JP2013178260A5 - - Google Patents
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上記で概観した方法の1つを用いて診断を容易にするため、本発明は、さらなる態様において、少なくとも2つの核酸分子のアレイであって、前記核酸分子の各々が、前述の発明の態様のいずれか1つによる核酸分子の配列に対応する、該核酸分子の配列に相補的である、又は該核酸分子に特異的にハイブリッド形成する核酸分子のアレイを提供する。該アレイは、少なくとも1〜9以上の前記核酸分子の配列に対応する、該核酸分子の配列に相補的である、又は該核酸分子に特異的にハイブリッド形成する核酸分子を含んでよい。該アレイにおける核酸分子は、12〜50ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド、より好ましくは、40〜50ヌクレオチドのオリゴヌクレオチドからなってよい。或いは、該アレイにおける核酸分子は、PCRで増幅したcDNA挿入物であって、核酸分子が300〜2000ヌクレオチドであるcDNA挿入物からなってよい。
これもまた診断に有用である関連の態様において、本発明は、少なくとも2つの異なる抗体種を含む抗体アレイであって、各抗体種が、前述のタンパク質に免疫特異性である抗体アレイを提供する。本発明は、前述の少なくとも2つのタンパク質種を含むタンパク質アレイをも提供する。
本発明の診断方法において有用なキットは、こうした核酸、抗体、及び/又はタンパク質のアレイを含んでよい。
Claims (20)
- 疾患を患う個人の、HDAC阻害剤での治療に対する感受性を診断するためのデータを収集する方法であって、
患者由来の試料における、遺伝子又はその発現産物、又は遺伝子の配列の発現若しくは活性レベルを評価するステップと、前記発現、活性又は配列のレベルを基準と比較するステップとを含み、前記発現、活性、又は配列のレベルが、前記基準と異なる場合に、基準状態と比べたHDAC阻害剤での治療に対する感受性の変化を示し、前記遺伝子が、hHRAD23B(ヒトrad23B)である、方法。 - 基準レベルよりも著明に高いレベルが、個人が、HDAC阻害剤での治療に対してより強く感受性であることを示す、請求項1に記載の方法。
- 基準レベルよりも著明に低いレベルが、HDAC阻害剤での治療に対して、個人が耐性である可能性を示す、請求項1に記載の方法。
- 発現産物がタンパク質であり、任意で以下のステップを含む、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
a)リガンド−タンパク質複合体の形成に適切な条件下において、前記タンパク質のリガンドを患者由来の試料に接触させるステップ;及び
b)前記複合体を検出するステップ; - 発現産物が、mRNAであり、任意で以下のステップを含む、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
a)疾患について調べる患者由来の試料由来のhHRAD23Bをコードする核酸分子を単離するステップ;及び
b)HDAC阻害剤での治療に対する感受性の変化に関連する突然変異の存在を検出するステップ; - 遺伝子の配列を評価するステップが、HDAC阻害剤での治療に対する感受性を評価するステップを含み、任意で以下のステップを含む、請求項1〜3のいずれかに記載の方法。
a)疾患について調べる患者由来の試料由来のhHRAD23Bをコードするタンパク質又は核酸分子を単離するステップ;及び
b)HDAC阻害剤での治療に対する感受性の変化に関連する突然変異の存在を検出するステップ; - 患者の試料のHDAC阻害剤の治療に対する感受性をインビトロで評価するための、hHRAD23Bの使用。
- 疾患を患う個人の、HDAC阻害剤での治療に対する感受性を診断する方法に用いるためのhHRAD23Bであって、前記方法が、患者から得た試料に対して請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、前記hHRAD23B。
- 増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態の診断又は治療に用いるための、以下のa)〜d)から選択される核酸分子であって、前記診断が、患者から得た試料に対して請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、核酸分子。
a)アクセッション番号NM_002874.3に記載のhHRAD23B配列を含む核酸分子;
b)a)の配列の断片である核酸分子;
c)a)又はb)の相補配列を含む核酸分子;
d)高度に厳密な条件下で、a)又はb)の核酸分子とハイブリダイズする核酸分子; - 増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態の診断又は治療に用いるための、以下のa)〜b)から選択されるタンパク質であって、前記診断が、患者から得た試料に対して請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、タンパク質。
a)請求項9に記載の核酸分子の核酸配列にコードされるアミノ酸配列を有するタンパク質;
b)a)のタンパク質の断片であって、ただし前記断片がa)若しくはb)の全長ポリペプチドが有する生物活性を保持する、又はa)若しくはb)のポリペプチドと共通の抗原決定基を有する断片からなるタンパク質; - 患者の増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態の治療に用いるためのhHRAD23B若しくは請求項10に記載のタンパク質、又は請求項9に記載の核酸分子であって、
前記治療が、前記タンパク質若しくは核酸分子を、HDAC阻害剤と併用した個別、同時、又は逐次投与により投与することを含む、hHRAD23B、タンパク質又は核酸分子。 - 患者における疾患又は生理学的状態の治療的処置をモニターする方法であって、請求項8若しくは11に記載のhHRAD23B、請求項10若しくは11に記載のタンパク質、又は請求項9若しくは11に記載の核酸分子の発現又は活性レベルを、前記患者由来の試料において一定期間にわたりモニターするステップを含み、前記一定期間における前記発現若しくは活性レベルの、対照レベルに対する変化が、前記疾患又は生理学的状態の退縮を示す、方法。
- 増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態を有する患者が、HDAC阻害剤での治療に対する感受性があるかどうかの診断に用いるための、以下のa)〜c)から選択されるアレイであって、前記診断が、患者から得た試料に対して請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、アレイ。
a)核酸分子のそれぞれが、請求項9又は請求項11の核酸分子の配列に相当するか、配列に相補的であるか、或いは特異的にハイブリダイズする、少なくとも2つの核酸分子を含むアレイ;
b)各抗体種が、請求項10又は11に記載のタンパク質に免疫特異性を有する、少なくとも2つの異なる種類の抗体種を含むアレイ;
c)請求項10又は11に記載の少なくとも2つのタンパク質種を含むアレイ; - 増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態を有する患者の治療に用いるためのHDAC阻害剤であって、前記患者が、請求項1〜6のいずれかに記載の方法を用いてHDAC阻害剤治療に感受性があると同定されている、HDAC阻害剤。
- 増殖性疾患、又は細胞の分化若しくは増殖の速度の変化が関与する疾患若しくは病態を有する患者の治療に用いるためのHDAC阻害剤であって、前記患者が、hHRAD23Bのレベルが基準レベルよりも著明に高いと同定され、前記患者が、HDAC阻害剤での治療に対してより強く感受性であることを示す、HDAC阻害剤。
- 疾患を患う個人の、HDAC阻害剤での治療に対する感受性の診断に用いるための抗体であって、請求項10又は11に記載のタンパク質に特異的に結合し、前記診断が、患者から得た試料に対して請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、抗体。
- 疾患を患う個人の、HDAC阻害剤での治療に対する感受性の診断に用いるための、以下のa)〜c)、又はi)〜ii)を含むキットであって、前記診断が、患者から得た試料に対し請求項1〜6のいずれかに記載の方法を実施することを含む、キット。
a)厳密な条件下において、請求項9又は11に記載の核酸分子とハイブリダイズする核酸プローブを含む第1の容器;
b)前記核酸分子を増幅するのに有用なプライマーを含む第2の容器;
c)前記プローブ及びプライマーを用いて診断を容易にするための説明書;
i)請求項16に記載の1又は2以上の抗体;
ii)前記抗体及び前記タンパク質の結合反応の検出に有用な試薬; - 試料が、組織試料である、請求項8〜11のいずれかに記載のhHRAD23B、タンパク質又は核酸分子。
- 試料が、血液、尿、唾液又は特定の組織生検である、請求項8〜11のいずれかに記載のhHRAD23B、タンパク質又は核酸分子。
- 増殖性疾患が癌である、請求項9〜11のいずれかに記載のhHRAD23B、タンパク質又は核酸分子。
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