JP2014516027A - 肺動脈高血圧の治療におけるmicroRNAの調節方法 - Google Patents

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Abstract

【課題】肺動脈高血圧を治療または予防する方法を提供する。
【解決手段】本発明は、miR−145の発現または活性の阻害剤を対象に投与することにより、肺動脈高血圧の治療または予防を必要とする対象において肺動脈高血圧を治療または予防する方法を提供する。肺動脈高血圧を治療するためのmiR−145阻害剤を含む医薬組成物およびキットをも開示する。
【選択図】なし

Description

発明の分野
本発明は、microRNA(miRNA)の活性または発現を調節する作用剤を投与することによる肺動脈高血圧の治療および予防に関する。特定的には、本発明は、肺動脈高血圧の治療または予防を必要とする対象の細胞内のmiR−145の発現または活性を阻害することにより肺動脈高血圧を治療または予防する方法を提供する。
発明の背景
肺動脈高血圧(PAH)は、肺血管抵抗の漸進的増加をもたらすPA圧増加および血管リモデリングにより特徴付けられる肺小動脈(PA)の疾患である(Rich et al., 1987)。血管閉塞の結果、右心不全および高い死亡率になる(Jeffery et al., 2002、Voelkel et al., 1997)。骨形成タンパク質(BMP)2型レセプター(BMPR2)(トランスフォーミング増殖因子(TGF)−βスーパーファミリーに対するレセプター)をコードする遺伝子の生殖系列変異は、遺伝型PAH(hPAH)の患者の約70%で同定されている(Morrell et al., 2001)。さらに、BMPR2発現はまた、この遺伝子の変異が不在であるPAH症例(特発性PAH、iPAH)では著しく低減されることから、PAHの発症におけるこのレセプター経路のより広い役割が示唆される。肺動脈平滑筋細胞(PASMC)では、BMPR2の変異は、BMPおよびTGF−βに対する異常増殖反応に関連する。内皮細胞では、この変異は、アポトーシスに対する細胞(PAEC)の感受性を増大させる(Morrell et al., 2001)。いくつかのファミリーおよび大多数のiPAH症例ではBMPR2変異が不在であることから、依然としてさらなる病理学的機序(おそらくTGF−βスーパーファミリーに関連する)を同定する必要があることが示唆される。
すべての型のPAHに共通する主要な病理組織学的特徴の1つは、平滑筋特異的α−アクチン(SMA)を発現する細胞が末梢肺動脈に蓄積することである。これは、新生内膜中のSMA陽性細胞の出現および通常は平滑筋を欠失している前毛細血管肺細動脈中へのSMA陽性細胞の伸長を含む(Mandegar et al., 2004)。PAのこの遠位部の筋肉化に関与する細胞過程は明らかでないが、これらの観測からPAHの発症におけるPASMCの中心的役割が示唆される。
microRNA(miRNA)は、特異的メッセンジャーRNA(mRNA)を標的としてその分解または翻訳抑制を誘発することにより遺伝子発現を負に制御することが可能な一群の小型内因性非コードRNAである(Ambros, 2004、Bartel, 2009)。最近の研究では、miRNA:mRNA標的の主な機序的効果としてmRNA分解が規定された(Guo et al., 2010)。いくつかの最近の研究では、血管炎症および血管病変発症におけるmiRNAの直接的役割が評価された(Kartha and Subramanian, 2010、Urbich et al., 2008)。最近の研究では、血管壁中でmiR−145が豊富に発現されることが示された(Cheng et al., 2009)。miR−145は、保存SRF結合部位により制御されてヒト5番染色体上(Lio et al., 2010)およびマウス18番染色体上(Xin et al., 2009)でmiR−143および、miR−145の両方をコードする長いpri−miRNAとして転写される。血管壁へのmiR−145の局在化により、外膜線維芽細胞および内皮細胞と比較して平滑筋層での高い発現が実証された(Cheng et al., 2009)。このため、miR−145は、その標的遺伝子KLF−5およびその下流シグナリング分子ミオカルジンを介して平滑筋細胞(SMC)の成熟および増殖ならびに血管新生内膜病変の形成を制御可能な平滑筋細胞表現型マーカーおよびモジュレーターと考えられる(Cheng et al., 2009、Elia et al., 2009)。TGF−βスーパーファミリー内では、Smad依存性経路を介して活性miR143/145クラスターに対するアゴニストが示された(Davis-Dusenbery et al., 2011、Long et al., 2011)。さらに、miR−145、miR−143、およびmiR143/145ノックアウト(ko、−/−)マウスの分析では、アクチンフィラメントの破壊により誘導されるSMCサイズの低減に起因して、大動脈および他の末梢動脈の著しくより薄い平滑筋層が示された(Elia et al., 2009)。これにより、miR−145−/−マウスでは、中等度の全身性低血圧がもたらされ、
傷害に対する反応による新生内膜形成が不在になる(Xin et al., 2009)。さらに、単一および二重ko動物から単離された血管平滑筋細胞(VSMC)は、過増殖活性および血小板由来増殖因子(PDGF)(VSMCに対する既知の化学誘引物質)へのより高い遊走能を示した(Elia et al., 2009、Xin et al., 2009)。さらにまた、miR−143(145)koマウスの血管系の薬理学的分析から、血圧上昇刺激に対する反応が弱められることが明らかにされた(Elia et al., 2009、Xin et al., 2009)。まとめると、これらの知見からmiR−145koマウスおよびmiR143/145二重koマウスではVSMCの表現型の脱分化が示される。
根底にある遺伝学の理解が向上したにもかかわらず、PAHは、依然として、重篤で死に至ることも多い疾患である。肺動脈平滑筋細胞(PASMC)の増殖を含めて、肺小動脈の広範なリモデリングは、病変を特徴付ける。PAHの現在の治療では、PAH病変の根底をなす平滑筋増殖に適切に対処できない。したがって、PAHの新規な治療を開発する必要性が当技術分野に存在する。血管リモデリングの役割を果たすと報告されているmicroRNAは、PAHの効果的治療を開発するための新規な治療標的になる可能性がある。
本発明は、部分的には、miR−145がPAHのマウスモデルにおいて特発型(idiopathic)および遺伝型のPAHのいずれに罹患するヒトの肺組織でも異常制御されてアップレギュレートされるという発見に基づく。開発されたノックアウト動物におけるmiR−145発現の排除は、PAHの発症を防ぐ。したがって、本発明は、miR−145の発現または機能の阻害剤を対象に投与することにより、必要とされる対象においてPAHを治療または予防する方法を提供する。
一実施形態において、本方法は、miR−145配列(たとえば、pri−miR−145、pre−miR−145、または成熟miR−145)に少なくとも部分的に相補的な配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドを対象に投与することを含む。特定の実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒト成熟miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含む。本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートリンケージ、2’−O−アルキル修飾、二環式糖ヌクレオシド修飾(たとえば、ロックド核酸(LNA))などの1つ以上の骨格修飾または糖修飾を含有可能である。いくつかの実施形態において、miR−145を標的とする本アンチセンスオリゴヌクレオチド阻害剤は、約8〜約18ヌクレオチド長である。特定の実施形態において、miR−145を標的とする本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、約12〜約16ヌクレオチド長または約10〜約14ヌクレオチド長の範囲内である。
一実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、antimiRである。antimiRは、miR−145を標的として阻害するアンチセンスオリゴヌクレオチドである。antimiRは、LNA antimiRであり得る。一実施形態において、antimiRは、成熟miR−145の塩基2〜17を標的とする。他の実施形態において、antimiRは、16ヌクレオチド長である。さらに他の実施形態において、antimiRは、完全にホスホロチオレート化される。antimiRは、完全にホスホロチオレート化されてmiR−145の5’領域に完全に相補的であり得る。antimiRはまた、LNAとDNAとの混合体として合成することも可能である。
本発明の他の実施形態において、本miR−145阻害剤は、肺高血圧もしくは肺動脈高血圧(PAH)と診断された対象またはそれらを発症するリスクのある対象に投与される。対象が診断され得るまたは発症するリスクがあり得る肺高血圧の型としては、特発性PAH、遺伝性または家族性PAH、および二次性肺高血圧(たとえば、肺塞栓、肺気腫、肺線維症、および先天性心疾患から生じる高血圧)が挙げられるが、これらに限定されるものではない。一実施形態において、対象は、特発性PAHまたは遺伝性PAHと診断される。いくつかの実施形態において、PAHを発症するリスクのある対象は、骨形成タンパク質2型レセプターをコードする遺伝子に変異を有する。特定の実施形態において、対象はヒトである。
本miR−145阻害剤は、静脈内、動脈内、経鼻、経口、または経肺(たとえば、鼻または口を介する吸入により)をはじめとする種々の経路により対象に投与可能である。特定の実施形態において、本miR−145阻害剤は、肺送達デバイスを介した吸入経路により投与される。そのような実施形態において、本miR−145阻害剤は、乾燥粉末剤または液体エアロゾル剤として製剤化さ得る。
本発明はまた、肺動脈高血圧を治療または予防するためのキットを包含する。一実施形態において、本キットは、本明細書に記載のmiR−145の阻害剤と投与デバイスとを含む。投与デバイスは、インヘラー、ネブライザー、インサフレーター、点滴器、エアロゾル発生器などのように肺送達に供すべく設計可能である。他の実施形態において、投与デバイスは、カテーテルなどのように静脈内送達または動脈内送達に供すべく設計可能である。本miR−145阻害剤は、投与デバイス内に貯蔵すべく任意選択で製剤化可能である。本キットは、PAHを治療または予防するために本miR−145阻害剤を対象(たとえばヒト)に投与するための説明書をさらに含み得る。
SMCへのmiR145プローブの共局在化。実施例に詳述されるようにmiR145およびSMAの染色のために正常ヒト肺切片を処理した。(A)miR145プローブおよびSMアクチン、(B)対照プローブおよびSMアクチン。倍率×10。(C)正常ヒト肺ならびにiPAHおよびfPAH患者の肺の分析。 マウス肺切片におけるmiR−145の局在化および低酸素マウスに対する正常酸素マウスにおける発現。(A)マウス肺におけるmiR−145の局在化を示すin situハイブリダイゼーション。パラフィン切片を再水和してanti−miR−145または陰性対照としてのスクランブルプローブと共にインキュベートした。共局在化では、陰性対照としての非免疫アイソタイプIgG抗体と共に免疫組織化学アッセイを用いて同一サンプルでα−アクチンを検出した。画像倍率×100または×400倍率 =50μm。正常酸素および14日間低酸素の野生型マウスのq−PCR分析。正常酸素(白色棒)または低酸素(黒色棒)の10週齢マウスの(B)全肺または(C)右室から全RNAを抽出した。6匹のマウス/グループを分析した。すべてのサンプルを三重試験方式で試験した。結果をU6の値に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。対応のないt検定を用いてデータを解析した(***p<0.001 vs対照サンプル)。 低酸素マウスに対する正常酸素マウスにおけるmiR−143。正常酸素および14日間低酸素のwtマウスのq−PCR分析。正常酸素(白色棒)または低酸素(黒色棒)の10週齢マウスの(A)全肺または(B)右室から全RNAを抽出した。6匹のマウス/グループを分析した。各サンプルを三重試験方式で試験した。結果をU6の値に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。対応のないt検定を用いてデータを解析した(p<0.05、***p<0.001 vs正常酸素サンプル)。 低酸素wtマウスの脳、腎臓、および脾臓におけるmiR−145発現。正常酸素(白色棒)または低酸素(黒色棒)のマウスの(それぞれA、B、C)。各器官から四重試験方式で全RNAを抽出してq−PCRにより分析した。t検定を用いてデータを解析したが、有意性は同定されなかった。 インビトロで5%低酸素に暴露されたSMCにおけるmiR−145発現。一次遠位肺動脈平滑筋細胞をインビトロで5%低酸素に(A)24時間または(B)72時間暴露し、そして阻害剤SB203580(p38阻害剤−5μM)、SB431542(TGF−β阻害剤−1μM)、U0126(ERK阻害剤−1μM)の存在下または不在下でmiR145のレベルを評価した。 wtマウスと比較したmiR−145−/−マウスにおけるmiR−145発現の分析。(A)q−PCRおよび(B)in situ分析によりkoマウスにおけるmiR−145破壊を確認した。画像はすべて×100の倍率、スケールバー=100μm。 低酸素に対する反応における野生型マウスおよびmiR−145−/−マウスでのmiR−143発現。正常酸素および14日間低酸素の野生型(WT)マウスおよびノックアウト(KO)マウスのq−PCR分析。正常酸素(黒色棒)または低酸素(ストライプ棒)の10週齢マウスから全RNAを抽出した。6匹のマウス/グループを分析した。結果をU6の値に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。二元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(***p<0.001 vs対照サンプル)。 マウスにおけるPAH発症および血管リモデリングに対するmiR−145破壊の効果。(A)収縮期右室圧(sRVP、n=9〜10)および(B)右室肥大(RVH、n=9〜10)の評価。(C)弾性線維ワンギーソン法を用いて染色された代表的肺動脈。画像はすべて400×の倍率、スケールバー=50μm。(D)正常酸素および低酸素の野生型(WT)マウスおよびmiR−145−/−マウス(n=5)の両方からの肺動脈リモデリング。マウスを低酸素に14日間暴露した。nはマウスの数である。二元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05 vs WT正常酸素マウス)。 正常酸素条件および低酸素条件に付された野生型マウスおよびmiR−145−/−マウスにおける(A)全身動脈圧(SAP、n=6〜9)および(B)心拍数(HR、n=6〜10)の評価。マウスを低酸素に14日間暴露した。nはマウスの数である。二元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、**p<0.005、***p<0.001 vs野生型正常酸素マウス)。 miR−145選択標的の分析。正常酸素および低酸素のwtマウスおよびmiR−145−/−マウスの全肺において、(A)SMAD5、(B)SMAD4、(C)KLF4、および(D)KLF5の発現レベルをq−PCRにより評価した。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、***p<0.001)。 WT低酸素雌マウスおよびmiR−145−/−低酸素雌マウスにおけるKLF4およびKLF5タンパク質発現レベルの分析。(A、D)慢性低酸素に14日間暴露されたWTマウスおよびmiR−145−/−マウスの全肺においてKLF4およびKLF5の発現レベルをウェスタンブロットにより評価した。4匹のマウス/グループを分析し、特定のソフトウェア(Scion Imageソフトウェア)を用いてウェスタンブロットバンドの強度を測定した。得られた定量値を(B)、(C)、(E)、および(F)に棒グラフで示す。結果をGAPDHの値に規格化し、そしてWTグループに任意の値1を割り当てて増加倍率として表した。対応のないt検定を用いてデータを解析した。**p<0.005 wtマウスと比較して。 マイクロアレイデータの確認。正常酸素および低酸素のwtマウスおよびmiR−145−/−マウスの肺動脈において、(A)WIF1、(B)TGFB2、(C)FRZB、(D)DAB2、(E)ACE、(F)FSCN1、(G)CTGF、(H)Angptl4、(I)AP2B1、および(J)ITGBL1Iの発現レベルをq−PCRにより評価した。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、***p<0.001)。 miRNA特異的antimiRの注射後に得られたmiR−145またはmiR−143の選択的ノックダウン。成熟miR−143またはmiR−145配列のいずれかの5’領域に完全に相補的なantimiRを8週齢の雌マウスに皮下注射して、慢性低酸素に14日間付した。それらは、低酸素の8日後、2回目の注射を受けた。14日後、マウスを屠殺して、肺から全RNAを抽出した。正常酸素媒体処置動物、低酸素媒体処置動物、およびスクランブル、miR−145、またはmiR−143のantimiRが注射された低酸素動物における(A)miR−145および(B)miR−143の発現。(C)〜(D)miR−145または(E)〜(F)miR−143の発現レベルを示す、q−PCRにより評価された同一のRNAの(C)〜(F)ノーザンブロット分析。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、***p<0.001。miR−145およびmiR−143のダウンレギュレーションは、他のすべてのグループと対比して統計的に有意である。)。 マウスにおけるPAH発症および血管リモデリングに対するmiR−145またはmiR−143ノックダウンの効果。miR−145もしくはmiR−143に特異的なantimiR、スクランブルantimiR、または媒体で処置されて慢性低酸素に14日間暴露されたC57B16マウスにおける(A)収縮期右室圧(sRVP、n=6〜10)、(B)右室肥大(RVH n=7〜13)の評価。(C)同一のグループ(n=4)で測定された肺動脈リモデリング。n=マウスの数。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、**p<0.005、***p<0.001)。(D)弾性線維ワンギーソン法を用いて染色された代表的肺動脈。画像はすべて×40の倍率、スケールバー=20μm。 媒体処置された正常酸素マウスおよび媒体、スクランブルantiMir、miR−145 antiMir、またはmiR−143 antiMirが注射された低酸素マウスにおける(A)全身動脈圧(SAP、n=6〜8)および(B)心拍数(HR、n=7〜13)の評価。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した。 iPAHおよびhPAHのヒト肺におけるmiR−145発現レベルの評価。(A)miR−145の発現レベルを示す、iPAH(n=6)、hPAH(n=5)、および対照患者(n=6)のパラフィン包埋ヒト肺から抽出されたRNAのq−PCR分析。すべてのサンプルをRnu−48の値に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。二元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した(p<0.05、**p<0.005)。(B)q−PCR分析に使用したのと同一のサンプルから取得したパラフィン切片におけるmiR−145発現のin situ分析。スクランブルプローブを陰性対照として使用した。共局在化では、陰性対照としての非免疫アイソタイプIgG抗体と共に免疫組織化学を用いて同一サンプルで連続切片に対してα−アクチンを検出した。典型的な複合病変および新たに筋肉化された細動脈におけるα−アクチンおよびmiR−145の発現の増大が、画像から実証される。画像はすべて400×の倍率、スケールバー=50μm。(C)hPAH患者の新生内膜病変におけるmiR−145ダウンレギュレーション。共局在化では、α−アクチン発現を免疫組織化学により検出した。 ヒトBMPR2変異PASMCの分析。(A)PASMCにおけるmiR−145発現のqPCR分析。BMPR2遺伝子に変異を有するhPAH患者のPASMCから全RNAを抽出した。第4継代一次細胞を使用した。非罹患対照と比較してpre−miR−145および成熟miR−145の発現に関してcDNAを分析した。結果を(A)pre−miR−145に対してはGAPDHおよび(B)成熟miR−145に対してはRnu−48に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。対応のないt検定を用いてデータを解析した(**p<0.005、***p<0.001 vs対照サンプル)。(C)q−PCRの結果を確認するために、野生型細胞およびBMPR2変異細胞から抽出された同一の全RNAをノーザンブロット分析にも使用した。Scion Imageソフトウェアを用いてブロットの定量を行い、関心対象のmiRNAのバンド強度を確定して、相対U6シグナルに規格化した(D)。対応のないt検定を用いてデータを解析した(***p<0.001 vs対照サンプル)。 siRNAを介してBMPR2発現がダウンレギュレートされたヒトPASMCにおけるmiR−143およびmiR−145のアップレギュレーション。BMPR2発現を標的として特異的に抑制可能なsiRNAまたは陰性対照としてのsiスクランブルを一次ヒトPASMCにトランスフェクトした。これらのサンプルおよび比較のための未処理細胞から全RNAを72時間後に抽出した。BMPR2ダウンレギュレーションの効率を(A)TaqManリアルタイムPCRにより評価した。また、(B)miR−143および(C)miR−145の発現を同一サンプルで評価した。結果をBMPR2に対してはGAPDHならびにmiR−143およびmiR−145に対してはRnu−48に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した。一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定を用いてデータを解析した。**p<0.005、***p<0.001 記載の対照またはsiスクランブルグループと比較して。 wtマウスおよびBMPR2 BMPR2 R899XマウスにおけるmiR−145発現。4匹のwtマウスまたはBMPR2変異マウスの全肺からRNAを抽出し、そして(A)q−PCR(すべてのサンプルを三重試験方式で分析し、結果をU6に規格化し、そして対照グループに任意の値1を割り当てて相対変化倍率として表した)(***p<0.001 vs対照サンプル)および(B)〜(C)ノーザンブロットによりmiR−145発現に関して評価した。(D)同一のマウスの肺におけるmiR−145の局在化を示すin situハイブリダイゼーション。パラフィン切片を再水和してanti−miR−145または陰性対照としてのスクランブルプローブと共にインキュベートした。共局在化では、陰性対照としての非免疫アイソタイプIgG抗体と共に免疫組織化学アッセイを用いて同一サンプルでα−アクチンを検出した。画像は×200の倍率、スケールバー=50μm。
発明の詳細な説明
本発明は、部分的には、miR−145の発現および機能が肺動脈高血圧(PAH)の発症に決定的な役割を果たすという驚くべき発見に基づく。本発明者らは、miR−145が慢性低酸素に対する反応によりマウスにおいて有意にアップレギュレートされることおよびmiR−145の遺伝子的または薬理学的な阻害がマウスにおいてPAHの発症を防ぐことを示した。ヒト組織において、本発明者らは、対照と比較してBMPR2遺伝子に変異を有するPAH患者から取得した肺組織および単離肺動脈平滑筋細胞(PASMC)におけるpre−miR−145および成熟型miR−145の増加を報告する。したがって、本発明は、PAHの治療的介入のための新しい標的としてmiR−145を提供する。
一実施形態において、本発明は、miR−145の発現および/または活性の阻害剤を対象に投与することを含む、肺高血圧とくにPAHの治療または予防を必要とする対象において肺高血圧とくにPAHを治療または予防する方法を提供する。肺高血圧は、肺内の肺動脈が狭窄、遮断、または損傷して動脈圧の増加を引き起こしたときに生じる。右室に高い負荷がかかると、心筋に歪みを生じて心不全になる可能性がある。PAHの症状としては、初期運動時および最終的休息時の息切れ、疲労、眩暈、または失神の発作、胸部圧迫感または疼痛、下肢(足首および脚)および腹の腫脹、皮膚および口唇に青み、ならびに脈拍亢進または心臓動悸が挙げられるが、これらに限定されるものではない。好ましくは、治療を受けていない対象と比較して、PAHに罹患している対象において、miR−145阻害剤の投与後、前述の症状の1つ以上が改善もしくは解消されるか、またはPAHの発症が遅延される。いくつかの実施形態において、対象における右室収縮期圧は、miR−145阻害剤の投与後、低減される。
本発明に係る方法により治療可能な肺高血圧の型としては、特発性PAH、遺伝性または家族性PAH、および二次性肺高血圧(たとえば、肺塞栓、肺気腫、肺線維症、および先天性心疾患から生じる高血圧)が挙げられるが、これらに限定されるものではない。家族性または遺伝性のPAHの型は、特定の遺伝子の変異に関連付けられてきた。たとえば、遺伝性のPAHの型を有する患者の70%は、骨形成タンパク質(BMP)2型レセプター(BMPR2)をコードする遺伝子に変異を有する(Morrell et al., 2001)。したがって、いくつかの実施形態において、本発明に係る方法により治療される対象は、PAHを発症するリスクがある。一実施形態において、リスクのある対象(たとえばヒト)は、BMPR2をコードする遺伝子に変異を有する。
本明細書で用いられる場合、「対象」または「患者」という用語は、ヒトおよび他の霊長動物(たとえば、チンパンジーおよび他の類人猿およびサル類)、家畜(たとえば、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、およびウマ)、家畜哺乳動物(たとえば、イヌおよびネコ)、実験動物(たとえば、マウス、ラット、モルモットなどの齧歯動物)、ならびにトリ(たとえば、家禽、野鳥、および猟鳥、たとえば、ニワトリ、シチメンチョウおよび他のジュンケイ類のトリ、アヒル、ガチョウなど)を含めて(ただし、これらに限定されるものではない)、任意の脊椎動物を意味する。いくつかの実施形態において、対象は哺乳動物である。他の実施形態において、対象はヒトである。
miR−145は、miR−143とクラスターをなしてネズミ18番染色体上およびヒト5番染色体上の遺伝子間領域に位置する。互いに相同性を有していないmiR−145およびmiR−143は、単一の転写物として共転写される。miR−145のpre−miRNA配列は、成熟配列およびスター(すなわちマイナー)配列にプロセシングされる。スター配列は、ステムループ構造の他のアームからプロセシングされる。マウスおよびヒトのmiR−145のpre−miRNA配列(たとえば、ステムループ配列)、成熟配列、およびスター配列を以下に与える。
Figure 2014516027
以上の配列は、リボ核酸配列またはデオキシリボ核酸配列または両者の組合せ(すなわちリボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドの両方を含む核酸)のいずれかであり得る。本明細書に記載の配列のいずれか1つを含む核酸は、DNA配列に対してはウリジン塩基の代わりにチミジン塩基を、およびRNA配列に対してはチミジン塩基の代わりにウリジン塩基を有するものとみなされる。
本発明に係る方法で使用するのに好適なmiR−145の発現または活性の阻害剤としては、アンチセンスオリゴヌクレオチド、アンタゴmir、合成リボザイム、またはアプタマーが挙げられる。特定の実施形態において、miR−145の阻害剤は、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、リボヌクレオチドもしくはデオキシリボヌクレオチドまたはそれらの組合せを含み得る。好ましくは、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの化学修飾(たとえば、糖または骨格修飾)を有する。たとえば、好適なアンチセンスオリゴヌクレオチドは、BSNを含有するオリゴヌクレオチドとその相補的マイクロRNA標的鎖との間で形成される複合体に増強された熱安定性を付与する1つ以上の「コンフォメーション拘束型」または二環式の糖ヌクレオシド修飾(BSN)を含み得る。たとえば、一実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの「ロックド核酸」を含有する。ロックド核酸(LNA)は、リボース糖部分が「ロックド」コンフォメーションをとる2’−O,4’−C−メチレンリボヌクレオシド(構造A)を含有する。他の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’,4’−C−架橋2’デオキシリボヌクレオシド(cDNA、構造B)を含有する。たとえば、米国特許第6,403,566号およびWang et al. (1999) Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters, Vol. 9: 1147-1150(その両方ともその全体を参照により本明細書に援用する)を参照されたい。さらに他の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、構造Cで示される構造を有する少なくとも1つの修飾ヌクレオシドを含有する。miR−145を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、BSN(LNA、cDNAなど)または他の修飾ヌクレオチド、リボヌクレオチド、もしくはデオキシリボヌクレオチドの組合せを含有することが可能である。いくつかの実施形態において、miR−145を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、LNAおよびDNAヌクレオチドの組合せを含む。
Figure 2014516027
他の選択肢として、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、糖−リン酸骨格ではなくペプチド系骨格を含有するペプチド核酸(PNA)を含み得る。アンチセンスオリゴヌクレオチドへの他の修飾糖またはホスホジエステル修飾も利用可能であると考えられる。たとえば、アンチセンスオリゴヌクレオチドが含有し得る他の化学修飾としては、糖修飾、たとえば、2’−O−アルキル(たとえば、2’−O−メチル、2’−O−メトキシエチル)、2’−フルオロ、および4’チオ修飾、ならびに骨格修飾、たとえば、1つ以上のホスホロチオエートリンケージ、モルホリノカルボキシレートリンケージ、またはホスホノカルボキシレートリンケージ(たとえば、米国特許第6,693,187号および同第7,067,641号(それらの全体を参照により本明細書に援用する)を参照されたい)が含まれるが、これらに限定されるものではない。特定の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、完全なホスホロチオエートリンケージ骨格を含む。一実施形態において、mi−145を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、各塩基上に2’O−メチル糖修飾を含有し、ホスホロチオエートリンケージにより結合される。アンチセンスオリゴヌクレオチド、特定的には、より短い長さ(たとえば15ヌクレオチド未満)のものは、1つ以上の親和性促進修飾、たとえば、LNA、二環式ヌクレオシド、ホスホノホルメート、2’O−アルキル修飾などを含み得るが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態において、好適なアンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’末端および3’末端の両方に2’−O−メトキシエチル修飾リボヌクレオチドを含有し、その中心に少なくとも10デオキシリボヌクレオチドを有する2’−O−メトキシエチル「ギャップマー」である。この「ギャップマー」は、RNA標的のRNase H依存的分解機序を開始可能である。安定性を向上させかつ有効性を改善するアンチセンスオリゴヌクレオチドの他の修飾、たとえば、米国特許第6,838,283号(その全体を参照により本明細書に援用する)に記載のものは、当技術分野で公知であり、本発明の方法で使用するのに好適である。たとえば、in vivo送達および安定性を向上させるために、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、コレステロール部分などのステロイド、ビタミン、脂肪酸、炭水化物もしくはグリコシド、ペプチド、または他の小分子リガンドに、その3’末端でリンケージさせることが可能である。
miRNAの活性の抑制に有用な好ましいアンチセンスオリゴヌクレオチドは、約5〜約25ヌクレオチド長、約10〜約30ヌクレオチド長、または約20〜約25ヌクレオチド長である。特定の実施形態において、miR−145を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、約8〜18約ヌクレオチド長、約12〜約16ヌクレオチド長、約10〜約14ヌクレオチド長、または約11〜約15ヌクレオチド長である。miR−145に相補的な8mer以上のものを使用することが可能である。
たとえば、一実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−AGGGAUUCCUGGGAAAACUGGAC−3’(配列番号7)の配列を有する。他の実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−CCUGGGAAAACUGGAC−3’(配列番号8)の配列を有する。他の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−UGGGAAAACUGGAC−3’(配列番号9)の配列を有する。他の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−GGAAAACUGGAC−3’(配列番号10)の配列を有する。さらに他の実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−AAAACUGGAC−3’(配列番号11)の配列を有する。さらに他の実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、5’−AACUGGAC−3’(配列番号12)の配列を有する。本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、成熟またはマイナー(すなわちスター)miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列、たとえば、成熟またはマイナー(すなわちスター)miR−145配列(たとえば、配列番号1または配列番号2)に少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的な配列を含み得る。いくつかの実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、成熟またはマイナーmiR−145配列に実質的に相補的でありうる。すなわち、標的ポリヌクレオチド配列に少なくとも約90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的でありうる。一実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、成熟またはマイナーmiR−145配列に100%相補的な配列を含む。特定の実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号1に少なくとも部分的に相補的である。他の実施形態において、本アンチセンスオリゴヌクレオチドは、配列番号2に少なくとも部分的に相補的である。
アンチセンスは、miRに部分的にまたは完全に相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドantimiRであり得る。antimiRは、配列番号7〜12の配列を含むかまたは有するものなどのように、miRNAの5’末端に相補的であり得るし、miRNAの完全相補的配列にわたりプロセシングされたものであり得る。antimiRは、成熟またはマイナー(すなわちスター)miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列、たとえば、成熟またはマイナー(すなわちスター)miR−145配列(たとえば、配列番号1または配列番号2)に少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的な配列を含み得る。いくつかの実施形態では、antimiRは、成熟またはマイナーmiR−145配列に実質的に相補的であり得る。すなわち、標的ポリヌクレオチド配列に少なくとも約90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的であり得る。一実施形態において、antimiRは、成熟またはマイナーmiR−145配列に100%相補的な配列を含む。特定の実施形態において、antimiRは、配列番号1に少なくとも部分的に相補的である。他の実施形態において、antimiRは、配列番号2に少なくとも部分的に相補的である。
antimiRは、約5〜約25ヌクレオチド長、約10〜約30ヌクレオチド長、または約20〜約25ヌクレオチド長である。特定の実施形態において、miR−145を標的とするantimiRは、約8〜18約ヌクレオチド長、約12〜約16ヌクレオチド長、約10〜約14ヌクレオチド長、または約11〜約15ヌクレオチド長である。一実施形態において、antimiRは、約16ヌクレオチド長である。antimiRは、完全にもしくは部分的にホスホロチオレート化され得るか、またはホスホロチオレート化され得ない。一実施形態において、antimiRは、LNA antimiRである。一実施形態において、antimiRは、成熟miR−145の塩基2〜17を標的とする。たとえば、antimiRは、5’−UCCUGGGAAAACUGGA−3’(配列番号13)の配列を有し得る。一実施形態において、antimiRは、配列番号13で示される配列を有し、かつ完全にホスホロチオレート化される。さらに他の実施形態において、配列番号13で示される配列を有するantimiRは、LNA antimiRである。配列番号13で示される配列を有するantimiRは、LNAとDNAとの混合物であり得る。さらに他の実施形態において、配列番号13で示される配列を有するantimiRは、完全にホスホロチオレート化されたLNA antimiRである。
いくつかの実施形態において、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンタゴmirである。「アンタゴmir」とは、miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な一本鎖化学修飾リボヌクレオチドのことである。アンタゴmirは、2’−O−メチル糖修飾などの1つ以上修飾ヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態において、アンタゴmirは、修飾ヌクレオチドのみを含む。アンタゴmirはまた、部分的または完全なホスホロチオエート骨格を生じる1つ以上のホスホロチオエートリンケージを含み得る。in vivo送達および安定性を向上させるために、アンタゴmirをその3’末端でコレステロールまたは他の部分にリンケージ可能である。miR−145を阻害するのに好適なアンタゴmirは、約15〜50約ヌクレオチド長、約18〜約30ヌクレオチド長、約20〜約25ヌクレオチド長、または約10〜約14ヌクレオチド長で得る。アンタゴmirは、成熟またはマイナーmiR−145配列に少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、または99%相補的であり得る。いくつかの実施形態では、アンタゴmirは、成熟またはマイナーmiR−145配列に実質的に相補的、すなわち、標的ポリヌクレオチド配列に少なくとも約95%、96%、97%、98%、または99%相補的であり得る。他の実施形態では、アンタゴmirは、成熟またはマイナーmiR−145配列に100%相補的である。
本明細書に記載の阻害ヌクレオチド分子は、好ましくは、miR−145(配列番号1)の成熟配列を標的とする。一実施形態において、本明細書に記載の阻害ヌクレオチド分子は、miR−145のマイナー(すなわちスター)配列(配列番号2)を標的とする。いくつかの実施形態において、miR−145の阻害剤は、成熟またはマイナーmiR−145配列に完全に相補的な配列を含むアンタゴmirである。一実施形態において、miR−145の阻害剤は、配列番号1に部分的にまたは完全に相補的な配列を有するアンタゴmirである。他の実施形態において、miR−145の阻害剤は、配列番号2に部分的にまたは完全に相補的な配列を有するアンタゴmirである。いくつかの実施形態において、miR−145の阻害剤は、化学修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドである。一実施形態において、miR−145の阻害剤は、配列番号1に実質的に相補的な配列を含む化学修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドである。他の実施形態において、miR−145の阻害剤は、配列番号2に実質的に相補的な配列を含む化学修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドである。本明細書で用いられる場合、「実質的に相補的」とは、標的ポリヌクレオチド配列(たとえば、成熟、マイナー、または前駆体miRNA配列)に少なくとも約95%、96%、97%、98%、99%、または100%相補的な配列を意味する。
アンチセンスオリゴヌクレオチドまたはアンタゴmirは、miR−145に対する前駆体miRNA配列(pre−miRNA)または初期miRNA配列(pri−miRNA)に実質的に相補的な配列を含み得る。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、pre−miR−145配列のステムループ領域の外側に位置する配列に実質的に相補的な配列を含む。一実施形態において、miR−145機能の阻害剤は、pre−miR−145配列(配列番号3)に実質的に相補的な配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
本明細書に記載のmiR−145の阻害剤はいずれも、miR−145阻害剤をコードする発現ベクターを細胞に配達することにより、標的細胞(たとえば平滑筋細胞)に配達可能である。「ベクター」は、細胞の内部に関心対象の核酸を送達するために使用可能な物質組成物である。線状ポリヌクレオチド、イオン性または両親媒性の化合物と会合したポリヌクレオチド、プラスミド、およびウイルスを含めて(ただし、これらに限定されるものではない)、多くのベクターが当技術分野で公知である。したがって、「ベクター」という用語は、自律複製プラスミドまたはウイルスを含む。ウイルスベクターの例としては、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクターなどが含まれるが、これらに限定されるものではない。発現コンストラクトは、生存細胞中で複製可能であるか、または、それは合成で作製可能である。本出願の目的では、「発現コンストラクト」、「発現ベクター」、および「ベクター」という用語は、一般的な例示的な意味で本発明の用途を示すべく同義的に用いられ、本発明を限定しようとするものではない。
一実施形態では、miR−145の阻害剤を発現するための発現ベクターは、アンチセンスオリゴヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドに機能可能に連結されたプロモーターを含み、発現されるアンチセンスオリゴヌクレオチドの配列は、miR−145の成熟またはマイナー配列(たとえば、配列番号1または配列番号2)に部分的にまたは完全に相補的である。本明細書で用いられる「機能可能に連結された」または「転写制御下で」という表現は、プロモーターが、RNAポリメラーゼによる転写の開始およびポリヌクレオチドの発現を制御すべく、ポリヌクレオチドに対して適正な位置および向きであることを意味する。
本明細書で用いられる場合、「プロモーター」とは、細胞の合成系または導入された合成系により認識され、遺伝子の特定の転写を開始するのに必要とされるDNA配列を意味する。好適なプロモーターとしては、RNA pol I、pol II、pol III、およびウイルスプロモーター(たとえば、ヒトサイトメガロウイルス(CMV)前初期遺伝子プロモーター、SV40初期プロモーター、およびラウス肉腫ウイルス長末端反復)が含まれるが、これらに限定されるものではない。一実施形態において、プロモーターは、組織特異的プロモーターである。とくに興味深いのは、血管特異的プロモーター、より特定的にはα平滑筋アクチンプロモーターなどの平滑筋特異的プロモーターである。他の好適なプロモーターとしては、ミオシン軽鎖−2プロモーター(Franz et al. (1994) Cardioscience, Vol. 5(4):235-43、Kelly et al. (1995) J. Cell Biol, Vol. 129(2):383-396)、αアクチンプロモーター(Moss et al. (1996) Biol. Chem., Vol. 271(49):31688-31694)、トロポニン1プロモーター(Bhavsar et al. (1996) Genomics, Vol. 35(1): 11-23)、Na+/Ca2+交換体プロモーター(Barnes et al. (1997) J. Biol. Chem., Vol. 272(17): 11510- 11517)、ジストロフィンプロモーター(Kimura et al. (1997) Dev. Growth Differ., Vol. 39(3):257-265)、α7インテグリンプロモーター(Ziober and Kramer (1996) J. Bio. Chem., Vol. 271(37):22915-22)、脳性ナトリウム利尿ペプチドプロモーター(LaPointe et al. (1996) Hypertension, Vol. 27(3 Pt 2):715-22)、およびαB−クリスタリン/低分子熱ショックタンパク質プロモーター(Gopal-Srivastava (1995) J. Mol. Cell. Biol., Vol. 15(12):7081-7090)、αミオシン重鎖プロモーター(Yamauchi-Takihara et al. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, Vol. 86(10):3504-3508)、ならびにANFプロモーター(LaPointe et al. (1988) J. Biol. Chem., Vol. 263(19):9075-9078)が挙げられる。
特定の実施形態において、miR−145阻害剤をコードするポリヌクレオチドに機能可能にリンケージされたプロモーターは、誘導性プロモーターであり得る。誘導性プロモーターは当技術分野で公知であり、テトラサイクリンプロモーター、メタロチオネインIIAプロモーター、熱ショックプロモーター、ステロイド/甲状腺ホルモン/レチノイン酸応答エレメント、アデノウイルス後期プロモーター、および誘導マウス乳腺腫瘍ウィルスLTRが含まれるが、これらに限定されるものではない。
細胞に発現コンストラクトおよび核酸を送達する方法は、当技術分野で公知であり、たとえば、リン酸カルシウム共沈、電気穿孔、マイクロインジェクション、DEAE−デキストラン、リポフェクション、ポリアミントランスフェクション試薬を利用するトランスフェクション、細胞超音波処理、高速度マイクロプロジェクタイルを使用する遺伝子衝撃およびレセプター媒介トランスフェクションを含み得る。
本発明はまた、治療後、miR−145阻害剤を捕捉または除去する方法を包含する。本方法は、肺組織においてmiR−145阻害剤に対する結合部位を過剰発現することを含み得る。結合部位領域は、好ましくは、miR−145のシード領域の配列を含有する。シード領域は、標的認識に重要な塩基2〜8にわたるmiRNAの5’部分である。いくつかの実施形態において、結合部位は、miR−145の1つ以上の標的の3’UTRからの配列、たとえば、KLF4、KLF−5、Srgap1、およびSrgap2を含有し得る。
本発明はまた、miR−145の阻害剤を含む医薬組成物を包含する。臨床用途を想定する場合、医薬組成物は、目的の用途に適合する形態で調製されるであろう。一般に、これは、発熱原およびヒトまたは動物に有害となり得る他の不純物を本質的に含まない組成物を調製することを包含する。
一実施形態において、医薬組成物は、有効用量のmiR−145阻害剤と薬学的に許容可能な担体とを含む。たとえば、医薬組成物は、本明細書に記載のmiR−145を標的とする有効用量の修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、医薬組成物は、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、および配列番号12からなる群から選択された配列を有する修飾アンチセンスオリゴヌクレオチドを含む。一実施形態において、医薬組成物は、有効用量の合成アンチセンスオリゴヌクレオチド、たとえば、配列番号13で示される配列を有するantimiRを含む。一実施形態において、医薬組成物は、完全にホスホロチオレート化された配列番号13を有する有効用量のantimiRを含む。さらに他の実施形態において、医薬組成物は、配列番号13を有する有効用量のLNA antimiRを含み、antimiRは、完全にホスホロチオレート化される。
「有効用量」とは、有利または所望の臨床結果を得るのに十分な量のことである。本発明に係るmiRNA阻害剤の有効用量は、約0.001mg/kg〜約100mg/kg、約0.01mg/kg〜約10mg/kg、約0.1mg/kg〜約10mg/kg、約1mg/kg〜約10mg/kg、約2.5mg/kg〜約50mg/kg、または約5mg/kg〜約25mg/kgであり得る。何が有効用量とみなされるのかの正確な決定は、背格好、年齢、肺動脈高血圧のタイプおよび重症度、ならびに阻害剤の性質(たとえば、アンタゴmir、発現コンストラクト、アンチセンスオリゴヌクレオチドなど)を含めて、各患者それぞれの因子に基づき得る。したがって、投与量は、本開示および当技術分野の知識から、当業者であれば容易に確認可能である。
miR−145機能のオリゴヌクレオチド阻害剤のためのまたは特定のmiRNA阻害剤を発現するコンストラクトのための送達媒体として、コロイド分散系、たとえば、高分子複合体、ナノカプセル、マイクロスフェア、ビーズ、および脂質ベース系、たとえば、水中油型エマルジョン、ミセル、混合ミセル、リポソームなどを使用してもよい。特定の実施形態において、miR−145阻害剤は、肺送達に供すべく製剤化される。本明細書で用いられる場合、「肺送達」または「呼吸送達」とは、口または鼻を介した肺内への吸入による対象へのmiR−145阻害剤の送達を意味する。たとえば、miR−145阻害剤は、ネブライザー用に嗅剤、エアロゾル剤、溶液剤として、または吹送用にマイクロ微粉末剤として、製剤化可能である。miR−145阻害剤が乾燥粉末剤として製剤化されるいくつかの実施態様において、活性化合物の粒子は、好適には50ミクロン未満、好ましくは10ミクロン未満、たとえば、1〜5ミクロンまたは2〜5ミクロンの直径を有する。
送達媒体を安定状態にして標的細胞による取込みを可能にすべく、一般的には、適切な塩および緩衝液を利用することが望まれるであろう。本発明に係る水性組成物は、薬学的に許容可能な担体または水性媒体中に溶解または分散された阻害剤ポリヌクレオチドを含む有効量の送達媒体(たとえば、リポソームまたは他の複合体または発現ベクター)を含む。「薬学的に許容可能な」または「薬理学的に許容可能な」という表現は、動物またはヒトに投与したときに、有害反応、アレルギー反応、または他の不利な反応を引き起こさない分子体および組成物を意味する。本明細書で用いられる場合、「製薬上許容される担体」には、医薬、たとえばヒトへの投与に好適な医薬の製剤化での使用が許容される溶媒、緩衝剤、溶液剤、分散媒、コーティング剤、抗細菌剤および抗菌類剤、等張化剤および吸収遅延剤などが含まれる。医薬活性物質用のそのような媒体および作用剤の使用は、当業界で周知である。いかなるの従来の媒体または作用剤の場合にもそれが本発明に係る活性成分と不適合でないかぎり、治療組成物でのその使用が可能であると考えられる。組成物のベクターやポリヌクレオチドを不活性化しないかぎり、補助的活性成分もまた、組成物中に組込み可能である。
本発明に係る活性組成物は、伝統的な医薬製剤を含み得る。本発明に係るこれらの組成物の投与は、標的組織を利用可能な経路であるかぎり、任意の通常経路を介して行い得る。これは、経口、経鼻、または頬腔内を含む。他の選択肢として、投与は、真皮内、皮下、筋肉内、腹腔内、動脈内、または静脈内への注射により行い得る。特定の実施形態において、miR−145阻害物を含む医薬組成物は、吸入により投与される。miRNA阻害剤またはmiRNA阻害剤を含む発現コンストラクトを含む医薬組成物はまた、カテーテルシステムまたは心臓および肺に治療剤を送達するために冠循環/肺循環を分離するシステムにより投与可能である。心臓および冠血管系に治療剤を送達するための種々のカテーテルシステムは、当業界で公知である。本発明で使用するのに好適なカテーテルに基づく送達法または冠脈分離法のいくつかの例(これらに限定されるものではない)は、米国特許第6,416,510号、米国特許第6,716,196号、米国特許第6,953,466号、国際公開第2005/082440号、国際公開第2006/089340号、米国特許出願公開第2007/0203445号、米国特許出願公開第2006/0148742号および米国特許出願公開第2007/0060907号(それらはすべて、それらの全体を参照により本明細書に援用する)に開示されている。そのような組成物は、本明細書で説明した製薬上許容される組成物として通常投与されるであろう。
活性化合物はまた、非経口投与または腹腔内投与が可能である。例として、遊離塩基または薬理学的に許容可能な塩としての活性化合物の溶液は、ヒドロキシプロピルセルロースなどの界面活性剤と好適に混合された水中に調製可能である。グリセロール、液体ポリエチレングリコール、およびそれらの混合物、ならびに油に導入して、ディスパージョン剤を調製することもできる。通常の貯蔵条件下および使用条件下では、こうした調製物は、微生物の増殖を防止するために一般的には保存剤を含有する。
注入使用、カテーテル送達、または吸入送達に好適な医薬製剤としては、たとえば、無菌の水性の溶液剤またはディスパージョン剤および無菌の注入用の溶液または分散液を即時調製するための無菌の粉末剤が挙げられる(たとえば、エアロゾル剤、ネブライザー溶液剤)。一般的には、これらの製剤は、無菌であり、容易な注入またはエアロゾル化ネブライゼーションが行える程度に流動性である。製剤は、製造条件下および貯蔵条件下で安定でなければならず、かつ細菌や菌類などの微生物の汚染作用を受けないように貯蔵されなければならない。適切な溶媒または分散媒体は、たとえば、水、エタノール、ポリオール(たとえば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコールなど)、それらの好適な混合物、ならびに植物油を含有することができる。適正な流動性は、たとえば、レシチンなどのようなコーティング剤を用いることにより、ディスパージョン剤の場合には所要の粒子サイズを維持することにより、および界面活性剤を用いることにより、維持することができる。微生物の活動の防止は、種々の抗細菌剤および抗菌類剤、たとえば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどにより行うことが可能である。多くの場合、等張化剤、たとえば、糖または塩化ナトリウムを組み込むことが好ましいであろう。吸収を遅らせる作用剤、たとえば、アルミニウムモノステアレートおよびゼラチンを組成物で使用することにより、注入用組成物を長期間にわたり吸収させるようにすることが可能である。
滅菌注射用溶液剤は、適切な量の活性化合物を、所望により任意の他の成分(たとえば、以上に列挙したもの)と共に、溶媒中に組み込んでから、濾過滅菌を行うことにより、調製可能である。一般的には、ディスパージョン剤は、基剤としての分散媒と所望の他の成分(たとえば、以上に列挙したもの)とを含有する滅菌媒体中に種々の無菌の活性成分を導入することにより調製される。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌粉末剤の場合、好ましい調製方法は、活性成分と任意の追加の所望の成分とよりなる粉末を事前に滅菌濾過されたその溶液から生成する真空乾燥技術および凍結乾燥技術を含む。いくつかの実施形態において、滅菌粉末剤は、たとえば、インサフレーターまたは吸入装置を介して、対象に直接投与可能である(すなわち、希釈剤による再構成を行わない)。
本発明に係る組成物は、中性形または塩形で製剤化可能である。薬学的に許容可能な塩としては、たとえば、無機酸(たとえば塩酸もしくはリン酸)から、または有機酸(たとえば、酢酸、シュウ酸、酒石酸、マンデル酸など)から誘導される酸付加塩(タンパク質の遊離アミノ基で形成される)が含まれる。遊離カルボキシル基を用いて形成される塩もまた、無機塩基(たとえば、ナトリウム、カリウム、アンモニウム、カルシウム、もしくは第二鉄の水酸化物)、または有機塩基(たとえば、イソプロピルアミン、トリメチルアミン、ヒスチジン、プロカイン)から、誘導可能である。
製剤化後、溶液剤は、好ましくは、投与処方に適合し得る形でかつ治療上有効な量で投与される。製剤は、注入用溶液剤、薬剤放出カプセル剤、吸入剤などのようなさまざまな剤形で容易に投与することができる。たとえば水溶液の状態で非経口投与に供する場合、一般的には、溶液を適切に緩衝化し、かつたとえば十分な生理食塩水またはグルコースを用いて最初に液体希釈液を等張化する。そのような水性溶液は、たとえば、静脈内、筋肉内、皮下、動脈内、および腹腔内への投与に使用することができる。好ましくは、当業者に公知のように、特定的には本開示に照らして、無菌の水性媒体が利用される。例として、1回の投与量を1mlの等張NaCl溶液中に溶解させて、1000mlの皮下注入液に添加するかまたは提案された注入部位に注入することが可能である(たとえば、“Remington’s Pharmaceutical Sciences” 15th Edition, pages 1035-1038 and 1570-1580を参照されたい)。治療される対象の病状に依存して投与量のいくらかの変更を生じることは避けられないであろう。いずれにせよ、投与の責任者が個々の対象に対して適切な用量を決定するであろう。さらに、ヒトに投与する場合、調製物は、FDA Office of Biologics基準に規定された、無菌性、発熱原性、ならびに一般的安全性および純度の基準を満たさなければならない。
本発明の他の実施形態において、miR−145の阻害剤は、他の治療剤、たとえば、PAHを阻害する他の作用剤と組み合わせて使用される。併用治療の例としては、以上のものがいずれも含まれる。組合せは、両方の作用剤を含む単一の組成物もしくは薬理学的製剤を用いて、または一方の組成物がmiR−145阻害剤および他の作用剤を含む2つの個別の組成物もしくは製剤を同時に用いて、達成され得る。他の選択肢として、miR−145阻害剤を用いた治療は、他の作用剤の投与前または投与後、数分間〜数週間の範囲内の間隔で行い得る。他の作用剤およびmiR−145阻害剤が細胞に別々に適用されるいくつかの実施態様において、一般的には、作用剤およびmiR−145阻害剤が細胞に対して依然として有利な組合せ効果を及ぼし得るように、各送達の時間の間で有意な期間が経たないことが保証されるであろう。そのような場合、典型的には、互いに約12〜24時間以内で、互いに約6〜12時間以内で、または約12時間だけ遅延時間をもたせて、細胞と両方の治療剤とを接触させるであろうと考えられる。いくつかの状況で、治療期間を有意に延長することが望ましいこともあるが、その場合、それぞれの投与間で数日間(2、3、4、5、6、または7)〜数週間(1、2、3、4、5、6、7、または8)の経過期間をとる。
一実施形態において、miR−145阻害剤または他の作用剤の1回超の投与が望まれるであろう。これに関連して、種々の組合せを利用し得る。例としてmiR−145阻害剤が「A」でありかつ他の作用剤が「B」である場合、合計3回および4回の投与に基づく次の入替え、すなわち、A/B/A、B/A/B、B/B/A、A/A/B、B/A/A、A/B B、B/B/B/A、B/B/A B、A/A/B/B、A/B/A/B、A/B/B/A、B/B/A/A、B/A/B/A、B/A/A/B、B/B/B/A、A/A/A/B、B/A/A/A、A/B/A/A、A A/B/A、A/B/B/B、B/A/B/B、B/B/A/Bが例として提供される。他の組合せも同様に考えられる。他の作用剤および治療剤の特定例を以下に提供する。
本発明の一実施形態において、必要とされる対象においてPAHを抑制、予防、または治療する方法は、miR−145阻害剤、たとえば、本明細書に記載のantimiR−145と、PAHを抑制、予防、または治療するする第2の作用剤と、1種以上の追加の作用剤とを、対象に投与することを含む。一実施形態において、異なるmiR−145阻害剤の組合せ、たとえば、本明細書に記載のantimiR−145とmiR−145の小分子阻害剤との組合せが投与される。
一実施形態において、追加のまたは他の作用剤は、miR−204のアゴニストである。ヒトmiR−204−5p配列は、5’−UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU−3’(配列番号15)である。ヒトmiR−204−3p配列は、5’−GCUGGGAAGGCAAAGGGACGU−3’(配列番号16)である。miR−204のアゴニストは、成熟miR−204配列を含むポリヌクレオチドであり得る。いくつかの実施形態において、ポリヌクレオチドは、miR−204に対するpri−miRNAまたはpre−miRNA配列の配列を含む。成熟miR−204、pre−miR−204、またはpri−miR−204配列を含むポリヌクレオチドは、一本鎖または二本鎖であり得る。一実施形態において、miR−204アゴニストは、約15〜約50ヌクレオチド長、約18〜約30ヌクレオチド長、約20〜約25ヌクレオチド長、または約10〜約14ヌクレオチド長であり得る。miR−204アゴニストは、miR−204の成熟、pri−miRNA、またはpre−miRNA配列に少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一であり得る。一実施形態において、miR−204アゴニストは、配列番号15または16で示される配列を有する。ポリヌクレオチドであるmiR204アゴニストは、1つ以上の化学修飾、たとえば、ロックド核酸、ペプチド核酸、糖修飾、たとえば、2’−O−アルキル(たとえば、2’−O−メチル、2’−O−メトキシエチル)修飾、2’−フルオロ修飾、および4’チオ修飾、ならびに1つ以上の骨格修飾、たとえば、ホスホロチオエートリンケージ、モルホリノカルボキシレートリンケージ、またはホスホノカルボキシレートリンケージを含有する。一実施形態において、miR−204配列を含むポリヌクレオチドは、コレステロールにコンジュゲートされる。miR−204配列を含むポリヌクレオチドは、以上に記載したように、ベクターからvivoで発現可能あり、かつ/またはプロモーターに機能可能にリンケージ可能である。
他の実施形態において、miR−204のアゴニストは、miR−204の機能を増大、追加、または置き換えるように作用するmiR−204とは異なる作用剤であり得る。たとえば、PDGF、エンドセリン−1、アンギオテンシンII、およびSTAT3の発現または活性を阻害する作用剤は、PAHを治療、予防、または予防するために、miR−145阻害剤と組み合わせて使用可能である。作用剤は、ポリペプチド、ペプチド、小有機分子、関心対象のポリペプチドをコードする核酸などの形態で送達され得る。ポリペプチドは、サイズおよびグリコシル化にかかわらず、核酸の任意の翻訳産物であり得る。作用剤はまた、単純な薬剤、ペプチド、ペプチド断片、DNA、RNA、リボザイム、核酸とペプチドもしくはペプチド断片との工学操作されたハイブリッド、またはそれぞれの誘導体の形態をとり得る。
PAHを治療、予防、または予防するための組合せはまた、miR−145阻害剤とエポプロステノール(これらに限定されるものではない)などの血管拡張剤とを含み得る。miR−145阻害剤と共に使用可能な他の作用剤としては、エンドセリンレセプターアンタゴニスト、たとえば、ボセンタン、シタキセンタン、およびアンブリセンタン、ホスホジエステラーゼ阻害剤、たとえば、5型ホスホジエステラーゼ阻害剤、シルデナフィル、およびタダラフィル、カルシウムチャネルブロッカー、たとえば、アムロジピン、ジルチアゼム、およびニフェジピン、プロスタグランジン、たとえば、トレプロスチニル、イロプロスト、およびベラプロスト、二硝酸イソソルビド、ならびにグアニル酸シクラーゼアクチベーター、たとえば、シナシグアトおよびリオシグアトが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
抗凝固剤またはトロンビンをブロックもしくは阻害する化合物、たとえば、ワルファリンおよびトリペプチドモチーフD−Phe−Pro−Argに基づく化合物、たとえば、LY287045などもまた、使用可能である。イノガトランやメラガトランなどの多くの化合物は、当技術分野で公知であり、これらもまた使用可能である。例として、とくに、米国特許第6,326,386号、同第6,232,315号、同第6,201,006号、同第6,174,855号、同第6,060,451号、および同第5,985,833号を参照されたい。ただし、これらに限定されるものではない。
miR−145阻害剤と共に使用可能な追加の作用剤としては、アンギオテンシン変換酵素阻害剤、ニコチンレセプターアゴニスト、一酸化窒素の濃度を増大させる作用剤、抗血管新生剤、TGF−βレセプターのアゴニスト、およびデスドメインレセプターリガンドが挙げられる。
PAHを治療、予防、または予防するために同様にmiR−145阻害剤と組み合わせて使用可能なアンギオテンシン変換酵素阻害剤(ACE−I)としては、カプトプリル、ベナゼプリル、エナラプリル、フォシノプリル、リシノプリル、キナプリル、ラミプリル、イミダプリル、ペリンドプリル、エルブミン、およびトランドラプリルが挙げられるが、これらに限定されるものではない。また、ACE阻害剤の代わりにまたはそれに加えて、ACEレセプターブロッカーを使用してもよく、こうしたものとしては、ロサルタン、イルベサルタン、カンデサルタン、シレキセチル、およびバルサルタンが挙げられるが、これらに限定されるものではない。
ニコチンレセプターアゴニスト、たとえば、ニコチン(S−3−(1−メチル−2−ピロリジニル)ピリジン)およびニコチンレセプターに実質的に特異的に結合して薬理学的効果を提供する他の化合物もまた、PAHを治療、予防、または予防するために、miR−145阻害剤と組み合わせて使用可能である。ニコチンレセプターアゴニストは、天然に存在する化合物(限定されるものではないが、小分子、ポリペプチド、ペプチド、たとえば、天然に存在する植物アルカロイドが挙げられる)、内因性リガンド(たとえば、天然源から精製されるか、組換え産生されるか、または合成されるものであり、さらにはそのような内因性リガンドの誘導体および変異体が含まれる)、および合成により生成される化合物(たとえば、小分子、ペプチドなど)を包含する。「ニコチン」という用語は、ニコチンに類似した薬剤治療性を呈する、ニコチンの薬理学的に許容可能な任意の誘導体または代謝物をさらに含む。そのような誘導体、代謝物、および代謝物の誘導体は、当技術分野で公知であり、コチニン、ノルコチニン、ノルニコチン、ニコチンN−オキシド、コチニンN−オキシド、3−ヒドロキシコチニン、および5−ヒドロキシコチニン、またはそれらの薬学的に許容可能な塩を含むが、必ずしもそれらに限定されるものではない。
PAHを治療、予防、または予防するために、一酸化窒素を増加させる1種以上の作用剤と共に、miR−145阻害剤を使用することも可能である。一酸化窒素増加剤の例としては、S−ニトロソペニシラミン、ニトロプルシドナトリウム、N−エチル−2−(1−エチル2−ヒドロキシ−2−ニトロソヒドラジノ)エタンアミン(NOC12)などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。一酸化窒素の生成はまた、サイトカイン、たとえば、γ−インターフェロン、腫瘍壊死因子、IL−1、IL−2、およびエンドトキシンにより、一酸化窒素シンターゼ酵素に対するそれらの効果に基づいて、調節され得る。誘導型のNOシンターゼは、サイトカインにより増加され、構成性型のものは、サイトカインにより低減されるように思われる。HMG−CoAレダクターゼ阻害剤は、Liaoらの米国特許第6,147,109号に記載されるように、内皮細胞NOS活性をアップレギュレートすることが見いだされた。一酸化窒素シンターゼはいずれの型のものでも、タンパク質もしくはそれから得られる活性断片としてまたは発現用のDNAコンストラクトとして、利用可能である。
PAHを治療、予防、または予防するために、抗血管新生効果を有する作用剤をmiR−145阻害剤と組み合わせて使用することも可能である。こうしたものとしては、抗血管新生ポリペプチド、すなわち、アンギオスタチン、エンドスタチン、および抗血管新生反トロンビンIIIなどが挙げられ、さらには機能活性なそれらの変異体および誘導体が挙げられるが、これらに限定されるものではない。他の抗血管新生剤としては、マトリックスメタロプロテアーゼの阻害剤、たとえば、アミホスチン、WR−1065、マリマスタット、プリモマスタット(primomastat)、a−1−抗トリプシン、スフィンゴシンなどが挙げられる。
TGF−βレセプターのアゴニストもまた、関心対象となる。TGF−βレセプターI型およびII型は、TGF−βのほとんどの活性を媒介する。リガンドは、TGF−βならびにそのミメティクスおよび生物学的活性誘導体を含む。
miR−145阻害剤と共に使用するための関心対象となる他の作用剤は、デスドメインまたはそのホモログもしくはオルソログを含む哺乳動物細胞表面レセプターに結合し、かつそのように結合することによりアポトーシスのシグナルを細胞に配達する化合物、通常はポリペプチド化合物であるデスドメインレセプターリガンドを含む。これらのレセプターにより引き起こされる細胞内タンパク質相互作用は、TNF−R1のC末端近傍の約80アミノ酸ドメインに相同的でありかつ細胞傷害性のシグナル伝達に関与するデスドメインの結合相互作用に帰属可能である。TNFレセプターデスドメインファミリーは、TNF−R1、Fas(CD95)、TRAMP(wsI/Apo−3/DR−3)、TRAIL−R1(DR−4)、およびTRAIL−R2(DR−5、TRICK2、KILLER)を含む。デスドメインリガンドは、特異的デスドメインレセプターに結合することにより細胞の増殖および分化を制御するタンパク質を含む。これらのリガンドは、TNFファミリー、たとえば、TNF、リンホトキシン、CD30リガンド、4−1 BBリガンド、CD40リガンド、CD27リガンド、およびTRAIL(TNF関連アポトーシス誘導リガンド)、ならびにそれらのホモログおよびアナログを含む。
通常、免疫抑制剤として使用されるが、最近、血管平滑筋細胞の増殖を阻害することが見いだされた、ラパマイシンのアナログ、たとえば、タクロリムス(FK−506)、シロリムス、およびエベロリムスもまた、miR−145阻害剤と組み合わせて使用され得る。細胞複製の進行にきわめて重要なタンパク質c−mycのアンチセンスノックダウンは、動脈壁において細胞増殖を阻害する他の方法であり、miR−145阻害剤と組み合わせて使用可能である。
一実施形態において、GPIIb/IIIa阻害剤(たとえばRheoPro)を含む、抗血小板剤の共有結合または非共有結合もまた、miR−145阻害剤と組み合わせて使用可能であり、関心対象となる。治療剤または酸素治療などの治療もまた、miR−145阻害剤の投与と組み合わせて使用可能である。
本発明はまた、肺動脈高血圧を治療または予防するためのキットを包含する。一実施形態において、本キットは、本明細書に記載の少なくとも1種のmiR−145阻害剤と投与デバイスとを含む。特定の実施形態において、投与デバイスは、鼻または口を介してmiR−145阻害剤を肺に配達すべく設計されたデバイスである。たとえば、肺送達に好適な投与デバイスとしては、点滴器、スワブ、エアロゾル発生器、インサフレーター、ネブライザー、インヘラー(たとえば、エアロゾル系定量噴霧式吸入器)、乾燥粉末散布デバイス、および他の肺送達デバイス、たとえば、手動式、ガス推進式、音波駆動式のものが挙げられるが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態において、miR−145阻害剤は、投与デバイス内に含有される粉末として製剤化される。他の実施形態において、miR−145阻害剤は、投与デバイス内に含有される液体エアロゾルとして製剤化される。特定の実施形態において、投与デバイスはインヘラーである。miR−145阻害剤が静脈内にまたは動脈内に送達される実施形態では、本キットは、カテーテルまたは他の類似の適切な投与デバイスを含み得る。本キットは、肺高血圧を治療するために有効用量のmiR−145阻害剤を対象に投与のための説明書をさらに含み得る。ある実施形態において、本キットは、以上に記載されるような1種以上の追加の作用剤または治療剤を含む。
以下の追加の実施例により本発明をさらに説明するが、それらに限定されるものとみなしてはならない。当業者であれば、本開示に照らして、開示されている特定の実施形態に多くの変更を加え得ることかつそれにより本発明の趣旨および範囲から逸脱することなく同一もしくは類似の結果が得られることはわかるはずである。
実施例
実施例1。ヒト肺動脈平滑筋細胞(PASMC)の初代培養。
既報のように、PASMCを末梢動脈から外植した(Yang et al., 2005)。BMPR2に変異を有することがわかっている4名のPAH患者から平滑筋細胞系を取得した。これらには、位置347でシステインがアルギニンと置き換わってBMPR2のキナーゼドメインに変異を有する1名の患者(C347R)、BMPR2の細胞質テールにミスセンス変異を有して903位でアスパラギンの代わりにセリンが入った1名の患者(N903S)、アミノ酸位置9に短縮(truncating)変異を有する1名の患者(W9X)、およびアミノ酸位置899に短縮変異を有する1名の患者(R899X)が含まれる。さらに3つのPASMC調製物を非罹患対象から取得した。既報のように細胞を培養した(Yang et al., 2005)。
実施例2。凍結肺PASMCからのRNA抽出および逆転写
製造業者の説明書に従ってmiRNeasyキット(Qiagen, Hilden, Germany)を用いて組織および細胞からの全RNAを取得し、ゲノムDNA汚染を排除するためにDNAse1(増幅グレード、Sigma, St. Louis, MO, USA)で処理し、そしてNanoDrop ND-1000 Spectrophotometer(Nano-Drop Technologies, Wilmington, DE, USA)を用いて定量した。TaqMan miRNAアッセイプロトコル(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)に従ってステムループ逆転写プライマーを用いて、miRNA分析のためのcDNAを全RNAから合成した。各反応系には、50ngの抽出全RNA、50nMのステムループRTプライマー、1×RT緩衝液、各0.25mMのdNTP、3.33U/mlのMultiscribe逆転写酵素、および0.25U/mlのRNアーゼ阻害剤が含まれていた。96ウェルプレート中で、15mlの反応系を16℃で30分間、42℃で30分間、85℃で5分間インキュベートし、次いで、4℃に保持した。Superscript II逆転写酵素(Invitrogen, Paisley, UK)を用いて、全RNAからpremiRNA分析用の全cDNAを取得した。各反応系には、1mgの全RNA、1×Superscript II緩衝液、10U/mlのSuperscript II RT、0.15mg/mlのランダムヘキサマープライマー(Invitrogen, Paisley, UK)、1U/mlのRNase阻害剤(Promega, Madison, WI, USA)、および各0.25mMのdNTPが含まれていた。サイクル条件は、次のとおり、すなわち、25℃で10分間、48℃で30分間、95℃で5分間であった。−20℃でcDNAを貯蔵した。すべてのin vivoグループにわたり安定であるので、GAPDHをハウスキーピング遺伝子として選択した。
実施例3。パラフィン包埋ヒト肺からのmiRNA抽出。
LRECおよびHTAのガイドラインに準拠して、Papworth NHS Foundation Trust Hospital Tissue Bankからホルマリン固定パラフィンワックス包埋組織ブロックを取得した。末期肺高血圧のためにPapworth Hospitalで移植を受けたインフォームドコンセントが得られた患者からの肺サンプルを使用した。変異BMPR2を伴うhPAH(n=5)、iPAH(n=6)、および対照(n=6)を含む一連の病状の組織を取得した。対照は、肺癌のために肺切除を受けた患者からの腫瘍のない肺葉から採取され、かつ病理学者により腫瘍がないと報告された組織で構成された。RecoverAll全RNA単離キット(Ambion, Streetsville, Canada)を用いて、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルから全RNA(miRNAを含む)を抽出した。3つの10mmスライスをキシレンにより50℃で3分間脱蝋し、エタノールで2回洗浄し、そしてプロテアーゼにより50℃で15分間、次いで、80℃で15分間消化させた。溶解物をフィルターカートリッジに通し、そしてDNAseにより消化させ、次いで、RNAseを含まない30mlの水中にRNAを溶出させ、そしてNanoDrop ND-1000分光光度計を用いて定量した。
実施例4。成熟miRNAおよびmRNAのTaqMan q−PCR分析
定量的PCR(q−PCR)では、10mlの反応系を386ウェル光学プレート中、95℃で10分間インキュベートし、続いて、95℃で15秒間および60℃で1分間を40サイクル行った。結果をマウスおよびヒトのmiRNAではそれぞれU6またはRnu−48の値に、pre−miR−145発現ではGAPDHに規格化した。2D D Ct法(1、2)を用いて、すべてのmiRNA発現に関して変化倍率を得た。各miRNAに対するq−PCRを三重試験方式で行い、結果をサンプルの平均±標準誤差として提示する。
すべてのq−PCR実験に対して、値を変化倍率または平均±標準偏差として表す。図面の説明に記載されるように、二元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定、一元配置ANOVAおよびそれに続いてボンフェローニの事後検定または必要に応じて対応のないt検定を用いて、すべてのデータを解析した。p<0.05、**p<0.005、***p<0.001。
実施例5。野生型(wt)およびmiR−145−/−の肺動脈のマイクロアレイ分析。
各グループから10週齢の6匹のマウスの主分岐肺動脈を切除し、RNA単離前、−80℃で凍結保存した。RNAの量および質をNanoDrop(登録商標)分光光度計(Thermo Scientific, Wilmington, DE, USA)により評価した。RNA 6000 Nanoキット(Santa Clara, CA)を用いて、Agilent 2100バイオアナライザーにより、RNA完全性を評価した。Illuminaアレイ(Applied biosystems Carlsbad, California)を用いたハイブリダイゼーションのために、Illumina TotalPrep RNA増幅キット(Ambion)を用いて、500ngの供給RNAからビオチン化増幅RNAを作製した。製造業者のプロトコルに従ってIllumina mouseWG-6 v2.0発現ビーズチップをハイブリダイズし、Illumina BeadArrayリーダーにより走査し、Illumina GenomeStudio(登録商標)ソフトウェア(バージョン1.1.1)に読み込んだ。マイクロアレイデータの解析および確認では、データ処理およびR解析(ランクプロダクト統計解析が行われる)のために、分位点規格化バックグラウンド除去強度値をGenomeStudio(登録商標)ソフトウェアからエクスポートした。4グループ間で隣接比較を行った。0.05未満の偽陽性率のプローブを有意であるとみなした。マイクロアレイで使用された24サンプルから誘導されたcDNAに関する標的確認のために、Taqman遺伝子発現アッセイ(Applied Biosystems, Foster City, CA, USA)を使用した(n=18/グループ)。
実施例6。ノーザンブロット分析
全RNAを15%TBE−尿素ゲル(Invitrogen, Paisley, UK)上で分離し、トランスブロットセミドライシステム(Bio-Rad Laboratories, Hemel Hempstead, UK)を用いて非荷電ナイロン膜Hybond-NX(Amersham Bioscience UK Ltd, Buckingham, UK)に移し、そしてUV架橋した。ハイブリダイゼーション緩衝液(50%脱イオン化ホルムアミド、5×SSPE、5×デンハート溶液、0.1%SDS、および2μg熱変性ニシン精子DNA)を用いて55℃でプレハイブリダイゼーションを30分間行った。次いで、25pmolのmiR−145検出プローブまたはU6 miRCURY LNA(商標)検出プローブ5’−ジゴキシゲニン(DIG)標識(Exiqon, Denmark)を同一プレハイブリダイゼーション温度で一晩添加した。ハイブリダイゼーション後、膜を低ストリンジェンシー洗浄溶液(invitrogen, Paisley, UK)により50℃で30分間洗浄し、続いて、高ストリンジェンシー洗浄溶液(invitrogen, Paisley, UK)により30分間洗浄した。その後、膜をブロッキング溶液(マレイン酸中の1%ブロッキング試薬)中でブロックし、そして室温で抗DIG抗体(Roche Applied Science, Indianapolis, IN, USA)と共に1:5000で30分間インキュベートした。CDP Star化学発光基質(Sigma-Aldrich, Poole, UK)を用いて膜上で関心対象のmiRNAの存在を検出した。Scion Imageソフトウェアを用いてmiRNA定量を行い、関心対象のmiRNAのバンド強度を確定して相対U6シグナルに規格化した。
実施例7。免疫組織化学
ヒトおよびマウスの肺を4%パラホルムアルデヒド溶液により40℃で18時間固定し、そしてパラフィン中に包埋した。段階的濃度のキシレンおよびエタノールで脱パラフィン化した後、内因性ペルオキシダーゼ活性をブロックするために、スライドを3%H入りのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中に室温で30分間浸漬した。次いで、非特異的バックグラウンド染色を低減するために、20%正常ヤギ血清と共に30分間インキュベートした。次いで、1%(w/v)ウシ血清アルブミン(BSA)入りのPBS中で、切片をα−平滑筋アクチンに対するマウスモノクローナル抗体(Dako, Clone 1A4, High Wycombe, UK)またはアイソタイプが一致したマウスIgG非免疫対照(Dako, High Wycombe, UK)と共にインキュベートした。次いで、1%(w/v)BSA入りのPBS中に1:200を希釈された切片を適切なビオチン化二次抗体(Dako, High Wycombe, UK)と共にインキュベートし、次いで、1%(w/v)BSA入りのPBS中に1:400を希釈されたホースラディッシュペルオキシダーゼ標識Extravidin(商標)(Sigma, St. Louis, MO, USA)と共にインキュベートした。3.3ジアミノベンジジンを用いて染色を可視化し、そして核をマイヤーのヘマトキシリンで対比染色した。
実施例8。検出されたmiRNA局在化に対するin situハイブリダイゼーション。
マウスおよびヒトの肺においてmiR−145を検出するために、histoclearおよび段階的濃度のエタノールを用いて切片を再水和した。次いで、スライドを10mMクエン酸ナトリウムpH6.0中で10分間煮沸し、室温(RT)に冷却し、10mg/mlプロテイナーゼKと共に37℃で15分間インキュベートし、最後に抗原回復させるために4%PFA中、室温で10分間固定した。抗原回復後、スライドをハイブリダイゼーション緩衝液(50%ホルムアミド、4×SSC、2.5×デンハルト溶液、2.5mg/mlサケDNA、0.6mg/ml酵母tRNA、0.025%SDS、および0.1%ブロッキング試薬)と共に60℃で1時間インキュベートし、続いて、同一の緩衝液中で40nM miR−145またはスクランブルmercury LNA(商標)検出プローブ(5’−DIG標識)(Exiqon, Denmark)と共に60℃で一晩インキュベートした。融解温度は、それぞれ、79℃および78℃であった。1%ブロッキング試薬入りのPBSおよび10%FCS中、室温で切片を1時間ブロックし、続いて、1:1000希釈された抗DIG抗体(Roche Applied Science, Indianapolis, IN, USA)と共に4℃で一晩インキュベートすることにより、免疫検出を行った。次いで、スライドを0.1MトリスpH9.0と共に5分間インキュベートした。miR−145を染色するために、BM紫色溶液(Roche Applied Science, Mannheim, Germany)またはNBT/BCIP溶液(Roche Applied Science, Mannheim, Germany)をそれぞれヒトまたはマウスの切片に添加し、そして室温で3日間放置した。
実施例9。SMAおよびmiR145の共局在化。
上述したように、慣例に従って固定されたパラフィン包埋6μmヒト肺切片上でmicroRNA in situハイブリダイゼーションを行った。スライドをhistoclearにより脱パラフィン化し、そして10μg/mlプロテイナーゼ(Sigma)により37℃で20分間処理し、次いで、4%パラホルムアルデヒドにより10分間固定した。リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄後、スライドをハイブリダイゼーション緩衝液と共に60度で1時間インキュベートした。次いで、スライドを60℃で40nM DIG標識miR145またはスクランブルプローブ(Exiqon)により一晩ハイブリダイズした。洗浄およびブロッキングの後、スライドをブロッキング緩衝液中で抗DIG_AP Fabフラグメント(Roche)と共に4度で一晩インキュベートし、そしてPBST(PBS+0.1%Tween 20)および0.1MトリスHCL(pH9.5)で洗浄した。染色が顕微鏡下で見えるようになるまで、BM紫色溶液(Roche)によりmiR−145を室温で1〜2日間可視化した。PBSで洗浄した後、スライドを0.3%H入りのPBSで10分間クエンチした。非特異的バックグラウンドをブロックするために、10%ウサギ正常血清をスライド上に1時間適用し、次いでスライドを、10%正常血清中、4℃でモノクローナル抗ヒトα平滑筋アクチン(DAKO)と共に一晩インキュベートした。色素原として3,3’−ジアミノベンジジンを用いてスライドを5分間可視化した。可視化を図1に示す。
実施例10。miR−145発現の排除は、マウスにおいて肺動脈高血圧の発症を防ぐ。
miR−145が肺組織中で発現されたかを評価するために、以上に記載したように、野生型(wt)マウスの肺組織切片上でin situハイブリダイゼーションを行った。マウスの肺の血管および気管支の平滑筋層内にmiR−145の陽性染色が観察された(図2A)。miR−145発現が傷害に対する反応時に変化されたかを評価するために、14日間低酸素暴露されたwtマウスからの全肺および右室においてmiR−145の発現を定量的PCRにより評価し、この発現を正常酸素条件に暴露されたマウスと比較した。分析の結果、低酸素に対する反応により肺および右室の両方でmiR−145の有意なアップレギュレーションが明らかにされた(それぞれ図2B、C)。miR−143レベルもまたアップレギュレートされた(図3)。同一動物の脳、腎臓、および脾臓におけるmiR−145発現の分析の結果、いかなる異常制御も明らかにされなかった(図4)。したがって、miR−145は、マウスの肺の平滑筋細胞内で発現され、低酸素に対する反応により肺において選択的にアップレギュレートされる。単離されたヒト遠位肺動脈SMCにおいて、24時間および72時間の低酸素暴露時にmiR−145の変化が検出されなかったことから、複数の細胞の血管区画(図5)におけるin vivoでの複雑な制御が示唆される。
次いで、PAHの発症に対するmiR−145の遺伝子破壊の効果を評価した。miR−145ノックアウトマウスは、既報である(Xin et al. (2009) Genes Dev., Vol. 23: 2166-2178)。ホモ接合miR−145−/−雌マウスまたは年齢の一致する野生型対照(8週齢のC57BL6J/129SVEV系統)を慢性低酸素に4日間暴露または正常酸素条件に維持し、そして10週齢で評価した。
8週齢のmiR−145ノックアウト(miR−145−/−)マウスおよび年齢の一致する対照の同腹仔を慢性低酸素に14日間暴露または正常酸素条件で維持し、10週齢でPAHの発症に関して評価した。すべての実験で、イソフルラン(O中1.5%)麻酔下のマウスにおいて、経横隔膜的に針を右室中に前進させて収縮期右室圧(sRVP)を測定した。既報のように、カニューレを頸動脈中に配置して全身動脈圧(SAP)を記録した(Keegan et al., 2001)。右室壁(RV)重量と左室+中隔(LV+S)重量との比として右室肥大(RVH)を判定した。既報のように、弾性線維ワンギーソン(EVG)染色法により肺切片を染色し、そして盲検方式でリモデリングされた血管のパーセントを決定した(Keegan et al., 2001)。血管断面の直径の少なくとも半分で観測可能な個別の二重弾性膜を有する場合、動脈は、筋肉化されたとみなした。5匹のマウス/グループをリモデリングに関して分析した。各肺切片から約150の動脈を評価した。
研究に使用したノックアウト動物におけるmiR−145発現の不在を定量的PCR(q−PCR)およびin situハイブリダイゼーションにより確認した(図6)。miR−145は、miR−143とクラスターを形成してそのpri−miRNA型で転写されるので、正常酸素および低酸素の両方の条件下の野生型動物およびノックアウト動物においてmiR−143の発現をも分析し、miR−143レベルが、miR−145の遺伝子破壊の後および低酸素傷害に対する反応により、肺において実質的に変化しないことを確認した。野生型マウスおよびmiR−145−/−マウスの全肺から抽出されたRNAでmiR−143発現のq−PCR分析を行ったが、野生型動物とmiR−145−/−動物との間で低酸素に対する反応により差を示していなかった(図7)。したがって、miR−145−/−における低酸素に対する反応によるPAHの発症の変化はいずれも、miR−145の選択的損失に特異的であった。
次いで、野生型マウスおよびmiR−145−/−マウスにおけるPAHの発症を定量化した。野生型マウスでは、収縮期RVPおよびRVHの顕著な予想された増加が観察された(図8A、B)。これとは対照的に、miR−145−/−動物は、収縮期RVPまたはRVHの増加を示さなかった。興味深いことに、野生型とmiR−145−/−マウスとの間にベースラインの収縮期RVPまたはRVHの差は存在しなかった(図8A、B)。測定値を表1および2に示す。
Figure 2014516027
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組織学的分析では、低酸素暴露後、野生型動物の肺小動脈(PA)における肺血管リモデリングの存在が示されたが、そのようなリモデリングは、miR−145−/−動物から採取された肺において低減され、この知見は、定量的スコアにより確認された(図8C、D)。したがって、miR−145の遺伝子破壊は、低酸素に対する反応によるPAHの発症からマウスを保護する。
平均SAPは、予想どおり、対照と比較してmiR−145−/−マウスでは低減され、これまでに発表された研究と合致する(Elia et al., 2009; Xin et al., 2009)。野生型マウスおよびmiR−145−/−マウスのSAPはいずれも、低酸素暴露により変化せず(図9A)、低酸素暴露されたwtマウスでもmiR−145−/−マウスでも、心拍数(HR)の変化は、観測されなかった(図9B)。
この一連の実験の結果から、miR−145は、正常酸素条件(図8A、B)または低酸素条件に付されたマウスから採取された肺において平滑筋細胞区画で排他的に発現されることが示される。低酸素マウスモデルでは、miR−145レベルは、対照と比較して上昇し、miR−145の遺伝子破壊は、PAHの発症を予防する。miR−145−/−マウスの血管系の機能分析では、低酸素に対する反応の低減が明らかにされ、これらのマウスを低酸素に2週間暴露した場合、収縮期圧は、野生型マウスのように著しい上昇を示さなかった。右室肥大に関しても類似の結果が得られた。それに加えて、リモデリングされた血管のパーセントは、ノックアウト動物において有意に低減されたことから、PAH発症におけるmiR−145破壊の保護的役割が強く示唆される。この効果は、miR−143の調節がまったく存在しなくても起こるので、PAHの発症におけるmiR−145の重要性が確認される。したがって、これらの知見から、miR−145は、PAHの治療を設計するための実用性のある治療標的であり得ることが示唆される。
実施例11。対照と比較した、miR−145−/−マウスの肺におけるmiR−145予測標的の分析。
遺伝子およびタンパク質の発現に対するmiR−145破壊の効果を確認するために、文献ですでに確認されたまたはTargetScanおよびPicTarの予測アルゴリズムを用いて同定されたかつPAHに関与する可能があるとして選択されたいくつかのmiR−145遺伝子標的を、wt動物およびmiR−145 ko動物の肺組織において、q−PCRにより分析した。それらは、KLF4およびKLF5(クルッペル様因子4および5)(両方ともSMCの増殖および分化に関与する)ならびにSMAD4およびSMAD5(TGF−βスーパーファミリーのシグナリング媒介物)を含んでいた。RNA分析の結果、miR−145−/−正常酸素マウスでは、wt正常酸素マウスと比較して、SMAD4およびのSMAD5の両方の有意なアップレギュレーションが明らかにされた(図10A、B)。KLF4は、正常酸素および低酸素の両方のmiR−145−/−マウスで増加し、KLF5発現は、miR−145−/−低酸素マウスと対比してwt低酸素マウスで有意にアップレギュレートされた(図10C、D)。低酸素条件でのWT動物およびKO動物におけるKLF4タンパク質発現のウェスタンブロット分析の結果、この標的の有意なアップレギュレーションが確認されたが、正常酸素では有意な変化が観測されなかった(図11)。これとは対照的に、KLF5タンパク質レベルは、正常酸素条件および低酸素条件のいずれでも同一サンプルで有意にアップレギュレートされなかった(図11)。
実施例12。WT動物と比較したmiR−145−/−マウスのPAにおける遺伝子発現プロフィールのマイクロアレイ分析。
miR−145−/−低酸素グループ、WT低酸素グループ、miR−145−/−正常酸素グループ、およびWT正常酸素グループのそれぞれから6つのサンプルを用いて、グローバルトランスクリプトーム分析を行った。miRWalk中のデータベースの少なくとも3つで予想された3’UTR miRNA結合領域を有し、かつmiR−145−/−低酸素とWT低酸素との比較で有意な偽陽性率を有する潜在的miR−145標的をさらなる分析に供すべく選択した。Ingenuity経路分析ソフトウェアおよびDatabase for Annotation, Visualization and Integrated Discovery(DAVID)を用いて、肺高血圧に関連する経路中に存在する標的を選択した。これらの選択基準を用いてリアルタイムPCRにより確認すべく、合計13の標的を選択した(表3)。
Figure 2014516027
確認された(validated)miR−145標的のFSCN1、DAB2、およびACEをさらなる分析に供すべく選択した(Cheng et al., 2009、Boettger et al., 2009、Kano et al., 2010、Xu et al., 2009)。マイクロアレイから選択された標的のうち10種をリアルタイムPCRにより確認した(図12)。標的TGFB2、FRZB、ACE、CTGF、ANGPTL4、AP2B1、およびITGBL1の7種では、すべての他のグループと対比して、WT低酸素グループが有意に発現増加を示した(図12)。さらに、リアルタイムPCRデータは、WIF1、CAMK2A、TTN、ACE、DAB2、およびFSCN1に対してマイクロアレイで観測されたグループ間変化を反映し(表3)、これらの変化が有意であることを示した(図12)。マイクロアレイで観測された変化は、TMOD1およびAPH1Aでは確認されなかった(図示せず)。確認された標的を5つのグループ、すなわち、wntシグナリングの阻害剤(WIF1、FRZB、DAB2)、アクチン細胞骨格の制御(FSCN、TTN)、転写制御(CAMK2A)、細胞接着(ITGBL1、CTGF)、および内皮機能(ACE、ANGPTL4)に分類した。アレイデータのさらなる分析により、WNTシグナリング経路の多くの成分で顕著な変化が明らかにされた(表4)。
Figure 2014516027
このように、単離肺動脈に関する全トランスクリプトームマイクロアレイ研究を用いて、低酸素に対する転写反応を定量化した。KLF4および5の発現は、miR−145制御と相関し、低酸素miR−145ノックアウトマウスにおいてこれらの両方の標的の有意なアップレギュレーションを生じる。WT低酸素とmiR145−/−低酸素との比較から確認された3種の標的は、カノニカルwnt/β−カテニンシグナリングを阻害する。WIF1およびFRZBは、細胞外空間でWntタンパク質に結合し、リガンド−レセプター相互作用を抑制し(Leyns et al , 1997、Hsieh et al., 1999、Jiang et al , 2009、Baldin et al., 1993、Baranwai et al., 2009)、一方、DAB2は、リン酸化アキシンを安定化し、β−カテニンのプロテアソーム分解を増大させることによりWnt/β−カテニンシグナリングを減少させる(Jiang et al., 2009)。これらの因子は、wntシグナリングを阻害してサイクリンD1(CCND1)やEカドヘリン(CDH)などのwnt標的遺伝子の発現の減少をもたらし、これらはまた、miR145−/−低酸素グループでダウンレギュレートされることが見いだされた(表2)。CDHおよびCCND1のダウンレギュレーションは、それぞれ、細胞骨格再組織化および増殖低減を引き起こし得る(Baldin el al. , 1993; Baranwai et al., 2009)。したがって、wnt/β−カテニンシグナリングの阻害は、miR145−/−マウスにおいて低酸素で観測された表現型に寄与し得る。
実施例13。対照マウスおよびmiR−143 antimiRで処置されたwtマウスと比較したmiR−145 antimiRで処置されたwtマウスにおけるPAHの発症の定量化。
慢性低酸素に対する反応でmiR−145破壊マウスにおいて観測されたPAHの発症に対する保護効果が、miR−145の薬理学的操作により再現可能であることを決定するために、LNA antimiRを使用した。
LNA antimiRは、16ヌクレオチド長であり、成熟miR−145(配列番号13)または成熟miR−143(5’−TACAGTGCTTCATCTC−3’、配列番号14)の塩基2〜17を標的とし、miR−143またはmiR−145のいずれかの5’領域に完全に相補的な完全にホスホロチオレート化されたオリゴヌクレオチドとして存在し、LNAとDNAとの混合体として合成された。LNA対照オリゴヌクレオチド(スクランブル)は、同程度のLNA/DNA含有量を有するC.エレガンス(C. elegans)特異的miRNAを指向する配列で構成された。antimiRおよび対照オリゴヌクレオチドは、皮下注射(0.2ml生理食塩水中25mg/kg)を介して雌C57B16マウス(8〜10週齢)に投与された。マウスは、14日間低酸素暴露の1および8日目にオリゴヌクレオチドまたは媒体を注射された。
8週齢の雌C57B16マウスにmiR−145またはmiR−143に特異的なantimiRを皮下注射し、次いで、慢性低酸素に2週間暴露し、媒体およびスクランブルで処置されたマウスと比較した。低酸素暴露の8日目に第2の用量を注射した。処置動物においてmiR−145またはmiR−143の選択的かつ実質的なダウンレギュレーションがq−PCRにより肺で確認された(図13A、B)。スクランブル処置されたマウスは、miR−143およびmiR−145のいずれでも発現に変化を示さなかった(図13A、B)。ノーザンブロットにより選択的ダウンレギュレーションを確認した(図13C〜F)。次いで、対照と比較して処置マウスにおけるPAHの発症を評価し、媒体処置正常酸素マウスと比較して、媒体処置低酸素マウスにおいて、収縮期RVPおよびRVHの有意な上昇を観測した(図14)。スクランブル処置動物およびantimiR−143動物では同一の効果が観測されたが、miR−145に対するantimiRで処置されたマウスは、収縮期RVP(図14A)の有意な減少を示した。antimiR−145またはantimiR−143で処置されたマウスでは、RVHおよびSAPの変化は、観測されなかった(図14B)。組織学的分析では、低酸素に暴露された媒体処置マウスまたはスクランブル処置マウスにおいて観測されたリモデリングのパーセントと比較して、慢性低酸素に暴露されたantimiR−145処置マウスの小PAの肺血管リモデリングの有意な減少を示した(図14C、D)。これらのデータから、miR−143ではなくmiR−145の選択的薬理学的操作により、低酸素に暴露されたマウスにおいてPAHの発症が予防されることが示される。平均SAPの変化は観測されなかった(図I5A)。グループにわたる変化は、HRでは観測されなかった(図15B)。
実施例14。miR−145発現は、特発性または遺伝性のPAHのヒト患者の肺組織において増大される。
PAHの発症におけるmiR−145の役割をさらに解明するために、特発性PAH(iPAH)または遺伝性PAH(hPAH)の患者から採取された肺組織におけるmiR−145発現を対照肺組織と比較した。末期肺高血圧のために移植を受けた患者から肺サンプルを取得した。変異BMPR2(n=5)に関連するhPAHまたはiPAH(n=6)と診断された患者から肺組織を取得した。対照(n=6)は、肺癌のために肺切除を受けた患者からの腫瘍のない肺葉から採取されたかつ病理学者により腫瘍がないと報告された組織で構成された。
上述のように、パラフィン包埋肺組織からmiRNAを抽出して、定量的PCRにより発現レベルを評価した。対照と比較して、miR−145は、hPAHおよびiPAHのサンプルの両方で有意に増加した(図16A)。次いで、in situハイブリダイゼーションを用いて、以上の患者グループから選択されたヒト肺におけるmiR−145の発現の位置を特定した(図16B)。マウス肺の分析と一致して、対照肺切片におけるmiR−145の発現は、血管および細気管支の両方の系列を含む、肺の平滑筋細胞に限定された(confined)(図16B)。PAHは、前腺房および腺房内の肺動脈を含む同心状および叢状の両方の動脈病変の発症により特徴付けられる。iPAHおよびhPAHの患者では、miR−145は、動脈の平滑筋細胞により発現され、どこに存在するかにかかわらず、同心状病変および叢状血管病変の筋肉成分中に観測された(図16B)。miR−145陽性細胞はまた、血管が筋肉化された前腺房および腺房内の動脈で観測された(図16B)。それに加えて、肺胞管のレベルで新たに筋肉化された細動脈は、豊富なmiR−145 mRNAを発現した(図16B)。in situ局在化は定量的でないが、miR−145発現は、中膜層(medial layer)内に存在するより分化したSMCと比較して、新生内膜筋線維芽細胞中ではとくに低減された(たとえば図16C参照)。まとめると、ヒト肺では、miR−145は、平滑筋細胞区画中で発現される。miR−145発現はまた、hPAHおよびiPAHの患者で複合病変のリモデリングされた血管内で観測される。いくつかの血管では、miR−145のレベルは、新生内膜細胞において低減されるように思われる。
BMPR2変異を有する患者から単離されたPASMCの増殖および特徴は、生殖系列変異を伴わない患者から単離されたものとは基本的には異なるので、培養下でヒト一次細胞を用いて、miR−145制御に対するBMPR2変異の効果を評価した。PAH患者から取得した一次ヒトPASMCを培養して、培養細胞中のpre−miRNAのmiRNAレベルおよび成熟miRNAレベルを定量した。pre−miR−145および成熟miR−145は両方とも、非罹患対照と比較して既知のBMPR2変異を有する患者に由来する細胞において有意に増加する(図17A、B)。ノーザンブロット分析を行って、同一サンプルで成熟miR−145のレベル差を確認および定量した。PCR分析と一致して、miR−145は、非変異対照PASMCと比較してBMPR2に変異を有する患者から抽出されたRNAにおいて有意に増加した(図17C、D)。したがって、miR145の基礎レベルは、生殖系列BMPR2変異を有する患者では増加する。
実施例15。ヒトPASMCにおけるmiR−143およびmiR−145の発現に対するBMPR2ダウンレギュレーションの効果
ヒトWT PASMCにおいてmiR−143およびmiR−145の発現レベルに対するBMPR2のsiRNA媒介ノックダウンの効果をインビトロで評価するために、BMPR2を標的として特異的にダウンレギュレート可能な低分子干渉(si)配列または陰性対照としてのsiスクランブルを細胞にトランスフェクトした。
PASMCを6ウェルプレートに接種して(1.5×105細胞/ウェル)、DMEM/10%FBS中で2日間増殖させた。トランスフェクション前、PASMCをOptimem I中で3時間インキュベートした。0日目、OptimemI中に希釈されたDharmaFECT1(商標)(4ml/ウェル)との複合状態のsiRNA[BMPR−IIもしくはSmad4に対するDharmacon(商標) On-TARGETplus siRNAまたはsi対照非標的化プール(siCP)(Perbio Science UK Ltd)]を最終濃度10nMでPASMCにトランスフェクトした。最終体積の半分の体積(1ウェルに対して200ml)のOptimemI中でDharmafectを5分間インキュベートし、続いて、10×最終濃度で関連siRNAを含有するOptimemI(1ウェルに対して200ml)を添加し、siRNAを5×最終濃度にした。ミックスを室温で20分間インキュベートしてリポプレックスを形成させた。トランスフェクションミックス(400ml/ウェル)を新鮮なOptimemI(1.6ml/ウェル)中の細胞上に滴下してウェルの十分な被覆を確保した。細胞を複合体と共に37℃で4時間インキュベートし、続いて、1日目にDMEM/10%FBSと24時間交換した。
4日後、これらのサンプルからおよび未処置細胞からRNAを抽出した。BMPR2のダウンレギュレーションは、miR−143およびmiR−145の両方の有意なアップレギュレーションを誘発したが、未処置細胞またはsiスクランブル処置細胞では変化は観測されなかった(図18)。
この一連の実験の結果から、miR−145レベルは、hPAHおよびiPAHの患者からのヒトサンプルにおいて増加し、かつmiR−145発現は、複合病変の中膜および新生内膜のSMCに局在化されることが示される。また、この結果から、肺平滑筋細胞におけるBMPR2変異とmiR−145レベルの増加との間の特異的関係が実証される。興味深いことに、分析されたPAH患者の全肺におけるmiR−145のアップレギュレーションにもかかわらず、iPAHおよびhPAHの患者の血管におけるこのmiRNAのin situ局在化は、肥大した動脈、肺血管病変、および新たに筋肉化された細動脈において豊富なmiR−145 mRNA発現を示した。miR−145発現の操作は、PAHの発症に対して実質的な影響を及ぼすように思われるので、miR−145のダウンレギュレーションは、PAHに対する新規な治療手段である。
実施例16。BMPR2 R899XマウスにおけるmiR−145発現。
PAHのマウスモデルにおけるおよびBMPR2遺伝子に変異を有するPAH患者から抽出されたPASMCにおけるmiR−145制御の重要性を考慮して、ヘテロ接合R899+/−マウスにおけるmiR−145発現に対する短縮BMPR2変異の効果を評価した。このマウスは、既報のR899Xトランスジェニックマウス(West et al., 2008)に類似して、自然肺高血圧を発症する。
6ヶ月齢のマウスの全肺からRNAを抽出して、miR−145に対するq−PCRおよびノーザンブロットにより分析した。これにより、対照と比較して変異マウスのmiR−145の有意なアップレギュレーションが明らかにされた(図19A〜C)。パラフィン肺切片におけるmiR−145のin situ局在化では、wtマウスおよびBMPR2変異マウスの両方の肺血管および気管支の平滑筋層中で陽性染色が確認され、変異動物では強い染色が観測された(図19D)。
実施例では、マウス肺のmiR−145が平滑筋に局在化することが実証される。定量的PCR(q−PCR)を用いて、低酸素に暴露される野生型(wt)マウスにおけるmiR−145の発現の増加が実証された。miR−145は、慢性低酸素に対する反応によりマウスにおいて有意にアップレギュレートされ、miR−145の遺伝子破壊またはantimiR駆動薬理学的低減は、マウスにおいてPAHの発症を防ぐ。
miR−145−/−マウスの血管系の機能分析では、慢性低酸素への肺血管反応の低減および右室肥大の低減が明らかにされた。miR−145ノックアウトマウスおよびantimiRで処置されたマウスにおいて、収縮期右室圧(sRVP)、右室肥大(RVH)、およびリモデリングされた肺動脈のパーセントの測定を介して、PAHを評価した。それに加えて、リモデリングされた血管のパーセントは、ノックアウト動物において有意に低減されたことから、PAH発症におけるmiR−145破壊の保護的役割が強く示唆される。miR−145発現を実質的に低減可能なantimiRで処置されたwtマウスにおいて、類似の保護効果が観測された。したがって、miR−145欠損およびantimiR媒介低減は、PAHの発症からの有意な保護をもたらした。これとは対照的に、miR−143 antimiRは、効果がなかった。
さらに、非罹患対照と比較して特発性および遺伝性のPAH(iPAH、hPAH)の患者の肺組織においてmiR−145のアップレギュレーションが観測され、リモデリングされた血管のSMCにおいてmiR−145の発現が実証された。ヒト組織では、対照と比較して、miR−145の前駆型および成熟型は、BMPR2遺伝子に変異を有するPAH患者から取得した組織内においておよび単離PASMCにおいて、増加する。BMPR2変異を有する患者から培養された一次PASMCにおいて、さらにはbmpr2欠損マウスの肺において、miR−145発現レベルの増加が見られた。この保存された異常制御から、miR−145の制御とTGF−βスーパーファミリーとの間の関連性の存在が示唆される。
miR−145は、PAHのマウスモデルにおいて異常制御され、miR−145のダウンレギュレーションは、PAHの発症を防ぐ。hPAHおよびiPAHの患者サンプルでは、miR−145は、リモデリングされた血管において発現され、BMPR2中の変異は、マウスおよびPAH患者においてmiR−145のアップレギュレーションをもたらす。これらの観測に基づいて、PAHの発症には、miR−145の決定的な役割が存在し、miR−145の操作は、PAH治療で新規な戦略になる。
本明細書で考察および引用された出版物、特許、および特許出願はすべて、それらの全体を参照により本明細書に援用する。開示された本発明は、記載の特定の方法、プロトコル、および材料に限定されるものではない。なぜなら、これらは、変更可能であるからである。同様に、本明細書中で用いられる用語は、特定の実施形態を説明することだけを目的としたものにすぎず、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定しようとするものではない。
当業者であれば、通常の実験の域を出ることなく、本明細書に記載の本発明の特定の実施形態に対する多くの等価形態がわかるであろう。またはそれらを確認することができるであろう。そのような等価形態は、以下の特許請求の範囲内に包含されるものとする。
参照文献
Figure 2014516027
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Claims (43)

  1. miR−145の阻害剤を対象に投与することを含む、肺動脈高血圧(PAH)の治療または予防を必要とする対象において肺動脈高血圧(PAH)を治療または予防する方法。
  2. miR−145の阻害剤が、成熟miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項1に記載の方法。
  3. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、5’−GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU−3’または5’−GGAUUCCUGGAAAUACUGUUCU−3’の配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含む、請求項2に記載の方法。
  4. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの糖修飾を含む、請求項2または3に記載の方法。
  5. 前記少なくとも1つの糖修飾が2’−O−アルキル修飾または二環式糖ヌクレオシド修飾である、請求項4に記載の方法。
  6. 前記二環式糖ヌクレオシド修飾がロックド核酸である、請求項5に記載の方法。
  7. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの骨格修飾を含む、請求項2〜6のいずれか1項に記載の方法。
  8. 前記骨格修飾がホスホロチオエートリンケージである、請求項7に記載の方法。
  9. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約8〜約18ヌクレオチド長である、請求項2〜8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約12〜約16ヌクレオチド長である、請求項9に記載の方法。
  11. 前記阻害剤が吸入投与経路により前記対象に投与される、請求項1〜10のいずれか1項に記載の方法。
  12. 前記阻害剤が乾燥粉末剤として製剤化される、請求項11に記載の方法。
  13. 前記阻害剤が液体エアロゾル剤として製剤化される、請求項11に記載の方法。
  14. 前記対象がヒトである、請求項1〜13のいずれか1項に記載の方法。
  15. 前記ヒトが、骨形成タンパク質2型レセプターをコードする遺伝子に変異を有する、請求項14に記載の方法。
  16. miR−145の阻害剤と投与デバイスとを含む、肺動脈高血圧を治療または予防するためのキット。
  17. 前記投与デバイスがインヘラーである、請求項16に記載のキット。
  18. miR−145の阻害剤が、成熟miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項16または請求項17に記載のキット。
  19. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、5’−GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU−3’または5’−GGAUUCCUGGAAAUACUGUUCU−3’の配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含む、請求項18に記載のキット。
  20. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの糖修飾を含む、請求項18または請求項19に記載のキット。
  21. 前記少なくとも1つの糖修飾が2’−O−アルキル修飾または二環式糖ヌクレオシド修飾である、請求項20に記載のキット。
  22. 前記二環式糖ヌクレオシド修飾がロックド核酸である、請求項21に記載のキット。
  23. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの骨格修飾を含む、請求項18〜22のいずれか1項に記載のキット。
  24. 前記骨格修飾がホスホロチオエートリンケージである、請求項23に記載のキット。
  25. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約8〜約18ヌクレオチド長である、請求項18〜24のいずれか1項に記載のキット。
  26. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約12〜約16ヌクレオチド長である、請求項25に記載のキット。
  27. 前記阻害剤が、前記投与デバイス内に含有される粉末剤として製剤化される、請求項16〜26のいずれか1項に記載のキット。
  28. 前記阻害剤が、前記投与デバイス内に含有される液体エアロゾル剤として製剤化される、請求項16〜26のいずれか1項に記載のキット。
  29. 肺動脈高血圧(PAH)の治療または予防を必要とする対象において肺動脈高血圧(PAH)を治療または予防する方法に使用するための、miR−145の阻害剤であって、前記方法が、miR−145の阻害剤を前記対象に投与することを含む、miR−145の阻害剤。
  30. miR−145の阻害剤が、成熟miR−145配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドである、請求項29に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  31. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、5’−GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU−3’または5’−GGAUUCCUGGAAAUACUGUUCU−3’の配列に少なくとも部分的に相補的な配列を含む、請求項30に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  32. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの糖修飾を含む、請求項30または31に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  33. 前記少なくとも1つの糖修飾が2’−O−アルキル修飾または二環式糖ヌクレオシド修飾である、請求項32に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  34. 前記二環式糖ヌクレオシド修飾がロックド核酸である、請求項33に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  35. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが少なくとも1つの骨格修飾を含む、請求項30〜34のいずれか1項に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  36. 前記骨格修飾がホスホロチオエートリンケージである、請求項35に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  37. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約8〜約18ヌクレオチド長である、請求項30〜36のいずれか1項に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  38. 前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが約12〜約16ヌクレオチド長である、請求項37に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  39. 前記阻害剤が、吸入投与経路により前記対象に投与されるか、または前記阻害剤が、吸入投与経路により前記対象に投与するのに好適である、請求項29〜38のいずれか1項に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  40. 前記阻害剤が乾燥粉末剤として製剤化される、請求項39に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  41. 前記阻害剤が液体エアロゾル剤として製剤化される、請求項39に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  42. 前記対象がヒトである、請求項29〜41のいずれか1項に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
  43. 前記ヒトが、骨形成タンパク質2型レセプターをコードする遺伝子に変異を有する、請求項42に記載の使用のためのmiR−145の阻害剤。
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