JP2009236728A - 画像解析装置、その方法、プログラムおよび記録媒体 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】入力された細胞、核、細胞小器官などの画像に対して、中心推定装置2によって細胞の中心位置を推定し、輪郭抽出装置3において細胞の輪郭を抽出し、座標変換装置4によって座標変換テーブルを生成し、外れ値検出装置5において抽出された各輪郭点に対して座標変換を施し、座標変換された空間において輪郭の外れ値を検出する。外れ値がなくなるまで輪郭抽出装置4における輪郭抽出と、外れ値検出装置5における外れ値検出を繰り返し、外れ値がなくなった時点で輪郭点を逆変換して最終的な細胞、核、細胞小器官などの輪郭を抽出する。
【選択図】図1
Description
2 中心推定装置
3 輪郭抽出装置
4 座標変換装置
5 外れ値検出装置
6 出力装置
100 細胞核の中心
101 外れ値修正前の輪郭線
102 外れ値
103 再推定後の輪郭線
Claims (23)
- 細胞、核、および/又は細胞小器官を含む解析対象物の画像から、前記解析対象物の輪郭を決定する画像解析装置であって、
前記解析対象物の輪郭点の座標を抽出する輪郭座標抽出手段と、
前記輪郭点の特徴量に基づいて不適切な輪郭点を求める不良輪郭点検出手段と、
前記不適切な輪郭点に対して適切な輪郭点を生成する適切輪郭点生成手段と、を有することを特徴とする画像解析装置。 - 前記解析対象物の画像を入力する画像入力手段と、
前記解析対象物の中心を決定する中心手段と、
前記解析対象物の部分画像を抽出する部分画像抽出手段と、をさらに有することを特徴とする請求項1記載の画像解析装置。 - 前記適切輪郭点生成手段は、前記不良輪郭点検出手段により検出された不適切な輪郭点を除外し、前記輪郭点座標抽出手段により抽出された座標値を、線形補間することにより適切な輪郭点を生成することを特徴とする請求項1又は2に記載の画像解析装置。
- 前記適切輪郭点生成手段は、前記不良輪郭点検出手段により検出された不適切な輪郭点を除外し、前記輪郭点座標抽出手段により抽出された座標値に、局所重み付き回帰を用いることにより適切な輪郭点を生成することを特徴とする請求項1又は2に記載の画像解析装置。
- 前記不良輪郭点検出手段は、前記座標変換された輪郭の微分係数に基づいて前記不適切な輪郭点を求めることを特徴とする請求項1から4の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記不良輪郭点検出手段は、前記座標変換された輪郭の座標値と微分係数に対して、複数クラス数を仮定してクラスタリングを行うことにより前記不適切な輪郭点を求めることを特徴とする請求項1から4の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記輪郭座標抽出手段は、極座標変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項1から6の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記輪郭座標抽出手段は、Log−Polar変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項1から6の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記輪郭座標抽出手段は、横軸を前記輪郭の経路長とし、縦軸を前記中心手段により決定された前記解析対象物の中心からの動径長とした空間への変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項2から8の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記輪郭点を生成する輪郭生成手段をさらに有し、前記輪郭生成手段は、前記座標変換テーブルに基づいて輪郭点を抽出することを特徴とする請求項7から9の何れか1項に記載の画像解析装置。
- 前記解析対象物の輪郭点の座標を抽出するステップと、
前記輪郭点の特徴量に基づいて不適切な輪郭点を求めるステップと、
前記不適切な輪郭点に対して適切な輪郭点を生成するステップと、を有することを特徴とする画像解析方法。 - 前記解析対象物の画像を入力するステップと、
前記解析対象物の中心を決定するステップと、
前記解析対象物の部分画像を抽出するステップと、を有することを特徴とする請求項11記載の画像解析方法。 - 前記求めるステップにより検出された不適切な輪郭点を除外し、前記座標を抽出するステップにより抽出された座標値を、線形補間することにより適切な輪郭点を生成することを特徴とする請求項11又は12に記載の画像解析方法。
- 前記求めるステップにより検出された不適切な輪郭点を除外し、前記座標を抽出するステップにより抽出された座標値に、局所重み付き回帰を用いることにより適切な輪郭点を生成することを特徴とする請求項11又は12に記載の画像解析方法。
- 前記座標変換された輪郭の微分係数に基づいて前記不適切な輪郭点を求めることを特徴とする請求項11から14の何れか1項に記載の画像解析方法。
- 前記座標変換された輪郭の座標値と微分係数に対して、複数クラス数を仮定してクラスタリングを行うことにより前記不適切な輪郭点を求めることを特徴とする請求項11から14の何れか1項に記載の画像解析方法。
- 極座標変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項11から16の何れか1項に記載の画像解析方法。
- Log−Polar変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項11から16の何れか1項に記載の画像解析方法。
- 横軸を前記輪郭の経路長とし、縦軸を前記決定するステップにより決定された前記解析対象物の中心からの動径長とした空間への変換に基づいて座標変換テーブルを生成することを特徴とする請求項12から18の何れか1項に記載の画像解析方法。
- 前記輪郭点を生成するステップをさらに有し、前記座標変換テーブルに基づいて輪郭点を抽出することを特徴とする請求項17から19の何れか1項に記載の画像解析方法。
- 前記解析対象物の輪郭点の座標を抽出する処理と、
前記輪郭点の特徴量に基づいて不適切な輪郭点を求める処理と、
前記不適切な輪郭点に対して適切な輪郭点を生成する処理と、をコンピュータに実行させるプログラム。 - 前記解析対象物の画像を入力する処理と、
前記解析対象物の中心を決定する処理と、
前記解析対象物の部分画像を抽出する処理と、
前記輪郭点を生成する処理と、をコンピュータに実行させるプログラム。 - 請求項21又は22に記載のプログラムを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体。
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