JP2019012072A5

JP2019012072A5 -

Info

Publication number: JP2019012072A5
Application number: JP2018153487A
Authority: JP
Filing date: 2018-08-17
Publication date: 2019-07-04
Anticipated expiration: 2033-08-29

Claims

患者から得た乾燥血液試料で行う健康モニタリング方法であって、
ａ）乾燥血液試料を溶液で再構成し、
ｂ）該再構成した試料とペプチドアレイを接触させ、ここで、該アレイは固体支持体上の予定した様々な位置に固定化された複数のインサイツ合成ペプチドを含み、該ペプチドのインサイツ合成が下記工程：
ａ. 固体支持体上の位置の予定した画分に第一モノマーを付加し、
ｂ. 固体支持体上の位置の予定した画分に第二モノマーを付加し、ここで、第二モノマーの位置の予定した画分は第一モノマーを含む位置およびモノマーがない位置を含み、
ｃ. 固体支持体上の位置の予定した画分に第三モノマーを付加し、ここで、第二モノマーの位置の予定した画分は第一および第二モノマーを含む位置、第二モノマーを含む位置およびモノマーを含まない位置を含み、そして
ｄ. モノマーが所望の平均長の少なくとも１種のペプチドを形成し、画分の和が少なくとも計１００％になるまで、定義された一連のモノマーを用いて手順ａ〜ｃを繰り返し、ここで、複数の種々のペプチドは再構成した乾燥血液試料中の少なくとも１種の抗体とオフターゲット結合できる
を含み、
ｃ）少なくとも１種の抗体のペプチドアレイ中の複数の異なるペプチドに対するオフターゲット結合を測定して免疫署名を形成させ、そして
ｄ）免疫署名に基づいて健康状態を同定し、ここで、免疫署名は、対照と比較した、該再構成した血液試料からの抗体のペプチドアレイへの結合における変化を測定する
手順を含む、方法。
再構成した乾燥血液試料をペプチドアレイと接触させる前に希釈する、請求項１に記載の方法。
再構成した乾燥血液試料中の複数の再構成した抗体がペプチドアレイに結合する、請求項１または２に記載の方法。
対象の健康状態が、健康、乳癌の罹患、卵巣癌の罹患、膵癌の罹患、脳の癌の罹患、食道癌の罹患、多発性骨髄腫の罹患、自己免疫障害の罹患、またはリウマチ性関節炎の罹患である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の方法。
ペプチドアレイ上の複数の異なるペプチドが８〜３５残基長である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の方法。
ペプチドアレイが３,０００を超える異なるペプチドを含む、請求項１〜５のいずれか一項に記載の方法。
ペプチドアレイ上の異なるペプチドが、ペプチドアレイ上のスポット内の約１nm〜約１.５nmの範囲の平均的間隙を有する、請求項１〜６のいずれか一項に記載の方法。
複数の異なるペプチドが少なくとも２種の抗体に１０ ^３〜１０ ^６Ｍ ^−１の範囲の結合定数で結合する、請求項１〜７のいずれか一項に記載の方法。
複数の異なるペプチドが少なくとも２種の抗体に１０ ^４〜１０ ^６Ｍ ^−１の範囲の結合定数で結合する、請求項１〜８のいずれか一項に記載の方法。
該アレイが疑似無作為アレイまたは無作為アレイである、請求項１〜９のいずれか一項に記載の方法。
該アレイが核酸およびペプチド核酸からなる群から選択されるモノマーをさらに含む、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の方法。
モノマーがリンカー分子によって該アレイに結合されている、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の方法。
ペプチドの少なくとも５％が少なくとも１０残基の長さを有する、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の方法。
免疫署名システムで行われ、該免疫署名システムは以下のコンポーネントからなる自動化デバイスを含む、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の方法：
１）対象からの乾燥血液試料を入手し、および再構成し、それによって請求項１に記載の方法のａ）の手順を行うための自動化システム；
２）自動化免疫署名アッセイのための区画であって、免疫署名アッセイが
ａ）希釈試料のペプチドアレイへの適用、
ｂ）一定時間のインキュベーション、
ｃ）未結合試料の洗浄および除去、
ｄ）二次抗体溶液の一定時間の適用、
ｅ）過剰の二次抗体の洗浄および除去、および
ｆ）各スポットの蛍光を決定するためのアレイの乾燥および走査
を含むものであり、それによって請求項１に記載の方法のｃ）の手順を行うための自動化免疫署名アッセイのための区画、および
３）コンピューター・システムを使用して、対照と比較した、再構成した乾燥血液試料からの抗体のペプチドアレイへの結合における変化を測定し、それによって請求項１に記載の方法のｄ）の手順を行う。