JP2010512147A5 - - Google Patents

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  1. 変異SPT15遺伝子を含む遺伝子操作酵母株であって、任意に、変異SPT15遺伝子の導入前または内在性SPT15遺伝子の変異前の、変異SPT15遺伝子を含まない前記酵母株は、野生型酵母株に比べて改善されたエタノール耐性および/またはグルコース耐性および/またはエタノール産生を有しており、ここで変異SPT15遺伝子が、野生型酵母および変異SPT15遺伝子を含まない酵母株と比べて、エタノール耐性および/またはグルコース耐性および/またはエタノール産生をさらに改善する、前記遺伝子操作酵母株。
  2. 変異SPT15遺伝子が、2つまたは3つ以上の位置F177、Y195およびK218において変異を含み、好ましくは、変異SPT15遺伝子が、3つの位置F177、Y195およびK218の全てにおいて変異を含み、さらに好ましくは、変異SPT15遺伝子が、2つまたは3つ以上の変異:F177S、Y195HおよびK218Rか、または変異アミノ酸の同類置換を含み、もっとも好ましくは、変異SPT15遺伝子が、変異:F177S、Y195HおよびK218Rか、または変異アミノ酸の同類置換を含む、請求項1に記載の遺伝子操作酵母株。
  3. 変異SPT15遺伝子が、組み換え的に発現される、請求項1または2に記載の遺伝子操作酵母株。
  4. 変異SPT15遺伝子を、酵母細胞内にプラスミド上で導入する、または変異SPT15遺伝子を、酵母細胞のゲノムDNAに導入する、または変異SPT15遺伝子が、in situで変異する酵母細胞の、ゲノムDNAの内在性遺伝子である、請求項1〜のいずれか一項に記載の遺伝子操作酵母株。
  5. 酵母株が、Saccharomyces spp.、Schizosaccharomyces spp.、Pichia spp.、Paffia spp.、Kluyveromyces spp.、Candida spp.、Talaromyces spp.、Brettanomyces spp.、Pachysolen spp.、Debaryomyces sppおよび工業用倍数体酵母株から選択される、または酵母株が、S. cerevisiae株である、請求項1〜のいずれか一項に記載の遺伝子操作酵母株。
  6. 変異SPT15遺伝子を含まない酵母株が、エタノール産生増強のための1または2以上の所望の表現型を有するように遺伝子操作されたか、選択されたか、またはこれを有することが知られている酵母株である、請求項1に記載の遺伝子操作酵母株。
  7. 1または2以上の所望の表現型が、エタノール耐性、および/またはC5およびC6糖の発酵増加である、またはC5およびC6糖の発酵増加の表現型が、キシロースの発酵増加である、請求項に記載の遺伝子操作酵母株。
  8. C5およびC6糖の発酵増加の表現型が、キシロースの発酵増加であり、遺伝子操作酵母株が、外来キシロースイソメラーゼ遺伝子、外来キシロースレダクターゼ遺伝子、および外来キシリトールデヒドロゲナーゼ遺伝子、および/または外来キシルロースキナーゼ遺伝子により形質転換されている、請求項に記載の遺伝子操作酵母株。
  9. C5およびC6糖の発酵増加の表現型が、キシロースの発酵増加であり、遺伝子操作酵母株が、非特異的または特異的アルドースレダクターゼ遺伝子(単数または複数)の欠失、キシリトールデヒドロゲナーゼ遺伝子(単数または複数)の欠失、および/またはキシルロキナーゼの過剰発現である、さらなる遺伝的改変を含む、請求項に記載の遺伝子操作酵母株。
  10. 変異SPT15遺伝子を含まない酵母株が、呼吸欠損酵母株である、または酵母株が、Spt3の正常な発現または増加発現を示す、または酵母株が、Spt3ノックアウトまたはヌル変異体ではない、請求項1に記載の遺伝子操作酵母株。
  11. 請求項1〜10のいずれか一項に記載の遺伝子操作酵母株を作製するための方法であって、酵母株に、変異SPT15遺伝子の1または2以上のコピーを導入すること、および/または、酵母細胞のゲノムDNAの内在性遺伝子をin situで変異させることを含む、前記方法。
  12. 請求項1〜10のいずれか一項に記載の遺伝子操作酵母株を、エタノールに代謝可能な1または2以上の基質を有する培養培地中で、エタノールを含有する発酵産物を産生するのに十分な時間、培養することを含む、エタノールを産生するための方法。
  13. 改善されたエタノール耐性および/またはグルコース耐性および/またはエタノール産生を有する酵母株を産生するための方法であって、
    請求項1〜10のいずれか一項に記載の変異SPT15遺伝子を含む酵母株を提供すること、および
    改善されたエタノール耐性および/またはグルコース耐性および/または改善されたエタノール産生のための、遺伝子操作および/または選択を行うこと、
    を含む、前記方法。
  14. 酵母株が、Spt15−300である、請求項13に記載の方法。
  15. 請求項13または14に記載の方法により産生される酵母株。
  16. 請求項15に記載の酵母株を、エタノールに代謝可能な1または2以上の基質を有する培養培地中で、エタノールを含有する発酵産物を産生するのに十分な時間、培養することを含む、エタノールを産生するための方法。
  17. エタノールに代謝可能な1または2以上の基質が、C5および/またはC6糖類を含み、好ましくは、1または2種以上のC5および/またはC6糖類が、グルコースおよび/またはキシロースを含む、請求項12または16に記載の方法。
  18. 請求項12、16および17のいずれか一項に記載の方法による、発酵産物。
  19. 表5に挙げた遺伝子の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、もしくは全14種の任意の組合せ、または、1もしくは2種以上の、実質的に類似であるかもしくは重複する生物学的/生化学的活性もしくは機能を有する遺伝子を、過剰発現する、酵母株。
  20. 上昇レベルのエタノールを含有する培養倍地中で培養された場合に、上昇レベルのエタノールを含有する培養倍地中で培養された野生型株の少なくとも4倍の細胞密度を達成する、好ましくは、野生型株の4〜5倍の細胞密度を達成する、遺伝子操作酵母株。
  21. エタノールの上昇レベルが、少なくとも約5%である、好ましくは、エタノールの上昇レベルが、少なくとも約6%である、請求項20に記載の遺伝子操作酵母株。
  22. 培養培地が、1または2種以上の糖類を少なくとも約20g/Lの濃度で含む、好ましくは、1または2種以上の糖類が、少なくとも約60g/Lの濃度で存在する、より好ましくは、1または2種以上の糖類が、少なくとも約100g/Lの濃度で存在する、最も好ましくは、1または2種以上の糖類が、少なくとも約120g/Lの濃度で存在する、請求項20または21に記載の遺伝子操作酵母株。
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Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011065539A1 (ja) * 2009-11-30 2011-06-03 国立大学法人神戸大学 バイオマスからのエタノールの生産方法
JP5585952B2 (ja) * 2009-12-08 2014-09-10 独立行政法人酒類総合研究所 エタノールの製造方法
US8809060B2 (en) * 2010-04-23 2014-08-19 Ewha University-Industry Collaboration Foundation Ethanol-resistant yeast gene, and use thereof
FR2968313B1 (fr) * 2010-12-03 2014-10-10 Lesaffre & Cie Procede de preparation d'une levure industrielle, levure industrielle et application a la production d'ethanol a partir d'au moins un pentose
KR20140021572A (ko) * 2011-02-25 2014-02-20 산토리 홀딩스 가부시키가이샤 자일로오스 발효 미생물
WO2012170436A1 (en) 2011-06-06 2012-12-13 The Regents Of The University Of California Synthetic biology tools
KR101428191B1 (ko) * 2012-09-24 2014-08-11 이화여자대학교 산학협력단 신규한 에탄올-내성 변이주 및 그의 용도
KR101517558B1 (ko) 2012-10-09 2015-05-06 이화여자대학교 산학협력단 고농도 rna 효모 균주 및 그 이용
US20140273131A1 (en) * 2013-03-13 2014-09-18 Abengoa Bioenergy New Technologies, Inc. Methods and systems for use in deactivating organisms used in bioproduct production processes
US20140302577A1 (en) * 2013-04-03 2014-10-09 University Of Wyoming Enhanced yeast fermentation platform using yeast lacking mitochondrial dna and containing growth improving mutations
KR101646310B1 (ko) * 2013-06-24 2016-08-12 씨제이제일제당 (주) L-쓰레오닌 생산 미생물 및 이를 이용한 l-쓰레오닌의 생산방법
CN105950649B (zh) * 2016-05-25 2019-07-09 西北农林科技大学 一种可提高酿酒酵母乙醇产率的重组质粒pY16TEF1-△SPT15-125及其应用
CN105907779B (zh) * 2016-05-25 2019-07-09 西北农林科技大学 一种可降低酿酒酵母乙醇产率的重组质粒pY16TEF1-△SPT15及其应用
CN109825516B (zh) * 2016-08-19 2020-01-14 南阳师范学院 一种提高乙醇产率的酿酒酵母定点饱和突变基因spt15-N及其应用
CN106978380A (zh) * 2016-12-14 2017-07-25 天津科技大学 一株高木糖耐性肺炎克雷伯氏菌株及其构建方法
CN108559721A (zh) * 2018-05-15 2018-09-21 北京师范大学 一种净化空气的复合微生物菌剂及其应用
EP4012015A1 (en) * 2020-12-14 2022-06-15 Sekab E-Technology AB Method and system for control of a microbial fermentation process
WO2023092547A1 (zh) * 2021-11-29 2023-06-01 中国科学院深圳先进技术研究院 基于自动化技术构建的高附加值代谢物智能细胞工厂

Family Cites Families (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5670350A (en) * 1990-08-20 1997-09-23 Novartis Finance Corporation Genomic DNA encoding a pseudomonas global transcriptional activation element and its use in activating gene expression
US5200341A (en) * 1991-10-07 1993-04-06 Monsanto Company Altered gene and E. coli strains and methods useful in enhanced accumulation of proteins
US5789210A (en) 1993-11-08 1998-08-04 Purdue Research Foundation Recombinant yeasts for effective fermentation of glucose and xylose
US6395547B1 (en) * 1994-02-17 2002-05-28 Maxygen, Inc. Methods for generating polynucleotides having desired characteristics by iterative selection and recombination
US6156532A (en) 1995-02-20 2000-12-05 Ajinomoto Co., Inc. Stress-resistant microorganism and method of producing fermentative product
IT1294728B1 (it) 1997-09-12 1999-04-12 Biopolo S C A R L Ceppi di lievito per la riproduzione di acido lattico
CA2374482C (en) 1999-05-21 2012-09-18 Cargill Dow Llc Methods and materials for the synthesis of organic products
CN1955299A (zh) 2000-11-22 2007-05-02 内特尔沃克公司 合成有机产物的方法和材料
WO2003049525A2 (en) 2001-11-23 2003-06-19 Cargill Dow Llc Methods and materials for the production of organic products in cells of $i(candida) species
BR0311452A (pt) 2002-05-30 2005-03-29 Cargill Dow Llc Processos e materiais para a produção de ácido lático em levedura
SE0401303D0 (sv) * 2004-05-19 2004-05-19 Forskarpatent I Syd Ab Ethanol productivities of microbial strains in fermentation of dilute-acid hydrolyzates depend on their furan reduction capacities
US7285403B2 (en) * 2005-04-06 2007-10-23 Wisconsin Alumni Research Foundation Xylose-fermenting recombinant yeast strains
JP2009509533A (ja) * 2005-09-28 2009-03-12 マサチューセッツ インスティテュート オブ テクノロジー 包括的な転写機構エンジニアリング
US20070072194A1 (en) * 2005-09-28 2007-03-29 Alper Hal S Global transcription machinery engineering

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