JP2014094006A - カルボン酸エステルの転化方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】配列番号2を有するポリペプチドまたはその変異体の活性が、該細胞の野生型に対して低減されている組み換え細胞を用いる。
【選択図】なし
Description
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの細胞による転化方法であって、
a)前記細胞と前記カルボン酸エステルとを水溶液中で接触させる工程
を含み、前記の細胞が、配列番号2を有するポリペプチドまたはその変異体の活性が、該細胞の野生型に対して低減されている組み換え細胞である前記方法、ならびに前記方法に適した細胞および前記細胞の使用に関する。
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの細胞による転化方法であって、
a)前記細胞と前記カルボン酸エステルとを水溶液中で接触させる工程
を含み、前記の細胞が、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が、該細胞の野生型に対して低減されている組み換え細胞である前記方法によって解決される。
b)前記水溶液と、カチオン交換体を含む疎水性の有機溶液とを接触させる工程
を含む方法によって解決される。
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基、特に少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有するアルキレン基である]のカルボン酸エステルの、相応の細胞の野生型に対する生産向上のために用いる使用によって解決される。
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基、好ましくは少なくとも8つの炭素原子を有するアルキレン基である]のカルボン酸エステルの転化のために用いる使用によって解決される。
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルを含む反応混合物によって解決される。
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの転化に関する。アルキレン基Aは、それが少なくとも4つの炭素原子を有するという条件では、任意の、特に直鎖状の、分枝鎖状のもしくは環状のアルキレン基であってよい。特に好ましい一実施形態においては、前記のAは、式−(CH2)n−のアルキレン鎖であり、式中、nは、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29または30であってよい。最も好ましい一実施形態においては、前記のAは、式−(CH2)n−のアルキレン基であり、式中、nは、4〜24であり、好ましくは4〜22であり、最も好ましくは4〜10であり、R1は、水素、−CH2OH、−CHOもしくは−COOHであり、最も好ましくは水素であり、かつR2は、メチルもしくはエチルである。
)、ブルクホルデリア・タイランデンシス(Burkholderia thailandensis)、藍藻(Cyanobakterien)、クレブシエラ・エスピー(Klebsiella sp.)、クレブシエラ・オキシトカ(Klebsiella oxytoca)、サルモネラ・エスピー(Salmonella sp.)、リゾビウム・エスピー(Rhizobium sp.)およびリゾビウム・メリロチ(Rhizobium meliloti)を含む群から選択される細菌であってよい。特に好ましい一実施形態においては、腸内細菌、最も好ましくはエシェリキア・コリである。
E.コリW3110およびBW25113におけるbioHの不活性化
基礎ベクターpKO3_E933によるbioH遺伝子(b3412、配列番号1)の狙い通りのノックアウトのために、新たなプラスミドが必要となった。ベクターpKO3_E933(配列番号14)を基礎とし、bioH遺伝子の500bp上流(配列番号3)あるいは500bp下流(配列番号4)が組み込まれ、それらはPspXI切断部位(CCTCGAGG)によって隔てられて存在する。完成されたプラスミドは、内部名称AHp-LL-42(配列番号5)を有する。その完成のためには以下のオリゴヌクレオチドを使用した:
o-LL-314(配列番号6)
5’-CCGGGGATCGCGGCCCGGCTTCGCTATCCCATTGGCAGT-3’
o-LL-315(配列番号7)
5’-CCTCTGCTTCAACGCCCTCGAGGCATCCGCTATTGTTCTCTTTTGACTTACAAGGATG-3’
o-LL-316(配列番号8)
5’-GCGTTGAAGCAGAGGGTGTAGGTG-3’
o-LL-317(配列番号9)
5’-TAGAGGATCGCGGCCCAAACTGGCAAGGCAGCTTTATGC-3’
初期変性:98℃で10秒
30回の変性:98℃で10秒
30回のアニーリング:57.9℃/58.8℃/59.7℃/60.6℃/61.4℃/62.3℃/63.2℃/64.1℃(温度勾配)
30回の伸長:72℃で20秒
最終伸長:72℃で4分間
遺伝子bioH中に欠失を有するE.コリW3110による、バシラス・サチリス由来の遺伝子aldとクロモバクテリウム・ビオラセウム由来のCv_2025についての発現ベクターを、シュードモナス・プチダのalkオペロンからの遺伝子alkB、alkG、alkTおよびalkLについての発現ベクターと組み合わせて使用することによるアミノラウリン酸メチルエステルの生産
バシラス・サチリス由来の遺伝子ald(アラニン−デヒドロゲナーゼをコードする、E.コリ用にコドン最適化された)と、クロモバクテリウム・ビオラセウム由来のCv_2025(トランスアミナーゼをコードする、E.コリ用にコドン最適化された)についての発現ベクターを、シュードモナス・プチダのalkオペロンからの遺伝子alkB、alkG、alkT(アルカン−モノオキシゲナーゼ、ルブレドキシンおよびルブレドキシン−レダクターゼをコードする)およびalkL(膜タンパク質/トランスポータータンパク質をコードする)についての発現ベクターと組み合わせて有するE.コリ菌株の作成のために、電気的にコンピテントにされたE.コリW3110ΔbioHと、相応の対照菌株E.コリW3110を製造した。それは、当業者に公知の様式および方法で行った。それらの菌株は、例1に記載されるように製造した。これらの菌株を、プラスミドpBT10_alkL(配列番号11もしくはWO/2011/131420およびそこに挙げられるSeq ID NR: 8)およびpJ294[alaDH_Bs(co)TA_Cv(co)](配列番号12もしくはWO/2013/024114の例1およびそこに挙げられるSEQ ID Nr. 17)で形質転換し、カナマイシン(50μg/ml)およびアンピシリン(100μg/ml)を有するLBアガープレート上にプレーティングした。形質転換体を、プラスミド調製と分析的な制限分析によって正確なプラスミドの存在について調べた。このようにして以下の菌株を作成した:
発酵試料におけるALS、ALSME、DDS、DDSME、LS、LSME、HLS、HLSME、OLSおよびOLSMEの定量化は、LC−ESI/MS2によって、全ての分析物についての外部校正(0.1〜50mg/L)をもとに、かつアミノウンデカン酸(AUD、これは、HLS、DDS、OLS、HLSME、OLSMEのため)、d4−ALSME(ALSMEのため)、13C−DDSME(DDSMEのため)、d3−LS(LSのため)およびd3−LSME(LSMEのため)といった内部標準を用いて行った。
・ オートサンプラー(G1367E)と、バイナリポンプ(G1312B)と、カラムオーブン(G1316A)とを備えたHPLCシステム1260(Agilent;Boeblingen)
・ ESI源を備えた質量分析計TripelQuad 6410(Agilent;Boeblingen)
・ HPLCカラム:Kinetex C18、100×2.1mm、粒度:2.6μm、細孔サイズ100Å(Phenomenex;Aschaffenburg)
・ プレカラム:KrudKatcher Ultra HPLC In-Line Filter;0.5μmの濾層厚および0.004mmの内径(Phenomenex;Aschaffenburg)
・ ガス温度 280℃
・ ガス流速 11L/分
・ ネブライザー圧力 50psi
・ キャピラリー電圧 4000V
E.コリW3110におけるbioHのノックアウト後の遊離酸であるアミノラウリン酸、ドデカン二酸およびラウリン酸の形成の減少
bioH−ノックアウトを有する菌株は、インタクトなbioHを有する対照菌株と比較して明らかに低減された、遊離酸であるアミノラウリン酸、ドデカン二酸およびラウリン酸の形成を示した。ドデカン二酸(DDS)とドデカン二酸メチルエステル(DDSME)の、アミノラウリン酸(ALS)とアミノラウリン酸メチルエステル(ALSME)の、ならびにラウリン酸(LS)とラウリン酸メチルエステル(LSME)の絶対最終滴定濃度(Absolut-Endtiter)の比率を計算してパーセンテージで表した。
一定時間(=生体内変換の終わり)後に達成された絶対滴定濃度を評価した。ここでは、菌株バックグラウンド(Stammhintergrund)W3110ΔbioHにおいて、同じ最終生成物滴定濃度を保ったままで、明らかに改善された生成物(ALSおよびALSME)対主要副生成物(DDSおよびDDSME)の比率が示された。その比率は、49.17%のALS(ME)から82.10%のALS(ME)まで高まる。
遺伝子bioH中に欠失を有するE.コリ菌株による、バシラス・サチリス由来の遺伝子aldとクロモバクテリウム・ビオラセウム由来のCv_2025とシュードモナス・プチダのalkオペロンからの遺伝子alkB、alkG、alkTおよびalkLについての発現ベクターを使用することによるアミノラウリン酸メチルエステルの生産
バシラス・サチリス由来の遺伝子ald(アラニン−デヒドロゲナーゼをコードする、E.コリ用にコドン最適化された)と、クロモバクテリウム・ビオラセウム由来のCv_2025(トランスアミナーゼをコードする、C.トロピカリス(C.tropicalis)用にコドン最適化された)、シュードモナス・プチダのalkオペロンからの遺伝子alkB、alkG、alkT(アルカン−モノオキシゲナーゼ、ルブレドキシンおよびルブレドキシン−レダクターゼをコードする)およびalkL(膜タンパク質/トランスポータータンパク質をコードする)についての発現ベクターを有するE.コリ菌株の作成のために、電気的にコンピテントにされたE.コリBW25113ΔbioHと、相応の対照菌株E.コリBW25113を製造した。それは、当業者に公知の様式および方法で行った。それらの菌株は、商業的に入手可能なKeioコレクションに由来するものである。これらの菌株を、プラスミドpACYC184{MCS2.0}[alkST_BFGL][alaDH_Bs(co) {PspXI} TAcv(ct)](配列番号13もしくはWO/2013/024114の例1およびそこに挙げられるSEQ ID Nr. 17)で形質転換し、クロラムフェニコール(50μg/ml)を有するLBアガープレート上にプレーティングした。形質転換体を、プラスミド調製と分析的な制限分析によって正確なプラスミドの存在について調べた。このようにして以下の菌株を作成した:
E.コリBW25113におけるbioHのノックアウト後の遊離酸であるアミノラウリン酸、ドデカン二酸、ラウリン酸およびヒドロキシラウリン酸の形成の減少
bioH−ノックアウトを有する菌株は、インタクトなbioHを有する対照菌株と比較して明らかに低減された、部分的に検出限界未満の、遊離酸であるアミノラウリン酸、ドデカン二酸、ラウリン酸およびヒドロキシラウリン酸の形成を示した。ドデカン二酸(DDS)とドデカン二酸メチルエステル(DDSME)の、アミノラウリン酸(ALS)とアミノラウリン酸メチルエステル(ALSME)の、ヒドロキシラウリン酸(HLS)とヒドロキシラウリン酸メチルエステル(HLSME)の、ならびにラウリン酸(LS)とラウリン酸メチルエステル(LSME)の絶対最終滴定濃度の比率を計算してパーセンテージで表した。
対照菌株と比較して、bioH−ノックアウト菌株における初期酸化能力は勾配を落とさず、プロセスの経過にわたるALSME形成の点ではほぼ一定に保たれることが示された。
一定時間(=生体内変換の終わり)後に達成された絶対滴定濃度を評価した。ここでは、ノックアウト菌株において、1リットルおよび1時間当たり0.75gのALSMEという、野生型菌株における1リットルおよび1時間当たり0.51gのALSMEに比して明らかに高い生成物形成速度が示された。
一定時間(=生体内変換の終わり)後に達成された絶対滴定濃度を評価した。ここでは、ノックアウト−菌株バックグラウンドにおいて、明らかに改善された生成物(ALSおよびALSME)対主要副生成物(DDSおよびDDSME)の比率が示された。
アミノラウリン酸とアミノラウリン酸メチルエステルの最終累積絶対滴定濃度を、グルコースの使用量と比較して考察した。
1. 式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの細胞による転化方法であって、
a)前記細胞と前記カルボン酸エステルとを水溶液中で接触させる工程
を含み、前記の細胞が、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が、該細胞の野生型に対して低減されている組み換え細胞である、前記方法。
2. 1に記載の方法であって、更に、
b)前記水溶液と、カチオン交換体を含む疎水性の有機溶液とを接触させる工程
を含む、前記方法。
3. 配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトを、組み換え細胞の遺伝的特徴の一部として、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの、相応の細胞の野生型に対する生産向上のために用いる使用。
4. 配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性がその野生型に対して低減されている組み換え細胞を、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの転化のために用いる使用。
5. 1から4までのいずれかに記載の方法または使用であって、Aが、飽和アルキレン基であり、好ましくは式−(CH2)n−で示され、式中、nが少なくとも4であるアルキレン基である、前記方法または使用。
6. 1または2に記載の方法であって、R1が、水素、−CH2OH、−CHOおよび−CH2NH2を含む群から選択される、前記方法。
7. 1から6までのいずれかに記載の方法であって、Aが、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状の、分枝鎖状の、および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である、前記方法。
8. 組み換えアルカンヒドロキシラーゼを発現する細胞であって、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が前記細胞の野生型に対して低減されている、前記細胞。
9. 7に記載の細胞であって、アルカンヒドロキシラーゼが、AlkB−モノオキシゲナーゼおよびCYP153−ファミリーのシトクロムP450−モノオキシゲナーゼを含む群からのアルカンヒドロキシラーゼである、前記細胞。
10. 8または9に記載の水溶液中の細胞と、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルとを含む反応混合物。
11. 10に記載の反応混合物であって、更に、カチオン交換体を有する疎水性の有機溶液を含む、前記反応混合物。
12. 1から11までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にトランスアミナーゼを発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
13. 1から12までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にアラニンデヒドロゲナーゼを発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
14. 1から13までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にAlkL−ファミリーからのタンパク質を有する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
15. 1から14までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、脂肪酸のβ−酸化の反応の一つを触媒する少なくとも1つの酵素の、その野生型に対して低減された活性を有し、その際、前記酵素が、好ましくは、脂肪酸−CoA−リガーゼ、アシル−CoA−デヒドロゲナーゼ、2,4−ジエノイル−CoA−レダクターゼ、エノイル−CoA−ヒドラターゼおよび3−ケトアシル−CoA−チオラーゼ、脂肪酸インポーターもしくはその変異体、特に好ましくはFadLもしくはその変異体を含む群からの酵素である、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
16. 1から15までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、アルカンヒドロキシラーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、トランスアミナーゼ、アラニンデヒドロゲナーゼおよびAlkL−ファミリーからのタンパク質を含む群からの少なくとも1つの酵素を組み換え形で有し、かつ/または過剰発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
17. 1から16までのいずれかに記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が、細胞の野生型に対して、配列番号2もしくは変異体を含むポリペプチドもまたはその変異体をコードする遺伝子のノックアウトによって低減されている、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
Claims (17)
- 式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの細胞による転化方法であって、
a)前記細胞と前記カルボン酸エステルとを水溶液中で接触させる工程
を含み、前記の細胞が、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が、該細胞の野生型に対して低減されている組み換え細胞である、前記方法。 - 請求項1に記載の方法であって、更に、
b)前記水溶液と、カチオン交換体を含む疎水性の有機溶液とを接触させる工程
を含む、前記方法。 - 配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドをコードする遺伝子のノックアウトを、組み換え細胞の遺伝的特徴の一部として、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの、相応の細胞の野生型に対する生産向上のために用いる使用。 - 配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性がその野生型に対して低減されている組み換え細胞を、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルの転化のために用いる使用。 - 請求項1から4までのいずれか1項に記載の方法または使用であって、Aが、飽和アルキレン基であり、好ましくは式−(CH2)n−で示され、式中、nが少なくとも4であるアルキレン基である、前記方法または使用。
- 請求項1または2に記載の方法であって、R1が、水素、−CH2OH、−CHOおよび−CH2NH2を含む群から選択される、前記方法。
- 請求項1から6までのいずれか1項に記載の方法であって、Aが、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状の、分枝鎖状の、および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である、前記方法。
- 組み換えアルカンヒドロキシラーゼを発現する細胞であって、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が前記細胞の野生型に対して低減されている、前記細胞。
- 請求項7に記載の細胞であって、アルカンヒドロキシラーゼが、AlkB−モノオキシゲナーゼおよびCYP153−ファミリーのシトクロムP450−モノオキシゲナーゼを含む群からのアルカンヒドロキシラーゼである、前記細胞。
- 請求項8または9に記載の水溶液中の細胞と、式(I)
R1−A−COOR2 (I)
[式中、R1は、水素、−CH2OH、−CHO、−COOR3、−CH2SH、−CH2OR3および−CH2NH2を含む群から選択され、R2は、アルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、R3は、水素およびアルキル、好ましくはメチル、エチルおよびプロピルを含む群から選択され、かつAは、少なくとも4つの、好ましくは6つの、更に好ましくは8つの炭素原子を有する、置換された、非置換の、直鎖状、分枝鎖状および/または環状のアルキレン基、アルケニレン基、アリーレン基もしくはアラルキレン基である]のカルボン酸エステルとを含む反応混合物。 - 請求項10に記載の反応混合物であって、更に、カチオン交換体を有する疎水性の有機溶液を含む、前記反応混合物。
- 請求項1から11までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にトランスアミナーゼを発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
- 請求項1から12までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にアラニンデヒドロゲナーゼを発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
- 請求項1から13までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、更にAlkL−ファミリーからのタンパク質を有する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
- 請求項1から14までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、脂肪酸のβ−酸化の反応の一つを触媒する少なくとも1つの酵素の、その野生型に対して低減された活性を有し、その際、前記酵素が、好ましくは、脂肪酸−CoA−リガーゼ、アシル−CoA−デヒドロゲナーゼ、2,4−ジエノイル−CoA−レダクターゼ、エノイル−CoA−ヒドラターゼおよび3−ケトアシル−CoA−チオラーゼ、脂肪酸インポーターもしくはその変異体、特に好ましくはFadLもしくはその変異体を含む群からの酵素である、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
- 請求項1から15までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、前記細胞が、アルカンヒドロキシラーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、トランスアミナーゼ、アラニンデヒドロゲナーゼおよびAlkL−ファミリーからのタンパク質を含む群からの少なくとも1つの酵素を組み換え形で有し、かつ/または過剰発現する、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
- 請求項1から16までのいずれか1項に記載の方法、細胞、反応混合物または使用であって、配列番号2もしくはその変異体を含むポリペプチドの活性が、細胞の野生型に対して、配列番号2もしくは変異体を含むポリペプチドもまたはその変異体をコードする遺伝子のノックアウトによって低減されている、前記方法、細胞、反応混合物または使用。
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