JP2014525040A - 網赤血球の同定および測定 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、以下の米国仮出願:2011年7月22日に出願された米国仮出願第61/510,614号、および2011年7月22日に出願された米国仮出願第61/510,710号に対して米国特許法第119条(e)に基づく優先権を主張するものである。上述の出願のそれぞれの内容は参照によりその全体が本明細書中に組み込まれる。
本開示は、血液を含む生物学的サンプル中、および血液を模倣するようにデザインされる精度管理組成物中の網赤血球の同定、カウント、および特性の測定に関する。
網赤血球は典型的には、成熟赤血球細胞を含む他の細胞型中よりも網赤血球中により高い濃度で存在するリボソームRNAのネットワークを含む。アズールBおよびメチレンブルーなどの特定の染色が網赤血球に適用される場合、染色剤はRNAと結合する。顕微鏡検査下において、染色されたRNAは、容易に視認され得、そして、網赤血球は成熟赤血球細胞と比べて、わずかにより青く、そして大きく見える。染色されたRNAの量は、他の細胞型から網赤血球を識別するために使用され得る一つの基準である。
本明細書中に開示されるシステムおよび方法は、サンプル(例えば、顕微鏡スライド上に配置され、そして続いて固定剤および染色剤を用いる自動化された顕微鏡イメージングのために調製される)中の細胞の画像を獲得し、そして、細胞画像の中から網赤血球を同定および定量する。図2は、このような画像中の網赤血球を同定するための様々な工程を含むフローチャート200を示す。第一の工程202において、代表的な赤血球細胞のセットが、一またはそれ以上の獲得されたサンプル画像において、白血球細胞、赤血球細胞、血小板、ならびに、細胞性および非細胞性アーチファクトの全てから特定される。次の工程204において、網赤血球が、代表的な赤血球細胞のセットにおいて同定される。その後、任意的には工程206において、網赤血球容積などの網赤血球の特徴および基準、ヘモグロビンなどの網赤血球成分の量、および網赤血球の幾何学的パラメータが、工程204においてその位置が示された網赤血球に基づいて決定され得る。プロセスは工程208で完了する。フローチャート200中の各ステップが以下により詳細に記載される。
上記で説明されるように、血液サンプル中の網赤血球を同定するための第一の工程は、一またはそれ以上の獲得されたサンプル画像における、白血球細胞、赤血球細胞、血小板、ならびに、細胞性および非細胞性アーチファクトの全てからの代表的な赤血球細胞のセット(その中で網赤血球が小集団を形成している)の同定である。この工程は、副題「(ii)代表的な赤血球細胞のセットの同定」のもと、より詳細に記載され、そして、赤血球細胞、白血球細胞、および血小板を含むサンプルの画像から赤血球細胞を同定するための、一またはそれ以上の特徴測定およびアーチファクト除去技術を含み得る。代表的な赤血球細胞のセットが同定された後、網赤血球が代表的な赤血球細胞から、赤血球細胞のセットのそれぞれの要素のさらなる分析によって同定される。網赤血球は未成熟な赤血球細胞であるため、他の細胞型(例えば白血球、血小板など)から、サンプル中の赤血球細胞を区別する方法は、網赤血球および成熟赤血球細胞両方を一緒に、代表的な赤血球細胞のセットとして同定し得る。網赤血球の位置を示す工程は、代表的なセットの中の網赤血球と他のより成熟した赤血球細胞とを区別する工程を含む。
である場合に、網赤血球として同定され得る。色および面積カットオフ値はともに、典型的には、代表的な赤血球細胞中での色および面積の分布内の特異的なパーセンタイルマーカーに対応する。網赤血球は、一般的には、成熟赤血球細胞と比較してスペクトルの青色面積においてより弱い吸収しかもたないので、カラーカットオフ値Cカットよりも小さい色Cである細胞は、網赤血球である可能性が高い。さらに、網赤血球は成熟赤血球細胞よりも大きいため、面積カットオフ値Aカットよりも大きな面積Aをもつ細胞は、網赤血球である可能性が高い。両方の条件を満たす細胞を網赤血球と同定するだけで、網赤血球は、代表的な赤血球細胞のより大きなセット内で高い正確性をもってその位置が示され得る。
CオフセットおよびAオフセットは、それぞれ、色および面積オフセット値である
で表され得る。図3は、代表的な赤血球細胞のセットから網赤血球の位置を示すために使用される色カットオフ値Cカットを示すヒストグラムである。図3Aにおいて、全ての代表的な赤血球細胞からの色パラメータCの分布値390が示されている。色パーセンタイルマーカーC%がまた、分布内に示されている。網赤血球は成熟赤血球細胞に比べて典型的にはより小さい色値を有しているため、色オフセット値Cオフセットは、負の値であり、色パーセンタイルマーカーと比較してより小さい色カットオフ値Cカットをもたらす。分布における網掛け領域392は、その色カットオフ値に基づき網赤血球として同定される赤血球細胞に対応する。
σy、σg、およびσbは、カットオフ値の標準偏差である
である場合、関連し合うピクセルのセットを有する細胞は、アーチファクトとして除去され得る。一般的に、適切な標準偏差カットオフ値は、上述のように、訓練データの分析から、および/または過去のデータ(例えば、細胞画像の以前の分析からのデータなど)から決定され得る。いくつかの実施態様において、例えば、適切な標準偏差カットオフ値は、σy=0.1、σg=0.099、およびσb=0.058である。これらの値は、サンプルの性質、染色手順、およびイメージング条件によって変化し得る。例えば、ある実施態様において、適切な標準偏差カットオフ値は、σy=0.079、σg=0.085、およびσb=0.060である。
図2に戻って、フローチャート200の第一の工程202は、本明細書中で開示されるシステムおよび方法を用いて獲得されるサンプルの画像(複数の画像)における細胞のあいだから、代表的な赤血球細胞のセットを同定する工程を含む。工程204における網赤血球の同定は、代表的な赤血球細胞のセットがサンプルの画像から同定された後に起こり、したがって、代表的な赤血球細胞のセットは典型的には成熟赤血球および網赤血球を含んでいる。その後、任意的な工程206において、一またはそれ以上の特徴および基準が、例えば、網赤血球のヘモグロビン測定などにより決定される。この開示の目的のため、網赤血球の特徴および基準の決定が別個の工程206として示されている。しかしながら、いくつかの実施態様において、例えば面積、周囲長、および形などのいくつかの網赤血球の特徴および基準は、工程202の一部分(例えば、代表的な赤血球細胞のセットの同定など)として測定される。この、代表的な赤血球細胞のセットを同定する工程202は、ここで、以下により詳細に記載されるであろう。
図2に戻って、代表的な赤血球細胞のセットが工程202において同定され、そして工程204において網赤血球の位置が示され(そして任意には、赤血球細胞からカウントされ)た後、一またはそれ以上の網赤血球の基準および特徴が任意には工程206において決定され得る。上記で説明されるように、網赤血球の面積、形、周囲長、サイズ、および任意には密度などを含むいくつかの網赤血球の特徴が、工程202のあいだに、代表的な赤血球細胞のセットを同定しつつ、決定され得る。これらの特徴はまた、工程206においても決定され得る。加えて、網赤血球と関連付けられる他の特徴および基準が工程206において決定され得る。例えば、本明細書中で開示されるシステムおよび方法は、網赤血球の、容積などの基準、および、ヘモグロビン含有量などの成分値を計算するための網赤血球の画像特徴の組合せを使用し得る。組み合わせとしては典型的には、発明者らが、正確な再現性のある結果を多種多様のサンプルに対してもたらすことを発見した、そのような網赤血球の特徴の線形結合が挙げられる(しかし、これらに限定されるわけではない)。
OD平均(c)は、網赤血球が色cの光で照射された場合の網赤血球の画像中のピクセルの平均光学濃度である
にしたがって決定され得る。網赤血球の画像が、異なる照射波長で得られている場合、IOD(c)の値は、それぞれの照射波長での網赤血球に対して計算され得る。図7は、色cの照射光を用いて得られた、フローチャート420に関連して記載されるプロセスを通じて同定される代表的な網赤血球700の概略イメージを示す。網赤血球700の画像は、複数のピクセルを包含する。網赤血球700におけるピクセルの平均光学濃度、OD平均(c)は、画像中のピクセルの数で割られた図7におけるピクセル強度の和に対応する。
OD最大は、網赤血球のピクセルと関連付けられるすべての光学濃度の中の最大光学濃度である
により見積もられ得る。したがって、例えば、網赤血球700の画像中のピクセル720は、ピクセル710に関連付けられる最大光学濃度よりも小さい光学濃度を有する。例えばピクセル720の網赤血球700への寄与は、比OD720/OD最大であり、ここで、OD720はピクセル720の光学濃度であり、そして、OD最大は、ピクセル710の光学密度である。その後、色特異的網赤血球容積Vが、ピクセル光学濃度の、網赤血球700中の全てのピクセルの最大光学濃度に対する比を合計することによって以下のように計算される:
によって決定され得る。計算された色特異的網赤血球容積Vol(c)は、適切な単位(例えばフェムトリットル)で網赤血球容積を表すために基準化され得る。
積分光学濃度IOD(c)および容積Vol(c)など)が、サンプル画像を得るために使用された照射光のそれぞれの色について決定され得る。例えば、4つの異なる照射光の色が使用される場合、合計で8つの異なる特徴が、代表的なセットから同定されるそれぞれの網赤血球において決定され得る。加えて、上記で説明されるように、個々の網赤血球の面積Aは、網赤血球の画像から決定され得る。色特異的積分光学濃度および網赤血球容積、および網赤血球面積は、その後それぞれの網赤血球において様々な基準を計算するために使用され得る。
によって決定され得る。例えば、4つの異なる照射波長が網赤血球の画像を得るために使用される場合(例えば赤=r、黄色=y、緑=g、および青=b)、網赤血球の容積Vは、以下の式:
式(14)〜(17)において、照射光の4つの色(赤色、黄色、緑色、および青色)が、サンプルを照射するために使用され、そして、積分光学濃度および網赤血球容積がこれらの色のそれぞれに対応する画像から計算される。色特異的積分光学濃度値および容積を計算するために使用される照射波長は、例えば、635nm、598nm、525nm、415nmであり得るが、電磁スペクトルの赤色、黄色、緑色、および青色領域内の他の値が他の実施態様において使用されてもよい。より一般的には、種々の数の照射波長が使用され得、そして、それぞれの照射波長に対応する画像が得られ、そして、積分光学濃度および/または網赤血球容積の色特異的値を計算するために使用され得る。例えば、いくつかの実施態様において、3つの異なる波長の光が、サンプルを照射するために使用される。ある実施態様において、4つより多くの数の波長(例えば、5つの波長、6つの波長、7つの波長、8つの波長、10の波長など)の照射光が使用され得、そして、色特異的積分光学濃度、細胞容積、および重み係数が照射波長のいくつかまたは全てにおいて決定され得る。一般的には、照射光の波長は、異なる波長のそれぞれにおけるそれぞれの画像がサンプルについての異なる情報を含むように選択され得る。例えば、サンプルが3つのスペクトル寄与因子を含んでいれば、照射光の3つの波長は、3つの波長のそれぞれがスペクトル寄与因子のうちの異なる一つによって最も強く吸収されるように使用されるために選択され得る。
ある実施態様において、同定された網赤血球、決定された網赤血球容積、成分量、平均網赤血球容積、および/または平均成分濃度は、例えばディスプレイ110などを用いてシステムオペレータに示され得る。容積および成分結果は、一赤血球あたりで表示されてもよく、また、全体のサンプルに対する平均された結果として表示されてもよい。また、計算された数値結果(例えば個々の網赤血球に対する)は、一またはそれ以上の網赤血球画像上に重ねられ得る。一般的に、システムオペレータは、ヒューマンインターフェースユニット112(例えば、キーボードおよび/またはマウスおよび/または他の任意の入力装置など)を使用して、結果が表示される方法を制御し得る。システムオペレータはまた、インターフェースユニット112およびディスプレイ110を介して、他の任意のパラメータ、条件および本明細書中で開示される方法と関連付けられるオプションを制御し得る。
本明細書中に開示されるシステムおよび方法は、様々な種々の自動化されたサンプル調製システムとともに使用され得る。図8は、自動化されたサンプル調製システム800の実施態様の概略図を示す。システム800は、基板を保管するため、サンプルを基板上にサンプルを配置するため、基板上に調製されたサンプルを検査するため、および調製されたサンプルを保管するための複数のサブシステムを備える。
本明細書中に開示される方法の工程および手順は、ハードウェア中またはソフトウェア中で、または両方の組合せ中で実行され得る。具体的には、電子プロセッサ114は、上述の任意の方法を行うためのソフトウェアおよび/またはハードウェア命令を備え得る。方法は、本明細書中に開示される方法の工程および図にしたがい標準のプログラミング技術を用いてコンピュータプログラム内に実装され得る。プログラムコードは、本明細書中に記載される機能を実行するためにデータをに適用される。出力情報は、例えばプリンタ、またはディスプレイ装置、またはウェブサイトにアクセス可能なコンピュータモニター上のウェブページなどの一またはそれ以上の出力装置へ、例えば遠隔モニタリングのためなどに適用される。
前述の記載は、例示を目的とするものであって、添付のクレームの範囲によって規定される開示の範囲を限定する意図はないことが理解されるべきである。他の態様、有利性、および改変は、以下のクレームの範囲内にある。例えば、先述の記載および図1における略図は、サンプルからの透過光の測定について説明しているものであるが、本明細書中に開示されている方法およびシステムはまた、サンプルの画像がサンプルからの屈折光に対応する場合にも使用され得る。あるサンプルは自然に反射性であるか、または、例えば反射光が細胞成分および/または容積の量を決定するために有用な方法を提供するような、反射マーカーを用いてタグ化されてもよい。いくつかの実施態様において、サンプル104は、反射コーティングを適用された例えば顕微鏡スライドなどの基板の上に配置され得る。反射コーティングは、一旦透過した光を二回目にサンプルを通って戻すように導き得るので、測定される「反射」光が、サンプルを二回透過させられた入射光に正確に相当する。
Claims (42)
- 2つの異なる波長の入射光を用いてサンプルを照射し、前記波長のうちの第一の波長に対応する、サンプルの2次元画像を得、および、前記波長のうちの第二の波長に対応する、サンプルの2次元画像を得る工程、
代表的な赤血球細胞のセットを同定するために画像を分析する工程、
前記セットの中の赤血球細胞のそれぞれの面積を決定する工程、
前記セットの中の赤血球細胞のそれぞれの明度を決定する工程、および
前記セットの中の一つ一つの赤血球細胞において、赤血球細胞の面積が面積カットオフ値を超えており、かつ、赤血球細胞の明度が明度カットオフ値よりも小さい場合に、赤血球細胞を網赤血球と同定する工程
を含む、基板上に配置された血液サンプル中の網赤血球を同定するための方法であって、
前記一つ一つの赤血球細胞の明度が、前記2つの照射波長における赤血球細胞の光学濃度値のあいだの差異を含んでいる方法。 - 前記波長の一つが、400nm〜475nmのあいだであり、および、他の波長が、575nm〜600nmのあいだである請求項1記載の方法。
- 前記同定された赤血球細胞のそれぞれの明度を決定する工程が、一つ一つの赤血球細胞において、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定する工程、
前記ピクセルのセットのうちの一つ一つにおいて第一の波長に対応する光学濃度を決定する工程、
前記ピクセルのセットのうちの一つ一つにおいて第二の波長に対応する光学濃度を決定する工程、
前記ピクセルのセットにおいて第一の波長に対応する平均光学濃度を決定する工程、
前記ピクセルのセットにおいて第二の波長に対応する平均光学濃度を決定する工程、および
細胞の明度を決定するために、前記平均光学濃度のあいだの差異を計算する工程
を含む請求項1記載の方法。 - 前記セットの中の赤血球細胞のそれぞれの面積を決定する工程が、一つ一つの赤血球細胞において、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定する工程、および
前記セットの中のピクセルの数をカウントすることによって細胞の面積を決定する工程
を含む請求項1記載の方法。 - 前記セットの中のそれぞれの赤血球細胞の面積を決定する工程が、一つ一つの赤血球細胞において、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定する工程、
前記ピクセルのセットの周囲を取り囲む多角形を決定する工程、および
前記多角形の面積を計算することによって細胞の面積を決定する工程
を含む請求項1記載の方法。 - 前記明度カットオフ値が、赤血球細胞の明度の分布のパーセンタイルに基づいている請求項1記載の方法。
- 前記パーセンタイルが、赤血球細胞の明度の分布内の70パーセンタイルに対応する請求項6記載の方法。
- 前記明度カットオフ値が、パーセンタイルと明度オフセット値との和に対応する請求項6記載の方法。
- 網赤血球の数が既知である訓練データのセットを基準として、前記パーセンタイルおよび前記明度オフセット値を決定する工程をさらに含む請求項8記載の方法。
- 前記面積カットオフ値が、赤血球細胞の面積の分布のパーセンタイルに基づいている請求項1記載の方法。
- 前記パーセンタイルが、赤血球細胞の面積の分布の20パーセンタイルに対応する請求項10記載の方法。
- 前記面積カットオフ値が、パーセンタイルおよび面積オフセット値の和に対応する請求項10記載の方法。
- 網赤血球の数が既知である訓練データのセットを基準として、前記パーセンタイルおよび前記面積オフセット値を決定する工程をさらに含む請求項12記載の方法。
- 前記2つの波長のうちの1つの波長における、赤血球細胞に関連付けられるピクセルの光学濃度の標準偏差が、カットオフ値よりも大きい場合に、前記代表的なセットから赤血球細胞を除外する工程をさらに含む請求項1記載の方法。
- 前記2つの波長とは異なる波長における、赤血球細胞に関連付けられるピクセルの光学濃度の標準偏差が、カットオフ値よりも大きい場合に、前記代表的なセットから赤血球細胞を除外する工程をさらに含む請求項1記載の方法。
- 網赤血球と同定された赤血球細胞のそれぞれにおいて、網赤血球の容積を決定する工程をさらに含む請求項1記載の方法。
- 複数の照射波長に対応する網赤血球の積分光学濃度に基づき、網赤血球の容積を決定する工程をさらに含む請求項16記載の方法。
- サンプルの平均網赤血球容積パラメータを決定する工程をさらに含む請求項17記載の方法。
- 網赤血球と同定された赤血球細胞のそれぞれにおいて、網赤血球のヘモグロビン含有量を決定する工程をさらに含む請求項1記載の方法。
- 網赤血球の面積、複数の照射波長に対応する網赤血球の容積、および、複数の照射波長に対応する網赤血球の積分光学濃度の重み付け組合せに基づき、網赤血球のヘモグロビン含有量を決定する工程をさらに含む請求項19記載の方法。
- サンプルの平均網赤血球ヘモグロビン値を決定する工程をさらに含む請求項19記載の方法。
- 2つの異なる波長の入射光を用いてサンプルを照射するように構成されている光源、
前記波長のうちの第一の波長に対応するサンプルの2次元画像を得るように、および、前記波長のうちの第二の波長に対応するサンプルの2次元画像を得るように構成されている検出器、ならびに
代表的な赤血球細胞のセットを同定するために画像を分析する、
前記セットの中のそれぞれの赤血球細胞の面積を決定する、
前記セットの中のそれぞれの赤血球細胞の明度を決定する、および
前記セットの中の一つ一つの赤血球細胞において、赤血球細胞の面積が面積カットオフ値を超えており、かつ、赤血球細胞の明度が明度カットオフ値よりも小さい場合に、赤血球細胞を網赤血球と同定する
ように構成されている電子プロセッサであって、一つ一つの赤血球細胞の明度を、2つの照射波長における赤血球細胞の光学濃度値のあいだの差異に基づいて決定するように構成されている電子プロセッサを備える、基板上に配置された血液サンプル中の網赤血球を同定するためのシステム。 - 前記第一の波長が、400nm〜475nmのあいだであり、および、前記第二の波長が、575nm〜600nmのあいだである請求項22記載のシステム。
- 前記セットの中の赤血球細胞の一つ一つにおいて、前記電子プロセッサが、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定すること、
前記ピクセルのセットのうちの一つ一つにおいて第一の波長に対応する光学濃度を決定すること、
前記ピクセルのセットのうちの一つ一つにおいて第二の波長に対応する光学濃度を決定すること、
前記ピクセルのセットにおいて第一の波長に対応する平均光学濃度を決定すること、
前記ピクセルのセットにおいて第二の波長に対応する平均光学濃度を決定すること、および
細胞の明度を決定するために、平均光学濃度のあいだの差異を計算すること
によって細胞の明度を決定するように構成される請求項22記載のシステム。 - 前記セットの中の赤血球細胞の一つ一つにおいて、前記電子プロセッサが、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定すること、および
前記セットの中のピクセルの数をカウントすることによって細胞の面積を決定すること
によって細胞の面積を決定するように構成される請求項22記載のシステム。 - 前記赤血球細胞の一つ一つにおいて、前記電子プロセッサが、
細胞に関連付けられるピクセルのセットを決定すること、
前記ピクセルのセットの周囲を取り囲む多角形を決定すること、および
前記多角形の面積を計算することによって細胞の面積を決定すること
によって細胞の面積を決定するように構成される請求項22記載のシステム。 - 前記電子プロセッサが、赤血球細胞の明度の分布のパーセンタイルに基づき明度カットオフ値を決定するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記パーセンタイルが、赤血球細胞の明度の分布内の70パーセンタイルに対応する請求項27記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、パーセンタイルおよび明度オフセット値の和として明度カットオフ値を決定するように構成される請求項27記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、網赤血球の数が既知である訓練データのセットを基準としてパーセンタイルおよび明度オフセット値を決定するように構成される請求項29記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、赤血球細胞の面積の分布のパーセンタイルに基づき面積カットオフ値を決定するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記パーセンタイルが、赤血球細胞の面積の分布の20パーセンタイルに対応する請求項31記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、パーセンタイルおよび面積オフセット値の和として面積カットオフ値を決定するように構成される請求項31記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、網赤血球の数が既知である訓練データのセットを基準としてパーセンタイルおよび面積オフセット値を決定するように構成される請求項33記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、前記2つの波長のうちの1つの波長における赤血球細胞に関連付けられるピクセルの光学濃度の標準偏差がカットオフ値よりも大きい場合に、代表的なセットから赤血球を除外するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、前記2つの波長とは異なる波長における赤血球細胞に関連付けられるピクセルの光学濃度の標準偏差がカットオフ値よりも大きい場合に、代表的なセットから赤血球細胞を除外するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、網赤血球の容積を決定するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、複数の照射波長に対応する網赤血球の積分光学濃度に基づき、網赤血球の容積を決定するように構成される請求項37記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、サンプルの平均網赤血球容積パラメータを決定するように構成される請求項38記載のシステム。
- 網赤血球と同定された赤血球細胞のそれぞれにおいて、前記電子プロセッサが、網赤血球のヘモグロビン含有量を決定するように構成される請求項22記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、網赤血球の面積と、複数の照射波長に対応する網赤血球の容積と、複数の照射波長に対応する網赤血球の積分光学濃度との重み付け組合せに基づき、網赤血球のヘモグロビン含有量を決定するように構成される請求項40記載のシステム。
- 前記電子プロセッサが、サンプルの平均網赤血球ヘモグロビン値を決定するように構成される請求項40記載のシステム。
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