JP2006275771A - 細胞画像解析装置 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】撮影条件の異なる複数の細胞画像を取得する撮影手段(55)と、前記複数の細胞の画像に基づいて、細胞の位置と、少なくとも1つの特徴量を抽出し、前記抽出された特徴量をパラメタとして統計的に解析する解析手段(80)と、を具備する
【選択図】 図1
Description
(1) 細胞の形態情報を取得することができ、例えば突起伸張効果など形態情報を使って効果を予測するスクリーニングを行うことができる。
(2) 解析を行う前処理として実験者が行わなくてはならない作業、つまり、細胞を単離などの作業を行う必要がなくなり負担を減らすことができる。
(3) 細胞の位置関係がわかるので、例えば細胞周辺の局所的な細胞密度が与える化合物の作用への影響などの、細胞間の相互作用を間接的に考慮に入れた解析を行うことができる。
すなわち、細胞スクリーニングにおいては、細胞を単離する必要がなく、複数の細胞がお互い作用しあっていると思われる状態を観察できるので、より生体内に近い情報を得ることができる。逆にこのことから、詳細なスクリーニング結果を出すには、細胞の相互の位置情報を使った解析をする必要があると思われる。
(1)スクリーニングを効率よく行うために、スクリーニングで行う各処理を自動化しなくてはならない。特に解析部分では、細胞の画像を正しく解析し、細胞の位置を正確に認識しなければいけない。
(2)計測する細胞のパラメタを効率よく選択しなくてはならない。有効なスクリーニング結果を出すには適切な細胞パラメタの選択が必要である。
(3)スクリーニングのための薬効評価を正しく行うためにパラメタの検証を充分行わなくてはならない。
さらに、画像上での細胞の位置を解析することにより、これら変化に与える細胞間相互の影響を予測することが可能になり、各細胞の位置関係を考慮に入れない解析と比較することにより詳細な化合物解析を行うことができる。
また、対物レンズ35をZ方向に移動させることにより、レーザ光のフォーカス位置をZ軸方向に沿って上下に移動させることができる。
(1)細胞試料の準備において、観察の対象となる各種条件下での細胞を準備する。
(2)準備した細胞試料に対してのサンプル操作を行う。ここで、複数種類の細胞が混在している試料においては、染色方法によって特定の種類の細胞のみ発光するように操作することができる。この性質を使い、観察したい細胞に対して、当該細胞に応じた特徴的な染色方法あるいは発光の操作を行う。
(3)サンプル操作後の試料42を細胞画像解析装置のステージ40に載置し、その位置を固定する。
(4)ステージ40に載置した試料42の画像(すなわち、「細胞画像」)をコンピュータ10のモニタ上に抽出する。この場合、試料の位置を固定したまま、必要な回数だけフィルターの変更を行う等の撮影条件の変更を行い、撮影条件の変更のつど撮影を行う。
(5)マイクロプレート41を使って細胞の位置を変更し、(4)と同様に、撮影条件を変更しながら複数の細胞画像を撮影する。
(1)細胞を2つの細胞群に分け、1つの細胞群に化合物を投与する。もう一方の細胞群には何も投与しない。
(2)2つの細胞群を一定期間培養する。
(3)細胞の数をパラメタとして、細胞群を上記方法で撮影し、解析を行い、2つの群の細胞数を比較する。
(1/N0)Sum_{i<N}(1/Misum_{j<Mi}|y(i,j)・avr(y(i)|) 式(1)
ここで、N0:全体のデータ数
i:横軸の値
j:縦軸の値
y(i、j):固定された各i上に分布している値
avr(y(i)):各iの平均値
上記のような方法により2つのパラメタ間の相関を定量化することができる。なお、パラメタが2つを越えるような複数のパラメタ群の場合には、2つずつ相関量を定量することにより、全体のパラメタの相関を計算することができる。
パラメタは、一般に、細胞の特徴量をさす。細胞の特徴量とは、上述したサイズや半径や、更には細胞境界の周囲長等があげられるが、これら特徴量の値を使って、実験等の系(以下、単に「実験系」と称する)の評価が行われる。
(1/N)sum_{i<N}|ai - Fn(di)|(di=(x1(i)、x2(i)、・・・、xn(i))) 式(2)
のように定義される。ここで、aiは正解となる薬効の測定値(あらかじめ測定された参考データ)、Fn(di)は、i番目のデータdiを代入した関数Fnの結果である。なお、式(2)では、薬効の測定値と計算した予測値の差の平均を取っているので、相関が高い場合、この値は、小さくなる。
20…光源
22…コリメートレンズ
25…ダイクロイックミラー
30…XYスキャナ
35…対物レンズ
40…試料ステージ
41…マイクロプレート
42…試料
45…試料ステージコントローラ
50…ミラー
51…レンズ
52…ピンホール
55…光検出器
80…画像処理部
81…細胞中心抽出処理部
82…中心点吟味処理部
83…細胞境界抽出処理部
84…特徴量抽出処理部
85…統計処理部
Claims (8)
- 撮影条件の異なる複数の細胞画像を取得する撮影手段と、
前記複数の細胞の画像に基づいて、細胞の位置と、少なくとも1つの特徴量を抽出し、前記抽出された特徴量をパラメタとして統計的に解析する解析手段と、を具備することを特徴とする細胞画像解析装置。 - 請求項1に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、複数の前記特徴量の相関関係に基づいてパラメタ設計をし、これらのパラメタを用いて化合物の有効性を評価することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項2に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、前記相関関係に基づいて、前記パラメタの重み付けを変更することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項2又は請求項3に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、前記相関関係と前記測定結果に基づいて、パラメタの測定精度あるいは測定の信頼性を評価することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項4に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、前記パラメタの測定精度あるいは測定の信頼性の評価に基づいて、測定系の条件による変化を最も有効に表現するパラメタを選択することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項5に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、前記選択されたパラメタに基づいて、細胞評価に最も有効な指標となるパラメタを選択することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項2に記載の細胞画像解析装置において、前記解析手段は、各細胞の位置情報を用いて細胞の特徴量を解析することを特徴とする細胞画像解析装置。
- 請求項7に記載の細胞画像解析装置において、前記位置情報は、局所的な細胞密度、最近接細胞までの距離、細胞同士が接しているか否かの情報を含むことを特徴とする細胞画像解析装置。
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Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009236728A (ja) * | 2008-03-27 | 2009-10-15 | Nec Corp | 画像解析装置、その方法、プログラムおよび記録媒体 |
JP2011257241A (ja) * | 2010-06-08 | 2011-12-22 | Kanagawa Acad Of Sci & Technol | 細胞分析装置 |
JP2012500972A (ja) * | 2008-08-20 | 2012-01-12 | ニューヨーク ブラッド センター, インコーポレイテッド | 高解像度デジタル撮像、分染および自動化実験室システムの使用による、cfuアッセイのための高スループットシステム |
US20120092478A1 (en) * | 2009-02-26 | 2012-04-19 | Nikon Corporation | Incubated state evaluating device, incubated state evaluating method, incubator, and program |
JP2014505465A (ja) * | 2010-11-18 | 2014-03-06 | バイオ−ラッド ラボラトリーズ インコーポレーティッド | 差次的な光吸収による生死判別細胞カウント方法 |
JPWO2018193612A1 (ja) * | 2017-04-21 | 2020-05-21 | 株式会社ニコン | 相関算出装置、相関算出方法及び相関算出プログラム |
WO2022259648A1 (ja) * | 2021-06-09 | 2022-12-15 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理プログラム、情報処理装置、情報処理方法、及び顕微鏡システム |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2001307066A (ja) * | 2000-04-21 | 2001-11-02 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 細胞画像分析装置および細胞画像分析方法 |
JP2003524775A (ja) * | 1999-11-04 | 2003-08-19 | メルテック・マルチ−エピトープ−リガンド−テクノロジーズ・ゲーエムベーハー | 顕微鏡画像の自動解析法 |
WO2003095986A1 (en) * | 2002-05-14 | 2003-11-20 | Amersham Biosciences Niagara, Inc. | System and methods for rapid and automated screening of cells |
JP2004070702A (ja) * | 2002-08-07 | 2004-03-04 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 細胞画像撮影装置、細胞画像撮影方法、プログラムおよび記憶媒体 |
WO2004042392A1 (ja) * | 2002-11-07 | 2004-05-21 | Fujitsu Limited | 画像解析支援方法、画像解析支援プログラムおよび画像解析支援装置 |
-
2005
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Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2003524775A (ja) * | 1999-11-04 | 2003-08-19 | メルテック・マルチ−エピトープ−リガンド−テクノロジーズ・ゲーエムベーハー | 顕微鏡画像の自動解析法 |
JP2001307066A (ja) * | 2000-04-21 | 2001-11-02 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 細胞画像分析装置および細胞画像分析方法 |
WO2003095986A1 (en) * | 2002-05-14 | 2003-11-20 | Amersham Biosciences Niagara, Inc. | System and methods for rapid and automated screening of cells |
JP2004070702A (ja) * | 2002-08-07 | 2004-03-04 | Matsushita Electric Ind Co Ltd | 細胞画像撮影装置、細胞画像撮影方法、プログラムおよび記憶媒体 |
WO2004042392A1 (ja) * | 2002-11-07 | 2004-05-21 | Fujitsu Limited | 画像解析支援方法、画像解析支援プログラムおよび画像解析支援装置 |
Cited By (10)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009236728A (ja) * | 2008-03-27 | 2009-10-15 | Nec Corp | 画像解析装置、その方法、プログラムおよび記録媒体 |
JP2012500972A (ja) * | 2008-08-20 | 2012-01-12 | ニューヨーク ブラッド センター, インコーポレイテッド | 高解像度デジタル撮像、分染および自動化実験室システムの使用による、cfuアッセイのための高スループットシステム |
US20120092478A1 (en) * | 2009-02-26 | 2012-04-19 | Nikon Corporation | Incubated state evaluating device, incubated state evaluating method, incubator, and program |
JPWO2010098105A1 (ja) * | 2009-02-26 | 2012-08-30 | 国立大学法人名古屋大学 | 培養状態評価装置、培養状態評価方法、インキュベータおよびプログラム |
US9567560B2 (en) | 2009-02-26 | 2017-02-14 | National University Corporation Nagoya University | Incubated state evaluating device, incubated state evaluating method, incubator, and program |
US20170166858A1 (en) * | 2009-02-26 | 2017-06-15 | National University Corporation Nagoya University | Incubated state evaluating device, incubated state evaluating method, incubator, and program |
JP2011257241A (ja) * | 2010-06-08 | 2011-12-22 | Kanagawa Acad Of Sci & Technol | 細胞分析装置 |
JP2014505465A (ja) * | 2010-11-18 | 2014-03-06 | バイオ−ラッド ラボラトリーズ インコーポレーティッド | 差次的な光吸収による生死判別細胞カウント方法 |
JPWO2018193612A1 (ja) * | 2017-04-21 | 2020-05-21 | 株式会社ニコン | 相関算出装置、相関算出方法及び相関算出プログラム |
WO2022259648A1 (ja) * | 2021-06-09 | 2022-12-15 | ソニーグループ株式会社 | 情報処理プログラム、情報処理装置、情報処理方法、及び顕微鏡システム |
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