本発明者らによって、細胞における染色体の安定化を阻害することにより、癌細胞(腫瘍細胞)において特異的にアポトーシスが誘導されることが見出された。
本発明はまず、染色体の安定化を阻害する化合物を含む、癌細胞特異的(癌細胞に対する)アポトーシス誘導剤を提供する。
本発明のアポトーシス誘導剤は、癌細胞に対して選択的にアポトーシス誘導作用を有することを特徴とするものである。本発明において「癌細胞特異的」とは、正常細胞に対しては実質的なアポトーシス誘導作用を示さず、癌細胞に対して実質的にアポトーシス誘導作用を示すことを言うが、好ましくは、正常細胞に対しては、アポトーシス誘導作用が見られず、癌細胞に対してアポトーシス誘導作用を有することを言う。
アポトーシスとは一般的に、生理的条件下で細胞自らが積極的に引き起こす細胞死を言う。アポトーシスの形態としては、例えば、細胞核の染色体凝集、細胞核の断片化、細胞表層微絨毛の消失、細胞質の凝集等が挙げられる。従って、本発明におけるアポトーシス誘導作用とは、例えば、細胞において上記のアポトーシスの形態を誘導する作用を指すが、必ずしも、上記の形態の誘導のみに限定されるものではない。当業者においては、細胞のアポトーシス誘導が起こっているか否かについて、適宜、判断することが可能である。
本発明の、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤は、例えばアポトーシス誘導作用を機序とする抗癌剤(制癌剤)となるものと考えられる。本発明のアポトーシス誘導剤は、癌細胞特異的にアポトーシスを誘導し、正常細胞にはアポトーシスが誘導されないことから、副作用の少ない、安全な抗癌剤となるものと期待される。
なお、本発明における「抗癌剤」は、制癌剤と表記することも可能である。また、前記「抗癌剤」は、「抗腫瘍剤」、「抗腫瘍薬剤」または「抗腫瘍医薬組成物」等と表現される場合もある。
本発明において「染色体の安定化が阻害される」とは、例えば、染色体DNA中に修復されずに残った損傷が蓄積した状態となること等を指し、具体的には、染色体DNA中に一本鎖が露出した領域が蓄積したり、二本鎖DNA切断部分が多数出現する状態を指すが、必ずしもこのような状態に限定されない。
本発明における「染色体の安定化」は、例えば、細胞における以下の機能によって維持されている。従って、以下の機能を阻害することによって、染色体の安定化が阻害される。
(a)ヒト染色体不安定性疾患関連遺伝子
(b)染色体DNAの複製開始、複製フォークの進行を含む染色体DNA複製反応
(c)DNA損傷チェックポイント
(d)姉妹染色分体凝集・分離
(e)塩基除去修復
(f)ミスマッチ除去修復
(g)ヌクレオチド除去修復
(h)相同組換え修復
(i)非相同末端結合修復(非相同組換え修復)
(j)二本鎖DNA切断修復
(k)DNA複製後修復(DNA損傷トレランス)
(l)DNA架橋損傷修復
(m)DNA−タンパク質架橋損傷修復
(n)DNAポリメラーゼ
(o)ヌクレアーゼ
(p)ヌクレオチド浄化
(q)クロマチン構造維持
(r)テロメア構造維持
本発明の好ましい態様において、染色体の安定化阻害とは、例えば、上記の(a)〜(r)のいずれかの機能を阻害することを挙げることができる。
即ち本発明の好ましい態様においては、上記(a)〜(r)のいずれかの機能を阻害する化合物を含む、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤に関する。
本発明において、上記(a)〜(r)のいずれかの機能を阻害するためには、例えば、該機能に関与する遺伝子(本明細書においては、「染色体安定化関連遺伝子」と記載する場合あり)の発現を阻害する、もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能(活性)を阻害することが挙げられる。
上記の各機能に関与する遺伝子としては、例えば、以下の遺伝子を挙げることができるが、上記の各機能に関与する遺伝子であれば、特に制限されない。
(a)ヒト染色体不安定性疾患関連遺伝子
ヒト染色体不安定性疾患としては、例えば色素性乾皮症、コケイン症、ナイミーヘン症、血管拡張性失調症、ファンコニー貧血症、あるいは早老症等が挙げられる。これら各疾患に関連する遺伝子を以下に記載する。
・色素性乾皮症: (a1)XPB、(a2)XPD、(a3)XPG、(a4)XPF、(a5)XPC、(a6)RAD23B、(a7)CETN2、(a8)RAD23A、(a9)ERCC1
・コケイン症: (a10)CSA、(a11)CSB、(a12)XAB
・ナイミーヘン症: (a13)NBS1
・血管拡張性失調症: (a14)ATM
・ファンコニー貧血症: (a15)FANCA、(a16)FANCC、(a17)FANCD2、(a18)FANCE、(a19)FANCF、(a20)FANCG
・早老症: (a21)WRN、(a22)BLM、(a23)RTS
(b)染色体DNAの複製開始、複製フォークの進行を含む染色体DNA複製反応
(b1)Mcm10、(b2)Orc1、(b3)Orc3、(b4)Cdc6、(b5)Cdt1、(b6)Geminin、(b7)Mcm3、(b8)Mcm4、(b9)Mcm5、(b10)Mcm6、(b11)Mcm7、(b12)Mcm8、(b13)Cdc7、(b14)Cdc5、(b15)Psf1、(b16)Psf2、(b17)Psf3、(b18)Cdc45、(b19)Pola p180、(b20)Pola p70、(b21)Pola Spp1(Prim2a)、(b22)RPA70、(b23)RPA34、(b24)PCNA、(b25)Elg1、(b26)Ligase1、(b27)Pole Pol2、(b28)Pole Dpb3、(b29)Topoisomerase I、(b30)TDP1、(b31)Orc2、(b32)Orc4、(b33)Orc5、(b34)Orc6、(b35)Mcm2、(b36)Dbf4、(b37)TopBP1、(b38)Sld5、(b39)Pola Spp2、(b40)RFC1、(b41)RFC2、(b42)RFC3、(b43)RFC4、(b44)RFC5、(b45)Pif1、(b46)Pold p50、(b47)Pole Dpb2、(b48)Topoisomerase Iia、(b49)Topoisomerase Iib 、(b50)RPA14、(b51)FEN1、(b52)DNA2、(b53)Pold p125、(b54)Pold p68、(b55)Pold p12、(b56)Pole Dpb4
(c)DNA損傷チェックポイント
(c1)ATR、(c2)Chk1、(c3)NBS1、(c4)Hus1、(c5)Rad1、(c11)Mad2、(c12)BubR1、(c12)ATM、(c13)Rad50、(c14)Mre11、(c15)Mdc1、(c16)53BP1、(c17)Rad17、(c22)BubR1、(c23)ATRIP、(c24)Chk2、(c25)H2AX、(c26)RFC1、(c27)RFC2、(c28)RFC3、(c29)RFC4、(c30)RFC5、(c31)ATM、(c32)BRCA1、(c33)Chk1、(c34)Chk2、(c35)14-3-3eta、(c36)14-3-3sigma、(c37)cdc25A、(c38)cdc25c、(c39)wee1、(c40)ATR、(c41)ATRIP、(c42)Rad17、(c43)RFC2、(c44)RFC3、(c45)RFC4、(c46)RFC5、(c47)HUS1、(c48)Rad1、(c49)Rad9、(c50)P53、(c51)Rad50、(c52)Mre11、(c53)NBS1、(c54)TopBP1、(c55)53BP1、(c56)H2AX
(d)姉妹染色分体凝集・分離
(d1)Ctf18、(d2)Scc1、(d3)Scc3、(d4)Dcc1、(d5)Trf4-1、(d6)Trf4-2、(d7)Smc1、(d8)Smc3、(d9)Pds1(Securin)、(d10)Mad2、(d11)BubR1、(d12)Esp1
(e)塩基除去修復
(e1)UNG、(e2)MBD4、(e3)TDG、(e4)NTH1、(e5)NEIL2、(e6)NEIL3、(e7)APE2、(e8)PARP1、(e9)PNK、(e10)Polb、(e11)OGG1、(e12)APE1、(e13)XRCC1、(e14)Ligase3、(e15)SMUG1、(e16)TDG、(e17)MYH、(e18)MPG、(e19)NEIL1、(e20)ADPRT、(e21)ADPRTL2、(e22)MGMT、(e23)ABH1、(e24)ABH2、(e25)ABH3
(f)ミスマッチ除去修復
(f1)MSH2、(f2)PMS1、(f3)PMS2、(f4)MLH3、(f5)Exonuclease1、(f6)MSH3、(f7)MSH6、(f8)MSH5、(f9)MLH1、(f10)MSH4、(f11)PMS2L3、(f12)Trex1、(f13)Trex2、(f14)PMS2L4
(g)ヌクレオチド除去修復
(g1)XPC、(g2)Rad23A、(g3)Rad23B、(g4)CSA、(g5)CSB、(g6)XPG、(g7)XPF、(g8)DDB1、(g9)DDB2、(g10)XAB2、(g11)XPB、(g12)ERCC1、(g13)XPD、(g14)XPA、(g15)DDB2、(g16)Mms19、(g17)CETN2、(g18)RPA70、(g19)RPA34、(g20)RPA14、(g21)GTF2H1、(g22)GTF2H2、(g23)GTF2H3、(g24)GTF2H4、(g25)CDK7、(g26)CCNH、(g27)MNAT1、(g28)LigaseI、(g29)CSA、(g30)CSB
(h)相同組換え修復
(h1)Rad51、(h2)Rad51L1、(h3)Rad51C、(h4)Rad51L3、(h5)DMC1、(h6)XRCC2、(h7)XRCC3、(h8)Rad52、(h9)Rad54L、(h10)Rad54B、(h11)BRCA1、(h12)BRCA2、(h13)Rad50、(h14)Mre11、(h15)NBS1、(h16)TopoisomeraseIIIa、(h17)TopoisomeraseIIIb、(h18)WHIP、(h19)WRN、(h20)BLM、(h21)RecQ1、(h22)RecQ5
(i)非相同末端結合修復(非相同組換え修復)
(i1)Ku70、(i2)Ku80、(i3)DNA-pk、(i4)Ligase4、(i5)XRCC4、(i6)Artemis、(i7)WRN
(j)二本鎖DNA切断修復
(j1)Rad51、(j2)Rad51D、(j3)Xrcc2、(j4)Rad54、(j5)BRCA1、(j6)Ku80、(j7)XRCC4、(j8)Rad52、(j9)Rad51C、(j10)Dmc1、(j11)Rad54B、(j12)DNA-pk、(j13)Ku70、(j14)Ligase4、(j15)Rad51B、(j16)XRCC3、(j17)BRCA2、(j18)Artemis
(k)DNA複製後修復(DNA損傷トレランス)
(k1)Rad6A、(k2)Rad6B、(k3)Rad18、(k4)Ubc13、(k5)FBH1
(l)DNA架橋損傷修復
(l1)FANCA、(l2)FANCC、(l3)FANCD2、(l4)FANCE、(l5)FANCF、(l6)FANCG
(m)DNA-タンパク質架橋損傷修復
(m1)TDP1
(n)DNAポリメラーゼ
(n1)Poli、(n2)Polh、(n3)Polq、(n4)Polk、(n5)Polz(REV3)、(n6)Poll、(n7)Polm、(n8)Rev1、(n9)Polb、(n10)Polg、(n11)Pold p50、(n12)Pole Pol2、(n13)REV7、(n14)Poln、(n15)Pola P180、(n16)Pola p70、(n17)Pola Spp1、(n18)Pola Spp2、(n19)Pold p68、(n20)Pold p12、(n21)Pole Dpb2、(n22)Pole Dpb3、(n23)Pole Dpb4
(o)ヌクレアーゼ
(o1)FEN1、(o2)TREX1、(o3)TREX2、(o4)Exonuclease1、(o5)SPO11、(o6)ENDO V、(o7)APE1、(o8)APE2、(o9)Mre11、(o10)Artemis
(p)ヌクレオチド浄化
(p1)MTH1、(p2)DUT、(p3)p53R2
(q)クロマチン構造維持
(q1)H2AX、(q2)Sir2、(q3)SIRT1 (Sirtuin)
(r)テロメア構造維持
(r1)Tin2、(r2)Sir2、(r3)hTert、(r4)TRF1、(r5)TRF2、(r6)Tankyrase、(r7)Pot1、(r8)Rap1、(r9)Pif1
上記(a)〜(r)の各機能に関与する遺伝子としては、好ましくは、後述の実施例に記載された遺伝子を好適に示すことができる。具体的には、以下に記載の遺伝子を挙げることができる。
APE2、ATR、BRCA1、Chk1、Cdc5、Cdc6、Cdc7、Cdc45、Cdt1、CSA、CSB、Ctf18、DDB1、DDB2、DNA2、DUT、Elg1、EndoV、Esp1、Exonuclease1、FBH1、FEN1、Geminin、Hus1、KNTC2 (NDC80)、Ku80、Ligase1、Mad2、MBD4、Mcm3、Mcm4、Mcm5、Mcm6、Mcm7、Mcm8、Mcm10、MGMT、MLH3、Mms4、MPG、MSH2、Mus81、NBS1、NEIL2、NEIL3、NTH1、Orc1、Orc3、PARP1、PCNA、Pif1、PMS1、PMS2、PNK、Pola p180、Pola p70、Pola Spp1(Prim2a)、Polb、Pold p125、Pole Dpb3、Pole Dpb4、Pole Pol2、Poli、Poll、Polm、Psf1、Psf2、Psf3、Rad1、Rad18、Rad23A、Rad23B、Rad51、Rad51D、Rad54、Rad6A、RPA34、RPA70、Scc1、Scc3、Sir2、SIRT1 (Sirtuin)、TDG、TDP1、TIMELESS、Tin2、Topoisomerase I、Topoisomerase IIIa、Topoisomerase IIIb、Ubc13、UNG、XAB2、XPC、XPF、XPG、Xrcc2、XRCC4
本発明の好ましい態様においては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現、または、該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を抑制する化合物を有効成分として含有する、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤を提供する。
本明細書において記載された遺伝子名は、広く一般的に知られた名称であることから、当業者であれば、該遺伝子の塩基配列についての情報を、遺伝子名を基に、公共の文献データベース、あるいは、遺伝子データベース(例えば、GenBank等)から、適宜取得することができる。
本発明の上記のいずれかに記載の各遺伝子の塩基配列、および該遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列の具体例を、配列表に掲載する。上記遺伝子の配列情報が取得可能なNCBIのアクセッション番号、および該番号によって取得される遺伝子の塩基配列の配列番号との関係を表1〜16に示す。また、本発明の上記の各遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列の一例についても、配列表に示す。
なお、上記に記載の各遺伝子は、塩基配列中の多型の有無等により、同一の遺伝子であっても複数のアクセッション番号が付与されている場合がある。この「多型」とは、一塩基の置換、欠失、挿入変異からなる一塩基多型(SNPs)に限定されず、連続する数塩基の置換、欠失、挿入変異も含まれる。従って、上記の各遺伝子の塩基配列としては、必ずしも表1〜表16に記載のアクセッション番号によって取得される配列、あるいは、配列番号:1〜637、810〜908に記載された配列に限定されない。同様に、上記の各遺伝子によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列も、配列番号:638〜723、909〜973に記載されたアミノ酸配列に特に限定されない。
本発明の上記タンパク質は、配列番号:638〜723、909〜973に記載されたアミノ酸配列に限定されず、該アミノ酸配列において、1もしくは複数のアミノ酸残基が付加、欠失、置換、挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質であって、配列番号:638〜723、909〜973に記載されたタンパク質と機能的に同等なタンパク質が含まれる。
また、本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記の各遺伝子)は特に制限されるものではないが、通常、動物由来であり、より好ましくは哺乳動物由来であり、最も好ましくはヒト由来である。
即ち、本発明はヒトの癌細胞についての特異的なアポトーシス誘導剤に限定されず、ヒト以外の動物の癌細胞に対するアポトーシス誘導剤も本発明に含まれる。従って、本発明の遺伝子には、上記の各遺伝子についてのヒト以外の動物におけるホモログ(カウンターパート)遺伝子が含まれる。例えば、配列番号:1〜637、810〜908に記載の各塩基配列からなる遺伝子に対応する他の動物における内在性の遺伝子(ホモログ等)が含まれる。該塩基配列からなるDNAに対応する他の動物の内在性のDNAは、一般的に、該配列番号に記載のDNAと高い相同性を有する。高い相同性とは、50%以上、好ましくは70%以上、さらに好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上(例えば、95%以上、さらには96%、97%、98%または99%以上)の相同性を意味する。この相同性は、mBLASTアルゴリズム(Altschul et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87: 2264-8; Karlin and Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 5873-7)によって決定することができる。また、該DNAは、生体内から単離した場合、該配列番号に記載のDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズすると考えられる。ここで「ストリンジェントな条件」としては、例えば「2×SSC、0.1%SDS、50℃」、「2×SSC、0.1%SDS、42℃」、「1×SSC、0.1%SDS、37℃」、よりストリンジェントな条件として「2×SSC、0.1%SDS、65℃」、「0.5×SSC、0.1%SDS、42℃」および「0.2×SSC、0.1%SDS、65℃」の条件を挙げることができる。当業者においては、他の動物における本発明の上記の各遺伝子に相当する内在性遺伝子に関する情報(配列等)について、配列表に掲載された塩基配列を基に適宜取得することが可能である。
また本発明は、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現を抑制する化合物を提供する。
本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現を抑制する化合物としては、例えば、該遺伝子に対してRNAi(RNA interferance;RNA干渉)効果を有する二本鎖RNAを好適に挙げることができる。一般的にRNAiとは、標的遺伝子のmRNA配列と相同な配列からなるセンスRNAおよびこれと相補的な配列からなるアンチセンスRNAとからなる二本鎖RNAを細胞内に導入することにより、標的遺伝子mRNAの破壊を誘導し、標的遺伝子の発現が阻害される現象を言う。
RNAi機構の詳細については未だに不明な部分もあるが、DICERといわれる酵素(RNase III核酸分解酵素ファミリーの一種)が二本鎖RNAと接触し、二本鎖RNAがsmall interfering RNAまたはsiRNAと呼ばれる小さな断片に分解されるものと考えられている。本発明におけるRNAi効果を有する二本鎖RNAには、このsiRNAも含まれる。さらに、本発明の二本鎖RNAを発現し得るDNAもまた、本発明に含まれる。
本発明の好ましい態様においては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現をRNAi効果により抑制し得るRNA(siRNA)であって、配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列からなるRNAと、該RNAと相補的な配列からなるRNAとがハイブリダイズした構造を含む二本鎖RNAを有効成分として含む、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤を提供する。
例えば、配列番号:724に記載の塩基配列(5'- ggaaaaucuggccacucucTT-3')を含む本発明のsiRNAとは、以下のような構造のRNA分子を例示することができる。
(上記「I」は水素結合を表す。)
なお、上記RNA分子において一方の端が閉じた構造の分子、例えば、ヘアピン構造を有するsiRNA(shRNA)も本発明に含まれる。即ち、分子内において二本鎖RNA構造を形成し得る分子もまた本発明に含まれる。
例えば、
5'-ggaaaaucuggccacucuc (xxxx)n gagaguggccagauuuucc-3' のような分子もまた本発明に含まれる。(上記「(xxxx)n」は任意塩基および配列数からなるポリヌクレオチドを表す。)
上記siRNAの好ましい態様としては、染色体安定化関連遺伝子(例えば上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現をRNAi効果により抑制し得るRNA(siRNA)であって、配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列からなるRNAと、該RNAと相補的な配列からなるRNAとがハイブリダイズした構造を含む二本鎖RNAを好適に示すことができる。ただし、二本鎖RNAの末端において、例えば、1もしくは複数のRNAが付加もしくは欠失された構造の二本鎖RNAもまた、本発明に含まれる。
即ち本発明は、本発明の二本鎖RNAを発現し得るDNA(ベクター)を提供する。本発明の上記二本鎖RNAを発現し得るDNA(ベクター)は、通常、該二本鎖RNAの一方の鎖をコードするDNA、および該二本鎖RNAの他方の鎖をコードするDNAが、それぞれ発現し得るようにプロモーターと連結した構造を有するDNAである。本発明の上記DNAは、当業者においては、一般的な遺伝子工学技術により、容易に作製することができる。より具体的には、本発明のRNAをコードするDNAを公知の種々の発現ベクターへ適宜挿入することによって、本発明の発現ベクターを作製することが可能である。
RNAiのために使用されるRNAは、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)もしくは該遺伝子の部分領域と完全に同一(相同)である必要はないが、完全な同一(相同)性を有することが好ましい。
本発明のRNAi効果を有する二本鎖RNAは、通常、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)のmRNAにおける連続する任意のRNA領域と相同な配列からなるセンスRNA、および該センスRNAに相補的な配列からなるアンチセンスRNAからなる二本鎖RNAである。上記「連続する任意のRNA領域」の長さは、通常20〜30塩基であり、好ましくは21〜23塩基である。例えば、配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載のRNAを一方の鎖とするsiRNAの長さを挙げることができるが、必ずしもこれらの長さに限定されない。しかしながら、そのままの長さではRNAi効果を有さないような長鎖のRNAであっても、細胞においてRNAi効果を有するsiRNAへ分解されることが期待されるため、本発明における二本鎖RNAの長さは、特に制限されない。また、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)のmRNAの全長もしくはほぼ全長の領域に対応する長鎖二本鎖RNAを、例えば、予めDICERで分解させ、その分解産物を本発明のアポトーシス誘導剤として利用することが可能である。この分解産物には、RNAi効果を有する二本鎖RNA分子(siRNA)が含まれることが期待される。この方法によれば、RNAi効果を有することが期待されるmRNA上の領域を、特に選択しなくともよい。即ち、RNAi効果を有する染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)のmRNA上の領域は、必ずしも正確に規定される必要はない。ただし、より好ましくは、後述の実施例において用いた各種siRNAを好適に示すことができる。
また、通常、末端に数塩基のオーバーハングを有する二本鎖RNAは、RNAi効果が高いことが知られており、本発明の二本鎖RNAは、末端に数塩基のオーバーハングを有することが望ましい。このオーバーハングを形成する塩基の長さは特に制限されない。また、このオーバーハングは、DNAおよびRNAのいずれであってもよい。好ましくは、2塩基のオーバーハングを例示することができる。本発明においては例えば、TT(チミンが2個)、UU(ウラシルが2個)、その他の塩基のオーバーハングを有する二本鎖RNA(最も好ましくは19塩基の二本鎖RNAと2塩基(TT)のオーバーハングを有する分子)を好適に用いることができる。本発明の二本鎖RNAには、このようにオーバーハングを形成する塩基がDNAであるような分子や、標的mRNA配列と相同な配列も含まれる。
例えば、オーバーハング部分の塩基がTTである場合には、本発明のsiRNA分子としては、
のような分子(3'側にTTが付加された分子)を例示することができる。
本発明の上記「染色体安定化関連遺伝子に対してRNAi効果を有する二本鎖RNA」は、当業者においては、該二本鎖RNAの標的となる染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の塩基配列をもとに、適宜作製することができる。染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の塩基配列は、上述のように公共の遺伝子データベースから容易に取得することができる。一例を示せば、配列番号:1〜637、810〜908のいずれかに記載の塩基配列をもとに、本発明の二本鎖RNAを作製することができる。即ち、配列番号:1〜637、810〜908のいずれかに記載の塩基配列をもとに、該配列の転写産物であるmRNAの任意の連続するRNA領域を選択し、この領域に対応する二本鎖RNAを作製することは、当業者においては、容易に行い得ることである。また、該配列の転写産物であるmRNA配列から、より強いRNAi効果を有するsiRNA配列を選択する方法は、例えば文献(Reynold et al. Nature biotechnology 22. 326-330 (2004)、Ui-Tei et al. Nucleic Acids Res. 32. 936-948 (2004)、Boese Q, Leake D, Reynolds A, Read S, Scaringe SA, Marshall WS, Khvorova A. Mechanistic insights aid computational short interfering RNA design.Methods Enzymol. 2005;392:73-96.、Snove O Jr, Nedland M, Fjeldstad SH, Humberset H, Birkeland OR, Grunfeld T, Saetrom P. Designing effective siRNAs with off-target control. Biochem Biophys Res Commun. 2004;325(3):769-73.、Yiu SM, Wong PW, Lam TW, Mui YC, Kung HF, Lin M, Cheung YT. Filtering of Ineffective siRNAs and Improved siRNA Design Tool. Bioinformatics. 200515;21(2):144-51、Chalk AM, Wahlestedt C, Sonnhammer EL. Improved and automated prediction of effective siRNA. Biochem Biophys Res Commun. 2004;319(1):264-74.、Amarzguioui M, Prydz H. An algorithm for selection of functional siRNA sequences. Biochem Biophys Res Commun. 2004;316(4):1050-8.、Sioud M, Leirdal M. Potential design rules and enzymatic synthesis of siRNAs. Methods Mol Biol. 2004;252:457-69.)等を参考にして、当業者においては、適宜実施することが可能である。また、一方の鎖(例えば、配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列)が判明していれば、当業者においては容易に他方の鎖(相補鎖)の塩基配列を知ることができる。siRNAは、当業者においては市販の核酸合成機を用いて適宜作製することが可能である。また、所望のRNAの合成については、一般の合成受託サービスを利用することが可能である。
また、本発明におけるsiRNAは、必ずしも全てのヌクレオチドがリボヌクレオチド(RNA)でなくともよい。即ち、本発明において、siRNAを構成する1もしくは複数のリボヌクレオチドは、対応するデオキシリボヌクレオチドであってもよい。この「対応する」とは、糖部分の構造は異なるものの、同一の塩基種(アデニン、グアニン、シトシン、チミン(ウラシル))であることを指す。例えば、アデニンを有するリボヌクレオチドに対応するデオキシリボヌクレオチドとは、アデニンを有するデオキシリボヌクレオチドのことを言う。また、前記「複数」とは特に制限されないが、好ましくは2〜5個程度の少数を指す。
また、本発明の二本鎖RNAの基となる遺伝子(標的遺伝子)の配列は、必ずしも遺伝子全長の塩基配列が判明している必要はない。選択すべき任意の連続するRNA領域(例えば、20〜30塩基)が判明していればよい。従って、EST(Expressed Sequence Tag)等のようにmRNAの一部は判明しているが、全長が判明していない遺伝子断片からも、該断片の塩基配列を基に本発明の二本鎖RNAを作製することが可能である。以下に、GenBankデータベースにおいて、上記のいずれかに記載の遺伝子と高い相同性を示したEST配列のアクセッション番号を、各遺伝子名ごとに分けて記載する。但し、これらは多数存在するEST配列のうちの一例に過ぎず、当業者においては、適切なEST断片に関する情報を公共のデータベースから容易に取得することができる。
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EndoV:BQ279208.1BM554738.1、BM911430.1、BI830073.1、BI829389.1、BG681481.1、BG819544.1、BI117355.1、BI551407.1、BQ287914.1、BQ050806.1、BQ024655.1、BQ021027.1、W87446.1、BM926784.1、BM128679.1、BM128571.1、BM128352.1、AA720808.1、AA452047.1、AA363057.1、AA351281.1、BU621053.1、BU553848.1、BU527982.1、BQ957094.1、AA056490.1、BQ923151.1、BQ923003.1、BQ772531.1、BQ435901.1、BQ429806.1、BQ429804.1、BQ427432.1、BQ417371.1、BQ342726.1、R14533.1、CB143295.1、AI370900.1、BX334744.2、BX355957.2、Z41683.1、AW157406.1、CK819308.1、CN288502.1、CN310874.1、CN310875.1、CN310876.1、AW975617.1、H09974.1、BE619534.1、BE905153.1、BE938460.1、BF686490.1、BF477753.1、AL541721.3、AL569045.3、BG749082.1、BI549266.1、BI550542.1、BI550562.1、BI837982.1、BI917934.1、BM007984.1、BM008131.1、BM043073.1、BM047737.1、BX092874.1、AI219827.1、AI249283.1、AA926664.1、AI223657.1、AI290823.1、AI300416.1、AI311040.1、AI349370.1、AI393803.1、AI307620.1、AI571214.1、AI635870.1、AI660440.1、AI681370.1、AI702794.1、AW001931.1、AW136860.1、AW204051.1、AW438764.1、BE041666.1、BE043347.1、BE049112.1、BE219425.1、BE219749.1、BE672512.1、BF194919.1、BF196166.1、BF718311.1、BF840896.1、BM662670.1、BM665527.1、BM671155.1、BM684408.1、BM689003.1、BM710007.1、BM711618.1、BM930887.1、AA451847.1、AA593804.1、AA617805.1、T96971.1
KNTC2(NDC80):BG612856.1、BG532554.1、BG531886.1、BI093871.1、BG500282.1、BI825656.1、BE561023.1、BE564344.1、BE565202.1、BE566742.1、BE903220.1、BQ233581.1、BQ425406.1、BF029347.1、CD557751.1、BU507911.1、BF977553.1、BF976962.1、BF700934.1、BF219086.1、BF244797.1、BF700668.1、BF246890.1、BF684028.1、BF667950.1、BF666100.1、BF665251.1、AU151690.2、BF540908.1、AU099103.1、BF576929.1,BG403284.1,BF589484.1、AL583281.3、AL583241.3、AL531915.3、AL531914.3、AL527360.3、BF984727.1、AL527307.3、BG257162.1、BF899120.1、BF994346.1、BF978548.1、BU633554.1、AA188980.1、AA188981.1、AA189047.1、AA211359.1、BU943322.1、AA249583.1、AA249666.1、CA311030.1、CA446863.1、AA312280.1、T89463.1、AA492580.1、AA628019.1、AA639709.1、AA700427.1、AA857356.1、AA878068.1、BG679506.1、BI087094.1、BI260526.1、N88235.1、BI861865.1、BM194061.1、BM453009.1、BM476696.1、BM806248.1、BM828736.1、BM995677.1、W72679.1、AL711170.1、AL710845.1、BQ307283.1、BQ307306.1、BQ776047.1、BQ776118.1、CN294243.1、CN294241.1、CN294240.1、CN294239.1、CN294238.1、CN294237.1、AW821289.1、AW955129.1、AW573107.1、AW449014.1、BP430527.1、AW069561.1、AI979323.1、BX453617.2、AI955047.1、AI954614.1、BX431751.2、BX372554.2、BX353230.2、BX351284.2、BX333981.2、AI913466.1、AI866885.1、BX284007.1、BF246242.1,AI660156.1、AI380253.1,BP369219.1 ,BF218992.1、BP282259.1、AU129601.1、BP283529.1、AI341287.1、BF084870.1、BP290528.1、BP242960.1、BP239153.1、CV030676.1、CN294245.1、CN294236.1、BF082771.1、BE503512.1、AI341285.1、BF038467.1、BE543964.1、CB150849.1、CB160181.1、BF001266.1、BE672102.1、CN294234.1、CN294233.1、R94766.1、CV363738.1、BE927464.1、AA911686.1、AV718407.2、BE940500.1、BE857720.1、BE889796.1、AV718036.1、BF687621.1、BF447144.1、CN294232.1、CN294235.1、CN294244.1、R92253.1
本発明の好ましい態様においては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)もしくは上記各ESTに対応するmRNAにおける、連続するRNA領域を一方の鎖とするRNAi効果を有する二本鎖RNA、を含むアポトーシス誘導剤を提供する。
上述のように上記のいずれかに記載の遺伝子には、同一の遺伝子であっても種々の多型が含まれている場合がある。当業者においては、配列番号:1〜637、810〜908のいずれかに記載の塩基配列もしくは上記のEST配列に対し、例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子に関する公共の多型データベースからの情報を加味し、RNAi効果を有することが期待されるRNAの配列を適宜設計することができる。このようなRNAを含むアポトーシス誘導剤もまた本発明に含まれる。また、当業者においては、複数種作製された本発明の二本鎖RNAから、最適なRNAi効果を有するRNAを適宜選択してアポトーシス誘導剤とすることも可能である。
本発明の上記「RNAi効果を有する二本鎖RNA」の具体例として、図1〜図4および図28〜32に記載の塩基配列(配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列)を該二本鎖RNAの一方の鎖とするsiRNA分子(配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列と、その相補鎖からなるsiRNA分子)を挙げることができる。即ち本発明の一つの態様としては、RNAi効果を有する二本鎖RNAの一方の鎖が配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列からなるsiRNA分子(配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列と、その相補鎖からなるsiRNA分子)を有効成分として含む、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤を提供する。
また、上記siRNA分子において二本鎖を形成する領域の一方のRNA配列は、必ずしも、上記の配列番号:724〜809、974〜1063のいずれかに記載の塩基配列と完全に同一であることに制限されない。例えば、該塩基配列において1もしくは複数の塩基が改変された配列からなる塩基配列を二本鎖RNAの一方の鎖とするsiRNA分子であっても、本発明の遺伝子の発現を抑制する機能を有するものであればよい。
即ち、本発明の好ましい態様において、RNAi効果を有する二本鎖RNAとは、該二本鎖の一方の鎖が配列番号:724〜809、または974〜1063のいずれかに記載の塩基配列において1もしくは複数の塩基が付加、欠失、置換された塩基配列であり、他方の鎖が該塩基配列と相補的な塩基配列であることを特徴とする二本鎖RNAであって、本発明の遺伝子の発現を抑制する機能を有する二本鎖RNAである。なお、上記「複数」とは、通常、少数を意味し、より具体的には、2〜10を意味し、好ましくは2〜5を意味し、より好ましくは2〜3を意味する。
また、本発明の好ましい態様としては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現を抑制する化合物が以下の(a)または(b)である、アポトーシス誘導剤を提供する。
(a)本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の転写産物、またはその一部に対するアンチセンス核酸
(b)本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の転写産物を特異的に開裂するリボザイム活性を有する核酸
本発明における「核酸」とはRNAまたはDNAを意味する。特定の内在性遺伝子の発現を阻害(抑制)する方法としては、アンチセンス技術を利用する方法が当業者によく知られている。アンチセンス核酸が標的遺伝子の発現を阻害する作用としては、以下のような複数の要因が存在する。すなわち、三重鎖形成による転写開始阻害、RNAポリメラーゼによって局部的に開状ループ構造が作られた部位とのハイブリッド形成による転写阻害、合成の進みつつあるRNAとのハイブリッド形成による転写阻害、イントロンとエキソンとの接合点におけるハイブリッド形成によるスプライシング阻害、スプライソソーム形成部位とのハイブリッド形成によるスプライシング阻害、mRNAとのハイブリッド形成による核から細胞質への移行阻害、キャッピング部位やポリ(A)付加部位とのハイブリッド形成によるスプライシング阻害、翻訳開始因子結合部位とのハイブリッド形成による翻訳開始阻害、開始コドン近傍のリボソーム結合部位とのハイブリッド形成による翻訳阻害、mRNAの翻訳領域やポリソーム結合部位とのハイブリッド形成によるペプチド鎖の伸長阻害、および発現制御領域と転写調節因子との相互作用部位とのハイブリッド形成による遺伝子発現阻害などである。このようにアンチセンス核酸は、転写、スプライシングまたは翻訳など様々な過程を阻害することで、標的遺伝子の発現を阻害する(平島および井上著、新生化学実験講座2 核酸IV遺伝子の複製と発現、日本生化学会編、東京化学同人、1993年、p.319-347)。
本発明で用いられるアンチセンス核酸は、上記のいずれの作用により染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現を阻害してもよい。一つの態様としては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)のmRNAの5'端近傍の非翻訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、遺伝子の翻訳阻害に効果的と考えられる。また、コード領域もしくは3'側の非翻訳領域に相補的な配列も使用することができる。このように、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の翻訳領域だけでなく、非翻訳領域の配列のアンチセンス配列を含む核酸も、本発明で利用されるアンチセンス核酸に含まれる。使用されるアンチセンス核酸は、適当なプロモーターの下流に連結され、好ましくは3'側に転写終結シグナルを含む配列が連結される。また臨床応用を考慮する場合、使用されるアンチセンス核酸は、通常、合成オリゴマーであり、ヌクレアーゼ分解に対する感受性を減らし、且つアンチセンス核酸としての活性を維持するために、リン酸エステル結合部のO(酸素)をS(硫黄)に置換したSオリゴ(ホスホロチオエート型オリゴヌクレオチド)の利用が一般に知られている。このSオリゴは現在ではアンチセンス薬として、直接患部に注入される臨床試験が行なわれている。本発明においてもこのSオリゴを好適に使用することができる。アンチセンス核酸の配列は、標的遺伝子またはその一部と相補的な配列であることが好ましいが、遺伝子の発現を有効に抑制できる限り、完全に相補的でなくてもよい。転写されたRNAは、標的遺伝子の転写産物に対して好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上の相補性を有する。アンチセンス核酸を用いて標的遺伝子の発現を効果的に抑制するには、アンチセンス核酸の長さは少なくとも15塩基以上であり、好ましくは100塩基以上であり、さらに好ましくは500塩基以上である。
また、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現の阻害は、リボザイム、またはリボザイムをコードするDNAを利用して行うことも可能である。リボザイムとは触媒活性を有するRNA分子を指す。リボザイムには種々の活性を有するものが存在し、RNAを部位特異的に切断するリボザイムの設計も可能である。リボザイムには、グループIイントロン型やRNase Pに含まれるM1 RNAのように400ヌクレオチド以上の大きさのものもあるが、ハンマーヘッド型やヘアピン型と呼ばれる40ヌクレオチド程度の活性ドメインを有するものもある(小泉誠および大塚栄子、蛋白質核酸酵素、1990年、35、2191)。
例えば、ハンマーヘッド型リボザイムの自己切断ドメインは、G13U14C15という配列のC15の3'側を切断するが、その活性にはU14とA9との塩基対形成が重要とされ、C15の代わりにA15またはU15でも切断され得ることが示されている(Koizumi, M.ら著、FEBS Lett、 1988年、228、228.)。基質結合部位が標的部位近傍のRNA配列と相補的なリボザイムを設計すれば、標的RNA中のUC、UUまたはUAという配列を認識する制限酵素的なRNA切断リボザイムが作出できる(Koizumi, M.ら著、FEBS Lett, 1988年、239, 285.、小泉誠および大塚栄子、蛋白質核酸酵素、1990年、35, 2191.、Koizumi, M.ら著、Nucl Acids Res、 1989年、17, 7059.)。
また、ヘアピン型リボザイムも本発明の目的に有用である。このリボザイムは、例えばタバコリングスポットウイルスのサテライトRNAのマイナス鎖に見出される(Buzayan, JM., Nature, 1986年、323, 349.)。ヘアピン型リボザイムからも、標的特異的なRNA切断リボザイムを作出できることが示されている(Kikuchi, Y. & Sasaki, N., Nucl Acids Res, 1991, 19, 6751.、菊池洋, 化学と生物, 1992, 30, 112.)。このように、リボザイムを用いて本発明における染色体安定化関連遺伝子の転写産物を特異的に切断することで、該遺伝子の発現を阻害することができる。
さらに本発明は、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質の機能(活性)を抑制する化合物を有効成分として含有する、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤に関する。
本発明の染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質には、該タンパク質のアミノ酸配列において1若しくは複数のアミノ酸が欠失、置換若しくは付加されたアミノ酸配列を含む、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質の変異タンパク質もしくはホモログタンパク質であって、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質と機能的に同等なタンパク質も含まれる。ここで「機能的に同等なタンパク質」とは、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質における機能(例えば、上述の(a)〜(s)のいずれかの機能)と同様の機能を備えたタンパク質である。
あるいは染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質のアミノ酸配列に対して、たとえば90%以上、望ましくは95%以上、更に望ましくは99%以上の相同性を有するタンパク質を、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質と機能的に同等なタンパク質として示すことができる。
本発明の好ましい態様においては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質の機能(活性)を抑制する化合物が、以下の(a)〜(c)のいずれかに記載の化合物である、アポトーシス誘導剤を提供する。これらの化合物は、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質の機能もしくは活性を阻害する(低下させる)ことにより、癌細胞に対してアポトーシス誘導作用を有するものと考えられる。
(a)本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質に対してドミナントネガティブの性質を有する変異体タンパク質
(b)本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質に結合する抗体
(c)本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質に結合する低分子化合物
上記(a)において「ドミナントネガティブの性質を有する変異体タンパク質」とは、内在性の野生型タンパク質の活性を消失もしくは低下させる機能を有する、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質変異体を指す。
また上記(b)の「抗体」は、当業者に公知の方法により調製することが可能である。ポリクローナル抗体であれば、例えば、次のようにして得ることができる。天然もしくは組換えの染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質、あるいはGSTとの融合タンパク質として大腸菌等の微生物において発現させたリコンビナントである染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質、またはその部分ペプチドをウサギ等の小動物に免疫し血清を得る。これを、例えば、硫安沈殿、プロテインAカラムおよびプロテインGカラム、DEAEイオン交換クロマトグラフィー、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質や合成ペプチドをカップリングしたアフィニティーカラム等により精製することにより調製する。また、モノクローナル抗体であれば、例えば、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質若しくはその部分ペプチドをマウスなどの小動物に免疫を行い、同マウスより脾臓を摘出し、これをすりつぶして細胞を分離し、該細胞とマウスミエローマ細胞とをポリエチレングリコール等の試薬を用いて融合させ、これによりできた融合細胞(ハイブリドーマ)の中から、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質に結合する抗体を産生するクローンを選択する。次いで、得られたハイブリドーマをマウス腹腔内に移植し、同マウスより腹水を回収し、得られたモノクローナル抗体を、例えば、硫安沈殿、プロテインAカラムおよびプロテインGカラム、DEAEイオン交換クロマトグラフィー、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質や合成ペプチドをカップリングしたアフィニティーカラム等により精製することで、調製することが可能である。
本発明の抗体は、本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質に結合し得るものであれば特に制限されず、上記ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体のほかに、ヒト抗体、遺伝子組み換えによるヒト型化抗体、さらにその抗体断片や抗体修飾物等も含まれる。
抗体取得の感作抗原として使用される本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質は、その由来となる動物種に制限されないが哺乳動物、例えばマウス、ヒト由来のタンパク質が好ましく、特にヒト由来のタンパク質が好ましい。
本発明において、感作抗原として使用されるタンパク質は、完全なタンパク質の他に該タンパク質の部分ペプチドであってもよい。タンパク質の部分ペプチドとしては、例えば、タンパク質のアミノ基(N)末端断片やカルボキシ(C)末端断片が挙げられる。本明細書における「抗体」とは通常、タンパク質の全長又は断片に反応する抗体を意味する。
また、ヒト以外の動物に抗原を免疫して上記ハイブリドーマを得る他に、ヒトリンパ球、例えばEBウィルスに感染したヒトリンパ球をin vitroでタンパク質、タンパク質発現細胞又はその溶解物で感作し、感作リンパ球をヒト由来の永久分裂能を有するミエローマ細胞、例えばU266と融合させ、タンパク質への結合活性を有する所望のヒト抗体を産生するハイブリドーマを得ることもできる。本発明の抗体を人体に投与する目的(抗体治療)で使用する場合には、免疫原性を低下させるため、ヒト抗体やヒト型抗体が好ましい。
染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質と結合することが既に知られている化合物として、例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子によってコードされるタンパク質に対するモノクローナルもしくはポリクローナル抗体を挙げることができる。
本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現もしくは該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能(活性)を抑制する化合物は、天然または人工の化合物のいずれであってもよい。通常、当業者に公知の方法を用いることによって製造または取得・単離可能な化合物である。例えば、有機化合物、無機化合物、核酸、タンパク質、ペプチド、糖などの単一化合物、あるいは、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物等もしくは該抽出物から単離精製される化合物を挙げることができる。
さらに本発明は、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤のスクリーニング方法を提供する。
本発明の上記方法の好ましい態様においては、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと被検化合物との結合活性を指標とする方法である。通常、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと結合する化合物は、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質の機能を阻害する効果を有することが期待される。
本発明の上記方法においては、まず、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと被検化合物を接触させる。染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドは、被検化合物との結合を検出するための指標に応じて、例えば、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドの精製された形態、細胞内または細胞外に発現した形態、あるいはアフィニティーカラムに結合した形態であり得る。この方法に用いる被検化合物は必要に応じて適宜標識して用いることができる。標識としては、例えば、放射標識、蛍光標識等を挙げることができる。
本方法においては、次いで、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと被検化合物との結合活性を測定する。染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと被検化合物との結合活性は、例えば、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドに結合した被検化合物に付された標識によって測定することができる。また、細胞内または細胞外に発現している染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドへの被検化合物の結合により生じる該タンパク質の活性の変化を指標として測定することも可能である。
本方法においては、次いで、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質またはその部分ペプチドと結合する被検化合物を選択する。
本方法に用いる被検化合物としては、特に制限はない。例えば、天然化合物、有機化合物、無機化合物、核酸、タンパク質、ペプチド、糖などの単一化合物、並びに、化合物ライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物、人工作出化合物等が挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のスクリーニング方法の別の態様においては、まず染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)を発現する細胞もしくは細胞抽出液と、被検化合物を接触させる。上記「染色体安定化関連遺伝子を発現する細胞」としては、内因性の染色体安定化関連遺伝子を発現している細胞、または外来性の染色体安定化関連遺伝子が導入され、該遺伝子を発現している細胞を利用することができる。外来性の染色体安定化関連遺伝子が発現した細胞は、通常、該遺伝子を含む発現ベクターを宿主細胞へ導入することにより作製することができる。この発現ベクターは、当業者においては一般的な遺伝子工学技術によって作製することができる。本発明のスクリーニング方法において、染色体安定化関連遺伝子を発現する細胞として例えば、MCF7 (乳癌)、A549 (肺癌)、U2OS (骨肉腫)、C33A (子宮頚癌)、HT1080(繊維肉腫)、PA-1(卵巣の奇形癌)、Tera2(胎生期癌)、T24(膀胱癌)、K562(慢性骨髄性白血病)、Molt4(急性リンパ芽球性白血病)、A172(神経膠芽細胞腫)、HeLa(子宮頚癌)、HepG2 (肝癌)、ACC62 (メラノーマ)、KP4 (膵臓癌)、CaKi‐1 (腎臓癌)、MKN45 (胃癌)、LNcap (前立腺癌)、MDA-MB435 (乳癌)、EJ 1 (膀胱癌)、OVCAR3 (卵巣癌)等の各種腫瘍細胞を好適に使用することができる。
上記染色体安定化関連遺伝子を発現する細胞への被検化合物の「接触」は、通常、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)を発現する細胞の培養液に被検化合物を添加することによって行うが、この方法に限定されない。被検化合物がタンパク質等の場合には、該タンパク質を発現するDNAベクターを、該細胞へ導入することにより、「接触」を行うことができる。
次いで本方法においては、染色体安定化関連遺伝子の発現レベルを測定する。ここで「遺伝子の発現」には、転写および翻訳の双方が含まれる。遺伝子の発現レベルの測定は、当業者に公知の方法によって行うことができる。例えば、染色体安定化関連遺伝子を発現する細胞からmRNAを定法に従って抽出し、このmRNAを鋳型としたノーザンハイブリダイゼーション法またはRT-PCR法を実施することによって、該遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。また、上記の染色体安定化関連遺伝子を発現する細胞からタンパク質画分を回収し、該遺伝子によってコードされるタンパク質の発現をSDS-PAGE等の電気泳動法で検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うこともできる。さらに、上記遺伝子によってコードされるタンパク質に対する抗体を用いて、ウェスタンブロッティング法を実施することにより、該タンパク質の発現を検出し、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。上記遺伝子によってコードされるタンパク質の検出に用いる抗体としては、検出可能な抗体であれば、特に制限はないが、例えばモノクローナル抗体、またはポリクローナル抗体の両方を利用することができる。
本方法においては更に、被検化合物の非存在下において測定した場合(対照)と比較して、該発現レベルを低下させる化合物を選択する。このようにして選択された化合物は、癌細胞に対してアポトーシスを誘導する作用を有することが期待される。さらに、該化合物は、アポトーシス誘導を作用機序とする制癌剤(抗癌剤)となることが期待される。
本発明の方法の更に別の態様においては、本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の発現レベルを低下させるような化合物を、レポーター遺伝子を利用してスクリーニングする方法である。
本方法においては、まず、上記の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを含む細胞または細胞抽出液と、被検化合物を接触させる。ここで「機能的に結合した」とは、上記の染色体安定化関連遺伝子の転写調節領域に転写因子が結合することにより、レポーター遺伝子の発現が誘導されるように、該遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが結合していることをいう。従って、レポーター遺伝子が他の遺伝子と結合しており、他の遺伝子産物との融合タンパク質を形成する場合であっても、該遺伝子の転写調節領域に転写因子が結合することによって、該融合タンパク質の発現が誘導されるものであれば、上記「機能的に結合した」の意に含まれる。染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)のcDNA塩基配列に基づいて、当業者においては、ゲノム中に存在する該遺伝子の転写調節領域を周知の方法により取得することが可能である。
本方法に用いるレポーター遺伝子としては、その発現が検出可能であれば特に制限されず、例えば、CAT遺伝子、lacZ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、およびGFP遺伝子等が挙げられる。「染色体安定化関連遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを含む細胞」として、例えば、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するベクターが導入された細胞等が挙げられる。上記ベクターは、当業者においては一般的な遺伝子工学技術によって作製することができる。ベクターの細胞への導入は、一般的な方法、例えば、リン酸カルシウム沈殿法、電気パルス穿孔法、リポフェタミン法、マイクロインジェクション法等によって実施することができる。「染色体安定化関連遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを含む細胞」には、染色体に該構造が挿入された細胞も含まれる。染色体へのDNA構造の挿入は、当業者に一般的に用いられる方法、例えば、ランダムインテグレーションや、相同組み換えを利用した遺伝子導入法により行うことができる。
「染色体安定化関連遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを含む細胞抽出液」とは、例えば、市販の試験管内転写翻訳キットに含まれる細胞抽出液に、染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを添加したものを挙げることができる。
本方法における「接触」は、「染色体安定化関連遺伝子の転写調節領域とレポーター遺伝子とが機能的に結合した構造を有するDNAを含む細胞」の培養液に被検化合物を添加する、または該DNAを含む上記の市販された細胞抽出液に被検化合物を添加することにより行うことができるが、これらの方法に限定されない。被検化合物がタンパク質の場合には、例えば、該タンパク質を発現するDNAベクターを、該細胞へ導入することにより接触を行うことも可能である。
本方法においては、次いで、該レポーター遺伝子の発現レベルを測定する。レポーター遺伝子の発現レベルは、該レポーター遺伝子の種類に応じて、当業者に公知の方法により測定することができる。例えば、レポーター遺伝子がCAT遺伝子である場合には、該遺伝子産物によるクロラムフェニコールのアセチル化を検出することによって、レポーター遺伝子の発現量を測定することができる。レポーター遺伝子がlacZ遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による色素化合物の発色を検出することにより、また、ルシフェラーゼ遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による蛍光化合物の蛍光を検出することにより、さらに、GFP遺伝子である場合には、GFPタンパク質による蛍光を検出することにより、レポーター遺伝子の発現量を測定することができる。
本方法においては、次いで、測定したレポーター遺伝子の発現レベルを、被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、低下させる化合物を選択する。このようにして選択された化合物は、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤となる。
本発明の方法の別の態様においては、本発明の染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質の活性を指標とする、化合物のスクリーニング方法である。
本方法においては、まず染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質、または該タンパク質を発現する細胞もしくは細胞抽出液と、被検化合物を接触させる。次いで、該タンパク質の活性を測定する。該タンパク質の活性としては、例えば、上記(a)〜(r)に示した機能(活性)等を挙げることができる。当業者においては、スクリーニングにおいて指標とするタンパク質についての機能(活性)、および該機能(活性)の評価(測定)方法についての情報を、例えば、文献データベース等により適宜、入手することができる。
一例を示せば、指標とされるタンパク質がMcm10である場合は、例えば、ARS(Autonomously replicating sequences)の挙動を二次元電気泳動で検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(MCB(1997)3261-3271.)。
指標とされるタンパク質がOrc1である場合は、例えば、該タンパク質を含むOrc1-6の複合体形成、あるいはCaCl2存在下でのOrc1-6複合体の電気泳動的移動度の変化を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1998)273,32421-32429.)。
指標とされるタンパク質がOrc3である場合は、例えば、該タンパク質を含むOrc1-6の複合体形成、該タンパク質のOri特異的な結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(1998)273,32421-32429.)。
指標とされるタンパク質がCdc6である場合は、例えば、Cell-free DNA replication assayを用いて、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(EMBO(1998)17,7219-7229.)。
指標とされるタンパク質がCdt1である場合は、例えば、該タンパク質とGemininとの結合を検出することによって、あるいはCell-free DNA replication assayを用いて、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Science(2000)290,2309-2312.)。
指標とされるタンパク質がGemininである場合は、例えば、Cell-free DNA replication assayを用いたDNA複製阻害活性を検出することにより、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1998)93,1043-1053.)。
指標とされるタンパク質がMcm3である場合は、例えば、該タンパク質を含むMcm2,3,5複合体によるMcm4,6,7のhelicase活性阻害活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1998)273,8369-8375.)。
指標とされるタンパク質がMcm4である場合は、例えば、該タンパク質を含むMcm4,6,7複合体によるssDNA結合活性、ATPase活性、Helicase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1997)272,24508-24513.)。
指標とされるタンパク質がMcm5である場合は、例えば、該タンパク質を含むMcm2,3,5複合体によるMcm4,6,7のhelicase活性阻害活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1998)273,8369-8375.)。
指標とされるタンパク質がMcm6である場合は、例えば、該タンパク質を含むMcm4,6,7複合体によるssDNA結合活性、ATPase活性、Helicase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1997)272,24508-24513.)。
指標とされるタンパク質がMcm7である場合は、例えば、該タンパク質を含むMcm4,6,7複合体によるssDNA結合活性、ATPase活性、Helicase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1997)272,24508-24513.)。
指標とされるタンパク質がMcm8である場合は、例えば、該タンパク質とMcm4,6,7複合体との結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic.Acids Res.(2003)31,570-579.)。
指標とされるタンパク質がCdc7である場合は、例えば、MCM複合体を基質とした該タンパク質のリン酸化活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(EMBO(1997)16,4340-4351.)。
指標とされるタンパク質がcdc5である場合は、例えば、該タンパク質の転写活性化能を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1998)273,4666-4671.)。
指標とされるタンパク質がPsf1である場合は、例えば、該タンパク質を含むPsf1-4とSld5によるGINS複合体形成、GINSによるDpb11,Sld3,Cdc47のOri配列への結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genes&Dev. (2003)17,1153-1165.)。
指標とされるタンパク質がPsf2である場合は、例えば、該タンパク質を含むPsf1-4とSld5によるGINS複合体形成、GINSによるDpb11,Sld3,Cdc47のOri配列への結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genes&Dev. (2003)17,1153-1165.)。
指標とされるタンパク質がPsf3である場合は、例えば、該タンパク質を含むPsf1-4とSld5によるGINS複合体形成、GINSによるDpb11,Sld3,Cdc47のOri配列への結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genes&Dev. (2003)17,1153-1165.)。
指標とされるタンパク質がCdc45である場合は、例えば、該タンパク質とMcm7、Pola p70との結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Eur.J.Biochem.265,936-943.)。
指標とされるタンパク質がPola p180である場合は、例えば、該タンパク質を含むPola p180、p70、p58、p48による4量体形成、あるいはこの複合体のPrimerse、Polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Eur.J.Biochem.222,781-793.)。
指標とされるタンパク質がPola p70である場合は、例えば、該タンパク質を含むPola p180、p70、p58、p48による4量体形成、あるいはこの複合体のPrimase、Polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Eur.J.Biochem.222,781-793.)。
指標とされるタンパク質がPola Spp1(p58)である場合は、例えば、該タンパク質を含むPola p180、p70、p58、p48による4量体形成、あるいはこの複合体のPrimase、Polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Eur.J.Biochem.222,781-793.)。
指標とされるタンパク質がRPA70である場合は、例えば、該タンパク質のssDNAへの結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(1997)385,176-181.)。
指標とされるタンパク質がRPA34である場合は、例えば、該タンパク質のssDNAへの結合を検出することによって、あるいは該タンパク質を含むin vitro replication assayを用いて、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる。JBC(1990)265,3177-3182.
指標とされるタンパク質がPCNAである場合は、例えば、該タンパク質を含むin vitro replication assayを用いて、、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC (1990) 265,3177-3182.)。
指標とされるタンパク質がLigase1である場合は、例えば、該タンパク質を含むDNA ligation活性によって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1990)87,6679-6683.)。
指標とされるタンパク質がPole Pol2である場合は、例えば、該タンパク質を含むPole精製標品のDNA合成活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS 1990 87: 6664-6668.)。
指標とされるタンパク質がPole Dpb3である場合は、例えば、該タンパク質を含むPole精製標品のDNA合成活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS 1990 87: 6664-6668.)。
指標とされるタンパク質がTopoisomerase1である場合は、例えば、plasmid DNAを基質とした該タンパク質のリラクシング活性を検出することよって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1988)85,2543-2547.)。
指標とされるタンパク質がTDP1である場合は、例えば、ssDNAの3’末端に結合させたチロシン残基の、該タンパク質による遊離活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Science(1999)286,552-555.)。
指標とされるタンパク質がFEN1である場合は、例えば、5’-overhanging flap構造をもつ二本鎖DNAを基質とした、flap構造の除去活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genomics(1995)25,220-225.)。
指標とされるタンパク質がPold P125である場合は、例えば、該タンパク質とPold P68, P50, P12とのヘテロ4量体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Biochemistry. 2002 41(44):13133-13142.)。
指標とされるタンパク質がPole Dpb4である場合は、該タンパク質を含むPole精製標品のDNA合成活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS 1990 87: 6664-6668.)。
指標とされるタンパク質がDNA2である場合は、例えば、ssDNA結合能、ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1995)92,7642-7646.)。
指標とされるタンパク質がATRである場合は、例えば、UV損傷部位をもった二本鎖DNAへの該タンパク質の結合、あるいはp53タンパク質を基質とした該タンパク質によるリン酸化を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS (2002) 99, 6673-6678.)。
指標とされるタンパク質がChk1である場合は、例えば、p53タンパク質を基質とした該タンパク質によるリン酸化を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genes Dev. (2000) 14, 289-300)。
指標とされるタンパク質がNBS1である場合は、例えば、DNA損傷に応答した該タンパク質とMre11/Rad50との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1998)93,477-486.)。
指標とされるタンパク質がHus1である場合は、例えば、DNA損傷に応答した該タンパク質とRad1,Rad9との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(1999)274,567-570.)。
指標とされるタンパク質がRad1である場合は、例えば、DNA損傷に応答した該タンパク質とRad1,Rad9との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(1999)274,567-570.)。
指標とされるタンパク質がMad2である場合は、例えば、該タンパク質とMad1との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Science274 (1996)246-248)。
指標とされるタンパク質がCtf18である場合は、例えば、該タンパク質とCtf8,Dcc1との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2003)30051-30056.)。
指標とされるタンパク質がScc1である場合は、例えば、該タンパク質とSmc1,Smc3,Scc1との14S cohesin複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(2000)151,749-761.)。
指標とされるタンパク質がScc3である場合は、例えば、該タンパク質とSmc1,Smc3,Scc1との14S cohesin複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(2000)151,749-761.)。
指標とされるタンパク質がUNGである場合は、例えば、ssDNA中のdeoxyuridineを基質としたグリコシラーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(EMBO(1989)8,3121-3125.)。
指標とされるタンパク質がMBD4である場合は、例えば、該タンパク質のメチル化CpG配列への結合活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(MCB(1998)18,6538-6547.)。
指標とされるタンパク質がNTH1である場合は、例えば、該タンパク質のグリコシラーゼ活性やAP lyase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1997)94,109-114.)。
指標とされるタンパク質がNEIL2である場合は、例えば、塩基に損傷をもったDNAを基質とした該タンパク質のAP lyase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2002)277,30417-30420.)。
指標とされるタンパク質がNEIL3である場合は、例えば、8-oxo, AP site, 5-ヒドロキシシトシンを含むDNAを基質とした該タンパク質のAP lyase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res.(2002)316,853-866.)。
指標とされるタンパク質がAPE2である場合は、例えば、該タンパク質のAP endonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JMB(2002)316,853-866.)。
指標とされるタンパク質がPARP1である場合は、例えば、ADP-riboseを基質とした該タンパク質のニックDNA へのADP-ribose polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1990)35,21907-21913.)。
指標とされるタンパク質がPNKである場合は、例えば、ologo(dT)を基質にしたpolynucleotide kinase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1999)274,24176-24186.)。
指標とされるタンパク質がPolbである場合は、例えば、該タンパク質のgap-filling polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Biochemistry(1988)901-909.)。
指標とされるタンパク質がMGMTである場合は、例えば、該タンパク質によるメチル化DNAからのメチル基転移反応を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1990)265,14754-14762.)。
指標とされるタンパク質がTDGである場合は、例えば、該タンパク質によるミスマッチチミジンの切断活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1993)268,21218-21224.)。
指標とされるタンパク質がMSH2である場合は、例えば、該タンパク質のミスマッチを含む二本鎖DNAへの結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cancer Res.(1994)54,5539-5542.)。
指標とされるタンパク質がPMS1である場合は、例えば、該タンパク質のDNA結合能、ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res. (2003) 31, 2025-2034.)。
指標とされるタンパク質がPMS2である場合は、例えば、該タンパク質とMLH1との相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Hum.Mutat.19,108-113.)。
指標とされるタンパク質がExonuclease1である場合は、例えば、該タンパク質のexonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res.(1998)26,3762-3768.)。
指標とされるタンパク質がXPCである場合は、例えば、該タンパク質のssDNAへの結合能を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(EMBO(1994)15,1831-1843.)。
指標とされるタンパク質がRad23Aである場合は、例えば、該タンパク質のN末端での26S proteasomeとの相互作用、C末端でのRad4との結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(1998)391,715-718.)。
指標とされるタンパク質がRad23Bである場合は、例えば、該タンパク質のN末端での26S proteasomeとの相互作用、C末端でのRad4との結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(1998)391,715-718.)。
指標とされるタンパク質がCSAである場合は、例えば、該タンパク質とCSB,TFIIHとの相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1995)82,555-564.)。
指標とされるタンパク質がCSBである場合は、例えば、該タンパク質のDNA依存的ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1997)272,1885-1890.)。
指標とされるタンパク質がXPGである場合は、例えば、バブル構造をもつpartial duplexを基質とした該タンパク質のendonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(1994)371,423-425.)。
指標とされるタンパク質がXPFである場合は、例えば、該タンパク質とERCC1との複合体形成、stem-loop構造DNAを基質とした該タンパク質のendonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1996)86,811-822.)。
指標とされるタンパク質がDDB1である場合は、例えば、該タンパク質のUV照射DNAへの結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(1993)268,21293-21300.)。
指標とされるタンパク質がXAB2である場合は、例えば、該タンパク質とXPA, CSA, CSB, RNA polymeraseIIとの相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2000)275,34931-34937.)。
指標とされるタンパク質がDDB2である場合は、例えば、該タンパク質のUV損傷DNAへの結合活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(DNA repair(2002)6,601-616.)。
指標とされるタンパク質がTopoisomeraseIIIbである場合は、例えば、RecQ5 helicaseとの相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res. (2000) 28, 1647-1655.)。
指標とされるタンパク質がRad51である場合は、例えば、該タンパク質のssDNA依存性ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2002)277,14417-14425.)。
指標とされるタンパク質がRad51Dである場合は、例えば、該タンパク質を含むRad51B/ Rad51C/ Rad51D/Xrcc2複合体のssDNAへの結合能、ssDNA依存的ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Genes.Dev.(2001)15,329-3307.)。
指標とされるタンパク質がXRCC2である場合は、例えば、該タンパク質を含むRad51B/ Rad51C/ Rad51D/Xrcc2複合体のssDNAへの結合能、ssDNA依存的ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(1999)401,397-399.)。
指標とされるタンパク質がRad54である場合は、例えば、該タンパク質のDNA依存的ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Curr.Biol(1996)6,828-838.)。
指標とされるタンパク質がBRCA1である場合は、例えば、該タンパク質のE3 ubiquitin ligase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(EMBO J. (2002) 21, 6755-6762.)。
指標とされるタンパク質がKu80である場合は、例えば、該タンパク質のDNA末端への結合、およびKu70との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1990)87,1777-1781.)。
指標とされるタンパク質がXRCC4である場合は、例えば、該タンパク質とLigase4との結合、および該タンパク質のDNA結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1995)83,1079-1089.)。
指標とされるタンパク質がUbc13である場合は、例えば、該タンパク質のユビキチンconjugating活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Cell(1999)96,645-653.)。
指標とされるタンパク質がRad6Aである場合は、例えば、該タンパク質とRad18との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(PNAS(1991)88,8865-8869.)。
指標とされるタンパク質がRad18である場合は、例えば、該タンパク質のDNA結合を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic.Acids Res.(2000)28,2847-2854.)。
指標とされるタンパク質がFBH1である場合は、例えば、該タンパク質のhelicase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JCB(2002)277,24530-24537.)。
指標とされるタンパク質がPoliである場合は、例えば、ミスマッチpartial duplex DNAからのprimer extension活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2001)276,30615-30622.)。
指標とされるタンパク質がDUT1である場合は、例えば、該タンパク質のdUTPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(J. Biol. Chem., (1996) 271, 7745-7751.)。
指標とされるタンパク質がTin2である場合は、例えば、該タンパク質とTRF1との相互作用を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nat Genet(1999)23,405-412.)。
指標とされるタンパク質がSir2である場合は、例えば、該タンパク質のヒストン脱アセチル化アッセイによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Gene(1999)234,161-168.)。
指標とされるタンパク質がElg1である場合は、例えば、該タンパク質とRFC2、RFC3、RFC4、RFC5との複合体形成を検出する事によって、該タンパク質の機能を評価する事ができる(EMBO J. (2003) 22, 4304-4313.)。
指標とされるタンパク質がTIMELESSである場合は、例えば、該タンパク質とmammalian clock Period proteins (mPERs)との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Science (2003) 302, 439-442.)。
指標とされるタンパク質がPif1である場合は、例えば、該タンパク質のATP依存的helicase活性、DNA依存的ATPase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる。
指標とされるタンパク質がMms4である場合は、例えば、該タンパク質とMus81タンパク質と複合体が有するendonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2003)278,21715-21720.)。
指標とされるタンパク質がTopoisomeraseIIIaである場合は、例えば、該タンパク質のtopoisomerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nucleic Acids Res.(2002)30,4823-4829.)。
指標とされるタンパク質がMus81である場合は、例えば、該タンパク質とMms4タンパク質との複合体が有するendonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(JBC(2003)278,21715-21720.)。
指標とされるタンパク質がSIRT1である場合は、例えば、該タンパク質のNAD依存性histone deacetylaseを検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Nature(2000)403,795-800.)。
指標とされるタンパク質がESP1である場合は、例えば、該タンパク質のプロテアーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(FEBS Lett.(2002)528,246-250.)。
指標とされるタンパク質がMPGである場合は、例えば、該タンパク質のglycosylase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Carcinogenesis(1996)17,2177-2182.)。
指標とされるタンパク質がPollである場合は、例えば、該タンパク質のDNA polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(J Biol Chem.(2000)275,31233-31238.)。
指標とされるタンパク質がPolmである場合は、例えば、該タンパク質のDNA polymerase活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(J Biol Chem.(2002)277,44582-44587.)。
指標とされるタンパク質がEndoVである場合は、例えば、該タンパク質のendonuclease活性を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる。
指標とされるタンパク質がKNTC2 (NDC80)である場合は、例えば、該タンパク質とヒトNuf2タンパク質との複合体形成を検出することによって、該タンパク質の機能を評価(測定)することができる(Mol Biol Cell.(2005)16,519-531.)。
次いで、被検化合物の非存在下において測定した場合と比較して、染色体安定化関連遺伝子によってコードされるタンパク質の活性を低下させる化合物を選択する。上記方法に使用する該遺伝子によってコードされるタンパク質は、変異を含まない全長タンパク質であることが好ましいが、該タンパク質と同等の活性を有するものであれば、一部のアミノ酸配列が置換および/あるいは欠失されたタンパク質であってもよい。
また本発明は、本発明の癌細胞特異的アポトーシス誘導剤を有効成分として含有する抗癌剤(癌治療のための医薬組成物)を提供する。
さらに本発明は、アポトーシス誘導剤もしくは抗癌剤を医薬組成物として製造する方法を提供する。本方法においてはまず、本発明の上記スクリーニング方法によって、癌細胞特異的アポトーシス誘導剤となる化合物を選択する。次いで、選択された化合物を薬学上許容される担体と混合する。これら薬学上許容される担体として、例えば界面活性剤、賦形剤、着色料、着香料、保存料、安定剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、矯味剤等が挙げられるが、これらに制限されず、その他常用の担体を適宜使用することができる。
本発明のアポトーシス誘導剤もしくは抗癌剤等の薬剤の製剤化にあたっては、常法に従い、必要に応じて上記担体を添加することができる。具体的には、軽質無水ケイ酸、乳糖、結晶セルロース、マンニトール、デンプン、カルメロースカルシウム、カルメロースナトリウム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルアセタールジエチルアミノアセテート、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、中鎖脂肪酸トリグリセライド、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油60、白糖、カルボキシメチルセルロース、コーンスターチ、無機塩類等を挙げることができる。
上記薬剤の剤型の種類としては、例えば経口剤として錠剤、粉末剤、丸剤、散剤、顆粒剤、細粒剤、軟・硬カプセル剤、フィルムコーティング剤、ペレット剤、舌下剤、ペースト剤等、非経口剤として注射剤、坐剤、経皮剤、軟膏剤、硬膏剤、外用液剤等が挙げられ、当業者においては投与経路や投与対象等に応じた最適の剤型を選ぶことができる。染色体安定化関連遺伝子(例えば、上記のいずれかに記載の遺伝子)によってコードされるタンパク質を発現するDNA、染色体安定化関連遺伝子を抑制するアンチセンスRNA、リボザイム、siRNAを発現するDNAを生体内に投与する場合、レトロウイルス、アデノウイルス、センダイウイルスなどのウイルスベクターやリポソームなどの非ウイルスベクターを利用することができる。また、染色体安定化関連遺伝子を抑制する合成アンチセンス核酸や合成siRNAを生体内に投与する場合、リポソーム、高分子ミセル、カチオン性キャリアなどの非ウイルスベクターを利用することができる。投与方法としては、例えばin vivo法およびex vivo法を挙げることができる。
本発明には、アポトーシス誘導作用を有する上記の医薬組成物も含まれる。
本発明の薬剤または医薬組成物の投与量は、剤型の種類、投与方法、患者の年齢や体重、患者の症状等を考慮して、最終的には医師の判断により適宜決定することができる。
また本発明は、所望の癌細胞についてアポトーシスを誘導する方法に関する。該方法の好ましい態様としては、アポトーシスを誘導させたい細胞(対象細胞)へ、本発明のアポトーシス誘導剤を投与する(接触させる)工程を含む、該細胞のアポトーシスを誘導する方法である。例えば、本発明のアポトーシス誘導剤の有効成分が核酸である場合には、該薬剤(核酸)を対象細胞内へ導入させることが好ましい。
さらに本発明は、本発明のアポトーシス誘導剤もしくは本発明の抗癌剤を個体(癌患者等)へ投与する工程を含む、癌の治療方法に関する。
上記の治療方法における個体とは、通常、癌疾患の患者を指し、特に制限されないが、好ましくはヒトである。個体への投与は、一般的には、例えば、動脈内注射、静脈内注射、皮下注射など当業者に公知の方法により行うことができる。投与量は、患者の体重や年齢、投与方法などにより変動するが、当業者であれば適当な投与量を適宜選択することが可能である。また、該化合物がDNAによりコードされうるものであれば、該DNAを遺伝子治療用ベクターに組込み、遺伝子治療を行うことも考えられる。遺伝子治療用ベクターとしては、例えば、レトロウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターなどのウイルスベクターやリポソームなどの非ウイルスベクターなどを例示することができる。該ベクターを利用して、ex vivo法やin vivo法などにより患者へ目的のDNAの投与を行うことができる。また本発明の核酸を直接、個体へ投与することも可能である。
さらに本発明は、染色体の安定化を阻害する化合物(例えば、本発明の遺伝子の発現、または該遺伝子によってコードされるタンパク質の機能を抑制する化合物等)のアポトーシス誘導剤もしくは抗癌剤の製造における使用に関する。
なお、本明細書において引用された全ての先行技術文献は、参照として本明細書に組み入れられる。
以下、実施例により本発明を具体的に説明するが、本発明は、これに限定されるものではない。
本実施例において「染色体安定化に関連する遺伝子」として用いた遺伝子は、以下に示す97個の遺伝子である:
APE2、ATR、BRCA1、Chk1、Cdc5、Cdc6、Cdc7、Cdc45、Cdt1、CSA、CSB、Ctf18、DDB1、DDB2、DNA2、DUT、Elg1、EndoV、Esp1、Exonuclease1、FBH1、FEN1、Geminin、Hus1、KNTC2 (NDC80)、Ku80、Ligase1、Mad2、MBD4、Mcm3、Mcm4、Mcm5、Mcm6、Mcm7、Mcm8、Mcm10、MGMT、MLH3、Mms4、MPG、MSH2、Mus81、NBS1、NEIL2、NEIL3、NTH1、Orc1、Orc3、PARP1、PCNA、Pif1、PMS1、PMS2、PNK、Pola p180、Pola p70、Pola Spp1(Prim2a)、Polb、Pold p125、Pole Dpb3、Pole Dpb4、Pole Pol2、Poli、Poll、Polm、Psf1、Psf2、Psf3、Rad1、Rad18、Rad23A、Rad23B、Rad51、Rad51D、Rad54、Rad6A、RPA34、RPA70、Scc1、Scc3、Sir2、SIRT1 (Sirtuin)、TDG、TDP1、TIMELESS、Tin2、Topoisomerase I、Topoisomerase IIIa、Topoisomerase IIIb、Ubc13、UNG、XAB2、XPC、XPF、XPG、Xrcc2、XRCC4
〔実施例1〕 細胞培養
ヒト培養細胞として、HeLa(ヒト子宮頸部癌細胞)、TIG3(正常二倍体線維芽細胞)を使用した。これらのヒト培養細胞を10% 牛胎児血清、50μg/mlゲンタマイシンを含むDulbecco's modified Eagle's mediumで37度、5% CO2条件下で培養した。
〔実施例2〕 染色体安定化に関連する遺伝子の発現抑制が癌細胞の増殖に及ぼす影響の検討
染色体安定化に関連する遺伝子の発現抑制が癌細胞の増殖に及ぼす影響を検討する目的で、上記各遺伝子に対するsiRNAを選定した。siRNAの合成は、株式会社キアゲン(東京)および、Dhamacon, Inc. (Colorado, USA)において行われた。
上記各遺伝子のsiRNA配列を図1〜4の「siRNA配列」の列に示す。なお、配列表にはセンス鎖のみ記載し、対応するアンチセンス鎖は配列表から省略した。また、各siRNA配列の「dTdT」の記載は配列表では「TT」と省略した。
これらsiRNAをヒト子宮頸部癌由来HeLa細胞に導入した。具体的には、siRNAのトランスフェクションを行う24時間前に、24ウエルプレートにHeLa細胞を播種して生着させ、20−50%コンフレントの状態でトランスフェクションを行った。トランスフェクション試薬として、Oligofectoamine (Invitrogen)を使用し、添付のマニュアルに従ってトランスフェクションを行った。導入48時間後に上記各遺伝子のmRNAの発現をTaqman PCRにより定量した。
詳しくは、siRNAをトランスフェクション後、48時間の細胞から、RNeasy Mini Kit(Qiagen)を用いて、全RNAを抽出した。定量的PCRには、ABI PRISM 7000 Sequence Detection System (Applied Biosystems)を用いた。上記各遺伝子および、β-アクチン遺伝子のRT-PCR用プライマーおよび、TaqManプローブを、Applied Biosystemsより購入した。RT-PCR反応試薬として、TaqMan One-Step RT-PCR Master Mix Reagents Kit (Applied Biosysytems)を用い、添付のマニュアルに従いRT-PCRを行った。β-アクチンを標準として用いて、比較定量を行った。
コントロールRNA(NS)を導入した細胞における各mRNAの発現を100%として、各siRNAを導入した細胞における各mRNAの発現を比較したところ、図1〜4の「HeLa細胞における遺伝子発現抑制」の列に示すように、各遺伝子に対するsiRNAはそれぞれのmRNA発現を効率的に抑制した。
〔実施例3〕 HeLa細胞の生存率
実施例2で選定した上記各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれHeLa細胞に導入し、導入4日後の細胞生存率をMTTアッセイにより調べた。導入96時間後の生細胞数を、生細胞数測定試薬SF(ナカライテスク)を用いて測定した。
その結果、図1〜4の「MTTアッセイ(HeLa細胞)」の列に示すように、上記各遺伝子のsiRNAを導入したHeLa細胞において、顕著な生存率の低下が認められた。
〔実施例4〕 siRNAのHeLa細胞におけるアポトーシス誘導効果
上記各遺伝子に対するsiRNAを導入したHeLa細胞における生存率の低下がアポトーシスによるものかどうかを調べた。各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれHeLa細胞に導入し、TUNEL法を用いて導入48時間後のHeLa細胞におけるアポトーシス誘導を検討した。
結果、図1〜4の「Tunel法」の列、および図5から図9の写真に示すように、上記各遺伝子に対するsiRNAを導入したHeLa細胞全てにおいて、顕著にアポトーシスの誘導が認められた。一方、コントロールRNA(NS)が導入されたHeLa細胞ではアポトーシスの誘導は認められなかった(図5の左上「非特異的」)。
即ち、本発明の上記の各遺伝子の発現を抑制することにより、効果的なアポトーシスの誘導が起こることが明らかとなった。
〔実施例5〕 siRNAが正常細胞の増殖に及ぼす影響
上記各遺伝子に対するsiRNAが正常細胞であるヒト胎児肺由来二倍体線維芽細胞株TIG3細胞の増殖に及ぼす影響を検討した。トランスフェクション試薬としてLipofectoamine2000 (Invitrogen)を用い、TIG3細胞に上記各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれ導入し、導入48時間後に上記各遺伝子のmRNAの発現をTaqman PCRにより測定した。この実験ではコントロールRNA(NS)を導入したTIG3細胞における各mRNAの発現を100%として、各siRNAを導入したTIG3細胞における各mRNAの発現を比較した。
その結果、図1〜4の「TIG3細胞における遺伝子発現抑制」の列に示すように、各siRNAを導入したTIG3細胞では上記各遺伝子のmRNAの発現は、コントロールRNA(NS)を導入したTIG3細胞におけるこれらのmRNAの発現と比較して、顕著に抑制されていた。
〔実施例6〕 TIG3細胞の生存率
上記のsiRNAをそれぞれTIG3細胞に導入し、導入4日後の細胞生存率をMTTアッセイにより調べた。その結果、図1〜4の「MTTアッセイ(TIG3細胞)」の列に示すように、上記各遺伝子に対するsiRNAを導入したTIG3細胞の生存率は、該siRNAを導入したHeLa細胞の生存率と比較して高く、顕著な低下は認められなかった。
上述の結果から、本発明の遺伝子の発現を抑制することによって、癌細胞特異的にアポトーシスが誘導されるものと考えられる。
〔実施例7〕 抗シングル鎖DNA抗体を用いたゲノム崩壊過程の解析
anti-ssDNA(抗シングル鎖DNA)抗体は、一本鎖DNAを特異的に認識する抗体である。本来、二重鎖からなるDNAにおいて、DNA損傷等の染色体不安定化によりゲノム構造が崩壊すると、部分的に一本鎖領域が露出されると言われている。したがって本抗体を用いることにより、このゲノムの崩壊過程を特異的に認識し、可視化することが可能である。
スライドガラス上にHeLa細胞を播種し、上記各遺伝子に対するsiRNAをトランスフェクションした。siRNA導入約30時間後に細胞をホルマリンにて固定し、一次抗体としてanti-ssDNA抗体を反応させた。anti-ssDNA抗体に対する蛍光標識抗体を二次抗体として用い、共焦点レーザー顕微鏡にて観察した。その結果、図10〜27に示すように、一本鎖DNAを有する核が緑色に染色された。
即ち、上記の各遺伝子の発現を抑制することにより、一本鎖DNAの生成を伴うDNA損傷が生じることが確認された。
〔実施例8〕 細胞培養
下記の実施例においては、「染色体安定化に関連する遺伝子」として、以下に示す11個の遺伝子を用いた。
Pif1、Mms4、TopoisomeraseIIIa、Mus81、SIRT1 (Sirtuin)、Esp1、MPG、Poll、Polm、EndoV、KNTC2(NDC80)
また、ヒト培養細胞として、実施例1に記載のHeLa細胞およびTIG3細胞の他に、正常細胞としてヒト皮膚由来二倍体線維芽細胞(HDF細胞)を使用した。培養は、実施例1と同様の条件にて行った。
〔実施例9〕 染色体安定化に関連する遺伝子の発現抑制が癌細胞の増殖に及ぼす影響の検討
染色体安定化に関連する上記11個の遺伝子の発現抑制が癌細胞の増殖に及ぼす影響を検討する目的で、上記各遺伝子に対するsiRNAを選定した。siRNAの合成は、実施例2と同様に行った。
上記11個の各遺伝子のsiRNA配列を図28〜32の「siRNA配列」の列に示す。なお、配列表にはセンス鎖のみ記載し、対応するアンチセンス鎖は配列表から省略した。
これらsiRNAをHeLa細胞へ導入した。具体的には、実施例2に記載の条件と同様にして実施した。導入48時間後に上記11遺伝子のmRNAの発現をTaqman PCRにより定量した。定量方法は実施例2と同様にして行った。
コントロールRNA(NS)を導入した細胞における各mRNAの発現を100%として、各siRNAを導入した細胞における各mRNAの発現を比較したところ、図28〜30の「40nM HeLa細胞における遺伝子発現抑制」の列、図31のHeLa細胞における「mRNA発現」の列、あるいは図32のHeLa細胞における「発現」の列に示すように、各遺伝子に対するsiRNAはそれぞれのmRNA発現を効率的に抑制した。
〔実施例10〕 HeLa細胞の生存率
上記11個の各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれHeLa細胞に導入し、導入4日後の細胞生存率をMTTアッセイにより調べた。導入96時間後の生細胞数を、生細胞数測定試薬SF(ナカライテスク)を用いて測定した。
その結果、図28〜30の「40nM HeLa細胞における増殖抑制」の列、図31のHeLa細胞における「増殖抑制」の列、あるいは図32のHeLa細胞における「増殖」の列に示すように、上記各遺伝子のsiRNAを導入したHeLa細胞において、顕著な生存率の低下が認められた。
〔実施例11〕 siRNAのHeLa細胞におけるアポトーシス誘導効果
上記11個の各遺伝子に対するsiRNAを導入したHeLa細胞における生存率の低下がアポトーシスによるものかどうかを調べた。各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれHeLa細胞に導入し、TUNEL法を用いて導入48時間後のHeLa細胞におけるアポトーシス誘導を検討した。
結果、図31のHeLa細胞における「アポトーシス」の列、図32のHeLa細胞における「アポトーシス」の列、さらに図33および34の「HeLa細胞」の写真、および図35のHeLa細胞のTUNEL染色の写真に示すように、上記各遺伝子に対するsiRNAを導入したHeLa細胞全てにおいて、顕著にアポトーシスの誘導が認められた。
即ち、本発明の上記の各遺伝子の発現を抑制することにより、効果的なアポトーシスの誘導が起こることが明らかとなった。
〔実施例12〕 siRNAが正常細胞の増殖に及ぼす影響
上記11個の各遺伝子に対するsiRNAが正常細胞であるヒト胎児肺由来二倍体線維芽細胞株TIG3細胞あるいはヒト皮膚繊維芽細胞株HDF細胞の増殖に及ぼす影響を検討した。トランスフェクション試薬としてLipofectoamine2000 (Invitrogen)を用い、TIG3細胞あるいはHDF細胞に上記各遺伝子に対するsiRNAをそれぞれ導入し、導入48時間後に上記各遺伝子のmRNAの発現をTaqman PCRにより測定した。この実験ではコントロールRNA(NS)を導入したTIG3細胞あるいはHDF細胞における各mRNAの発現を100%として、各siRNAを導入したTIG3細胞あるいはHDF細胞における各mRNAの発現を比較した。
その結果、図28〜30の「40 nM TIG3細胞における遺伝子発現抑制」の列、図31のHDF細胞における「mRNA発現」の列、あるいは図32のHDF細胞における「発現」の列に示すように、各siRNAを導入したTIG3細胞あるいはHDF細胞では上記各遺伝子のmRNAの発現は、コントロールRNA(NS)を導入したTIG3細胞あるいはHDF細胞におけるこれらのmRNAの発現と比較して、顕著に抑制されていた。
〔実施例13〕 TIG3細胞あるいはHDF細胞の生存率
上記11個の各遺伝子のsiRNAをそれぞれTIG3細胞あるいはHDF細胞に導入し、導入4日後の細胞生存率をMTTアッセイにより調べた。その結果、図28〜30の「40 nM TIG3細胞における増殖抑制」の列、図31のHDF細胞における「増殖抑制」の列、あるいは図32のHDF細胞の「増殖」の列に示すように、上記各遺伝子に対するsiRNAを導入したTIG3細胞あるいはHDF細胞の生存率は、該siRNAを導入したHeLa細胞の生存率と比較して高く、顕著な低下は認められなかった。
上述の結果から、本発明の遺伝子の発現を抑制することによって、癌細胞特異的にアポトーシスが誘導されるものと考えられる。
〔実施例14〕 抗シングル鎖DNA抗体を用いたゲノム崩壊過程の解析
スライドガラス上にHeLa細胞を播種し、Pif1、Mms4、TopoisomeraseIIIa、Mus81、SIRT1 (Sirtuin)、Esp1、MPG、Poll、Polm、EndoVの各遺伝子に対するsiRNAをトランスフェクションした。siRNA導入約30時間後に細胞をホルマリンにて固定し、一次抗体としてanti-ssDNA抗体を反応させた。anti-ssDNA抗体に対する蛍光標識抗体を二次抗体として用い、共焦点レーザー顕微鏡にて観察した。その結果、図36に示すように、一本鎖DNAを有する核が緑色に染色された。
即ち、上記の各遺伝子の発現を抑制することにより、一本鎖DNAの生成を伴うDNA損傷が生じることが確認された。