JP2017503502A - 調節可能な移動性を有するプローブと結合された支持型脂質二重層を含む人工細胞膜及びそれを用いて分子間の相互作用を分析する方法 - Google Patents
調節可能な移動性を有するプローブと結合された支持型脂質二重層を含む人工細胞膜及びそれを用いて分子間の相互作用を分析する方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
本発明の第4の態様は、人工細胞膜上でA分子が結合された第1の金属粒子とB分子が結合された第2の金属粒子のプラズモン散乱信号から第1の金属粒子と第2の金属粒子との間の距離を確認してA分子とB分子の結合有無を確認するための分析キットにおいて、基材;前記基材上に配置され、脂質の一部または全部が二重層内で位置移動可能な支持型脂質二重層;及び前記支持型脂質二重層の一部として、第1のリガンドが結合された第1の脂質及び第1のリガンドと同一または異なる第3のリガンドが結合された第3脂質;を含む人工細胞膜;前記第1のリガンドに特異的に結合する第2のリガンドを含む第1の金属粒子として、第1のリガンドと第2のリガンドの結合を通じて1つ以上の第1の脂質と結合可能な第1の金属粒子;及び前記第3のリガンドに特異的に結合する第4のリガンドを含む第2の金属粒子として、第3のリガンドと第4のリガンドの結合を通じて1つ以上の第3の脂質と結合可能な第2の金属粒子;を含むことを特徴とする分析キットを提供する。
好ましくは、前記第2のリガンドは、チオール基を含み、前記チオール基を通じて第1の金属粒子に共有結合することができる。
前記A分子及びB分子は、それぞれDNA、RNA、抗原、抗体、リガンド、キレート、受容体、アプタマー、ポリマー、有機化合物、金属イオン、またはポリペプチドであってもよい。
前述したように、前記分析装置において、第1の粒子は、支持型脂質二重層の平面上に固定されており、第2の粒子は、別途の刺激が加わえられない限り、自由ブラウン運動をする。
また、第2の金属粒子のリアルタイム移動軌跡または速度、または第2の金属粒子による信号の強度または波長の変化をモニタリングすることができる。
本発明に係るリガンド結合を通じて脂質上に結合された粒子を含む支持型脂質二重層を含む流体チャネルに流体の流れを適用すると、前記粒子は、脂質二重層上で自由なブラウン運動が可能であるため、流体の流れ方向に沿って移動して流体チャネル内の特定の部分に濃縮することができる。従来の脂質二重層上に位置する粒子を濃縮させるための方法としては、電場などの刺激を加える方法が使用されたが、電場を適用した場合の露出時間が長くなるにつれて粒子上に結合されたタンパク質や遺伝子などが変性したり、脂質二重層自体が破壊されることがあり、これにより、pHや温度が変化したり、空気の泡が発生するなどの実験条件の変化をもたらすことがあるが、本発明に係る流体の流れを利用する場合、このような欠点を克服することができる。
1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン(1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine;DOPC)、1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン−N−(キャップビオチニル)ナトリウム塩(1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-(cap biotinyl)sodium salt;biotinylated DOPE)及び1,2−ジオレオイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン−N−[メトキシ(ポリエチレングリコール)−1000]アンモニウム塩(1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine-N-[methoxy(polyethylene glycol)-1000] ammonium salt;PEG-DOPE)をAvanti Polar Lipids(Alabaster、AL、USA)から購入した。Cy3−修飾されたストレプトアビジン(streptavidin;STV)は、Molecular Probes(Eugene、OR、USA)から購入した。カルボキシメチルポリエチレングリコール(carboxymethyl polyethylene glycol;MW 5000)は、Laysan Bio Inc.(Arab、AL、USA)から購入した。ウシ血清アルブミン(bovine serum albumin;BSA)、ナトリウムドデシル硫酸ナトリウム(sodium dodecyl sulfate;SDS)及びジチオトレイトール(dithiothreitol;DTT)は、Sigma−Aldrich(St.Louis、MO、USA)から購入した。0.15MのPBS溶液は、NaH2PO4、Na2HPO4とNaCl(Sigma-Aldrich、St. Louis、MO、USA)を脱イオン水(DI water)に溶かして150mMのNaClを含む10mMリン酸緩衝溶液(pH7.4)で製造した。0.025MのPBSは、同じ試薬で25mMのNaClを含むように製造した。すべての実験に最小の抵抗(>18MΩ/cm)を有するナノピュアウォーターを使用した。小胞(vesicle)の製造(小胞押出;vesicle extrusion)のために、気孔径が100nmであるポリカーボネート(polycarbonate;PC)フィルタ(Whatman、Fisher Scientific)を使用した。クロロホルム、アセトン、及びエタノールのような有機溶媒は、Duksan Pure Chemicals Co.Ltd.(Gyeonggi-do、Korea)から購入した。硫酸及び過酸化水素は、Daejung Chemicals&Metals Co.Ltd.(Gyeonggi-do、Korea)から購入した。50nmの金ナノ粒子及びオリゴヌクレオチドは、それぞれBBI Life Sciences(Cardiff、UK)、及びIntegrated DNA Technology(Coralville、IA、USA)から購入した。I−PNP(immobile PNP)に対する標的捕獲配列は5’−HS−(CH2)6−PEG6−CTTTGAGCAC ATCCTTATCAATATT−3’、I−PNPのSLB結合(tethering)配列は5’−HS−(CH2)6−PEG6−CTTTGAGCACTGTTAGCGTGTGTGGAATTTTAAT−ビオチン−3’である。M−PNP(mobile PNP)の標的捕獲配列は5’−TAACAATAATCCCTC CACGAGTTTC−PEG 6−(CH2)3−SH−3’、M−PNPのSLB結合(tethering)配列は5’−ビオチン−TAATTTTAAGGTGTGTGCGATTGTCACGAGTTTC−PEG6−(CH2)3−SH−3’である。標的配列は、5’−GAGGGATTATTGTTAAATATTGA TAAGGAT−3’である。標的捕獲配列の下線部分は、標的DNA配列に混成化した(hybridize)。単一塩基対の不一致DNA配列には、標的DNA配列のAをTに置換したものを用いた。非相補的DNA配列は、5’−CTGATTACTATTGCATCTTCCGTTACAACT−3’であった。
97.4モル%のDOPC、0.1モル%のビオチン化−DOPE及び2.5モル%のPEG−DOPEを含むSUVの拡散によりカバーグラス上に支持型脂質二重層(supported lipid bilayer;SLB)を形成した。クロロホルムに適量の脂質を溶解させてSUV溶液を製造した。回転蒸発器(rotary evaporator)を利用し、50mlの丸底フラスコで、脂質溶液を蒸発させた。窒素の流れの下で脂質薄膜(lipid film)を完全に乾燥させた。乾燥した混合物は、脱イオン水に再懸濁させ、凍結−融解サイクル(freeze-thaw cycle)を3回繰り返して行った。総脂質濃度は2mg/mlであった。溶液を25℃で100nm細孔径のPC膜を通じて21回以上押出した。生成されたSUV溶液は使用するまで4℃で保管した。
100mMのPB(pH8.0)に溶解した100mMのDTTと2時間インキュベーションしてチオール化されたオリゴヌクレオチドを還元させてNAP−5カラム(GE health care、Buckinghamshire、UK)を用いて分離した。DNA機能化のために、新たに還元させた4μMのオリゴヌクレオチドを50pMの50nm金ナノ粒子と混合し、室温で一晩中インキュベーションした。I−PNPに対して、SLB結合配列と標的捕獲配列のモル比を200:600(SLB結合配列のモル分率=0.25)であった。M−PNPに対して、モル比は、1:799(SLB結合配列のモル分率=0.00125)であった。その後、溶液を調整し、10mMのリン酸緩衝液と0.1%(wt/vol)SDSを得た。前記調節された溶液を、30分間の軌跡攪拌機(orbital shaker)でさらにインキュベーションし、2M NaCl 6 aliquotを添加して0.05Mの段階に増加し、最終的にNaCl濃度が0.3Mになるようにした。それぞれの2MのNaCl添加後、溶液を55℃で10分間加熱し、室温で30分間インキュベーションした。DNA−金ナノ粒子混合物を一晩中放置した後、溶液を遠心分離した(4500rpm、10分)。上澄液を除去し、沈殿は、脱イオン水に再分散させた(前記の過程を3回繰り返した)。DNA−機能化された金ナノ粒子溶液は使用時まで4℃で保管した。金ナノ粒子当りSLB結合配列の数を定量するためにCy3−標識オリゴヌクレオチド−改質金ナノ粒子を30mM KCN溶液に溶解させた。そして、励起光源としてキセノンランプ(500W)を備えたActon分光光度計(Spectra Pro、MA、USA)でCy3の蛍光発光強度を測定した。
ガラスフローチャンバーでSLBと結合された金プラズモンナノ粒子を製造した。フローチャンバーは、互いに100μmの厚さの熱可塑性スペーサ(thermoplastic spacer)で分離された上部(top)及び下部(bottom)ガラス基質(glass substrate)で構成される。入口及び出口の細孔は、上部ガラスの両端に穴を打った。上部スライドガラスは、0.15MのBPSに溶かした10mg/ml BSAで1時間前処理してSLB沈着(deposition)に不活性であるようにした。下部カバーガラスは、クロロホルム、アセトン、及びエタノールで10分間超音波処理して洗浄した。音波処理した後のカバーガラスを脱イオン水で洗浄し、窒素流により乾燥した。次に、下部カバーガラスを1時間の間、1M NaOHで前処理し、蒸留水で完全に洗浄した。ガラス基質は、サンドイッチされた熱可塑性プラスチックのスペーサと共にデジタルホットプレート上で120℃で加熱して組み立てた。製造されたSUV溶液を0.15MのPBSと1:1v/vで混合して入口を通じてガラスフローチャンバーに導入した。約70μlのSUV溶液を流れチャネルに満たした。25℃で45分間インキュベーションした後、過量の非融合(excess and unfused)SUVを200μlの脱イオン水で2回洗浄した。流れチャネル内の脱イオン水をPBSで置換した後、0.15MのPBSに溶かした1nm STVをビオチン化されたSLBと1時間反応させた。未反応STVを0.15MのPBSで洗浄し、流れチャネルを0.025MのPBSで満たした。次に、2pM I−PNPと15pM M−PNPプローブを導入し、10分間反応させた。結合していないPNPを除去し、未反応STVの結合部位を1μMの自由ビオチンを含む0.025MのPBSで洗浄して抑制した。15分後、緩衝液を0.15MのPBSに交換した。一般的には、前記のプロセスを通じて1:3の割合でSLB−結合されたI−PNP及びM−PNPを得ることができる。
まず、PNPのビオチン結合価を変化させることにより、脂質−結合されたPNPの拡散を調節した。これから、粒子当りリガンドの数は脂質膜上でナノ粒子の横的移動性に顕著な効果を示すことを確認した。本発明者らは標的捕獲DNA配列とSLB結合DNA配列との間のモル比を変化させることにより、DNA機能化の段階でAuNP上のビオチン分子の結合価を調節した。前記化学量論的調節方法で高い再現性のある結果を獲得した。KCN溶液にAuNPを溶解させた後、SLB結合配列に修飾されたCy3分子の蛍光発光強度を測定することにより、PNP当りSLB結合配列の数を計算した。平均ビオチン結合価はSLB結合DNAリンカーの添加量が増加するにつれて、約0.57から128まで直線的に増加した(図1及び表1)。製造したPNPプローブをビオチン−ストレプトアビジン相互作用を通じてSLB表面に結合させた。0.57のビオチン結合価を有するSLB上のPNPプローブは、ビオチンを含まないPNPは、SLBに結合することができず、表面から完全に洗浄することができるため、一つのビオチンを有するものとみなされた。
暗視野顕微鏡を用いて単一ナノ粒子の解像度でSLB結合PNPプローブの横的動きを観察し、イメージ解析プログラムを用いて個々の軌跡を分析した(ImageJソフトウェア;具体的な実験と解析の方法は、後述)。他のビオチン結合価を有するSLB−結合PNPプローブの事件の関数で平均二乗変異(mean square displacement;MSD)の値をそれぞれ図2aに示した。多結合価PNPは、少数結合価(paucivalent)PNPと比較し、遥かにゆっくり拡散し、より短い距離を移動する傾向を示した。486個のビオチンを含むPNPは、ほとんど移動性がなく、ほぼ同じ位置に留まることを確認した。486個のビオチンを含む場合を除き、これらの軌跡のMSDプロットは、MSDと時間間隔の間の線形関係を明確に示した。これらの結果は、これらのナノ粒子は、SLBの表面上の任意の2Dブラウン運動を表すことを意味する。PNPプローブの拡散係数を計算するために、本発明者らは、各ビオチン結合価に対して100個の粒子の軌跡を分析し、対応するMSDプロットを下記の数式に最適化した。
金属ナノ粒子の共鳴光散乱は、有機色素からの蛍光とは異なる物理的起源を有する。局部化された表面プラズモンの放射減衰(radiative damping)は、散乱された光子を形成し、これらの過程は、点滅及び光漂白の影響を受けない。PNPの光安定性を確認するために、SLB上の50nmのAuNPを30分間継続的に、暗視野顕微鏡の照射に露出させ、散乱強度を、6秒間隔で記録した(図5)。粒子は全体の実験時間にわたって強度変更せずにきらめき(shining)を維持した。これは、AuNPが単一粒子追跡するために、複数の染料を使用している場合でも、実質的に水分内に信号を失う蛍光染料に比べて、リアルタイム光学の研究において、より強い(robust)光学的標識であることを示すものである。
流動性SLBにPNPを動的に連結し、粒子の結合価を調節することにより、PNPの動力学的挙動を調節した。また、単一粒子レベルの解像度で本来の場所のDNA混成化により誘導された粒子のクラスタ成長動力学と相互作用するPNPとの間のリアルタイムプラズモンカップリングを使用し、前記プラットフォーム上で定量を分析した(図6及び7)。複数の粒子の反応場所からの相互作用を同時にモニタリングして分析した。二量体、三量体、及び四量体ナノ粒子クラスターの形成に対する速度論的研究を行い、本方法の適用事例として、多重平行の単一粒子分析ベースのDNA検出アッセイを開始した。前記プラズモンナノ粒子(PNP)は、効果的に共鳴光を散乱させ、光漂白及びちらつきの影響を受けないため、このような接近に使用され、長期間に渡って優れた時空間解像度で、単一ナノ粒子を追跡することができる(〜1.5nmと〜10μs解像度で1時間以上)。個別の金または銀ナノ粒子(AuNPまたはAgNP)のプラズモンは、距離依存の方法で、互いに相互作用し、これは追加の標識なしに散乱強度または分光学的反応の変化をモニタリングすることにより、数十ナノメートル以内の分子相互作用の測定のベースとなる基本的原理を形成する。SLBは、固体基質上に2D流体表面を合成して調節し、側方流動性を有する多様な膜種を含むことができる非常に強力なプラットフォームである。SLBにナノ粒子を連結することにより、ナノ粒子を2D関心のあるすべての粒子の効率的な映像化及び追跡のために、光学顕微鏡の焦点面(focal plane)に閉じ込めることができる一方、SLBの流動的性質により、ナノ粒子の自由な動きを保存することができる。連結されたPNPは入射光を共鳴散乱させ、常に平面の脂質二重層表面上で移動することにより、単一粒子の解像度で2D拡散軌跡及び光学信号を暗視野顕微鏡(Axiovert 200M、Carl Zeiss、Gottingen、Germany)に本来の場所で記録することができる(図7)。暗視野顕微鏡観察の結果から、連結されたPNPが2D膜表面を通じて均一に分散され、膜表面にわたる自由拡散に優れた側方移動性を示すことを確認した。前記粒子の動力学的2D拘束及びPNP標識の使用は、粒子間の効率的な衝突及びナノ粒子上の分子との間のほぼすべての反応の本来の場所観察及び分析を容易にする。
DNAアッセイのために、ガラス基質上にパターン化された金フィルムに120×120μm2 SLBを形成した。金パターンは、既存のフォトリソグラフィとリフトオフ工程(lift-off process)により製造した。金表面はSLB形成に対して不活性であるため、SUV溶液の導入により露出されたガラス表面上にSLBを選択的に沈着させることができた。SLBを形成した後、PNPと標的DNAの非特異的結合を抑制するために、金の表面をPBSに溶かした2mg/mlのBSAと10μMカルボキシポリエチレングリコールで不活性化(passivate)した。その後、DNAアッセイ実験に使用するためにPNPを結合させた。
40×対物レンズ(NA 0.6)を備えた暗視野顕微鏡(Axiovert 200M、Carl Zeiss、Gottingen、Germany)によりSLB−結合されたPNPプローブの移動とプラズモンカップリングを観察した。すべてのイメージ分析プロセスは、ImageJソフトウェア(http://rsb.info.nih.gov/ij/)を用いて行った。個々のSLB−結合PNPプローブの追跡及び軌跡の分析のために、MOSAICプラグインを使用した(http://www.mosaic.ethz.ch/Downloads/ParticleTracker)。散乱強度及びRGB色のスペクトルは、それぞれImageJソフトウェアの基本的な強度測定及びRGB色強度分割機能により測定した。Cy3−改質STVを532nmレーザーで励起し、60×レンズ(NA 1.49)を備えたepifluorescence顕微鏡(TE-2000、Nikon、Tokyo、Japan)を用いて観察した。
高解像度映像化アッセイの他の重要な点は、相互作用する粒子を観察することができる安定的で信頼性の高い方法であるということである。これを容易にするために、著しく異なる側方移動性を有する2つの形式のDNA修飾されたプラズモンナノ粒子(DNA−PNP)を考案し、製造してSLBの表面に連結させた(高移動性のPNP及びほぼ固定されたPNP(それぞれM−PNP及びI−PNP)プローブ;図6)。固定されたI−PNP位置からの散乱信号は、安定的にモニタリングし、分析することができ、M−PNPは、I−PNP位置で拡散してプラズモンカップリング−ベース散乱信号の変化を誘導することができる。I−PNP及びM−PNPプローブは、それぞれ5’−チオール−改質されたDNA及び3’チオール−改質されたDNAプローブで製造した。二つの異なるチオール化されたDNA配列(標的捕獲配列とSLB連結配列)を使用し、それぞれのPNPプローブを機能化した。SLB連結配列はチオールと他の末端にビオチン基を含み、ストレプトアビジン−改質されたSLBに安定結合を形成する。PNPプローブの移動性をDNA修飾過程でSLB連結配列のモル分率を異にして探針のビオチン結合価により調節した。PNPがより多結合性であるほど、拡散係数、及び移動の分率は、より減少し、0.15625モル分率のSLB連結配列で達成されるビオチン結合価が486に達したとき、すべての粒子は実質的に固定された(図8)。M−PNPプローブを製造するために、0.00125モル分率のSLB連結配列を添加して1ビオチン結合価を得た。M−PNPプローブは、少数結合価(paucivalent)であり、任意の2Dブラウン運動により遥かに自由に拡散することができる。一方、多結合価I−PNPプローブは、ほぼ完全に膜表面上に固定された。散乱強度は、ImageJソフトウェアを用いて、本発明に使用された顕微鏡装置の光学解像度、dと類似の500nmの半径のI−PNP位置(site)−中心の円形区域(nanoparticle-centered circular area)を平均して分析した(d=λ/2NA;λは、50nm AuNPの共鳴散乱波長である530nm、NAは対物レンズの開口数(numerical aperture)である0.6)。
単量体から四量体でクラスタ成長速度をI−PNPに比べてM−PNPが過量で存在することと仮定して3−段階の1次連続反応で最適化された。
標的DNAとその相補的な配列との相互作用により形成された金ナノ粒子クラスターの場合、散乱信号の強度増加が明確であり、単一ナノ粒子レベルで観察が可能であるため、クラスターの形成程度を定量化する場合は、標的DNAを検知するバイオセンサーとして応用することができる。したがって、標的DNAの濃度に応じて、ナノ粒子クラスターが形成され、変化する暗視野顕微鏡イメージの信号の明度を分析し、検出可能な濃度範囲を確認した。金フィルムに挿入された(embeded)120×120μm2のSLBパターンでDNAの検出を行った(図15b)。PNP−修飾されたSLBを4時間の間300aM〜300fMの範囲の異なる濃度の標的DNAと反応させた。対照試料を含む、すべての試料は、本発明に係るアッセイの選択性を検証するために、300fMの非相補的DNA配列を含む。本発明に使用された標的DNAの濃度範囲でPNPは、三量体及び四量体へのさらなる成長はせずに、二量体のみを形成した。カップルされた二量体散乱強度を示すI−PNP位置(>3.5倍−の向上;図15a)を標的DNA配列に対する光学的信号として係数した(図15b)。アッセイ結果は、最適化過程なしに30fMの検出限界を示した(図15c)。また、単一塩基対の不一致DNA配列も明確に区別された(図15c)。
SLB上に導入された金属ナノ粒子のビオチン結合価を適切に調節すると、ナノ粒子は、SLB上で流動性を有するようになる。流動的なナノ粒子は、自由な2次元拡散運動をするようになるが、外部からの刺激(例えば、電場あるいは流体の流れ)を利用し、SLB上でナノ粒子が所望の方向に移動するように調節することができ、この時、刺激の強度、すなわち、加えられる電場のサイズまたは流速を変化させることにより、粒子の移動速度も調節可能である。図16に示すように、パターン化されたSLBでナノ粒子の空間的分布を操作する場合、特定の部分で粒子の密度を高め、粒子間の衝突頻度を大幅に向上させることができる。したがって、SLB上でナノ粒子間の相互作用を増加させて反応速度を向上させ、バイオセンサーの感度を高め、検知時間を短縮させることができる。また、粒子間の距離を調節してプラズモンカップリングを調節するためのプラットフォームとして使用することもできる。
細胞膜は、細胞の内部と外部を区別する構造物であり、リン脂質及びタンパク質分子で構成された薄いリン脂質二重層である。細胞膜は、選択的な透過性を有し、複数のタンパク質を通じて細胞の機能及び組織を維持する機能を行う。このように、細胞膜では細胞の恒常性の維持及び必須機能のための多様な生物学的現象が行われているため、細胞膜での生物学的及び細胞生物学的な理解は非常に重要である。
金及び銀のような貴金属ナノ粒子は、プラズモン共鳴現象を示し、ナノ粒子の形状及び/またはサイズに応じて多様な色を散乱する特性を有するため、このような特性を利用し、ナノ粒子の組成、形状、及び/またはサイズを変化させ、それぞれ赤、青、または緑色の光を散乱させるナノ粒子を提供することができ、これらのナノ粒子は、互いに異なる色を表すため、暗視野顕微鏡で区分が可能である。したがって、互いに異なる結合の区分を可能にすることにより、これらのそれぞれ異なる3色のナノ粒子を使用してmiRNAの多重検知に対する適用可能性を確認した。一方、miRNAは、生体内の機能を調節する短いRNA鎖で、がんのような疾患を有する患者から誤発現することが知られているため、がんなどの疾患を診断するバイオマーカーとして作用することができる。様々ながん疾患で確認された誤発現されるmiRNAを表2に示した。
赤色を散乱するナノ粒子は、15nm×15nm×45nmサイズの金ナノロッドに約5nmの厚さで銀のシェルをコーティングして製造した。緑色を散乱するナノ粒子としては、50nmの直径の球状の金ナノ粒子を使用した。一方、青色を散乱するナノ粒子は、20nmの直径の球状の金ナノ粒子に約10nmの厚さの銀のシェルを導入して製造した。前記製造されたそれぞれのナノ粒子を暗視野顕微鏡及び電子顕微鏡を用いて色相と形態を確認し、その結果を図22に示した。また、各粒子の吸収/散乱スペクトルを測定し、共に示した(図22右)。
前記実施例7.2.から得たそれぞれのナノ粒子に、実施例3と同様の方法でDNAを導入して機能化してナノプローブを合成した。実施例4と同様の方法で、前記三色のナノプローブの移動性を調節して三色のナノ粒子のそれぞれに対して、I−PNP(以下、IR、IG、及びIBと表記)及びM−PNP(以下、MR、MG及びMBと記す)、計6種のナノプローブをSLB上に導入した。実施例6.1.で確認したように、プラズモン共鳴散乱を示す金属ナノ粒子は、これに結合された相補的な配列のDNAの混成化に応じて互いに接近して2つ以上の粒子がクラスターを形成し、これにより、プラズモン散乱強度が変わるだけではなく、プラズモン色の変化を伴うため(図5〜7)、これを互いに異なる色を表す3つの粒子に適用すると、互いの組み合わせによりプラズモンスペクトルから計9種の異なる変化が示されると予想することができ(図23a)、これを具体的な実施例を通じて確認した(図23b〜23d)。具体的には、それぞれのナノプローブを組み合わせて、9つのmiRNA(図23b)と結合することができるように相補的なDNAで改質し、各結合をリアルタイムで観察することができるだけでなく、9種のmiRNAを定量的に分析することができることを確認した。結合前(0分)、及び60分間反応させた後(60分)、同じフレームで測定した暗視野顕微鏡イメージを図23cに示し、反応時間による累積結合数の変化を図23dに示した。固定された個々の粒子(IR、IG及びIB)で経時による同種または異種粒子との結合によるプラズモン散乱スペクトルの変化をそれぞれ図24〜26に示し、暗視野顕微鏡を用いて前記それぞれのカラー(それぞれ互いに異なるプラズモン散乱波長)を有する、及び/または移動度を有する複数の粒子の挙動及びその測定方法を図27に概略的に示した。したがって、本発明の多重検知方法は、9種以上のmiRNAを同時に定性及び/または定量分析することができるため、6種以上の異なる種類のがんを区別して診断するのに使用することができる。
Claims (25)
- 基材及び前記基材上に配置された支持型脂質二重層(supported lipid bilayer;SLB)を含む人工細胞膜(artificial cell membrane)において、
前記支持型脂質二重層は、脂質の一部または全部が二重層内で位置移動可能であり、第1のリガンドが結合された第1の脂質を含み、
前記第1のリガンドに特異的に結合する第2のリガンドを100〜100,000個/μm2以上の密度で含む第1の金属粒子が、第1のリガンドと第2のリガンドの結合を通じて2つ以上の第1の脂質と結合し、平均0〜0.5×10−8cm2/secで支持型脂質二重層内の移動性が減少したことを特徴とする人工細胞膜。 - 前記第1のリガンド及び第2のリガンドは、それぞれ独立して抗原、抗体、リガンド、受容体、キレート、DNA、RNA、アプタマー、互いに特異的に結合する化学分子、及びこれらの組み合わせで構成された群から選択されるものである、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 第2のリガンドは、チオール基を含み前記チオール基を通じて第1の金属粒子に共有結合されたものである、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 前記第1の金属粒子は、第1のリガンドと第2のリガンドとの間の抗原−抗体結合、リガンド−受容体結合、核酸混成化、キレート結合、共有結合または静電結合により脂質に結合されたものある、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 前記第1の金属粒子は、粒子の大きさまたは形態に応じて固有の波長でプラズモン散乱を発生するものである、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 前記第1のリガンドが結合された第1の脂質を前記支持型脂質二重層の全脂質に対して0.05〜0.5モル%で含まれるものである、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 前記支持型脂質二重層の全脂質に対して1〜10モル%のポリエチレングリコールが結合された第2の脂質をさらに含むものである、請求項1に記載の人工細胞膜。
- 前記ポリエチレングリコールの平均分子量は、500〜2000である、請求項7に記載の人工細胞膜。
- 人工細胞膜を利用してA分子とB分子の相互作用を確認するための分析装置であって、
支持型脂質二重層が、第1のリガンドと同一または異なる第3のリガンドが結合された第3の脂質をさらに含む、請求項1〜請求項8のいずれか一項に記載の人工細胞膜;
前記人工細胞膜中、第1の金属粒子の表面上に結合されたA分子;
前記第3のリガンドに特異的に結合する第4のリガンドを含む第2の金属粒子として、第3のリガンドと第4のリガンドの結合を通じて1つ以上の第3の脂質と結合するが、第1の金属粒子より支持型脂質二重層内の移動性が大きい第2の金属粒子;及び
前記人工細胞膜中、第2の金属粒子の表面上に結合されたB分子を含み、
移動性が大きい第2の金属粒子が第1の金属粒子に接近してA分子とB分子の相互作用により、第2の金属粒子が第1の金属粒子に拘束されることを特徴とする分析装置。 - 前記A分子及びB分子は、それぞれ独立してDNA、RNA、抗原、抗体、リガンド、キレート、受容体、アプタマー、ポリマー、有機化合物、金属イオン及びポリペプチドで構成された群から選択される、請求項9に記載の分析装置。
- 前記A分子とB分子の相互作用は、抗原−抗体結合、リガンド−受容体結合、核酸混成化、キレート結合、共有結合、及び静電結合で構成された群から選択される、請求項9に記載の分析装置。
- 第1の金属粒子は、支持型脂質二重層上に固定され、第2の金属粒子は、相互作用不在時、支持型脂質二重層上で2次元的自由ブラウン運動(2-dimensional brownian motion)が可能であることを特徴とする、請求項9に記載の分析装置。
- 請求項9に記載の分析装置を用いて、A分子とB分子の相互作用を確認する、方法。
- 第1の金属粒子の位置及び第1の金属粒子による散乱強度または波長の変化をモニタリングすることを特徴とする、請求項13に記載の方法。
- 第2の金属粒子のリアルタイム移動軌跡または速度、または第2の粒子による信号の強度または波長の変化をモニタリングすることを特徴とする、請求項13に記載の方法。
- 前記モニタリングは、第1の金属粒子のプラズモン散乱を測定することにより達成される、請求項14に記載の方法。
- 前記モニタリングは、第2の金属粒子のプラズモン散乱を測定することにより達成される、請求項15に記載の方法。
- さらに、特定の方向に力を加えて粒子の密度を高め、粒子間の衝突頻度を増加させることを特徴とする、請求項13に記載の方法。
- 人工細胞膜上でA分子が結合された第1の金属粒子とB分子が結合された第2の金属粒子のプラズモン散乱信号から第1の金属粒子と第2の金属粒子との間の距離を確認してA分子とB分子の結合有無を確認するための分析キットにおいて、
基材;前記基材上に配置され、脂質の一部または全部が二重層内で位置移動可能な支持型脂質二重層;及び前記支持型脂質二重層中の一部として、第1のリガンドが結合された第1の脂質及び第1のリガンドと同一または異なる第3のリガンドが結合された第3脂質;を含む人工細胞膜;
前記第1のリガンドに特異的に結合する第2のリガンドを含む第1の金属粒子として、第1のリガンドと第2のリガンドの結合を通じて1つ以上の第1の脂質と結合可能な第1の金属粒子;及び
前記第3のリガンドに特異的に結合する第4のリガンドを含む第2の金属粒子として、第3のリガンドと第4のリガンドの結合を通じて1つ以上の第3の脂質と結合可能な第2の金属粒子;を含むことを特徴とする分析キット。 - A分子及びB分子と結合可能な標的物質の定性的または定量的分析のためのキットにおいて、
分析キットは、人工細胞膜上でA分子が結合された第1の金属粒子とB分子が結合された第2の金属粒子のプラズモン散乱信号から第1の金属粒子と第2の金属粒子との間の距離を確認し、前記標的物質を通じたA分子とB分子の結合の有無を確認するためのものであり、
基材;前記基材上に配置され、脂質の一部または全部が二重層内で位置移動可能な支持型脂質二重層;及び前記支持型脂質二重層の一部として、第1のリガンドが結合された第1の脂質及び第1のリガンドと同一または異なる第3のリガンドが結合された第3脂質;を含む人工細胞膜;
前記第1のリガンドに特異的に結合する第2のリガンドを含む第1の金属粒子として、第1のリガンドと第2のリガンドの結合を通じて1つ以上の第1の脂質と結合された第1の金属粒子;
前記第1の金属粒子の表面上に結合され、標的物質の一部に特異的に結合するA分子;
前記第3のリガンドに特異的に結合する第4のリガンドを含む第2の金属粒子として、第3のリガンドと第4のリガンドの結合を通じて1つ以上の第3脂質と結合する第2の金属粒子;及び
前記人工細胞膜中、第2の金属粒子の表面上に結合され、標的物質中、A分子と結合しない他の部分に特異的に結合するB分子を含むことを特徴とするキット。 - 前記標的物質、A分子、B分子、第1のリガンド及び第2のリガンドは、それぞれ独立して抗原、抗体、リガンド、受容体、キレート、DNA、RNA、アプタマー、互いに特異的に結合する化学分子及びこれらの組み合わせで構成された群から選択されるものである、請求項20に記載のキット。
- 第1の金属粒子は、支持型脂質二重層上に固定され、第2の金属粒子は、標的物質を通じたA分子とB分子の連結不在時、支持型脂質二重層上で2次元的自由ブラウン運動(2-dimensional brownian motion)が可能であることを特徴とする、請求項20に記載のキット。
- 標的物質が存在する場合、A分子及びB分子と標的物質の結合により移動性が大きい第2の金属粒子が第1の金属粒子に接近して発生する第1の金属粒子の位置でプラズモン散乱信号の強度、波長、またはその両方の変化を測定するものである、請求項22に記載のキット。
- プラズモン散乱測定によるimax×mmax個の標的物質の定性的または定量的分析のための多重分析キットにおいて、(imax及びmmaxは、それぞれ下記に定義された変数i及びmの最大値であり、それぞれ独立して1以上の整数であり、imax=mmax=1を除く)、
前記多重分析キットは、
基材;前記基材上に配置され、脂質の一部または全部が二重層内で位置を移動可能な支持型脂質二重層;及び前記支持型脂質二重層の一部として、第Iiリガンドが結合された第Ii脂質及び第Mmリガンドが結合された第Mm脂質;を含む人工細胞膜(ここで、第Iiリガンド及び第Mmリガンドは、それぞれ互いに独立して同一または異なってもよい);
前記第Iiリガンドに特異的に結合する、第I’iリガンドを含む第Ii金属粒子として、第Iiリガンドと第I’iリガンドの結合を通じて1つ以上の第Ii脂質と結合された第Ii金属粒子;
前記第Ii金属粒子の表面上に結合され、標的物質の一部に特異的に結合するAi分子;
前記第Mm脂質それぞれ特異的に結合する第M’mリガンドを含む第Mmの金属粒子として、第Mmリガンドと第M’mリガンドの結合を通じて1つ以上の第Mm脂質と結合する第Mmの金属粒子;及び
前記人工細胞膜中、第Mmの金属粒子の表面上に結合され、標的物質のAi分子と結合しない他の部分に特異的に結合するBm分子を含み、
前記一連の第Ii金属粒子らは、互いに異なるプラズモン散乱波長を有し、一連の第Mmの金属粒子らも互いに異なるプラズモン散乱波長を有するものである、多重分析キット。 - 流体チャネルの特定の領域内に粒子を濃縮させる方法であって、
脂質の一部または全部が二重層内で位置移動可能であり、第1のリガンドが結合された第1の脂質を含む支持型脂質二重層を前記流体チャネルの内部に準備する段階;
前記第1のリガンドに特異的に結合する第2のリガンドを含む第1の粒子を前記支持型脂質二重層上に適用させる段階;及び
流体チャネルに流体の流れを適用し、第1の粒子を特定の領域内に移動させる段階を含む粒子濃縮方法。
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