WO2021153192A1 - 情報処理装置、粒子分析装置、情報処理方法、及びプログラム - Google Patents

情報処理装置、粒子分析装置、情報処理方法、及びプログラム Download PDF

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WO2021153192A1
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fluorescence
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康晴 山内
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ソニーグループ株式会社
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    • G01N15/10Investigating individual particles
    • G01N15/14Optical investigation techniques, e.g. flow cytometry
    • G01N2015/1402Data analysis by thresholding or gating operations performed on the acquired signals or stored data

Definitions

  • This technology relates to information processing equipment, particle analyzers, information processing methods, and programs. More specifically, the present technology relates to an information processing apparatus, a particle analyzer, an information processing method, and a program used in fluorescence analysis of a particle population labeled with a plurality of phosphors.
  • a particle population such as a cell
  • a fluorescent dye for example, by labeling a particle population such as a cell with a fluorescent dye, irradiating each particle of the particle population with a laser beam, and measuring the intensity and / or pattern of fluorescence generated from the excited fluorescent dye, the particles of the particle are measured. The characteristics are being measured.
  • a flow cytometer can be mentioned as a typical example of a particle analyzer that performs the measurement.
  • multiple fluorescent dyes are often used to label the particle population.
  • the fluorescence generated from the target fluorescent dye is separated by an optical filter, the fluorescence generated from the unintended fluorescent dye leaks to the optical detector that detects the separated light. It may get crowded.
  • fluorescence leakage occurs, the fluorescence intensity measured by the photodetector becomes higher than the true fluorescence intensity derived from the target fluorescent dye. Therefore, a correction is performed to subtract the fluorescence intensity of the leaked fluorescence.
  • fluorescence generated from a fluorescent dye excited by irradiating microparticles multiple-labeled with a plurality of fluorescent dyes having overlapping fluorescence wavelength bands with fluorescence is fluorescent.
  • the measurement spectrum obtained by receiving light with light detectors with different light-receiving wavelength bands arranged in a larger number than the number of dyes and collecting the detected values from each light detector is obtained by using fine particles individually labeled with each fluorescent dye.
  • a fluorescence intensity correction method including a procedure of approximating by the linear sum of the obtained monochromatic spectra is disclosed.
  • the unmixing process By performing the unmixing process using the spectral reference of each of the plurality of types of fluorescent dyes, it is possible to make a correction by subtracting the fluorescence intensity of the leaked fluorescence from the measured fluorescence intensity.
  • the two-dimensional plot obtained using the corrected fluorescence data may not be the desired plot.
  • the cause in this case is, for example, that the spectral reference prepared in advance does not match the waveform of the spectral reference of the fluorescent dye actually used, or that the fluorescent dye used for dyeing is deteriorated.
  • the number of types of fluorescent dyes used in the measurement has been increasing.
  • the number of types of fluorescent dyes is often 10 or more, 20 or more, or even 30 or more.
  • it is often difficult to grasp the effect on the unmixing process and the effect on the obtained plot for example, by modifying the spectral reference of a certain fluorescent dye. Therefore, if the effect can be grasped more easily, it is considered that it can contribute to the rapid analysis and / or adjustment of the measurement result.
  • the correction of the spectral reference waveform due to the intuitive correction of the analysis result of the acquired fluorescence data is better than the correction of the spectral reference waveform itself. It may be easier for the user to use. Therefore, the main purpose of this technique is to provide a technique for easily grasping the influence of the modification of the spectral reference.
  • the present technology generates a two-dimensional plot based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and one of the plurality of phosphors based on a correction process to the two-dimensional plot.
  • an information processing apparatus including a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for one phosphor and all other phosphors.
  • the correction process may be a correction process based on a user operation on the two-dimensional plot displayed on the display device.
  • the information processing device may further include an output unit that outputs the generated two-dimensional plot group to the display device.
  • the information processing device may further include a spectral reference correction unit that corrects the spectral reference.
  • the spectral reference correction unit can correct the spectral reference of each phosphor corresponding to the fluorescence data of the two-dimensional plot that is the target of the correction process.
  • the two-dimensional plot generator can modify the two-dimensional plot based on the fluorescence data unmixed using the modified spectral reference.
  • the particle population can be a particle population labeled with 10 or more types of phosphors.
  • the number of two-dimensional plots constituting the generated two-dimensional plot group can be 9 or more.
  • the fluorescence detection may be fluorescence detection by a flow cytometer.
  • the output unit may output an alert to the display device when at least one of the two-dimensional plots in the two-dimensional plot group does not satisfy a predetermined condition.
  • the output unit may display a list box for selecting any one of the above-mentioned phosphors from the plurality of phosphors on the display device.
  • the two-dimensional plot generation unit can generate the two-dimensional plot group by using the phosphor selected from the list box as any one of the phosphors.
  • each of the phosphors corresponding to the fluorescence data of the two-dimensional plot is used.
  • Spectral reference correction part that corrects the spectral reference
  • An information processing apparatus including a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot using the fluorescence data obtained by the unmixing process using the modified spectral reference is also provided.
  • the user operation may be a user operation for the two-dimensional plot displayed on the display device.
  • the spectral reference correction unit can correct the spectral reference in response to a drag operation in the direction of any one axis on the two-dimensional plot.
  • the spectral reference correction unit can correct the spectral reference of the phosphor corresponding to the fluorescence data constituting the two-dimensional plot.
  • the two-dimensional plot generator can modify the two-dimensional plot previously displayed on the worksheet by using the fluorescence data obtained by the unmixing process.
  • the present technology generates a two-dimensional plot based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and based on a correction process for the two-dimensional plot, among the plurality of phosphors.
  • a particle analyzer comprising a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for each of any one fluorophore and all other fluorophores.
  • the present technology generates a two-dimensional plot based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and based on a correction process for the two-dimensional plot, among the plurality of phosphors. Also provided is an information processing method comprising a two-dimensional plot group generation step of generating a two-dimensional plot group for each of any one phosphor and all other phosphors.
  • the present technology is based on a correction process to a two-dimensional plot obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors, and the phosphor of any one of the plurality of phosphors. Also provided is a program for causing the information processing apparatus to perform a two-dimensional plot group generation step of generating a two-dimensional plot group for each of the and all other phosphors.
  • the present technology relates to any one of the 10 or more phosphors and all the other phosphors from the results of fluorescence detection for the particle population labeled with 10 or more phosphors.
  • An information processing apparatus including a two-dimensional plot generator for generating a two-dimensional plot group is also provided.
  • FIG. 1 It is a figure which shows the configuration example of the particle analysis system including the information processing apparatus which follows this technology.
  • This is an example of a flow chart of processing by an information processing device according to the present technology.
  • It is a figure which shows an example of the screen display of the analysis result of fluorescence data.
  • This is an example of a flow chart of processing by an information processing device according to the present technology.
  • This is an example of a flow chart of processing by an information processing device according to the present technology.
  • This is a display example of a two-dimensional plot presented by an information processing apparatus according to the present technology.
  • This is a display example of a two-dimensional plot presented by an information processing apparatus according to the present technology.
  • First Embodiment Information Processing Device
  • Description of the first embodiment (2) First example of the first embodiment (2-1) Light irradiation unit (2-2) Chip (2-3) Detection unit (2-4) Information Processing device (2-5) Output unit and input unit (2-6) Example of processing fluorescence data by an information processing device (2-7) Particle population (2-8) Other embodiments (2-9) Other Embodiment 2.
  • Second embodiment (particle analyzer) 3.
  • Third embodiment (information processing method) 4.
  • Fourth embodiment program
  • the information processing apparatus generates a two-dimensional plot based on the fluorescence data obtained from the particle populations labeled with the plurality of phosphors, and based on the correction processing to the two-dimensional plot, the plurality of phosphors. It is provided with a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for each of one of the phosphors and all the other phosphors.
  • the two-dimensional plot generation unit generates a two-dimensional plot group for each of the phosphor and all other phosphors based on the correction process for the two-dimensional plot. By generating the two-dimensional plot group, it becomes easy to grasp the influence of the correction process.
  • the generation of the two-dimensional plot group is performed based on the correction processing to the two-dimensional plot.
  • the correction process for the two-dimensional plot makes it easier to visually and intuitively grasp the content of the correction process as compared with the correction of the waveform itself of the spectral reference or the correction of the correction coefficient.
  • the two-dimensional plot generation unit receives a visual and intuitive correction operation on the two-dimensional plot by the user, and generates a two-dimensional plot group for grasping the influence of the correction. Therefore, the two-dimensional plot generation unit contributes to making it easier for the user to grasp the influence of the correction processing on the fluorescence data analysis result.
  • the information processing device may be configured as a device for processing fluorescence data obtained by, for example, flow cytometry.
  • An example of an information processing apparatus according to the present technology configured as described above and an example of processing by the information processing apparatus will be described below with reference to FIG.
  • FIG. 1 shows a particle analysis system 1 including an information processing device according to the present technology.
  • the particle analysis system includes a light irradiation unit 2, a chip T provided with a flow path through which particles to be analyzed flow, a detection unit 3, an information processing device 100, an output unit 4, and an input unit 5.
  • the particle analysis system 1 is configured as a system for performing flow cytometry.
  • the light irradiation unit 2 is configured to irradiate light at a predetermined position in the flow path of the chip T. When the particles pass through the light irradiation position in the flow path, the particles are irradiated with light, and as a result, fluorescence is generated. That is, the light can act as excitation light on the particles, particularly the phosphor labeling the particles.
  • the light irradiation unit 2 may include one light source that produces light having a certain wavelength or a plurality of light sources that generate light having different wavelengths, and preferably may include a plurality of light sources that generate light having different wavelengths from each other.
  • the light source can be, for example, a laser light source.
  • the light irradiation unit 2 may include a combination of a plurality of semiconductor lasers that generate laser beams having different wavelengths from each other. Further, the light irradiation unit 2 may include a light guide optical system for guiding the light emitted from the light source to a predetermined position in the flow path.
  • the light guide optical system may include, for example, an optical system that combines light generated by the plurality of light sources.
  • the light guide optical system irradiates a predetermined position in the flow path with light.
  • the light irradiation position may be one or two or more (for example, two, three, four, or five).
  • the chip T can be configured as, for example, a flow cell.
  • the chip T is provided with a flow path.
  • the flow path structure provided in the chip T is configured to form, for example, a flow (particularly a laminar flow) in which particles flow in substantially a row.
  • the chip T shown in FIG. 1 is provided with flow paths P11, P12a, P12b, and P13.
  • the sample liquid is introduced into the sample liquid flow path P11 from the container (bag) B1 containing the sample liquid containing the particles.
  • the sample liquid flows through the sample liquid flow path P11 toward the main flow path P13.
  • the sheath liquid is introduced into the tip T from the container (bag) B2 containing the sheath liquid.
  • the sheath liquid flows through the two sheath liquid flow paths P12a and P12b toward the main flow path P13.
  • the sample liquid flow path P11 and the sheath liquid flow paths P12a and P12b are configured to merge to form the main flow path P13.
  • Particles are arranged in a substantially row in the laminar flow.
  • the particles flowing side by side in the main flow path P13 are irradiated with the excitation light generated by the light irradiation unit 2, and the light generated by this is detected by the detection unit 3.
  • the chip T may have a two-dimensional or three-dimensional flow path structure.
  • the chip T may have a substrate shape formed of a plastic material or a glass material.
  • the chip T and the flow path structure provided on the chip T are not limited to those shown in FIG. 1, and for example, a chip and a flow path structure known in the technical field related to a flow cytometer may be adopted. That is, in the present technology, the fluorescence detection may be, for example, fluorescence detection by a flow cytometer.
  • the shape of the cross section of the flow path provided on the chip T may be, for example, a circle, an ellipse, or a rectangle (square or rectangle).
  • the cross section of the flow path When the cross section of the flow path is circular or elliptical, its diameter or major axis may be, for example, 1 mm or less, and in particular, 10 ⁇ m or more and 1 mm or less.
  • the cross section of the flow path When the cross section of the flow path is square or rectangular, the length of one side or long side thereof may be, for example, 1 mm or less, and in particular, 10 ⁇ m or more and 1 mm or less.
  • the particles emitted from the chip T may be fractionated. For example, by vibrating the chip with a vibrating element such as a piezo vibrating element, a droplet containing one particle can be generated from the discharge port. By charging the droplet with a charged part, the traveling direction can be controlled and the particles can be separated.
  • the particle analysis system 1 may be configured as a system having a sorting function.
  • the chip T a chip provided with a preparative mechanism in the chip may be used as an example of such a chip, for example, the microchip for fine particle sorting described in Japanese Patent Application Laid-Open No. 2019-174192 can be mentioned.
  • the particle analysis system 1 may have a sorting unit for sorting particles.
  • the sorting unit can sort particles based on the fluorescence detection result by the detecting unit.
  • the detection unit 3 is configured to detect the fluorescence generated by irradiating the particles flowing in the flow path of the chip T with light. In addition to detecting fluorescence, the detection unit 3 may further detect scattered light (for example, any one or more of forward scattered light, backscattered light, and side scattered light).
  • the detector 3 includes one or more photodetectors.
  • the photodetector may include a PMT (photomultiplier tube) and / or a photodiode, in particular one or more PMTs.
  • the photodetector may include, for example, a PMT array in which a plurality of PMTs are arranged, for example, in a one-dimensional direction.
  • the number of PMTs contained in the photodetector may be, for example, 2 or more, 5 or more, 8 or more, 10 or more, 15 or more, 20 or more, 22 or more, 24 or more, or 26 or more.
  • the number of PMTs contained in the photodetector may be, for example, 50 or less, 45 or less, or 40 or less.
  • the photodetector may include spectroscopic optical systems that disperse fluorescence.
  • the spectroscopic optical system may be configured, for example, to disperse fluorescence so that light of the predetermined detection wavelength reaches a PMT to which a predetermined detection wavelength is assigned.
  • the detection unit 3 includes a fluorescence measuring device, a scattered light measuring device, a transmitted light measuring device, a reflected light measuring device, a diffracted light measuring device, an ultraviolet spectroscopic measuring device, an infrared spectroscopic measuring device, a Raman spectroscopic measuring device, and a FRET measuring device. , And one or more measuring instruments selected from FISH measuring instruments may be included. Further, the detection unit 3 may include a two-dimensional light receiving element such as a CCD or CMOS.
  • the detection unit 3 may include a signal processing unit.
  • the signal processing unit converts the output obtained by the photodetector into a digital signal.
  • the signal processing unit may include, for example, an A / D converter as a device that performs the conversion.
  • the fluorescence signal detected by the photodetector can be converted into a digital signal by the signal processing unit and transmitted to the processing unit 101.
  • the fluorescent signal may be converted into a digital signal by the signal processing unit and stored in the storage unit 102.
  • the digital signal is treated as fluorescence data by the processing unit 101, and can be used, for example, for generating a two-dimensional plot by the processing unit 101, or can be an object of unmixing processing by the processing unit 101.
  • the fluorescence data may include data on fluorescence intensity.
  • the detection unit 3 (particularly the photodetector) is arranged at a position where the fluorescence generated from the particles can be detected.
  • the detection unit 3 may be arranged so as to sandwich the chip T (particularly the main flow path P13) between the light irradiation unit 2 and the detection unit 3, or the detection unit 3 may be arranged. It may be arranged on the same side as the light irradiation unit 2 with respect to the chip T.
  • the information processing device 100 includes, for example, a processing unit 101 and a storage unit 102.
  • the processing unit 101 processes the fluorescence data (for example, fluorescence intensity data) acquired by the detection unit 3.
  • An example of processing the fluorescence data by the processing unit 101 will be described below (2-6).
  • the storage unit 102 stores various data.
  • the storage unit 102 may be configured to store the fluorescence data acquired by, for example, the detection unit 3.
  • the storage unit 102 may be further configured to store spectral reference data.
  • the processing unit 101 includes a two-dimensional plot generation unit 103 and a spectral reference correction unit 104.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 performs a process of generating a two-dimensional plot based on the fluorescence data. Further, the two-dimensional plot generation unit 103 may perform a process of outputting the two-dimensional plot to the output unit 4, and in particular, the two-dimensional plot can be displayed on the display device.
  • the spectral reference correction unit 104 performs a process of correcting the spectral reference data. The modification can be made, for example, in response to a user's correction operation of the two-dimensional plot.
  • the spectral reference correction unit is also referred to as an SR correction unit. Further, in the present specification, the spectral reference is also referred to as SR.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 and the spectral reference correction unit 104 will be described in more detail below (2-6).
  • the processing unit 101 can control the output unit 4 to output the processing result of the fluorescence data. Further, the processing unit 101 receives a signal from the input unit 5 (for example, an operation signal generated by the operation of the input unit 5 by the user), executes various processes based on the signal, or controls the information processing device 100. sell.
  • a signal from the input unit 5 for example, an operation signal generated by the operation of the input unit 5 by the user
  • executes various processes based on the signal or controls the information processing device 100. sell.
  • the processing by the processing unit 101 can be realized by, for example, the following configuration, but the configuration of the information processing apparatus 100 is not limited to the following.
  • the information processing device 100 may include, for example, a CPU (Central Processing Unit), a RAM, and a ROM.
  • the CPU, RAM, and ROM may be connected to each other via a bus.
  • An input / output interface may be further connected to the bus.
  • the output unit 4 and the input unit 5 may be connected to the bus via the input / output interface.
  • a communication device may be connected to the input / output interface.
  • a storage device may be connected to the input / output interface.
  • a drive may be connected to the input / output interface.
  • the communication device connects the information processing device 100 to the network by wire or wirelessly.
  • the information processing device 100 can acquire various data (for example, fluorescence data and / or SR data) via a network.
  • the acquired data can be stored in, for example, the storage unit 2.
  • the type of the communication device may be appropriately selected by those skilled in the art.
  • the storage device includes an operating system (for example, WINDOWS (registered trademark), UNIX (registered trademark), or LINUX (registered trademark)), and an information processing device (or particle analyzer or particle) according to the present technology.
  • an operating system for example, WINDOWS (registered trademark), UNIX (registered trademark), or LINUX (registered trademark)
  • an information processing device or particle analyzer or particle
  • a program to be executed by an analysis system and various other programs, as well as fluorescence data, SR data, and various other data may be stored.
  • the drive can read data (for example, fluorescence data, SR data, etc.) or a program recorded on a recording medium and output it to RAM.
  • the recording medium is, for example, a microSD memory card, an SD memory card, or a flash memory, but is not limited thereto.
  • the output unit 4 may include, for example, a device that outputs the result of processing the fluorescence data by the processing unit 101.
  • the output unit 4 can output, for example, the two-dimensional plot group generated by the two-dimensional plot generation unit 103 to the display device (display).
  • the output unit 4 can output an alert to the display device, for example, when at least one of the two-dimensional plot groups does not satisfy a predetermined condition.
  • the alert may be generated in step S309 described in the following "(2-6) Example of processing fluorescence data by the information processing apparatus". Further, the output unit 4 may display a list box for selecting any one of the above-mentioned phosphors from the plurality of phosphors on the display device.
  • the list box may be the one described with respect to step S207 described in the following "(2-6) Example of processing of fluorescence data by the information processing apparatus".
  • the display device can output the result of processing the fluorescence data as an image (still image or moving image).
  • the output unit 4 may include, for example, a printing device.
  • the printing apparatus can print the result of processing the fluorescence data on a printing medium such as paper and output it.
  • the input unit 5 is, for example, a device that accepts operations by the user.
  • the input unit 5 may include, for example, a mouse, a keyboard, or a display (in this case, the user operation may be a touch operation on the display).
  • the input unit 5 transmits the operation by the user as an electric signal to the information processing device 100.
  • the processing unit 101 of the information processing device 100 can perform various processes according to the electric signal.
  • FIG. 2 is an example of a flow chart of processing fluorescence data by the information processing apparatus 100.
  • step S101 the information processing device 100 starts processing the fluorescence data. For example, in response to the user clicking a predetermined processing start button displayed on the display of the output unit 4, the processing unit 101 displays a window for processing the fluorescence data on the display.
  • the particle population labeled with the plurality of phosphors Prior to the start of the processing of the fluorescence data, the particle population labeled with the plurality of phosphors is subjected to fluorescence detection (particularly, the fluorescence detection unit 2), the chip T, and the detection unit 3 described above. Flow cytometry) is performed, and the fluorescence data acquired as a result may be stored in the storage unit 102.
  • step S102 the processing unit 101 acquires fluorescence data for the particle population.
  • the processing unit 101 can receive, for example, the fluorescence data acquired by the detection unit 3.
  • the processing unit 101 may acquire the fluorescence data stored in the storage unit 102.
  • the processing unit 101 performs an unmixing process on the fluorescence data acquired in step S102.
  • the unmixing process is also called a fluorescence separation process.
  • the processing unit 101 may perform the unmixing process using, for example, the least squares method (Least Square Method, LSM), more preferably the weighted least squares method (WLSM).
  • LSM least square Method
  • WLSM weighted least squares method
  • the unmixing process using the least squares method may be performed, for example, by using the fluorescence intensity correction method described in Japanese Patent No. 5985140.
  • the fluorescence intensity correction method can be performed using, for example, the following WLSM mathematical formula (1).
  • x n denotes the fluorescence intensity of the n-th fluorescent dye
  • [S T] denotes the transposed matrix of spectral reference
  • [L] represents a weighting matrix
  • [S] is the spectral reference
  • y i shows the measured value at the i-th photodetector
  • ⁇ i shows the weight at the i-th photodetector
  • max (y i , 0) shows the detection of the i-th detector.
  • a large value is shown by comparing the value with zero, and offset'shows a value determined based on the detection value of each detector.
  • the fluorescence wavelength distribution of a fluorescent substance may be wide. Therefore, for example, the PMT used for detecting the fluorescence generated from a certain phosphor can also detect the fluorescence generated from another phosphor. Therefore, the output from each PMT is corrected so that the output is caused only by the fluorescence derived from the target phosphor of each PMT.
  • the unmixing process is a method for the correction.
  • the processing unit 101 can perform the unmixing process using the spectral reference data of each of the plurality of fluorescent dyes.
  • the spectral reference data may be stored in the storage unit 102 in advance.
  • the processing unit 101 can acquire the spectral reference data from, for example, the storage unit 102, and perform the unmixing process.
  • the spectral reference data (also referred to as SR data) is the spectrum data of fluorescence generated when a predetermined excitation light is irradiated to each phosphor.
  • the SR data can be obtained, for example, by detecting the fluorescence generated by irradiating the particles labeled with each phosphor alone with a predetermined excitation light with a photodetector.
  • step S104 the user sets and unfolds the gate so as to generate a two-dimensional plot for two of the plurality of fluorophores used to label the particle population.
  • the gate setting and deployment operations can be appropriately determined by the user according to the purpose of the analysis.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 generates a two-dimensional plot for the two phosphors in response to the operation. More specifically, the two-dimensional plot generator 103 uses the fluorescence data after the unmixing process in step S103 to make a two-dimensional plot based on the gate set by the user and the two phosphors selected by the user. Can be generated.
  • the vertical axis of the two-dimensional plot may be fluorescence fluorescence data (particularly fluorescence intensity) of fluorescence corresponding to one of the two phosphors, and the horizontal axis may be the other phosphor. It may be the fluorescence data of the corresponding fluorescence (particularly the fluorescence intensity).
  • the two-dimensional plot may be, for example, a density plot (dot plot), a contour plot, or both a density and contour plot.
  • the number of two-dimensional plots generated may be one or plural (eg, two or more, particularly 2 to 30, more particularly 2 to 20). Further, in step S104, in addition to the two-dimensional plot for the two phosphors, the plot and / or the scattering based on the scattered light (for example, any two of the forward scattered light, the side scattered light, and the backscattered light). A plot based on light and fluorescence may be generated. These plots may be generated, for example, by the two-dimensional plot generator 103.
  • step S104 the two-dimensional plot generation unit 103 causes the display device to display the generated one or a plurality of two-dimensional plots.
  • the one or more two-dimensional plots generated in step S104 may be displayed, for example, on one window or worksheet.
  • the plurality of two-dimensional plots generated in step S104 may be displayed separately on two or more windows or worksheets.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 generates a scattered light plot 10 and a spectrum plot 11 in which all events are plotted based on the side scattered light (SSC) data and the forward scattered light (FSC) data.
  • the user can then set the gate A in the scattered light plot 10 and perform an unfolding operation on the gate A to generate a two-dimensional plot for the two desired phosphors.
  • the operation produces, for example, the two-dimensional plot 12 shown in FIG.
  • the user performs an unfolding operation to generate a two-dimensional plot for the combination of the other two phosphors for Gate A, which produces, for example, the two-dimensional plots 13 and 14 shown in FIG.
  • the user wants to check the two-dimensional plot generated in step S104, and as a result, correct, for example, any one of the plots.
  • the two-dimensional plot correction process is performed in step S105, and then the two-dimensional plot group generation process is performed in step S106.
  • the two-dimensional plot correction process may be a correction process based on a user operation on the two-dimensional plot displayed on the display device.
  • the two-dimensional plot group generation process may be a process of generating a group of two-dimensional plots of one phosphor and all the phosphors other than the phosphor based on the correction process.
  • FIG. 4A shows an example of a flow chart of the two-dimensional plot correction process and the two-dimensional plot group generation process. Steps S201 to S205 in FIG. 4A correspond to the details of step S105. Steps S206-208 in FIG. 4A correspond to the details of step S106.
  • step S201 the processing unit 101 starts the two-dimensional plot correction process in response to the user performing the predetermined correction process start operation.
  • the correction processing start operation is performed by, for example, clicking the correction processing start button in the window or worksheet displaying the two-dimensional plot generated in step S104, or the correction processing start button in another window or worksheet. It may be there.
  • step S202 the processing unit 101 shifts the two-dimensional plot generated in step S104 to the adjustment mode in response to the user performing the correction processing start operation in step S201.
  • the processing unit 101 makes a predetermined modification to, for example, the two-dimensional plot.
  • the predetermined modification may be the display of a diagonal line from the lower left corner to the upper right corner in the two-dimensional plot.
  • the diagonal lines are displayed on the two-dimensional plots 12 to 14.
  • Two-dimensional plots 12-14 with diagonal lines added are shown in FIG.
  • diagonal lines d12, d13, and d14 are added to the two-dimensional plots 12, 13, and 14, respectively. The diagonal makes it easier for the user to see if the desired two-dimensional plot has been obtained.
  • a display for indicating the direction of the plot adjustment operation may be added in the two-dimensional plot that has been shifted to the adjustment mode. An example of such a display will be described with reference to FIGS. 6A and 6B.
  • the two-dimensional plot to which the diagonal display described above is added is divided into a triangle in the upper left half and a triangle in the lower right half by the diagonal line.
  • the processing unit 101 displays on the display a display indicating an adjustable direction in the area of the triangle in the lower right half.
  • the display may be an arrow display such as the arrow 60 in FIG. 6A.
  • the adjustable direction within the triangular region of the lower right half can be the vertical axis direction.
  • the processing unit 101 causes the display to display a display indicating an adjustable direction within the triangular area of the upper left half. ..
  • the display may be an arrow display such as the arrow 61 in FIG. 6B.
  • the adjustable direction within the triangular region of the upper left half can be the horizontal axis direction. Such a display makes it easier for the user to grasp the adjustable direction.
  • step S203 for example, it is assumed that the user operates the two-dimensional plot displayed on the display device.
  • the operation may be, for example, a drag operation of the mouse pointer on the two-dimensional plot.
  • the processing unit 101 corrects the two-dimensional plot based on the operation.
  • the correction process based on the operation may include, for example, the SR correction process in step S203, the unmixing process in step S204, and the two-dimensional plot correction process in step S205. Specific examples of these processes will be described below.
  • the SR correction unit corrects the SR of each phosphor.
  • the SR correction unit 104 responds to the user's operation on the two-dimensional plot (for example, in response to the user dragging the mouse pointer on the two-dimensional plot).
  • the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence data of the dimensional plot (that is, the two-dimensional plot that is the target of the correction process) is corrected.
  • the SR correction unit 104 corrects the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence data constituting the two-dimensional plot based on the movement amount or the drag operation amount of the mouse pointer.
  • step S203 A more specific example of the SR correction process in step S203 will be described below.
  • the SR correction unit 104 is a phosphor corresponding to the fluorescence data constituting the two-dimensional plot.
  • the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence intensity data on the vertical axis of the two-dimensional plot and the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence intensity data on the horizontal axis of the two-dimensional plot can be modified. The modification is preferably performed based on the amount of drag operation in the vertical direction of the mouse pointer or the amount of movement of the mouse pointer within the area by the user. As a result, the SR data can be intuitively corrected by operating the mouse.
  • the "adjustment coefficient" may be set based on the relationship between the fluorescence intensities of the phosphors on the horizontal and vertical axes of the two-dimensional plot.
  • the modification of the SR data may be performed over the entire wavelength range of the SR data, or may be performed over a part of the wavelength range of the SR data.
  • the SR correction unit 104 determines the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence data constituting the two-dimensional plot. To fix. Also in this case, in particular, the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence intensity data on the vertical axis of the two-dimensional plot and the SR data of the phosphor corresponding to the fluorescence intensity data on the horizontal axis of the two-dimensional plot are modified. sell. The modification is preferably performed based on the amount of drag operation of the mouse pointer in the horizontal axis direction by the user or the amount of movement of the mouse pointer in the area. This makes it possible to intuitively correct SR data by operating the mouse.
  • the "adjustment coefficient" may be set based on the relationship between the fluorescence intensities of the phosphors on the horizontal and vertical axes of the two-dimensional plot.
  • the modification of the SR data may be performed over the entire wavelength range of the SR data, or may be performed over a part of the wavelength range of the SR data.
  • the information processing apparatus may include an SR correction unit that corrects SR.
  • the SR correction unit corrects the SR data in response to a user operation on the two-dimensional plot (more particularly, a drag operation on the two-dimensional plot by the user), and in particular, any one axis on the two-dimensional plot.
  • the SR is modified according to the drag operation in the direction.
  • the SR correction unit can correct the SR data based on the drag operation amount or the movement amount of the mouse pointer.
  • the SR correction unit is a phosphor associated with the axis based on the drag operation amount or the mouse pointer movement amount in the axial direction of one of the two axes of the two-dimensional plot on the two-dimensional plot.
  • SR data can be modified.
  • the processing unit 101 of the SR of each of the phosphors associated with the fluorescence intensity of the axis of the generated two-dimensional plot (two-dimensional plot displayed on the display).
  • the waveform may be displayed on the display.
  • the processing unit 101 may display the SR waveform at any position in the window or worksheet where the two-dimensional plot is displayed.
  • the SR waveform 91 may be displayed at the top of the window.
  • the SR correction unit 104 may correct the displayed SR waveform according to the user operation or the correction of the SR data.
  • the display of the SR waveform and the display of the modification of the SR waveform as described above make it easier for the user to grasp the influence of the user operation on the SR waveform.
  • the SR correction unit 104 can correct the two-dimensional plot on the display so that the SR waveform displayed on the display is corrected in conjunction with the user operation on the two-dimensional plot in step S203. .. Due to such modifications on the display, the processing unit 101 may perform steps S203 and S204 substantially simultaneously.
  • steps S203 and S204 are performed consecutively to the extent that the user viewing the display does not recognize that there is a time lag between steps S203 and S204. It can mean being struck.
  • step S204 the processing unit 101 performs an unmixing process using the SR data modified in step S203.
  • the unmixing process may be the same as the unmixing process in step S103, except that the SR data used is different.
  • step S205 the two-dimensional plot generation unit 103 modifies the two-dimensional plot based on the fluorescence data after the unmixing process in step S204.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 can display the modified two-dimensional plot on the display using the fluorescence data after the unmixing process.
  • the two-dimensional plot to be modified by the two-dimensional plot generation unit 103 in step S205 may be, for example, the two-dimensional plot to be the target of the drag operation in step S203. Further, in addition to the two-dimensional plot that is the target of the drag operation, a two-dimensional plot other than the two-dimensional plot that is the target of the drag operation may also be a correction target in step S205.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 may use a plurality of two-dimensional plots (a two-dimensional plot that is the target of the drag operation and one or a plurality of two-dimensional plots other than the two-dimensional plot) that are displayed in advance on the worksheet. May be modified using the fluorescence data obtained by the unmixing process.
  • the two-dimensional plot generator 103 can modify all of the two-dimensional plots generated in step S104 based on the fluorescence data after the unmixing process in step S204.
  • the two-dimensional plot generator 103 also includes the two-dimensional plots 13 and 14 in addition to the two-dimensional plot 12. Can be fixed.
  • the processing unit 101 can modify the two-dimensional plot on the display so that the two-dimensional plot in step S205 is modified in conjunction with the user operation on the two-dimensional plot in step S203. Due to such modifications on the display, the processing unit 101 may perform steps S203 and S205 substantially simultaneously.
  • steps S203 and S205 are performed consecutively to the extent that the user viewing the display does not recognize that there is a time lag between steps S203 and S205. It can mean being struck.
  • the two-dimensional plot shown in A of FIG. 8 is generated.
  • the fluorescence intensity of FL1 is on the horizontal axis and the fluorescence intensity of FL2 is on the vertical axis.
  • the set of events A is a set of events that fluoresce FL1 and fluoresce FL2.
  • the set of events B is a set of events that fluoresce FL1 but do not fluoresce FL2.
  • the set of events C is a set of events that did not fluoresce FL1 but did fluoresce FL2.
  • the set of events D is a set of events that did not fluoresce FL1 and did not fluoresce FL2.
  • the user confirms the two-dimensional plot shown in A and finds that the shapes and positions of the event sets B and C are different from the expected shapes and positions. Therefore, the user decides to correct the two-dimensional plot and shifts the two-dimensional plot to the adjustment mode as described above. As a result, a diagonal line d is displayed on the two-dimensional plot as shown in B of FIG.
  • the user drags the mouse pointer in the direction of the arrow a1 within the area of the lower right half separated by the diagonal line d.
  • the set B of events also moves in the direction of arrow a1.
  • the shape of the event set B also changes from an elliptical shape to a circular shape with the movement.
  • the user drags the mouse pointer in the direction of the arrow a2 within the area of the upper left half separated by the diagonal line d.
  • the set C of events also moves in the direction of arrow a2.
  • the shape of the event set C also changes from an elliptical shape to a circular shape with the movement.
  • FIG. 8C A two-dimensional plot after the drag operation is performed is shown in FIG. 8C.
  • the set B is moved to a position assumed by the user and has a circular shape in accordance with the drag operation.
  • the set C is also moved to the position assumed by the user by the drag operation, and its shape is circular.
  • the shape and position of the set of events displayed on the screen are changed in accordance with the drag operation.
  • the influence on the two-dimensional plot other than the two-dimensional plot can be grasped, it further contributes to the user's examination of whether the correction is appropriate. It is thought that. It is considered useful to understand the effect, especially when the number of phosphors labeled with a particle population is large.
  • the two-dimensional plot generator included in the information processing apparatus according to the present technology generates a two-dimensional plot group for any one of a plurality of phosphors labeled with a particle population and each of all other phosphors. It is configured to be able to. As a result, the influence can be grasped.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 can execute the generation process of the two-dimensional plot group according to, for example, a predetermined user operation.
  • the user operation may be, for example, a click of a two-dimensional plot group generation button for causing the two-dimensional plot generation unit 103 to start the generation processing of the two-dimensional plot group.
  • the window or worksheet for displaying the modified 2D plot in step S205 or another window or worksheet on the display may be provided with the 2D plot group generation button.
  • the processing unit 101 advances the processing to step S207 in response to the user clicking the two-dimensional plot group generation button. If the button is not clicked by the user, the processing unit 101 may proceed to, for example, step S211.
  • step S207 the two-dimensional plot generation unit 103 displays a window for displaying the two-dimensional plot group on the display.
  • An example of the window is shown in FIG. 7A.
  • the window 70 shown in FIG. 7A is provided with, for example, a list box 71 for selecting one of the plurality of phosphors (fluorescent dyes) labeled with the particle population.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 can display a list box for selecting any one of the plurality of phosphors on the display device.
  • the two-dimensional plot generator 103 In response to the user selecting one phosphor from the list box 71, the two-dimensional plot generator 103 produces a two-dimensional plot group for each of the one phosphor and all other phosphors. Generate. Then, the two-dimensional plot generation unit 103 causes, for example, a display device to display the generated two-dimensional plot group.
  • the number of two-dimensional plots constituting the generated two-dimensional plot group may be one less than the number of phosphors labeling the particle population, for example, four or more, particularly seven or more, nine or more, 14 or more, or It may be 19 or more, and may be 21, 23 or more, or 25 or more.
  • the number of two-dimensional plots constituting the generated two-dimensional plot group may be, for example, 49 or less, 44 or less, or 39 or less.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 generates a two-dimensional plot group 72 as shown in FIG. 7B according to the selection of FITC.
  • the horizontal axis of all the two-dimensional plots of the two-dimensional plot group 72 is the fluorescence intensity of FITC.
  • the vertical axis of the two-dimensional plot group 72 is the fluorescence intensity of each of the phosphors other than FITC.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 may generate a two-dimensional plot having the fluorescence intensity of one phosphor selected by the user as the horizontal axis, or the fluorescence.
  • a two-dimensional plot with intensity as the vertical axis may be generated.
  • the two-dimensional plot generator 103 in step S207, relates to a two-dimensional plot group relating to any one of the phosphors whose SR data has been modified in step S204 and all the other phosphors. Can be generated.
  • the two-dimensional plot group is automatically displayed in the window displayed in response to the user operation for starting the generation process of the two-dimensional plot group. good. That is, the two-dimensional plot group may be displayed without the user selecting a phosphor from the list box described above. For example, when the two-dimensional plot 12 in FIG.
  • the SR data of the phosphors of the two axes of the two-dimensional plot 12 can be modified in step S204.
  • the two-dimensional plot generator 103 may generate a two-dimensional plot group for any one of the two-axis phosphors of the two-dimensional plot 12 and all the other phosphors. ..
  • the user may be particularly interested in how the modification of the SR data associated with the 2D plot correction process affects the 2D plot group, that is, the effect of the SR data modification is first grasped. You may want to. According to this embodiment, the influence can be grasped and such needs of the user can be satisfied.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 proceeds to step S208 when the two-dimensional plot group is generated.
  • step S208 the two-dimensional plot generation unit 103 determines whether to end the display of the two-dimensional plot group.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 determines that the display of the two-dimensional plot group is finished, and proceeds to the process in step S209.
  • the operation may be, for example, the user clicking the close button of the window of the two-dimensional plot group. If the operation is not performed, for example, the process can proceed to step S207. Then, for example, the user may select another phosphor from the list box 71. Then, depending on the selection, the two-dimensional plot generation unit 103 can generate a two-dimensional plot group for each of the other phosphor and all the other phosphors.
  • step S209 the processing unit 101 determines whether to end the adjustment mode.
  • the processing unit 101 determines that the adjustment mode is ended and proceeds to the process in step S210.
  • the operation may be, for example, clicking the adjustment mode button or clicking the adjustment mode end button. If it is not determined to exit the adjustment mode, for example, the process may be returned to step S203. Then, the user may re-perform the correction process for the specific two-dimensional plot.
  • step S210 the processing unit 101 ends the adjustment mode.
  • the processing unit 101 removes or removes the predetermined modification made to the two-dimensional plot.
  • the processing unit 101 can erase the diagonal line added to the two-dimensional plot.
  • step S107 the processing unit 101 may end, for example, the fluorescence data correction process. Steps S209 and S210 described above may be performed in step S107. Further, prior to the termination, the processing unit 101 can store the modified SR data, the fluorescence data after the unmixing process, and the generated or corrected two-dimensional plot group in the storage unit 102.
  • the information processing apparatus 100 is among the plurality of phosphors based on the correction processing to one two-dimensional plot obtained from the result of fluorescence detection for the particle population labeled by the plurality of phosphors. It has a two-dimensional plot generation unit 103 that generates a two-dimensional plot group for each one of the phosphors and all the other phosphors. In this way, it is possible to understand how the correction to the 2D plot affects not only the 2D plot displayed on the display but also the 2D plot of one phosphor and the other phosphor. be able to.
  • the two-dimensional plot generator 103 generates an alert when there is a plot that does not meet a predetermined criterion in the two-dimensional plot generated in the two-dimensional plot group generation process in step S106. You may. Details of steps S105 and S106 including the alert generation step will be described below with reference to FIG. 4B. Steps S301 to S305 in FIG. 4B correspond to the details of step S105. Steps S306-3010 in FIG. 4B correspond to the details of step S106.
  • Steps S301 to S307 in FIG. 4B are the same as steps S201 to S207 in FIG. 4A. Therefore, the description of steps S301 to S307 will be omitted.
  • step S307 in FIG. 4B the two-dimensional plot generation unit 103 proceeds to the process in step S308.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 determines whether or not there is a two-dimensional plot that does not satisfy the criteria in the generated two-dimensional plot group.
  • the criterion may be, for example, that the number of events plotted within a predetermined range is greater than or equal to a predetermined proportion, but is not limited thereto.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 determines that the standard is satisfied when the shape of the event group is close to a perfect circle, and does not satisfy the standard when the shape is dispersed due to fluorescence leakage.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 advances the process to step S309. If there is no two-dimensional plot that does not meet the criteria, the two-dimensional plot generation unit 103 advances the process to step S310.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 generates an alert indicating that the two-dimensional plots that do not meet the criteria are included in the two-dimensional plot group.
  • the alert may be displayed, for example, by displaying a two-dimensional plot that does not meet the criteria with a predetermined color, displaying a window stating that there is a two-dimensional plot that does not meet the criteria, or the criteria.
  • a predetermined mark is attached to a two-dimensional plot that does not satisfy the above, but the present invention is not limited to these.
  • the two-dimensional plot generation unit 103 advances the process to step S310.
  • the two-dimensional plot generation unit may display an alert on the display device when at least one two-dimensional plot in the two-dimensional plot group does not satisfy a predetermined condition. This makes it easier for the user to grasp the two-dimensional plot to be noted.
  • Steps S310 to S312 in FIG. 4B are the same as steps S208 to 210 in FIG. 4A. Therefore, the description of steps S310 to S312 will be omitted.
  • the two-dimensional plot group generated in this technique can be derived from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors.
  • the particle population may be contained in the sample solution at the time of detecting the fluorescence.
  • the type of the sample solution may be appropriately selected by those skilled in the art, and may be determined according to factors to be considered such as the type of particles (cells). stomach.
  • the type of the sheath liquid may also be appropriately selected by those skilled in the art.
  • the particle population can be labeled with a plurality of phosphors.
  • the plurality of fluorescent substances may be, for example, a plurality of dyes, particularly a plurality of fluorescent dyes.
  • the fluorescent material may be, for example, a fluorescent material (dye) known in the technical field of flow cytometry. Examples of the fluorescent dye include, but are not limited to, Cascade Blue, Pacific Blue, Fluorescein isothiocyanate (FITC), AleaFluor488, Phycoerythrin (PE), Propidium iodide (PI), Texas Red (TR).
  • FITC Fluorescein isothiocyanate
  • PE Phycoerythrin
  • PI Propidium iodide
  • TR Texas Red
  • PE-efluor 610 PE / Dazzle594, ECD (PE-TxRed), PE-CF594, PE-Vio 615, 7-AAD, PE / Cy5, Peridinin chlorophyll protein (PerCP), PerCP / Cy5.5, PerCP / eFluor710 , PE / Cy7, Allophycocyanin (APC), AlexaFluor647, AlexaFluor700, APC-AlexaFluor700, APC / Fire750, APC / eFluor780, APC / H7, Brilliant Violet (BV421), BD Horizon V450, eFluor450, Pacific Blue, 4', 6- Diamidino-2-phenylindole (DAPI), AmCyan, BD Horizon V500, Brilliant Violet 510, Pacific Orange, Brilliant Violet 570, Brilliant Violet 605, Brilliant Violet 650, eFluor 650NC, Brilliant Violet 711, Brilliant Violet 785, Brilliant Violet 785, Brilliant
  • the particle population is, for example, a particle population labeled with 5 or more phosphors, and more preferably a particle population labeled with 8 or more, 10 or more, 15 or more, or 20 or more phosphors. It's okay.
  • the particle population may be a particle population labeled with 22 or more, 24 or more, or 26 or more phosphors.
  • the particle population may be, for example, a particle population labeled with 50 or less, 45 or less, or 40 or less phosphors.
  • the information processing apparatus makes it possible to easily grasp the influence of the correction processing on the analysis result of the particle population labeled with such various kinds of phosphors (fluorescent dyes).
  • the particles may be particles having dimensions capable of flowing in the flow path provided in the chip T, for example.
  • the particles may be appropriately selected by those skilled in the art.
  • particles include biological fine particles such as cells, cell clumps, microorganisms, and liposomes, and synthetic fine particles such as gel particles, beads, latex particles, polymer particles, and industrial particles. Can be done.
  • Biological microparticles can include chromosomes, liposomes, mitochondria, organelles (organelles), etc. that make up various cells.
  • Cells can include animal cells (such as blood cell lineage cells) and plant cells.
  • the cells can be blood-based cells or tissue-based cells in particular.
  • the blood line cell may be a floating line cell such as T cell and B cell.
  • the tissue-based cells may be, for example, adherent cultured cells or adherent cells separated from the tissue.
  • Cell clusters can include, for example, spheroids and organoids.
  • Microorganisms may include bacteria such as Escherichia coli, viruses such as tobacco mosaic virus, and fungi such as yeast.
  • biological microparticles can also include biological macromolecules such as nucleic acids, proteins, and complexes thereof. These biological macromolecules may be, for example, those extracted from cells or may be contained in blood samples or other liquid samples. According to one embodiment of the present art, the particles are bioparticles, especially cells.
  • Synthetic fine particles can be fine particles made of, for example, an organic or inorganic polymer material or a metal.
  • Organic polymer materials may include polystyrene, styrene / divinylbenzene, polymethylmethacrylate and the like.
  • Inorganic polymer materials may include glass, silica, magnetic materials and the like.
  • the metal may include colloidal gold, aluminum and the like.
  • the synthetic microparticles may be, for example, gel particles or beads, and more particularly gel particles or beads to which one or more combinations selected from oligonucleotides, peptides, proteins, and enzymes are bound. You can.
  • the shape of the particles may be spherical, substantially spherical, or non-spherical.
  • the size and mass of the particles can be appropriately selected by those skilled in the art depending on the size of the flow path of the chip. On the other hand, the size of the flow path of the chip can also be appropriately selected depending on the size and mass of the particles.
  • the particle population may be a population of the above particles, in particular a population of biological particles, and more particularly a population of cells.
  • the particle population may be labeled with a plurality of phosphors.
  • the fluorescent material may be the fluorescent dye described above.
  • the fluorescent dye may be bound to particles (particularly cells) via a molecule that specifically binds to the particles (for example, an antibody, an aptamer, DNA, or RNA, particularly an antibody).
  • the present technology provides a spectral reference for each of the phosphors corresponding to the fluorescence data of the two-dimensional plot, depending on the user's operation on the two-dimensional plot obtained from the results of fluorescence detection for the particle population labeled by the plurality of phosphors.
  • Information processing including a spectral reference correction unit that corrects the above and a two-dimensional plot generation unit that generates a two-dimensional plot using the fluorescence data obtained by the unmixing process using the corrected spectral reference.
  • Equipment is also provided.
  • the spectral reference correction unit and the two-dimensional plot generation unit can reflect the user operation on the two-dimensional plot in the correction processing of the two-dimensional plot, and the user can visually and intuitively grasp the influence of the correction processing. can do.
  • the spectral reference correction unit and the two-dimensional plot generation unit are as described in (2-4) and (2-6) above, and the description also applies to this embodiment. Further, the above description in (2-1) to (2-3) and (2-5) also applies to this embodiment.
  • the present technology is two-dimensional with respect to any one of the 10 or more phosphors and all other phosphors from the results of fluorescence detection for a particle population labeled with 10 or more phosphors.
  • An information processing apparatus including a two-dimensional plot generator for generating a plot group is also provided.
  • the information processing apparatus may be configured as described above, for example, in (2-1) to (2-5), and the description also applies to this embodiment.
  • the information processing apparatus in this embodiment does not perform the processes (two-dimensional plot correction process) in steps S202 to S205 after executing steps S101 to S104 among the processes described in (2-6) above.
  • the processing in S206 to S208 (two-dimensional plot group generation processing) or the processing in steps S306 to S310 (two-dimensional plot group generation processing) can be performed.
  • the information processing apparatus according to the present technology may perform the generation processing of the two-dimensional plot group without performing the two-dimensional plot correction processing.
  • the information processing apparatus in this embodiment may particularly target fluorescence detection results for a particle population labeled with 15 or more phosphors, more preferably 20 or more, 22 or more, 24 or more, or 26 or more phosphors. It may be a particle population labeled with.
  • the particle population may be, for example, a particle population labeled with 50 or less, 45 or less, or 40 or less phosphors.
  • the present technology is based on a correction process to a two-dimensional plot obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors, and the phosphor of any one of the plurality of phosphors and others.
  • a particle analyzer provided with a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for each of all the phosphors of the above.
  • the two-dimensional plot generator is described in 1. above. As described above, the description also applies to this embodiment.
  • the particle analyzer of this technology is, for example, the top 1.
  • the information processing device, the light irradiation unit, and the detection unit described in the above may be provided.
  • the particle analyzer of the present technology is provided with the above-mentioned two-dimensional plot generation unit, it becomes easy to grasp the influence of the fluorescence leakage correction on the two-dimensional plot in the multicolor analysis.
  • the present technology is based on a correction process to a two-dimensional plot obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors, and the phosphor of any one of the plurality of phosphors and the others. Also provided is an information processing method that includes a two-dimensional plot group generation step of generating a two-dimensional plot group for each of all the fluorophores.
  • the information processing method according to the present technology can be performed, for example, to process data obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors.
  • the information processing method according to the present technology is described in, for example, the above 1.
  • the information processing method includes, for example, a fluorescence data acquisition step of acquiring fluorescence data obtained from the results of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors, and an unmixing process of unmixing the fluorescence data.
  • the fluorescence data acquisition process is described in 1.
  • step S102 described in (2-6).
  • the unmixing process is described in 1.
  • step S103 described in (2-6).
  • the two-dimensional plot generation step is described in 1.
  • step S104 described in (2-6).
  • the two-dimensional plot correction step is described in 1.
  • steps S105 and S106 described in (2-6). Therefore, the above 1.
  • the explanation of these steps in (2-6) also applies to each step in the information processing step of the present technology.
  • the two-dimensional plot correction step is, for example, an SR correction step of modifying the SR according to an operation operation on the two-dimensional plot, and an additional unmixing processing step of performing an unmixing process using the SR modified in the SR correction step.
  • the SR correction process is described in 1. Corresponds to step S203 described in (2-6). The additional unmixing process is described in 1. Corresponds to step S204 described in (2-6). The two-dimensional plot correction step is described in 1. Corresponds to step S205 described in (2-6) of. The two-dimensional plot group generation step is described in 1. Corresponds to step S207 described in (2-6). Therefore, the above 1. The description of these steps in (2-6) also applies to these steps in the information processing process of the present technology.
  • the present technology is based on a correction process to a two-dimensional plot obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors, and the phosphor of any one of the plurality of phosphors and the others. Also provided is a program for causing an information processing apparatus (or a particle analyzer or a particle analysis system including the information processing apparatus) to execute a two-dimensional plot group generation step for generating a two-dimensional plot group for each of all the phosphors of the above. .. The step is described in 1. And 3. As described above, the description also applies to the present embodiment.
  • the two-dimensional plot group generation step can be performed, for example, in a two-dimensional plot correction step for correcting a two-dimensional plot obtained from the results of fluorescence detection for a particle group labeled with a plurality of phosphors. That is, the program may be for causing the information processing apparatus (or the particle analyzer or the particle analysis system including the information processing apparatus) to execute the two-dimensional plot correction step.
  • the two-dimensional plot correction step is, for example, the above 3.
  • the SR correction step, the additional unmixing processing step, and the two-dimensional plot correction step described in the above may be further included.
  • the two-dimensional plot correction step may be executed as a step of forming a part of an information processing method for data obtained from the result of fluorescence detection for a particle population labeled with a plurality of phosphors.
  • the information processing method is, for example, the above 3.
  • the fluorescence data acquisition step, the unmixing treatment step, and the two-dimensional plot generation step described in the above may be further included.
  • the two-dimensional plot generated in the two-dimensional plot generation step can be corrected in the two-dimensional plot correction step.
  • the present technology can also have the following configuration.
  • a two-dimensional plot is generated based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and one of the plurality of phosphors is used based on a correction process for the two-dimensional plot.
  • An information processing device including a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for each of one phosphor and all other phosphors.
  • the correction process is a correction process based on a user operation on the two-dimensional plot displayed on the display device.
  • the information processing device according to [1] or [2] further including an output unit that outputs the generated two-dimensional plot group to a display device.
  • [4] Includes a spectral reference correction section that modifies the spectral reference.
  • the spectral reference correction unit corrects the spectral reference of each phosphor corresponding to the fluorescence data of the two-dimensional plot that is the target of the correction process, any one of [1] to [3].
  • the information processing device described in. [5] The information according to [4], wherein in the correction process, the two-dimensional plot generator corrects the two-dimensional plot based on the fluorescence data unmixed using the modified spectral reference. Processing equipment.
  • the information processing apparatus according to any one of [1] to [5], wherein the particle group is a particle group labeled with 10 or more kinds of phosphors.
  • the information processing apparatus according to any one of [1] to [6], wherein the number of two-dimensional plots constituting the generated two-dimensional plot group is 9 or more.
  • the information processing device according to any one of [1] to [7], wherein the fluorescence detection is fluorescence detection by a flow cytometer.
  • the output unit outputs an alert to the display device when at least one of the two-dimensional plot groups does not satisfy a predetermined condition, any one of [1] to [8].
  • the output unit causes the display device to display a list box for selecting any one of the above-mentioned phosphors from the plurality of phosphors, in any one of [1] to [9].
  • any one of the plurality of phosphors and the other A particle analyzer equipped with a two-dimensional plot generator that generates a two-dimensional plot group for each of all phosphors.
  • a two-dimensional plot is generated based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and one of the plurality of phosphors is used based on a correction process for the two-dimensional plot.
  • a two-dimensional plot group generation step that produces a two-dimensional plot group for each of one fluorophore and all other fluorophores.
  • Information processing method [19] A two-dimensional plot is generated based on fluorescence data obtained from a group of particles labeled with a plurality of phosphors, and one of the plurality of phosphors is used based on a correction process for the two-dimensional plot.

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Abstract

二次元プロットへの補正処理の影響を簡便に把握するための技術を提供すること。 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている情報処理装置を提供する。また、本技術は、前記二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含む情報処理方法及び前記前記二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を情報処理装置に実行させるためのプログラムも提供する。

Description

情報処理装置、粒子分析装置、情報処理方法、及びプログラム
 本技術は、情報処理装置、粒子分析装置、情報処理方法、及びプログラムに関する。より詳細には、本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団に対する蛍光解析において用いられる情報処理装置、粒子分析装置、情報処理方法、及びプログラムに関する。
 例えば細胞などの粒子集団を蛍光色素によって標識し、当該粒子集団のそれぞれの粒子にレーザ光を照射して励起された蛍光色素から発生する蛍光の強度及び/又はパターンを計測することによって、粒子の特性を測定することが行われている。当該測定を行う粒子分析装置の代表的な例として、フローサイトメータを挙げることができる。
 上記のような測定において、粒子集団を標識するために複数種の蛍光色素が用いられることがしばしばある。複数種の蛍光色素が用いられる場合、目的の蛍光色素から発生する蛍光を光学フィルタにより分離しても、分離した光を検出する光検出器には、目的外の蛍光色素から発生した蛍光が漏れ込むことがある。蛍光の漏れ込みが生じると、当該光検出器で計測される蛍光強度が、前記目的の蛍光色素に由来する真の蛍光強度よりも大きくなる。そのため、前記漏れ込んだ蛍光の蛍光強度を差し引くための補正が行われる。
 当該補正に関する技術として、例えば下記特許文献1には、蛍光波長帯域の重複する複数の蛍光色素により多重標識された微小粒子に光を照射することによって励起された蛍光色素から発生する蛍光を、蛍光色素の数よりも多く配設した、受光波長帯域の異なる光検出器で受光し、各光検出器から検出値を収集して得られる測定スペクトルを、各蛍光色素を個別に標識した微小粒子で得られる単染色スペクトルの線形和により近似する手順を含む蛍光強度補正方法が開示されている。
特開2011-232259
 複数種の蛍光色素それぞれのスペクトラルリファレンスを用いてアンミキシング処理を行うことによって、前記計測された蛍光強度から前記漏れ込んだ蛍光の蛍光強度を差し引く補正ができる。しかしながら、当該補正後の蛍光データを用いて得られた二次元プロットが、所望のプロットにならない場合がある。この場合の原因として、例えば予め用意されていたスペクトラルリファレンスが実際に用いた蛍光色素のスペクトラルリファレンスの波形と一致しないこと、又は、染色に使用した蛍光色素が劣化していることなどが挙げられる。この問題を解消するために、例えばスペクトラルリファレンスの波形自体を修正すること、又は、実際に粒子を標識した蛍光色素の波形にスペクトラルリファレンスの波形を一致させることが考えられる。
 近年、前記測定に用いられる蛍光色素の種類の数が多くなってきており、例えば蛍光色素の種類の数が10以上となることはしばしばあり、20以上となる場合や、さらには30以上になる場合もある。これに伴い、例えば或る蛍光色素のスペクトラルリファレンスを修正したことによるアンミキシング処理への影響及び得られるプロットへの影響は、しばしば把握しにくい。そのため、当該影響をより簡便に把握することができれば、測定結果の迅速な分析及び/又は調整に貢献できると考えられる。
 また、スペクトラルリファレンスの修正に関しては、スペクトラルリファレンスの波形自体の修正よりも、取得された蛍光データの解析結果(例えば二次元プロットなど)の直感的な修正に伴うスペクトラルリファレンスの波形の修正のほうが、ユーザにとって使いやすい場合がある。
 そこで、本技術は、スペクトラルリファレンスの修正の影響を簡便に把握するための技術を提供することを主目的とする。
 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている情報処理装置を提供する。
 前記補正処理は、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作に基づく補正処理であってよい。
 前記情報処理装置は、前記生成された二次元プロット群を表示装置に出力する出力部をさらに含みうる。
 前記情報処理装置は、スペクトラルリファレンスを修正するスペクトラルリファレンス修正部をさらに含んでよく、
 前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記補正処理において、前記補正処理の対象である二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスを修正しうる。
 前記補正処理において、前記二次元プロット生成部が、当該修正されたスペクトラルリファレンスを用いてアンミキシング処理された蛍光データに基づき、前記二次元プロットを修正しうる。
 前記粒子集団が、10種以上の蛍光体により標識された粒子集団でありうる。
 前記生成される二次元プロット群を構成する二次元プロットの数が9以上でありうる。
 前記蛍光検出が、フローサイトメータによる蛍光検出であってよい。
 前記出力部は、前記二次元プロット群のうち少なくとも一つの二次元プロットが所定の条件を満たさない場合に、アラートを表示装置に出力しうる。
 前記出力部は、前記複数の蛍光体のうちから前記いずれか1つの蛍光体を選択させるためのリストボックスを表示装置に表示させうる。
 前記二次元プロット生成部は、前記リストボックスから選択された蛍光体を前記いずれか1つの蛍光体として、前記二次元プロット群を生成しうる。
 また、本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットに対するユーザ操作に応じて、前記二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスの修正を行うスペクトラルリファレンス修正部と、
 前記修正後のスペクトラルリファレンスを用いたアンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて二次元プロットを生成する二次元プロット生成部と
 を備えている情報処理装置も提供する。
 前記ユーザ操作が、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作でありうる。
 前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロット上でのいずれか一軸の方向におけるドラッグ操作に応じてスペクトラルリファレンスを修正しうる。
 前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のスペクトラルリファレンスを修正しうる。
 前記二次元プロット生成部が、予めワークシート上に表示されている二次元プロットを、アンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて修正しうる。
また、本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている粒子分析装置も提供する。
 また、本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含む情報処理方法も提供する。
 また、本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を情報処理装置に実行させるためのプログラムも提供する。
 また、本技術は、10以上の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から、前記10以上の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている情報処理装置も提供する。
本技術に従う情報処理装置を含む粒子分析システムの構成例を示す図である。 本技術に従う情報処理装置による処理のフロー図の一例である。 蛍光データの分析結果の画面表示の一例を示す図である。 本技術に従う情報処理装置による処理のフロー図の一例である。 本技術に従う情報処理装置による処理のフロー図の一例である。 蛍光データの分析結果の画面表示の一例を示す図である。 本技術に従う情報処理装置により提示される二次元プロットの表示例である。 本技術に従う情報処理装置により提示される二次元プロットの表示例である。 本技術に従い生成される二次元プロット群が表示されるウィンドウの例である。 本技術に従い生成される二次元プロット群が表示されているウィンドウの例である。 本技術に従う情報処理装置による二次元プロットの補正の一例を示す模式図である。 スペクトルデータの表示の仕方の一例を示す図である。
 以下、本技術を実施するための好適な形態について説明する。なお、以下に説明する実施形態は、本技術の代表的な実施形態を示したものであり、本技術の範囲がこれらの実施形態のみに限定されることはない。なお、本技術の説明は以下の順序で行う。
1.第1の実施形態(情報処理装置)
(1)第1の実施形態の説明
(2)第1の実施形態の第1の例
(2-1)光照射部
(2-2)チップ
(2-3)検出部
(2-4)情報処理装置
(2-5)出力部及び入力部
(2-6)情報処理装置による蛍光データの処理の例
(2-7)粒子集団
(2-8)他の実施態様
(2-9)他の実施態様
2.第2の実施形態(粒子分析装置)
3.第3の実施形態(情報処理方法)
4.第4の実施形態(プログラム)
1.第1の実施形態(情報処理装置)
(1)第1の実施形態の説明
 本技術に従う情報処理装置は、複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている。
 前記二次元プロット生成部は、二次元プロットへの補正処理に基づき蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する。当該二次元プロット群が生成されることによって、補正処理の影響を把握しやすくなる。
 加えて、当該二次元プロット群の生成は、二次元プロットへの補正処理に基づき行われる。二次元プロットへの補正処理は、スペクトラルリファレンスの波形自体の修正又は補正係数の修正と比べて、補正処理内容を視覚的且つ直感的に把握しやすい。
 以上のとおり、前記二次元プロット生成部は、ユーザによる二次元プロットへの視覚的且つ直感的な補正操作を受け付け、且つ、当該補正の影響を把握するための二次元プロット群を生成する。従って、前記二次元プロット生成部は、蛍光データ解析結果に対する補正処理の影響をユーザがより把握しやすくすることに貢献する。本技術によって、特にマルチカラー解析において用いられる蛍光体の種類の数が多い場合であっても、例えば10種以上、特には15種類以上、より特には20種類以上、さらにより特には25種類の場合であっても、前記影響を把握しやすくなる。
(2)第1の実施形態の第1の例
 本技術に従う情報処理装置は、例えばフローサイトメトリーにおいて得られた蛍光データを処理する装置として構成されてよい。このように構成された本技術に従う情報処理装置の例及び当該情報処理装置による処理の例を、以下で図1を参照しながら説明する。
 図1に、本技術に従う情報処理装置を含む粒子分析システム1が示されている。当該粒子分析システムは、光照射部2、分析対象となる粒子が流れる流路が設けられたチップT、検出部3、情報処理装置100、出力部4、及び入力部5を含む。粒子分析システム1は、フローサイトメトリーを行う系として構成されている。
(2-1)光照射部
 光照射部2は、チップTの流路の所定の位置に光の照射を行うように構成されている。流路内の光照射位置を粒子が通過することで、粒子に光が照射され、その結果蛍光が生じる。すなわち、当該光は励起光として、粒子、特には粒子を標識している蛍光体に作用しうる。
 光照射部2は、或る波長の光を生成する1つの光源又は互いに異なる波長の光を生成する複数の光源を含み、好ましくは互いに異なる波長の光を生成する複数の光源を含みうる。前記光源は、例えばレーザ光源でありうる。レーザ光源として、半導体レーザ、アルゴンイオン(Ar)レーザ、ヘリウム-ネオン(He-Ne)レーザ、ダイ(dye)レーザ、クリプトン(Cr)レーザ、又は、半導体レーザと波長変換光学素子を組み合わせた固体レーザなどを挙げることができるがこれらに限定されない。特に好ましくは、光照射部2は、互いに異なる波長のレーザ光を生成する複数の半導体レーザの組合せを含みうる。
 また、光照射部2は、前記光源から出射された光を流路内の所定の位置に導くための導光光学系を含みうる。当該導光光学系は、例えば前記複数の光源により生成された光を合波する光学系を含んでもよい。前記導光光学系によって、前記流路内の所定の位置に光が照射される。光の照射位置は、1つであってよく又は2つ以上(例えば2つ、3つ、4つ、又は5つ)であってもよい。
(2-2)チップ
 チップTは、例えばフローセルとして構成されうる。チップTには流路が設けられている。チップTに設けられている流路構造は、例えば、粒子が略一列に並んで流れる流れ(特には層流)を形成するように構成されている。
 図1に示されるチップTには、流路P11、P12a、P12b、及びP13が設けられている。粒子を含むサンプル液が収容されている容器(バッグ)B1から、当該サンプル液がサンプル液流路P11に導入される。当該サンプル液は、サンプル液流路P11を主流路P13に向かって流れる。シース液を含む容器(バッグ)B2から、シース液がチップTに導入される。シース液は、2本のシース液流路P12a及びP12bを、主流路P13に向かって流れる。サンプル液流路P11とシース液流路P12a及びP12bは合流して主流路P13を形成するように構成されている。サンプル液流路P11内を送液されるサンプル液と、シース液流路P12a及びP12b内を送液されるシース液とが、前記3つの流路が合流する地点にて合流し、そして、主流路P13内を流れる。主流路P13内には、例えばサンプル液がシース液に挟み込まれた層流が流れる。当該層流中には、粒子が略一列に並んでいる。主流路P13内を並んで流れる粒子に、光照射部2によって生成された励起光が照射され、これにより生じた光が、検出部3によって検出される。
 チップTは、2次元又は3次元の流路構造を有するものであってよい。チップTは、プラスチック材料又はガラス材料から形成された基板形状を有しうる。チップT及びチップTに設けられる流路構造は、図1に示されるものに限定されず、例えばフローサイトメータに関する技術分野において既知のチップ及び流路構造が採用されてもよい。すなわち、本技術において、蛍光検出は、例えばフローサイトメータによる蛍光検出であってよい。
 チップTに設けられる流路の横断面の形状は例えば円形、楕円形、又は矩形(正方形又は長方形)などであってよい。流路の横断面が円形又は楕円形である場合、その直径又は長径は、例えば1mm以下であってよく、特には10μm以上1mm以下であってよい。流路の横断面が正方形又は長方形である場合、その一辺又は長辺の長さは、例えば1mm以下であってよく、特には10μm以上1mm以下であってよい。
 チップTから出た粒子は分取されてもよい。例えば、例えばピエゾ振動素子など振動素子によってチップを振動させることで、吐出口から、1つの粒子を含む液滴を発生させることができる。当該液滴を荷電部によって荷電することで進行方向を制御し、粒子を分取することができる。このように、粒子分析システム1は、ソーティング機能を有する系として構成されてよい。
 また、チップTとして、チップ内に分取機構を設けられたチップが用いられてもよい。このようなチップの例として、例えば特開2019-174192に記載された微小粒子分取用マイクロチップを挙げることができる。当該チップにより、サンプル液中の粒子を外気との接触なく分取でき、すなわち閉鎖型分取操作が可能となる。
 以上のとおり、粒子分析システム1は、粒子を分取する分取部を有していてもよい。当該分取部は、検出部による蛍光検出結果に基づき、粒子を分取しうる。
(2-3)検出部
 検出部3は、チップTの流路内を流れる粒子への光照射により生じた蛍光を検出するように構成されている。検出部3は、蛍光の検出に加え、散乱光(例えば前方散乱光、後方散乱光、及び側方散乱光のいずれか1つ以上)をさらに検出してもよい。
 検出部3は、1つ又は複数の光検出器を含む。当該光検出器は、PMT(光電子増倍管)及び/又はフォトダイオードを含んでよく、特には1又は複数のPMTを含みうる。当該光検出器は、例えば複数のPMTを例えば一次元方向に配列したPMTアレイを含みうる。当該光検出器に含まれるPMTの数は、例えば2以上、5以上、8以上、10以上、15以上、20以上、22以上、24以上、又は26以上であってよい。当該光検出器に含まれるPMTの数は、例えば50以下、45以下、又は40以下であってもよい。
 当該光検出器は、蛍光を分光する分光光学系を含みうる。当該分光光学系は、例えば、蛍光を分光して、所定の検出波長が割り当てられたPMTに当該所定の検出波長の光を到達させるように構成されうる。
 また、検出部3は、蛍光測定器、散乱光測定器、透過光測定器、反射光測定器、回折光測定器、紫外分光測定器、赤外分光測定器、ラマン分光測定器、FRET測定器、及びFISH測定器から選ばれる1つ以上の測定器を含んでもよい。また、検出部3は、例えばCCD又はCMOSなどの2次元受光素子を含んでもよい。
 検出部3は、信号処理部を含みうる。当該信号処理部が、前記光検出器により得られた出力をデジタル信号に変換する。当該信号処理部は、当該変換を行う装置として例えばA/D変換器を含んでよい。光検出器により検出された蛍光信号は、当該信号処理部によりデジタル信号に変換され、そして、処理部101に送信されうる。代替的には、前記蛍光信号は、当該信号処理部によりデジタル信号に変換され、そして、記憶部102に格納されてもよい。前記デジタル信号が、処理部101により蛍光データとして取り扱われ、例えば処理部101による二次元プロット生成のために用いられ、又は、処理部101によるアンミキシング処理の対象となりうる。当該蛍光データは、蛍光強度に関するデータを含みうる。
 検出部3(特に光検出器)は、粒子から生成された蛍光を検出可能な位置に配置される。例えば、図1に示されるように、検出部3は、チップT(特には主流路P13)を光照射部2と検出部3とで挟むように配置されてよく、又は、検出部3は、チップTに対して、光照射部2と同じ側に配置されてもよい。
(2-4)情報処理装置
 情報処理装置100は、例えば処理部101及び記憶部102を含む。
 処理部101は、検出部3により取得された蛍光データ(例えば蛍光強度データなど)の処理を行う。処理部101による蛍光データの処理の例は、以下(2-6)において説明する。
 記憶部102は、各種データを記憶する。記憶部102は、例えば検出部3により取得された蛍光データを格納できるように構成されていてよい。記憶部102は、さらに、スペクトラルリファレンスデータを格納できるように構成されていてよい。
 処理部101は、二次元プロット生成部103及びスペクトラルリファレンス修正部104を含む。
 二次元プロット生成部103は、蛍光データに基づき二次元プロットを生成する処理を行う。また、二次元プロット生成部103は、当該二次元プロットを出力部4に出力させる処理を行ってよく、特には当該二次元プロットを表示装置に表示させうる。
 スペクトラルリファレンス修正部104は、スペクトラルリファレンスデータを修正する処理を行う。当該修正は、例えばユーザによる二次元プロットの補正操作に応じて行われうる。本明細書内において、スペクトラルリファレンス修正部をSR修正部ともいう。また、本明細書内において、スペクトラルリファレンスをSRともいう。
 二次元プロット生成部103及びスペクトラルリファレンス修正部104について、以下(2-6)においてより詳細に説明する。
 処理部101は、出力部4を制御して、蛍光データの処理結果を出力させうる。また、処理部101は、入力部5からの信号(例えばユーザによる入力部5の操作により生じた操作信号)を受信し、当該信号に基づき、各種処理を実行し又は情報処理装置100を制御しうる。
 情報処理装置100の構成例を以下で説明する。処理部101による処理は例えば以下の構成により実現されうるが、情報処理装置100の構成は以下に限定されない。
 情報処理装置100は、例えばCPU(Central Processing Unit)、RAM、及びROMを備えていてよい。CPU、RAM、及びROMは、バスを介して相互に接続されていてよい。バスには、さらに入出力インタフェースが接続されていてよい。バスには、当該入出力インタフェースを介して、出力部4及び入力部5が接続されうる。
前記入出力インタフェースにはさらに、例えば通信装置、記憶装置、及びドライブが接続されていてよい。
 前記通信装置は、情報処理装置100をネットワークに有線又は無線で接続する。前記通信装置によって、情報処理装置100は、ネットワークを介して各種データ(例えば蛍光データ及び/又はSRデータなど)を取得することができる。取得したデータは、例えば記憶部2に格納されうる。前記通信装置の種類は当業者により適宜選択されてよい。
 前記記憶装置には、オペレーティング・システム(例えば、WINDOWS(登録商標)、UNIX(登録商標)、又はLINUX(登録商標)など)、本技術に従う情報処理方法を情報処理装置(又は粒子分析装置若しくは粒子分析システム)に実行させるためのプログラム及び他の種々のプログラム、並びに、蛍光データ、SRデータ、及び他の種々のデータが格納されうる。
 前記ドライブは、記録媒体に記録されているデータ(例えば蛍光データ及びSRデータなど)又はプログラムを読み出して、RAMに出力することができる。記録媒体は、例えば、microSDメモリカード、SDメモリカード、又はフラッシュメモリであるが、これらに限定されない。
(2-5)出力部及び入力部
 出力部4は、例えば処理部101による蛍光データの処理の結果を出力する装置を含みうる。出力部4は例えば、二次元プロット生成部103により生成された二次元プロット群を表示装置(ディスプレイ)に出力しうる。
 出力部4は、例えば、前記二次元プロット群のうち少なくとも一つの二次元プロットが所定の条件を満たさない場合に、アラートを表示装置に出力しうる。当該アラートは、以下の「(2-6)情報処理装置による蛍光データの処理の例」において説明するステップS309において生成されるものであってよい。また、出力部4は、前記複数の蛍光体のうちから前記いずれか1つの蛍光体を選択させるためのリストボックスを表示装置に表示させうる。当該リストボックスは、以下の「(2-6)情報処理装置による蛍光データの処理の例」において説明するステップS207に関して説明したものであってよい。前記表示装置は、前記蛍光データの処理の結果を、画像(静止画像又は動画像)として出力しうる。また、出力部4は例えば印刷装置を含みうる。前記印刷装置は、前記蛍光データの処理の結果を、例えば紙などの印刷媒体に印刷して出力しうる。
 入力部5は、例えばユーザによる操作を受け付ける装置である。入力部5は、例えばマウス、キーボード、又はディスプレイ(この場合ユーザ操作はディスプレイへのタッチ操作であってよい)を含みうる。入力部5は、ユーザによる操作を電気信号として情報処理装置100に送信する。情報処理装置100の処理部101は、当該電気信号に応じて、各種の処理を行いうる。
(2-6)情報処理装置による蛍光データの処理の例
 情報処理装置100による蛍光データの処理の例を、図2を参照しながら以下で説明する。図2は、情報処理装置100による蛍光データの処理のフロー図の一例である。
 ステップS101において、情報処理装置100は蛍光データの処理を開始する。例えばユーザが、出力部4のディスプレイに表示されている所定の処理開始ボタンをクリックすることに応じて、処理部101が、蛍光データの処理を行うためのウィンドウをディスプレイ上に表示する。
 なお、前記蛍光データの処理の開始に先立ち、複数の蛍光体によって標識された粒子集団に対して、上記で説明した光照射部2、チップT、及び検出部3を用いて蛍光検出(特にはフローサイトメトリー)が行われ、その結果取得された蛍光データが記憶部102に格納されていてよい。
 ステップS102において、処理部101は、前記粒子集団についての蛍光データを取得する。処理部101は、例えば、検出部3によって取得された蛍光データを受信しうる。代替的には、処理部101は、記憶部102に格納されている蛍光データを取得してもよい。
 ステップS103において、処理部101は、ステップS102において取得された蛍光データについてアンミキシング処理を行う。当該アンミキシング処理は、蛍光分離処理とも呼ばれる。処理部101は、当該アンミキシング処理を、例えば最小二乗法(Least Square Method, LSM)、より好ましくは重み付き最小二乗法(Weighted Least Square Method, WLSM)を用いて行いうる。最小二乗法を用いたアンミキシング処理は、例えば、特許第5985140号公報に記載された蛍光強度補正方法を用いて行われてよい。当該蛍光強度補正方法は、例えば以下のWLSMの数式(1)を用いて行われうる。
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 上記数式(1)において、xnはn番目の蛍光色素の蛍光強度を示し、[S]はスペクトラルリファレンスの転置行列を示し、[L]は重み行列を示し、[S]はスペクトラルリファレンスの行列を示し、yiはi番目の光検出器での測定値を示し、λはi番目の光検出器での重みを示し、max(y,0)はi番目の検出器の検出値とゼロとを比較し大きい値を示し、offset’は各検出器の検出値に基づいて決定される値を示す。
 蛍光体(例えば蛍光色素など)の蛍光波長分布は広い場合がある。そのため、例えば或る蛍光体から生じた蛍光を検出するために用いられるPMTが、他の蛍光体から生じた蛍光も検出しうる。そこで、各PMTからの出力を、各PMTが目的とする蛍光体由来の蛍光だけに起因する出力となるように補正することが行われる。前記アンミキシング処理は、当該補正のための手法である。
 ステップS103において、処理部101は、前記複数の蛍光色素それぞれのスペクトラルリファレンスデータを用いて、前記アンミキシング処理を行いうる。当該スペクトラルリファレンスデータは、予め記憶部102に格納されていてよい。処理部101は、当該スペクトラルリファレンスデータを、例えば記憶部102から取得し、そして、前記アンミキシング処理を行いうる。
 本明細書内において、スペクトラルリファレンスデータ(SRデータともいう)は、各蛍光体に対して所定の励起光が照射されたときに生じる蛍光のスペクトルデータである。SRデータは、例えば各蛍光体単独で標識した粒子に所定の励起光を照射することによって生じた蛍光を光検出器により検出することにより得られる。
 ステップS104において、ユーザが、前記粒子集団の標識に用いた複数の蛍光体のうちの所望の2つの蛍光体に関する二次元プロットを生成するように、ゲートの設定及び展開操作を行う。ゲートの設定及び展開操作は、ユーザが、分析の目的に応じて適宜決定することができる。ステップS104において、二次元プロット生成部103は、当該操作に応じて、当該2つの蛍光体に関する二次元プロットを生成する。より具体的には、二次元プロット生成部103は、ステップS103におけるアンミキシング処理後の蛍光データを用いて、ユーザにより設定されたゲート及びユーザにより選択された2つの蛍光体に基づき、二次元プロットを生成しうる。前記二次元プロットの縦軸は、前記2つの蛍光体のうちの一方の蛍光体に対応する蛍光の蛍光データ(特には蛍光強度)であってよく、且つ、横軸は、他方の蛍光体に対応する蛍光の蛍光データ(特には蛍光強度)であってよい。前記二次元プロットは、例えば密度プロット(ドットプロット)、等高線プロット、又は、密度及び等高線の両方のプロットであってもよい。
 ステップS104において、生成される二次元プロットの数は、1つであってよく又は複数(例えば2以上、特には2~30、より特には2~20)であってもよい。また、ステップS104において、2つの蛍光体に関する二次元プロットに加えて、散乱光(例えば前方散乱光、側方散乱光、及び後方散乱光のうちのいずれか2つ)に基づくプロット及び/又は散乱光と蛍光とに基づくプロットが生成されてもよい。これらのプロットは、例えば二次元プロット生成部103により生成されてよい。
 ステップS104において、二次元プロット生成部103は、生成した1つ又は複数の二次元プロットを表示装置に表示させる。ステップS104において生成された1又は複数の二次元プロットは、例えば1つのウィンドウ又はワークシート上に表示されうる。ステップS104において生成された複数の二次元プロットが、2つ以上のウィンドウ又はワークシート上に分けて表示されてもよい。
 ステップS104における操作の具体例を、図3を参照しながら説明する。二次元プロット生成部103は、全イベントを側方散乱光(SSC)データ及び前方散乱光(FSC)データに基づきプロットした散乱光プロット10と、スペクトルプロット11とを生成する。そして、ユーザは、散乱光プロット10中にゲートAを設定し、そして、ゲートAに対して、所望の2つの蛍光体に関する二次元プロットを生成する展開操作を行いうる。当該操作によって、例えば図3に示される二次元プロット12が生成される。同様に、ユーザは、ゲートAについて他の2つの蛍光体の組合せに関する二次元プロットを生成する展開操作を行い、これにより、例えば図3に示される二次元プロット13及び14が生成される。
 ユーザは、ステップS104において生成された二次元プロットを確認し、その結果、例えばいずれか一つのプロットを補正したいとする。この場合、ステップS105において二次元プロット補正処理が行われ、そして次に、ステップS106において二次元プロット群生成処理が行われる。当該二次元プロット補正処理は、表示装置に表示された前記二次元プロット上でのユーザ操作に基づく補正処理でありうる。当該二次元プロット群生成処理は、当該補正処理に基づき、1つの蛍光体と当該蛍光体以外の全ての蛍光体それぞれとの二次元プロットの一群を生成する処理でありうる。
 以下で、ステップS105及びステップS106の詳細を、図4Aを参照しながら説明する。図4Aは、当該二次元プロット補正処理及び二次元プロット群生成処理のフロー図の一例を示す。図4AにおけるステップS201~S205が、ステップS105の詳細に相当する。図4AにおけるステップS206~208が、ステップS106の詳細に相当する。
 ステップS201において、所定の補正処理開始操作をユーザが行うことに応じて、処理部101は、二次元プロット補正処理を開始する。当該補正処理開始操作は、例えばステップS104において生成された二次元プロットを表示するウィンドウ若しくはワークシート内にある補正処理開始ボタン又は他のウィンドウ若しくはワークシート内にある補正処理開始ボタンをクリックすることであってよい。
 ステップS202において、処理部101が、ステップS201における前記補正処理開始操作がユーザにより行われることに応じて、ステップS104において生成された二次元プロットを調整モードに移行する。当該調整モードに移行されたことをディスプレイ上で示すために、処理部101は、例えば二次元プロットに所定の修飾を行う。当該所定の修飾は、前記二次元プロット中の左下の角から右上の角への対角線の表示であってよい。例えば図3に示されるプロットのうち、二次元プロット12~14に当該対角線が表示される。対角線が追加された二次元プロット12~14が、図5に示されている。図5に示されるとおり、対角線d12、d13、及びd14が、二次元プロット12、13、及び14にそれぞれ追加される。前記対角線によって、ユーザが希望する二次元プロットが得られたかを確認しやすくなる。
 調整モードに移行された前記二次元プロット内に、プロットの調整操作の方向を示すための表示が追加されてもよい。そのような表示の例を、図6A及びBを参照しながら説明する。
 上記で述べた対角線の表示が追加された二次元プロットは、当該対角線によって左上半分の三角形及び右下半分の三角形に区切られる。
 例えばユーザが、マウスポインタを当該右下半分の三角形の領域内に移動させることに応じて、処理部101は、当該右下半分の三角形の領域内に調整可能な方向を示す表示をディスプレイに表示させる。当該表示は、例えば図6A中の矢印60のような矢印表示であってよい。矢印60に示されるように、当該右下半分の三角形の領域内における前記調整可能な方向は、縦軸方向でありうる。
 また、ユーザが、マウスポインタを当該左上半分の三角形の領域内に移動させることに応じて、処理部101は、当該左上半分の三角形の領域内に調整可能な方向を示す表示をディスプレイに表示させる。当該表示は、例えば図6B中の矢印61のような矢印表示であってよい。矢印61に示されるように、当該左上半分の三角形の領域内における前記調整可能な方向は、横軸方向でありうる。
 このような表示によって、調整可能な方向をユーザが把握しやすくなる。
 ステップS203において、例えば表示装置に表示された前記二次元プロットに対してユーザが操作を行うとする。当該操作は、例えば前記二次元プロット上にあるマウスポインタのドラッグ操作であってよい。処理部101は、当該操作に基づき、前記二次元プロットを補正する。当該操作に基づく補正処理は、例えば、ステップS203におけるSR修正処理、ステップS204におけるアンミキシング処理、及びステップS205における二次元プロット修正処理を含みうる。これらの処理の具体例について、以下で説明する。
 ステップS203において、SR修正部が、各蛍光体のSRを修正する。例えば、ステップS203において、ユーザが、前記二次元プロットに対するユーザ操作に応じて(例えばユーザが前記二次元プロット上でマウスのポインタをドラッグ操作することに応じて)、SR修正部104は、当該二次元プロット(すなわち補正処理の対象である二次元プロット)の蛍光データに対応する蛍光体のSRデータを修正する。より具体的には、SR修正部104は、マウスポインタの移動量又はドラッグ操作量に基づき、当該二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のSRデータを修正する。
 ステップS203におけるSR修正処理のより具体的な例を以下で説明する。
 ユーザが、図6Aの前記右下半分の三角形の領域内でマウスポインタを縦軸方向にドラッグ操作することに応じて、SR修正部104は、二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のSRデータを修正する。特には、当該二次元プロットの縦軸の蛍光強度データに対応する蛍光体のSRデータ及び当該二次元プロットの横軸の蛍光強度データに対応する蛍光体のSRデータが修正されうる。当該修正は、好ましくは、ユーザによる前記領域内でのマウスポインタの縦軸方向におけるドラッグ操作量又はマウスポインタの移動量に基づき行われる。これにより、マウス操作によって、SRデータの修正を直感的に行うことができる。
 SR修正部104は、前記SRデータの修正を、例えば以下の関係を満たすように行いうる。
マウスを下方にドラッグした場合:
(横軸の蛍光体のSRデータの所定波長における蛍光強度の増加量)=(移動距離比)×(調整係数)×(縦軸の蛍光体のSRデータの前記所定波長における蛍光強度)
マウスを上方にドラッグした場合:
(横軸の蛍光体のSRデータの所定波長における蛍光強度の減少量)=(移動距離比)×(調整係数)×(縦軸の蛍光体のSRデータの前記所定波長における蛍光強度)
 以上の関係において、「移動距離比」は、プロットサイズに対するドラッグ操作又はマウスポインタの移動による距離の比である。「調整係数」は、二次元プロットの横軸及び縦軸の蛍光体の蛍光強度の関係性に基づき設定されてよい。
 前記SRデータの修正は、SRデータの波長の全範囲にわたって行われてよく、又は、SRデータの波長の一部の範囲に対して行われてもよい。
 ユーザが、前記左上半分の三角形の領域内でマウスのポインタを横軸方向にドラッグ操作することに応じて、SR修正部104は、二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のSRデータを修正する。この場合においても、特には、当該二次元プロットの縦軸の蛍光強度データに対応する蛍光体のSRデータ及び当該二次元プロットの横軸の蛍光強度データに対応する蛍光体のSRデータが修正されうる。当該修正は、好ましくは、ユーザによる前記領域内でのマウスポインタの横軸方向におけるドラッグ操作量又はマウスポインタの移動量に基づき行われる。これによりマウス操作により、SRデータの修正を直感的に行うことができる。
 SR修正部104は、前記SRデータの修正を、例えば以下の関係を満たすように行いうる。
マウスを左にドラッグした場合:
(縦軸の蛍光体のSRデータの所定波長における蛍光強度の増加量)=(移動距離比)×(調整係数)×(横軸の蛍光体のSRデータの前記所定波長における蛍光強度)
マウスを右にドラッグした場合:
(縦軸の蛍光体のSRデータの所定波長における蛍光強度の減少量)=(移動距離比)×(調整係数)×(横軸の蛍光体のSRデータの前記所定波長における蛍光強度)
 以下の関係において、「移動距離比」は、プロットサイズに対するドラッグ操作又はマウスポインタの移動による距離の比である。「調整係数」は、二次元プロットの横軸及び縦軸の蛍光体の蛍光強度の関係性に基づき設定されてよい。
 前記SRデータの修正は、SRデータの波長の全範囲にわたって行われてよく、又は、SRデータの波長の一部の範囲に対して行われてもよい。
 以上のように、本技術に従う情報処理装置は、SRを修正するSR修正部を含みうる。SR修正部は、二次元プロットに対するユーザ操作(より特にはユーザによる当該二次元プロット上でのドラッグ操作)に応じてSRデータを修正し、特には、前記二次元プロット上でのいずれか一軸の方向におけるドラッグ操作に応じてSRを修正する。
 例えば、SR修正部は、ドラッグ操作量又はマウスポインタの移動量に基づき、SRデータを修正しうる。例えば、SR修正部は、二次元プロット上での当該二次元プロットの2つの軸のうちのいずれか一方の軸方向におけるドラッグ操作量又はマウスポインタ移動量に基づき、当該軸に関連付けられた蛍光体のSRデータを修正しうる。
 ステップS202における調整モードへの移行に伴い、処理部101は、生成されている二次元プロット(ディスプレイ上に表示されている二次元プロット)の軸の蛍光強度に関連付けられた蛍光体それぞれのSRの波形をディスプレイに表示してもよい。例えば、処理部101は、SRの波形を、二次元プロットが表示されているウィンドウ又はワークシート内のいずれかの位置に表示しうる。例えば図9に示されるとおり、ウィンドウの上部に、SRの波形91が表示されうる。
 SR修正部104は、前記ユーザ操作に応じて又は前記SRデータの修正に応じて、表示されているSRの波形を修正してもよい。
 以上のようなSRの波形の表示およびSR波形の修正の表示によって、ユーザが、前記ユーザ操作によるSR波形への影響を把握しやすくなる。
 好ましくは、ステップS203における二次元プロット上でのユーザ操作に連動してディスプレイに表示されているSRの波形が修正されているように、SR修正部104はディスプレイ上の二次元プロットを修正しうる。このようなディスプレイ上の修正のために、処理部101は、ステップS203及びS204を実質的に同時に行いうる。これらのステップが「実質的に同時」に行われるとは、ディスプレイを見ているユーザが、ステップS203及びS204の間に時間差があることを認識しない程度に、ステップS203及びS204が連続して行われることを意味しうる。
 ステップS204において、処理部101は、ステップS203において修正されたSRデータを用いて、アンミキシング処理を行う。当該アンミキシング処理は、用いられるSRデータが異なること以外は、ステップS103におけるアンミキシング処理と同じであってよい。
 ステップS205において、二次元プロット生成部103が、ステップS204におけるアンミキシング処理後の蛍光データに基づき、二次元プロットを修正する。二次元プロット生成部103は、前記アンミキシング処理後の蛍光データを用いて修正された二次元プロットを表示に表示させうる。
 ステップS205において、二次元プロット生成部103による修正の対象となる二次元プロットは、例えば、ステップS203におけるドラッグ操作の対象となった二次元プロットであってよい。
 また、前記ドラッグ操作の対象となった前記二次元プロットに加えて、前記ドラッグ操作の対象となった二次元プロット以外の二次元プロットも、ステップS205における修正対象とされてよい。例えば、二次元プロット生成部103は、予めワークシート上に表示されている複数の二次元プロット(ドラッグ操作の対象となった二次元プロットと当該二次元プロット以外の1又は複数の二次元プロット)を、アンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて修正してよい。
 好ましくは、ステップS205において、二次元プロット生成部103は、ステップS104において生成された二次元プロットの全てを、ステップS204におけるアンミキシング処理後の蛍光データに基づき修正しうる。例えば図5のうちの二次元プロット12がステップS203におけるドラッグ操作の対象となった場合、ステップS205において、二次元プロット生成部103は、二次元プロット12に加えて、二次元プロット13及び14も修正しうる。
 好ましくは、ステップS203における二次元プロット上でのユーザ操作に連動してステップS205における二次元プロットの修正が行われているように、処理部101はディスプレイ上の二次元プロットを修正しうる。このようなディスプレイ上の修正のために、処理部101は、ステップS203及びS205を実質的に同時に行いうる。これらのステップが「実質的に同時」に行われるとは、ディスプレイを見ているユーザが、ステップS203及びS205の間に時間差があることを認識しない程度に、ステップS203及びS205が連続して行われることを意味しうる。
 ステップS203、S204、及びS205における処理に伴う表示装置の画面上の変化の例を、図8を参照しながら説明する。
 図8のAに示される二次元プロットが生成されたとする。当該二次元プロットは、FL1の蛍光強度を横軸とし、且つ、FL2の蛍光強度を縦軸とするものである。当該二次元プロットには、イベントの集合が4つ存在する(A~D)。イベントの集合Aは、FL1の蛍光を生じ且つFL2の蛍光を生じたイベントの集合である。イベントの集合Bは、FL1の蛍光を生じたがFL2の蛍光を生じなかったイベントの集合である。イベントの集合Cは、FL1の蛍光を生じなかったがFL2の蛍光を生じたイベントの集合である。イベントの集合Dは、FL1の蛍光を生じず且つFL2の蛍光も生じなかったイベントの集合である。
 ユーザがAに示される二次元プロットを確認し、そして、イベントの集合B及びCの形状及び位置が、想定される形状及び位置と異なっていることを知る。そのため、ユーザは、この二次元プロットを補正することを決定し、この二次元プロットを上記で述べたように調整モードへ移行させる。これにより図8のBに示されるとおり、二次元プロットに対角線dが表示される。
 そして、ユーザが、対角線dにより区切られた右下半分の領域内で、マウスポインタを矢印a1の方向にドラッグする。これにより、イベントの集合Bも矢印a1の方向へ移動する。また、当該移動に伴い、イベントの集合Bの形状も、楕円形状から円形状へと変化する。
 また、ユーザが、対角線dにより区切られた左上半分の領域内で、マウスポインタを矢印a2の方向にドラッグする。これにより、イベントの集合Cも矢印a2の方向へ移動する。また、当該移動に伴い、イベントの集合Cの形状も、楕円形状から円形状へと変化する。
 上記ドラック操作が行われた後の二次元プロットが図8のCに示されている。図8に示されるとおり、集合Bは、上記ドラッグ操作に伴い、ユーザが想定する位置へ移動され、且つ、その形状が円形状となっている。集合Cも、上記ドラッグ操作に伴い、ユーザが想定する位置へ移動され、且つ、その形状が円形状となっている。
 以上で図8を参照して説明したように、前記ドラッグ操作に伴い、画面上に表示されているイベントの集合の形状及び位置が変更される。
 ステップS205における修正の結果表示された二次元プロットに加えて、当該二次元プロット以外の二次元プロットへの影響を把握することができれば、補正が適切であるかをユーザが検討することにさらに貢献すると考えられる。特に粒子集団を標識した蛍光体の数が多い場合に、前記影響を把握することは有用であると考えられる。
 本技術に従う情報処理装置に含まれる二次元プロット生成部は、粒子集団を標識した複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成することができるように構成されている。これにより、前記影響を把握することができる。
 二次元プロット生成部103は、前記二次元プロット群の生成処理を、例えば、所定のユーザ操作に応じて実行しうる。当該ユーザ操作は、例えば、前記二次元プロット群の生成処理を二次元プロット生成部103に開始させるための二次元プロット群生成ボタンのクリックであってよい。より具体的には、例えば、ステップS205における修正後の二次元プロットを表示するウィンドウ若しくはワークシート又はディスプレイ上の他のウィンドウ若しくはワークシートに、前記二次元プロット群生成ボタンが設けられていてよい。ステップS206において、処理部101は、当該二次元プロット群生成ボタンがユーザによってクリックされることに応じて、処理をステップS207に進める。処理部101は、当該ボタンがユーザによってクリックされない場合は、処理は、例えばステップS211に進められうる。
 ステップS207において、二次元プロット生成部103は、前記二次元プロット群を表示するためのウィンドウをディスプレイ上に表示する。当該ウィンドウの例を図7Aに示す。図7Aに示されるウィンドウ70には、例えば、前記粒子集団を標識した複数の蛍光体(蛍光色素)のうちの1つの蛍光体を選択するためのリストボックス71が設けられている。このように、二次元プロット生成部103は、複数の蛍光体のうちからいずれか1つの蛍光体を選択させるためのリストボックスを表示装置に表示させうる。
 ユーザが、このリストボックス71のうちから1つの蛍光体を選択することに応じて、二次元プロット生成部103は、当該1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する。そして、二次元プロット生成部103は、前記生成された二次元プロット群を例えば表示装置に表示させる。前記生成される二次元プロット群を構成する二次元プロットの数は、粒子集団を標識した蛍光体の数から1だけ少なくて
よく、例えば4以上、特には7以上、9以上、14以上、又は19以上であってよく、さらには21以上、23以上、又は25以上であってよい。前記生成される二次元プロット群を構成する二次元プロットの数は、例えば49以下、44以下、又は39以下であってよい。
 例えば、リストボックス71のうちから、ユーザがFITCをマウスポインタPによってクリックして選択したとする。二次元プロット生成部103は、FITCが選択されたことに応じて、図7Bに示されるような二次元プロット群72を生成する。二次元プロット群72は、図7Bに示されるとおり、そのすべての二次元プロットの横軸がFITCの蛍光強度である。また、二次元プロット群72の縦軸が、FITC以外の蛍光体それぞれの蛍光強度である。
 図7Bに示されるように、ステップS207において、二次元プロット生成部103は、ユーザにより選択された1つの蛍光体の蛍光強度を横軸とする二次元プロットが生成してよく、又は、当該蛍光強度を縦軸とする二次元プロットを生成してもよい。
 本技術の一つの実施態様において、ステップS207において、二次元プロット生成部103は、ステップS204においてSRデータが修正された蛍光体のいずれか一つとその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成しうる。この実施態様において、例えば、前記二次元プロット群の生成処理を開始するためのユーザ操作が行われたことに応じて表示される前記ウィンドウ中に、自動的に当該二次元プロット群が表示されてよい。すなわち、上記で述べたリストボックスからユーザが蛍光体を選択することなく、当該二次元プロット群が表示されてよい。
 例えば図5のうちの二次元プロット12がステップS203におけるドラッグ操作の対象となった場合、ステップS204において二次元プロット12の2つの軸の蛍光体のSRデータが修正されうる。この実施態様において、ステップS207において、二次元プロット生成部103は、二次元プロット12の2つの軸の蛍光体のいずれか一つとその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成しうる。
 ユーザは、二次元プロットの補正処理に伴うSRデータの修正によって二次元プロット群にどのような影響が生じているかに特に関心がある場合があり、すなわち、SRデータの修正の影響を最初に把握したい場合がある。本実施態様によって、当該影響を把握することができ、ユーザのこのようなニーズを満たすことができる。
 二次元プロット生成部103は、二次元プロット群が生成されたら、処理をステップS208に進める。
 ステップS208において、二次元プロット生成部103は、二次元プロット群の表示を終了するかを判定する。
 ユーザが二次元プロット群の表示を終了するための操作が行われた場合に、二次元プロット生成部103は、二次元プロット群の表示を終了すると判定して、処理をステップS209に進める。前記操作は、例えば二次元プロット群のウィンドウの閉じるボタンをユーザがクリックするなどであってよい。
 前記操作が行われない場合、例えば処理がステップS207に進められうる。そして、例えばユーザにより、リストボックス71のうちから他の1つの蛍光体が選択されうる。そして、当該選択に応じて、二次元プロット生成部103が、当該他の1つの蛍光体と、その他の全ての蛍光体それぞれと、に関する二次元プロット群を生成しうる。
 ステップS209において、処理部101は、調整モードを終了するかを判定する。
 ユーザによって調整モードを終了するための操作が行われた場合に、処理部101は、調整モードを終了すると判定して、処理をステップS210に進める。前記操作は、例えば調整モードのボタンをクリックすること、又は、調整モード終了ボタンをクリックすることなどであってよい。
 調整モードを終了すると判定されない場合、例えば処理は、ステップS203に戻されうる。そして、ユーザにより、特定の二次元プロットについての補正処理が再度行われてもよい。
 ステップS210において、処理部101は、調整モードを終了する。調整モードの終了に応じて、例えばステップS202において、処理部101は、二次元プロットに対して行われた前記所定の修飾を除去又は解除する。例えば、処理部101は、二次元プロットに対して追加された前記対角線を消去しうる。
 ステップS107において、処理部101は、例えば蛍光データの補正処理を終了しうる。上記で説明した、ステップS209及びS210が、ステップS107において行われてよい。
 また、当該終了に先立ち、処理部101は、修正後のSRデータ、アンミキシング処理後の蛍光データ、及び、生成又は補正された二次元プロット群を記憶部102に保存しうる。
 以上のとおり、情報処理装置100は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた1つの二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部103を有する。これにより、二次元プロットへの補正が、ディスプレイ上に表示されている二次元プロットだけでなく、1つの蛍光体とその他の蛍光体との二次元プロットにどのような影響を及ぼすかを把握することができる。
 本技術の一つの実施態様において、二次元プロット生成部103は、ステップS106の二次元プロット群生成処理において生成された二次元プロットに所定の基準を満たさないプロットがある場合に、アラートを生成してもよい。アラート生成工程を含むステップS105及びS106の詳細について、以下で図4Bを参照しながら説明する。図4BにおけるステップS301~S305が、ステップS105の詳細に相当する。図4BにおけるステップS306~3010が、ステップS106の詳細に相当する。
 図4BにおけるステップS301~S307は、図4AにおけるステップS201~S207と同じである。そのため、ステップS301~S307についての説明は省略する。
 図4BにおけるステップS307において二次元プロット群が生成されたら、二次元プロット生成部103は、処理をステップS308に進める。
 ステップS308において、二次元プロット生成部103は、生成された二次元プロット群のうちに基準を満たさない二次元プロットがあるかを判定する。前記基準は例えば、所定範囲内にプロットされるイベントの数が所定の割合以上であることなどであってよいが、これに限定されない。例えば、二次元プロットに対してユーザがゲーティングした結果若しくは機械学習等によるオートゲーティング処理の結果特定されたイベント集団の形状又はイベント集団間の距離に基づき、基準を満たさないかを判定することができる。具体的には、二次元プロット生成部103は、イベント集団の形状が真円に近い場合には基準を満たし、蛍光漏れ込みにより分散した形状の場合には基準を満たさないと判断する。
 前記基準を満たさない二次元プロットがある場合、二次元プロット生成部103は、処理をステップS309に進める。基準を満たさない二次元プロットが無い場合、二次元プロット生成部103は、処理をステップS310に進める。
 ステップS309において、二次元プロット生成部103は、前記基準を満たさない二次元プロットが前記二次元プロット群に含まれることを示すアラートを生成する。当該アラートは、例えば、前記基準を満たさない二次元プロットに所定の色を付して表示すること、前記基準を満たさない二次元プロットがあることを記載するウィンドウを表示すること、又は、前記基準を満たさない二次元プロットに所定のマークを付すことなどであるが、これらに限定されない。アラートの生成後、二次元プロット生成部103は、処理をステップS310に進める。
 このように、前記二次元プロット生成部は、前記二次元プロット群のうち少なくとも一つの二次元プロットが所定の条件を満たさない場合に、アラートを表示装置に表示させてよい。これにより、注意すべき二次元プロットをユーザが把握しやすくなる。
 図4BにおけるステップS310~S312は、図4AにおけるステップS208~210と同じである。そのため、ステップS310~S312についての説明は省略する。
(2-7)粒子集団
 本技術において生成される二次元プロット群は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果に由来するものでありうる。前記粒子集団は、当該蛍光検出に際して、前記サンプル液に含まれていてよい。前記サンプル液の種類は、当業者により適宜選択されてよく、例えば粒子(細胞)の種類などの考慮要素に応じて決定されうる。い。なお、前記シース液の種類も、当業者により適宜選択されてよい。
 前記粒子集団は、複数の蛍光体により標識されうる。当該複数の蛍光体は、例えば複数の色素、特には複数の蛍光色素であってよい。前記蛍光体は、例えばフローサイトメトリーの技術分野において公知の蛍光体(色素)であってよい。前記蛍光色素の例として、例えば以下を挙げることができるがこれらに限定されない:Cascade Blue、Pacific Blue、Fluorescein isothiocyanate(FITC)、AleaFluor488、Phycoerythrin(PE)、Propidium iodide(PI)、Texas Red(TR)、PE-efluor 610、PE/Dazzle594、ECD(PE-TxRed)、PE-CF594、PE-Vio 615、7-AAD、PE/Cy5、Peridinin chlorophyll protein(PerCP)、PerCP/Cy5.5、PerCP/eFluor710、PE/Cy7、Allophycocyanin(APC)、AlexaFluor647、AlexaFluor700、APC-AlexaFluor700、APC/Fire750、APC/eFluor780、APC/H7、Brilliant Violet(BV421)、BD Horizon V450、eFluor450、Pacific Blue、4’,6-Diamidino-2-phenylindole(DAPI)、AmCyan、BD Horizon V500、Brilliant Violet 510、Pacific Orange、Brilliant Violet 570、Brilliant Violet 605、Brilliant Violet 650、eFluor 650NC、Brilliant Violet 711、Brilliant Violet 785、Cy3、Cy5、及びCy7。
 前記粒子集団は、例えば5以上の蛍光体により標識された粒子集団であり、より好ましくは8種以上、10種以上、15種以上、又は20種以上の蛍光体により標識された粒子集団であってよい。前記粒子集団は、さらに22種以上、24種以上、又は26種以上の蛍光体により標識された粒子集団であってもよい。前記粒子集団は、例えば50種以下、45種以下、又は40種以下の蛍光体により標識された粒子集団であってよい。本技術に従う情報処理装置は、このような多種類の蛍光体(蛍光色素)により標識された粒子集団の分析結果についての補正処理の影響の把握を容易に行うことを可能にする。
 本技術において、粒子は、例えばチップTに設けられた流路内を流れることができる寸法を有する粒子であってよい。本技術において、粒子は当業者により適宜選択されてよい。本技術において、粒子には、細胞、細胞塊、微生物、及びリポソームなどの生物学的微小粒子、並びに、ゲル粒子、ビーズ、ラテックス粒子、ポリマー粒子、及び工業用粒子などの合成微小粒子などが包含されうる。
 生物学的微小粒子(生体粒子ともいう)には、各種細胞を構成する染色体、リポソーム、ミトコンドリア、オルガネラ(細胞小器官)などが含まれうる。細胞には、動物細胞(血球系細胞など)および植物細胞が含まれうる。細胞は、特には血液系細胞又は組織系細胞でありうる。前記血液系細胞は、例えばT細胞及びB細胞などの浮遊系細胞であってよい。前記組織系細胞は、例えば接着系の培養細胞又は組織からばらされた接着系細胞などであってよい。細胞塊には、例えばスフェロイド及びオルガノイドなどが含まれうる。微生物には、大腸菌などの細菌類、タバコモザイクウイルスなどのウイルス類、イースト菌などの菌類などが含まれうる。さらに、生物学的微小粒子には、核酸、タンパク質、これらの複合体などの生物学的高分子も包含されうる。これら生物学的高分子は、例えば細胞から抽出されたものであってよく又は血液サンプル若しくは他の液状サンプルに含まれるものであってもよい。本技術の一つの実施態様に従い、前記粒子は生体粒子であり、特には細胞である。
 合成微小粒子は、例えば有機若しくは無機高分子材料又は金属などからなる微小粒子でありうる。有機高分子材料には、ポリスチレン、スチレン・ジビニルベンゼン、及びポリメチルメタクリレートなどが含まれうる。無機高分子材料には、ガラス、シリカ、及び磁性体材料などが含まれうる。金属には、金コロイド及びアルミなどが含まれうる。前記合成微小粒子は、例えばゲル粒子又はビーズなどであってよく、より特にはオリゴヌクレオチド、ペプチド、タンパク質、及び酵素から選ばれる1つ又は2つ以上の組合せが結合されたゲル粒子又はビーズであってよい。
 粒子の形状は、球形若しくは略球形であってよく、又は非球形であってもよい。粒子の大きさ及び質量は、チップの流路のサイズによって当業者により適宜選択されうる。他方で、チップの流路のサイズも、粒子の大きさ及び質量によって適宜選択されうる。
 本技術において、粒子集団は、上記粒子からなる集団であってよく、特には生体粒子の集団であってよく、より特には細胞の集団であってよい。前記粒子集団は、複数の蛍光体により標識されたものであってよい。蛍光体は、上記で述べた蛍光色素であってよい。また、前記蛍光色素は、粒子に特異的に結合する分子(例えば抗体、アプタマー、DNA、又はRNAなど、特には抗体)を介して粒子(特には細胞)に結合されていてよい。
(2-8)他の実施態様
 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットに対するユーザ操作に応じて、前記二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスの修正を行うスペクトラルリファレンス修正部と、前記修正後のスペクトラルリファレンスを用いたアンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて二次元プロットを生成する二次元プロット生成部と、を備えている情報処理装置も提供する。前記スペクトラルリファレンス修正部及び前記二次元プロット生成部によって、二次元プロットへのユーザ操作を二次元プロットの補正処理へと反映することができ、ユーザが視覚的且つ直感的に補正処理の影響を把握することができる。
 前記スペクトラルリファレンス修正部及び前記二次元プロット生成部は、上記(2-4)及び(2-6)において説明したとおりであり、その説明が本実施態様においても当てはまる。また、上記(2-1)~(2-3)及び(2-5)における説明も、本実施態様においても当てはまる。
(2-9)他の実施態様
 本技術は、10以上の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から、前記10以上の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている情報処理装置も提供する。前記情報処理装置は、例えば以上(2-1)~(2-5)において説明されたとおりに構成されてよく、その説明がこの実施態様においても当てはまる。
 この実施態様における情報処理装置は、上記(2-6)において述べた処理のうち、ステップS101~S104を実行した後に、ステップS202~S205における処理(二次元プロット補正処理)を行うことなく、ステップS206~S208における処理(二次元プロット群の生成処理)又はステップS306~S310における処理(二次元プロット群の生成処理)を行いうる。このように、本技術に従う情報処理装置は、二次元プロット補正処理を行うことなく、上記二次元プロット群の生成処理を行ってもよい。この実施態様における情報処理装置は、特には15以上の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出結果を対象としてよく、より好ましくは20以上、22以上、24以上、又は26以上の蛍光体により標識された粒子集団であってよい。前記粒子集団は、例えば50種以下、45種以下、又は40種以下の蛍光体により標識された粒子集団であってよい。
2.第2の実施形態(粒子分析装置)
 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている粒子分析装置を提供する。当該二次元プロット生成部は、上記1.において説明したとおりであり、その説明が本実施形態においてもあてはまる。
 本技術の粒子分析装置は、例えば上位1.において説明した情報処理装置、光照射部、及び検出部を備えていてよい。
 本技術の粒子分析装置は、上記二次元プロット生成部を備えていることによって、マルチカラー解析における蛍光漏れ込み補正の二次元プロットへの影響が把握しやすくなる。
3.第3の実施形態(情報処理方法)
 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含む情報処理方法も提供する。
 本技術に従う情報処理方法は、例えば、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られたデータを処理するために行われうる。本技術に従う情報処理方法は、例えば上記1.において述べた情報処理装置(又は当該情報処理装置を含む粒子分析システム)又は上記2.において述べた粒子分析装置によって実行されうる。
 本技術に従う情報処理方法のフロー図の例は、上記1.の(2-6)において説明した図2及び4において示されるとおりでありうる。
 前記情報処理方法は、例えば、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた蛍光データを取得する蛍光データ取得工程、前記蛍光データについてアンミキシング処理を行うアンミキシング処理工程、アンミキシング処理後の蛍光データを用いて二次元プロットを生成する二次元プロット生成工程、及び、前記生成された二次元プロットの補正処理を行い且つ当該補正処理に応じて二次元プロット群を生成する二次元プロット補正工程を含みうる。
 前記蛍光データ取得工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS102に相当する。前記アンミキシング処理工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS103に相当する。前記二次元プロット生成工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS104に相当する。前記二次元プロット補正工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS105及びS106に相当する。そのため、上記1.の(2-6)におけるこれらステップについての説明が、本技術の情報処理工程における各工程にもあてはまる。
 前記二次元プロット補正工程は、例えば、二次元プロットへの操作操作に応じてSRを修正するSR修正工程、前記SR修正工程において修正されたSRを用いてアンミキシング処理を行う追加アンミキシング処理工程、前記追加アンミキシング処理工程後の蛍光データを用いて二次元プロットを修正する二次元プロット修正工程、及び、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含みうる。
 前記SR修正工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS203に相当する。前記追加アンミキシング処理工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS204に相当する。前記二次元プロット修正工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS205に相当する。前記二次元プロット群生成工程は、上記1.の(2-6)において説明したステップS207に相当する。そのため、上記1.の(2-6)におけるこれらステップについての説明が、本技術の情報処理工程におけるこれらの工程にもあてはまる。
4.第4の実施形態(プログラム)
 本技術は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を情報処理装置(又は当該情報処理装置を含む粒子分析装置又は粒子分析システム)に実行させるためのプログラムも提供する。前記工程は、上記1.及び3.において説明したとおりであり、当該説明が本実施形態にも当てはまる。
 前記二次元プロット群生成工程は、例えば、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットを補正する二次元プロット補正工程において行われうる。すなわち、前記プログラムは、当該二次元プロット補正工程を情報処理装置(又は当該情報処理装置を含む粒子分析装置又は粒子分析システム)に実行させるためのものであってよい。
 前記二次元プロット補正工程は、例えば上記3.において述べた前記SR修正工程、前記追加アンミキシング処理工程、及び前記二次元プロット修正工程をさらに含みうる。
 また、前記二次元プロット補正工程は、複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られたデータに対する情報処理方法の一部を構成する工程として実行されてよい。当該情報処理方法は、例えば上記3.において述べた前記蛍光データ取得工程、前記アンミキシング処理工程、及び前記二次元プロット生成工程をさらに含みうる。前記二次元プロット生成工程において生成された二次元プロットに対して、前記二次元プロット補正工程における補正が行われうる。
 なお、本技術は、以下のような構成をとることもできる。
〔1〕複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部
 を備えている情報処理装置。
〔2〕前記補正処理は、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作に基づく補正処理である、〔1〕に記載の情報処理装置。
〔3〕前記生成された二次元プロット群を表示装置に出力する出力部をさらに含む、〔1〕又は〔2〕に記載の情報処理装置。
〔4〕スペクトラルリファレンスを修正するスペクトラルリファレンス修正部をさらに含み、
 前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記補正処理において、前記補正処理の対象である二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスを修正する、〔1〕~〔3〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔5〕前記補正処理において、前記二次元プロット生成部が、当該修正されたスペクトラルリファレンスを用いてアンミキシング処理された蛍光データに基づき、前記二次元プロットを修正する、〔4〕に記載の情報処理装置。
〔6〕前記粒子集団が、10種以上の蛍光体により標識された粒子集団である、〔1〕~〔5〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔7〕前記生成される二次元プロット群を構成する二次元プロットの数が9以上である、〔1〕~〔6〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔8〕前記蛍光検出が、フローサイトメータによる蛍光検出である、〔1〕~〔7〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔9〕前記出力部は、前記二次元プロット群のうち少なくとも一つの二次元プロットが所定の条件を満たさない場合に、アラートを表示装置に出力する、〔1〕~〔8〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔10〕前記出力部は、前記複数の蛍光体のうちから前記いずれか1つの蛍光体を選択させるためのリストボックスを表示装置に表示させる、〔1〕~〔9〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔11〕前記二次元プロット生成部が、前記リストボックスから選択された蛍光体を前記いずれか1つの蛍光体として、前記二次元プロット群を生成する、〔10〕に記載の情報処理装置。
〔12〕複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットに対するユーザ操作に応じて、前記二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスの修正を行うスペクトラルリファレンス修正部と、
 前記修正後のスペクトラルリファレンスを用いたアンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて二次元プロットを生成する二次元プロット生成部と
 を備えている情報処理装置。
〔13〕前記ユーザ操作が、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作である、〔12〕に記載の情報処理装置。
〔14〕前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロット上でのいずれか一軸の方向におけるドラッグ操作に応じてスペクトラルリファレンスを修正する、〔12〕又は〔13〕に記載の情報処理装置。
〔15〕前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のスペクトラルリファレンスを修正する、〔14〕に記載の情報処理装置。
〔16〕前記二次元プロット生成部が、予めワークシート上に表示されている二次元プロットを、アンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて修正する、〔12〕~〔15〕のいずれか一つに記載の情報処理装置。
〔17〕複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部
 を備えている粒子分析装置。
〔18〕複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含む、
 情報処理方法。
〔19〕複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を
 情報処理装置に実行させるためのプログラム。
〔20〕10以上の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から、前記10以上の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部を備えている情報処理装置。
1 粒子分析システム
2 光照射部
T チップ
3 検出部
100 情報処理装置
101 処理部
102 記憶部
103 二次元プロット生成部
104 スペクトラルリファレンス修正部
4 出力部
5 入力部

Claims (20)

  1.  複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部
     を備えている情報処理装置。
  2.  前記補正処理は、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作に基づく補正処理である、請求項1に記載の情報処理装置。
  3.  前記生成された二次元プロット群を表示装置に出力する出力部をさらに含む、請求項1に記載の情報処理装置。
  4.  スペクトラルリファレンスを修正するスペクトラルリファレンス修正部をさらに含み、
     前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記補正処理において、前記補正処理の対象である二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスを修正する、請求項1に記載の情報処理装置。
  5.  前記補正処理において、前記二次元プロット生成部が、当該修正されたスペクトラルリファレンスを用いてアンミキシング処理された蛍光データに基づき、前記二次元プロットを修正する、請求項4に記載の情報処理装置。
  6.  前記粒子集団が、10種以上の蛍光体により標識された粒子集団である、請求項1に記載の情報処理装置。
  7.  前記生成される二次元プロット群を構成する二次元プロットの数が9以上である、請求項1に記載の情報処理装置。
  8.  前記蛍光検出が、フローサイトメータによる蛍光検出である、請求項1に記載の情報処理装置。
  9.  前記出力部は、前記二次元プロット群のうち少なくとも一つの二次元プロットが所定の条件を満たさない場合に、アラートを表示装置に出力する、請求項3に記載の情報処理装置。
  10.  前記出力部は、前記複数の蛍光体のうちから前記いずれか1つの蛍光体を選択させるためのリストボックスを表示装置に表示させる、請求項3に記載の情報処理装置。
  11.  前記二次元プロット生成部は、前記リストボックスから選択された蛍光体を前記いずれか1つの蛍光体として、前記二次元プロット群を生成する、請求項10に記載の情報処理装置。
  12.  複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットに対するユーザ操作に応じて、前記二次元プロットの蛍光データに対応する蛍光体それぞれのスペクトラルリファレンスの修正を行うスペクトラルリファレンス修正部と、
     前記スペクトラルリファレンス修正部による修正後のスペクトラルリファレンスを用いたアンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて二次元プロットを生成する二次元プロット生成部と
     を備えている情報処理装置。
  13.  前記ユーザ操作が、表示装置に表示された前記二次元プロットに対するユーザ操作である、請求項12に記載の情報処理装置。
  14.  前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロット上でのいずれか一軸の方向におけるドラッグ操作に応じてスペクトラルリファレンスを修正する、請求項12に記載の情報処理装置。
  15.  前記スペクトラルリファレンス修正部が、前記二次元プロットを構成する蛍光データに対応する蛍光体のスペクトラルリファレンスを修正する、請求項14に記載の情報処理装置。
  16.  前記二次元プロット生成部が、予めワークシート上に表示されている二次元プロットを、アンミキシング処理により得られた蛍光データを用いて修正する、請求項12に記載の情報処理装置。
  17.  複数の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から得られた二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部
     を備えている粒子分析装置。
  18.  複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を含む、
     情報処理方法。
  19.  複数の蛍光体により標識された粒子集団から得られた蛍光データに基づき二次元プロットを生成し、前記二次元プロットへの補正処理に基づき、前記複数の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット群生成工程を
     情報処理装置に実行させるためのプログラム。
  20.  10以上の蛍光体により標識された粒子集団についての蛍光検出の結果から、前記10以上の蛍光体のうちのいずれか1つの蛍光体とその他の全ての蛍光体それぞれとに関する二次元プロット群を生成する二次元プロット生成部
     を備えている情報処理装置。
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