JP2020515282A - 多標的キメラ抗原受容体 - Google Patents

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Abstract

本発明において、多標的キメラ抗原受容体を開示する。本発明において、主ペプチド鎖および補助ペプチド鎖からなる多標的キメラ抗原受容体であって、主ペプチド鎖が、抗原結合ドメインA、補助ペプチド鎖連結ドメインB、膜貫通ドメインCおよび細胞内シグナル伝達ドメインDを含み;補助ペプチド鎖が、主ペプチド鎖連結ドメインFを含み;抗原結合ドメインAが、抗原結合機能を有するポリペプチドであり;補助鎖連結ドメインBおよび主ペプチド連結ドメインFが、互いに組み合わせることができ;膜貫通ドメインCが、任意の膜結合タンパク質または膜貫通タンパク質の膜貫通ドメインであり;細胞内シグナル伝達ドメインDが、一次シグナル伝達領域を含む、多標的キメラ抗原受容体を提供する。

Description

本発明は、バイオテクノロジーの分野、特に、多標的キメラ抗原受容体に関する。
キメラ抗原受容体(CAR)は、通常、抗原結合ドメイン、膜貫通ドメインおよび細胞内シグナル伝達ドメインから主になる膜貫通融合タンパク質である(特許CN105392888A)。免疫細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)は、キメラ抗原受容体の発現の際に、抗原特異性をもたらす。
CAR分子の抗原結合ドメインは、免疫細胞の特異的な標的化を決定する。最も典型的なCARは、しばしば、抗体の重鎖の可変領域およびリンカーによって結合される軽鎖可変領域からなるその抗原結合ドメインとして単鎖可変断片(scFv)を使用する。その単純な構造のために、たった1本のペプチド鎖が存在し、これは、融合タンパク質の部分としてCAR分子への組み込みに適切である。腫瘍抗原それ自体が受容体である場合、CARの抗原結合ドメインはまた、受容体に特異的なそのリガンドによって置き換えられ得る。
CAR分子の第2の単位構造は、細胞表面から膜にわたってCAR分子が発現することを可能にする、膜貫通型(TM)である。通常、CAR分子は、腫瘍の処置のためのT細胞上で武装されており、したがって、CD3ζ、CD4、CD8またはCD28などのT細胞発現タンパク質の多くの膜貫通領域は、CAR膜貫通ドメインとして使用され得る。CD28の膜貫通領域を有するCARの発現レベルがCD3ζの膜貫通領域を有するものよりも高いことが文献に報告されている。加えて、一部のCAR分子構造では、スペーサー/ヒンジ領域が、抗原ドメインおよび膜貫通ドメインの間に挿入され得、これは、抗原構造および標的化された抗原の立体障害を低減し得る。IgG1、IgG4、IgDおよびCD8の断片ペプチドは、しばしば、このような目的のために使用される。
細胞内シグナル伝達領域は、CAR分子の最も重要な部分である。これは、細胞内シグナルを伝達し、免疫細胞の活性化および増殖を担う。第1世代CARとしても公知である、初期の設計の細胞内シグナル伝達ドメインは、1種のCD3ζ刺激シグナルのみを使用していた。CD3ζ分子と同じく、共刺激の第2のシグナルなしの3つのITAMのみが存在する。したがって、第1世代のCARは、T細胞が腫瘍の抗原と結合したときに第2のシグナルを欠くことに起因してT細胞は増殖が困難であるので、弱い抗腫瘍効果しか有さず、臨床適用においてあまり有効ではない。これに基づいて、CARは、CAR中に第2のシグナルを伝達するCD28分子の活性ドメインを組み込むように改変され、それ故、第2世代のCARと呼ばれている。CAR−T細胞への共刺激シグナルの付加は、in vivoでCAR−T細胞の生存を増強することができ、細胞が、増殖を維持しながらこれらの腫瘍細胞を死滅させることを可能にし、CAR−T細胞の抗腫瘍能を改善する。したがって、第2世代のCARは、臨床適用において良好な抗腫瘍効果を示した。例えば、Alvavez-VallinaおよびHawkinsらは、CAR分子に共刺激分子のCD28シグナル断片を挿入し、T細胞が対応する抗原によって刺激を受け得ることを実証した(Alvarezvallina L、Hawkins R E.、1996年)。したがって、第2世代のCARは、臨床適用において良好な抗腫瘍効果を示した。しかしながら、外因性の共刺激分子の欠如で、すべての第2世代のCARがT細胞の増殖を促進するのに十分なIL−2を産生できなかった。しかしながら、トランスジェニックB7共刺激分子を与えると、これらのトランスジェニックCAR−T細胞は、IL−2を産生して、それら自体の増殖を促進することができた。これに基づいて、第3世代のCARが生み出され、これは、細胞内シグナル領域が、CD28分子に加えて、別の共刺激分子、通常、OX40または4−1BBを有する(Till BG、Jensen MC、Wang Jら、2012年)。第2世代のCARと比較して、第3世代のCARは、in vivoで拡大増殖し、サイトカインを産生する能力が良好である一方、相当の細胞毒性を有する(Pule MA、Straathof KC、Dotti Gら、2005年)。しかしながら、最近の研究は、CAR−T細胞の機能活性が、これらの細胞内シグナル配列に加えて標的細胞によって提供される細胞内受容体に関連していることを示している。第3世代のCARが第2世代のCARより優れているか否かは、臨床的に検証されていないままである。
キメラ抗原受容体T細胞療法は、B細胞由来腫瘍において良好な結果を達成している。CART19に基づくマウス抗体(「CTL019」)による処置の臨床転帰は、CLLの患者および小児ALLについて、完全奏効の確立において、有望な結果を示している。軽減(Kalos M、Levine BL、Porter DLら、2011年;Porterら、2011年;Gruppら、2013年)は、がんの適合処置の新たな時代を開いた。
キメラ抗原受容体−免疫細胞療法のT細胞またはNK細胞のin vitro拡大増殖は、IL−2刺激に依拠しており、したがって、ある程度の量のIL−2を、T細胞およびNK細胞の培養培地に添加しなければならない(Bodnarら、2008年;Grundら、2005年)。NK細胞の培養を平易にするため、および臨床適用におけるIL−2による毒性の副作用を考慮して、研究者らは、IL−2を安定的に発現させるためにIL−2依存NK92細胞を遺伝子操作し、これは、培養培地中へのIL−2の添加を不必要にする(Shigeki Nagashima、1998年;Y.K. TAM、1999年)。IL−15はIL−2と機能的に類似しており、同じベータおよびガンマ受容体単位を共有している。研究は、IL−2またはIL−15が、NK細胞およびCD8+T細胞の生存および増殖のために必要であることを示している(Boymanら、2007年)。したがって、研究者らは、IL−15発現NK細胞株を構築し、IL−15発現NK92細胞が、培地中で必要なIL−2の量を大幅に低減し得ることを見出した(JIAN ZHANG、2004年;Jiangら、2008年;03152968.2)。IL−15およびIL−2は同じβγ受容体単位を共有するが、それぞれ、特異的なα受容体を有し、IL−15Rα−sushi(IL−15受容体αのsushiドメイン)がIL−15のスーパーアゴニストであることが見出された。アゴニストは、IL−15の機能を大いに増強することができ(Hanら、2011年;Mortierら、2006年)(特許:201280037114.2;201510358540.1)、IL−15およびIL−15Rα−sushiの複合体は、T/NK細胞の成長のサポートにおいてIL−2の役割に代わって完全に使用することができ(Peter S. Kim 1、2016年;Rosarioら、2016年)、NK/CD8+T細胞は活性化され、腫瘍を死滅させるそれらの細胞毒性が増加する。したがって、細胞の免疫療法の有効性を改善するために、CAR構築物において、IL−15およびIL−15Rα−sushi複合体または他の機能性サイトカインならびに受容体複合体の融合を使用する傾向がある。
同時に、腫瘍は単一の標的によって処置され、腫瘍細胞はこの標的の発現レベルをダウンレギュレーションすることによって回避し、2つの標的によって腫瘍を処置することは、この問題を緩和するだろう(特許:201710005395.8;201510733585.2;201710640609;201610353118.1)。例えば、研究者は、Car−T細胞が2つの標的を認識することを可能にする、キメラ抗原受容体の細胞外部分として、2つの異なる抗体または抗原リガンドの配列を一緒に連結するリンカーを使用することができ、これは、腫瘍免疫回避に起因する有効性の減少を止める(Hegde M、Mukherjee M、Grada Zら、2016年;Schneider D、Xiong Y、Wu Dら、2017年)。さらにまた、研究者らは、CAR−Tの細胞外ドメインとして5B9タグという名称のバイオマーカーに対する抗体を使用し、異なる腫瘍標的を標的化する抗体の群を5B9タグに融合した。Car−Tは、それぞれの抗原への異なる抗体の結合によって異なる標的を認識する能力を得ることができる(Cartellieri M、Feldmann A、Koristka Sら、2016年)。
加えて、キメラ抗原受容体の1つが免疫チェックポイント関連部位になる場合、免疫細胞の活性は、免疫学的チェックポイントによって伝達される負のシグナルを遮断することによって大きく増強され得る。例えば、PD−1(プログラム細胞死1)およびその受容体のPD−L1、PD−L2は、T細胞の活性の重要な調節因子である(OkazakiおよびHonjo、2007年)。他の細胞におけるPD−L1/2に対して、T細胞の表面におけるPD−1の結合は、T細胞の阻害を引き起こし、これは、ヒトにおける自己免疫疾患の回避および免疫寛容を生じさせるプロセスにおいて重要な役割を果たすが、病原微生物に感染した一部の細胞およびがん細胞は、これらのPD−L1/2のアップレギュレーション、次いで、またはT細胞におけるPD−1発現によってT細胞の監視から逃れることもでき、疾患をもたらす(Freemanら、2000年;Keirら、2008年;Parryら、2005年)。したがって、研究者らは、このシグナル伝達経路を遮断するために、抗原と結合するPD−1またはPD−L1に対する抗体を探索し、これは、T細胞の活性を有意に改善し、病原微生物およびがんに対する身体の抵抗性を増強することができる(Topalianら、2012年;Yanan Guo1、2016年)。MSLNを標的とするCAR−T療法とPD1抗体の組合せは、この組合せが腫瘍細胞を死滅させるCAR−T細胞の能力を向上させることを示している(Cherkassky L、Morello A、Villenavargas Jら、2016年)。さらにまた、研究者らは、免疫チェックポイント分子であるPD1またはCTLA−4を細胞内シグナル領域と連結させることによって、いわゆるキメラ抗原受容体スイッチングシステムを構築した。この方法では、腫瘍細胞および腫瘍内微小環境からの免疫チェックポイントによる負のシグナルが変化して、処置する腫瘍におけるCAR−T細胞の有効性を向上させ、オフターゲット効果の危険性を低減する(Liu X、Ranganathan R、Jiang Sら、2016年;Fedorov VD、Themeli M、Sadelain M.、2013年)。多くの臨床試験は、メラノーマ(Choら、2016年;Hamidら、2013年)、多発性骨髄腫(Badrosら、2015年)、白血病(Porkkaら、2014年)の処置のためのPD−1/PD−L1抗体が良好な治療効果を有することを実証している(特許番号:200380109929.8、201310258289.2、201180019629.5)。したがって、複数の標的を認識するCAR分子の改変は、細胞の免疫療法において重要な役割を果たす。
中国特許出願公開200380109929号明細書 中国特許出願公開201310258289号明細書 中国特許出願公開201180019629号明細書
本発明の目的は、多標的キメラ抗原受容体(図1)を提供することである。
本発明によって提供される多標的キメラ抗原受容体は、主ペプチド鎖および補助ペプチド鎖からなり;
主ペプチド鎖は、抗原結合ドメインA、補助ペプチド鎖連結ドメインB、膜貫通ドメインCおよび細胞内シグナル伝達ドメインDを含み;
補助ペプチド鎖は、主ペプチド鎖連結ドメインFを含み;
抗原結合ドメインAは、抗原と結合する機能を有するポリペプチドであり;
補助ペプチド鎖連結ドメインBおよび主ペプチド鎖連結ドメインFは、互いに組み合わされ;
補助ペプチド鎖連結ドメインBおよび主ペプチド鎖連結ドメインFは、互いに結合することができる、サイトカインおよび対応するサイトカイン受容体、またはサイトカインおよび対応するサイトカイン受容体断片であり;
膜貫通ドメインCは、任意の膜結合性タンパク質の膜貫通領域または膜貫通タンパク質の膜貫通領域であり;
細胞内シグナル伝達ドメインDは、一次シグナル伝達領域を含む。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
補助ペプチド鎖が、抗原結合ドメインEをさらに含み;
抗原結合ドメインEが、抗原と結合する機能を有するポリペプチドであり;
抗原結合ドメインEおよび抗原結合ドメインAが、同一または相違する。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
細胞内シグナル伝達ドメインDが、共刺激シグナル伝達領域も含む。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原と結合する機能を有するポリペプチドが、抗原と結合することが可能な抗体、抗原と結合することが可能なリガンドまたは抗原と結合する能力を有する受容体である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原と結合することが可能な抗体が、インタクト抗体、抗体のFab、抗体のFc、scFv、VHH、抗体のVLまたはVHの完全長ポリペプチドまたは部分断片であり;
抗原結合リガンドまたは抗原結合受容体が、リガンドまたは受容体の完全長ポリペプチドまたは部分断片である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEと結合することができる抗原が、細胞表面抗原またはMHC分子とポリペプチドの複合体である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原が、がん関連抗原であるか;
あるいは、一実施形態では、抗原が、脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がん、腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫、肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、子宮がんの関連抗原またはこれらの任意の組合せである。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEによって結合される抗原が、以下:CD123、CD19、CD20、CD22、CD37、ROR1、メソテリン、CD33/IL3Ra、c−Met、BCMA、PSMA、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGEA3、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、hsp70−2、M−CSF、PSA、PAP、LAGE−la、p53、プロステイン(Prostein)、PSMA、Her2/neu、テロメラーゼ、PCTA−1、MAGE、ELF2M、IGF−I、IGF−II、IGF−I受容体、BCR−ABL、E2A−PRL、H4−RET、1GH−IGK、MYL−RAR、GP100、Mart1、TSP−180、MAGE−4、MAGE−5、MAGE−6、RAGE、p185erbB2、p180erbB−3、c−met、nm−23H1、TAG−72、CA 19−9、CA 72−4、CAM 17.1、NuMa、K−ras、β−カテニン、CDK4、Mum−1、p15、p16、43−9F、5T4、791Tgp72、β−HCG、BCA225、BTAA、CA 125、CA 15−3\CA 27.29\BCAA、CA 195、CA 242、CA−50、WT1、CD68、FGF−5、G250、EpCAM、MA−50、MG7−Ag、MOV 18、NB/70K、RCAS1、SDCCAG16、TA−90、TAAL6、TAG72、TLP、p53、Ras、TPS、エプスタインバーウイルス抗原EBVAならびにヒトパピローマウイルス(HPV)E6およびE7、またはこれらの任意の組合せであるか;
あるいは、抗原結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEによって結合される抗原が、MHCおよび上記の抗原の短いペプチドの複合体であり、抗原は、結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEを結合することができる抗原である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗原結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEによって結合される抗原が、CD19、CD20、BCMA、CD22、CD33/IL3Ra、Her2、PDL1、NY−ESO−1、GP100、Mart1、WT1、またはこれらの任意の組合せであるか;
あるいは、抗原結合ドメインAおよび抗原結合ドメインEによって結合される抗原が、MHCおよび抗原の上記の短いペプチドの複合体である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
サイトカインおよび対応するサイトカイン受容体が、ガンマ鎖サイトカインファミリーにおけるサイトカインおよび対応するサイトカイン受容体である。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
γcサイトカインファミリーにおけるサイトカインおよび対応するサイトカイン受容体が、IL15およびIL15Rα、IL4およびIL4Rα、またはIL2およびIL2Rαであるか;
あるいは、γcサイトカインファミリーにおけるサイトカインおよび対応するサイトカイン受容体が、IL15およびIL15Rα、IL4およびIL4Rα、またはIL2およびIL2Rαと75%より高い相同性を有するポリペプチドである。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
一次シグナル伝達領域が、CD3−ζ、FcεRIγ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79bおよびCD66dのシグナル伝達領域、または上記シグナル伝達領域の組合せであるか;
あるいは、一次シグナル伝達領域が、配列6のタンパク質配列を有するCD3−ζシグナル伝達領域、またはCD3−ζシグナル伝達領域と75%より高い相同性を有するポリペプチドである。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
共刺激シグナル伝達領域が、CD27、CD28、4−1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、リンパ球機能関連抗原−1、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3シグナル伝達領域、もしくはCD83と特異的に結合するリガンドのシグナル伝達領域、または上記の1つもしくは複数の任意の組合せであるか;
あるいは、共刺激シグナル伝達領域が、特に、CD28シグナル伝達領域および4−1BBシグナル伝達領域の1つまたは両方の組合せであるか;
あるいは、共刺激シグナル伝達領域が、CD28シグナル伝達領域、4−1BBシグナル伝達領域と75%より高い相同性を有する2つのポリペプチドの1つまたは両方の組合せである。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
多標的キメラ抗原受容体において、抗原結合ドメインAまたはEが、抗CD19−ScFv、抗MHC/GP100−VHH、抗MHC/WT1−VH、抗CD20−ScFv、抗CD22−ScFvまたはPD1細胞外ドメインの1つまたは2つの組合せであり;
補助ペプチド連結ドメインが、IL15Rαsushi、IL4Rα−N−FN3、IL15またはIL4であり;
膜貫通ドメインが、CD8の膜貫通領域またはCD28の膜貫通領域であり;
細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζシグナル伝達領域が4−1BBシグナル伝達領域と、またはCD3ζシグナル伝達領域がCD28シグナル伝達領域と融合することによって得られるポリペプチドであり;
主ペプチド鎖連結ドメインが、IL15、IL4、IL15RαsushiまたはIL4Rα−N−FN3であるか;
あるいは、多標的キメラ抗原受容体において、抗原結合ドメインAが、抗CD19−ScFvであり;
補助ペプチド鎖連結ドメインが、IL15Rαsushiであり;
膜貫通ドメインが、CD8の膜貫通領域であり;
細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζシグナル伝達領域が4−1BB(CD137)シグナル伝達領域と融合することによって得られるポリペプチドであり;
抗原結合ドメインEが、PD1の細胞外領域であり;
主ペプチド鎖連結ドメインが、IL15である。
補助ペプチド鎖ドメインおよび主ペプチド鎖ドメインは、最も好ましくは、IL15およびIL15Rαsushiである。IL15およびIL15Rαsushiが、補助ペプチド鎖ドメイン(B)および主ペプチド鎖ドメイン(F)として使用される場合、これらは、NK細胞またはT細胞の増殖を刺激して、NK細胞またはT細胞におけるこの多標的キメラ受容体の発現を可能にする。
共刺激シグナル伝達領域は、以下のタンパク質の1つのシグナル伝達領域に由来するのが特に好ましい:CD28および4−1BB(CD137)または両方の組合せ。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
抗CD19−ScFvのアミノ酸配列が、配列1として記載され;
抗MHC/GP100−VHHのアミノ酸配列が、配列15として記載され;
抗MHC/Mart1−VHHのアミノ酸配列が、配列16として記載され;
抗CD20−ScFvのアミノ酸配列が、配列17として記載され;
抗CD22−ScFvのアミノ酸配列が、配列18として記載され;
抗MHC/WT1−VHのアミノ酸配列が、配列19として記載され;
PD1の細胞外ドメインの配列が、配列2として記載され;IL15Rαsushiのアミノ酸配列は、配列4として記載され;
IL4Rα−N−FN3のアミノ酸配列が、配列20として記載され;
CD8の膜貫通領域のアミノ酸配列が、配列5として記載され;
CD28の膜貫通領域のアミノ酸配列が、配列22として記載され;
CD3ζシグナル伝達領域のアミノ酸配列が、配列6として記載され;
4−1BBシグナル伝達領域のアミノ酸配列が、配列8として記載され;
CD28シグナルのアミノ酸配列が、配列7として記載され;
IL15のアミノ酸配列が、配列3として記載され;
IL4のアミノ酸配列が、配列21として記載される。
上記の多標的キメラ抗原受容体の中で、
多標的キメラ抗原受容体の主ペプチド鎖のアミノ酸配列が、配列9、配列23、配列24、配列25、配列26、配列27、配列28または配列29のいずれか1つであり;
受容体の補助ペプチド鎖のアミノ酸配列が、配列3、配列4、配列10、配列30、配列31、配列32、配列33または配列34のいずれか1つである。
本発明の別の目的は、上記に記載の多標的キメラ抗原受容体をコードする核酸分子を提供することである。
本発明によって提供される多標的キメラ抗原受容体をコードする核酸分子は、主ペプチド鎖をコードする核酸分子または補助ペプチド鎖をコードする核酸分子を含む。
受容体分子をコードする核酸配列は、例えば、遺伝子を発現する細胞からライブラリーをスクリーニングすることによって、遺伝子を含むことが公知のベクターから遺伝子を得ることによって、または遺伝子を含有する細胞および組織から直接単離するための標準的技術もしくは化学的にポリヌクレオチドの合成を利用することによってなどの本技術分野における公知の組換え方法を使用して得ることができる。
上記の核酸分子を含有する、組換えベクター、発現カセット、組換えバクテリア、細胞または組換えウイルスも本発明の範囲内である。
上記の組換えベクターは、上記の核酸配列または組合せを含む。一実施形態では、主ペプチド鎖(X)または補助ペプチド鎖(Y)をコードする核酸は、プロモーターにライゲーションされ、構築物は、主ペプチド鎖(X)または補助ペプチド鎖(Y)を発現させるために、発現ベクターに組み込まれる。典型的なクローニングベクターは、所望の核酸配列の発現を調節するために使用することができる、転写および翻訳ターミネーター、初期配列およびプロモーターを含む。例えば、レンチウイルスベクターは、これらが長期間の安定な遺伝子の組み込みおよび娘細胞におけるこれらの複製を可能にするので、遺伝子の長期間の安定な遺伝を達成するための適切なツールである。レンチウイルスベクターは、これらが肝細胞などの非分裂細胞に形質導入することができるので、マウス白血病ウイルスなどの発がん性レトロウイルスに由来するベクターを超える追加の利点を有する。これらはまた、低免疫原性という追加の利点を有する。本発明によって提供されるキメラ抗原受容体は、限定されるものではないが、主ペプチド鎖(X)および補助ペプチド鎖(Y)をコードするそれぞれのベクターの共トランスフェクション、または、主ペプチド鎖(X)をコードする核酸配列および補助ペプチド鎖(Y)をコードする核酸配列を有する発現フレームワークの2つのセットを含有する発現ベクター、または主ペプチド鎖(X)および補助ペプチド鎖(Y)をコードする核酸配列が発現フレームワークにタンデムでライゲーションされること、ならびに両方のペプチド鎖が、主ペプチド鎖(X)および補助ペプチド鎖(Y)の核酸配列の間のリボソーム結合部位を挿入することによって発現されることを含む、公知の手法で、同じ細胞中で発現することができる2つのペプチド鎖を含む。
上述の細胞が、原核細胞、酵母細胞もしくは哺乳動物細胞であるか;
または、哺乳動物細胞が、特に、ヒト細胞であるか;
または、ヒト細胞が、特に、免疫細胞であるか、
あるいは、免疫細胞が、特に、T細胞もしくはNK細胞である。
免疫療法における、上記に記載の多標的キメラ抗原受容体、上記の核酸分子、または上記の組換えベクター、発現カセット、組換え株、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護の範囲内であり;
あるいは、免疫療法製品を調製するための、上記に記載の多標的キメラ抗原受容体、上記の核酸分子、または上記の組換えベクター、発現カセット、組換え株、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護の範囲内である。
免疫細胞の培養および/または免疫細胞の増殖の促進のための、上記の多標的キメラ抗原受容体、上記の核酸分子、または上記の組換えベクター、発現カセット、組換え株、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用は、本発明の範囲であり;
免疫細胞の培養および/または免疫細胞の増殖を促進するための製品の調製における、上述の多標的キメラ抗原受容体、上記の核酸分子、または上記の組換えベクター、発現カセット、組換え株、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の範囲内である。
イムノアッセイのための、上記に記載の多標的キメラ抗原受容体、上記の核酸分子、または上記の組換えベクター、発現カセット、組換え株、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護の範囲内であり;
あるいは、本発明において、免疫検出キットを作成するための、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクターおよび発現カセット、組換えバクテリア、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲であり;
あるいは、腫瘍の診断のための、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクターおよび発現カセット、組換えバクテリア、細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護の範囲内であり;
腫瘍の処置または診断のための製品の調製における、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクター、発現カセットおよび組換えバクテリア、組換え細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲であり;
腫瘍細胞の阻害または死滅における、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクター、発現カセットおよび組換えバクテリア、組換え細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲であり;
腫瘍細胞を阻害または死滅させるための製品の調製における、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクター、発現カセットおよび組換えバクテリア、組換え細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲であり;
抗原を発現する標的細胞の阻害または死滅における、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクター、発現カセットおよび組換えバクテリア、組換え細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲であり;
抗原を有する標的細胞を阻害または死滅させるための標的細胞製品の調製における、多標的キメラ抗原受容体、核酸分子、または組換えベクター、発現カセットおよび組換えバクテリア、トランスジェニック細胞もしくは組換えウイルス、あるいはキットの使用も、本発明の保護範囲である。
免疫療法が、免疫細胞によって腫瘍細胞を阻害または死滅させるために使用されるか;
あるいは、免疫細胞が、T細胞またはNK細胞などであるか:
あるいは、抗原が、がん関連抗原であるか;
あるいは、抗原が、脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がんおよび腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫および神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫および肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、子宮がん、またはこれらの任意の組合せの関連抗原であるか;
あるいは、腫瘍が、以下:脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がんおよび腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫および神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫および肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、ならびに子宮がん、または上記の組合せのいずれか1つであるか;
あるいは、標的細胞が、原核細胞、酵母細胞または哺乳動物細胞であるか;
あるいは、哺乳動物細胞が、特に、ヒト細胞であるか;
あるいは、ヒト細胞が、免疫細胞であるか;
あるいは、免疫細胞が、特に、T細胞またはNK細胞である。
抗原を発現する標的細胞中の抗原は、多標的キメラ抗原受容体によって結合され得る抗原である。
本発明におけるIL15Rαsushiは、IL15受容体のアルファ鎖のsushi断片、略してIL15Rαsushiであり、IL15と結合する能力を有する。
本発明において、IL4Rα−N−FN3は、IL4と結合する機能を有する、IL4受容体のアルファ鎖由来の断片である。
本発明の主ペプチド鎖の抗原結合ドメイン(A)および補助ペプチド鎖連結ドメイン(E)は、抗原と結合する機能を有する。抗原結合ドメインによって結合される抗原は、免疫応答、特に、T細胞介在免疫応答を引き起こす腫瘍細胞によって産生されるタンパク質である。本発明の抗原結合ドメインの選択は、処置される疾患の具体的な種類に依存する。腫瘍抗原は、本分野において周知である。
一実施形態では、本明細書で言及される腫瘍抗原としては、例えば、神経膠腫関連抗原、がん胚抗原(CEA)、ベータ−ヒト絨毛性ゴナドトロピンおよびアルファ−胎児性タンパク質(AFP)、レクチン反応性AFP、サイログロブリン、RAGE−1、MN−CA/IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、エンテロカルボキシルエステラーゼ、mut hsp70−2、M−CSF、前立腺酵素、前立腺特異抗原(PSA)、PAP、NY−ESO−1、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、サバイビン、テロメラーゼ、前立腺がん腫瘍抗原−1(PCTA−1)、MAGE、ELF2M、中性白血球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン成長因子(IGF)−I、IGF−II、IGF−I受容体およびメソテリンが挙げられる。
一実施形態では、腫瘍抗原は、悪性腫瘍と関連する1つまたは複数の抗原がんエピトープを含む。悪性腫瘍は、免疫攻撃のための標的抗原として使用することができる多くのタンパク質を発現する。これらの分子としては、限定されるものではないが、メラノーマにおけるMART−1、チロシナーゼおよびGP100、ならびに前立腺がんにおける前立腺酸性ホスファターゼ(PAP)および前立腺特異抗原(PSA)などの組織特異抗原が挙げられる。他の標的分子は、がん遺伝子であるHER−2/Neu/Erb−2などの形質転換関連分子の群に属する。他の群の標的抗原は、癌胎児性抗原(CEA)などの胎児性のがん抗原である。B細胞リンパ腫では、腫瘍特異的な個体の遺伝子型の免疫グロブリンは、個体の腫瘍に固有の、真の腫瘍特異免疫グロブリン抗原を形成する。CD19、CD20およびCD37などのB細胞分化抗原は、B細胞リンパ腫における標的抗原の他の候補である。これらの抗原(CEA、HER−2、CD19、CD20、個体の遺伝子型)の一部は、モノクローナル抗体を使用する受動的療法のための標的として成功裏に使用されている。
一実施形態では、本発明において言及される腫瘍抗原はまた、腫瘍特異抗原(TSA)または腫瘍関連抗原(TAA)であり得る。TSAは、腫瘍細胞に対して固有であり、身体の他の細胞において生じない。対照的に、TAA関連抗原は、腫瘍細胞に対して固有ではなく、抗原の免疫寛容状態が誘導され得ない条件下で正常細胞において発現することもできる。腫瘍における抗原の発現は、免疫系が抗原に応答することができる疾患の状態下で生じ得る。TAAは、免疫系が未成熟で応答できない場合に、胚発生の間に現れ、正常細胞において発現する抗原であり得るか、またはこれらは、腫瘍細胞においてより高いレベルで発現する一方で、正常細胞において極めて低いレベルで正常に存在する抗原であり得る。
TSAまたはTAA抗原の例としては、限定されるものではないが、以下のものが挙げられる:分化抗原、例えば、MART−1/MelanA(MART−1)、gp100(Pmel 17)、チロシナーゼ、TRP−1、TRP−2;腫瘍特異多系統抗原、例えば、MAGE−1、MAGE−3、BAGE、GAGE−1、GAGE−2、p15;過剰発現した胚抗原、例えば、CEA;過剰発現した発がん性遺伝子および変異した腫瘍抑制遺伝子、例えば、p53、Ras、HER−2/neu;染色体転座によって発生した固有の腫瘍抗原、例えば、BCR−ABL、E2A−PRL、H4−RET、1GH−IGK、MYL−RAR;ならびにウイルス抗原、例えば、エプスタインバーウイルス抗原EBVAおよびヒトパピローマウイルス(HPV)抗原E6およびE7。他のタンパク質抗原は、TSP−180、MAGE−4、MAGE−5、MAGE−6、RAGE、NY−ESO、p185erbB2、p180erbB−3、c−met、nm−23H1、PSA、TAG−72、CA 19−9、CA 72−4、CAM 17.1、NuMa、K−ras、ベータ−カテニン、CDK4、Mum−1、p15、p16、43−9F、5T4、791Tgp72、アルファ−胎児性タンパク質、ベータ−HCG、BCA225、BTAA、CA 125、CA 15−3/CA、27.29/BCAA、CA 195、CA 242、CA−50、CAM43、CD68/P1、CO−029、FGF−5、G250、Ga733/EpCAM、HTgp−175、M344、MA−50、MG7−Ag、MOV18、NB/70K、NY−CO−1、RCAS1、SDCCAG16、TA−90\Mac−2結合タンパク質\輪状親和性タンパク質C関連タンパク質、TAAL6、TAG72、TPSおよびTLPを含む。
一実施形態では、本明細書において言及される腫瘍抗原は、MHCと前記抗原ペプチド断片の複合体であり得、限定されるものではないが、HLA−GP100複合体、HLA−Mart−1複合体およびHLA−WT1複合体などが挙げられる。
一実施形態では、前記主ペプチド鎖中の抗原結合ドメイン(A)または補助ペプチド鎖中の抗原結合ドメイン(E)は、抗原、リガンド、受容体、抗原結合能を有するポリペプチドまたはこれらの任意の組合せと組み合わせることができる抗体である。
抗体は、完全ペプチド鎖、もしくはIg、FabおよびscFvのペプチド断片、またはこれらの任意の組合せであり得る。リガンドまたは受容体は、完全ペプチド鎖、ペプチド断片、またはこれらの任意の組合せであり得る。
補助ペプチド鎖連結ドメイン(B)および主ペプチド鎖連結ドメイン(F)は、相互結合機能を有するペプチド断片のペアである。相互結合機能を有するペプチド断片は、互いと組み合わせられ得る受容体およびリガンドのペア、または互いと組み合わせられ得る抗体および抗原のペアであり得る。相互に組み合わされる受容体およびリガンドとしては、限定されるものではないが、IL15およびIL15Rアルファ、IL4およびIL4R、IL2およびIL2Rアルファ、CD16およびIgG Fc、CD32およびIgG Fc、CD64およびIgG Fcが挙げられる。
ここで、膜貫通ドメイン(C)は、任意の膜結合タンパク質または膜貫通タンパク質の膜貫通領域に由来し得る。膜貫通ドメインに関して、一部の例では、構造ドメインが、立体障害を低減するために、表面で発現する膜タンパク質の同一または相違する膜貫通領域と結合することを防止することができるように、膜貫通ドメインが選択されてもよく、または改変がアミノ酸置換によって行われる。膜貫通ドメインは、天然供給源または合成供給源に由来し得る。天然供給源において、ドメインは、任意の膜結合タンパク質または膜貫通タンパク質に由来し得る。本発明において特に使用される膜貫通領域は、限定されるものではないが、T細胞受容体のアルファ、ベータまたはゼータ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154およびICOSを含むものに由来し得る。
ここで、細胞内シグナル伝達ドメイン(D)は、シグナル伝達領域を含み、共刺激シグナル伝達領域またはこれらの組合せも含んでいてもよい。細胞内シグナル伝達ドメインは、エフェクター機能のシグナルを伝達し、細胞が特異的な機能を実行するのを導く、タンパク質断片を指す。例えば、T細胞のエフェクター機能は、サイトカイン分泌による細胞の溶解活性または補助的活性であり得る。細胞内シグナル伝達構造ドメイン全体を使用することができるが、多くの例では、鎖全体を使用する必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインの切断型は、これが伝達エフェクターの機能シグナルを有する限り、鎖全体に代えて使用することができる。
一次細胞血漿シグナル伝達配列は、刺激の様式または阻害の様式で免疫細胞の一次活性化を刺激する。刺激の様式で作用する一次細胞シグナル伝達配列は、免疫受容活性化チロシンモチーフすなわちITAMとして公知のシグナル伝達モチーフを含んでいてもよい。
本発明において一次細胞質シグナル伝導を有するITAMの例としては、TCRζ、FcεRIγ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b、CD66d、またはこれらの組合せが挙げられる。好ましくは、本発明によって開示されるCAR構築物の細胞質シグナル伝達分子は、CD3ζに由来する。
本発明における共刺激シグナル伝達領域は、共刺激分子を含む細胞内ドメインを指す。共刺激分子は、抗原に対するが、抗原受容体またはそのリガンドに対してではない、リンパ球の有効な応答によって必要とされる細胞表面分子である。このような分子の例としては、CD27、CD28および4−1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、リンパ球機能関連抗原−1(LFA−1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、およびCD83と特異的に結合するリガンドなどが挙げられる。したがって、本発明は、共刺激シグナル分子として4−1BBおよびCD28を主に使用するが、他の共刺激要素も本発明の範囲内である。
多標的キメラ抗原受容体の細胞シグナル伝達部分の細胞質シグナル伝達配列は、ランダムまたは特定の配列で、互いと連結され得る。
一実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、CD3−ゼータシグナル伝達ドメインを含む。別の実施形態では、細胞内シグナル伝達領域は、CD3−ゼータ、および4−1BBのシグナル断片を含む。別の実施形態では、細胞内シグナル伝達構造は、CD3−ゼータのシグナル部分およびCD28のシグナル伝達構造を含む。
短いオリゴペプチドまたはポリペプチドは、多標的キメラ抗原受容体の機能に影響を与え得ないように、多標的キメラ抗原受容体中のモジュールの間を連結するペプチドとして使用することができ、好ましくは、連結するペプチドの長さは、2〜10アミノ酸の間であり、連結するペプチドのアミノ酸は、好ましくは、グリシンおよびセリンである。
図1は、多標的キメラ抗原受容体の模式図である。多標的キメラ抗原受容体は、主ペプチド鎖および補助ペプチド鎖からなり、主ペプチド鎖は、抗原結合ドメインA、補助ペプチド鎖連結ドメインB、膜貫通ドメインCおよび細胞内シグナル伝達ドメインDを含み、補助ペプチド鎖は主ペプチド鎖連結ドメインFを含み、これは抗原結合ドメインEを含むこともできる。
図2は、RaceCar−1発現カセットの模式図である。本発明は、プロモーターおよびRaceCar−1をコードする遺伝子で構成されるRaceCar−1発現カセットを開示する。
図3は、異なるRaceCar発現カセットの模式図である。他のRaceCar発現カセットは、プロモーターおよびRaceCarをコードする遺伝子で構成される。 同上
図4は、細胞表面で発現するRaceCarを検証するためのFACS分析である。図中の水平の座標はIL15のレベルを表し、T細胞およびNK92細胞は、影響を受けず、陰性対照として使用され、表面でのIL15の発現は検出されなかった。IL15の異なるレベルの発現は、RaceCarウイルスで感染したT細胞およびNK92細胞の表面で検出することができる。IL15は、RaceCar(RaceCar−8、RaceCar−12およびRaceCar−13を除く)の補助ペプチド鎖中のドメイン分子であるので、IL−15は、これが細胞の表面で発現した主ペプチド鎖のドメインと結合した場合に、細胞の表面でのみ検出することができ、これは、RaceCarが、T細胞およびNK92細胞の表面で発現することができ、発現したIL15が免疫学的活性を有することを実証した。その一方で、IL15は、RaceCar−12およびRaceCar−13における主ペプチド鎖にあり、直接的に検出することができる。 同上
図5は、ウエスタンブロットによって実証されたRaceCar発現である。RaceCar−1−293T、RaceCar−2−293T、RaceCar−6−293T、RaceCar−7−293TおよびRaceCar−10−293Tの試料を、それぞれ、レーン1〜5にロードした。第6レーンは、陰性対照として使用したトランスフェクションなしの293T細胞である。下側のストリップは、ベータ−アクチン参照である。PD1の特異的ストリップは、レーン1〜レーン5において見ることができ、これは、RaceCarがトランスフェクトされた細胞で発現していることを示す。
図6は、RaceCar−NK92細胞の実証された死滅能力である。グラフの水平の座標は、エフェクター細胞の標的細胞に対する比であり、垂直の座標は、死滅効率である。RaceCar−1−NK92、RaceCar−2−NK92、RaceCar−3−NK92、RaceCar−4−NK92およびRaceCar−5−NK92はすべて、3m−CD19−luc細胞を死滅させることができ、死滅効率は、NK92の死滅効率よりも高く、これは、CD19およびPD−L1を標的にする多標的キメラ抗原受容体のRaceCar−1がNK92細胞で発現し、生物学的機能を有していることを実証する。これらは、RaceCar−1−NK92に対する抗CD19抗体の添加を伴う実験群の死滅能力を低減する一方で、抗CD19抗体がRaceCar−1の標的細胞への結合を遮断するので、RaceCar−2−NK92の死滅能力は、変化せず、その結果、標的細胞におけるラセマーゼ−1−NK92の死滅能力が阻害され、これは、RaceCar−NK92が3m−CD19−luc細胞の死滅に対する特異性を有することを証明する。 同上
図7は、RaceCar−T細胞およびCar−T細胞の間の標的細胞に対する死滅効率の比較である。グラフの水平の座標は、エフェクター細胞の標的細胞に対する比であり、垂直の座標は、死滅効率である。RaceCar−1−T細胞、RaceCar−4−T細胞、RaceCar−5−T細胞は、k562−cd19−luc細胞を死滅させることができ、これは、RaceCar−1、RaceCar−4およびRaceCar−5が、T細胞において発現し、生物学的機能を有すること、ならびにRaceCar−T細胞の死滅能力が、通常のCar−T細胞の死滅能力よりも高いことを実証する。
図8は、MHC/WT−1複合体を標的にするRaceCar−TおよびRaceCar−NK92の異なる形態の機能確認である。グラフの水平の座標は、エフェクター細胞の種類であり、垂直の座標は、死滅効率である。RaceCar−NK92細胞およびRaceCar−T細胞は両方ともBV173−luc細胞を死滅させることができ、死滅効率は、未感染T細胞またはNK92細胞の死滅効率よりも高く、RaceCar−6、RaceCar−7、RaceCar−8、RaceCar−9、RaceCar−10、RaceCar−11、RaceCar−12、RaceCar−13およびRaceCar−14が、T細胞およびNK92細胞の両方で発現することができ、対応する標的細胞についての死滅を誘導する生物学的機能を有することを実証する。
図9は、免疫細胞の増殖を誘導するRaceCarの能力についてのFACS分析である。0日目では、4群の細胞の蛍光シグナルはほぼ同じである。T細胞群は陰性対照群であり、5日目のその蛍光強度は、0日目のものと比較して、基本的に変化していない。5日目の陽性対照としてのT細胞+IL−2群のFACS分析は、図において見られ得、蛍光シグナルが、0日目のものと比較して弱くなり、細胞は異なる蛍光染色を示し、細胞が、分裂および増殖の表現型を示すことを実証する。RaceCar−1−TおよびRaceCar−2−Tの蛍光シグナルの分布は、陽性対照群のものと同様であり、RaceCar−1−TおよびRaceCar−2−Tが、IL2なしでも培養培地中で増殖することができ、RaceCarがT細胞などのような免疫細胞の増殖を促進する能力を有することを示す。
以下の実施例において使用される実験方法は、特に記載がなければ、従来の方法である。
本発明の実施形態で使用される材料、試薬などは、特に説明がなければ、市販の供給業者から入手することができる。
(実施例1 多標的キメラ抗原受容体の構造および発現ベクターの構築)
1. 多標的キメラ抗原受容体(RaceCar)タンパク質を、主ペプチド鎖Xおよび補助ペプチド鎖Yを複合体化することによって得る。
主ペプチド鎖(X)は、抗原結合ドメイン(A)、補助ペプチド鎖連結ドメイン(B)および膜貫通ドメイン(C)、ならびに細胞内シグナル伝達ドメイン(D)を含み、補助ペプチド鎖(Y)は、抗原結合ドメイン(E)および主ペプチド鎖連結ドメイン(F)を含む。補助ペプチド鎖連結ドメイン(B)および主ペプチド鎖連結ドメイン(F)は、互いに相補的に結合し、主ペプチド鎖Xおよび補助ペプチド鎖Yが重合して多標的キメラ抗原受容体(RaceCar)を形成することを可能にする。
CD19およびPD−L1の陽性細胞の両方を標的にする多標的キメラ抗原受容体(RaceCar−1)は、主ペプチド鎖X1および補助ペプチド鎖Y1を重合することによって得られる。
RaceCar−1において、抗CD19のScFv(配列1)を、主ペプチド鎖X1の抗原結合ドメイン(A1)として選択し、補助ペプチド鎖連結ドメイン(B)は、IL15R[アルファ]のsushi断片(配列4)を採用し、膜貫通のCD8(配列5)を膜貫通ドメイン(C)として選択し、細胞内シグナル伝達ドメイン(D)を、41BBシグナル伝達ドメイン(配列8)をCD3ゼータシグナル伝達領域(配列6)に連結させることによって構築し、補助ペプチド鎖Y1の抗原結合ドメイン(E)は、PDL1の受容体であるPD1の細胞外領域(配列2)を採用する。IL15(配列3)は、主ペプチド鎖連結ドメイン(F)として使用される。最後に、補助ペプチド鎖Y1(配列10)と連結した主ペプチド鎖X1(配列9)を作成する。
2. 分泌性シグナルペプチド(配列11)を、主ペプチド鎖X1のN末端の前に挿入し、これを、コード核酸のDNA−X1(配列13)として人工的に合成し、同様に、2Aシグナルペプチド(配列12)を、補助ペプチド鎖Y1のN末端の前に追加し、コード配列を、配列DNA−X2(配列14)として合成する。
3. Bam HIおよびHindIII部位を、DNA−X1の各末端に追加し、Bam HIおよびHindIIIによって切断して、DNA−X1の断片を得、同様に、HindIII部位を、DNA−X2配列の5’末端に追加し、3’末端にEcoRI部位を追加し、HindIIIおよびEcoRIによって切断して、DNA−X2の核酸断片を得る。
4. 3で得られた2つの核酸断片を、同じ酵素の組合せによって切断されたベクターpFUGW(addgene、USA)に挿入し、ライゲーションされた生成物をescherichia coliに形質転換し、個々のコロニーを取り出し、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)分析を使用してスクリーニングし、最後に、組換えベクターであるpFUGW−RaceCar−1を得る。組換えベクターのpFUGW−RaceCar−1を、pFUGWベクターのBamHI切断部位およびEcoRI切断部位の間の断片について、RaceCar−1(コード核酸は、配列13、AAGCTTおよび配列14で構成され、配列13の最後のヌクレオチドは、AAGCTTの最初の塩基に隣接し、配列14の最初のヌクレオチドは、HindIIIのための消化部位であるAAGCTTの最後の塩基に隣接する)を発現させるための核酸と置き換える。RaceCar発現カセットを、RaceCar−1のコード核酸およびpFUGW中のプロモーターによって形成する(図2)。
5. 同じ方法での他の多標的キメラ抗原受容体の設計を表1に示す。
表1において、抗MHC/GP100−VHHのアミノ酸配列を配列15に記載し、抗MHC/Mart−1−VHのアミノ酸配列を配列16に記載し、抗CD20−ScFvのアミノ酸配列を配列17に記載し、抗CD22−ScFvのアミノ酸配列を配列18に記載し、抗MHC/WT1−VHのアミノ酸配列を配列19に記載し、IL4Rアルファ−N−FN3アミノ酸配列の配列を配列20に示し、IL4の配列を配列21に記載し、CD28膜貫通領域の配列を配列22に記載する。
異なる主ペプチド鎖Xの配列は、以下の通り記載する:主ペプチド鎖X2(アミノ酸配列は配列23である);主ペプチド鎖X3(アミノ酸配列は配列24である);X4(アミノ酸配列は配列25である);X5(アミノ酸配列は配列26である);X6(アミノ酸配列は配列27である);X7(アミノ酸配列は配列28である);X8(アミノ酸配列は配列29である);ならびに、補助ペプチド鎖Y2(アミノ酸配列は配列30である);Y3(アミノ酸配列は配列31である);Y4(アミノ酸配列は配列32である);Y5(アミノ酸配列は配列33である);Y6(アミノ酸配列はIL15の配列であり、配列3に記載する);Y7(IL15Rアルファ−sushi、アミノ酸配列は配列4である);Y8(アミノ酸配列は配列34である);およびY9(アミノ酸配列は配列39である)。
ここで、
RaceCar−2は、主ペプチド鎖X2および補助ペプチド鎖Y1で構成され;
RaceCar−3は、主ペプチド鎖X2および補助ペプチド鎖Y2で構成され;
RaceCar−4は、主ペプチド鎖X1および補助ペプチド鎖Y3で構成され;
RaceCar−5は、主ペプチド鎖X1および補助ペプチド鎖Y4で構成され;
RaceCar−6は、主ペプチド鎖X3および補助ペプチド鎖Y1で構成され;
RaceCar−7は、主ペプチド鎖X4および補助ペプチド鎖Y1で構成され;
RaceCar−8は、主ペプチド鎖X5および補助ペプチド鎖Y9によって形成され;
RaceCar−9は、主ペプチド鎖X6および補助ペプチド鎖Y1で構成され;
RaceCar−10は、主ペプチド鎖X7および補助ペプチド鎖Y5で構成され;
RaceCar−11は、主ペプチド鎖X3および補助ペプチド鎖Y6で構成され;
RaceCar−12は、主ペプチド鎖X8および補助ペプチド鎖Y7で構成され;
RaceCar−13は、主ペプチド鎖X8および補助ペプチド鎖Y8で構成され;
RaceCar−14は、主ペプチド鎖X3および補助ペプチド鎖Y5で構成される。
RaceCar1と同じく、他のRaceCarについての発現ベクターを構築する場合、分泌リーダー配列(配列11)が、他のRaceCarの主ペプチド鎖のN末端配列の前に追加することが必要であり、ここで、2Aシグナルペプチドが、補助ペプチド鎖のアミノ酸配列の前に追加され、特異的なコード核酸配列は以下の通りである。
RaceCar2を発現する核酸配列は、DNA−X2(配列40)、AAGCTTおよびDNA−Y1(配列14)で構成され;
RaceCar3を発現するための核酸配列は、DNA−X2(配列40)、AAGCTTおよびDNA−Y2(配列47)で構成され;
RaceCar4を発現する核酸配列は、DNA−X1(配列13)、AAGCTTおよびDNA−Y3(配列48)で構成され;
RaceCar5を発現する核酸配列は、DNA−X1(配列13)、AAGCTTおよびDNA−Y4(配列49)で構成され;
RaceCar6を発現する核酸配列は、DNA−X3(配列41)、AAGCTTおよびDNA−Y1(配列14)で構成され;
RaceCar7を発現するための核酸配列は、DNA−X4(配列42)、AAGCTTおよびDNA−Y1(配列14)からなり;
RaceCar8を発現するための核酸配列は、DNA−X5(配列43)、AAGCTTおよびDNA−Y9(配列50)からなり;
RaceCar9を発現する核酸配列は、DNA−X6(配列44)、AAGCTTおよびDNA−Y1(配列14)で構成され;
RaceCar10を発現するための核酸配列は、DNA−X7(配列45)、AAGCTTおよびDNA−Y5(配列51)で構成され;
RaceCar11を発現するための核酸配列は、DNA−X3(配列41)、AAGCTTおよびDNA−Y6(配列52)で構成され;
RaceCar12を発現するための核酸配列は、DNA−X8(配列46)、AAGCTTおよびDNA−Y7(配列53)で構成され;
RaceCar13を発現するための核酸配列は、DNA−X8(配列46)、AAGCTTおよびDNA−Y8(配列54)で構成され;
RaceCar14を発現するための核酸配列は、DNA−X3(核酸配列41)、AAGCTTおよびDNA−Y5(配列51)で構成される。
他の多標的キメラ抗原受容体を発現するための核酸配列は、同様の方法で得られ、pFUGW−RaceCar−2からpFUGW−RaceCar−14の範囲の組換えベクターが構築される。組換えベクターにおいて、他の個々の多標的キメラ抗原受容体RaceCarに対する発現カセットが存在する(図3)。
pFUGW−RaceCar−2からpFUGW−RaceCar−14の範囲の組換えベクターは、pFUGWベクターのBamHIおよびEcoRI切断部位の間の断片の、それぞれ、RaceCar2からRaceCar14を発現するための核酸配列による置き換えに由来する。
(実施例2 細胞におけるRaceCar発現を確認するためのFACS分析)
1. 実施例4で得られたRaceCar−1−NK92細胞、RaceCar−2−NK92細胞、RaceCar−3−NK92細胞、RaceCar−4−NK92細胞、RaceCar−5−NK92細胞、RaceCar−6−NK92細胞、RaceCar−7−NK92細胞、RaceCar−9−NK92細胞、RaceCar−10−NK92細胞、RaceCar−11−NK92細胞、RaceCar−12−NK92細胞、RaceCar−13−NK92細胞、RaceCar−14−NK92細胞、RaceCar−1−T細胞、RaceCar−2−T細胞、RaceCar−3−T細胞、RaceCar−4−T細胞、RaceCar−5−T細胞、RaceCar−6−T細胞、RaceCar−7−T細胞、RaceCar−9−T細胞、RaceCar−10−T細胞、RaceCar−11−T細胞、RaceCar−12−T細胞、RaceCar−13−T細胞、RaceCar−14−T細胞を、それぞれ、PBS(リン酸緩衝食塩水)に懸濁させ、細胞の濃度を、1×10E/mlの範囲になるように制御する。
2. 1.5μlの抗hIL−15PEコンジュゲート(R&D、IC2471P)を、200μlの処理細胞に添加し、氷上で30分間インキュベートする。上清を遠心分離によって除去し、細胞を、等量のPBS(リン酸緩衝食塩水)を添加することによって再懸濁する。
3. 細胞表面で発現するRaceCarを検証するためのFACS分析(図4)。図中の水平の座標はIL15のレベルを表し、T細胞およびNK92細胞は、感染せず、陰性対照として使用され、表面でのIL15の発現は検出されなかった。IL15の異なるレベルの発現は、RaceCarウイルスで感染したT細胞およびNK92細胞の表面で検出することができる。IL15は、RaceCar(RaceCar−8、RaceCar−12およびRaceCar−13を除く)の補助ペプチド鎖中のドメイン分子であるので、IL−15は、これが細胞の表面で発現した主ペプチド鎖のドメインと結合した場合に、細胞の表面でのみ検出することができ、これは、RaceCarが、T細胞およびNK92細胞の表面で発現することができ、発現したIL15が免疫学的活性を有することを実証した。その一方で、IL15は、RaceCar−12およびRaceCar−13における主ペプチド鎖にあり、直接的に検出することができる。
(実施例3 ウエスタンブロットによって実証されたRaceCarの発現)
1. 1.2×10EのLenti−X−293T細胞(Clonetech、632180、本明細書の以下で、略して、293Tと称する)を6ウェルプレートに入れ、37℃の温度および5%のCOで、終夜培養する。
2. 上記1に記載の293T細胞を、lipofectamine3000を使用して、実施例1に列挙したpFUGW−RaceCar−1、pFUGW−RaceCar−2、pFUGW−RaceCar−6、pFUGW−RaceCar−7およびpFUGW−RaceCar−10のベクターで、それぞれトランスフェクトし、RaceCar−1−293T、RaceCar−2−293T、RaceCar−6−293T、RaceCar−7−293TおよびRaceCar−10−293Tと名付け、37℃の温度で、5%のCOで48時間培養する。
3. 5×10EのRaceCar−1−293T、RaceCar−2−293T、RaceCar−6−293T、RaceCar−7−293TおよびRaceCar−10−293Tを取り、1500Rで10分間遠心分離し、上清を廃棄した。
4. 200μlの細胞溶解液(Beyotime、Shanghai、P0013B)をそれぞれの細胞に添加し、氷上で30分間インキュベートした。細胞を8000gで5分間遠心分離した。それぞれの試料について20μlの上清を5倍のタンパク質電気泳動緩衝液と混合し、95℃で5分間インキュベーションして、電気泳動試料として使用した。
5. SDS−PAGE電気泳動を行い、ゲルを、100V、200mAで1時間、膜に移した。
6. タンパク質を移したPVDF(ポリフッ化ビニリデン)膜を、5%のPBSのスキムミルクで終夜ブロッキングした。膜を、シェーカーでPBSTを用いて各回15分間で、3回洗浄した。
7. 移したタンパク質を有するPVDFを、1%のスキムミルクのPBS溶液に溶解した0.1%の抗PD1抗体(R&D MAB1086−100)とともに、振とう条件で1時間、インキュベートした。膜を、PBSTを用いて、3回、それぞれ15分間洗浄した。
8. 洗浄した膜を、1%のスキムミルクのPBS溶液に溶解した0.1%のHRPコンジュゲート抗マウスIgG(H+L)抗体(Beyotime、Shanghai、A0216)とともに、振とう条件で1時間、インキュベートした。膜を、PBSTを用いて、3回、それぞれ15分間洗浄した。
9. 膜をW−TMBキット(Sangon Biotech、Shanghai、C510025−0005)で可視化し、結果を図5に示す。第1〜第5レーンの試料は、それぞれ、RaceCar−1−293T、RaceCar−2−293T、RaceCar−6−293T、RaceCar−7−293TおよびRaceCar−10−293Tに属し、トランスフェクションなしの陰性対照の293T細胞は第6レーンに位置する。下部の染色ラインは、ベータ−アクチン参照である。図5に示されるように、PD1染色としての特異的なラインをレーン1〜レーン5で見ることができ、RaceCarがトランスフェクトされた細胞の表面で十分に発現していたことを実証する。
(実施例4 pFUGW−RaceCarを有するレンチウイルスのパッケージングおよび細胞感染)
1. 例としてRaceCar−1を挙げ、293T細胞を、トランスフェクションのために70〜80%の密度まで終夜培養した。ウイルス殻タンパク質を提供するpCMV−VSV−g、pCMV−デルタR8.91(pCMV−VSV−GおよびpCMV−デルタR8.91はAddgeneの製品であった)を、実施例1で調製したpFUGW−RaceCar−1と、pCMV−VSV−g:pCMV−デルタR8.91:pFUGW−RaceCar−1=1:3:4の比に従って混合して、40μgの共トランスフェクションプラスミドを得た。
2. チューブ1と印をつけた15mlの遠心分離チューブに、上記1に記載の共トランスフェクションプラスミドを添加し、無血清DMEMを1.5mlまで添加し、チューブ2と印をつけた別の15mlの遠心分離チューブに、120μlのPEI溶液(Sigma、GF70215825、1mg/ml)を添加し、無血清DMEM(DMEM)を1.5mlまで添加した。チューブ1およびチューブ2の両方の試薬を、それぞれ、適切に混合した。次いで、チューブ1をボルテックスし、チューブ2中のPEIをチューブ1に1滴ずつ添加して、プラスミド−PEI混合物溶液を得て、溶液を、30分間室温に保ち、混合物を、細胞を懸濁させていないトランスフェクション用の293T培養物に添加した。トランスフェクトされた細胞を、37℃/COインキュベーター中で24時間培養した。次いで、細胞の培養培地を廃棄し、20mlの新たな10%FBS−DMEMを補充した。最後に、酪酸ナトリウムを、酪酸ナトリウムの最終濃度が10mMまで、添加した。細胞を、5%COのインキュベーター中、37℃で48時間さらに培養した。
3. 細胞培養上清を4000g/分で15分間遠心分離することによって収集し、上清を0.45ミクロンのフィルターを通して濾過して、1×10TU/mlのウイルス溶液を得た。元のウイルス溶液に、1/3容積の40%PEG溶液(g/g)を添加し、混合後、4℃の温度で終夜静置する。翌日、ウイルスの沈殿物を1800g、4℃で45分間遠心分離し、上清を廃棄した。ウイルス沈殿物を元の容積の1/10の培養培地(T細胞についてX−VIVO15、NK92細胞についてMEM−Alpha)で再懸濁して、10倍濃縮のウイルス懸濁物を得た。
4. 3×10のNK92細胞(ATCC、CRL−2407)および1×10のT細胞(健康な血液ドナーからのT細胞、勾配遠心分離によって分離、OKT3を使用することによって刺激および培養)を、それぞれ、1×10のウイルス粒子で感染させ、8μg/mlのポリブレン(Sigma、H9268−5G)を添加した。感染細胞を24ウェルプレートの1つのウェルに移し、1500R、32℃で45分間遠心分離した。プレートを、37℃、5%のCOで3時間インキュベートし、培地を、100U/mlのIL−2(T細胞のために、100ng/mlのOKT3が必要であった)を含有する培地で交換し、プレートを上記と同じ条件でインキュベートして、以下の実験のためのRaceCar−1−NK92およびRaceCar−1−Tを得た。
5. 上記の記載の方法と同じく、pFUGW−RaceCar−1ベクターのみを、pFUGW−RaceCar−2からpFUGW−RaceCar−14のうちの1つとそれぞれ置き換えて、対応する、RaceCar−2−NK92細胞、RaceCar−3−NK92細胞、RaceCar−4−NK92細胞、RaceCar−5−NK92細胞、RaceCar−6−NK92細胞、RaceCar−7−NK92細胞、RaceCar−8−NK92細胞、RaceCar−9−NK92細胞、RaceCar−10−NK92細胞、RaceCar−11−NK92細胞、RaceCar−12−NK92細胞、RaceCar−13−NK92細胞、RaceCar−14−NK92細胞、ならびにRaceCar−2−T細胞、RaceCar−3−T細胞、RaceCar−4−T細胞、RaceCar−5−T細胞、RaceCar−6−T細胞、RaceCar−7−T細胞、RaceCar−8−T細胞、RaceCar−9−T細胞、RaceCar−10−T細胞、RaceCar−11−T細胞、RaceCar−12−T細胞、RaceCar−13−T細胞およびRaceCar−14−T細胞を得た。
(実施例5 NK92におけるRaceCarの発現およびRaceCar−NK92の標的化死滅の確認)
1. 標的細胞の3m−CD19−lucを、CD19(配列36)およびルシフェラーゼ(配列37)の導入遺伝子をMalme−3M細胞(ATCC、HTB−64)のゲノムに組み込むことによって調製した。実験群を以下の通り分けた:1、実施例4を使用することによって調製した、エフェクター細胞として働くRaceCar−1−NK92;2、実施例4を使用することによって調製した、エフェクター細胞として働くRaceCar−2−NK92;3、実施例4を使用することによって調製した、エフェクター細胞として働くRaceCar−3−NK92;4、実施例4を使用することによって調製した、エフェクター細胞として働くRaceCar−4−NK92;5、実施例4を使用することによって調製した、エフェクター細胞として使用されるRaceCar−5−NK92;6、エフェクター細胞として使用されるNK92;7、エフェクター細胞として使用されるRaceCar−1−NK92;8、エフェクター細胞としてのRaceCar−2−NK92。抗CD19抗体(ビオチン標識化マウス抗ヒトCD19抗体、Beijing biodragonimmunetechnologies、Beijing、BDLS−1968−100)を群7および8に添加した後に、細胞毒性アッセイを行った。標的細胞のみを陰性対照群として使用した。
2. エフェクター細胞を、96ウェルプレート中で、100μl中の1×10標的細胞と、10:1、5:1、1:1の比で混合し、37℃で、5%のCOインキュベーター中、24時間インキュベートした。50μlの1%のTriton溶解物と1μlの基質(3:1の容積比での300μg/mLのLuc溶液および2mg/mLのATP溶液の混合物)をそれぞれのウェルに添加し、細胞を5分間溶解し、ルシフェラーゼの蛍光強度を検出した。死滅効率を以下の通り計算した。死滅効率={(陰性対照の蛍光値−実験群の蛍光値)/陰性対照の蛍光値}×100%。
3. 結果を図6に示す。RaceCar−1−NK92、RaceCar−2−NK92、RaceCar−3−NK92、RaceCar−4−NK92およびRaceCar−5−NK92は、NK92よりも効率的に3m−CD19−luc細胞を死滅させることができ、これは、CD19およびPD−L1を標的にする多標的キメラ抗原受容体のRaceCar−1がNK92細胞で発現し、生物学的機能を有していることを実証した。CD19抗体を添加した実験群では、標的細胞に対する抗CD19抗体がエフェクター細胞におけるCARの標的細胞への結合を遮断し、それによって死滅を阻害するので、RaceCar−1−NK92の死滅能力が減少した一方、RaceCar−2−NK92の死滅能力はほとんど変化しなかった。標的細胞に対するRaceCar−1−NK92の死滅能力は、RaceCar−NK92が3m−CD19−luc細胞の死滅に対して特異的であることを実証した。
(実施例6 T細胞におけるRaceCarの発現およびRaceCar−TおよびCar−Tの間の標的化死滅の比較)
1. k562−cd19−luc細胞株を、CD19抗原およびルシフェラーゼを発現させるために、CD19抗原をコードする核酸配列(配列36)およびルシフェラーゼをコードする核酸配列(配列37)をk562細胞株(ATCC)のゲノムに組み込むことによって得て、標的細胞として使用した。使用したエフェクター細胞は、実施例4で得られたRaceCar−1−T、RaceCar−4−TおよびRaceCar−5−Tであり、使用した対照のエフェクター細胞は、従来の抗CD19ScFv−CD8TM−41BB−CD3ζキメラ抗原受容体を発現するように上記に従ってT細胞へのウイルストランスフェクションによって得られたCar−T細胞(抗CD19ScFv−CD8TM−41BB−CD3ζキメラ抗原受容体、配列38)であり、エフェクター細胞の添加なしの標的細胞のみを細胞死滅実験のための陰性対照として使用した。
2. k562−cd19−luc細胞を、1×10細胞/ウェルで蒔き、エフェクター細胞を、エフェクター細胞の標的細胞に対する比が、それぞれ、5:1、10:1および20:1で添加した。24時間後、50μlの1%のTriton溶解物と1μlの基質(3:1の容積比での300μg/mLのLuc水溶液および2mg/mLのATP水溶液の混合物)を細胞に添加し、5分間溶解した。ルシフェラーゼのルミネセンスを、マイクロプレートリーダーによって検出して、死滅を計算した。効率={(陰性対照の蛍光値−実験群の蛍光値)/陰性対照の蛍光値}×100%。
結果を図7に示す。図において、横軸は、エフェクター細胞の標的細胞に対する比であり、縦軸は死滅効率である。RaceCar−1−T細胞、RaceCar−4−T細胞およびRaceCar−5−T細胞は、k562−cd19−luc細胞を死滅させることができることが分かり、これは、RaceCar−1、RaceCar−4−TおよびRaceCar−5−Tが、T細胞において発現し、生物学的機能を有すること、ならびにRaceCar−T細胞の死滅能力が、通常のCar−T細胞の死滅能力よりも高いことを実証する。
(実施例7 MHC/WT1を標的とする異なる種類のRaceCar−T細胞およびRaceCar−NK92細胞の細胞死滅)
1. BV173−luc細胞株を、ルシフェラーゼ(配列番号37)をコードする核酸配列を、GP100/MHC分子複合体を表面で発現し、かつ標的細胞としてのBV173細胞株(DSMZ、ACC20)のゲノムに組み込むことによって得た。使用したエフェクター細胞株は、実施例4で得られたRaceCar−6−NK92、RaceCar−7−NK92、RaceCar−8−NK92、RaceCar−9−NK92、RaceCar−10−NK92、RaceCar−11−NK92およびRaceCar−12−NK92であった。RaceCar−13−NK92、RaceCar−14−NK92およびRaceCar−6−T、RaceCar−7−T、RaceCar−8−T、RaceCar−9−T、RaceCar−10−T、RaceCar−11−T、RaceCar−12−T、RaceCar−13−T、RaceCar−14−T、対照のエフェクター細胞は、未感染のNK92細胞またはT細胞であり、細胞死滅実験を、陰性対照としてエフェクター細胞の添加なしで行った。
2. BV173−luc細胞を、1×10細胞/ウェルで蒔き、エフェクター細胞を、5:1の比で標的細胞に添加した。24時間後、50μlの1%のTriton溶解物と1μlの基質(300μg/mLのルシフェリン溶液および2mg/mLのATPを3:1の容積比で混合した)を細胞に添加し、5分間溶解した。ルシフェラーゼのルミネセンスを、マイクロプレートリーダーによって検出した。死滅効率={(陰性対照の蛍光値−実験群の蛍光値)/陰性対照の蛍光値}×100%。
結果を図8に示す。図において、横軸は、異なるエフェクター細胞であり、縦軸は死滅効率である。RaceCar−NK92細胞およびRaceCar−T細胞は両方ともBV173−luc細胞を死滅させることができ、効率は、未感染T細胞またはNK92細胞による効率よりも高いことが分かり、これは、RaceCar−6、RaceCar−7、RaceCar−8、RaceCar−9、RaceCar−10、RaceCar−11、RaceCar−12、RaceCar−13およびRaceCar−14が、NK92細胞またはT細胞において発現することができ、標的細胞を死滅させるために、エフェクター細胞を媒介する生物学的機能を有することを実証する。
(実施例8 免疫細胞の増殖に対するRaceCarの効果)
1. 実施例4で得られた1×10のRaceCar−1−T細胞およびRaceCar−2−T細胞を2.5mlのX−VIVO培地に置き、1×10のT細胞を2.5mlのX−VIVO培地に陰性対照として置いた。別の1×10のT細胞を、最終濃度100U/mlのIL−2を補充した2.5mLのX−VIVO培地に陽性対照として置いた。4群の細胞を37℃、5%COでインキュベートした。
2. 作業用溶液を、CSFE染料をDMSOに5μmol/L溶液として溶解することによって調製した。培養の開始および培養の5日目に、1×10細胞を4群の細胞から取り出し、CSFE染料を、CSFE作業用溶液:培地の容積比が1:2000の比に従って、各群の細胞に添加し、37℃で30分間インキュベートした。
3. 上清を、1000gで5分間の遠心分離によって廃棄し、細胞を、等容量のX−VIVO培地を使用して再懸濁させた。この手順を2回繰り返した。
4.CSFEで染色された細胞は、緑色の蛍光を有し、緑色の蛍光の強度は細胞の分裂につれて減少する。異なる世代の細胞は異なる蛍光シグナルを示す。FACSスペクトルを使用して、細胞の蛍光を分析した。図9において、0日目では、4群の細胞の蛍光シグナルは基本的に同じであることが分かった。T細胞群は陰性対照群であった。5日目のフロー検出の蛍光強度は、0日目の蛍光強度と比較して、基本的に変化していなかった。T細胞+IL2は陽性対照群であり、細胞は、5日目と0日目の間で異なる蛍光シグナルを示し、これにより、培養の5日の間に細胞が増殖したことを確認した。図に示されるように、RaceCar−1−TおよびRaceCar−2−Tの蛍光シグナルの分布は、5日目に、IL−2を有する陽性対照群のものと同様であり、RaceCar−1−TおよびRaceCar−2−TがIL2なしの培地中で正常に増殖することができることも実証する。全体の結果は、RaceCarがT細胞などの免疫細胞の増殖を促進する能力を有することを証明する。
本発明の実験は、本発明の多標的キメラ抗原受容体が、その2つの抗原結合ドメインによって異なる抗原と結合することができ、特異的な細胞の死滅を媒介することができ、治療標的化の精度を改善することもでき、単一の標的の発現のダウンレギュレーションによって引き起こされる疾患の再発を回避することができることを証明し;本発明の多標的キメラ抗原受容体は、その2つの抗原結合ドメインによって異なる抗原と結合することができ、免疫抑制シグナルを遮断することができ、抗原結合ドメインの1つが免疫チェックポイントタンパク質と関連する抗原と結合する場合、腫瘍を死滅する能力を改善することができる。本発明の多標的キメラ抗原受容体は、サイトカインおよびサイトカイン受容体の複合体を導入し、これは、サイトカインの機能を生じさせることができ、例えば、IL−15およびIL15Rα−sushiの複合体の導入は、T細胞およびNK細胞の増殖を刺激し、これらをサイトカイン依存性活性化から免除する。

Claims (27)

  1. 主ペプチド鎖および補助ペプチド鎖で構成される多標的キメラ抗原受容体であって、前記主ペプチド鎖が、抗原結合ドメインA、補助ペプチド鎖連結ドメインB、膜貫通ドメインCおよび細胞内シグナル伝達構造ドメインDからなり;前記補助ペプチド鎖が、主ペプチド鎖連結ドメインFを含み;前記抗原結合ドメインAが、抗原と結合する能力を有するポリペプチドであり;前記補助ペプチド鎖連結ドメインBが、互いに前記主ペプチド鎖連結ドメインFと結合することができ;前記補助ペプチド鎖連結ドメインBおよび前記主ペプチド鎖連結ドメインFが、互いに結合することができる、サイトカインおよび完全長の対応するサイトカイン受容体、またはサイトカインおよび対応するサイトカイン受容体断片であり;前記膜貫通ドメインCが、任意の膜結合性タンパク質の膜貫通領域または膜貫通タンパク質の膜貫通領域であり;前記細胞内シグナル伝達ドメインDが、一次シグナル伝達領域を含む、多標的キメラ抗原受容体。
  2. 前記補助ペプチド鎖が、抗原結合ドメインEをさらに含み;前記抗原結合ドメインEが、抗原結合機能を有するポリペプチドであり;前記抗原結合ドメインEおよび前記抗原結合ドメインAが、同一または相違し得る、請求項1に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  3. 前記細胞内シグナル伝達ドメインDが、共刺激シグナル伝達領域をさらに含む、請求項1または2に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  4. 抗原結合能力を有する前記ポリペプチドが、抗原と結合することが可能な抗体、抗原と結合することが可能なリガンドまたは抗原と結合する能力を有する受容体である、請求項2または3に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  5. 抗原と結合することが可能な前記抗体が、完全長抗体、抗体のFab、抗体のFc、scFv、VHH、抗体のVH、抗体のVLの完全長ポリペプチドまたは抗体のVLの部分断片であり;前記抗原結合リガンドまたは前記抗原結合受容体が、リガンドまたは受容体の完全長ポリペプチドまたは部分断片である、請求項4に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  6. 前記抗原結合ドメインAまたは前記抗原結合ドメインEによって結合される前記抗原が、細胞表面抗原またはペプチドを有するMHC分子のいずれかである、請求項2〜5のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  7. 前記抗原が、がん関連抗原であるか;あるいは、前記抗原が、脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がん、腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫、肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、子宮がんまたはこれらの任意の組合せに関する抗原である、請求項6に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  8. 前記抗原結合ドメインAおよび前記抗原結合ドメインEによって結合される前記抗原が、以下:CD123、CD19、CD20、CD22、CD37、ROR1、メソテリン、CD33/IL3Ra、c−Met、BCMA、PSMA、EGFRvIII、GD−2、NY−ESO−1、MAGEA3、β−ヒト絨毛性ゴナドトロピン、AFP、RAGE−1、MN−CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、hsp70−2、M−CSF、PSA、PAP、LAGE−la、p53、プロステイン、PSMA、Her2/neu、テロメラーゼ、PCTA−1、MAGE、ELF2M、IGF−I、IGF−II、IGF−I受容体、BCR−ABL、E2A−PRL、H4−RET、1GH−IGK、MYL−RAR、GP100、Mart1、TSP−180、MAGE−4、MAGE−5、MAGE−6、RAGE、p185erbB2、p180erbB−3、c−met、nm−23H1、TAG−72、CA 19−9、CA 72−4、CAM 17.1、NuMa、K−ras、β−カテニン、CDK4、Mum−1、p15、p16、43−9F、5T4、791Tgp72、β−HCG、BCA225、BTAA、CA 125、CA 15−3\CA 27.29\BCAA、CA 195、CA 242、CA−50、WT1、CD68、FGF−5、G250、EpCAM、MA−50、MG7−Ag、MOV 18、NB/70K、RCAS1、SDCCAG16、TA−90、TAAL6、TAG72、TLP、p53、Ras、TPS、エプスタインバーウイルス抗原EBVAならびにヒトパピローマウイルス(HPV)抗原E6およびE7、またはこれらの組合せであるか;あるいは前記抗原結合ドメインAおよび前記抗原結合ドメインEによって結合される前記抗原が、MHCおよび上述のいずれか1つの抗原の短いペプチドの複合体である、請求項2〜7のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  9. 前記抗原結合ドメインAおよび前記抗原結合ドメインEによって結合される前記抗原が、CD19、CD20、BCMA、CD22、CD33/IL3Ra、Her2、PDL1、NY−ESO−1、GP100、Mart1、WT1、またはこれらの任意の組合せであるか;あるいは前記抗原結合ドメインAおよび前記抗原結合ドメインEによって結合される前記抗原が、MHCおよび上記の抗原の1つの短いペプチドの複合体である、請求項8に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  10. 前記サイトカインおよび前記対応するサイトカイン受容体が、γcサイトカインファミリーにおけるサイトカインおよび対応するサイトカインならびにその受容体である、請求項1〜9のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  11. γcサイトカインファミリーにおける前記サイトカインおよび前記対応するサイトカイン受容体が、IL15およびIL15Rα、IL4およびIL4Rα、またはIL2およびIL2Rαであるか;あるいはγcサイトカインファミリーにおける前記サイトカインおよび前記対応するサイトカイン受容体が、IL15およびIL15Rα、IL4およびIL4Rα、IL2またはIL2Rαと75%より高い相同性を有するポリペプチドである、請求項10に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  12. 前記一次シグナル伝達領域が、以下のタンパク質の1つ、または複数の以下のタンパク質の任意の組合せのシグナル伝達領域:CD3−ζ、FcεRIγ、FcRγ、FcRβ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79bおよびCD66dであるか;あるいは前記一次シグナル伝達領域が、配列6で示されるCD3−ζシグナル伝達領域のアミノ酸配列を有するCD3−ζシグナル伝達領域、または配列6で示されるCD3−ζシグナル伝達領域と75%より高い相同性を有するポリペプチドである、請求項1〜11のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  13. 前記共刺激シグナル伝達領域が、以下:CD27、CD28、4−1BB(CD137)、OX40、CD30、CD40、PD−1、ICOS、リンパ球機能関連抗原−1、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7−H3、およびCD83と特異的に結合するシグナル伝達領域の分子のうちの1つまたは複数の任意の組合せであるか、あるいは前記共刺激シグナル伝達領域が、特に、アミノ酸配列7のCD28シグナル伝達領域またはアミノ酸配列8の4−1BBシグナル伝達領域の1つまたは両方の組合せであるか;あるいは、前記共刺激シグナル伝達領域が、CD28シグナル伝達領域および4−1BBシグナル伝達領域のそれぞれと75%より高い相同性を有する2つのポリペプチドの1つまたは組合せである、請求項3〜12のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  14. 前記多標的キメラ抗原受容体において、前記抗原結合ドメインAまたはEが、抗CD19−ScFv、抗MHC/GP100−VHH、抗MHC/WT1−VH、抗CD20−ScFv、抗CD22−ScFvまたはPD1細胞外領域の1つまたは両方の組合せであり;前記補助ペプチド鎖連結ドメインが、IL15Rαsushi、IL4Rα−N−FN3、IL15またはIL4であり;前記膜貫通ドメインが、CD8の膜貫通領域またはCD28の膜貫通領域であり;前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζシグナル伝達領域、CD3ζシグナル伝達領域および4−1BBシグナル伝達領域が融合することによって得られるポリペプチド、またはCD3ζシグナル伝達領域がCD28シグナル伝達領域と融合することによって得られるポリペプチドであり;前記主ペプチド鎖連結ドメインが、IL15、IL4、IL15RαsushiまたはIL4RαもしくはN−FN3であるか;あるいは、前記多標的キメラ抗原受容体において、前記抗原結合ドメインAが、抗CD19−ScFvであり;前記補助ペプチド鎖連結ドメインが、IL15Rαsushiであり;前記膜貫通ドメインが、CD8の膜貫通領域であり;前記細胞内シグナル伝達ドメインが、CD3ζシグナル伝達領域が4−1BB(CD137)シグナル伝達領域と融合することによって得られるポリペプチドであり;前記抗原結合ドメインEが、PD1の細胞外領域であり;前記主ペプチド鎖連結ドメインが、IL15である、請求項2〜12のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  15. 前記抗CD19−ScFvのアミノ酸配列が、配列1であり;前記抗MHC/GP100−VHHのアミノ酸配列が、配列15であり;抗MHC/Mart1−VHHのアミノ酸配列が、配列16であり;前記抗CD20−ScFvのアミノ酸配列が、配列17であり;前記抗CD22−ScFvのアミノ酸配列が、配列18であり;前記抗MHC/WT1−VHのアミノ酸配列が、配列19であり;PD1の細胞外領域のアミノ酸配列が、配列2であり;IL15Rαsushiのアミノ酸配列が、配列4であり;前記IL4Rα−N−FN3のアミノ酸配列が、配列20であり;CD8の膜貫通領域のアミノ酸配列が、配列5であり;CD28の膜貫通領域のアミノ酸配列が、配列22であり;前記CD3ζシグナル伝達領域のアミノ酸配列が、配列6であり;4−1BBシグナル伝達領域のアミノ酸配列が、配列8であり;CD28シグナルのアミノ酸配列が、配列7であり;IL15のアミノ酸配列が、配列3であり;IL4のアミノ酸配列が、配列21である、請求項14に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  16. 前記多標的キメラ抗原受容体の前記主ペプチド鎖のアミノ酸配列が、配列9、配列23、配列24、配列25、配列26、配列27、配列28または配列29の1つであり;前記受容体の前記補助ペプチド鎖のアミノ酸配列が、配列3、配列4、配列10、配列30、配列31、配列32、配列33または配列34の1つである、請求項1〜15のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体。
  17. 主ペプチド鎖をコードする核酸分子および補助ペプチド鎖をコードする核酸分子で構成される、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体をコードする核酸分子。
  18. 組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞または組換えウイルスに含まれる、請求項17に記載の核酸分子。
  19. 前記細胞が、原核細胞、酵母細胞もしくは哺乳動物細胞であるか;または前記哺乳動物細胞が、特に、ヒト細胞であるか;または前記ヒト細胞が、特に、免疫細胞であるか;あるいは前記免疫細胞が、特に、T細胞もしくはNK細胞である、請求項18に記載の細胞。
  20. 請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項16、17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞または組換えウイルス、組換えプラスミドを含む、キット。
  21. 免疫療法の適用のための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換えプラスミド、細胞もしくは組換えウイルスまたは請求項20に記載のキットの使用;あるいは、免疫療法製品の調製のための、請求項1〜16のいずれかに記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  22. 免疫細胞を培養するため、および/または免疫細胞の増殖を促進するための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換えプラスミド、細胞もしくは組換えウイルスまたは請求項20に記載のキットの使用;あるいは、免疫細胞の培養の調製の製品のため、および/または免疫細胞の増殖を促進するための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  23. イムノアッセイの適用のための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換えプラスミド、細胞もしくは組換えウイルスまたは請求項20に記載のキットの使用;あるいは、免疫検出製品の調製のための、請求項1〜16のいずれかに記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  24. 腫瘍の処置または検出のための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルスまたは請求項20に記載のキットの使用;あるいは、腫瘍治療製品または腫瘍検出製品の調製のための、請求項1〜16のいずれかに記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  25. 腫瘍細胞を阻害または死滅させる適用のための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、請求項20に記載のキットの使用;あるいは、腫瘍細胞を阻害または死滅させるための製品の調製のための、請求項1〜16のいずれかに記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、細胞もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  26. 言及した抗原を発現する標的細胞を阻害または死滅させるための、請求項1〜19のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、または請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、トランスジェニック細胞もしくは組換えウイルス、請求項20に記載のキットの使用;あるいは、前記抗原を阻害または死滅させるための標的細胞製品の調製における使用のための、請求項1〜16のいずれか一項に記載の多標的キメラ抗原受容体、請求項17に記載の核酸分子、請求項18に記載の組換えベクター、発現カセット、組換え微生物株、トランスジェニック細胞、もしくは組換えウイルス、または請求項20に記載のキットの使用。
  27. 前記免疫療法が、免疫細胞によって腫瘍細胞を阻害または死滅させるためであるか;あるいは前記免疫細胞が、T細胞またはNK細胞であるか;あるいは前記抗原が、がん関連抗原であるか;あるいは前記抗原が、脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がん、腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫、肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、子宮がんに関する抗原またはこれらの任意の組合せであるか;前記腫瘍が、脳がん、膀胱がん、乳がん、子宮頸がん、結腸直腸がん、肝臓がん、腎臓がん、リンパ腫、白血病、肺がん、メラノーマ、転移性メラノーマ、中皮腫、神経芽細胞腫、卵巣がん、前立腺がん、膵臓がん、腎臓がん、皮膚がん、胸腺腫、肉腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、子宮がん、またはこれらの1つもしくは任意の組合せであるか;あるいは前記標的細胞が、原核細胞、酵母細胞または哺乳動物細胞であるか;あるいは特に、前記哺乳動物細胞が、ヒト細胞であるか;あるいは特に、ヒト細胞が、前記免疫細胞であるか;あるいは免疫細胞が、T細胞またはNK細胞である、請求項21〜26のいずれか一項に記載の使用。
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