゼ活性を刺激し、下流シグナル伝達カスケードを誘発して、ＤＮＡ合成および細胞増殖をもたらす。ＥＧＦＲは、細胞の遊走、接着、および増殖などの表現型のモジュレーションに関与する。
ＥＧＦＲの過剰発現または過剰活性をもたらす変異は、いくつかのがん（非小細胞肺がん、肛門がん、膠芽細胞腫、および頭頸部の上皮腫瘍が含まれる）に関連している。ＥＧＦＲが関与するこれらの体細胞変異によりＥＧＦＲが常時活性化され、それにより、無制御の細胞分裂が起こる。膠芽細胞腫では、差はあるが、ＥＧＦＲｖＩＩＩと呼ばれるＥＧＦＲの特異的変異が認められることが多い。ＥＧＦＲまたはファミリーメンバーの変異、増幅、または誤調節は、他の固形腫瘍（結腸直腸がん、腎細胞癌、膀胱がん、子宮頸がん、卵巣がん、膵臓がん、および肝臓がんが含まれる）に関与している。
免疫系は腫瘍発生で重要な役割を果たし、免疫監視の回避は、がんの重要な特徴のうちの１つとなっている。ＨＬＡ−Ｅは、非古典的主要組織適合性遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子である。ＨＬＡ−Ｅは非古典的ＨＬＡ−クラスＩｂファミリーに属し、このファミリーにはＨＬＡ−Ｇ、ＨＬＡ−Ｆ、およびＨＬＡ−Ｈも含まれる。ＨＬＡ−Ｅの機能は、ＨＬＡ−クラスＩ分子（ＨＬＡ−Ａ、−Ｂ、−Ｃ、および−Ｇ）のリーダー配列に由来するペプチドに結合すること、および抑制性受容体ＣＤ９４／ＮＫＧ２Ａとの相互作用によってこれらをＮＫ細胞に提示することにより、ＨＬＡ−クラスＩ分子を正常レベルで発現する細胞に対するＮＫ細胞溶解を抑制することである。この機序は、免疫監視を回避するために多くのがん（リンパ腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、および肉腫が含まれる）によって利用されている。
ＣＣＲ４は、ＣＣケモカイン（ＣＣＬ２、ＣＣＬ４、ＣＣＬ５、ＣＣＬ１７、およびＣＣＬ２２が含まれる）のためのＣ−Ｃ型ケモカイン受容体である。ケモカインは、種々の白血球型の細胞輸送を調節する小型の構造的に関連するタンパク質群であり、免疫系の発生、ホメオスタシス、および機能で基本的役割を果たす。さらに、ＣＣＲ４は、いくつかのタイプの悪性疾患（成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病（ＡＴＬＬ）、末梢Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞悪性疾患、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、胸腺腫、胃がん、および腎細胞癌が含まれる）で発現されることが示されている。
プログラム死リガンド１（ＰＤ−Ｌ１）は、免疫ホメオスタシスの維持において重要な役割を果たす。ＰＤ−Ｌ１は、Ｔ細胞上のＰＤ−１受容体に結合し、細胞傷害性Ｔ細胞を下方調節し、それにより、付随的傷害から正常細胞を防御する。腫瘍の発生および進行は、特殊な腫瘍免疫微小環境の形成を伴う。腫瘍細胞は、ＰＤ−Ｌ１の過剰発現によって免疫監視を回避し、宿主の免疫チェックポイントを破壊することができる。ＰＤ−Ｌ１がＰＤ−１に結合する場合、抑制シグナルがＴ細胞に伝達され、それにより、サイトカイン産生が低下し、Ｔ細胞増殖が抑制される。腫瘍細胞は、検出を回避して免疫応答を抑制する機構としてこの免疫チェックポイント経路を活用する。ＰＤ−Ｌ１は、種々のタイプのがん、特に、リンパ腫、白血病、多発性骨髄腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、肉腫、および胃がんにおい
て過剰発現される。
国際公開第２０１６／１３４３７１号 国際公開第２０１５／０９５４１２号
本発明は、ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体、ならびにＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する多特異性結合タンパク質を提供する。かかるタンパク質は、１種類を超えるＮＫ活性化受容体と会合することができ、ＮＫＧ２Ｄへの天然のリガンドの結合を遮断し得る。ある特定の実施形態では、タンパク質は、ヒトのＮＫ細胞をアゴナイズすることができる。いくつかの実施形態では、タンパク質は、ヒトならびにげっ歯類およびカニクイザルなどの他の種のＮＫ細胞をアゴナイズすることができる。本発明の種々の態様および実施形態を、以下にさらに詳細に記載する。
したがって、本発明の１つの態様は、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位；および抗体断片結晶性（Ｆｃ）ドメイン、ＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位が組み込まれたタンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、ヒトのＮＫＧ２Ｄに結合する。
抗原結合部位は、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインをそれぞれ組み込む（例えば、抗体にあるように配置されるか、共に融合して単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を形成する）ことができるか、あるいは、１またはそれを超える抗原結合部位は、単一ドメイン抗体（ラクダ抗体のようなＶＨＨ抗体または軟骨魚類で認められるようなＶＮＡＲ抗体など）であり得る。例えば、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位は、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位は、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位は、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位、第２の抗原結合部位、および第３の抗原結合部位のうちの２つまたはそれを超える部位は、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位は、単一ドメイン抗体（例えば、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片）である。いくつかの実施形態では、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位は、単一ドメイン抗体（例えば、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片）である。いくつかの実施形態では、ＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位は、単一ドメイン抗体（例えば、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片）である。いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位、第２の抗原結合部位、および第３の抗原結合部位のうちの２つまたはそれを超える部位は、単一ドメイン抗体（例えば、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片）である。
いくつかの実施形態では、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインは、同一のポリペプチド上に存在する。例えば、いくつかの実施形態では、ＮＫＧ２Ｄに結合する
第１の抗原結合部位は、同一のポリペプチド上に存在する抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位は、同一のポリペプチド上に存在する抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位は、同一のポリペプチド上に存在する抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位、第２の抗原結合部位、および第３の抗原結合部位のうちの２つまたはそれを超える部位は、同一のポリペプチド上に存在する抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを含む。
１つの態様では、本発明は、（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合するＦａｂ断片を含む第１の抗原結合部位；（ｂ）ＥＧＦＲに結合する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を含む第２の抗原結合部位；および（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位を含むタンパク質を提供する。本発明は、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位がＦａｂ断片であり、腫瘍−関連抗原ＥＧＦＲに結合する第２の抗原結合部位がｓｃＦｖであるタンパク質を提供する。
本開示に記載のある特定のタンパク質は、Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介して抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位に連結した重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含むｓｃＦｖを含む。本開示のいくつかのタンパク質は、抗体Ｆｃドメインに連結したｓｃＦｖを含む。本開示のいくつかのタンパク質は、ｓｃＦｖの重鎖可変ドメインを含み、このドメインがｓｃＦｖの軽鎖可変ドメインとジスルフィド架橋を形成している。
本開示のいくつかのタンパク質は、ｓｃＦｖ断片を含み、ここで、ジスルフィド架橋は、重鎖可変ドメイン由来のＣ４４と軽鎖可変ドメイン由来のＣ１００との間に形成されている。
本開示のいくつかのタンパク質は、抗体Ｆｃドメインに連結したｓｃＦｖを含み、ここで、ｓｃＦｖの軽鎖可変ドメインは、ｓｃＦｖの重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されており、可動性リンカー（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）４（Ｇ４Ｓ）４）（配列番号２６３）を介してｓｃＦｖの重鎖可変ドメインに連結しており、Ｆａｂが抗体Ｆｃドメインに連結している。
本開示のいくつかのタンパク質は、可動性リンカー（例えば、（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）４（（Ｇ４Ｓ）４）リンカー）を介してｓｃＦｖの軽鎖可変ドメインに連結したｓｃＦｖの重鎖可変ドメインを含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、重鎖可変ドメインがｓｃＦｖの軽鎖可変ドメインのＮ末端またはＣ末端に配置されているｓｃＦｖを含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、軽鎖可変ドメインがｓｃＦｖの重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されているｓｃＦｖを含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位に連結されたＦａｂ断片を含む。
本開示のいくつかのタンパク質はＦａｂ断片を含み、ここで、Ｆａｂ断片の重鎖部分が重鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、重鎖可変ドメインがＣＨ１ドメインに連
結している。
本開示のいくつかのタンパク質は、抗体Ｆｃドメインに連結されたＦａｂを含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６４、配列番号２６５、および配列番号２６６から選択される配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、抗体Ｆｃドメインに連結されたｓｃＦｖを含み、ここで、抗体Ｆｃドメインに連結されたｓｃＦｖが、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択される配列で表されている。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２７０、ＳＥＱ、および配列番号２７１の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６４、配列番号２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６４、配列番号２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６４、配列番号２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む。
本開示のいくつかのタンパク質は、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む。
１つの態様では、本発明は、ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体、ならびにＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する多特異性結合タンパク質を提供する。ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位は、配列番号１、配列番号４１、配列番号４９、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６９、配列番号７７、配列番号８５、および配列番号９３のアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインを含む。
ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位は、いくつかの実施形態では、配列番号１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列を有すること、および／または配列番号１のＣＤＲ１配列（配列番号１０５）、ＣＤＲ２配列（配列番号１０６）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１０７）と同一のアミノ酸配列を組み込むことによるなど、配列番号１に関連する重鎖可変ドメインを組み込むことができる。配列番号１に関連する重鎖可変ドメインを種々の軽鎖可変ドメインとカップリングして、ＮＫＧ２Ｄ結合部位を形成することができる。例えば、配列番号１に関連する重鎖可変ドメインが組み込まれた第１の抗原結合部位は、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、および４０に関連す
る配列のうちのいずれか１つから選択される軽鎖可変ドメインをさらに組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位は、配列番号１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメインならびに配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、および４０から選択される配列のうちのいずれか１つと少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインが組み込まれている。
あるいは、第１の抗原結合部位は、配列番号４１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号４２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号４１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号４１のＣＤＲ１配列（配列番号４３）、ＣＤＲ２配列（配列番号４４）、およびＣＤＲ３配列（配列番号４５）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号４２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号４２のＣＤＲ１配列（配列番号４６）、ＣＤＲ２配列（配列番号４７）、およびＣＤＲ３配列（配列番号４８）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
他の実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号４９に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号５０に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号４９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号４９のＣＤＲ１配列（配列番号５１）、ＣＤＲ２配列（配列番号５２）、およびＣＤＲ３配列（配列番号５３）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号５０と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号５０のＣＤＲ１配列（配列番号５４）、ＣＤＲ２配列（配列番号５５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号５６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第１の抗原結合部位は、配列番号５７に少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列および配列番号５８に少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列をそれぞれ有することによるなど、配列番号５７に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号５８に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。
別の実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号５９に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号６０に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができ、例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号５９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号５９のＣＤＲ１配列（配列番号１３４）、ＣＤＲ２配列（配列番号１３５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１３６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号６０と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４
％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号６０のＣＤＲ１配列（配列番号１３７）、ＣＤＲ２配列（配列番号１３８）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１３９）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位は、いくつかの実施形態では、配列番号６１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号６２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号６１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号６１のＣＤＲ１配列（配列番号６３）、ＣＤＲ２配列（配列番号６４）、およびＣＤＲ３配列（配列番号６５）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号６２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号６２のＣＤＲ１配列（配列番号６６）、ＣＤＲ２配列（配列番号６７）、およびＣＤＲ３配列（配列番号６８）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号６９に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号７０に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号６９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号６９のＣＤＲ１配列（配列番号７１）、ＣＤＲ２配列（配列番号７２）、およびＣＤＲ３配列（配列番号７３）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号７０と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号７０のＣＤＲ１配列（配列番号７４）、ＣＤＲ２配列（配列番号７５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号７６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号７７に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号７８に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号７７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号７７のＣＤＲ１配列（配列番号７９）、ＣＤＲ２配列（配列番号８０）、およびＣＤＲ３配列（配列番号８１）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号７８と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号７８のＣＤＲ１配列（配列番号８２）、ＣＤＲ２配列（配列番号８３）、およびＣＤＲ３配列（配列番号８４）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号８５に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号８６に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号８５と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号８５のＣＤＲ１配列（配列番号８７）、ＣＤＲ２配列（配列番号８８）、およびＣＤＲ３配列（配列番号８９）と同一
のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号８６と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号８６のＣＤＲ１配列（配列番号９０）、ＣＤＲ２配列（配列番号９１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号９２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号９３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号９４に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第１の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号９３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号９３のＣＤＲ１配列（配列番号９５）、ＣＤＲ２配列（配列番号９６）、およびＣＤＲ３配列（配列番号９７）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号９４と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号９４のＣＤＲ１配列（配列番号９８）、ＣＤＲ２配列（配列番号９９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１００）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号１０１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列および配列番号１０２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列をそれぞれ有することによるなど、配列番号１０１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１０２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位は、配列番号１０３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列および配列番号１０４と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一のアミノ酸配列をそれぞれ有することによるなど、配列番号１０３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１０４に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号２１７に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１０９に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号２１７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号２１７のＣＤＲ１配列（配列番号２１８）、ＣＤＲ２配列（配列番号２１９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２２０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１０９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１０９のＣＤＲ１配列（配列番号１１０）、ＣＤＲ２配列（配列番号１１１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１１２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１１３に
関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１１７に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１１３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１１３のＣＤＲ１配列（配列番号１１４）、ＣＤＲ２配列（配列番号１１５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１１６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１１７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１１７のＣＤＲ１配列（配列番号１１８）、ＣＤＲ２配列（配列番号１１９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１２０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１２１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１２５に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１２１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１２１のＣＤＲ１配列（配列番号１２２）、ＣＤＲ２配列（配列番号１２３）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１２４）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１２５と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１２５のＣＤＲ１配列（配列番号１２６）、ＣＤＲ２配列（配列番号１２７）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１２８）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１２９に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１３３に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１２９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１２９のＣＤＲ１配列（配列番号１３０）、ＣＤＲ２配列（配列番号１３１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１３２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１３３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１３３のＣＤＲ１配列（配列番号１４０）、ＣＤＲ２配列（配列番号１４１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１４２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１４３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１４７に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１４３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１４３のＣＤＲ１配列（配列番号１４４）、ＣＤＲ２配列（配列番号１４５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１４６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１４７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１４７のＣＤＲ１配列（配列番号１４８）、ＣＤＲ２配列（配列番号１４９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１５０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１５１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１５２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１５１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１５２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得る。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１５３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１５４に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１５３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５３のＣＤＲ１配列（配列番号２２７）、ＣＤＲ２配列（配列番号２２８）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２２９）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１５４と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５４のＣＤＲ１配列（配列番号２３０）、ＣＤＲ２配列（配列番号２３１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２３２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１５５に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１５６に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１５５と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５５のＣＤＲ１配列（配列番号２３３）、ＣＤＲ２配列（配列番号２３４）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２３５）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１５６と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５６のＣＤＲ１配列（配列番号２３６）、ＣＤＲ２配列（配列番号２３７）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２３８）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１５７に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１５８に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１５７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５７のＣＤＲ１配列（配列番号２３９）、ＣＤＲ２配列（配列番号２４０）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２４１）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１５８と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５８のＣＤＲ１配列（配列番号２４２）、ＣＤＲ２配列（配列番号２４３）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２４４）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１５９に
関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１６０に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１５９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１５９のＣＤＲ１配列（配列番号２４５）、ＣＤＲ２配列（配列番号２４６）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２４７）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１６０と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６０のＣＤＲ１配列（配列番号２４８）、ＣＤＲ２配列（配列番号２４９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２５０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１６１に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１６２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１６１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６１のＣＤＲ１配列（配列番号２５１）、ＣＤＲ２配列（配列番号２５２）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２５３）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１６２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６２のＣＤＲ１配列（配列番号２５４）、ＣＤＲ２配列（配列番号２５５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２５６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＥＧＦＲに結合することができ、配列番号１６３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１６４に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１６３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６３のＣＤＲ１配列（配列番号２５７）、ＣＤＲ２配列（配列番号２５８）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２５９）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１６４と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６４のＣＤＲ１配列（配列番号２６０）、ＣＤＲ２配列（配列番号２６１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２６２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＰＤ−Ｌ１に結合することができ、配列番号１６７に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１７１に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１６７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１６７のＣＤＲ１配列（配列番号１６８）、ＣＤＲ２配列（配列番号１６９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１７０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１７１と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１７１のＣＤＲ１配列（配列番号１７２）、ＣＤＲ２配列（配列番号１７３）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１７４）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＰＤ−Ｌ１に結合することができ、配列番号１７５に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１７９に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１７５と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１７５のＣＤＲ１配列（配列番号１７６）、ＣＤＲ２配列（配列番号１７７）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１７８）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１７９と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１７９のＣＤＲ１配列（配列番号１８０）、ＣＤＲ２配列（配列番号１８１）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１８２）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＰＤ−Ｌ１に結合することができ、配列番号１８３に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１８７に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１８３と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１８３のＣＤＲ１配列（配列番号１８４）、ＣＤＲ２配列（配列番号１８５）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１８６）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１８７と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１８７のＣＤＲ１配列（配列番号１８８）、ＣＤＲ２配列（配列番号１８９）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１９０）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＣＣＲ４に結合することができ、配列番号１９２に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号１９６に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号１９２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１９２のＣＤＲ１配列（配列番号１９３）、ＣＤＲ２配列（配列番号１９４）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１９５）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号１９６と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号１９６のＣＤＲ１配列（配列番号１９７）、ＣＤＲ２配列（配列番号１９８）、およびＣＤＲ３配列（配列番号１９９）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＣＣＲ４に結合することができ、配列番号２００に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号２０４に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号２００と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号２００のＣＤＲ１配列（配列番号２０１）、ＣＤＲ２配列（配列番号２０２）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２０３）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号２０４と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号２０４のＣＤＲ１配列（配列番号
２０５）、ＣＤＲ２配列（配列番号２０６）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２０７）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
あるいは、第２の抗原結合部位は、ＣＣＲ４に結合することができ、配列番号２０８に関連する重鎖可変ドメインおよび配列番号２１２に関連する軽鎖可変ドメインを組み込むことができる。例えば、第２の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号２０８と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号２０８のＣＤＲ１配列（配列番号２０９）、ＣＤＲ２配列（配列番号２１０）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２１１）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。同様に、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号２１２と少なくとも９０％（例えば、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％）同一であり得、そして／または配列番号２１２のＣＤＲ１配列（配列番号２１３）、ＣＤＲ２配列（配列番号２１４）、およびＣＤＲ３配列（配列番号２１５）と同一のアミノ酸配列を組み込むことができる。
いくつかの実施形態では、第１の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含む。例えば、いくつかの実施形態では、ＮＫＧＤ２に結合する第１の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質には、ＣＤ１６に結合するのに十分な抗体Ｆｃドメインの一部が組み込まれており、ここで、抗体Ｆｃドメインが、ヒンジおよびＣＨ２ドメイン（例えば、ヒトＩｇＧ抗体のヒンジおよびＣＨ２ドメイン）を含む。いくつかの実施形態では、抗体Ｆｃドメインは、ヒトＩｇＧ抗体のアミノ酸配列２３４〜３３２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体Ｆｃドメインは、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインと少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、抗体Ｆｃドメインのアミノ酸配列は、Ｑ３４７、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｓ３５４、Ｅ３５６、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｔ３６６、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９４、Ｄ３９９、Ｓ４００、Ｄ４０１、Ｆ４０５、Ｙ４０７、Ｋ４０９、Ｔ４１１、Ｋ４３９から選択される１またはそれを超える位置で異なる。
本明細書中に記載のタンパク質のうちのいずれか１つを含む製剤、前記タンパク質を発現する１またはそれを超える核酸を含む細胞、および前記タンパク質を使用した腫瘍細胞死を増強する方法も提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、本明細書中に記載のタンパク質および薬学的に許容され得る担体を含む製剤を提供する。例えば、いくつかの実施形態では、製剤は、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位；および抗体Ｆｃドメイン、ＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位が組み込まれたタンパク質、ならびに薬学的に許容され得る担体を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位；および抗体Ｆｃドメイン、ＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位が組み込まれたタンパク質を発現する１またはそれを超える核酸を含む細胞を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍細胞およびナチュラルキラー細胞を有効量の本明細書中に記載のタンパク質に暴露することによって腫瘍細胞死を増強する方法であって、前記腫瘍細胞が、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する、方法を提供する。例えば、腫瘍細胞およびナチュラルキラー細胞を、有効量の、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗
原結合部位；ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位；および抗体Ｆｃドメイン、ＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位が組み込まれたタンパク質に暴露することによって腫瘍細胞死を増強する方法であって、ここで、前記腫瘍細胞が、タンパク質の第２の抗原結合部位が結合する腫瘍−関連抗原（例えば、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１）を発現する、方法を本明細書中に提供する。
本発明の別の態様は、患者のがんを処置する方法を提供する。本方法は、治療有効量の本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質または治療有効量の本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質を含む製剤を、患者（例えば、それを必要とする患者）に投与することを含む。例えば、いくつかの実施形態では、がんを処置する方法は、治療有効量の本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質および薬学的に許容され得る担体を含む製剤を、患者（例えば、それを必要とする患者）に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、がんを処置する方法は、治療有効量の、ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、およびＰＤ−Ｌ１から選択される腫瘍−関連抗原に結合する第２の抗原結合部位；および抗体Ｆｃドメイン、ＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位が組み込まれたタンパク質を、患者（例えば、処置を必要とする患者）に投与することを含む。
多特異性結合タンパク質を使用して処置すべきがんの例には、成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病、未分化大細胞リンパ腫、Ｂ細胞悪性疾患、膀胱がん、慢性リンパ球性白血病、子宮頸がん、結腸直腸がん、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、胃がん、膠芽細胞腫、神経膠腫、頭頸部がん、ホジキンリンパ腫、白血病、肝臓がん、肺がん、リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、黒色腫、多発性骨髄腫、非ホジキンリンパ腫、非小細胞肺がん、卵巣がん、膵臓がん、末梢Ｔ細胞リンパ腫、腎がん、腎細胞癌、肉腫、および胸腺腫が含まれる。いくつかの実施形態では、タンパク質の第２の抗原結合部位はＥＧＦＲに結合し、処置すべきがんは、頭頸部がん、結腸直腸がん、非小細胞肺がん、神経膠腫、腎細胞癌、膀胱がん、子宮頸がん、卵巣がん、膵臓がん、または肝臓がんである。いくつかの実施形態では、タンパク質の第２の抗原結合部位はＨＬＡ−Ｅに結合し、処置すべきがんは、リンパ腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、または肉腫である。いくつかの実施形態では、タンパク質の第２の抗原結合部位はＰＤ−Ｌ１に結合し、処置すべきがんは、リンパ腫、白血病、多発性骨髄腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、肉腫、または胃がんである。いくつかの実施形態では、タンパク質の第２の抗原結合部位はＣＣＲ４に結合し、処置すべきがんは、成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病、白血病、末梢Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞悪性疾患、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、胸腺腫、胃がん、または腎細胞癌である。
図１は、ヘテロ二量体多特異性抗体を表す。各アームは、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン、またはＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、もしくはＰＤ−Ｌ１結合ドメインのいずれかを表し得る。いくつかの実施形態では、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１結合ドメインは、共通の軽鎖を共有することができる。
図２Ａは、ヘテロ二量体多特異性抗体を表す。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインまたはＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、もしくはＰＤ−Ｌ１結合ドメインのいずれかは、ｓｃＦｖ形式（右アーム）を取ることができる。
図２Ｂは、ＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖ、ＮＫＧ２ＤターゲティングＦａｂ、およびＣＤ１６に結合するヘテロ二量体化抗体定常領域／ドメイン（「ＣＤドメイン」）（ｓｃＦｖ−Ｆａｂ形式）を含む三重特異性抗体（ＴｒｉＮＫＥＴ）を示す。１つの例示的な実施形態では、Ｆａｂ断片に連結したＦｃドメインは、変異Ｋ３６０Ｅ、Ｋ４０９Ｗを含み、ｓｃＦｖに連結したＦｃドメインは、Ｆｃヘテロ二量体形成のための適合変異Ｑ３４７Ｒ、Ｄ３９９Ｖ、Ｆ４０５Ｔを含む。この抗体形式を、本明細書中でＦ３’−ＴｒｉＮＫＥＴと呼ぶ。別の例示的な実施形態では、Ｆａｂ断片に連結したＦｃドメインは、変異Ｑ３４７Ｒ、Ｄ３９９Ｖ、およびＦ４０５Ｔを含み、ｓｃＦｖに連結したＦｃドメインは、ヘテロ二量体形成のための適合変異Ｋ３６０ＥおよびＫ４０９Ｗを含む。
図３は、ＥＬＩＳＡアッセイにおけるヒト組換えＮＫＧ２Ｄに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図４は、ＥＬＩＳＡアッセイにおけるカニクイザル組換えＮＫＧ２Ｄに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図５は、ＥＬＩＳＡアッセイにおけるマウス組換えＮＫＧ２Ｄに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図６は、平均蛍光強度（ＭＦＩ）のバックグラウンドに対する倍率（ＦＯＢ）を示す、フローサイトメトリーによるヒトＮＫＧ２Ｄを発現するＥＬ４細胞へのＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の結合を実証する棒グラフである。
図７は、平均蛍光強度（ＭＦＩ）のバックグラウンドに対する倍率（ＦＯＢ）を示す、フローサイトメトリーによるマウスＮＫＧ２Ｄを発現するＥＬ４細胞へのＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の結合を実証する棒グラフである。
図８は、天然リガンドＵＬＢＰ−６との競合による組換えヒトＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の特異的結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図９は、天然リガンドＭＩＣＡとの競合による組換えヒトＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の特異的結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図１０は、天然リガンドＲａｅ−１δとの競合による組換えマウスＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃに対するＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の特異的結合親和性を実証する折れ線グラフである。
図１１は、ヒトＮＫＧ２Ｄ−ＣＤ３ζ融合タンパク質を発現するＴＮＦ−α陽性細胞の百分率を定量することによってＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるヒトＮＫＧ２Ｄの活性化を示す棒グラフである。
図１２は、マウスＮＫＧ２Ｄ−ＣＤ３ζ融合タンパク質を発現するＴＮＦ−α陽性細胞の百分率を定量することによってＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるマウスＮＫＧ２Ｄの活性化を示す棒グラフである。
図１３は、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるヒトＮＫ細胞の活性化を示す棒グラフである。
図１４は、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるヒトＮＫ細胞の活性化を示す棒グラフである。
図１５は、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるマウスＮＫ細胞の活性化を示す棒グラフである。
図１６は、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）によるマウスＮＫ細胞の活性化を示す棒グラフである。
図１７は、腫瘍細胞に及ぼすＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の細胞傷害効果を示す棒グラフである。
図１８は、示差走査蛍光測定法によって測定したＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン（クローンとして列挙）の融解温度を示す棒グラフである。
図１９Ａ〜１９Ｃは、ＣＤ１６およびＮＫＧ２Ｄ結合を使用したＮＫ細胞の相乗的活性化の棒グラフである。図１９Ａは、ＣＤ１０７ａのレベルを明示している；図１９Ｂは、ＩＦＮ−γのレベルを明示している；図１９Ｃは、ＣＤ１０７ａおよびＩＦＮ−γのレベルを明示している。グラフは、平均（ｎ＝２）±ＳＤを示す。データは、５人の異なる健康なドナーを使用した５つの独立した実験の代表値である。
図２０は、ＩｇＧ様形状を維持している三機能二重特異性抗体であるＴｒｉｏｍａｂ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す。このキメラは、２種の親抗体を起源とする２つの半抗体からなり、各半抗体は１つの軽鎖および１つの重鎖を有する。Ｔｒｉｏｍａｂ形態は、ラット抗体の１／２およびマウス抗体の１／２を含むヘテロ二量体構築物であり得る。
図２１は、ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅｓ（ＫＩＨ）テクノロジーが関与するＫｉＨ共通軽鎖形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す。ＫｉＨは、標的１および２に結合する２つのＦａｂ断片を含むヘテロ二量体であり、ヘテロ二量体化変異によってＦｃが安定化されている。ＫｉＨ形式のＴｒｉＮＫＥＴは、２つの異なる重鎖および両方の重鎖と対合する１つの共通軽鎖を含む、標的１および標的２に結合する２つのＦａｂ断片を有するヘテロ二量体構築物であり得る。
図２２は、天然に存在する可動性リンカーを介して２つのモノクローナル抗体の標的結合ドメインを組み合わせて４価のＩｇＧ様分子が生成される二重可変ドメイン免疫グロブリン（ＤＶＤ−Ｉｇ（商標））形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す。ＤＶＤ−Ｉｇ（商標）は、抗原２を標的にする可変ドメインが抗原１を標的にするＦａｂ断片の可変ドメインのＮ末端に融合しているホモ二量体構築物である。ＤＶＤ−Ｉｇ（商標）形態は、通常のＦｃを含む。
図２３は、直交Ｆａｂ界面（Ｏｒｔｈｏ−Ｆａｂ）形態のＴｒｉＮＫＥＴを表し、これは、Ｆｃに融合した標的１および標的２に結合する２つのＦａｂ断片を含むヘテロ二量体構築物である。直交界面によって確実に軽鎖（ＬＣ）−重鎖（ＨＣ）が対合している。Ｆｃの変異によって確実にヘテロ二量体化している。
図２４は、２−ｉｎ−１ Ｉｇ形式のＴｒｉＮＫＥＴを表す。
図２５は、ＥＳ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表し、これは、Ｆｃに融合した標的１および標的２に結合する２つの異なるＦａｂ断片を含むヘテロ二量体構築物である。Ｆｃ変異の静電的ステアリングによって確実にヘテロ二量体化している。
図２６は、Ｆａｂ断片アーム交換形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す：重鎖および結合している軽鎖（半分子）を別の分子由来の重鎖−軽鎖対と取り替え、それにより、二重特異性抗体を得ることによってＦａｂアームが交換されている抗体。Ｆａｂアーム交換形態（ｃＦａｅ）は、標的１および２に結合する２つのＦａｂ断片ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃを含むヘテロ二量体である。
図２７は、ＳＥＥＤ Ｂｏｄｙ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表し、これは、標的１および２に結合する２つのＦａｂ断片ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃを含むヘテロ二量体である。
図２８は、ロイシンジッパーを使用して２つの異なるＨＣのヘテロ二量体化を誘導するＬｕＺ−Ｙ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す。ＬｕＺ−Ｙ形態は、Ｆｃに融合した標的１および２に結合する２つの異なるｓｃＦａｂを含むヘテロ二量体である。ＦｃのＣ末端に融合したロイシンジッパーモチーフを介して確実にヘテロ二量体化している。
図２９は、Ｃｏｖ−Ｘ−Ｂｏｄｙ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表す。
図３０Ａおよび３０Ｂは、κλ−Ｂｏｄｙ形態のＴｒｉＮＫＥＴを表し、これらは、ヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃに融合した以下の２つの異なるＦａｂ断片を有するヘテロ二量体構築物である：抗原１を標的にする１つのＦａｂ断片はκＬＣを含み、抗原２を標的にする第２のＦａｂ断片はλＬＣを含む。図３０Ａは、κλ−Ｂｏｄｙの１つの形態の例示的な図であり；図３０Ｂは、別のκλ−Ｂｏｄｙの例示的な図である。
図３１は、標的１に結合するＦａｂ断片および標的２に結合するｓｃＦａｂを含み、これらの両方がＦｃドメインに融合しているＯａｓｃ−Ｆａｂヘテロ二量体構築物である。Ｆｃドメインの変異によって確実にヘテロ二量体化している。
図３２は、ＤｕｅｔＭａｂであり、これは、抗原１および２に結合する２つの異なるＦａｂ断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃを含むヘテロ二量体構築物である。Ｆａｂ断片１および２は、正確な軽鎖と重鎖の対合を確実にする特異な（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ）Ｓ−Ｓ架橋を含む。
図３３は、ＣｒｏｓｓｍＡｂであり、これは、標的１および２に結合する２つの異なるＦａｂ断片ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃを有するヘテロ二量体構築物である。ＣＬドメインとＣＨ１ドメインおよびＶＨドメインとＶＬドメインが切り替えられている（例えば、ＣＨ１がＶＬに沿って融合しており、一方、ＣＬがＶＨに沿って融合している）。
図３４は、Ｆｉｔ−Ｉｇであり、これは、抗原２に結合するＦａｂ断片が抗原１に結合するＦａｂ断片のＨＣのＮ末端に融合しているホモ二量体構築物である。構築物は野生型Ｆｃを含む。
図３５は、ＴｒｉＮＫＥＴおよびモノクローナル抗体（「ｍＡｂ」）がＮＣＩ−Ｈ２１７２ヒト肺がん細胞上に発現したＥＧＦＲに結合することを示す折れ線グラフである。
図３６は、ＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂがＨＣＣ８２７ヒト肺がん細胞上に発現したＥＧＦＲに結合することを示す折れ線グラフである。
図３７は、ＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂがＮＣＩ−Ｈ７４７ヒト結腸がん細胞上に発現したＥＧＦＲに結合することを示す折れ線グラフである。
図３８は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図３９は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４０は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ７４７細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４１は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ７４７細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４２は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４３は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ１９７５細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４４は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｎ８７細胞（胃）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４５は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＨＣＴ１１６細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
図４６は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＡ５４９細胞（肺、ＫＲＡＳ Ｇ１２Ｓ）のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の殺滅を示す折れ線グラフである。
本発明は、ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体、ならびに腫瘍−関連抗原ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する多特異性結合タンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、もしくはＰＤ−Ｌ１または他の腫瘍−関連抗原に結合するさらなる抗原結合部位をさらに含む。本発明はまた、かかる多特異性結合タンパク質を含む医薬組成物、ならびにがんの処置などの目的のためにかかる多特異性タンパク質および医薬組成物を使用する治療方法を提供する。本発明の種々の態様を以下の節で説明しているが、１つの特定の節に記載の本発明の態様がいかなる特定の節に制限されるものではない。
本発明の理解を容易にするために、いくつかの用語および句を以下に定義する。
本明細書中で使用される場合、用語「ａ」および「ａｎ」は、「１またはそれを超える」を意味し、文脈上不適切でない限り、複数を含む。
本明細書中で使用される場合、用語「抗原結合部位」は、抗原結合に関与する免疫グロブリン分子の一部を指す。ヒト抗体では、抗原結合部位は、重（「Ｈ」）鎖および軽（「Ｌ」）鎖のＮ末端可変（「Ｖ」）領域のアミノ酸残基によって形成される。重鎖および軽鎖のＶ領域内の３つの高度に異なるストレッチは「超可変領域」と呼ばれ、この領域は、「フレームワーク領域」または「ＦＲ」として公知のより保存された隣接ストレッチの間に挿入されている。したがって、用語「ＦＲ」は、天然には免疫グロブリン内の超可変領域の間でかつ隣接した状態で認められるアミノ酸配列を指す。ヒト抗体分子では、軽鎖の３つの超可変領域および重鎖の３つの超可変領域は、抗原結合表面を形成するように三次元空間において相互に関連して配置されている。抗原結合表面は、結合する抗原の三次元表面に相補的であり、重鎖および軽鎖の各々の３つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」と呼ばれる。ラクダおよび軟骨魚類などのある特定の動物では、抗原結合部位が単一の抗体鎖によって形成されており、それにより「単一ドメイン抗体」が得られる。抗原結合部位は、インタクトな抗体内、抗原結合表面を保持する抗体の抗原結合断片内、または単一のポリペプチド内で重鎖可変ドメインと軽鎖可変ドメインとを接続するためのペプチドリンカーを使用したｓｃＦｖなどの組換えポリペプチド内に存在し得る。
本明細書中で使用される場合、用語「腫瘍関連抗原」は、がんに関連する任意の抗原（タンパク質、糖タンパク質、ガングリオシド、炭水化物、脂質が含まれるが、これらに限定されない）を意味する。かかる抗原は、悪性細胞上または腫瘍微小環境中（腫瘍に関連する血管、細胞外基質、間葉系間質、または免疫浸潤物など）に発現し得る。
本明細書中で使用される場合、「ＥＧＦＲ」（上皮成長因子受容体、ＥＲＢＢ、ＥＲＢＢ１、およびＨＥＲ１としても公知）は、Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ００５３３のタンパク質および関連するイソ型を指す。
本明細書中で使用される場合、「ＨＬＡ−Ｅ」（ＨＬＡクラスＩ組織適合抗原α鎖Ｅ（ＭＨＣクラスＩ抗原Ｅ、ＨＬＡ−６．２、およびＨＬＡＥとしても公知））は、Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ１３７４７のタンパク質および関連するイソ型を指す。
本明細書中で使用される場合、「ＣＣＲ４」（Ｃ−Ｃケモカイン受容体タイプ４（Ｃ−Ｃ ＣＫＲ−４、ＣＣ−ＣＫＲ−４、ＣＣＲ−４、Ｋ５−５、およびＣＭＫＢＲ４としても公知））は、Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｐ５１６７９のタンパク質および関連するイソ型を指す。
本明細書中で使用される場合、「ＰＤ−Ｌ１」（プログラム細胞死１リガンド１（ＰＤＣＤ１リガンド１、プログラム死リガンド１、Ｂ７ホモログ１、Ｂ７−Ｈ１、ＣＤ２７４、Ｂ７Ｈ１、ＰＤＣＤ１Ｌ１、ＰＤＣＤ１ＬＧ１、およびＰＤＬ１としても公知））は、Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｑ９ＮＺＱ７のタンパク質および関連するイソ型を指す。
本明細書中で使用される場合、用語「被験体」および「患者」は、本明細書中に記載の方法および組成物によって処置すべき生物を指す。かかる生物には、好ましくは、哺乳動物（例えば、マウス、サル、ウマ、ウシ、ブタ、イヌ、およびネコなど）が含まれるがこれらに限定されず、より好ましくは、ヒトが含まれる。
本明細書中で使用される場合、用語「有効量」は、有益または望ましい結果を得るのに十分な化合物（例えば、本発明の化合物）の量を指す。有効量を、１またはそれを超える投与、適用、または投薬量で投与することができ、特定の製剤や投与経路に制限されることを意図しない。本明細書中で使用される場合、用語「処置すること」には、任意の効果（例えば、状態、疾患、および障害などを改善する緩和、低下、モジュレート、回復、もしくは排除、またはその症状の回復）が含まれる。
本明細書中で使用される場合、用語「医薬組成物」は、ｉｎ ｖｉｖｏまたはｅｘ ｖｉｖｏでの診断または治療における使用のために組成物を特に適切にする活性薬剤の担体（不活性または活性）との組み合わせを指す。
本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に許容され得る担体」は、任意の標準的な薬学的担体（リン酸緩衝食塩水、水、乳濁液（例えば、水中油型または油中水型の乳濁液）、および種々のタイプの湿潤剤など）を指す。組成物はまた、安定剤および防腐剤を含み得る。担体、安定剤、およびアジュバントの例については、例えば、Ｍａｒｔｉｎ，Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１５ｔｈ Ｅｄ．，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌ．Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ［１９７５］を参照のこと。
本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に許容され得る塩」は、被験体への投与の際に本発明の化合物またはその活性代謝産物もしくは残渣をもたらすことができる本発明の化合物の任意の薬学的に許容され得る塩（例えば、酸または塩基）を指す。当業者に公知のように、本発明の化合物の「塩」は、無機酸または有機酸および無機塩基または有機塩基に由来し得る。例示的な酸には、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、過塩素酸、フマル酸、マレイン酸、リン酸、グリコール酸、乳酸、サリチル酸、コハク酸、ｐ−トルエンスルホン酸（ｔｏｌｕｅｎｅ−ｐ−ｓｕｌｆｏｎｉｃ ａｃｉｄ）、酒石酸、酢酸、クエン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ギ酸、安息香酸、マロン酸、ナフタレン−２−スルホン酸、およびベンゼンスルホン酸などが含まれるが、これらに限定されない。シュウ酸などの他の酸は、それ自体は薬学的に許容されないが、本発明の化合物およびその薬学的に許容され得る酸付加塩を得るための中間体として有用な塩の調製で使用することができる。
例示的な塩基には、アルカリ金属（例えば、ナトリウム）水酸化物、アルカリ土類金属（例えば、マグネシウム）水酸化物、アンモニア、および式ＮＷ４ ＋（式中、ＷはＣ１−４アルキルである）の化合物などが含まれるが、これらに限定されない。
例示的な塩には、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、硫酸水素塩、酪酸塩、クエン酸塩、ショウノウ酸塩、カンファースルホン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、二グルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、フルコヘプタン酸塩、グリセロリン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、２−ヒドロキシエタンスルホン酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、メタンスルホン酸塩、２−ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、シュウ酸塩、パルモアート、ペクチニン酸塩、過硫酸塩、フェニルプロピオン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トシラート（ｔｏｓｙｌａｔｅ）、およびウンデカン酸塩などが含まれるが、これらに限定されない。塩の他の例には、適切なカチオン（Ｎａ＋、ＮＨ４ ＋、およびＮＷ４ ＋（式中、ＷはＣ１−４アルキル基である）など）と共に化合された（ｃｏｍｐｏｕｎｄｅｄ）本発明の化合物のアニオンが含まれる。
治療での使用のために、本発明の化合物の塩は、薬学的に許容され得ることが意図される。しかし、薬学的に許容され得ない酸および塩基の塩もまた、例えば、薬学的に許容さ
れ得る化合物の調製または精製で使用することができる。
説明全体を通して、組成物が特定の構成要素を有する、含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）、または含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）と記載される場合、またはプロセスおよび方法が特定のステップを有する、含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）、または含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）と記載される場合、さらに、記載された構成要素から本質的になる、またはそれからなる本発明の組成物が存在する、および記載された処理工程から本質的になる、またはそれからなる本発明によるプロセスおよび方法が存在することが意図される。
一般的事項として、百分率を特定する組成物は、別段の指定がない限り、重量を基準とする。さらに、変数が定義を伴わない場合、変数の以前の定義に従う。
Ｉ．タンパク質
本発明は、ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体、ならびに腫瘍−関連抗原ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する多特異性結合タンパク質を提供する。多特異性結合タンパク質は、本明細書中に記載の医薬組成物および治療方法で有用である。ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体への多特異性結合タンパク質の結合により、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞の破壊に対するナチュラルキラー細胞の活性が増強される。ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する細胞への多特異性結合タンパク質の結合によってがん細胞がナチュラルキラー細胞に接近し、それにより、ナチュラルキラー細胞によるがん細胞の直接および間接的な破壊が容易になる。いくつかの例示的な多特異性結合タンパク質を、以下にさらに説明する。
多特異性結合タンパク質の第１の構成要素は、ＮＫＧ２Ｄ受容体発現細胞（ＮＫ細胞、γδＴ細胞、およびＣＤ８＋αβＴ細胞が含まれ得るが、これらに限定されない）に結合する。ＮＫＧ２Ｄ結合の際に、多特異性結合タンパク質は、天然リガンド（ＵＬＢＰ６（ＵＬ１６結合タンパク質６）およびＭＩＣＡ（主要組織適合性遺伝子複合体クラスＩ鎖関連Ａ）など）がＮＫＧ２Ｄに結合してＮＫＧ２Ｄ受容体を活性化するのを遮断することができる。
多特異性結合タンパク質の第２の構成要素は、白血病（例えば、急性骨髄性白血病およびＴ細胞白血病など）で見出され得るＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する細胞に結合する。
多特異性結合タンパク質の第３の構成要素は、ＣＤ１６（白血球表面上のＦｃ受容体）を発現する細胞（ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、好中球、好酸球、肥満細胞、および濾胞樹状細胞が含まれる）に結合する。
本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質は、種々の形式を取ることができる。例えば、１つの形式は、第１の免疫グロブリン重鎖、第１の免疫グロブリン軽鎖、第２の免疫グロブリン重鎖および第２の免疫グロブリン軽鎖を含むヘテロ二量体多特異性抗体である（図１）。第１の免疫グロブリン重鎖は、第１のＦｃ（ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３）ドメイン、第１の重鎖可変ドメイン、および必要に応じて第１のＣＨ１重鎖ドメインを含む。第１の免疫グロブリン軽鎖は、第１の軽鎖可変ドメインおよび第１の軽鎖定常ドメインを含む。第１の免疫グロブリン軽鎖は、第１の免疫グロブリン重鎖と共に、ＮＫＧ２Ｄに結合する抗原結合部位を形成する。第２の免疫グロブリン重鎖は、第２のＦｃ（ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３）ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、および必要に応じて第２のＣＨ１重鎖ドメインを含む。第２の免疫グロブリン軽鎖は、第２の軽鎖可変ドメインおよび第２の軽鎖定常ドメインを含む。第２の免疫グロブリン軽鎖は、第２の免疫グロブリン重鎖と共に
、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する抗原結合部位を形成する。第１のＦｃドメインおよび第２のＦｃドメインは共にＣＤ１６に結合することができる（図１）。いくつかの実施形態では、第１の免疫グロブリン軽鎖は、第２の免疫グロブリン軽鎖と同一である。
別の例示的な形式は、第１の免疫グロブリン重鎖、第２の免疫グロブリン重鎖、および免疫グロブリン軽鎖を含むヘテロ二量体多特異性抗体に関与する（図２）。第１の免疫グロブリン重鎖は、リンカーまたは抗体ヒンジのいずれかを介して単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）に融合した第１のＦｃ（ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３）ドメインを含み、前記単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）は、対合してＮＫＧ２Ｄに結合するか、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１抗原に結合する重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインから構成される。第２の免疫グロブリン重鎖は、第２のＦｃ（ヒンジ−ＣＨ２−ＣＨ３）ドメイン、第２の重鎖可変ドメイン、および必要に応じてＣＨ１重鎖ドメインを含む。免疫グロブリン軽鎖は、軽鎖可変ドメインおよび軽鎖定常ドメインを含む。第２の免疫グロブリン重鎖は、免疫グロブリン軽鎖と対合し、ＮＫＧ２Ｄに結合するか、腫瘍−関連抗原ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する。第１のＦｃドメインおよび第２のＦｃドメインは共にＣＤ１６に結合することができる（図２）。
１またはそれを超えるさらなる結合モチーフを必要に応じてリンカー配列を介して定常領域ＣＨ３ドメインのＣ末端に融合することができる。ある特定の実施形態では、抗原結合モチーフは、４価または３価分子を形成する単鎖またはジスルフィド安定化された可変領域（ｓｃＦｖ）である。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ＩｇＧ様形状を維持している三機能二重特異性抗体であるＴｒｉｏｍａｂ形態である。このキメラは、２種の親抗体を起源とする２つの半抗体からなり、各半抗体は１つの軽鎖および１つの重鎖を有する。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ−ｈｏｌｅｓ（ＫＩＨ）テクノロジーが関与するＫｉＨ共通軽鎖（ＬＣ）形態である。ＫＩＨは、各重鎖内にヘテロ二量体化を促進するための「ノブ」または「ホール」のいずれかを作製するためにＣＨ３ドメインを操作することを含む。「Ｋｎｏｂｓ−ｉｎｔｏ−Ｈｏｌｅｓ（ＫｉＨ）」Ｆｃテクノロジーの背景となる概念は、小さな残基を嵩高い残基（例えば、ＥＵナンバリングにおけるＴ３６６ＷＣＨ３Ａ）で置換することによって一方のＣＨ３ドメイン（ＣＨ３Ａ）内に「ノブ」を導入することであった。「ノブ」に適応させるために、相補的な「ホール」表面を、ノブに最も隣接する残基をより小さな残基（例えば、Ｔ３６６Ｓ／Ｌ３６８Ａ／Ｙ４０７ＶＣＨ３Ｂ）で置き換えることによって他方のＣＨ３ドメイン（ＣＨ３Ｂ）上に作製した。「ホール」変異を、構造ガイドファージライブラリースクリーニングによって最適化した（Ａｔｗｅｌｌ Ｓ，Ｒｉｄｇｗａｙ ＪＢ，Ｗｅｌｌｓ ＪＡ，Ｃａｒｔｅｒ Ｐ．，Ｓｔａｂｌｅ ｈｅｔｅｒｏｄｉｍｅｒｓ ｆｒｏｍ ｒｅｍｏｄｅｌｉｎｇ ｔｈｅ ｄｏｍａｉｎ ｉｎｔｅｒｆａｃｅ ｏｆ ａ ｈｏｍｏｄｉｍｅｒ ｕｓｉｎｇ ａ ｐｈａｇｅ ｄｉｓｐｌａｙ ｌｉｂｒａｒｙ，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（１９９７）２７０（１）：２６‐３５）。ＫｉＨ ＦｃバリアントのＸ線結晶構造（Ｅｌｌｉｏｔｔ ＪＭ，Ｕｌｔｓｃｈ Ｍ，Ｌｅｅ Ｊ，Ｔｏｎｇ Ｒ，Ｔａｋｅｄａ Ｋ，Ｓｐｉｅｓｓ Ｃ，ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｐａｒａｌｌｅｌ ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｋｎｏｂ ａｎｄ ｈｏｌｅ ａｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｅｄ ｈａｌｆ−ａｎｔｉｂｏｄｙ ｈｏｍｏｄｉｍｅｒｓ ｉｓ ｍｅｄｉａｔｅｄ ｂｙ ａ ＣＨ２−ＣＨ３ ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ．Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（２０１４）４２６（９）：１９４７−５７；Ｍｉｍｏｔｏ Ｆ，Ｋａｄｏｎｏ Ｓ，Ｋａｔａｄａ Ｈ，Ｉｇａｗａ Ｔ，Ｋａｍｉｋａｗａ Ｔ，Ｈａｔｔｏｒｉ Ｋ．Ｃｒｙｓｔａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ａ ｎｏｖｅｌ ａｓｙｍｍｅｔ
ｒｉｃａｌｌｙ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ Ｆｃ ｖａｒｉａｎｔ ｗｉｔｈ ｉｍｐｒｏｖｅｄ ａｆｆｉｎｉｔｙ ｆｏｒ ＦｃγＲｓ．Ｍｏｌ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．（２０１４）５８（１）：１３２−８）は、ヘテロ二量体化はＣＨ３ドメイン間コア界面での立体相補性によって駆動される疎水性相互作用によって熱力学的に好ましいのに対して、ノブ−ノブ界面およびホール−ホール界面はそれぞれ、立体障害および好ましい相互作用の破壊に起因してホモ二量体化を好まないことが実証された。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、天然に存在する可動性リンカーを介して２つのモノクローナル抗体の標的結合ドメインを組み合わせて４価のＩｇＧ様分子が生成される二重可変ドメイン免疫グロブリン（ＤＶＤ−Ｉｇ（商標））形態である。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、直交性Ｆａｂ境界（Ｏｒｔｈｏ−Ｆａｂ）形態である。ｏｒｔｈｏ−Ｆａｂ ＩｇＧアプローチ（Ｌｅｗｉｓ ＳＭ，Ｗｕ Ｘ，Ｐｕｓｔｉｌｎｉｋ Ａ，Ｓｅｒｅｎｏ Ａ，Ｈｕａｎｇ Ｆ，Ｒｉｃｋ ＨＬ，ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｉｓｐｅｃｉｆｉｃ ＩｇＧ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｂｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ−ｂａｓｅｄ ｄｅｓｉｇｎ ｏｆ ａｎ ｏｒｔｈｏｇｏｎａｌ Ｆａｂ ｉｎｔｅｒｆａｃｅ．Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．（２０１４）３２（２）：１９１−８）では、構造ベースの領域デザインにより、一方のＦａｂ断片においてのみＬＣおよびＨＣＶＨ−ＣＨ１界面に相補的変異を導入し、他方のＦａｂ断片にはいかなる変更も加えない。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、２−ｉｎ−１ Ｉｇ形式である。いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ＥＳ形態であり、これは、Ｆｃに融合した標的１および標的２に結合する２つの異なるＦａｂ断片を含むヘテロ二量体構築物である。Ｆｃ変異の静電的ステアリングによって確実にヘテロ二量体化している。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質はκλ−Ｂｏｄｙ形態であり、これは、ヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃに融合した以下の２つの異なるＦａｂ断片を有するヘテロ二量体構築物である：抗原１を標的にするＦａｂ断片１はκＬＣを含み、一方、抗原２を標的にする第２のＦａｂ断片はλＬＣを含む。図３０Ａは、κλ−Ｂｏｄｙの１つの形態の例示的な図であり；図３０Ｂは、別のκλ−Ｂｏｄｙの例示的な図である。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、Ｆａｂアーム交換形態である（重鎖および結合している軽鎖（半分子）を別の分子由来の重鎖−軽鎖対と取り替え、それにより、二重特異性抗体を得ることによってＦａｂアームが交換されている抗体）。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ＳＥＥＤ Ｂｏｄｙ形態である。鎖交換操作ドメイン（ＳＥＥＤ）プラットフォームを、天然抗体の治療への応用範囲を拡大することが可能な非対称で二重特異性の抗体様分子を生成するようにデザインした。このタンパク質操作プラットフォームは、免疫グロブリンの保存ＣＨ３ドメイン内の構造的に関連する配列の交換に基づく。ＳＥＥＤデザインは、ＡＧ／ＧＡヘテロ二量体を効率的に生成することが可能である一方で、ＡＧおよびＧＡのＳＥＥＤ ＣＨ３ドメインのホモ二量体化には不向きである（Ｍｕｄａ Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．Ｄｅｓ．Ｓｅｌ．（２０１１，２４（５）：４４７−５４））。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ロイシンジッパーを使用して２つの異なるＨＣのヘテロ二量体化を誘導するＬｕＺ−Ｙ形態である（Ｗｒａｎｉｋ，ＢＪ．ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．（２０１２），２８７：４３３３１−９）。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、Ｃｏｖ−Ｘ−Ｂｏｄｙ形態である。二重特異性ＣｏｖＸ−Ｂｏｄｙでは、分岐アゼチジノンリンカーを用いて２つの異なるペプチドが相互に連結されており、穏やかな条件下にて部位特異的様式で足場抗体に融合している。ファルマコフォアが機能活性を担うのに対して、抗体足場は、半減期の延長およびＩｇ様分布を付与する。ファルマコフォアを化学的に最適にするか他のファルマコフォアで置き換えて、最適化されたか固有の二重特異性抗体を生成することができる（Ｄｏｐｐａｌａｐｕｄｉ ＶＲ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ（２０１０），１０７（５２）；２２６１１−２２６１６）。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、Ｆｃに融合した標的１に結合するＦａｂ断片およびＦｃに融合した標的２に結合するｓｃＦａｂを含むＯａｓｃ−Ｆａｂヘテロ二量体形態である。Ｆｃの変異によって確実にヘテロ二量体化している。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質はＤｕｅｔＭａｂ形態であり、これは、抗原１および２に結合する２つの異なるＦａｂ断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたＦｃを含むヘテロ二量体構築物である。Ｆａｂ断片１および２は、正確なＬＣとＨＣの対合を確実にする特異なＳ−Ｓ架橋を含む。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質は、ＣｒｏｓｓｍＡｂ形態であり、これは、ヘテロ二量体化によって安定化されたＦｃに融合した、標的１および２に結合する２つの異なるＦａｂ断片を有するヘテロ二量体構築物である。ＣＬドメインとＣＨ１ドメインおよびＶＨドメインとＶＬドメインが切り替えられている（例えば、ＣＨ１がＶＬに沿って融合しており、一方、ＣＬがＶＨに沿って融合している）。
いくつかの実施形態では、多特異性結合タンパク質はＦｉｔ−Ｉｇ形態であり、これは、抗原２に結合するＦａｂ断片が抗原１に結合するＦａｂ断片のＨＣのＮ末端に融合しているホモ二量体構築物である。構築物は野生型Ｆｃを含む。
表１は、組み合わせてＮＫＧ２Ｄに結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのペプチド配列を列挙している。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、ＮＫＧ２Ｄへのその結合親和性が変動し得るが、それにもかかわらず、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは全て、ヒトＮＫＧ２ＤおよびＮＫ細胞を活性化することができる。
Figure 2021098732
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あるいは、米国特許第９，２７３，１３６号に示すように、配列番号１０１で表された重鎖可変ドメインを配列番号１０２で表された軽鎖可変ドメインと対合して、ＮＫＧ２Ｄに結合することができる抗原結合部位を形成することができる。
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あるいは、米国特許第７，８７９，９８５号に示すように、配列番号１０３で表した重鎖可変ドメインを配列番号１０４で表した軽鎖可変ドメインと対合して、ＮＫＧ２Ｄに結合することができる抗原結合部位を形成することができる。
Figure 2021098732
本開示のタンパク質は、ＫＤ値１０ｎＭまたはそれより弱い親和性でＮＫＧ２Ｄに結合する。
１つの態様では、本開示は、ナチュラルキラー細胞上のＮＫＧ２Ｄ受容体およびＣＤ１６受容体ならびに抗原ＥＧＦＲに結合する多特異性結合タンパク質を提供する。表２は、組み合わせてＥＧＦＲに結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのいくつかの例示的な配列を列挙している。
Figure 2021098732
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組み合わせてＥＧＦＲに結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのさらなる例示的な配列を以下に提供する（ＣＤＲに下線を付す）
Ｐ１Ｘ
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Ｐ２Ｘ
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パニツムマブ
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ＡｄｉＣＬＣ２
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ネシツムマブ
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 セツキシマブ
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ＡｄｉＣＬＣ３
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本開示のいくつかのＴｒｉＮＫＥＴは、Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ形態であり、その配列を以下に提供する（ＣＤＲｓ（Ｋａｂａｔナンバリング）に下線を付
す）。
Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲは、Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介してＦｃドメインに連結したＥＧＦＲに結合する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）（配列番号２６４、２７２、２６５、２７３、２７４、および２６６は、かかるＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖポリペプチドの例示的な配列である）（例えば、配列番号２６７）；ならびに重鎖可変ドメイン（配列番号８５）およびＣＨ１ドメインを含む重鎖部分、ならびに軽鎖可変ドメイン（配列番号８６）および軽鎖定常ドメインを含む軽鎖部分を含むＮＫＧ２Ｄ結合Ｆａｂ断片（「Ａ４９」）を含み、ここで、重鎖可変ドメインはＣＨ１ドメインに接続しており、ＣＨ１ドメインはＦｃドメインに接続している。
本開示のＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖは、（Ｇ４Ｓ）４リンカーを用いてネシツムマブ、パニツムマブ、またはＡｄｉＣＬＣ２の軽鎖可変ドメインに接続したネシツムマブ、パニツムマブ、またはＡｄｉＣＬＣ２の重鎖可変ドメインを含み得る（ＶＬ（Ｇ４Ｓ）４ＶＨまたはＬＨ（ＶＬはＶＨに対してＮ末端側にある）と表され、ＶＨ（Ｇ４Ｓ）４ＶＬまたはＨＬ（ＶＨはＶＬに対してＮ末端側にある）と表される）。配列番号２６４、２７２、２６５、２７３、２７４、および２６６は、かかるＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖポリペプチドの例示的な配列である。ネシツムマブｓｃＦｖ（配列番号２６４または２７２）のＶＬおよびＶＨは、１００ＶＬ−１０５ＶＨ Ｓ−Ｓ架橋（それぞれ、Ｇ１００ＣおよびＱ１０５Ｃ置換に起因する）を含む（以下の配列中において、システイン残基を、下線を引いた太字の斜体で示す）。パニツムマブｓｃＦｖ（配列番号２６５または２７３）のＶＬおよびＶＨは、１００ＶＬ−４４ＶＨ Ｓ−Ｓ架橋（ぞれぞれ、Ｇ１００ＣおよびＧ４４Ｃ置換に起因する）を含む（下の配列中において、システイン残基を、下線を引いた太字の斜体で示す）。（Ｇ４Ｓ）４は、例えば、配列番号２６４中の下線を引いた太字配列ＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳＧＧＧＧＳ（配列番号２６３）である。
ＥＧＦＲ（ｎｅｃｉＬＨ）ｓｃＦｖ（ネシツムマブ由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｎｅｃｉＨＬ）ｓｃＦｖ（ネシツムマブ由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｐａｎＬＨ）ｓｃＦｖ（パニツムマブ由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｐａｎＨＬ）ｓｃＦｖ（パニツムマブ由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ａｄｉＣＬＣ２ＬＨ）ｓｃＦｖ（ＡｄｉＣＬＣ２由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ａｄｉＣＬＣ２ＨＬ）ｓｃＦｖ（ＡｄｉＣＬＣ２由来の可変ドメイン）
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配列番号２６７、配列番号２７５、配列番号２６８、配列番号２７６、配列番号２６９、および配列番号２７７は、Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介してＦｃドメインに連結したＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖ（ｓｃＦｖ−Ｆｃ）の６つの配列を表す。ｓｃＦｖに連結したＦｃドメインは、Ｑ３４７Ｒ置換、Ｄ３９９Ｖ置換、およびＦ４０５Ｔ置換を含む。
ＥＧＦＲ（ｎｅｃｉＬＨ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｎｅｃｉＨＬ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｐａｎＬＨ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ｐａｎＨＬ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ
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 ＥＧＦＲ（ａｄｉＣＬＣ２ＬＨ）ｓｃＦｖ（ＡｄｉＣＬＣ２由来の可変ドメイン）
Figure 2021098732
 ＥＧＦＲ（ａｄｉＣＬＣ２ＨＬ）ｓｃＦｖ−Ｆｃ
Figure 2021098732
配列番号２７０は、ＮＫＧ２Ｄ結合部位の重鎖可変ドメイン（配列番号８５）およびＦｃドメインに接続したＣＨ１ドメインを含むＦａｂ断片の重鎖部分を表す。配列番号２７０中のＦｃドメインは、ＣＨ３ドメイン内にＹ３４９Ｃ置換を含み、ＣＨ３ドメインは、ＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖ（例えば、配列番号２６４、配列番号２６５、および配列番号２６６）に連結したＦｃ上のＳ３５４Ｃ置換を用いてジスルフィド結合を形成する。配列番号２７０では、Ｆｃドメインはまた、Ｋ３６０Ｅ置換およびＫ４０９Ｗ置換を含む。
Figure 2021098732
配列番号２７１は、ＮＫＧ２Ｄ結合部位の軽鎖可変ドメイン（配列番号８６）および軽
鎖定常ドメインを含むＦａｂ断片の軽鎖部分を表す。
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１つの例示的な実施形態では、ＮＫＧ２Ｄ結合Ｆａｂ断片に連結したＦｃドメインは、Ｑ３４７Ｒ、Ｄ３９９Ｖ、およびＦ４０５Ｔの変異を含み、ＥＧＦＲ ｓｃＦｖに連結したＦｃドメインは、ヘテロ二量体を形成するための適合変異Ｋ３６０ＥおよびＫ４０９Ｗを含む。１つの例示的な実施形態では、ＮＫＧ２Ｄ結合Ｆａｂ断片に連結したＦｃドメインは、ＣＨ３ドメイン内にＳ３５４Ｃ置換を含み、ＣＨ３ドメインは、ＥＧＦＲ結合ｓｃＦｖに連結したＦｃ上のＹ３４９Ｃ置換を用いてジスルフィド結合を形成する。
あるいは、ＥＧＦＲに結合することができる新規の抗原結合部位を、配列番号１６５によって定義したアミノ酸配列への結合についてのスクリーニングによって同定することができる。
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ＨＬＡ−Ｅに結合することができる抗原結合部位を、配列番号１６６によって定義したアミノ酸配列への結合についてのスクリーニングによって同定することができる。
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表３は、組み合わせてＰＤ−Ｌ１に結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのペプチド配列を列挙している。
Figure 2021098732
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あるいは、ＰＤ−Ｌ１に結合することができる新規の抗原結合部位を、配列番号１９１によって定義したアミノ酸配列への結合についてのスクリーニングによって同定することができる。
Figure 2021098732
表４は、組み合わせてＣＣＲ４に結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのペプチド配列を列挙している。
Figure 2021098732
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あるいは、ＣＣＲ４に結合することができる新規の抗原結合部位を、配列番号２１６によって定義したアミノ酸配列への結合についてのスクリーニングによって同定することができる。
Figure 2021098732
Ｆｃドメイン内では、ＣＤ１６結合は、ヒンジ領域およびＣＨ２ドメインによって媒介される。例えば、ヒトＩｇＧ１内では、ＣＤ１６との相互作用は、主にＣＨ２ドメイン中のアミノ酸残基Ａｓｐ２６５−Ｇｌｕ２６９、Ａｓｎ２９７−Ｔｈｒ２９９、Ａｌａ３２７−Ｉｌｅ３３２、Ｌｅｕ２３４−Ｓｅｒ２３９、および炭水化物残基Ｎ−アセチル−Ｄ−グルコサミンに集中する（Ｓｏｎｄｅｒｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，４０６（６７９３）：２６７−２７３を参照のこと）。既知のドメインに基づいて、変異を、ファージディスプレイライブラリーまたは酵母表面ディスプレイｃＤＮＡライブラリーなどを使用してＣＤ１６に対する結合親和性を増強または低下させるように選択することができるか、既知の相互作用の三次元構造に基づいてデザインすることができる。
ヘテロ二量体抗体重鎖を、同一細胞中での２つの異なる抗体重鎖配列の発現によってアセンブリすることができるが、各抗体重鎖のヘテロ二量体のアセンブリだけでなくホモ二量体のアセンブリももたらし得る。米国特許出願第１３／４９４８７０号、同第１６／０２８８５０号、同第１１／５３３７０９号、同第１２／８７５０１５号、同第１３／２８９９３４号、同第１４／７７３４１８号、同第１２／８１１２０７号、同第１３／８６６７５６号、同第１４／６４７４８０号、および同第１４／８３０３３６に示されるように、各抗体重鎖定常領域のＣＨ３ドメインに異なる変異を組み込むことによって、ヘテロ二量体の優先的なアセンブリを促進することができる。例えば、ヒトＩｇＧ１に基づいて、ＣＨ３ドメインに対して、第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチド内にこれら２つの鎖が相互に選択的にヘテロ二量体化される別個のアミノ酸置換対を組み込む変異がなされ得る。以下に示したアミノ酸置換の位置を、全てＫａｂａｔのようなＥＵインデックスにしたがってナンバリングする。
１つのシナリオでは、第１のポリペプチドのアミノ酸置換は、元のアミノ酸を、アルギニン（Ｒ）、フェニルアラニン（Ｆ）、チロシン（Ｙ）、またはトリプトファン（Ｗ）か
ら選択されるより大きいアミノ酸で置き換え、第２のポリペプチドの少なくとも１つのアミノ酸置換は、元のアミノ酸（複数可）を、アラニン（Ａ）、セリン（Ｓ）、トレオニン（Ｔ）、またはバリン（Ｖ）から選択されるより小さいアミノ酸（複数可）で置き換え、その結果、前記のより大きいアミノ酸置換（突起（ｐｒｏｔｕｂｅｒａｎｃｅ））がより小さいアミノ酸置換（窪み）の表面に収まる。例えば、一方のポリペプチドにＴ３６６Ｗ置換を組み込むことができ、他方のポリペプチドにＴ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖを含む３つの置換を組み込むことができる。
本発明の抗体重鎖可変ドメインを、抗体定常領域（ヒンジ、ＣＨ２ドメイン、およびＣＨ３ドメインを含む（ＣＨ１ドメインを含むか含まない）ＩｇＧ定常領域など）と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列と必要に応じてカップリングすることができる。いくつかの実施形態では、定常領域のアミノ酸配列は、ヒト抗体定常領域（ヒトＩｇＧ１定常領域、ＩｇＧ２定常領域、ＩｇＧ３定常領域、またはＩｇＧ４定常領域など）と少なくとも９０％同一である。いくつかの他の実施形態では、定常領域のアミノ酸配列は、別の哺乳動物（ウサギ、イヌ、ネコ、マウス、またはウマなど）由来の抗体定常領域と少なくとも９０％同一である。ヒトＩｇＧ１定常領域と比較して、１またはそれを超える変異を、定常領域中の、例えば、Ｑ３４７、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｓ３５４、Ｅ３５６、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｔ３６６、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９４、Ｄ３９９、Ｓ４００、Ｄ４０１、Ｆ４０５、Ｙ４０７、Ｋ４０９、Ｔ４１１、および／またはＫ４３９に組み込むことができる。例示的な置換には、例えば、Ｑ３４７Ｅ、Ｑ３４７Ｒ、Ｙ３４９Ｓ、Ｙ３４９Ｋ、Ｙ３４９Ｔ、Ｙ３４９Ｄ、Ｙ３４９Ｅ、Ｙ３４９Ｃ、Ｔ３５０Ｖ、Ｌ３５１Ｋ、Ｌ３５１Ｄ、Ｌ３５１Ｙ、Ｓ３５４Ｃ、Ｅ３５６Ｋ、Ｅ３５７Ｑ、Ｅ３５７Ｌ、Ｅ３５７Ｗ、Ｋ３６０Ｅ、Ｋ３６０Ｗ、Ｑ３６２Ｅ、Ｓ３６４Ｋ、Ｓ３６４Ｅ、Ｓ３６４Ｈ、Ｓ３６４Ｄ、Ｔ３６６Ｖ、Ｔ３６６Ｉ、Ｔ３６６Ｌ、Ｔ３６６Ｍ、Ｔ３６６Ｋ、Ｔ３６６Ｗ、Ｔ３６６Ｓ、Ｌ３６８Ｅ、Ｌ３６８Ａ、Ｌ３６８Ｄ、Ｋ３７０Ｓ、Ｎ３９０Ｄ、Ｎ３９０Ｅ、Ｋ３９２Ｌ、Ｋ３９２Ｍ、Ｋ３９２Ｖ、Ｋ３９２Ｆ、Ｋ３９２Ｄ、Ｋ３９２Ｅ、Ｔ３９４Ｆ、Ｔ３９４Ｗ、Ｄ３９９Ｒ、Ｄ３９９Ｋ、Ｄ３９９Ｖ、Ｓ４００Ｋ、Ｓ４００Ｒ、Ｄ４０１Ｋ、Ｆ４０５Ａ、Ｆ４０５Ｔ、Ｙ４０７Ａ、Ｙ４０７Ｉ、Ｙ４０７Ｖ、Ｋ４０９Ｆ、Ｋ４０９Ｗ、Ｋ４０９Ｄ、Ｔ４１１Ｄ、Ｔ４１１Ｅ、Ｋ４３９Ｄ、およびＫ４３９Ｅが含まれる。
ある特定の実施形態では、ヒトＩｇＧ１定常領域のＣＨ１中に組み込むことができる変異は、アミノ酸Ｖ１２５、Ｆ１２６、Ｐ１２７、Ｔ１３５、Ｔ１３９、Ａ１４０、Ｆ１７０、Ｐ１７１、および／またはＶ１７３においてであり得る。ある特定の実施形態では、ヒトＩｇＧ１定常領域のＣκ中に組み込むことができる変異は、アミノ酸Ｅ１２３、Ｆ１１６、Ｓ１７６、Ｖ１６３、Ｓ１７４、および／またはＴ１６４においてであり得る。
あるいは、アミノ酸置換を、以下の表５に示す置換セットから選択することができる。
Figure 2021098732
あるいは、アミノ酸置換を、以下の表６に示す置換セットから選択することができる。
Figure 2021098732
Figure 2021098732
あるいは、アミノ酸置換を、以下の表７に示す置換セットから選択することができる。
Figure 2021098732
あるいは、各ポリペプチド鎖中の少なくとも１つのアミノ酸置換を、表８から選択することができる。
Figure 2021098732
あるいは、少なくとも１つのアミノ酸置換を、以下の表９中の置換セットから選択することができ、ここで、第１のポリペプチド列に示した位置（複数可）が任意の公知の負電荷アミノ酸によって置き換えられ、第２のポリペプチド列に示した位置（複数可）が任意の公知の正電荷アミノ酸によって置き換えられる。
Figure 2021098732
あるいは、少なくとも１つのアミノ酸置換を、以下の表１０中のセットから選択することができ、ここで、第１のポリペプチド列に示した位置（複数可）が任意の公知の正電荷アミノ酸によって置き換えられ、第２のポリペプチド列に示した位置（複数可）が任意の公知の負電荷アミノ酸によって置き換えられる。
Figure 2021098732
あるいは、アミノ酸置換を、以下の表１１中のセットから選択することができる。
Figure 2021098732
あるいは、またはさらに、ヘテロ多量体タンパク質の構造安定性を、第１のまたは第２のポリペプチド鎖上のいずれかにＳ３５４Ｃを導入し、反対側のポリペプチド鎖上にＹ３４９Ｃを導入し、それにより、２つのポリペプチドの界面内に人工ジスルフィド架橋を形成させることによって増加させることができる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、位置Ｔ３６６でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６、Ｌ３６８、およびＹ４０７からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６、Ｌ３６８、およびＹ４０７からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、位置Ｔ３６６でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｔ３９４、Ｄ４０１、Ｆ４０５、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９、Ｅ３５７、Ｓ３６４、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｔ３９４、Ｄ４０１、Ｆ４０５、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９、Ｅ３５７、Ｓ３６４、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｔ３９４、Ｄ４０１、Ｆ４０５、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｔ３９４、Ｄ４０１、Ｆ４０５、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｌ３５１、Ｄ３９９、Ｓ４００、およびＹ４０７からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｋ４０９、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｋ４０９、およびＴ４１１からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｌ３５１、Ｄ３９９、Ｓ４００、およびＹ４０７か
らなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｑ３４７、Ｙ３４９、Ｋ３６０、およびＫ４０９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｑ３４７、Ｅ３５７、Ｄ３９９、およびＦ４０５からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｑ３４７、Ｅ３５７、Ｄ３９９、およびＦ４０５からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９、Ｋ３６０、Ｑ３４７、およびＫ４０９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｋ３７０、Ｋ３９２、Ｋ４０９、およびＫ４３９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｄ３５６、Ｅ３５７、およびＤ３９９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｄ３５６、Ｅ３５７、およびＤ３９９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｋ３７０、Ｋ３９２、Ｋ４０９、およびＫ４３９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｌ３５１、Ｅ３５６、Ｔ３６６、およびＤ３９９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｌ３６８、Ｋ３９２、およびＫ４０９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｌ３６８、Ｋ３９２、およびＫ４０９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｌ３５１、Ｅ３５６、Ｔ３６６、およびＤ３９９からなる群から選択される１またはそれを超える位置でＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｓ３５４Ｃ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９Ｃ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｙ３４９Ｃ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｓ３５４Ｃ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｋ３６０ＥおよびＫ４０９Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｏ３４７Ｒ、Ｄ３９９Ｖ、およびＦ４０５Ｔ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｏ３４７Ｒ、Ｄ３９９Ｖ、およびＦ４０５Ｔ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｋ３６０ＥおよびＫ４０９Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６Ｓ、Ｔ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６Ｓ、Ｔ３６８Ａ、およびＹ４０７Ｖ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３６６Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３５０Ｖ、Ｌ３５１Ｙ、Ｆ４０５Ａ、およびＹ４０７Ｖ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３５０Ｖ、Ｔ３６６Ｌ、Ｋ３９２Ｌ、およびＴ３９４Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
いくつかの実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３５０Ｖ、Ｔ３６６Ｌ、Ｋ３９２Ｌ、およびＴ３９４Ｗ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なり、抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Ｔ３５０Ｖ、Ｌ３５１Ｙ、Ｆ４０５Ａ、およびＹ４０７Ｖ置換によってＩｇＧ１定常領域のアミノ酸配列と異なる。
上記の多特異性タンパク質を、当業者に周知の組換えＤＮＡテクノロジーを使用して作製することができる。例えば、第１の免疫グロブリン重鎖をコードする第１の核酸配列を、第１の発現ベクターにクローニングすることができ；第２の免疫グロブリン重鎖をコードする第２の核酸配列を、第２の発現ベクターにクローニングすることができ；免疫グロブリン軽鎖をコードする第３の核酸配列を、第３の発現ベクターにクローニングすることができ；第１、第２、および第３の発現ベクターを、共に宿主細胞に安定的にトランスフェクトして、多量体タンパク質を産生することができる。
多特異性タンパク質の最高の収量を達成するために、異なる比の第１、第２、および第３の発現ベクターを調査して、宿主細胞へのトランスフェクションに最適な比を決定することができる。トランスフェクション後、限界希釈、ＥＬＩＳＡ、ＦＡＣＳ、顕微鏡法、またはＣｌｏｎｅｐｉｘなどの当該分野で公知の方法を使用して、細胞バンク生成のための単一クローンを単離することができる。
クローンを、バイオリアクターのスケールアップに適切な条件下で培養し、多特異性タンパク質の発現を維持することができる。多特異性タンパク質を、当該分野で公知の方法（遠心分離、深層濾過、細胞溶解、ホモジネーション、凍結融解、親和性精製、ゲル濾過
、イオン交換クロマトグラフィ、疎水性相互作用交換クロマトグラフィ、および混合モードのクロマトグラフィが含まれる）を使用して単離および精製することができる。
ＩＩ．多特異性タンパク質の特徴づけ
本明細書中に記載の多特異性タンパク質は、ＮＫＧ２Ｄ結合部位、ＣＤ１６結合部位、およびＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１結合部位を含む。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、ＮＫＧ２Ｄおよび／またはＣＤ１６を発現する細胞（ＮＫ細胞など）、ならびにＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞に同時に結合する。多特異性タンパク質のＮＫ細胞への結合は、腫瘍細胞の破壊に対するＮＫ細胞の活性を増強することができる。
いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、対応するＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１モノクローナル抗体（すなわち、多特異性タンパク質に組み込まれた結合部位と同一のＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１結合部位を含むモノクローナル抗体）と類似の親和性でＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、対応するＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１モノクローナル抗体よりもＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞をより有効に死滅させる。
ある特定の実施形態では、ＮＫＧ２Ｄ結合部位およびＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１の結合部位を含む本明細書中に記載の多特異性タンパク質は、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する細胞と共培養した場合に初代ヒトＮＫ細胞を活性化する。ＮＫ細胞の活性化は、ＣＤ１０７ａの脱顆粒およびＩＦＮ−γサイトカイン産生の増加によって特徴づけられる。さらに、対応するＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１モノクローナル抗体と比較して、多特異性タンパク質は、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する細胞の存在下でヒトＮＫ細胞の優れた活性化を示し得る。
ある特定の実施形態では、ＮＫＧ２Ｄ結合部位およびＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１の結合部位を含む本明細書中に記載の多特異性タンパク質は、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する細胞と共培養した場合に休止およびＩＬ−２活性化されたヒトＮＫ細胞の活性を増強する。
ある特定の実施形態では、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する対応するモノクローナル抗体と比較して、多特異性タンパク質は、中レベルおよび低レベルのＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する腫瘍細胞の標的化において利点を提供する。本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質は、腫瘍成長の低下およびがん細胞の殺滅においてより有効である。例えば、ＥＧＦＲ発現腫瘍／がん細胞を標的にする本開示の多特異性結合タンパク質は、パニツムマブまたはネシツムマブよりも有効である。本開示のＴｒｉＮＫＥＴであるＡ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ（Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介してＦｃドメインに連結したＥＧＦＲに結合するｓｃＦｖ（例えば、配列番号２６４）（配列番号２６７で表したｓｃＦｖ−Ｆｃ）；ならびにＡＤＩ−２７７４９（Ａ４９）の重鎖可変ドメイン（配列番号８５）およびＣＨ１ドメインを含む重鎖部分ならびに軽鎖可変ドメイン（配列番号８６）および軽鎖定常ドメインを含む軽鎖部分を含むＮＫＧ２Ｄ結合Ｆａｂ断片を含み、ここで、重鎖可変ドメインはＣＨ１に接続しており、ＣＨ１ドメインはＦｃドメインに接続している（ＶＨ−ＣＨ１−Ｆｃとして表される重鎖部分、アミノ酸配列は配列番号２７０に記載））は、ＥＧＦＲ発現ヒトがん細胞株のＮＫ媒介性細胞溶解の促進で有効である。
ＩＩＩ．治療への応用
本発明は、本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質および／または本明細書中に記載の医薬組成物を使用してがんを処置する方法を提供する。本方法を使用して、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１を発現する種々のがんを処置することができる。いくつかの実施形態では、がんは、白血病、例えば、急性骨髄性白血病、Ｔ細胞白血病、急性リンパ球性白血病、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、または毛様細胞白血病である。
いくつかの他の実施形態では、がんは、乳がん、卵巣がん、食道がん、膀胱がん、または胃がん、唾液腺導管癌（ｓａｌｉｖａｒｙ ｄｕｃｔ ｃａｒｃｉｎｏｍａ）、唾液腺導管癌（ｓａｌｉｖａｒｙ ｄｕｃｔ ｃａｒｃｉｎｏｍａｓ）、肺腺癌、または進行性子宮がん（漿液性子宮内膜癌など）である。いくつかの他の実施形態では、がんは、脳がん、乳がん、子宮頸がん、結腸がん、結腸直腸がん、子宮内膜がん、食道がん、白血病、肺がん、肝臓がん、黒色腫、卵巣がん、膵臓がん、直腸がん、腎がん、胃がん、睾丸がん、または子宮がんである。さらに他の実施形態では、がんは、扁平上皮癌、腺癌、小細胞癌、黒色腫、神経芽細胞腫、肉腫（例えば、血管肉腫または軟骨肉腫）、喉頭がん、耳下腺がん、胆道がん、甲状腺がん、末端部黒子黒色腫、光線性角化症、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、腺様嚢胞癌、腺腫、腺肉腫、腺扁平上皮癌、肛門管がん、肛門がん、肛門直腸がん、星状細胞腫瘍、バルトリン腺癌、基底細胞癌、胆嚢がん、骨がん、骨髄がん、気管支がん、気管支腺癌、カルチノイド、胆管癌、軟骨肉腫（ｃｈｏｎｄｏｓａｒｃｏｍａ）、脈絡叢乳頭腫／脈絡叢癌、慢性リンパ球性白血病、慢性骨髄性白血病、明細胞癌、結合組織がん、嚢胞腺腫、消化器系がん、十二指腸がん、内分泌系がん、内胚葉洞腫瘍、子宮内膜過形成、子宮内膜間質部肉腫、類内膜腺癌、内皮細胞がん、上衣がん、上皮細胞がん、ユーイング肉腫、眼と眼窩のがん、女性生殖器がん、限局性結節性過形成、胆嚢がん、胃前庭部がん（ｇａｓｔｒｉｃ ａｎｔｒｕｍ ｃａｎｃｅｒ）、胃底部がん、ガストリノーマ、膠芽細胞腫、グルカゴノーマ、心臓がん、血管芽細胞腫（ｈｅｍａｎｇｉｂｌａｓｔｏｍａ）、血管内皮腫、血管腫、肝細胞腺腫、肝細胞腺腫症、肝胆道がん、肝細胞癌、ホジキン病、回腸がん、インスリノーマ、上皮内新生物、上皮間扁平細胞新生物、肝内胆管がん、浸潤性扁平上皮癌、空腸がん、関節がん、カポジ肉腫、骨盤がん、大細胞癌、大腸がん、平滑筋肉腫、悪性黒子型黒色腫、リンパ腫、男性生殖器がん、悪性黒色腫、悪性中皮腫瘍、髄芽腫、髄様上皮腫、髄膜がん、中皮がん、転移性癌、口腔がん、粘膜類表皮癌、多発性骨髄腫、筋肉がん、鼻道がん、神経系がん、神経上皮腺癌 結節性黒色腫、非上皮性皮膚がん、非ホジキンリンパ腫、燕麦細胞癌、乏突起神経膠細胞がん、口腔がん、骨肉腫、乳頭状漿液性腺癌、陰茎がん、咽頭がん、下垂体腫瘍、形質細胞腫、偽肉腫、肺芽腫、直腸がん、腎細胞癌、呼吸器系がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、肉腫、漿液性癌、副鼻腔がん、皮膚がん、小細胞癌、小腸がん、平滑筋がん、軟部組織がん、ソマトスタチン分泌腫瘍、脊椎がん、扁平上皮癌、横紋筋がん、中皮下層がん、表在性拡大型黒色腫、Ｔ細胞白血病、舌がん、未分化癌、尿管がん、尿道がん、膀胱がん、泌尿器系がん、子宮頸がん、子宮体がん、ブドウ膜黒色腫、膣がん、疣状癌、ビポーマ、外陰がん、高分化型癌、またはウィルムス腫瘍である。
いくつかの他の実施形態では、処置すべきがんは、非ホジキンリンパ腫（Ｂ細胞リンパ腫またはＴ細胞リンパ腫など）である。ある特定の実施形態では、非ホジキンリンパ腫は、Ｂ細胞リンパ腫（びまん性大細胞型Ｂ細胞リンパ腫、原発性縦隔Ｂ細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、小リンパ球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、節外性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、結節性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、脾性辺縁帯Ｂ細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、毛様細胞白血病、または原発性中枢神経系（ＣＮＳ）リンパ腫など）である。ある特定の他の実施形態では、非ホジキンリンパ腫は、Ｔ細胞リンパ腫（前駆Ｔリンパ芽球性リンパ腫、末梢性Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、血管免疫芽球性Ｔ細胞リンパ腫、節外性ナチュラルキラー／Ｔ細胞リンパ腫、腸症型Ｔ細胞リンパ腫、皮下脂肪組織炎様Ｔ細胞リンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、ま
たは末梢性Ｔ細胞リンパ腫など）である。
いくつかの他の実施形態では、処置すべきがんは、頭頸部がん、結腸直腸がん、非小細胞肺がん、神経膠腫、腎細胞癌、膀胱がん、子宮頸がん、卵巣がん、膵臓がん、および肝臓がんからなる群から選択される。
いくつかの他の実施形態では、処置すべきがんは、リンパ腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、および肉腫からなる群から選択される。
いくつかの他の実施形態では、処置すべきがんは、リンパ腫、白血病、多発性骨髄腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、肉腫、および胃がんからなる群から選択される。
いくつかの他の実施形態では、処置すべきがんは、成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病、末梢Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞悪性疾患、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、胸腺腫、胃がん、および腎細胞癌からなる群から選択される。
ＩＶ．併用療法
本発明の別の態様は、併用療法を提供する。本明細書中に記載の多特異性結合タンパク質を、がんを処置するためのさらなる治療剤と組み合わせて使用することができる。
がん処置における併用療法の一部として使用することができる例示的な治療剤には、例えば、放射線、マイトマイシン、トレチノイン、リボムスチン、ゲムシタビン、ビンクリスチン、エトポシド、クラドリビン、ミトブロニトール、メトトレキサート、ドキソルビシン、カルボコン、ペントスタチン、ニトラクリン、ジノスタチン、セトロレリクス、レトロゾール、ラルチトレキセド、ダウノルビシン、ファドロゾール、ホテムスチン、サイマルファシン、ソブゾキサン、ネダプラチン、シタラビン、ビカルタミド、ビノレルビン、ベスナリノン、アミノグルテチミド、アムサクリン、プログルミド、エリプチニウムアセタート、ケタンセリン、ドキシフルリジン、エトレチナート、イソトレチノイン、ストレプトゾシン、ニムスチン、ビンデシン、フルタミド、ドロゲニル、ブトシン、カルモフール、ラゾキサン、シゾフィラン、カルボプラチン、ミトラクトール、テガフール、イフォスファミド、プレドニムスチン、ピシバニール、レバミゾール、テニポシド、インプロスルファン、エノシタビン、リスリド、オキシメトロン、タモキシフェン、プロゲステロン、メピチオスタン、エピチオスタノール、ホルメスタン、インターフェロン−α、インターフェロン−２α、インターフェロン−β、インターフェロン−γ（ＩＦＮ−γ）、コロニー刺激因子−１、コロニー刺激因子−２、デニロイキンジフチトクス、インターロイキン−２、黄体形成ホルモン放出因子、ならびにその同族受容体への特異の結合（ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ ｂｉｎｄｉｎｇ）、および血清半減期の増加または減少を示し得る前記薬剤のバリエーションが含まれる。
がん処置における併用療法の一部として使用することができるさらなる薬剤のクラスは、免疫チェックポイント阻害剤である。例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、（ｉ）細胞傷害性Ｔリンパ球関連抗原４（ＣＴＬＡ４）、（ｉｉ）プログラム細胞死タンパク質１（ＰＤ１）、（ｉｉｉ）ＰＤＬ１、（ｉｖ）ＬＡＧ３、（ｖ）Ｂ７−Ｈ３、（ｖｉ）Ｂ７−Ｈ４、および（ｖｉｉ）ＴＩＭ３のうちの１つまたは複数を阻害する薬剤が含まれる。ＣＴＬＡ４阻害剤イプリムマブは、米国食品医薬品局により黒色腫処置について承認を受けている。
がん処置における併用療法の一部として使用することができるさらなる他の薬剤は、非チェックポイント標的を標的にするモノクローナル抗体剤（例えば、ハーセプチン）および非細胞毒性剤（例えば、チロシン−キナーゼ阻害剤）である。
抗がん剤のさらなる他のカテゴリーには、例えば、以下が含まれる：（ｉ）ＡＬＫ阻害剤、ＡＴＲ阻害剤、Ａ２Ａアンタゴニスト、塩基除去修復阻害剤、Ｂｃｒ−Ａｂｌチロシンキナーゼ阻害剤、ブルトン型チロシンキナーゼ阻害剤、ＣＤＣ７阻害剤、ＣＨＫ１阻害剤、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤、ＤＮＡ−ＰＫ阻害剤、ＤＮＡ−ＰＫおよびｍＴＯＲの両方の阻害剤、ＤＮＭＴ１阻害剤、ＤＮＭＴ１阻害剤＋２−クロロ−デオキシアデノシン、ＨＤＡＣ阻害剤、ヘッジホッグシグナル伝達経路阻害剤、ＩＤＯ阻害剤、ＪＡＫ阻害剤、ｍＴＯＲ阻害剤、ＭＥＫ阻害剤、ＭＥＬＫ阻害剤、ＭＴＨ１阻害剤、ＰＡＲＰ阻害剤、ホスホイノシチド３−キナーゼ阻害剤、ＰＡＲＰ１およびＤＨＯＤＨの両方の阻害剤、プロテアソーム阻害剤、トポイソメラーゼ−ＩＩ阻害剤、チロシンキナーゼ阻害剤、ＶＥＧＦＲ阻害剤、ならびにＷＥＥ１阻害剤から選択される阻害剤；（ｉｉ）ＯＸ４０、ＣＤ１３７、ＣＤ４０、ＧＩＴＲ、ＣＤ２７、ＨＶＥＭ、ＴＮＦＲＳＦ２５、またはＩＣＯＳのアゴニスト；および（ｉｉｉ）ＩＬ−１２、ＩＬ−１５、ＧＭ−ＣＳＦ、およびＧ−ＣＳＦから選択されるサイトカイン。
本発明のタンパク質を、原発性病変の外科的除去の補助剤として使用することもできる。
多特異性結合タンパク質およびさらなる治療剤の量ならびに相対的な投与のタイミングを、所望の併用治療効果を達成するために選択することができる。例えば、併用療法をかかる投与を必要とする患者に施す場合、治療剤の組み合わせ（すなわち、治療剤を含む医薬組成物（単数または複数）を、任意の順序で、例えば、例えば、順次、併せて、共に、同時になどで投与することができる。さらに、例えば、多特異性結合タンパク質を、さらなる治療剤（複数可）がその予防効果または治療効果を発揮している間に投与することができ、その逆も同じであり得る。
Ｖ．医薬組成物
本開示はまた、治療有効量の本明細書中に記載のタンパク質を含む医薬組成物を特徴とする。組成物を、種々の薬物送達系で用いるために製剤化することができる。適切な製剤化のために１またはそれを超える生理学的に許容され得る賦形剤または担体を組成物中に含めることもできる。本開示における使用で適用な製剤は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，Ｐａ．，１７ｔｈ ｅｄ．，１９８５に見出される。薬物送達方法の簡単な総説については、例えば、Ｌａｎｇｅｒ（Ｓｃｉｅｎｃｅ
２４９：１５２７−１５３３，１９９０）を参照のこと。
本開示の静脈内薬物送達製剤を、バッグ、ペン、またはシリンジ中に含めることができる。ある特定の実施形態では、バッグを、管および／または針を含むチャネルに接続することができる。ある特定の実施形態では、製剤は、凍結乾燥製剤または液体製剤であり得る。ある特定の実施形態では、製剤をフリーズドライ（凍結乾燥）し、約１２〜６０のバイアル中に含めることができる。ある特定の実施形態では、製剤をフリーズドライし、４５ｍｇのフリーズドライ製剤を１つのバイアルに含めることができる。ある特定の実施形態では、約４０ｍｇ〜約１００ｍｇのフリーズドライ製剤を１つのバイアル中に含めることができる。ある特定の実施形態では、１２、２７、または４５個のバイアル由来のフリーズドライ製剤を合わせて、静脈内薬物製剤中の治療用量のタンパク質が得られる。ある特定の実施形態では、製剤は液体製剤であってよく、約２５０ｍｇ／バイアル〜約１０００ｍｇ／バイアルとして保存することができる。ある特定の実施形態では、製剤は液体製
剤であってよく、約６００ｍｇ／バイアルとして保存することができる。ある特定の実施形態では、製剤は液体製剤であってよく、約２５０ｍｇ／バイアルとして保存することができる。
タンパク質は液体水性医薬製剤中に存在することができ、その製剤は、製剤を形成させる緩衝液中に治療有効量のタンパク質を含んでいる。
これらの組成物を、従来の滅菌技術によって滅菌することができるか、濾過滅菌することができる。得られた水溶液を、そのまま使用するために包装することができるか、凍結乾燥させ、凍結乾燥された調製物を投与前に滅菌水性担体と組み合わせることができる。調製物のｐＨは、典型的には、ｐＨ３とｐＨ１１との間、より好ましくはｐＨ５とｐＨ９との間またはｐＨ６とｐＨ８との間、最も好ましくはｐＨ７とｐＨ８との間（ｐＨ７〜ｐＨ７．５など）である。得られた固体形態の組成物を、複数の単一用量単位に包装することができ、単一用量単位の各々は、固定量の上記単数または複数の薬剤を含むことができる。固体形態の組成物を、フレキシブルな量に適する容器に包装することもできる。
ある特定の実施形態では、本開示は、マンニトール、クエン酸一水和物、クエン酸ナトリウム、リン酸二ナトリウム二水和物、リン酸二水素ナトリウム二水和物、塩化ナトリウム、ポリソルベート８０、水、および水酸化ナトリウムと組み合わせた本開示のタンパク質を含む、貯蔵寿命が長い製剤を提供する。
ある特定の実施形態では、ｐＨ緩衝溶液中に本開示のタンパク質を含む水性製剤を調製する。本発明の緩衝液のｐＨは約４〜約８（例えば、約４．５〜約６．０、または約４．８〜約５．５）の範囲であり得るか、約５．０〜約５．２であり得る。上に列挙したｐＨの中間の範囲も、本開示の一部であることが意図される。例えば、上限および／または下限として上に列挙した値のいずれかの組み合わせを使用した値の範囲が含まれることが意図される。この範囲内にｐＨを制御する緩衝液の例には、酢酸緩衝液（例えば、酢酸ナトリウム）、コハク酸緩衝液（コハク酸ナトリウムなど）、グルコン酸緩衝液、ヒスチジン緩衝液、クエン酸緩衝液、および他の有機酸の緩衝液が含まれる。
ある特定の実施形態では、製剤は、約４〜約８のｐＨ範囲を維持するためのクエン酸塩およびリン酸塩を含む緩衝系を含む。ある特定の実施形態では、ｐＨ範囲は、約４．５〜約６．０、または約ｐＨ４．８〜約５．５、または約５．０〜約５．２のｐＨ範囲であり得る。ある特定の実施形態では、緩衝系は、クエン酸一水和物、クエン酸ナトリウム、リン酸二ナトリウム二水和物、および／またはリン酸二水素ナトリウム二水和物を含む。ある特定の実施形態では、緩衝系は、約１．３ｍｇ／ｍＬのクエン酸（例えば、１．３０５ｍｇ／ｍＬ）、約０．３ｍｇ／ｍＬのクエン酸ナトリウム（例えば、０．３０５ｍｇ／ｍＬ）、約１．５ｍｇ／ｍＬのリン酸二ナトリウム二水和物（例えば、１．５３ｍｇ／ｍＬ）、約０．９ｍｇ／ｍＬのリン酸二水素ナトリウム二水和物（例えば、０．８６）、および約６．２ｍｇ／ｍＬの塩化ナトリウム（例えば、６．１６５ｍｇ／ｍＬ）を含む。ある特定の実施形態では、緩衝系は、１〜１．５ｍｇ／ｍＬのクエン酸、０．２５〜０．５ｍｇ／ｍＬのクエン酸ナトリウム、１．２５〜１．７５ｍｇ／ｍＬのリン酸二ナトリウム二水和物、０．７〜１．１ｍｇ／ｍＬのリン酸二水素ナトリウム二水和物、および６．０〜６．４ｍｇ／ｍＬの塩化ナトリウムを含む。ある特定の実施形態では、製剤のｐＨを、水酸化ナトリウムで調整する。
等張剤として作用し、抗体を安定化させることができるポリオールを、製剤中に含めることもできる。製剤の望ましい等張性に応じて変え得る量のポリオールを製剤に添加する。ある特定の実施形態では、水性製剤は等張であり得る。ポリオールの添加量を、ポリオールの分子量に応じて変更することもできる。例えば、ジサッカリド（トレハロースなど
）と比較して少量のモノサッカリド（例えば、マンニトール）を添加することができる。ある特定の実施形態では、等張化剤として製剤中に使用することができるポリオールはマンニトールである。ある特定の実施形態では、マンニトール濃度は、約５〜約２０ｍｇ／ｍＬであり得る。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は、約７．５〜１５ｍｇ／ｍＬであり得る。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は、約１０〜１４ｍｇ／ｍＬであり得る。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は、約１２ｍｇ／ｍＬであり得る。ある特定の実施形態では、ポリオールであるソルビトールを、製剤中に含めることができる。
界面活性剤または表面活性剤を、製剤に添加することもできる。例示的な界面活性剤には、非イオン性界面活性剤（ポリソルベート（例えば、ポリソルベート２０、８０など）またはポロクサマー（例えば、ポロクサマー１８８）など）が含まれる。界面活性剤の添加量は、製剤化された抗体の凝集を減少させ、そして／または製剤中の粒子の形成を最小にし、そして／または吸着を低下させるような量である。ある特定の実施形態では、製剤は、ポリソルベートである表面活性剤を含むことができる。ある特定の実施形態では、製剤は、界面活性剤であるポリソルベート８０またはＴｗｅｅｎ８０を含み得る。Ｔｗｅｅｎ８０は、ポリオキシエチレン（２０）ソルビタンモノオレアートを説明するために使用される用語である（Ｆｉｅｄｌｅｒ，Ｌｅｘｉｋｏｎ ｄｅｒ Ｈｉｆｓｓｔｏｆｆｅ，Ｅｄｉｔｉｏ Ｃａｎｔｏｒ Ｖｅｒｌａｇ Ａｕｌｅｎｄｏｒｆ，４ｔｈ ｅｄ．，１９９６を参照のこと）。ある特定の実施形態では、製剤は、約０．１ｍｇ／ｍＬと約１０ｍｇ／ｍＬとの間または約０．５ｍｇ／ｍＬと約５ｍｇ／ｍＬとの間のポリソルベート８０を含み得る。ある特定の実施形態では、約０．１％ポリソルベート８０を製剤中に添加することができる。
複数の実施形態では、本開示のタンパク質産物を、液体製剤として製剤化する。液体製剤は、ゴム栓で栓をし、アルミニウムクリンプシールでシールされた米国薬局方／欧州薬局方タイプＩ ５０Ｒバイアルのいずれかに濃度１０ｍｇ／ｍＬで存在し得る。栓は、米国薬局方および欧州薬局方に準拠したエラストマー製であり得る。ある特定の実施形態では、バイアルに、６０ｍＬの容量がを抜き取れるように、６１．２ｍＬのタンパク質産物溶液を充填することができる。ある特定の実施形態では、液体製剤を、０．９％食塩水で希釈することができる。
ある特定の実施形態では、本開示の液体製剤を、安定化レベルの糖と組み合わせた濃度１０ｍｇ／ｍＬの溶液として調製することができる。ある特定の実施形態では、液体製剤を、水性担体中に調製することができる。ある特定の実施形態では、安定剤を、静脈内投与に望ましくないか適切でない粘度になり得る量以下の量で添加することができる。ある特定の実施形態では、糖は、ジサッカリド（例えば、スクロース）であり得る。ある特定の実施形態では、液体製剤はまた、緩衝剤、表面活性剤、および防腐剤のうちの１つまたは複数を含み得る。
ある特定の実施形態では、液体製剤のｐＨを、薬学的に許容され得る酸および／または塩基の添加によって設定することができる。ある特定の実施形態では、薬学的に許容され得る酸は塩酸であり得る。ある特定の実施形態では、塩基は水酸化ナトリウムであり得る。
凝集に加えて、脱アミドは、発酵、回収／細胞清澄化、精製、原体／医薬品の貯蔵の間、ならびに試料分析の間に起こり得るペプチドおよびタンパク質の一般的な産物の変種である。脱アミドは、タンパク質からのＮＨ３の喪失であり、それによりスクシンイミド中間体が形成され、これが加水分解を受け得る。スクシンイミド中間体は、親ペプチドから質量１７ダルトンが減少している。その後の加水分解により質量１８ダルトンが増加する
。スクシンイミド中間体の単離は、水性条件下で不安定であるので困難である。そのため、脱アミドは、典型的には、１ダルトンの質量増加として検出可能である。アスパラギンの脱アミドにより、アスパラギン酸またはイソアスパラギン酸のいずれかが生成する。脱アミド速度に影響を及ぼすパラメーターには、ｐＨ、温度、溶媒誘電率、イオン強度、一次配列、ポリペプチドの局所高次構造、および三次構造が含まれる。ペプチド鎖内のＡｓｎに隣接するアミノ酸残基は、脱アミド速度に影響を及ぼす。タンパク質配列内でＡｓｎにＧｌｙおよびＳｅｒが続くと、脱アミドに対する感受性がより高くなる。
ある特定の実施形態では、本開示の液体製剤を、タンパク質産物の脱アミノ化を防止するｐＨおよび湿度の条件下で保存することができる。
本明細書中の目的の水性担体は、薬学的に許容され得（ヒトへの投与に関して安全かつ無毒である）、かつ液体製剤の調製に有用な水性担体である。実例となる担体には、滅菌注射用水（ＳＷＦＩ）、静菌注射用水（ＢＷＦＩ）、ｐＨ緩衝液（例えば、リン酸緩衝食塩水）、滅菌食塩水、リンゲル液、またはデキストロース溶液が含まれる。
防腐剤を、細菌作用を低下させるために必要に応じて本明細書中の製剤に添加することができる。防腐剤の添加により、例えば、マルチユース（複数回投与）製剤の生産を容易にすることができる。
静脈内（ＩＶ）製剤は、特定の例（患者が院内で移植後にＩＶ経路を介して全ての薬物を投与されている場合など）における好ましい投与経路であり得る。ある特定の実施形態では、液体製剤を、投与前に０．９％塩化ナトリウム溶液で希釈する。ある特定の実施形態では、注射のために希釈された医薬品は等張であり、静脈内注入による投与に適切である。
ある特定の実施形態では、塩または緩衝液の構成要素を、１０ｍＭ〜２００ｍＭの量で添加することができる。塩および／または緩衝液は、薬学的に許容され得、「塩基生成」金属またはアミンを含んで種々の公知の酸（無機および有機）から得られる。ある特定の実施形態では、緩衝液は、リン酸緩衝液であり得る。ある特定の実施形態では、緩衝液は、グリシン酸緩衝液、炭酸緩衝液、クエン酸緩衝液であり得、この場合、ナトリウムイオン、カリウムイオン、またはアンモニウムイオンは、対イオンとしての機能を果たし得る。
防腐剤を、細菌作用を低下させるために必要に応じて本明細書中の製剤に添加することができる。防腐剤の添加により、例えば、マルチユース（複数回投与）製剤の生産を容易にすることができる。
本明細書中の目的の水性担体は、薬学的に許容され得（ヒトへの投与に関して安全かつ無毒である）、かつ液体製剤の調製に有用な水性担体である。実例となる担体には、滅菌注射用水（ＳＷＦＩ）、静菌注射用水（ＢＷＦＩ）、ｐＨ緩衝液（例えば、リン酸緩衝食塩水）、滅菌食塩水、リンゲル液、またはデキストロース溶液が含まれる。
本開示のタンパク質は、タンパク質および凍結乾燥保護剤を含む凍結乾燥製剤中に存在し得る。凍結乾燥保護剤は、糖（例えば、ジサッカリド）であり得る。ある特定の実施形態では、凍結乾燥保護剤は、スクロースまたはマルトースであり得る。凍結乾燥製剤はまた、緩衝剤、表面活性剤、増量剤、および／または防腐剤のうちの１つまたは複数を含み得る。
凍結乾燥医薬品の安定化に有用なスクロースまたはマルトースの量は、タンパク質のス
クロースまたはマルトースに対する重量比が少なくとも１：２であり得る。ある特定の実施形態では、タンパク質のスクロースまたはマルトースに対する重量比は、１：２〜１：５であり得る。
ある特定の実施形態では、凍結乾燥前の製剤のｐＨを、薬学的に許容され得る酸および／または塩基の添加によって設定することができる。ある特定の実施形態では、薬学的に許容され得る酸は、塩酸であり得る。ある特定の実施形態では、薬学的に許容され得る塩基は、水酸化ナトリウムであり得る。
凍結乾燥前に、本開示のタンパク質を含む溶液のｐＨを、６〜８に調整することができる。ある特定の実施形態では、凍結乾燥医薬品のｐＨ範囲は、７〜８であり得る。
ある特定の実施形態では、塩または緩衝液の構成要素を、１０ｍＭ〜２００ｍＭの量で添加することができる。塩および／または緩衝液は、薬学的に許容され得、「塩基生成」金属またはアミンを含んで種々の公知の酸（無機および有機）から得られる。ある特定の実施形態では、緩衝液は、リン酸緩衝液であり得る。ある特定の実施形態では、緩衝液は、グリシン酸緩衝液、炭酸緩衝液、クエン酸緩衝液であり得、この場合、ナトリウムイオン、カリウムイオン、またはアンモニウムイオンは、対イオンとしての機能を果たし得る。
ある特定の実施形態では、「増量剤」を添加することができる。「増量剤」は、凍結乾燥した混合物のかさ（ｍａｓｓ）を増加させ、凍結乾燥ケーキの物理的構造に寄与する（例えば、開孔構造を維持する本質的に均一な凍結乾燥ケーキの生成を容易にする）化合物である。実例となる増量剤には、マンニトール、グリシン、ポリエチレングリコール、およびソルビトールが含まれる。本発明の凍結乾燥製剤は、かかる増量剤を含み得る。
防腐剤を、細菌作用を低下させるために必要に応じて本明細書中の製剤に添加することができる。防腐剤の添加により、例えば、マルチユース（複数回投与）製剤の生産を容易にすることができる。
ある特定の実施形態では、凍結乾燥医薬品を、水性担体を用いて構成することができる。本明細書中の目的の水性担体は、薬学的に許容され得（例えば、ヒトへの投与に関して安全かつ無毒である）、かつ凍結乾燥後の液体製剤の調製に有用な水性担体である。実例となる希釈剤には、滅菌注射用水（ＳＷＦＩ）、静菌注射用水（ＢＷＦＩ）、ｐＨ緩衝液（例えば、リン酸緩衝食塩水）、滅菌食塩水、リンゲル液、またはデキストロース溶液が含まれる。
ある特定の実施形態では、本開示の凍結乾燥医薬品を、米国薬局方滅菌注射用水（ＳＷＦＩ）または米国薬局方０．９％塩化ナトリウム注射液のいずれかで再構成する。再構成中に、凍結乾燥粉末が溶液へと溶解する。
ある特定の実施形態では、本開示の凍結乾燥タンパク質産物は、約４．５ｍＬ注射用水で構成され、０．９％生理食塩水（塩化ナトリウム溶液）で希釈する。
本発明の医薬組成物中の有効成分の実際の投薬量レベルを、特定の患者に対する毒性を示さずに、その患者、組成物、および投与様式について所望の治療反応を達成するのに有効な有効成分の量を得るために変えることができる。
具体定な用量は、各患者について均一な用量（例えば、５０〜５０００ｍｇのタンパク質）であり得る。あるいは、患者の用量は、患者のおおよその体重または表面積に適合さ
せることができる。適切な投薬量を決定する他の要因には、処置または予防すべき疾患または状態、疾患の重症度、投与経路、患者の年齢、性別、および病状が含まれ得る。当業者は、日常的に、特に本明細書中に開示の投薬量の情報およびアッセイを考慮して、処置に適切な投薬量の決定に必要な計算をさらに改良する。適切な用量−応答データと併せて投薬量の決定のための公知のアッセイを使用して、投薬量を決定することもできる。個別の患者の投薬量を、疾患の進行をモニタリングしながら調整することができる。患者における標的可能な構築物または複合体の血中レベルを測定して、有効濃度を達成するか維持するために投薬量を調整する必要があるかどうかを確認することができる。ファーマコゲノミクスを使用して、どの標的可能な構築物および／または複合体ならびにその投薬量が所与の個体にとって有効である可能性が最も高いかを決定することができる（Ｓｃｈｍｉｔｚ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎｉｃａ Ｃｈｉｍｉｃａ Ａｃｔａ ３０８：４３−５３，２００１；Ｓｔｅｉｍｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎｉｃａ Ｃｈｉｍｉｃａ Ａｃｔａ ３０８：３３−４１，２００１）。
一般に、体重に基づいた投薬量は、約０．０１μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重（約０．０１μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約１００μｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約５０μｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約１０μｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約１μｇ／ｋｇ体重、約０．０１μｇ〜約０．１μｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１００μｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１０μｇ／ｋｇ体重、約０．１μｇ〜約１μｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約１００μｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約５０μｇ／ｋｇ体重、約１μｇ〜約１０μｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約１００μｇ／ｋｇ体重、約１０μｇ〜約５０μｇ／ｋｇ体重、約５０μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約５０μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約５０μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約５０μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約５０μｇ〜約１００μｇ／ｋｇ体重、約１００μｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約１００μｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約１００μｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１００μｇ〜約１ｍｇ／ｋｇ体重、約１ｍｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約１ｍｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約１ｍｇ〜約１０ｍｇ／ｋｇ体重、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重、約１０ｍｇ〜約５０ｍｇ／ｋｇ体重、約５０ｍｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ体重など）である。
複数の用量を、毎日、毎週、毎月、または毎年１回または複数回、またはさらに２〜２０年毎に１回投与することができる。当業者は、体液または組織内の標的可能な構築物または複合体の滞留時間および濃度の測定値に基づいて、投薬の反復率を容易に推定することができる。本発明の投与は、静脈内、動脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、胸膜内、髄腔内、腔内、カテーテルを介する灌流による、または病巣内への直接注射によるものであり得る。毎日１またはそれを超える回数、毎週１またはそれを超える回数、毎月１またはそれを超える回数、および毎年１またはそれを超える回数投与することができる。
上記の説明は、本発明の複数の態様および実施形態を記載している。本特許出願は、特に、態様および実施形態の全ての組み合わせおよび変更を意図する。
実施例
ここに一般的に説明した本発明は、以下の実施例を参照してより容易に理解される。こ
れらの実施例は、本発明のある特定の態様および実施形態の例証のみを目的として含まれ、本発明を限定することを意図しない。
実施例１−ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインはＮＫＧ２Ｄに結合する
ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、精製した組換えＮＫＧ２Ｄに結合する
ヒト、マウス、またはカニクイザルのＮＫＧ２Ｄ外部ドメインの核酸配列を、ヒトＩｇＧ１ Ｆｃドメインをコードする核酸配列と融合し、発現すべき哺乳動物細胞に導入した。精製後、ＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ融合タンパク質を、マイクロプレートのウェルに吸着させた。非特異的結合を防止するためウシ血清アルブミンでウェルをブロッキングした後、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを滴定し、ＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ融合タンパク質を予め吸着させたウェルに添加した。セイヨウワサビペルオキシダーゼにコンジュゲートし、ヒトκ軽鎖を特異的に認識してＦｃ交差反応を回避する二次抗体を使用して、一次抗体結合を検出した。３，３’，５，５’−テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）（セイヨウワサビペルオキシダーゼの基質）をウェルに添加して結合シグナルを可視化し、その吸光度を４５０ｎＭで測定し、５４０ｎＭで補正した。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインクローン、アイソタイプコントロール、またはポジティブコントロール（配列番号１０１〜１０４から選択される重鎖および軽鎖の可変ドメイン、または、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅから入手可能な抗マウスＮＫＧ２ＤクローンＭＩ−６およびＣＸ−５を含む）を、各ウェルに添加した。
アイソタイプコントロールは組換えＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質への結合が最小であった一方で、ポジティブコントロールの組換え抗原への結合は最強であった。全クローンによって産生されたＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、クローンごとに親和性が異なるが、ヒト、マウス、およびカニクイザルの組換えＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質にわたって結合が実証された。一般に、各抗ＮＫＧ２Ｄクローンは、ヒト（図３）およびカニクイザル（図４）の組換えＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃに類似の親和性で結合したが、マウス（図５）組換えＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃに対する親和性は低かった。
ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、ＮＫＧ２Ｄを発現する細胞に結合する
ＥＬ４マウスリンパ腫細胞株を、ヒトまたはマウスのＮＫＧ２Ｄ−ＣＤ３ζシグナル伝達ドメインキメラ抗原受容体を発現するように操作した。ＮＫＧ２Ｄ結合クローン、アイソタイプコントロール、またはポジティブコントロールを、濃度１００ｎＭで使用してＥＬ４細胞上に発現された細胞外ＮＫＧ２Ｄを染色した。フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトＩｇＧ二次抗体を使用して抗体結合を検出した。細胞を、フローサイトメトリーによって分析し、バックグラウンドに対する倍率（ＦＯＢ）を、親ＥＬ４細胞と比較したＮＫＧ２Ｄ発現細胞の平均蛍光強度（ＭＦＩ）を使用して計算した。
全てのクローンによって産生されたＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、ヒトおよびマウスのＮＫＧ２Ｄを発現するＥＬ４細胞に結合した。ポジティブコントロール抗体（配列番号１０１〜１０４から選択される重鎖および軽鎖の可変ドメイン、または、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅから入手可能な抗マウスＮＫＧ２ＤクローンＭＩ−６およびＣＸ−５を含む）が、最良のＦＯＢ結合シグナルを示した。各クローンに対するＮＫＧ２Ｄ−結合親和性は、ヒトＮＫＧ２Ｄ（図６）およびマウス（図７）ＮＫＧ２Ｄを発現する細胞の間で類似していた。
実施例２−ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、ＮＫＧ２Ｄへの天然リガンドの結合を遮断する
ＵＬＢＰ−６との競合
組換えヒトＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質を、マイクロプレートのウェルに吸着させ、ウェルをウシ血清アルブミンでブロッキングして非特異的結合を低下させた。飽和濃度のＵＬＢＰ−６−Ｈｉｓ−ビオチンをウェルに添加し、その後にＮＫＧ２Ｄ結合ドメインクローンを添加した。２時間のインキュベーション後、ウェルを洗浄し、ＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃコ
ーティングしたウェルに結合したままのＵＬＢＰ−６−Ｈｉｓ−ビオチンを、セイヨウワサビペルオキシダーゼにコンジュゲートしたストレプトアビジンおよびＴＭＢ基質によって検出した。吸光度を４５０ｎＭで測定し、５４０ｎＭで補正した。バックグラウンドを差し引いた後、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質への特異的結合を、ウェル内でのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質への結合が遮断されたＵＬＢＰ−６−Ｈｉｓ−ビオチンの百分率から計算した。ポジティブコントロール抗体（配列番号１０１〜１０４から選択される重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む）および種々のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインがＮＫＧ２ＤへのＵＬＢＰ−６結合を遮断した一方で、アイソタイプコントロールはＵＬＢＰ−６とほとんど競合しなかった（図８）。
ＵＬＢＰ−６配列を、配列番号１０８で表す。
Figure 2021098732
 ＭＩＣＡとの競合
組換えヒトＭＩＣＡ−Ｆｃタンパク質を、マイクロプレートのウェルに吸着させ、ウェルをウシ血清アルブミンでブロッキングして非特異的結合を低下させた。ＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンをウェルに添加し、その後にＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを添加した。インキュベーションおよび洗浄後、ＭＩＣＡ−Ｆｃコーティングしたウェルに結合したままのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンを、ストレプトアビジン−ＨＲＰおよびＴＭＢ基質を使用して検出した。吸光度を４５０ｎＭで測定し、５４０ｎＭで補正した。バックグラウンドを差し引いた後、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質への特異的結合を、ＭＩＣＡ−Ｆｃコーティングしたウェルへの結合が遮断されたＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンの百分率から計算した。ポジティブコントロール抗体（配列番号１０１〜１０４から選択される重鎖および軽鎖の可変ドメインを含む）および種々のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインがＮＫＧ２ＤへのＭＩＣＡ結合を遮断した一方で、アイソタイプコントロールはＭＩＣＡとほとんど競合しなかった（図９）。
Ｒａｅ−１δとの競合
組換えマウスＲａｅ−１δ−Ｆｃ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓから購入）を、マイクロプレートのウェルに吸着させ、ウェルをウシ血清アルブミンでブロッキングして非特異的結合を低下させた。マウスＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンをウェルに添加し、その後にＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを添加した。インキュベーションおよび洗浄後、Ｒａｅ−１δ−Ｆｃコーティングしたウェルに結合したままのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンを、ストレプトアビジン−ＨＲＰおよびＴＭＢ基質を使用して検出した。吸光度を４５０ｎＭで測定し、５４０ｎＭで補正した。バックグラウンドを差し引いた後、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインのＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃタンパク質への特異的結合を、Ｒａｅ−１δ−Ｆｃコーティングしたウェルへの結合が遮断されたＮＫＧ２Ｄ−Ｆｃ−ビオチンの百分率から計算した。ポジティブコントロール（配列番号１０１〜１０４から選択される重鎖および軽鎖の可変ドメイン、または、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅから入手可能な抗マウスＮＫＧ２ＤクローンＭＩ−６およびＣＸ−５を含む）および種々のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインクローンがマウスＮＫＧ２ＤへのＲａｅ−１δ結合を遮断した一方で、アイソタイプコントロール抗体はＲａｅ−１δとほとんど競合しなかった（図１０）。
実施例３−ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインクローンはＮＫＧ２Ｄを活性化する
ヒトおよびマウスのＮＫＧ２Ｄの核酸配列を、ＣＤ３ζシグナル伝達ドメインをコードする核酸配列に融合して、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）構築物を得た。次いで、ＮＫＧ２Ｄ−ＣＡＲ構築物を、Ｇｉｂｓｏｎアセンブリを使用してレトロウイルスベクターにクローニングし、レトロウイルス産生のためｅｘｐｉ２９３細胞にトランスフェクトした。ＥＬ４細胞に、８μｇ／ｍＬポリブレンと共にＮＫＧ２Ｄ−ＣＡＲを含むウイルスを感染させた。２４時間の感染後、ＥＬ４細胞内でのＮＫＧ２Ｄ−ＣＡＲの発現レベルを、フローサイトメトリーによって解析し、細胞表面上に高レベルのＮＫＧ２Ｄ−ＣＡＲを発現するクローンを選択した。
ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインがＮＫＧ２Ｄを活性化するかどうかを決定するために、前記ドメインをマイクロプレートのウェルに吸着させ、ＮＫＧ２Ｄ−ＣＡＲ ＥＬ４細胞を、抗体断片をコーティングしたウェル上でブレフェルジン−Ａおよびモネンシンの存在下にて４時間培養した。細胞内ＴＮＦ−α産生（ＮＫＧ２Ｄ活性化の指標）を、フローサイトメトリーによってアッセイした。ＴＮＦ−α陽性細胞の百分率を、ポジティブコントロールで処置した細胞に対して正規化した。全てのＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、ヒトＮＫＧ２Ｄ（図１１）およびマウスＮＫＧ２Ｄ（図１２）の両方を活性化した。
実施例４−ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインはＮＫ細胞を活性化する
初代ヒトＮＫ細胞
末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を、密度勾配遠心分離を使用してヒト末梢血バフィーコートから単離した。ＮＫ細胞（ＣＤ３−ＣＤ５６＋）を、磁気ビーズを用いたネガティブ選択を使用してＰＢＭＣから単離し、単離したＮＫ細胞の純度は、典型的には、９５％超であった。次いで、単離したＮＫ細胞を、１００ｎｇ／ｍＬ ＩＬ−２を含む培地中で２４〜４８時間培養後にマイクロプレートのウェルに移し、このウェルにＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを吸着させ、フルオロフォアコンジュゲート抗ＣＤ１０７ａ抗体、ブレフェルジン−Ａ、およびモネンシンを含む培地中で培養した。培養後、ＮＫ細胞を、ＣＤ３、ＣＤ５６、およびＩＦＮ−γに対するフルオロフォアコンジュゲート抗体を使用したフローサイトメトリーによってアッセイした。ＣＤ３−ＣＤ５６＋細胞におけるＣＤ１０７ａおよびＩＦＮ−γ染色を解析して、ＮＫ細胞活性化を評価した。ＣＤ１０７ａ／ＩＦＮ−γ二重陽性細胞の増加は、１つの受容体よりもむしろ２つの活性化受容体の会合によるより良好なＮＫ細胞活性化を示す。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびポジティブコントロール（例えば、配列番号１０１または配列番号１０３で表した重鎖可変ドメインおよび配列番号１０２または配列番号１０４で表した軽鎖可変ドメイン）は、アイソタイプコントロールよりもＮＫ細胞がＣＤ１０７ａ＋およびＩＦＮ−γ＋になる百分率が高いことを示していた（図１３および図１４は、それぞれがＮＫ細胞調製のために異なるドナーのＰＢＭＣを使用した２つの独立した実験からのデータを示す）。
初代マウスＮＫ細胞
脾臓をＣ５７Ｂｌ／６マウスから入手し、７０μｍセルストレーナーで破砕して単一細胞の懸濁物を得た。細胞をペレット化し、ＡＣＫ溶解緩衝液（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ番号Ａ１０４９２０１から購入；１５５ｍＭ塩化アンモニウム、１０ｍＭ重炭酸カリウム、０．０１ｍＭ ＥＤＴＡ）に再懸濁して、赤血球を除去した。残存する細胞を１００ｎｇ／ｍＬ ｈＩＬ−２と共に７２時間培養後に回収し、ＮＫ細胞単離のために調製した。次いで、ＮＫ細胞（ＣＤ３−ＮＫ１．１＋）を、磁気ビーズを用いた負の枯渇技術（ｎｅｇａｔｉｖｅ ｄｅｐｌｅｔｉｏｎ ｔｅｃｈｎｉｑｕｅ）を使用して、脾臓細胞から、典型的には純度９０％超で単離した。精製したＮＫ細胞を、１００ｎｇ／ｍＬ ｍＩＬ−１５を含む培地中で４８時間培養後にマイクロプレートのウェルに移し、このウェルにＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを吸着させ、フルオロフォアコンジュゲート抗ＣＤ１０７ａ抗体、ブレフェルジン−Ａ、およびモネンシンを含む培地中で培養した。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインコーティングしたウェル中での培養後、ＮＫ細胞を、ＣＤ３
、ＮＫ１．１、およびＩＦＮ−γに対するフルオロフォアコンジュゲート抗体を使用したフローサイトメトリーによってアッセイした。ＣＤ３−ＮＫ１．１＋細胞におけるＣＤ１０７ａおよびＩＦＮ−γ染色を解析して、ＮＫ細胞活性化を評価した。ＣＤ１０７ａ／ＩＦＮ−γ二重陽性細胞の増加は、１つの受容体よりもむしろ２つの活性化受容体の会合によるより良好なＮＫ細胞活性化を示す。ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびポジティブコントロール（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅから入手可能な抗マウスＮＫＧ２ＤクローンＭＩ−６およびＣＸ−５から選択）は、アイソタイプコントロールよりもＮＫ細胞がＣＤ１０７ａ＋およびＩＦＮ−γ＋になる百分率が高いことを示していた（図１５および図１６は、それぞれがＮＫ細胞調製のために異なるマウスを使用した２つの独立した実験からのデータを示す）。
実施例５−ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインは、標的腫瘍細胞の細胞傷害を可能とする
ヒトおよびマウスの初代ＮＫ細胞活性化アッセイにより、ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインとのインキュベーション後のＮＫ細胞上の細胞傷害性マーカーの増加が実証された。これを腫瘍細胞溶解の増加と解釈するかどうかを検討するために、各ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインを単一特異性抗体に発達させた細胞ベースのアッセイを利用した。Ｆｃ領域を１つのターゲティングアームとして使用した一方で、Ｆａｂ断片領域（ＮＫＧ２Ｄ結合ドメイン）はＮＫ細胞を活性化するための別のターゲティングアームとして作用した。ヒトを起源で高レベルのＦｃ受容体を発現するＴＨＰ−１細胞を腫瘍標的として使用し、Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ ＤＥＬＦＩＡ細胞傷害性キットを使用した。ＴＨＰ−１細胞をＢＡＴＤＡ試薬で標識し、培養培地に１０５／ｍＬで再懸濁した。次いで、標識したＴＨＰ−１細胞をＮＫＧ２Ｄ抗体および単離したマウスＮＫ細胞とマイクロタイタープレートのウェル中にて３７℃で３時間組み合わせた。インキュベーション後、２０μＬの培養上清を取り出し、２００μＬのユウロピウム溶液と混合し、振盪しながら暗所で１５分間インキュベートした。時間分解蛍光モジュールを備えたＰｈｅｒａＳｔａｒ プレートリーダー（励起３３７ｎＭ、放射６２０ｎＭ）によって蛍光を経時的に測定し、キットの指示にしたがって特異的溶解を計算した。
ポジティブコントロール（ＦｃにコンジュゲートしたＵＬＢＰ−６（ＮＫＧ２Ｄの天然リガンド））は、マウスＮＫ細胞によるＴＨＰ−１標的細胞の特異的溶解を増加させた。ＮＫＧ２Ｄ抗体もＴＨＰ−１標的細胞の特異的溶解を増加させた一方で、アイソタイプコントロール抗体は特異的溶解が低いことを示した。点線は、抗体を添加しないマウスＮＫ細胞によるＴＨＰ−１細胞の特異的溶解を示す（図１７）。
実施例６−ＮＫＧ２Ｄ抗体は高い熱安定性を示す
ＮＫＧ２Ｄ結合ドメインの融解温度を、示差走査蛍光測定法を使用してアッセイした。外挿した見かけ上の融解温度は、典型的なＩｇＧ１抗体と比較して高い（図１８）。
実施例７−ＮＫＧ２ＤとＣＤ１６の架橋によるヒトＮＫ細胞の相乗的活性化
初代ヒトＮＫ細胞活性化アッセイ
末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を、密度勾配遠心分離を使用してヒト末梢血バフィーコートから単離した。ＮＫ細胞を、陰性磁気ビーズ（ｎｅｇａｔｉｖｅ ｍａｇｎｅｔｉｃ ｂｅａｄ）（ＳｔｅｍＣｅｌｌ番号１７９５５）を使用してＰＢＭＣから精製した。フローサイトメトリーによって決定したところ、ＮＫ細胞は、９０％超がＣＤ３−ＣＤ５６＋であった。次いで、細胞を、１００ｎｇ／ｍＬ ｈＩＬ−２（Ｐｅｐｒｏｔｅｃｈ番号２００−０２）を含む培地中で４８時間拡大した後に活性化アッセイで使用した。９６ウェル平底プレート上を滅菌ＰＢＳ１００μＬ中の濃度２μｇ／ｍＬ（抗ＣＤ１６、Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号３０２０１３）および５μｇ／ｍＬ（抗ＮＫＧ２Ｄ、Ｒ＆Ｄ番号ＭＡＢ１３９）の抗体で４℃一晩コーティングし、その後にウェルを十分に洗浄して過剰な抗体を除去した。脱顆粒の評価のために、ＩＬ−２活性化ＮＫ細胞を５×１０５細胞／ｍＬで１０
０ｎｇ／ｍＬヒトＩＬ−２（ｈＩＬ２）および１μｇ／ｍＬ ＡＰＣコンジュゲート抗ＣＤ１０７ａ ｍＡｂ（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号３２８６１９）を補充した培養培地中に再懸濁した。次いで、１×１０５細胞／ウェルを、抗体をコーティングしたプレート上に添加した。タンパク質輸送阻害剤ブレフェルジンＡ（ＢＦＡ、Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号４２０６０１）およびモネンシン（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号４２０７０１）を、それぞれ、最終希釈１：１０００および１：２７０で添加した。プレーティングした細胞を、５％ＣＯ２中にて３７℃で４時間インキュベートした。ＩＦＮ−γの細胞内染色のために、ＮＫ細胞を抗ＣＤ３（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号３００４５２）および抗ＣＤ５６ ｍＡｂ（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号３１８３２８）で標識し、続いて固定し、透過処理し、抗ＩＦＮ−γ
ｍＡｂ（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ番号５０６５０７）で標識した。ＮＫ細胞を、ＣＤ５６＋ＣＤ３−生細胞のゲーティング後にフローサイトメトリーによってＣＤ１０７ａおよびＩＦＮ−γの発現について解析した。
受容体組み合わせの相対効力を調査するために、プレート結合刺激（ｐｌａｔｅ−ｂｏｕｎｄ ｓｔｉｍｕｌａｔｉｏｎ）によるＮＫＧ２ＤまたはＣＤ１６の架橋および両方の受容体の共架橋を行った。図１９（図１９Ａ〜１９Ｃ）に示すように、ＣＤ１６およびＮＫＧ２Ｄの組み合わせ刺激により、ＣＤ１０７ａレベル（脱顆粒）（図１９Ａ）および／またはＩＦＮ−γ産生（図１９Ｂ）が非常に上昇した。点線は、各受容体の個別の刺激の相加効果を示す。
ＩＬ−２活性化ＮＫ細胞のＣＤ１０７ａレベルおよび細胞内ＩＦＮ−γ産生を、抗ＣＤ１６、抗ＮＫＧ２Ｄ、または両方のモノクローナル抗体の組み合わせでの４時間のプレート結合刺激後に解析した。グラフは、平均（ｎ＝２）±Ｓｄを示す。図１９ＡはＣＤ１０７ａレベルを明示しており；図１９ＢはＩＦＮ−γレベルを明示しており；図１９ＣはＣＤ１０７ａおよびＩＦＮ−γのレベルを明示している。図１９Ａ〜１９Ｃに示すデータは、５つの異なる健康なドナーを使用した５つの独立した実験の代表データである。
実施例８−細胞が発現したヒトがん抗原へのＴｒｉＮＫＥＴまたはｍＡｂ結合の評価
ＥＧＦＲを発現するヒトがん細胞株（例えば、Ｈ２１７２、Ｈ７４７、Ｈ１９７５、Ｎ８７、ＨＣＴ１１６、およびＡ５４９細胞株）を使用して、異なるＥＧＦＲを標的にするモノクローナル抗体（ｍＡｂ）由来のＴｒｉＮＫＥＴの腫瘍抗原結合を評価した。試験したＴｒｉＮＫＥＴには、Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−パニツムマブ（クローンＡＤＩ−２７７４９由来のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびＥＧＦＲモノクローナル抗体パニツムマブ由来のＥＧＦＲを標的にするｓｃＦｖ）、Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブ（クローンＡＤＩ−２７７４９由来のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびモノクローナル抗体ネシツムマブ由来のＥＧＦＲを標的にするｓｃＦｖ）、およびＡ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ＡｄｉＣＬＣ３（クローンＡＤＩ−２７７４９由来のＮＫＧ２Ｄ結合ドメインおよびモノクローナル抗体ＡｄｉＣＬＣ２由来のＥＧＦＲを標的にするｓｃＦｖ）が含まれる。
ＴｒｉＮＫＥＴまたはｍＡｂを希釈し、各細胞株とインキュベートした。ＴｒｉＮＫＥＴまたはｍＡｂの結合を、フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトＩｇＧ二次抗体を使用して検出した。細胞をフローサイトメトリーによって解析し、ＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂによる細胞が発現したＥＧＦＲへの結合のメジアン蛍光強度（ＭＦＩ）を最大シグナルに対して正規化して、ＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂの最大シグナル値に対する百分率を得た。
初代ヒトＮＫ細胞の細胞傷害性アッセイ
ＰＢＭＣを、密度勾配遠心分離を使用してヒト末梢血バフィーコートから単離した。単離したＰＢＭＣを洗浄し、ＮＫ細胞単離のために調製した。ＮＫ細胞を、磁気ビーズを用
いたネガティブ選択技術を使用して単離した。達成された単離したＮＫ細胞の純度は、典型的には、９０％超のＣＤ３−ＣＤ５６＋であった。単離したＮＫ細胞を、サイトカインなしで一晩インキュベートし、翌日に細胞傷害性アッセイで使用した。
ＣＤ１６−Ｆ１５８Ｖを発現するように形質導入されたＫＨＹＧ−１細胞を使用して、ＮＫＧ２ＤおよびＣＤ１６の二重刺激の寄与を調査した。ＫＨＹＧ−１ ＣＤ１６−Ｆ１５８Ｖ細胞を、１０ｎｇ／ｍＬ ＩＬ−２を含む１０％ＨＩ−ＦＢＳ−ＲＰＭＩ−１６４０中で維持した。殺滅アッセイにおけるエフェクター細胞としての使用前日に、細胞を培養物から採取し、ＩＬ−２を洗い流した。ＫＨＹＧ−１ ＣＤ１６−Ｆ１５８Ｖ細胞を１０％ＨＩ−ＦＢＳ−ＲＰＭＩ−１６４０に再懸濁し、サイトカインなしで一晩インキュベートした。
ＤＥＬＦＩＡ細胞傷害性アッセイ
目的の標的を発現するヒトがん細胞株を、培養物から採取し、ＨＢＳで洗浄し、ＢＡＴＤＡ試薬（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ，ＡＤ０１１６）での標識のために１０６細胞／ｍＬを成長培地に再懸濁した。標的細胞の標識については、製造者の指示に従った。標識後、細胞をＨＢＳで３回洗浄し、０．５×１０５細胞／ｍＬを培養培地に再懸濁した。バックグラウンドウェルを調製するために、標識された細胞のアリコートを取っておき、細胞を培地からスピン除去した。ペレット化した細胞を乱さないように、１００μＬの培地を３連で慎重にウェルに添加した。１００μＬのＢＡＴＤＡ標識細胞を、９６ウェルプレートの各ウェルに添加した。ウェルを、標的細胞からの自発的放出のために保存しておき、１％Ｔｒｉｔｏｎ−Ｘの添加による標的細胞の溶解のために調製した。目的の腫瘍標的に対するモノクローナル抗体またはＴｒｉＮＫＥＴを培養培地で希釈し、５０μＬの希釈されたｍＡｂまたはＴｒｉＮＫＥＴを各ウェルに添加した。休止ＮＫ細胞を培養物から採取し、洗浄し、所望のエフェクター対標的細胞比に応じて１．０×１０５〜２．０×１０６細胞／ｍＬを培養培地に再懸濁した。５０μＬのＮＫ細胞をプレートの各ウェルに添加して、総培養液量を２００μＬにした。プレートを５％ＣＯ２にて３７℃で２〜４時間インキュベートした後、アッセイを行った。
２〜４時間の培養後、恒温器からプレートを取り出し、細胞を２００×ｇで５分間の遠心分離によってペレット化した。２０μＬの培養上清を、製造者から提供された清潔なマイクロプレートに移し、２００μＬの室温のユウロピウム溶液を各ウェルに添加した。プレートを遮光し、プレート振盪機にて２５０ｒｐｍで１５分間インキュベートした。プレートを、ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ（登録商標）ｉ３Ｘ装置（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ）を使用して読み取り、特異的溶解パーセントを計算した（特異的溶解％＝（実験による放出−自発的放出）／（最大放出−自発的放出））×１００）。
細胞抗原結合
図３５は、ＮＣＩ−Ｈ２１７２ヒト肺がん細胞上に発現したＥＧＦＲへのＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂの結合を示す。図３６は、ＨＣＣ８２７ヒト肺がん細胞上に発現したＥＧＦＲへのＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂの結合を示す。図３７は、ＮＣＩ−Ｈ７４７ヒト結腸がん細胞上に発現したＥＧＦＲへのＴｒｉＮＫＥＴおよびｍＡｂの結合を示す。細胞を、図３５〜３７のグラフ中に示した濃度のＴｒｉＮＫＥＴまたはモノクローナル抗体で処置した。
初代ヒトＮＫ細胞傷害性アッセイ
図３８〜４６は、種々の細胞型に対する休止したヒトＮＫ細胞またはＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞のＴｒｉＮＫＥＴ媒介性の細胞傷害性を示す。ＴｒｉＮＫＥＴは、その親ｍＡｂよりも効率的に標的細胞を死滅させた。
細胞を、各グラフ中に示した濃度のＴｒｉＮＫＥＴまたはモノクローナル抗体で処置した。各実験におけるエフェクター対標的比は１０：１であった。図３８は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ｎｅｃｉＬＨ）殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。
図３９は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ｐａｎＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（パニツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４０は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ７４７細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−パニツムマブＬＨ（ｐａｎＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（パニツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４１は、休止ヒトＮＫ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ７４７細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４２は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ２１７２細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ Ｔ７９０Ｍ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４３は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｈ１９７５細胞（肺、ＥＧＦＲ Ｌ８５８Ｒ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４４は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＮＣＩ−Ｎ８７細胞（胃）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４５は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＨＣＴ１１６細胞（結腸、ＫＲＡＳ Ｇ１３Ｄ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。図４６は、ＫＨＹＧ１−ＣＤ１６Ｖ細胞を用いたＡ５４９細胞（肺、ＫＲＡＳ Ｇ１２Ｓ）のＴｒｉＮＫＥＴ−媒介性の（Ａ４９−Ｆ３’−ＴｒｉＮＫＥＴ−ＥＧＦＲ−ネシツムマブＬＨ（ｎｅｃｉＬＨ））殺滅およびモノクローナル抗体−媒介性の（ネシツムマブ）殺滅を示す（ＤＥＬＦＩＡアッセイ）。
全ての実験において、ＴｒｉＮＫＥＴはその親ｍＡｂよりも有効に標的細胞を死滅させた。これらの結果は、開示のＴｒｉＮＫＥＴが同一の抗原を標的にするｍＡｂと比較して、標的化細胞死の促進において有効性が改善されていることを証明している。
参照による援用
本明細書中で言及される特許文書および科学論文のそれぞれの開示全体は、あらゆる目的のために本明細書中で参考として援用される。
均等物
本発明を、その意図または本質的な特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化することができる。したがって、前記の実施形態は、あらゆる点において本明細書中に記載の発明の限定ではなく例示と見なされるべきである。したがって、本発明の範囲は、前記の説明によるのではなく添付の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と同等の意味および範囲内にある全ての変更形態が本発明に包含されることが意図される。
本発明を、その意図または本質的な特徴から逸脱することなく、他の特定の形態で具体化することができる。したがって、前記の実施形態は、あらゆる点において本明細書中に記載の発明の限定ではなく例示と見なされるべきである。したがって、本発明の範囲は、前記の説明によるのではなく添付の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と同等の意味および範囲内にある全ての変更形態が本発明に包含されることが意図される。
本発明は、以下の態様を提供しうる。
[１]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[２]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＥＧＦＲに結合する第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[３]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＨＬＡ−Ｅに結合する第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[４]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＣＣＲ４に結合する第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[５]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＰＤ−Ｌ１に結合する第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[６]
前記第１の抗原結合部位がヒトＮＫＧ２Ｄに結合する、上記[１]〜[５]のいずれかに記載のタンパク質。
[７]
前記第１の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[５]または上記[６]のいずれかに記載のタンパク質。
[８]
前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが同一のポリペプチド上に存在する、上記[７]に記載のタンパク質。
[９]
前記第２の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、上記[７]または[８]に記載のタンパク質。
[１０]
前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが、同一のポリペプチド上に存在する、上記[９]に記載のタンパク質。
[１１]
前記第１の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する、上記[９]または[１０]に記載のタンパク質。
[１２]
タンパク質であって、
（ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合するＦａｂ断片を含む第１の抗原結合部位；
（ｂ）ＥＧＦＲに結合する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を含む第２の抗原結合部位；および
（ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
を含む、タンパク質。
[１３]
前記ｓｃＦｖが、Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介して前記抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する前記第３の抗原結合部位に連結しており、ここで、前記ｓｃＦｖが重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、上記[１２]に記載のタンパク質。
[１４]
前記ｓｃＦｖが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、上記[１３]に記載のタンパク質。
[１５]
前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインとジスルフィド架橋を形成している、上記[１３]または[１４]に記載のタンパク質。
[１６]
前記ジスルフィド架橋が、前記重鎖可変ドメイン由来のＣ４４と前記軽鎖可変ドメイン由来のＣ１００との間に形成されている、上記[１５]に記載のタンパク質。
[１７]
前記ｓｃＦｖが前記抗体Ｆｃドメインに連結しており、ここで、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されており、可動性リンカー（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ） ４ （（Ｇ４Ｓ） ４ ）を介して前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインに連結しており、前記Ｆａｂが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、上記[１６]に記載のタンパク質。
[１８]
前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、可動性リンカーを介して前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインに連結している、上記[１３]〜[１７]のいずれかに記載のタンパク質。
[１９]
前記可動性リンカーが（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ） ４ （（Ｇ４Ｓ） ４ ）を含む、上記[１８]に記載のタンパク質。
[２０]
前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインのＮ末端またはＣ末端に配置されている、上記[１３]〜[１９]のいずれかに記載のタンパク質。
[２１]
前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されている、上記[２０]に記載のタンパク質。
[２２]
前記Ｆａｂ断片が、前記抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する前記第３の抗原結合部位に連結している、上記[１２]〜[２１]のいずれかに記載のタンパク質。
[２３]
前記Ｆａｂ断片の重鎖部分が重鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、前記重鎖可変ドメインが前記ＣＨ１ドメインに連結している、上記[２２]に記載のタンパク質。
[２４]
前記Ｆａｂが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、上記[２２]または[２３]に記載のタンパク質。
[２５]
配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択される配列を含む、上記[１２]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[２６]
抗体Ｆｃドメインに連結されたｓｃＦｖを含み、ここで、前記抗体Ｆｃドメインに連結した前記ｓｃＦｖが、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択される配列で示されている、上記[１３]〜[２５]のいずれかに記載のタンパク質。
[２７]
配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択される配列を含む、上記[１３]〜[２５]のいずれかに記載のタンパク質。
[２８]
配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[２９]
配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[３０]
配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[３１]
配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２６]のいずれかに記載のタンパク質。
[３２]
配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２９]のいずれかに記載のタンパク質。
[３３]
配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む、上記[１３]〜[２９]のいずれかに記載のタンパク質。
[３４]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号１、配列番号４１、配列番号４９、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６９、配列番号７７、配列番号８５、および配列番号９３から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[３５]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号４１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号４２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[３６]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号４９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号５０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[３７]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号５７と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号５８と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[３８]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号５９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号６０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[３９]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号６１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号６２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４０]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号６９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号７０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４１]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号７７と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号７８と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４２]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号８５と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号８６と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４３]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号９３と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号９４と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４４]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号１０１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号１０２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４５]
前記第１の抗原結合部位が、配列番号１０３と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号１０４と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[３２]のいずれかに記載のタンパク質。
[４６]
前記第１の抗原結合部位が単一ドメイン抗体を含む、上記[１]〜[６]のいずれかに記載のタンパク質。
[４７]
前記単一ドメイン抗体が、Ｖ Ｈ Ｈ断片またはＶ ＮＡＲ 断片を含む、上記[４６]に記載のタンパク質。
[４８]
前記第２の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、上記[１]〜[６]、[４６]、または[４７]のいずれかに記載のタンパク質。
[４９]
前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが、同一のポリペプチド上に存在する、上記[４７]に記載のタンパク質。
[５０]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５１]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５２]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５６と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５３]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５４]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６０と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５５]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５６]
前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[２４]のいずれかに記載のタンパク質。
[５７]
前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１７１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[５８]
前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１７５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１７９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[５９]
前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１８３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１８７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[６０]
前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１９２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１９６と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[６１]
前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号２００と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号２０４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[６２]
前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号２０８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号２１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[１]〜[１１]および上記[３３]〜[４８]のいずれかに記載のタンパク質。
[６３]
前記第２の抗原結合部位が単一ドメイン抗体を含む、上記[１]〜[１１]のいずれかに記載のタンパク質。
[６４]
前記第２の抗原結合部位の前記単一ドメイン抗体が、Ｖ Ｈ Ｈ断片またはＶ ＮＡＲ 断片を含む、上記[６２]に記載のタンパク質。
[６５]
前記抗体Ｆｃドメインが、ヒンジおよびＣＨ２ドメインを含む、上記[１]〜[６３]のいずれかに記載のタンパク質。
[６６]
前記抗体Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１抗体のヒンジおよびＣＨ２ドメインを含む、上記[６４]に記載のタンパク質。
[６７]
前記Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１抗体のアミノ酸２３４〜３３２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、上記[６５]または[６６]に記載のタンパク質。
[６８]
前記Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインと、少なくとも９０％同一であり、かつＱ３４７、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｓ３５４、Ｅ３５６、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｔ３６６、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９４、Ｄ３９９、Ｓ４００、Ｄ４０１、Ｆ４０５、Ｙ４０７、Ｋ４０９、Ｔ４１１、およびＫ４３９からなる群から選択される１またはそれを超える位置で異なるアミノ酸配列を含む、上記[６７]に記載のタンパク質。
[６９]
前記タンパク質が、１０ｎＭのＫ Ｄ またはそれより弱い親和性でＮＫＧ２Ｄに結合する、上記[１]〜[６７]のいずれかに記載のタンパク質。
[７０]
前記項のいずれかに記載のタンパク質および薬学的に許容され得る担体を含む製剤。
[７１]
上記[１]〜[６８]のいずれかに記載のタンパク質を発現する１またはそれを超える核酸を含む細胞。
[７２]
腫瘍細胞死を増強する方法であって、腫瘍細胞およびナチュラルキラー細胞を、有効量の上記[１]〜[６９]のいずれかに記載のタンパク質に曝露することを含み、ここで、前記腫瘍細胞が、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１のうちの少なくとも１つを発現する、方法。
[７３]
がんを処置する方法であって、有効量の上記[１]〜[６９]のいずれかに記載のタンパク質または上記[７０]に記載の製剤を患者に投与することを含む、方法。
[７４]
前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、ここで、前記がんが、頭頸部がん、結腸直腸がん、非小細胞肺がん、神経膠腫、腎細胞癌、膀胱がん、子宮頸がん、卵巣がん、膵臓がん、および肝臓がんからなる群から選択される、上記[７３]に記載の方法。
[７５]
前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＨＬＡ−Ｅに結合し、ここで、前記がんが、リンパ腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、および肉腫からなる群から選択される、上記[７３]に記載の方法。
[７６]
前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、ここで、前記がんが、リンパ腫、白血病、多発性骨髄腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、肉腫、および胃がんからなる群から選択される、上記[７３]に記載の方法。
[７７]
前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、ここで、前記がんが、成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病、末梢Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞悪性疾患、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、胸腺腫、胃がん、および腎細胞癌からなる群から選択される、上記[７３]に記載の方法。

Claims (77)

  1. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１に結合する第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  2. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＥＧＦＲに結合する第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  3. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＨＬＡ−Ｅに結合する第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  4. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＣＣＲ４に結合する第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  5. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合する第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＰＤ−Ｌ１に結合する第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  6. 前記第１の抗原結合部位がヒトＮＫＧ２Ｄに結合する、請求項１〜５のいずれか１項に記載のタンパク質。
  7. 前記第１の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜５または請求項６のいずれか１項に記載のタンパク質。
  8. 前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが同一のポリペプチド上に存在する、請求項７に記載のタンパク質。
  9. 前記第２の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項７または８に記載のタンパク質。
  10. 前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが、同一のポリペプチド上に存在する、請求項９に記載のタンパク質。
  11. 前記第１の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する、請求項９または１０に記載のタンパク質。
  12. タンパク質であって、
    （ａ）ＮＫＧ２Ｄに結合するＦａｂ断片を含む第１の抗原結合部位；
    （ｂ）ＥＧＦＲに結合する単鎖可変断片（ｓｃＦｖ）を含む第２の抗原結合部位；および
    （ｃ）抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部またはＣＤ１６に結合する第３の抗原結合部位
    を含む、タンパク質。
  13. 前記ｓｃＦｖが、Ａｌａ−Ｓｅｒを含むヒンジを介して前記抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する前記第３の抗原結合部位に連結しており、ここで、前記ｓｃＦｖが重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項１２に記載のタンパク質。
  14. 前記ｓｃＦｖが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、請求項１３に記載のタンパク質。
  15. 前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインとジスルフィド架橋を形成している、請求項１３または１４に記載のタンパク質。
  16. 前記ジスルフィド架橋が、前記重鎖可変ドメイン由来のＣ４４と前記軽鎖可変ドメイン由来のＣ１００との間に形成されている、請求項１５に記載のタンパク質。
  17. 前記ｓｃＦｖが前記抗体Ｆｃドメインに連結しており、ここで、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されており、可動性リンカー（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）４（（Ｇ４Ｓ）４）を介して前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインに連結しており、前記Ｆａｂが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、請求項１６に記載のタンパク質。
  18. 前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、可動性リンカーを介して前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインに連結している、請求項１３〜１７のいずれか１項に記載のタンパク質。
  19. 前記可動性リンカーが（ＧｌｙＧｌｙＧｌｙＧｌｙＳｅｒ）４（（Ｇ４Ｓ）４）を含む、請求項１８に記載のタンパク質。
  20. 前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインのＮ末端またはＣ末端に配置されている、請求項１３〜１９のいずれか１項に記載のタンパク質。
  21. 前記ｓｃＦｖの前記軽鎖可変ドメインが、前記ｓｃＦｖの前記重鎖可変ドメインのＮ末端に配置されている、請求項２０に記載のタンパク質。
  22. 前記Ｆａｂ断片が、前記抗体ＦｃドメインもしくはＣＤ１６に結合するのに十分なその一部、またはＣＤ１６に結合する前記第３の抗原結合部位に連結している、請求項１２〜２１のいずれか１項に記載のタンパク質。
  23. 前記Ｆａｂ断片の重鎖部分が重鎖可変ドメインおよびＣＨ１ドメインを含み、前記重鎖可変ドメインが前記ＣＨ１ドメインに連結している、請求項２２に記載のタンパク質。
  24. 前記Ｆａｂが前記抗体Ｆｃドメインに連結している、請求項２２または２３に記載のタンパク質。
  25. 配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択される配列を含む、請求項１２〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  26. 抗体Ｆｃドメインに連結されたｓｃＦｖを含み、ここで、前記抗体Ｆｃドメインに連結した前記ｓｃＦｖが、配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択される配列で示されている、請求項１３〜２５のいずれか１項に記載のタンパク質。
  27. 配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択される配列を含む、請求項１３〜２５のいずれか１項に記載のタンパク質。
  28. 配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む、請求項１３〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  29. 配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む、請求項１３〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  30. 配列番号２６４、配列番号（ＳＥＱ ＩＳ ＮＯ：）２６５、および配列番号２６６から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む、請求項１３〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  31. 配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の配列を含む、請求項１３〜２６のいずれか１項に記載のタンパク質。
  32. 配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９５％同一の配列を含む、請求項１３〜２９のいずれか１項に記載のタンパク質。
  33. 配列番号２６７、配列番号２６８、および配列番号２６９から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９９％同一の配列を含む、請求項１３〜２９のいずれか１項に記載のタンパク質。
  34. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号１、配列番号４１、配列番号４９、配列番号５７、配列番号５９、配列番号６１、配列番号６９、配列番号７７、配列番号８５、および配列番号９３から選択されるアミノ酸配列と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  35. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号４１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号４２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  36. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号４９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインお
    よび配列番号５０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  37. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号５７と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号５８と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  38. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号５９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号６０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  39. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号６１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号６２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  40. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号６９と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号７０と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  41. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号７７と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号７８と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  42. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号８５と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号８６と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  43. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号９３と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号９４と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  44. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号１０１と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号１０２と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  45. 前記第１の抗原結合部位が、配列番号１０３と少なくとも９０％同一の重鎖可変ドメインおよび配列番号１０４と少なくとも９０％同一の軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜３２のいずれか１項に記載のタンパク質。
  46. 前記第１の抗原結合部位が単一ドメイン抗体を含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載のタンパク質。
  47. 前記単一ドメイン抗体が、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片を含む、請求項４６に記載のタンパク質。
  48. 前記第２の抗原結合部位が、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項１〜６、４６、または４７のいずれか１項に記載のタンパク質。
  49. 前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインが、同一のポリペプチド上に存在する、請求項４７に記載のタンパク質。
  50. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  51. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  52. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５６と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  53. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１５８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  54. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１５９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６０と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  55. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  56. 前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１６４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜２４のいずれか１項に記載のタンパク質。
  57. 前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１６７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１７１と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  58. 前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１７５と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１７９と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  59. 前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１８３と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の
    抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１８７と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  60. 前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号１９２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号１９６と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  61. 前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号２００と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号２０４と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  62. 前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、前記第２の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインが、配列番号２０８と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含み、前記第２の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインが、配列番号２１２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項１〜１１および請求項３３〜４８のいずれか１項に記載のタンパク質。
  63. 前記第２の抗原結合部位が単一ドメイン抗体を含む、請求項１〜１１のいずれか１項に記載のタンパク質。
  64. 前記第２の抗原結合部位の前記単一ドメイン抗体が、ＶＨＨ断片またはＶＮＡＲ断片を含む、請求項６２に記載のタンパク質。
  65. 前記抗体Ｆｃドメインが、ヒンジおよびＣＨ２ドメインを含む、請求項１〜６３のいずれか１項に記載のタンパク質。
  66. 前記抗体Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１抗体のヒンジおよびＣＨ２ドメインを含む、請求項６４に記載のタンパク質。
  67. 前記Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１抗体のアミノ酸２３４〜３３２と少なくとも９０％同一のアミノ酸配列を含む、請求項６５または６６に記載のタンパク質。
  68. 前記Ｆｃドメインが、ヒトＩｇＧ１のＦｃドメインと、少なくとも９０％同一であり、かつＱ３４７、Ｙ３４９、Ｌ３５１、Ｓ３５４、Ｅ３５６、Ｅ３５７、Ｋ３６０、Ｑ３６２、Ｓ３６４、Ｔ３６６、Ｌ３６８、Ｋ３７０、Ｎ３９０、Ｋ３９２、Ｔ３９４、Ｄ３９９、Ｓ４００、Ｄ４０１、Ｆ４０５、Ｙ４０７、Ｋ４０９、Ｔ４１１、およびＫ４３９からなる群から選択される１またはそれを超える位置で異なるアミノ酸配列を含む、請求項６７に記載のタンパク質。
  69. 前記タンパク質が、１０ｎＭのＫＤまたはそれより弱い親和性でＮＫＧ２Ｄに結合する、請求項１〜６７のいずれか１項に記載のタンパク質。
  70. 前記請求項のいずれか１項に記載のタンパク質および薬学的に許容され得る担体を含む製剤。
  71. 請求項１〜６８のいずれか１項に記載のタンパク質を発現する１またはそれを超える核酸を含む細胞。
  72. 腫瘍細胞死を増強する方法であって、腫瘍細胞およびナチュラルキラー細胞を、有効量の請求項１〜６９のいずれか１項に記載のタンパク質に曝露することを含み、ここで、前記腫瘍細胞が、ＥＧＦＲ、ＨＬＡ−Ｅ、ＣＣＲ４、またはＰＤ−Ｌ１のうちの少なくとも１つを発現する、方法。
  73. がんを処置する方法であって、有効量の請求項１〜６９のいずれか１項に記載のタンパク質または請求項７０に記載の製剤を患者に投与することを含む、方法。
  74. 前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＥＧＦＲに結合し、ここで、前記がんが、頭頸部がん、結腸直腸がん、非小細胞肺がん、神経膠腫、腎細胞癌、膀胱がん、子宮頸がん、卵巣がん、膵臓がん、および肝臓がんからなる群から選択される、請求項７３に記載の方法。
  75. 前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＨＬＡ−Ｅに結合し、ここで、前記がんが、リンパ腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、および肉腫からなる群から選択される、請求項７３に記載の方法。
  76. 前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＰＤ−Ｌ１に結合し、ここで、前記がんが、リンパ腫、白血病、多発性骨髄腫、頭頸部がん、膀胱がん、子宮頸がん、肺がん、腎がん、黒色腫、結腸直腸がん、卵巣がん、膠芽細胞腫、肉腫、および胃がんからなる群から選択される、請求項７３に記載の方法。
  77. 前記タンパク質の前記第２の抗原結合部位がＣＣＲ４に結合し、ここで、前記がんが、成人Ｔ細胞リンパ腫／白血病、末梢Ｔ細胞リンパ腫、皮膚Ｔ細胞リンパ腫、慢性リンパ球性白血病、Ｂ細胞悪性疾患、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、成熟Ｔ／ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞新生物、胸腺腫、胃がん、および腎細胞癌からなる群から選択される、請求項７３に記載の方法。
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