JP2011500077A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2011500077A5 JP2011500077A5 JP2010530545A JP2010530545A JP2011500077A5 JP 2011500077 A5 JP2011500077 A5 JP 2011500077A5 JP 2010530545 A JP2010530545 A JP 2010530545A JP 2010530545 A JP2010530545 A JP 2010530545A JP 2011500077 A5 JP2011500077 A5 JP 2011500077A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- trna synthetase
- polypeptide
- trna
- nucleic acid
- acetyl lysine
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 102000008745 EC 6.1.1.- Human genes 0.000 claims 17
- 108030004302 EC 6.1.1.- Proteins 0.000 claims 17
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 7
- DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N nicotinamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 6
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 6
- DTERQYGMUDWYAZ-ZETCQYMHSA-N N(6)-acetyl-L-lysine zwitterion Chemical compound CC(=O)NCCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O DTERQYGMUDWYAZ-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims 5
- 229920001949 Transfer RNA Polymers 0.000 claims 5
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims 5
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 4
- VEYYWZRYIYDQJM-ZETCQYMHSA-N N(2)-acetyl-L-lysine zwitterion Chemical compound CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCCC[NH3+] VEYYWZRYIYDQJM-ZETCQYMHSA-N 0.000 claims 3
- 229920002892 amber Polymers 0.000 claims 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims 3
- 229960003966 nicotinamide Drugs 0.000 claims 3
- 235000005152 nicotinamide Nutrition 0.000 claims 3
- 239000011570 nicotinamide Substances 0.000 claims 3
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 claims 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims 2
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims 2
- 102000007312 Recombinant Proteins Human genes 0.000 claims 2
- 108010033725 Recombinant Proteins Proteins 0.000 claims 2
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 claims 2
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 2
- 239000011436 cob Substances 0.000 claims 1
- 238000003381 deacetylation reaction Methods 0.000 claims 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 1
Claims (29)
- Nε−アセチルリシンを結合可能なtRNAシンテターゼ。
- tRNAシンテターゼが、MbPylRSのアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するポリペプチドを含む、請求項1に記載のtRNAシンテターゼ。
- tRNAシンテターゼが、MbPylRSの少なくともL266〜C313のアミノ酸配列に対応するアミノ酸配列、又は前記アミノ酸配列と少なくとも90%の同一性を有する配列を含むポリペプチドからなる、請求項2に記載のtRNAシンテターゼ。
- ポリペプチドが、野生型MbPylRS配列に対し、L266、L270、Y271、L274又はC313の1又は2以上において変異を有する、請求項3に記載のtRNAシンテターゼ。
- 少なくとも1つの変異が、L270、Y271、L274又はC313における変異である、請求項4に記載のtRNAシンテターゼ。
- 少なくとも1つの変異が、L270、L274又はC313における変異である、請求項5に記載のtRNAシンテターゼ。
- Y271Lを含む、請求項1〜6のいずれかに記載のtRNAシンテターゼ。
- Y271Fを含む、請求項1〜7のいずれかに記載のtRNAシンテターゼ。
- L266Vを含む、請求項1〜8のいずれかに記載のtRNAシンテターゼ。
- L270I、Y271L、L274A及びC313Fを含む、請求項1〜9のいずれかに記載のtRNAシンテターゼ。
- L266V、L270I、Y271F、L274A及びC313Fを含む、請求項1〜10のいずれかに記載のtRNAシンテターゼ。
- 請求項1〜11のいずれかに記載のtRNAシンテターゼをコードするヌクレオチド配列を含む核酸。
- tRNAにNε−アセチルリシンをチャージするための、請求項1〜11のいずれかに記載のポリペプチドの使用。
- tRNAがMbtRNACUAを含む、請求項13に記載の使用。
- ポリペプチドをコードするRNAの翻訳をアレンジするステップを含むNε−アセチルリシンを含むポリペプチドを作製する方法であって、前記RNAがアンバーコドンを含み、前記翻訳が請求項1〜11のいずれかに記載のポリペプチドの存在下で、かつ、Nε−アセチルリシンをチャージすることができるtRNAの存在下で、かつ、Nε−アセチルリシンの存在下で行われる方法。
- 翻訳が脱アセチル化阻害剤の存在下で行われる、請求項15に記載の方法。
- 阻害剤がニコチンアミド(NAM)を含む、請求項16に記載の方法。
- Nε−アセチルリシンを含むポリペプチドを作製する方法であって、前記方法が、Nε−アセチルリシンを取り込むのに望ましい前記ポリペプチドにおける位置に対応する1又は2以上の位置でアンバーコドンを提供するために、前記ポリペプチドをコードする核酸を修飾するステップを含む方法。
- 核酸を修飾するステップが、リシンに対するコドンをアンバーコドン(TAG)に変異させるステップを含む、請求項18に記載の方法。
- Nε−アセチルリシンを含むホモジニアスな組換えタンパク質。
- タンパク質が、請求項15〜19のいずれかに記載の方法で作製される、請求項20に記載のホモジニアスな組換えタンパク質。
- 請求項12に記載の核酸を含むベクター。
- ベクターが、tRNAシンテターゼのtRNA基質をコードする核酸配列をさらに含む、請求項22に記載のベクター。
- tRNA基質が、MbPylT遺伝子によってコードされる、請求項23に記載のベクター。
- 請求項12に記載の核酸又は請求項22〜24のいずれかに記載のベクターを含む細胞。
- 不活性化されたデアセチラーゼ遺伝子をさらに含む、請求項25に記載の細胞。
- 不活性化されたデアセチラーゼ遺伝子が、CobBの欠失又は破壊を含む、請求項26に記載の細胞。
- 請求項22〜24のいずれかに記載のベクター又は請求項25〜27のいずれかに記載の細胞、及びニコチンアミドを一定量含むキット。
- Nε−アセチルリシンを結合可能なtRNAシンテターゼを作製する方法であって、L266、L270、Y271、L274又はC313の1又は2以上において親tRNAシンテターゼ配列をコードする核酸を変異させるステップと、Nε−アセチルリシンを結合可能な1又は2以上の変異体を選択するステップとを含む方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB0721291.3A GB0721291D0 (en) | 2007-10-30 | 2007-10-30 | Methods and compositions |
PCT/GB2008/003611 WO2009056803A1 (en) | 2007-10-30 | 2008-10-27 | Methods and compositions |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011500077A JP2011500077A (ja) | 2011-01-06 |
JP2011500077A5 true JP2011500077A5 (ja) | 2011-12-01 |
Family
ID=38834528
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2010530545A Pending JP2011500077A (ja) | 2007-10-30 | 2008-10-27 | 方法及び組成物 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20110027829A1 (ja) |
EP (1) | EP2212422A1 (ja) |
JP (1) | JP2011500077A (ja) |
CN (1) | CN101910403B (ja) |
CA (1) | CA2703847A1 (ja) |
GB (1) | GB0721291D0 (ja) |
WO (1) | WO2009056803A1 (ja) |
Families Citing this family (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB2470770A (en) * | 2009-06-04 | 2010-12-08 | Medical Res Council | Incorporation of unnatural amino acids having an orthogonal functional group into polypeptides using orthogonal tRNA/tRNA synthetase pairs |
GB0917242D0 (en) | 2009-10-01 | 2009-11-18 | Medical Res Council | Acetyl lysine incorporation with tRNA synthetase |
GB0917240D0 (en) | 2009-10-01 | 2009-11-18 | Medical Res Council | Incorporation of methyl lysine into poiypeptide |
JP2013522352A (ja) * | 2010-03-24 | 2013-06-13 | メディカル リサーチ カウンシル | 方法 |
CN104718285A (zh) | 2012-05-18 | 2015-06-17 | 医药研究委员会 | 利用编码包含BCN基团的氨基酸的正交密码子和正交PylRS合成酶将包含BCN基团的氨基酸整合到多肽中的方法 |
GB2528227A (en) | 2014-03-14 | 2016-01-20 | Medical Res Council | Cyclopropene amino acids and methods |
CN105294475A (zh) * | 2015-11-14 | 2016-02-03 | 复旦大学 | 广谱的去乙酰化酶抑制剂乙酰化赖氨酸及其应用 |
HRP20240344T1 (hr) * | 2017-06-02 | 2024-05-24 | Ambrx, Inc. | Postupci i pripravci za unapređenje produkcije proteina koji sadrže neprirodne aminokiseline |
EP3818072A1 (en) * | 2018-07-03 | 2021-05-12 | Technische Universität München | Means and methods for site-specific protein modification using transpeptidases |
CN111718920B (zh) * | 2019-03-19 | 2021-05-07 | 宁波鲲鹏生物科技有限公司 | 在蛋白中高效引入赖氨酸衍生物的氨酰基-tRNA合成酶 |
EP4328308A1 (en) | 2022-08-22 | 2024-02-28 | Technische Universität Berlin | Modified trna-synthetase for the incorporation of non-canonical amino acids |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2007219793A1 (en) * | 2006-02-22 | 2007-09-07 | Riken | Method for synthesis of suppressor tRNA, DNA construct, and production of protein having non-natural amino acid integrated therein by using the DNA construct |
-
2007
- 2007-10-30 GB GBGB0721291.3A patent/GB0721291D0/en not_active Ceased
-
2008
- 2008-10-27 CN CN2008801232954A patent/CN101910403B/zh not_active Expired - Fee Related
- 2008-10-27 US US12/739,247 patent/US20110027829A1/en not_active Abandoned
- 2008-10-27 WO PCT/GB2008/003611 patent/WO2009056803A1/en active Application Filing
- 2008-10-27 EP EP08844006A patent/EP2212422A1/en not_active Withdrawn
- 2008-10-27 JP JP2010530545A patent/JP2011500077A/ja active Pending
- 2008-10-27 CA CA2703847A patent/CA2703847A1/en not_active Abandoned
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2011500077A5 (ja) | ||
Diebold-Durand et al. | Structure of full-length SMC and rearrangements required for chromosome organization | |
Kong et al. | In vitro selection of diversely functionalized aptamers | |
Bornberg-Bauer et al. | Structure and function of naturally evolved de novo proteins | |
MacAuley et al. | The archetype γ-class carbonic anhydrase (Cam) contains iron when synthesized in vivo | |
JP2013528372A5 (ja) | ||
Liu et al. | Gene cloning, expression, and characterization of a nitrilase from Alcaligenes faecalis ZJUTB10 | |
JP2017513479A5 (ja) | ||
JP2010273685A5 (ja) | ||
JP2010539926A5 (ja) | ||
JP2010529860A5 (ja) | ||
WO2008140615A3 (en) | Modified messenger rna stabilizing sequences for expressing genes in bacterial cells | |
JP2010512160A5 (ja) | ||
WO2022056254A3 (en) | Dna modifying enzymes and active fragments and variants thereof and methods of use | |
WO2007005837A3 (en) | Inducible expression vectors and methods of use thereof | |
Jiang et al. | Post-transcriptional modifications modulate rRNA structure and ligand interactions | |
JP2007504810A5 (ja) | ||
JP2013507934A5 (ja) | ||
DE602005024868D1 (de) | Neuer l-lysin-induzierbarer promotor | |
Gao et al. | Three novel Escherichia coli vectors for convenient and efficient molecular biological manipulations | |
Feng et al. | Construction of cell factory through combinatorial metabolic engineering for efficient production of itaconic acid | |
Yao et al. | A direct RNA-to-RNA replication system for enhanced gene expression in bacteria | |
Sut et al. | Protein and DNA effectors control the TraI conjugative helicase of plasmid R1 | |
Daggett et al. | A general method for scanning unnatural amino acid mutagenesis | |
WO2008017073A3 (en) | Vector systems |