JP2005512537A - Egviエンドグルカナーゼ及びそれをエンコードする核酸 - Google Patents
Egviエンドグルカナーゼ及びそれをエンコードする核酸 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2005512537A JP2005512537A JP2003552924A JP2003552924A JP2005512537A JP 2005512537 A JP2005512537 A JP 2005512537A JP 2003552924 A JP2003552924 A JP 2003552924A JP 2003552924 A JP2003552924 A JP 2003552924A JP 2005512537 A JP2005512537 A JP 2005512537A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- acid sequence
- amino acid
- sequence
- egvi
- nucleic acid
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
- C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
- C12N9/2405—Glucanases
- C12N9/2434—Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
- C12N9/2437—Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C11—ANIMAL OR VEGETABLE OILS, FATS, FATTY SUBSTANCES OR WAXES; FATTY ACIDS THEREFROM; DETERGENTS; CANDLES
- C11D—DETERGENT COMPOSITIONS; USE OF SINGLE SUBSTANCES AS DETERGENTS; SOAP OR SOAP-MAKING; RESIN SOAPS; RECOVERY OF GLYCEROL
- C11D3/00—Other compounding ingredients of detergent compositions covered in group C11D1/00
- C11D3/16—Organic compounds
- C11D3/38—Products with no well-defined composition, e.g. natural products
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C11—ANIMAL OR VEGETABLE OILS, FATS, FATTY SUBSTANCES OR WAXES; FATTY ACIDS THEREFROM; DETERGENTS; CANDLES
- C11D—DETERGENT COMPOSITIONS; USE OF SINGLE SUBSTANCES AS DETERGENTS; SOAP OR SOAP-MAKING; RESIN SOAPS; RECOVERY OF GLYCEROL
- C11D3/00—Other compounding ingredients of detergent compositions covered in group C11D1/00
- C11D3/16—Organic compounds
- C11D3/38—Products with no well-defined composition, e.g. natural products
- C11D3/386—Preparations containing enzymes, e.g. protease or amylase
- C11D3/38636—Preparations containing enzymes, e.g. protease or amylase containing enzymes other than protease, amylase, lipase, cellulase, oxidase or reductase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
- C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
- C12Y302/01004—Cellulase (3.2.1.4), i.e. endo-1,4-beta-glucanase
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02E—REDUCTION OF GREENHOUSE GAS [GHG] EMISSIONS, RELATED TO ENERGY GENERATION, TRANSMISSION OR DISTRIBUTION
- Y02E50/00—Technologies for the production of fuel of non-fossil origin
- Y02E50/10—Biofuels, e.g. bio-diesel
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Detergent Compositions (AREA)
Abstract
Description
この研究の一部は、米国エネルギー省との主契約番号DE−AC36−99GO10337の下、再生可能エネルギー研究所との下請け契約番号ZCO−30017−01により資金提供されたものである。従って、米国政府は本発明について一定の権利を有する。
本発明は、エンドグルカナーゼ活性を有するポリペプチドをエンコードする単離egl6核酸配列に関する。また、本発明は該核酸配列を含んだ核酸構築体、ベクター及び宿主細胞、並びに組換えEGVIポリペプチドの生成方法に関する。
Altschul, S.F., et al., J. Mol. Biol. 215:403-410, 1990.
Altschul, S.F., et al., Nucleic Acids Res. 25:3389-3402, 1997.
Aro, N., et al., J. Biol. Chem., 10.1074/M003624200, April 13, 2001.
Aubert, et al., Ed., p11 et seq., Academic Press, 1988.
Ausubel G. M., et al. CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, John Wiley &Sons, New York, N.Y., 1993.
Baldwin, D., et al., Curr. Opin. Plant Biol. 2(2):96-103, 1999.
Baulcombe, D., Arch. Virol. Suppl. 15:189-201, 1999.
Bhikhabhai, R. et al., J. Appl. Biochem. 6:336, 1984
Brumbauer, A. et al., Bioseparation 7:287-295, 1999.
Carter et al., Nucl. Acids Res. 13:4331, 1986
Chem et al., Biochem. Biophys. Acta. 1121:54-60, 1992
Coligan, J. E. et al., eds., CURRENT PROTOCOLS IN IMMULOGY, 1991.
Collen, A., et al., Journal of Chromatography A 910:275-284, 2001.
Coughlan, et al., BIOCHEMISTRY AND GENETICS OF CELLULOSE DEGRADATION.
Cummings and Fowler, Curr. Genet. 29:227-233, 1996.
Dayhoff et al. in Atlas of Protein Sequence and Structure, Volume 5, Supplement 3, Chapter22, pp. 345-352, 1978.
Deutscher, M.P., Methods Enzymol. 182:779-80, 1990.
Doolittle, R. F., OF URFS AND ORFS, University Science Books, CA, 1986.
Ellouz, S. et al., J. Chromatography 396:307, 1987.
Fields and Song, Nature 340:245-246, 1989.
Filho, et al. Can.J. Microbiol. 42:1-5, 1996.
Fliess, A., et al., Eur. J. Appl. Microbiol. Biotechl. 17:314, 1983.
Freer, et al. J. Biol. Chem. 268:9337-9342, 1993
Freshney, R. I., ed., ANIMAL CELL CULTURE, 1987.
Goyal, A. et al. Bioresource Techl. 36:37, 1991.
Halldorsdottir, S et al., Appl Microbiol Biotechl. 49(3):277-84, 1998.
Hu et al., Mol Cell Biol. 11:5792-9, 1991.
Hemmpel, W.H. ITB Dyeing/Printing/Finishing 3:5-14, 1991.
Herr et al., Appl. Microbiol. Biotechl. 5:29-36, 1978
Jakobovits, A, et al., Ann N Y Acad Sci 764:525-35, 1995.
Jakobovits, A, Curr opin Biotechl 6(5):561-6, 1995
Jones et al., Nature 321:522-525, 1986.
Kawaguchi, T et al., Gene 173(2):287-8, 1996
Kwles, J. et al., TIBTECH 5, 255-261, 1987.
Kohler and Milstein, Nature 256:495, 1975.
Krishna, S. et al., Bioresource Tech. 77:193-196, 2001.
Kumar, A., et al., Textile Chemist and Colorist 29:37-42, 1997
Lehtio, J. et al., FEMS Microbiology Letters 195:197-204, 2001.
Li and Ljungdahl Appl. Environ. Microbiol. 62:209-213, 1996.
Linder, M. and Teeri, T. T., Biotechl. 57:15-28, 1997.
Medve, J. et al., J. Chromatography A 808:153, 1998.
Ohmiya et al., Biotechl. Gen. Engineer. Rev. 14:365-414, 1997.
Ooi et al., Nucleic Acids Res. 18(19):5884, 1990.
Ortega et al., International Biodeterioration and Biodegradation 47:7-14, 2001.
Penttila et al., Yeast 3:175-185, 1987.
Penttila et al., Gene 63: 103-112, 1988.
Pere, J., et al., In Proc. Tappi Pulping Conf., Nashville, TN, 27-31, pp. 693-696, 1996.
Riechmann et al., Nature 332:323-327, 1988.
Rothstein et al., Gene 55:353-356, 1987.
Saarilahti et al., Gene 90:9-14, 1990.
Sakamoto et al., Curr. Genet. 27:435-439, 1995.
Saloheimo M, et al., Gene 63:11-22, 1988.
Sambrook et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL (Second Eition ), Cold Spring Harbor Press, Plainview, N.Y., 1989.
Schulein, Methods Enzymol., 160, 25, pages 234 et seq, 1988.
Scopes, Methods Enzymol. 90 Pt E:479-90, 1982.
Spilliaert R, et al., Eur J Biochem. 224(3):923-30, 1994.
Stahlberg, J. et al., Bio/Techl. 9:286-290, 1991.
Strathem et al., eds. (1981) The Molecular Biology of the Yeast Saccharomyces.
Suurnakki, A. et al., Cellulose 7:189-209, 2000.
Te’o, J. et al., FEMS Microbiology Letters 190:13-19, 2000.
Tilbeurgh, H. et al., FEBS Lett. 16:215, 1984.
Timberlake et al., Cell 1:29-37, 1981.
Tomaz, C. and Queiroz, J., J. Chromatography A 865:123-128, 1999.
Tomme, P. et al., Eur. J. Biochem. 170:575-581, 1988.
Tormo, J. et al., EMBO J. 15:5739-5751, 1996.
Tyndall, R.M., Textile Chemist and Colorist 24:23-26, 1992.
Van Rensburg et al., Yeast 14:67-76, 1998.
Van Tilbeurgh, H. et al., FEBS Lett. 204:223-227, 1986.
Verhoeyen et al., Science 239:1534-1536, 1988.
Warrington, et al., Gemics 13:803-808, 1992.
Wells et al., Gene 34:315, 1985.
Wells et al., Philos. Trans. R. Soc. London SerA 317-415, 1986.
Wood, Biochem. Soc. Trans., 13, pp. 407-410, 1985.
Wood et al., METHODS IN ENZYMOLOGY, 160, 25, p. 87 et seq., Academic press, New York, 1988.
Zoller et al., Nucl. Acids Res. 10:6487, 1987.
セルロース及びヘミセルロースは光合成によって生成される最も豊富な植物性材料である。これらは高分子基質を単糖に加水分解することができる細胞外酵素を生産する細菌、酵母及び真菌などの多くの微生物によって分解され、エネルギー源として使用され得る(Aro et al.、2001)。非再生可能資源の限界が近づいているので、セルロースが主な再生可能エネルギー資源となる可能性は非常に大きい(Krishna et al.、2001)。生物学的プロセスを介したセルロースの効果的活用は食料、飼料及び燃料不足を克服するための1つの手段である(Ohmiya et al.、1997)。
本発明は、ここでEGVIとして同定される単離セルラーゼタンパク質、及びEGVIをエンコードする核酸を提供する。
1.定義
特に示さない限り、ここで用いる全ての技術及び科学用語は本発明の当業界における意味と同じ意味を有する。定義及び技術用語に関しては特にSambrook et al.、1989及びAusubel FM et al、1993を参照されたい。本発明は記載した特定の方法、手順及び試薬に限定されないことは当然であり、これらは変更可能である。
A.糸状菌
糸状菌は真菌門及び卵菌門分類の全ての線状体を含む。糸状菌はキチン、グルカン、キトサン、マンナン及びその他の多糖類複合体からなり、菌糸伸長及び偏性好気性の炭素異化による栄養成長性の細胞壁を有する栄養菌糸により特徴付けられる。
セルラーゼはセルロース(β1,4−グルカンまたはβD−グルコシド結合)を加水分解し、グルコース、セロビオース、セロオリゴ糖等の構造を生じる酵素として当業界に公知である。上に示すように、セルラーゼは従来から大きく3つに分類される:エンドグルカナーゼ(EC 3.2.1.4)(“EG”)、エキソグルカナーゼまたはセロビオヒドロラーゼ(EC 3.2.1.91)(“CBH”)及びβ−グルコシダーゼ(EC 3.2.1.21)(“BG”)。(Kwles、et al.、1987;Schulein,1988)。
オープン・リーディング・フレーム(ORF)をトリコデルマreeseiゲノムまたはトリコデルマreesei mRA由来のcDNAライブラリーのクローンの全部または一部の配列に従って分析し、さらに配列分析ソフトウェアを用いて、(公開/非公開の)データベース中の公知の配列のホモロジーを決定することにより分析する。
A.egl6核酸
本発明の核酸分子はegl6の天然コード配列を含む。1の実施態様において、該配列は、ここで配列番号1または配列番号4で示すegl6のcDNA配列、及びその他の種におけるそれらの相同体、天然対立遺伝子多型及びスプライス変異体、核酸断片及び生物学的に活性な(機能的)それらの誘導体であり、例えば天然分子のアミノ酸配列変異体及び融合タンパク質をエンコードする配列である。該配列は集合的にここでは“EGVIエンコード核酸配列”という。
好ましい実施態様において、本発明はEGVIポリペプチドを提供し、図2(配列番号2)に示す配列を含んだ天然成熟型または完全長EGVIポリペプチド配列を含む。本発明のEGVIポリペプチドは成熟EGVIポリペプチド、融合タンパク質の一部、または図2(配列番号2)に示すEGVIポリペプチド配列の断片または変異体であってもよい。
“非同類置換”はある種類のアミノ酸を別の種類のアミノ酸で置換することをいう。
本発明はさらに抗EGVI抗体を提供する。抗体はポリクローナル、モノクローナル、ヒト化、二重特異性またはヘテロ共役抗体であってよい。
本発明の抗EGVI抗体はさらにヒト化またはヒト抗体を含む。“ヒト化抗体”の語は非ヒト抗体由来の配列を部分的に含む、キメラ抗体、免疫グロブリン鎖またはそれらの断片である(例えばFv、Fab、Fab’、F(ab’)2またはその他の抗体の抗原結合部分配列)非ヒト(例えば、ネズミ)抗体のヒト化体をいう。非ヒト抗体をヒト化する方法は当業者に公知であり、さらなる詳細はJones et al.、1986;Riechmann et al.1988;及びVerhoeyen et al.、1988にある。ヒト抗体の生成方法も公知である。例えば、Jakobovits,A,et al.、1995及びJakobovits,A、1995を参照されたい。
本発明の方法はEGVIを発現するための細胞の使用に依存し、特定のEGVI発現方法を必要とするものではない。
EGVIをエンコードする天然または合成ポリヌクレオチド断片(“EGVIエンコード核酸配列”)は導入が可能で糸状菌または酵母細胞内で複製される異種核酸構築体またはベクター内に組み込むことができる。ここに開示するベクター及び方法はEGVI発現のための宿主細胞での使用に適している。導入される細胞内で複製可能で生存可能ないかなるベクターも使用できる。多くの適したベクター及びプロモーターが当業者に公知であり、市販されている。また、クローニング及び発現ベクターについても各々ここに明示的に引用するものとするSambrook et al.、1989、Ausubel FM et al.、1989及びStrathern et al.、1981に記載されている。菌類に適した発現ベクターはvan den Hondel、C.A.M.J.J.et al.(1991)In:Bennett,J.W.及びLasure,L.L.(eds.)More Gene Manipulations in Fungi(菌類における遺伝子操作).Academic Press、pp.396−428に記載されている。適当なDNA配列は種々の方法によりプラスミドまたはベクター(ここで集合的に“ベクター等”とする)に挿入できる。一般に、DNA配列は標準的な方法により適当な制限エンドヌクレアーゼ部位に挿入する。このような方法及び関連するサブクローニング方法は当業者の知識の範囲内であると考えられる。
(i)糸状菌
従って、本発明は対応する非形質転換親菌と比較して高められたEGVI生成または発現を生じるように効果的に修飾、選択及び培養された細胞を含む糸状菌を提供する。
また、本発明はEGVI生成用の宿主細胞として酵母菌の使用を目的とする。加水分解酵素をエンコードするその他いくつかの遺伝子は酵母菌サッカロマイセス・セレヴィシエの種々の株において発現される。これらは2つのエンドグルカナーゼ(Penttila et al.,1987)、2つのセロビオヒドロラーゼ(Penttila et al.、1988)及びトリコデルマreesei由来の1つのβ―グルコシダーゼ(Cummings and Fowler,1996)、オーレオバシディウム・プルランス由来キシラナーゼ(Li and Ljungdahl、1996)、小麦由来のα−アミラーゼ(Rothstein et al.、1987)等をエンコードする配列を含む。さらに、ブチリビブリオ・フィブリソルベンズ・エンド−[β]−1,4−グルカナーゼ(END1)ファネロキーテ・クリソスポリウム・セロビオヒドロラーゼ(CBH1)、ルミノコッカス・フラヴェファシエンス・セロデキストリナーゼ(CEL1)及びエンドマイセスfibrilizerセロビアーセ(Bgl1)をエンコードするセルラーゼ遺伝子カセットはサッカロマイセス・セレヴィシエの研究所菌株でうまく発現した(Van Rensburg et al.,1998)。
本発明はさらに、外から供給されたEGVIエンコード核酸配列を含むように遺伝子操作された細胞及び細胞組成物を提供する。親細胞または細胞株はクローニングベクターまたは発現ベクターを用いて遺伝子操作(すなわち、変換、形質転換またはトランスフェクト)できる。ベクターは例えば、上述したプラスミド、ウイルス粒子、ファージ等の形態である。
EGVIエンコード核酸構築体を用いて形質転換した細胞株によるEGVIの発現を評価するために、分析はタンパク質レベル、RNAレベルで行うことができ、または特にグルコシダーゼ活性及び/または生成に対して機能的バイオアッセイを用いることにより行うことができる。
一般に、細胞培養で生成したEGVIタンパク質は培地内に分泌され、例えば、不要成分を培養基から除去することにより精製または単離する。しかし、場合によってはEGVIタンパク質は細胞溶解物から必然的に再生した細胞の形で生成する。その場合、EGVIタンパク質を細胞から精製し、当業者が日常的に用いる技術を用いて生成した。例として、限定されないが、アフィニティ・クロマトグラフィ(Tilbeurgh et al.、1984)、イオン交換クロマトグラフィ法(Goyal et al.、1991;Fliess et al.、1983;Bhikhabhai et al.、1984;Ellouz et al.、1987)などがあり、高分解能を有する物質を用いるイオン交換(Medve et al.、1988)、疎水性相互作用クロマトグラフィ(Tomaz and Queiroz,1999)及び2相分割(two−phase partitioning)(Brumbauer,et al.、1999)を含む。
bgl6ヌクレオチド、EGVIタンパク質及びEGVIタンパク質活性を含む組成物は多種多様の用途において有用であることがわかる。そのいくつかを以下に説明する。
関連EGVIエンコード核酸配列の機能は特定機能を有する公知の遺伝子との相同性により決定できる。例えば、同定した核酸分子のコード配列と公開されている核酸配列データベースとの比較は公知遺伝子との相同性によりまたは同定核酸配列の伸長(extension)により機能を確認するために用いる。
2つ以上の配列間の“%同一性”を決定するために選択された配列の好ましいアラインメントは例えば、MacVectorバージョン6.5のCLUSTAL−Wプログラムを用いて実行し、10.0のオープンギャップペナルティ、0.1の延長ギャップペナルティ及びBLOSUM30類似マトリックス等の初期値パラメーターを用いて操作する。
本発明により同定されるタンパク質は酵母2ハイブリッドシステムにおいて使用でき、推測シグナル経路タンパク質であるタンパク質を結合するタンパク質を“捕捉”する。酵母2ハイブリッドシステムはFields and Song,Nature 340:245−246(1989)に記載されている。つまり、2ハイブリッドシステムでは、DNA結合ドメイン−egl6の融合体(例えば、GAL4−egl6融合体)が構築され、酵母細菌内にトランスフェクトされる。全egl6遺伝子またはegl6遺伝子のサブ領域が使用できる。DNA活性ドメインに融合される潜在的な結合パートナーのライブラリーを含む第2の構築体をコトランスフェクトする。EGVIタンパク質に結合する酵母共形質転換体含有(harboring)タンパク質は例えば使用するベクターに応じて、β−ガラクトシダーゼまたはルシフェラーゼ生成(スクリーン)または必須栄養素が欠如したプレート上での残存(選別)により同定する。
さらに、発現プロファイリングまたは転写プロファイリングとしても知られるマイクロアレイ分析は所定のDNA配列の存在または発現、または様々な遺伝子の発現変化を同時に評価するために用いる。1の方法において、DNA配列の大きなセット(プローブ)、通常は発現した配列タグの大きなセット、cDNA、cDNA断片または配列特異オリゴヌクレオチドをスライド・ガラスまたはナイロン膜などの固形担体上に配置する。プローブへのハイブリダイゼーションのために標識した標的は制御及び導入組織からmRNAを単離することにより生成し、それから各mRNAプールを通常は蛍光染料などの明確なマーカーを用いて、直接またはcDNAやcRNA中間体を用いて標識する。マイクロアレイは複合プローブを用いてハイブリダイズし、アレイ上の各配置に関する関連ハイブリダイゼーション・シグナル強度は各マーカー染料について量ることができる。制御及び導入状態間の発現の違いは2つのマーカー染料からのシグナル比として測定できる(Baldwin,D et al.,1999を参照。)
egl6を生じる供給有機体のマイクロアレイ分析が実施でき、egl6過剰発現の結果として協調して調節されるその他の遺伝子を同定することにより遺伝子機能の理解を助ける。協調して調節される遺伝子の同定はegl6遺伝子を特定経路に位置付けするのに役立つ。もしくは、そのような分析はマイクロアレイ分析を用いる同じ経路に関係するその他の遺伝子を同定するのに役立つ。
1の典型的な方法において、プローブとして用いるcDNA断片はセルラーゼ生産を誘発することが公知の条件下で成長させたT.reesei株の菌糸体から全RNAを抽出し、そこからポリアデニル酸(polyA)断片を得ることにより単離する。polyA RNAはcDNAプールを生成するために用い、該cDNAプールはそれからここで提供するegl6核酸配列に基づく特異的プライマーを用いて増幅する。
Claims (36)
- エンドグルカナーゼ活性を有する酵素をエンコードするヌクレオチド配列を含む、真菌源由来の単離ポリヌクレオチド。
- 以下からなる群より選択される単離ポリヌクレオチド:
(a)図2(配列番号2)で表すアミノ酸配列と少なくとも85%の配列同一性を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(b)図2(配列番号2)で表すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(c)図2で表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(d)図2で表すアミノ酸配列を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(e)配列番号2として表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(f)配列番号2として表すアミノ酸配列を有するEGVIポリペプチドをエンコードする核酸配列または相補的な核酸配列;
(g)配列番号4として表す核酸配列またはその相補的配列;及び
(h)高ストリンジェンシーな条件下で配列番号4として表す配列にハイブリダイズする核酸配列またはその相補的または断片配列であり、前記単離ポリヌクレオチドがエンドグルカナーゼの生物学的活性を有するポリペプチドをエンコードするもの。 - 10.0のオープンギャップペナルティ、0.1の延長ギャップペナルティ及びBLOSUM30類似マトリックスの初期値パラメーターを用いて操作するMacVectorバージョン6.5のCLUSTAL−Wプログラムを使用して同一性%を計算する、請求項2の単離ポリヌクレオチド。
- 50%ホルムアミド、6X SSC、5X Denhardt’s溶液、0.5% SDS及び100μg/ml変性キャリアDNA中、約42℃でハイブリダイゼーションを行い、続いて室温で2X SSPE及び0.5% SDS中で2回洗浄し及び42℃で0.1X SSPE及び0.5%SDS中でさらに2回洗浄した、請求項2の単離ポリヌクレオチド。
- 前記ポリヌクレオチドがRNA分子である、請求項2の単離ポリヌクレオチド。
- エンドグルカナーゼ活性を有する酵素をエンコードし、該酵素がトリコデルマ源由来である単離ポリヌクレオチド。
- 酵素がトリコデルマreesei由来である、請求項6の単離ポリヌクレオチド。
- 以下のいずれかのポリヌクレオチド配列を含む発現構築体;(i)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも85%の配列同一性を有する配列、または(ii)図2に記載のヌクレオチド配列由来のプローブに中から高ストリンジェンシーの条件下でハイブリダイズできる配列、または(iii)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも85%の配列同一性を有するヌクレオチド配列に相補的な配列。
- 請求項8の発現構築体を含むベクター。
- 請求項2の単離ポリヌクレオチドを含むベクターであって、該ベクターで形質転換した宿主細胞により認識される制御配列に作動可能に連結するベクター。
- 請求項9のベクターにより形質転換された宿主細胞。
- 請求項10のベクターにより形質転換された宿主細胞。
- 宿主細胞が原核細胞である、請求項12の宿主細胞。
- 宿主細胞が真核細胞である、請求項12の宿主細胞。
- 請求項2のポリヌクレオチドを含む組換え宿主細胞。
- 組換え宿主細胞が原核細胞である、請求項15の組換え宿主細胞。
- 組換え宿主細胞が真核細胞である、請求項15の組換え宿主細胞。
- 以下からなる群より選択される配列を含む、エンドグルカナーゼの生物学的活性を有する精製EGVIポリペプチド:
(a)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(b)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(c)図2に表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(d)図2に表すアミノ酸配列;
(e)配列番号2として表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(f)配列番号2として表すアミノ酸配列;
(g)配列番号2として表すアミノ酸配列の精製された生物学的活性断片。 - エンドグルカナーゼ活性を有する酵素を生成する方法であって、以下を含む:
(a)請求項2で定義するポリヌクレオチドを含む発現ベクターを用いて宿主細胞を安定に形質転換する工程;
(b)前記形質転換宿主細胞を該宿主細胞に適切な条件下で培養し、前記エンドグルカナーゼを生成する工程;及び
(c)前記エンドグルカナーゼを再生する工程。 - 宿主細胞が糸状菌または酵母菌細胞である、請求項19の方法。
- 請求項19の方法により調製されるエンドグルカナーゼ活性を有する精製酵素。
- 遺伝子を不活化させ、EGVIポリペプチド生成を防ぐ欠失または挿入またはその他の変異をegl6遺伝子内に含む組換え宿主細胞。
- 配列番号2として表す配列を有するEGVIポリペプチドをエンコードするメッセンジャーRNAに相補的なアンチセンスオリゴヌクレオチドであって、エンドグルカナーゼ生成宿主細胞にさらすと、前記宿主細胞によるエンドグルカナーゼ生成を減少または抑制する前記オリゴヌクレオチド。
- 宿主細胞が糸状菌である、請求項23のアンチセンスオリゴヌクレオチド。
- 以下からなる群より選択されるポリペプチドを含む洗剤組成物:
(a)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(b)図2(配列番号2)に表すアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(c)図2に表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(d)図2に表すアミノ酸配列;
(e)配列番号2として表すアミノ酸配列と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列;
(f)配列番号2として表すアミノ酸配列;
(g)配列番号2として表すアミノ酸配列の精製された生物学的活性断片。 - アルペルギルス種内でβ−グルコシダーゼ活性を有する異種ポリペプチドを発現する方法であって、以下を含む:
(a)異種β−グルコシダーゼをエンコードするポリヌクレオチドに結合し、それによりキメラポリペプチドをエンコードする、シグナル配列をエンコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターを有する宿主アスペルギルスを提供する工程;
(b)前記キメラポリペプチドが生成される前記アスペルギルスに適切な条件下で、宿主アスペルギルスを培養し、前記キメラポリペプチドを生成する工程。 - エタノールを生成する方法であって、前記方法は以下の工程を含む:
(a)バイオマス組成物をβ−グルコシダーゼ4を含む酵素組成物と接触させ、砂糖水を得る工程;
(b)砂糖水に発酵生物を加える工程;及び
(c)エタノールを生成するのに十分な条件下で発酵生物を培養する工程、及びバイオマス組成物は任意で前処理する。 - さらに、工程(a)が少なくとも1のエンドグルカナーゼを追加する工程を含む、セルロース27に記載の方法。
- 工程(a)がさらに少なくとも1のセロビオヒドロラーゼ(cellbiohydrolase)を追加する工程を含む、請求項27に記載の方法。
- 工程(a)がさらに少なくとも1のセロビオヒドロラーゼを追加する工程を含む、請求項28に記載の方法。
- 前処理は希酸を用いる、請求項27に記載の方法。
- エタノールを生成する方法であって、前記方法は以下の工程を含む:
(a)バイオマス組成物をβ−グルコシダーゼ4を含む酵素組成物及び発酵生物と接触させる工程;及び
(b)エタノールを生成するのに十分な条件下で発酵生物を培養する工程、及びバイオマス組成物は任意で前処理する。 - さらに、工程(a)が少なくとも1のエンドグルカナーゼを追加する工程を含む、セルロース32に記載の方法。
- 工程(a)がさらに少なくとも1のセロビオヒドロラーゼを追加する工程を含む、請求項27に記載の方法。
- 工程(a)がさらに少なくとも1のセロビオヒドロラーゼを追加する工程を含む、請求項33に記載の方法。
- 前処理は希酸を用いる、請求項36に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US10/026,994 US7056721B2 (en) | 2001-12-18 | 2001-12-18 | EGVI endoglucanase and nucleic acids encoding the same |
PCT/US2002/034882 WO2003052057A2 (en) | 2001-12-18 | 2002-10-30 | Egvi endoglucanase and nucleic acids encoding the same |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005512537A true JP2005512537A (ja) | 2005-05-12 |
JP2005512537A5 JP2005512537A5 (ja) | 2006-01-05 |
Family
ID=21835044
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2003552924A Pending JP2005512537A (ja) | 2001-12-18 | 2002-10-30 | Egviエンドグルカナーゼ及びそれをエンコードする核酸 |
Country Status (7)
Country | Link |
---|---|
US (7) | US7056721B2 (ja) |
EP (1) | EP1490497B1 (ja) |
JP (1) | JP2005512537A (ja) |
AU (1) | AU2002359337A1 (ja) |
CA (1) | CA2470414C (ja) |
DK (1) | DK1490497T3 (ja) |
WO (1) | WO2003052057A2 (ja) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010521134A (ja) * | 2006-10-06 | 2010-06-24 | ダニスコ・ユーエス・インク、ジェネンコー・ディビジョン | セルラーゼを含まない酵素組成物及びこれを生成するための宿主細胞 |
Families Citing this family (137)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7045331B2 (en) * | 2001-12-18 | 2006-05-16 | Genencor International, Inc. | EGVII endoglucanase and nucleic acids encoding the same |
US7056721B2 (en) * | 2001-12-18 | 2006-06-06 | Genencor International, Inc. | EGVI endoglucanase and nucleic acids encoding the same |
WO2003089598A2 (en) * | 2002-04-19 | 2003-10-30 | Novozymes Biotech, Inc | Polypeptides having xyloglucanase activity and nucleic acids encoding same |
CA2504744C (en) * | 2002-11-07 | 2012-07-10 | Genencor International, Inc. | Bgl6 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same |
US8278079B2 (en) | 2002-11-07 | 2012-10-02 | Danisco Us Inc. | BGL6 β-glucosidase and nucleic acids encoding the same |
MX2009000712A (es) | 2006-07-21 | 2009-03-23 | Xyleco Inc | Sistemas para conversion de biomasa. |
EA201070764A1 (ru) | 2007-12-19 | 2010-12-30 | Новозимс А/С | Полипептиды, обладающие активностью, усиливающей лизис целлюлозы, и кодирующие их полинуклеотиды |
US7771983B2 (en) | 2008-12-04 | 2010-08-10 | Novozymos, Inc. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
EP3141609A1 (en) | 2008-12-19 | 2017-03-15 | Novozymes, Inc. | Methods for increasing hydrolysis of cellulosic material in the presence of cellobiose dehydrogenase |
EP2379733A2 (en) | 2008-12-19 | 2011-10-26 | Novozymes Inc. | Methods for increasing hydrolysis of cellulosic material |
WO2010080527A1 (en) | 2008-12-19 | 2010-07-15 | Novozymes, Inc. | Methods for determining cellulolytic enhancing activity of a polypeptide |
CA2747056A1 (en) | 2008-12-19 | 2010-07-15 | Novozymes, Inc. | Methods for increasing enzymatic hydrolysis of cellulosic material in the presence of a peroxidase |
US8604277B2 (en) | 2009-01-28 | 2013-12-10 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having beta-glucosidase activity and polynucleotides encoding same |
US8629324B2 (en) | 2009-01-30 | 2014-01-14 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having expansin activity and polynucleotides encoding same |
BRPI1013483B1 (pt) | 2009-03-24 | 2019-04-24 | Novozymes A/S | Construção de ácido nucleico, vetor de expressão recombinante, célula hospedeira microbiana transgênica, métodos para produzir o polipeptídeo, para degradar um xilano acetilado e para produzir um produto de fermentação, e, composição |
EP2435561B1 (en) | 2009-05-29 | 2018-08-08 | Novozymes Inc. | Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material |
CA2764148A1 (en) | 2009-06-02 | 2010-12-09 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellobiohydrolase activity and polynucleotides encoding same |
US8143021B2 (en) | 2009-07-07 | 2012-03-27 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
WO2011035027A2 (en) | 2009-09-17 | 2011-03-24 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
CN102712916B (zh) | 2009-09-18 | 2015-11-25 | 诺维信股份有限公司 | 具有β-葡糖苷酶活性的多肽和编码该多肽的多核苷酸 |
KR20120115206A (ko) | 2009-09-23 | 2012-10-17 | 다니스코 유에스 인크. | 신규 글리코실 히드롤라제 효소 및 이의 용도 |
DK2483295T3 (en) | 2009-09-29 | 2016-02-22 | Novozymes Inc | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding them |
WO2011041405A1 (en) | 2009-09-29 | 2011-04-07 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having xylanase activity and polynucleotides encoding same |
CN102666846A (zh) | 2009-09-30 | 2012-09-12 | 诺维信公司 | 具有纤维素分解增强活性的多肽和编码该多肽的多核苷酸 |
CA2775353A1 (en) | 2009-09-30 | 2011-04-07 | Novozymes, Inc. | Polypeptides derived from thermoascus crustaceu having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
CA2775967A1 (en) | 2009-10-23 | 2011-04-28 | Novozymes, Inc. | Cellobiohydrolase variants and polynucleotides encoding same |
US20120260371A1 (en) | 2009-10-29 | 2012-10-11 | Novozymes A/S | Polypeptides Having Cellobiohydrolase Activity and Polynucleotides Encoding Same |
DK2496693T3 (en) | 2009-11-06 | 2018-01-22 | Novozymes Inc | Polypeptides with cellobiohydrolase activity and polynucleotides encoding them |
DK2496692T3 (en) | 2009-11-06 | 2016-06-27 | Novozymes Inc | POLYPEPTIDES WITH xylanase AND POLYNUCLEOTIDES ENCODING THEM |
AU2010333801B2 (en) | 2009-12-23 | 2015-12-17 | Danisco Us Inc. | Methods for improving the efficiency of simultaneous saccharification and fermentation reactions |
CA2794963A1 (en) | 2010-03-31 | 2011-10-06 | Novozymes, Inc. | Cellobiohydrolase variants and polynucleotides encoding same |
WO2012003379A1 (en) | 2010-06-30 | 2012-01-05 | Novozymes A/S | Polypeptides having beta-glucosidase activity and polynucleotides encoding same |
WO2012021408A1 (en) | 2010-08-12 | 2012-02-16 | Novozymes, Inc. | Compositions comprising a polypeptide having cellulolytic enhancing activity and a dioxy compound and uses thereof |
US9267126B2 (en) | 2010-08-30 | 2016-02-23 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having endoglucanase activity and polynucleotides encoding same |
US9187742B2 (en) | 2010-08-30 | 2015-11-17 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellobiohydrolase activity and polynucleotides encoding same |
DK2735611T3 (en) | 2010-08-30 | 2019-01-28 | Novozymes As | POLYPEPTIDES WITH CELLULOLYSE INCREASING ACTIVITY AND POLYNUCLEOTIDES CODING THEM |
US8624082B2 (en) | 2010-08-30 | 2014-01-07 | Novozymes A/S | Polypeptides having xylanase activity and polynucleotides encoding same |
WO2012030845A2 (en) | 2010-08-30 | 2012-03-08 | Novozymes A/S | Polypeptides having beta-glucosidase activity, beta-xylosidase activity, or beta-glucosidase and beta-xylosidase activity and polynucleotides encoding same |
WO2012030858A2 (en) | 2010-08-30 | 2012-03-08 | Novozymes A/S | Polypeptides having hemicellulolytic activity and polynucleotides encoding same |
DK2622068T3 (en) | 2010-09-30 | 2016-10-17 | Novozymes Inc | Variants of polypeptides having cellulolytic enhancing ACTIVITY AND POLYNUCLEOTIDES ENCODING THEM |
DK2622070T3 (en) | 2010-09-30 | 2016-11-21 | Novozymes Inc | Variants of polypeptides having cellulolytic enhancing ACTIVITY AND POLYNUCLEOTIDES ENCODING THEM |
EP2622069B1 (en) | 2010-10-01 | 2015-11-25 | Novozymes, Inc. | Beta-glucosidase variants and polynucleotides encoding same |
BR112013009817B1 (pt) | 2010-10-26 | 2020-02-04 | Novozymes As | métodos de degradar ou converter refugo de cana de açúcar, de produzir um produto de fermentação, e, de fermentar refugo de cana de açúcar |
CN110079558A (zh) | 2010-11-02 | 2019-08-02 | 诺维信股份有限公司 | 用家族61多肽预处理纤维素材料的方法 |
WO2012059053A1 (en) | 2010-11-04 | 2012-05-10 | Novozymes A/S | Polypeptides having cellobiohydrolase activity and polynucleotides encoding same |
EP2638153B1 (en) | 2010-11-12 | 2017-07-12 | Novozymes Inc. | Polypeptides having endoglucanase activity and polynucleotides encoding same |
US9676830B2 (en) | 2010-11-18 | 2017-06-13 | Novozymes, Inc. | Chimeric polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
WO2012078656A1 (en) | 2010-12-06 | 2012-06-14 | Novozymes North America, Inc. | Methods of hydrolyzing oligomers in hemicellulosic liquor |
WO2012103350A1 (en) | 2011-01-26 | 2012-08-02 | Novozymes A/S | Polypeptides having cellobiohydrolase activity and polynucleotides encoding same |
WO2012103322A1 (en) | 2011-01-26 | 2012-08-02 | Novozymes A/S | Polypeptides having endoglucanase activity and polynucleotides encoding same |
BR112013018695B1 (pt) | 2011-01-26 | 2021-03-30 | Novozymes A / S | Célula hospedeira microbiana recombinante, processos para produzir um polipeptídeo, para produzir uma proteína, para degradar um material celulósico, e, construto de ácido nucleico ou vetor de expressão |
CN103534348B (zh) | 2011-01-26 | 2018-04-10 | 诺维信公司 | 具有纤维二糖水解酶活性的多肽和编码该多肽的多核苷酸 |
BR112013018307A2 (pt) | 2011-01-26 | 2017-07-11 | Novozymes As | polipeptídeo isolado, composição, polinucleotídeo isolado, construto de ácido nucleico ou vetor de expressão, célula hospedeira recombinante, métodos para produzir um polipeptídeo e uma proteína, e, processos para degradar um material celulósico, para sintetizar um produto de fermentação, e para fermentar um material celulósico. |
EP2670853B1 (en) | 2011-01-31 | 2017-05-24 | Novozymes North America, Inc. | Processes for enzymatic refining of pretreated cellulosic material for saccharification |
DK2678352T3 (en) | 2011-02-23 | 2018-03-05 | Novozymes Inc | Polypeptides with cellulolysis enhancing activity and polynucleotides encoding them |
CN103608461B (zh) | 2011-03-09 | 2016-08-03 | 诺维信公司 | 增加多肽的纤维素分解增强活性的方法 |
US9409958B2 (en) | 2011-03-10 | 2016-08-09 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
RU2013146245A (ru) | 2011-03-17 | 2015-04-27 | ДАНИСКО ЮЭс ИНК. | Способ уменьшения вязкости в процессе осахаривания |
US20140106408A1 (en) | 2011-03-17 | 2014-04-17 | Danisco Us Inc. | Glycosyl hydrolase enzymes and uses thereof for biomass hydrolysis |
WO2012130120A1 (en) | 2011-03-25 | 2012-10-04 | Novozymes A/S | Method for degrading or converting cellulosic material |
WO2012135659A2 (en) | 2011-03-31 | 2012-10-04 | Novozymes A/S | Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material |
EP2691519A1 (en) | 2011-03-31 | 2014-02-05 | Novozymes, Inc. | Cellulose binding domain variants and polynucleotides encoding same |
DK2702153T3 (en) | 2011-04-28 | 2019-03-18 | Novozymes Inc | Polypeptides with endoglucanase activity and polynucleotides encoding them |
US9624518B2 (en) | 2011-04-29 | 2017-04-18 | Novozymes, Inc. | Methods for enhancing the degradation or conversion of cellulosic material |
EP2710132A1 (en) | 2011-05-19 | 2014-03-26 | Novozymes, Inc. | Methods for enhancing the degradation of cellulosic material with chitin binding proteins |
WO2012159009A1 (en) | 2011-05-19 | 2012-11-22 | Novozymes, Inc. | Methods for enhancing the degradation of cellulosic material with chitin binding proteins |
EP2734633B1 (en) | 2011-07-22 | 2019-05-01 | Novozymes North America, Inc. | Processes for pretreating cellulosic material and improving hydrolysis thereof |
WO2013019780A2 (en) | 2011-08-04 | 2013-02-07 | Novozymes A/S | Polypeptides having endoglucanase activity and polynucleotides encoding same |
ES2586307T3 (es) | 2011-08-04 | 2016-10-13 | Novozymes, Inc. | Polipéptidos con actividad de xilanasa y polinucleótidos que los codifican |
EP2748322A2 (en) | 2011-08-24 | 2014-07-02 | Novozymes, Inc. | Methods for producing multiple recombinant polypeptides in a filamentous fungal host cell |
EP2748321A2 (en) | 2011-08-24 | 2014-07-02 | Novozymes, Inc. | Methods for obtaining positive transformants of a filamentous fungal host cell |
WO2013039776A1 (en) | 2011-09-13 | 2013-03-21 | Novozymes North America, Inc. | Methods of hydrolyzing and fermenting cellulosic material |
US20140308705A1 (en) | 2011-09-20 | 2014-10-16 | Novozymes A/S | Polypeptides Having Cellulolytic Enhancing Activity And Polynucleotides Encoding Same |
BR112014007651A2 (pt) | 2011-09-30 | 2017-04-11 | Novozymes Inc | polipeptídeo quimérico isolado, polinucleotídeo isolado, métodos para produzir um polipeptídeo quimérico e um produto de fermentação, para degradar ou converter um material celulósico, e para fermentar um material celulósico, planta, parte de planta ou célula de planta transgênica, e, formulação de caldo inteiro ou composição de cultura de células |
US10308921B2 (en) | 2011-10-31 | 2019-06-04 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
EP3382017A1 (en) | 2011-11-18 | 2018-10-03 | Novozymes A/S | Polypeptides having beta-glucosidase activity, beta-xylosidase activity, or beta-glucosidase and beta-xylosidase activity and polynucleotides encoding same |
CA2855451A1 (en) | 2011-11-21 | 2013-08-15 | Novozymes, Inc. | Gh61 polypeptide variants and polynucleotides encoding same |
WO2013075644A1 (en) | 2011-11-22 | 2013-05-30 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having beta-xylosidase activity and polynucleotides encoding same |
EP2785732B1 (en) | 2011-12-01 | 2017-04-12 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having beta-xylosidase activity and polynucleotides encoding same |
EP3272862A1 (en) | 2011-12-16 | 2018-01-24 | Novozymes, Inc. | Polypeptides having laccase activity and polynucleotides encoding same |
CN104768391A (zh) | 2011-12-19 | 2015-07-08 | 诺维信公司 | 用于增加纤维素材料的消化率的方法和组合物 |
EP2794870A4 (en) | 2011-12-19 | 2015-06-17 | Novozymes Inc | POLYPEPTIDES WITH XYLANASE ACTIVITY AND POLYNUCLEOTIDES THAT CODE |
CN103998605B (zh) | 2011-12-20 | 2021-08-03 | 诺维信股份有限公司 | 纤维二糖水解酶变体和编码它们的多核苷酸 |
WO2013096652A1 (en) | 2011-12-21 | 2013-06-27 | Novozymes, Inc. | Methods for determining the degradation of a biomass material |
WO2013160247A2 (en) | 2012-04-23 | 2013-10-31 | Novozymes A/S | Polypeptides having glucuronyl esterase activity and polynucleotides encoding same |
BR112014026268A2 (pt) | 2012-04-23 | 2017-07-18 | Novozymes As | polipeptídeo isolado, composição, polinucleotídeo isolado, construção de ácido nucleico ou vetor de expressão, célula hospedeira recombinante, e, métodos de produção de um polipeptídeo e de degradação ou conversão de um material celulósico |
US10227579B2 (en) | 2012-04-27 | 2019-03-12 | Novozymes A/S | GH61 polypeptide variants and polynucleotides encoding same |
BR112015005884A2 (pt) | 2012-09-19 | 2017-08-08 | Novozymes Inc E Novozymes As | processos para degradação de um material celulósico, para produção de um produto da fermentação, e de fermentação de um material celulósico, composição, e, formulação de caldo inteiro ou composição de cultura de células |
EP2903412B1 (en) | 2012-10-08 | 2019-09-11 | Novozymes A/S | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and polynucleotides encoding same |
US20150275194A1 (en) | 2012-10-24 | 2015-10-01 | Novozymes A/S | Polypeptides Having Cellulolytic Enhancing Activity And Polynucleotides Encoding Same |
BR112015013421A2 (pt) | 2012-12-14 | 2017-11-14 | Novozymes As E Novozymes Inc | célula hospedeira microbiana transgênica, polipeptídeo isolado, métodos de produção de um polipeptídeo e de uma proteína, processos de degradação de um material celulósico, de produção de um produto de fermentação e de fermentação de um material celulósico, construção de ácido nucleico ou vetor de expressão, polipeptídeo isolado, e polinucleotídeo isolado |
US20150337280A1 (en) | 2012-12-19 | 2015-11-26 | Novozymes A/S | Polypeptides Having Cellulolytic Enhancing Activity And Polynucleotides Encoding Same |
US8771993B1 (en) * | 2013-02-12 | 2014-07-08 | Novozymes A/S | Polypeptides having endoglucanse activity and polynucleotides encoding same |
US8778639B1 (en) * | 2013-02-12 | 2014-07-15 | Novozymes Inc. | Polypeptides having endoglucanase activity and polynucleotides encoding same |
CN105164254B (zh) | 2013-03-08 | 2019-06-28 | 诺维信公司 | 纤维二糖水解酶变体和编码它们的多核苷酸 |
US9850512B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-12-26 | The Research Foundation For The State University Of New York | Hydrolysis of cellulosic fines in primary clarified sludge of paper mills and the addition of a surfactant to increase the yield |
WO2015057517A1 (en) | 2013-10-17 | 2015-04-23 | Danisco Us Inc. | Use of hemicellulases to improve ethanol production |
US9951363B2 (en) | 2014-03-14 | 2018-04-24 | The Research Foundation for the State University of New York College of Environmental Science and Forestry | Enzymatic hydrolysis of old corrugated cardboard (OCC) fines from recycled linerboard mill waste rejects |
BR122023022768A2 (pt) | 2014-09-05 | 2023-12-12 | Novozymes A/S | Variante de celobiohidrolase, polipeptídeo híbrido tendo atividade celulolítica, composição, método de produção de uma variante de celobiohidrolase ou de um polipeptídeo híbrido, método de degradação de um material celulósico e método de produção de um produto de fermentação |
US9616114B1 (en) | 2014-09-18 | 2017-04-11 | David Gordon Bermudes | Modified bacteria having improved pharmacokinetics and tumor colonization enhancing antitumor activity |
WO2016120298A1 (en) | 2015-01-28 | 2016-08-04 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
WO2016120297A1 (en) | 2015-01-28 | 2016-08-04 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
CA2973302C (en) | 2015-01-28 | 2022-10-25 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
US10557127B2 (en) | 2015-02-24 | 2020-02-11 | Novozymes A/S | Cellobiohydrolase variants and polynucleotides encoding same |
EP3067428A1 (en) | 2015-03-12 | 2016-09-14 | BETA RENEWABLES S.p.A. | A process for producing a hydrolyzed mixture from a pre-treated ligno-cellulosic slurry comprising a slurry liquid and slurry solids |
WO2016169892A1 (en) | 2015-04-20 | 2016-10-27 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
WO2016169893A1 (en) | 2015-04-20 | 2016-10-27 | Dsm Ip Assets B.V. | Whole fermentation broth |
WO2016207144A1 (en) | 2015-06-22 | 2016-12-29 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
MX2017016625A (es) | 2015-07-07 | 2018-05-15 | Danisco Us Inc | Induccion de la expresion genica usando una mezcla de azucar de alta concentracion. |
BR112018074561A2 (pt) | 2016-06-09 | 2019-03-12 | Dsm Ip Assets Bv | trem de semente para produção de enzima em grande escala |
WO2018019948A1 (en) | 2016-07-29 | 2018-02-01 | Dsm Ip Assets B.V. | Polypeptides having cellulolytic enhancing activity and uses thereof |
WO2018053058A1 (en) | 2016-09-14 | 2018-03-22 | Danisco Us Inc. | Lignocellulosic biomass fermentation-based processes |
CN109790510B (zh) | 2016-10-04 | 2024-04-12 | 丹尼斯科美国公司 | 在不存在诱导底物下丝状真菌细胞中的蛋白产生 |
EP3545099A1 (en) | 2016-11-24 | 2019-10-02 | DSM IP Assets B.V. | Enzyme composition |
US11499142B2 (en) | 2016-11-24 | 2022-11-15 | Dsm Ip Assets B.V. | Enzyme composition |
US11180535B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-11-23 | David Gordon Bermudes | Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria |
US11129906B1 (en) | 2016-12-07 | 2021-09-28 | David Gordon Bermudes | Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria |
CN110381746B (zh) | 2016-12-21 | 2023-12-01 | 杜邦营养生物科学有限公司 | 使用热稳定丝氨酸蛋白酶的方法 |
WO2018185071A1 (en) | 2017-04-03 | 2018-10-11 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
CN111225982A (zh) | 2017-10-09 | 2020-06-02 | 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 | 用于木质纤维素材料的酶促水解和糖发酵的方法 |
WO2019086369A1 (en) | 2017-10-30 | 2019-05-09 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
WO2019086370A1 (en) | 2017-10-30 | 2019-05-09 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of lignocellulosic material and fermentation of sugars |
EP3775189A1 (en) | 2018-03-28 | 2021-02-17 | DSM IP Assets B.V. | Enzyme composition |
WO2019185681A1 (en) | 2018-03-28 | 2019-10-03 | Dsm Ip Assets B.V. | Enzyme composition |
WO2019219804A1 (en) | 2018-05-17 | 2019-11-21 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for producing a polypeptide |
WO2019229108A1 (en) | 2018-05-30 | 2019-12-05 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for producing sugars from carbohydrate materials |
WO2020058248A1 (en) | 2018-09-18 | 2020-03-26 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of carbohydrate material and fermentation of sugars |
WO2020058249A1 (en) | 2018-09-18 | 2020-03-26 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of carbohydrate material and fermentation of sugars |
WO2020058253A1 (en) | 2018-09-18 | 2020-03-26 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of carbohydrate material and fermentation of sugars |
EP3870715A1 (en) | 2018-10-24 | 2021-09-01 | DSM IP Assets B.V. | Process for enzymatic hydrolysis of carbohydrate material and fermentation of sugars |
BR112021017167A2 (pt) | 2019-03-12 | 2021-11-09 | Dsm Ip Assets Bv | Processo para a produção de um caldo de fermentação |
WO2021048164A1 (en) | 2019-09-10 | 2021-03-18 | Dsm Ip Assets B.V. | Enzyme composition |
WO2022013148A1 (en) | 2020-07-13 | 2022-01-20 | Dsm Ip Assets B.V. | Process for the production of biogas |
BR112023020370A2 (pt) | 2021-04-06 | 2023-11-21 | Dsm Ip Assets Bv | Composição de enzimas |
BR112023020448A2 (pt) | 2021-04-06 | 2023-11-21 | Dsm Ip Assets Bv | Composição enzimática |
BR112023020357A2 (pt) | 2021-04-06 | 2023-11-21 | Dsm Ip Assets Bv | Composição de enzima |
JP2024512872A (ja) | 2021-04-08 | 2024-03-21 | ベルサリス エッセ.ピー.アー. | 糖生成物及び発酵生成物を製造するプロセス |
Family Cites Families (24)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB1368599A (en) | 1970-09-29 | 1974-10-02 | Unilever Ltd | Softening compositions |
DK187280A (da) | 1980-04-30 | 1981-10-31 | Novo Industri As | Ruhedsreducerende middel til et fuldvaskemiddel fuldvaskemiddel og fuldvaskemetode |
GB2095275B (en) | 1981-03-05 | 1985-08-07 | Kao Corp | Enzyme detergent composition |
GB2094826B (en) | 1981-03-05 | 1985-06-12 | Kao Corp | Cellulase enzyme detergent composition |
US4816567A (en) | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
US4822516A (en) | 1986-12-08 | 1989-04-18 | Kao Corporation | Detergent composition for clothing incorporating a cellulase |
WO1989009259A1 (en) | 1988-03-24 | 1989-10-05 | Novo-Nordisk A/S | A cellulase preparation |
US5648263A (en) | 1988-03-24 | 1997-07-15 | Novo Nordisk A/S | Methods for reducing the harshness of a cotton-containing fabric |
US5487989A (en) | 1988-08-31 | 1996-01-30 | Bioenergy International, L.C. | Ethanol production by recombinant hosts |
DK494089D0 (ja) | 1989-10-06 | 1989-10-06 | Novo Nordisk As | |
US5475101A (en) | 1990-10-05 | 1995-12-12 | Genencor International, Inc. | DNA sequence encoding endoglucanase III cellulase |
CA2093422C (en) | 1990-10-05 | 2001-04-03 | DETERGENT COMPOSITIONS CONTAINING LOW CBH I CONTENT CELLULASE COMPOSITIONS | |
JPH06503960A (ja) | 1990-12-10 | 1994-05-12 | ジェネンコア インターナショナル インコーポレーテッド | TRICHODERMA REESEIのβ−グルコシダーゼ遺伝子のクローニングおよび増幅によるセルロースの改良糖化 |
DK154492D0 (da) | 1992-12-23 | 1992-12-23 | Novo Nordisk As | Enzym |
DK81293D0 (da) * | 1993-07-06 | 1993-07-06 | Novo Nordisk As | Enzym |
AU2445895A (en) | 1994-05-11 | 1995-12-05 | Novo Nordisk A/S | An enzyme with beta -(1-6)-endoglucanase activity |
US6265204B1 (en) * | 1997-01-17 | 2001-07-24 | Genencor International, Inc. | DNA sequences, vectors, and fusion polypeptides for secretion of polypeptides in filamentous fungi |
US6015703A (en) * | 1998-03-10 | 2000-01-18 | Iogen Corporation | Genetic constructs and genetically modified microbes for enhanced production of beta-glucosidase |
EP1080204A2 (en) | 1998-05-06 | 2001-03-07 | University of Georgia Research Foundation, Inc. | Beta-glucosidase coding sequences and protein from orpinomyces pc-2 |
EP1235855A2 (en) | 1999-03-22 | 2002-09-04 | Novozymes Biotech, Inc. | Methods for monitoring multiple gene expression |
US7056721B2 (en) * | 2001-12-18 | 2006-06-06 | Genencor International, Inc. | EGVI endoglucanase and nucleic acids encoding the same |
WO2003089598A2 (en) * | 2002-04-19 | 2003-10-30 | Novozymes Biotech, Inc | Polypeptides having xyloglucanase activity and nucleic acids encoding same |
RU2013146245A (ru) * | 2011-03-17 | 2015-04-27 | ДАНИСКО ЮЭс ИНК. | Способ уменьшения вязкости в процессе осахаривания |
US8674962B2 (en) * | 2011-11-30 | 2014-03-18 | Silicon Integrated Systems Corp. | Touch coordinate calculation method for touch panel |
-
2001
- 2001-12-18 US US10/026,994 patent/US7056721B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2002
- 2002-10-30 WO PCT/US2002/034882 patent/WO2003052057A2/en active Search and Examination
- 2002-10-30 AU AU2002359337A patent/AU2002359337A1/en not_active Abandoned
- 2002-10-30 EP EP02793865.3A patent/EP1490497B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-10-30 CA CA2470414A patent/CA2470414C/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-10-30 DK DK02793865.3T patent/DK1490497T3/en active
- 2002-10-30 JP JP2003552924A patent/JP2005512537A/ja active Pending
-
2006
- 2006-01-10 US US11/329,714 patent/US7807434B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2006-01-10 US US11/329,621 patent/US7811799B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2006-01-10 US US11/329,439 patent/US7351568B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-11-13 US US11/938,954 patent/US8674062B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2014
- 2014-01-29 US US14/167,779 patent/US20140227756A1/en not_active Abandoned
-
2017
- 2017-05-15 US US15/594,847 patent/US20180030426A1/en not_active Abandoned
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2010521134A (ja) * | 2006-10-06 | 2010-06-24 | ダニスコ・ユーエス・インク、ジェネンコー・ディビジョン | セルラーゼを含まない酵素組成物及びこれを生成するための宿主細胞 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
WO2003052057A2 (en) | 2003-06-26 |
US20070213249A1 (en) | 2007-09-13 |
EP1490497B1 (en) | 2015-07-08 |
US7807434B2 (en) | 2010-10-05 |
US7811799B2 (en) | 2010-10-12 |
CA2470414A1 (en) | 2003-06-26 |
EP1490497A2 (en) | 2004-12-29 |
WO2003052057A3 (en) | 2004-10-14 |
US20030113732A1 (en) | 2003-06-19 |
US20090036648A1 (en) | 2009-02-05 |
CA2470414C (en) | 2014-03-11 |
US20140227756A1 (en) | 2014-08-14 |
US7351568B2 (en) | 2008-04-01 |
US8674062B2 (en) | 2014-03-18 |
EP1490497A4 (en) | 2005-08-31 |
US20180030426A1 (en) | 2018-02-01 |
US20060154844A1 (en) | 2006-07-13 |
US20060166322A1 (en) | 2006-07-27 |
AU2002359337A1 (en) | 2003-06-30 |
AU2002359337A8 (en) | 2003-06-30 |
DK1490497T3 (en) | 2015-09-21 |
US7056721B2 (en) | 2006-06-06 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4500047B2 (ja) | bgl3β−グルコシダーゼ及びそれをエンコードする核酸 | |
US9005948B2 (en) | EGVII endoglucanase and nucleic acids encoding the same | |
US20180030426A1 (en) | Egvi endoglucanase and nucleic acids encoding the same | |
JP5366287B2 (ja) | Bgl7ベータ−グルコシダーゼをエンコードする核酸 | |
US7320886B2 (en) | BGL4 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same | |
US7582462B2 (en) | BGL6 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same | |
US7727754B2 (en) | β-glucosidase 5 (BGL5) compositions | |
CA2469572C (en) | Egviii endoglucanase and nucleic acids encoding the same | |
US9102929B2 (en) | BGL6 beta-glucosidase and nucleic acids encoding the same |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20050913 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20050913 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20060208 |
|
A711 | Notification of change in applicant |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A711 Effective date: 20060208 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20080226 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20080501 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20080512 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20080626 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20080710 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20080725 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20080801 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20080826 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20080826 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20081224 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20090423 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A821 Effective date: 20090423 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20090525 |
|
A912 | Re-examination (zenchi) completed and case transferred to appeal board |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912 Effective date: 20090724 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110502 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20110510 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110603 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20110608 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20110705 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20110708 |