JP2010518398A - 電気泳動を使用する迅速な均一系イムノアッセイ - Google Patents
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Abstract
Description
この出願は、米国特許法§119(e)の下、2007年2月7日に出願された、米国仮特許出願第60/899,831号(この全体の本文は、参考として本明細書に援用される)の利益を主張する。
本発明は、試料におけるタンパク質または他の標的分子の存在の検出および/またはその濃度決定のための方法、組成物、および/または装置に関する。その方法、組成物、および/または装置は、幅広い範囲の濃度にわたる標的分子(複数可)の検出および/または濃度測定に有効である。より具体的には、その方法は、現在の別法で可能であるものより、短時間(数分)かつ高感度で行うことができる。
流体中を移動する粒子(分子でもよい)は、その速度、(その水力学的半径により示される)そのサイズ、および流体の粘性に比例した摩擦力を受ける。方程式1(図2)に示されたこれの形式的表現は、ストークス方程式として知られている。
信頼のおける様式でタンパク質濃度を測定することの重要性は、抗体または抗体様分子を含む多数のアッセイの開発へと導いてきた。現在用いられている幅広い種類のイムノアッセイは、本明細書に参照により組み込まれている、Gosling(1990)によって詳細に記載されている。下記の説明は、結合作用物質として抗体を用いるが、多くの場合、Fab断片またはアプタマーを代わりに用いることができる。しかしながら、本明細書に記載された方法および組成物はそのように限定されず、他の代替実施形態において、結合作用物質は、例えば、生物学的受容体であってもよい。いくつかのそのような受容体(例えば、インスリン受容体、インスリン様成長因子1受容体、アセチルコリン受容体、GABA受容体、アンチオテンシン(antiotensin)受容体、グルカゴン受容体、ケモカイン受容体、サイトカイン受容体など)は当技術分野において周知であり、任意のそのような公知の受容体またはそれらのリガンド結合性断片を、特許請求に係る方法の実施に用いてもよい。
サンドイッチ酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)は、Rosalyn YalowおよびSolomon Bersonによってラジオイムノアッセイとして1950年代に初めて開発され、その主な利点として非常に高い特異性および精度を示す、タンパク質検出のゴールドスタンダードとみなされている(Gosling、1990年)。その主な欠点は、それにかかる時間、および必要とされる工程の数の多さである。手順は、一般的に、洗浄のストリンジェンシーおよびインキュベーション工程の長さに依存して、実施するのに2時間から6時間、かかる。
キャピラリー電気泳動は、イオン性緩衝液で満たされた長いキャピラリーにわたって、正電極および負電極を用いて電圧をかけ、それにより、荷電分子を一方の電極または他方の電極へ移動させることを含む(OdaおよびLanders、1997年)。一つのよく見られる厄介な問題は、「電気浸透流」として知られている。ガラスキャピラリーは、負荷電表面を有する傾向にあり、それは表面近くの溶液中の正荷電イオンに関係する。これらの正荷電イオンは負電極(陰極)へ移動し、それらと共にバルク溶液を引っ張っていく。この電気浸透流は全イオンを陰極へ移動させ(異なる速度ではあるが)、それらが流れ過ぎるとき、単一の検出器が電荷に関わらず全イオン種を分析することができるため、通常、うまく利用される。電気浸透流は、キャピラリー壁の電気的特性を変化させることによって、除去する、または逆転さえすることができる。
本出願は、垂直積層型電気泳動(vertical stacked electrophoresis)を含む、試料において標的分子の濃度を検出および決定するための迅速な高感度の方法を提供する。EVEIA技術の電気泳動的部分は、マイクロキャピラリーよりはるかに大きい容量および断面積の容器で行われるため、特許請求に係る方法は、試料に低濃度で存在する標的分子の検出を可能にする。特定の好ましい実施形態において、電気泳動は、最小水力学的半径(断面積を断面周囲長で割った値の2倍)が0.5mmまたはそれ以上のチューブ、チャネル、または他の容器で行うことができる。
1.対象となる標的に対する第1の結合作用物質を獲得し、対象となる標的への特異的結合に干渉しない様式でシグナル伝達物質をそれに結合体化する工程。この前記第1の結合作用物質は、モノクローナル抗体、抗体断片(例えば、Fab)、アプタマー、または対象となる標的への特異的結合を示す任意の他の分子もしくは分子の複合体であり得る。対象となる標的は、タンパク質、タンパク質複合体、または水溶液に可溶な任意の分子であり得る。シグナル伝達物質は、蛍光分子、放射標識、比色生成物を生じる酵素、電気的に検出可能な生成物を生じる酵素、または直接的か間接的かのいずれかで容易に検出および定量化することができる任意の分子もしくは分子の複合体であり得る。図9に示されているような1つの好ましい実施形態において、第1結合作用物質はモノクローナル抗体であり、シグナル伝達物質はフルオレセインである。
タンパク質トランスフェリンの検出
1.ヒトトランスフェリンへ特異的に結合するウサギ由来モノクローナル抗体をフルオレセインに結合体化し、結合体化された抗体を精製する。
2.トランスフェリンへの結合に関して第1抗体と競合せずにヒトトランスフェリンへ特異的に結合する第2ウサギ由来モノクローナル抗体をビオチンに結合体化し、結合体化された第2抗体を精製する。
3.本質的に非荷電のポリマーを含む導電性水溶液の2つの積層からなる垂直電気泳動チャンバーを調製する。これらの層は、混合を抑制するために上端から下端へ密度を増加させて配置される。上層は、反応緩衝液中のビオチン結合体化デキストランからなる(「捕獲層」)。下層は、反応緩衝液中のリニアポリアクリルアミドからなる(「スタッキング層」)。
4.これらの2つの結合体化抗体およびニュートラアビジンを試料と共に、フルオレセインに結合体化した抗体を1nMの濃度、ビオチンに結合体化した抗体を10nMの濃度、およびニュートラアビジンを10nMの濃度で混合する。この混合物を37℃で5分間、インキュベートする。
5.試料/抗体混合物を、工程3に記載された電気泳動チャンバーの捕獲層の上に層状に積み重ね、100V/cmの電位を5分間、かける。そのような装置についての1つの好ましい実施形態は、図14に示されている。
6.反応チャンバーを475nmの光で工程5の間に照射し、捕獲層とスタッキング層の界面近くの蛍光シグナルを、500nm高域フィルターを有するCCDカメラなどの蛍光検出器で測定する。シグナル伝達物質の総蛍光シグナルの1%に相当するシグナルが見出される。
7.計算(1%×1nM)は、トランスフェリンが少なくとも10pMの濃度で試料混合物に存在することを示す。
u=(1.6−19)(−10)(2×107)(1×107)=−3.2×10−4cm2/sV 。
概念実証
図15は、概念実証実験からのデータを示す。ニュートラアビジンの捕獲は、いかに、3層設計が、所望の標的を捕獲するように機能して、かつこれらの標的を検出のためのバンドへと集中させるかを実証している。以下の3つの層からなる、このアッセイのための標準電気泳動セルを調製した:最下層(「スタッキング層」)には、トリス酢酸緩衝液および7.5%グリセロール中のリニアポリアクリルアミドであった;中間層(「捕獲層」)には、トリス酢酸緩衝液および4%グリセロール中のビオチン化デキストランであった;ならびに最上層(「試料層」)には、トリス酢酸緩衝液中のFITC標識ニュートラアビジンであった。対照泳動において、捕獲層は、ビオチン化デキストランを含まない。
IL−6測定
生体分子濃度を測定するための記載された方法、装置、および組成物の適用の例としてIL−6を用いた。実証されているように、EVEIA方法は、約3pM〜1000pMの濃度を表す、ほぼ2.5濃度logに及ぶIL−6濃度の範囲にわたってほぼ直線的に増加するシグナルを発生することができる。
緩衝液リザーバと石英管の上端および下端との間に開口部を設けた、内径3mm×60mm石英管(電気泳動チャネル)を、陰極(上端)緩衝液リザーバと陽極(下端)緩衝液リザーバとの間にガスケットを介して取り付けた。リザーバと管端を、ガスケットを施した酢酸セルロース分子量カットオフ膜で仕切ることによって、リザーバと石英管開口部との間のバルク流体の流れを防止した。各リザーバを、7.5mlの50mMホウ酸ナトリウム、pH8.3で満たした。電気泳動チャネル内の流体を以下の緩衝ショ糖勾配として設定した:チャネルの下半分(陽極端)を、追加として7.5%w/vショ糖を含む泳動用緩衝液で満たし、スタッキング層と名付ける;追加として5.0%w/vショ糖を含む30μl容量の泳動用緩衝液、およびビオチンを結合体化した500nMリニアポリアクリルアミド(高分子量LPA−B)を、スタッキング層の上に重層し、捕獲層と名付ける。追加として2.0%ショ糖を含む泳動用緩衝液を捕獲層の上に重層して、電気泳動チャネルの上半分(陰極端)を満たした。泳動用緩衝液は、150mMベタイン、0.02%NP−40、0.01%アジ化ナトリウム、および24mMホウ酸ナトリウム、pH7.8で構成された。
IL−6用量反応アッセイで測定されたシグナルは、50μlアッセイ試料容量において1pMから1nMの間の範囲にあるIL−6濃度(1nM IL−6原液からの3.2倍希釈系列)で達成され、「IL−6無し」の対照を含んだ。各IL−6用量反応結合アッセイ試料をEppendorf(登録商標)チューブ内に構築した。5μlの10nMフルオレセイン標識抗IL−6モノクローナル抗体MAB206(R&D Systems、Minneapolis、MN)を5μlの適切なIL−6希釈液に加えた。室温での10分間のインキュベーション後、5ulの10nMビオチン化抗IL−6ポリクローナル抗体BAF206(R&D Systems)を加えた。室温でさらに10分間、インキュベートした後、7.5ulの500nMニュートラアビジン(Pierce Biotechnology、Rockford、IL)および追加として4.0%w/vショ糖を含む27.5μlの泳動用緩衝液を加えて、50μlの最終アッセイ試料容量とした。各50μlアッセイ試料容量における各抗体およびニュートラアビジンの濃度は、それぞれ、1nMおよび75nMであった。試料構築およびEVEIA方法は、図17に図示されている。
抗原をビオチン化捕獲抗体、蛍光標識検出抗体、およびニュートラアビジンと組み合わせることによってアッセイ試料を調製した。以下の3つの密度層で構成される緩衝ショ糖密度勾配で満たされた垂直電気泳動チャネル(例えば、上端陰極緩衝液リザーバと下端陽極緩衝液リザーバとの間に取り付けられた内径3mm×60mm石英管)へこの試料をゆっくり注入した:2%ショ糖を加えた泳動用緩衝液で構成される上端層、5%ショ糖を含む泳動用緩衝液およびビオチン化リニアポリアクリルアミド捕獲用ポリマー(LPA−B)で構成される小さな中間層(30μl)、ならびに7.5%ショ糖を含む泳動用緩衝液で構成される下端層。チャネルにわたる電圧(300〜900V)の印加によって、負イオン性アッセイ試料成分は、チューブの下端へ移動した。ニュートラアビジンの捕獲抗体への結合によるサンドイッチ複合体は、それらが中間層に到達したとき、高分子量LPA−Bに結合し、複合体の非常に低い移動度およびショ糖勾配によってこの中間層内に本質的に固定化される。結合していない検出抗体を含む、結合していないアッセイ試料成分は、電気泳動チャネルの下端へ電気泳動的に移動した。蛍光強度データをリアルタイムに記録し、泳動時間中を通して保存した。この実施例に関して、励起光源は478nmレーザーであり、検出は、フィルター処理(フルオレセイン放射光についての適切な帯域通過フィルター)CCDカメラを用いた。
50ulアッセイ試料のうちの40ul容量をHamilton注射器で電気泳動チャネルの上端(陰極端)へゆっくり注入した。電気泳動については、限度を2mAおよび650Vに設定して、開始した。泳動中を通して、チャネルを478nmレーザーで照射した。30秒間隔で12分間にわたって7秒露光(CCDカメラ)を記録した(24個の「蛍光強度対チャネル位置」プロットを生じる合計24回の露光)。各アッセイ試料からの蛍光強度データ点を、捕獲されたサンドイッチ複合体ピークの領域(すなわち、捕獲層内のシグナルピークの領域)とみなした。「IL−6無し」の対照から得られたバックグラウンド値をピーク領域値から引いた。このデータのlog−logプロットは図16に示されている。用量反応は少なくとも2.5logにわたってほぼ直線であった。
Claims (24)
- 標的分子を検出するための方法であって、
a)該標的分子を含む可能性がある試料を得る工程と、
b)検出分子に結合体化した第1の結合作用物質および捕獲分子に結合体化した第2の結合作用物質の存在下で該試料を垂直積層型電気泳動に供する工程であって、該標的分子が該第1の結合作用物質および該第2の結合作用物質に結合して複合体を形成する、工程と、
c)該標的分子および第1の結合作用物質および第2の結合作用物質によって形成された該複合体の存在を検出する工程と
を含む方法。 - i)前記捕獲分子に結合して前記複合体の一部となる能力がある本質的に非荷電のポリマーの存在下で前記電気泳動を行う工程
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記結合作用物質が抗体またはその抗原結合性断片である、請求項1に記載の方法。
- 前記結合作用物質の一方または両方が生物学的受容体またはその断片である、請求項1に記載の方法。
- 前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項3に記載の方法。
- 前記標的分子がタンパク質またはペプチドである、請求項1に記載の方法。
- 前記電気泳動を、断面積を断面周囲長で割った値の2倍に等しい最小水力学的半径が0.5mmのチューブ、チャネル、または容器で行う、請求項1に記載の方法。
- 試料を前記チューブ、チャネル、または容器の上端に添加し、前記電気泳動を、該チューブ、チャネル、または容器の上端から下端へと密度および/または粘性が増加する勾配で行い、該勾配が、密度または粘性が異なる少なくとも2つの相を含む、請求項7に記載の方法。
- 試料を、前記チューブ、チャネル、または容器の下端に、または下端の近くに添加し、前記電気泳動を、該チューブ、チャネル、または容器の上端から下端へと密度および/または粘性が増加する勾配で行い、該勾配が、密度または粘性が異なる少なくとも2つの相を含む、請求項7に記載の方法。
- 前記勾配が試料層、捕獲層、およびスタッキング層を含む、請求項8または9に記載の方法。
- 前記勾配が、前記捕獲層と混合した試料層、およびスタッキング層を含む、請求項10に記載の方法。
- 前記捕獲分子がビオチンであり、前記電気泳動をビオチン結合性タンパク質の存在下で行う、請求項10に記載の方法。
- 前記ビオチン結合性タンパク質が、アビジン、ストレプトアビジン、およびニュートラアビジンからなる群から選択される、請求項12に記載の方法。
- 前記電気泳動を、ビオチンに結合体化した中性ポリマーの存在下で行う、請求項12または13に記載の方法。
- 前記複合体が、標的分子と、第1の結合作用物質と、第2の結合作用物質と、アビジン、ストレプトアビジン、またはニュートラアビジンから選択される多価ビオチン結合作用物質と、ビオチンに結合体化した1つまたは複数のポリマーとを含む、請求項14に記載の方法。
- 前記複合体の形成が、質量対電荷比の増加、ならびに前記標的分子および複合体の電気泳動移動度の低下をもたらす、請求項15に記載の方法。
- 標的分子、第1結合作用物質、第2結合作用物質、多価ビオチン結合作用物質、およびビオチンに結合体化した1つまたは複数のポリマーを含む前記複合体が形成すると、溶液中で自己集合して、検出可能な低移動度の複合体が形成される、請求項15に記載の方法。
- 前記複合体が前記スタッキング層で濃縮されて、検出を向上させる、請求項15に記載の方法。
- 前記複合体が前記スタッキング層で本質的に動かなくなる、請求項18に記載の方法。
- 複合体の一部ではない第1結合作用物質が、前記スタッキング層の中を移動し、該複合体から分離される、請求項18に記載の方法。
- ii)前記複合体における検出分子の量を測定して、前記試料における前記標的分子の濃度を決定する工程
をさらに含む、請求項1に記載の方法。 - 前記検出分子が、蛍光性であるか、発光性であるか、化学発光性であるか、放射性核種であるか、または蛍光性、発光性、化学発光性、もしくは有色の生成物を生じる酵素である、請求項1に記載の方法。
- 標的分子を検出するための装置であって、
a)水力学的半径が少なくとも0.5mmの垂直に配置されたチューブ、チャネル、または容器と、
b)該チューブ、チャネル、または容器内の増加する密度の勾配であって、試料層、捕獲層、およびスタッキング層を含む勾配と
を含む装置。 - i)前記試料層において複合体を形成する能力がある、標的分子、検出分子に結合体化した第1の結合作用物質、および捕獲分子に結合体化した第2の結合性分子と、
ii)該捕獲分子に結合して該複合体の一部となる能力がある、前記捕獲層における本質的に非荷電のポリマーと
をさらに含む、請求項23に記載の装置。
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