JP2019500609A - グリコシル化シグネチャの決定 - Google Patents
グリコシル化シグネチャの決定 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2019500609A JP2019500609A JP2018533606A JP2018533606A JP2019500609A JP 2019500609 A JP2019500609 A JP 2019500609A JP 2018533606 A JP2018533606 A JP 2018533606A JP 2018533606 A JP2018533606 A JP 2018533606A JP 2019500609 A JP2019500609 A JP 2019500609A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- target
- protein
- antibody
- glycosylation
- sample
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 title claims abstract description 87
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 title claims abstract description 71
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 130
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 124
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 123
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 30
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 27
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 76
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 68
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 55
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 54
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 48
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims description 44
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 claims description 42
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 claims description 42
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims description 40
- 239000002523 lectin Substances 0.000 claims description 40
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 38
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 34
- 238000003556 assay Methods 0.000 claims description 27
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 21
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 20
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 20
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 20
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 claims description 17
- INZOTETZQBPBCE-NYLDSJSYSA-N 3-sialyl lewis Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]([C@H](O)CO)[C@@H]([C@@H](NC(C)=O)C=O)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@]2(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C2)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 INZOTETZQBPBCE-NYLDSJSYSA-N 0.000 claims description 15
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 15
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims description 15
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 15
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 15
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 15
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 14
- 108010022366 Carcinoembryonic Antigen Proteins 0.000 claims description 11
- 102100025475 Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5 Human genes 0.000 claims description 11
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 claims description 10
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 claims description 10
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 claims description 10
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 claims description 9
- 102100038358 Prostate-specific antigen Human genes 0.000 claims description 9
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 claims description 9
- 102000035122 glycosylated proteins Human genes 0.000 claims description 9
- 108091005608 glycosylated proteins Proteins 0.000 claims description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 9
- 102000004625 Aspartate Aminotransferases Human genes 0.000 claims description 8
- 108010003415 Aspartate Aminotransferases Proteins 0.000 claims description 8
- 230000033581 fucosylation Effects 0.000 claims description 8
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 claims description 8
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 7
- 101000990902 Homo sapiens Matrix metalloproteinase-9 Proteins 0.000 claims description 6
- 102100030412 Matrix metalloproteinase-9 Human genes 0.000 claims description 6
- 229940027941 immunoglobulin g Drugs 0.000 claims description 6
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 claims description 4
- 108010008150 Apolipoprotein B-100 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000006991 Apolipoprotein B-100 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100029470 Apolipoprotein E Human genes 0.000 claims description 4
- 101710095339 Apolipoprotein E Proteins 0.000 claims description 4
- 102100021943 C-C motif chemokine 2 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710155857 C-C motif chemokine 2 Proteins 0.000 claims description 4
- 108010074051 C-Reactive Protein Proteins 0.000 claims description 4
- 102100032752 C-reactive protein Human genes 0.000 claims description 4
- 102000000013 Chemokine CCL3 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000004420 Creatine Kinase Human genes 0.000 claims description 4
- 108010042126 Creatine kinase Proteins 0.000 claims description 4
- 102000012192 Cystatin C Human genes 0.000 claims description 4
- 108010061642 Cystatin C Proteins 0.000 claims description 4
- 108010041308 Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 claims description 4
- 108010062715 Fatty Acid Binding Protein 3 Proteins 0.000 claims description 4
- 101710083182 Fatty acid-binding protein 1 Proteins 0.000 claims description 4
- 108050003772 Fatty acid-binding protein 4 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030421 Fatty acid-binding protein 5 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710083187 Fatty acid-binding protein 5 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100037735 Fatty acid-binding protein 9 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710083193 Fatty acid-binding protein 9 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030431 Fatty acid-binding protein, adipocyte Human genes 0.000 claims description 4
- 102100037738 Fatty acid-binding protein, heart Human genes 0.000 claims description 4
- 102100026748 Fatty acid-binding protein, intestinal Human genes 0.000 claims description 4
- 108050008832 Fatty acid-binding protein, intestinal Proteins 0.000 claims description 4
- 102100026745 Fatty acid-binding protein, liver Human genes 0.000 claims description 4
- 101710188974 Fatty acid-binding protein, liver Proteins 0.000 claims description 4
- 101710189565 Fatty acid-binding protein, liver-type Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030426 Gastrotropin Human genes 0.000 claims description 4
- 102000053171 Glial Fibrillary Acidic Human genes 0.000 claims description 4
- 101710193519 Glial fibrillary acidic protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101001076407 Homo sapiens Interleukin-1 receptor antagonist protein Proteins 0.000 claims description 4
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 108010003272 Hyaluronate lyase Proteins 0.000 claims description 4
- 102000001974 Hyaluronidases Human genes 0.000 claims description 4
- 108010064593 Intercellular Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000015271 Intercellular Adhesion Molecule-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 229940119178 Interleukin 1 receptor antagonist Drugs 0.000 claims description 4
- 102000000589 Interleukin-1 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000051628 Interleukin-1 receptor antagonist Human genes 0.000 claims description 4
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000003810 Interleukin-18 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000171 Interleukin-18 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000000743 Interleukin-5 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004890 Interleukin-8 Human genes 0.000 claims description 4
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100033421 Keratin, type I cytoskeletal 18 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000010909 Monoamine Oxidase Human genes 0.000 claims description 4
- 108010062431 Monoamine oxidase Proteins 0.000 claims description 4
- 108010064862 Nicotinamide phosphoribosyltransferase Proteins 0.000 claims description 4
- 102000015532 Nicotinamide phosphoribosyltransferase Human genes 0.000 claims description 4
- 102100036961 Nuclear mitotic apparatus protein 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 claims description 4
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 claims description 4
- 102100029796 Protein S100-A10 Human genes 0.000 claims description 4
- 102100029811 Protein S100-A11 Human genes 0.000 claims description 4
- 101710110945 Protein S100-A11 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 claims description 4
- 108010015695 S100 calcium binding protein A10 Proteins 0.000 claims description 4
- 102100026966 Thrombomodulin Human genes 0.000 claims description 4
- 108010079274 Thrombomodulin Proteins 0.000 claims description 4
- 102000013394 Troponin I Human genes 0.000 claims description 4
- 108010065729 Troponin I Proteins 0.000 claims description 4
- 102000004987 Troponin T Human genes 0.000 claims description 4
- 108090001108 Troponin T Proteins 0.000 claims description 4
- 108010000134 Vascular Cell Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 claims description 4
- 108010073929 Vascular Endothelial Growth Factor A Proteins 0.000 claims description 4
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 claims description 4
- 102100023543 Vascular cell adhesion protein 1 Human genes 0.000 claims description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 4
- 108010062689 fatty acid-binding protein 6 Proteins 0.000 claims description 4
- 210000005046 glial fibrillary acidic protein Anatomy 0.000 claims description 4
- 229960002773 hyaluronidase Drugs 0.000 claims description 4
- 239000003407 interleukin 1 receptor blocking agent Substances 0.000 claims description 4
- 229940076144 interleukin-10 Drugs 0.000 claims description 4
- 229940100602 interleukin-5 Drugs 0.000 claims description 4
- 229940096397 interleukin-8 Drugs 0.000 claims description 4
- XKTZWUACRZHVAN-VADRZIEHSA-N interleukin-8 Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@@H](NC(C)=O)CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N1[C@H](CCC1)C(=O)N1[C@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@H](CO)C(=O)N1[C@H](CCC1)C(N)=O)C1=CC=CC=C1 XKTZWUACRZHVAN-VADRZIEHSA-N 0.000 claims description 4
- 108010036112 nuclear matrix protein 22 Proteins 0.000 claims description 4
- 108010047303 von Willebrand Factor Proteins 0.000 claims description 4
- 102100036537 von Willebrand factor Human genes 0.000 claims description 4
- 229960001134 von willebrand factor Drugs 0.000 claims description 4
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 claims description 3
- 108010001387 Fatty Acid-Binding Protein 7 Proteins 0.000 claims description 3
- 102100037733 Fatty acid-binding protein, brain Human genes 0.000 claims description 3
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 claims description 3
- 102000006992 Interferon-alpha Human genes 0.000 claims description 3
- 108010047761 Interferon-alpha Proteins 0.000 claims description 3
- 108010066327 Keratin-18 Proteins 0.000 claims description 3
- 102000003855 L-lactate dehydrogenase Human genes 0.000 claims description 3
- 108700023483 L-lactate dehydrogenases Proteins 0.000 claims description 3
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 claims description 3
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 claims description 3
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 claims description 3
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 claims description 3
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 claims description 3
- LOGFVTREOLYCPF-KXNHARMFSA-N (2s,3r)-2-[[(2r)-1-[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]pyrrolidine-2-carbonyl]amino]-3-hydroxybutanoic acid Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN LOGFVTREOLYCPF-KXNHARMFSA-N 0.000 claims description 2
- 102100031786 Adiponectin Human genes 0.000 claims description 2
- 108010076365 Adiponectin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100036774 Afamin Human genes 0.000 claims description 2
- 101710149366 Afamin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100035248 Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 4 Human genes 0.000 claims description 2
- 102100022524 Alpha-1-antichymotrypsin Human genes 0.000 claims description 2
- 102100033312 Alpha-2-macroglobulin Human genes 0.000 claims description 2
- 108010059886 Apolipoprotein A-I Proteins 0.000 claims description 2
- 102000005666 Apolipoprotein A-I Human genes 0.000 claims description 2
- 102100022005 B-lymphocyte antigen CD20 Human genes 0.000 claims description 2
- 108700020463 BRCA1 Proteins 0.000 claims description 2
- 102000036365 BRCA1 Human genes 0.000 claims description 2
- 101150072950 BRCA1 gene Proteins 0.000 claims description 2
- 108700020462 BRCA2 Proteins 0.000 claims description 2
- 102000052609 BRCA2 Human genes 0.000 claims description 2
- 101150008921 Brca2 gene Proteins 0.000 claims description 2
- 101710155856 C-C motif chemokine 3 Proteins 0.000 claims description 2
- 108700012434 CCL3 Proteins 0.000 claims description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims description 2
- 108010075016 Ceruloplasmin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 claims description 2
- 102100023804 Coagulation factor VII Human genes 0.000 claims description 2
- 108010028780 Complement C3 Proteins 0.000 claims description 2
- 102000016918 Complement C3 Human genes 0.000 claims description 2
- 108010028773 Complement C5 Proteins 0.000 claims description 2
- 102100031506 Complement C5 Human genes 0.000 claims description 2
- 239000003154 D dimer Substances 0.000 claims description 2
- 102100025012 Dipeptidyl peptidase 4 Human genes 0.000 claims description 2
- 108010024212 E-Selectin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100023471 E-selectin Human genes 0.000 claims description 2
- 101000870529 Enterobacteria phage T4 DNA alpha-glucosyltransferase Proteins 0.000 claims description 2
- 108010023321 Factor VII Proteins 0.000 claims description 2
- 108010071289 Factor XIII Proteins 0.000 claims description 2
- 102000030914 Fatty Acid-Binding Human genes 0.000 claims description 2
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 claims description 2
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 claims description 2
- 102000013382 Gelatinases Human genes 0.000 claims description 2
- 108010026132 Gelatinases Proteins 0.000 claims description 2
- 102000007390 Glycogen Phosphorylase Human genes 0.000 claims description 2
- 108010046163 Glycogen Phosphorylase Proteins 0.000 claims description 2
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 claims description 2
- 108010026027 Hemopexin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000013271 Hemopexin Human genes 0.000 claims description 2
- 101001022185 Homo sapiens Alpha-(1,3)-fucosyltransferase 4 Proteins 0.000 claims description 2
- 101000897405 Homo sapiens B-lymphocyte antigen CD20 Proteins 0.000 claims description 2
- 101000908391 Homo sapiens Dipeptidyl peptidase 4 Proteins 0.000 claims description 2
- 101000746373 Homo sapiens Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Proteins 0.000 claims description 2
- 102100028627 Hornerin Human genes 0.000 claims description 2
- 101710100096 Hornerin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000003777 Interleukin-1 beta Human genes 0.000 claims description 2
- 108090000193 Interleukin-1 beta Proteins 0.000 claims description 2
- 102000004125 Interleukin-1alpha Human genes 0.000 claims description 2
- 108010082786 Interleukin-1alpha Proteins 0.000 claims description 2
- 108010038501 Interleukin-6 Receptors Proteins 0.000 claims description 2
- 102100037792 Interleukin-6 receptor subunit alpha Human genes 0.000 claims description 2
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 claims description 2
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 claims description 2
- 108010044467 Isoenzymes Proteins 0.000 claims description 2
- 108010092694 L-Selectin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100033467 L-selectin Human genes 0.000 claims description 2
- 102000019298 Lipocalin Human genes 0.000 claims description 2
- 108050006654 Lipocalin Proteins 0.000 claims description 2
- 208000001145 Metabolic Syndrome Diseases 0.000 claims description 2
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 claims description 2
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 claims description 2
- 108010035766 P-Selectin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100023472 P-selectin Human genes 0.000 claims description 2
- 108090000279 Peptidyltransferases Proteins 0.000 claims description 2
- 108010015078 Pregnancy-Associated alpha 2-Macroglobulins Proteins 0.000 claims description 2
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 claims description 2
- 102000005937 Tropomyosin Human genes 0.000 claims description 2
- 108010030743 Tropomyosin Proteins 0.000 claims description 2
- 102100031988 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Human genes 0.000 claims description 2
- 108050002568 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 Proteins 0.000 claims description 2
- 102100033732 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A Human genes 0.000 claims description 2
- 101710187743 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A Proteins 0.000 claims description 2
- 102100033733 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Human genes 0.000 claims description 2
- 101710187830 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B Proteins 0.000 claims description 2
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 claims description 2
- 102000050760 Vitamin D-binding protein Human genes 0.000 claims description 2
- 101710179590 Vitamin D-binding protein Proteins 0.000 claims description 2
- 201000000690 abdominal obesity-metabolic syndrome Diseases 0.000 claims description 2
- 108010091628 alpha 1-Antichymotrypsin Proteins 0.000 claims description 2
- 108090000183 alpha-2-Antiplasmin Proteins 0.000 claims description 2
- 102000003801 alpha-2-Antiplasmin Human genes 0.000 claims description 2
- 125000000337 alpha-glutamyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 claims description 2
- 229940105784 coagulation factor xiii Drugs 0.000 claims description 2
- 229940012413 factor vii Drugs 0.000 claims description 2
- 108091022862 fatty acid binding Proteins 0.000 claims description 2
- 108010052295 fibrin fragment D Proteins 0.000 claims description 2
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 claims description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 claims description 2
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 claims description 2
- 102100023541 Glutathione S-transferase omega-1 Human genes 0.000 claims 2
- 101710145248 Glutathione S-transferase omega-1 Proteins 0.000 claims 2
- 101710106944 Serine/threonine-protein kinase TBK1 Proteins 0.000 claims 2
- 102100038192 Serine/threonine-protein kinase TBK1 Human genes 0.000 claims 2
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 claims 2
- 239000013014 purified material Substances 0.000 claims 2
- 101800000407 Brain natriuretic peptide 32 Proteins 0.000 claims 1
- 102400000667 Brain natriuretic peptide 32 Human genes 0.000 claims 1
- 101800002247 Brain natriuretic peptide 45 Proteins 0.000 claims 1
- 102000036675 Myoglobin Human genes 0.000 claims 1
- 108010062374 Myoglobin Proteins 0.000 claims 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 claims 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 claims 1
- 230000001594 aberrant effect Effects 0.000 claims 1
- 238000010924 continuous production Methods 0.000 claims 1
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 claims 1
- OHDXDNUPVVYWOV-UHFFFAOYSA-N n-methyl-1-(2-naphthalen-1-ylsulfanylphenyl)methanamine Chemical compound CNCC1=CC=CC=C1SC1=CC=CC2=CC=CC=C12 OHDXDNUPVVYWOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- HPNRHPKXQZSDFX-OAQDCNSJSA-N nesiritide Chemical compound C([C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CSSC[C@@H](C(=O)N1)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=CC=C1 HPNRHPKXQZSDFX-OAQDCNSJSA-N 0.000 claims 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 103
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 description 22
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 12
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 11
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 10
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 description 9
- 108010075843 alpha-2-HS-Glycoprotein Proteins 0.000 description 9
- 102000012005 alpha-2-HS-Glycoprotein Human genes 0.000 description 9
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 9
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 9
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 7
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 7
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 5
- OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N N-Acetyl-D-Galactosamine Chemical group CC(=O)N[C@H]1[C@@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-CBQIKETKSA-N 0.000 description 5
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 5
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 5
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 5
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 5
- 241000894007 species Species 0.000 description 5
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 5
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 4
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 4
- 101000871708 Homo sapiens Proheparin-binding EGF-like growth factor Proteins 0.000 description 4
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 4
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 4
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 4
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 4
- 102100033762 Proheparin-binding EGF-like growth factor Human genes 0.000 description 4
- 238000004455 differential thermal analysis Methods 0.000 description 4
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 4
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 4
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 4
- 125000000311 mannosyl group Chemical group C1([C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 4
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 4
- 101710186708 Agglutinin Proteins 0.000 description 3
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 3
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 102400000597 Glycosylated protein A Human genes 0.000 description 3
- 101800002131 Glycosylated protein A Proteins 0.000 description 3
- 101710146024 Horcolin Proteins 0.000 description 3
- SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N L-fucopyranose Chemical group C[C@@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-DHVFOXMCSA-N 0.000 description 3
- 101710189395 Lectin Proteins 0.000 description 3
- 101710179758 Mannose-specific lectin Proteins 0.000 description 3
- 101710150763 Mannose-specific lectin 1 Proteins 0.000 description 3
- 101710150745 Mannose-specific lectin 2 Proteins 0.000 description 3
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical class CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 3
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical group CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 3
- 230000004989 O-glycosylation Effects 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 3
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 3
- 239000000910 agglutinin Substances 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 230000022811 deglycosylation Effects 0.000 description 3
- 238000011161 development Methods 0.000 description 3
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 3
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 3
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 235000008995 european elder Nutrition 0.000 description 3
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 3
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 3
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 3
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 239000000107 tumor biomarker Substances 0.000 description 3
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 108010005094 Advanced Glycation End Products Proteins 0.000 description 2
- 108010041181 Aleuria aurantia lectin Proteins 0.000 description 2
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 2
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 2
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 2
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 2
- 241000219726 Griffonia simplicifolia Species 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 2
- 108010046016 Peanut Agglutinin Proteins 0.000 description 2
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 2
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 2
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 2
- 206010036790 Productive cough Diseases 0.000 description 2
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 description 2
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 description 2
- 241000208829 Sambucus Species 0.000 description 2
- 235000018735 Sambucus canadensis Nutrition 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102100039037 Vascular endothelial growth factor A Human genes 0.000 description 2
- 108010046516 Wheat Germ Agglutinins Proteins 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 2
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 235000007123 blue elder Nutrition 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 2
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 2
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 235000007124 elderberry Nutrition 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 235000001727 glucose Nutrition 0.000 description 2
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 2
- 229920000344 molecularly imprinted polymer Polymers 0.000 description 2
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 2
- 108091000699 pea lectin Proteins 0.000 description 2
- HXITXNWTGFUOAU-UHFFFAOYSA-N phenylboronic acid Chemical compound OB(O)C1=CC=CC=C1 HXITXNWTGFUOAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 2
- 238000002331 protein detection Methods 0.000 description 2
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M sodium periodate Chemical compound [Na+].[O-]I(=O)(=O)=O JQWHASGSAFIOCM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 210000003802 sputum Anatomy 0.000 description 2
- 208000024794 sputum Diseases 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 125000000341 threoninyl group Chemical group [H]OC([H])(C([H])([H])[H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 125000000430 tryptophan group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12 0.000 description 2
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 2
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- 125000003287 1H-imidazol-4-ylmethyl group Chemical group [H]N1C([H])=NC(C([H])([H])[*])=C1[H] 0.000 description 1
- HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 3-[3-[3,5-dihydroxy-6-methyl-4-(3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]oxydecanoyloxy]decanoic acid;hydrate Chemical compound O.OC1C(OC(CC(=O)OC(CCCCCCC)CC(O)=O)CCCCCCC)OC(C)C(O)C1OC1C(O)C(O)C(O)C(C)O1 HVCOBJNICQPDBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710104910 Alpha-1B-glycoprotein Proteins 0.000 description 1
- 102100033326 Alpha-1B-glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- 102100031366 Ankyrin-1 Human genes 0.000 description 1
- 241000228257 Aspergillus sp. Species 0.000 description 1
- 201000001320 Atherosclerosis Diseases 0.000 description 1
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 240000003521 Bauhinia purpurea Species 0.000 description 1
- 235000011462 Bauhinia purpurea Nutrition 0.000 description 1
- 102100022548 Beta-hexosaminidase subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- -1 ConA Proteins 0.000 description 1
- 108010062580 Concanavalin A Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 241000255601 Drosophila melanogaster Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 108050001049 Extracellular proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 238000012413 Fluorescence activated cell sorting analysis Methods 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N Fucose Natural products C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-SLPGGIOYSA-N 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 108010046569 Galectins Proteins 0.000 description 1
- 102000007563 Galectins Human genes 0.000 description 1
- 208000015872 Gaucher disease Diseases 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 1
- 102000002068 Glycopeptides Human genes 0.000 description 1
- 108010015899 Glycopeptides Proteins 0.000 description 1
- 229920002683 Glycosaminoglycan Polymers 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000899806 Homo sapiens Retinal guanylyl cyclase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000851376 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Proteins 0.000 description 1
- 108010042653 IgA receptor Proteins 0.000 description 1
- 108010058683 Immobilized Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 1
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 description 1
- 101710197072 Lectin 1 Proteins 0.000 description 1
- 101710198419 Lectin 11 Proteins 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241000218212 Maclura pomifera Species 0.000 description 1
- 102000001696 Mannosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010054377 Mannosidases Proteins 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 102000007474 Multiprotein Complexes Human genes 0.000 description 1
- 108010085220 Multiprotein Complexes Proteins 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 1
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 108020001621 Natriuretic Peptide Proteins 0.000 description 1
- 102000004571 Natriuretic peptide Human genes 0.000 description 1
- 102000005348 Neuraminidase Human genes 0.000 description 1
- 108010006232 Neuraminidase Proteins 0.000 description 1
- 208000010577 Niemann-Pick disease type C Diseases 0.000 description 1
- 102000011931 Nucleoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108010061100 Nucleoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108010061952 Orosomucoid Proteins 0.000 description 1
- 102000012404 Orosomucoid Human genes 0.000 description 1
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 description 1
- 102000000447 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Human genes 0.000 description 1
- 108010055817 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100034014 Prolyl 3-hydroxylase 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 1
- 241000589540 Pseudomonas fluorescens Species 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 108010017507 Ricinus communis agglutinin-1 Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 240000006028 Sambucus nigra Species 0.000 description 1
- 235000003142 Sambucus nigra Nutrition 0.000 description 1
- 208000021811 Sandhoff disease Diseases 0.000 description 1
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 1
- 208000022292 Tay-Sachs disease Diseases 0.000 description 1
- 241001313536 Thermothelomyces thermophila Species 0.000 description 1
- 241000223259 Trichoderma Species 0.000 description 1
- 241000255993 Trichoplusia ni Species 0.000 description 1
- 102100036857 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8 Human genes 0.000 description 1
- 208000007930 Type C Niemann-Pick Disease Diseases 0.000 description 1
- 241000510764 Villosa Species 0.000 description 1
- AJTUNRJTNFESSC-DPBDWXOKSA-N [(3s)-1-[[(2s,3r,4r,5s,6r)-6-[[(2r,3r,4r,5s,6r)-3-[[(3s)-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3s)-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxyoxan-2-yl]oxymethyl]-2,5-dihydroxy-4-[(3s)-3-hydroxytetradecanoyl]oxyoxan-3-yl]amino]- Chemical compound O[C@H]1[C@H](OC(=O)C[C@@H](O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](NC(=O)C[C@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)[C@@H](O)O[C@@H]1CO[C@H]1[C@H](NC(=O)C[C@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCC)[C@@H](OC(=O)C[C@H](CCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](CO)O1 AJTUNRJTNFESSC-DPBDWXOKSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 238000010306 acid treatment Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000001154 acute effect Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Chemical group CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 208000035269 cancer or benign tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000002490 cerebral effect Effects 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000013211 curve analysis Methods 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 239000000104 diagnostic biomarker Substances 0.000 description 1
- 150000002009 diols Chemical class 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 108010039433 dolichos biflorus agglutinin Proteins 0.000 description 1
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 108010014507 erythroagglutinating phytohemagglutinin Proteins 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 150000002304 glucoses Chemical class 0.000 description 1
- 125000002791 glucosyl group Chemical group C1([C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O1)CO)* 0.000 description 1
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 1
- 108091005996 glycated proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000036252 glycation Effects 0.000 description 1
- 108091010992 glycosaminoglycan binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000036208 glycosaminoglycan binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 229930182470 glycoside Natural products 0.000 description 1
- 150000002338 glycosides Chemical class 0.000 description 1
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000012760 immunocytochemical staining Methods 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 238000003364 immunohistochemistry Methods 0.000 description 1
- 238000010324 immunological assay Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000008611 intercellular interaction Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 108010034897 lentil lectin Proteins 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 206010025135 lupus erythematosus Diseases 0.000 description 1
- 108010003491 maclurin Proteins 0.000 description 1
- 230000031852 maintenance of location in cell Effects 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 150000002704 mannoses Chemical class 0.000 description 1
- 238000005621 mannosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000873 masking effect Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 238000012775 microarray technology Methods 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000000692 natriuretic peptide Substances 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 150000001282 organosilanes Chemical class 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 1
- 230000001323 posttranslational effect Effects 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 230000027380 protein glycosylation in Golgi Effects 0.000 description 1
- 230000026447 protein localization Effects 0.000 description 1
- 238000004451 qualitative analysis Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical group CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 1
- 125000005629 sialic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 108010002645 sophora japonica agglutinin Proteins 0.000 description 1
- 108010048090 soybean lectin Proteins 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 238000012916 structural analysis Methods 0.000 description 1
- 108010064394 succinylated wheat germ agglutinin Proteins 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 208000001072 type 2 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 238000002424 x-ray crystallography Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57438—Specifically defined cancers of liver, pancreas or kidney
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/46—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
- G01N2333/47—Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
- G01N2333/4701—Details
- G01N2333/4724—Lectins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2440/00—Post-translational modifications [PTMs] in chemical analysis of biological material
- G01N2440/38—Post-translational modifications [PTMs] in chemical analysis of biological material addition of carbohydrates, e.g. glycosylation, glycation
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
Description
よびO結合型グリコシル化に供される場合もある。
7), Trends Immunol 28: 482-490)。これは、試料中のたんぱく質レベルの過小評価及び診断試験における偽の結果につながる可能性がある。
(a)基質上に不動化され標的に特異的に結合する捕捉抗体に対し、試料を接触させる工程と;
(b)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、標的と特異的に結合する検出抗体に接触させる工程と;
(c)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、それぞれ別個の(すなわち異なる)グリカン特異性を有する1つ以上の別個のグリカン結合剤に接触させる工程と;
(d)(b)において検出抗体を介して結合された標的のレベルを測定する工程と;
(e)(c)において標的に結合された剤のレベルを測定する工程と;を含む。
(a)基質上に不動化され標的に特異的に結合する捕捉抗体に対し、試料を接触させる工程と;
(b)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、標的と特異的に結合する検出抗体に接触させる工程と;
(c)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、グリカン結合剤に接触させる工程と;
(d)(b)において検出抗体を介して結合された標的のレベルを測定する工程と;
(e)(c)においてグリカン結合剤に結合された標的のレベルを測定する工程と;を含む。
、すなわち、異なるグリカンの検出を識別する検出分子を使用する場合、あるいは、各標的が基質の離散試験領域(DTR)に不動化されている異なる標的を検査する場合には、異なるグリカンの存在を決定するための反応を、同じ離散試験領域に対して実行してもよい。代わりに、異なる種、すなわち、たんぱく質、ペプチドまたは炭水化物抗原およびグリカン等を含む反応に対して同じ検出分子を使用する場合は、特徴評価の対象となる標的をユーザーが決定できるように、標的ごとに異なった標的反応部位が物理的に分離することを必須とするのが好ましい。例えば、同じ検出分子を使用する場合には、同じ標的種上に存在する異種グリカンを決定するための反応を、例えばバイオチップといった、物理的に別々の反応基質に対して、またはマイクロタイタープレートのような離散試験領域を組み込んだ単一の基質に対して、遂行する場合がある。本発明は、患者から採取された試料からの標的分子用のグリコシル化プロファイルを、効率的に且つ経済的に生成することを実現する。これは、患者試料中のたんぱく質グリコシル化の特徴評価において、有意なブレイクスルーである。
異性抗体)、一本鎖可変断片(scFvS)、多重特異性抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ならびに標的上の所与のエピトープが認識するのに必要なドメインを含む融合たんぱく質を挙げることができるが、これらに限定されない。本発明との関連において言及されている抗体は、モノクローナル抗体のことを指すのが好ましい。また、検出を可能にするための種々の検出可能標識に抗体が抱合される場合がある。これらの検出可能標識には、限定されないが、放射性核種、フルオロフォア、染料、または例えばセイヨウワサビペルオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼ等の酵素が挙げられる。
た組換えレクチン分子、または、例えばモノクローナル抗体といった、グリカン免疫原標的に対して産生された抗体、抗原結合(Fab)断片、一本鎖可変断片(scFvs)、一本鎖抗体を含む、誘導体組換え抗体断片を挙げることができる。また、精製グリカンもしくは組換えグリカン、またはグリコサミノグリカン結合型のたんぱく質およびペプチドも、R型、C型、P型、C型およびI型のレクチン;哺乳動物、微生物もしくは植物源由来のガレクチン;アプタマー;ならびに分子刷込ポリマーを含む、グリカン特異的検出において使用できる。グリカン結合剤は、レクチンであることが好ましい。
って得ることもできる。本発明において、好ましい実施形態では、バイオマーカーたんぱく質の総たんぱく質レベル、および同じバイオマーカーたんぱく質のグリコシル化たんぱく質レベルに基づいて比率を計算することによって、AUC測定値を良好化することが可能である。更なる実施形態において、AUC測定値を良好化するため、総たんぱく質レベル、非グリコシル化たんぱく質レベル、グリコシル化たんぱく質レベル、たんぱく質に対する自己抗体のレベル、グリカンに対する自己抗体のレベル、および個々のグリカンのレベル、例えば総たんぱく質Aのレベル対グリコシル化たんぱく質Aのレベル、総たんぱく質Aのレベル対非グリコシル化たんぱく質Aのレベル、非グリコシル化たんぱく質Aのレベル対たんぱく質Aに対する自己抗体レベルなど;といった種のうちの1つ以上を対象とした種内比較および種間比較から導き出された測定値に基づいて比率が計算される場合もあれば、加えてまたは代わりに、異なる検体、例えば、たんぱく質Aおよびたんぱく質Bにおけるこれらのレベル間の比較または比率計算が行われる場合もある。
(a)標的に特異的に結合する、不動化された捕捉抗体に対し、試料を接触させる工程と;
(b)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、標的と特異的に結合する検出抗体に接触させる工程と;
(c)不動化された捕捉抗体に結合された標的を、グリカン結合剤に接触させる工程と;
(d)(b)において検出抗体を介して結合された標的のレベルを測定する工程と;
(e)(c)においてグリカン結合剤を介して結合された標的のレベルを測定する工程と;を含む。
(a)上述されている第1の態様の方法を遂行することによって、患者から採取された試料中の標的のグリコシル化シグネチャを決定する工程と;
(b)上述した第2の態様の方法によって患者から採取された試料中の標的のレベルを決定する工程と;
(c)試料中の標的に対する自己抗体のレベルを測定する工程と;(d)試料中のグリカン自己抗体シグネチャを測定する工程と;
(e)工程(a)〜(d)のうちのいずれか1つ以上で得られた結果に基づいて患者プロファイルを編纂する工程であって(e)の患者プロファイルが疾患の存在または不在を示す編纂工程;のうちの少なくとも1つを含む。
ミン、α2抗プラスミン、アポリポたんぱく質A1、補因子H、免疫グロブリンG(IgG)、免疫グロブリンGのFc結合たんぱく質、ホルネリン、フィブリノゲン、がん胎児性抗原(CEA)、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン(NGAL)、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、インターロイキン−2(IL−2)、トロンボモジュリン(TM)、Dダイマー、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、MMP9/NGAL複合体、Fasリガンド、C反応性たんぱく質(CRP)、核マトリックスたんぱく質22(NMP22)、膀胱腫瘍抗原(BTA)、サイトケラチン18(CK−18)、インターロイキン−1(IL−1)、腫瘍壊死因子α(TNFα)、可溶性腫瘍壊死因子受容体1(sTNFr1)、可溶性腫瘍壊死因子受容体2(sTNFr1)、遊離型の前立腺特異抗原(FPSA)、全前立腺特異抗原(TPSA)、ヒアルロニダーゼ(HA)、インターロイキン−10(IL−10)、ヴォン・ヴィレブランド因子(vWF)、第VII因子、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ(NAMPT)、細胞間接着分子1(ICAM−1)、血管細胞接着分子1(VCAM−1)、脂肪酸結合たんぱく質1(FABP1)、脂肪酸結合たんぱく質2(FABP2)、脂肪酸結合たんぱく質3(FABP3)、脂肪酸結合たんぱく質4(FABP4)、脂肪酸結合たんぱく質5(FABP5)、脂肪酸結合たんぱく質6(FABP6)、脂肪酸結合たんぱく質7(FABP7)、脂肪酸結合たんぱく質8(FABP8)、脂肪酸結合たんぱく質9(FABP9)、グリア線維性酸性たんぱく質(GFAP)、S100カルシウム結合たんぱく質A10(S100A10)、S100カルシウム結合たんぱく質A11(S100A11)、インターロイキン−18(IL−18)、インターロイキン−1受容体アンタゴニスト(IL1−ra)、α−グルタミルトランスペプチダーゼ(α−GT)、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、シスタチンC(CysC)、C3aDesArg、トロポニンT(TnT)、トロポニンI(TnI)、マクロファージ炎症たんぱく質1α(MIP−1α)、アディポネクチン、分化抗原群26(CD26)、GMCSF、インターロイキン−15(IL−15)、インターロイキン−5(IL−5)、可溶性インターロイキン2α(sIL−2α)、可溶性インターロイキン6受容体(sIL−6r)、ピルビン酸キナーゼアイソザイム型M2(M2−PK)、分泌性白血球プロテイナーゼ阻害剤(SLPI)、炭水化物抗原125(CA−125)、炭水化物抗原19−9(CA−19−9)、前立腺特異抗原(PSA)、BRCA1、BRCA2、分化抗原群15(CD15)、分化抗原群20(CD20)、分化抗原群30(CD30)、分化抗原群45(CD45)、ヒト上皮増殖因子受容体2(HER−2)、脳性ナトリウム利尿ペプチド(Pro−BNP)、グリコーゲンホスホリラーゼBB(GPBB)、ミオグロビン、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、乳酸脱水素酵素(LDH)、クレアチンキナーゼ(CK)からなる群から選択される。また、これらのたんぱく質の変種、断片またはドメインは、好適な標的となることが理解されるであろう。
ャワンタケレクチン(AAL, Aleuria Aurantia Lectin)、植物または微生物源由来の組換えレクチン等のレクチンである。
方法において用いられるソリッドステートデバイスは、Biochip Array Technology system(BAT)(Randox Laboratories Limitedから入手可能)であることが好ましく、Evidence Evolution、Evidence InvestigatorおよびMultistat装置(Randox Laboratoriesから入手可能)を使用して、試料中のバイオマーカーのレベルを決定できれば、より好ましい。
以下の非限定例を参照しながら、本発明について更に説明する。
グリコシル化によるレクチン/抗体エピトープのマスキングを用いたバイオマーカーの検出の向上
レクチンおよび抗体を用いた、フェチュインAの検出
フェチュインAは、肝臓を介して循環系に分泌される急性期の抗炎症性糖たんぱく質であり、乳がん細胞における成長シグナル伝達の媒介物質として同定されてきた。フェチュインA上には、6つのグリコシル化部位が存在し、たんぱく質のC末端に向かって4つのO結合型n−アセチルガラクトサミン部位が位置していることが、報告されている。健常者または乳がん患者から採取された血清中において捕捉されたフェチュインAの検出が、これらのグリコシル化修飾によってマスキングされる可能性が評価された。図10に、VVAレクチンを用いたことにより、n−アセチルガラクトサミン含有フェチュインAたんぱく質が検出可能であったと共に、健常対照よりも乳がん患者の方が実に高値であったことが、図示されている。一方、フェチュインA総たんぱく質の検出は、或る特定のディテクター抗体(図10BにおいてAb1と呼ばれる)を使用して阻害されたのに対し、代替のディテクター(図10CのAb2)では、この検出が阻害されず、試料群にわたって同様なレベルのたんぱく質が検出された。したがって、或る検出試薬の結合が、たんぱく質
のグリコシル化によって阻害される可能性がある、と仮定して差し支えない。イムノアッセイとの関連においてだけでなく、プロテオミクスベースのバイオマーカーの同定においても、多様なグリコシル化状態を介してたんぱく質の検出が阻害された場合、結果が誤差を生じた値で返される可能性がある。
糖たんぱく質マーカーの多重化分析によって導き出された付加的利益の原理
早期疾患患者の同定精度が低いことから、膵臓がんに対する単一の循環疾患バイオマーカーによる検出では不十分であることが立証されてきた。したがって、複数の疾患マーカーの同時検出において多面的病理が反映される可能性があるという考えが浮上してきた。多重糖たんぱく質腫瘍マーカーの同時評価による、膵臓がんに対する診断力改善の原理の証明を、膵臓がん血清試料と対照とを比較して、図11に示す。この図中、3つの検体を併用したロジスティック回帰では、CA19−9、CEAまたはA1AGのいずれかを別々に分析した場合よりもROC AUC値が高値であったことが、図示されている。
グリコシル化による臨床上の付加的利益の例
グリコシル化を用いての、患者の血清試料中の膵臓がんバイオマーカーの検出の向上
従来の免疫比濁(immunoturbimetric)総たんぱく質とバイオチップベースのグリコシル化α−1酸性糖たんぱく質(A1AG)の検出の比較を実行した。引き続いての分析を用い、ディベロップメント患者試料コホート(development patient sample cohort)における膵臓がんの同定に際して、各アッセイプラットフォームの診断力を決定した。総たんぱく質検出法では、ROC AUC値として0.648が返された。この値は、統計的有意性に到達していなかった(図12A中、p=0.2155)。加えて、膵臓がん群と健常対照群との間では、総たんぱく質全般において統計的な差は見られなかった(図12B中、p=0.1614)。一方、フコシル化A1AGのAAL媒介検出を用いたことで、ROC出力値が顕著に上昇したことが観察された(0.919)。この値は、統計学的有意性に到達していた(図12C中、p<0.0001)。また、フコシル化A1AGの典型であるRLU出力値からも、膵臓がん群と健常群との間の差が有意であることが判明し、がんの識別におけるバイオチップベースの糖たんぱく質検出法が、感度に優れること、および臨床的利益が認められることが強調された。A1AGグリコシル化シグナルを、総たんぱく質との比として表した場合(図12のE、F)、ROC AUCの上昇(0.951)が明らかであり、診断力が更に増強されたことが観察される。
転移病巣の指標としてのがんマーカーの特定のグリコシル化
腫瘍細胞は、糖代謝をたんぱく質のグリコシル化からより高代謝的に活性な状態および消化性の高い状態に向かわせるため、たんぱく質のグリコシル化が異常な場合、がんの状態を呈する可能性がある。このようにして、CA19−9およびCEAについてバイオマーカーの特定のグリコシル化が評価されたという仮説を立てた。図13に、測定された総たんぱく質に対しAALレクチン結合を突き合わせた、フコシル化のプロッティングを示す。(AおよびBにおいて右下の楕円で強調されている)低グリコシル化たんぱく質の母集団が同定された。この母集団において、グリコシル化シグナルと総たんぱく質濃度との間の相関はさほど見られないことが観察された。低グリコシル化バイオマーカーを有する患者において、転移病巣の増大が観察された。これは、たんぱく質の特定のグリコシル化の分析から、疾患進行に関する情報を得ることが可能なことを提示するものである。
Claims (69)
- 患者から採取された試料中の標的生体分子のグリコシル化シグネチャを決定する方法であって、
(a)基質上に不動化され前記標的に特異的に結合する捕捉抗体に対し、前記試料を接触させる工程と;
(b)前記不動化された捕捉抗体に結合された前記標的を、前記標的と特異的に結合する検出抗体に接触させる工程と;
(c)前記不動化された捕捉抗体に結合された前記標的を、それぞれ異なるグリカンに対して親和性を有する1つ以上の別個のグリカン結合剤に接触させる工程と;
(d)(b)において前記検出抗体を介して結合された標的のレベルを測定する工程と;
(e)(c)において前記標的に結合された剤のレベルを測定する工程と;
を含む方法。 - 前記標的生体分子が、たんぱく質または炭水化物である、請求項1に記載の方法。
- 前記標的生体分子がたんぱく質である、請求項1または請求項2に記載の方法。
- (c)において前記標的を、複数の異なるグリカン結合剤に接触させる、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記別個のグリカン結合剤のそれぞれが、別個のレポーター分子に抱合される、請求項4に記載の方法。
- 工程(b)および(c)が、同時に遂行される、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(b)および(c)が、アッセイ基質の単一の離散試験領域にて遂行されるか、あるいは物理的に別々の反応部位に対して遂行される、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
- (b)において前記標的と特異的に結合する前記抗体、および(c)における前記グリカン結合剤のうちの1つ以上が、同じレポーター分子を使用して検出され、且つ前記反応(b)および(c)が物理的に分離された反応領域にて遂行される、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(b)〜(e)が、検査対象となる複数の異なる標的分子に対して遂行される、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
- (f)前記試料を、前記基質上に不動化された1つ以上の捕捉たんぱく質に接触させる工程であって、前記捕捉たんぱく質が前記標的と同じタイプである前記接触工程と;
(g)前記捕捉たんぱく質に結合する前記試料中の抗体(自己抗体)レベルを測定する工程と;を更に別途に含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法。 - 工程(a)および(f)が、実質的に同時に且つ物理的に分離された反応部位にて遂行される、請求項10に記載の方法。
- 工程(b)、(c)および(g)が単一のプロセスとして遂行される、請求項10に記載の方法。
- 工程(f)および(g)が、工程(b)および(c)の反応部位と比較して物理的に分離された反応部位に対して遂行される、請求項10に記載の方法。
- (h)前記試料を前記基質上に不動化された1つ以上の捕捉グリカンに接触させる工程と;(i)前記捕捉グリカンに結合する前記試料中の抗体(自己抗体)のレベルを測定する工程と;
を更に別途に含む、請求項1〜13のいずれか一項に記載の方法。 - 工程(a)および(h)ならびに任意選択的に(f)もまた同時に遂行される、請求項14に記載の方法。
- 工程(b)、(c)および(i)ならびに任意選択的に(g)もまた、単一のプロセスとして遂行される、請求項14に記載の方法。
- 工程(h)および(i)が、工程(b)および(c)の反応部位と比較して物理的に分離された反応部位にて遂行される、請求項16に記載の方法。
- 前記工程が、検査対象となる複数の異なる標的分子、および/または検査対象となる複数の異なるグリカンを含んでなる多重化配列に対して遂行される、請求項1〜17のいずれか一項に記載の方法。
- 患者から採取された試料中の標的生体分子のレベルを決定する方法であって、前記方法が、
(a)前記試料を前記標的に特異的に結合する不動化された捕捉抗体に接触させる工程と;
(b)前記不動化された捕捉抗体に結合された前記標的を、前記標的と特異的に結合する検出抗体に接触させる工程と;
(c)前記不動化された捕捉抗体に結合された前記標的を、グリカン結合剤に接触させる工程と;
(d)(b)において前記検出抗体を介して結合された前記標的のレベルを測定する工程と;
(e)(c)において前記グリカン結合剤を介して結合された前記標的のレベルを測定する工程と;を含む、方法。 - 前記標的がたんぱく質または炭水化物である、請求項19に記載の方法。
- 前記標的がたんぱく質である、請求項20に記載の方法。
- 工程(b)および(c)が同時に遂行される、請求項19〜21のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(b)および(c)が、アッセイ基質における単一の離散試験領域に対して遂行されるか、あるいは物理的に分離された反応領域に対して遂行される、請求項19〜22のいずれか一項に記載の方法。
- (b)において前記標的と特異的に結合する前記抗体、および(c)における前記グリカン結合剤のうちの1つ以上が、同じレポーター分子を使用して検出され、且つ前記反応(b)および(c)が物理的に分離された反応部位にて遂行される、請求項19〜23のいずれか一項に記載の方法。
- 工程(b)〜(e)が連続プロセスにて遂行される、請求項19〜24のいずれか一項に記載の方法。
- (f)前記試料を前記基質上に不動化された捕捉たんぱく質に接触させる工程と;
(g)前記捕捉たんぱく質に結合する前記試料中の抗体(自己抗体)のレベルを測定する工程と;を更に含む、請求項19〜25のいずれか一項に記載の方法。 - 工程(a)および(f)が同時に遂行される、請求項26に記載の方法。
- 工程(b)、(c)および(g)が単一のプロセスにて遂行される、請求項26に記載の方法。
- 工程(f)および(g)が、工程(b)および(c)の反応部位と比較して物理的に分離された反応部位に対して遂行される、請求項28に記載の方法。
- (h)前記試料を前記基質上に不動化された1つ以上の捕捉グリカンに接触させる工程と;
(i)前記捕捉グリカンに結合する前記試料中の抗体(自己抗体)のレベルを測定する工程と;を更に含む、請求項19〜29のいずれか一項に記載の方法。 - 工程(a)および(h)ならびに任意選択的に(f)もまた同時に遂行される、請求項30に記載の方法。
- 工程(b)、(c)および(i)ならびに任意選択的に(g)もまた同時に遂行される、請求項30に記載の方法。
- 工程(h)および(i)が工程(b)の反応部位と比較して物理的に分離された反応部位に対して遂行される、請求項32に記載の方法。
- 前記工程が、検査対象となる複数の異なる標的分子、および/または検査対象となる複数の異なるグリカンを含んでなる多重化配列に対して遂行される、請求項19〜33のいずれか一項に記載の方法。
- 前記捕捉抗体および検出抗体のいずれか一方または両方が、前記標的上の非グリコシル部位に対して特異的である、請求項19〜34のいずれか一項に記載の方法。
- 患者における疾患の存在または不在を同定する方法であって、(a)請求項1〜18のいずれか一項に記載の患者から採取された試料中の標的生体分子のグリコシル化シグネチャを決定する工程と;(b)請求項19〜35のいずれか一項に記載の方法によって患者から採取された試料中の前記標的のレベルを決定する工程と;(c)前記試料中の当該の標的に対する自己抗体のレベルを測定する工程と;(d)前記試料中の前記グリカン自己抗体プロファイルを決定する工程と;(e)工程(a)〜(d)のうちのいずれか1つ以上で得られた結果に基づいて患者プロファイルを編纂する工程であって(e)の前記患者プロファイルが前記疾患の存在または不在を示す前記編纂工程;のうちの少なくとも1つを含む、方法。
- 前記標的のレベルを、特異的検出抗体を介した結合を測定することによって決定し、その標的の前記グリコシル化シグネチャを、特異的グリカン結合剤を介した結合を測定することによって決定し、前記標的に対する自己抗体のレベルを、前記標的に対する特異的自
己抗体の結合を測定することによって決定し、前記グリカン自己抗体プロファイルを、前記グリカンに対する特異的自己抗体の結合を測定することによって決定する、請求項36に記載の方法。 - 前記工程が多重化配列に対して遂行される、請求項36または請求項37に記載の方法。
- 前記測定された標的が、モノアミンオキシダーゼB(MAO−B)、トロポミオシン、凝固第XIII因子、アポリポたんぱく質E(APOE)、グルタチオンS−トランスフェラーゼオメガ1(GSTO−1)、P−セレクチン、L−セレクチン、E−セレクチン、単球走化性たんぱく質1(MCP−1)、インターロイキン−1α(IL−1α)、インターロイキン−1β(IL−1β)、インターロイキン−8(IL−8)、Iインターフェロン−α(IFN−α)、血管内皮増殖因子(VEGF)、内皮増殖因子(EGF)、アファミン、α1−抗キモトリプシン、α2−マクログロブリン、アポリポたんぱく質B100(APOB100)、補体C3、補体C5、TANK結合キナーゼ1(TBK−1)、ビタミンD結合たんぱく質、α1−B糖たんぱく質、ヘモペキシン、血清アルブミン、セルロプラスミン、α2抗プラスミン、アポリポたんぱく質A1、補因子H、免疫グロブリンG(IgG)、免疫グロブリンG Fc結合たんぱく質、ホルネリン、フィブリノゲン、がん胎児性抗原(CEA)、好中球ゼラチナーゼ関連リポカリン(NGAL)、ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)、インターロイキン−2(IL−2)、トロンボモジュリン(TM)、Dダイマー、マトリックスメタロペプチダーゼ9(MMP9)、MMP9/NGAL複合体、Fasリガンド、C反応性たんぱく質(CRP)、核マトリックスたんぱく質22(NMP22)、膀胱腫瘍抗原(BTA)、サイトケラチン18(CK−18)、インターロイキン−1(IL−1)、腫瘍壊死因子α(TNFα)、可溶性腫瘍壊死因子受容体1(sTNFr1)、可溶性腫瘍壊死因子受容体2(sTNFr1)、遊離型の前立腺特異抗原(FPSA)、全前立腺特異抗原(TPSA)、ヒアルロニダーゼ(HA)、インターロイキン−10(IL−10)、ヴォン・ヴィレブランド因子(vWF)、第VII因子、ニコチンアミドホスホリボシルトランスフェラーゼ(NAMPT)、細胞間接着分子1(ICAM−1)、血管細胞接着分子1(VCAM−1)、脂肪酸結合たんぱく質1(FABP1)、脂肪酸結合たんぱく質2(FABP2)、脂肪酸結合たんぱく質3(FABP3)、脂肪酸結合たんぱく質4(FABP4)、脂肪酸結合たんぱく質5(FABP5)、脂肪酸結合たんぱく質6(FABP6)、脂肪酸結合たんぱく質7(FABP7)、脂肪酸結合たんぱく質8(FABP8)、脂肪酸結合たんぱく質9(FABP9)、グリア線維性酸性たんぱく質(GFAP)、S100カルシウム結合たんぱく質A10(S100A10)、S100カルシウム結合たんぱく質A11(S100A11)、インターロイキン−18(IL−18)、インターロイキン−1受容体アンタゴニスト(IL1−ra)、α−グルタミルトランスペプチダーゼ(α−GT)、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、シスタチンC(CysC)、C3aDesArg、トロポニンT(TnT)、トロポニンI(TnI)、マクロファージ炎症たんぱく質1α(MIP−1α)、アディポネクチン、分化抗原群26(CD26)、GMCSF、インターロイキン−15(IL−15)、インターロイキン−5(IL−5)、可溶性インターロイキン2α(sIL−2α)、可溶性インターロイキン6受容体(sIL−6r)、ピルビン酸キナーゼアイソザイム型M2(M2−PK)、分泌性白血球プロテイナーゼ阻害剤(SLPI)、炭水化物抗原125(CA−125)、炭水化物抗原19−9(CA−19−9)、前立腺特異抗原(PSA)、BRCA1、BRCA2、分化抗原群15(CD15)、分化抗原群20(CD20)、分化抗原群30(CD30)、分化抗原群45(CD45)、ヒト上皮増殖因子受容体2(HER−2)、脳性ナトリウム利尿ペプチド(Pro−BNP)、グリコーゲンホスホリラーゼBB(GPBB)、ミオグロビン、アスパラギン酸トランスアミナーゼ(AST)、乳酸脱水素酵素(LDH)、クレアチンキナーゼ(CK)からなる群から選択される、請求項1〜38のいずれか一項に
記載の方法。 - 前記特異的グリカン結合剤がレクチンである、請求項1〜39のいずれか一項に記載の方法。
- 前記疾患が心血管疾患、アルツハイマー病等の神経障害、がん、炎症性疾患、または代謝症候群からなる群から選択される、請求項1〜40のいずれか一項に記載の方法。
- 前記疾患ががんである、請求項41に記載の方法。
- 前記がんが膵臓がんである、請求項42に記載の方法。
- 標的生体分子がCEA、CA19−9およびA1AGからなるリストから選択される、請求項43に記載の方法。
- CEA、CA19−9およびA1AG測定値が任意の組み合わせで利用される、請求項44に記載の方法。
- CEA、CA19−9およびA1AGグリコシル化測定値が任意の組み合わせで利用される、請求項44に記載の方法。
- 前記グリコシル化の度量法(measurement)がフコシル化である、請求項46に記載の方法。
- バイオマーカーグリコシル化がグリカン結合剤を用いて検出される、請求項46または47に記載の方法。
- 前記特異的グリカン結合剤がレクチンである、請求項48に記載の方法。
- 前記レクチンがAALである、請求項49に記載の方法。
- 前記標的生体分子がA1AGである、請求項44に記載の方法。
- グリコシル化A1AGが測定される、請求項46に記載の方法。
- 前記グリコシル化の度量法がフコシル化である、請求項52に記載の方法。
- グリコシル化A1AGと総A1AGとの比率が計算される、請求項44または46に記載の方法。
- A1AGがフコシル化されている、請求項54に記載の方法。
- バイオマーカーグリコシル化がグリカン結合剤を用いて検出される、請求項52〜55に記載の方法。
- 前記特異的グリカン結合剤がレクチンである、請求項56に記載の方法。
- 前記レクチンがAALである、請求項57に記載の方法。
- CA19−9をCA19−9に特異的に結合する抗体と接触させ、結果として生じる不
動化した精製材料を、グリカン結合剤によるグリコシル化に関して評価する、請求項44に記載の方法。 - CA19−9をCA19−9に特異的に結合する抗体と接触させ、結果として生じる不動化した精製材料を、グリカン結合剤を用いたフコシル化に関して評価する、請求項44に記載の方法。
- 前記特異的グリカン結合剤がレクチンである、請求項59または60に記載の方法。
- 前記レクチンがAALである、請求項61に記載の方法。
- 標的生体分子に特異的に結合する捕捉抗体が不動化されているアッセイチップと;その捕捉抗体を介して特異的に結合される生体分子が不動化されている更なるアッセイチップと;を含む基質。
- 患者から採取された試料中のグリカン自己抗体を介して特異的に認識されるグリカンが不動化されるアッセイチップを更に含む、請求項63に記載の基質。
- 請求項1〜62のいずれか一項に記載の方法における、請求項63または請求項64に記載の基質の使用法。
- 前記患者試料の一部をグリコシル化たんぱく質枯渇工程に供して、総たんぱく質含量に関して分析する、請求項1〜62のいずれか一項に記載の方法。
- グリコシル化および合計の標的測定値を比較して、特定のグリコシル化の状態を同定する、請求項1〜62のいずれか一項に記載の方法。
- 異常なグリコシル化が検出されたことによって疾患のリスクまたは疾患の存在が示唆される、請求項67に記載の方法。
- 前記疾患が転移性疾患である、請求項68に記載の方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB1522839.8 | 2015-12-23 | ||
GBGB1522839.8A GB201522839D0 (en) | 2015-12-23 | 2015-12-23 | Method |
PCT/GB2016/054074 WO2017109518A1 (en) | 2015-12-23 | 2016-12-23 | Determination of glycosylation signature |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019500609A true JP2019500609A (ja) | 2019-01-10 |
JP2019500609A5 JP2019500609A5 (ja) | 2020-02-06 |
JP6880033B2 JP6880033B2 (ja) | 2021-06-02 |
Family
ID=55311596
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2018533606A Active JP6880033B2 (ja) | 2015-12-23 | 2016-12-23 | グリコシル化シグネチャの決定 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US11467163B2 (ja) |
EP (1) | EP3394619A1 (ja) |
JP (1) | JP6880033B2 (ja) |
CN (1) | CN108700585A (ja) |
AU (1) | AU2016378909B2 (ja) |
CA (1) | CA3009442C (ja) |
GB (1) | GB201522839D0 (ja) |
WO (1) | WO2017109518A1 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022024995A1 (ja) * | 2020-07-27 | 2022-02-03 | 国立大学法人群馬大学 | 膵臓がん又は悪性膵管内乳頭粘液性腫瘍における新規がんバイオマーカー |
Families Citing this family (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3903105A1 (en) | 2019-02-18 | 2021-11-03 | The University Of Liverpool | Method of diagnosis |
CN112924672A (zh) * | 2021-01-28 | 2021-06-08 | 中国医学科学院北京协和医院 | 一种用于诊断类风湿关节炎合并肺间质纤维化的生物标志物及其用途 |
CN117916599A (zh) * | 2021-09-07 | 2024-04-19 | 美国西门子医学诊断股份有限公司 | 生物标记物组合物及其使用方法 |
GB202203639D0 (en) | 2022-03-16 | 2022-04-27 | Randox Laboratories Ltd | Standardisation method for glycosylation arrays |
Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH07191027A (ja) * | 1993-11-16 | 1995-07-28 | Wako Pure Chem Ind Ltd | 糖蛋白質の分別測定法 |
JP2005527835A (ja) * | 2002-05-29 | 2005-09-15 | アクシス−シールド エイエスエイ | 糖化タンパク質の分析 |
US20110257029A1 (en) * | 2005-04-15 | 2011-10-20 | Haab Brian B | Biomarkers for pancreatic cancer and diagnostic methods |
US20130005598A1 (en) * | 2009-12-31 | 2013-01-03 | The Regents Of The University Of Michigan | Methods for Diagnosing The Malignant Potential of Pancreatic Cystic Lesions |
WO2015097863A1 (ja) * | 2013-12-27 | 2015-07-02 | コニカミノルタ株式会社 | 診断用情報の分析方法およびそのためのキット |
US20160084844A1 (en) * | 2010-01-08 | 2016-03-24 | Glycozym, Inc. | Methods of identifying glycopeptides recognized by disease-associated auto-antibodies |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7955837B2 (en) * | 2005-10-29 | 2011-06-07 | Bayer Technology Services Gmbh | Process for determining one or more analytes in samples of biological origin having complex composition, and use thereof |
JP5057402B2 (ja) * | 2006-10-26 | 2012-10-24 | アボット・ラボラトリーズ | 内在性の抗分析物抗体を含有する試料中の分析物の免疫アッセイ |
CA2686206A1 (en) * | 2007-05-07 | 2008-11-13 | Wyeth | Elimination of interference in immunoassays caused by anti-carbohydrate antibodies |
WO2011130332A1 (en) * | 2010-04-12 | 2011-10-20 | Academia Sinica | Glycan arrays for high throughput screening of viruses |
JP5660806B2 (ja) * | 2010-05-25 | 2015-01-28 | Lsipファンド運営合同会社 | 炎症性腸疾患等慢性炎症の鑑別方法 |
US9469686B2 (en) * | 2013-03-15 | 2016-10-18 | Abbott Laboratories | Anti-GP73 monoclonal antibodies and methods of obtaining the same |
-
2015
- 2015-12-23 GB GBGB1522839.8A patent/GB201522839D0/en not_active Ceased
-
2016
- 2016-12-23 EP EP16825874.7A patent/EP3394619A1/en active Pending
- 2016-12-23 WO PCT/GB2016/054074 patent/WO2017109518A1/en active Application Filing
- 2016-12-23 US US16/065,646 patent/US11467163B2/en active Active
- 2016-12-23 CA CA3009442A patent/CA3009442C/en active Active
- 2016-12-23 AU AU2016378909A patent/AU2016378909B2/en active Active
- 2016-12-23 CN CN201680082420.6A patent/CN108700585A/zh active Pending
- 2016-12-23 JP JP2018533606A patent/JP6880033B2/ja active Active
Patent Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH07191027A (ja) * | 1993-11-16 | 1995-07-28 | Wako Pure Chem Ind Ltd | 糖蛋白質の分別測定法 |
JP2005527835A (ja) * | 2002-05-29 | 2005-09-15 | アクシス−シールド エイエスエイ | 糖化タンパク質の分析 |
US20110257029A1 (en) * | 2005-04-15 | 2011-10-20 | Haab Brian B | Biomarkers for pancreatic cancer and diagnostic methods |
US20130005598A1 (en) * | 2009-12-31 | 2013-01-03 | The Regents Of The University Of Michigan | Methods for Diagnosing The Malignant Potential of Pancreatic Cystic Lesions |
US20160084844A1 (en) * | 2010-01-08 | 2016-03-24 | Glycozym, Inc. | Methods of identifying glycopeptides recognized by disease-associated auto-antibodies |
WO2015097863A1 (ja) * | 2013-12-27 | 2015-07-02 | コニカミノルタ株式会社 | 診断用情報の分析方法およびそのためのキット |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
ANA LUCIA R: "Antigen, antibody and immune complex detection in serum samples from rats experimentally infected wi", EXPERIMENTAL PARASITOLOGY, vol. 130, no. 3, JPN6020042286, 2012, pages 205 - 208, XP028462313, ISSN: 0004479042, DOI: 10.1016/j.exppara.2012.01.007 * |
MARKO I. VUSKOVIC: "Processing and analysis of serum antibody binding signals from Printed Glycan Arrays for diagnostic", INT. J. BIOINFORMATICS RESEARCH AND APPLICATIONS, vol. 7, no. 4, JPN6020042288, 2011, pages 402 - 426, ISSN: 0004479043 * |
TAISUKE YOSHIDA: "Decreased Serum Levels of Mature Brain-Derived Neurotrophic Factro (BDNF), but Not Its Precursor pro", PLOS ONE, vol. 7, no. 8, JPN6020042291, 2012, pages 42476, ISSN: 0004479044 * |
TINGTING YUE: "The Prevalence and Nature of Glycan Alterations on Specific Proteins in Pancreatic Cancer Patients R", MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS, vol. 8, no. 7, JPN6020042285, 2009, pages 1697 - 1707, XP055076258, ISSN: 0004479041, DOI: 10.1074/mcp.M900135-MCP200 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2022024995A1 (ja) * | 2020-07-27 | 2022-02-03 | 国立大学法人群馬大学 | 膵臓がん又は悪性膵管内乳頭粘液性腫瘍における新規がんバイオマーカー |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU2016378909B2 (en) | 2023-03-02 |
EP3394619A1 (en) | 2018-10-31 |
GB201522839D0 (en) | 2016-02-03 |
CA3009442C (en) | 2023-03-28 |
JP6880033B2 (ja) | 2021-06-02 |
WO2017109518A1 (en) | 2017-06-29 |
CA3009442A1 (en) | 2017-06-29 |
CN108700585A (zh) | 2018-10-23 |
US11467163B2 (en) | 2022-10-11 |
US20190004050A1 (en) | 2019-01-03 |
AU2016378909A1 (en) | 2018-07-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Dang et al. | Application of lectin microarrays for biomarker discovery | |
JP6880033B2 (ja) | グリコシル化シグネチャの決定 | |
Syed et al. | Role of lectin microarrays in cancer diagnosis | |
Arnold et al. | Novel glycan biomarkers for the detection of lung cancer | |
Hendrickson et al. | Analytical application of lectins | |
Biskup et al. | Serum glycome profiling: a biomarker for diagnosis of ovarian cancer | |
JP4575354B2 (ja) | 肝線維症測定用血清マーカー | |
Badr et al. | Lectin approaches for glycoproteomics in FDA-approved cancer biomarkers | |
Patwa et al. | Glycoprotein analysis using protein microarrays and mass spectrometry | |
Wu et al. | Analysis of glycan variation on glycoproteins from serum by the reverse lectin-based ELISA assay | |
Drabik et al. | Glycosylation changes in serum proteins identify patients with pancreatic cancer | |
Wang et al. | Multiplex profiling of glycoproteins using a novel bead‐based lectin array | |
Noro et al. | N-glycan structures of Wisteria floribunda agglutinin-positive Mac2 binding protein in the serum of patients with liver fibrosis | |
WO2016068226A1 (ja) | 関節リウマチマーカー | |
Sogabe et al. | Sensitive new assay system for serum wisteria floribunda agglutinin-reactive ceruloplasmin that distinguishes ovarian clear cell carcinoma from endometrioma | |
KR101583457B1 (ko) | 다중 당단백질의 발현량 및 당질변이의 측정을 통한 간암의 예측방법 | |
KR20240035629A (ko) | 단백질의 당 프로파일링을 위한 표준물질 | |
KR101143891B1 (ko) | 단백질의 비정상적인 당쇄화를 이용하는 암진단 마커 | |
Chatterjee et al. | Glycosylation of acute phase proteins: A promising disease biomarker | |
KR101100809B1 (ko) | 암 진단용 펩티드 마커 및 이를 이용한 암 진단방법 | |
WO2023175110A1 (en) | Standardisation method for glycosylation arrays | |
US20240077486A1 (en) | Flow Cytometry Platform for the Detection of Glycosylated Proteins in a Clinical Sample | |
WO2023198337A1 (en) | Means and methods for high-throughput glycoprofiling of proteins |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191220 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20191220 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20201028 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20201110 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20210210 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210325 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20210406 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210430 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6880033 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |