JP2010521154A5 - - Google Patents
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Description
特定の実施形態では、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法を提供する。特定の実施形態では、当該方法は、上記腫瘍のサンプルにおけるK−ras変異の有無を決定するステップであって、該K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、B−raf変異の有無を決定するステップであって、該B−raf変異はコドン600にあるステップとを含む。特定の実施形態では、K−ras変異およびB−raf変異のうちの少なくとも1つの存在が、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に該腫瘍が無反応であることを示唆する。
本発明は例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてK−ras変異の有無を決定するステップを含み、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあり、かつK−ras変異が存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目2)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目1に記載の方法。
(項目4)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目3に記載の方法。
(項目5)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含む、項目1に記載の方法。
(項目6)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択される、項目1に記載の方法。
(項目7)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップを含み、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあり、かつ前記K−ras変異の存在は、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に前記腫瘍が無反応であることを示唆する、方法。
(項目8)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目7に記載の方法。
(項目9)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目7に記載の方法。
(項目10)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含む、項目7に記載の方法。
(項目12)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択される、項目7に記載の方法。
(項目13)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつB−raf変異が存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目14)
腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目13に記載の方法。
(項目16)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目15に記載の方法。
(項目17)
腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目13に記載の方法。
(項目18)
前記B−raf変異がV600Eである、項目13に記載の方法。
(項目19)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつ前記B−raf変異の存在が、前記腫瘍がEGFrポリペプチド特異的結合剤に無反応であることを示唆する、方法。
(項目20)
前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目19に記載の方法。
(項目21)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目19に記載の方法。
(項目22)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記腫瘍の前記サンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目19に記載の方法。
(項目24)
前記B−raf変異がV600Eである、項目19に記載の方法。
(項目25)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、前記患者の腫瘍においてB−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、K−ras変異およびB−raf変異のうちの少なくとも1つが存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目26)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目25に記載の方法。
(項目28)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目27に記載の方法。
(項目29)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目25に記載の方法。
(項目30)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、項目25に記載の方法。
(項目31)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、B−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、かつ前記K−ras変異および前記B−raf変異のうちの少なくとも1つの存在が、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に前記腫瘍が無反応であることを示唆する、方法。
(項目32)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目31に記載の方法。
(項目33)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目31に記載の方法。
(項目34)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目33に記載の方法。
(項目35)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目31に記載の方法。
(項目36)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、項目31に記載の方法。
本発明は例えば、以下の項目を提供する:
(項目1)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてK−ras変異の有無を決定するステップを含み、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあり、かつK−ras変異が存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目2)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目1に記載の方法。
(項目3)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目1に記載の方法。
(項目4)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目3に記載の方法。
(項目5)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含む、項目1に記載の方法。
(項目6)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択される、項目1に記載の方法。
(項目7)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップを含み、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあり、かつ前記K−ras変異の存在は、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に前記腫瘍が無反応であることを示唆する、方法。
(項目8)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目7に記載の方法。
(項目9)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目7に記載の方法。
(項目10)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目9に記載の方法。
(項目11)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含む、項目7に記載の方法。
(項目12)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択される、項目7に記載の方法。
(項目13)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつB−raf変異が存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目14)
腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目13に記載の方法。
(項目15)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目13に記載の方法。
(項目16)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目15に記載の方法。
(項目17)
腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目13に記載の方法。
(項目18)
前記B−raf変異がV600Eである、項目13に記載の方法。
(項目19)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつ前記B−raf変異の存在が、前記腫瘍がEGFrポリペプチド特異的結合剤に無反応であることを示唆する、方法。
(項目20)
前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目19に記載の方法。
(項目21)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目19に記載の方法。
(項目22)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目21に記載の方法。
(項目23)
前記腫瘍の前記サンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目19に記載の方法。
(項目24)
前記B−raf変異がV600Eである、項目19に記載の方法。
(項目25)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に患者が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記患者の腫瘍においてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、前記患者の腫瘍においてB−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、K−ras変異およびB−raf変異のうちの少なくとも1つが存在する場合は、前記患者はEGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に無反応であることが予測される、方法。
(項目26)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目25に記載の方法。
(項目27)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目25に記載の方法。
(項目28)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目27に記載の方法。
(項目29)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目25に記載の方法。
(項目30)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、項目25に記載の方法。
(項目31)
EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかを予測する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、B−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、かつ前記K−ras変異および前記B−raf変異のうちの少なくとも1つの存在が、EGFrポリペプチド特異的結合剤を用いる治療に前記腫瘍が無反応であることを示唆する、方法。
(項目32)
前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、項目31に記載の方法。
(項目33)
前記EGFrポリペプチド特異的結合剤が、EGFrに対する抗体である、項目31に記載の方法。
(項目34)
前記EGFrに対する抗体がパニツムマブである、項目33に記載の方法。
(項目35)
腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、項目31に記載の方法。
(項目36)
前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、項目31に記載の方法。
Claims (20)
- パニツムマブを用いる治療に患者が無反応であるかどうかの予測を支援する方法であって、前記患者由来の腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつ前記B−raf変異の存在は、前記患者がパニツムマブを用いる治療に無反応であることを示す、方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍のサンプルからB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、請求項1に記載の方法。
- 前記B−raf変異がV600Eである、請求項1に記載の方法。
- 前記腫瘍のサンプルが結腸直腸腫瘍サンプルである、請求項1に記載の方法。
- パニツムマブを用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかの予測を支援する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定するステップを含み、前記B−raf変異はコドン600にあり、かつ前記B−raf変異の存在が、前記腫瘍がパニツムマブに無反応であることを示唆する、方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍からB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、請求項6に記載の方法。
- 前記腫瘍の前記サンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、請求項6に記載の方法。
- 前記B−raf変異がV600Eである、請求項6に記載の方法。
- 前記腫瘍が結腸直腸腫瘍である、請求項6に記載の方法。
- パニツムマブを用いる治療に患者が無反応であるかどうかの予測を支援する方法であって、前記患者由来の腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、前記患者由来の腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、K−ras変異およびB−raf変異のうちの少なくとも1つの存在は、前記患者がパニツムマブを用いる治療に無反応であることを示す、方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍のサンプルからK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍のサンプルからB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、請求項11に記載の方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、請求項11に記載の方法。
- 前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、請求項11に記載の方法。
- 前記腫瘍のサンプルが結腸直腸腫瘍サンプルである、請求項11に記載の方法。
- パニツムマブを用いる治療に腫瘍が無反応であるかどうかの予測を支援する方法であって、前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定するステップであって、前記K−ras変異はコドン12またはコドン13にあるステップと、B−raf変異の有無を決定するステップであって、前記B−raf変異はコドン600にあるステップとを含み、かつ前記K−ras変異および前記B−raf変異のうちの少なくとも1つの存在が、パニツムマブを用いる治療に前記腫瘍が無反応であることを示唆する、方法。
- 前記腫瘍のサンプルにおいてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍のサンプルからK−ras核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含み、かつ前記腫瘍のサンプルにおいてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、前記腫瘍のサンプルからB−raf核酸を増幅するステップと、前記増幅された核酸の配列を決定するステップとを含む、請求項16に記載の方法。
- 腫瘍においてK−ras変異の有無を決定する前記ステップが、変異K−rasポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異K−rasポリペプチドを検出するステップを含み、かつ腫瘍においてB−raf変異の有無を決定する前記ステップが、変異B−rafポリペプチド特異的結合剤を用いて、前記腫瘍のサンプルにおいて変異B−rafポリペプチドを検出するステップを含む、請求項16に記載の方法。
- 前記K−ras変異が、G12S、G12V、G12D、G12A、G12C、G13A、およびG13Dから選択され、かつ前記B−raf変異がV600Eである、請求項16に記載の方法。
- 前記腫瘍が結腸直腸腫瘍である、請求項16に記載の方法。
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