JP2020514701A5 - - Google Patents
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Description
本発明の好ましい実施態様が示され、記載されているが、当業者には、それらに添付の特許請求の範囲を超えない修正がなされてもよいことが容易に明らかである。したがって、本発明の範囲は、以下の特許請求の範囲によってのみ限定される。特許請求の範囲で列挙される参照番号は、例示的且つ特許事務所のレビューを容易にするためだけのものであり、決して限定的ではない。いくつかの実施態様において、この特許出願に提示される図は、角度、寸法比等を含め、縮尺通りに描かれている。いくつかの実施態様において、図は代表的であるのみであり、特許請求の範囲は図の寸法により制限されない。いくつかの実施態様において、語句「含む」を使用する本明細書に記載される発明の説明は、「から成る」として記載することのできる実施態様を含み、したがって、用語「から成る」を使用する本発明の一又は複数の実施態様を主張するためのそのような書面の説明要件が満たされる。
<さらなる実施態様>
[実施態様1]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様2]
試料が組織試料である、実施態様1に記載の方法。
[実施態様3]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様2に記載の方法。
[実施態様4]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様1−3のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様5]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様4に記載の方法。
[実施態様6]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様1−5のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様7]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様6に記載の方法。
[実施態様8]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様6又は7に記載の方法。
[実施態様9]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様1−8のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様10]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様1−9のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様11]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様10に記載の方法。
[実施態様12]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様1−11のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様13]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様1−12のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様14]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様13に記載の方法。
[実施態様15]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様1−14のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様16]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様15に記載の方法。
[実施態様17]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様1−16のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様18]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様1−17のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様19]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様1−18のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様20]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的なポリクローナル第2結合剤を適用することであって、ポリクローナル第2結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様21]
試料が組織試料である、実施態様20に記載の方法。
[実施態様22]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様21に記載の方法。
[実施態様23]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様20−22のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様24]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様23に記載の方法。
[実施態様25]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様20−24のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様26]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様25に記載の方法。
[実施態様27]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様25又は26に記載の方法。
[実施態様28]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様20−27のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様29]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様20−28のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様30]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様29に記載の方法。
[実施態様31]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様20−30のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様32]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様20−31のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様33]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様32に記載の方法。
[実施態様34]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様20−33のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様35]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様34に記載の方法。
[実施態様36]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様20−35のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様37]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様20−36のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様38]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様20−37のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様39]
a.組織試料を脱パラフィン化試薬で処理すること;
b.組織試料を抗原回復試薬で処理すること;
c.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を組織試料に適用すること;
d.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
e.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
f.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
g.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様40]
標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を適用する前に、組織試料をプロテアーゼで処理することを更に含む、実施態様39に記載の方法。
[実施態様41]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様39又は40に記載の方法。
[実施態様42]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様41に記載の方法。
[実施態様43]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様39−42のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様44]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様43に記載の方法。
[実施態様45]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様43又は44に記載の方法。
[実施態様46]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様39−45のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様47]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様39−46のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様48]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様47に記載の方法。
[実施態様49]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様39−48のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様50]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様39−49のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様51]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様50に記載の方法。
[実施態様52]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様39−51のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様53]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様52に記載の方法。
[実施態様54]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様39−53のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様55]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様39−54のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様56]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様39−55のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様57]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーを検出するための定量的免疫組織化学(IHC)の方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様58]
試料が組織試料である、実施態様57に記載の方法。
[実施態様59]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様58に記載の方法。
[実施態様60]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様57−59のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様61]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様60に記載の方法。
[実施態様62]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様57−61のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様63]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様62に記載の方法。
[実施態様64]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様62又は63に記載の方法。
[実施態様65]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様57−64のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様66]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様57−65のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様67]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様66に記載の方法。
[実施態様68]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様57−67のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様69]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様57−68のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様70]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様69に記載の方法。
[実施態様71]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様57−70のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様72]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様71に記載の方法。
[実施態様73]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様57−72のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様74]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様57−73のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様75]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様57−74のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様76]
a.分泌標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の分泌標的タンパク質バイオマーカーの定量的免疫組織化学(IHC)の方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが分泌標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様77]
試料が組織試料である、実施態様76に記載の方法。
[実施態様78]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様77に記載の方法。
[実施態様79]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様76−78のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様80]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様79に記載の方法。
[実施態様81]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様76−80のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様82]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様81に記載の方法。
[実施態様83]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様81又は82に記載の方法。
[実施態様84]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様76−83のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様85]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様76−84のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様86]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様85に記載の方法。
[実施態様87]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様76−86のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様88]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様76−87のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様89]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様88に記載の方法。
[実施態様90]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様76−89のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様91]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様90に記載の方法。
[実施態様92]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様76−91のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様93]
2つ以上の分泌標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様76−92のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様94]
分泌標的タンパク質バイオマーカー及び1つ以上の更なる標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重IHCアッセイを可能にする、実施態様76−93のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様95]
自動化されている、実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様96]
自動染色機で実行される、実施態様1−95のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様97]
手動である、実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様98]
実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法を実行するための自動染色機。
[実施態様99]
プロセッサに接続されたメモリを備える自動染色装置であって、メモリが、プロセッサによって実行されると、実施態様1−75のいずれか一項に記載の方法のための動作を自動染色装置に実行させるコンピュータ可読命令を記憶する、自動染色装置。
[実施態様100]
実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法を実行するための、スライドホルダー、試薬及びディスペンサーを備える自動システム。
[実施態様101]
プロセッサに接続されたメモリを備えるシステムを更に含み、メモリが、プロセッサによって実行されると、実施態様1−66のいずれか一項に記載の方法のための動作を自動システムに実行させるコンピュータ可読命令を記憶する、実施態様100に記載のシステム。
[実施態様102]
ディスペンサーがスライドホルダー内のスライド上に試薬を分配するように適合されている、実施態様100又は101に記載のシステム。
[実施態様103]
a.患者の腫瘍から組織切片を調製すること;
b.実施態様1−97のいずれか一項に記載の標的タンパク質バイオマーカーについて組織切片を組織化学的に染色することであって、標的タンパク質バイオマーカーは点状ドットとして現れる、染色すること、
c.(b)の染色された組織切片のデジタル画像を取得すること;
d.染色された組織切片中の対象領域(ROI)を同定し、標的タンパク質バイオマーカーに対応するROI中の点状ドットを定量すること;
e.定量化された点状ドットに所定のスコアリング関数を適用すること
を含むワークフロー方法。
[実施態様104]
a.実施態様1−97のいずれか一項に記載の第2の標的タンパク質バイオマーカーについて組織切片を染色することであって、標的タンパク質バイオマーカーは点状ドットとして現れる、染色すること
b.(a)の染色された組織切片のデジタル画像を取得すること;
c.染色された組織切片中の対象領域(ROI)を同定し、標的タンパク質バイオマーカー及び第2の標的タンパク質バイオマーカーに対応するROI中の点状ドットを定量すること;
d.定量化された点状ドットに所定のスコアリング関数を適用すること
を更に含む、実施態様103に記載の方法。
<さらなる実施態様>
[実施態様1]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様2]
試料が組織試料である、実施態様1に記載の方法。
[実施態様3]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様2に記載の方法。
[実施態様4]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様1−3のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様5]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様4に記載の方法。
[実施態様6]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様1−5のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様7]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様6に記載の方法。
[実施態様8]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様6又は7に記載の方法。
[実施態様9]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様1−8のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様10]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様1−9のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様11]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様10に記載の方法。
[実施態様12]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様1−11のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様13]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様1−12のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様14]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様13に記載の方法。
[実施態様15]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様1−14のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様16]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様15に記載の方法。
[実施態様17]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様1−16のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様18]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様1−17のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様19]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様1−18のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様20]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的なポリクローナル第2結合剤を適用することであって、ポリクローナル第2結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様21]
試料が組織試料である、実施態様20に記載の方法。
[実施態様22]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様21に記載の方法。
[実施態様23]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様20−22のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様24]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様23に記載の方法。
[実施態様25]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様20−24のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様26]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様25に記載の方法。
[実施態様27]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様25又は26に記載の方法。
[実施態様28]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様20−27のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様29]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様20−28のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様30]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様29に記載の方法。
[実施態様31]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様20−30のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様32]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様20−31のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様33]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様32に記載の方法。
[実施態様34]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様20−33のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様35]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様34に記載の方法。
[実施態様36]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様20−35のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様37]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様20−36のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様38]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様20−37のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様39]
a.組織試料を脱パラフィン化試薬で処理すること;
b.組織試料を抗原回復試薬で処理すること;
c.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を組織試料に適用すること;
d.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
e.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
f.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
g.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様40]
標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を適用する前に、組織試料をプロテアーゼで処理することを更に含む、実施態様39に記載の方法。
[実施態様41]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様39又は40に記載の方法。
[実施態様42]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様41に記載の方法。
[実施態様43]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様39−42のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様44]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様43に記載の方法。
[実施態様45]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様43又は44に記載の方法。
[実施態様46]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様39−45のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様47]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様39−46のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様48]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様47に記載の方法。
[実施態様49]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様39−48のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様50]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様39−49のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様51]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様50に記載の方法。
[実施態様52]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様39−51のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様53]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様52に記載の方法。
[実施態様54]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様39−53のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様55]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様39−54のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様56]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様39−55のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様57]
a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーを検出するための定量的免疫組織化学(IHC)の方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様58]
試料が組織試料である、実施態様57に記載の方法。
[実施態様59]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様58に記載の方法。
[実施態様60]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様57−59のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様61]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様60に記載の方法。
[実施態様62]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様57−61のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様63]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様62に記載の方法。
[実施態様64]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様62又は63に記載の方法。
[実施態様65]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様57−64のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様66]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様57−65のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様67]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様66に記載の方法。
[実施態様68]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様57−67のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様69]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様57−68のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様70]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様69に記載の方法。
[実施態様71]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様57−70のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様72]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様71に記載の方法。
[実施態様73]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様57−72のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様74]
2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様57−73のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様75]
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、実施態様57−74のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様76]
a.分泌標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の分泌標的タンパク質バイオマーカーの定量的免疫組織化学(IHC)の方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが分泌標的タンパク質バイオマーカーを示している方法。
[実施態様77]
試料が組織試料である、実施態様76に記載の方法。
[実施態様78]
組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料である、実施態様77に記載の方法。
[実施態様79]
標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様76−78のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様80]
翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、実施態様79に記載の方法。
[実施態様81]
バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含む、実施態様76−80のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様82]
一次抗体が天然の未修飾抗体である、実施態様81に記載の方法。
[実施態様83]
一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルである、実施態様81又は82に記載の方法。
[実施態様84]
第2の結合剤が二次抗体を含む、実施態様76−83のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様85]
二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含む、実施態様76−84のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様86]
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含む、実施態様85に記載の方法。
[実施態様87]
チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、実施態様76−86のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様88]
第3の結合剤が三次抗体を含む、実施態様76−87のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様89]
三次抗体がモノクローナル抗体を含む、実施態様88に記載の方法。
[実施態様90]
検出可能部分が銀又はチラミドローダミン染料を含む、実施態様76−89のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様91]
チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、実施態様90に記載の方法。
[実施態様92]
検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、実施態様76−91のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様93]
2つ以上の分泌標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、実施態様76−92のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様94]
分泌標的タンパク質バイオマーカー及び1つ以上の更なる標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重IHCアッセイを可能にする、実施態様76−93のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様95]
自動化されている、実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様96]
自動染色機で実行される、実施態様1−95のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様97]
手動である、実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法。
[実施態様98]
実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法を実行するための自動染色機。
[実施態様99]
プロセッサに接続されたメモリを備える自動染色装置であって、メモリが、プロセッサによって実行されると、実施態様1−75のいずれか一項に記載の方法のための動作を自動染色装置に実行させるコンピュータ可読命令を記憶する、自動染色装置。
[実施態様100]
実施態様1−94のいずれか一項に記載の方法を実行するための、スライドホルダー、試薬及びディスペンサーを備える自動システム。
[実施態様101]
プロセッサに接続されたメモリを備えるシステムを更に含み、メモリが、プロセッサによって実行されると、実施態様1−66のいずれか一項に記載の方法のための動作を自動システムに実行させるコンピュータ可読命令を記憶する、実施態様100に記載のシステム。
[実施態様102]
ディスペンサーがスライドホルダー内のスライド上に試薬を分配するように適合されている、実施態様100又は101に記載のシステム。
[実施態様103]
a.患者の腫瘍から組織切片を調製すること;
b.実施態様1−97のいずれか一項に記載の標的タンパク質バイオマーカーについて組織切片を組織化学的に染色することであって、標的タンパク質バイオマーカーは点状ドットとして現れる、染色すること、
c.(b)の染色された組織切片のデジタル画像を取得すること;
d.染色された組織切片中の対象領域(ROI)を同定し、標的タンパク質バイオマーカーに対応するROI中の点状ドットを定量すること;
e.定量化された点状ドットに所定のスコアリング関数を適用すること
を含むワークフロー方法。
[実施態様104]
a.実施態様1−97のいずれか一項に記載の第2の標的タンパク質バイオマーカーについて組織切片を染色することであって、標的タンパク質バイオマーカーは点状ドットとして現れる、染色すること
b.(a)の染色された組織切片のデジタル画像を取得すること;
c.染色された組織切片中の対象領域(ROI)を同定し、標的タンパク質バイオマーカー及び第2の標的タンパク質バイオマーカーに対応するROI中の点状ドットを定量すること;
d.定量化された点状ドットに所定のスコアリング関数を適用すること
を更に含む、実施態様103に記載の方法。
Claims (15)
- a.標的タンパク質バイオマーカーに特異的なバイオマーカー特異的薬剤を試料に適用すること;
b.試料にバイオマーカー特異的薬剤に特異的な第2の結合剤を適用することであって、第2の結合剤は二次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;
c.試料に、チラミドハプテンとコンジュゲートしたチラミド分子を含むチラミド剤を適用することであって、二次酵素が第2の結合剤の位置でチラミドハプテンの試料への付着を触媒する、適用すること;
d.試料にチラミドハプテンに特異的な第3の結合剤を適用することであって、第3の結合剤は三次酵素とコンジュゲートされる、適用すること;及び
e.試料に検出可能部分を適用することであって、三次酵素が検出可能部分との反応を触媒して検出可能部分を可視化する、適用すること;
を含む、試料中の標的タンパク質バイオマーカーに対するシグナルを増幅する方法であって、それによって検出可能部分が明視野顕微鏡法を用いて点状ドットとして可視化され、点状ドットが標的タンパク質バイオマーカーを示しており、且つ
検出可能部分がチラミドローダミン染料を含む、方法。 - 試料が組織試料であり、組織試料がホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)組織試料であってもよい、請求項1に記載の方法。
- 標的タンパク質バイオマーカーがタンパク質、炭水化物、核酸、脂質、翻訳後修飾又はこれらの組み合わせを含むか、又は
標的タンパク質バイオマーカーが分泌分子である、請求項1又は2に記載の方法。 - 翻訳後修飾がリン酸修飾、ゲラニル修飾、アセチル修飾、ユビキチン修飾、炭水化物修飾、カルバミル修飾又はこれらの組み合わせを含む、請求項3に記載の方法。
- バイオマーカー特異的薬剤が一次抗体を含み、
一次抗体が天然の未修飾抗体であってもよく及び/又は一次抗体がモノクローナル又はポリクローナルであってもよい、請求項1−4のいずれか一項に記載の方法。 - 第2の結合剤が二次抗体を含む、請求項1−5のいずれか一項に記載の方法。
- 二次酵素がオキシドレダクターゼ、ヒドロラーゼ又はペルオキシダーゼを含み、
ペルオキシダーゼがホースラディッシュペルオキシダーゼ(HRP)を含んでもよい、請求項1−6のいずれか一項に記載の方法。 - チラミドハプテンがビオチン、ジゴキシゲニン(DIG)、ニトロピラゾール(NP)、ベンゾフラザン(BF)、ベンゾダザピン(BD)、ニトロシンアミド(NCA)又はジニトロフェニル(DNP)を含む、請求項1−7のいずれか一項に記載の方法。
- 第3の結合剤が三次抗体を含み、
三次抗体がモノクローナル抗体を含んでもよい、請求項1−8のいずれか一項に記載の方法。 - チラミドローダミン染料がローダミン110、ローダミン6G、テトラメチルローダミン(TAMRA)、スルホローダミンB、スルホローダミン101(テキサスレッド)又はこれらの組み合わせを含む、請求項1−9のいずれか一項に記載の方法。
- 検出可能部分がDAB、4−ニトロフェニルホスフェート(pNPP)、ファストレッド、ブロモクロロインドリルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、BCIP/NBT、ファストレッド、APオレンジ、APブルー、テトラメチルベンジジン(TMB)、2,2’−アジノ−ジ−[3−エチルベンゾチアゾリンスルホネート](ABTS)、o−ジアニシジン、4−クロロナフトール(4−CN)、ニトロフェニル−β−D−ガラクトピラノシド(ONPG)、o−フェニレンジアミン(OPD)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトピラノシド(X−Gal)、メチルウンベリフェリル−β−D−ガラクトピラノシド(MU−Gall)、p−ニトロフェニル−α−D−ガラクトピラノシド(PNP)、5−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−D−グルクロニド(X−Gluc)、3−アミノ−9−エチルカルバゾール(AEC)、フクシン、ヨードニトロテトラゾリウム(INT)、テトラゾリウムブルー又はテトラゾリウムバイオレットを含む、請求項1−10のいずれか一項に記載の方法。
- 2つ以上の標的タンパク質バイオマーカーが検出及び識別される多重免疫組織化学(IHC)アッセイに適用される、請求項1−11のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項1−12のいずれか一項に記載の方法を実行するための、スライドホルダー、試薬及びディスペンサーを備える自動システム。
- プロセッサに接続されたメモリを備えるシステムを更に含み、メモリが、プロセッサによって実行されると、請求項1−12のいずれか一項に記載の方法のための動作を自動システムに実行させるコンピュータ可読命令を記憶する、請求項13に記載のシステム。
- ディスペンサーがスライドホルダー内のスライド上に試薬を分配するように適合されている、請求項13又は14に記載のシステム。
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