JP2011232259A - 蛍光強度補正方法、蛍光強度算出方法及び蛍光強度算出装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して得られる測定スペクトルを、各蛍光色素を個別に標識した微小粒子で得られる単染色スペクトルの線形和により近似する手順を含む蛍光強度補正方法を提供する。
【選択図】図1
Description
前記手順において、前記単染色スペクトルの線形和による前記測定スペクトルの近似は、最小二乗法を用いて行うことができる。また、このとき、前記検出値に無効な値が含まれる場合には、無効な検出値を除外して、前記単染色スペクトルの線形和による前記測定スペクトルの近似を行ってもよい。無効な検出値を除外することで、蛍光強度の補正精度を高められる。
具体的には、前記手順において、下記式で示される評価関数が最小値となるパラメータak(k=1〜m)を正規方程式や特異値分解などを用いて求めることにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出できる。
また、前記検出値に無効な値が含まれる場合には、前記手順において、下記式で示される評価関数が最小値となるパラメータak(k=1〜m)を求めることにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出できる。
生体関連微小粒子には、各種細胞を構成する染色体、リポソーム、ミトコンドリア、オルガネラ(細胞小器官)などが含まれる。細胞には、動物細胞(血球系細胞など)および植物細胞が含まれる。微生物には、大腸菌などの細菌類、タバコモザイクウイルスなどのウイルス類、イースト菌などの菌類などが含まれる。さらに、生体関連微小粒子には、核酸やタンパク質、これらの複合体などの生体関連高分子も包含され得るものとする。また、工業用粒子は、例えば有機もしくは無機高分子材料、金属などであってもよい。有機高分子材料には、ポリスチレン、スチレン・ジビニルベンゼン、ポリメチルメタクリレートなどが含まれる。無機高分子材料には、ガラス、シリカ、磁性体材料などが含まれる。金属には、金コロイド、アルミなどが含まれる。これら微小粒子の形状は、一般には球形であるのが普通であるが、非球形であってもよく、また大きさや質量なども特に限定されない。
1.蛍光強度補正方法
(1−1)近似曲線
(1−2)線形最小二乗法
(1−2−1)正規方程式
(1−2−2)特異値分解
2.蛍光強度算出方法
(2−1)標識
(2−2)測定
(2−3)蛍光強度算出
3.蛍光強度算出装置
(1−1)近似曲線
本発明に係る蛍光強度補正方法は、測定スペクトルを単染色スペクトルの線形和により近似することにより、各蛍光色素からの真の蛍光強度を算出することを特徴とする。「測定スペクトル」とは、蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して得られるものである。また、「単染色スペクトル」とは、各蛍光色素の蛍光波長分布であり、各蛍光色素を個別に標識した微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を光検出器で受光し、検出値を収集して得られるものである。
akを求めるため、まず、下記式(2)で示される評価関数(カイ二乗)を定義する。そして、この式(2)が最小値となるようなパラメータak(k=1〜m)を求める。
次に、下記式(3)の要素から構成されるN×M行例A(図2参照)と、長さNのベクトルb(下記式(4))を定義し、当てはめにより得たM個のパラメータa1〜amを並べたベクトルをaとおく。
上記の正規方程式を用いた方法に替えて特異値分解により、M個のパラメータa1〜amを並べたベクトルaを求めても良い。
次に、上述の蛍光強度補正方法を適用した本発明に係る蛍光強度算出方法について説明する。
始めに、測定対象とする微小粒子を複数の蛍光色素により標識する。蛍光色素の標識は、一般に、蛍光標識抗体を微小粒子の表面に存在する分子に結合させることにより行われる。蛍光色素としては、特に限定されないが、例えば、フィコエリスリン(PE)、FITC、PE−Cy5、PE−Cy7、PE−テキサスレッド(PE-Texas red)、アロフィコシアニン(APC)、APC−Cy7、エチジウムブロマイド(Ethidium bromide)、プロピジウムアイオダイド(Propidium iodide)、ヘキスト(Hoechst)33258/33342、DAPI、アクリジンオレンジ(Acridine orange)、クロモマイシン(Chromomycin)、ミトラマイシン(Mithramycin)、オリボマイシン(Olivomycin)、パイロニン(Pyronin)Y、チアゾールオレンジ(Thiazole orange)、ローダミン(Rhodamine)101イソチオシアネート(isothiocyanate)、BCECF、BCECF−AM、C.SNARF−1、C.SNARF−1−AMA、エクオリン(Aequorin)、Indo−1、Indo−1−AM、Fluo−3、Fluo−3−AM、Fura−2、Fura−2−AM、オキソノール(Oxonol)、テキサスレッド(Texas red)、ローダミン(Rhodamine)123、10−N−ノニ−アクリジンオレンジ(Acridine orange)、フルオレセイン(Fluorecein)、フルオレセインジアセテート(Fluorescein diacetate)、カルボキシフルオレセイン(Carboxyfluorescein)、カルビキシフルオレセインジアセテート(Caboxyfluorescein diacetate)、カルボキシジクロロフルオレセイン(Carboxydichlorofluorescein)、カルボキシジクロロフルオレセインジアセテート(Carboxydichlorofluorescein diacetate)などが挙げられる。
蛍光色素により標識した微小粒子を、受光波長帯域が異なる光検出器が蛍光色素の数よりも多く配設されたマルチカラー測定装置により測定し、各光検出器からの検出値を収集して測定スペクトルを得る。測定操作は、通常行われる方法と同様にして行うことができる。
測定スペクトルを、上述した方法に従って単染色スペクトルの線形和により近似し、各蛍光色素から発生した真の蛍光強度を算出する。このとき、光検出器における測定誤差分散が不明の場合には、上記式(2)中のσiは全て1としてよい。単染色スペクトルは、測定の都度に各蛍光色素を個別に標識したサンプルを調製して取得してもよく、あるいは予め記憶された標準スペクトルを利用してもよい。
本発明に係る蛍光強度算出装置は、従来のフローサイトメータ等と同様に流体系と光学系、分取系、データ処理系などから構成される。
AF488, PE, PerCP-Cy5.5, PE-Cy7, PI, APC, APC-Cy7の7種類の単染色素スペクトルを測定したもので、ピークが1になるように正規化してある。横軸はPMT、縦軸は検出値を示しており、488nmレーザで励起された蛍光スペクトルの検出値は488Ch1〜32に、640nmレーザで励起された蛍光スペクトルの検出値は640Ch1〜32に、それぞれ表示してある。
Claims (9)
- 蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して得られる測定スペクトルを、各蛍光色素を個別に標識した微小粒子で得られる単染色スペクトルの線形和により近似する手順を含む蛍光強度補正方法。
- 前記手順において、前記単染色スペクトルの線形和による前記測定スペクトルの近似を最小二乗法を用いて行う請求項1記載の蛍光強度補正方法。
- 前記手順において、下記式で示される評価関数が最小値となるパラメータak(k=1〜m)を求めることにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出する請求項2記載の蛍光強度補正方法。
(式中、Xk(xi)は、k番目の蛍光色素の単染色スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。また、yiは、測定スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。σiは、i番目の光検出器の検出値に対する重みの逆数を表す。) - パラメータakを正規方程式あるいは特異値分解を用いて求める請求項3記載の蛍光強度補正方法。
- 前記検出値に無効な値が含まれる場合、前記手順において、無効な検出値を除外して、前記単染色スペクトルの線形和による前記測定スペクトルの近似を最小二乗法を用いて行う請求項1記載の蛍光強度補正方法。
- 前記手順において、下記式で示される評価関数が最小値となるパラメータak(k=1〜m)を求めることにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出する請求項5記載の蛍光強度補正方法。
(式中、Xk(xi)は、k番目の蛍光色素の単染色スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。また、yiは、測定スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。σiは、i番目の光検出器の検出値に対する重みの逆数を表す。ただし、無効な検出値をyi(i=「N1+1」〜N)、有効な検出値をyi(i=1〜N1)とする。) - 前記手順において、下記式で示される評価関数が最小値となるパラメータak(k=1〜m)を求めることにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出する請求項5記載の蛍光強度補正方法。
(式中、Xk(xi)は、k番目の蛍光色素の単染色スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。また、yiは、測定スペクトルにおけるi番目の光検出器の検出値を表す。σiは、i番目の光検出器の検出値に対する重みの逆数を表す。ただし、無効な検出値をyi(i=「N1+1」〜N)、有効な検出値をyi(i=1〜N1)とする。) - 蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して測定スペクトルを得る手順と、
各蛍光色素を個別に標識した微小粒子で得られる単染色スペクトルの線形和により前記測定スペクトルを近似することにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出する手順と、を含む蛍光強度算出方法。 - 蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して測定スペクトルを得る測定手段と、
各蛍光色素を個別に標識した微小粒子で得られる単染色スペクトルの線形和により前記測定スペクトルを近似することにより、各蛍光色素から発生した蛍光の強度を算出する算出手段と、を備える蛍光強度算出装置。
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