JP2009106280A - ヒトに適合したモノクローナル抗体における使用法 - Google Patents
ヒトに適合したモノクローナル抗体における使用法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2009106280A JP2009106280A JP2008270067A JP2008270067A JP2009106280A JP 2009106280 A JP2009106280 A JP 2009106280A JP 2008270067 A JP2008270067 A JP 2008270067A JP 2008270067 A JP2008270067 A JP 2008270067A JP 2009106280 A JP2009106280 A JP 2009106280A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- human
- antibody
- sequence
- sequences
- gene
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 63
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 54
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 claims abstract description 46
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 claims abstract description 8
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 claims abstract description 8
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 claims description 57
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 29
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 claims description 9
- 101150008942 J gene Proteins 0.000 claims description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 5
- GNFTZDOKVXKIBK-UHFFFAOYSA-N 3-(2-methoxyethoxy)benzohydrazide Chemical compound COCCOC1=CC=CC(C(=O)NN)=C1 GNFTZDOKVXKIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- FGUUSXIOTUKUDN-IBGZPJMESA-N C1(=CC=CC=C1)N1C2=C(NC([C@H](C1)NC=1OC(=NN=1)C1=CC=CC=C1)=O)C=CC=C2 Chemical compound C1(=CC=CC=C1)N1C2=C(NC([C@H](C1)NC=1OC(=NN=1)C1=CC=CC=C1)=O)C=CC=C2 FGUUSXIOTUKUDN-IBGZPJMESA-N 0.000 claims description 3
- 230000006978 adaptation Effects 0.000 abstract description 14
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 abstract description 5
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 17
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 17
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 13
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 11
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 11
- 229960000598 infliximab Drugs 0.000 description 11
- 239000000370 acceptor Substances 0.000 description 9
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 7
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 7
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 6
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 6
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 5
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 5
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 5
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 5
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 5
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 5
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 5
- 101000611183 Homo sapiens Tumor necrosis factor Proteins 0.000 description 4
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 4
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 4
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 4
- 229940116176 remicade Drugs 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- 229940036185 synagis Drugs 0.000 description 4
- 238000000954 titration curve Methods 0.000 description 4
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 239000013065 commercial product Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- 102000005717 Myeloma Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010045503 Myeloma Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 2
- 101150117115 V gene Proteins 0.000 description 2
- 238000013357 binding ELISA Methods 0.000 description 2
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 102000057041 human TNF Human genes 0.000 description 2
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 2
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 210000004180 plasmocyte Anatomy 0.000 description 2
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 2-nitrophenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1[N+]([O-])=O IQUPABOKLQSFBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 101000935587 Homo sapiens Flavin reductase (NADPH) Proteins 0.000 description 1
- 241000711920 Human orthopneumovirus Species 0.000 description 1
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 1
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 1
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 230000010530 Virus Neutralization Effects 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009830 antibody antigen interaction Effects 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical class N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000013178 mathematical model Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229940126619 mouse monoclonal antibody Drugs 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000012856 packing Methods 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/46—Hybrid immunoglobulins
- C07K16/461—Igs containing Ig-regions, -domains or -residues form different species
- C07K16/464—Igs containing CDR-residues from one specie grafted between FR-residues from another
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/08—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses
- C07K16/10—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from viruses from RNA viruses
- C07K16/1027—Paramyxoviridae, e.g. respiratory syncytial virus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/24—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against cytokines, lymphokines or interferons
- C07K16/241—Tumor Necrosis Factors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/565—Complementarity determining region [CDR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
- C07K2317/56—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments variable (Fv) region, i.e. VH and/or VL
- C07K2317/567—Framework region [FR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
- C07K2317/73—Inducing cell death, e.g. apoptosis, necrosis or inhibition of cell proliferation
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
- C07K2317/90—Immunoglobulins specific features characterized by (pharmaco)kinetic aspects or by stability of the immunoglobulin
- C07K2317/92—Affinity (KD), association rate (Ka), dissociation rate (Kd) or EC50 value
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
【解決手段】ヒトに適合した抗体分子の作成に使用するヒト生殖細胞系列抗体配列及び、体細胞突然変異を含むヒト抗体配列の選択法であって、具体的には、候補となるヒト抗体フレームワーク配列をヒト生殖細胞系列遺伝子データベースまたは体細胞突然変異を有するヒトの配列から選択する方法。
【選択図】なし
Description
grafting)」として知られている。この技術の科学的基礎は、抗体の結合特異性が主にその軽および重鎖可変領域(V−領域)の相補性決定領域(CDR)として知られている3つの超可変ループ内に主に存在する一方、より保存されたフレームワーク領域(フレームワーク、FW;フレームワーク領域、FR)が構造的な支持機能を提供するとう点にある。CDRを適切に選択したFWに移植することにより、ある程度の、またはすべての抗体結合活性を生成する組換え抗体に移すことができる。CDR移植による特異性の転移の最初の証明はハプテンニトロフェノールに関するものであった(非特許文献1)。
重鎖アクセプターおよびベスト−フィットの軽鎖アクセプターは、ドナーの結合活性を最高に保存するためには互いに適応してしないかもしれない。鎖内の適応度を評価するために利用できる道具は無い。研究者は、より良いペアを見いだすために幾つかのエピトープに対して幾つかの抗体の重鎖および軽鎖を対合させた。しかしこれは抗体のヒトへの適合化について試されなかった。
てきたが、2つの潜在的問題がある。第1は生じた抗体のFRは、すべてヒト起源でも非連続的FWに由来する可能性があり、したがって自然ではない。これはこれらの不自然なFWがヒトで免疫原性となるかどうか知ることが残る。第2に、理論的にライブラリーが極端に大きくなる可能性があり、そしてスクリーニングおよびアッセイ能力に対する高い要求を出す。
本発明の1つの観点は、ヒトに適合した抗体分子の作成に使用するヒト生殖細胞系列抗体配列の選択法であって、この方法は:
a.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列を得;
b.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列の相補性決定領域(CDR)およびフレームワーク領域(FR)の輪郭を描き(delineating):
c.VH、VK、Vλ、JH、JKおよびJλ遺伝子サブ−ライブラリーを含んでなるヒト生殖細胞系列抗体遺伝子ペプチド配列のライブラリーを準備し;
d.非ヒト抗体に対して最大のCDRおよびFR類似性を有するペプチド配列のサブセットを、ヒト生殖細胞系列遺伝子ライブラリーから選択し;
e.工程dで選択したヒト生殖細胞系列抗体の重鎖配列のサブセットを:
e1.CDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
e2.CDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択し:
f.工程dで選択したヒト生殖細胞系列抗体の軽鎖配列のサブセットを:
f1.CDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
f2.CDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との配列の類似性に基づき選択し:
g.重鎖J遺伝子のペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJH遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JH遺伝子サブ−ライブラリーから選択し:
h.軽鎖J遺伝子のペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJKおよびJλ遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JKおよびJλ遺伝子サブ−ライブラリーから選択し:
i.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体重鎖配列を選択するために、ヒト重鎖に関する工程eからのFR1、2および3の選択と工程gからのFR4の選択とを合わせ;そして
j.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体軽鎖配列を選択するために、ヒト軽鎖に関する工程fからのFR1、2および3の選択と工程hからのFR4の選択とを合わせる、
工程を含んでなる。
a.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列を得;
b.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列の相補性決定領域(CDR)およびフレームワーク領域(FR)の輪郭を描き:
c.ヒト体細胞抗体遺伝子のペプチド配列のライブラリーを準備し;
d.非ヒト抗体の重および軽鎖に対して最大のCDRおよびFR類似性を有するペプチド配列のサブセットをヒト体細胞遺伝子ライブラリーから選択し;
e.ヒトに適合した抗体の作成に使用するために、工程dで選択したヒト体細胞抗体の重鎖配列のサブセットを、:
e1.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
e2.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択し:そして
f.ヒトに適合した抗体の作成に使用するために、工程dで選択したヒト体細胞抗体の軽鎖配列のサブセットを:
f1.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
f2.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択する
工程を含んでなる。
限定する訳ではないが、本明細書に引用する特許および特許出願を含むすべての刊行物は完全に説明されているように参照により全部、本明細書に編入する。
テロ四量体の糖タンパク質である。典型的には各軽鎖が1つの共有ジスルフィド結合により重鎖に連結されているが、ジスルフィド結合の数は異なる免疫グロブリンアイソタイプの重鎖間で変動する。また各重および軽鎖は、規則的に間隔が空いた鎖内ジスルフィド架橋も有する。各重鎖は1つの末端に可変ドメイン(VH)、続いて幾つかの定常ドメインを有する。各軽鎖は1つの末端に可変ドメイン(VL)、およびもう一端に定常ドメインを有し;軽鎖の定常ドメインは重鎖の第1定常ドメインに並び、そして軽鎖可変ドメインは重鎖の可変ドメインに並んでいる。脊椎動物種の抗体軽鎖は、2つの明らかに異なる型、すなわちカッパ(κ)およびラムダ(λ)の1つにそれらの定常ドメインのアミノ酸配列により割り当てられる。
異の導入を必要としない。ヒトに適合した抗体の親和性の保持は、フレームワークの選択で使用される原理によるものである。フレームワークは全分子にわたる全体的な配列同一性に基づくだけでなく、VLおよびVHに各3つの6つのすべてのCDRループのループ長および配列同一性にも基づいて選択される。そのような原理で抗体の認識表面上の混乱(perturbation)は確実に最少となり、そして結果的に抗体の抗原に対する親和性の混乱も非ヒトからヒトに適合した抗体へ移った時に最少となる。
1.ヒトの配列は4つすべてのフレームワークおよび3つのCDRを網羅する全分子長にわたりマウスの配列と有意な同一性を有する。
2.ヒトの配列はCDR1、2および3の長さを最大に保存し、すなわちヒトおよびマウスの配列のアライメントは、3つのCDRで最少数の欠失および挿入を有する。
3.ヒトのデータベース中の配列の中で、選択された配列はCDR1、2および3のマウス配列と有意な相同性を有する。
a.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列を得、典型的には非ヒト抗体はマウスまたはラットのような齧歯類に由来する。ペプチド配列の情報は、非ヒト抗体可変領域遺伝子のヌクレオチド配列から推論することができる。これらの遺伝子は当業者に周知な技術により単離され、クローン化され、そして配列決定されることができる。
b.非ヒト抗体可変領域のペプチド配列のCDRおよびFRの輪郭を描きる。
c.VH、VK、Vλ、JH、JKおよびJλ遺伝子のサブ−ライブラリーを含んでなるヒト生殖細胞系列の抗体遺伝子ペプチド配列のライブラリーを準備する。
d.非ヒト抗体に対して最大のCDRおよびFR類似性を有するペプチド配列のサブセットを、ヒト生殖細胞系列遺伝子ライブラリーから選択する。非ヒト配列はBLASTプログラムを使用して全長について生殖細胞系列遺伝子のデータベースに対する類似性が調査され(Altschul et al.,J.Mol.Biol.215:403−410(1990))、そして最高のBLASTスコアを有する最高の候補が選択される。この工程は重および軽鎖について行う。非ヒト重鎖はヒト生殖細胞系列VH遺伝子に対して調査される;非ヒト軽鎖はヒト生殖細胞系列VKおよびVλ遺伝子サブライブラリーに対して調査される。
e.工程dで選択したヒト抗体の重鎖配列のサブセットを、CDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較、ならびにCDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との配列の類似性に基づき選択し、複合スコアを使用して上記2つの基準を評価する。BLOSUM62置換マトリックスのような標準突然変異マトリックス(Henikoff and Henikoff,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 89:10915−10919(1992))を、非ヒトおよびヒト配列のCDR領域のアライメントを採点するために使用し、そして挿入および/または欠失がCDRループにある場合、大きなペナルティを適用する。このプロセスはPipeline Pilot
(商標)プロトコールを使用して自動化された(カリフォルニア州、サンディエゴのAccelrys,Incから利用可能なモジュラーソフトウェア開発環境)。任意に使用者はスコアおよび配列アライメントを見直すことができ、そしてFR1、2および3に使用するための1組のヒト生殖細胞系列遺伝子を選ぶことができる。
f.工程dで選択したヒト抗体の軽鎖配列のサブセットを、CDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との長さの適合性の比較、ならびにCDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との配列の類似性に基づき選択し、複合スコアを使用して工程eで上に検討した2つの基準を評価する。
g.重鎖J遺伝子のペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJH遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JH遺伝子サブ−ライブラリーから選択する。
h.軽鎖J遺伝子ペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJKおよびJλ遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JKおよびJλ遺伝子サブ−ライブラリーから選択する。
i.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体重鎖配列を選択するために、ヒト重鎖に関する工程eからのFR1、2および3の選択と工程gからのFR4の選択とを合わせる。
j.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体軽鎖配列を選択するために、ヒト軽鎖に関する工程fからのFR1、2および3の選択と工程hからのFR4の選択とを合わせる。
ちこれが配列に基づく割り当てを補正する。ここで使用する構造的モデリングおよび配列分析法の組み合わせはヒトのフレームワークを選択するために有用であり、そしてまたヒトに適合化した抗体の親和性の成熟にも有用である。
キメラモノクローナル抗体のヒト適合化
インフリキシマブ(infliximab)は約149kDaの分子量を持つキメラIgGκモノクローナル抗体である。インフリキシマブはヒトの腫瘍壊死因子アルファ(TNFα)に特異的に結合し、そしてヒト定常およびマウス可変領域からなり(インフリキシマブのアミノ酸配列(cA2)に関しては米国特許第5,656,272号明細書の図16A&16Bを参照にされたい)、そしてREMICADE(商標)という登録商標で
販売されている。インフリキシマブは119アミノ酸(配列番号1)の重鎖可変領域と、107アミノ酸(配列番号2)の軽鎖可変領域を有する。
マウスモノクローナル抗体のヒト適合化
本発明の方法は、ヒト生殖細胞系列VHおよびVLを選択してヒトに適合化した抗−RSV抗体B21Mを構築するために、抗−RSV 101Fと命名されたマウスの中和RSウイルス(RSV)Fタンパク質抗体に適用した。101F抗体は120アミノ酸の重鎖可変領域(配列番号3)、および112アミノ酸の軽鎖可変領域(配列番号4)を有する。
Claims (3)
- ヒトに適合した抗体分子の作成に使用するヒト抗体配列の選択方法であって:
a.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列を得;
b.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列の相補性決定領域(CDR)およびフレームワーク領域(FR)の輪郭を描き:
c.VH、VK、Vλ、JH、JKおよびJλ遺伝子サブ−ライブラリーを含んでなるヒト生殖細胞系列抗体遺伝子のペプチド配列のライブラリーを準備し;
d.非ヒト抗体の重および軽鎖に対して最大のCDRおよびFR類似性を有するペプチド配列のサブセットを、ヒト生殖細胞系列遺伝子ライブラリーから選択し;
e.工程dで選択したヒト生殖細胞系列抗体の重鎖配列のサブセットを:
e1.CDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
e2.CDR1およびCDR2ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択し:
f.工程dで選択したヒト生殖細胞系列抗体の軽鎖配列のサブセットを:
f1.CDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
f2.CDR1、CDR2およびCDR3ループの一部と非ヒト抗体との配列の類似性に基づき選択し:
g.重鎖J遺伝子のペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJH遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JH遺伝子サブ−ライブラリーから選択し:
h.軽鎖J遺伝子のペプチド配列のサブセットを、非ヒト抗体のフレームワーク4とJKおよびJλ遺伝子領域との間の配列類似性に基づきヒト生殖細胞系列JKおよびJλ遺伝子サブ−ライブラリーから選択し:
i.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体重鎖配列を選択するために、ヒト重鎖に関する工程eからのFR1、2および3の選択と工程gからのFR4の選択とを合わせ;そして
j.ヒトに適合した抗体の作成に使用するヒト抗体軽鎖配列を選択するために、ヒト軽鎖に関する工程fからのFR1、2および3の選択と工程hからのFR4の選択とを合わせる、
工程を含んでなる上記方法。 - さらにライブラリーのサイズ、FRの同一性、CDRループ長の適合性および配列類似性の混成評価、およびヒトvおよびj遺伝子の組み合わせの選択基準を含んでなる請求項1に記載の方法。
- ヒトに適合した抗体分子の作成に使用する体細胞突然変異を含むヒト抗体配列の選択法であって:
a.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列を得;
b.非ヒト抗体可変領域用のペプチド配列の相補性決定領域(CDR)およびフレームワーク領域(FR)の輪郭を描き:
c.ヒト体細胞抗体遺伝子のペプチド配列のライブラリーを準備し;
d.非ヒト抗体の重および軽鎖に対して最大のCDRおよびFR類似性を有するペプチド配列のサブセットを、ヒト体細胞遺伝子ライブラリーから選択し;
e.ヒトに適合した抗体の作成に使用するために、工程dで選択したヒト体細胞抗体の重鎖配列のサブセットを、:
e1.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
e2.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択し:そして
f.ヒトに適合した抗体の作成に使用するために、工程dで選択したヒト体細胞抗体の軽鎖配列のサブセットを:
f1.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との長さの適合性の比較;および
f2.CDR1、CDR2およびCDR3ループと非ヒト抗体との配列の類似性
に基づき選択する
工程を含んでなる上記方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US11/875,416 US8748356B2 (en) | 2007-10-19 | 2007-10-19 | Methods for use in human-adapting monoclonal antibodies |
US11/875,416 | 2007-10-19 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2009106280A true JP2009106280A (ja) | 2009-05-21 |
JP5457009B2 JP5457009B2 (ja) | 2014-04-02 |
Family
ID=40304294
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008270067A Active JP5457009B2 (ja) | 2007-10-19 | 2008-10-20 | ヒトに適合したモノクローナル抗体における使用法 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US8748356B2 (ja) |
EP (1) | EP2050765B1 (ja) |
JP (1) | JP5457009B2 (ja) |
DK (1) | DK2050765T3 (ja) |
ES (1) | ES2387585T3 (ja) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013514794A (ja) * | 2009-12-22 | 2013-05-02 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 配列依存性の凝集 |
JP2019535319A (ja) * | 2016-11-14 | 2019-12-12 | ダイノナDinona | CD66cに特異的に結合する抗体およびその用途 |
Families Citing this family (45)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012109553A2 (en) * | 2011-02-11 | 2012-08-16 | Research Corporation Technologies | Ch2 domain template molecules derived from rational grafting of donor loops onto ch2 scaffolds |
US8722044B2 (en) | 2011-03-15 | 2014-05-13 | Janssen Biotech, Inc. | Human tissue factor antibody and uses thereof |
GB201116092D0 (en) | 2011-09-16 | 2011-11-02 | Bioceros B V | Antibodies and uses thereof |
CA2867299C (en) | 2012-03-15 | 2019-08-27 | John Chen | Human anti-cd27 antibodies, methods, and uses |
US9090694B2 (en) | 2012-04-30 | 2015-07-28 | Janssen Biotech, Inc. | ST2L antibody antagonists |
SI2922872T1 (sl) | 2012-11-21 | 2019-01-31 | Janssen Biotech, Inc., | Bispecifična protitelesa EGFR/C-MET |
US9902770B2 (en) | 2013-03-15 | 2018-02-27 | Janssen Biotech, Inc. | Interferon alpha and omega antibody antagonists |
HUE040234T2 (hu) | 2013-03-18 | 2019-02-28 | Biocerox Prod Bv | Humanizált anti-CD134 (OX40) antitestek és felhasználásaik |
RS62373B1 (sr) | 2013-11-06 | 2021-10-29 | Janssen Biotech Inc | Anti-ccl17 antitela |
US9732154B2 (en) | 2014-02-28 | 2017-08-15 | Janssen Biotech, Inc. | Anti-CD38 antibodies for treatment of acute lymphoblastic leukemia |
TWI713453B (zh) | 2014-06-23 | 2020-12-21 | 美商健生生物科技公司 | 干擾素α及ω抗體拮抗劑 |
ES2890669T3 (es) | 2014-09-09 | 2022-01-21 | Janssen Biotech Inc | Terapias de combinación con anticuerpos anti-CD38 |
WO2016089610A1 (en) | 2014-12-06 | 2016-06-09 | H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. | Bispecific antibody for cancer immunotherapy |
US10766965B2 (en) | 2015-05-20 | 2020-09-08 | Janssen Biotech, Inc. | Anti-CD38 antibodies for treatment of light chain amyloidosis and other CD38-positive hematological malignancies |
CN107921128B (zh) | 2015-08-05 | 2022-04-26 | 詹森生物科技公司 | 抗cd154抗体及其使用方法 |
AU2016329057A1 (en) | 2015-09-30 | 2018-04-12 | Janssen Biotech, Inc. | Antagonistic antibodies specifically binding human CD40 and methods of use |
US10894830B2 (en) | 2015-11-03 | 2021-01-19 | Janssen Biotech, Inc. | Antibodies specifically binding PD-1, TIM-3 or PD-1 and TIM-3 and their uses |
KR20180087430A (ko) | 2015-12-17 | 2018-08-01 | 얀센 바이오테크 인코포레이티드 | Hla-dr에 특이적으로 결합하는 항체 및 이의 용도 |
WO2018015498A1 (en) | 2016-07-20 | 2018-01-25 | Hybrigenics Sa | Combinations of inecalcitol with an anti-cd38 agent and their uses for treating cancer |
MA45941A (fr) | 2016-08-12 | 2019-06-19 | Janssen Biotech Inc | Anticorps de membres de la superfamille anti-tnfr modifiés par fc ayant une activité agoniste améliorée et leurs procédés d'utilisation |
US10669344B2 (en) | 2016-08-12 | 2020-06-02 | Janssen Biotech, Inc. | Engineered antibodies and other Fc-domain containing molecules with enhanced agonism and effector functions |
KR20200014414A (ko) | 2017-06-05 | 2020-02-10 | 얀센 바이오테크 인코포레이티드 | Pd-1과 특이적으로 결합하는 항체 및 사용 방법 |
AU2018359527A1 (en) | 2017-10-31 | 2020-05-07 | Janssen Biotech, Inc. | Methods of treating high risk multiple myeloma |
US20190225689A1 (en) | 2018-01-22 | 2019-07-25 | Janssen Biotech, Inc. | Methods of treating cancers with antagonistic anti-pd-1 antibodies |
JOP20200303A1 (ar) | 2018-05-24 | 2020-11-23 | Janssen Biotech Inc | عوامل ربط psma واستخداماتها |
PE20210634A1 (es) | 2018-05-24 | 2021-03-23 | Janssen Biotech Inc | Anticuerpos anti-tmeff2 monoespecificos y multiespecificos y sus usos |
JOP20200302A1 (ar) | 2018-05-24 | 2020-11-23 | Janssen Biotech Inc | الأجسام المضادة لـ cd3 واستخداماتها |
TW202043256A (zh) | 2019-01-10 | 2020-12-01 | 美商健生生物科技公司 | 前列腺新抗原及其用途 |
EP3956022A1 (en) | 2019-04-19 | 2022-02-23 | Janssen Biotech, Inc. | Methods of treating prostate cancer with an anti- psma/cd3 antibody |
JP2022541332A (ja) | 2019-07-26 | 2022-09-22 | ヤンセン バイオテツク,インコーポレーテツド | カリクレイン関連ペプチダーゼ2抗原結合ドメインを含むタンパク質及びその使用 |
EP4061405A1 (en) | 2019-11-18 | 2022-09-28 | Janssen Biotech, Inc. | Vaccines based on mutant calr and jak2 and their uses |
TW202140012A (zh) | 2020-02-12 | 2021-11-01 | 比利時商健生藥品公司 | 用於治療尿路上皮癌的fgfr酪胺酸激酶抑制劑和抗pd1藥劑 |
TW202144388A (zh) | 2020-02-14 | 2021-12-01 | 美商健生生物科技公司 | 在卵巢癌中表現之新抗原及其用途 |
TW202144389A (zh) | 2020-02-14 | 2021-12-01 | 美商健生生物科技公司 | 在多發性骨髓瘤中表現之新抗原及其用途 |
KR20230051617A (ko) | 2020-03-13 | 2023-04-18 | 얀센 바이오테크 인코포레이티드 | Siglec-3/cd33을 결합시키기 위한 물질 및 방법 |
MX2022014938A (es) | 2020-05-27 | 2023-03-06 | Janssen Biotech Inc | Proteínas que comprenden dominios de unión al antígeno de cd3 y usos de éstas. |
CA3190307A1 (en) | 2020-07-29 | 2022-02-03 | Janssen Biotech, Inc. | Proteins comprising hla-g antigen binding domains and their uses |
AR123767A1 (es) | 2020-10-13 | 2023-01-11 | Janssen Biotech Inc | Inmunidad mediada por células t mediante bioingeniería, materiales y otros métodos para modular el cúmulo de diferenciación iv y/o viii |
WO2022084915A1 (en) | 2020-10-22 | 2022-04-28 | Janssen Biotech, Inc. | Proteins comprising delta-like ligand 3 (dll3) antigen binding domains and their uses |
AU2022214491A1 (en) | 2021-01-28 | 2023-09-14 | Janssen Biotech, Inc. | Psma binding proteins and uses thereof |
AU2022244453A1 (en) | 2021-03-24 | 2023-11-09 | Janssen Biotech, Inc. | Antibody targeting cd22 and cd79b |
IL306132A (en) | 2021-03-24 | 2023-11-01 | Janssen Biotech Inc | Proteins containing CD3 antigen binding sites and uses thereof |
US11987641B2 (en) | 2021-08-27 | 2024-05-21 | Janssen Biotech, Inc. | Anti-PSMA antibodies and uses thereof |
WO2023046322A1 (en) | 2021-09-24 | 2023-03-30 | Janssen Pharmaceutica Nv | Proteins comprising cd20 binding domains, and uses thereof |
WO2023152581A1 (en) | 2022-02-09 | 2023-08-17 | Janssen Biotech, Inc. | Method of treating cancer with psmaxcd3 antibody |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005112564A2 (en) * | 2004-04-15 | 2005-12-01 | The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Germline and sequence variants of humanized antibodies and methods of making and using them |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5656272A (en) | 1991-03-18 | 1997-08-12 | New York University Medical Center | Methods of treating TNF-α-mediated Crohn's disease using chimeric anti-TNF antibodies |
US5565332A (en) * | 1991-09-23 | 1996-10-15 | Medical Research Council | Production of chimeric antibodies - a combinatorial approach |
US6706484B1 (en) * | 1995-08-18 | 2004-03-16 | Morphosys Ag | Protein/(poly)peptide libraries |
AU2002368077B2 (en) | 2001-07-12 | 2010-03-04 | Jefferson Foote | Super humanized antibodies |
EP1720908A2 (en) | 2004-02-17 | 2006-11-15 | Absalus, Inc. | Super-humanized antibodies against respiratory syncytial virus |
US20090238825A1 (en) * | 2007-05-21 | 2009-09-24 | Kovacevich Brian R | Novel rabbit antibody humanization methods and humanized rabbit antibodies |
-
2007
- 2007-10-19 US US11/875,416 patent/US8748356B2/en active Active
-
2008
- 2008-10-17 EP EP08253381A patent/EP2050765B1/en active Active
- 2008-10-17 DK DK08253381.1T patent/DK2050765T3/da active
- 2008-10-17 ES ES08253381T patent/ES2387585T3/es active Active
- 2008-10-20 JP JP2008270067A patent/JP5457009B2/ja active Active
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005112564A2 (en) * | 2004-04-15 | 2005-12-01 | The Government Of The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Department Of Health And Human Services | Germline and sequence variants of humanized antibodies and methods of making and using them |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
JPN6013036280; Methods Vol.36, 2005, p.35-42 * |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013514794A (ja) * | 2009-12-22 | 2013-05-02 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 配列依存性の凝集 |
JP2019535319A (ja) * | 2016-11-14 | 2019-12-12 | ダイノナDinona | CD66cに特異的に結合する抗体およびその用途 |
JP2021177770A (ja) * | 2016-11-14 | 2021-11-18 | ダイノナDinona | CD66cに特異的に結合する抗体およびその用途 |
JP7450585B2 (ja) | 2016-11-14 | 2024-03-15 | クンホ、エイチティー、インコーポレイテッド | CD66cに特異的に結合する抗体およびその用途 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US8748356B2 (en) | 2014-06-10 |
DK2050765T3 (da) | 2012-09-17 |
US20090118127A1 (en) | 2009-05-07 |
EP2050765B1 (en) | 2012-06-20 |
JP5457009B2 (ja) | 2014-04-02 |
EP2050765A1 (en) | 2009-04-22 |
ES2387585T3 (es) | 2012-09-26 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP5457009B2 (ja) | ヒトに適合したモノクローナル抗体における使用法 | |
Almagro et al. | Humanization of antibodies | |
EP3209684B1 (en) | Vh-vl-interdomain angle based antibody humanization | |
JP5143551B2 (ja) | ユニバーサル抗体のライブラリー | |
US9550986B2 (en) | High-throughput antibody humanization | |
JP5323710B2 (ja) | ヒトに適合するモノクローナル抗体に使用するための方法 | |
Almagro et al. | Characterization of a high‐affinity human antibody with a disulfide bridge in the third complementarity‐determining region of the heavy chain | |
Sevy et al. | Antibodies: Computer‐aided prediction of structure and design of function | |
WO2020246617A1 (ja) | 情報処理システム、情報処理方法、プログラム、及び、抗原結合分子或いはタンパク質を製造する方法 | |
US9249232B2 (en) | Framework selection | |
CN109415441B (zh) | 抗体及其制备方法 | |
Sulea | Humanization of camelid single-domain antibodies | |
JP2022528387A (ja) | アビド結合多重特異性抗体を作製する方法 | |
Saldanha | Humanization strategies | |
JP7210276B2 (ja) | 抗体変異体 | |
JP2022516445A (ja) | エピトープおよびパラトープを同定する方法 | |
US20130109586A1 (en) | Generation of antibodies to an epitope of interest that contains a phosphomimetic amino acid | |
CN101426526A (zh) | 使用工程诱杀蛋白的液相生物淘选方法 | |
Almagro et al. | Humanization of antibodies | |
WO2024006975A1 (en) | Methods for antibody humanization | |
JP2011115175A (ja) | スーパーヒト化抗体 | |
JP2012152223A (ja) | スーパーヒト化抗体 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20110805 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20130730 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20131030 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20131105 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20131202 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20131224 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140109 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5457009 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |