JP2017105783A

JP2017105783A - Ｃｎｓ治療用のプロテオグリカン分解変異体

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Publication number: JP2017105783A
Application number: JP2017000133A
Authority: JP
Inventors: グルスキン、エリオット、エー．; Elliott A Gruskin; カッジアーノ、アンソニー、オー．; Anthony O Caggiano; ローイ、ガージ; Gargi Roy; ディソウザ、ロヒーニ; Rohini D'souza
Original assignee: Acorda Therapeutics Inc
Current assignee: Acorda Therapeutics Inc
Priority date: 2003-05-16
Filing date: 2017-01-04
Publication date: 2017-06-15
Anticipated expiration: 2024-05-17
Also published as: ES2616749T3; US20150299687A1; WO2004110360A2; JP2019030295A; JP5341808B2; MX348062B; US9528102B2; JP6100142B2; JP6867167B2; EP3514238B1; JP2014064580A; US20090041728A1; CA2525784A1; EP1631237A2; US7968089B2; JP6505379B2; US20140322192A1; EP2460881A1; US20110250631A1; US20090028829A1

Abstract

【課題】挫傷、外傷性脳損傷、脳卒中、多発性硬化症、上腕神経叢損傷、弱視、及び脊髄損傷等の中枢神経系の障害または疾患後の神経機能回復に対する組成の提供。【解決手段】ヒアルロニダーゼ等のコンドロイチン硫酸プロテオグリカンを分解するプロテオグリカン分解ポリペプチドと、可溶性ＮＯＧＯアンタゴニスト、神経細胞接着分子、神経栄養因子、成長因子、ホスホジエステラーゼ阻害剤、ＭＡＧまたはＭＯＧの阻害剤、ニューレグリン、再ミエリン化を促す抗体等の神経突起伸長を促進する分子とを有する組成物。【選択図】なし

Description

関連文献の相互参照
本明細書は、２００３年５月１６日に提出された米国仮出願番号第６０／４７１，２４０号（代理人整理番号１２７３０４．０１３００）、２００３年５月１６日に提出された米国仮出願番号第６０／４７１，２３９号（代理人整理番号１２７３０４．０１２００）、２００３年５月１６日に提出された米国仮出願番号第６０／４７１，３００号（代理人整理番号１２７３０４．０１４００）、２００３年５月１６日に提出された米国仮出願番号第６０／４７４，３７２号（代理人整理番号１２７３０４．０１７００）、及び２００４年５月１７日に本明細書と同時に提出された表題「ＣＮＳ治療に対する融合蛋白質」の米国特許出願明細書（米国特許出願番号［未定］、代理人整理番号１２７３０４．０１２０１）の利益と優先権を主張するものであり、これらの各引用文献の全体の内容は、この参考によって本明細書に組み込まれるものである。

コンドロイチン分解酵素は、中枢神経系などの広範な組織の細胞外基質成分であるプロテオグリカンの成分、つまりコンドロイチン硫酸に作用する細菌由来の酵素であり、例えば網膜とヒト眼の硝子体の間の接着を介在することができる。コンドロイチン分解酵素の例は、細菌プロテウス・ブルガリス（Ｐ．ｖｕｌｇａｒｉｓ）が産生するコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）、Ｆｌａｖｏｂａｃｔｅｒｉｕｍｈｅｐａｒｉｎｕｍが産生するコンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）である。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）とコンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）は、蛋白質−多糖類複合体の多糖類側鎖を分解することで機能し、蛋白質のコア部分は分解しない。

Ｙａｒｎａｇａｔａら（Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２４３：１５２３〜１５３５，１９６８）は、Ｐ．ｖｕｌｇａｒｉｓ抽出物からＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）などのコンドロイチン分解酵素を精製する方法について報告している。この酵素は、ｐＨ８においてコンドロイチンまたはヒアルロン酸を分解するよりも速い速度で、グルコサミノグリカンコンドロイチン−４−硫酸、デルタマン硫酸、コンドロイチン−６−硫酸（それぞれコンドロイチン硫酸Ａ、Ｂ、Ｃとも呼ばれ、プロテオグリカンの側鎖である）を選択的に分解する。前記分解生成物は、高分子量の不飽和オリゴ糖と不飽和二糖類である。しかし、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）は、ケラトサルフェート（ｋｅｒａｔｏｓｕｌｆａｔｅ）、ヘパリン、または硫酸ヘパリチンには作用しない。

コンドロイチン分解酵素の利用では、眼の神経網膜に接着している硝子体を急速に、特異的に非外科的に破壊することで、硝子体の除去を促すことが含まれる。

例えばＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）などのＰ．ｖｕｌｇａｒｉｓコンドロイチン分解酵素は、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分離すると、見かけの分子量が約１１０ｋＤａで移動する。ＳＤＳ−ＰＡＧＥの解像度でコンドロイチン分解酵素ＡＢＣが二重線に見えることが報告された（Ｓａｔｏｅｔａｌ．，Ａｇｒｉｃ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．５０：４，１０５７〜１０５９，１９８６）。しかし、この二重線は無傷のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣと９０ｋＤａの分解生成物である。市販のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣ蛋白質製剤は、この９０ｋＤａの分解生成物を様々な量で含み、さらに１８ｋＤａの分解生成物もコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）に由来する。

コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）もＰ．ｖｕｌｇａｒｉｓから単離、精製され、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）は９９０アミノ酸のポリペプチドで、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによる見かけの分子量が約１１２ｋＤａである。エレクトロスプレーとレーザー脱離質量分析で決定したその分子量は、約１１１，７７２ダルトンである。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）の等電点は８．４〜８．４５である。その酵素活性は、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）と異なるが、相補的である。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）は、プロテオグリカンを内側から溶解して（ｅｎｄｏｌｙｔｉｃａｌｌｙ）開裂し、最終産物の二糖類と、少なくとも他に２つの生成物を産生し、これらの生成物は四糖類のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）と考えられ、プロテオグリカンのコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）の消化でこれらの四糖類生成物を少なくとも１つ消化する。

成体哺乳類の中枢神経系（ＣＮＳ）に障害があると、軸索が再生することができず、永久に麻痺する可能性がある。障害による病変はグリア性瘢痕を生じ、これはコンドロイチン硫酸プロテオグリカン（ＣＳＰＧｓ）などの細胞外基質分子を含む。ＣＳＰＧはｉｎｖｉｔｒｏで神経組織の成長を阻害し、ｉｎｖｉｖｏではＣＳＰＧが豊富な領域で神経組織の再生ができない。

多数の分子とその特異的領域は、神経突起伸長とも呼ばれる、神経細胞からの神経突起の発芽を支持できると考えられた。前記神経突起という用語は、軸索と樹状突起構造の両方を指す。この神経突起の発芽プロセスは、特に身体的な障害または疾患が神経細胞を障害した後での、神経の発達と再生に重要である。神経突起は、すべての動物種の中枢および末梢神経系いずれにおいても、発達中は盛んに伸長する。この現象は軸索と樹状突起の両方に関係する。しかし、ＣＮＳにおける神経突起伸長は、動物の加齢と共に減弱する。

コンドロイチン分解酵素は、いくつかの脊髄損傷のｉｎｖｉｖｏモデルで機能的結果を改善する効果が示された。組み換え技術によって作られたコンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）とコンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）のポリペプチドは、アグリカンなど抑制基質関門のバリアを克服し、ラット皮質ニューロンの神経突起を伸長することで、ｉｎｖｉｔｒｏで効果を示した。

本発明者は、利用できる結晶構造に基づいた欠損解析から、コンドロイチン硫酸プロテオグリカン（ＣＳＰＧ）を分解することができる変異型ポリペプチドを発見した。これらの変異体すべての開裂活性は、基質としてアグリカンを用いた酵素電気泳動法によりｉｎｖｉｔｒｏでスクリーニングされた。アミノ末端とカルボキシ末端それぞれから５０アミノ酸、２７５アミノ酸が欠落し、蛋白質の全長７５ｋＤａに対し、分子量３８ｋＤａを有する、コンドロイチン分解酵素ＡＣの切断されたポリペプチド（ｎΔ５０−ｃΔ２７５）（配列ＩＤ番号：１１）は、酵素電気泳動法で検査した活性を保持する最小限のサイズであることが分かった。アミノ末端とカルボキシ末端それぞれから１２０アミノ酸が欠落し、蛋白質の全長５２ｋＤに対し、分子量２６ｋＤを有する、コンドロイチン分解酵素Ｂの欠損変異体（ｎΔ１２０−ｃΔ１２０）（配列ＩＤ番号：１７）は、酵素電気泳動法で活性を保持することが示された。分子のサイズと複雑性が減少することで、作用部位への拡散を促す可能性があり、長期的に治療に使用すると、免疫原性を低下させる可能性がある。これらのより小さなコンドロイチン分解酵素は、脊髄損傷の潜在的な治療法となる可能性がある。

本開示は、コンドロイチン分解酵素遺伝子の変異体、それに由来するポリペプチドと蛋白質、及び中枢神経系（「ＣＮＳ」）の障害または疾患後に神経性の機能的回復を促す方法におけるそれらの利用に関するものである。変異型遺伝子、ポリペプチド、及びそれに由来する蛋白質は、好ましくは成熟遺伝子またはポリペプチドの構造単位に欠損、置換、またはその組み合わせを含み、より好ましくは、前記変異型遺伝子またはポリペプチドは、成熟遺伝子またはポリペプチドの欠損変異体である。これらの変異型遺伝子またはポリペプチド、好ましくは生物学的活性は、様々な医薬組成物に利用される可能性がある。

コンドロイチン分解酵素ポリペプチドの変異体、例えばコンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）が、提供される。コンドロイチン分解酵素様の活性を持つ他の哺乳類酵素変異体は、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、ヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）、及び任意にＰＨ−２０（配列ＩＤ番号：３４）などの酵素をそれぞれ独立して含んでもよい。これらの欠損または置換変異体は、治療組成物および混合物として、単独で、またはコンドロイチン分解酵素または欠損または置換変異体と併用して使用されてもよい。さらに、これらの変異体、好ましくは、これだけに限らないが外傷性障害などのＣＮＳの損傷後に哺乳類で神経性の機能的回復を促すコンドロイチン分解酵素の欠損または置換変異体の使用法を提供する。

本発明の１つの実施形態は、プロテオグリカン分解分子の欠損および／または置換変異体であるポリペプチドのアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列から成る、及び好ましくはこれを有する単離核酸分子である。独立して、本発明の核酸分子は、コンドロイチン分解酵素の変異型プロテオグリカン分解ポリペプチド、例えばコンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、ヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）、または任意にＰＨ−２０（配列ＩＤ番号：３４）と、その組み合わせをコードするものである。好ましくは、前記核酸は、コンドロイチン分解酵素の欠損および／または置換変異体をコードし、最も好ましくは、前記核酸は、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩまたはＩＩポリペプチドをコードするものである。本発明は、上述した核酸配列に相補的なヌクレオチド配列から成る、及び好ましくはこれを有する核酸分子に関するものでもある。また、上述した核酸分子のいずれかと、少なくとも８０％、好ましくは８５％または９０％、より好ましくは９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一である拡散分子も提供される。さらに、厳密な条件下において上述した核酸分子のいずれかにハイブリダイズした核酸分子も提供されるものである。本発明は、これらの核酸分子を有する組換えベクター、及びそのようなベクターで形質転換した宿主細胞も提供するものである。

さらに、プロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損および／または置換変異体のアミノ酸配列から成る、及び好ましくはこれを有する単離ポリペプチドも提供される。独立して、プロテオグリカン分解酵素は、例えばＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）、プロテオグリカン分解酵素ＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、プロテオグリカン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、プロテオグリカン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、ヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）、また任意にＰＨ−２０（配列ＩＤ番号：３４）などのコンドロイチン分解酵素を含むことができる。好ましくは、前記ポリペプチドは、コンドロイチン分解酵素の欠損変異体である。医薬組成物は、これらのコンドロイチン分解酵素および／またはヒアルロニダーゼなどの変異型プロテオグリカン分解分子から調整することができ、前記組成物は、異なるプロテオグリカン分解ポリペプチドからの欠損および置換変異体を１若しくはそれ以上含むことができる。

本発明の１つの観点において、生物学的に活性なプロテオグリカン分解ポリペプチドが提供され、これは少なくとも１つのアミノ酸の欠損または置換を有するものである。前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドは、本明細書で示された酵素アッセイにより決定されたように、最小のサイズであるが、ある程度の活性を保持するものを含む。好ましいプロテオグリカン分解分子の欠損または置換変異体は、コンドロイチンを分解し、Ｎ末端から約１〜約１２０以上のアミノ酸、および／またはＣ末端から約１〜約２７５以上のアミノ酸で、１つ若しくはそれ以上のアミノ酸の欠損を有するものであり、より好ましくは前記欠損は、コンドロイチン分解酵素または置換コンドロイチン分解酵素に存在するものであり、さらに好ましくはコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ或いはＩＩまたは置換コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ或いはＩＩに存在するものである。

本発明の１つの観点は、神経突起の再生および／またはＣＮＳの可塑性を促す、および／またはプロテオグリカンの分解により組織への治療分子の拡散を促進または阻害する、プロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損および／または置換変異体、好ましくはコンドロイチン分解酵素ポリペプチドの欠損変異体である。

前記変異型分解ポリペプチド、好ましくはコンドロイチン分解酵素の欠損および／または置換変異体は、ＣＮＳの神経突起の再生を促し、および／またはプロテオグリカンの分解により組織への治療分子の拡散を促進または阻害してもよく、適切に修飾されたＤＮＡ配列の発現を介して得られる可能性がある。従って、本発明は適切な発現ベクターとそれに適合性を有する宿主細胞も提供している。

さらなる別の観点において、本発明は、薬学的に許容可能な担体との組み合わせで、プロテオグリカン分解分子の欠損および／または置換変異体の、および好ましくは前記コンドロイチン分解ポリペプチドの欠損または置換変異体の生物学的に活性なポリペプチドを含む医薬組成物を有する。

本発明のプロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損変異体および／または置換変異体を利用し、神経組織の神経突起の再生を促してもよい。これらの変異体は、他のＣＮＳ疾患の治療に有用であると考えられ、可塑性、再生、またはその両方に対して有益である可能性がある。例えば、ＣＮＳの障害と疾患には、挫傷、外傷性脳損傷、脳卒中、多発性硬化症、上腕神経叢損傷、弱視（ａｍｂｌｉｏｐｌｉａ）を含むと考えられるが、これだけに限らない。プロテオグリカンを分解する性質のために、通常はこれらを透過しない組織および細胞への治療組成物や診断薬の送達を促すために用いてもよい。或いは、組織に入れるために細胞外基質の一部を利用した、組織への治療組成物、診断薬、または細胞の浸透を抑制するために使用することもできる。完全長の酵素と比べサイズが小さいため、前記欠損および／または置換変異体は作成が容易で、標的細胞と組織への送達が容易である。このようなさらに小さなプロテオグリカン分解酵素の欠損または置換変異体を潜在的な治療薬として用いることができ、ＣＮＳ損傷の治療では免疫原性が低く、組織浸透能は同等若しくはより高い。

前記欠損変異体は、前記治療開発プロセスにおいて完全長の蛋白質以上に重要な利益をもたらす可能性がある。前記酵素の組織浸透は、著しく前記蛋白質の大きさの影響を受ける。組織浸透における蛋白質サイズの作用は予測が難しいが、サイズと荷電に依存する。浸透率は、組織の組成物、荷電の相互作用、水和効果に依存する。幅広いサイズの活性酵素があることで、最適な組織浸透作用に基づき、酵素の選択が可能と考えられ、おそらく効果的な濃度を最大限とするか、前記酵素への末梢曝露を限定するものである。

細菌蛋白質に対する哺乳類の免疫反応は、治療薬としての蛋白質またはポリペプチドを利用する能力を制限する可能性もあれば、制限しない可能性もある。前記蛋白質に対する抗体の生成は、反復曝露を制限し、蛋白質を治療薬として不活化しその効果がなくなる可能性がある。より小さな変異型プロテオグリカン分解酵素、好ましくは、変異型コンドロイチン分解酵素は、抗原部位を制限し、免疫反応を制限し、または少なくとも免疫原性を低下させる酵素の設計プロセスを簡素化する可能性がある。

しばしば徐放性製剤で使用される基質からの蛋白質放出速度は、サイズと架橋結合に依存する可能性がある。前記基質からプロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損変異体が効果的に放出される速度は、酵素のサイズを操作することを通じて設計される可能性がある。様々なサイズと荷電のコンドロイチン分解酵素のレパートリーを有することは、徐放性製剤の開発に重要な利益を与えるだろう。

図１（Ａ）は、コンドロイチン分解酵素Ｂの欠損ＮΔ１２０ＣΔ１２０変異体（配列ＩＤ番号：１７）の発現活性を示す抗Ｈｉｓ標識ウエスタンブロット（上）と酵素電気泳動像（下）を示している。図１（Ｂ）は、コンドロイチン分解酵素ＡＣ欠損ＮΔ５０ＣΔ２７５変異体（配列ＩＤ番号：１１）の発現活性を示す抗Ｈｉｓ標識ウエスタンブロット（上）と酵素電気泳動像（下）を示している。図２は、コンドロイチン分解酵素ＡＣ配列ＩＤ番号：５の全長に対する、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：６〜１１）の様々な欠損変異型ポリペプチドの相対的な基質分解活性を示している。図３（Ａ）は、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：６〜１１）の欠損変異型ポリペプチドの概略図を示しており、図３（Ｂ）は、ウエスタンブロット法によるコンドロイチン分解酵素ＡＣ欠損変異体の確認法を示している。図４は、（Ａ）ウエスタンブロットと（Ｂ）酵素電気泳動像によるコンドロイチン分解酵素ＡＣ欠損変異体（配列ＩＤ番号：６〜１１）の蛋白質発現と酵素活性の確認法を示している。図５は、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）の欠損変異型ポリペプチド（配列ＩＤ番号：１３〜１７）の概略図を示している。図６は、（Ａ）ウエスタンブロットと（Ｂ）酵素電気泳動像によるコンドロイチン分解酵素Ｂと欠損変異体（配列ＩＤ番号：1２〜１７）の蛋白質発現と酵素活性の確認法を示している。図７は、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ欠損変異型ポリペプチド（配列ＩＤ番号：２〜４）の概略図を示している。

本発明の組成物と方法を説明する前に、説明される特定の分子、組成物、方法論、またはプロトコールは様々である可能性があるため、本発明はこれらに限定されないことは理解されるものとする。前記説明に使用される用語は、特定の説明または実施例のみを説明することを目的としたもので、前記添付の請求項のみで限定される、本発明の範囲を限定する意図はないことも理解されることとする。

本文および添付の請求項に用いられるとおり、文脈が明確にそうでないことを示していない限り、単数形の「ａ」、「ａｎ」、「ｔｈｅ」は複数の言及も含めることにも注意して頂きたい。従って、例えば、「セル」という言及は１若しくはそれ以上のセルおよび当業者に周知の同等物などを言及している。それ以外に定義されているのではない限り、本文に用いられるすべての技術的、科学的用語は、通常の当業者の１人によって一般に理解されるものと同じ意味を有する。本文に説明したものと同様またはそれに相当するすべての方法および材料は、本発明の実施例を実行または検討するために用いることができるが、前記好適な方法、装置、材料が今回報告される。本文に述べたすべての文献は、参考文献に含められている。本明細書は、本発明が先願発明の長所によってそのような公開を予期する権利がないことを承認するものとして解釈されるものではない。

「任意」または「任意に」は、その後に記載された事象或いは状況が生じる若しくは生じないこと、及びその記載がその事象が起こる或いは物質が存在する場合及びそれが起こらない或いは物質が存在しない場合を含むことを意味している。

本開示の１つの観点は、かなり分子量が少ないが修飾されている、好ましくは野生型酵素と比べ、同等であるか優れたプロテオグリカン分解酵素の活性を有する欠損変異型酵素の作成に用いることができる、コンドロイチン変換酵素遺伝子の一連の欠損および／または置換変異体に関連するものである。前記欠損および／または置換変異体は、ポリメラーゼ連鎖反応により作成することができる。結果生じた変異体は発現され、次に前記変異型ポリペプチドの酵素活性は酵素電気泳動法で確認されうる。

前記プロテオグリカン分解分子の変異型を利用し、哺乳類のＣＮＳ損傷、特に外傷または疾患により生じた損傷を治療できる。特に、例えばＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）、ＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）などのコンドロイチン分解酵素のようなプロテオグリカン分解ポリペプチド分子の欠損変異体、またはヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、ヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）、また任意にＰＨ−２０（配列ＩＤ番号：３４）などのコンドロイチン分解酵素様活性を有する哺乳類酵素、またはこれらのいずれかの混合物を利用し、ＣＮＳ障害および疾患の治療に提供することができ、これには、これだけに限らないが、外傷性障害、外傷性脳損傷、脳卒中、多発性硬化症、上腕神経叢損傷、ａｍｂｌｉｏｐｌｉａ、脊髄損傷を含むものである。脊髄損傷には、自動車事故、転倒、打撲傷、射創、またその他の損傷によって引き起こされるニューロンの粉砕などの疾患および外傷を含む。本発明の方法の実行により、治療された哺乳類に臨床的利益を与えることができ、被験動物の運動協調性機能及び知覚の少なくとも１つにおいて臨床的に関連性のある改善を提供する。臨床的に関連性のある改善は、検出可能な改善から前記ＣＮＳの機能損傷または機能喪失の完全な回復まで幅がある可能性がある。

プロテオグリカン分解酵素変異体、例えばコンドロイチン分解酵素ＡＣの欠損変異体（配列ＩＤ番号：５）は、賦形剤を追加するか、凍結乾燥により安定化された酵素活性を有する可能性がある。安定剤には、炭水化物、アミノ酸、脂肪酸、界面活性剤が含まれると考えられ、当業者に周知である。例としては、スクロース、ラクトース、マンニトール、デキストランなどの炭水化物、アルブミン、プロタミンなどの蛋白質、アルギニン、グリシン、トレオニンなどのアミノ酸、ＴＷＥＥＮ（登録商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣ（登録商標）などの界面活性剤、塩化カルシウム、リン酸ナトリウムなどの塩、脂肪酸、リン脂質、胆汁塩などの脂質を含む。１：１０〜４：１の比で前記安定剤は前記プロテオグリカン分解ポリペプチド欠損変異体に、１：１０００〜１：２０の比で炭水化物はポリペプチド、アミノ酸ポリペプチドに、蛋白質安定剤はポリペプチドに、塩はポリペプチドに、また界面活性剤はポリペプチドに、１：２０〜４：１で脂質はポリペプチドに追加することができる。ヘパリナーゼ活性を用いた比較研究に基づいて、他の安定剤としては高濃度の硫酸アンモニウム、酢酸ナトリウム、または硫酸ナトリウムを含む。前記安定剤、好ましくは前記硫酸アンモニウムまたは他の同様の塩が０．１〜４．０ｍｇ硫酸アンモニウム／ＩＵ酵素の比で前記酵素に追加される。

前記プロテオグリカン分解変異型ポリペプチドは、組成物として製剤化され、被験動物または患者に局所性、局在性、または全身性に投与されてもよい。好ましくは、前記被験動物は、前記コンドロイチン分解酵素の１つなどのプロテオグリカン分解組成物を必要とする哺乳類、またさらに好ましくはヒトである。局所性または局在性投与は、適用をさらにコントロールするために利用される。１若しくはそれ以上のプロテオグリカン分解変異型ポリペプチドは、単独または併用で、投与前に適切な薬学的に許容可能な担体と混合される可能性がある。一般的に利用される薬学的担体および添加物の例は、従来の希釈液、結合剤、潤滑剤、着色料、崩壊剤、緩衝剤、等脹化剤、保存料、麻酔薬などである。利用できる具体的な薬学的担体は、デキストラン、血清アルブミン、ゼラチン、クレアチニン、ポリエチレングリコール、非イオン界面活性剤（ポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリオキシエチレン硬質ヒマシ油、ショ糖脂肪酸エステル、ポリオキシエチレンポリオキシエチレングリコートなど）、およびそれらと同等の化合物である。

プロテオグリカン分解ポリペプチドまたはそれを発現する核酸を有する本発明の組成物には、治療分子、診断薬、及び神経突起の伸長と再生を促す薬物を含んでもよい。診断分子の例には、蛍光プローブ、放射性同位体、色素、磁気造影剤を含んでもよいが、これだけに限らない。可塑性、神経突起伸長、及び再生を促す化合物には、ＮｇＲ_{２７−３１１}などの可溶性ＮＯＧＯアンタゴニスト、Ｌ１などの神経細胞接着因子、神経栄養因子、成長因子、ホスホジエステラーゼ阻害剤、及びＭＡＧまたはＭＯＧの阻害剤など神経突起の増殖抑制を克服するか、神経成長を促す分子を含んでもよいが、これだけに限らない。さらに、欠損変異体は、ニューレグリン（ＧＧＦ２）などの再ミエリン化を促す他の化合物および再ミエリン化を促す抗体と組み合わされてもよい。

神経系の可塑性は、すべてのタイプの機能的再構築を指す。この再構築は、発達、学習と記憶、及び脳の修復と共に生じる。可塑性と共に生じる構造変化には、シナプスの形成、シナプスの除去、及び神経突起の発芽を含んでもよく、既存のシナプスの強化または弱化を含むことさえある。再生に特徴的な断裂した路において軸索が広範にわたり成長することにより、再生は一般に可塑性と区別される。

本発明の前記プロテオグリカン分解分子の生物学的活性を利用し、組織におけるプロテオグリカンの分解率を制御することができ、例えば、過敏性組織の分解活性を遅くし、より厚い組織の蛋白質分解率を高くするように選択することができる。前記活性は、前記ポリペプチドまたはそれらを発現するために用いたベクターにおいて、１つ以上のアミノ酸の置換または欠損により制御されてもよく、前記活性は、成分中のプロテオグリカン分解ポリペプチドの濃度または組み合わせにより制御されてもよい。前記プロテオグリカン分解活性は、完全長のポリペプチドよりも高いか低くなるように作られてもよい。例えば、完全長のコンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）よりも低く作ることができ、図２に示す通り、完全長のポリペプチドの活性の半分よりも低く作ることができる。また、さらに図２に示されるとおり、前記プロテオグリカン分解活性は、完全長のコンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）よりも高く作ることができ、１．５以上の因数で完全長のポリペプチドよりも高い活性とすることができ、２．５以上の因数で完全長のポリペプチドよりも高い活性とすることができる。

典型的には、天然または野生型Ｐ．ｖｕｌｇａｒｉｓ菌株を利用し、通常の伸長条件でコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）、およびコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、及びこれら完全長のポリペプチドの変異体を作ることができる。Ｐ．ｖｕｌｇａｒｉｓの野生型株を導入し、唯一の炭素源としてコンドロイチン硫酸などの導入基質を提供することで、検出可能レベルのコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩとその変異体を作成することができる。

変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドを発現させるため、変異型核酸を用いることができる。前記発現されたポリペプチドまたは前記変異型核酸を利用し、哺乳類のＣＮＳ損傷、特に外傷または疾患により生じた損傷を治療することができる。特に、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣタイプＩなどのプロテオグリカン分解ポリペプチド分子を発現した欠損変異型核酸は、これだけに限らないが、クローン化コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：２２または２８）、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２６）、欠損変異型ＴＡＴコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ６０（配列ＩＤ番号：４３）の融合蛋白質を発現した核酸などを含んでもよく、Ｅ．ｃｏｉｌｉ中のこれらの遺伝子の変異型は、人工誘導因子を用いた不均一発現系を用いて発現させることができる。コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：２２または２８）、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：２６）、その変異型はＦ．ｈｅｐａｒｉｎｕｍからクローニングされ、Ｅ．ｃｏｌｉに発現される。

コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）などの完全長のプロテオグリカン分解酵素、またプロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損および／または置換は、多数の細菌および哺乳類発現ベクターでクローニングされうる。これらのベクターは制限なく、ｐＥＴ１５ｂ、ｐＥＴ１４ｂ、ｐＧＥＸ６Ｐ１、ｐＤＮＡ４ＨｉｓＭａｘ、またはｐＳＥＣＴａｇ２ｂを含む。本発明の前記欠損変異体と置換ポリペプチドは、コンドロイチンＣＳ、ＤＳなどのプロテオグリカンを分解する能力を示し、細胞や組織へ、また膜を貫通して拡散を促すことが予想される成熟酵素ポリペプチドよりもサイズと分子量が小さい。発現ベクターには、発現制御配列と操作可能に連結された変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドを発現した、拡散配列を含むことができる。操作可能に連結されたとは、発現制御配列とコード配列間の結合を指し、前記連結は前記コード配列の発現を発現調節配列によって調節できるようにするものである。

前記プロテオグリカン分解分子の天然型、置換および／または欠損変異型の性質は、前記蛋白質に様々な突然変異を導入することで変化させることができる。そのような変化は変異誘発技術を用いて適切に導入され、例えば、これだけに限らないがＰＲＣ変異誘発などがあり、前記変異型ポリペプチド分子は前記発現ベクターを用いて適切に合成される。

本発明の変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドは、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドのアミノ酸の欠損および／または置換を含む。好ましくは、前記欠損または置換は、２つの連続または離れたアミノ酸、ＮまたはＣ末端アミノ酸の欠損または置換、ポリペプチド内部のアミノ酸の欠損または置換を含む。前記欠損および／または置換は前記分子のアミノ酸で開始することができ、前記分子に２つの離れた欠損がある可能性がある。前記欠損または置換では変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドが生じ、これは前記変異型酵素よりも小さく、プロテオグリカン分解能力を保持しているものである。変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドは、別のポリペプチドと融合するか連結させることができる。ポリペプチドは、プロテオグリカン分解活性を有するすべての長さの変異型に対するアミノ酸配列を明白に含むように用いられ、翻訳時には最初ポリペプチドの一部であり、宿主の翻訳修飾により開裂されるシグナル配列の不足を含む可塑性を改善する。

本発明の変異型核酸は、成熟プロテオグリカン分解ポリペプチドを発現している遺伝子からのヌクレオチドの欠損および／または置換体を含む。ＤＮＡレベルでの欠損と置換の突然変異を利用し、前記コードされた蛋白質にアミノ酸置換および／または欠損を導入する。これらのヌクレオチドの欠損と置換を利用し、前記ポリペプチドの重要な配座または活性領域に欠損および／または置換を導入することができる。核酸断片は成熟プロテオグリカン分解ポリペプチドの全アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列よりも少ないヌクレオチドを有する核酸であるが、好ましくは成熟ポリペプチドをコードし、これは完全な長さの蛋白質の生物活性を一部保持し、例えば前記発現されたポリペプチド断片がプロテオグリカンの分解を誘導し、細胞および組織への治療薬の拡散を促し、または神経突起の再生を促す。他のポリペプチドと連鎖したプロテオグリカン分解ポリペプチドドメインのＮまたはＣ末端変異体をコードする遺伝子は、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドと結合した融合蛋白質を発現させるコンストラクトにも利用されうる。

本発明の欠損および／または置換変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドは、これらのポリペプチドの誘導体を含んでもよく、これは化学的または酵素的に修飾されているが、プロテオグリカンを分解する生物学的活性を保持する。これらの変異型のプロテオグリカン分解活性は、前記ポリペプチドを発現させるために用いたポリペプチドまたは核酸に対する欠損および／または置換によって制御されてもよい。前記成熟プロテオグリカン分解ポリペプチドまたは核酸の変異体、断片、または類似体およびこれらを発現させるために用いたベクターは、欠損、置換、またはその両方の組み合わせの１つ以上だけ、成熟ポリペプチドまたは核酸配列と異なる配列を有する変異型ポリペプチドおよび核酸を含み、前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドが生物学的活性を保持し、プロテオグリカンを分解することができ、好ましくはコンドロイチン硫酸プロテオグリカンを分解する。

遺伝子コードの縮重のため、変異型プロテオグリカン分解分子をコードする核酸配列と少なくとも８０％、好ましくは８５％または９０％、さらに好ましくは９５％、９６％、９７％、９８％、或いは９９％同一な配列を有する多数の核酸分子は、プロテオグリカン分解活性、および好ましくはコンドロイチン分解活性を有する変異型ポリペプチドをコードすることを、当業者は認識するだろう。さらに、変異体を変性させないそのような核酸分子では、妥当な数がプロテオグリカン分解活性を有する変異型ポリペプチドをコードすることがさらに認識される。これは（例えば、第１の脂肪族アミノ酸と第２の脂肪族アミノ酸を置換するなどの）ポリペプチド活性に有意に影響をもたらす可能性が低いか、その可能性がないアミノ酸置換は、プロテオグリカンを分解し、好ましくはコンドロイチンを分解するためである。

本発明に含まれる変異型には、前記核酸および／またはポリペプチド配列に対する個々の置換、欠損または付加を含む可能性がある。そのような変化により、コードされた配列に１つのアミノ酸または少ない割合のアミノ酸が変化、付加、または欠損する。変異型は「保存的に修飾された変異型」と呼ばれ、前記変化により化学的に類似なアミノ酸を有するアミノ酸置換が生じる。

本発明の欠損および置換変異型ポリペプチドの前記プロテオグリカン分解活性は、完全長のプロテオグリカン分解分子よりも低いか、ほぼ同様か、高いという発見は、別の考えられる利益をもたらすものである。前記プロテオグリカン分解分子を含む医薬組成物は、非経口、静脈内、皮下に投与されうる。前記ポリペプチドを封入し連続的に放出する生物分解性ポリマーから成るハイドロゲルの使用は、ハイドロゲルに封入された前記ポリペプチドの量によって制限される。特異的活性がより高いポリペプチドの欠損変異体を使用することは、モルを基本とし、活性基質の多くが同量で封入され、それによって連続投与の間の時間を長くする、または場合によっては反復投与を回避することを意味する。

発現後に得られたポリペプチドの精製は、使用される宿主細胞と発現コンストラクトに依存する。一般に、プロテオグリカンの欠損または置換変異体の精製は、ヒスタミン標識の利用など、完全長の天然ポリペプチドの精製と同様の方法で行われる可能性がある。

前記欠損または置換変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドと蛋白質は、ＣＳＰＧｓの分解に有効な量で投与される。前記ポリペプチドは、治療および診断組成物の拡散を補助するために利用され、さらに神経機能と神経突起伸長の回復を促すために利用され得る。前記組成物における変異型プロテオグリカン分解蛋白質またはポリペプチドが望みの程度まで精製されると、それらは、ＳＣＩ投与に対して、或いはアグリカンのような適切な基質におけるｉｎｖｉｔｒｏの神経突起伸長を促す組成物のスクリーニングアッセイに対して適切な生理学的担体または賦形剤に懸濁または希釈されてもよい。ＳＣＩモデルでは、ラットにおけるコンドロイチン分解酵素の有効なくも膜下腔投与が１４日間、隔日で約０．０６単位であった。７０キログラムのヒトに対する用量は、約１７単位と考えられる。約１００単位／ミリグラムでは、これが約１７０マイクログラムに相当する。２０単位までの用量はラットなどの哺乳類被験動物で安全であるように見える。組成物にはプロテオグリカン分解変異型ポリペプチド、好ましくは変異型コンドロイチン分解酵素ポリペプチド、さらにより好ましくは欠損変異型コンドロイチンポリペプチドを含んでもよい。これらの組成物には、他のプロテオグリカン分解分子とそれらの欠損および／または置換変異体、神経突起成長阻害剤の作用を遮断する分子、神経突起または軸索の接着、診断、治療、または融合タンパク質の一部として前記プロテオグリカン分解分子変異体を促進する分子を含んでもよい。前記混合物または融合蛋白質は担体または医薬品として認められる賦形剤に追加され、通常は被験動物１μｇ〜５００ｍｇ／ｋｇの範囲の濃度で注入されうる。前記薬物の投与はボーラス投与、静脈内投与、連続注入、インプラントからの持続的放出、または徐放性製剤により行うことができる。注入による投与は、筋肉内、腹膜、皮下、静脈内、くも膜下腔内に行うことができる。経口投与には錠剤またはカプセル剤を含んでもよく、好ましくは前記経口投与剤は１日１回または２回投与用の徐放性製剤である。経皮投与は、１日１回とすることができ、好ましくは１日１回未満の投与とする。前記ヒト患者または他の哺乳類被験動物に対する投与は、前記患者で自律神経系または運動神経系機能の測定可能な改善が達成されるまで継続してもよい。

これらを含む前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドまたは融合ポリペプチドは、遺伝的に修飾された細胞により、発現または分泌されてもよい。前記表現された欠損または置換プロテオグリカン分解ポリペプチドま或いは融合ポリペプチドは、治療組成物用に取り出し、精製してもよく、または前記遺伝的に修飾された細胞は、遊離状態またはカプセル剤として、ＣＮＳ障害またはその付近に、または前記治療分子または診断分子の制御された拡散が望ましい組織で移植される可能性がある。変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドを発現した変異型核酸は、置換コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩのポリペプチドであり、リーダーアミノ酸配列がないポリペプチドをコードしたコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：２２および２８）、コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：２１）の変異型ポリペプチドＮΔ１２０ＣΔ１２０をコードしたコンドロイチン分解酵素Ｂ核酸変異体（配列ＩＤ番号：２１）、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：１１）の変異型ポリペプチドＮΔ５０ＣΔ２７５をコードしたコンドロイチン分解酵素ＡＣ核酸変異型（配列ＩＤ番号：１９）などの限定のない実例で説明されている。融合核酸の例には、制限なく、ＴＡＴ欠損変異型コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ融合ＤＮＡコンストラクト（配列ＩＤ番号：４１）を含む。別の例は、発現されたポリペプチド（配列ＩＤ番号：４４）のＴＡＴ−コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ６０（配列ＩＤ番号：４３）の核酸であろう。

前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドが、ＣＳＰＧｓと共に細胞または組織に投与された場合、ＣＳＰＧｓの分解は、神経突起伸長を遮断する抑制分子を除去し、患部の神経突起の再生を可能にする。ＣＳＰＧの除去もＣＮＳの可塑性を促す。例えば、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、およびコンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）の完全長のポリペプチドは、それぞれＣＳとＤＳを分解し、その結果、不飽和硫酸二糖類を生じる。コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）は、ＣＳの多糖類の骨格において、Ｎ−アセチルガラクトサミンとグルクロン酸との間にある１，４グリコシド結合でＣＳを開裂する。開裂は、ランダムで内側から溶解する（ｅｎｄｏｌｙｔｉｃ）作用パターンでβ−除去を介して起こる。コンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）は、ＤＳの多糖類の骨格にある１，４ガラクトサミンイズロン酸結合を開裂する。ＣＳおよびＤＳの開裂は、これらの酵素メカニズムと哺乳類ＧＡＧ分解酵素を区別するβ−除去プロセスを介して起こる。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）は、ＣＳおよびＤＳの両方を開裂するエキソ−およびエンド−リアーゼである。グリア性瘢痕からＣＳとＤＳを除去すると、損傷部位への神経突起伸長再生が可能となり、可塑性を促す。例えば、図２に示されている前記プロテオグリカン分解分子、コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、様々な変異型コンドロイチン分解酵素ＡＣ（配列ＩＤ番号：６〜１１）は、様々な量でモデルプロテオグリカン基質を分解する。同様の結果が、図６におけるコンドロイチン分解酵素Ｂ（配列ＩＤ番号：１２）と実例となる変異体（配列ＩＤ番号：１３〜１７）でｉｎｖｉｔｒｏ酵素電気泳動により示されている。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）などのプロテオグリカン分解分子が外傷性脊髄損傷があるラットにおいて機能回復を改善し、脳組織へのモデル化合物の拡散を促すため、前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドおよびそれを含む組成物は、外傷性脊髄損傷があるラットなどの哺乳類被験動物で機能回復を改善させることもでき、脳組織へのモデル化合物の拡散を促すこともできると予想することが妥当である。

神経細胞の再生と患部ＣＮＳの可塑性回復により、運動神経系機能と感覚神経系機能を回復させることができる。臨床的に関連性のある改善は、検出可能な改善から神経機能の障害または損失の完全回復まで幅があり、個々の患者と損傷によって異なる。機能的な回復の度合いは、脊柱病変にコンドロイチン分解酵素を投与後、皮質脊髄路伝導の改善、テープ除去の改善、梁の歩行、格子の歩行、脚の置き方が改善することで証明されうる。機能改善の指標として、運動技術の改善、及び自律神経機能、すなわち、腸、膀胱、感覚、性機能も、機能的改善の指標として利用することができ、これは本発明の前記組成物における分子構造と構成成分に関連するものである。

プロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損または置換変異型のコードを含む一連のポリヌクレオチドは、鋳型としてプロテオグリカンの完全長のｃＤＮＡを利用して、ＰＣＲによって作成され、Ｅ．Ｃｏｌｉの発現に利用されるＮｄｅＩおよびＢａｍＨＩ部位で、ｐＥＴ１５ｂなどの発現ベクターへクローニングすることができる。イソプロピル−β−Ｄ−チオガラクトピラノシド（ＩＰＴＧ）の遺伝子発現を誘導後、前記細菌は超音波処理により溶解させ、ＴｒｉｔｏｎＸ−１１４／ＰＢＳなどの界面活性剤を用いて変異型ポリペプチドを同時に抽出することができる。組み換え型プロテオグリカン分解ポリペプチドの大部分が細菌細胞溶解物の細胞質分画に認められ、コンドロイチン分解酵素精製プロトコールを利用し、高い収率で高い活性の前記変異型プロテオグリカン分解酵素を得ることができる。このプロトコールは、Ｈｉｓ−タグ化変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドに選択的に結合する抗Ｈｉｓ抗体を有するカラムによる精製を含み、捕捉段階として陽イオン交換クロマトグラフィー、及び研磨段階としてゲル濾過を含むことができる。これらの段階の後、例えばＩｎｔｅｒｃｅｐｔＱ、ミリポア（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）に陰イオン交換膜濾過を利用し、エンドトキシンと宿主ＤＮＡの除去を行うことができる。濾過後、前記プロテオグリカン分解変異型ポリペプチドをｐＨ８．０の揮発性緩衝液に透析し、凍結乾燥することができる。前記最終生成物は、長期間保存では−７０で安定であると予想される。前記精製した塩基性プロテオグリカン分解変異型ポリペプチドのｐＩは、粗細胞溶解物からのサンプルＩＥＦ−ＰＡＧＥ分析により決定することができる。

様々な分析法は、プロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損または置換変異体の組み換え体の酵素活性を、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）のような完全長のプロテオグリカン分解分子、または市販されている形の前記酵素などの酵素活性と比較するために利用され得る。さらに、前記方法は、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドの一部を含む、融合蛋白質の活性を評価するように適合され得る。プロテオグリカンの分解により反応生成物が生産されることによる吸光度の変化を測定する、認められた分光光度法を利用し、特異的な活性測定を行ってもよい。サイズ排除クロマトグラフィーを利用し、前記変異型酵素の流体特性を比較することができる。

一種の酵素電気泳動法を利用し、前記成熟プロテオグリカン分解酵素を特徴付けることができ、前記成熟プロテオグリカン分解特性の特徴に適応させてもよい。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩなどのプロテオグリカン分解分子の基質であるアグリカン存在下で、ポリアクリルアミドゲルを重合させることができる。前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドの酵素サンプルは、ＳＤＳの存在下、電気泳動によりアグリカンを充填したゲル上で分解させてもよい。次に前記ゲルは、前記ＳＤＳが抽出でき、前記酵素が再び折り畳むことができる再生段階に適用することができる。前記再び折り畳まれた酵素は、活性を回復し、次に前記ゲル内でアグリカンを消化し、前記ゲルの部分に生じた炭水化物の喪失は炭水化物特異的な染色で可視化することができる。同様の前記ゲル内の炭水化物の喪失は、前記変異型プロテオグリカン分解分子の同等の活性体と濃度で予想されるだろう。遺伝子組み換えコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩの場合、その活性が酵素電気泳動像で明確なスポットとして可視化される可能性がある。前記酵素電気泳動法は前記分光光度的分析と一致している。

変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドによるＣＳＰＧ消化の結果、遊離される四硫酸二糖および六硫酸二糖（それぞれΔ４ＤＳおよびΔ６ＤＳ）を検出するため、ＨＰＬＣ法を利用してもよい。前記２種類の二糖類は、陰イオン交換クロマトグラフィーで効果的に分離することができる。クロマトグラムからΔ４ＤＳおよびΔ６ＤＳを定量化するＨＰＬＣアッセイでは、ＨＰＬＣに注入される量に比例した直線関係が得られると予想される。ＣＳＰＧ消化によるΔ４ＤＳおよびΔ６ＤＳの産生は、分光光度法で決定されるとおり、コンドロイチン分解酵素特異的な活性の量と直接関連する。このアッセイは、様々な基質の変異型プロテオグリカン分解ポリペプチド消化により放出されたΔ４ＤＳおよびΔ６ＤＳを、独立して定量する高感度の正確な方法として利用することができ、それらを含む変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドと融合蛋白質の活性を定量するためにも利用することができる。

変異型プロテオグリカン分解ポリペプチド活性を特徴付けるために実施することができる別の機能的アッセイでは、後根神経節（ＤＲＧ）のニューロンがアグリカン、または欠損または置換変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドで処理したアグリカンで培養される。アグリカンで培養されたニューロンは、培養皿および伸展した軸索に接着できなくなることが予想される。対照的に、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドで処理したアグリカンで培養されたニューロンは、組成物または融合ポリペプチドの一部として、前記表面または伸展したニューロンに接着することが予想される。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）で観察される広範な軸索の成長は、軸索の成長に対してより許容状態の基質を作るアグリカンの中心蛋白質で炭水化物が消化されるためと考えられる。

本発明の様々な観点が、以下の限定されない実施例を参照して理解されうる。

この机上の実施例は、組成物にプロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損または置換変異体を用い、細胞および組織への分子の拡散を示している。

成体ＳｐｒａｇｕｅＤａｗｌｅｙラットの脳は頭蓋から除去してもよく、半球を緩衝液のみまたは（配列ＩＤ番号：９）ＮΔ５０ＣΔ２００ＡＣ（Ｔ７４−Ｔ５００）蛋白質などの変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドを約３３Ｕ／ｍｌ含む緩衝液に２時間３７℃で浸してもよい。半球をすすぎ、直ちに７０％エタノール中のエオシンＹ（Ｓｉｇｍａ）またはコンゴレッド（Ｓｉｇｍａ）の飽和溶液などの染料につけることができる。一片の組織を切断し、画像をスキャナに取り込んでもよい。変異型プロテオグリカン分解分子のプロテオグリカン分解活性、および同型の組織への治療および診断分子の期待される浸透または拡散の指標として、前記脳組織への染料の浸透を利用してもよい。

この机上の実施例は、例えばプロテオグリカン分解ポリペプチドの欠損および／または置換変異体を含む、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩの欠損変異体または融合蛋白質など、変異型プロテオグリカン分解分子の活性を測定するために修飾されうる、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩのアッセイプロトコールを示している。

プロテオグリカン分解分子または融合蛋白質の触媒活性による反応生成物の産生は、波長２３２ｎｍでの前記プロテオグリカン分解生成物の吸光度測定により、決定することができる。典型的な反応混合物は、基質（５μｌの５０ｍＭコンドロイチンＣ（ＭＷ５２１）、コンドロイチン６ＳＯ４、またはデルマタン硫酸）および１．５μｌのコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）または（配列ＩＤ番号：２）などのコンドロイチン分解酵素の変異体と混合した、１２０μｌの反応混合物（４０ｍＭＴｒｉｓ、ｐＨ８．０、４０ｍＭ酢酸ナトリウム、０．００２％カゼイン）から成る。約１２０μｌの反応混合物アリコートは、３分以上３０〜３７℃で調整することができる。前記生成物の形成は、分光計を用い、２３２ｎｍの波長での時間の関数として、２３２ｎｍで吸光度の上昇としてモニターする。前記反応は０．１％ＳＤＳを加えて停止させ、その後５分間沸騰させてもよい。前記観察された活性は、前記反応で形成されたＣ４−Ｃ５二重結合のモル吸光計数を利用し、単位（１分当たりに生成した生成物のμｍｏｌｅｓ）に変換してもよい（３８００ｃｍ^−１ｍｉｎ^−１）。

前記反応生成物のモル吸光計数を知ることによって、０．００２％のカゼインおよび追加されたコンドロイチン基質と共に既知量のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）または他の変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドを１２０μｌの反応混合物に追加すると、経時的に２３２ｎｍの読み値で反応生成物の吸光度の変化を測定し、前記変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドの特異的活性をｕｍｏｌ／ｍｉｎ／ｍｇで決定することができる。これらの約４５０μｍｏｌｅ／ｍｉｎ／ｍｇのアッセイ条件で、Ｓｅｉｋａｇａｋｕのコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩには特異的活性がある。

コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：３７）などのプロテオグリカン分解分子はＣＮＳ組織に存在する軸索成長抑制コンドロイチンを消化し、外傷性脊髄損傷を有するラットで機能的回復を改善する。プロテオグリカン分解活性を示した（配列ＩＤ番号：１１）ＮΔ５０ＣΔ２７５ＡＣ（Ｔ７４−Ｔ４２６）ポリペプチドなどのプロテオグリカン分解分子変異体は、一部神経の再生を示し、可塑性を刺激し、組織への薬物の拡散に有用であると予想することは妥当である。前記投与方法、投与時期、用量を実行し、神経突起伸長と可塑性を促すことにより、前記ＣＮＳの障害の機能的回復を高める。（配列ＩＤ番号：１１）ＮΔ５０ＣΔ２７５ＡＣ（Ｔ７４−Ｔ４２６）蛋白質などのプロテオグリカン分解分子の欠損または置換変異体を投与すると、ＣＳＰＧｓの分解により組織中の抑制分子を除去することができ、これが薬物の拡散を遮断し、神経突起伸長を遮断し、神経突起の再生または患部への他の治療薬を促すと予想することは妥当である。患部ＣＮＳへの前記神経細胞の再生と可塑性により、運動機能と感覚機能を回復させてもよい。臨床的に関連性のある改善は、検出可能な改善から神経機能の障害または損失の完全回復まで幅があり、個々の患者と損傷によって異なる。

この実施例では、コンドロイチン分解酵素の欠損変異体が生物学的に活性であることを示している。

組み換え技術によって作られたコンドロイチン分解酵素ＡＣおよびＢは、アグリカンなどの抑制基質の境界関門を克服することでｉｎｖｉｔｒｏで効果を示し、ラットの皮質ニューロンの神経突起を拡張する。前記損傷部位への前述の酵素の効果的輸送を促すため、これらのコンドロイチン分解酵素の欠損変異体を調整し、ＣＳＰＧｓを分解することができる最小限のサイズのポリペプチドを決定した。これらの変異体すべての開裂活性は、基質としてアグリカンを用い、酵素電気泳動アッセイによりｉｎｖｉｔｒｏでスクリーニングされた。コンドロイチン分解酵素ＡＣの切断されたポリペプチド（ｎΔ５０−ｃΔ２７５）（配列ＩＤ番号：１１）は、アミノ末端およびカルボキシ末端からそれぞれ５０および２７５アミノ酸が欠損しており、完全長の蛋白質７５ｋＤａと比べ、分子量３８ｋＤａを有し、図４（Ｂ）の酵素電気泳動法で検討したとおりの活性を保持する、ほぼ最小限のサイズの変異型コンドロイチン分解酵素ＡＣであることが分かった。さらに、より小さい変異体でも、コンドロイチン分解酵素Ｂの欠損変異体（ｎΔ １２０−ｃΔ １２０）（配列ＩＤ番号：１７）は、アミノ末端とカルボキシ末端それぞれから１２０アミノ酸が欠損しており、完全長の蛋白質５２ｋＤａと比べ、分子量２６ｋＤａを有し、図６（Ｂ）の酵素電気泳動法でも活性を保持していることも示された。これらのさらに小さな欠損変異体は、前記変異型酵素と比べ、免疫原性が低く、同様または高い組織浸透能を有する潜在的治療薬として利用することができ、脊髄損傷の治療に利用することができる。

一連のコンドロイチン分解酵素ＡＣおよびＢの欠損変異体は、鋳型としてコンドロイチン分解酵素ＡＣおよびＢの完全な長さのｃＤＮＡを利用してＰＣＲで生成され、ＮｄｅＩおよびＢａｍＨＩ部位で、前記ｐＥＴｌ５ｂ発現ベクターへクローニングされた。検出および精製を簡単にするヒスチジン−タグにより、完全長の欠損変異体が作成された。これらのｃＤＮＡのそれぞれは、イソプロピル−β−Ｄ−チオガラクトピラノシド（ＩＰＴＧ）で誘導され、抗Ｈｉｓ抗体（Ｎｏｖａｇｅｎ）を用いたウエスタンブロット法により、前記発現が確認された。図３（Ａ）は、様々な非制限欠損変異体を概略的に示し、図３（Ｂ）は、抗ヒスチジン−タグのウエスタンブロット法によりこれらのコンドロイチン分解酵素ＡＣ変異型ポリペプチドの発現の確認法を示している。図５および６は、コンドロイチン分解酵素Ｂの欠損で同じ所見を示している。ウエスタンブロットは、予想されるサイズの蛋白質を示している。欠損変異体の酵素電気泳動ＰＡＧＥは、基質消化の強いバンド（左）を示し、炭水化物染色は陰性である。

酵素電気泳動法：ＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲルを注ぎ、アグリカン（８５μｇ／ｍｌ）をその中に重合させた。コンドロイチン分解酵素ＡＣおよびＢの欠損変異体の粗抽出物を３７℃で一晩反応、再生させた。分離後、前記ゲルを０．２％セチルピリジニウムで９０分間、室温でインキュベートした。前記コンドロイチン分解酵素による前記プロテオグリカンの消化は、０．２％ＴｏｌｕｄｅｎｅＢｌｕｅのエタノール−Ｈ_２Ｏ−酢酸（５０：４９：１ｖ／ｖ／ｖ）溶液を用いたゲルで３０分染色することで可視化し、エタノール−Ｈ_２Ｏ−酢酸（５０：４９：１ｖ／ｖ／ｖ）で脱染した。脱染後、前記ゲルを暗所で一晩５０μｇ／ｍｌＳｔａｉｎｓ−ａｌｌの５０％エタノール溶液でインキュベートし、Ｈ_２Ｏで脱染している。前記ゲルに明確なバンドがあることは、前記ＣＳＰＧのコンドロイチン分解酵素による炭水化物が消化され、中心蛋白質が未染色のまま残っていることを示している（図４および図６）。

この実施例では、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドに対するＨｉｓタグの連結について説明する。

前記変異体でＮ末端から特定数のアミノ酸が欠損し、プロテオグリカン分解活性を維持した、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ酵素の欠損変異体が作成されうる（配列ＩＤ番号：２〜４）。これらのＮ末端の欠損は、Ｎ末端に接着したヒスチジンタグを保存しているが、同様にタグ化した完全長のコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１）は、発現後、前記ヒスチジンタグを保存していなかった。

例えば、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩの触媒的に活性な欠損変異体は、図７で示した成熟ＡＢＣＩ蛋白質のＮ末端から、それぞれ２０および６０アミノ酸を欠損するように調整されうるが、これだけに限らない。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ６０−ＣΔ８０（配列ＩＤ番号：４）などのＮ末端およびＣ末端の欠損両方を持つ変異型ポリペプチドも作ることができる。

Ｎ末端融合キメラ蛋白質の作成に、これらのコンドロイチン分解酵素の欠損変異体および他のプロテオグリカン分解分子の変異体を利用してもよい。アッセイではコンドロイチンを分解するこれらの融合ポリペプチドにより検査し、これを利用して、前記基質特異性、基質の結合、組織浸透について、組成物と融合蛋白質中の成熟ＡＢＣＩと様々な欠損変異体の効果を決定することができる。変異型プロテオグリカンポリペプチドまたは融合ポリペプチドの活性を特徴付けるために実施することができる機能的アッセイには、これらを含む。この機能的アッセイでは、後根神経節（ＤＲＧ）ニューロンが、アグリカンまたは変異型プロテオグリカンポリペプチドまたは前記変異体を含む融合ポリペプチドで培養されうる。アグリカンで培養されたニューロンは、培養皿および伸展した軸索に接着できなくなることが予想される。対照的に、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドまたは前記変異体を含む融合ポリペプチドで処理したアグリカンで培養されたニューロンは、組成物または融合ポリペプチドの一部として、前記表面または伸展したニューロンに接着することが予想される。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：１または３７）などのコンドロイチン分解酵素で観察される広範な軸索の伸長は、軸索の成長に対してより許容状態の基質を作るアグリカンの中心蛋白質で炭水化物が消化されるためと考えられる。

この机上の実施例では、未変性の蛋白質構造を有するが、プロテオグリカン分解触媒活性がないコンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩの変異型について示している。

この変異型は、バイオアッセイおよびＳＣＩ試験のヌル（空値）またはネガティブコントロールとして調整されてもよい。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩの結晶構造に基づき、推定上の活性部位で触媒活性をノックアウトする、Ｈ５０１ａおよびＹ５０８ａ（配列ＩＤ番号：３６）に指定される部位特異的変異体を調整することができる。そのような変異体は、触媒活性とＳＥＣの不活化を検討され、野生型酵素と比較することができる。ヌル活性変体型を利用し、バイオアッセイおよび最終的にはＳＣＩ動物研究で利用するための様々なプロテオグリカン分解融合蛋白質のネガティブコントロールを提供することもできる。

この実施例では、本発明のポリペプチドからの置換および欠損の両方を含む、変異型プロテオグリカン分解ポリペプチドの例を示している。

コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ配列（配列ＩＤ番号：３７）は、開示された成熟コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩペプチドの配列であり、リーダー配列を含む。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ配列（配列ＩＤ番号：３７）は（配列ＩＤ番号：１または２９）と類似であるが、（配列ＩＤ番号：１）は（配列ＩＤ番号：３７）の最初の２５アミノ酸を有しておらず、（配列ＩＤ番号：３７）の１５４および１９５位のアミノ酸は、（配列ＩＤ番号：１）および（配列ＩＤ番号：３７）が一列になっている場合に同様の位置に見られるこれら（の置換）とは異なる。

（配列ＩＤ番号：３８〜４０）は、（配列ＩＤ番号：３７）ポリペプチドのＮまたはＣ末端と（配列ＩＤ番号：１）に対する置換による欠損体を示している。これらの変異型ポリペプチドは、ＮΔ２０（配列ＩＤ番号：３８）、ＮΔ６０（配列ＩＤ番号：３９）、およびＮΔ６０ＣΔ８０（配列ＩＤ番号：４０）である。

この実施例は、これだけに限らないが、ＨＩＶＴＡＴ蛋白質のポリペプチド部分などに対する膜の形質導入ポリペプチドと融合する本発明の変異型ポリペプチドの、限定されない実例を示している。前記融合ポリペプチドの完全な配列リストは、本明細書に含まれる配列リストで提供されている。

ＴＡＴ−コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ｎΔ２０のヌクレオチド配列（配列ＩＤ番号：４１）の一部が以下に示されており、コンドロイチン分解酵素ヌクレオチドと結合した部分に下線を引いてハイライトし、ＴＡＴ配列ヌクレオチドを示している。

前記核酸配列のこの部分の下線を引いたヌクレオチドは、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ２０核酸の５’に結合したＴＡＴ配列（配列ＩＤ番号：４７）を示している。

ＴＡＴ−コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ｎΔ２０（配列ＩＤ番号：４２）のアミノ酸配列の一部が以下に示され、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ２０（配列ＩＤ番号：２）のＮ末端に下線を引いてハイライトし、ＴＡＴ配列のアミノ酸を示している。

ＴＡＴ−ＡＢＣＩ−ＮΔ６０（配列ＩＤ番号：４３）のヌクレオチド配列の一部が以下に示され、下線を引いてハイライトしたＮ−末端ＴＡＴ（配列ＩＤ番号：４９）ヌクレオチドを示している。

ＴＡＴ−ＡＢＣＩ−ｎΔ６０（配列ＩＤ番号：４４）のアミノ酸配列の一部を以下に示し、コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ−ＮΔ６０（配列ＩＤ番号：３）のＮ末端で下線を引いてハイライトしたＴＡＴ配列（配列ＩＤ番号：５０）を示している。

ＡＢＣＩ−ＴＡＴ−Ｃ（配列ＩＤ番号：４５）のヌクレオチド配列の一部が以下に示され、下線を引いてハイライトしたＣ−末端ＴＡＴ配列ヌクレオチドを示している。コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：２８）のストップコドンをＴＡＴ配列と置き換え、ＴＡＴ配列の３’末端で置き換えた。

ＡＢＣＩ−ＴＡＴ−Ｃ（配列ＩＤ番号：４６）のアミノ酸配列の一部を以下に示し、成熟コンドロイチン分解酵素ＡＢＣＩ（配列ＩＤ番号：1）のＣ末端でコンドロイチン分解酵素ポリペプチドと結合したＴＡＴ配列を下線を引き、ハイライトして示している。

この実施例は、コンドロイチン分解酵素の核酸とポリペプチドの配列を示しており、本発明の変異型で欠損または置換に用いてもよい。これらの配列では、ヌクレオチドレベルおよびアミノ酸レベルの両方で、発表された配列との不一致が太字でハイライトされている。これらは本発明の置換の実例である。

前記ヌクレオチドレベルの不一致である太字部分は、前記アミノ酸レベルで９８．３％同一であり、前記置換された残りは以下に太字でマークされている。

前記アミノ酸レベルでの配列同一性が以下に示されている。

本発明は、特定の好ましい実施形態を参照することによって、考えられる詳細を記載したが、他のバージョンも可能である。従って、添付された請求項の要旨と範囲は、この記載によって限定されるべきではなく、好ましいバージョンが本明細書に含まれるべきである。

Claims

プロテオグリカン分解ポリペプチドの変異体をコードする配列を有する単離された核酸を有する組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、またはヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）の変異体である、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）の変異体である、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）の変異体である、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）の変異体である、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸の配列は、プロテオグリカン分解ポリペプチドの変異体をコ―ドする核酸配列と少なくとも８０％同一である、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、中枢神経系の組織でプロテオグリカンを分解するポリペプチドをコードするものである、組成物。
請求項１記載の組成物において、前記核酸は、コンドロイチン硫酸プロテオグリカンを分解するポリペプチドをコードするものである、組成物。
発現調節配列と操作可能に連結した請求項１記載の核酸を有する発現ベクター。
請求項１記載の組成物において、さらに細胞を含むものである、組成物。
生物学的に活性なプロテオグリカン分解ポリペプチドの変異体をコードする配列から成る単離核酸を有する組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、またはヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）の変異体である、組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）の変異体である、組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）の変異体である、組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、プロテオグリカン分解ポリペプチドをコードするものであり、これはコンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）の変異体である、組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、中枢神経系の組織でプロテオグリカンを分解するポリペプチドをコードするものである、組成物。
請求項１１記載の組成物において、前記核酸は、コンドロイチン硫酸プロテオグリカンを分解するポリペプチドをコードするものである、組成物。
請求項１１記載の組成物において、さらに細胞を含むものである、組成物。
生物学的に活性なプロテオグリカン分解ポリペプチドの変異体のアミノ酸配列を有するポリペプチドを有する組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、またはヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）の変異体である、組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）の変異体である、組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）の変異体である、組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：２７）の変異体である、組成物。
（配列ＩＤ番号：２）、（配列ＩＤ番号：３）、または（配列ＩＤ番号：４）である請求項１９記載のプロテオグリカン分解ポリペプチドの組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記ポリペプチドは、前記中枢神経系の組織でプロテオグリカンを分解するものである、組成物。
請求項１９記載の組成物において、前記ポリペプチドは、コンドロイチン硫酸プロテオグリカンを分解するものである、組成物。
請求項１９記載の組成物において、さらに細胞を含むものである、組成物。
請求項１９記載の組成物および薬学的に許容可能な賦形剤。
請求項１９記載の組成物であって、さらに、神経突起伸長阻害剤の作用を遮断する分子、神経突起の接着を促す分子、診断用分子またはこれらの組み合わせを含む、組成物。
組織を治療する方法であって、前記組織にプロテオグリカン分解ポリペプチドの変異体組成物を投与する工程を有し、前記組織はプロテオグリカン分子を含み、前記組成物は組織におけるプロテオグリカンの少なくとも一部を分解する、方法。
請求項３０記載の方法において、前記組織は、ＣＮＳからのものである、方法。
請求項３０記載の方法において、前記プロテオグリカンの分解は、組織への分子の拡散を促すものである、方法。
請求項３０記載の方法であって、さらに、外傷性脊髄損傷の組織を同定する行為を有する、方法。
請求項３０記載の方法において、前記組成物は、神経突起の再生を促すものである、方法。
請求項３０記載の方法において、前記組成物はさらに、神経突起成長阻害剤の作用を遮断する分子、神経突起の接着を促す分子、診断用分子またはこれらの組み合わせを含むものである、方法。
請求項３０記載の方法において、前記神経系の可塑性は改善されるものである、方法。
請求項３０記載の方法において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）、ヒアルロニダーゼ１（配列ＩＤ番号：３０）、ヒアルロニダーゼ２（配列ＩＤ番号：３１）、ヒアルロニダーゼ３（配列ＩＤ番号：３２）、またはヒアルロニダーゼ４（配列ＩＤ番号：３３）の変異体である、方法。
請求項３０記載の方法において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：１）、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩＩ（配列ＩＤ番号：２７）、コンドロイチナーゼＡＣ（配列ＩＤ番号：５）、コンドロイチナーゼＢ（配列ＩＤ番号：１２）の変異体である、方法。
請求項３０記載の方法において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：1）の変異体である、方法。
請求項３０記載の方法において、前記プロテオグリカン分解ポリペプチドは、コンドロイチナーゼＡＢＣタイプＩ（配列ＩＤ番号：２７）の変異体である、方法。
（配列ＩＤ番号：２）、（配列ＩＤ番号：３）、または（配列ＩＤ番号：４）である請求項３０記載のプロテオグリカン分解ポリペプチド。
プロテオグリカンを分解する精製コンドロイチナーゼ変異型ポリペプチド。