JP2013527848A5 - - Google Patents

Claims (11)

1. イメージング用の基板を準備して、前記基板上における生化学的部位の位置およびレジストレーションを確定するステップと；
   画像中で前記基板上の生化学的部位に対応するフィールドスポットを検出するステップと；
   グリッドオフセットを決定するために、二次元グリッドと前記基板上の生化学的部位のフィールドスポットとのアラインメントを行うステップと；並びに
   前記グリッドのポイントとフィールド内の既知の位置とのレジストレーションを行うステップとを含み、
   前記レジストレーションを行うステップは、前記フィールドスポットを前記基板上のフィールドスポットの第一の既知の欠失パターンと交差相関させて、フィールド内の絶対位置を決定するステップを含む、方法。
2. 前記欠失パターンは疑似ランダムとなるように選ばれる、請求項１に記載の方法。
3. 前記レジストレーションを行うステップは、前記フィールドスポットを、前記基板上のフィールドスポットの位置を特定する第二の既知の欠失パターンとさらに交差相関させるステップを含む、請求項１に記載の方法。
4. 前記アラインメントを行うステップは、各グリッドポイントと各フィールドスポットの間で最小二乗距離を有する試験された組合せをフィールドスポットのパターン中に見出すために、回転、スケール、ｘ−オフセット、及びｙ−オフセットの様々な組合せを繰り返し試験するステップを含む、請求項１に記載の方法。
5. 前記アラインメントを行うステップは、
   強度群によってフィールドスポットを収集するステップ；
   群平均スポット輝度を最も近いグリッドポイントからの群平均距離に対してプロットするステップ；及び
   前記最も近いグリッドポイントからの群平均距離が閾値未満となる群の全スポットに対して精密フィッティングする工程を繰り返すステップを含む、請求項１に記載の方法。
6. 光学的に解像可能な個々の表面部位であって、生化学実験をサポートするように修飾されている、表面部位を有する固体平面基板を含み；
   ここで、前記表面部位は、前記基板の表面上のスポットの二次元の周期的アレイ内のスポットに位置し；かつ
   ここで、そうでなければ存在したであろう前記スポットの部分は、少なくとも１つの既知の欠失パターンに従って前記アレイから欠失させられている、装置。
7. 前記欠失パターンは疑似ランダムである、請求項６に記載の装置。
8. 前記部分は約１％〜約３％である、請求項６に記載の装置。
9. 前記生化学実験は、ＤＮＡナノボールを用いるコンビナトリアルプローブ−アンカーライゲーションを含む、請求項６に記載の装置。
10. 個々の表面部位であって、生化学実験をサポートするように修飾されている、表面部位を有し、前記部位は、基板の表面上のスポットの二次元の周期的アレイ内のスポットに位置し、かつそうでなければ存在したであろう前記スポットの部分は、既知の欠失パターンに従って前記アレイから欠失させられている、固体平面基板を提供するステップ；
    前記部位で生化学実験を行うステップ；
    前記生化学実験の画像を取得するステップ；
    前記画像を前記欠失パターンと交差相関させて、前記スポットの絶対位置を決定するステップ；及び
    前記画像をサブピクセル精度で観察して、前記生化学実験についての情報を引き出すステップを含む、方法。
11. 前記画像を取得するステップは、前記スポットの正確な位置に基づいて、隣接ピクセルからの出力の寄与に重み付けするステップを含む、請求項１０に記載の方法。