JP2008283902A - イネおよびその作出方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】イネは、イネ品種である「コシヒカリ」と「カサラス」の交配により得られる、耐倒伏性と玄米粒の大きさが改善されたイネであって、 染色体上に、下記(i)〜(iii)から選択されるいずれかの塩基配列を有し、かつ、残部の染色体領域がコシヒカリ由来の染色体で構成されてなることを特徴とする: (i)特定の塩基配列;(ii)前記(i)の塩基配列と少なくとも80%の同一性を有する塩基配列;および、(iii)前記(i)の塩基配列において1もしくは複数個の塩基が欠失、置換、挿入もしくは付加された塩基配列。
【選択図】なし
Description
本発明は、イネ品種である「コシヒカリ」と「カサラス」の交配により得られる、耐倒伏性と粒の大きさが改善された新規品種のイネ、およびその作出方法に関する。
コシヒカリは、我が国で開発された代表的なジャポニカ種のイネ品種であり、良食味品種として、半世紀に渡り、多くの人に指示されててきている。栽培技術の改良と消費者の良食味志向により作付け面積は年々拡大し、日本国内で最も多く栽培されている品種である。また、品種の改良のさらなる進展により、栽培の北限も北上してきており、今後も栽培面積が拡大することが予想される。
イネ品種である「コシヒカリ」と「カサラス」の交配により得られる、耐倒伏性と玄米粒の大きさが改善されたイネであって、
染色体上に、下記(i)〜(iii)から選択されるいずれかの塩基配列を有し、かつ、残部の染色体領域がコシヒカリ由来の染色体で構成されてなることを特徴とするものである:
(i) 配列番号1に示される塩基配列、
(ii) 前記(i)の塩基配列と少なくとも80%の同一性を有する塩基配列、および
(iii) 前記(i)の塩基配列において1もしくは複数個の塩基が欠失、置換、挿入もしくは付加された塩基配列。
このイネは、換言すると、非遺伝子組み換え作物(非GMO)である。
(a) コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として交配を行ってF1雑種を得、
(b) 得られたF1雑種に、コシヒカリを戻し交配し、この戻し交配を少なくとも2回繰り返し、
(c) 一塩基多型(SNP)マーカーを用いて、得られた世代の染色体の遺伝子型をタイピングし、
(d) 染色体1上の一塩基多型であるSNP−4、SNP−5および/またはそれらの近傍がカサラス型であって、他がコシヒカリ型である個体を選抜する
工程を含んでなる方法によって得られるものである。
(e) 一塩基多型SNP−4とSNP−5との間に見出される複数のSNP部位について、後代をタイピングして、それらの遺伝子型に基づいて個体を選抜する工程
をさらに含む。
(a) コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として交配を行ってF1雑種を得、
(b) 得られたF1雑種に、コシヒカリを戻し交配し、この戻し交配を少なくとも2回繰り返し、
(c) 一塩基多型(SNP)マーカーを用いて、得られた世代の染色体の遺伝子型をタイピングし、
(d) 染色体1上の一塩基多型であるSNP−4、SNP−5および/またはそれらの近傍がカサラス型であって、他がコシヒカリ型である個体を選抜する
を含んでなることを特徴とする。
好ましくは、この方法は、工程(d)の後に、前記した(e)工程をさらに含む。
前記したように、本発明によるイネは、
イネ品種である「コシヒカリ」と「カサラス」の交配により得られる、耐倒伏性と玄米粒の大きさが改善されたイネであって、
染色体上に、下記(i)〜(iii)から選択されるいずれかの塩基配列を有し、かつ、残部の染色体領域がコシヒカリ由来の染色体で構成されてなることを特徴とするものである:
(i) 配列番号1に示される塩基配列、
(ii) 前記(i)の塩基配列と少なくとも80%(好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、さらにより好ましくは98%以上、特に好ましくは99%以上)の同一性を有する塩基配列、および
(iii) 前記(i)の塩基配列において1もしくは複数個(好ましくは1または数個)の塩基が欠失、置換、挿入もしくは付加された塩基配列。
なお、本発明によるイネの染色体1は図1に模式的に示したような状態になっていると考えられる。
草型は中間型、稈長は中程度、稈の細太はやや太、稈の剛柔はやや柔、止葉の直立の程度は中程度である。穂長はやや短、穂数は中程度、粒着密度はやや密である。頴色は黄白、ふ先色は黄白〜黄、芒の有無と多少は極多、芒長は中である。玄米の形は中、玄米の大小は中、玄米の見かけの品質は中の下、光沢はやや大である。出穂期および成熟期は早生の晩、穂発芽性は難、耐倒伏性は極弱である。なおここでの指標は、コシヒカリを比較対象とし、必要により、農林水産省で公開されている水稲の特性表および審査基準に従って評価したものである。
本発明による新規イネは、品種「コシヒカリ」と「カサラス」との交配により得られるものである。好ましくは、前記したように、下記工程(a)〜(d)を含んでなる方法により得られるものである:
(a) コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として交配を行ってF1雑種を得、
(b) 得られたF1雑種に、コシヒカリを戻し交配し、この戻し交配を少なくとも2回繰り返し、
(c) 一塩基多型(SNP)マーカーを用いて、得られた世代の染色体の遺伝子型をタイピングし、
(d) 染色体1上の一塩基多型であるSNP−4、SNP−5および/またはそれらの近傍がカサラス型であって、他がコシヒカリ型である個体を選抜する。
コシヒカリ(反復親)とカサラス(供与親)の種子を用意し、これらをまず数日間(例えば2日間)、水に浸して約30℃に保温して催芽を施す。これらを温室にて栽培を進め、出穂させ交配させる。交配は、コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として行い、通常、母本の除雄を行った後、授粉を行う。交配処理後、約3〜4週間で登熟した段階、F1雑種の種子を得ることができる。
ここで、「コシヒカリ」と「カサラス」からのゲノムDNA抽出は、例えば、CTAB法(Murray,M.G,et al.,Nucleic.Acids.Res.,8,4321-4325,1980等)を用いて行うことができる。
遺伝子型のタイピングに際しては、タイピングを行う世代の種子を播種し、播種日より約7〜14日後に幼苗の葉を採取し、ここから、ゲノムDNAを簡易ゲノム抽出法(Lisa Monna,et al.,DNA Research,9,11-17,2002)により抽出する。
まず、両系統それぞれのゲノムDNAを鋳型としてSNPを含む領域をPCRにより増幅し、アガロースゲル電気泳動で増幅を確認した後、増幅産物を酵素処理して残存プライマーの分解、モノヌクレオチドの脱リン酸化を行う。次いで、SNPの一塩基手前に作成したSNPプライマーとそれぞれのSNPに対応する2種類の蛍光標識ジデオキシヌクレオチド(ddATP,ddCTP,ddGTP,ddCTPのうちいずれか2種類)を用いて、PCR産物を鋳型とし一塩基伸長反応させる(AcycloPrime反応)。反応産物はそれぞれのSNPに対応した蛍光偏光度を示すため(Chen,X.et al.,Genome Res.,9,492-498,1999)、この蛍光偏光度を測定し、遺伝子型をタイピングする。なおここで、遺伝子型の「タイピング」とは、SNP部位の塩基種がコシヒカリ型か、カサラス型かを決定・判定することをいう。
本発明の好ましい態様によれば、前記工程の後に、一塩基多型SNP−4とSNP−5との間に見出される複数のSNP部位について、後代をタイピングして、それらの遺伝子型に基づいて個体を選抜する工程をさらに行う。
本発明において、反復親である品種「コシヒカリ」と供与親である品種「カサラス」との間で使用可能なSNPを全ゲノム上に下記のようにして89個検出して(表1)、SNPマーカーを設定した(表2)。
コシヒカリ(反復親)とカサラス(供与親)の種子を用意し、これらにまず催芽処理を施した後、温室にて栽培を進め、出穂させ、交配させた。交配は、コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として行い、母本の除雄を行った後、授粉を行った。交配処理後、登熟させた後、F1雑種の種子を得た。
まず、両系統それぞれのゲノムDNAを鋳型としてSNPを含む領域をPCRにより増幅し、アガロースゲル電気泳動で増幅を確認した後、増幅産物を酵素処理して残存プライマーの分解、モノヌクレオチドの脱リン酸化を行った。次いで、SNPの一塩基手前に作成したSNPプライマーとそれぞれのSNPに対応する2種類の蛍光標識ジデオキシヌクレオチド(ddATP,ddCTP,ddGTP,ddCTPのうちいずれか2種類)を用いて、PCR産物を鋳型とし一塩基伸長反応させた(AcycloPrime反応)。反応産物はそれぞれのSNPに対応した蛍光偏光度を示すため(Chen,X.et al.,Genome Res.,9,492-498,1999)、この蛍光偏光度をマルチラベルカウンターで測定し、遺伝子型をタイピングした。
例2に従って得られた固定系統を、圃場(愛知県愛知郡東郷町内の農場)において、2005年と2006年の2年間に渡り2回栽培し、詳細な形質調査(特性調査)を行った。
形質調査にあたっては、比較例として、コシヒカリと、日本晴の各品種を同条件にて栽培した。
栽培規模は、各品種について0.06aであり、耕種方法は愛知県における標準的な水稲の耕種方法によった。本発明によるイネはコシヒカリと同様に病抵抗性を有さないため、適期に必要な薬剤散布を行い防除に努めた。
例3に従って栽培した本発明によるイネと、比較例であるコシヒカリおよび日本晴について、稈長、穂長、穂数、籾1000粒重、玄米1000粒重、および種子の再分化能などについて、測定し比較を行った。測定および評価にあたっては、農林水産省の品種登録ホームページ(http://hinsyu.maff.go.jp/)で公開されている水稲の特性表および審査基準に従った。結果は下記の通りであった。
なお図9は出穂期の本発明によるイネとコシヒカリの形態を撮影した写真である。図10は、収穫された本発明によるイネとコシヒカリを撮影した写真である。また図11は、本発明によるイネと比較例としてのコシヒカリ、日本晴およびアキヒカリの玄米を比較して撮影した写真である。
各品種の出穂期(出穂日)を調査した。出穂日は、2005年栽培時および2006年栽培時共に、本発明によるイネ(両年とも8月8日)とコシヒカリ(2005年は8月8日、2006年は8月9日)とでは、殆ど差がないことが確認された。
成熟期を迎えたイネを採取し、穂の長さを除いて、それぞれの稈長を測定し、各裁判条件ごとに平均値を求めた。
結果は図4に示されるとおりであった。
結果から明らかなように、成熟期における本発明によるイネの稈長は、コシヒカリよりも平均して6cm程短かった。
穂長および穂数についての結果はそれぞれ図5および図6に示されるとおりであった。
結果は図7に示されるとおりであった。
籾1000粒重については、本発明によるイネの重量がコシヒカリに比べて大きい傾向が観察された。
結果は図8に示されるとおりであった。
玄米1000粒重についても、本発明によるイネの重量がコシヒカリに比べて大きい傾向が観察された。
玄米の長さは、2005年および2006年の測定値の平均をとると、本発明によるイネでは5.06mmであり、コシヒカリでは、5.01mmであった。
玄米の幅は、2005年および2006年の測定値の平均をとると、本発明によるイネでは2.99mmであり、コシヒカリでは、2.91mmであった。
玄米の側面からの形は、本発明によるイネおよびコシヒカリの共に半円形であり、色は共に淡い褐色で、香りも共に殆ど無いといえるものであった。
例3の圃場にて、同条件にて、本発明によるイネ(系統1および3)と、コシヒカリ(比較例)(系統2および4)とを慣行法にしたがって栽培し、各系統のイネを10個体収穫し、これを財団法人日本穀物検定協会に送り、協会で定める食味官能試験に供した。
なお、系統1(本発明)と系統2(比較例)、および系統3(本発明)および系統4(比較例)はそれぞれ隣接した試験区で栽培したものである。
・スコア基準: 5:極端に、4:たいそう、3:かなり、2:少し、1:わずかに
これらに従い、各項目について−5〜+5までの11段階(粘り、硬さについては7段階)で評価した。さらに、5項目の結果から、協会の所定の方法に従い、総合評価を算出した。
Claims (7)
- イネ品種である「コシヒカリ」と「カサラス」の交配により得られる、耐倒伏性と玄米粒の大きさが改善されたイネであって、
染色体上に、下記(i)〜(iii)から選択されるいずれかの塩基配列を有し、かつ、残部の染色体領域がコシヒカリ由来の染色体で構成されてなることを特徴とする、イネ:
(i) 配列番号1に示される塩基配列、
(ii) 前記(i)の塩基配列と少なくとも80%の同一性を有する塩基配列、および
(iii) 前記(i)の塩基配列において1もしくは複数個の塩基が欠失、置換、挿入もしくは付加された塩基配列。 - 非遺伝子組み換え作物(非GMO)である、請求項1に記載のイネ。
- (a) コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として交配を行ってF1雑種を得、
(b) 得られたF1雑種に、コシヒカリを戻し交配し、この戻し交配を少なくとも2回繰り返し、
(c) 一塩基多型(SNP)マーカーを用いて、得られた世代の染色体の遺伝子型をタイピングし、
(d) 染色体1上の一塩基多型であるSNP−4、SNP−5および/またはそれらの近傍がカサラス型であって、他がコシヒカリ型である個体を選抜する
工程を含んでなる方法によって得られるものである、請求項1または2に記載のイネ。 - 前記方法が、工程(d)の後に、
(e) 一塩基多型SNP−4とSNP−5との間に見出される複数のSNP部位について、後代をタイピングして、それらの遺伝子型に基づいて個体を選抜する工程
をさらに含む、請求項3に記載のイネ。 - 請求項1〜4のいずれか一項に記載のイネを交配親の一方とすることを特徴とする、交雑育種方法。
- 請求項1に記載の耐倒伏性と玄米粒の大きさが改善されたイネの作出方法であって、
下記工程:
(a) コシヒカリを母本とし、カサラスを夫本として交配を行ってF1雑種を得、
(b) 得られたF1雑種に、コシヒカリを戻し交配し、この戻し交配を少なくとも2回繰り返し、
(c) 一塩基多型(SNP)マーカーを用いて、得られた世代の染色体の遺伝子型をタイピングし、
(d) 染色体1上の一塩基多型であるSNP−4、SNP−5および/またはそれらの近傍がカサラス型であって、他がコシヒカリ型である個体を選抜する
を含んでなることを特徴とする、作出方法。 - 工程(d)の後に、
(e) 一塩基多型SNP−4とSNP−5との間に見出される複数のSNP部位について、後代をタイピングして、それらの遺伝子型に基づいて個体を選抜する工程
をさらに含む、請求項6に記載の作出方法。
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