JP2020524519A5

JP2020524519A5 -

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Publication number: JP2020524519A5
Application number: JP2019571052A
Authority: JP
Filing date: 2018-06-20
Publication date: 2021-07-29

Claims

移植対象からの試料を評価する方法であって、
（ａ）対象からの試料中の全ｃｆ−ＤＮＡの量を決定すること、ここで、対象は、移植合併症を有するか、これを有することが疑われるか、これを既に有しているか、またはこれを有するリスクがある；ならびに
（ｂ）全ｃｆ−ＤＮＡの量を報告および／または記録すること
を含む、前記方法。
（ｃ）全ｃｆ−ＤＮＡの量を、全ｃｆ−ＤＮＡの閾値または少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡ量と比較すること、および／または、
（ｄ）全ｃｆ−ＤＮＡの閾値および／または少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡ量と比較して決定した全ｃｆ−ＤＮＡの量に基づいて、対象が、移植合併症を有すること、または移植合併症のリスクが増大しているものと決定すること、
をさらに含む、請求項１に記載の方法。
移植対象を評価する方法であって、
（ａ）対象からの試料中の全ｃｆ−ＤＮＡの量を得ること、ここで、対象は、移植合併症を有するか、これを有することが疑われるか、これを既に有しているか、またはこれを有するリスクがある；
（ｂ）全ｃｆ−ＤＮＡの量を、全ｃｆ−ＤＮＡの閾値および／または少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡ量と比較すること；ならびに
（ｃ）全ｃｆ−ＤＮＡの閾値および／または少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡ量と比較して決定された全ｃｆ−ＤＮＡの量に基づいて、対象のための処置またはモニタリングレジメンを決定すること、
任意に、全ｃｆ−ＤＮＡの閾値および／または少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡ量と比較して決定された全ｃｆ−ＤＮＡの量に基づいて、対象を、移植合併症を有するものとして、または移植合併症を有するリスクが増大しているものとして、分類することをさらに含む、前記方法。
対象が、
（ｉ）機械的サポートを受けているかまたはこれを必要としている、
（ｉｉ）移植合併症を有すると決定されている、および／または、
（ｉｉｉ）前に対象に適用された１つ以上のさらなる検査により、移植合併症を有すると決定されたか、または対象に対する１つ以上のさらなる検査を行うことをさらに含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
（ｉ）ドナー特異的ｃｆ−ＤＮＡの量を決定または比較することなく、評価または決定が行われる、および／または、
（ｉｉ）移植合併症が、心停止、感染または死亡である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
（ｉ）全ｃｆ−ＤＮＡ量が、レポートにおいて提供され、任意に、また対象からの試料中のものであった少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡの量も含むレポートにおいて、量が提供される、および／または、
（ｉｉ）全ｃｆ−ＤＮＡ量が、データベースにおいて記録され、任意に、データベースがまた、対象からの試料中のものであった少なくとも１つの前の全ｃｆ−ＤＮＡの量を含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
全ｃｆ−ＤＮＡの量が、
（ａ）複数の単一ヌクレオチドバリアント（ＳＮＶ）標的について、試料またはその一部に対して、少なくとも２組のプライマーペアにより、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）定量アッセイなどの増幅ベースの定量アッセイを行うこと、ここで、各々のプライマーペアは、フォワードプライマーおよびリバースプライマーを含み、ここで、少なくとも２組のプライマーペアのうちの一方は、プライマー中に、ＳＮＶ標的の一方のアレルと比較して３’の最後から２番目にミスマッチを含むが、該ＳＮＶ標的の別のアレルと比較して３’の二重のミスマッチは含まず、該ＳＮＶ標的の一方のアレルを特異的に増幅し、少なくとも２組のプライマーペアの他方は、該ＳＮＶ標的の他方のアレルを特異的に増幅する、ならびに
（ｂ）結果に基づいて全ｃｆ−ＤＮＡの量を評価すること、
任意に、ドナーの遺伝子型が既知である、または、ドナーの遺伝子型が不明である、
により決定されるかまたは得られる、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
全ｃｆ−ＤＮＡの量は、
（ｉ）増幅ベースの定量アッセイを用いて決定するかまたは得られ、任意に、増幅ベースの定量アッセイが、定量リアルタイムＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）である、または、
（ｉｉ）配列決定、例えばハイスループットな配列決定または次世代配列決定を用いて決定するかまたは得ることができる、
請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
（ｉ）８または９ｎｇ／ｍＬまたはそれより多い量が、心停止または死亡のリスクを表す、および／または、
（ｉｉ）２０ｎｇ／ｍＬまたはそれより多い量が、感染または増大した感染のリスクの存在を表す、および／または、
（ｉｉｉ）少なくとも１つの量が、臓器移植の後４、５、６、７または８日以内に対象から採取された試料において決定される、および／または、
（ｉｖ）閾値よりも高いか、および／またはより早い時点からの量と比較して増大した全ｃｆ−ＤＮＡの量が、増大したリスク、または増大中のリスクを表す、および／または、
（ｖ）閾値よりも低いか、および／またはより早い時点からの量と比較して低下した全ｃｆ−ＤＮＡの量が、低下したリスク、または低下中のリスクを表す、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
モニタリングレジメンを決定することは、対象において全ｃｆ−ＤＮＡの量を経時的にもしくはその後の時点において決定すること、または対象にかかるモニタリングを示唆することを含み、任意に、対象を、１ヵ月ごと、または２ヵ月ごとに評価する、請求項３〜９のいずれか一項に記載の方法。
（ｉ）対象を、６ヵ月まで、８ヵ月まで、１０ヵ月まで、または１年までにわたり評価する、および／または、
（ｉｉ）閾値、またはより早い時点からの量と比較して全ｃｆ−ＤＮＡの量が増大する場合、試料採取の間の時間が短縮される、
請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
全ｃｆ−ＤＮＡのさらなる量を、記録または報告する、任意に、さらなる量が、レポートにおいて報告される、または、さらなる量が、データベースにおいて記録される、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
（ｉ）モニタリングレジメンを決定することが、対象を評価するために、１つ以上のさらなる検査を使用すること、またはこれの使用を示唆することを含む、および／または、
（ｉｉ）処置レジメンを決定することが、対象のための処置を選択または示唆することを含む、および／または、
（ｉｉｉ）処置レジメンを決定することが、対象を処置することを含む、および／または、
（ｉｖ）処置が、本明細書において提供される処置のいずれか１つを含む、および／または、
（ｖ）処置レジメンを決定することが、処置についての情報を対象に提供することを含む、
（ｖｉ）処置が、抗感染処置である、抗拒絶処置である、または、心停止処置である、請求項３〜１２のいずれか一項に記載の方法。
試料が、血液、血漿または血清試料である、任意に、血液試料が、血漿試料である、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
移植対象が、心臓移植対象である、請求項１〜１４のいずれか一項に記載の方法。