JP2008295415A - 1細胞レベルでの抗体遺伝子の解析・同定方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取し、標識化がん特異的抗原ペプチド及びヒト抗体により、末梢血単核球中のB細胞を標識化して、抗体を細胞膜上に発現するB細胞を1細胞ずつ分取し、全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成し、合成したcDNAを鋳型としたPCR反応により遺伝子断片を増幅して、増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する。
【選択図】なし
Description
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(G)増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する工程;
や、[2]以下の(A)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(G)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子の解析・同定方法
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(G)増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する工程;
に関する。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(H)増幅された遺伝子断片を、発現ベクターを用いて発現させる工程;
や、[5]以下の(A)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(H)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体を製造する方法
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(H)増幅された遺伝子断片を、発現ベクターを用いて発現させる工程;
や[6]がん特異的抗原ペプチドが、HLA−A24又はHLA−A2拘束性のがん特異的抗原ペプチドであることを特徴とする上記[4]又は[5]記載の抗体を製造する方法に関する。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
や、[8]以下の(A)、(C)、(D)、(E)及び(F)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子を調製する方法
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
や、[9]がん特異的抗原ペプチドが、HLA−A24又はHLA−A2拘束性のがん特異的抗原ペプチドであることを特徴とする上記[7]又は[8]記載の抗体遺伝子を調製する方法に関する。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(G)増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する工程;
(H)増幅された遺伝子断片を、発現ベクターを用いて発現させる工程;
なお、これまでの検討でヒト末梢血に含まれるB細胞は、全細胞の約10%、細胞膜上に抗体(IgG)を発現するB細胞は、その内の約2%と考えられ、細胞膜表面抗体陽性のB細胞は、全細胞の0.2%しか存在せず、この中でさらにMAGE1ペプチド陽性細胞はさらに少数であり、通常の方法では検出することが困難と考えられる。しかし、本発明では、前記工程(A)において、がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンにより免疫され、すでに抗体価の増加したがん患者のB細胞を用いるため、微少の細胞の検出が可能となる。このように、本発明においては、あらかじめがん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンを投与する工程(A)が、きわめて重要である。
メラノーマ細胞特異的抗原ペプチドMAGE1を用いたワクチン治療を受けた転移性メラノーマ患者由来の末梢血単核球を以下のようにして採取した。
転移性メラノーマ患者(症例:MEL−018)に、HLA−A24拘束性MAGE1135−143(MAGE1−A24)により処理された樹状細胞ワクチンを投与し、MAGE1−A24に対する免疫応答を確認した。MAGE1135−143のアミノ酸配列は配列番号70に示す。このMEL−018患者由来の末梢血から、末梢血単核球(peripheral blood mononuclear cell; PBMC)を採取し、以下の実験に用いた。
エプスタインバールウイルス(EBV)による不死化B細胞株(EBV−B細胞株)を以下のようにして作製した。
フィーダーであるヒト繊維芽細胞株(MRC−5;ATCC cat.CCL−171)を、25cm2フラスコにて90%confluencyまで増殖させ(培地:MEM+10%FBS)、30−40Gyのirradiationを実施した。24時間後、実施例1で採取したMEL−018症例由来PBMCを1〜2×107cells/4mlとなるように培地(IMDM+20%FBS)に懸濁し、上記の培養MRC−5に加えた。その後、EBV溶液(EBV strain B95−8, ATCC cat.VR−1492)1mlを25mlフラスコに添加し、37℃、5%CO2の気相条件下で培養した。48時間後に培地を交換した後、4日ごとに培地交換を行った。3〜4週間後に、B細胞の増殖を確認し、EBウイルスにより不死化したB細胞(EBV−B細胞)を回収した。株化した細胞を、Bリンパ球マーカーである抗CD19抗体、抗ヒトIgG抗体、及びFITC標識MAGE1−A24ペプチドにて染色し、EBV−B細胞株の特性を検討した。
EBV−B細胞を抗CD19抗体、抗ヒトIgG抗体、及びFITC標識MAGE1−A24ペプチドにより染色した。結果を図7に示す。抗CD19抗体よる染色の結果、EBV−B細胞株は、ほとんどすべての細胞がCD19+(98.4%)であった。また、EBV−B細胞株の抗原特異性を検討する目的で、FITC標識MAGE1−A24により細胞を染色した。ネガティブコントロールとしてA24拘束性HIVペプチド(HIV−A24)を、ポジティブコントロールとしてA24拘束性CMVペプチド(CMV−A24)を合成・精製し、染色に用いた。CD19+細胞のうち、ヒトIgG、MAGE1−A24陽性細胞は、それぞれ約20%、6%(ペプチド濃度10μg/mlでの染色結果)であり、ヒトIgG+/MAGE1−A24ともに陽性細胞は、約2.5%であった(図7)。このFITC標識MAGE1+/PE標識抗ヒトIgG+ のEBV−B細胞は、シングルセルソーティングにより1細胞として選別・分離することができる。
シングルセルソーティング用モジュールを装着した、BD FACSAriaTMセルソーター(BD Science社製)により、MAGE1−A24+/ヒトIgG+のEBV−B細胞のシングルセルソーティングを行った。ソーティングの結果を図8に示す。ソーティングは、100μmのノズルを用い、sort setup: low , flow rate 5000 events/sec, Drop delay 25.73で行い、96ウェルプレート(MicroAmp(R) Optical 96-ウェル Reaction Plate;Applied Biosystem社製)に一細胞ずつ分取した。
分取された一細胞からのRNA抽出及び逆転写反応によるcDNAの合成は、SuperScriptTMIII CellsDirect cDNASynthesis System cell (cat.18080−300, Invitrogen社製)を用いて行った。まず、10μlのResuspensinBuffer 及び1μlのLysis Enhancer solutionを加え、サーマルサイクラーを用いて75℃で10分間処理した。続いて、5μlのDNaseI(1U/μl)及び1.6μlの10xDNaseIBufferを加え、ピペッティングにより混和し、室温で5分間インキュベートした。プレートを軽く遠心し、1.2μlの25mM EDTAを加え、サーマルサイクラーを用いて70℃で5分間インキュベートした。その後、プレートを軽く遠心し、氷上で、各ウェルに2μlの50mM Oligo(dT)20及び1μlの10mM dNTP Mixを加えた。ピペッティングによる混和の後、サーマルサイクラーを用いて70℃で5分間処理し、氷上で2分間インキュベートした。プレートを軽く遠心し、再び氷上で、6μlの5xRT Buffer、1μlのRNaseOUTTM(40U/μl)、1μlのSuperScriptTMIII RT(200U/μl)、及び1μlの0.1M DTTを加え、ピペッティングにより混和した。プレートを軽く遠心し、サーマルサイクラーを用いて50℃で50分間、85℃で5分間インキュベートし、cDNAを合成した。
ヒトIgG重鎖遺伝子、ヒトIgG軽鎖κ遺伝子、又はヒトIgG軽鎖λ遺伝子の各領域に特異的なPCR用プライマーを設計した。ヒトIgG重鎖遺伝子に特異的なプライマー塩基配列を図4及び配列番号1〜26に、ヒトIgG軽鎖κ遺伝子に特異的なプライマー塩基配列を図5及び配列番号27〜38に、ヒトIgG軽鎖λ遺伝子に特異的なプライマー塩基配列を図6及び配列番号39〜63にそれぞれ示す。また、各プライマーミックスにより増幅される遺伝子断片の大きさは、ヒトIgG重鎖遺伝子が1400bp、ヒトIgG軽鎖κ遺伝子が700bp、ヒトIgG軽鎖λ遺伝子が700bpである。
実施例5で調製したcDNAを、1サンプルにつき4本のPCR用0.2mlチューブ(#1〜#4)に1μlずつ分注し、各チューブに、1μlの10x PCR bufferII(Mg+)、1μlの2.5mM dNTP Mix、5.9μlのdH2O、0.1μlのLA−Taqポリメラーゼ(TaKaRa LA-Taq(R) Hot Start version;タカラバイオ社製)、0.5μlのフォワードプライマー(10μM)、及び0.5μlのリバースプライマー(10μM)を加え、サーマルサイクラー(GeneAmp(R) PCR System9700;Applied Biosystems社製)を用いてPCR反応を行った。チューブ#1は内部標準であるβ−アクチン遺伝子、チューブ#2はヒトIgG重鎖領域遺伝子、チューブ#3はヒトIgG軽鎖κ領域遺伝子、チューブ#4はヒトIgG軽鎖λ領域遺伝子のPCR反応に用いた。
チューブ#1のPCR反応は、94℃で5分間の熱変性の後、94℃で15秒及び68℃で2分間の反応を55サイクル、72℃で5分間の伸長反応、
チューブ#2及び#3のPCR反応は、94℃で5分間の熱変性の後、94℃で15秒及び68℃で1分間の反応を55、72℃で5分間の伸長反応、
チューブ#4のPCR反応は、94℃で5分間の熱変性の後、94℃で15秒及び60℃で30分間の反応を55サイクル、72℃で5分間の伸長反応。
得られたPCR反応液を、1.5%のアガロースゲルを用いて電気泳動し、エチヂウムブロマイド染色によりバンドを確認した。図9に示すように、用いた6細胞のうち5個において、β−アクチン遺伝子の増幅が確認された。また、ヒトIgG領域遺伝子領域増幅用プライマーセットにより増幅されたPCR産物のバンドの大きさを確認し、各プライマーセットにつき2サンプルずつのバンドを切り出した。選択されたバンドは図中に星印で示される。PCR反応物は、DNA抽出用カラム(QIAEXII(R) Gel Extraction Kit;QIAGEN社製)を用いてゲルから抽出・精製した。
実施例8で得られたPCR断片を、pCR2.1-TA Plasmid vectorに挿入することによりプラスミドDNAを作製した。DNA断片1μlのSalt Solution(TOPO TA Cloning(R) Kit pCR2.1(R)TOPO (R) Vector;Invitrogen社製)及び1μlのTOPO(R)Vector(TOPO TA Cloning(R) Kit pCR2.1(R)TOPO (R) Vector;Invitrogen社製)を氷上で混和した。室温で5分間反応させた後、再び氷上に戻しTransformationに使用した。
DH5αコンピテントセル(Competent high DH5α;TOYOBO社製)を氷上で融解し、20μlずつ別のサンプルチューブに分注した。実施例8で調製した反応液を2μlずつ加え、チップの先で穏やかに混和した。氷上に30分間置いた後、ヒートブロックを用いて42℃で30秒間処理をした。再び、氷上に2分間置き冷却した後、250μlのSOC培地を加え、37℃で1時間振盪培養を行った。振盪培養を行っている間に、50μg/mlのカナマイシンを含む2×YT固形培地に0.1M IPTG(Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside;SIGMA社製)及び0.1MX−Gal(5-Bromo-4-chloro-3-indolyl β-D-galactopyranoside;SIGMA社製)を50μlずつ塗付した。作製した固形培地に培養したサンプル100μlを播き、37℃で一晩培養した。
実施例9で作製したプレートにコロニーが出現していることを確認した後、4℃に5時間静置した。白いコロニーをマークしてからチップの先を使って軽くつつき、50μlの滅菌水の入った96ウェルプレートに入れて軽くゆすいだ。サーマルサイクラーを用いて95℃で5分間処理をした後に、軽く遠心を行い、2μlを新しいプレートのウェルに入れた。続いて、1μlの10x PCR bufferII(Mg+)、0.8μlの2.5mM dNTP Mix、6.11μlのdH2O、0.05μlのLA−Taqポリメラーゼ(TaKaRa LA-Taq(R) Hot Start version;タカラバイオ社製)、0.02μlの100μM M13 フォワードプライマー、及び0.02μlの100μM M13 リバースプライマーを加え、プレートを軽く遠心した。サーマルサイクラーGeneAmp(R) PCR System9700を用いて、94℃で1分間の熱変性の後、94℃で10秒、50℃で10秒、及び68℃で2分間の反応を35サイクル繰り返す反応条件でのPCR反応を行った。1.5%アガロースゲルを用いた電気泳動により、各PCR反応液のPCR産物(チューブ#2:1.6Kbp、チューブ#3:0.9Kbp、チューブ#4:0.9Kbp)を確認した。
実施例11により、ベクターへのPCR増幅断片の挿入が確認されたコロニーを選び、3.5mlの50μg/mlのカナマイシンを含む2×YT液体培地中で、37℃で一晩振盪培養を行った。培養したサンプル1.8mlを2mlサンプルチューブに入れ、1000×gで10分間遠心した。上清を廃棄し、沈殿に対して250μlのBuffer A1(NucleoSpin(R) Multi-8 Plasmid;MACHEREY-NAGEL社製)を加えvortexして混和した。続いて、250μlのBuffer A2を加え転倒混和してから室温で5分間置き、細胞を溶解させた。350μlのBuffer A3を加え転倒混和し、4℃・14000×gで10分間遠心をした。上清をNucleoVac vacuum manifoldにセットしたNucleoSipn(R) Plasmid Binding Stripsに移した。400mbarで1分間吸引して溶液をsilica membraneを透過させ、DNAを結合させた。600mlのBuffer AWを加え400mbarで1分間吸引して溶液を透過させた後、900mlのBuffer A4を加えて、400mbarで1分間吸引して溶液を透過させ、silica membraneを洗浄した。再度、900mlのBuffer A4を加えて、400mbarで1分間吸引して溶液を透過させ、silica membraneを洗浄した。600mbarで15分間吸引し、silica membraneを乾燥させた。NucleoVac vcuum manifoldに回収用のNucleoSipn(R) MN Tube Stripsを付け替え、membraneに120μlのBuffer AEを加え1分間置き、400mbarで1分間吸引してプラスミドDNAを回収した。回収したプラスミドDNA液3μlに、1μlの10×H Buffer、5μlのdH2O、及び1μlのEcoRI(TOYOBO社製)加え、37℃で1時間処理した。1.5%アガロースゲルを用いた電気泳動により、酵素反応液中のDNA消化断片(チューブ#2:1.4Kbp、チューブ#3:0.7Kbp、チューブ#4:0.7Kbp)を確認し、各プラスミドサンプルについて吸光度を測定してDNA濃度を算出し、100μg/μlのプラスミドDNA希釈液を調製した。
氷上に置いた96ウェルプレートに実施例11で調製したDNA希釈液をチューブ#2については3ウェル(#2−1、#2−2、#2−3)に、チューブ#3及び#4については2ウェル (#3−1、#3−2及び#4−1、#4−2) にそれぞれ6μlずつ加えた。続いて、各ウェルに、3μlの5×Sequencing Buffer (BigDye(R)Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit;Applied Biosystem社製)、2μlのBigDye(R) Terminator Pre mix(BigDye(R)Terminatorv3.1 Cycle Sequencing Kit;Applied Biosystem社製)、8μlのdH2O、1μlの3.2μM プライマーを加え、軽く遠心した。
EBV−B1細胞由来の抗体遺伝子レパトワ解析結果を表1に示す。ヒトIgG重鎖領域(IGH)は1クローンが、ヒトIgG軽鎖領域はそれぞれ2つの配列が得られた。
実施例14で決定した、不死化したEBV−B細胞のレパトワが、不死化処理をしていないBリンパ球(集団)においても発現しているかを以下の実験により確認した。
Claims (9)
- 以下の(A)、(B)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(G)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子の解析・同定方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(G)増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する工程; - 以下の(A)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(G)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子の解析・同定方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(G)増幅された遺伝子断片の塩基配列を解析・決定する工程; - がん特異的抗原ペプチドが、HLA−A24又はHLA−A2拘束性のがん特異的抗原ペプチドであることを特徴とする請求項1又は2記載の解析・同定方法。
- 以下の(A)、(B)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(H)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体を製造する方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(H)増幅された遺伝子断片を、発現ベクターを用いて発現させる工程; - 以下の(A)、(C)、(D)、(E)、(F)及び(H)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体を製造する方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程;
(H)増幅された遺伝子断片を、発現ベクターを用いて発現させる工程; - がん特異的抗原ペプチドが、HLA−A24又はHLA−A2拘束性のがん特異的抗原ペプチドであることを特徴とする請求項4又は5記載の抗体を製造する方法。
- 以下の(A)、(B)、(C)、(D)、(E)、及び(F)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子を調製する方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(B)得られた末梢血単核球をエプスタインバールウイルス(EBV)を用いて、不死化B細胞(EBV−B細胞)株を作製する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程; - 以下の(A)、(C)、(D)、(E)及び(F)の工程を順次備えたことを特徴とする、1個のB細胞由来の抗体遺伝子を調製する方法。
(A)がん特異的抗原ペプチドで処理された樹状細胞ワクチンの投与により、該がん特異的抗原ペプチドに対する免疫応答が確認されているがん患者から得られる末梢血単核球を採取する工程;
(C)標識物質により標識された前記がん特異的抗原ペプチドと、前記標識物質とは異なる標識物質により標識された、ヒト抗体を認識しうる抗体とにより、末梢血単核球中のB細胞を標識化する工程;
(D)前記がん特異的抗原ペプチドを認識する抗体を細胞膜上に発現するB細胞を、1細胞ずつ分取する工程;
(E)1細胞から全RNAを抽出し、逆転写反応によりcDNAを合成する工程;
(F)合成したcDNAを鋳型として、ヒト抗体重鎖領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、ヒト抗体軽鎖κ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応、又はヒト抗体軽鎖λ領域遺伝子に特異的なプライマー対を用いたPCR反応とにより、それぞれの領域遺伝子断片を増幅する工程; - がん特異的抗原ペプチドが、HLA−A24又はHLA−A2拘束性のがん特異的抗原ペプチドであることを特徴とする請求項7又は8記載の抗体遺伝子を調製する方法。
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Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2010094475A1 (en) * | 2009-02-20 | 2010-08-26 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Method for obtaining immunoglobulin encoding nucleic acid |
EP2316936A1 (en) * | 2008-06-04 | 2011-05-04 | Shizuoka Prefecture | Method for analysis/identification of antibody gene at one-cell level |
JP2014521316A (ja) * | 2011-07-12 | 2014-08-28 | エックスバイオテク,インコーポレイテッド | 親和性成熟化ヒト抗体の同定 |
JP2016220687A (ja) * | 2011-04-28 | 2016-12-28 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | 試料に関連するポリヌクレオチドの同定 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004173681A (ja) * | 2002-11-14 | 2004-06-24 | Atsushi Muraguchi | 抗原特異的リンパ球検出用マイクロウェルアレイチップ、抗原特異的リンパ球の検出法及び製造方法 |
JP2004187676A (ja) * | 2002-11-29 | 2004-07-08 | Atsushi Muraguchi | 抗原特異的リンパ球抗原受容体遺伝子のクローニング方法 |
WO2007055226A1 (ja) * | 2005-11-10 | 2007-05-18 | National University Corporation University Of Toyama | 抗原特異的リンパ球の検出方法および調製方法 |
WO2007067046A1 (en) * | 2005-12-09 | 2007-06-14 | Academisch Medisch Centrum Bij De Universiteit Van Amsterdam | Means and methods for influencing the stability of antibody producing cells |
-
2007
- 2007-06-01 JP JP2007147525A patent/JP5205597B2/ja active Active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2004173681A (ja) * | 2002-11-14 | 2004-06-24 | Atsushi Muraguchi | 抗原特異的リンパ球検出用マイクロウェルアレイチップ、抗原特異的リンパ球の検出法及び製造方法 |
JP2004187676A (ja) * | 2002-11-29 | 2004-07-08 | Atsushi Muraguchi | 抗原特異的リンパ球抗原受容体遺伝子のクローニング方法 |
WO2007055226A1 (ja) * | 2005-11-10 | 2007-05-18 | National University Corporation University Of Toyama | 抗原特異的リンパ球の検出方法および調製方法 |
WO2007067046A1 (en) * | 2005-12-09 | 2007-06-14 | Academisch Medisch Centrum Bij De Universiteit Van Amsterdam | Means and methods for influencing the stability of antibody producing cells |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
EUR. J. IMMUNOL., vol. 21, JPN6012058072, 1991, pages 2529 - 2536, ISSN: 0002428866 * |
J. IMMUNOL. METH., vol. 207, JPN6012058074, 1997, pages 61 - 67, ISSN: 0002428867 * |
NUC. ACID. RES., vol. 28, no. 20, JPN6012058068, 2000, pages 85, ISSN: 0002428864 * |
SCIENCE, vol. 274, JPN6012058070, 1996, pages 94 - 96, ISSN: 0002428865 * |
シグマ抗体カタログ2001-2002, JPN6012036210, 2001, pages 546 - 547, ISSN: 0002428869 * |
日本免疫学会総会・学術集会記録, vol. 34, JPN6012036208, 2004, pages 259 - 3, ISSN: 0002428868 * |
Cited By (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2316936A1 (en) * | 2008-06-04 | 2011-05-04 | Shizuoka Prefecture | Method for analysis/identification of antibody gene at one-cell level |
EP2316936A4 (en) * | 2008-06-04 | 2012-03-07 | Shizuoka Prefecture | METHOD FOR ANALYZING / IDENTIFYING AN ANTIBODY GENE AT A UNICELLULAR LEVEL |
WO2010094475A1 (en) * | 2009-02-20 | 2010-08-26 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Method for obtaining immunoglobulin encoding nucleic acid |
JP2012518392A (ja) * | 2009-02-20 | 2012-08-16 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲー | 免疫グロブリンをコードする核酸を得る方法 |
JP2014221069A (ja) * | 2009-02-20 | 2014-11-27 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | 免疫グロブリンをコードする核酸を得る方法 |
US9399670B2 (en) | 2009-02-20 | 2016-07-26 | Hoffmann-La Roche Inc. | Method for obtaining immunoglobulin encoding nucleic acid |
JP2016220687A (ja) * | 2011-04-28 | 2016-12-28 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | 試料に関連するポリヌクレオチドの同定 |
JP2018193389A (ja) * | 2011-04-28 | 2018-12-06 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | 試料に関連するポリヌクレオチドの同定 |
US11098302B2 (en) | 2011-04-28 | 2021-08-24 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Identification of polynucleotides associated with a sample |
JP2014521316A (ja) * | 2011-07-12 | 2014-08-28 | エックスバイオテク,インコーポレイテッド | 親和性成熟化ヒト抗体の同定 |
US9670483B2 (en) | 2011-07-12 | 2017-06-06 | Xbiotech, Inc. | Immunoglobulin variable region libraries |
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