JP2006503088A5

JP2006503088A5 -

Info

Publication number: JP2006503088A5
Application number: JP2004544870A
Authority: JP
Filing date: 2003-10-14
Publication date: 2006-11-30

Claims

βターンヘアピン構造を提示するための環状ペプチド骨格であって、アミノ酸配列Ｃ１-Ａ１-Ａ２-(Ａ３)_ｎ-Ａ４-Ａ５-Ｃ２（配列番号１）
（ここで、
Ｃ１とＣ２がシステインであり；
Ａ１、Ａ２、Ａ３、Ａ４及びＡ５が天然に生じるＬ−アミノ酸であり；
骨格のＮ'末端がアミノ保護基によって保護されていてもよく；
骨格のＣ'末端がカルボキシ保護基によって保護されていてもよく；
Ａ１とＡ５がアミノ酸Ｗ、Ｙ、Ｆ、Ｈ、Ｉ、Ｖ及びＴからなる群から選択され；
Ａ２とＡ４がアミノ酸Ｗ、Ｙ、Ｆ、Ｌ、Ｍ、Ｉ、及びＶからなる群から選択され；
Ａ３が任意の天然に生じるＬ−アミノ酸であり、ｎが３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、又は１２の整数であり；
Ｃ１とＣ２がジスルフィド結合を形成して、環状ペプチドを形成する）
を含む環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５が、アミノ酸残基のβ炭素に二つの非水素置換基を有するβ分岐残基である、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５がＴである、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５がアミノ酸Ｗ、Ｆ、Ｈ又はＹである、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１がＨであり、Ａ５がＶである、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ２又はＡ４がアミノ酸Ｗ、Ｆ、又はＹである、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ２とＡ４がＷである、請求項６に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ２とＡ４の双方がＷである、請求項７に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが少なくとも４である、請求項１ないし８の何れか一項に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが１０以下である、請求項９に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが４である、請求項９に記載の環状ペプチド骨格。
(Ａ３)_４がＥＧＮＫ、ＥＮＧＫ、ＱＧＳＦ又はＶＷＱＬである、請求項１ないし１１の何れか一項に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１がＴ又はＨであり、Ａ２がＷ又はＬであり、Ａ４がＷ又はＬであり、Ａ５がＴ又はＶである、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１が、ＨとＶからなる群から選択され、Ａ５が、Ｖ、Ｈ及びＩからなる群から選択される、請求項１に記載の環状ペプチド骨格。
(Ａ３)_ｎがＤＬＬＶＲＨである、請求項１ないし１４の何れか一項に記載の環状ペプチド骨格。
アミノ酸配列がＣＨＷＤＬＬＶＲＨＷＶＣ（配列番号３３）である、請求項１５に記載の環状ペプチド骨格。
アミノ酸配列がＣＴＷＥＧＮＫＬＴＣ（配列番号２）である、請求項１３に記載の環状ペプチド骨格。
アミノ酸配列がＣＨＷＥＧＮＫＬＶＣ（配列番号３０）である、請求項１３に記載の環状ペプチド骨格。
βターンヘアピン構造を提示するための環状ペプチド骨格であって、アミノ酸配列Ｃ１-Ａ１-Ａ２-(Ａ３) _ｎ -Ａ４-Ａ５-Ｃ２（配列番号１）
（ここで、
Ｃ１とＣ２がシステインであり；
Ａ１、Ａ２、Ａ３、Ａ４及びＡ５が天然に生じるＬ−アミノ酸であり；
Ａ１とＡ５がアミノ酸Ｗ、Ｙ、Ｆ、Ｈ、Ｉ、Ｖ及びＴからなる群から選択され；
Ａ２がアミノ酸Ｗ、Ｙ、Ｆ、Ｌ、Ｍ、Ｉ、又はＶであり；
Ａ３が任意の天然に生じるＬ−アミノ酸であり、ｎが３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、又は１２の整数であり；
Ａ４がアミノ酸Ｗ、Ｌ、Ｙ、Ｆ、Ｍ、Ｉ、又はＶであり；
Ｃ１とＣ２がジスルフィド結合を形成して、環状ペプチドを形成する）
を含んでなり、該環状ペプチドがＢＡＦＦに結合する環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５が、Ｖ、Ｉ又はＴである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５がＴである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１又はＡ５がアミノ酸Ｗ、Ｆ、Ｈ又はＹである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１がＨであり、Ａ５がＶである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ２とＡ４がＷである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが少なくとも４である、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが１０以下である、請求項２５に記載の環状ペプチド骨格。
ｎが６である、請求項２６に記載の環状ペプチド骨格。
Ａ１がＴ又はＨであり、Ａ２がＷであり、Ａ４がＷ又はＬであり、Ａ５がＴ又はＶである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
(Ａ３) _ｎがＤＬＬＶＲＨである、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
アミノ酸配列がＣＨＷＤＬＬＶＲＨＷＶＣ（配列番号３３）である、請求項２９に記載の環状ペプチド骨格。
ペプチドのＮ末端、ペプチドのＣ末端、又はこれらの両方に１ないし５０アミノ酸をさらに含んでなる、請求項１９に記載の環状ペプチド骨格。
ａ）少なくとも一の請求項１に記載のペプチドとＢＡＦＦ又はその断片とを接触させ；
ｂ）ＢＡＦＦに結合するペプチドを選択する
ことを含む、ＢＡＦＦに結合可能なペプチドの同定方法。