JP2020536524A5 - - Google Patents

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Claims (14)

  1. クリックライゲーション反応で第一の分子を第二の分子に結合するための方法において、第一の分子が、アルキン基である第一のクリック官能基を含み、かつ第二の分子が、アジド基である第二のクリック官能基を含み、前記方法が、触媒の存在下で反応混合物中で第一の分子と第二の分子との接触を含む方法であって、クリック反応が反応混合物中で追加のMg 2+ 金属カチオンの存在下で実施されることを特徴とする、前記方法。
  2. 前記金属カチオンが、1〜200mmol/l、好ましくは5〜25mmol/l、及び最も好ましくは10〜20mmol/lの量でクリック反応混合物中に含まれる、請求項に記載の方法。
  3. 前記クリック反応混合物が、有機溶媒、好ましくはDMSO、及び/又は好ましくはトリス(3−ヒドロキシプロピルトリアゾリルメチル)アミン(THPTA)、2−(4−((ビス((1−(tert−ブチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−4−イル)メチル)アミノ)メチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−1−イル)酢酸(BTTAA)、トリス((1−ベンジル−4−トリアゾリル)メチル)アミン(TBTA)、2−(4−((ビス((1−(tert−ブチル)−1H−1,2,3,−トリアゾール−4−イル)メチル)アミノ)メチル)−1H−1,2,3−トリアゾリル−1−イル)エチルスルフェート(BTTES)又はそれらの類似体、特に他の三座型のポリトリアゾールの少なくとも1つから選択される、Cu安定化リガンドを含む、請求項1又は2に記載の方法。
  4. 前記有機溶媒が、2〜10%(v/v)、好ましくは4〜6%(v/v)の量でクリック反応混合物中に含まれ、及び/又はCu(I)−安定化リガンドが、10〜4000μmol/l、好ましくは500〜1000μmol/lの量でクリック反応混合物中に含まれる、請求項に記載の方法。
  5. 前記触媒が、Cu触媒、好ましくは不均一Cu触媒である、請求項1からまでのいずれか1項に記載の方法。
  6. 前記第一の分子及び前記第二の分子の少なくとも1つが、生体分子、好ましくはヌクレオシド、ヌクレオチド、核酸、アミノ酸、ペプチド、糖及び脂質から選択される生体分子であり、かつ特に好ましくは第一の分子と第二の分子の双方がオリゴヌクレオチドである、請求項1からまでのいずれか1項に記載の方法。
  7. 前記第一の分子及び前記第二の分子の少なくとも1つが、検出可能な標識を有する、請求項1からまでのいずれか1項に記載の方法。
  8. クリックライゲーション反応において使用するためのアクチベーター組成物であって、アルキン基である第一のクリック官能基を含む第一の分子とアジド基である第二のクリック官能基を含む第二の分子とが、触媒、好ましくは不均一Cu触媒の存在下で結合され、アクチベーター混合物が、追加のMg 2+ 金属カチオン及びさらに有機溶媒及び/又はCu安定化リガンドを含む、前記アクチベーター組成物。
  9. 記Cu安定化リガンドが、トリス(3−ヒドロキシプロピルトリアゾリルメチル)アミン(THPTA)、2−(4−((ビス((1−(tert−ブチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−4−イル)メチル)アミノ)メチル)−1H−1,2,3−トリアゾール−1−イル)酢酸(BTTAA)、トリス((1−ベンジル−4−トリアゾリル)メチル)アミン(TBTA)、2−(4−((ビス((1−(tert−ブチル)−1H−1,2,3,−トリアゾール−4−イル)メチル)アミノ)メチル)−1H−1,2,3−トリアゾリル−1−イル)エチルスルフェート(BTTES)又はそれらの類似体、特に他の三座型のポリトリアゾールの少なくとも1つから選択され、及び/又は有機溶媒が、DMSOである、請求項に記載のアクチベーター組成物。
  10. 前記Mg 2+ 金属カチオンを1〜200mmol/l、好ましくは5〜25mmol/lの量で、及び/又は前記有機溶媒を2〜10%(v/v)、好ましくは4〜6%(v/v)の量で、及び/又は前記Cu安定化リガンドを10〜4000μmol/l、好ましくは500〜1000μmol/lの量で含む、請求項8又は9に記載のアクチベーター組成物。
  11. 第一の成分として不均一Cu触媒を、及び第二の成分として請求項から10までのいずれか1項に記載のアクチベーター組成物を含む、クリックライゲーション試薬キット。
  12. アルキン基である第一のクリック官能基を含む第一の分子、アジド基である第二のクリック官能基を含む第二の分子、緩衝液、溶媒、酵素、修飾及び/又は非修飾ヌクレオチド、5’末端に二本鎖ループを任意に含む(インデックス)プライマー及び/又はアダプター、並びに任意にクロマトグラフィー材料からなる群から好ましくは選択されるクリック反応の1種以上のさらなる成分を含む、請求項11に記載のクリックライゲーション試薬キット。
  13. 第一の分子を第二の分子に結合するためのクリックライゲーション反応のための不均一Cu触媒を含む少なくとも1つの反応チャンバーを有する装置であって、第一の分子がアルキン基である第一のクリック官能基、第二の分子がアジド基である第二のクリック官能基、及び任意にさらに固体キャリア材料を含み、少なくとも装置の1つの反応チャンバーにおいて金属カチオン又は請求項から10までのいずれか1項記載のアクチベーター組成物が存在する、前記装置。
  14. RNA又はDNA増幅、RNA又はDNA標識方法及びRNA又はDNAシーケンシング方法から選択される後続反応を任意にさらに含む、クリック反応産物を提供するための、請求項1からまでのいずれか1項に記載の方法、請求項から10までのいずれか1項に記載のアクチベーター組成物、請求項11又は12に記載のクリックライゲーション試薬キット、又は請求項13に記載の装置の使用。
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Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021130151A1 (en) 2019-12-23 2021-07-01 Baseclick Gmbh Method of amplifying mrnas and for preparing full length mrna libraries
EP3842532A1 (en) 2019-12-23 2021-06-30 baseclick GmbH Method of amplifying mrnas and for preparing full length mrna libraries
AU2021238777A1 (en) 2020-03-19 2022-10-20 Baseclick Gmbh Modified mRNAs for vaccine development
EP4046651A1 (en) 2021-02-23 2022-08-24 baseclick GmbH Method for producing an mrna tumor vaccine
WO2023194331A1 (en) 2022-04-04 2023-10-12 Ecole Polytechnique Federale De Lausanne (Epfl) CONSTRUCTION OF SEQUENCING LIBRARIES FROM A RIBONUCLEIC ACID (RNA) USING TAILING AND LIGATION OF cDNA (TLC)

Family Cites Families (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ZA973642B (en) * 1996-04-26 1997-11-25 Merck & Co Inc DNA vaccine formulations.
KR101048279B1 (ko) * 2002-05-30 2011-07-13 더 스크립스 리서치 인스티튜트 구리 촉매 작용하에서의 아지드와 아세틸렌과의 리게이션
US8114636B2 (en) * 2006-02-10 2012-02-14 Life Technologies Corporation Labeling and detection of nucleic acids
GB0706243D0 (en) * 2007-03-30 2007-05-09 Univ Southampton Modified nucleic acids
EP2239053A1 (en) * 2009-04-09 2010-10-13 baseclick GmbH Click chemistry on heterogeneous catalysts
US8680260B2 (en) * 2009-05-15 2014-03-25 Riken 18F-labeled azide compound, reagent for 18F-labeling and method for 18F-labeling of alkyne compound using same
US20110210017A1 (en) * 2010-03-01 2011-09-01 Lai Rebecca Y Fabrication of electrochemical biosensors via click chemistry
US20130046083A1 (en) * 2011-08-16 2013-02-21 Tom Brown Oligonucleotide ligation
WO2014016202A1 (en) * 2012-07-22 2014-01-30 Universität Basel Methods for catalytic alkylation of nucleic acids
EP2940150A1 (en) * 2014-04-29 2015-11-04 Baseclick GmbH Self-assembly of DNA Origami: a new diganostic tool
WO2016196492A1 (en) * 2015-06-01 2016-12-08 Occidental College Methods, compositions, and kits using heterogeneous catalysts
US10155797B2 (en) * 2015-09-11 2018-12-18 The Governors Of The University Of Alberta Binding-induced DNA nanomachines

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