JP2019150027A - エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 - Google Patents
エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2019150027A JP2019150027A JP2019069638A JP2019069638A JP2019150027A JP 2019150027 A JP2019150027 A JP 2019150027A JP 2019069638 A JP2019069638 A JP 2019069638A JP 2019069638 A JP2019069638 A JP 2019069638A JP 2019150027 A JP2019150027 A JP 2019150027A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- biomarker
- eribulin
- subject
- expression level
- breast cancer
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/33—Heterocyclic compounds
- A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
- A61K31/35—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P15/00—Drugs for genital or sexual disorders; Contraceptives
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
- G01N33/57407—Specifically defined cancers
- G01N33/57415—Specifically defined cancers of breast
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Oncology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
Abstract
Description
式中、AはC1−6飽和又はC2−6不飽和炭化水素骨格であり、前記骨格は置換されていないか、又はシアノ、ハロ、アジド、Q1及びオキソから選択される1から13個の置換基、例えば1から10個の置換基をもち;
各Q1は独立してOR1、SR1、SO2R1、OSO2R1、NR2R1、NR2(CO)R1、NR2(CO)(CO)R1、NR4(CO)NR2R1、NR2(CO)OR1、(CO)OR1、O(CO)R1、(CO)NR2R1及びO(CO)NR2R1から選択され;
R1、R2及びR4は各々独立してH、C1−6アルキル、C1−6ハロアルキル、C1−6ヒドロキシアルキル、C1−6アミノアルキル、C6−10アリール、C6−10ハロアリール、C6−10ヒドロキシアリール、C1−4アルコキシ−C6アリール、C6−10アリール−C1−6アルキル、C1−6アルキル−C6−10アリール、C6−10ハロアリール−C1−6アルキル、C1−6アルキル−C6−10ハロアリール、(C1−3アルコキシ−C6アリール)−C1−3アルキル、C2−9複素環基、C2−9複素環基−C1−6アルキル、C2−9ヘテロアリール及びC2−9ヘテロアリール−C1−6アルキルから選択される。
1態様において、本発明は乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体もしくはその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を使用できるか否かを判定するため、及び/又はエリブリン、その類似体もしくはその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)による治療に対する乳房腫瘍の感受性を判定するための方法を提供する。前記方法は例えば乳癌をもつ対象に由来するサンプルをアッセイすることにより、少なくとも1種のバイオマーカーの発現レベルを測定する。少なくとも1種のバイオマーカーの低い発現レベルが確認されたならば、エリブリン、その類似体もしくはその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を乳癌の治療に使用できる及び/又は乳房腫瘍がエリブリン、その類似体もしくはその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)による治療に対して感受性であると判断する。
乳癌をもつ対象における所定のバイオマーカー(例えば表1に記載するバイオマーカー)の発現レベルはエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)に対する対象の応答性に影響を与えるという知見に鑑みると、当業者は対象におけるバイオマーカーの発現レベルに基づいて対象に適切な治療レジメンを選択することができる。従って、本発明は(i)乳癌をもつ対象のうちで表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも1種のバイオマーカーの発現レベルの低い対象を同定し、(ii)治療有効量のエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を前記対象に投与することにより、乳癌をもつ対象を治療するための方法を提供する。別の態様において、本発明は(i)乳癌をもつ対象に由来するサンプルをアッセイし、表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも1種のバイオマーカーの発現レベルを測定し、(ii)前記少なくとも1種のバイオマーカーの低い発現レベルがサンプル中で検出される場合には、治療有効量のエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を前記対象に投与することにより、前記対象を治療するための方法を提供する。
本発明は更に、乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を使用できるか否かを予想するための組成物とキットを提供する。これらのキットは表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも1種、例えば1種、2種、3種、4種、5種、6種、7種、8種、9種又は10種のバイオマーカーの発現レベルを測定するための試薬と、乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩(例えばエリブリンメシラート)を使用できるか否かを予想する場合の前記キットの使用説明書を含む。
siRNA技術を利用して所定遺伝子の発現を「ノックダウン」させ、得られたノックダウン細胞のエリブリン感受性を評価した。これらの試験に基づき、表1に記載する遺伝子の発現はエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療に対する乳癌細胞の感受性に相関すると断定した。
Dharmacon製トランスフェクション試薬DharmaFect 1を使用してヒト乳癌細胞株MDA−MB−231(ATCCカタログ番号HTB26(登録商標))及びBT−549(ATCCカタログ番号HTB122(登録商標))のトランスフェクション条件を最適化した。MDA−MB−231細胞株とBT−549細胞株はエストロゲン受容体(ER)陰性且つプロゲステロン受容体(PR)陰性且つHER−2陰性(トリプルネガティブ)であると報告されている。非ターゲティング陰性対照としてApplied Biosystems製品Silencer Negative Control #1 siRNAを使用した。細胞死を誘導するように設計された2本鎖RNAであるsiGENOME TOX(siTOX)Transfection Control(Dharmacon)を細胞増幅アッセイの陽性対照として使用した。全実験で逆転写法を使用し、siRNAを先ずトランスフェクション試薬と混合後に細胞をウェルに加えた。培地、陰性対照siRNA及びsiTOX試薬に種々の量のDharmaFect 1を加えて処理した細胞における細胞生存率を比較した。選択した最終トランスフェクション条件はMDA−MB−231細胞にはウェル当たり0.035μlのDharmaFect 1を加え、BT−549細胞にはウェル当たり0.05μlのDharmaFect 1を加えた。siRNA終濃度50nMでアッセイ及びライブラリースクリーニングを実施した。PPIA遺伝子とGAPDH遺伝子を標的とする対照SMARTpool siRNA試薬(Dharmacon)を使用してqPCRによりトランスフェクション効果を更に確認した。
全長ヒトゲノムsiRNAライブラリーをDharmaconから購入した。このライブラリーを5μMまで希釈した。各々特定遺伝子に対する4種類のSMARTpool siRNA試薬を各ウェルに加えた(1個のウェルで同一遺伝子を標的とする4種類のsiRNA)。このライブラリーで18,500種を上回るヒト遺伝子を標的とした。各ウェルに36μlのOPTI−MEM培地を加えた384穴マスタープレートにライブラリープレートからの各組のsiRNA4μlを移した。希釈したDharmaFect 1試薬40μlをマスタープレートの各ウェルに加え、混合した。ウェル当たり10μlのsiRNAとトランスフェクション試薬の混合液をスクリーニングプレート5枚に分配した。10分間インキュベーション後、増殖培地40μl中の細胞を各ウェルに加えた。陰性対照siRNAを加えたウェル、陽性対照siTOXを加えたウェル及び培地とトランスフェクション試薬を加えたウェル(siRNA非添加)を各スクリーニングプレートに数個ずつ含むようにした。24時間インキュベーション後に、増殖培地で希釈したDMSO 10μlをスクリーニングプレート3枚に加え、増殖培地で希釈したエリブリンメシラート(E7389)10μlで2枚を処理し、試験した細胞株に対するE7389のIC20に対応する終濃度とした(MDA−MB−231では0.75nM E7389とし、エリブリンはDMSOのストック溶液として提供し、増殖培地で希釈した)(図1参照)。トランスフェクションから96時間後にPromega製品CellTiter−Glo発光アッセイにより細胞生存率を測定した。ウェル当たり10μlのCellTiter−Glo溶液を使用した。プレートを水平型シェーカーで2分間混合し、10分間インキュベートし、PerkinElmer製品EnVision(登録商標)マルチラベルプレートリーダーで読み取った。
パクリタキセルsiRNAスクリーンについて記載されている方法(Whitehurst et al.(2007)Nature 446:815−819)と同様の方法により、E7389に対する細胞感受性に有意効果のある遺伝子の同定を行った。要約すると、培地とトランスフェクション試薬を加えた参照ウェルのプレート1枚当たりの平均(プレート1枚当たり32ウェル)により各ウェルの測定値を正規化した。DMSOとE7389で処理したプレートについてバイオロジカルレプリケートを平均した。遺伝子毎に2サンプルt検定を実施し、2種類の異なる条件で処理したウェルには有意差値があることを確認した。ヒットリストを絞り込むために、全データを変化倍率比(平均E7389/平均DMSO)に従って昇順で並べることにより応答の強さを考慮に入れた。変化倍率が分布の下位5パーセント以内の遺伝子364個がカットオフレベルを超えた。その後、仮想オープンリーディングフレームと仮想蛋白質をコードする遺伝子を除外し、残りの240個の遺伝子に解析を絞り込んだ(図2参照)。
選択した240個の遺伝子のsiRNA SMARTpoolをDharmacon製品ON−TARGETplusフォーマットで特注した。これらの試薬はRISCとの相互作用を防ぎ、アンチセンス鎖取込みを優先するように改変センス鎖を含む。オフターゲット活性を減らし、ターゲット特異性を強化するようにアンチセンス鎖シード領域を改変している。これらの試薬を確認二次スクリーニングに使用した。E7389に対する癌細胞の感受性に影響を与える共通遺伝子を同定するために、240個の選択したsiRNAプールでBT−549乳癌細胞をスクリーニングした。各ウェルのエリブリンメシラート(E7389)の終濃度をBT−549細胞のIC20(0.25nM E7389)に対応するようにした以外はMDA−MB−231細胞による一次スクリーンと同一プロトコールを使用してスクリーニングを実施した。
Claims (52)
- 乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を使用できるか否かを判定するための方法であって、
前記対象に由来するサンプルにおける表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定することを含み、前記バイオマーカーの低い発現レベルが、エリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩が前記対象の治療に有効なものとなることを示すものである、方法。 - 乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を使用できるか否かを判定するための方法であって、
前記対象に由来するサンプルをアッセイし、前記サンプルにおける表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定することを含み、前記バイオマーカーの低い発現レベルが、エリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩が前記対象の治療に有効なものとなることを示すものである、方法。 - 乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を使用できるか否かを予測するための方法であって、
前記対象に由来するサンプルにおける表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定する段階、及び
前記サンプルにおける前記バイオマーカーの発現レベルが低いと判定される場合には、エリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩が乳癌をもつ対象の治療に有効になると予測する段階
を含む、方法。 - エリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療に対する乳房腫瘍の感受性の判定方法であって、
前記腫瘍における表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定することを含み、前記腫瘍における前記バイオマーカーの低い発現レベルが、前記腫瘍はエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療に対して感受性であることを示す、方法。 - エリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療に対する乳房腫瘍の感受性の判定方法であって、
前記腫瘍における表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定する段階、及び
前記腫瘍における前記バイオマーカーの発現レベルが低いと判定される場合には、前記腫瘍はエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療に対して感受性であると同定する段階
を含む、方法。 - 乳房腫瘍のサンプルが乳癌をもつ対象から取得される、請求項4又は5に記載の方法。
- 乳癌をもつ対象の治療方法であって、
表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルが低い乳癌をもつ対象を同定する段階、及び
治療有効量のエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を前記対象に投与する段階
を含む、方法。 - 乳癌をもつ対象の治療方法であって、
前記対象に由来するサンプルをアッセイし、前記サンプルにおける表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定する段階、及び
前記サンプルにおいて前記バイオマーカーの低い発現レベルが検出される場合には、治療有効量のエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を前記対象に投与する段階
を含む、方法。 - エリブリンの医薬的に許容可能な塩がエリブリンメシラートである、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 対象がエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療を以前に受けていない、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 対象がエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩による治療を以前に受けている、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がエストロゲン受容体(ER)陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がプロゲステロン受容体(PR)陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がHER−2陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がエストロゲン受容体(ER)陰性且つプロゲステロン受容体(PR)陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がエストロゲン受容体(ER)陰性且つHER−2陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がプロゲステロン受容体(PR)陰性且つHER−2陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌がエストロゲン受容体(ER)陰性、プロゲステロン受容体(PR)陰性且つHER−2陰性乳癌である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも2種のバイオマーカーが低い発現レベルを有する、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも3種のバイオマーカーの発現レベルが低い発現レベルを有する、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも4種のバイオマーカーの発現レベルが低い発現レベルを有する、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 表1に記載するバイオマーカー群から選択される少なくとも5種のバイオマーカーの発現レベルが低い発現レベルを有する、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 対照に比較して低いバイオマーカーの発現レベルが存在する、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- バイオマーカーが検出可能なレベルで発現されない、請求項23に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルが核酸レベルで測定される、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルがcDNAを検出することにより測定される、請求項25に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルがmRNA又はmiRNAを検出することにより測定される、請求項25に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルがDNAを検出することにより測定される、請求項25に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルが、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)増幅反応、逆転写酵素PCR解析法、定量逆転写酵素PCR解析法、ノーザンブロット解析法、RNAaseプロテクションアッセイ、デジタルRNA検出/定量法、及びその組合せ又は部分組合せから構成される群から選択される技術を使用することにより測定される、請求項25に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルが蛋白質レベルで測定される、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 蛋白質の存在が、蛋白質と特異的に結合する抗体又はその抗原結合性フラグメントを使用して検出される、請求項30に記載の方法。
- 抗体又はその抗原結合性フラグメントがマウス抗体、ヒト抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体、キメラ抗体、Fab、Fab’、F(ab’)2、ScFv、SMIP、アフィボディ、アビマー、バーサボディ、ナノボディ、ドメイン抗体及びこれらの抗体のいずれかの抗原結合性フラグメントから構成される群から選択される、請求項31に記載の方法。
- 抗体又はその抗原結合性フラグメントが標識されている、請求項31に記載の方法。
- 抗体又はその抗原結合性フラグメントが放射性ラベル、ビオチンラベル、発色団ラベル、蛍光団ラベル及び酵素ラベルから構成される群から選択されるラベルで標識されている、請求項33に記載の方法。
- バイオマーカーの発現レベルが、イムノアッセイ、ウェスタンブロット解析法、ラジオイムノアッセイ、免疫蛍光測定法、免疫沈降法、平衡透析法、免疫拡散法、電気化学発光イムノアッセイ(ECLIA)、ELISAアッセイ、イムノポリメラーゼ連鎖反応及びその組合せ又は部分組合せから構成される群から選択される技術を使用することにより測定される、請求項28に記載の方法。
- イムノアッセイが電気化学発光法、化学発光法、蛍光化学発光法、蛍光偏光法及び時間分解蛍光法から構成される群から選択される溶液イムノアッセイである、請求項35に記載の方法。
- イムノアッセイが電気化学発光法、化学発光法及び蛍光化学発光法から構成される群から選択されるサンドイッチイムノアッセイである、請求項35に記載の方法。
- サンプルが対象から得られた体液又はその成分を含む、請求項1から3、6又は8のいずれか一項に記載の方法。
- 体液が血液、リンパ液、血清、血漿、嚢胞液、乳頭吸引分泌液、尿、唾液、及び生検から採取された体液から構成される群から選択される、請求項38に記載の方法。
- サンプルが対象から得られた組織又はその成分を含む、請求項1から3、6又は8のいずれか一項に記載の方法。
- 組織が乳房組織、結合組織、リンパ組織、生検から得られた組織及び腫瘤生検から得られた組織から構成される群から選択される、請求項40に記載の方法。
- 組織が乳房組織又はその成分である、請求項40に記載の方法。
- 乳房組織の前記成分が乳房組織細胞を含む、請求項42に記載の方法。
- 乳房組織細胞が循環乳房腫瘍細胞である、請求項43に記載の方法。
- 対象がヒト対象である、請求項1から3又は6から8のいずれか一項に記載の方法。
- 乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を使用できるか否かを予測するためのキットであって、
表1に記載するバイオマーカー群から選択されるバイオマーカーの発現レベルを測定するための試薬;及び
乳癌をもつ対象を治療するためにエリブリン、その類似体又はその医薬的に許容可能な塩を使用できるか否かを予測する場合の前記キットの使用説明書
を含む、キット。 - エリブリンの医薬的に許容可能な塩がエリブリンメシラートである、請求項46に記載のキット。
- バイオマーカーの発現レベルを測定するための試薬がバイオマーカーにおけるヌル突然変異を同定するためのプローブである、請求項46に記載のキット。
- バイオマーカーの発現レベルを測定するための試薬がバイオマーカーを増幅及び/又は検出するためのプローブである、請求項46に記載のキット。
- バイオマーカーの発現レベルを測定するための試薬が抗体である、請求項46に記載のキット。
- 更に対象から生体サンプルを取得するための試薬を含む、請求項46に記載のキット。
- 更に対照サンプルを含む、請求項46に記載のキット。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201161454426P | 2011-03-18 | 2011-03-18 | |
US61/454,426 | 2011-03-18 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017046070A Division JP6612280B2 (ja) | 2011-03-18 | 2017-03-10 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2019150027A true JP2019150027A (ja) | 2019-09-12 |
JP2019150027A5 JP2019150027A5 (ja) | 2019-12-26 |
Family
ID=45879070
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013558214A Pending JP2014509515A (ja) | 2011-03-18 | 2012-03-16 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
JP2017046070A Expired - Fee Related JP6612280B2 (ja) | 2011-03-18 | 2017-03-10 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
JP2019069638A Pending JP2019150027A (ja) | 2011-03-18 | 2019-04-01 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013558214A Pending JP2014509515A (ja) | 2011-03-18 | 2012-03-16 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
JP2017046070A Expired - Fee Related JP6612280B2 (ja) | 2011-03-18 | 2017-03-10 | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9637795B2 (ja) |
EP (1) | EP2686441B1 (ja) |
JP (3) | JP2014509515A (ja) |
CN (1) | CN103562406B (ja) |
CA (1) | CA2828959A1 (ja) |
ES (1) | ES2731653T3 (ja) |
SG (2) | SG10201602147YA (ja) |
WO (1) | WO2012129100A1 (ja) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2892780A1 (en) * | 2012-12-04 | 2014-06-12 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Use of eribulin in the treatment of breast cancer |
CN105338977B (zh) * | 2013-06-26 | 2018-10-16 | 卫材R&D管理有限公司 | 艾日布林和乐伐替尼作为治疗癌症的联合疗法的用途 |
RU2699545C2 (ru) * | 2014-05-28 | 2019-09-06 | ЭЙСАЙ Ар ЭНД Ди МЕНЕДЖМЕНТ КО., ЛТД | Применение эрибулина в лечении рака |
US10238630B2 (en) | 2014-05-28 | 2019-03-26 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Use of eribulin and poly (ADP ribose) polymerase (PARP) inhibitors as combination therapy for the treatment of cancer |
CA2978311A1 (en) * | 2015-03-04 | 2016-09-09 | Merck Sharp & Dohme Corp. | Combination of a pd-1 antagonist and eribulin for treating cancer |
EP3290054B1 (en) | 2015-05-01 | 2022-04-13 | Japan Science and Technology Agency | Anti-tumor agent suppressing or inhibiting zic5 |
SG10202007520WA (en) | 2016-03-02 | 2020-09-29 | Eisai R&D Man Co Ltd | Eribulin-based antibody-drug conjugates and methods of use |
US11419856B2 (en) | 2017-11-20 | 2022-08-23 | Basilea Pharmaceutica International AG | Pharmaceutical combinations for use in the treatment of neoplastic diseases |
WO2020179712A1 (en) * | 2019-03-01 | 2020-09-10 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Methods for predicting tumor response to eribulin |
US11083705B2 (en) | 2019-07-26 | 2021-08-10 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Pharmaceutical composition for treating tumor |
CN113174427B (zh) * | 2021-04-29 | 2023-02-28 | 遵义医科大学 | 基于DNA分子检测ERGIC3 mRNA的方法 |
CN113512733B (zh) * | 2021-05-13 | 2022-07-26 | 浙江工业大学 | 一种电化学nhk反应合成艾日布林中间体的方法 |
Family Cites Families (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4683202A (en) | 1985-03-28 | 1987-07-28 | Cetus Corporation | Process for amplifying nucleic acid sequences |
US5075216A (en) | 1988-09-23 | 1991-12-24 | Cetus Corporation | Methods for dna sequencing with thermus aquaticus dna polymerase |
US5143854A (en) | 1989-06-07 | 1992-09-01 | Affymax Technologies N.V. | Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof |
US5800992A (en) | 1989-06-07 | 1998-09-01 | Fodor; Stephen P.A. | Method of detecting nucleic acids |
US5744101A (en) | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US6040138A (en) | 1995-09-15 | 2000-03-21 | Affymetrix, Inc. | Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays |
DE69233331T3 (de) | 1991-11-22 | 2007-08-30 | Affymetrix, Inc., Santa Clara | Kombinatorische Strategien zur Polymersynthese |
WO1994016101A2 (en) | 1993-01-07 | 1994-07-21 | Koester Hubert | Dna sequencing by mass spectrometry |
US5556752A (en) | 1994-10-24 | 1996-09-17 | Affymetrix, Inc. | Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA |
US5545531A (en) | 1995-06-07 | 1996-08-13 | Affymax Technologies N.V. | Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
EP0880598A4 (en) | 1996-01-23 | 2005-02-23 | Affymetrix Inc | RAPID EVALUATION OF NUCLEIC ACID ABUNDANCE DIFFERENCE, WITH A HIGH-DENSITY OLIGONUCLEOTIDE SYSTEM |
WO1999023254A1 (en) | 1997-10-31 | 1999-05-14 | Affymetrix, Inc. | Expression profiles in adult and fetal organs |
US6020135A (en) | 1998-03-27 | 2000-02-01 | Affymetrix, Inc. | P53-regulated genes |
US6653341B1 (en) | 1998-06-17 | 2003-11-25 | Eisai Co., Ltd. | Methods and compositions for use in treating cancer |
US8097648B2 (en) | 1998-06-17 | 2012-01-17 | Eisai R&D Management Co., Ltd. | Methods and compositions for use in treating cancer |
WO1999065894A1 (en) | 1998-06-17 | 1999-12-23 | Eisai Co., Ltd. | Macrocyclic analogs and methods of their use and preparation |
US20050208512A1 (en) * | 2003-10-01 | 2005-09-22 | The Ohio State University Research Foundation | Determining the chemosensitivity of cells to cytotoxic agents |
US20060154312A1 (en) * | 2004-12-09 | 2006-07-13 | Sergei Agoulnik | Tubulin isotype screening in cancer therapy using halichondrin B analogs |
TW201132813A (en) * | 2010-03-03 | 2011-10-01 | Koo Foundation Sun Yat Sen Cancer Ct | Methods for classifying and treating breast cancers |
-
2012
- 2012-03-16 SG SG10201602147YA patent/SG10201602147YA/en unknown
- 2012-03-16 CN CN201280013701.8A patent/CN103562406B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2012-03-16 ES ES12710643T patent/ES2731653T3/es active Active
- 2012-03-16 SG SG2013069646A patent/SG193489A1/en unknown
- 2012-03-16 WO PCT/US2012/029479 patent/WO2012129100A1/en active Application Filing
- 2012-03-16 JP JP2013558214A patent/JP2014509515A/ja active Pending
- 2012-03-16 CA CA2828959A patent/CA2828959A1/en not_active Abandoned
- 2012-03-16 EP EP12710643.3A patent/EP2686441B1/en active Active
- 2012-03-16 US US14/001,737 patent/US9637795B2/en active Active
-
2017
- 2017-03-10 JP JP2017046070A patent/JP6612280B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
2019
- 2019-04-01 JP JP2019069638A patent/JP2019150027A/ja active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2686441B1 (en) | 2019-05-08 |
CA2828959A1 (en) | 2012-09-27 |
WO2012129100A1 (en) | 2012-09-27 |
CN103562406B (zh) | 2018-03-27 |
SG193489A1 (en) | 2013-10-30 |
ES2731653T3 (es) | 2019-11-18 |
JP6612280B2 (ja) | 2019-11-27 |
US9637795B2 (en) | 2017-05-02 |
JP2014509515A (ja) | 2014-04-21 |
SG10201602147YA (en) | 2016-05-30 |
CN103562406A (zh) | 2014-02-05 |
US20140235707A1 (en) | 2014-08-21 |
EP2686441A1 (en) | 2014-01-22 |
JP2017148049A (ja) | 2017-08-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP6612280B2 (ja) | エリブリンに対する応答を予測するための方法及び組成物 | |
EP3458604B1 (en) | Method for determining sensitivity to a cdk4/6 inhibitor | |
Kitange et al. | Expression of CD74 in high grade gliomas: a potential role in temozolomide resistance | |
KR101347107B1 (ko) | 도세탁셀에 대한 내성 또는 감수성을 측정하는 방법 | |
RU2728674C2 (ru) | Экспрессия fgfr и чувствительность к ингибитору fgfr | |
JP2010528659A (ja) | 肝細胞癌のサブタイプを決定し、肝癌幹細胞を検出するための方法 | |
ES2568753T3 (es) | Una firma pronóstica y terapéutica para melanoma maligno | |
Chen et al. | The predictive role of E2-EPF ubiquitin carrier protein in esophageal squamous cell carcinoma | |
Liu et al. | TUG1 long non‐coding RNA enlists the USF1 transcription factor to overexpress ROMO1 leading to hepatocellular carcinoma growth and metastasis | |
EP2722400A2 (en) | Methods of using biomarkers | |
JPWO2016148115A1 (ja) | ホスファチジルセリンシンターゼ1阻害剤への応答性を予測する方法 | |
JP7167263B2 (ja) | Pmvkを有効成分として含む放射線抵抗性癌診断用または放射線治療予後予測用バイオマーカー組成物 | |
JP6779517B2 (ja) | 抗癌剤の感受性及び癌の予後に対する診断マーカー | |
CN112462072B (zh) | 一种tmub1蛋白在制备肿瘤免疫抑制分子检测剂中的应用 | |
US20240102105A1 (en) | Biomarker for predicting responsiveness to anticancer agent and use thereof | |
KR102238258B1 (ko) | 간암 진단을 위한 신규 바이오마커 및 이를 이용한 치료 방법 | |
JP2014082953A (ja) | 癌の検出方法、癌検出キット、癌治療薬のスクリーニング方法、及び癌治療薬 | |
US11639530B2 (en) | CD133 related to anticancer agent resistance in colon cancer and use thereof | |
KR101370108B1 (ko) | 위암 진단용 마커로서 hdac2의 용도 | |
CN114381528B (zh) | Mettl7a基因及其表达产物在诊断和治疗肿瘤中的用途 | |
KR102199001B1 (ko) | 간암 진단을 위한 신규 바이오마커 | |
KR101150410B1 (ko) | 간암 진단용 마커로서의 s100p의 용도 | |
WO2023239920A1 (en) | Biomarkers in pancreatic cancer | |
WO2023070121A1 (en) | Compositions and methods for treatment of mic60 depleted cancers and metastasis | |
CN115558652A (zh) | 靶向n-乙酰基转移酶10在弥漫大b细胞淋巴瘤治疗中的应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190507 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190507 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20191112 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200602 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200727 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20201201 |