JP2008544225A - 体液における神経学的障害の診断のための方法および組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、米国特許出願第10/993,813号(2004年11月19日に出願され、米国仮特許出願第60/523,796号(2003年11月19日出願)、同第60/566,783(2004年4月30日出願)および同第60/566,782号(2004年4月30日出願)(これらは全て、その全体が本明細書に参考として援用される)の利益を主張する)の一部継続出願である。
適用なし。
適用なし。
推定450万人の米国人が、アルツハイマー病(「AD])を有している。2050年までに、AD有病率の推定範囲は、1130万人から1600万人である。現時点で、米国にかかる社会的費用は、米国の業務(business)によって負担されている610億ドルを含め、1年あたり1000億ドルである。政府医療保障も大部分の個人用健康保険も、大部分の患者が必要とする長期のケアをカバーしていない。
本発明者らは、個体の血液中に存在する、アルツハイマー病(「AD」)を有する個体において変化している生化学マーカー(個体の血清または血漿由来を含む)の集団を発見した。従って、これらバイオマーカー(「AD診断バイオマーカー」)は、AD患者における認知機能を評価するために、ADを診断もしくはADの診断を補助するために、および/またはADの進行を測定するために使用され得る。AD診断マーカーは、ADを診断もしくはADの診断を補助するために、個々にまたは組み合わせて、使用され得る。本発明は、生物学的流体サンプル(例えば、個体由来の末梢性の生物学的流体サンプル)中の1種以上のAD診断バイオマーカーの量を測定する工程、およびその測定された量と、測定された各AD診断バイオマーカーの参照値とを比較する工程により、個体におけるADの診断もしくはADの診断を補助するための方法を提供する。このようにして得られた情報は、個体におけるADの診断を補助するか、またはADを診断するために使用され得る。従って、本発明は、アルツハイマー病(「AD」)の診断を補助するための方法を提供し、この方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、上記バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで上記AD診断バイオマーカーは、GCSF;IFN−g;IGFBP−1;BMP−6;BMP−4;Eotaxin−2;IGFBP−2;TARC;RANTES;ANG;PARC;Acrp30;AgRP(ART);TIMP−1;TIMP−2;ICAM−1;TRAIL R3;uPAR;IGFBP−4;レプチン(OB);PDGF−BB;EGF;BDNF;NT−3;NAP−2;IL−1ra;MSP−a;SCF;TGF−b3;TNF−b;MIP−1d;IL−3;FGF−6;IL−6 R;sTNF RII;AXL;bFGF;FGF−4;CNTF;MCP−1;MIP−1b;TPO;VEGF−B;IL−8;FAS;EGF−Rからなる群より選択される。いくつかの例において、上記AD診断バイオマーカーは、塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF);BBホモ二量体血小板由来増殖因子(PDGF−BB);脳由来神経栄養因子(BDNF);上皮増殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因子6(FGF−6)、インターロイキン−3(IL−3)、可溶性インターロイキン−6レセプター(sIL−6R)、レプチン(obとしても公知)、マクロファージ炎症性タンパク質−1δ(MIP−1δ)、マクロファージ刺激タンパク質α鎖(MSP−α)、ニューロトロフィン−3(NT−3)、好中球活性化ペプチド−2(NAP−2)、RANTES、可溶性腫瘍壊死因子レセプター−2(sTNF RII)、幹細胞因子(SCF)、トロンボポエチン(TPO)、メタロプロテアーゼ−1の組織インヒビター(TIMP−1)、メタロプロテアーゼ−2の組織インヒビター(TIMP−2)、トランスホーミング増殖因子−β3(TGF−β3)、および腫瘍壊死因子β(TNF−β)からなる群より選択される。他の例では、上記AD診断マーカーは、BDNF、sIL−6R、IL−8、レプチン、MIP−1δ、PDGF−BB、およびTIMP−1からなる群より選択される。なお他の例では、上記AD診断マーカーは、sIL−6R、IL−8、およびTIMP−1からなる群より選択される。さらなる例では、上記AD診断マーカーは、BDNF、MIP−1δ、およびTIMP−1からなる群より選択される。さらなる例において、上記AD診断マーカーは、BDNF、PDGF−BB、レプチンおよびRANTESからなる群より選択される。さらなる例において、上記AD診断マーカーは、BDNF、PDGF−BB、レプチンおよびRANTESを含む。さらなる例において、上記方法は、少なくとも2種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、上記バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する。さらなる例において、上記方法は、少なくとも3種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、上記バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する。さらなる例において、上記方法は、少なくとも4種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、上記バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する。さらなる例において、測定されたレベルと、測定された各AD診断バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程は、上記測定されたレベルと上記参照レベルとの間の倍数差を計算する工程を包含する。いくつかの例において、方法は、測定された各AD診断バイオマーカーの倍数差と、最小の倍数差レベルとを比較する工程をさらに包含する。いくつかの例において、上記方法は、上記測定されたレベルと上記参照レベルとの比較のための値を得る工程をさらに包含する。本明細書中で提供されるのは、本明細書に記載されるような方法によって得られる値を含むコンピューター読み取り可能フォーマットである。
炎症および損傷応答は、AD、パーキンソン病(PD)、前頭側頭型痴呆、脳血管疾患、多発性硬化症、およびニューロパシーにおけるニューロン変性と常に関連している。脳およびCNSは、それら自身が免疫学的に活性であるだけでなく、複雑な末梢性の免疫学的相互作用を有する。Fialaら(1998 Mol Med.Jul;4(7):480−9)は、アルツハイマー病において、血液脳関門の透過性および化学走性の変化(一部、ケモカインおよびサイトカインによって媒介される)が、末梢細胞の漸増および脳実質への末梢細胞の経血管内皮性通過を可能にし得ることを示した。血液脳関門のパラダイムは、インビボにおいて観察された解剖学的特徴および生理学的特徴を有するヒト脳血管内皮細胞および星状膠細胞を利用して構築された。このモデルは、血液脳関門モデルの脳側においてAβl−42によってチャレンジされた場合、単球/マクロファージの血管外遊出能力を試験するために使用した。そのモデルにおいて、Aβ1−42および脳側にある単球は、血液側から脳側への単球の血管外遊出を増加させた。いくらかの個体において、循環する単球/マクロファージは、活性化ミクログリアおよびマクロファージによって生成されたケモカインによって補充された場合、アルツハイマー病における脳の炎症性の破壊に加わることができた。
本明細書において使用される場合、用語「アルツハイマー患者」、「AD患者」、および「ADと診断された個体」は全て、ADと診断されたかまたは推定アルツハイマー病(AD)と診断される個体に言及する。
(バイオマーカー同定のための方法)
本発明は、神経学的疾患の診断のため、診断において補助するため、階層毎に分類するため、リスクを評価するため、モニターするため、および/または予見するために有用な1つ以上のバイオマーカーを同定するための方法を提供する。本発明の特定の局面では、一群のバイオマーカーのレベルが、1つ以上の個体からの末梢生物学的流体サンプルのセットについて得られる。これらサンプルは、それらが神経学的疾患の基礎を基に、1つ以上のサブセットに分離され得るように選択される(例えば、正常個体および筋萎縮性側索硬化症と診断された個体からのサンプル、または軽度のアルツハイマー病をもつ個体ならびに重症のアルツハイマー病および/または神経変性疾患のようなその他の神経学的疾患をもつ個体からのサンプル)。これらサンプルから測定された値は、互いと比較され、上記サブセット間で有意に異なるようなバイオマーカーを同定する。これらサブセット間で有意に変動するようなバイオマーカーは、次いで、神経学的疾患の判断で補助するため、診断のため、階層毎に分類するため、モニターするため、および/または予見のための方法で用いられ得る。本発明の別の局面では、1つ以上の個体からの末梢生物学的流体サンプルのセット(ここで、これらサンプルは、神経学的疾患の基礎を基に1つ以上のサブセットに分離され得る)に対する測定値が比較され、ここで有意に変動するバイオマーカーは、神経学的疾患の判断で補助するため、診断のため、階層毎に分類するため、モニターするため、および/または予見のために有用である。本発明のさらなる局面では、1つ以上の個体からの末梢生物学的流体サンプルのセット(ここで、これらサンプルは、神経学的疾患の基礎を基に1つ以上のサブセットに分離され得る)のレベルが、生成された測定値に対して測定され、ここで、有意に変動するバイオマーカーは、神経学的疾患の判断で補助するため、診断のため、階層毎に分類するため、モニターするため、および/または予見のために有用である。
本明細書に提供されるのは、認識機能を評価する、認識損傷を評価する、認識損傷を診断するか、またはその診断を補助するための方法であり、例えば、個体からの末梢生物学的流体サンプルのような個体からの生物学的流体サンプル中の1つ以上のAD診断の測定されたレベルを得る工程、およびこれらの測定されたレベルを参照レベルと比較する工程による。「AD診断マーカー」、「ADバイオマーカー」および「バイオマーカー」(本明細書では交換可能に用いられる)への参照は、本明細書に記載されるマーカーおよびそれらの使用を参照するための便宜の用語であり、そしてこれらマーカーがADを診断するために用いられるに過ぎないことを示すことは意図されない。本開示が明瞭にするように、これらのマーカーは、例えば、認識機能を評価するため、MCIを評価するため、ADを発症するリスクを評価するため、ADを階層に分類するためなどに有用である。ADバイオマーカーは、制限されないで、例えば、全血、血漿または血清を含む血液;尿;脳脊髄液;涙;および唾液のような、ヒトの生物学的流体(すなわち、生物学的流体サンプル)中に存在する分泌タンパク質または代謝物を含む。生物学的流体サンプルは臨床サンプルを包含し、そしてまた、血清、血漿、およびその他の生物学的流体を含む。血液サンプルは、例えば、血小板、リンパ球、多形核細胞、マクロファージ、赤血球を含む血液中に存在する種々の細胞タイプを含み得る。
免疫機構は、宿主防御システムの本質的部分であり、そして代表的には炎症性応答において顕著な特徴である。増加する数の研究が、この免疫系とCNSとの間の興味をそそる連携を発見している。例えば、このCNSは免疫監視から完全に保護されず、しかも種々の免疫細胞が血液−脳関門を横切り得ることが明瞭になった。侵入する白血球はこのCNS中の標的抗原を攻撃し得るか、または変性に対してニューロンを保護し得る成長因子を生成し得る(Hohlfeldら、2000、J.Neuroimmunol.107、161〜166)。これらの応答は、種々のタンパク質メディエーターを通じて惹起され、制限されないで、ニューロン、グリア細胞、内皮細胞および白血球を横切る細胞内伝達における、免疫および炎症システム中のサイトカイン、ケモカイン、神経栄養因子、コレクチン、キニン、および急性期タンパク質を含む。理論によって拘束されることなく、表7に列挙されるサイトカイン、ケモカイン、神経栄養因子、コレクチン、キニン、および急性期タンパク質は、アルツハイマー病、パーキンソン病、多発性硬化症、および神経障害のような神経変性および炎症性疾患に付随して血清中で異なって発現されると仮定される。サイトカインは、免疫系および炎症性応答を含む、多くの機能の活性化に関連するポリペプチドメディエーターの不均質群である。末梢サイトカインはまた、活性輸送機構を経由して直接的に、または迷走神経刺激を経由して間接的に血液−脳関門を貫通する。サイトカインは、このサイトカインを放出する細胞の挙動に影響して自己分泌様式で作用し得るか、または隣接する細胞の挙動に影響してパラ分泌様式で作用し得る。いくつかのサイトカインは、遠隔の細胞の挙動に影響して内分泌様式で作用し得るが、これは、それらの循環に入る能力おびそれらの半減期に依存する。このサイトカインファミリーは、制限されないで、インターロイキン(IL−Iα、IL−Iβ、ILIraおよびIL−2〜IL−18)、腫瘍壊死因子(TNF−αおよびTNF−β)、インターフェロン(INF−α、βおよびγ)、コロニー刺激因子(G−CSF、M−CSF、GM−CSF、IL−3およびいくつかのその他のIL)、および成長因子(EGF、FGF、PDGF、TGFα、TGFβ、BMP、GDF、CTGF、およびECGF)を含む。
サブセット間で著しく変動するバイオマーカーを同定する統計的試験は一般的t検定を含めて多数ある。しかし、測定するバイオマーカーの数が増えるにつれて、SAMのようなより複雑な方法を使用するのが一般的に有益である(Tusherら,2001,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.98(9):5116−21)。その他の有用な方法としてはツリーハーベスティング(Hastieら,Genome Biology 2001,2:research0003.1−0003.12)、自己組織化マップ(Kohonen,1982b,Biological Cybernetics 43(1):59−69)、頻出アイテムセット(Agrawalら,1993「Mining association rules between sets of items in large databases.」In Proc.of the ACM SIGMOD Conference on Management of Data,207−216ページ,Washington,D.C.,1993年5月)、ベイジアンネットワーク(Gottardo,Statistical analysis of microarray data,A Bayesian approach.Biostatistics(2001),1,1,pp1−37)、および一般に使用できるソフトウエアパッケージ類、CARTおよびMARSなどがある。
あるADバイオマーカーについて測定されたレベルと比較するために使用する参照レベルは前述の議論から明らかなように、実施する発明の局面に依存して変化し得る。AD診断法では、「参照レベル」は、代表的に、あらかじめ決められた参照レベル、例えばADまたはMCIに罹っていない集団から得られる平均レベルであるが、いくつかの例では、参照レベルは、AD患者を含む個体群の平均または中間レベルであり得る。いくつかの例において、あらかじめ決められた参照レベルは、年齢をマッチングさせている集団から得られるレベルから誘導される(例えば平均値または中央値)。本明細書中に開示されるいくつかの例において、年齢をマッチングさせている集団は、非AD神経変性障害を有する個体を含む。実施例11および実施例12を参照のこと。
測定された値および参照値を比較するプロセスは、問題のADバイオマーカーの測定された値および参照値の型に適した任意の都合のよい方法で行うことができる。上で考察されるように、「測定すること」は定量的または定性的測定法によって行われ、測定された値と参照値を比較する方法は使用する測定技術に依存して変わり得る。例えば定性的比色アッセイを用いてADバイオマーカーレベルを測定する場合、それらのレベルは、着色した反応産物の強度を視覚的に比較することによってか、または着色した反応産物の濃度測定または分光測定からのデータ(測定デバイスから得られる、例えば、棒チャートなどの数字的データまたはグラフ的データ)を比較することによって比較できる。しかし、本発明の方法に使用される測定された値は最も一般的には定量的数値(例えばサンプル1ミリリットルあたりのADバイオマーカーのナノグラム、または絶対量などの定量的濃度測定値)である。他の例において、測定された値は、定性的である。定性的測定に関しては比較は数字的データの検査、データ表示の検査によって(例えば、棒グラフまたは線グラフのようなグラフ的表現を検査することによって)行うことができる。
本発明は、ADバイオマーカー調節活性のための有望な候補薬剤をアッセイすることによってADおよび/またはMCIを処置する候補薬剤をスクリーニングする方法も提供する。上記スクリーニングアッセイは、インビトロおよび/またはインビボで行われる。本明細書に記載されるスクリーニング法によって同定される候補薬剤は、ADおよび/またはMCIを処置する治療剤として有用であると考えられる。
本発明は、本明細書に記載される任意の方法を実施するためのキットを提供する。本発明のキットはADバイオマーカーに特異的な少なくとも1種の試薬を備え得、さらに本明細書に記載の方法を実施するための説明書を備え得る。キットはADバイオマーカーの参照サンプル(すなわち、参照値として有用である)も含むことができる。キットは、任意のバイオマーカーおよび/または本明細書中に記載されるようなバイオマーカーのセットを備える。本明細書に記載されるキットに使用するための「AD診断マーカー」としては、GCSF;IFN−g;IGFBP−1;BMP−6;BMP−4;エオタキシン−2;IGFBP−2;TARC;RANTES;ANG;PARC;Acrp30;AgRP(ART);TIMP−1;TIMP−2;ICAM−1;TRAIL R3;uPAR;IGFBP−4;レプチン(OB);PDGF−BB;EGF;BDNF;NT−3;NAP−2;IL−1ra;MSP−a;SCF;TGF−b3;TNF−b;MIP−1d;IL−3;FGF−6;IL−6R;sTNF RII;AXL;bFGF;FGF−4;CNTF;MCP−1;MIP−1b;TPO;VEGF−B;IL−8;FAS;EGF−Rが挙げられるが、これらに限定されない。他の例において、本明細書中に記載されるキットに使用するための「AD診断バイオマーカー」としては、塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF);BBホモダイマー血小板由来増殖因子(PDGF−BB);脳由来神経栄養因子(BDNF);上皮増殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因子6(FGF−6)、インターロイキン−3(IL−3)、可溶性インターロイキン−6レセプター(sIL−6R)、レプチン(obとしても公知である)、マクロファージ炎症性タンパク質−1δ(MIP−1δ)、マクロファージ刺激タンパク質α鎖(MSP−α)、ニューロトロフィン−3(NT−3)、好中球活性化ペプチド−2(NAP−2)、RANTES、可溶性腫瘍壊死因子レセプター−2(sTNF RII)、幹細胞因子(SCF)、トロンボポイエチン(TPO)、組織性メタロプロテアーゼインヒビタ−1(TIMP−1)、組織性メタロプロテアーゼインヒビタ−2(TIMP−2)、トランスフォーミング増殖因子−β3(TGF−β3)、腫瘍壊死因子β(TGF−β)が挙げられるが、これらに限定されない。他の例において、キットはAD診断マーカー;レプチン、RANTES、PDFG−BBおよびBDNFの任意の1、2、3または4種類を備える。他の例において、本明細書中に記載されるキットに使用するための「AD診断バイオマーカー」としては、年齢をマッチングさせている正常コントロールに加えて例えばPDおよびPNなどの神経変性の他の非AD形態と比較される(すなわち、全てのコントロールと比較される)場合にADにおいて有意に増加(9A1〜9A2)または減少(9B)する、表9A1〜9A2および表9Bにおいて列挙されるバイオマーカーからなる群より選択される少なくとも1種のバイオマーカーが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの例において、表9A1〜9A2および表9Bに列挙されるバイオマーカーのうちの任意の1種以上(すなわち、そのバイオマーカーに特異的な試薬である)は、本明細書中に開示されるような方法(例えば、ADを診断するため、または例えばPDおよびPNなどの他の非AD神経変性疾患または非AD神経変性障害と区別してADを診断するための方法を含む)に使用するためのキットにおいて使用され得る。
アルツハイマー病患者(平均年齢74歳)から集めた32例の血清中の120種のタンパク質に関するタンパク質発現レベルを、コントロール群(平均年齢74歳)から集めた19例の血清中のそれらと比較した。アルツハイマー病患者は、神経科医によって臨床的にADと診断され、26〜14の範囲のMini Mental State Exam(MMSE)を示した。
RANTESおよびレプチンのレベルをコントロール被験体(平均年齢=74)からの18サンプルおよび軽度認識障害(MCI)と診断された患者からの6サンプルで測定した。MCI患者は神経科医によって臨床的に診断され、5未満のAULT−A7スコアおよび30〜28の範囲のMini Mental State Exam(MMSE)スコアを示した。コントロール被験体は5以上のAULT−A7スコアおよび30〜28の範囲のMMSEスコアを示した。
アルツハイマー病と診断された36名の患者(平均年齢74)から集めた血清サンプルにおいて、R&D systems社からのELISAキットを用い、製造業者からの説明書にしたがって、RANTES、レプチン、PDNF−BBおよびBDNFのレベルを測定した。生のELISA発現値は、各値を全サンプルの中央値で除算することによって正規化された。これらのサンプルをMMSEスコアに基づいて次の3群に分類した:クラス1(軽度AD)、MMSE27〜22;クラス2(中程度AD)、MMSE21〜16;クラス3(重症AD)、MMSE15〜12。
ELISAによって測定した4種類だけの識別マーカー、BDNF、PDGF−BB、レプチン、およびRANTESの血漿中の絶対濃度を用いてサンプルを分類した。ELISAキットはR&D Systems社から購入し、測定値を、製造業者の推奨にしたがって得た。例えばRANTESでは以下のプロトコルにしたがった。
1.50μLの標準、サンプルまたはコントロールを適切なウェルに加える。
2.50μL抗−RANTESビオチン結合体を各ウェルに加える。
3.ウェルを37℃で1時間インキュベートする。
4.吸引し、洗浄緩衝液でウェルを4回洗う。
5.100μLストレプトアビジン−HRP結合体を各ウェルに加える。
6.室温で30分間インキュベートする。
7.吸引し、洗浄緩衝液でウェルを4回洗う。
8.安定化クロモゲン100μLを各ウェルに加える。
9.暗所において室温で30分間インキュベートする。
10.停止溶液100μLを各ウェルに加える。
11.450nmの吸光度を読み取る。
AD(n=95)対年齢的にマッチしたコントロール(n=88)の血漿サンプルにおけるタンパク質、レプチン、BDNFおよびRANTESのタンパク質濃度を図1A〜1Cに示す。本発明者らが測定した4種類のタンパク質のうちの1つは脳由来神経栄養因子(BDNF)であった。AD血漿におけるBDNFの平均濃度は8.1ng/ml(SE±0.4)であり、これに対してコントロール血漿の平均は10.8ng/ml(SE±0.68)であった。その差は統計的に極めて有意であることが判明した(p値=0.0006)。ADに比べてその他の形の痴呆ではBDNFの濃度がより低い(5.74ng/ml、n=20)ことを本発明者らは見いだした。AD血漿中の第二のタンパク質であるレプチンの平均濃度は10.9ng/ml(SE±1.06)であり、これに対してコントロール血漿の平均値は17.4ng/ml(SE±1.8)であることが判明した。その差は統計的に非常に有意であることが判明した(p値=0.0018)。AD血漿中の第三のタンパク質であるRANTESの平均濃度は66.3ng/ml(SE±2.4)であり、これに対してコントロールサンプルでは74.5ng/ml(SE±3.2)であることが判明した。この差は統計的に非常に有意であることが判明した(p値=0.0403)。MMSEスコア≧20を有するAD患者(n=54)とMMSEスコア<20(n=41)のAD患者との間ではRANTES、PDGF−BB、およびBDNFの濃度の平均値の差は認められなかった。
さらに、血漿中のバイオマーカーの絶対濃度をBDNFについて測定し、コントロールの平均濃度をMCI(軽度認識障害)、MMSE25〜28、MMSE20〜25、およびMMSE10〜20と比較した。この実験の目的のために下記の実施例において使用した指数は:疑わしいAD=25〜28の範囲のMMSEスコア;軽度AD=20〜25の範囲のMMSEスコア;中程度AD=10〜20の範囲のMMSEスコアおよび重症AD=10〜20の範囲のMMSEスコアである。実施例7の目的から、疑わしいADを有すると評価された全ての患者は、医師によってADに罹っていると診断された。図2は、MMSE25〜28;MMSE20〜25;MMSE10〜20を示す血漿中のBDNFの平均濃度は、コントロール(正常、平均年齢74)の平均濃度より有意に低く、MCIのBDNF濃度はコントロールおよび全てのAD症例より有意に高いことを示す。図2。
ADの末梢免疫系において変化するタンパク質を同定する目的で、AD患者32名および年齢的にマッチしている痴呆でないコントロール19名から得た血漿について120種のサイトカイン、ケモカイン、および増殖因子の発現レベルをフィルター上の斑点抗体マイクロアレイを用いて測定した。統計分析により、ADとコントロールとの間で有意に異なる20種のタンパク質が同定された。これらのうち、脳由来神経栄養因子(BDNF)およびNT−3、およびPDGF−BB、EGF、FGF−6、bFGF、TGF−b3を含む6種類は既知の神経栄養活性を有し、AD血漿中では有意に減少していた。BDNFレベルは、mini mental state exam(MMSE)によるより良い認識機能と相関を示した。200のAD症例およびコントロールからの血漿について、市販のサンドイッチELISAを用いて得られたBDNF測定された値は、AD症例において25%という高度に有意な減少を示した。アレイデータと一致して、減少した血中BDNFレベルは記憶機能障害と関連していた。BDNFは神経細胞の維持、生存および機能のために重要である。理論によって裏付けられているわけではないが、ADではニューロトロフィンおよびBDNFの血中レベルの減少が神経変性および認識機能異常と関連しているらしい。
さらに、GDNF、SDF−1、IGFBP3、FGF−6、TGF−b3、BMP−4、NT−3、EGF、BDNF、IGFBP−2の定性的バイオマーカーレベルはADサンプル(MMSEの範囲12〜28)およびコントロールサンプル(MMSEの範囲25〜30)ではMMSEスコア(MMSEの範囲12〜30)と関連していた。表5は相関性およびそれらの統計的有意性(p値)を示す。より高い相関およびより低い相関は、MMSEスコアの範囲の上端とバイオマーカー濃度、またはMMSEスコアの範囲の下端とバイオマーカー濃度、のどちらがより大きく相関しているかを示す。負の相関はバイオマーカーレベルが減少するにつれてMMSEスコアは高まることを意味し、その逆も同様である。正の相関は、バイオマーカーレベルの増加につれてMMSEスコアが増加することを意味する。
この実施例は、ADバイオマーカーのレベルを測定し、そして/またはADバイオマーカーのレベルの測定に関してデータを分析し、そして/またはADバイオマーカーのレベルの測定に基づいてデータを関連付け、そして/または異なる試験施設にわたる被験体由来の生物学的サンプルから得たADバイオマーカーのレベルの測定に基づいてデータを分析および/もしくは関連付けることによってADバイオマーカーを同定するために有用な方法を記載する。これらの方法はまた、個体および/または単一の回収施設から得た生物学的サンプルに適用可能である。その方法は、回収手順および/または保存条件および取り扱い条件から生じる試験施設変動を最小化するか、またはそれらを減少させるように設計される。この実施例は、実施例12と一緒に、ADの検出に有用であるさらなるバイオマーカーを同定するための方法を提供し、その方法は、高い程度の感度(その実験に使用したADサンプルの総数によって除算したADクラスターにおけるADサンプルの数として計算される)および特異性(ADを診断するための実験において使用したコントロールの総数によって除算したコントロールクラスターにおけるコントロールの数として計算される)を提供するマーカー、ならびにこのようなバイオマーカーを同定することを含む。
この実施例は、健康な年齢をマッチングさせているコントロールおよび/または非ADである神経変性性の年齢をマッチングさせているコントロール(すなわち、非AD神経変性コントロール(パーキンソン病(PD)および末梢神経障害(PN))と比較して、ADと診断された個体において増加する(13A)かまたは減少する(13B)かのいずれかであるADバイオマーカーを同定するための方法を記載する。ADが神経変性疾患であり、そして適切なコントロール(ADに特有でありそして/または同じ年齢群において、神経変性の他の非AD(例えば、PDおよびPN)と区別可能である)および健康な年齢をマッチングさせているコントロールに対して減少するかまたは増加するかのいずれかであるバイオマーカーの同定に関して、ADに関連した神経変性のバイオマーカーパターンを同定することが有益であるので、この方法は、重要である。
90%よりも大きい(r=0.9〜r=0.99)相関;
0.001〜0.05未満のP値;
20%よりも大きい変化倍数;および
1よりも大きいスコア(増加するマーカーについて)または1未満のスコア(減少するマーカーについて)。
この実施例は、有意であると2つの異なる実験(単一の回収施設および複数の回収施設)において同定された、ADの診断において補助するためまたはADを診断するためのバイオマーカーを提供する。
実施例14は、下で表14に示されるようなAD被験体のMMSEスコア(8〜28)と有意に相関することが見出されたバイオマーカーの同定を開示する。したがって、リンホタクチンおよびIL−11は、初期〜中程度のADの検出ならびにその疾患の病気分類および進行のために有用である。リンホタクチンおよび/またはIL−11は、単独か、または他のADバイオマーカー(本明細書中に開示した方法において本明細書中に記載したADバイオマーカーを含む)と一緒に使用され得る。したがって、ADを階層化するための方法およびADの進行をモニターするための方法が、本明細書中に提供され、これらの方法は、個体由来の生物学的流体サンプル(例えば、血漿)中のリンホタクチンおよび/またはIL−11の測定されたレベルをそのバイオマーカーの参照レベルと比較することを包含する。
Claims (34)
- アルツハイマー病(「AD」)の診断を補助するための方法であって、該方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該バイオマーカーについての参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該AD診断バイオマーカーは、GCSF;IFN−g;IGFBP−1;BMP−6;BMP−4;Eotaxin−2;IGFBP−2;TARC;RANTES;ANG;PARC;Acrp30;AgRP(ART);TIMP−1;TIMP−2;ICAM−1;TRAIL R3;uPAR;IGFBP−4;レプチン(OB);PDGF−BB;EGF;BDNF;NT−3;NAP−2;IL−1ra;MSP−a;SCF;TGF−b3;TNF−b;MIP−1d;IL−3;FGF−6;IL−6 R;sTNF RII;AXL;bFGF;FGF−4;CNTF;MCP−1;MIP−1b;TPO;VEGF−B;IL−8;FAS;EGF−Rからなる群より選択される、方法。
- 少なくとも2種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルと比較する工程を包含する、請求項1に記載の方法。
- 少なくとも3種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項1に記載の方法。
- 少なくとも4種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項1に記載の方法。
- 少なくとも5種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項1に記載の方法。
- 前記測定された値と、測定された各AD診断バイオマーカーの参照値とを比較する工程は、該測定された値と該参照値との間の倍数差を計算する工程を包含する、請求項1に記載の方法。
- アルツハイマー病(「AD」)の診断を補助するための方法であって、該方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該AD診断バイオマーカーは、BTC;SDF−1;MCP−2;IFN−γ;IGFBP−4;IGF−1SR;IL−8;GM−CSF;およびANG−2からなる群より選択される、方法。
- 少なくとも2種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項7に記載の方法。
- 少なくとも3種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項7に記載の方法。
- 少なくとも4種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項7に記載の方法。
- 少なくとも5種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項7に記載の方法。
- 少なくとも1種のAD診断バイオマーカーは、バイオマーカーIFN−γおよびIL−8からなる群より選択される、請求項7に記載の方法。
- アルツハイマー病(「AD」)の診断を補助するための方法であって、該方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該AD診断バイオマーカーは、TNF RII;MSP−α;uPAR;TPO;MIP−1β;VEGF−β;FAS;MCP−1;NAP−2;ICAM−1;TRAIL R3;PARC;ANG;IL−3;MIP−1δ;IFN−γ;IL−8;およびFGF−6からなる群より選択される、方法。
- 少なくとも2種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項13に記載の方法。
- 少なくとも3種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項13に記載の方法。
- 少なくとも4種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項13に記載の方法。
- 少なくとも5種のAD診断バイオマーカーの前記測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含する、請求項13に記載の方法。
- アルツハイマー病(「AD」)の診断を補助するための方法であって、該方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該AD診断バイオマーカーは、リンホタクチンおよびIL−11からなる群より選択される、方法。
- 前記生物学的流体サンプルは、末梢性の生物学的流体サンプルである、請求項7または13に記載の方法。
- アルツハイマー病(AD)患者においてADの進行をモニターするための方法であって、該方法は、個体由来の生物学的流体サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該バイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該AD診断バイオマーカーは、リンホタクチンおよびIL−11からなる群より選択される、方法。
- 前記参照レベルは、早期時点で、前記同じAD患者由来の生物学的流体サンプルから得られたレベルである、請求項20に記載の方法。
- 前記生物学的流体サンプルは、抹消性の生物学的流体サンプルである、請求項20に記載の方法。
- 個体におけるアルツハイマー病(AD)を層別化するための方法であって、該方法は、該個体由来の生物学的サンプル中の少なくとも1種のAD診断バイオマーカーの測定されたレベルと、該少なくとも1種のバイオマーカーの参照レベルとを比較する工程を包含し、ここで該少なくとも1種のバイオマーカーは、リンホタクチンおよびIL−11からなる群より選択される、方法。
- 前記生物学的流体サンプルは、抹消性の流体サンプルである、請求項23に記載の方法。
- ADの診断を補助することにおいて使用するためのキットであって、該キットは、少なくとも1種のAD診断マーカーに特異的な少なくとも1種の試薬およびADの診断を補助するための方法を実施するための説明書を含み、ここで該少なくとも1種のAD診断バイオマーカーは、BTC;SDF−1;MCP−2;IFN−γ;IGFBP−4;IGF−1SR;IL−8;GM−CSF;およびANG−2からなる群より選択される、キット。
- 前記少なくとも1種のAD診断バイオマーカーは、バイオマーカーIFN−γおよびIL−8からなる群より選択される、請求項25に記載のキット。
- ADの診断を補助することにおいて使用するためのキットであって、該キットは、少なくとも1種のAD診断マーカーに特異的な少なくとも1種の試薬およびADの診断を補助するための方法を実施するための説明書を含み、ここで該少なくとも1種のAD診断バイオマーカーは、sTNF RII;MSP−α;uPAR;TPO;MIP−1β;VEGF−β;FAS;MCP−1;NAP−2;ICAM−1;TRAIL R3;PARC;ANG;IL−3;MIP−1δ;IFN−γ;IL−8;およびFGF−6からなる群より選択される、キット。
- ADの診断を補助することにおいて使用するためのキットであって、該キットは、少なくとも1種のAD診断マーカーに特異的な少なくとも1種の試薬およびADの診断を補助するための方法を実施するための説明書を含み、ここで該少なくとも1種のAD診断バイオマーカーは、バイオマーカーリンホタクチンおよびIL−11からなる群より選択される、キット。
- 前記AD診断バイオマーカーに特異的な試薬は、該AD診断バイオマーカーに特異的な抗体またはそのフラグメントである、請求項28に記載のキット。
- データを正規化するための少なくとも1種のバイオマーカーをさらに含む、請求項28に記載のキット。
- 前記データを正規化するためのバイオマーカーは、TGF−βおよびTGF−β3からなる群より選択される、請求項30に記載のキット。
- 神経学的疾患を診断するために有用な少なくとも1種のバイオマーカーを同定するための方法であって、該方法は、
末梢性の生物学的流体サンプルのセットから、複数のバイオマーカーの測定された値を得る工程であって、ここで該末梢性の生物学的流体サンプルのセットは、神経学的疾患を基礎としたサブセットへと分割することができる、工程;
少なくとも1種のバイオマーカーの各サブセットからの測定された値を比較する工程;ならびに
該測定された値が該サブセット間で統計学的に異なる少なくとも1種のバイオマーカーを同定する工程、
を包含する、方法。 - 前記神経学的疾患はADである、請求項32に記載の方法。
- 神経変性疾患の診断を補助するための方法であって、該方法は、表12A〜12Bに示される、1.5未満のq値%を有する1種以上のバイオマーカーの測定された値を得る工程、および該測定された値と参照値とを比較する工程を包含する、方法。
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