JP2003508022A5

JP2003508022A5 -

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Publication number: JP2003508022A5
Application number: JP2001506870A
Authority: JP
Filing date: 2000-06-30
Publication date: 2007-09-13

Description

【特許請求の範囲】
【請求項１】被験者が、IL-1炎症性ハプロタイプと関連する病気または疾患を有するまたは発生させやすいか否かを検査する方法であって、前記被験者から採取した核酸サンプルにおいて、前記ハプロタイプの少なくとも一つの対立遺伝子を検出する工程を含み、該対立遺伝子の存在により前記被験者が病気または疾患を発生させやすいということが示されることを特徴とする方法。
【請求項２】前記病気または疾患が、炎症性疾患、変性疾患、免疫疾患、感染症、外傷により誘発される疾患、および癌からなる群より選択されることを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項３】前記検出工程が：
ａ）対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション；
ｂ）サイズ分析；
ｃ）配列決定；
ｄ）ハイブリダイゼーション；
ｅ）5’ヌクレアーゼ分解；
ｆ）一本鎖高次構造多型；
ｇ）対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーション
ｈ）プライマー特異的伸長；および
ｊ）オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ：
から成る群より選択されることを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項４】前記検出の前にまたは前記検出と同時に、前記核酸サンプルを増幅工程にかけることを特徴とする請求項１記載の方法。
【請求項５】前記増幅工程が、配列番号８から３２までのいずれかからなる群より選択されるプライマーを使用することを特徴とする請求項４記載の方法。
【請求項６】前記サイズ分析が、制限酵素分解の後であることを特徴とする請求項３記載の方法。
【請求項７】配列番号８から３２までのいずれかからなる群より選択されるプライマーを含むキット。
【請求項８】 IL-1多型性と関連する病気または疾患を有するまたは発生させやすい個人に適切な治療法を選択する方法であって、患者から採取した核酸サンプルが多型性を有するか否かを検出する工程を含み、IL-1多型性と連鎖不平衡にある原因機能的突然変異を補う治療法が選択されることを特徴とする方法。
【請求項９】前記検出が、
ａ）対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーション；
ｂ）サイズ分析；
ｃ）配列決定；
ｄ）ハイブリダイゼーション；
ｅ）5’ヌクレアーゼ分解；
ｆ）一本鎖高次構造多型；
ｇ）対立遺伝子特異的ハイブリダイゼーション
ｈ）プライマー特異的伸長；および
ｊ）オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ
からなる群より選択されることを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１０】前記検出の前にまたは前記検出と同時に、前記核酸サンプルを増幅工程にかけることを特徴とする請求項８記載の方法。
【請求項１１】前記増幅工程が、配列番号８から３２までのいずれかからなる群より選択されるプライマーを使用することを特徴とする請求項１０記載の方法。
【請求項１２】前記サイズ分析が、制限酵素分解の後であることを特徴とする請求項９記載の方法。
【請求項１３】前記病気または疾患が、炎症性疾患、変性疾患、免疫疾患、感染症、外傷により誘発される疾患、および癌からなる群より選択されることを特徴とする請求項９記載の方法
【請求項１４】前記治療が、IL-1活性のモジュレータであることを特徴とする請求項９記載の方法。
【請求項１５】前記IL-1活性がIL-1αであることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項１６】前記IL-1活性がIL-1βであることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項１７】前記IL-1活性がIL-1RNであることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項１８】前記IL-1活性のモジュレータが、タンパク質、ペプチド、偽ペプチド、小分子、核酸または栄養補助食品であることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項１９】前記モジュレータがアゴニストであることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項２０】前記モジュレータがアンタゴニストであることを特徴とする請求項１４記載の方法。
【請求項２１】特定の投与量の特定の治療薬によりIL-1多型性と関連する病気または疾患を有するまたは発生させやすい被験者を治療する有効性を測定する方法であって、
a)IL-1タンパク質；または被験者から得られたサンプル中のIL-1 mRNAまたはDNAのレベル、量または活性を検出し、
b)前記特定の投与量の特定の治療を被験者に適用し；IL-1タンパク質；または被験者から得られたサンプル中のIL-1 mRNAまたはDNAのレベル、量または活性を検出し、
c)工程a)で得られた相対的なレベル、量または活性を工程b)で得られたレベル、量または活性と比較する、
各工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項２２】前記治療法がIL-1活性のモジュレータであることを特徴とする請求項２１記載の方法。
【請求項２３】前記IL-1活性がIL-1αであることを特徴とする請求項２２記載の方法。
【請求項２４】前記IL-1活性がIL-1βであることを特徴とする請求項２２記載の方法。
【請求項２５】前記IL-1活性がIL-1RNであることを特徴とする請求項２２記載の方法。
【請求項２６】前記治療が、タンパク質、ペプチド、偽ペプチド、小分子または核酸であることを特徴とする請求項２１記載の方法。
【請求項２７】前記モジュレータがアゴニストであることを特徴とする請求項２２記載の方法。
【請求項２８】前記モジュレータがアンタゴニストであることを特徴とする請求項２２記載の方法。
【請求項２９】前炎症性のハプロタイプを含むIL-1多型性と関連する病気または疾患を治療または予防する治療法を選別する方法であって、
a)テスト化合物がなければIL-1タンパク質およびIL-1結合パートナーが相互作用できる条件下で、IL-1ポリペプチドまたはその生物活性断片、IL-1結合パートナーおよびテスト化合物を結合させ、
b) 前記テスト化合物の存在下においてIL-1タンパク質／IL-1結合パートナー複合体が形成される程度を検出し、前記化合物の不存在下と比較して前記化合物の存在下でアゴニストにより形成される複合体の量の増加または前記化合物の不存在下と比較して前記化合物の存在下でアンタゴニストにより形成される複合体の量の減少によって、前記化合物が病気または疾患の治療または予防に有効な治療法であることが示される、
各工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項３０】前記アゴニストまたはアンタゴニストが、タンパク質、ペプチド、偽ペプチド、小分子または核酸からなる群より選択されることを特徴とする請求項２９記載の方法。
【請求項３１】前記核酸が、アンチセンス、リボザイムおよび三量体核酸からなる群より選択されることを特徴とする請求項３０記載の方法。
【請求項３２】前記化合物から薬剤組成物を調製する工程をさらに含むことを特徴とする請求項２９記載の方法。
【請求項３３】前記IL-1ポリペプチドがIL-1αであることを特徴とする請求項２９記載の方法。
【請求項３４】前記IL-1ポリペプチドがIL-1βであることを特徴とする請求項２９記載の方法。
【請求項３５】前記IL-1ポリペプチドがIL-1RNであることを特徴とする請求項２９記載の方法。
【請求項３６】炎症性ハプロタイプを含むIL-1多型性と関連する病気または疾患を治療または予防する治療法を同定する方法であって、
a)適切な量の候補化合物を、IL-1遺伝子を発現する細胞または細胞抽出物と接触させ、
b) 生じたタンパク質生物活性を測定し、前記化合物の不存在下における生物活性と比較して前記化合物の存在下でのアゴニスト生物活性の減少またはアンタゴニスト生物活性減少によって、前記候補物が有効な治療法であることを示す、
各工程を含むことを特徴とする方法。
【請求項３７】前記モジュレータが、IL-1αまたはIL-1β生物活性のアンタゴニストであることを特徴とする請求項３６記載の方法。
【請求項３８】前記モジュレータが、IL-1RN生物活性のアゴニストであることを特徴とする請求項３６記載の方法。
【請求項３９】前記工程(b)において、IL-1遺伝子の発現レベルを測定することにより前記タンパク質生物活性を測定することを特徴とする請求項３６記載の方法。
【請求項４０】 IL-1遺伝子から転写されるmRNAの量を検出することにより前記発現レベルを測定することを特徴とする請求項３９記載の方法。
【請求項４１】産生されたIL-1産物の量を検出することにより前記発言レベルを測定することを特徴とする請求項３９記載の方法。
【請求項４２】免疫検出アッセイにおいて抗−IL-1抗体を使用して前記発現レベルを測定することを特徴とする請求項３９記載の方法。
【請求項４３】前記化合物から薬剤組成物を調製する工程をさらに含むことを特徴とする請求項３９記載の方法。
【請求項４４】前記細胞が動物中に含まれることを特徴とする請求項３９記載の方法。
【請求項４５】前記動物がトランスジェニック動物であることを特徴とする請求項４４記載の方法。