JP2019512573A - ポリフルオレノ[4,5−cde]オキセピンコンジュゲート及び分析物検出方法におけるそれらの使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、全ての目的のために参照により全体が本明細書に組み込まれる、2016年8月19日出願の米国仮特許出願第62/376,941号及び2016年3月28日出願の米国仮特許出願第62/313,977号の優先権を主張するものである。
本発明は、概して、蛍光ポリマーコンジュゲート及び分析物の検出方法におけるそれらの使用に関する。
式Aのモノマー
(式中、Xが、ポリマー中のモノマーA単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが6〜100である)、
式Bのモノマー
(式中、Yが、ポリマー中のモノマーB単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜99である)、及び
式Cのモノマー
(式中、Zが、ポリマー中のモノマーC単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜99である)
からなる群から選択され、式中、XのY+Zに対する比率が1超であり、X+Y+Zの合計が10超であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSである、ポリマーを提供する。いくつかの実施形態では、水溶性基は、PEG基、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキル基から選択される。生物学的基質(BS)は、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり得る。リンカーは、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含む。特定の実施形態では、本明細書に記載のポリマーは、それに結合した生物学的基質を欠く。代わりに、特定の実施形態では、生物学的基質を欠く本明細書に記載のポリマーは、R1、R2、R3、R4、R5、R6、SG1、SG2、SG3、SG4、SG5、SG6、HG1、またはHG2のうちの1つ以上でコンジュゲートされるか、またはさもなければ付加される1つ以上の生物学的基質を含むように修飾され得る。特定の実施形態では、ポリマーがL−BSを含む場合、BSのポリマーに対する比率は、0.2〜3である。
式Dのモノマー
(式中、Wが、ポリマー中のモノマーD単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが6〜100である)、
式Eのモノマー
(式中、Xが、ポリマー中のモノマーE単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜98である)、
式Fのモノマー
(式中、Yが、ポリマー中のモノマーF単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20であり、フルオロフォア(FP)が蛍光色素であり、例示の蛍光色素が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、蛍光量子収率が5%を超える)、及び
式Gのモノマー
(式中、Zが、ポリマー中のモノマーG単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜98である)
からなる群から選択され、式中、WのX+Y+Zに対する比率が1超であり、W+X+Y+Zの合計が10超であり、FPが、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超えるフルオロフォアまたは蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSである、ポリマーを提供する。いくつかの実施形態では、水溶性基は、PEG基、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキル基から選択される。生物学的基質(BS)は、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり得る。リンカーは、アルキル、PEG、カルボキサミド、及びFP基、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含む。特定の実施形態では、本明細書に記載のポリマーは、それに結合した生物学的基質を欠く。代わりに、特定の実施形態では、生物学的基質を欠く本明細書に記載のポリマーは、R1、R2、R3、R4、R5、R6、SG1、SG2、SG3、SG4、SG5、SG6、SG7、HG1、またはHG2のうちの1つ以上でコンジュゲートされるか、またはさもなければ付加される1つ以上の生物学的基質を含むように修飾され得る。特定の実施形態では、ポリマーがL−BSを含む場合、BSのポリマーに対する比率は、0.2〜3である。
式Hのモノマー
(式中、Xが、ポリマー中のモノマーH単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である)、
式Iのモノマー
(式中、Yが、ポリマー中のモノマーI単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜100である)、及び
式Jのモノマー
(式中、Zが、ポリマー中のモノマーJ単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である)
からなる群から選択され、式中、X+Y+Zの合計が10超であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSである、ポリマーを提供する。いくつかの実施形態では、水溶性基は、PEG基、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキル基から選択される。生物学的基質(BS)は、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり得る。リンカーは、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含む。特定の実施形態では、本明細書に記載のポリマーは、それに結合した生物学的基質を欠く。代わりに、特定の実施形態では、生物学的基質を欠く本明細書に記載のポリマーは、R1、R2、R3、R4、SG1、SG2、SG3、SG4、SG5、SG6、HG1、またはHG2のうちの1つ以上でコンジュゲートされるか、またはさもなければ付加される1つ以上の生物学的基質を含むように修飾され得る。特定の実施形態では、ポリマーがL−BSを含む場合、BSのポリマーに対する比率は、0.2〜3である。
式Kのモノマー
(式中、Wが、ポリマー中のモノマーK単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが0〜100である)、
式Lのモノマー
(式中、Xが、ポリマー中のモノマーL単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である)、
式Mのモノマー
(式中、Yが、ポリマー中のモノマーM単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20であり、フルオロフォア(FP)が蛍光色素であり、例示の蛍光色素が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、蛍光量子収率が5%を超える)、及び
式Nのモノマー
(式中、Zが、ポリマー中のモノマーN単位の数であり、モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である)
からなる群から選択され、式中、W+X+Y+Zの合計が10超であり、フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSである、ポリマーを提供する。いくつかの実施形態では、水溶性基は、PEG基、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキル基から選択される。生物学的基質(BS)は、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり得る。リンカーは、アルキル、PEG、カルボキサミド、FP基、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含む。特定の実施形態では、本明細書に記載のポリマーは、それに結合した生物学的基質を欠く。代わりに、特定の実施形態では、生物学的基質を欠く本明細書に記載のポリマーは、R1、R2、R3、R4、SG1、SG2、SG3、SG4、SG5、SG6、SG7、HG1、またはHG2のうちの1つ以上でコンジュゲートされるか、またはさもなければ付加される1つ以上の生物学的基質を含むように修飾され得る。特定の実施形態では、ポリマーがL−BSを含む場合、BSのポリマーに対する比率は、0.2〜3である。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したA、B、及びCで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
xが6〜100の整数であり、y及びzが各々、0〜99から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式I内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x/(y+z)の比率が1超であり、
(3)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲートを提供する。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したD、E、F、及びGで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(上で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
wが6〜100の整数であり、x及びzが各々、0〜98から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式II内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、
(3)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲートを提供する。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したH、I、及びJで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
x、y、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式III内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲートを提供する。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したK、L、M、及びNで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(上で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
w、x、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であり、
yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式IV内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲートを提供する。
a)前記試料を、本発明のポリマーコンジュゲートまたはポリマー、具体的には、本明細書に開示され、かつ本明細書でさらに定義される式I〜IVのうちのいずれか1つの構造を有するポリマーコンジュゲート、または本明細書に開示され、かつ本明細書でさらに定義されるモノマー成分との関連で定義されるポリマーを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含む、前記方法を提供する。
a)前記試料を、式Iの構造を有するポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含み、
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したA、B、及びCで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
xが6〜100の整数であり、y及びzが各々、0〜99から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x/(y+z)の比率が1超であり、
(3)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記方法を提供する。
a)前記試料を、式IIの構造を有するポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含み、
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したD、E、F、及びGで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(本明細書で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
wが6〜100の整数であり、x及びzが各々、0〜98から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、
(3)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記方法を提供する。
a)前記試料を、式IIIの構造を有するポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含み、
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したH、I、及びJで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
x、y、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記方法をさらに提供する。
a)前記試料を、式IVの構造を有するポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含み、
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したK、L、M、及びNで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(本明細書で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
w、x、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記方法を提供する。
必要とされる主要な中間体が商業的に入手不能であるため、全ての既存の水溶性ポリフルオレンポリマーは、非置換フルオレンに基づいている。置換フルオレンポリマーの生物学的用途を調査する努力がなされていない。米国特許第8,598,306号(Mary McKiernan and Jonathan Pillow)は、仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンモノマーを開示した。しかしながら、このモノマーは、いくつかの理由により本発明に関連しない。(1).当業者は、Mary McKiernan and Jonathan Pillowによって説明されたモノマーを使用して、有用な生物学的ポリマーを作製することができない。Mary McKiernan and Jonathan Pillowが電子デバイス(例えば、OLED)用に特別に設計したポリマーは、極めて疎水性である。仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンモノマーに由来するポリマーは水不溶性であり、それ故に、常に水性環境を必要とする生物学的系では使用することができない。(2).仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンモノマーさえもMary McKiernan and Jonathan Pillowによって開示される方法によって作製することができないことが明らかである。米国特許第8,598,306号は、AlCl3及びBF3によって触媒された合成法を開示した。これらの条件下で、オキセピン環が破壊されるであろう。(3).仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンポリマーのスペクトル研究も生物学的研究もMary McKiernan and Jonathan Pillowによって説明されてない。(4).少なくとも3つの理由により、Mary McKiernan and Jonathan Pillowの仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンポリマーを生物学的基質にコンジュゲートすることは不可能である。(a).Mary McKiernan and Jonathan Pillowの仮説上のポリマーは、生物学的基質に結合するための生物学的に適合性の官能基を欠く。(b).それらの極めて乏しい水溶性により、仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンポリマーに由来するいずれの生物学的コンジュゲートも役に立たなくなるであろう。(c).全ての生物学的コンジュゲートが水性系中で使用されるため、仮説上のフルオレノ[4,5−cde]オキセピンポリマーの凝集により、それらの生物学的用途の調査が不可能になるであろう。
(1)高い蛍光量子収率、
(2)赤方偏移発光、
(3)高い水溶性、
(4)高い直線性、
(5)高い平面性、
(6)第2のフルオロフォアがポリマーに結合したときの高い蛍光共鳴エネルギー伝達(FRET)効率、及び
(7)高い安定性
を有することが見出された。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したA、B、及びCで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
xが6〜100の整数であり、y及びzが各々、0〜99から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式I内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x/(y+z)の比率が1超であり、
(3)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したD、E、F、及びGで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(本明細書で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
wが6〜100の整数であり、x及びzが各々、0〜98から独立して選択される整数であり、
yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式II内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、
(3)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したH、I、及びJで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
x、y、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式III内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする。
式中、ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したK、L、M、及びNで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BS(本明細書で定義されるもの)を表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
w、x、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)生物学的基質が式IV内の1つ以上の位置に存在する場合、BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする。
−(CH2)nCOOW
式V
式中、nが、1〜20であり、
Wが、水素、アルカリ金属イオン、アンモニウム、または他の生物学的に適合性の対イオンである。
−(CH2)nS(=O)2OW
式VI
式中、nが、2〜10であり、
Wが、水素、アルカリ金属イオン、アンモニウム、または他の生物学的に適合性の対イオンである。
−(CH2)nP(=O)O2W2
式VII
式中、nが、2〜10であり、
Wが、水素、アルカリ金属イオン、アンモニウム、または他の生物学的に適合性の対イオンである。
−(CH2)n−N(R3)X
式VIII
式中、nが、1〜20であり、
Rが、短いアルキル(例えば、C1〜C12アルキル)であり、
Xが、生物学的に適合性のアニオン、例えば、F−、Cl−、Br−、またはI−である。
−(CH2)n−
式IX
式中、nが、1〜20である。
−(OCH2CH2O)n−
式X
式中、nが、2〜20である。
本発明の反応性ポリマーの合成は、図3に図解されるある特定の主要な中間体の初期調製に依存する。簡略化のために、可能な置換基のうちのいくつかを除いて全てが水素として示されている。これらの基本構造は、合成中または合成後に任意にさらに置換されて、上で定義される対応するポリマーコンジュゲート置換基が得られる。同等の結果をもたらし得る多くの可能な変形が存在することが認識される。
一用途では、本発明のポリマーコンジュゲートは、試料が特定または定量され得るように試料を直接染色または標識するために使用される。かかる使用は、インビトロ用途であり得る。例えば、かかるポリマーコンジュゲートは、生物学的標的分析物のアッセイの一部として、生物学的もしくは非生物学的流体中の検出可能なトレーサー要素として、またはポリマーコンジュゲート試料が照射されて腫瘍細胞及び組織を選択的に破壊する腫瘍の光力学的療法の目的のために、または通常一重項酸素の光増感産生による動脈プラークまたは細胞にフォトアブレーションを行うために添加され得る。好ましい一実施形態では、ポリマーコンジュゲートは、コンジュゲートされた生物学的基質が特異的結合対の相補的メンバーであるリガンドを含む試料を染色するために使用される。本発明に従って有用な代表的な結合対が表3に記載される。
アルゴン下で、DMF(30mL)溶液中3−[2−ブロモ−4−(3−ヒドロキシプロピル)−6−ヨード−8,10−ジヒドロ−4H−9−オキサシクロヘプタ[def]フルオレン−4−イル]−プロパン−1−オール(化合物1)(3g、5.67mmol)の溶液に、ビス(ピナコラト)ジボロン(2g、8mmol)、Pd(dppf)Cl2(0.2g、0.28mmol)及び酢酸カリウム(2.23g、22.7mmol)を添加した。混合物を60℃で2時間加熱した。室温で、酢酸エチル(200mL))を添加し、水(100mL)、ブライン(100mL)で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過した。溶媒を除去し、粗生成物をカラムクロマトグラフィー(ヘキサン−酢酸エチル)により精製して、薄茶色の発泡体(1.5g、50%)を得た。
室温及びアルゴン下で、ジクロロメタン(20mL)中化合物2(5.84g、11mmol)の溶液に、トリエチルアミン(9.2mL、66mmol)、続いて、p−トルエンスルホニルクロリド(6.3g、33mmol)を添加した。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を濃縮した。酢酸エチル(200mL))を添加し、水(200mL)、ブライン(100mL)で洗浄した。有機層を無水硫酸ナトリウム上で乾燥させ、濾過した。溶媒を除去し、粗生成物をカラムクロマトグラフィー(ヘキサン−酢酸エチル)により精製して、白色の固体(5.2g、70%)を得た。
アルゴン下かつ0℃で、乾燥THF(20mL)中水素化ナトリウム(0.24g、5.95mmol)の混合物に、mPEG11アルコール(3.08g、5.95mmol)を添加した。0℃で10分後、乾燥THF(20mL)中化合物3(1g、1.19mmol)の溶液を滴加した。混合物を室温で一晩撹拌した。飽和塩化アンモニウム溶液(100mL)を添加して溶液をクエンチし、粗生成物をジクロロメタン(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を濃縮し、ジクロロメタン/イソプロピルアルコールの勾配でカラムクロマトグラフィーにより精製して、無色の油(1.0g、55%)を得た。
アルゴン下で、シュレンクフラスコ内のDMF(6mL)中化合物4(0.6g、0.4mmol)及び化合物5(0.023g、0.04mmol)の溶液に、水(2M、4mL)中K2CO3、続いて、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(14mg、0.012mol)を添加した。混合物を3回の凍結ポンプ解凍サイクルにより脱気し、その後、80℃になるまで12時間にわたって加熱した。室温で、反応混合物に、20%EtOH/H2O(20mL))中EDTA(100mg、0.33mmol)を添加し、室温で1時間撹拌した。その後、結果として生じた混合物を0.45μmカップフィルターに通して濾過した。濾過した溶液を、20%EtOH/H2Oを使用して、2mg/mLの濃度に希釈した。その後、結果として生じた希釈物を、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、黄色の繊維状固体(0.41g)を得た。分子量を、ポリスチレン標準(MW=85,000、MW=170,000、D=2.0)に対するSEC分析によって決定した。室温で、ジクロロメタン(20mL)中化合物6(410mg)の溶液に、トリフルオロ酢酸(5mL)を添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌した。溶媒を除去し、高真空下で一晩乾燥させて、淡黄色の油を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)の大半が除去されるまで、残渣をエーテルで複数回洗浄した。残渣を冷酸性水(pH=5)中に素早く溶解し、エーテルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマースクシンイミジルエステルを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を酸性水(pH=5)中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーマレイミドを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、シアヌル酸クロリド(1mg、Sigma)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応シアヌル酸クロリドの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマージクロロトリアジンを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、DBCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応DBCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーDBCOを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、TCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応TCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーTCOを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーメチルテトラジンを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、アジド−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アジド−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアジドを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアルキンを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、Cy3.5モノスクシンイミジルエステル(10mg、AAT Bioquest)及び20μLトリエチルアミンのDMF溶液を1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、DBCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応DBCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーDBCOを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、TCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応TCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーTCOを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーメチルテトラジンを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、アジド−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アジド−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアジドを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアルキンを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)の大半が除去されるまで、残渣をエーテルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、エーテルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマースクシンイミジルエステルを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水(pH=6)中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーマレイミドを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、シアヌル酸クロリド(1mg、Sigma)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応シアヌル酸クロリドの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマージクロロトリアジンを得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、DBCO−PEG4 Cy5モノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、TCO−PEG4 Cy5モノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物16(100mg)の溶液に、メチルテトラジン−PEG4 Cy5モノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び20μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物27(100mg)の溶液に、アジド−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、Cy5モノスクシンイミジルエステル(10mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)の大半が除去されるまで、残渣をエーテルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、エーテルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマースクシンイミジルエステルを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水(pH=6)中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーマレイミドを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、シアヌル酸クロリド(1mg、Sigma)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応シアヌル酸クロリドの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマージクロロトリアジンを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、DBCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応DBCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーDBCOを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、TCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応TCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーTCOを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーメチルテトラジンを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、アジド−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アジド−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアジドを得た。
DMF(10mL)中化合物29(100mg)の溶液に、アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアルキンを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、5−TAMRAスクシンイミジルエステル(10mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、DBCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応DBCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーDBCOを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、TCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応TCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーTCOを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応メチルテトラジン−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーメチルテトラジンを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、アジド−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アジド−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアジドを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応アルキニル−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーアルキンを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応グルタル酸ジ(N−スクシンイミジル)の大半が除去されるまで、残渣をエーテルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、エーテルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマースクシンイミジルエステルを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で2時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水(pH=6)中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマーマレイミドを得た。
DMF(10mL)中化合物37(100mg)の溶液に、シアヌル酸クロリド(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応シアヌル酸クロリドの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を冷水(pH=6)中に素早く溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉PFOポリマージクロロトリアジンを得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、2−(Texas Red)スルホンアミジル−6−(TCO−PEG4)カルボキサミジル−リジンモノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、2−(Texas Red)スルホンアミジル−6−(TCO−PEG4)カルボキサミジル−リジンモノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、2−(Texas Red)スルホンアミジル−6−(メチルテトラジン−PEG4)カルボキサミド−リジンモノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、2−(Texas Red)スルホンアミジル−6−(アジド− PEG4)カルボキサミジル−リジンモノスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、TCO−PEG4スクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応TCO−PEG4スクシンイミジルエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉TCO官能化PFOポリマーを得た。
DMF(10mL)中化合物50(10mg)の溶液に、6−ROXスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。未反応3−マレイミドプロピオン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステルの大半が除去されるまで、残渣を酢酸エチルで複数回洗浄した。残渣を水中に溶解し、酢酸エチルで3回抽出した。水溶液を凍結させ、乾燥させて、所望の不斉マレイミド官能化PFOポリマーを得た。
DMF(10mL)中化合物52(10mg)の溶液に、6−ROXスクシンイミジルエステル(1mg、AAT Bioquest)及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を0.1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(10mL)中化合物7(100mg)の溶液に、Cy7モノマレイミド、モノスクシンイミジルエステル(5mg、AAT Bioquest)、及び10μLトリエチルアミンのDMF溶液を1mL添加した。反応混合物を室温で3時間撹拌し、高真空下で濃縮して、DMFを除去した。残渣を水中に溶解し、30,000kDの分子量カットオフ膜を備えた接線流濾過システムを使用して、溶出物中に0.1mg/mL未満のポリマーが存在するまで、20%EtOH/H2O中で透析した。溶液を濃縮し、凍結乾燥させて、所望の青色の繊維状固体を得た。
DMF(0.5mL)中アミノファロイジン(1mg、AAT Bioquest)及びスクシンイミジルエステル誘導体化合物8(10mg)に、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(25μL)を添加した。混合物を室温で3時間撹拌した。この溶液に、5mLのEtOAcを添加した。固体を遠心分離によって収集した。粗生成物を、水で溶出するSEPHADEX LH−20、続いて、分取HPLCで精製して、純粋なファロイジンコンジュゲートを得た。
アクチンは、ほぼ全ての真核細胞に見られる球状のおよそ42kDaのタンパク質である。これは、藻及びヒトと同様に多様性のある種において20%以下異なる最も高度に保存されたタンパク質のうちの1つでもある。ファロイジン−PFOポリマーコンジュゲートは、F−アクチンに選択的に結合する。ナノモル濃度で使用する場合、ファロイジン−PFOポリマーコンジュゲート(化合物55)を、ホルムアルデヒド固定及び透過化組織切片、細胞培養物、または無細胞実験におけるF−アクチンの標識、特定、及び定量に使用することができる。細胞をホルムアルデヒドで固定し、ファロイジン−PFOポリマーコンジュゲートのDMSOストック溶液を添加した後にインキュベートした。細胞をPBSで2〜3回穏やかにすすいで、過剰なファロイジンコンジュゲートを除去した。細胞をプレーティングし、密封し、蛍光顕微鏡で画像化した(図4を参照のこと)。他のファロイジン−PFOポリマーコンジュゲートを同様に使用して、異なる蛍光色でF−アクチンフィラメントを染色することができる。
アミノデキストラン−色素コンジュゲートを、一例として70,000MWを使用して説明した以下のように調製した。アミノデキストラン(50mg)を平均13個のアミノ基で誘導体化した。アミノデキストラン(50mg)を0.1M NaHCO3中に10mg/mLで溶解した。化合物8を添加して、約10〜15のPFOポリマー/デキストラン比を得た。6〜12時間後、結果として生じたコンジュゲートをイオン交換クロマトグラフィーにより精製した。コンジュゲーション混合物を低塩緩衝液[50mMのMES緩衝液(pH=5.0)]中UNOsphere(商標)S樹脂(Bio−Rad)に装填し、室温で10分間インキュベートし、試料の装填を3回繰り返して、最大結合を得た。装填後、培地を低塩緩衝液で洗浄し、上昇pH及びイオン強度[10mMのリン酸緩衝液(pH=7.4)+1.0MのNaCl緩衝液/メタノール]の勾配で流した。
ミクロスフェアを、いくつかの周知のプロトコルのうちのいずれかを使用して本発明のPFOポリマー色素で標識することができる。アミノ、カルボキシル、またはアルデヒド等の官能基を表面上に有するように化学的に修飾されたミクロスフェアを、表面基を表2に列記される対応する反応性色素と共有結合的にコンジュゲートすることによって表面標識することができる。例えば、アミン修飾ミクロスフェアは、化合物8または22等のスクシンイミジルエステルを介して本発明の色素に容易にコンジュゲートした。
本発明のPFOポリマー色素にコンジュゲートされたヌクレオチドは、M.Nimmakayalu et al.,Biotechniques 2000,28,518−522、Muhlegger et al.,Biol Chem Hoppe Seyler 1990,371,953−965、及びGiaid et al.,Histochemistry 1989,93,191−196に記載の手順等の周知の公開された手順に従って当業者によって容易に調製され得る。100μLの水中2mgの5−(3−アミノアリル)−2’−デオキシウリジン5’−三リン酸(Sigma−Aldrich)に、100μLのDMF及び5μLのトリエチルアミン中化合物8または22(5mg)を添加した。3時間後、溶液を蒸発させ、残渣をHPLCにより精製する。生成物画分を凍結乾燥させて、蛍光ヌクレオチドコンジュゲートを得た。あるいは、デオキシウリジン5’−三リン酸の蛍光色素−コンジュゲートを、5−(3−アミノ−1−プロピニル)−2’−デオキシウリジン 5’−三リン酸から調製するか、またはチオール化ヌクレオチドまたはチオリン酸ヌクレオチドを本発明のチオール−反応性PFOポリマー色素(マレイミド化合物9または23等)で処理することによって調製した。
5’−アミンで修飾された18塩基M13プライマー配列(約100μg)を4μLの水中に溶解した。これに、100μLの0.1Mホウ酸ナトリウム(pH8.5)中1mgの化合物8または22を添加した。16時間後、10μLの5M NaCl及び3体積の冷エタノールを添加した。混合物を−20℃に冷却し、遠心分離し、上清をデカントし、ペレットをエタノールですすぎ、その後、ペレットを100μLの水中に溶解した。標識オリゴヌクレオチドをHPLCにより精製した。所望のピークを収集し、蒸発させて、蛍光オリゴヌクレオチド−色素コンジュゲートを得た。
ヤギ抗マウスIgG(GAM)を10mMのNaHCO3(pH8.2)緩衝液中に溶解して、5mg/mLの溶液にした。GAMタンパク質水溶液に、化合物8または22(20当量)のDMF溶液を添加した。溶液を室温で3時間回転させ、反応混合物をAmicon Ultraフィルター(MWCO=10kDa)に移して、DMFを除去した。タンパク質を、PBS緩衝液を用いて初期体積中で回収した。
ヤギ抗ウサギIgG(GAR)を1MのNaHCO3(pH=8.6)中に溶解して、10mg/mLの濃度にした。GAR溶液に、メチルテトラジン−PEG4−スルホ−NHSエステル(10mg/mLのDMSO溶液、3当量)を添加した。混合物を管回転器上で、室温で1〜2時間回転させ、P−6−DGゲル媒体(Bio−Rad)を充填した脱塩カラムで精製して、遊離メチルテトラジン−PEG4−スルホ−NHSエステルを除去した。メチルテトラジン修飾GARをPBS中で回収した。修飾GAR溶液を化合物13(4mg/mL、5当量)のPBSストック溶液と混合した。混合した溶液を室温で1〜3時間回転させた。結果として生じた溶液を陽イオン交換カラムに装填し、これを、非反応性遊離ポリマーを除去するために使用した。PFOポリマー−GAR溶液を実施例59に記載されるように精製した。純粋な所望のPFOポリマー−GARコンジュゲートをプールし、組み合わせ、Amicon Ultraフィルター(MWCO=30kD)で所望の濃度に濃縮した。
ヒツジ抗マウスIgG(SAM)を、MEA、DTT、またはTCEPで還元した(G.T.Hermanson,Bioconjugate Techniques,1996,463−469)。還元したGAMを50mMのMES緩衝液(pH=6.0)中に溶解して、5mg/mLの溶液にした。SAMタンパク質水溶液に、化合物9または23(10当量)のDMF溶液を添加した。溶液を室温で3時間回転させ、反応混合物をAmicon Ultraフィルター(MWCO=10kDa)に移して、DMFを除去した。タンパク質を、PBS緩衝液を用いて初期体積中で回収した。PFOポリマー−SAM溶液を実施例59に記載されるように精製した。純粋な所望のPFOポリマー−SAMコンジュゲートをプールし、組み合わせ、Amicon Ultraフィルター(MWCO=30kD)で所望の試験濃度に濃縮した。
ヤギ抗ウサギIgG(GAH)を1MのNaHCO3(pH=8.6)中に溶解して、10mg/mLの濃度にした。GAH溶液に、アジド−PEG4−スルホ−NHSエステル(10mg/mLのDMSO溶液、3当量)を添加した。混合物を管回転器上で、室温で1〜2時間回転させ、P−6−DGゲル媒体(Bio−Rad)を充填した脱塩カラムで精製して、遊離アジド−PEG4−スルホ−NHSエステルを除去した。アジド修飾GAHをPBS中で回収した。修飾GAH溶液を化合物11(4mg/mL、5当量)のPBSストック溶液と混合した。混合した溶液を室温で1〜3時間回転させた。結果として生じた溶液を陽イオン交換カラムに装填し、これを、非反応性遊離ポリマーを除去するために使用した。PFOポリマー−GAH溶液を実施例59に記載されるように精製した。純粋な所望のPFOポリマー−GAHコンジュゲートをプールし、組み合わせ、Amicon Ultraフィルター(MWCO=30kD)で所望の濃度に濃縮した。
ロバ抗マウスIgG(DAM)を1MのNaHCO3(pH=8.6)中に溶解して、10mg/mLの濃度にした。DAM溶液に、アジド−PEG4−スルホ−NHSエステル(10mg/mLのDMSO溶液、3当量)を添加した。混合物を管回転器上で、室温で1〜2時間回転させ、P−6−DGゲル媒体(Bio−Rad)を充填した脱塩カラムで精製して、遊離アジド−PEG4−スルホ−NHSエステルを除去した。アジド修飾DAMをPBS中で回収した。修飾DAM溶液を化合物17(4mg/mL、5当量)のPBSストック溶液と混合した。混合した溶液を室温で1〜3時間回転させた。結果として生じた溶液を陽イオン交換カラムに装填し、これを、非反応性遊離ポリマーを除去するために使用した。PFOポリマー−DAM溶液を実施例59に記載されるように精製した。純粋な所望のPFOポリマー−DAMコンジュゲートをプールし、組み合わせ、Amicon Ultraフィルター(MWCO=30kD)で所望の濃度に濃縮した。
PFOポリマー色素−CD抗体コンジュゲートを、抗マウスCD8a(クローン53−6.7、eBioscience)及び抗ヒトCD8a(クローンSK1、eBioscience)に特異的な抗体を使用して調製し、これらは各々、別個の調製で、実施例59〜63に記載の比率と類似した色素とタンパク質との比率の範囲にわたって化合物8、9、11、及び12にコンジュゲートされたものであった。抗体−ポリマーコンジュゲートを、Bio−Rad NGC FPLCクロマトグラフィーシステムを使用したSuperdex200サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により遊離抗体から精製した。最初に、コンジュゲートを15k rpmで5分間回転させて、いずれの沈殿または架橋コンジュゲートもペレット化した。その後、上清を1.5v/v%未満でSuperdex 200 10/300 GLカラム(GE Lifesciences)に注入し、10mMのリン酸緩衝液(pH7.4)を用いて1.0mL/分で溶出した。各PFOポリマー−抗体コンジュゲーションについて、抗体−ポリマーコンジュゲート及び任意の遊離ポリマーを含んだ280nmでの第1の溶出ピークを収集し、いずれのその後のピークも切り捨てた。
PFOポリマー色素−CD抗体コンジュゲートを、抗マウスCD8a(クローン53−6.7、eBioscience)及び抗ヒトCD8a(クローンSK1、eBioscience)に特異的な抗体を使用して調製し、これらは各々、別個の調製で、実施例59〜63に記載の色素とタンパク質との比率の範囲にわたって化合物17、18、22、23、25、32、36、及び38にコンジュゲートされたものであった。抗体−ポリマーコンジュゲートを実施例64に記載されるように精製した。
ストレプトアビジンを10mMのNaHCO3緩衝液(pH8.2)中に溶解して、1mg/mLの溶液にした。ストレプトアビジンタンパク質水溶液に、化合物8または22(20当量)のDMF溶液を添加した。溶液を室温で3時間振盪し、反応物をAmicon Ultraフィルター(MWCO=10kDa)に移して、DMFを除去した。タンパク質を、PBS緩衝液を用いて所期体積中で回収した。陽イオン交換クロマトグラフィーを使用して、遊離ポリマーを除去した。コンジュゲーション混合物を低塩緩衝液[50mMのMES緩衝液(pH=5.0)]中UNOsphere(商標)S樹脂(Bio−Rad)に装填し、室温で10分間インキュベートし、試料の装填を3回繰り返して、最大結合を得た。装填後、培地を低塩緩衝液でベースラインまで洗浄して(414nmでの吸光度が0.01未満になるまで)、全ての遊離ポリマーを除去した。陽イオン交換樹脂上に保持されたPFOポリマー色素−ストレプトアビジンコンジュゲートを、高塩リン酸緩衝液[10mMのリン酸緩衝液(pH=7.4)+1.0MのNaCl緩衝液/メタノール、90/10]を用いてpH及びイオン強度の両方を上昇させることによって放出した。溶出した画分を合わせ、所望の濃度に濃縮した。
本発明のPFOポリマー色素にコンジュゲートされた分析物特異的抗体(すなわち、標識抗体)は、フローサイトメトリーによる(例えば、全血試料中の)血球の分析に有用である。標識抗体を使用して細胞タンパク質を染色し、フローサイトメーターを使用して標識細胞を検出した。PFOポリマーバイオコンジュゲートを、フローサイトメーター上でBD Biosciencesによって定義される染色指標によって評価した。例えば、H.Maeker and J.Trotter,BD Biosciences Application Note:”Selecting Reagents for Multicolour Flow Cytometry”,September 2009を参照されたい。染色指標は、ポリマーの輝度、非特異的結合の尺度を報告する。フローサイトメトリーは、目的とする特定の表現型または分析物の細胞を特定のミクロスフェア上で測定する方法を提供する。これは、一次抗体の直接標識によって、またはシグナル増幅が所望される場合、二次抗体もしくはアビジン−ポリマーコンジュゲートとのアビジン−ビオチン複合体化によって行われ得る。目的とする細胞を十分な量で取り込み、沈降させ、DPBS+0.2%BSA及び0.05%NaN3中で洗浄し、その後、PFOポリマーコンジュゲートの染色緩衝液中に再懸濁した。
細胞染色を、本質的に実施例67に記載されるように調製した。PFOポリマー−CD8抗体コンジュゲートを使用して、全血試料中のリンパ球を分析した。全血試料(100μL)(好ましくは、EDTA中で収集したもの)を、典型的には、抗体−PFOポリマー色素コンジュゲートで、1〜20μg/血液mLの色素−コンジュゲート濃度で、暗所で30〜60分間染色した。染色後、適切な量の細胞溶解溶液を細胞試料に添加した。処理した試料をボルテックスミキサー上で中速で混合し、その後、室温で10分間インキュベートした。試料を200〜500gで5分間遠心分離し、上清をデカントする。試料を2回洗浄し(2mLの0.5%BSA/PBS洗浄緩衝液中に再懸濁、混合、遠心分離)、洗浄緩衝液中に再懸濁させ、フローサイトメトリー分析を行うまで4℃で維持した。
式Iのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したA、B、及びCで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
xが6〜100の整数であり、y及びzが各々、0〜99から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x/(y+z)の比率が1超であり、
(3)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。
[本発明1002]
モノマー単位B及びモノマー単位Cが異なる、本発明1001のポリマーコンジュゲート。
[本発明1003]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1001または1002のポリマーコンジュゲート。
[本発明1004]
前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルまたはPEG基を含む、本発明1001〜1003のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1005]
(i)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(ii)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(iii)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(iv)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(v)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(vi)xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1001〜1004のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1006]
(i)R1〜R6が水素であり、かつ/または
(ii)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(iii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1001〜1005のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1007]
(i)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキルもしくはL−BSを表す、
本発明1001〜1006のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1008]
アルキルがメチル基である、本発明1007のポリマーコンジュゲート。
[本発明1009]
R1〜R6が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1001のポリマーコンジュゲート。
[本発明1010]
SG1及びSG2が独立して、PEG6〜PEG18である、本発明1001〜1009のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1011]
BS/ポリマーの比率が1であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜64から独立して選択される整数であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1001〜1010のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1012]
(i)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1001〜1011のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1013]
式IIのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したD、E、F、及びGで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
wが6〜100の整数であり、x及びzが各々、0〜98から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、
(3)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。
[本発明1014]
モノマー単位E及びモノマー単位Gが異なる、本発明1013のポリマーコンジュゲート。
[本発明1015]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1013または1014のポリマーコンジュゲート。
[本発明1016]
前記リンカー(L)が、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキル、PEG、またはFPを含む、本発明1013〜1015のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1017]
(a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール(rhodol)、シアニン、ボディピー(bodipy)、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1013または1016のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1018]
R1〜R6が水素である、本発明1013〜1017のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1019]
BS/ポリマーの比率が1であり、wが16〜79の整数であり、x及びzが各々、0〜63から独立して選択される整数であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、本発明1013〜1018のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1020]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R6が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1013のポリマーコンジュゲート。
[本発明1021]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、本発明1013〜1020のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1022]
(a)FPがローダミンであるか、または
(b)FPがシアニンである、
本発明1021のポリマーコンジュゲート。
[本発明1023]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1013〜1022のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1024]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1013〜1023のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1025]
式IIIのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したH、I、及びJで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、x、y、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、(2)x+y+zの合計が10超であることを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。
[本発明1026]
モノマー単位H、I、及びJが異なる、本発明1025のポリマーコンジュゲート。
[本発明1027]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1025または1026のポリマーコンジュゲート。
[本発明1028]
前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルまたはPEG基を含む、本発明1025〜1027のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1029]
(a)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(b)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(c)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(d)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(e)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(f)x、y、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1025〜1028のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1030]
(a)R1〜R4が水素であり、かつ/または
(b)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(c)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1025〜1029のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1031]
(a)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(b)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1025〜1030のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1032]
アルキルがメチル基である、本発明1031のポリマーコンジュゲート。
[本発明1033]
R1〜R4が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはまたはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1025のポリマーコンジュゲート。
[本発明1034]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1025〜1033のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1035]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1025〜1034のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1036]
式IVのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したK、L、M、及びNで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
w、x、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。
[本発明1037]
モノマー単位K、L、及びNが異なる、本発明1036のポリマーコンジュゲート。
[本発明1038]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1036または1037のポリマーコンジュゲート。
[本発明1039]
前記リンカー(L)が、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキル、PEG、またはFPを含む、本発明1036〜1038のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1040]
(a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1036〜1039のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1041]
R1〜R4が水素である、本発明1036〜1040のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1042]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R4が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖であり、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1036〜1041のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1043]
BS/ポリマーの比率が1であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、本発明1036〜1042のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1044]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、本発明1036〜1043のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1045]
FPが、
(a)ローダミンであるか、または
(b)シアニンである、
本発明1044のポリマーコンジュゲート。
[本発明1046]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1036〜1045のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1047]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、本発明1036〜1046のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1048]
試料中の分析物を検出する方法であって、
a)前記試料を、本発明1001〜1047のいずれかのポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)前記検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含む、前記方法。
[本発明1049]
BSが抗体である、本発明1048の方法。
[本発明1050]
BSが抗ジゴキシゲニン抗体である、本発明1049の方法。
[本発明1051]
BSが、ヤギ抗マウスIgG抗体、ヤギ抗ウサギIgG抗体、ヤギ抗ヒトIgG抗体、ロバ抗マウスIgG抗体、ロバ抗ウサギIgG抗体、ロバ抗ヒトIgG抗体、ニワトリ抗マウスIgG抗体、ニワトリ抗ウサギIgG抗体、またはニワトリ抗ヒトIgG抗体である、本発明1049の方法。
[本発明1052]
BSが、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、アビジンDN、またはアビジンD部分である、本発明1048の方法。
[本発明1053]
前記分析物が、細胞表面で発現する標的タンパク質である、本発明1048〜1052のいずれかの方法。
[本発明1054]
1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Aのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーA単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが6〜100である、式Aのモノマー、
式Bのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーB単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜99である、式Bのモノマー、及び
式Cのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーC単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜99である、式Cのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
XのY+Zに対する比率が1超であり、
X+Y+Zの合計が10超である、
前記ポリマー。
[本発明1055]
前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、本発明1054のポリマー。
[本発明1056]
モノマー単位B及びモノマー単位Cが異なる、本発明1054または1055のポリマー。
[本発明1057]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1054〜1056のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1058]
前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基である、本発明1054〜1057のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1059]
(i)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(ii)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(iii)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(iv)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(v)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(vi)xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1054〜1058のいずれかのポリマー。
[本発明1060]
(i)R1〜R6が水素であり、かつ/または
(ii)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(iii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1054〜1059のいずれかのポリマー。
[本発明1061]
(i)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキルもしくはL−BSを表す、
本発明1054〜1060のいずれかのポリマー。
[本発明1062]
アルキルがメチル基である、本発明1061のポリマー。
[本発明1063]
R1〜R6が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1054のポリマーコンジュゲート。
[本発明1064]
SG1及びSG2が独立して、PEG6〜PEG18である、本発明1054〜1063のいずれかのポリマー。
[本発明1065]
BS/ポリマーの比率が1であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜64から独立して選択される整数であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1054〜1064のいずれかのポリマー。
[本発明1066]
(i)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1054〜1065のいずれかのポリマー。
[本発明1067]
1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Dのモノマー
であって、
式中、Wが、前記ポリマー中のモノマーD単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが6〜100である、式Dのモノマー、
式Eのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーE単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜98である、式Eのモノマー、
式Fのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーF単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20である、式Fのモノマー、及び
式Gのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーG単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜98である、式Gのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
WのX+Y+Zに対する比率が1超であり、
W+X+Y+Zの合計が10超であり、
FPが、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超えるフルオロフォアまたは蛍光色素である、
前記ポリマー。
[本発明1068]
前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、本発明1067のポリマー。
[本発明1069]
モノマー単位E及びモノマー単位Gが異なる、本発明1067または1068のポリマー。
[本発明1070]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1067〜1069のいずれかのポリマー。
[本発明1071]
前記リンカーが、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基もしくはFPを含むか、またはアルキルもしくはPEG基もしくはFPである、本発明1067〜1070のいずれかのポリマー。
[本発明1072]
(a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1067〜1071のいずれかのポリマー。
[本発明1073]
R1〜R6が水素である、本発明1067〜1072のいずれかのポリマー。
[本発明1074]
BS/ポリマーの比率が1であり、wが16〜79の整数であり、x及びzが各々、0〜63から独立して選択される整数であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、本発明1067〜1073のいずれかのポリマー。
[本発明1075]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R6が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1067のポリマーコンジュゲート。
[本発明1076]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、本発明1067〜1075のいずれかのポリマー。
[本発明1077]
(a)FPがローダミンであるか、または
(b)FPがシアニンである、
本発明1075のポリマー。
[本発明1078]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1067〜1077のいずれかのポリマー。
[本発明1079]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1067〜1078のいずれかのポリマー。
[本発明1080]
1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Hのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーH単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である、式Hのモノマー、
式Iのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーI単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜100である、式Iのモノマー、及び
式Jのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーJ単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である、式Jのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
X+Y+Zの合計が10超である、
前記ポリマー。
[本発明1081]
前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、本発明1080のポリマー。
[本発明1082]
モノマー単位H、I、及びJが異なる、本発明1080または1081のポリマー。
[本発明1083]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1080〜1082のいずれかのポリマー。
[本発明1084]
前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基である、本発明1080〜1083のいずれかのポリマー。
[本発明1085]
(a)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(b)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(c)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(d)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(e)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(f)x、y、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1080〜1084のいずれかのポリマー。
[本発明1086]
(a)R1〜R4が水素であり、かつ/または
(b)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(c)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1080〜1085のいずれかのポリマー。
[本発明1087]
(a)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(b)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
本発明1080〜1086のいずれかのポリマー。
[本発明1088]
アルキルがメチル基である、本発明1087のポリマー。
[本発明1089]
R1〜R4が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはまたはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1080のポリマー。
[本発明1090]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1080〜1089のいずれかのポリマー。
[本発明1091]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1080〜1090のいずれかのポリマー。
[本発明1092]
1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Kのモノマー
であって、
式中、Wが、前記ポリマー中のモノマーK単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが0〜100である、式Kのモノマー、
式Lのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーL単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である、式Lのモノマー、
式Cのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーM単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20である、式Cのモノマー、及び
式Nのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーN単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である、式Nのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
W+X+Y+Zの合計が10超であり、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素である、
前記ポリマー。
[本発明1093]
前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、本発明1092のポリマー。
[本発明1094]
モノマー単位K、L、及びNが異なる、本発明1092または1093のポリマー。
[本発明1095]
前記モノマー単位が互いに直接結合している、本発明1092〜1094のいずれかのポリマー。
[本発明1096]
前記リンカーが、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基もしくはFP基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基もしくはFP基である、本発明1092〜1095のいずれかのポリマー。
[本発明1097]
(a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
本発明1092〜1096のいずれかのポリマー。
[本発明1098]
R1〜R4が水素である、本発明1092〜1097のいずれかのポリマー。
[本発明1099]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R4が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖であり、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、本発明1092〜1098のいずれかのポリマー。
[本発明1100]
BS/ポリマーの比率が1であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、本発明1092〜1099のいずれかのポリマー。
[本発明1101]
FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、本発明1092〜1100のいずれかのポリマー。
[本発明1102]
FPが、
(a)ローダミンであるか、または
(b)シアニンである、
本発明1101のポリマーコンジュゲート。
[本発明1103]
BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、本発明1092〜1102のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1104]
(a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
本発明1092〜1103のいずれかのポリマーコンジュゲート。
[本発明1105]
試料中の分析物を検出する方法であって、
a)前記試料を、本発明1054〜1104のいずれかのポリマーを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)前記検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含む、前記方法。
[本発明1106]
BSが抗体である、本発明1105の方法。
[本発明1107]
BSが抗ジゴキシゲニン抗体である、本発明1106の方法。
[本発明1108]
BSが、ヤギ抗マウスIgG抗体、ヤギ抗ウサギIgG抗体、ヤギ抗ヒトIgG抗体、ロバ抗マウスIgG抗体、ロバ抗ウサギIgG抗体、ロバ抗ヒトIgG抗体、ニワトリ抗マウスIgG抗体、ニワトリ抗ウサギIgG抗体、またはニワトリ抗ヒトIgG抗体である、本発明1106の方法。
[本発明1109]
BSが、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、アビジンDN、またはアビジンD部分である、本発明1105の方法。
[本発明1110]
前記分析物が、細胞表面で発現する標的タンパク質である、本発明1105〜1109のいずれかの方法。
本開示、具体的には、特許請求の範囲及び/または項において、「含む(comprises)」、「含まれる(comprised)」、「含むこと(comprising)」等の用語は、米国特許法におけるそれに帰する意味を有してもよく、例えば、それらは、「含む(includes)」、「含まれる(included)」、「含むこと(including)」等を意味してもよく、「から本質的になること」及び「から本質的になる」等の用語は、米国特許法におけるそれらに帰する意味を有し、例えば、それらは、明確に列挙されていない要素を考慮するが、先行技術に見られる要素または本発明の基本的特性もしくは新規の特性に影響を及ぼす要素を除外することに留意されたい。これら及び他の実施形態が開示されるか、または以下の発明を実施するための形態から明らかであり、それに包含される。
Claims (110)
- 式Iのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したA、B、及びCで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
xが6〜100の整数であり、y及びzが各々、0〜99から独立して選択される整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)x/(y+z)の比率が1超であり、
(3)x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。 - モノマー単位B及びモノマー単位Cが異なる、請求項1に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項1または2に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルまたはPEG基を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (i)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(ii)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(iii)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(iv)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(v)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(vi)xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - (i)R1〜R6が水素であり、かつ/または
(ii)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(iii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項1〜5のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - (i)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキルもしくはL−BSを表す、
請求項1〜6のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - アルキルがメチル基である、請求項7に記載のポリマーコンジュゲート。
- R1〜R6が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項1に記載のポリマーコンジュゲート。
- SG1及びSG2が独立して、PEG6〜PEG18である、請求項1〜9のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- BS/ポリマーの比率が1であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜64から独立して選択される整数であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (i)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項1〜11のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - 式IIのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したD、E、F、及びGで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、
HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
wが6〜100の整数であり、x及びzが各々、0〜98から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、
(3)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。 - モノマー単位E及びモノマー単位Gが異なる、請求項13に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項13または14に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記リンカー(L)が、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキル、PEG、またはFPを含む、請求項13〜15のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール(rhodol)、シアニン、ボディピー(bodipy)、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項13または16のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - R1〜R6が水素である、請求項13〜17のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- BS/ポリマーの比率が1であり、wが16〜79の整数であり、x及びzが各々、0〜63から独立して選択される整数であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、請求項13〜18のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R6が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項13に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、請求項13〜20のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)FPがローダミンであるか、または
(b)FPがシアニンである、
請求項21に記載のポリマーコンジュゲート。 - BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項13〜22のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項13〜23のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - 式IIIのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したH、I、及びJで表される3つのモノマー単位を含み、
R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)を表し、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲンもしくはボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、x、y、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、(2)x+y+zの合計が10超であることを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。 - モノマー単位H、I、及びJが異なる、請求項25に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項25または26に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルまたはPEG基を含む、請求項25〜27のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(b)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(c)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(d)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(e)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(f)x、y、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項25〜28のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - (a)R1〜R4が水素であり、かつ/または
(b)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(c)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項25〜29のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - (a)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(b)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項25〜30のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - アルキルがメチル基である、請求項31に記載のポリマーコンジュゲート。
- R1〜R4が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはまたはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項25に記載のポリマーコンジュゲート。
- BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項25〜33のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項25〜34のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - 式IVのポリマーコンジュゲートであって、
式中、前記ポリマーコンジュゲートが、ポリマー主鎖に沿ってランダムに分布したK、L、M、及びNで表される4つのモノマー単位を含み、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素であり、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、PEG、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、ハロゲン、ボロニル、アルキル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSを表し、
w、x、及びzが各々、0〜100から独立して選択される整数であり、yが1〜20の整数であるが、但し、
(1)BS/ポリマーの比率が0.2〜3であり、
(2)w+x+y+zの合計が10超である
ことを条件とする、前記ポリマーコンジュゲート。 - モノマー単位K、L、及びNが異なる、請求項36に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項36または37に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記リンカー(L)が、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキル、PEG、またはFPを含む、請求項36〜38のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項36〜39のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - R1〜R4が水素である、請求項36〜40のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R4が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖であり、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項36〜41のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- BS/ポリマーの比率が1であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、請求項36〜42のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、請求項36〜43のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、
(a)ローダミンであるか、または
(b)シアニンである、
請求項44に記載のポリマーコンジュゲート。 - BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項36〜45のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、請求項36〜46のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - 試料中の分析物を検出する方法であって、
a)前記試料を、請求項1〜47のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲートを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)前記検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含む、前記方法。 - BSが抗体である、請求項48に記載の方法。
- BSが抗ジゴキシゲニン抗体である、請求項49に記載の方法。
- BSが、ヤギ抗マウスIgG抗体、ヤギ抗ウサギIgG抗体、ヤギ抗ヒトIgG抗体、ロバ抗マウスIgG抗体、ロバ抗ウサギIgG抗体、ロバ抗ヒトIgG抗体、ニワトリ抗マウスIgG抗体、ニワトリ抗ウサギIgG抗体、またはニワトリ抗ヒトIgG抗体である、請求項49に記載の方法。
- BSが、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、アビジンDN、またはアビジンD部分である、請求項48に記載の方法。
- 前記分析物が、細胞表面で発現する標的タンパク質である、請求項48〜52のいずれか一項に記載の方法。
- 1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Aのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーA単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが6〜100である、式Aのモノマー、
式Bのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーB単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜99である、式Bのモノマー、及び
式Cのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーC単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜99である、式Cのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
XのY+Zに対する比率が1超であり、
X+Y+Zの合計が10超である、
前記ポリマー。 - 前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、請求項54に記載のポリマー。
- モノマー単位B及びモノマー単位Cが異なる、請求項54または55に記載のポリマー。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項54〜56のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基である、請求項54〜57のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (i)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(ii)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(iii)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(iv)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(v)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(vi)xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項54〜58のいずれか一項に記載のポリマー。 - (i)R1〜R6が水素であり、かつ/または
(ii)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(iii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項54〜59のいずれか一項に記載のポリマー。 - (i)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキルもしくはL−BSを表す、
請求項54〜60のいずれか一項に記載のポリマー。 - アルキルがメチル基である、請求項61に記載のポリマー。
- R1〜R6が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項54に記載のポリマーコンジュゲート。
- SG1及びSG2が独立して、PEG6〜PEG18である、請求項54〜63のいずれか一項に記載のポリマー。
- BS/ポリマーの比率が1であり、xが16〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜64から独立して選択される整数であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項54〜64のいずれか一項に記載のポリマー。
- (i)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(ii)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項54〜65のいずれか一項に記載のポリマー。 - 1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Dのモノマー
であって、
式中、Wが、前記ポリマー中のモノマーD単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが6〜100である、式Dのモノマー、
式Eのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーE単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜98である、式Eのモノマー、
式Fのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーF単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20である、式Fのモノマー、及び
式Gのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーG単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜98である、式Gのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R6が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
WのX+Y+Zに対する比率が1超であり、
W+X+Y+Zの合計が10超であり、
FPが、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超えるフルオロフォアまたは蛍光色素である、
前記ポリマー。 - 前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、請求項67に記載のポリマー。
- モノマー単位E及びモノマー単位Gが異なる、請求項67または68に記載のポリマー。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項67〜69のいずれか一項に記載のポリマー。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基もしくはFPを含むか、またはアルキルもしくはPEG基もしくはFPである、請求項67〜70のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R6が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項67〜71のいずれか一項に記載のポリマー。 - R1〜R6が水素である、請求項67〜72のいずれか一項に記載のポリマー。
- BS/ポリマーの比率が1であり、wが16〜79の整数であり、x及びzが各々、0〜63から独立して選択される整数であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、請求項67〜73のいずれか一項に記載のポリマー。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R6が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、または炭水化物であり、wが11〜80の整数であり、x及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w/(x+y+z)の比率が1超であり、(3)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項67に記載のポリマーコンジュゲート。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、請求項67〜75のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)FPがローダミンであるか、または
(b)FPがシアニンである、
請求項75に記載のポリマー。 - BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項67〜77のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項67〜78のいずれか一項に記載のポリマー。 - 1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Hのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーH単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である、式Hのモノマー、
式Iのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーI単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが0〜100である、式Iのモノマー、及び
式Jのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーJ単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である、式Jのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG6が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
X+Y+Zの合計が10超である、
前記ポリマー。 - 前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、請求項80に記載のポリマー。
- モノマー単位H、I、及びJが異なる、請求項80または81に記載のポリマー。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項80〜82のいずれか一項に記載のポリマー。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基である、請求項80〜83のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(b)SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(c)Lが、アルキル鎖もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(d)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴヌクレオチド、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(e)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(f)x、y、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項80〜84のいずれか一項に記載のポリマー。 - (a)R1〜R4が水素であり、かつ/または
(b)SG1及びSG2がPEGであり、かつ/または
(c)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項80〜85のいずれか一項に記載のポリマー。 - (a)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、もしくはL−BSを表すか、または
(b)SG3〜SG6が独立して、PEG、アルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表す、
請求項80〜86のいずれか一項に記載のポリマー。 - アルキルがメチル基である、請求項87に記載のポリマー。
- R1〜R4が水素であり、SG1〜SG6が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはまたはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖またはPEG鎖を含み、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、xが11〜80の整数であり、y及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)x/(y+z)の比率が1超であり、(3)x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項80に記載のポリマー。
- BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項80〜89のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項80〜90のいずれか一項に記載のポリマー。 - 1つ以上のモノマーを含むポリマーであって、前記1つ以上のモノマーが、
式Kのモノマー
であって、
式中、Wが、前記ポリマー中のモノマーK単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Wが0〜100である、式Kのモノマー、
式Lのモノマー
であって、
式中、Xが、前記ポリマー中のモノマーL単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Xが0〜100である、式Lのモノマー、
式Cのモノマー
であって、
式中、Yが、前記ポリマー中のモノマーM単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Yが1〜20である、式Cのモノマー、及び
式Nのモノマー
であって、
式中、Zが、前記ポリマー中のモノマーN単位の数であり、前記モノマー単位が、連続的または非連続的であり、Zが0〜100である、式Nのモノマー
からなる群から選択され、
式中、R1〜R4が独立して、水素、アルキル、ポリエチレングリコール(PEG)、アリール、ヘテロアリール基、またはリンカーを介してコンジュゲートされた生物学的基質(L−BS)であり、
SG1〜SG7が独立して、アルキル、水溶性基、またはL−BSであり、
前記ポリマーが、末端基HG1及びHG2を含み、HG1及びHG2が独立して、水素、アルキル、ハロゲン、ボロニル、アリール、ヘテロアリール基、またはL−BSであり、
W+X+Y+Zの合計が10超であり、
フルオロフォア(FP)が、450nmを超える吸収極大及び500nmを超える発光極大を有し、かつ蛍光量子収率が5%を超える蛍光色素である、
前記ポリマー。 - 前記ポリマーがL−BSを含み、BSのポリマーに対する比率が0.2〜3である、請求項92に記載のポリマー。
- モノマー単位K、L、及びNが異なる、請求項92または93に記載のポリマー。
- 前記モノマー単位が互いに直接結合している、請求項92〜94のいずれか一項に記載のポリマー。
- 前記リンカーが、アルキル、PEG、FP、カルボキサミド、チオエーテル、エステル、イミン、ヒドラジン、オキシム、アルキルアミン、エーテル、アリールアミン、ボロン酸エステル、N−アシル尿素もしくは無水物、白金錯体、アミノトリアジン、トリアジニルエーテル、アミジン、尿素、ウレタン、チオ尿素、亜リン酸エステル、シリルエーテル、スルホンアミド、スルホン酸エステル、1,2,3−トリアゾール、ピラダジン、チアゾリジン、2−ジフェニルホスホニル−ベンゾアミド、イソオキサゾール、またはスクシンイミド基を含み、好ましくは、前記リンカーが、アルキルもしくはPEG基もしくはFP基を含むか、またはアルキルもしくはPEG基もしくはFP基である、請求項92〜95のいずれか一項に記載のポリマー。
- (a)FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、もしくはフタロシアニンであり、かつ/または
(b)R1〜R4が独立して、水素、メチル、もしくはエチルを表し、かつ/または
(c)SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、アミノアルキル、もしくはL−BSを表し、かつ/または
(d)Lが、アルキル鎖、FP、もしくはPEG鎖であり、かつ/または
(e)BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、もしくは炭水化物であり、かつ/または
(f)HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、もしくはボロニルを表し、かつ/または
(g)w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、
請求項92〜96のいずれか一項に記載のポリマー。 - R1〜R4が水素である、請求項92〜97のいずれか一項に記載のポリマー。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、ロドール、シアニン、ボディピー、スクアライン、クマリン、ペリレンジイミド、ジケトピロロピロール、ポルフィリン、またはフタロシアニンであり、R1〜R4が水素であり、SG1〜SG7が独立して、PEG、アルキル、カルボキシアルキル、スルホニルアルキル、ホスホニルアルキル、またはアミノアルキルを表し、HG1及びHG2が独立して、水素、アリール、ハロゲン、ボロニル、またはL−BSを表し、ここで、Lが、アルキル鎖、FP、またはPEG鎖であり、BSが、抗体、ペプチド、タンパク質、オリゴ、核酸、または炭水化物であり、w、x、及びzが各々、0〜80から独立して選択される整数であり、yが1〜10の整数であるが、但し、(1)BS/ポリマーの比率が1〜2であり、(2)w+x+y+zの合計が20超であることを条件とする、請求項92〜98のいずれか一項に記載のポリマー。
- BS/ポリマーの比率が1であり、w+x+y+zの合計が30〜80である、請求項92〜99のいずれか一項に記載のポリマー。
- FPが、フルオレセイン、ローダミン、シアニン、ボディピー、スクアライン、ペリレンジイミド、またはフタロシアニンである、請求項92〜100のいずれか一項に記載のポリマー。
- FPが、
(a)ローダミンであるか、または
(b)シアニンである、
請求項101に記載のポリマーコンジュゲート。 - BS/ポリマーの比率が1であり、x+y+zの合計が30〜80である、請求項92〜102のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。
- (a)HG1及びHG2が独立して、水素、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表すか、または
(b)HG1及びHG2が独立して、ハロゲン、ボロニル、カルボキシアリール、もしくはL−BSを表す、
請求項92〜103のいずれか一項に記載のポリマーコンジュゲート。 - 試料中の分析物を検出する方法であって、
a)前記試料を、請求項54〜104のいずれか一項に記載のポリマーを含む検出試薬と、前記検出試薬が前記分析物に結合する条件下で組み合わせることと、
b)前記検出試薬が結合した分析物を蛍光により検出すること
を含む、前記方法。 - BSが抗体である、請求項105に記載の方法。
- BSが抗ジゴキシゲニン抗体である、請求項106に記載の方法。
- BSが、ヤギ抗マウスIgG抗体、ヤギ抗ウサギIgG抗体、ヤギ抗ヒトIgG抗体、ロバ抗マウスIgG抗体、ロバ抗ウサギIgG抗体、ロバ抗ヒトIgG抗体、ニワトリ抗マウスIgG抗体、ニワトリ抗ウサギIgG抗体、またはニワトリ抗ヒトIgG抗体である、請求項106に記載の方法。
- BSが、アビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジン、アビジンDN、またはアビジンD部分である、請求項105に記載の方法。
- 前記分析物が、細胞表面で発現する標的タンパク質である、請求項105〜109のいずれか一項に記載の方法。
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