JP2018503646A - miR−92阻害剤およびその使用 - Google Patents

miR−92阻害剤およびその使用 Download PDF

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Abstract

本発明は、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤、ならびに、それを必要とする被験体におけるmiR−92の機能および/または活性を阻害するための前記阻害剤の使用方法を提供する。本発明は、創傷治癒を促進するための治療薬の有効性を評価またはモニタリングするため、ならびにmiR−92の機能および/または活性を調節する治療薬を用いた処置のために被験体を選択するための方法も提供する。本発明は、被験体における血管新生(angiogenesis)を促進させる方法であって、被験体に、表2から選択されるオリゴヌクレオチドなどの、本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドを投与することを含む方法も提供する。

Description

関連出願
本出願は、2015年1月20日に提出された米国仮出願62/105,546号のの利益を主張し、その全体を参照によって援用する。
本発明は、一般に、miR−92の機能および/または活性の調節物質、例えば、miR−92阻害剤であるオリゴヌクレオチド、ならびにmiR−92の機能および/または活性の調節物質についてのバイオマーカー、ならびにその使用に関する。
糖尿病および非治癒性糖尿病性足部潰瘍は、米国における非外傷性下肢切断の主な原因になっている。糖尿病性足部潰瘍は、血液供給不十分、虚血、ニューロパチー、グルコース制御不全、感染、および他の寄与因子に起因して、治癒できない。処置は、一般に、デブリードマン、感染制御、免荷を含み、成長因子(例えば、血小板由来成長因子(PDGF))または生体包帯のいずれかを施すことを含み得る。
マイクロRNA(miRNA:microRNA)とは、特異的なメッセンジャーRNA(mRNA:messenger RNA)をターゲティングし、それらの分解または翻訳の抑制を誘導することにより、遺伝子発現を負に調節することが可能な、小型で内因性の非コードRNAのクラスである(Ambros、Nature 431:350−355(2004年);Bartel、Cell 136:215−233(2009年))。近年の研究は、mRNAの分解を、mRNA標的に関するmiRNAの主要な機構的効果と規定している(Guoら、Nature 2010年 466:835−840)。
マイクロRNAは、心機能の制御および維持、血管炎症および血管病態の発生を含めた、いくつもの生物学的プロセスに関係づけられている(Eva Van RooijおよびEric Olson、J. Clin. Invest.、117巻(9号):2369〜2376頁(2007年);Chien、Nature、447巻:389〜390頁(2007年);KarthaおよびSubramanian、J. Cardiovasc. Transl. Res.、3巻:256〜270頁(2010年);Urbichら、Cardiovasc. Res.、79巻:581〜588頁(2008年)を参照されたい)。miRNAはまた、生物体の発生に関与し(Ambros、Cell、113巻:673〜676頁(2003年))、多数の組織において(Xuら、Curr. Biol.、13巻:790〜795頁(2003年);Landgrafら、Cell、129巻:1401〜14頁(2007年))、ウイルス感染プロセスにおいて(Pfefferら、Science、304巻:734〜736頁(2004年))示差的に発現し、また、発がんに関連する(Calinら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、101巻:2999〜3004頁(2004年);Calinら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、99巻(24号):15524〜15529頁(2002年))ことも報告されている。
したがって、マイクロRNAの機能および/または活性の調節は、種々の状態に対する有効な処置の開発における治療標的を示し得る。しかし、miRNAをターゲティングするアンチセンスベースの治療剤の送達は、複数の難題を提起しうる。特異的なmiRNAに対する結合アフィニティーおよび結合特異性、細胞内の取込みの効率、ならびにヌクレアーゼ耐性は全て、オリゴヌクレオチドベースの治療剤の送達および活性における因子であり得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、無傷細胞へと導入されると、ヌクレアーゼにより攻撃および分解され、活性の喪失がもたらされることがあり得る。したがって、有用なアンチセンス治療剤は、細胞外および細胞内のヌクレアーゼに対する耐性が大きいほか、細胞膜を透過することも可能であるかもしれない。逆に、治療薬が投与される組織および部位以外の組織および部位においてオンターゲット効果が望ましくない場合には、ヌクレアーゼ分解に対する感受性により、遠位組織の曝露および活性を限定する、または全身毒性を限定することができる。
Ambros、Nature 431:350−355(2004年) Bartel、Cell 136:215−233(2009年) Eva Van RooijおよびEric Olson、J. Clin. Invest.、117巻(9号):2369〜2376頁(2007年) Chien、Nature、447巻:389〜390頁(2007年) KarthaおよびSubramanian、J. Cardiovasc. Transl. Res.、3巻:256〜270頁(2010年) Urbichら、Cardiovasc. Res.、79巻:581〜588頁(2008年) Ambros、Cell、113巻:673〜676頁(2003年) Xuら、Curr. Biol.、13巻:790〜795頁(2003年) Landgrafら、Cell、129巻:1401〜14頁(2007年) Pfefferら、Science、304巻:734〜736頁(2004年) Calinら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、101巻:2999〜3004頁(2004年) Calinら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、99巻(24号):15524〜15529頁(2002年)
したがって、例えばmiR−92などのmiRNAに対するものを含めた、安定かつ効果的なオリゴヌクレオチドに基づく阻害剤が必要とされている。処置の決定の指針とするための、miRNA調節物質についてのバイオマーカーの同定も必要とされている。本発明のオリゴヌクレオチドは、被験体に投与した際の効力、送達の効率、標的特異性、安定性、および/または毒性において利点を有し得る。
本発明は、表1および表2から選択される配列を含むオリゴヌクレオチドを提供する。オリゴヌクレオチドは、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾されている少なくとも1つの非ロックドヌクレオチド(non−locked nucleotide)を含んでよい。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’−4’メチレン架橋(2’ to 4’ methylenebridge)を有する少なくとも1つのLNAを含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、完全にホスホロチオエート結合している。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ペンダント親油基を含む。有効量のオリゴヌクレオチドまたは薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容されるキャリアもしくは希釈剤を含む医薬組成物も本明細書に提供される。一部の実施形態では、薬学的に許容されるキャリアは、コロイド分散系、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、水中油エマルション、ミセル、混合ミセル、またはリポソームを含む。
本発明は、細胞におけるmiR−92の活性を低下させるまたは阻害する方法であって、細胞を、表2から選択されるオリゴヌクレオチドなどの、本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドと接触させることを含む方法も提供する。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vitro、in vivoまたはex vivoにある。
本発明は、被験体における血管新生(angiogenesis)を促進させる方法であって、被験体に、表2から選択されるオリゴヌクレオチドなどの、本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドを投与することを含む方法も提供する。一部の実施形態では、被験体は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
本発明は、被験体における創傷治癒を促進する方法であって、被験体にmiR−92阻害剤を投与することを含む方法も提供する。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含むオリゴヌクレオチドである。オリゴヌクレオチドは、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾された少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドを含んでよい。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’−4’メチレン架橋を有する少なくとも1つのLNAを含む。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドであり、配列は、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAである。一部の実施形態では、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドの5’末端からの、2位は、5−メチルシトシンであるデオキシリボ核酸(DNA)ヌクレオチドである。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドであり、配列は、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位および16位がLNAである。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドであり、配列は、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位および16位がLNAである。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドであり、配列は、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位および16位がLNAである。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、完全にホスホロチオエート結合している。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ペンダント親油基を含む。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、表1または2から選択されるオリゴヌクレオチドなどの、本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドである。一部の実施形態では、被験体は、糖尿病、創傷、末梢もしくは冠動脈閉塞、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。一部の実施形態では、創傷は、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡である。一部の実施形態では、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤の投与により、創傷治癒の間の被験体における創傷の再上皮化、肉芽および/または新血管新生(neoangiogenesis)の改善がもたらされる。一部の実施形態では、創傷の再上皮化、肉芽および/または新血管新生(新生血管形成(neovascularization))の改善は、処置を受けていない被験体と比較したものである。一部の実施形態では、創傷の再上皮化、肉芽および/または新血管新生の改善は、創傷治癒を促進することが公知の薬剤を用いた処置を受けた被験体と比較したものである。一部の実施形態では、創傷治癒を促進することが公知の薬剤は、成長因子である。一部の実施形態では、成長因子は、血小板由来成長因子(PDGF)または血管内皮成長因子(VEGF)である。
本発明は、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチドであって、配列が、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAであり、また、5’末端からの、2位が、5−メチルシトシンであるデオキシリボ核酸(DNA)ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチドも提供する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位および16位にLNAを含む。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。オリゴヌクレオチドは、2’−デオキシ、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾された少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドをさらに含んでよい。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドの全ての非ロックドヌクレオチドは2’−デオキシ修飾されている。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’−4’メチレン架橋を有する少なくとも1つのLNAを含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、完全にホスホロチオエート結合している。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ペンダント親油基を含む。一部の実施形態では、16ヌクレオチドの配列を含むオリゴヌクレオチド阻害剤の5’末端からの、2位に5−メチルシトシンが存在することにより、同じ配列ならびにLNAの数および位置を含有するが5−メチルシトシンを欠くオリゴヌクレオチド阻害剤と比較して、in vivo、ex vivoおよび/またはin vitroにおける有効性の増大が付与される。一部の実施形態では、有効性の増大は、miR−92の機能および/または活性の排除または低下の増強によって証明される。
本発明は、細胞におけるmiRNAの活性または機能を低下させるまたは阻害する方法であって、細胞を、16ヌクレオチドの配列を含む、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドであって、配列が、miRNAと相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAである、オリゴヌクレオチドと接触させることを含む方法も提供する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位および16位にLNAを含む。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。一部の実施形態では、配列は、miR−92と相補的である。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vitro、in vivoまたはex vivoにある。
本発明は、被験体における血管新生を促進させる方法であって、被験体に、16ヌクレオチドの配列を含む、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドであって、配列が、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAである、オリゴヌクレオチドを投与することを含む方法も提供する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位および16位にLNAを含む。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。一部の実施形態では、被験体は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
本発明は、被験体において虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)または末梢動脈疾患を処置する方法であって、被験体に、16ヌクレオチドの配列を含む、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドであって、配列が、miR−92と相補的であり、3つ以下の連続したLNAを含み、配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAである、オリゴヌクレオチドを投与することを含む方法も提供する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位および16位にLNAを含む。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位および16位にLNAを含む。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
本発明はまた、一部において、miR−92によって有意に制御される遺伝子の発見にも基づく。したがって、本発明の別の態様は、血管新生を調節するおよび/または慢性創傷を処置するための治療薬の、該治療薬を受けている被験体における有効性を評価またはモニタリングするための方法であって、被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により治療薬の有効性が示されることを含む方法である。本発明の別の態様は、miR−92の機能および/または活性を調節する治療薬を用いた処置のために被験体を選択するための方法であって、治療薬を用いた処置を受けた被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により被験体が治療薬を用いた処置(例えば、さらなる処置または処置の継続)のために選択されるべきかどうかが示されることを含む方法である。一部の実施形態では、方法は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している被験体を含む。一部の実施形態では、被験体は、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡を有する。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
一部の実施形態では、方法は、被験体に対して歩行時間試験(walk time test)を実施すること、被験体についての足関節上腕血圧比(ankle-bronchial index)(ABI)を決定すること、被験体に対して動脈造影もしくは血管造影を実施すること、または被験体に対してSPECT分析を実施することをさらに含む。一部の実施形態では、治療薬は、miR−92の機能および/または活性を調節する。治療薬は、表1および2から選択されるmiR−92阻害剤などのmiR−92アンタゴニストであってよい。他の実施形態では、治療薬は、miR−92模倣物などのmiR−92アゴニストである。一部の実施形態では、方法は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している被験体を含む。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
血管新生を促進する薬剤の能力を評価するための方法であって、薬剤と接触させた細胞における、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により血管新生を促進する薬剤の能力が示されることを含む方法も本明細書に提供される。一部の実施形態では、方法は、薬剤と接触させた細胞におけるmiR−92の機能および/または活性を決定することをさらに含む。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vitro、in vivoまたはex vivoにある。
本発明の別の態様は、創傷治癒を促進するための治療薬の、治療薬を受けている被験体における有効性を評価またはモニタリングするための方法であって、被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により治療薬の有効性が示されることを含む方法である。一部の実施形態では、治療薬は、miR−92の機能および/または活性を調節する。治療薬は、表1および2から選択されるmiR−92阻害剤などのmiR−92アンタゴニストであってよい。他の実施形態では、治療薬は、miR−92模倣物などのmiR−92アゴニストである。一部の実施形態では、方法は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している被験体を含む。一部の実施形態では、被験体は、ヒトである。
創傷治癒を促進する薬剤の能力を評価するための方法であって、薬剤と接触させた細胞における、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により創傷治癒を促進する薬剤の能力が示されることを含む方法も本明細書に提供される。一部の実施形態では、方法は、薬剤と接触させた細胞におけるmiR−92の機能および/または活性を決定することをさらに含む。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vitro、in vivoまたはex vivoにある。
図1は、ヒト臍帯静脈内皮細胞(HUVEC)においてmiR−92a調節によって有意に制御される多数の遺伝子を例示する図である。
図2A〜Cは、HUVECにおけるmiR−92aによるインテグリンα5発現制御を例示するグラフである。インテグリンα5(ITGA5)転写物(図2A〜B)およびタンパク質(図2C)のレベルは、miR−92a阻害に応答して上昇し、miR−92a模倣物に応答して低下する。図2A〜Bは、指示オリゴヌクレオチドをそれぞれHUVECに脂質トランスフェクトしたまたは受動的に送達した指示濃度を示す。図2Cは、脂質媒介性トランスフェクション後のインテグリンα5タンパク質レベルを示す。受動的送達とは、補助を伴わないオリゴヌクレオチドの取り込みを指す。A(配列番号7)、B(配列番号61)およびC(配列番号62)は、LNA/DNAを含有するmiR−92a阻害剤である。「アンタゴmiR」は、O−メチル化された、コレステロールとコンジュゲートした阻害剤である。Dは、一本鎖LNA/DNA対照阻害剤である。
図3は、リアルタイムPCRによる、マイクロアレイプロファイリングによって同定された標的の制御を例示するグラフである。マイクロアレイプロファイリングによって同定された4つの遺伝子は、独立したHUVEC脂質トランスフェクション実験において、miR−92a阻害に応答して上昇し、miR−92a模倣物に応答して低下する。レーダープロットは、オリゴヌクレオチドを伴わずに脂質を用いてトランスフェクトしたHUVECに対して正規化した、miR−92a阻害剤または模倣物に応答したMAN2A1、CNEP1R1、ERGIC2、およびCD93の相対的な発現量を示す。黒い線は、変化がない場合の遺伝子発現を示し、赤い線は、D(対照オリゴ)トランスフェクションに応答した遺伝子発現を示す。
図4は、阻害剤デザインの活性(inhibitor designactivity)を試験するための二重ルシフェラーゼアッセイを例示するグラフである。miR−92a阻害剤を、二重ルシフェラーゼレポータープラスミドからのルシフェラーゼの発現を抑制解除するそれらの能力に基づいて順位付けした。3回の反復実験の最初の実験からのデータの例のセットが示されている。
図5A〜Fは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおけるmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤の活性を調査する第1の試験の結果を例示するグラフである。図5Aは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、リン酸緩衝食塩水(PBS;ビヒクル対照)処置群、血管内皮成長因子(VEGF;陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A(配列番号7);C(配列番号62))処置群からの、創傷のパーセント再上皮化を例示する。図5Bは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷における肉芽組織内部成長もしくは充填のパーセントを例示する。図5Cは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷における肉芽組織面積を例示する。図5Dは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷にわたる肉芽組織の厚さの平均(創傷面積を創傷の幅で割ったもの)を例示する。図5E〜Fは、新生血管形成/血管新生の指標として免疫組織化学的検査を使用した、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A)処置群からの、創傷におけるCD31+内皮細胞の数(図5E)およびCD31+の組織面積(図5F)を例示する。
図6A〜Fは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおけるmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤の活性を調査する第2の試験の結果を例示するグラフである。図6Aは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群、血小板由来成長因子(PDGF;陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷のパーセント再上皮化を例示する。図6Bは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群、PDGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷における肉芽組織内部成長もしくは充填のパーセントを例示する。図6Cは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群、PDGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷における肉芽組織面積を例示する。図6Dは、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群、PDGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;C)処置群からの、創傷にわたる肉芽組織の厚さの平均(創傷面積を創傷の幅で割ったもの)を例示する。図6E〜Fは、新生血管形成/血管新生の指標として免疫組織化学的検査を使用した、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、PBS(ビヒクル対照)処置群、VEGF(陽性対照)処置群、PDGF(陽性対照)処置群およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A)処置群からの、創傷におけるCD31+内皮細胞の数(図6E)およびCD31+の組織面積(図6F)を例示する。
図7は、定量的RT−PCRによって評価した、db/dbマウス切除創における1つのin vivo試験からの、miR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤による選択されたmiR−92a標的遺伝子の抑制解除を例示するグラフである。
図8A〜Dは、免疫組織化学的検査を使用して評価した、創傷治癒不良のin vivoモデルにおける、創傷におけるmiR−92標的ITGA5のタンパク質の発現に対する食塩水(ビヒクル対照;図8A)による処置、PDGF(陽性対照;図8B)による処置、およびmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤(A;図8C〜D)による処置の効果を例示する図である。
図9は、阻害剤デザインの活性に対する5−メチルシトシンの存在の効果を試験するための二重ルシフェラーゼアッセイを例示するグラフである。5−メチルシトシンを伴う場合と伴わない場合のmiR−92a阻害剤を、二重ルシフェラーゼレポータープラスミドからのルシフェラーゼの発現を抑制解除するそれらの能力に基づいて分析した。データの例のセットが示されている。
本発明は、miR−92の活性または機能を阻害するオリゴヌクレオチド阻害剤および組成物ならびにその使用を提供する。miR−92模倣物などのmiR−92アゴニストも本明細書に提供される。
miR−92は、miR−17−5p、miR−17−3p、miR−18a、miR−19a、miR−20a、miR−19b、およびmiR−92−1からなるmiR−17−92クラスターに位置する(Venturiniら、Blood 109巻、10号:4399〜4405頁(2007年))。miR−92のpre−miRNA配列がプロセシングされて成熟配列(3p)およびアスタリスク付きの(star)(すなわち副または5p)配列になる。アスタリスク付きの配列は、幹ループ構造の他方の腕からプロセシングされる。ヒトmiR−92、マウスmiR−92、およびラットmiR−92の成熟miRNA配列およびアスタリスク付きのmiRNA配列を提示する:
上記の配列は、リボ核酸配列の場合もあり、デオキシリボ核酸配列の場合もあり、これら2つの組合せ(すなわち、リボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドの両方を含む核酸)の場合もある。本明細書で記載される配列のうちのいずれか1つを含む核酸は、DNA配列では、ウリジン塩基の代わりにチミジン塩基を有し、RNA配列では、チミジン塩基の代わりにウリジン塩基を有することが理解される。
一部の実施形態では、miR−92と相補的な配列を含むオリゴヌクレオチドは、miR−92阻害剤である。miR−92と相補的な配列を含むオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチド阻害剤であってよい。本発明に関しては、「オリゴヌクレオチド阻害剤」、「抗miR」、「アンタゴニスト」、「アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはASO」、「オリゴマー」、「抗マイクロRNAオリゴヌクレオチドまたはAMO」、または「ミクスマー(mixmer)」という用語は広範に使用され、標的マイクロRNA(miRNA)の活性または機能を、miRNAと完全にまたは部分的にハイブリダイズし、それにより、標的miRNAの機能または活性を抑制することによって阻害するリボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、修飾されたリボヌクレオチド、修飾されたデオキシリボヌクレオチドまたはこれらの組合せを含むオリゴマーを包含する。
「miR−92」という用語は、本明細書で使用される場合、pri−miR−92、pre−miR−92、miR−92、miR−92a、miR−92b、miR−92a−3p、およびhsa−miR−92a−3pを含む。
一部の実施形態では、本発明のある特定のオリゴヌクレオチド阻害剤は、他のmiR−92阻害剤と比較して、細胞におけるmiR−92の活性または機能のより大きな阻害を示し得る。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vivoまたはex vivoにある。一部の実施形態では、本発明のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、表3から選択される遺伝子などの、miR−92の標的の抑制解除の量によって測定される通り、他のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤と比較してより高い有効性を示す。
「他のmiR−92阻害剤」という用語は、miR−92の発現または活性を阻害するアンチセンスオリゴヌクレオチド、抗miR、アンタゴmiR、ミクスマー、ギャップマー(gapmer)、アプタマー、リボザイム、低分子干渉RNA、または低分子ヘアピン型RNA;抗体もしくはその抗原結合性断片;および/または薬物などの核酸阻害剤を含む。本発明の特定のオリゴヌクレオチド阻害剤は、本発明の他のオリゴヌクレオチド阻害剤と比較して、細胞(例えば、筋肉細胞、心臓細胞、内皮細胞、線維細胞(fiborcyte)、線維芽細胞、またはケラチノサイト)におけるmiR−92のより大きな阻害を示し得る可能性がある。「より大きな」という用語は、本明細書で使用される場合、定量的により多いことまたは統計的に有意により多いことを指す。
miR−92の機能および/または活性の調節におけるオリゴヌクレオチドの活性は、in vitro、ex vivoおよび/またはin vivoで決定することができる。例えば、miR−92活性の阻害をin vitroで決定する場合、活性は、二重ルシフェラーゼアッセイを使用して決定することができる。二重ルシフェラーゼアッセイは、当技術分野で公知の任意の二重ルシフェラーゼアッセイであってよい。二重ルシフェラーゼアッセイは、市販の二重ルシフェラーゼアッセイであってよい。市販品であるPsiCHECK(商標)(Promega)により例示される二重ルシフェラーゼアッセイは、検出用タンパク質(例えば、ウミシイタケルシフェラーゼ)のためのmiR認識部位の、遺伝子の3’UTR内の配置を伴い得る。阻害剤活性を、シグナルの変化により決定しうるように、構築物を、miR−92と共に共発現させ得る。検出用タンパク質(例えば、ホタルルシフェラーゼ)をコードする第2の遺伝子も、同じプラスミドに組み入れることができ、シグナルの比を、候補オリゴヌクレオチドのantimiR−92活性の指標として決定する。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、二重ルシフェラーゼ活性により決定されるこのような活性を、約50nMもしくはそれ未満、または他の実施形態では、40nMもしくはそれ未満、20nMもしくはそれ未満、または10nMもしくはそれ未満の濃度で著明に阻害する。例えば、二重ルシフェラーゼ活性により決定される通り、オリゴヌクレオチドは、miR−92活性の阻害についてのIC50が、約50nMもしくはそれ未満、40nMもしくはそれ未満、30nMもしくはそれ未満、または20nMもしくはそれ未満でありうる。
その代わりに、またはそれに加えて、本明細書に提供されるmiRNA(例えば、miR−92)のオリゴヌクレオチド阻害剤のin vivo有効性は、適切な動物モデルにおいて決定することもできる。動物モデルは、げっ歯類モデル(例えば、マウスモデルまたはラットモデル)であってよい。オリゴヌクレオチドは、50mg/kgもしくはそれ未満、25mg/kgもしくはそれ未満、10mg/kgもしくはそれ未満または5mg/kgもしくはそれ未満の用量で、少なくとも50%のmiR−92の標的抑制解除を示し得る。そのような実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マウスの静脈内または皮下に投薬、送達または投与することも、筋肉または創傷(例えば、創縁または創床)への局部注射など、局部に送達することもでき、また、オリゴヌクレオチドは、食塩水中で製剤化されていてよい。一部の実施形態では、適用を、マウスに、例えば創傷(例えば、創縁または創床)に、局所的にまたは皮内に(すなわち、皮内注射)投薬することができる。本明細書に提供されるmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、他のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤と比較して、特定の組織においてin vivo有効性が増大し得る。
一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドのin vivo有効性を適切な糖尿病のマウスモデルまたはラットモデルにおいて決定する。一実施形態では、マウスモデルは、db/dbマウスなどの遺伝的II型糖尿病マウスである(Jackson カタログ番号000642 BKS.Cg Dock(Hom)7m+/+Leprdb/j)。一実施形態では、モデルに全層皮膚切除パンチ生検を使用する。他の実施形態では、モデルに切開、熱湯傷または熱傷を利用する。そのような実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マウスの静脈内または皮下に投薬することも、創傷(例えば、創縁または創床)への局部注射または局所適用など、局部に送達することもできる。
これらまたは他の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、投与後に安定であり得、投与後少なくとも3週間、少なくとも4週間、少なくとも5週間、または少なくとも6週間、またはそれ超にわたって、循環中および/または標的器官において検出可能である。したがって、本明細書に提供されるmiRNA(例えば、miR−92)のオリゴヌクレオチド阻害剤により、miRNA(例えば、miR−92)の他のオリゴヌクレオチド阻害剤と比較して、より頻度の低い投与、より低い用量、および/またはより長い治療効果の持続時間がもたらされ得る。
オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列は、mRNAまたはmiRNAなどのRNAのヌクレオチド配列と実質的に相補的であってよい。オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列は、mRNAまたはmiRNAなどのRNAのヌクレオチド配列と完全に相補的であってよい。一部の実施形態では、miRNAは、miR−92またはmiR−92aである。オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのLNA、例えば、少なくとも2つのLNA、少なくとも3つのLNA、少なくとも5つのLNA、少なくとも7つのLNAまたは少なくとも9つのLNAを含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、LNAと非ロックドヌクレオチドとの混合物を含む。例えば、オリゴヌクレオチドは、少なくとも5つまたは少なくとも7つまたは少なくとも9つのロックドヌクレオチドと、少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドとを含有してよい。
一般に、オリゴヌクレオチドの長さならびにロックトヌクレオチドの数および位置は、オリゴヌクレオチドが、miR−92機能および/または活性を低減するような、長さならびに数および位置である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの長さならびにロックトヌクレオチドの数および位置は、オリゴヌクレオチドが、miR−92機能および/または活性を、各々が記載されている通りに、in vitroのルシフェラーゼアッセイにおいて、約50nMまたはそれ未満のオリゴヌクレオチド濃度で、あるいは適切なマウスモデルまたはラットモデルにおいて、約50mg/kgもしくはそれ未満、または約25mg/kgもしくはそれ未満の用量で低減するような、長さならびに数および位置である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの長さならびにロックトヌクレオチドの数および位置は、本明細書で記載されているマウスモデルまたはラットモデルなどの、適切なマウスモデルまたはラットモデルにおいて、約50mg/kgもしくはそれ未満、または約25mg/kgもしくはそれ未満の用量で、標的の抑制解除により決定される通り、オリゴヌクレオチドが、miR−92の活性を低減するような、長さならびに数および位置である。
本発明のオリゴヌクレオチドは、少なくとも5つのLNA、配列の5’末端にあるLNA、配列の3’末端にあるLNA、またはそれらの任意の組合せを含むヌクレオチドの配列を含んでよい。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも5つのLNA、配列の5’末端にあるLNA、配列の3’末端にあるLNA、またはそれらの任意の組合せを含むヌクレオチドの配列を含み、ヌクレオチドの3つ以下は連続したLNAである。例えば、オリゴヌクレオチドは、3つ以下の連続したLNAを含む。例えば、オリゴヌクレオチドは、少なくとも5つのLNA、5’末端にあるLNA、3’末端にあるLNA、および3つ以下の連続したLNAを有する配列を含んでよい。オリゴヌクレオチドは、少なくとも5つのLNA、5’末端にあるLNA、3’末端にあるLNA、および3つ以下の連続したLNAを有する配列を含んでよく、配列は少なくとも16ヌクレオチドの長さである。配列は、mRNAまたはmiRNAなどのRNAと実質的にまたは完全に相補的であってよく、実質的に相補的な配列は、その標的配列に対して1〜4つのミスマッチ(例えば、1つまたは2つのミスマッチ)を有してよい。一実施形態では、標的配列はmiRNAであり、したがって、オリゴヌクレオチドはmiRNA阻害剤または抗miRである。一実施形態では、標的配列は、本明細書に提供されるmiR−92配列である。
さらに別の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、miRNAのシード領域(例えば、miR−92)と相補的であり、少なくとも5つのLNAを含む配列を含んでよい。「miRNAのシード領域」とは、miRNAの5’末端にある塩基2〜9にわたる部分である。miRNAのシード領域(例えば、miR−92)と相補的であり、少なくとも5つのLNAを含む配列を含むオリゴヌクレオチドは、5’末端にあるLNAまたは3’末端にあるLNA、または5’末端と3’末端の両方にあるLNAを含んでよい。一実施形態では、少なくとも5つのLNA、5’末端にあるLNAおよび/または3’末端にあるLNAを含むオリゴヌクレオチドは、3つ以下の連続したLNAも有する。一部の実施形態では、配列は少なくとも16ヌクレオチドの長さである。miRNAのシード領域と相補的な配列は実質的に相補的であっても完全に相補的であってもよい。
本発明のオリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のロックド核酸(LNA)残基、または「ロックドヌクレオチド」を含んでよい。本発明のオリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のロックド核酸(LNA)残基、または「ロックドヌクレオチド」を含有してよい。本発明のオリゴヌクレオチドは、他の糖または塩基修飾を含有する1つまたは複数のヌクレオチドを含んでよい。「ロックドヌクレオチド」、「ロックド核酸単位」、「ロックド核酸残基」、「LNA」または「LNA単位」という用語は、本開示全体を通して互換的に使用することができ、二環式ヌクレオシド類似体を指す。例えば、適切なオリゴヌクレオチド阻害剤は、BSNを含有するオリゴヌクレオチドとそれらの相補的な標的鎖との間で形成される複合体に増強された熱安定性を付与する、1つまたは複数の「コンフォメーション的に制約された」または二環式糖ヌクレオシド修飾(BSN)で構成されてよい。LNAは、例えば、全てが本明細書によってその全体が参照により組み込まれる米国特許第6,268,490号;同第6,316,198号;同第6,403,566号;同第6,770,748号;同第6,998,484号;同第6,670,461号;および同第7,034,133号に記載されている。LNAは、「ロックド」コンフォメーションをもたらすリボース糖部分の2’炭素と4’炭素との間の追加の架橋、および/または二環式構造を含有する修飾されたヌクレオチドまたはリボヌクレオチドである。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、下の構造Aによって示される構造を有するLNAを1つまたは複数含有する。その代わりにまたはそれに加えて、オリゴヌクレオチドは、下の構造Bによって示される構造を有するLNAを1つまたは複数含有してよい。その代わりにまたはそれに加えて、オリゴヌクレオチドは、下の構造Cによって示される構造を有するLNAを1つまたは複数含有する。
本発明に関しては、DNAまたはRNAヌクレオチドの、その対応するロックドヌクレオチドによる置換について言及する場合、「対応するロックドヌクレオチド」という用語は、DNA/RNAヌクレオチドが、それが置き換えられたDNA/RNAヌクレオチドと同じ天然に存在する窒素塩基または化学修飾された同じ窒素塩基を含有するロックドヌクレオチドによって置き換えられていることを意味するものとする。例えば、窒素塩基Cを含有するDNAヌクレオチドの対応するロックドヌクレオチドは、同じ窒素塩基Cまたは化学修飾された同じ窒素塩基C、例えば5−メチルシトシンを含有してよい。
「非ロックドヌクレオチド」という用語は、ロックドヌクレオチドとは異なるヌクレオチドを指す、すなわち、「非ロックドヌクレオチド」という用語は、DNAヌクレオチド、RNAヌクレオチド、ならびに、修飾がロックド修飾ではないことを除いては、塩基および/または糖が修飾されたものである、修飾されたヌクレオチドを含む。
本発明のオリゴヌクレオチドに組み入れることができる他の適切なロックドヌクレオチドとしては、どちらも本明細書によってその全体が参照により組み込まれる米国特許第6,403,566号および同第6,833,361号に記載されているものが挙げられる。
例示的な実施形態では、ロックドヌクレオチドは、例えば構造Aに示されている2’−4’メチレン架橋を有する。他の実施形態では、架橋は、メチレン基またはエチレン基を含み、これは置換されていてもよく、そして2’位にエーテル結合を有しても有さなくてもよい。
本発明のオリゴヌクレオチド阻害剤は、塩基修飾または置換を有する修飾されたヌクレオチドを含んでよい。RNA内の天然のまたは修飾されていない塩基は、プリン塩基アデニン(A)およびグアニン(G)、ならびにピリミジン塩基シトシン(C)およびウラシル(U)(DNAはチミン(T)を有する)である。修飾された塩基は、複素環式塩基部分とも称され、それらとして、他の合成および天然の核酸塩基、例えば、5−メチルシトシン(5−me−C)、5−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、2−アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの6−メチル誘導体および他のアルキル誘導体、アデニンおよびグアニンの2−プロピル誘導体および他のアルキル誘導体、2−チオウラシル、2−チオチミンおよび2−チオシトシン、5−ハロウラシルおよびシトシン、5−プロピニルウラシルおよびシトシンおよびピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、6−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、5−ウラシル(シュードウラシル)、4−チオウラシル、8−ハロ、8−アミノ、8−チオール、8−チオアルキル、8−ヒドロキシルおよび他の8−置換アデニンおよびグアニン、5−ハロ(5−ブロモ、5−トリフルオロメチルおよび他の5−置換ウラシルおよびシトシンを含む)、7−メチルグアニンおよび7−メチルアデニン、2−F−アデニン、2−アミノ−アデニン、8−アザグアニンおよび8−アザアデニン、7−デアザグアニンおよび7−デアザアデニンおよび3−デアザグアニンおよび3−デアザアデニンが挙げられる。ある特定の実施形態では、miR−92を標的とするオリゴヌクレオチド阻害剤は、1つまたは複数のBSN修飾(すなわち、LNA)を塩基修飾(例えば、5−メチルシチジン)と組み合わせて含む。
本発明のオリゴヌクレオチド阻害剤は、修飾された糖部分を有するヌクレオチドを含んでよい。代表的な修飾された糖としては、炭素環式または非環式糖、それらの2’位、3’位または4’位の1つまたは複数に置換基群を有する糖、および、糖の1つまたは複数の水素原子の代わりに置換基を有する糖が挙げられる。ある特定の実施形態では、糖は、2’位に置換基群を有することによって修飾されている。追加の実施形態では、糖は、3’位に置換基群を有することによって修飾されている。他の実施形態では、糖は、4’位に置換基群を有することによって修飾されている。糖がこれらの位置の1つ超に修飾を有してよいこと、またはオリゴヌクレオチド阻害剤が1つの位置に糖修飾を有する1つまたは複数のヌクレオチドならびに異なる位置にも糖修飾を有する1つまたは複数のヌクレオチドを有してよいことも意図されている。
オリゴヌクレオチドは、miR−92に対するアンチセンス配列を含んでも、それから本質的になっても、それからなってもよい。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92を対象とするアンチセンス配列を含む。例えば、オリゴヌクレオチドは、成熟miR−92配列と少なくとも部分的に相補的な配列、例えば、ヒト成熟miR−92配列と少なくとも約75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、6%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的である配列を含んでよい。一実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤は、成熟miR−92配列と100%または完全に相補的である配列を含む。オリゴヌクレオチド阻害剤の配列は、オリゴヌクレオチド阻害剤配列が天然に存在するヌクレオチドの代わりに修飾されたヌクレオチドを含んでいたとしても、miR−92と相補的であるとみなされることが理解される。例えば、miR−92の成熟配列が特定の位置にグアノシンヌクレオチドを含む場合、オリゴヌクレオチド阻害剤は、対応する位置にロックドシチジンヌクレオチドまたは2’−フルオロ−シチジンなどの修飾されたシチジンヌクレオチドを含んでよい。
「約」という用語は、本明細書で使用される場合、+/−10%、より好ましくは+/−5%の変動を包含するものとし、そのような変動は本発明の実行に適するものである。
ある種の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92のヌクレオチド配列と完全に相補的なヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92と相補的なヌクレオチド配列を含むか、これらから本質的になるか、またはこれらからなる。この場合、「から本質的になる」とは、5’末端と3’末端のいずれかまたはその両方への任意選択のヌクレオチドの付加(例えば、1つまたは2つ)を、追加のヌクレオチド(複数可)が、二重ルシフェラーゼアッセイまたは動物(例えば、マウス)モデルにおけるオリゴヌクレオチドによる標的miRNA活性の阻害に実質的に影響を及ぼさない(IC50の増加が20%以下であることによって定義される)限りは含む。
オリゴヌクレオチドは一般に、成熟miR−92をターゲティングするようにデザインされたヌクレオチド配列を有する。オリゴヌクレオチドは、これらの実施形態または他の実施形態ではまた、miR−92のpre−miRNA形態またはpri−miRNA形態もターゲティングするようにデザインされる場合もあり、代替的に、これらをターゲティングするようにデザインされる場合もある。ある種の実施形態では、オリゴヌクレオチドを、完全に相補的な(成熟)miR−92配列と比べて、1〜5カ所(例えば、1、2、3、または4カ所)のミスマッチを含有する配列を有するようにデザインすることができる。ある種の実施形態では、このようなアンチセンス配列を、例えば、ステム部分およびループ部分を含有するshRNA構造内または他のRNA構造内に組み込むことができる。
オリゴヌクレオチドは、8〜20ヌクレオチドの長さ、15〜50ヌクレオチドの長さ、18〜50ヌクレオチドの長さ、10〜18ヌクレオチドの長さ、または11〜16ヌクレオチドの長さでありうる。オリゴヌクレオチドは、いくつかの実施形態では、約8、約9、約10、約11、約12、約13、約14、約15、約16、約17、または約18ヌクレオチドの長さである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも約16ヌクレオチドの長さである。一実施形態では、本発明は、11〜16ヌクレオチドの長さを有するmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を提供する。種々の実施形態では、miR−92を標的とするオリゴヌクレオチド阻害剤は、11ヌクレオチド、12ヌクレオチド、13ヌクレオチド、14ヌクレオチド、15ヌクレオチド、または16ヌクレオチドの長さを有する。一実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、12ヌクレオチドの長さである。一部の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、少なくとも16ヌクレオチドの長さである。
一般に、LNAの数および位置は、オリゴヌクレオチドによりmiR−92の活性または機能が低下するようなものであり得る。一実施形態では、LNAの数および位置は、オリゴヌクレオチドの有効性が対照と比較して増大するようなものである。一部の実施形態では、有効性とは、有益なまたは所望の結果(例えば、臨床結果)を生じさせる能力である。有益なまたは所望の結果とは、疾患または状態の症状(1つまたは複数)の低下、好転、または除去であってよい。有益なまたは所望の結果は、miR−92の活性または機能の阻害、低下、好転、または除去であってよい。有効性の増大は、in vivo、in vitro、またはex vivoにおける増大であってよい。対照は、本明細書に提供されるLNAを含むオリゴヌクレオチドと同じ配列を含有するが化学修飾は含有しないオリゴヌクレオチドであってよい。対照は、本明細書に提供されるLNAを含むオリゴヌクレオチドと同じ配列を含有するが、異なる化学修飾モチーフまたはパターンを含有するオリゴヌクレオチドであってよい。対照は、本明細書に提供されるLNAを含むオリゴヌクレオチドと同じ配列を含有するが、数および/または位置が異なるLNAを含有するオリゴヌクレオチドであってよい。対照は、同じ配列ならびに同じ数および/または位置のLNAを含有するが、1つまたは複数の5−メチルシトシンの存在など、異なる追加の修飾を含有するオリゴヌクレオチドであってよい。
本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、一般には、少なくとも約2つ、少なくとも約3つ、少なくとも約4つ、少なくとも約5つ、少なくとも約7つ、または少なくとも約9つのLNAを含有するが、種々の実施形態では、完全にLNAで構成されるのではない。一般に、LNAの数および位置は、オリゴヌクレオチドによりmRNAまたはmiRNAの機能または活性が低下するようなものである。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、4つより多くまたは3つより多く連続したLNAを有するひと続きのヌクレオチドを含有しない。例えば、オリゴヌクレオチドは、3つ以下の連続したLNAを含む。これらまたは他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miRNAシード領域と実質的にまたは完全に相補的であり、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、または少なくとも5つのロックドヌクレオチドを含む領域または配列を含んでよい。
ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤は、少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、または少なくとも5つのDNAヌクレオチドを含有する。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤は、少なくとも1つのLNAを含み、オリゴヌクレオチド阻害剤内の各非ロックドヌクレオチドはDNAヌクレオチドである。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤は、少なくとも2つのLNAを含み、オリゴヌクレオチド阻害剤内の各非ロックドヌクレオチドはDNAヌクレオチドである。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤の5’末端から少なくとも2番目のヌクレオチドはDNAヌクレオチドである。一実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドの少なくとも1つ、少なくとも2つ、少なくとも3つ、少なくとも4つ、または少なくとも5つのDNAヌクレオチドが化学修飾された窒素塩基を含有する。一実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤の5’末端から2番目のヌクレオチドは化学修飾された窒素塩基を含有する。化学修飾された窒素塩基は、5−メチルシトシンであってよい。一実施形態では、5’末端から2番目のヌクレオチドは、5−メチルシトシンである。一実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤は、シトシンである各LNAに5−メチルシトシンを含む。
一実施形態では、本明細書に提供されるmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、12〜16ヌクレオチドの配列を含み、配列は、miR−92の成熟配列と少なくとも部分的にまたは完全に相補的であり、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、少なくとも最初のヌクレオチド位置および最後のヌクレオチド位置はLNAである。ある特定の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、12ヌクレオチドの長さを有する。ある特定の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、13ヌクレオチドの長さを有する。ある特定の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、14ヌクレオチドの長さを有する。ある特定の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、15ヌクレオチドの長さを有する。ある特定の実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、16ヌクレオチドの長さを有する。オリゴヌクレオチドは、完全なまたは部分的な(すなわち、1つまたは複数の)ホスホロチオエート骨格を有してよい。オリゴヌクレオチドは、これだけに限定されないが、1つまたは複数の化学修飾された窒素塩基、5’および/もしくは3’キャップ構造、ペンダント親油基および/または2’デオキシ、2’O−アルキルもしくは2’ハロ修飾(複数可)を含めた、本明細書に提供される任意の追加の修飾をさらに含んでよい。ある特定の実施形態では、12ヌクレオチドから16ヌクレオチドまでの配列を含むmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤は、化学修飾された窒素塩基を有する少なくとも1つのヌクレオチドを含む。化学修飾された窒素塩基は、メチル化された塩基であってよい。ある特定の実施形態では、化学修飾された窒素塩基は、5−メチルシトシンである。一実施形態では、シトシンである各LNAは、5−メチルシトシンである。ある特定の実施形態では、化学修飾された窒素塩基を有する少なくとも1つのヌクレオチド(例えば、5−メチルシトシン)を含む本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤は、化学修飾された窒素塩基を欠く同じオリゴヌクレオチド阻害剤と比較して、有効性の増大を示す。有効性の増大は、miR−92の機能および/または活性の低下または阻害の増大であってよい。有効性の増大は、in vivo、ex vivoおよび/またはin vitroにおけるものであってよい。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、13〜16ヌクレオチドの配列を含んでよく、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位および13位はLNAであり、残りの位置は非ロックドヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドは、miRNAまたはmiRNAのシード領域と少なくとも部分的に相補的であり、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。オリゴヌクレオチドは、miRNAと完全に相補的であってよく、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。一部の実施形態では、少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドは、化学修飾された窒素塩基を含む。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤は、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、2番目のヌクレオチド位置に化学修飾された窒素塩基を含有するヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態では、2番目のヌクレオチド位置はシトシンであり、化学修飾された窒素塩基は5−メチルシトシンである。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤における化学修飾された窒素塩基(複数可)(例えば、5−メチルシトシン)が存在すると、同じ数および/または位置のLNAを有するが、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)は有さないオリゴヌクレオチドと比較して、in vivoまたはin vitroにおける有効性が増大した。有効性の増大は、miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の低下の増大であってよい。
別の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも16ヌクレオチドを含んでよく、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、8位、10位、11位、13位、14位、および16位はLNAであり、残りの位置は非ロックドヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドはmiRNAまたはmiRNAのシード領域と少なくとも部分的に相補的であり、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。オリゴヌクレオチドは、miRNAと完全に相補的であってよく、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。一部の実施形態では、5’末端から2番目のヌクレオチドは、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤における化学修飾された窒素塩基(複数可)(例えば、5−メチルシトシン)が存在すると、同じ数および/または位置のLNAを有するが、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)は有さないオリゴヌクレオチドと比較して、in vivoまたはin vitroにおける有効性が増大した。有効性の増大は、miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の低下の増大であってよい。
別の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも16ヌクレオチドを含んでよく、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、1位、5位、6位、8位、10位、11位、13位、15位、および16位はLNAであり、残りの位置は非ロックドヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドはmiRNAまたはmiRNAのシード領域と少なくとも部分的に相補的であり、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。オリゴヌクレオチドは、miRNAと完全に相補的であってよく、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。一部の実施形態では、5’末端から2番目のヌクレオチドは、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤における化学修飾された窒素塩基(複数可)(例えば、5−メチルシトシン)が存在すると、同じ数および/または位置のLNAを有するが、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)は有さないオリゴヌクレオチドと比較して、in vivoまたはin vitroにおける有効性が増大した。有効性の増大は、miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の低下の増大であってよい。
別の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも16ヌクレオチドを含んでよく、オリゴヌクレオチドの5’末端から3’末端までの、1位、3位、6位、9位、10位、11位、13位、14位、および16位はLNAであり、残りの位置は非ロックドヌクレオチドであり、オリゴヌクレオチドはmiRNAまたはmiRNAのシード領域と少なくとも部分的に相補的であり、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。オリゴヌクレオチドは、miRNAと完全に相補的であってよく、miRNAは、一部の実施形態では、miR−92であってよい。一部の実施形態では、5’末端から2番目のヌクレオチドは、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチド阻害剤における化学修飾された窒素塩基(複数可)(例えば、5−メチルシトシン)が存在すると、同じ数および/または位置のLNAを有するが、化学修飾された窒素塩基(例えば、5−メチルシトシン)は有さないオリゴヌクレオチドと比較して、in vivoまたはin vitroにおける有効性が増大した。有効性の増大は、miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の低下の増大であってよい。
一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは表1または2から選択される。ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、表2から選択されるオリゴヌクレオチド阻害剤である。
一部の実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤(例えば、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤)は、標的miRNA(例えば、miR−92)の他の阻害剤と比較して、標的miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の少なくとも約0.5%、少なくとも約1%、少なくとも約2%、少なくとも約3%、少なくとも約4%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、または少なくとも約99%大きな阻害を示す。改善または増大は、in vitro、ex vivoおよび/またはin vivoにおけるものであってよい。
一部の実施形態では、本明細書に提供される5−メチルシトシンを含むオリゴヌクレオチド阻害剤(例えば、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤)により、同じヌクレオチド配列ならびにLNA/DNAパターンを有するが5−メチルシトシンを欠くオリゴヌクレオチドと比較して、標的miRNA(例えば、miR−92)の機能および/または活性の低下の少なくとも約0.5%、少なくとも約1%、少なくとも約2%、少なくとも約3%、少なくとも約4%、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、または少なくとも約99%の増大または改善がもたらされる。改善または増大は、in vitro、ex vivoおよび/またはin vivoにおけるものであってよい。一部の場合では、本明細書で提供されるオリゴヌクレオチド阻害剤の全てのLNAシトシンは、5−メチルシトシンLNAである。
非ロックドヌクレオチドについての一部の実施形態では、ヌクレオチドは、2’ヒドロキシルに関して2’修飾を含有してよい。例えば、2’修飾は2’デオキシであってよい。2’修飾されたヌクレオチドをアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み入れることにより、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼに対する抵抗性が増大し得る。2’修飾されたヌクレオチドをアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み入れることにより、相補的なRNAとのそれらの熱安定性が増大し得る。2’修飾されたヌクレオチドをアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み入れることにより、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼに対する抵抗性および相補的なRNAとのそれらの熱安定性の両方が増大し得る。2’位における種々の修飾は、独立に、RNA標的または細胞機構との分子相互作用を損なうことなくヌクレアーゼ感受性の増大をもたらす修飾から選択することができる。そのような修飾は、in vitro、ex vivoまたはin vivoでのそれらの効力の増大に基づいて選択することができる。miR−92の阻害に関する効力の増大(例えば、IC50)を決定するための例示的な方法は、二重ルシフェラーゼアッセイおよびin vivoにおけるmiR−92の存在度または標的抑制解除を含むが、これに限定されず、本明細書に記載されている。
一部の実施形態では、2’修飾は、独立に、O−アルキル(置換されていてもよい)、ハロ、およびデオキシ(H)から選択することができる。ある特定の実施形態では、非ロックドヌクレオチドの実質的に全てまたは全てのヌクレオチドの2’位を、例えば、独立に、O−アルキル(例えば、O−メチル)、ハロ(例えば、フルオロ)、デオキシ(H)、およびアミノから選択される通り修飾することができる。例えば、2’修飾は、各々独立に、O−メチル(OMe)およびフルオロ(F)から選択することができる。例示的な実施形態では、プリンヌクレオチドは各々2’OMeを有し、ピリミジンヌクレオチドは各々2’−Fを有する。ある特定の実施形態では、1つ〜約5つの2’位、または約1つ〜約3つの2’位が修飾されていないままである(例えば、2’ヒドロキシルのように)。
本発明による2’修飾は、小さな炭化水素置換基も含み得る。炭化水素置換基としては、アルキル、アルケニル、アルキニル、およびアルコキシアルキルが挙げられ、アルキル(アルコキシのアルキル部分を含む)、アルケニルおよびアルキニルは置換されていても置換されていなくてもよい。アルキル、アルケニル、およびアルキニルは、C1〜C10のアルキル、アルケニルまたはアルキニル、例えば、C1、C2、またはC3などであってよい。炭化水素置換基は、1つまたは2つまたは3つの非炭素原子を含んでよく、これは、独立に、窒素(N)、酸素(O)、および/または硫黄(S)から選択することができる。2’修飾は、アルキル、アルケニル、およびアルキニルをO−アルキル、O−アルケニル、およびO−アルキニルとしてさらに含んでよい。
本発明による2’修飾の例としては、2’−O−アルキル(C1〜3アルキル、例えば、2’OMeまたは2’OEtなど)置換、2’−O−メトキシエチル(2’−O−MOE)置換、2’−O−アミノプロピル(2’−O−AP)置換、2’−O−ジメチルアミノエチル(2’−O−DMAOE)置換、2’−O−ジメチルアミノプロピル(2’−O−DMAP)置換、2’−O−ジメチルアミノエチルオキシエチル(2’−O−DMAEOE)置換、または2’−O−N−メチルアセトアミド(2’−O−NMA)置換が挙げられ得る。
ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’−ハロ修飾(例えば、2’ヒドロキシルの代わりに)、例えば、2’−フルオロ、2’−クロロ、2’−ブロモ、および2’−ヨードなどを含有する。一部の実施形態では、2’ハロ修飾はフルオロである。オリゴヌクレオチドは、1つ〜約5つの2’−ハロ修飾(例えば、フルオロ)、または1つ〜約3つの2’−ハロ修飾(例えば、フルオロ)を含有してよい。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、全ての2’−フルオロヌクレオチドを非ロックド位に含有する、または全ての非ロックドピリミジンヌクレオチド上に2’−フルオロを含有する。ある特定の実施形態では、2’−フルオロ基は、独立に、ジメチル化されている、トリメチル化されている、またはメチル化されていない。
オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数の2’−デオキシ修飾(例えば、2’ヒドロキシルについてのH)を有してよく、一部の実施形態では、2〜約10の2’−デオキシ修飾を非ロックド位に含有する、または、全ての非ロックド位に2’デオキシを含有する。
例示的な実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’OMeに修飾された2’位を非ロックド位に含有する。あるいは、非ロックドプリンヌクレオチドは2’位で2’OMeに修飾されており、非ロックドピリミジンヌクレオチドは2’位で2’−フルオロに修飾され得る。
ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの末端修飾または「キャップ」をさらに含む。キャップは、5’および/または3’キャップ構造であってよい。「キャップ」または「末端キャップ」という用語は、オリゴヌクレオチドのいずれかの末端における化学修飾(末端リボヌクレオチドに関して)を含み、そして5’末端上の最後の2つのヌクレオチドと3’末端上の最後の2つのヌクレオチドの間の連結における修飾を含む。本明細書に記載のキャップ構造により、miRNA標的(すなわち、miR−92)または細胞機構との分子相互作用を損なうことなくオリゴヌクレオチドのエキソヌクレアーゼに対する抵抗性を増大させることができる。そのような修飾は、in vitroまたはin vivoでのそれらの効力の増大に基づいて選択することができる。キャップは5’末端に存在してもよく(5’キャップ)、3’末端に存在してもよく(3’キャップ)、両末端上に存在してもよい。ある特定の実施形態では、5’キャップおよび/または3’キャップは、独立に、ホスホロチオエートモノホスフェート、脱塩基残基(部分)、ホスホロチオエート結合、4’−チオヌクレオチド、炭素環式ヌクレオチド、ホスホロジチオエート結合、反転ヌクレオチド(inverted nucleotide)または反転脱塩基(inverted abasic)部分(2’−3’または3’−3’)、ホスホロジチオエートモノホスフェート、およびメチルホスホネート部分から選択される。ホスホロチオエート結合またはホスホロジチオエート結合(複数可)は、キャップ構造の一部である場合、一般に、5’末端上の2つの末端ヌクレオチドと3’末端上の2つの末端ヌクレオチドの間に配置される。
ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの末端ホスホロチオエートモノホスフェートを有する。ホスホロチオエートモノホスフェートは、エキソヌクレアーゼの作用を阻害することによってより高い効力を支持し得る。ホスホロチオエートモノホスフェートは、オリゴヌクレオチドの5’末端および/または3’末端にあってよい。ホスホロチオエートモノホスフェートは以下の構造によって定義され、式中、Bは塩基であり、Rは上記の2’修飾である:
キャップ構造によりロックドヌクレオチドの化学的性質を支持することができる場合、キャップ構造に本明細書に記載のLNAを組み入れることができる。
いくつかの実施形態では、ホスホロチオエート結合は、例えば、5’末端および3’末端上の最後の2つのヌクレオチド間に存在してもよく(例えば、キャップ構造の一部として)、リン酸ジエステル結合と交互に存在してもよい。これらのまたは他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’末端と3’末端のいずれかまたはその両方に少なくとも1つの末端脱塩基残基を含有してよい。脱塩基部分は、アデノシン、グアニン、シトシン、ウラシルまたはチミンなどの一般に認識されているプリンヌクレオチド塩基またはピリミジンヌクレオチド塩基を含有しない。したがって、そのような脱塩基部分はヌクレオチド塩基を欠く、または1’位にヌクレオチド塩基ではない他の化学基を有する。例えば、脱塩基ヌクレオチドは、例えば、逆脱塩基(reverse abasic)ホスホルアミダイトが5’アミダイト(3’アミダイトの代わりに)を介してカップリングし、それにより5’−5’リン酸結合が生じた、逆脱塩基ヌクレオチドであってよい。ポリヌクレオチドの5’末端および3’末端の逆脱塩基ヌクレオシドの構造が下に示されている。
オリゴヌクレオチドは、1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含有してよい。ホスホロチオエート結合は、オリゴヌクレオチドをヌクレアーゼによる切断に対してより抵抗性にするために使用されて得る。例えば、ポリヌクレオチドは部分的にホスホロチオエート結合していてよく、例えば、ホスホロチオエート結合とリン酸ジエステル結合が交互になっていてよい。しかし、ある特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは完全にホスホロチオエート結合している。他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは1つ〜5つまたは1つ〜3つのリン酸結合を有する。
一部の実施形態では、ヌクレオチドは、本明細書によって参照により組み込まれるPCT/US11/59588に記載されている1つまたは複数のカルボキシアミド修飾塩基を、そこに複素環置換基と共に開示されている例示的なピリミジンカルボキシアミド修飾の全てに関しても含めて有する。
修飾されたポリヌクレオチドを含めたオリゴヌクレオチドの固相合成による合成は周知であり、Caruthersら、Nucleic Acids Symp. Ser.、7巻:215〜23頁(1980年)に概説されている。
一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、表1および2から選択される配列を含み、表1および2では、「+」または「l」はヌクレオチドがLNAであることを示し、「d」はヌクレオチドがDNAであることを示し、「s」は2つのヌクレオチド間のホスホロチオエート結合を示し、「mdC」はヌクレオチドが5−メチルシトシンDNAであることを示す。
一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、表1および2から選択される配列を含み、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾された少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドを含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’−4’メチレン架橋を有する少なくとも1つのLNAを含む。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する。さらに他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ペンダント親油基を含む。
オリゴヌクレオチドは種々の高分子集合体または組成物に組み入れることができる。そのような送達用の複合体としては、患者に送達するために製剤化された種々のリポソーム、ナノ粒子、およびミセルを挙げることができる。複合体は、細胞膜透過を開始させるための1つまたは複数の融合性分子または親油性分子を含んでよい。そのような分子は、例えば、本明細書によってそれらの全体が参照により組み込まれる米国特許第7,404,969号および米国特許第7,202,227号に記載されている。代替的に、オリゴヌクレオチドは、参照により本明細書に組み込まれる、WO2010/129672において記載されている親油性のペンダント基など、細胞内送達の一助となる親油性のペンダント基をさらに含みうる。
本発明はまた、細胞内のmiR−92の活性または機能を低減または阻害するために、本明細書で開示されるオリゴヌクレオチドを、細胞へと(例えば、本明細書で記載される組成物または処方物の一部として)送達するための方法も提供する。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは表1または2から選択される。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vivoまたはex vivoにある。
本明細書ではまた、被験体における状態の進行を処置、改善、または防止するための方法であって、本明細書で開示されるオリゴヌクレオチドを含む医薬組成物を投与するステップを含む方法も提示される。方法は一般に、オリゴヌクレオチドまたはこれを含む組成物を、被験体へと投与するステップを含む。「被験体」または「患者」という用語は、限定せずに述べると、ヒトおよび他の霊長動物(例えば、チンパンジーおよび他の類人猿ならびにサル種)を含む、任意の脊椎動物、農場動物(例えば、畜牛、ヒツジ、ブタ、ヤギ、およびウマ)、愛玩用哺乳動物(例えば、イヌおよびネコ)、実験動物(例えば、マウス、ラット、およびモルモットなどの齧歯動物)、および鳥類(例えば、愛玩用鳥類、野生鳥類、ならびにニワトリなどの闘鶏用鳥類、シチメンチョウ、および他の家禽、カモ、ガチョウなど)を指す。いくつかの実施形態では、被験体は、哺乳動物である。他の実施形態では、被験体は、ヒトである。被験体は、miR−92の発現に関連する、それによって媒介される、またはそれによって生じる状態を有してよい。
一実施形態では、被験体における血管新生を促進させる方法は、被験体に本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドを投与することを含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、表1または2から選択される。一部の実施形態では、被験体は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。
一実施形態では、被験体における創傷治癒を促進する方法は、被験体に本明細書に開示されているオリゴヌクレオチドなどのmiR−92阻害剤を投与することを含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含む。一実施形態では、オリゴヌクレオチドは、表1または2から選択される。一部の実施形態では、被験体は、糖尿病に罹患している。一部の実施形態では、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡の治癒は、miR−92阻害剤の投与により促進される。
一実施形態では、本明細書に提供されるmiR−92阻害剤の投与により、miR−92阻害剤を投与していない創傷と比較して、創傷の再上皮化または創傷閉鎖において少なくとも約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%の改善がもたらされる。一部の実施形態では、本明細書に提供されるmiR−92阻害剤の投与により、miR−92阻害剤を投与していない創傷と比較して、少なくとも約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%多い肉芽組織形成または新生血管形成がもたらされる。
一実施形態では、本明細書に提供されるmiR−92阻害剤の投与により、創傷を処置するための当技術分野で公知の薬剤を投与した創傷と比較して、創傷の再上皮化または創傷閉鎖において少なくとも約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%の改善がもたらされる。一部の実施形態では、本明細書に提供されるmiR−92阻害剤の投与により、創傷を処置するための当技術分野で公知の薬剤を投与した創傷と比較して、少なくとも約5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%多い肉芽組織形成または新生血管形成がもたらされる。薬剤は、例えば血小板由来成長因子(PDGF)および/または血管内皮成長因子(VEGF)などの成長因子であってよい。
miR−92のアゴニストも本明細書に提供される。miR−92のアゴニストは成熟miR−92配列を含むオリゴヌクレオチドであってよい。一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、miR−92のpri−miRNAの配列またはpre−miRNA配列を含む。成熟miR−92、pre−miR−92、またはpri−miR−92配列を含むオリゴヌクレオチドは、一本鎖であっても二本鎖であってもよい。一実施形態では、miR−92アゴニストは、約15〜約50ヌクレオチドの長さ、約18〜約30ヌクレオチドの長さ、約20〜約25ヌクレオチドの長さ、または約10〜約14ヌクレオチドの長さであってよい。miR−92アゴニストは、miR−92の成熟配列、pri−miRNA配列またはpre−miRNA配列と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一であってよい。オリゴヌクレオチドであるmiR−92アゴニストは、ロックド核酸、ペプチド核酸、2’−O−アルキル(例えば、2’−O−メチル、2’−O−メトキシエチル)、2’−フルオロ、および4’チオ修飾などの糖修飾、ならびに1つまたは複数のホスホロチオエート、モルホリノ、またはホスホノカルボン酸結合などの骨格修飾などの、1つまたは複数の化学修飾を含有してよい。一実施形態では、miR−92配列を含むオリゴヌクレオチドは、コレステロールとコンジュゲートしている。miR−92配列を含むオリゴヌクレオチドは、ベクターから、および/またはプロモーターに作動可能に連結して、in vivoにおいて発現させることができる。別の実施形態では、miR−92のアゴニストは、miR−92の機能を増大させる、補う、または置き換えるように作用する、miR−92とは別個の薬剤であってよい。
本発明は、本明細書で開示されるオリゴヌクレオチドを含む医薬組成物もさらに提供する。臨床適用が想定される場合、医薬組成物は、意図される適用に適する形態で調製され得る。一般に、これは、発熱物質のほか、ヒトまたは動物に有害でありうる他の不純物を本質的に含まない組成物を調製することを伴い得る。
一実施形態では、医薬組成物は、有効用量のmiR−92阻害剤と、薬学的に許容されるキャリアとを含む。例えば、医薬組成物は、有効用量または有効量の、本発明のオリゴヌクレオチドまたは薬学的に許容されるその塩と、薬学的に許容されるキャリアまたは希釈剤とを含む。オリゴヌクレオチドは、表1および表2から選択することができる。
一部の実施形態では、「有効用量」は、有益なまたは所望の臨床結果に影響を及ぼすために十分な量である。「有効用量」は、疾患および/または状態の症状(1つまたは複数)を実質的に低下させる、排除するまたは好転させるために十分なまたは必要な量であり得る。これは、無処置の被験体に対して相対的なものであってよい。「有効用量」は、被験体における病態を遅らせる、安定化する、予防する、またはその重症度を低下させるために十分なまたは必要な量であり得る。これは、無処置の被験体に対して相対的なものであってよい。本明細書で開示されるオリゴヌクレオチドの有効用量は、約0.001mg/kg〜約100mg/kg、約0.01mg/kg〜約10mg/kg、約0.1mg/kg〜約10mg/kg、約1mg/kg〜約10mg/kg、約2.5mg/kg〜約50mg/kg、または約5mg/kg〜約25mg/kgでありうる。一部の実施形態では、有効用量は、創傷エリアに適用されるオリゴヌクレオチドの量である。一部の実施形態では、有効用量は、創傷エリア1cm当たり約0.01mg〜創傷エリア1cm当たり約50mg 創傷エリア1cm当たりmg、創傷エリア1cm当たり約0.02mg〜創傷エリア1cm当たり約20mg、創傷エリア1cm当たり約0.1mg〜創傷エリア1cm当たり約10mg、創傷エリア1cm当たり約1mg〜創傷エリア1cm当たり約10mg、創傷エリア1cm当たり約2.5mg〜創傷エリア1cm当たり約50mg、または創傷エリア1cm当たり約5mg〜創傷エリア1cm当たり約25mg、または約0.05〜創傷エリア1cm当たり約25mgである。有効用量と考えられる量の正確な決定は、患者の体格、年齢、を含む、各患者に個別の因子と、オリゴヌクレオチドの性質(例えば、溶融温度、LNA含量など)とに基づきうる。したがって、当業者は、投与量を、本開示および当技術分野における知見から、たやすく確認することができる。いくつかの実施形態では、方法は、有効用量の医薬組成物を、毎日1、2、3、4、5、または6回投与するステップを含む。いくつかの実施形態では、投与は、毎週1、2、3、4、5、6または7回である。他の実施形態では、投与は、隔週または毎月である。
コロイド分散系、例えば、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、ならびに水中油エマルション、ミセル、混合ミセルおよびリポソームを含めた脂質ベースの系を、miR−92機能のオリゴヌクレオチド阻害剤の送達ビヒクルとして使用することができる。本発明の核酸を心臓組織および骨格筋組織に送達するために適した市販の脂肪エマルションとして、Intralipid(商標)、Liposyn(商標)、Liposyn(商標)II、Liposyn(商標)III、Nutrilipid、および他の同様の脂質エマルションが挙げられる。in vivoにおける送達ビヒクルとして使用するのに好ましいコロイド系は、リポソーム(すなわち、人工膜小胞)である。そのような系の調製および使用は当技術分野において周知である。例示的な製剤は、全てが本明細書によってその全体が参照により組み込まれる、米国特許第5,981,505号;同第6,217,900号;同第6,383,512号;同第5,783,565号;同第7,202,227号;同第6,379,965号;同第6,127,170号;同第5,837,533号;同第6,747,014号;およびWO03/093449にも開示されている。
ある特定の実施形態では、送達のために使用されるリポソームは、米国付与前公開第20110076322号に詳しく記載されているSMARTICLES(登録商標)(Marina Biotech,Inc.)のような両性リポソームである。SMARTICLES(登録商標)上の表面電荷は、完全に可逆的であり、それにより、核酸の送達に特に適したものになっている。SMARTICLES(登録商標)は、注射によって送達することができ、安定なままであり、凝集せず、かつ、細胞膜を渡って核酸を送達する。
本明細書に記載のオリゴヌクレオチド阻害剤(例えば、miR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤)はいずれも、標的細胞(例えば、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞)に、細胞にオリゴヌクレオチド阻害剤をコードする発現ベクターを送達することにより、送達することができる。「ベクター」は、目的の核酸を細胞の内部に送達するために使用することができる物質の組成物である。これだけに限定されないが、線状ポリヌクレオチド、イオン性または両親媒性化合物に会合したポリヌクレオチド、プラスミド、およびウイルスを含めた多数のベクターが当技術分野で公知である。したがって、「ベクター」という用語は、自律複製性プラスミドまたはウイルスを含む。ウイルスベクターの例としては、これだけに限定されないが、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクターなどが挙げられる。特定の一実施形態では、ウイルスベクターは、レンチウイルスベクターまたはアデノウイルスベクターである。発現構築物は、生細胞において複製することもでき、合成により作製することもできる。本出願の目的に関しては、「発現構築物」、「発現ベクター」および「ベクター」という用語は、一般的な例示的な意味で本発明の適用を示すために互換的に使用され、本発明を限定するものではない。
一実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド阻害剤(例えば、miR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤)を発現させるための発現ベクターは、オリゴヌクレオチド阻害剤をコードするポリヌクレオチド配列に作動可能に連結したプロモーターを含む。「作動可能に連結した」または「転写制御下」という句は、本明細書で使用される場合、プロモーターが、RNAポリメラーゼによる転写の開始およびポリヌクレオチドの発現を制御するために、ポリヌクレオチドとの関連で妥当な位置および配向にあることを意味する。
本明細書で使用される場合、「プロモーター」とは、遺伝子の特異的な転写を開始するために必要な細胞の合成機構、または導入された合成機構によって認識されるDNA配列を指す。適切なプロモーターとしては、これだけに限定されないが、RNA pol I、pol II、pol III、およびウイルスプロモーター(例えば、ヒトサイトメガロウイルス(CMV)最初期遺伝子プロモーター、SV40初期プロモーター、およびラウス肉腫ウイルスの長い末端反復)が挙げられる。一実施形態では、プロモーターは、例えばFSP1プロモーターなどの線維芽細胞(fibroplast)特異的プロモーターである。別の実施形態では、プロモーターは、例えばICAM−2プロモーターなどの内皮特異的プロモーターである。
ある特定の実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド阻害剤(例えば、miR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤)をコードするポリヌクレオチドに作動可能に連結したプロモーターは、誘導性プロモーターであってよい。誘導性プロモーターは、当技術分野で公知であり、それらとして、これだけに限定されないが、テトラサイクリンプロモーター、メタロチオネインIIAプロモーター、熱ショックプロモーター、ステロイド/甲状腺ホルモン/レチノイン酸応答エレメント、アデノウイルス後期プロモーター、および誘導性マウス乳房腫瘍ウイルスLTRが挙げられる。
発現構築物および核酸を細胞に送達する方法は、当技術分野で公知であり、それらとして、例えば、リン酸カルシウム共沈澱、電気穿孔、マイクロインジェクション、DEAE−デキストラン、リポフェクション、ポリアミントランスフェクション試薬を用いるトランスフェクション、細胞超音波処理、高速微粒子銃を使用した遺伝子銃撃、および受容体媒介性トランスフェクションを挙げることができる。
一般に、送達ビヒクルを安定なものにし、標的細胞による取り込みを可能にするために、適切な塩およびバッファを用いることが望まれる。本発明の水性組成物は、薬学的に許容されるキャリアまたは水性媒体に溶解または分散させた阻害剤ポリヌクレオチド(例えば、リポソーム、もしくは他の複合体、まあは発現ベクター)を含む送達ビヒクルを有効量で含み得る。「薬学的に許容される」または「薬理学的に許容される」という句は、動物またはヒトに投与した際に有害な反応、アレルギー性反応、または他の不都合な反応を生じない分子実体および組成物を指す。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容されるキャリア」は、ヒトに投与するために適した医薬品などの医薬品の製剤化において使用するために許容される溶媒、緩衝液、溶液、分散媒、コーティング剤、抗細菌剤および抗真菌剤、等張化剤および吸収遅延剤などを含む。薬学的に活性な物質に対するそのような媒体および薬剤の使用は当該技術分野において周知である。任意の従来の媒質または薬剤が、本発明の有効成分に不適合である場合を除き、治療用組成物中のその使用が想定される。また、補助的有効成分も、それらが組成物のオリゴヌクレオチドを不活化しない限りにおいて、組成物へと組み込むことができる。
本発明の活性組成物は、古典的な医薬調製物を含みうる。本発明に従うこれらの組成物の投与は、標的組織が、その経路を介して到達可能である限りにおいて、任意の一般的な経路を介しうる。これは、経口経路、鼻腔内経路、または口腔内経路を含む。代替的に、投与は、皮内注射、皮下注射、筋肉内注射、腹腔内注射、動脈内注射、または静脈内注射も介しうる。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、肺組織または心臓組織への注射を指向する。一部の実施形態では、医薬組成物を創傷エリアに直接注射する。一部の実施形態では、医薬組成物を創傷エリアに局所的に適用する。
miR−92阻害剤を含む医薬組成物は、カテーテルシステムまたは治療剤を心臓および肺に送達するために冠循環/肺循環を隔離するシステムによって投与することもできる。治療剤を心臓および冠血管系に送達するための種々のカテーテルシステムが当該技術分野で公知である。本発明において使用するために適したカテーテルに基づく送達方法または冠血管の隔離方法のいくつかの非限定的な例は、全て本明細書によってその全体が参照により組み込まれる米国特許第6,416,510号;同第6,716,196号;および同第6,953,466号;PCT公開第WO2005/082440号および同第WO2006/089340号;および米国特許公開第2007/0203445号、同第2006/0148742号、および同第2007/0060907号に開示されている。そのような組成物は、通常、本明細書に記載の薬学的に許容される組成物として投与される。
活性化合物はまた、非経口的にまたは腹腔内に投与することもできる。例示として、遊離塩基または薬理学的に許容される塩として活性化合物の溶液を、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性物質と適切に混合されている水中で調製することができる。グリセロール、液体ポリエチレングリコール、ならびにそれらの混合物中、および油中で分散液を調製することもできる。保管および使用の通常の条件下で、これらの調製物は、一般に、微生物の成長を予防するために防腐剤を含有する。
注射用の使用、カテーテルによる送達、または吸入による送達に適する薬学的形態は、例えば、滅菌水溶液または滅菌水性分散液および滅菌注射用溶液または滅菌注射用分散液(例えば、エアゾール溶液、ネブライザー溶液)の即席調製のための滅菌粉末を含む。一般に、これらの調製物は、容易な注射可能性またはエアゾール化/噴霧化がなされる程度に滅菌であり、かつ、流体である。調製物は製造および保管の条件下で安定であるべきであり、細菌および真菌などの微生物の混入作用から保護されるべきである。適切な溶媒または分散媒は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど)、それらの適切な混合物、および植物油を含有してよい。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティング剤を使用することによって、分散液の場合では必要な粒子サイズを維持することによって、および界面活性物質を使用することによって維持することができる。微生物の作用の予防は、種々の抗細菌剤および抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどによってもたらすことができる。多くの場合、等張化剤、例えば、糖または塩化ナトリウムを含むことが好ましい。注射用組成物の持続吸収は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンを組成物中に使用することによってもたらすことができる。
一部の実施形態では、miR−92阻害剤を含む組成物は、創縁または創床への投与などの局所適用に適する。一部の実施形態では、組成物は、水、食塩水、PBSまたは他の水溶液を含む。一部の実施形態では、miR−92阻害剤は、ローション、クリーム、軟膏、ゲルまたはハイドロゲルの状態である。一部の実施形態では、局所適用に適した組成物は、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、または脂質ベースの系(例えば、水中油エマルション、ミセル、混合ミセルおよびリポソーム)を送達ビヒクルとして含む。さらに別の実施形態では、miR−92阻害剤は、乾燥粉末の形態であるか、または創傷被覆材に組み入れられている。
滅菌注射用溶液は、濾過滅菌の前に、所望の通り、適量のコンジュゲートを任意の他の成分(例えば、上に列挙されているもの)と一緒に溶媒中に組み入れることによって調製することができる。一般に、分散液は、種々の滅菌された活性成分を、基本的な分散媒および所望の他の成分、例えば、上に列挙されているものを含有する滅菌ビヒクルに組み入れることによって調製される。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌粉末の場合では、好ましい調製方法として、活性成分(複数可)と任意の追加の所望の成分の粉末を予め滅菌濾過したその溶液から得る真空乾燥技法および凍結乾燥技法が挙げられる。いくつかの実施形態では、滅菌粉末は、例えば、粉体噴霧器または吸入デバイスにより、被験体へと直接(すなわち、希釈剤中の再構成を伴わずに)投与することができる。
一部の実施形態では、miR−92阻害剤の投与は、創傷(例えば、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡)へなどの皮下注射または皮内注射による。投与は、創縁または創床へなど、創傷部位におけるものであってよい。
本発明の組成物は一般に、中性形態または塩形態で製剤化することができる。薬学的に許容可能な塩は、例えば、無機酸(例えば、塩酸またはリン酸)または有機酸(例えば、酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸など)に由来する酸添加塩(タンパク質の遊離アミノ基により形成される)を含む。また、タンパク質の遊離カルボキシル基により形成される塩は、無機塩基(例えば、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、水酸化カルシウム、または水酸化第二鉄)に由来する場合もあり、有機塩基(例えば、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカインなど)に由来する場合もある。
製剤化されたら、溶液は、投薬製剤と適合する様式で、かつ治療的に有効な量で投与されることが好ましい。製剤は、注射用溶液、薬物放出カプセル剤、単一用量吸入器などの種々の剤形で容易に投与することができる。水溶液中で非経口投与するためには、例えば、一般に、溶液を適切に緩衝し、液体希釈剤を、まず、例えば、十分な食塩水またはグルコースを用いて等張性にする。そのような水溶液は、例えば、静脈内投与、筋肉内投与、皮下投与、動脈内投与および腹腔内投与のために使用することができる。滅菌水性媒体を当業者に公知の通り、特に本開示に照らして使用することが好ましい。例示として、単一用量を等張性NaCl溶液1mlに溶解させ、皮下注入用液1000mlに添加するか、または提案される注入部位に注射することができる(例えば、「Remington’s Pharmaceutical Sciences」15版、1035〜1038頁および1570〜1580頁を参照されたい)。治療されている被験体の状態に応じて投与量のいくらかの変動が必ず生じる。投与を担当する人は、いかなる場合においても、個々の被験体に適した用量を決定する。さらに、ヒトに投与するためには、調製物は、必要に応じてFDA Office of Biologics standardsによる滅菌、発熱性、ならびに一般的な安全性および純度の基準に適合するべきである。
組成物または処方物は、本明細書で記載される少なくとも1つの治療用オリゴヌクレオチドを含む、複数の治療用オリゴヌクレオチドを援用しうる。例えば、組成物または処方物は、本明細書で記載される、少なくとも2、3、4、または5つのmiR−92阻害剤を援用しうる。別の実施形態では、本発明のオリゴヌクレオチドは、他の治療モダリティーと組み合わせて使用することができる。組合せはまた、細胞を、複数の顕著に異なる組成物または処方物と同時に接触させることにより達成することもできる。代替的に、組合せは、逐次的に投与することもできる。
本発明の一実施形態ではmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を、他の治療モダリティーと組み合わせて使用する。組合せ療法の例は、前出のうちのいずれかを含む。組合せは、両方の薬剤を含む単一の組成物または薬理学的処方物により達成することもでき、2つの顕著に異なる組成物または処方物であって、一方の組成物が、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を含み、もう一方の組成物が他の薬剤を含む組成物または処方物の同時的な組合せにより達成することもできる。代替的に、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を使用する治療は、数分間〜数週間の範囲の間隔で、他の薬剤の投与に先行する場合もあり、これに後続する場合もある。他の薬剤とmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤とを、細胞へと個別に適用する実施形態では、薬剤とmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤とが、有利に組み合わされた効果を細胞に対して及ぼすことがやはり可能であるように、各送達時点の間でそれほど長い時間が経過しないことが一般に確認される。このような場合は典型的に、細胞を、互いから約12〜24時間以内に、互いから約6〜12時間以内に、または遅延時間を約12時間に限って、両方のモダリティーと接触させることが想定される。しかし、それぞれの投与の間で、数日間(2、3、4、5、6、または7)〜数週間(1、2、3、4、5、6、7、または8)が経過するいくつかの状況では、処置のための期間を著明に延長することが所望でありうる。
一実施形態では、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤または他の薬剤の複数回の投与が所望となる。この点で、多様な組合せを援用することができる。例示を目的として述べると、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤が「A」であり、他の薬剤が「B」である場合、合計3回および4回の投与に基づく以下の順列:A/B/A、B/A/B、B/B/A、A/A/B、B/A/A、A/B/B、B/B/B/A、B/B/A/B、A/A/B/B、A/B/A/B、A/B/B/A、B/B/A/A、B/A/B/A、B/A/A/B、B/B/B/A、A/A/A/B、B/A/A/A、A/B/A/A、A/A/B/A、A/B/B/B、B/A/B/B、B/B/A/Bを、例として提示する。他の組合せも同様に想定される。他の薬剤および治療の具体例を、下記に提供する。
本発明の一実施形態では、血管新生を促進することを必要とする被験体において血管新生を促進する方法は、被験体に、本明細書に記載のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤などのmiR−92阻害剤および血管新生を促進する別の薬剤を投与することを含む。本発明の一実施形態では、末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置または予防することを必要とする被験体において末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置または予防する方法は、被験体に、本明細書に記載のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤などのmiR−92阻害剤を投与することを含む。一部の実施形態では、方法は、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤と一緒に別の薬剤を投与することをさらに含む。他の薬剤は、血管新生を促進し得るか、またはアテローム性動脈硬化症もしくは末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置するために使用される薬剤であってよい。他の薬剤は、ホスホジエステラーゼ3型阻害剤(シロスタゾールなど)、スタチン、抗血小板薬、L−カルニチン、プロピオニル−L−カルニチン、ペントキシフィリン、またはナフチドロフリルであってよい。末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置または予防することを必要とする被験体において末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置または予防する方法は、被験体にmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を投与することも含んでよく、ここで、被験体はまた、遺伝子療法(例えば、VEGF、FGF、HIF−1α、HGF、またはDel−1などの血管新生促進因子を用いた)、細胞療法、および/または抗血小板療法も受けているかまたは受ける予定である。一部の実施形態では、方法は、被験体にmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤および抗菌物質を投与することを含む。
本発明の一実施形態では、創傷治癒を促進することを必要とする被験体において創傷治癒を促進する方法は、被験体に本明細書に記載のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤などのmiR−92阻害剤を投与することを含む。一実施形態では、被験体は糖尿病を有する。一部の実施形態では、被験体は、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡を有する。別の実施形態では、被験体は末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を有する。一部の実施形態では、方法は、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤と一緒に別の薬剤を投与することをさらに含む。他の薬剤は、例えば上記の、末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)を処置するために使用される薬剤であってよい。一部の実施形態では、他の薬剤は、創傷治癒を促進する、または糖尿病を処置するために使用される。他の薬剤は、血管新生促進因子であってよい。一部の実施形態では、他の薬剤は、VEGFまたはPDGFなどの成長因子である。一部の実施形態では、他の薬剤は、VEGF発現もしくは活性またはPDGF発現もしくは活性を促進する。一部の実施形態では、他の薬剤は、同種異系皮膚代替物または生体包帯(例えば、Organogenesis、Canton、MAから入手可能なDermagraft(登録商標)またはApligraf(登録商標))、または、ベカプレルミン(Buchbergerら、Experimental and ClinicalEndocrinology and Diabetes、119巻:472〜479頁(2011年))などの血小板由来成長因子(PDGF)ゲルである。一部の実施形態では、他の薬剤は、デブリードマン用薬剤または抗菌剤である。
本発明はまた、一部において、miR−92によって有意に制御される遺伝子の発見にも基づく。したがって、本発明の別の態様は、血管新生または創傷治癒を調節するための治療薬の有効性を、治療薬を受けている被験体において評価またはモニタリングするための方法であって、被験体から試料を得ること;試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により治療薬の有効性が示されることを含む方法である。一部の実施形態では、治療薬は、miR−92の機能および/または活性を調節する。治療薬は、表1および2から選択されるmiR−92オリゴヌクレオチド阻害剤などのmiR−92アンタゴニストであってよい。他の実施形態では、治療薬は、miR−92模倣物などのmiR−92アゴニストである。一部の実施形態では、被験体は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。一部の実施形態では、被験体は、糖尿病、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡に罹患している。
一部の実施形態では、血管新生または創傷治癒を調節するための治療薬の有効性を、治療薬を受けている被験体において評価またはモニタリングする方法は、被験体における血管新生を評価する、別の診断アッセイまたは試験を実施することをさらに含む。一部の実施形態では、血管新生を調節するための治療薬の有効性を評価またはモニタリングするための追加の診断アッセイまたは試験は、被験体に対する歩行時間試験、足関節上腕血圧比(ABI)、動脈造影もしくは血管造影、またはSPECT分析である。
本発明の別の態様は、miR−92の機能および/または活性を調節する治療薬を用いた処置のために被験体を選択するための方法であって、被験体から試料を得ること;試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つまたは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により被験体が治療薬を用いた処置のために選択されるべきかどうかが示されることを含む方法である。一部の実施形態では、治療薬は、表1および2から選択されるmiR−92オリゴヌクレオチド阻害剤などのmiR−92アンタゴニストである。他の実施形態では、治療薬は、miR−92模倣物などのmiR−92アゴニストである。一部の実施形態では、被験体は、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、または末梢血管疾患(例えば、末梢動脈疾患)に罹患している。一部の実施形態では、被験体は、糖尿病、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡に罹患している。
一部の実施形態では、miR−92の機能および/または活性を調節する治療薬を用いた処置のために被験体を選択するための方法は、治療薬を用いて処置した被験体から試料を得ることを含む。一部の実施形態では、被験体は治療薬を用いて処置せず、試料を治療薬で処理する。一部の実施形態では、被験体を、治療薬を用いて処置し、かつ試料を治療薬で処理する。一部の実施形態では、方法は、被験体における血管新生または創傷治癒を評価する、別の診断アッセイまたは試験を実施することをさらに含む。一部の実施形態では、血管新生を評価するための追加の診断アッセイまたは試験は、被験体に対する歩行時間試験、足関節上腕血圧比(ABI)、動脈造影もしくは血管造影、またはSPECT分析である。
歩行試験は、療法に応答した、最大または無痛の歩行時間の変化を測定するための非侵襲的トレッドミル試験であってよい。足関節上腕血圧比(ABI)は、超音波によって測定されるものなどの、上腕および足首で行う血圧測定であってよい。次いで、指数を上腕での血圧に対する足首での血圧の比として表すことができる。動脈造影は、動脈または静脈を通る血流を測定するための造影剤(contrast dye)法であってよい。SPECT(単一光子放射型コンピュータ断層撮影法)分析は、毛細血管を通る血流を測定するために放射線を使用する3−Dイメージングシステムを用いて実施することができる。
血管新生または創傷治癒を促進する薬剤の能力を評価するための方法であって、細胞を薬剤に接触させること;薬剤と接触させた細胞における、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により血管新生を促進する薬剤の能力が示されることを含む方法も本明細書に提供される。一部の実施形態では、方法は、薬剤と接触させた細胞におけるmiR−92の機能および/または活性を決定することをさらに含む。一部の実施形態では、細胞は、哺乳動物細胞である。一部の実施形態では、細胞は、心臓細胞または筋肉細胞である。一部の実施形態では、細胞は、創傷治癒に関与する。一部の実施形態では、細胞は、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である。さらに他の実施形態では、細胞は、in vivoまたはex vivoにある。
遺伝子の発現の測定または検出は、当業者に公知の任意の様式で実施することができ、遺伝子のレベルを測定または検出するためのそのような技法は周知であり、容易に用いることができる。遺伝子発現レベルは、遺伝子のmRNAレベルまたは遺伝子によりコードされるタンパク質のタンパク質レベルを測定することによって決定することができる(may be determined measuring)。遺伝子発現を検出するための種々の方法が記載されており、それらとして、ウエスタンブロッティング、ノーザンブロッティング、マイクロアレイ、電気化学的方法、生物発光、生物発光タンパク質再集合、BRETに基づくもの(BRET:生物発光共鳴エネルギー移動)、RT−PCR、蛍光相関分光法および表面増強ラマン分光法が挙げられる。市販のキットも使用することができる。遺伝子発現を検出するための方法は、ハイブリダイゼーションに基づく技術プラットフォームおよび複数の遺伝子を同時に検出することを可能にする大規模並列処理次世代配列決定(massively-parallel next generation sequencing)を含み得る。
一部の実施形態では、被験体において状態(例えば、末梢動脈疾患または創傷)を処置するための治療薬の治療有効性を決定するための方法は、治療薬(例えば、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤)を用いた処置のために被験体を選択すること、治療薬(例えば、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤)を用いた処置のために被験体を選択すること、または血管新生または創傷治癒を促進する薬剤の能力を評価すること;表3から選択されるものなどの1つまたは複数の遺伝子のレベルを決定することを含む。
試料(例えば、治療薬を投与されている被験体由来の試料、または、被験体もしくは細胞培養物由来の、治療薬で処理された試料)における遺伝子発現を、それぞれが参照レベルと称することができる、上記状態を有する被験体または健康な集団内の被験体由来の試料中に存在する遺伝子の標準の量と比較することができる。他の実施形態では、遺伝子発現のレベルを、対照試料(状態を有する被験体に由来しない試料)中のレベルと比較する、または処理されていない試料(例えば、治療薬を用いた処置前に被験体から取得した試料、または無処置の被験体から取得した試料、または、治療薬を用いて処理されていない細胞培養試料)中の遺伝子発現レベルと比較する。遺伝子の標準レベルは、正常な、健康な対照の被験体から得た十分に多数の試料中の遺伝子発現レベルを決定して所定の参照値または閾値を得ることによって決定することができる。本明細書で使用される場合、「参照値」とは、公知の試料から確認された遺伝子発現レベルの所定の値を指す。
標準レベルは、治療薬を用いた処理前の試料中の遺伝子発現レベルを決定することによって決定することもできる。さらに、標準レベル情報および標準レベルを決定するための方法は、公的に入手可能なデータベース、ならびに他の供給源から得ることができる。一部の実施形態では、通常は試料中に存在しない、既知量の別の遺伝子を試料に添加し(すなわち、試料を既知量の外因性mRNAまたはタンパク質を用いてスパイクする)、1つまたは複数の目的の遺伝子のレベルを、スパイクされたmRNAまたはタンパク質の既知量に基づいて算出する。1つまたは複数の遺伝子の測定されたレベルと、対照試料中の遺伝子の1つまたは複数の参照量またはレベルとの比較は、当業者に公知の任意の方法によって行うことができる。
本発明に従って、一部の実施形態では、対照試料(例えば、処置を受ける前の患者または無処置の患者における試料)中の遺伝子のレベルまたは所定の参照値と比較した、測定された遺伝子のレベルの差異(上昇または低下)により、治療薬の治療有効性、治療薬を用いた処置のための被験体の選択、または血管新生を促進もしくは阻害する薬剤の能力が示される。
例えばACTA2、LACTB、SESN1、およびKIAA1598から選択される1つもしくは複数の遺伝子のレベルが対照試料中のレベルもしくは所定の参照値と比較して低下し、かつ/またはLPCAT4、MYO5A、ERGIC2、LEPREL2、SERPIND1、TSPAN8、ITGA5、NOMA///NOMO2///NOMO3、NPTN、CD93、LOC100507246、MAN2A1、CNEP1R1、EFR3A、UBE2Q2、RNF4、ATP6V1B2、FZD6、MYO1C、PPP3CB、CYYR1、EDEM1、LHFPL2、SEMA3F、UBE2Zから選択される1つもしくは複数の遺伝子のレベルが治療薬を投与されている被験体由来の試料もしくは治療薬で処理された試料において上昇した場合、結果から、治療薬がmiR−92阻害剤であり、かつ/もしくは血管新生を促進すること、および/または被験体がmiR−92治療薬(例えば、miR−92阻害剤またはアゴニストを用いた)を用いた処置のために選択されるべきであることが示される。
別の例では、ACTA2、LACTB、SESN1、およびKIAA1598から選択される1つもしくは複数の遺伝子のレベルが対照試料中のレベルもしくは所定の参照値と比較して上昇し、かつ/またはLPCAT4、MYO5A、ERGIC2、LEPREL2、SERPIND1、TSPAN8、ITGA5、NOMA///NOMO2///NOMO3、NPTN、CD93、LOC100507246、MAN2A1、CNEP1R1、EFR3A、UBE2Q2、RNF4、ATP6V1B2、FZD6、MYO1C、PPP3CB、CYYR1、EDEM1、LHFPL2、SEMA3F、UBE2Zから選択される1つもしくは複数の遺伝子のレベルが治療薬を投与された被験体由来の試料もしくは治療薬で処理された試料において低下した場合、結果から、治療薬が、miR−92アゴニストであり、かつ/もしくは血管新生を阻害すること、および/または被験体がmiR−92治療薬(例えば、miR−92阻害剤またはアゴニストを用いた)を用いた処置のために選択されるべきであることが示される。
試料採取方法は当業者に周知であり、任意の型の生体試料を得るための任意の適用可能な技法が意図されており、それを本発明の方法で用いることができる(例えば、Clinical Proteolytics: Methods and Protocols、Methods in Molecular Biology、428巻、AntoniaVlahou編、(2008年)を参照されたい)。試料としては、mRNAまたはタンパク質を単離することが可能な任意の生体試料を挙げることができる。そのような試料としては、血清、血液、血漿、全血およびそれらの誘導体、心臓組織、筋肉、皮膚、毛髪、毛包、唾液、口腔粘液、膣粘液、汗、涙、上皮組織、尿、精液(semen)、精液(seminal fluid)、精漿、前立腺液、尿道球腺液(カウパー腺液)、排泄物、生検材料、腹水、脳脊髄液、リンパ、心臓組織、ならびに他の組織抽出試料または生検材料を挙げることができ、一部の実施形態では、生体試料は、血漿または血清である。
開示されている方法において使用するための生体試料は、治療薬の投与開始後の任意の時点で被験体から得ることができる。一部の実施形態では、試料は、治療介入開始の少なくとも1カ月、2カ月、3カ月、または6カ月後に得る。一部の実施形態では、試料は、治療介入開始の少なくとも1週間、2週間、3週間、4週間、6週間または8週間後に得る。一部の実施形態では、試料は、治療介入開始の少なくとも1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日後に得る。一部の実施形態では、試料は、治療介入開始の少なくとも1時間、6時間、12時間、18時間または24時間後に得る。他の実施形態では、試料は、治療介入開始の少なくとも1週間後に得る。
本発明の方法は、治療薬の処置レジメンを変更するための方法も含み得る。処置レジメンの変更は、これだけに限定されないが、治療介入の型、治療介入を投与するときの投与量、治療介入の投与の頻度、治療介入の投与経路、ならびに変化および/または改変が医師に周知である任意の他のパラメータを変化させることおよび/または改変することを含んでよい。
一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入を継続するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入を中止するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入を改変するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入の投与量を増やすか減らすかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入の投薬頻度を変更するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、治療介入の投与の数または頻度を変更するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、1日当たり、1週間当たりの用量の数、1日当たりの回数を変更するかどうかを決定するために使用することができる。一部の実施形態では、処置の有効性は、投薬量を変更するかどうかを決定するために使用することができる。
本発明を、限定的とみなされるべきではない、以下のさらなる例によりさらに例示する。当業者は、本開示に照らして、開示される具体的な実施形態に多くの変化を施すことができ、本発明の精神および範囲から逸脱しない限りにおいて、やはり同様または類似の結果を得うることを察知する。
(実施例1)
HUVECにおいて、miR−92aの調節により複数の遺伝子が有意に制御される。
HUVECに、miR−92a(1nM)またはmiR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤(化合物A;配列番号7;10nM)を脂質媒介性トランスフェクションによってトランスフェクトし、48時間後に、発現プロファイリングのためにRNAを単離した。各処理について3回の個々の反復をプロファイリングした。miR−92aによる処理についての1つの試料はQCできず、したがって、分析から除いた。miR−92aによる処理細胞対無処理細胞について、示差的な発現(FDR p値≦0.05)に基づいて遺伝子を選択した。興味深いことに、図1に示されている通り、この遺伝子のシグネチャーは、miR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤によって相反的に制御される。抗miRによって遺伝子のシグネチャー全体が相反的に制御されるという事実が顕著である。miR−92a模倣物によって下方制御される遺伝子の全てがmiR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤によって上方制御され、miR−92a模倣物に応答して上方制御される遺伝子はmiR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤によって下方制御される。これらの遺伝子は表3に列挙されている。
図1に示されている遺伝子および表3に列挙されている遺伝子をPubMed文献検索に供して、それらの潜在的な機能を同定した。血管の血管新生に関する機能を有することが報告されている遺伝子を表4に列挙する。表4にはまた、抗miRまたはmiRトランスフェクションに応答した遺伝子発現の倍数変化、ならびに遺伝子の3’UTRがmiR−92aの標的となるシード配列を含有するか否かも示す。
(実施例2)
HUVECにおけるmiR−92aの調節による遺伝子制御の確認
実施例1に記載の通り、HUVECに、miR−92a(5nM)またはmiR−92aのオリゴヌクレオチド阻害剤(アンタゴmiR;A(配列番号7);B(配列番号63);C(配列番号64);それぞれ5nM)を脂質媒介性トランスフェクションによってトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、RNAを単離し、実施例1においてマイクロアレイプロファイリングによって同定された標的の制御をリアルタイムPCRによって評価した。図3に示されている通り、マイクロアレイプロファイリングによって同定された4つの遺伝子は、独立したHUVEC脂質トランスフェクション実験において、miR−92a阻害に応答して上昇し、miR−92a模倣物に応答して低下する。図3のレーダープロットは、オリゴヌクレオチドを伴わずに脂質を用いてトランスフェクトしたHUVECに対して正規化した、miR−92a阻害剤または模倣物に応答したMAN2A1、CNEP1R1、ERGIC2、およびCD93の相対的な発現量を示す。太い黒い線は、変化がない場合の遺伝子発現を示し、矢印は、D対照オリゴトランスフェクションに応答した遺伝子発現を示す線を指す。
(実施例3)
HUVECにおけるmiR−92aによるインテグリンα5発現の制御
miR−92aの調節によるインテグリンα5の制御を、HUVECにおいて、様々な濃度のmiR−92a(模倣物)または抗miR−92aオリゴヌクレオチド(アンタゴmiR;A(配列番号7);B(配列番号63);C(配列番号64))の脂質媒介性トランスフェクション(図2A)または受動的送達(図2B)によって調査した。脂質媒介性トランスフェクションについては、薬剤を1nM、5nM、25nM、または50nMでトランスフェクトし、一方、オリゴヌクレオチドの受動的送達については、細胞を、0.01μM、0.1μM、または1μMの濃度の、図2Bに示されているオリゴヌクレオチドに曝露した。図2Aに示されている通り、脂質媒介性トランスフェクションの24時間後、インテグリンα5 mRNAの相対的な発現量は、miR−92a阻害に応答して増加し、miR−92a模倣物に応答して低下した。脂質媒介性トランスフェクション後のインテグリンα5 mRNAの相対的な発現量を、HUVEC細胞から全RNAを抽出し、その後、RT−PCRを行うことによって調査した。miR−92a阻害剤または模倣物に応答したインテグリンα5 mRNAの相対的な発現量を、オリゴヌクレオチドを伴わずに脂質を用いてトランスフェクトしたHUVECに対して正規化した。図2Bに示されている通り、受動的送達の72時間後、インテグリンα5の相対的な発現量は、高濃度のオリゴヌクレオチドで、対照オリゴヌクレオチドに対して増加した。受動的送達後のインテグリンα5 mRNAの相対的な発現量を、HUVEC細胞から全RNAを抽出し、その後、RT−PCRを行うことによって調査した。miR−92a阻害剤または模倣物に応答したインテグリンα5 mRNAの相対的な発現量を、オリゴヌクレオチドを伴わずにトランスフェクトしたHUVECに対して正規化した。相対的なmRNAレベルの調査に加えて、インテグリンα5タンパク質の相対的な発現量を脂質媒介性トランスフェクション実験において調査した。mRNA発現の結果と同様に、脂質媒介性トランスフェクションの24時間後のインテグリンα5タンパク質の相対的な発現量も、miR−92a阻害後に増加し、miR−92a模倣物に応答して低下した(図2Cを参照されたい)。脂質媒介性トランスフェクション後のインテグリンα5タンパク質の相対的な発現量を、HUVEC細胞からタンパク質を抽出し、その後、ウエスタンブロット分析を行うことによって調査した。miR−92a阻害剤または模倣物に応答したインテグリンα5タンパク質の相対的な発現量を、無処理のHUVECに対して正規化した。
(実施例4)
miR−92阻害剤デザインの活性を試験するための二重ルシフェラーゼアッセイ
miR−92阻害剤を指示濃度で二重ルシフェラーゼレポーターと共トランスフェクトした(図4)。ルシフェラーゼレポーターは、遺伝子の3’UTR内のmiR−92aシード配列に対する結合部位を含有し、したがって、ルシフェラーゼ活性の増大により、miR−92a阻害の増大が示される。ルシフェラーゼ活性をトランスフェクションの48時間後に測定した。阻害剤の全てが2nMおよび0.2nMの用量で活性を示したので、0.02nMの用量を使用して、阻害剤を順位付けした。図4の各阻害剤群の中で、2nMの用量が左側の棒に示されており、0.2nMの用量が中央の棒であり、0.02nMの用量が右側の棒である。
さらに、例えば5−メチルシトシンなどの化学修飾された窒素塩基が存在することの、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤の活性に対する効果も試験した。5−メチルシトシンを有するmiR−92阻害剤と5−メチルシトシンを有さないmiR−92阻害剤の活性を比較するために、図9に示されている通り、HeLa細胞に、二重ルシフェラーゼレポーターと、miR−92aアンタゴmiR、化合物A(A;配列番号7)、化合物B(B;配列番号63)、5−メチルシトシンを欠く化合物B(Bマイナス5−Me;配列番号8)、化合物C(C;配列番号64)、5−メチルシトシンを欠く化合物C(Cマイナス5−Me;配列番号9)、化合物D(D)またはmiR−92a模倣物のいずれかとを共トランスフェクトした。HeLa細胞に、化合物を図9に示されている濃度(すなわち、10nM、1nM、0.1nM、または0.01nM)でトランスフェクトした。本明細書に記載の通り、ルシフェラーゼレポーターは、遺伝子の3’UTR内のmiR−92aシード配列に対する結合部位を含有し、したがって、ルシフェラーゼ活性の増大により、miR−92a阻害の増大が示される。正規化したルシフェラーゼ活性を発光の測定によって評価した。ルシフェラーゼ活性はトランスフェクションの48時間後に測定した。各化合物についての用量曲線全体にわたる二元配置ANOVA分析により、化合物BとBマイナス5−Meの間に統計学的有意差があることが明らかになり、化合物BはBマイナス5−Meよりも活性が高かった(Hom−Sidak多重比較ポストホック検定を用いた二元配置ANOVAによってp値<0.05)。同様の分析により、化合物Cマイナス5−メチルシトシンと化合物Cの間にも統計学的有意差が観察されることが示され、p値は0.05未満であった(Hom−Sidak多重比較ポストホック検定を用いた二元配置ANOVA)。化合物CはCマイナス5−Meよりも活性が高かった。
(実施例5)
創傷治癒不良のin vivoモデルにおける抗miR−92化合物の活性
抗miR−92化合物(すなわち、miR−92aオリゴヌクレオチド阻害剤)をin vivo慢性創傷モデルにおいて創傷血管新生の増大および創傷治癒の加速について試験した。db/db(BKS.Cg Dock(Hom)7m+/+Leprdb/j)マウスは、6週齢までに2型糖尿病および創傷治癒不全を発症することが示されている。2つの別々の試験において、年齢および性別をマッチさせた成体マウスに麻酔を行い、背側を脱毛した。マウスの背中の肩部と臀部から等距離のところで脊椎のいずれかの側面に直径6mmの切除によるパンチ創傷を2つ作製し、創傷を半閉鎖包帯で覆った。
外科手術のとき、および手術後2日目、4日目および8日目に、化合物を創傷当たり100nmol(約0.55mg)の用量で創縁の周囲の複数部位への皮内注射によって適用した。創傷治癒増強についての陽性対照として、組換えヒトVEGF(すなわち、rhVEGF−165)を創傷当たり1μgの用量で、および、組換えPDGF−B(すなわち、rhPDGF−B)を創傷当たり2μgの用量で使用した。陰性対照として、ビヒクル対照(すなわち、リン酸緩衝食塩水(PBS))を投与したマウスまたはマウス(mice or mice)を使用した。
外科手術後10日目に動物を屠殺した。再上皮化の割合、肉芽組織内部成長の割合、ならびに新しい上皮および肉芽組織の厚さおよび断面積を評価するために組織学的分析を実施した。組織学的分析は、標準のプロトコールに従い、各皮膚創傷の半分を10%中性緩衝ホルマリン中に24時間固定し、パラフィン包埋することによって実施した。4μmの組織切片を脱パラフィンし、ヘマトキシリンおよびエオシンで染色した。4〜20×倍率で組織学的画像を取得し、画像を、ImageJ(NCBI)を使用して再上皮化の割合、肉芽組織内部成長の割合、ならびに新しい上皮および肉芽組織の面積および厚さおよび断面積について分析した。
2つの試験からのデータをそれぞれ図5A〜Fおよび図6A〜Fに示す。図5Aおよび6Aは、パーセント再上皮化((1−[上皮の間隙を創傷の幅で割ったもの])×100)を例示し、図5Bおよび6Bは、肉芽組織で充填された各創傷のパーセント((1−[肉芽組織の間隙を創傷の幅で割ったもの])×100)を示し、図5Cおよび6Cは、創傷内の肉芽組織面積を示し、図5Dおよび6Dは、創傷内の肉芽組織の厚さの平均を示す。VEGF−165では創傷の再上皮化(図5Aおよび6A)および肉芽組織の厚さ(図5Dおよび6D)は有意ではなく増大したが、肉芽組織で充填された各創傷のパーセントは有意に増大した(図5Bおよび6B)。PDGF−Bでは、創傷の再上皮化(図6A)および肉芽組織内部成長(図6B)が有意に増大し、肉芽組織面積(図6Cを参照されたい)および厚さ(図6D)は有意ではなく増大した。逆に、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤AおよびCでは、肉芽組織形成(%肉芽組織充填(図6B)、肉芽組織面積(図5Bおよび6B)および肉芽組織の厚さの平均(図5Dおよび6D)が有意に増大し、Aでは創傷の再上皮化のいくらかの増大も示された(図5Aおよび6A)。これらの結果から、複数のmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤により、創傷治癒および新しい組織形成がVEGFペプチドまたはPDGFペプチドのいずれよりも大きな程度まで加速されることが示される。
miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤による慢性創傷の治癒が加速する機構は、血管新生の増加によるものと考えられる。2つのdb/db創傷治癒試験からの群のサブセットに対して、新生血管形成/血管新生の尺度として血管内部成長および内皮細胞の数を評価するために免疫組織化学的検査を実施した。免疫組織化学的検査は、4μmの脱パラフィン組織切片を、CD31に特異的な一次抗体を用い、その後、核を可視化するために蛍光二次抗体およびDAPIよって染色するか(第1の試験)、または、HRPとコンジュゲートした二次抗体により、その後、それぞれ免疫複合体および核を可視化するためにDABおよびヘマトキシリンで染色するか(第2の試験)して実施した。4〜20×倍率で蛍光画像または発色画像を取得し、ImageJにおいて自動閾値設定および画像解析マクロを使用して創縁におけるCD31+内皮細胞の数および血管を計数した。これらのデータは、第1の試験については図5Eに、および第2の試験については図6Eに示されている。同様に、ImageJを使用してCD31+の組織の面積を自動で算出し、それが第1の試験については図5Fに、および第2の試験については図6Fに示されている。どちらの試験によっても、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を用いた処理に伴ってCD31+内皮細胞およびCD31+の組織面積の有意な増大が実証された。この試験では、PDGFによる処理では新血管新生(neoangiogenesis)は加速されなかった。
miR−92標的遺伝子のmRNA発現(例えば、表3に列挙されている)に対する化合物の効果を定量的RT−PCRによって測定した。全RNAを、皮膚組織10〜50mgから、Omni BeadRuptorにおいてTRIzol試薬(Life Technologies)1mlを用いて組織をホモジナイズすることによって単離した。全RNA単離は製造者(Life Technologies)の指示に従って実施した。RNA濃度をNanoDrop 1000(Thermo)で測定した。定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応分析(RT−PCR)を用いて遺伝子発現を測定した。in vivo組織試料のRT−PCR分析については、100ngの全RNAをMultiScribe RT(Life Technologies)により、製造者の仕様に従って逆転写した。Life Technologies Taqman遺伝子発現アッセイを用いて遺伝子発現を測定した。遺伝子発現をGAPDHなどのハウスキーピング遺伝子に対して正規化し、対照群の平均と比較した相対的な発現量として算出した。図7は、db/dbマウス切除創における1つのin vivo試験からの、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤による選択されたmiR−92a標的遺伝子の抑制解除を示す。
miR−92標的ITGA5のタンパク質発現に対する化合物の効果を、免疫組織化学的検査を使用して評価した。免疫組織化学的検査は、4μmの脱パラフィン組織切片をITGA5に特異的な一次抗体で染色し、その後、HRPとコンジュゲートした二次抗体で染色し、次いで、それぞれ免疫複合体および核を可視化するためにDABおよびヘマトキシリンで染色することによって実施した。発色画像を4〜20×倍率で取得した。代表的な切片を図8A〜Dに示す。PBS(図8A)またはrhPDGF(図8B)で処置したdb/dbマウス創傷ではわずかな染色が見られたが、miR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤で処置した(例えば、図8C〜Dの化合物A)創傷では、内皮細胞および血管壁に局在する高レベルの染色が示された。全ての画像において、矢印は選択された血管を示す;PBS群およびPDGF群では染色が見られず、Aで処置した創傷では染色の程度が高いことに留意されたい。これにより、抗miR−92aオリゴヌクレオチドによる、miR−92a標的ITGA5の抑制解除が示される。
抗miR−92化合物により、陰性対照と比較して、およびrhVEGFまたはrhPDGFと比較して、創傷治癒が増強された。表3に列挙されているmiR−92aの標的は、創傷治癒を増強するmiR−92のオリゴヌクレオチド阻害剤を投与したマウスにおいて調節された。
本明細書で論じられ、引用された、全ての刊行物、特許、および特許出願は、参照によりそれらの全体において本明細書に組み込まれる。開示された発明は、それらは変化しうるので、記載された特定の方法、プロトコール、および材料に限定されないことが理解される。また、本明細書で使用される用語法は、特定の実施形態を記載することだけを目的とするものであり、付属の特許請求の範囲だけにより限定される、本発明の範囲を限定することを意図するものではないことも理解される。
当業者は、単に日常的な実験のみを使用して、本明細書で記載される本発明の具体的な実施形態の多くの均等物を認識または確認することが可能である。このような均等物は、以下の特許請求の範囲により包摂されることが意図されている。

Claims (58)

  1. 被験体における創傷治癒を促進するための方法であって、miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含むオリゴヌクレオチドを投与することを含み、該オリゴヌクレオチドの投与によりmiR−92の機能または活性が低下し、それにより、創傷治癒を促進する、方法。
  2. 前記オリゴヌクレオチドが、2’−4’メチレン架橋を含有する少なくとも1つのロックド核酸(LNA)を含む、請求項1に記載の方法。
  3. miR−92と少なくとも部分的に相補的な配列を含む前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも16ヌクレオチドの配列を含み、該配列が、3つ以下の連続したLNAを含み、該配列の5’末端から3’末端までの、1位、6位、10位、11位、13位および16位がLNAである、請求項1または2に記載の方法。
  4. 前記配列が、5’末端から3’末端までの、3位、9位、および14位にLNAをさらに含む、請求項3に記載の方法。
  5. 前記配列が、5’末端から3’末端までの、3位、8位、および14位にLNAをさらに含む、請求項3に記載の方法。
  6. 前記配列が、5’末端から3’末端までの、5位、8位、および15位にLNAをさらに含む、請求項3に記載の方法。
  7. 前記配列が、5’末端から3’末端までの、2番目のヌクレオチド位置にデオキシリボ核酸(DNA)ヌクレオチドをさらに含む、請求項4から6のいずれか一項に記載の方法。
  8. 前記2番目のヌクレオチド位置の前記DNAヌクレオチドが、化学修飾された窒素塩基を含有する、請求項7に記載の方法。
  9. 前記化学修飾された窒素塩基が、5−メチルシトシンである、請求項8に記載の方法。
  10. 前記オリゴヌクレオチドが、2’−デオキシ、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾された少なくとも1つのヌクレオチドを含む、請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記オリゴヌクレオチドが、5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 前記オリゴヌクレオチドが、1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含む、請求項1から11のいずれか一項に記載の方法。
  13. 完全にホスホロチオエート結合している、請求項12に記載のオリゴヌクレオチド。
  14. ペンダント親油基をさらに含む、請求項1から13のいずれか一項に記載の方法。
  15. 前記オリゴヌクレオチドが、表1または2から選択される配列を含む、請求項1に記載の方法。
  16. 前記被験体がヒトである、請求項1から15のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記被験体が、糖尿病に罹患している、請求項1から16のいずれか一項に記載の方法。
  18. 前記創傷治癒が、慢性創傷、糖尿病性足部潰瘍、静脈うっ血性下腿潰瘍または褥瘡に対するものである、請求項1から17のいずれか一項に記載の方法。
  19. 前記オリゴヌクレオチドの投与により、無処置または創傷治癒を促進することが公知の薬剤を用いた処置と比較して、創傷治癒の間の再上皮化、肉芽、および/または新血管新生の速度が増大する、請求項1から18のいずれか一項に記載の方法。
  20. 創傷治癒を促進することが公知の前記薬剤が、血小板由来成長因子(PDGF)または血管内皮成長因子(VEGF)である、請求項19に記載の方法。
  21. 表2から選択される配列を含むオリゴヌクレオチド。
  22. 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つの非ロックドヌクレオチドが、2’デオキシ、2’O−アルキルまたは2’ハロ修飾されている、請求項21に記載のオリゴヌクレオチド。
  23. 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのロックド核酸(LNA)が、2’−4’メチレン架橋を有する、請求項21または22に記載のオリゴヌクレオチド。
  24. 5’キャップ構造、3’キャップ構造、または5’および3’キャップ構造を有する、請求項21から23のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  25. 1つまたは複数のホスホロチオエート結合を含む、請求項21から24のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  26. 完全にホスホロチオエート結合している、請求項25に記載のオリゴヌクレオチド。
  27. ペンダント親油基をさらに含む、請求項21から26のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド。
  28. 有効量の請求項21から27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド、または薬学的に許容されるその塩、および薬学的に許容されるキャリアもしくは希釈剤を含む医薬組成物。
  29. 前記薬学的に許容されるキャリアが、コロイド分散系、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズ、水中油エマルション、ミセル、混合ミセル、またはリポソームを含む、請求項28に記載の医薬組成物。
  30. 細胞におけるmiR−92の活性を低下させるまたは阻害する方法であって、該細胞を請求項21から27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドと接触させることを含む方法。
  31. 前記細胞が、哺乳動物細胞である、請求項30に記載の方法。
  32. 前記細胞が、心臓細胞、筋肉細胞、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である、請求項31に記載の方法。
  33. 前記細胞が、in vitro、in vivoまたはex vivoにある、請求項30から32のいずれか一項に記載の方法。
  34. 被験体における血管新生を促進させる方法であって、該被験体に、請求項21から27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドを投与することを含む方法。
  35. 前記被験体が、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、末梢血管疾患または末梢動脈疾患に罹患している、請求項34に記載の方法。
  36. 前記被験体が、ヒトである、請求項34または35に記載の方法。
  37. 糖尿病、慢性創傷(複数可)、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、または末梢動脈疾患を処置する方法であって、前記被験体に、請求項21から27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドを投与することを含む方法。
  38. 前記被験体が、ヒトである、請求項37に記載の方法。
  39. 血管新生を調節するための治療薬の、該治療薬を受けている被験体における有効性を評価またはモニタリングするための方法であって、
    a)該被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および
    b)該1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の該1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により該治療薬の有効性が示されること
    を含む方法。
  40. 前記被験体に対して歩行時間試験を実施すること、前記被験体についての足関節上腕血圧比(ABI)を決定すること、前記被験体に対して動脈造影または血管造影を実施すること、または前記被験体に対してSPECT分析を実施することをさらに含む、請求項39に記載の方法。
  41. 創傷治癒を調節するための治療薬の、該治療薬を受けている被験体における有効性を評価またはモニタリングするための方法であって、
    a)該被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および
    b)該1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の該1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により該治療薬の有効性が示されること
    を含む方法。
  42. 前記治療薬が、miR−92の機能および/または活性を調節する、請求項39から41のいずれか一項に記載の方法。
  43. 前記治療薬が、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤である、請求項42に記載の方法。
  44. 前記miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤が、表1および2から選択される、請求項43に記載の方法。
  45. 前記被験体が、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、末梢血管疾患または末梢動脈疾患に罹患している、請求項39から44のいずれか一項に記載の方法。
  46. 前記被験体がヒトである、請求項39から45のいずれか一項に記載の方法。
  47. 血管新生または創傷治癒を促進する薬剤の能力を評価するための方法であって、
    a)該薬剤と接触させた細胞における、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および
    b)該1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の該1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により、血管新生または創傷治癒を促進する該薬剤の能力が示されること
    を含む方法。
  48. 前記薬剤と接触させた前記細胞におけるmiR−92の機能および/または活性を決定することをさらに含む、請求項47に記載の方法。
  49. 前記細胞が、哺乳動物細胞である、請求項47または48に記載の方法。
  50. 前記細胞が、心臓細胞、筋肉細胞、線維細胞、線維芽細胞、ケラチノサイトまたは内皮細胞である、請求項49に記載の方法。
  51. 前記細胞が、in vitro、in vivoまたはex vivoにある、請求項47から50のいずれか一項に記載の方法。
  52. miR−92の機能および/または活性を調節する治療薬を用いた処置のために被験体を選択するための方法であって、
    a)該治療薬で処置される該被験体由来の試料中の、表3に列挙されている1つまたは複数の遺伝子の発現を測定すること;および
    b)該1つまたは複数の遺伝子の発現を、所定の参照レベルまたは対照試料中の該1つもしくは複数の遺伝子のレベルと比較し、その比較により該被験体が該治療薬を用いた処置のために選択されるべきかどうかが示されること
    を含む方法。
  53. 前記被験体に対して歩行時間試験を実施すること、前記被験体についての足関節上腕血圧比(ABI)を決定すること、前記被験体に対して動脈造影または血管造影を実施すること、または前記被験体に対してSPECT分析を実施することをさらに含む、請求項52に記載の方法。
  54. 前記試料中のmiR−92の機能および/または活性を決定することをさらに含む、請求項52に記載の方法。
  55. 前記治療薬が、miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤である、請求項52から54のいずれか一項に記載の方法。
  56. 前記miR−92オリゴヌクレオチド阻害剤が、表1および2から選択される、請求項55に記載の方法。
  57. 前記被験体が、虚血、心筋梗塞、慢性虚血性心疾患、末梢もしくは冠動脈閉塞、虚血性梗塞、脳卒中、アテローム性動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、冠動脈疾患、頸動脈疾患、糖尿病、慢性創傷(複数可)、末梢血管疾患または末梢動脈疾患に罹患している、請求項52から56のいずれか一項に記載の方法。
  58. 前記被験体が、ヒトである、請求項52から57のいずれか一項に記載の方法。
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EA (1) EA201791644A1 (ja)
HK (2) HK1247617A1 (ja)
MX (1) MX2017009427A (ja)
SG (2) SG10201906716QA (ja)
WO (1) WO2016118612A2 (ja)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013192576A2 (en) 2012-06-21 2013-12-27 Miragen Therapeutics Oligonucleotide-based inhibitors comprising locked nucleic acid motif
SG10201906716QA (en) 2015-01-20 2019-08-27 Miragen Therapeutics Inc Mir-92 inhibitors and uses thereof
CA3043768A1 (en) 2016-11-29 2018-06-07 PureTech Health LLC Exosomes for delivery of therapeutic agents
WO2018195210A1 (en) 2017-04-19 2018-10-25 Cedars-Sinai Medical Center Methods and compositions for treating skeletal muscular dystrophy
US11660355B2 (en) 2017-12-20 2023-05-30 Cedars-Sinai Medical Center Engineered extracellular vesicles for enhanced tissue delivery
CN110484537B (zh) * 2019-09-02 2021-07-27 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 一种miR-92促进剂及其注射剂的制备方法和应用
CN117916249A (zh) * 2021-07-01 2024-04-19 西达-赛奈医疗中心 用于口服递送核酸的制剂

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2011500858A (ja) * 2007-10-30 2011-01-06 テー2キュア ゲーエムベーハー 血管新生、血管形成、若しくは血管修復を促進するか、又は腫瘍血管新生を阻害する方法
WO2013192576A2 (en) * 2012-06-21 2013-12-27 Miragen Therapeutics Oligonucleotide-based inhibitors comprising locked nucleic acid motif
WO2014115103A1 (en) * 2013-01-24 2014-07-31 Pierre Fabre Medicament S.A.S. Composition comprising an encapsulated antagomir

Family Cites Families (119)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6231881B1 (en) 1992-02-24 2001-05-15 Anton-Lewis Usala Medium and matrix for long-term proliferation of cells
US5981505A (en) 1993-01-26 1999-11-09 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Compositions and methods for delivery of genetic material
AU7404994A (en) 1993-07-30 1995-02-28 Regents Of The University Of California, The Endocardial infusion catheter
US5837533A (en) 1994-09-28 1998-11-17 American Home Products Corporation Complexes comprising a nucleic acid bound to a cationic polyamine having an endosome disruption agent
US5840710A (en) 1994-12-09 1998-11-24 Genzyme Corporation Cationic amphiphiles containing ester or ether-linked lipophilic groups for intracellular delivery of therapeutic molecules
JP3756313B2 (ja) 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US6770748B2 (en) 1997-03-07 2004-08-03 Takeshi Imanishi Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogue
US6416510B1 (en) 1997-03-13 2002-07-09 Biocardia, Inc. Drug delivery catheters that attach to tissue and methods for their use
US6217900B1 (en) 1997-04-30 2001-04-17 American Home Products Corporation Vesicular complexes and methods of making and using the same
AU731909B2 (en) 1997-07-01 2001-04-05 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for the delivery of oligonucleotides via the alimentary canal
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US6749617B1 (en) 1997-11-04 2004-06-15 Scimed Life Systems, Inc. Catheter and implants for the delivery of therapeutic agents to tissues
SK17432000A3 (sk) 1998-05-26 2001-07-10 Icn Pharmaceuticals, Inc. Zlúčenina, ktorá zahŕňa nukleozid s 2',4'-mostíkom a oligonukleotid z nej odvodený
US6833361B2 (en) 1998-05-26 2004-12-21 Ribapharm, Inc. Nucleosides having bicyclic sugar moiety
CN1361829A (zh) 1999-03-18 2002-07-31 埃克西库恩公司 利用特异性lna引物检测基因突变
WO2001025478A1 (en) 1999-10-04 2001-04-12 Exiqon A/S A method of increasing the specificity of oxy-lna oligonucleotides
EP1334109B1 (en) 2000-10-04 2006-05-10 Santaris Pharma A/S Improved synthesis of purine locked nucleic acid analogues
EP2428571B1 (en) 2001-09-28 2018-07-18 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. MicroRNA molecules
JP4868739B2 (ja) 2002-05-06 2012-02-01 アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド 核酸の送達法
US20080214437A1 (en) 2002-09-06 2008-09-04 Mohapatra Shyam S Methods and compositions for reducing activity of the atrial natriuretic peptide receptor and for treatment of diseases
DK2284269T3 (en) 2002-11-18 2017-10-23 Roche Innovation Ct Copenhagen As Antisense design
CA2533701A1 (en) 2003-07-31 2005-02-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for use in modulation of small non-coding rnas
WO2005017145A1 (ja) 2003-08-13 2005-02-24 Japan Biological Informatics Consortium 機能性rnaが制御する被制御遺伝子の同定・予測方法及びその利用方法
WO2005078139A2 (en) 2004-02-09 2005-08-25 Thomas Jefferson University DIAGNOSIS AND TREATMENT OF CANCERS WITH MicroRNA LOCATED IN OR NEAR CANCER-ASSOCIATED CHROMOSOMAL FEATURES
US20050256072A1 (en) 2004-02-09 2005-11-17 University Of Massachusetts Dual functional oligonucleotides for use in repressing mutant gene expression
CA2556435C (en) 2004-02-13 2014-08-12 The Rockefeller University Anti-microrna oligonucleotide molecules
US7722596B2 (en) 2004-02-26 2010-05-25 Osprey Medical, Inc. Regional cardiac tissue treatment
US20070203445A1 (en) 2004-02-26 2007-08-30 V-Kardia Pty Ltd Isolating cardiac circulation
WO2005082440A1 (en) 2004-02-26 2005-09-09 V-Kardia Pty Ltd Isolating cardiac circulation
EP2290071B1 (en) 2004-05-28 2014-12-31 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving microRNA
DK2302055T3 (da) 2004-11-12 2014-10-13 Asuragen Inc Fremgangsmåder og sammensætninger involverende miRNA og miRNA-inhibitormolekyler
WO2006063356A1 (en) 2004-12-10 2006-06-15 Isis Phamaceuticals, Inc. Regulation of epigenetic control of gene expression
US20060185027A1 (en) 2004-12-23 2006-08-17 David Bartel Systems and methods for identifying miRNA targets and for altering miRNA and target expression
EP1959012A3 (en) 2004-12-29 2009-12-30 Exiqon A/S Novel oligonucleotide compositions and probe sequences useful for detection and analysis of microRNAs and their target mRNAs
US8071306B2 (en) 2005-01-25 2011-12-06 Merck Sharp & Dohme Corp. Methods for quantitating small RNA molecules
US7404969B2 (en) 2005-02-14 2008-07-29 Sirna Therapeutics, Inc. Lipid nanoparticle based compositions and methods for the delivery of biologically active molecules
WO2006089340A2 (en) 2005-02-23 2006-08-31 V-Kardia Pty Ltd Polynucleotide delivery to cardiac tissue
US9085774B2 (en) 2005-04-19 2015-07-21 Basf Plant Science Gmbh Methods controlling gene expression
EP3002330A1 (en) 2005-05-27 2016-04-06 Ospedale San Raffaele S.r.l. Gene vector
WO2006133022A2 (en) 2005-06-03 2006-12-14 The Johns Hopkins University Compositions and methods for decreasing microrna expression for the treatment of neoplasia
KR20080082956A (ko) 2005-09-15 2008-09-12 노보솜 아게 양쪽성 리포솜의 개선 또는 양쪽성 리포솜에 관련된 개선
JP2009519339A (ja) 2005-12-12 2009-05-14 ザ ユニバーシティ オブ ノース カロライナ アット チャペル ヒル 筋細胞増殖及び分化を調節するマイクロrna
US8129515B2 (en) 2006-01-27 2012-03-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of microRNAs
DK2666859T3 (en) 2006-04-03 2019-04-08 Roche Innovation Ct Copenhagen As PHARMACEUTICAL COMPOSITION CONTAINING ANTI-miRNA ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES
EP2455493B1 (en) 2006-07-13 2014-01-08 The Ohio State University Research Foundation Micro-RNA-based methods and compositions for the diagnosis and treatment of colon related diseases
US8466117B2 (en) 2006-07-28 2013-06-18 The Johns Hopkins University Compositions and methods for modulating angiogenesis
PT2056882E (pt) 2006-08-01 2012-11-19 Univ Texas Identificação de um micro-rna que ativa a expressão da cadeia pesada de beta-miosina
WO2008042231A2 (en) 2006-09-29 2008-04-10 Children's Medical Center Corporation Compositions and methods for evaluating and treating heart failure
WO2008043521A2 (de) 2006-10-09 2008-04-17 Julius-Maximilians-Universität Würzburg Microrna (mirna) zur diagnose und therapie von herzerkrankungen
WO2008147430A2 (en) 2006-10-11 2008-12-04 Nucleonics, Inc. Microrna-formatted multitarget interfering rna vector constructs and methods of using the same
CA2681568C (en) 2006-11-23 2019-01-08 Querdenker Aps Oligonucleotides for modulating target rna activity
WO2008070082A2 (en) 2006-12-04 2008-06-12 The Johns Hopkins University Stem-progenitor cell specific micro-ribonucleic acids and uses thereof
CN101563458A (zh) 2006-12-14 2009-10-21 诺瓦提斯公司 治疗肌肉和心血管病症的组合物和方法
WO2008074328A2 (en) 2006-12-21 2008-06-26 Exiqon A/S Microrna target site blocking oligos and uses thereof
EP2113567B1 (en) 2006-12-21 2019-04-03 QIAGEN GmbH MicroRNA target site blocking oligos and uses thereof
US8580756B2 (en) 2007-03-22 2013-11-12 Santaris Pharma A/S Short oligomer antagonist compounds for the modulation of target mRNA
US20090105174A1 (en) 2007-04-20 2009-04-23 Amgen Inc. Nucleic acids hybridizable to micro rna and precursors thereof
WO2008147839A1 (en) 2007-05-23 2008-12-04 Dharmacon, Inc. Micro-rna scaffolds and non-naturally occurring micro-rnas
WO2009004632A2 (en) 2007-07-05 2009-01-08 Yeda Research And Development Co. Ltd. Methods of identifying components of a biological pathway and use of said components in regulating diseases associated with altered cell proliferation
BRPI0813527A2 (pt) 2007-07-18 2014-12-30 Univ Colorado Expressão diferencial de micro-rnas em corações humanos que não falham versus que falham
NZ583025A (en) 2007-07-31 2012-06-29 Univ Texas Micro-rnas that control myosin expression and myofiber identity
WO2009026574A2 (en) 2007-08-23 2009-02-26 Keren Pharmaceutical, Inc. Immunogenic compositions and uses thereof
EP3112464A1 (en) 2007-09-14 2017-01-04 The Ohio State University Research Foundation Mirna expression in human peripheral blood microvesicles and uses thereof
ES2463665T3 (es) 2007-10-04 2014-05-28 Stella Aps Tratamiento de combinación para el tratamiento de infección por virus de la hepatitis C
WO2009058818A2 (en) 2007-10-29 2009-05-07 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Compositions comprising a micro-rna and methods of their use in regulating cardiac remodeling
CN101424640B (zh) 2007-11-02 2012-07-25 江苏命码生物科技有限公司 血清中微小核糖核酸的检测方法和用于检测的试剂盒、生物芯片及其制作和应用方法
JP5654352B2 (ja) 2007-11-09 2015-01-14 ボード・オブ・リージエンツ,ザ・ユニバーシテイ・オブ・テキサス・システム miR−15ファミリーのマイクロRNAによる心筋細胞生存及び心臓修復の調節
CN102920996A (zh) * 2007-12-11 2013-02-13 科达治疗公司 受损伤口愈合的药物组合物
AU2008346801A1 (en) 2007-12-31 2009-07-16 Nanocor Therapeutics, Inc. RNA interference for the treatment of heart failure
EP2096171A1 (en) 2008-02-27 2009-09-02 Julius-Maximilians-Universität Würzburg MicroRNA (miRNA) and down-stream targets for diagnostic and therapeutic purposes
US20110160285A1 (en) 2008-03-13 2011-06-30 The Regents Of The University Of Colorado Identification of mirna profiles that are diagnostic of hypertrophic cardiomyopathy
US20090326049A1 (en) 2008-04-04 2009-12-31 Alexander Aristarkhov Blocking oligos for inhibition of microrna and sirna activity and uses thereof
EP2297322A1 (en) 2008-06-04 2011-03-23 The Board of Regents of The University of Texas System Modulation of gene expression through endogenous small rna targeting of gene promoters
US20110152352A1 (en) 2008-06-10 2011-06-23 Tufts University Smad proteins control drosha-mediated mirna maturation
DK2310505T3 (en) 2008-06-30 2017-10-16 Roche Innovation Ct Copenhagen As ANTIDOT oligomers
CN101386848A (zh) 2008-08-12 2009-03-18 南京大学 细胞微粒子所载微小核糖核酸及其制备研究方法和应用
EP2346883B1 (en) 2008-09-23 2016-03-23 Scott G. Petersen Self delivering bio-labile phosphate protected pro-oligos for oligonucleotide based therapeutics and mediating rna interference
US8987435B2 (en) 2008-10-24 2015-03-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and methods
WO2010091204A1 (en) 2009-02-04 2010-08-12 Board Of Regents, The University Of Texas System Dual targeting of mir-208 and mir-499 in the treatment of cardiac disorders
WO2010093788A2 (en) 2009-02-11 2010-08-19 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Multiplex dicer substrate rna interference molecules having joining sequences
US20110086348A1 (en) 2009-02-19 2011-04-14 The Cleveland Clinic Foundation Method for assessing heart disease
WO2010129672A1 (en) 2009-05-05 2010-11-11 Miragen Therapeutics Lipophilic polynucleotide conjugates
JP2012527478A (ja) 2009-05-20 2012-11-08 ボード・オブ・リージエンツ,ザ・ユニバーシテイ・オブ・テキサス・システム 心筋梗塞後のリモデリングおよび心不全に関与するマイクロrnaの同定
NZ597078A (en) 2009-06-08 2013-11-29 Miragen Therapeutics CHEMICAL MODIFICATION MOTIFS FOR miRNA INHIBITORS AND MIMETICS
WO2011017408A1 (en) * 2009-08-05 2011-02-10 The Ohio State University Research Foundation Anti-mir-1 therapy for wound healing
CN102573856B (zh) 2009-09-10 2016-10-26 弗莱明·韦林 用于制备微小rna 的方法及其治疗性应用
WO2011048125A1 (en) 2009-10-20 2011-04-28 Santaris Pharma A/S Oral delivery of therapeutically effective lna oligonucleotides
US8592151B2 (en) 2009-11-17 2013-11-26 Musc Foundation For Research Development Assessing left ventricular remodeling via temporal detection and measurement of microRNA in body fluids
US20130109738A1 (en) 2010-02-24 2013-05-02 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Control of Cardiac Growth, Differentiation and Hypertrophy
US20130079505A1 (en) 2010-03-24 2013-03-28 Mirrx Therapeutics A/S Bivalent antisense oligonucleotides
EP2371370A1 (en) 2010-04-01 2011-10-05 Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt am Main Antagonists of miRNA-29 expression and their use in the prevention and treatment of aortic aneurysms and atherosclerotic plaque destabilization
US9821009B2 (en) 2010-04-13 2017-11-21 Jiangsu Mingma Biotech Co., Ltd. Method for modulating microRNA content in living beings and the use thereof
WO2011131354A1 (en) 2010-04-20 2011-10-27 Febit Holding Gmbh Complex mirna sets as novel biomarkers for an acute coronary syndrome
US20130156845A1 (en) 2010-04-29 2013-06-20 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Lipid formulated single stranded rna
WO2011154553A2 (en) 2010-06-11 2011-12-15 Cellartis Ab Novel micrornas for the detection and isolaton of human embryonic stem cell-derived cardiac cell types
ITMI20101089A1 (it) 2010-06-16 2011-12-17 Istituto Naz Di Genetica Molecolare Ingm Profili di espressione di micro-rna nel sangue periferico per il monitoraggio del sistema immunitario
WO2012006181A2 (en) 2010-06-29 2012-01-12 Mount Sinai School Of Medicine Compositions and methods for inhibiting oncogenic micrornas and treatment of cancer
WO2012006577A2 (en) 2010-07-08 2012-01-12 Duke University Direct reprogramming of cells to cardiac myocyte fate
US20130137753A1 (en) 2010-08-03 2013-05-30 University Of South Alabama Methods and compositions for the diagnosis and treatment of breast cancer
EP2603592A2 (en) 2010-08-13 2013-06-19 The University Court of the University of Glasgow Therapeutic uses of microvesicles and related micrornas
EP3372684B1 (en) 2010-08-24 2020-10-07 Sirna Therapeutics, Inc. Single-stranded rnai agents containing an internal, non-nucleic acid spacer
US9290760B2 (en) 2010-09-15 2016-03-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Modified iRNA agents
EP2635681B8 (en) 2010-11-05 2017-10-04 Miragen Therapeutics, Inc. Base modified oligonucleotides
WO2012065024A1 (en) * 2010-11-11 2012-05-18 University Of Miami Compositions, cells, kits and methods for autologous stem cell therapy
BR112013012319A2 (pt) 2010-12-15 2019-09-24 Miragen Therapeutics inibidores de micro rna compreendendo nucleotídeos bloqueados
WO2012149646A1 (en) 2011-05-05 2012-11-08 Sunnybrook Research Institute Mirna inhibitors and their uses
JP6177243B2 (ja) 2011-10-06 2017-08-09 ミラゲン セラピューティクス, インコーポレイテッド マイクロrnaの調節による全身エネルギーホメオスタシスの制御
GB201117482D0 (en) 2011-10-11 2011-11-23 Univ Dundee Targetiing of miRNA precursors
EP2584040A1 (en) 2011-10-17 2013-04-24 Pharmahungary 2000 Kft. Compounds for treatment of ischemic injury
PT3597644T (pt) 2011-10-18 2021-11-03 Dicerna Pharmaceuticals Inc Lípidos catiónicos de amina e suas utilizações
EP2790736B1 (en) 2011-12-12 2018-01-31 Oncoimmunin, Inc. In vivo delivery of oligonucleotides
EP2604690A1 (en) 2011-12-15 2013-06-19 Oncostamen S.r.l. MicroRNAs and uses thereof
EP2816114A3 (en) 2011-12-15 2015-02-25 Oncostamen S.r.l. MicroRNAs and uses thereof
FR2984358A1 (fr) 2011-12-16 2013-06-21 Genethon Methodes pour le diagnostic de dystrophies musculaires
US9163235B2 (en) 2012-06-21 2015-10-20 MiRagen Therapeutics, Inc. Inhibitors of the miR-15 family of micro-RNAs
US20160251720A1 (en) 2013-11-01 2016-09-01 The Trustees Of Columbia University In The City New York MicroRNA PROFILES IN HEART FAILURE: METHODS AND SYSTEMS FOR DETECTION AND USE
SG10201906716QA (en) 2015-01-20 2019-08-27 Miragen Therapeutics Inc Mir-92 inhibitors and uses thereof
SG10201910479UA (en) 2015-05-08 2020-03-30 Agency Science Tech & Res Method for diagnosis and prognosis of chronic heart failure
EP3601565A4 (en) 2017-03-25 2021-01-06 Miragen Therapeutics, Inc. MIR-92 INHIBITORS IN THE TREATMENT OF HEART FAILURE

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2011500858A (ja) * 2007-10-30 2011-01-06 テー2キュア ゲーエムベーハー 血管新生、血管形成、若しくは血管修復を促進するか、又は腫瘍血管新生を阻害する方法
WO2013192576A2 (en) * 2012-06-21 2013-12-27 Miragen Therapeutics Oligonucleotide-based inhibitors comprising locked nucleic acid motif
JP2015521626A (ja) * 2012-06-21 2015-07-30 ミラゲン セラピューティクス, インコーポレイテッド ロックド核酸モチーフを含むオリゴヌクレオチドベースの阻害剤
WO2014115103A1 (en) * 2013-01-24 2014-07-31 Pierre Fabre Medicament S.A.S. Composition comprising an encapsulated antagomir
JP2016506923A (ja) * 2013-01-24 2016-03-07 ピエール・ファーブル・メディカマン・エス・ア・エスPierre Fabre Medicament S.A.S. カプセル化アンタゴmirを含む組成物

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
J. BIOL. CHEM., 1992, VOL.267. NO.16. PP.10931-10934, JPN6019038077, ISSN: 0004275068 *

Also Published As

Publication number Publication date
KR20170103841A (ko) 2017-09-13
US20180237779A1 (en) 2018-08-23
SG11201705907XA (en) 2017-08-30
WO2016118612A3 (en) 2016-08-25
EP3247716A4 (en) 2018-10-17
US20190194662A1 (en) 2019-06-27
CA2974189A1 (en) 2016-07-28
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