JP2018537979A - タバコ遺伝子NtTCTPの、植物における抗ジャガイモYウイルスへの応用 - Google Patents

タバコ遺伝子NtTCTPの、植物における抗ジャガイモYウイルスへの応用 Download PDF

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Abstract

本発明は、タバコ遺伝子NtTCTPの、植物における抗ジャガイモYウイルス(PVY)への応用に関するものである。前記タバコ遺伝子NtTCTPの全長が507bpであり、168個のアミノ酸を含む一つのタンパク質をコードし、その活性はタバコのPVYに対する抵抗性に密接に関係している。タバコにおいて当該遺伝子をサイレンシングさせると、タバコはPVYに対してより強い抵抗性を示し、免疫レベルにまで到達でき、タバコにおいて当該遺伝子を過剰に発現させると、タバコはPVYに対してより敏感になる。当該遺伝子は、抗PVYタバコなどの植物の育種に使用できる。
【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本願は、2015年12月1日に提出された、出願番号が201510858859.0である中国特許出願の優先権を主張し、参照により前記出願で開示された全ての内容を本願に援用する。
本発明は植物遺伝子工学の分野に属すものであり、具体的には、タバコ遺伝子NtTCTPの、植物における抗ジャガイモYウイルスへの応用に関するものである。
翻訳制御された腫瘍タンパク質(Translationally controlled tumor protein、TCTP)はp21またはp23とも呼ばれ、真核生物において一般的に発現し、分布する一種のタンパク質である。TCTPは最初に哺乳動物の腫瘍細胞で発見され、そのレベルは転写後に調節される。
複数種類の生物に対する大量の研究により、TCTPが、例えば、ヒスタミン放出の促進、アポプトーシス、微小管の集合、イオンバランスなどの複数種類の細胞学的過程に関与するもので、ポロキナーゼ、チューブリン、アクチン及びナトリウムカリウムATPアーゼ酵素などの一連のタンパク質と相互作用するものであることが見出された。動物において、TCTPは細胞の増殖と分化、悪性形質転換、ストレス耐性及びアポプトーシスなどに関与するものである。TCTP遺伝子がノックアウトされたマウスは、細胞分化の欠如と過度なアポプトーシスのため、マウスの胚胎に致死現象が現れる。ショウジョウバエにおいて、ある特定の器官におけるTCTPの発現が中断された後、当該器官の細胞数が低下し、細胞の増殖に欠陥が生じ、その結果、当該器官が小さくなる。植物において、TCTP mRNAの発現は有糸分裂と密接に関係し、暗闇はアサガオにおけるmRNAの蓄積を誘導できる。なお、TCTPタンパク質は、師部タンパク質の長距離輸送及び花粉管の成長を調節する過程において、重要な役割を果たしている。近来の研究では、シロイヌナズナにおいて、TCTPが有糸分裂による増殖の正の調節因子として、細胞周期の時間を特異的に調節できることが見出された。TCTPはTOR(Target of rapamycin)による増殖の調節径路により細胞の分化を調節する。キャベツに対する研究では、TCTPが成長および発達を制御するとともに、外部環境によって誘導されることが見出された。これら既存の研究によって、TCTPが有機体の成長と発達を制御できるだけでなく、植物の専属的な機能も有することが示され、よって、この種類の遺伝子のPVYに対する抵抗性の研究は、重要な意義を持つ。
植物ゲノムにおける抗ジャガイモYウイルス(potato virus Y、PVY)の遺伝子を探究することは、抗ウイルス植物の育種の鍵である。
本発明の目的は、タバコ遺伝子NtTCTPの、植物における抗ジャガイモYウイルスへの応用を提供することである。
本発明の目的を実現するため、本発明のタバコ遺伝子NtTCTPの活性はタバコのPVYに対する抵抗性に密接に関係し、遺伝子配列は下記のとおりである。
i)配列番号1で表されるヌクレオチド配列;または
ii)配列番号1で表されるヌクレオチド配列の一つ又は複数のヌクレオチドが置換、欠失及び/または付加され、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列;または
iii)0.1% SDSを含む0.1×SSPEまたは0.1% SDSを含む0.1×SSC溶液において、65℃でハイブリダイズし、当該溶液で膜を洗浄するというストリンジェントな条件下で、配列番号1で表される配列とハイブリダイズし、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列;または
iv)i)、ii)またはiii)のヌクレオチド配列と90%以上の相同性を有し、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列。
また、本発明は前記遺伝子NtTCTPがコードするタンパク質を提供し、そのアミノ酸配列は配列番号2に示すとおりである。
また、本発明は前記遺伝子NtTCTPの、タバコにおける抗ジャガイモYウイルス(PVY)への応用を提供する。即ち、タバコ遺伝子NtTCTPをタバコのPVYに対する抵抗性の調節に用いる。前記ジャガイモYウイルスはPVY壊死株系(N株系)を含む。
前記の応用はRNAi技術によりタバコにおける遺伝子NtTCTPをサイレンシングさせるものである。例えば、配列番号3で表されるヌクレオチド配列を植物発現ベクターにクローニングした後、アグロバクテリウム媒介形質転換方法で組み換え発現ベクターをタバコに導入し、トランスジェニックタバコ株をスクリーニングすることができる。前記植物発現ベクターがpBin438であることが好ましい。
また、本発明はトランスジェニックタバコ株の構築方法を提供し、当該方法は、まず、前記遺伝子NtTCTPのRNAi発現ベクターを構築し、次に、アグロバクテリウム媒介形質転換方法により組み換え発現ベクターをタバコに導入し、トランスジェニックタバコ株をスクリーニングするものである。開始ベクター(starting vector)がpBin438であることが好ましい。
また、本発明は前記遺伝子NtTCTPのタバコ品種の改良への応用を提供する。
また、本発明は前記遺伝子NtTCTPの抗PVYタバコの育種への応用を提供する。
さらに、本発明はタバコ遺伝子NtTCTPを抑制する発現カセットを有する発現ベクターを提供する。
前記発現ベクターが、配列番号3で表されるヌクレオチド配列を有することが好ましい。
本発明では、クローニングにより、タバコから全長が507bpであり、168個のアミノ酸を含む一つのタンパク質をコードする翻訳制御された腫瘍タンパク質遺伝子NtTCTPを得、さらに、タバコの抗PVY過程における当該遺伝子の役割について研究した。栽培したタバコにおいて当該遺伝子をサイレンシングさせると、タバコはPVYに対してより強い抵抗性を示し、免疫レベルにまで達成でき、栽培したタバコにおいて当該遺伝子を過剰に発現させると、タバコはPVYに対してより敏感になる。これにより、タバコの抗PVY過程において、当該遺伝子が重要な役割を果たし、抗PVYタバコなどの植物の育種に用いられることが実証されている。
本発明は、遺伝子NtTCTPのRNAi発現ベクターを構築し、アグロバクテリウム媒介形質転換によりタバコに対して遺伝子の形質転換を行い、その結果により、当該遺伝子がタバコにおいてサイレンシングされた後、タバコのPVYに対する抵抗性が向上し、抵抗性が50%〜80%向上できることが実証されている。
本発明の実施例3における異なるタバコ株系のTCTP遺伝子のウエスタンブロットの検証結果を示す図である。 本発明の実施例3において、PVY接種を行った後、遺伝子TCTP過剰発現株系であるO2、O7、遺伝子TCTPサイレンシング株系であるRi16、Ri20、及び野生タバコの葉の性状を示す図である。図面により、過剰発現株系であるO2、O7の葉脈が既に壊死したが、サイレンシング株系であるRi16とRi20の葉脈には何の症状もないことが分かる。
以下の実施例により本発明を説明するが、本発明の範囲はこれらに限定されるものではない。特に断りがない限り、実施例はいずれも通常の実験条件、例えば、Sambrookなどの分子クローニング実験ハンドブック(Sambrook J & Russell DW、 Molecular Cloning: a Laboratory Manual、2001)、或いはメーカーの説明書に記載される推奨条件に基づくものである。
実施例1 タバコ遺伝子NtTCTPのクローニング
一、材料と方法
1.実験材料
1.1 栽培したタバコの品種は「山西煙」であり、貴州省タバコ科学研究院育種工程センターより提供されたものである。
1.2 試薬
タカラバイオ株式会社から購入したLA Taq DNAポリメラーゼと制限エンドヌクレアーゼ。TIANGEN Biotech(Beijing)Co.,Ltd.から購入したDNAゲル精製回収キット。ニュー・イングランド・バイオラボ社から購入したT DNAリガーゼ。プロメガ社から購入したpGEM−T vector。アプライドバイオシステムズ社から購入したABI PRISMTM Optical 96−Well Reation Plates、Optical Caps。Escherichia coli DH5α、Agrobacterium tumefaciens EHA105、植物発現ベクターpBin438はいずれも市販品である。DNAの合成及び塩基配列決定はBGI Tech Solutions Co.,Ltd.により完成された。
2.実験の方法
NCBIにログインし、GenbankにおけるタバコTCTP遺伝子(Accession NO:KM507327.1)の全長配列に基づき、遺伝子の全長を増幅させるプライマーを設計し、酵素切断部位であるBamH IとSal Iを添加した。設計されたプライマーの配列は下記のとおりである。
2.2 タバコ遺伝子NtTCTPの全長の増幅
「山西煙」の葉の全RNAを抽出し、逆転写でcDNAの第一鎖を合成して、0.2mlの遠心チューブに下記の試薬を添加し、PCR反応を行った。
PCR反応の手順:蓋を加熱し、95℃で初期変性を5分間行った;その後、95℃での30秒間の変性、55℃での30秒間のアニーリング、72℃での30秒間の伸長を、35サイクル行った。
増幅により得られたDNAフラグメントの塩基配列決定を行い、その結果は配列番号1に示すとおりである。
実施例2 タバコ遺伝子NtTCTPのトランスジェニック株系の構築
1.過剰発現遺伝子NtTCTPベクターの構築
1.1 植物発現ベクターpBin438と全長が増幅したPCR産物をそれぞれSal IとBamH Iで二重消化させ、酵素消化システムは下記のとおりである。






1.2 酵素消化産物を1%アガロースゲル電気泳動で検出し、PCR酵素消化産物及びベクターpBin438の大きなフラグメントを回収して連結させた。回収した産物を下記の割合で一定方向にて連結させた。連結システムは下記のとおりである。
連結の効率を向上させるため、連結を16℃で16時間または16時間以上行った。
1.3 組み換えプラスミドによるAgrobacterium tumefaciensの形質転換
1)0.5〜1.0μLのDNAを取り出し、Agrobacterium tumefaciensのコンピテント細胞に加え、軽く混合させ、5分間氷浴を行い、速やかに液体窒素に投入し、5分間冷凍させた;
2)37℃の水浴で融解させた後、800μLのYEB液体培地を加え、28℃、100r/minで4時間の振とう培養を行った;
3)4000r/minで5分間遠心させ、100μL程度残るように大部分の上清を除去し、菌体を懸濁させた;
4)40mg/Lのリファンピシン(Rif)、50mg/Lのストレプトマイシン(Sm)、及び100mg/Lのカナマイシン(Km)を含有する固体YEB培地に塗布し、28℃で48〜96時間培養した。
2.サイレンシングベクターの構築
タバコ遺伝子NtTCTPにおける第1bpから330bpまでの330bpのフラグメントの順方向配列と逆相補鎖配列を中間配列により連結させ、BamH IとSal Iの酵素切断部位を添加し、設計された配列はSangon Biotech(Shanghai)Co.,Ltd.により合成され、合成された配列は配列番号3に示すとおりである。合成フラグメントをBamH IとSal Iで酵素消化させ、それを同じように酵素消化されたpBin438ベクターと連結させ、最終のサイレンシングベクターを構築した。
3.Agrobacterium tumefaciens媒介形質転換によるタバコの遺伝子形質転換
タバコのリーフディスクに対して2〜3日の前培養を行った後、植物発現ベクターを含むAgrobacterium tumefaciens EHA105でそれぞれ感染させた。3〜4日の共培養を行った後、リーフディスクを取り出し、除菌剤を含む液体培地で2〜3時間の除菌を行った後、スクリーニング培地に移してスクリーニング及び分化培養を行い、約3週間後分化し始め、抵抗性のある芽が出た。抵抗性のある芽が3〜4cmの高さに成長した際に、それを外植片の基部から切り取って、発根培地に接種し、発根培養を行った。小植物の根が発達した後、順化・移植を行った。移植後にも生存する大量の、抵抗性を有する植物を得た。種を得るまで、PCR検出の結果が陽性である植物を大きな植木鉢に移植した。
最小培地:MS培地、pH5.8、0.8%寒天
スクリーニング培地:最小培地+25mg/L Km+100mg/Lセファロスポリン
分化培地:最小培地+1.0mg/L 6−BA+0.1mg/L NAA、pH5.8、0.75%寒天
発根培地:MS培地+0.5mg/L NAA、pH5.8、0.75%寒天
遺伝子組み換え材料として、TCTP遺伝子過剰発現株系O2、O7;TCTP遺伝子サイレンシング株系Ri16、Ri20を得た。
実施例3 トランスジェニックタバコ株系のPVYに対する抵抗性の研究
1.材料と方法
1.1 実験の材料
実施例2で構築した遺伝子NtTCTPが過剰に発現したトランスジェニックタバコ株系O2、O7。
実施例3で構築した遺伝子NtTCTPがサイレンシングされたトランスジェニックタバコ株系Ri16、Ri20。
PVY株はPVY壊死株系(N株系)である。
1.2 実験の方法
1.2.1 PVY接種物の調製:新鮮な病葉を破砕機に投入し、少量のリン酸緩衝液を入れて粉砕させ、病葉の残渣をガーゼでろ過し、新鮮な汁液を採取し、PVY接種物を調製した。
1.2.2 PVY接種:接種の時期がタバコの4葉期であり、接種待ちのタバコ株から2〜3枚の若葉を選び、サンドペーパーで軽く摩擦し、微小な傷を発生させた。そして、摩擦された葉にブラシでPVY接種物をブラッシングした。
1.2.3 データの調査:発病が最も重篤な時期を選び、PVYの罹患率及び病害レベルを調査した。
病害レベルを以下の基準に従って調査した。
レベル0:株全体に病害がなく、または葉に極めてわずかな斑が現れた。
レベル1:1/10〜1/3の葉において、軽微な小葉脈の壊死または点刻状条斑(stipple streak)の症状及びわずかな変形が現れたが、株全体における他の葉には症状がなく、植物には明らかな矮小化がなかった。
レベル2:1/3〜1/2の葉において点刻状条斑または葉脈の壊死が現れ、病葉の大部分の小葉脈が壊死し、その結果、葉において比較的に大きな面積の黄化、枯死が起こり、植物が正常な植物の高さの2/3以上までに矮小化した。
レベル3:1/2〜2/3の葉において比較的に深刻な葉脈の壊死が現れ、または2/3以上の葉において点刻状条斑の壊死が現れ、単一の葉において比較的に大きい面積の枯死が発生し、少部分の葉が落ちてしまった。あるいは、株全体の葉が黄色になり始めた。
レベル4:株全体の葉において深刻な葉脈の壊死または葉の変形、萎縮が現れ、2/3程度の葉が萎れ落ち、罹病株は正常なタバコ株の高さの1/2〜1/3までに矮小化し、若しくは株全体が枯れてしまった。
2.実験の結果
(1)異なるタバコ株系におけるNtTCTP遺伝子の発現の検証
ウエスタンブロット検証により、2つのサイレンシング株系であるRi16とRi20において、TCTP遺伝子が発現していないことが証明され、よって、TCTP遺伝子をサイレンシングさせることに成功したことが実証された。一方、2つの過剰発現株系であるO2とO7の発現量がいずれもコントロール群(WT)を超えたため、TCTP遺伝子の過剰発現の構築にも成功したことが実証された。
(2)NtTCTP遺伝子過剰発現株系とNtTCTP遺伝子サイレンシング株系の耐病性の鑑定結果
接種した14日後に、病状を調査した結果、サイレンシング株系であるRi16とRi20はいずれも免疫性を表し、発病しておらず、病状の指数が0であり、耐病性が大幅に向上した。一方、過剰発現株系であるO2とO7において、いずれも野生型コントロール群(WT)より深刻な壊死症状が現れ、病状がより深刻であった(図2)。そのうち、株系O2の病状の指数が96.97であり、O7の病状の指数が91.92であり、コントロール群である野生タバコの病状の指数が85.86であった。
以上の結果により、タバコにおいて、TCTP遺伝子をサイレンシングさせることで、PVYに対する植物の耐病性を向上でき、当該遺伝子が重要な応用価値を有することが実証されている。
上記において、一般的な説明及び具体的な実施形態により本発明を詳しく説明したが、本発明に基づいて補正や改善を行い得るのは当業者にとって自明なことである。よって、本発明の趣旨から逸脱しない上で行ったこれらの補正や改善は全て、本発明の保護範囲に属すものである。
本発明が提供するタバコ遺伝子NtTCTPの活性は、タバコのPVYに対する抵抗性に密接に関係している。遺伝子NtTCTPのRNAi発現ベクターを構築し、アグロバクテリウム媒介形質転換方法でタバコの遺伝子形質転換を行った結果、当該遺伝子がタバコにおいてサイレンシングされた後、タバコのPVYに対する抵抗性が向上し、抵抗性が50%〜80%向上できることが実証された。

Claims (10)

  1. i)配列番号1で表されるヌクレオチド配列;または
    ii)配列番号1で表されるヌクレオチド配列の一つ又は複数のヌクレオチドが置換、欠失及び/または付加され、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列;または
    iii)0.1% SDSを含む0.1×SSPEまたは0.1% SDSを含む0.1×SSC溶液において、65℃でハイブリダイズし、当該溶液で膜を洗浄するというストリンジェントな条件下で、配列番号1で表される配列とハイブリダイズし、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列;または
    iv)i)、ii)またはiii)のヌクレオチド配列と90%以上の相同性を有し、かつ同じ機能タンパク質を発現するヌクレオチド配列
    であるタバコ遺伝子NtTCTPの、タバコにおける抗ジャガイモYウイルスへの応用。
  2. RNAi技術によりタバコにおける遺伝子NtTCTPをサイレンシングさせることを特徴とする、請求項1に記載の応用。
  3. 配列番号3で表されるヌクレオチド配列を植物発現ベクターにクローニングした後、アグロバクテリウム媒介形質転換方法により組み換え発現ベクターをタバコに導入し、トランスジェニックタバコ株をスクリーニングし、前記植物発現ベクターがpBin438であることが好ましいことを特徴とする、請求項2に記載の応用。
  4. 前記ジャガイモYウイルスが、ジャガイモYウイルス壊死株系であるN株系を含むことを特徴とする、請求項1〜3のいずれか一項に記載の応用。
  5. まず、遺伝子NtTCTPのRNAi発現ベクターを構築し、次に、アグロバクテリウム媒介形質転換方法により組み換え発現ベクターをタバコに導入し、トランスジェニックタバコ株をスクリーニングすることを特徴とする、トランスジェニックタバコ株の構築方法。
  6. 使用する開始ベクターがpBin438であることを特徴とする、請求項5に記載の方法。
  7. タバコ遺伝子NtTCTPのタバコ品種の改良への応用。
  8. タバコ遺伝子NtTCTPの抗PVYタバコの育種への応用。
  9. タバコ遺伝子NtTCTPを抑制する発現カセットを有することを特徴とする、発現ベクター。
  10. 配列番号3で表されるヌクレオチド配列を有することを特徴とする、請求項9に記載の発現ベクター。
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