JP2003004739A - 遺伝子発現プロファイル解析方法及び装置 - Google Patents

遺伝子発現プロファイル解析方法及び装置

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JP2003004739A
JP2003004739A JP2001192146A JP2001192146A JP2003004739A JP 2003004739 A JP2003004739 A JP 2003004739A JP 2001192146 A JP2001192146 A JP 2001192146A JP 2001192146 A JP2001192146 A JP 2001192146A JP 2003004739 A JP2003004739 A JP 2003004739A
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JP2001192146A
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Yoshie Yoshikawa
良恵 吉川
Junichi Mineno
純一 峰野
Hiroyuki Mukai
博之 向井
Kiyozou Asada
起代蔵 浅田
Ikunoshin Kato
郁之進 加藤
Yoshinori Kagawa
芳範 香川
Shigeki Yajima
成樹 谷嶋
Takafumi Nagano
隆文 永野
Satoshi Yamada
訓 山田
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Takara Bio Inc
Mitsubishi Space Software Co Ltd
Original Assignee
Takara Bio Inc
Mitsubishi Space Software Co Ltd
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Abstract

(57)【要約】 【課題】 遺伝子発現プロファイルデータから注目する
評価指標データを推定する。 【解決手段】 遺伝子の組み合わせ候補を生成し、生成
された遺伝子の組み合わせを用いて評価指標を推定し、
その推定結果に基づき遺伝子の組み合わせを評価し、そ
の評価に基づき遺伝子の組み合わせを生成することを繰
り返すことによって、設定した評価以上の遺伝子の組み
合わせを求め、その遺伝子の組み合わせを用いて注目す
る評価指標を推定する構成にした。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】この発明は、DNAチップ、
DNAマイクロアレイで計測した遺伝子発現プロファイ
ルデータを解析し、評価指標の推定に有用な解析方法及
び解析装置等に関する。
【0002】
【従来の技術】従来、病気の分類は被検試料の諸症状や
病変部位の形態学的な差異によってなされていた。例え
ば、胃癌の場合には、癌の深達度・リンパ節転移の有無
・他の臓器への転移の有無などの形態学的な所見によっ
て胃癌の病期(ステージ)を判断していた。しかし、形
態学的な違いによる分類には明確な判断基準がないこと
により、しばしば不正確であり、客観的な分類が困難な
場合が多い。また複数の病理診断医間で判定が異なる場
合も多い。
【0003】全ての細胞はその生物の一そろいの遺伝子
を持っているが、細胞の種類・時期によって発現されて
いる遺伝子の種類・量は異なる。各細胞・組織で発現さ
れている遺伝子の種類・量のパターンを遺伝子発現プロ
ファイルと呼んでいる。各細胞の機能・性質はその時点
で細胞内にある蛋白質の種類と分布によって決定され
る。従って、蛋白質の合成量を計測できる遺伝子発現プ
ロファイルの計測から、その細胞の機能・性質を推定す
ることが可能であると考えられる。
【0004】疾病(特に癌)によって、遺伝子発現プロ
ファイルは正常な細胞の遺伝子発現プロファイルから大
きく変化することが知られている。逆に言えば、遺伝子
発現プロファイルを計測することによって、病気の状態
を遺伝子発現のレベルの面から客観的に分類することが
可能になると考えられる。また、病気に伴う性質(癌の
転移しやすさ、手術後の予後等)も遺伝子発現プロファ
イルの変化から定量的に推定することが可能になると考
えられる。近年、多数の遺伝子をチップ上に固定し、同
時に多数の遺伝子の発現を計測できるDNAチップ・D
NAマイクロアレイが開発されてきており、遺伝子発現
プロファイルを計測することが可能になってきた。
【0005】DNAチップで計測された多数の遺伝子発
現量の変化のデータ解析法として、自己組織化写像を用
いてデータをクラスター化して分類する方法(特開20
00−342299号)や特定の疾病に関するクラス分
けに有効な遺伝子を相関解析から選択し、重み付け票決
スキームでクラス分けする方法(特開2001−017
171号)がある。また、サポートベクトルマシン(S
upport Vector Machine:SV
M)を用いて遺伝子の分類を学習する方法がある(Pr
occedings of National Aca
demy ofScience USA(2000)9
7、第262頁〜第267頁)。
【0006】疾病に伴う遺伝子発現プロファイルの変化
を計測する場合、被検試料を多量に集めることが困難で
あるので、発現量の変化を計測する遺伝子の数と比較し
て、被検試料の数が非常に少ないという問題がある。被
検試料の数が非常に少ないので、通常の統計的な手法で
は疾病との相関解析が困難である場合が多い。
【0007】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、以上の
ような従来の技術では、各被検試料をクラス分けする方
法はあるが、各被検試料から得られるデータから注目す
る評価指標(例えば、手術後の予後)を定量的に予測で
きないという問題点があった。定量的に予測する場合、
計測した全ての遺伝子の発現プロファイルデータを用い
て予測すると、不必要なデータも含まれているため推定
精度が悪い、遺伝子の数に対して被検試料の数が圧倒的
に少ないため推定に汎用性がないといった問題があっ
た。
【0008】一般に遺伝子と関係する疾病においては複
数の遺伝子が複雑に関係していることが多く、かつ個々
の遺伝子発現データ自体と評価指標とは必ずしも高い相
関を示すわけではないため、相関係数に基づいて選択し
た、遺伝子の発現プロファイルデータを用いた推定では
精度のよい推定ができなかった。したがって、適切な遺
伝子を選択しないとよい推定ができないという問題があ
った。
【0009】この発明は、以上のような課題を解決する
ためになされたもので、各被検試料から得られるデータ
から注目する評価指標を定量的に推定するための適切な
遺伝子を選択し、評価指標を推定する遺伝子発現プロフ
ァイル解析方法及び解析装置等を提供することを目的と
する。
【0010】
【課題を解決するための手段】この発明に係わる遺伝子
発現プロファイル解析装置においては、データを入力す
る入力手段と、遺伝子の組み合わせを生成する遺伝子組
み合わせ手段と、評価指標データを推定するための手段
を構築する第1推定手段構築手段と、評価指標データを
推定する第1推定手段と、生成した遺伝子の組み合わせ
を評価する遺伝子組み合わせ評価手段と、前記遺伝子の
組み合わせと推定法を出力する出力手段とを備えたもの
である。
【0011】また、不必要な遺伝子を除いたり、データ
の正規化などを行うデータ前処理手段を備えたものであ
る。
【0012】また、求めた最適の遺伝子の組み合わせを
用いて評価指標データを推定する第2推定手段構築手段
と第2推定手段を備えたものである。
【0013】また、前記遺伝子組み合わせ手段における
組み合わせを制約する組み合わせ制約手段を備えたもの
である。
【0014】また、前記遺伝子の組み合わせ手段に遺伝
的アルゴリズムを用いたものである。
【0015】また、前記遺伝子の組み合わせ手段に用い
た前記遺伝的アルゴリズムの組み合わせの評価に評価指
標データの推定誤差と採用する遺伝子数に基づく評価を
用いるものである。
【0016】また、前記遺伝子の組み合わせ手段に用い
る前記遺伝的アルゴリズムの遺伝子の組み合わせの変化
法として、遺伝子の採用と非採用を同程度変化させるよ
うにしたものである。
【0017】また、前記第2推定手段構築手段として、
誤差逆伝播学習を用いたニューラルネットを用いたもの
である。
【0018】この発明における遺伝子発現プロファイル
解析方法は、遺伝子発現プロファイルと注目する評価指
標データを入力する入力ステップにて、入力データに変
換し、次に、遺伝子組み合わせ候補生成ステップにて、
任意の数の遺伝子組み合わせで構成される1つ以上の遺
伝子の組み合わせ(以下、遺伝子組み合わせ群と称す)
を生成し、次に、推定方法生成ステップにて生成した遺
伝子組み合わせ群を用いて評価指標を推定する方法を生
成し、推定ステップにて生成した推定方法と遺伝子組み
合わせ群を用いて評価指標の推定値を求め、評価指標の
推定値を用いて遺伝子組み合わせ抽出ステップにて評価
指標と関係の深い遺伝子組み合わせ群が1つ以上有れば
それらの遺伝子組み合わせ群を抽出し、抽出した遺伝子
組み合わせ群の推定値群の中で最もよい評価があらかじ
め設定した値よりよくない場合は遺伝子組み合わせ候補
ステップから推定ステップまでを繰り返し、よい場合
は、出力ステップにて抽出された遺伝子組み合わせ群と
推定法を出力することを特徴としている。
【0019】また、入力した遺伝子発現プロファイルを
正規化し、注目する評価指標データと相関の低い遺伝子
発現プロファイルを取り除くことを特徴としている。
【0020】また、前記出力ステップにて抽出された遺
伝子組み合わせ群と推定法群を用いて遺伝子発現プロフ
ァイルと推定法に対応した評価指標データを推定する方
法を生成する第2推定方法生成ステップで推定方法を生
成し、生成した推定方法を用いて遺伝子発現プロファイ
ルの評価指標データの推定値を得ることを特徴としてい
る。
【0021】また、前記遺伝子組み合わせ群の評価にお
いて遺伝子の機能、遺伝子同士の関連などに関する既知
の知識を用いて、遺伝子の組み合わせに制約を加えて、
遺伝子組み合わせ群の評価指標データ推定値を変化させ
る遺伝子組み合わせ制約ステップを特徴としている。
【0022】また、前記遺伝子組み合わせ生成方法に遺
伝的アルゴリズムを用いることを特徴としている。
【0023】また、前記遺伝子組み合わせの評価に評価
指標データの推定誤差と採用する遺伝子数に基づく評価
を用いることを特徴としている。
【0024】また、前記遺伝的アルゴリズムにおける遺
伝子の組み合わせの変化法として、遺伝子の採用と非採
用を同程度変化させることを特徴としている。
【0025】また、前記評価指標データを推定する推定
法を生成する第2推定方法生成ステップとして、誤差逆
伝播学習を用いたニューラルネットによって推定法を学
習することを特徴としている。
【0026】また、上記の方法にて出力した遺伝子組み
合わせ群と推定法群を蓄積する際に、少なくとも遺伝子
組み合わせと評価指標と評価指標データの推定法を関連
付けて蓄積するデータベースを用いることを特徴として
いる。
【0027】また、前記遺伝子組み合わせ群に対して、
評価指標群及び評価指標の推定法群を関連付けて蓄積す
るデータベースを用いることを特徴としている。
【0028】
【発明の実施の形態】[発明の実施の形態1]この明細
書において、「遺伝子発現プロファイルデータ」とは、
個々の試料、例えば組織、細胞等において発現されてい
る複数の遺伝子の発現パターンを指し、言い換えれば遺
伝子の種類とそのそれぞれの発現量(若しくは発現比
率)から構成されるデータの集合体を意味する。母集団
から選択された遺伝子群に関する発現パターンもこの発
明に言う遺伝子発現プロファイルデータに包含される。
また、「遺伝子発現データ」とは、個々の試料における
任意の遺伝子の発現量(若しくは発現比率)を指す。
【0029】この明細書に記載の「評価指標」とは、試
料の性格付けに関連する任意の性質を指し、定性的な指
標、定量的な指標のいずれもが包含される。この発明に
使用される評価指標には特に限定はないが、例えば、疾
病に関連するものでは疾病の名称、原因、進行状況、予
後、余命や発症、再発、転移の可能性等が挙げられる。
また、「評価指標データ」とは、各試料における特定の
評価指標に関するデータを指す。すなわち、各試料が特
定の評価指標に関してどのような数値を有するか、或い
はどのようなクラスに分類されるかを示すデータであ
る。
【0030】この発明において使用される試料として
は、評価指標データが既知のもの、未知のもののいずれ
もが包含される。例えば、既知の評価指標データをこの
発明に使用し、当該評価指標データの推定に有用な遺伝
子群、並びに該遺伝子群の発現プロファイルデータから
評価指標データを推定する方法を見出すことができる。
また、こうして得られた推定法と評価指標データ未知の
試料における遺伝子発現プロファイルデータから、当該
試料に関する評価指標データを推定することができる。
【0031】図1は、この発明の実施の形態1の遺伝子
発現プロファイル解析装置の構成を示すブロック図であ
る。
【0032】図1において、1は遺伝子発現プロファイ
ルデータと注目する評価指標データを入力する入力手
段、2は遺伝子発現プロファイルデータの正規化、注目
する評価指標データとの相関の低い遺伝子データの削除
などを行うデータ前処理手段、3は推定に用いる遺伝子
の組み合わせを選択する遺伝子組み合わせ手段、4は選
択された遺伝子の発現データから評価指標データを推定
する手段を構築する推定手段構築手段、5は第1推定手
段構築手段4で構築された方法により評価指標データを
推定する第1推定手段、6は得られた推定法があらかじ
め設定した基準を満たしているかどうかを評価する遺伝
子組み合わせ評価手段、7は遺伝子の機能・関連などの
既知の情報により遺伝子の組み合わせに制約を設ける組
み合わせ制約手段、8は得られた遺伝子の組み合わせか
ら新たに評価指標データを推定する手段を構築する第2
推定手段構築手段、9は第2推定手段構築手段8で構築
された推定法により評価指標を推定する第2推定手段、
10は遺伝子の組み合わせと評価指標データの推定法を
出力する出力手段である。
【0033】ここで、この発明の態様として入力には、
手術で摘出された器官の癌患部試料と正常と判断された
部位試料との各遺伝子の発現比率をDNAマイクロアレ
イで計測したデータ(発現プロファイルデータ)を用い
た。また、被検試料の注目する評価指標として、その被
検試料を得た被験者の予後の存命月数を用いた。但し、
存命月数が60ヶ月(5年)以上は該癌における影響はな
いものとして60ヶ月として取り扱う。第1推定手段構
築手段4と第2推定手段構築手段8、第1推定手段5と
第2推定手段9は同じ手段を用いてもよいし、違う手段
を用いてもよい。
【0034】なお、上記の癌患部試料と正常部位試料に
おける遺伝子発現プロファイルデータと評価指標データ
である存命月数は、この発明に使用される遺伝子発現プ
ロファイルデータ、及び評価指標データのそれぞれの一
例であり、この発明を何ら限定するものではないのは当
然であり、目的の評価指標データを推定するために使用
できる被検試料の遺伝子発現プロファイルデータ、評価
指標データであればよい。
【0035】次に、この発明の実施の形態1に係る遺伝
子発現プロファイル解析装置の使用方法について説明す
る。
【0036】使用方法の手順は、図8のフローチャート
の通りであるので、図8を用いて説明する。まず、入力
ステップS1に各被検試料の遺伝子の発現プロファイル
データと評価指標データである予後の存命月数を入力す
る。
【0037】次に、データ前処理ステップS2で、遺伝
子発現プロファイルデータの正規化、不必要なデータの
削除などを行う。この前処理は入力されたデータに基づ
き適切な方法を選択することができる。
【0038】次に、遺伝子組み合わせ候補生成ステップ
S3で遺伝子の組み合わせを生成する。この実施の形態
1では、遺伝的アルゴリズムを用いて遺伝子の組み合わ
せを生成する。遺伝的アルゴリズムでは、複数の組み合
わせを生成し、その組み合わせの評価を行い、基準を満
たす組み合わせが得られるまで探索を行う。基準を満た
さない場合は、遺伝子の組み合わせの選択・交叉を行
い、新たな遺伝子の組み合わせを生成し、評価・選択を
行う。
【0039】遺伝子の組み合わせを表現する方法とし
て、図2のようなビット列を用いた。DNAアレイで計
測した各遺伝子に対応したビットを設け、そのビットが
1である場合、その遺伝子を遺伝子の組み合わせに採用
し、0である場合採用しない。このようなビット列を複
数個用意し(ビット列のセット)、遺伝的アルゴリズム
でビット列の生成・評価を行い、注目する評価指標デー
タ(この実施の形態1では予後の存命月数)を推定する
のに適切な遺伝子の組み合わせを探索する。
【0040】第1回目のビット列のセットの生成では、
ランダムに各ビット列を生成する。2回目以降のビット
列のセットの生成では、前回のビット列のセットを基に
次のような方法で、ビット列のセットを生成する。ビッ
ト列に対する評価が最も高いいくつかのビット列はその
まま残す。残りのビット列は、前回のビット列のセット
の中から任意の2つのビット列を選択し、交叉によって
新たなビット列を生成する。ここでの交叉は、各ビット
毎にどちらのビット列のビットを選択するか決める一様
交叉を用いる。交叉によって生成したビット列にさらに
突然変異を加えて、新たなビット列を生成する。ここ
で、各ビットをランダムに反転させるような突然変異を
行うと、1の数が約半数になるように変化してしまう。
【0041】この発明の課題では、遺伝子の採用数は入
力された遺伝子数の半数より非常に少なくないと推定の
汎用性が小さいと考えられるので、採用数が多いビット
列は評価が低い。そこで、突然変異の前後でビット列に
おける1の数が大きく変化しないように、1 変異率を設定するようにした。この2つの確率間に数1
を満たすような関係を導入することによって、1の数を
大きく変化させないようにできる。
【0042】
【数1】 命月数、は係数を表す。
【0043】次に、第1推定方法生成ステップS4で各
遺伝子の組み合わせ毎に推定方法を構築する。推定方法
として、採用した遺伝子の重み付き線形和による推定で
ある数2を採用した。
【0044】
【数2】
【0045】次に、第1推定ステップS5で予後の存命
月数を推定する。最小2乗法により予後の存命月数を推
定するための係数を推定する。
【0046】次に、遺伝子組み合わせ評価ステップS6
で各遺伝子の組み合わせの評価を行う。推定方法S5で
求めた推定法によって推定した予後の存命月数の誤差と
採用した遺伝子数の2つの観点で遺伝子の組み合わせを
評価した。
【0047】 は数3で行った。
【0048】
【数3】 定数である。図3は数3のグラフの一例を示す。図3の
ような評価関数により、望ましくない遺伝子の組み合わ
せを効果的に排除し、有望な組み合わせを幅広く受け入
れることが可能になっている。
【0049】
【0050】
【数4】
【0051】図4は、数4の説明図である。数4は、遺
伝子の数に対して被検試料の数が圧倒的に少ないため採
用する遺伝子数が多くなると推定に汎用性がなくなって
しま より小さくすることにより解決されることを見出し、こ
の発 することにより解決した。
【0052】数3、数4の評価を組み合わせて各遺伝子
の組み合わせを評価する。組み合わ とのバランスを図ることができ、被検試料の数が極端に
少なく推定誤差をある程度犠牲にする必要がある場合な
どに対話的に遺伝子を抽出することができる。
【0053】
【数5】 を用いて遺伝子組み合わせ群を抽出する。遺伝子組み合
わせ
【0054】次に、遺伝子組み合わせ制約ステップS8
で、抽出された遺伝子組み合わせ群の中で制約条件を満
たしているものを抽出する。遺伝子の機能や遺伝子同士
の関連などに関する情報を利用できるならば、遺伝子組
み合わせ制約ステップS8でその情報を入力し、遺伝子
の組み合わせにおける制約条件を生成する。既知の知識
は、複数遺伝子の同時利用、同時利用禁止などの制約と
して表現する。すなわち、遺伝子組み合わせ候補生成ス
テップS3で説明した図2のビット列で遺伝子の組み ト列を用いる。こうすることにより、遺伝的アルゴリズ
ムの探索空間を小さくすることができると同時に、既知
の知識を推定に役立つ部分ビット列として効果的に利用
することができる。
【0055】遺伝子組み合わせ評価ステップS6で求め
た各遺伝子の組み合わせの評価を比較し、最もよい評価
があらかじめ設定した値よりよければ、遺伝子の組み合
わせの選択を終了し、第2推定方法生成ステップS9に
移る。設定した値以上の遺伝子の組み合わせがなけれ
ば、遺伝子組み合わせ候補生成ステップS3に戻って遺
伝子の組み合わせの生成・推定・評価・選択を繰り返
す。
【0056】次に、第2推定方法生成ステップS9で
は、求めた最適な遺伝子の組み合わせを用いて予後の存
命月数を推定する手段を構築する。第1推定方法生成ス
テップS4で用いた線形多項式を採用してもよいし、誤
差逆伝播学習を用いたニューラルネットワークを採用し
てもよい。ニューラルネットワークを用いる場合、予め
相関の高い遺伝子の組み合わせに絞り込んだ上で学習す
ることができるため、被検試料データが少ないことに起
因する過学習を防ぐことができると期待される。
【0057】次に、第2推定ステップS10では、採用
した推定手段を用いて予後の存命月数を推定する。線形
多項式の場合には、最小2乗法を用いればよいし、ニュ
ーラルネットワークの場合には誤差逆伝播学習則を用い
て係数を学習する。
【0058】最後に出力ステップS11から、求めた最
適な遺伝子の組み合わせ群と予後の存命月数の推定法を
出力する。すなわち、求めた遺伝子の発現プロファイル
データから、求めた推定法により予後の存命月数を推定
することができる。
【0059】図5は、予後の存命月数との相関係数の大
きい順に選んだ25個の遺伝子を用いて予後の存命月数
を線形多項式を用いて推定した結果である。予後の存命
月数の誤差の平均値は10.7ヶ月であり、よい推定は
できなかった。
【0060】図6は、この発明で求めた最適な遺伝子の
組み合わせの一例で推定した結果である。 予後の存命
月数の誤差の平均値は2.6ヶ月であり、精度のよい推
定ができた。
【0061】この発明により一度求めた、最適な遺伝子
の組み合わせ群と予後の存命月数の推定法をデータベー
スに蓄積することにより、入力される遺伝子発現プロフ
ァイルを時間の経過とともに増加させることができ、例
えば、第2推定方法生成ステップS9の学習効果を高め
ることができ、データの蓄積が進めば、少量のデータで
精度の高い評価指標の推定値を得ることが可能になる。
【0062】また、一度データベースに蓄積した遺伝子
組み合わせ群と存命月数に代表される評価指標の推定法
のデータの再利用方法として、特に限定するものではな
いが、例えば、小型のパーソナルコンピュータにインス
トールし、ヒトを含む生物の生体内環境、例えば分化、
成長、老化、代謝のモニタリング、疾病の診断等が挙げ
られる。
【0063】上記のような、この発明により選択された
遺伝子の発現プロファイルを測定する態様としては、特
に限定するものではないが、例えば、被検試料中で発現
されている前記遺伝子由来のmRNA量の測定が挙げら
れる。mRNA量の測定方法には、適切なプローブを使
用するハイブリダイゼーション法やRT−PCR法に代
表される核酸増幅法を利用することができるが、これら
に限定されるものではなく、公知のmRNA定量方法の
いずれもが使用できる。同時に複数のmRNA種の定量
を行う観点からは、前記遺伝子又はその断片が担体上に
固定化されたDNAアレイを使用したハイブリダイゼー
ション法が好適である。ここでDNAアレイとは、1以
上のDNA分子種がそれぞれ担体上のあらかじめ定めら
れた領域に固定化されたものを称する。当該DNAアレ
イに使用される単体には特に限定はなく、例えば、平板
上、膜状、テープ又はひも状、粒子状の担体が使用でき
る。粒子状単体を使用したアレイとしては、個々のビー
ズに特定のDNA分子種が固定化されたマイクロビーズ
アレイが例示される。また、固定化されたDNAと試料
中の核酸とのハイブリッドの形成を直接検出する手段、
例えばハイブリッド形成の有無を電気信号として出力す
る手段を備えたDNAアレイであってもよい。
【0064】さらに、この発明は、上記のように選択さ
れた遺伝子の発現プロファイルの測定に有用なDNAア
レイ並びにmRNA量測定用のキットを提供する。この
発明のDNAアレイは、上記のようにこの発明により選
択された遺伝子、又はその断片が担体上のあらかじめ定
められた領域に固定化されたものである。また、この発
明のキットは選択された遺伝子から転写されるmRNA
をそれぞれ定量可能なものであり、この発明により選択
された遺伝子、又はその断片にハイブリダイズ可能なプ
ローブを含むキット、並びに前記遺伝子、又はその断片
を核酸増幅法によって増幅するための少なくとも1種の
プライマーを含むキットが例示される。これらのキット
は、ハイブリダイゼーション、又は核酸増幅方法を実施
するための試薬類をさらに含むものが好適である。
【0065】試料に関する評価指標データを得るための
装置もこの発明により提供される。該装置は下記手段:
(1)この発明の遺伝子発現プロファイル解析方法を用
いて選択された遺伝子の発現プロファイルデータを入力
する手段、(2)この発明の遺伝子発現プロファイル解
析方法を用いて提供される評価指標データの推定法によ
り、手段(1)で得られた遺伝子発現プロファイルから
被検試料における評価指標データを推定する手段、及び
(3)手段(2)で得られた評価指標データを出力する
手段。
【0066】を備えていることを特徴とする。
【0067】ここで、手段(1)としては、さらに前記
の方法を用いて選択された遺伝子の発現を測定する手段
を備えていてもよく、例えば前記この発明により選択さ
れた遺伝子、及びその断片が担体上の予め定められた領
域に固定化されたDNAアレイを備えたものが例示され
る。この場合、DNAアレイ上でのハイブリダイゼーシ
ョンを実施するための装置、試料由来の核酸とハイブリ
ダイズしたDNAを検出するための装置をさらに備えた
ものが好ましい。手段(3)としては、評価指標データ
をディスプレイ上、印刷物、及び/又は磁気若しくはそ
の他の記憶手段を備えた記憶媒体上に出力可能なものが
挙げられる。
【0068】この発明は、以上説明したように構成され
ているので、以下に示すような効果を奏する。
【0069】データを入力する入力手段と、遺伝子の組
み合わせを生成する遺伝子組み合わせ手段と、評価指標
データを推定するための手段を構築する第1推定手段構
築手段と、評価指標データを推定する第1推定手段と、
生成した遺伝子の組み合わせを評価する遺伝子組み合わ
せ評価手段と、遺伝子の組み合わせと推定法を出力する
出力手段とを備えることにより、適切な遺伝子の組み合
わせを選択することができ、注目する評価指標データを
推定する推定法を得ることができる。
【0070】また、不必要な遺伝子を除いたり、データ
の正規化を行うデータ前処理手段によりデータの前処理
を行うことにより、効率よく遺伝子の組み合わせの生成
・推定・評価を行うことができる。
【0071】また、求めた最適の遺伝子の組み合わせを
用いて評価指標データを推定する第2推定手段構築手段
と第2推定手段を備えることにより、よりよい推定を得
ることができる。
【0072】また、遺伝子組み合わせ手段における組み
合わせを制約する組み合わせ制約手段を備えたことによ
り、既存の遺伝子の機能や遺伝子同士の関連などに対す
る知識を利用することができ、より必然性の高い推定法
を得ることができる。
【0073】また、遺伝子組み合わせ手段に遺伝的アル
ゴリズムを用いることにより、効率よく最適な遺伝子の
探索を行うことができる。
【0074】また、遺伝子組み合わせ手段に用いる遺伝
的アルゴリズムの評価に、評価指標データの推定誤差と
採用する遺伝子数に基づく評価を用いることにより、推
定誤差が小さく汎用性のある推定を得ることができる。
【0075】また、遺伝子組み合わせ手段に用いる遺伝
的アルゴリズムの遺伝子の組み合わせの変化法として、
遺伝子の採用と非採用を同程度変化させるようにしたの
で、不必要な変化を減少させ、効率よく最適な遺伝子の
組み合わせを探索できる。
【0076】また、第2推定手段構築手段として、誤差
逆伝播学習を用いたニューラルネットを用いたので、よ
り精度の高い推定法を得ることができる。
【0077】この発明の遺伝子発現プロファイル解析装
置を使用して、目的とする評価指標データを得るために
最適な遺伝子の組み合わせを探索し、同時に、選択され
た遺伝子の発現プロファイルデータから個々の試料にお
ける評価指標データを推定するための推定方法を構築す
ることができる。この発明を利用する態様としては、特
に限定するものではないが、例えばヒトを含む生物の生
体内環境、例えば分化、成長、老化、代謝のモニタリン
グ、疾病の診断等が挙げられる。
【0078】例えば、ヒトの疾病の診断や治療法の選択
においては、当該疾病の特徴を分子レベルで把握するこ
とが有用である。各種の疾病には多数の遺伝子の発現変
動が起こっているが、当該変動はその原因、病状、或い
は個体差によってそのパターンが異なる。すなわち、い
くつかの遺伝子の発現プロファイルデータは各個体にお
ける疾病の性格や病状を反映しており、その解析によっ
て診断、治療に有用な評価指標に関するデータを得るこ
とが可能である。前記評価指標としては、例えば、疾病
の名称、タイプ、原因、進行状況、予後、余命、薬剤に
対する感受性やその副作用、発症、再発、転移の可能性
等がある。この発明により、これらの評価指標の推定に
有用な遺伝子の選択、並びに評価指標データの推定法を
効率よく、かつ高い精度で得ることができる。また、疾
病を有していない個体においても、適切に選択された遺
伝子の発現プロファイルから健康状態や各種疾病の発症
の可能性を評価指標として得ることができる。
【0079】このような解析が有用な疾患としては、特
に限定するものではないが、例えば、癌、糖尿病、肝疾
患、循環器系疾患(心筋梗塞、脳血管障害等)、高血
圧、遺伝性疾患、感染症等が挙げられる。また、寿命、
肥満、禿頭等の評価指標データを得ることもできる。
【0080】上記の他、生理活性物質の探索や薬物代謝
の研究など、生物学、分子生物学、医学、薬学領域にお
ける基礎研究にもこの発明を利用することが可能であ
る。
【0081】
【実施例】以下、この発明を実施例をもって更に具体的
に説明するが、この発明はこれらの実施例によって限定
されるものではない。
【0082】[実施例1] 癌関連遺伝子搭載DNAチ
ップの作製と胃癌検体における遺伝子発現プロファイル
の解析 (1)胃の癌化により発現が変化する遺伝子由来cDN
Aの単離 胃の癌化病変部試料と対照正常部試料とを比較するディ
ファレンシャルディスプレイ法を行い、癌化により発現
量の変化する遺伝子由来cDNAを単離した。
【0083】まず、インフォームド・コンセントの得ら
れた低分化腺癌の進行癌患者から摘出された胃の癌化病
変部及び対照正常部のそれぞれから、TRIzolTM
試薬(ギブコBRL社製)を用いて、全RNAを抽出
し、粗RNA試料とした。得られた粗RNA試料のうち
50μg相当量と、最終濃度5mM MgClと20
単位のRNase阻害剤(宝酒造社製)と10単位のD
NaseI(宝酒造社製)とを、37℃、30分間反応
させ、ゲノムDNAを除去し、RNA試料を得た。
【0084】前記RNA試料について、Fluores
cence Differential Displa
TM Kit Rhodamine version
(宝酒造社製)とEnzyme Set−FDD(宝酒
造社製)とを用いて、キット添付の説明書記載の手順に
従い、下記の通りにRT−PCRを行った。
【0085】まず、前記RNA試料200ngと、前記
Fluorescence Differential
DisplayTM Kit Rhodamine
versionに添付された、5’−CG−3’のアン
カー配列を有するローダミンラベル下流プライマーとを
混合して得た混合液を70℃、10分間の熱処理後、急
冷した。この混合液にAMV逆転写酵素とdNTPとを
添加して、55℃、30分の逆転写反応を行い、一本鎖
cDNA試料を得た。
【0086】前記一本鎖cDNA試料を鋳型とし、逆転
写反応時と同じローダミンラベル下流プライマーと、前
記キットの24種の上流プライマー(R1乃至R24)
のいずれか1種とを用いて、1.3mM MgCl
と、基質として各100μMのdATP、dGTP、
dCTP及びdTTPとを含有した反応液中でPCRを
行い、合計24種類の増幅DNA試料を得た。なお、前
記PCRのサーマルプロファイルは、94℃、2分−4
0℃、5分−72℃、5分の処理のあと、94℃、30
秒−40℃、2分−72℃、1分からなる反応を1サイ
クルとして34サイクル、その後、さらに72℃、5分
の処理、とした。
【0087】反応終了後の反応液に等量の95%ホルム
アミドを添加し、90℃、2分間熱変性して電気泳動用
サンプルとした。このサンプルを7M尿素変性4%ポリ
アクリルアミドゲル電気泳動に供し、得られたゲル上の
DNA断片泳動パターンを蛍 で読み取り、検出した。その結果、多数のバンドからな
るフィンガープリントが得られ、癌病変部由来試料と対
照正常部由来試料とで強度の異なる複数のバンドが存在
した。
【0088】ついで、上記のフィンガープリント上に、
前記電気泳動後のポリアクリルアミドゲル板を置き、癌
病変部と対照正常部との間で強度の異なるバンド部分の
ゲル250本を切り出した。ゲルからDNA断片を水抽
出し、Cloning−Sequencing Pri
mer Set for FDD(宝酒造社製)中の各
DNAフラグメントに対応するプライマーを用い、再度
PCRによる増幅を行った。
【0089】増幅されたフラグメントをTAクローニン
グ法にてクローン化し、1フラグメントにつき4クロー
ンずつ単離した。ついで、得られた各クローンに含まれ
る核酸について、ダイデオキシ法により、塩基配列を決
定した。得られた塩基配列をParacel Clus
tering packageソフト(Paracel
社製)を用いてアセンブリを行い、形成された各コンテ
ィグ(contig)配列について、塩基配列情報を収
録したデータベースを用いたホモロジー探索を行った。
【0090】以上のようにして得られた遺伝子のうち、
65遺伝子は既に単離、同定された遺伝子であるが、そ
の癌との関連は知られていないことが明らかとなった。
これらの遺伝子名並びにGenBankにおける登録番
号(AccesssionNo.)を表1に示す。
【0091】
【表1】 さらに、上記の遺伝子の他、データベースを用いたホモ
ロジー検索では既知の遺伝子とのホモロジーが見出され
なかった171種の遺伝子断片が得られた。これらの遺
伝子断片の塩基配列をそれぞれ配列表の配列番号1乃至
171に示す。これらの各群の遺伝子の組み合わせは、
いずれも平均誤差2.0〜3.0ヶ月で存命月数を推測
することができた。
【0092】(2)DNAアレイの作製 前記(1)記載の、胃の癌化により発現変動することが
見出された各遺伝子由来増幅DNA断片を用い、DNA
アレイ搭載フラグメントを調製した。
【0093】まず、(1)記載の方法でDD法により見
出されたクローンのうち、各コンティグを代表する配列
を含有したクローン、並びにWO98/37187号国
際公開パンフレットに記載された癌関連遺伝子のクロー
ンの計346種類のクローンを鋳型とし、当該プラスミ
ドのマルチクローニングサイトの両端に設定されたプラ
イマーを使用したPCR法により目的のcDNA断片を
増幅した。ついで、増幅されたcDNA断片の塩基配列
分析を行って、目的の断片であることを確認した。ま
た、目的の断片をエタノール沈殿法により回収し、回収
された断片を100mM炭酸緩衝液(pH9.5)に1
μMとなるように溶解した。
【0094】この他、ハウスキーピング遺伝子としてβ
−アクチン遺伝子、チューブリンα2、シクロフィリ
ン、グリセルアルデヒド3燐酸デヒドロゲナーゼ、リボ
ゾーマルタンパク質S5、リボゾーマルタンパク質S9
等の遺伝子を、またネガティブ対照として、プラスミド
pUC19をそれぞれ同様に調製した。これらをDNA
チップ作製装置(アフィメトリクス社製)を用いて、ア
ミノ基導入スライドガラス(シグマ社製)にスポット
し、UV照射により固定した。スライドを0.2%SD
S、次いで蒸留水で洗浄乾燥してDNAアレイとした。
【0095】(3)蛍光標識cDNAの調製 遺伝子発現解析には、インフォームド・コンセントの得
られた35名の胃癌患者由来の試料を用いた。これら3
5名の胃癌患者の臨床病理因子の内訳を以下に示す。
【0096】進行度: 進行度1(癌の浸潤程度が浅く、転移の認められない早
期の癌):7名 進行度2(癌が浸潤、近接リンパ節に転移した状態):
8名 進行度3(遠隔リンパ節に広がった状態):4名 進行度4(より遠隔リンパ節に広がるとともに腹膜転
移、肝転移した状態):16名 分化度: 乳頭腺癌(pap):1名 高分化腺癌(tub):4名 中分化腺癌(tub2):11名 低分化腺癌(por):15名 印環細胞癌(sig):2名 粘液癌(muc):2名 深達度(癌浸潤の及んだ最も深い胃壁の層で表す): 粘膜(m):2名 粘膜下層(sm):4名 筋層(mp):5名 しょう膜化組織(ss)若しくはしょう膜を破り腹膜に
露出(se):24名 リンパ節転移 なし:8名 あり:27名 腹膜播種 なし:32名 あり:3名 それぞれの胃癌患者より癌摘出手術等に摘出された組織
から胃癌組織と対照正常胃組織とを取り分けた。つい
で、AGPC(Acid GuanidiumPhen
ol−Chloroform)法により、各組織から個
々に全RNAを摘出した。これらの全RNAのそれぞれ
からOligotex−MAG mRNA Purif
ication Kit(宝酒造社製)を用いてmRN
Aを射精した。
【0097】上記mRNAを鋳型とし、逆転写酵素を用
いてcDNA合成反応を行った。なお、対照正常胃組織
群の場合、Cy3−dUTP(アマシャム社製)を含む
dNTPを用い、胃癌組織群の場合、Cy5−dUTP
(アマシャム社製)を含むdNTPを用いた。なお、各
検体由来胃癌組織と対照正常胃組織につき2反応ずつ標
識反応を行った。反応液組織を以下に示す。
【0098】反応液A:上記mRNA約1μg、300
pmolのオリゴdTプライマー(宝酒造社製)及び最
終的に11.9μlになるようにジエチルピロカーボネ
ート(DEPC,ナカライテスク社製)処理水を添加。
【0099】反応液B:5×AMV RTase用緩衝
液(ライフサイエンス社製)4μlと、各0.1mMの
dATP、dCTP、dGTP及び0.065mMのd
TTPと、30UのRNaseインヒビター(宝酒造社
製)と、0.035mMのCy3又はCy5標識dUT
P(アマシャムファルマシア社製)とを混合し、最終容
量6.5μlの溶液を得た。
【0100】反応液Aを70℃で10分間保持した後、
氷俗上で冷却し、反応産物を得た。ついで、前記反応産
物に、反応液Bと約30単位のAMV RTase(ラ
イフサイエンス社製)とを添加し、さらに55℃で30
分間保持した。その後、得られた反応産物に約30単位
のAMV RTaseをさらに添加し、反応液量を20
μlにし、RT反応液を得た。前記RT反応液を42℃
で60分間保持した。ついで、この反応液を70℃で1
0分間保持し、逆転写反応を停止し、室温まで冷却し
た。得られた反応産物を、Centri−sep sp
in Column(アプライド・バイオシステムズ社
製)を用いてゲルろ過した。このようにして得られたC
y3標識cDNA、Cy5cDNAを、同一患者分を混
合してエタノール沈殿濃縮し、ハイブリダイゼーション
緩衝液(6×SSC/0.2%SDS/5×デンハート
液/0.1mg/mlサケ精子DNA)10μlに溶解
して、蛍光標識cDNAを調整した。なお、1×SSC
の組織は、0.15M NaCl、0.015Mクエン
酸ナトリウム、pH7.0である。
【0101】(4)ハイブリダイゼーション 前記(2)で作製したDNAアレイ、及び市販のTaK
aRa IntelliGeneTM Human C
ancer CHIP version2.0(ヒト由
来既知遺伝子のうち癌疾患に関連する遺伝子425種類
搭載、宝酒造社製)に、プレハイブリダイゼーション緩
衝液(6×SSC、0.2%SDS、5×デンハート
液、1mg/mlサケ精子DNA)を滴下し、カバーグ
ラスをかけて室温で2時間保持した。その後、カバーグ
ラスを除き、アレイを2×SSCで洗浄し、ついで、
0.2×SSCで洗浄し、風乾した。
【0102】ついで、前記(3)で調製した標識cDN
A各2本を熱変性した後、1反応分全量を(2)で調製
したDNAアレイに、残り1反応分全量をTaKaRa
IntelliGene(商標)Human Can
cer CHIP version2.0に滴下し、カ
バーグラスをかけて周囲をフィルムで密閉した。これを
65℃で16時間保持した。ついで、カバーグラスを除
いて、アレイを、0.2×SSC/0.1%SDS中、
55℃で30分の洗浄を2回行い、ついで、65℃で5
分洗浄し、さらに、0.05×SSC中、室温で5分洗
浄し、風乾した。
【0103】風乾後のアレイを、マイクロアレイスキャ
ナー(アフィメトリクス社製)にかけて各スポットの蛍
光シグナルを解析した。測定されたシグナルを発現デー
タ解析ソフトImagene(バイオディスカバリー社
製)で解析し、個々の胃癌患者について、癌組織と対照
正常組織とにおける各遺伝子の発現量を調べた。
【0104】(5)遺伝子発現データの解析 各遺伝子の発現変動を、癌組織の対照正常組織に対する
各遺伝子の相対発現比率[癌組織の発現強度シグナル/
対照正常組織の発現強度シグナル]により判定した。こ
の際、比較対照となる癌組織mRNAと対象正常組織m
RNAの質の補正のため、ハウスキーピング遺伝子の発
現量の平均値で補正し、ノーマライゼーションを行っ
た。この結果、35名の胃癌患者における、前記(2)
で作製したDNAアレイ、及びTaKaRa Inte
lliGeneTM HumanCancer CHI
P version2.0 に搭載された合計771種
類の遺伝子発現プロファイルを得た。
【0105】前記771種類の遺伝子の35名の胃癌患
者における発現比率と予後の存命月数との相関関係を求
めた。そのヒストグラムを図7に示す。
【0106】[実施例2] 遺伝子発現プロファイル解
析 (1)周知の方法を用いた予後の存命月数の推定 評価指標を予後の存命月数とし、35名の被験者由来の
被検試料より前述実施例1−(5)で得られた771種
類の遺伝子発現プロファイルデータと予後の存命月数を
用いた。図7に示したヒストグラムの中から、相関係数
の大きい順に選んだ25個の遺伝子を用いて予後の存命
月数を線形多項式を用いて推定した結果を図5に示す。
予後の存命月数の誤差の平均値は10.7ヶ月であり、
よい推定はできなかった。
【0107】(2)この発明の方法を用いた予後の存命
月数の推定 評価指標を予後の存命月数とし、35名の被験者由来の
被検試料より前述実施例1−(5)で得られた771種
類の遺伝子発現プロファイルデータと予後の存命月数を
入力データとする。存命月数が60ヶ月(5年)以上は
該癌に影響はないものとして60ヶ月として扱う。入力
された遺伝子発現プロファイルデータは、前処理とし
て、発現比率データの正規化、不必要データの削除を行
った後、各遺伝子を1ビットとして長さ771のビット
列を生成する。遺伝的アルゴリズムで500個のビット
列の生成を行った。1回目の生成では、ランダムに50
0個のビット列を生成した。2回目以降の生成では、最
も評価が高かったビット列を1つ残し、残りのビット列
は前回のビット列のセットから任意の2つのビット列を
選択し、交叉によって新たなビット列を作り、それに突
然変異を加えることによって生成した。交叉は一様交叉
とし、突然変異は、突然変異率の数1を用いて、λ
out=0.1、λin=0.1*n/(771−n)
で設定した。ここで、nは値が1のビットの数を表す。
実測値と予測値との平均誤差と採用した遺伝子数によ
り、各遺伝子組み合わせを評価した。平均誤差評価は、
数3を使用し、それぞれa=0.525186747
5、b=16.50272566、c=0.37655
90625とした。また、採用遺伝子数の評価は数4で
s=0.9、Gin=25である。
【0108】これらに対して重み付けを行い、最終的に
数5で表される評価関数、α=0.9で評価を行った。
【0109】評価を繰り返し行い、下記に第1群として
示した24種の遺伝子の組み合わせが得られた。求まっ
た最適な遺伝子の組み合わせで予後推定をした結果を図
6に示す。誤差平均が2.6ヶ月となり、精度のよい推
定ができた。
【0110】1群(24種) ・"retinoic acid receptor,beta"(GenBank Accession
No. Y00291) ・envoplakin(GenBank Accession No. U53786) ・insulin-like growth factor binding protein(GenB
ank Accession No. M35878) ・proliferating cell nuclear antigen(GenBank Acce
ssion No. M15796) ・platelet-derived growth factor beta polypeptide
(simian sarcoma viral(v-sis)oncogene homolog)(Gen
Bank Accession No. M12783) ・Homo sapiens mRNA for Prer protein(GenBank Acce
ssion No. AJ005579) ・Human CO-029 (GenBank Accession No. M35252) ・配列表の配列番号159に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"collagen,type VIII,alpha 1"(GenBank Accession
No. X57527) ・frizzled-related protein(GenBank Accession No.
U91903) ・Human cell adhesion protein (vitronectin) recept
or alpha subunit mRNA,complete cds"(GenBank Acces
sion No. M14648) ・GC36 (WO98/37187号国際公開パンフレッ
ト) ・配列表の配列番号84に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号95に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・ectodermal-neural cortex (with BTB-like domain)
(GenBank Accession No.AF059611) ・Ric (Drosophila)-like、expressed in many tissues
(GenBank Accession No. Y07566) ・"Homo sapiens MD-1, RP105-associated (MD-1), mRN
A"(GenBank AccessionNo. NM_004271) ・"Homo sapiens cDNA FLJ10986 fis, clone"(GenBank
Accession No. AK001848) ・配列表の配列番号160に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号101に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"tumor necrosis factor receptor superfamily,memb
er 1B"(GenBank Accession No. M32315) ・配列表の配列番号16に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号56に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"integrinalpha L (antigen CD11A (p180),lymphocyt
efunction-associatedantigen 1; alpha polypeptide)"
(GenBank Accession No. AC002310) さらに、上記の第1群の遺伝子の選択とは独立した遺伝
子発現プロファイル解析を実施し、下記に第2群〜第8
群として示した、7通りの遺伝子の組み合わせが得られ
た。これらの各群の遺伝子の組み合わせは、いずれも平
均誤差2.0〜3.0ヶ月で存命月数を推測することが
できた。
【0111】第2群(25種) ・配列表の配列番号6に記載された塩基配列を有する遺
伝子 ・配列表の配列番号159に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"caspase 6, apoptosis-related cysteine protease"
(GenBank Accession No. U20536) ・forkhead box C1(GenBank Accession No. AF04869
3) ・chondroitin sulfate proteoglycan 2 (versican)(G
enBank Accession No. U16306) ・cell division cycle 10 (homologous to CDC10 of
S. cerevisiae)(GenBankAccession No. S72008) ・配列表の配列番号161に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma 2 viral oncogene h
omolog(GenBank Accession No. M54968) ・cyclin D2(GenBank Accession No. D13639) ・vascular endothelial growth factor B (GenBank A
ccession No. U43368) ・配列表の配列番号1に記載された塩基配列を有する遺
伝子 ・connective tissue growth factor(GenBank Accessi
on No. X78947) ・cadherin 18(GenBank Accession No. U59325) ・Human mRNA for SB classII histocompatibility ant
igen alpha-chain(GenBank Accession No. X03100) ・caveolin 2(GenBank Accession No. AF035752) ・EphA2 (GenBank Accession No. M59371) ・"Homo sapiens mRNA for PKU-beta, com"(GenBank A
ccession No. AB004885) ・"Human tissue factor gene, complete cds. 1/1995"
(GenBank Accession No. J02846) ・配列表の配列番号162に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号94に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号163に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"guanine nucleotide binding protein (G protein),
alpha activating activity polypeptide, olfactory
type"(GenBank Accession No. U55184) ・kinase insert domain receptor (a type III recept
or tyrosine kinase)(GenBank Accession No. AF03512
1) ・O-6-methylguanine-DNA methyltransferase(GenBank
Accession No. M29971) ・E2F transcription factor 3(GenBank Accession N
o. D38550) 第3群(25種) ・"retinoic acid receptor, beta"(GenBank Accessio
n No. Y00291) ・EphB2 (GenBank Accession No. AF025304) ・Homo sapiens full length insert cDNA clone YP42A
04(GenBank AccessionNo. AF085884) ・配列表の配列番号164に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・GG24 (WO98/37187号国際公開パンフレッ
ト) ・配列表の配列番号122に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・interleukin 8 (GenBank Accession No. M26383) ・wingless-type MMTV integration site family membe
r 2(GenBank AccessionNo. X07876) ・apoptotic protease activating factor(GenBank Ac
cession No. AF013263) ・"laminin, alpha 4"(GenBank Accession No. S7856
9) ・DNA-damage-inducible transcript 3(GenBank Acces
sion No. X92120) ・"pleckstrin homology, Sec7 and coiled/coil domai
ns 2-like"(GenBank Accession No. U59752) ・配列表の配列番号3に記載された塩基配列を有する遺
伝子 ・配列表の配列番号34に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・keratin 19(GenBank Accession No. Y00503) ・"tumor necrosis factor receptor superfamily, mem
ber 5"(GenBank Accession No. X60592) ・thyroid autoantigen 70kD (Ku antigen)(GenBank A
ccession No. Z83840) ・"integrin, beta 8"(GenBank Accession No. M7378
0) ・配列表の配列番号165に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号41に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"collagen, type XI, alpha 2"(GenBank Accession
No. AL031228) ・Homo sapiens KIAA0402 mRNA, partial cds"(GenBan
k Accession No. AB007862) ・v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral onc
ogene homolog(GenBankAccession No. X06182) ・"cadherin 6, K-cadherin (fetal kidney)"(GenBank
Accession No. D31784) ・Ras-related associated with diabetes(GenBank Ac
cession No. L24564) 第4群(24種) ・"integrin, alpha 7"(GenBank Accession No. AF032
108) ・配列表の配列番号166に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号36に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号52に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・leukocyte antigen related protein(GenBank Acces
sion No. X54890) ・CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with d
eath domain(GenBank Accession No. U84388) ・"superoxide dismutase 1, soluble (amyotrophic la
teral sclerosis 1 (adult))"(GenBank Accession No.
X02317) ・wingless-type MMTV integration site family membe
r 2(GenBank AccessionNo. X07876) ・37 kDa leucine-rich repeat (LRR) protein(GenBan
k Accession No. U32907) ・配列表の配列番号45に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号167に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma 2 viral oncogene h
omolog(GenBank Accession No. M54968) ・v-jun avian sarcoma virus 17 oncogene homolog(G
enBank Accession No. J04111) ・deoxyribonuclease I-like 1(GenBank Accession N
o. X90392) ・配列表の配列番号129に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号20に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・cell adhesion molecule with homology to L1CAM (c
lose homologue of L1)(GenBank Accession No. AF002
246) ・"catenin (cadherin-associated protein), beta 1
(88kD)"(GenBank Accession No. X87838) ・配列表の配列番号115に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号43に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"Homo sapiens nibrin (NBS) mRNA, complete cds"
(GenBank Accession No.AF051334) ・配列表の配列番号71に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"Homo sapiens ubiquitin hydrolyzing enzyme I (UB
H1) mRNA, partial cds"(GenBank Accession No. AF02
2789 52) ・配列表の配列番号85に記載された塩基配列を有する
遺伝子 第5群(24種) ・配列表の配列番号166に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"Human beta adaptin mRNA, complete cds"(GenBank
Accession No. M34175) ・配列表の配列番号169に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号123に記載された塩基配列を有す
る遺伝子(ID No. 123) ・forkhead box C1(GenBank Accession No. AF04869
3) ・insulin-like growth factor binding protein 6 (G
enBank Accession No. M62402) ・cell division cycle 10 (homologous to CDC10 of
S. cerevisiae)(GenBankAccession No. S72008) ・配列表の配列番号45に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号54に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号86に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"integrin, alpha 2 (CD49B, alpha 2 subunit of VL
A-2 receptor)"(GenBank Accession No. X17033) ・tyrosine kinase 2(GenBank Accession No. X5463
7) ・"Homo sapiens unknown mRNA, complete cds"(GenBa
nk Accession No. AF047439) ・465 (ID No. 155) ・"Homo sapiens CGI-65 protein mRNA, complete cds"
(GenBank Accession No. AF151823) ・配列表の配列番号170に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号101に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・"integrin, alpha 1"(GenBank Accession No. X6874
2) ・Human mRNA for SB classII histocompatibility ant
igen alpha-chain(GenBank Accession No. X03100) ・"ligase IV, DNA, ATP-dependent"(GenBank Accessi
on No. X83441) ・"CDC6 (cell division cycle 6, S. cerevisiae) hom
olog"(GenBank Accession No. U77949) ・配列表の配列番号14に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号115に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・plasminogen(GenBank Accession No. L07899) 第6群(23種) ・insulin-like growth factor binding protein 3(Ge
nBank Accession No. M35878) ・"Human transactivator protein (CREB) mRNA, compl
ete cds"(GenBank Accession No. M27691) ・配列表の配列番号6に記載された塩基配列を有する遺
伝子 ・protein tyrosine kinase 2 beta(GenBank Accessio
n No. U43522) ・tissue inhibitor of metalloproteinase 2(GenBank
Accession No. U44385) ・配列表の配列番号21に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・Rho6 protein(GenBank Accession No. U69563) ・"integrin, alpha 3 (antigen CD49C, alpha 3 subun
it of VLA-3 receptor)"(GenBank Accession No. M599
11) ・"ataxia telangiectasia mutated (includes complem
entation groups A, C and D)"(GenBank Accession N
o. U82828) ・cell division cycle 27(GenBank Accession No. S7
8234) ・heat shock protein 75 AF043254) ・"excision repair cross-complementing rodent repa
ir deficiency, complementation group 1 (includes o
verlapping antisense sequence)"(GenBank Accession
No. M13194) ・配列表の配列番号59に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・Homo sapiens mRNA from HIV-associated non-Hodgki
n's lymphoma (clone hl2-253)(GenBank Accession N
o. Y17173 ) ・"Human lactoferrin (HLF2) mRNA, complete cds"(G
enBank Accession No. U07643) ・bone morphogenetic protein 4(GenBank Accession
No. U43842) ・tyrosine-protein kinase receptor tyro3 precurso
r; tyrosine-protein kinase rse; tyrosine-protein k
inase sky; tyrosine-protein kinase dtk(GenBank Ac
cession No. U18934) ・"matrix metalloproteinase 7 (matrilysin, uterin
e)"(GenBank AccessionNo. Z11887) ・"mutS (E. coli) homolog 2 (colon cancer, nonpoly
posis type 1)"(GenBank Accession No. NM_000251) ・配列表の配列番号139に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・AG26 (WO98/37187号国際公開パンフレッ
ト) ・"cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1
(p35)"(GenBank Accession No. X80343) ・growth factor receptor-bound protein 10(GenBank
Accession No. D86962) 第7群(22種) ・"retinoic acid receptor, beta"(GenBank Accessio
n No. Y00291) ・"Homo sapiens cDNA FLJ20693 fis, clone"(GenBank
Accession No. AK000700) ・GG24 (WO98/37187号国際公開パンフレッ
ト) ・"ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP),
member 2"(GenBank Accession No. U49248) ・B-cell CLL/lymphoma 2(GenBank Accession No. M14
745) ・junction plakoglobin(GenBank Accession No. Z682
28) ・"Human guanylate binding protein isoform II (GBP
-2) mRNA, complete cds"(GenBank Accession No. M55
543) ・配列表の配列番号171に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号34に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・"tumor necrosis factor (TNF superfamily, member
2)"(GenBank AccessionNo. X02910) ・"laminin, beta 1"(GenBank Accession No. NM_0022
91) ・配列表の配列番号63に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・配列表の配列番号22に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・developmentally regulated GTP-binding protein 1
(GenBank Accession No.AF078103) ・keratin 7(GenBank Accession No. AJ238246) ・"mutS (E. coli) homolog 2 (colon cancer, nonpoly
posis type 1)"(GenBank Accession No. NM_000251) ・ubiquitin-conjugating enzyme E2A (RAD6 homolog)
(GenBank Accession No.M74524) ・"collagen, type VI, alpha 3"(GenBank Accession
No. X52022) ・low density lipoprotein-related protein-associat
ed protein 1 (alpha-2-macroglobulin receptor-assoc
iated protein 1)(GenBank Accession No. M63959) ・nidogen (enactin)(GenBank Accession No. M3026
9) ・"cadherin 6, K-cadherin (fetal kidney)"(GenBank
Accession No. D31784) ・"collagen, type III, alpha 1 (Ehlers-Danlos synd
rome type IV, autosomal dominant)"(GenBank Access
ion No. X14420) 第8群(20種) ・insulin-like growth factor binding protein 3 (G
enBank Accession No. M35878) ・"Human transactivator protein (CREB) mRNA, compl
ete cds"(GenBank Accession No. M27691) ・配列表の配列番号6に記載された塩基配列を有する遺
伝子 ・protein tyrosine kinase 2 beta(GenBank Accessio
n No. U43522) ・tissue inhibitor of metalloproteinase 2(GenBank
Accession No. U44385) ・Rho6 protein(GenBank Accession No. U69563) ・"integrin, alpha 3 (antigen CD49C, alpha 3 subun
it of VLA-3 receptor)"(GenBank Accession No. M599
11) ・heat shock protein 75(GenBank Accession No. AF0
43254) ・Homo sapiens mRNA from HIV-associated non-Hodgki
n's lymphoma (clone hl2-253)(GenBank Accession N
o. Y17173) ・"Human cyclin-dependent kinase inhibitor p27kip1
mRNA, complete cds"(GenBank Accession No. U1090
6) ・bone morphogenetic protein 4(GenBank Accession
No. U43842) ・tyrosine-protein kinase receptor tyro3 precurso
r; tyrosine-protein kinase rse; tyrosine-protein k
inase sky; tyrosine-protein kinase dtk(GenBank Ac
cession No. U18934) ・metastasis associated 1(GenBank Accession No. U
35113) ・Human mRNA for SB classII histocompatibility ant
igen alpha-chain(GenBank Accession No. X03100) ・"matrix metalloproteinase 7 (matrilysin, uterin
e)"(GenBank AccessionNo. Z11887) ・"mutS (E. coli) homolog 2 (colon cancer, nonpoly
posis type 1)"(GenBank Accession No. NM_000251 ) ・配列表の配列番号139に記載された塩基配列を有す
る遺伝子 ・配列表の配列番号79に記載された塩基配列を有する
遺伝子 ・AG26 (WO98/37187号国際公開パンフレッ
ト) ・"cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1
(p35)"(GenBank Accession No. X80343) [実施例3] DNAアレイの作製 実施例2に示された第1群〜第8群のそれぞれの遺伝子
の組み合わせについて、それぞれの遺伝子断片を調製
し、これをスライドグラスに固定化したDNAアレイを
作製した。DNAアレイは第1群〜第8群のそれぞれに
ついて別個に作製した。また、DNA断片の調製〜固定
化の操作は実施例1−(2)に記載の方法で実施した。
【0112】上記のDNAアレイを使用して、胃癌試料
における遺伝子発現プロファイルデータの測定を行い、
さらに各試料について存命月数の推定を行うことが可能
であった。
【0113】
【発明の効果】この発明の装置及び方法を使用すること
により、遺伝子発現プロファイルデータを得た多数の遺
伝子より、目的とする評価指標データを得るために最適
な遺伝子発現プロファイルデータの組み合わせを生成す
ることが可能になる。被検試料中の選択された遺伝子の
遺伝子発現プロファイルデータを測定することにより、
被検体の評価指標データ、例えば、余命、健康状態、疾
病の分類、薬効の評価等を得ることができ、この発明は
生化学、医学の分野において極めて有用である。
【0114】
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> TAKARA SHUZO CO., LTD. <110> MITSUBISHI SPACE SOFTWARE CO., LTD. <120> Method for analysis of gene expression profile and a system theref or <130> 01-0078 <160> 171 <210> 1 <211> 540 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 1 gatcaagtcc atacccagca gctatcaagg atttcaaggt ctctccctac atctccctcc 60 acctactcct gttagaggtg ttgaaattgt gctgtaaatg tacgtgcatg gttatagctc 120 caccatttag ttcatgccat tccctcagcc caaattcttc tttccctcat tctttgcctg 180 ttgaaagttt tcttttcatt caaaaccagc agagcgccta ttcctttctg aagtttttcc 240 tgatattccc aggcagagtc actcactcat tccttcaacc atgtacctgt tggtgtcact 300 tgtacctcag tttggtgtgt ttgtcagatt gcatttctgc agacttagtt gttgtcacat 360 ctcttacttt cattagattg taagcacatt aaaggcaagg gctgtatttt catcatatct 420 tctagaagta ctacctaaca caattgccag tacagagtag atgctcaata agttgctgat 480 taaattaaat ttcagaggaa gtaatgtgat aaacaccttt aggtaaagca ctgagacacg 540
【0115】 <210> 2 <211> 536 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 2 gatcaagtcc aacaaaaaca tgaaaagaaa gacacacatg gccaagtaca ttgtccttcc 60 caggaaggta agtaaggttg gtttaacatc caaaaatgca atgaatgtaa ctcaacatat 120 ttctaaacta aaaagaaaaa ccacacaaca atctctaaag tggcagaaaa agcatttgac 180 aaaatccagc atgtatactt gattaacact ctcacagcct aatagaataa aacttcctca 240 agctgataaa ggacatctac aaaaacccta caattaacat gacacttaat aatgaaggtc 300 tgaatgcatt tcttctaaga tcaagaacaa gccaagagta tgttctcact actactaatc 360 aatgttattc tggagattct agccagggca gtaaggcaag aaaaagcaac aagtatagta 420 ataatactgt cttgatgggc agatgacatg tttgtctatg aagaaaattc aatagaatct 480 ttaaagaaac tcttgaaact aacaggtgag tttagcaaag ctatacccta tcaacg 536
【0116】 <210> 3 <211> 511 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 3 ggtattttta gtagagacgg ggtttcaccg tgtcagcgag gatggtctca atcttctgac 60 ctcatgatcc gcccacctca gcctcccaaa gcactgggat tacaggcatg agccactgcg 120 tctggccgaa aaatagctgt ttttttaaaa agccaacatt atgctgaaac atggctaaat 180 ggttaactta cacttaaaat tattcactgg tgtccaataa tacaagccaa aatttgttta 240 tctagctgtt agtcctctcc tacttcttat agtcctgtct gctttgagtc ggtccagtct 300 atttggagaa atcagaccac aatgcttcaa aattactatt acaacaacaa atcagatcac 360 agaacagcca aaccccattc atatggtcaa aaagttacat tttttcttca ttaaacagaa 420 aatagctcaa ctggtcaaaa gaaaacatca gttctttgga gatgaggatt cctctccaca 480 tgtttagaaa tagcacacca ggcaaatcaa g 511
【0117】 <210> 4 <211> 404 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 4 cgagacagaa tctcactctg tcacccaggc tggagtcctg tgatgtgatc tcgtctcact 60 gctacctcca cctcctgggt tcaagcaaat ctcatgcctc agcctcctga gaagctggga 120 ttgtagagat agggtttcac catgttggcc aggctggtct cgaactcctg agctcaggtg 180 atccgcctgc ctcggcctcc caaagcgctg ggattacagg cgtgagccac cgcacccagc 240 tgcaagtttg attttaaaca tgctaaattt gaggtgcttt taggacatcc atgtgagggc 300 atctgggagg cagctgacaa tctggaggtc tggagagtag tcagggttga agacatcaac 360 agaggtgatg gctgaaatct tgggaggagg taagggcaat caag 404
【0118】 <210> 5 <211> 157 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 5 gtaaatgata gcatgatatc aatggcaaat gcggggaaag tagacaaatc gattaccttc 60 tcggtctttg ttgcttctgt ggcaagtcct cccactcatc tctttacatt ttagtcacct 120 aaaaagaata atcataactg aaatcctggc aatcaag 157
【0119】 <210> 6 <211> 364 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 6 cgagaaggag tctcactttg ttgcccaggc tggagtgcag cggtgcaatt tcagctcact 60 gcaacctcca cctcccaggt ttacgcaatt cttgtgcctc agcctcctga gtaggtggga 120 ttacaggtgc ccgccaccac gccctgctta tttttgtatt tttagaagag atagggtttt 180 gccatgttag ccaggctggt ctcgaactcc tgacctcagg tgatctgcct gcctcggccc 240 cccaaagtgc tgggattata ggagtaagcc accgcgcccg gcccaataaa gctcttttta 300 agtgatcatg tctgaactct acagtaatga ggctttacca cattcccatg tgacccgacg 360 tttg 364
【0120】 <210> 7 <211> 625 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 7 ctccacctcc cagcctcaag caatcctacc acctcagccc tccgagtagc tggggctaca 60 ggtgtgttgc acaccagcac gcccggctaa tttttgtacc ccctgtagag acggggtttt 120 gcttttgcca tgttgcccag gctggtctag agctcctggg ctccagcaat ccacctgcct 180 cgggctccca aagtgctggg attacaggca tgagaaacca cactcagcct agtaccccat 240 tccttattat tgttgaataa tatttcattg tatgggcaca ccatgtattt tatctatcca 300 ttcatcagtt gatggacatt tgggttgttt ccactctgga ctattatgaa taatgctcct 360 atgaacattt atgtacaggt ctttgtgtaa catatgtttc catttctctt gggcatatat 420 ctaggagtgg aattcctggg tctttgctta accttttgag aacctgccaa gatgttttcc 480 aaagcagctg taccatttta cattcccacc agaagtgtat aaaggttcca gttactccac 540 atatattatg tctctctttc tttctttctt ttttgataca gagtcttgct ctgtcaccca 600 gaatgaagac agtggggcaa tcaag 625
【0121】 <210> 8 <211> 457 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 8 cgagatgaag tctcactctg ttgcccaggc tggagtgcag tggcactatc tcagctcact 60 gaaacctcca cctcccaggt tcaagcaatt ctcctgcctt agcctcccaa gtagctggga 120 ttacaggtgt gcgccaccat acacggctaa tttttatatt ttgagtagag acagggttcc 180 gccatgttgg ccaggccggt ttcaaactcc tgacctcaag tgatctgccc tcttcagcct 240 ctcaaagtac tgggattata ggcgtgaccc accacaccca gcctcttttt ccttacttag 300 agctaagacc aaacaatgca aggaaacaaa gtttaatatt aatgagcacc gcccacatgg 360 catcaaaccc tgatgacagt tccatgaagc tatgattaca attcctattt tataaatgaa 420 gaaatggaag ctcaaggtcc cttgctcacg gtcacct 457
【0122】 <210> 9 <211> 457 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 9 aggtgaccgt acagttatca gatgataaat tctaatcatg ggacattcgc gtgggtcgtt 60 tgtaattgaa gacagtgcat cctttgtaac cgaagctagt gcaaatgagg acaggagtgg 120 agggacagaa agcggagagg tgtacagctg ctcttcttgc actgtacccc tcatatccgc 180 agccgggatc agtcaagatc tcattcgtga tgcttgggtg ccttgggggc ttgggaagcc 240 agctcaggcc ttgtgatcca ctcggattag tgttgtctgg ggttctcact ttctgactcc 300 tggaggacga aacgccactt gtctgagagg gagtgggagt gattcttgag aatgaaaaca 360 tgatttgggt agtgaagagg tggagaggag aggcagaggg gatgtggaaa agaggtagaa 420 gcagggaagt aagcatgaat aaagagtaaa ttgggcg 457
【0123】 <210> 10 <211> 402 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 10 cggcaagtca aaccagagaa aatggtgaaa cttttaagtg acagctgact cgagacagac 60 ggccctatag ctgaggaccc aggtaaggtt agatgatcaa tgtgtagcgg caccactctg 120 caacggtgcg acttctccag aagttgttcg aggaggaaag agaagtcatt agagtagccc 180 acagtggtgt ctgctgggga aacgccgcag accaacgcaa ggatgggcgt aaacaacccc 240 aagaagagct gggctgcctc ctgtctctgc attcccatca cttctttcct tcttggtttt 300 atccttaacc acgaagagca gttctcaccc ttaatgttga ctcaacattt ccttttgata 360 ataaatactt gcttagcgtc tacttttact gcccgacgtt tg 402
【0124】 <210> 11 <211> 501 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 11 cgtagagacg gggtttcacc atgttagcca ggatggtctt gatctcctga tctcatgatc 60 cacccgcctc ggcctcccaa agtgctggga ttacaggcgt gagccaccgc gcctggccgt 120 gctgggccaa gttttctatt tttagtagag acagagtttc accatgttgg ccaggcttgt 180 ctcgaactct tgacctcaag tgatcctccc tccttggcct cccaaagtgc tgggattgca 240 ggtgtgagcc accatgccca gccagtatct atatatttca aatgagtaag ttaagggaat 300 gaggaattga ggcaggagct agagagcaat ggttcgtaat agtggatggc tctggctggg 360 tggagtatct tcatatgaat cccatgaaaa tgctgaatat tcccaagtac aacctacagg 420 tgacagacaa agcctggcct ttgtacacac gcgcaccact catcacaagg tcccctccta 480 caagccccat gacggtcacc t 501
【0125】 <210> 12 <211> 502 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 12 aggaacactg aatgaagttt attgaagaga aacacgtact gaaaacgttg aagagaaggg 60 aatcacaaca cagagagaaa ctgcaaacgg ccaccacagg acacaggtcc cacacaggtc 120 ccgggccccc tcctcctggg gttcctggca agacgcctca tctgctccta ctcctgctgc 180 agcccccgct gccaactccc tccttcctga gggccccggg gtctgcctct tgccaggaag 240 gtagactctg gcagtgtcca ctggctttag ggagccccct cccaagccca tctgctggga 300 cagggccctg ccctatggcc cgcacaggac agtcacagga cactggaaaa cacagcaggg 360 aacaccctac caggtcaagg aaactgagtc atgagtaaca acaggggtgg aacaccaaag 420 cacaaagctc ctcgggagcc tcaggcaggg cagccccgct ccgtcctggg tccagttctt 480 cctcccacag tcacggtcac ct 502
【0126】 <210> 13 <211> 393 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 13 caaacgtcgg gtaggaatgc tgatcatgat aggtttggtt ttctacagat tctgttccgg 60 tgcctttcct atccaggcac cacctgagaa agttgtcatt tgaggtcgca cttggaagtt 120 acatctgtga agtttctgtc attcgtccag atctgtgtgt gtagcatgtg ctgaggaagc 180 acgtgctggg ctgtgcctca gacagtgcat caccgggcac ccagaggctt gcctggctat 240 tcctgttctg gtgtgtgtgg agtgttgggg aggaacagat gcagatcaac ctgtggctgt 300 tttcccgtct aggttctcac aggtatctcc tgacagaggt acttaacaat ggctctgctg 360 gaaatttcta taaataaaat gtccaaaatg gcg 393
【0127】 <210> 14 <211> 381 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 14 gatcatggtc acaaacacgg gtaaattctg tggattaaag aaagatatct agagatctac 60 aaacacaaat ctaaagaatc cttgatttca ctggaaatca aagatgttga tgaaggtaat 120 catgagctat tgtttttcac tcataaaact ggaggtgaaa gacaaggatt aacgtttcta 180 gcgatggtaa aagtgtaaaa agtatttggc tgcgcggctg gtggtgaata atttttacaa 240 ccttctcaga aaacaatatg gaaacgtcca gcacaagcca gcagagaaag cctgtttgag 300 gcctctgctg tggataggga tgcctgcctg aacacagggg aatcatgtgc atccatgcta 360 gctgcagtca ttttggtaat c 381
【0128】 <210> 15 <211> 266 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 15 cggggggaag tgggaataat tccaaaggaa atttaaaaaa caaatacatg aaatacaaaa 60 ttgtgcagat agtacagtac agggacaaag atcccatagt gggagtcaga ttatctgcac 120 tcaaatctgg ttctgccact tactgacttt ggatgagctt cttaacctcc ctaggcctca 180 attttaagaa ttaagtgaaa caacccaaga aaaatttagc acagtactga gagacagagg 240 cacacacaca agcacagacc atgatc 266
【0129】 <210> 16 <211> 523 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 16 gatccatggt cctttcttag aagcattttt gaacactagg aaggacattg agatgccctg 60 taacctttca gacaactaca cataaaacat gctagatagt tgataactca gtttgttaag 120 cactgagtgt tctctctgct ccacacccag ttctctagac tctagggata cacagataaa 180 taagtatagc tcttgttctt gtatgttatc agtgtgttag gaaatatttg aaaggacatt 240 ttataaacct ctagtttagc atttagtacc caaatgtatt ctctttttct gcacctagta 300 gcaattgaaa atggttaatg cccattttct gagaaaggtc cttgatattc tcagaaaaat 360 tattgttgaa ttcttctttc tgggttaagt aataccagct cattaaacat ttcttcataa 420 aattcctagc tagatatggc aatttataga cctctctatt ccatgagaat gaacagacat 480 tgagacataa ttttatacat cagtatagaa taggagtcac ccg 523
【0130】 <210> 17 <211> 611 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 165, 486, 503, 504, 512, 584, 599, 609 <223> n is a or c or g or t. <400> 17 ttttggctcc gtgggacgtt gtaatgtgca cagacatttc caaggaaatt ctaaacagtc 60 acccttccct tttgcattcc cccaaatctt aagtgtatac ataaaaccct gtgtacatat 120 tgttgtggtg ataaaaggga attggttaaa cagtacactt gggtnatgga actttctgtg 180 gccacctacg aaagacaagt taacaaactg tcatggaggg ctgttgttgc ccagccaggg 240 ccgctgcatt ttgacaacat ttccaccctg gccactcagc acatttcatg gaggtcatgt 300 cttttcactg atactttttt gatagttttt atataacaaa atccttattc tatttataac 360 ttaagatgat aaggcactat aaattaatgg cctaaaataa tatatttgtc tgttatcttt 420 tgctatttct acttcacttt aatttttagc tgtaaaattg gtaaatggat tcttacgact 480 atctcncccc cccccccccc ccnnggtttt tnaaatttaa ttaaatggca gaatttcctt 540 tttttaggaa caatgtgtat tttcaattgc acctatttaa aaantaaact caaaatttng 600 catgcccgna a 611
【0131】 <210> 18 <211> 480 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 18 gttttcgcag cacagtctta tccagttcca ttattgggga tgcaaagatg agtaaggaat 60 gaaaacagga caaaacctcc gctcttgatg atcttcattt agccagagag aagtaagaaa 120 agagttaaca tcaatcatga ggtcctggaa ggaagataag ctctgaagtc aaatagacct 180 gggatccacc agtaatgatg gaaatttaga aggtaactta aacctctcag gttcagtttc 240 ctcatctata ggaagcgaat acaaatcatt acaaatacta gcaaactgaa tccagcagca 300 caccataaaa ttaattcacc atgatcaaat gggctttatt cctggggtgc aaatttggtt 360 caacatactc aaatcagtaa atgtgattca ccacataagc agcattaaaa acaaaacaga 420 catgatcatc tcaatagacg tagaataagc ttttgataaa atttaacatc atttcatgac 480
【0132】 <210> 19 <211> 333 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 19 cgagtaaaat agaaattctt taatatacag tgcagttttt ataaagatgc tctgtgtgtt 60 atgctgaacg cacaaacatc cttagaaaat agtaatgtaa aaattcaaaa gggtttcctt 120 attgcagata ttcttggaga tgttaattta tgcatctcct cgaagaggca cagccatcca 180 accatgttct cttttcttta caacagcttc aaacatttct cttctgagat gcatatttgg 240 gaaatgctgg aataaattat atccagtctt tcatatttgc atctatgcaa atctgctgaa 300 aagcttaagt ttattattta cagctgcgaa aac 333
【0133】 <210> 20 <211> 243 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 20 cgtaagagct ggaggtgttt gggaagtgcc tcagacacgc tgttctctag ccatggagta 60 ccatctccta cctacttccc gtcacattcc ctgtgcaaac cccatctgtt ctctaaacct 120 cgctcatgca gtctacccct cctcccagtt cccatgtcgt tgttttctct tccctacagc 180 cttaaccatt tggctcctga attgtaattc tctgcccctg tgtcttctct gtcctgcgaa 240 aac 243
【0134】 <210> 21 <211> 857 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 21 gggtgcagac agggttttac catgttgccc aggctggcct tgaactcctg agctcaaatg 60 agtgctagga ttatagggca tgagacactg tgtacagcca tcattacata atattacatc 120 agtcaattat gtaactaaaa ccaaaaagat tttaagatct cttttcaccc ccaggcaaac 180 caagaacact gataattgag tgaaggaggt catttttaag gaattaggct ccatagtgaa 240 ttcacaaata ttccaaaaga catcaccctc aggccaattt tccaaaagta ctatactatg 300 ctgcctttca aatagcgtaa tattaaaccg atgattccag tatgaatcct ctagaactag 360 aaccacatta gtctaaataa aaacaattta gacaaagtcc ttggttgtcc aacttgttcc 420 ctcaagtcgt tgggatcttt actttctttc tagtcctttt ctaattcagt tgagtaaaaa 480 tcagtttgaa aaattaacca gtcagttact aactataaag ttctgtaaat acttcctatc 540 atcattcact gttttaatca caccaacttg ggaaatcaac acttgtaaca gacacgctat 600 tccaaaaagc aagattcatt tgggctcctt gaaaagaact caaaatgaag agaaagcatt 660 ttcattaact cctaatttac acataagtta atcttttaca gtatattaat gctattttgc 720 atttttgagt agggatttgg ggatgtcgtc aaatagctcc aaactcaaag tgcacctcag 780 cagcagcaga ggcatgagcc tttacacaag tgagtcagag ggaatccatg ctcttgaatg 840 tctagaaccg acgtttg 857
【0135】 <210> 22 <211> 786 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 22 ggggtcagaa atatgtctta ttcacttttc aagacttttt tcctgtgttt ttaaaaaatg 60 aattgaacgg aattgattgg catcacctga atgctgacta ggacattgaa gatcccattt 120 cgtcactcat ctttgtgaga aagacactaa tacgataatg atataaccac cttcattttt 180 gtatgcttag cagatactag accatgcatt cagcaccatc attagtatta tctcatttat 240 gatttttaac aactggaggg tgtaggtact gttatcatcc ctacttaaca cagattgaaa 300 aacttccata agagcccaag ctggtaagct gtggagctga gctagatttc aaattcagat 360 ctgtctgact ccaagtcagt gttctgtcct ataatgttct acagtcactc tcaattagct 420 ggtgagacgt tagaagctac aggtaaaaat ggctagtccc caaagttcta ccaactcaat 480 aagtgcacat aattagtagg gaattagtta ggaataaaag gatgttcaca gcctgggaat 540 ttcaatatct aaaacttccc taggcacctg acctttcctg gctgtaggca ttactcccaa 600 gaccagtaat ccaggaaccc agataatcaa tcacccacag cacagcttcc ttgttgccat 660 caccatggct tttcagagca tctgtcacca tgctttgtca cacaaataga gagtgcagtc 720 ttcaactccg tgaaagttta tttctctgct ctttgctaaa aacagggctc tgtctactgc 780 gaaaac 786
【0136】 <210> 23 <211> 782 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 23 cgtagaaatg gggcctcact aggttgccca ggctggtctc caactcctgg acttaagtga 60 tcctcctgcc tcagcttcct aaaatgttgg gattacaggt gtgagttact atgcccagcc 120 tgaaaatata aagccacaga ttatccacag gctaattagt gaaaacagat tgtggtatat 180 tgtgggactt agtatagaac aaggcttgat tcataaacca gaggaaaatg agagactgat 240 tgttcaataa atgattgact atcaggtaaa tagaatcaga agtgtatgtt gacccctctt 300 tctataccaa aagtatacta atgatttcaa aagttaatgt aataaacaaa taaagcctaa 360 ggaaaataat aagtaaaatt acatgtttat ttatgttcag caattgtaag gaccttgtga 420 acaaataaaa gcaatggaag gcaaaaatta acaactttga cacagcattt ttttatctga 480 atatcataaa tcagaaacaa aattaaaaga caaactgtga ggaaaccgaa taacaaatat 540 ggcaaagaat taaaaccctg aagaagtcat gtagatcaaa gggtaacatt aaaataaaag 600 ctcaataggg aaattgacaa aggggaggaa cataatctat ctaaaaagaa atacagataa 660 ccagcaaaca aatatactca gcctcacaga gaaatgcaaa ttaggtgttt ttttcctatc 720 ctttatttaa agatttttaa aagtgactac tatacccagt ttggtaaggg ggctgcgaaa 780 ac 782
【0137】 <210> 24 <211> 539 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 24 cgtgacggag tctcgcactg ttgccctggc tggagtgcaa tggcgtggtc tcggctcact 60 gcaacctccg cctcccatgt tcacgccatt ctcctgcctc agccttctga gtagctggga 120 ctacgggcgc ccaccaccat gcctggctaa tttttggtgt ttttagtaga gatggggttt 180 caccatgtta gccaggatgg tcttgatctc ctgaccttgt gatccacccg cctcggcctc 240 ccaaagtgct gggattacag gtgtaagcta ccacgcccag ccacaaaaag cctgttttat 300 aataaggtgt tgtacatctc atgtcattta ttgaatactg tactatatta tgtcaaaact 360 gagacaggtt cacaccattg taaggtcaaa aagtcttaag ttgaaccacc caaagtcaag 420 gactgtctat atagcctatt gttcctgttt ctctgaagaa ccctaactag cacagcgtta 480 tccactagat tggatgaaag ataatgtgtc ttggacaaag gtggttgctt gcgaaaacc 539
【0138】 <210> 25 <211> 534 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 25 gttttcgcag taacatacca tgttagttca ttttacaaat gagaaaatgg gttatacagg 60 aagtacataa gttatgcaga gtcacttacg agtggtagta ccgtgtcaag ctctatggct 120 ctagcatctg tgcctaaact cctgtgttac atggcctatc aaataatgag gaaaggaaat 180 ttcaaaaatt gtttgctctt taactggttg gaaaaagaat cacaatgaat cacataaatt 240 ttttctattg gttgttagat atccttctga atctccgtga acaatctctg ccccaaaagt 300 agtgggcatt caattcagaa aagaaagata atttaaaaaa agataaaaca attaccctta 360 gttacacaat tcattgttaa catgttatag ttgttttaag gaacacattt atggctggac 420 atggtagcgc atgcctgtaa tcctggcagt ttgggagagg ctaaggtggg aggttcactt 480 gaggcagatg tttgtgacca gcctaggaaa tgtagtgaga gtgctatctt tacg 534
【0139】 <210> 26 <211> 322 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 26 gttttcgcag cagctgttct gtgtaggtga gagaatgtgt ctttacaggt gggatttctg 60 tttggatgtg tgggaaagga gaaggcatat tgataagcag acaaacagac atatctatgc 120 aaatacgcaa ctgcagaaat aggcgaggag agctagttta ttgcatgaaa tcaataccga 180 agacttggac atccagtcaa gaaaggagag gccaggcacg atggttcaca cttgtaatcc 240 cagcactttg ggaggctggg gcaggtggat tgcctgagct caggattcca agaccagaac 300 attgtaggac cctaactcta cg 322
【0140】 <210> 27 <211> 206 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 27 cgctatcaca ttcaggctat tcttaagcgt ttttctgcca tgatcacatt gtgatgaaga 60 acatgatggt cactagtagg taactttctg tgtcattgcc ttactctcag tgaggtgcta 120 gtggatttac ctacccctgc ttttgcatca ccactgtaaa tctaatagtg aaaaggcaaa 180 tgatgtctca gtatcactgc gaaaac 206
【0141】 <210> 28 <211> 479 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 28 cgaggtagag tcttactctg tcacccaaac tggtgtgtgg tggtaagatc acggctcact 60 gcagcttcaa tctcagcaga ctcaggtaat cctcccacct tagcctccca agtagctggg 120 tccagaggcc cacaccacca cacccaactg attggtattt taggtagaga caggatttca 180 ccatgttgcc caggctggtc ttgaactcct gggctcaagt gatccacctg ctttggcctc 240 ccaaagtgct aggattacac gcataagcca ctgtgcctgg ctgagatttt atctacttgt 300 aacctaacaa attagcatga cagtttcctg ggtgctagca ggaaacctga gattcctgat 360 aagagaaaaa ggacagttta tttctcccag taatgatggt agccagacta ccttcatttt 420 tgcatcagtt ccccagtacc aaaggcaagg tgaaatggga cacttgacac tgcgaaaac 479
【0142】 <210> 29 <211> 877 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 29 cgacactggc agctcttctc tttccctctg aatagagtcc caaaaatttg ccaaagttgc 60 taatctcgtt tccctcttaa agggagcacg ctacaattga acccttctct ccggcttttc 120 agtgttttcc tgatactttc acggacatcc ttaggcaaaa taatttttct ccctccaaat 180 tcagtcttga aaacatcaag gcagaacatg cagctcttgc catttttagc atccatggta 240 taataggcca aaggatttcc cagctcaagt caaagtgaaa tttaaaactg caacatcaaa 300 atcatcttga gttactcctg tgcaaaacaa acaaaaataa aagtattgta gccaatttta 360 acagcttagt aactattaga atatgtgttt ttcacagtct acctgtgcta gatgggatga 420 agggattata acgggggact ttagggaatc ctgcctctct attacataga aaatgcagta 480 tgaataaata ctattcctga cataaagacc ccttggaact aaccagggaa attcatcact 540 aaatatgtgt tcagcacctt ctctgctgca aaaggacaga aagagttaac ttccctccag 600 tgaaaaagaa tcaattttct tttcctccag ggatcaggcc cactttacaa taaactcttt 660 gtttaatgca ccacttacaa ggatggactc cacttaaagc cacaaactcc cgtaaggcat 720 gtatgggttt atctctgtcc tctatctgcc tgcacttcac tcacccatca tccagatcag 780 ttttgatctg ttacatcctc tcgtttgtca gcacttcaac ccaatttggg gggatccaat 840 tgtataattt caagatgtga cctagggctg cgaaaac 877
【0143】 <210> 30 <211> 876 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 375 <223> n is a or c or g or t. <400> 30 cgatgtaaaa atgtggagag ggagtacttg gagagggggt gtattttcgt tttgttttgt 60 tttgctttgt ttgtagagat gggggtctca tgttggccag gctggtctca aactcctggc 120 ctcaagcaat ccttccagct tggccttcca aagtgctggg attacaggcg tgagccacca 180 tgccaagcca agaattttaa aaaattagcc aggtgtgttg gtgcacacct gcagtcccag 240 ctcctggctt ggctgaggca ggagtgtcgc atgaacccag gagttcaagg ttacggtgag 300 ctatgatcgc atgtgtactc cagcctggga gcctgggtga cacagttaag accctgtctc 360 ttaaaaaaag aaaanaatta aataaatgct gatggaaaat ctaaatagat ctggacctat 420 cttccttagg cactcatcac atctctattt ttaatttctc caaaggatta tttatggtct 480 tatcttggcc tgaggatact aagtggaagt taacataatg ctgtttgagg aaaaataaaa 540 ataaacaggc acttacagga atctgttacc aacagtatct aaacaactga agccaagtgt 600 tttctggaat catatctaag atttgctgaa ttttctactg tgactgagga gctgcattct 660 tgtgaccaaa aaaagctatt aaaaaagaaa agaaaaccag acacgtacac acaaacttgg 720 gggcagactt gttggcaata tcgatgaaaa tgacctacaa aaagaacttg gactcacaca 780 aggaccatag gagagtggga agaaggaaac cacgcaccgc tctgaagcaa cataaattgc 840 aaaaggaaac aactggagat ttaacactgc gaaaac 876
【0144】 <210> 31 <211> 802 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 31 gttttcgcag cagtagagag ggacagcctg gggaacgctg gggccctgct gaatcccggg 60 ctctccaggc acgaacaggg gcatcccgcg tccacgccgc ggggaggagg gtttcaccgt 120 ctccagggac ttggctcgag gaaattaaac tctaatgagt agctcgagaa atgttccggg 180 atggtggatg agcgatcatc cttaaaagaa aatgctattc tgggagctcc aacctgcaat 240 taacctacag aaggaacctt ttgagaggct ggtgcagcgc ttcggggagg cagattaaga 300 acttagttgg cctggttgaa gctctgtgag gagcaaagca gccctctcca ggtgaactgc 360 ttgactttac cacctgaagg agtatttact gcaagaatta acaaagcagg tgttcctgat 420 ccaagcagaa ccctgttatt tgaagagcct gagaaatctt atcccgttta caaatgtcct 480 gggagtgcat ccaaagtgaa acttgggtgg atgaaccgca tcaaagactt ccagaagcca 540 ctccagtgac cataagataa atgtcagaat cgcataaccc ccaggatcag agatggagtc 600 tcgctctgtc acccagcctg gaatgtagtg gcatcattgt aactcactgc agcctgaaac 660 tccttggctt aagtgatcct cccacctcag cctcccaagt agctggaact ataggcacaa 720 gctaccatgc ctggctattc tttttcgtta atttttttta aactaaggaa tgaagaaaat 780 aaaacattac atgactggta cg 802
【0145】 <210> 32 <211> 783 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 663, 670, 679, 684, 688, 691, 692, 706, 714, 733, 734, 775, 777 <223> n is a or c or g or t. <400> 32 cgtagaaaca aggtcttact atgttgccca gggtggtctc caactcctgg gctcaagcaa 60 tcctcctgcc ttggcctctc aaagtgccgg gattacaggt gtgagacact gcacctggcc 120 ccttattttg taactcttat caccattata acaacaccga tggtatcttt ttaatgtcgt 180 cagtctgccc tactaaactg caagctgtgt ggaggcaaga accatgtctg ttcactgctg 240 tatttctagc accaagtgga gcgtctggag cacaggtgag agtaaccatt ataaacggtc 300 ctcaccattg tcccagccat ccagaataac cagctaactt cacagagtta agaggtaaac 360 actttcagat cagttgggtt cacagatgtg caatattgtc agatgaaaag taaattcaac 420 atcttcctgg tttccaaagg cagaatcaag aaaaacctga aaaacaactg cggaccctct 480 gaatttaaac tgacagctaa cttcagattc aaaatttggg aatcacgcct ataaaaccaa 540 gcaaactagt agattgactc tggtatgaaa caccatcatg ggtaacagcc ctgcctccca 600 tctactcaat ctggacaaaa agagggaaac aggcaaatgt gtgtgtcttc tgcttgccct 660 tanttttcan ccttccacnt ttantggnac nnccgaaaac cctggngtga aatngtaacc 720 cggtccaatt ggnngaccct caaggcatgc aagcttggca ctggccgtcg taatngncat 780 caa 783
【0146】 <210> 33 <211> 272 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 33 cgtaaatgcc tgatttgtaa ctgttgatgt ctacttttaa tgaaacaaac aacatgttta 60 atgacaatta cacttccaaa gtgaggagaa acggcaggca gctgccacct aaaaatcagc 120 cctgattctt ttctcaggtc tcaggctggc tttcctctct gataactgca atgctggtct 180 ttggagggga caaaaggaga gcccacaggg tgggaaaccg tctccccata ttgctgtgga 240 gtatgtgtgt ctttaatttc ctggacttga tc 272
【0147】 <210> 34 <211> 684 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 663, 678 <223> n is a or c or g or t. <400> 34 acaagggttt tcgcagatga gaagatgaga aaggtcacta gcacgtgtgg cctgccacac 60 agcaggcacc cagtgagggt ggactcaact tccatgaagc ataagaggca tccgtctgtc 120 ccaggccttt gggtgggcac ttgggccttt tggaagtgcc tgatgggttt agggaatttg 180 tcttctctgg aaatcagctg acggctcatg aatttgtgat attttaaagt ctctggctgg 240 gcattttggc tcatgcctgt aatcccagtg ctttgggagg tggaggaggg aggattgctt 300 gaacccagga gttcaagacc agcctgggca acagtgagat cgcgtctcta caaaaatttt 360 tttaaaaaat tagctgggca tcagccaggc gcggtgtctc acgcctgtaa tcccagcact 420 ttgggaggcc gaggcaggcg gatcacgagg tcaggagatc gagaccatcc tggctagcac 480 ggtgaaaaca tgtctctact aaaaatacaa aaattagctg ggcatggtgg tgggcacctg 540 tagtcccagc tgctcgggag gctgaggcgg gagaatggtg tgaacccggg aggcagagct 600 ggcagtgagc cgagatcgcg ccactgcact ccagcctggg cgacagagcg agactccatt 660 cgnaaaaagg atcaccgngt accg 684
【0148】 <210> 35 <211> 536 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 35 gttttcgcag ctactaggta aaactgatct taaggttata gcaggtcatt tcagcagctg 60 gcttgccaga taatccctgg gcaggtgctt gtgccctaag tgcttttctt ttccttttct 120 tcctccctca tctcatgact gtaatttaat tgggtatgac aagataattc caatttatat 180 aatcaatttt cacaatatcc aatgcatcca aaattaattt ttctttatat ttttatgggt 240 tacttgagtt ccatgtactt gttataatgt attgaagttt ataattaatc tttcgaatgt 300 aaacttagga taattagaat gttgaagata tgatgactat attatagaaa tactcattgg 360 gctatgcagt taatatgctt cagacgtggt atgtaaatgt tgatggaaac aatatttcat 420 gtcggttcag attcagtgtt ttattttttg aaacattgca gtggaatttt tatgtttaat 480 tctgttagct ggtaacagaa cttctggggc aattttgttt cagtttgttg taactc 536
【0149】 <210> 36 <211> 619 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 36 ggtagggaat ggtgtcttac tgttgcccag catggtcacg aattcctggc ttcaagtgat 60 cctcctacct cagcctccac cctgcctggg gtctccctga gggctgggac tgagatctgt 120 tgtgtgtact gccatattcc caaaacctaa acgatgcctt gcatggaaca ggggatcagt 180 ggtgatttgt tgaaggaaag actcctgtct gtccccactg tcctggcctc cagacccccc 240 tacctgtgag gggtacagga ccctctgggg aggggccgct ccaacagctg gcttcgttgg 300 taacagtggc tgtaggggtc ttgtcaggtt ctgggtcttc tgagagtaga gggtctccag 360 ccagcatctc aagggtcctg ggggataaag gtgtgtcagg atgccacctt acacccagtc 420 tgtcctgcca aggggtgctg gggaccttag ggttgtttgt ggcaaacatc acctctgtgg 480 catctcttgt gtctgggagg tctgaagaat ggtgttttgg gggaatcagg tgagtttttt 540 ttaaatagga cttgaaaaag catctgaagg gccccagata actttgaggt tcatagagtg 600 ggattatagg gatcgcaac 619
【0150】 <210> 37 <211> 788 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 37 cgatatcagt catgtgggga ttctcagtca ttctttagat caggctagat ttaggacaca 60 acattcagtg atagctcttg acctgagctg ctgatgacca ctgccctggt ctcgcaagag 120 gatcaatctt acatgtggat gacagtgcac aatatgatgg gtaaaccaag gtatcatgaa 180 aaatatgggg ctcttcttcc aaaccaggtt gttcatgctg atgacatcaa catacccaaa 240 tcatgatttg ctggttacaa ataaagcatt gcaaaaacca cactggcctg gaatagcagg 300 gatcatcaca aaactaagaa aagttctggt tattcttcca caaactcagc gcaacattcg 360 attggtaggg cacggtgggg gaccaggaag agatagagat ttagccaaga tatgccccaa 420 agccactgct tttctggact caaaccaggg gattagggaa acaacattcc ccagcttcta 480 tgcaaagagc caaagggaac acagacttaa atatcatgac atgaaagtta cttcacttga 540 tgaaattaca aaatcattgg taattgctga gaatctctca cctctagggt tttacaatgc 600 aaaaccccac cactagagtt aatgcgctat agtcaatctc tcttctatga gggagggttg 660 tcggggagtg ggatatggta ttgcctggga atccctaaag aagacagaga ggcacaaaat 720 gatggagaag ggcaccagag aaacaatctc ctcaaactac aattacttta ttctttggcc 780 gacgtttg 788
【0151】 <210> 38 <211> 481 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 38 gggctcactc atggttagct attttcttat gctcactatt ttcttatgct caattcacaa 60 acttgctttt tatctggttc agatggcaga tagacatgcg tggagaataa ataacatgtc 120 atggaaagag cccttgagtt ggaataagaa aaccttgatt aaaatccaag ctcttaataa 180 cattattaat gacatgaggg gtatgtgttc tttaacctcg ctctctgagt ctgtttccta 240 agatgcaata attacattag ctaatgcatt taaaaaggtg atcactatgt acaagttata 300 tattatgatt agtttgaaag aatggggtat atcttatctc taactttaat cctaagcttc 360 agaaatagaa ttgttcatca gacaagaaca taagggggca actgggacac acaataggtt 420 cacattggcc tcagtgagct acgaatatag aggtaggcaa acagcagaga cggatcgcaa 480 c 481
【0152】 <210> 39 <211> 192 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 39 gttgttgtta caagaagcat gaggacttag attttcattt tataaatttt ttaatcattg 60 gcattaagta gacctgcgaa aatgagaacg aatatatatt aagtaaaatt aagttcaaaa 120 gttagtagta aacaccatgt gacagaagct gggccagtat atatgtaaat ttcacgtgtt 180 taggatcgca ac 192
【0153】 <210> 40 <211> 821 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 40 cggacaaaga tgatttattt tcatacctaa agcactttat aatattctct ggaaaatcta 60 aaatcattct gttatcctaa catttttata ctatcatcat tttagaaaat aaaaggcctg 120 cgttatatac tagaaaaatt tcttcattat atgcaaaata tttatctcct ctagtaaagg 180 agattaaaga acaactgcaa gaggaaggaa ggtcctgaaa gtgtttcatt tggtatctac 240 ctaccccaac cccaagacat aaagacagat aaaggcacta agatgctagt atgtggctag 300 tcctttcaat aacccagtca gtccatacag ataacccatg ggatatattc aagccactct 360 ttgagccatc gatggtcatt atttggttag ttcacccaag gtaaggccat accagctgtt 420 aaaatgatgt agagattaat caacagggct gccacttgcg aatcccctcc aaggatgctg 480 tgcaaagggt ctcattggtc ctgatgagta atcttgtgac tgtacatatt cctgggtgca 540 tgtccacaaa tactgaggta tagcctgcat gccactaaaa ataacaaagg tttcagggct 600 ggagacattg tcaaccacac tgtcatgacc atctatagct ccaggactca gtggtggggg 660 aacaatattt aacggatgtc cctggcagaa gaagcctgtg agtacttcag cctcaaacac 720 atagatcagc ttatctgcag cagagatttt cttggccttc tctgccaggt ttttgaggtt 780 cttggtgaag tatatgccag ctccgtattt tggatcgcaa c 821
【0154】 <210> 41 <211> 669 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 41 gttgcgatcc cctttgacag ttttgtaatg aaggcaggaa gtgaatttga gcaaggcccc 60 cacgtagcca tgtgacccga gcaaggcagc acccgccttg gagccccttt cccgcctgcg 120 agggagacct ggcgtctgcc ccgctgctcg cagagtcacg ttgccggcgg catcaaaggg 180 cgaggaaagg atgaggaagc gctttgtggt ctgaggcagc ccctctgtca tgtggtgctc 240 cctattcctc ctcctcgtct tcctcgtctt ccccctcctc ctcgcgcccg gcaggcaccc 300 tcgctactca ggagttctgt ccatcctcgt tttgtgtggc tgactcagtt ctcgagcccc 360 cttcctccca tgcagaaagg ggacagtgtg gcaacccgcc cccaacctct attcttggtg 420 aatttaaaat gggggttccc agagtgggtg ctggcacccc aggggacacc acacagacca 480 ccaggctgca ggagggagac acaggccgtg ctgtctgtgt tatggagtgc accctttaaa 540 agttccgagg tggtctagcc agggggcggt ggctcacgcc tgtaatccca gcactttggg 600 aggccgaggc gagttcagga gatcgagact attctggctt ggctagcgtg gtgaaacccc 660 gtctctacg 669
【0155】 <210> 42 <211> 398 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 42 gatctgactg ctgttgggat gagagactga aatagaagag tcaaagttga cctggaagtt 60 ataaccctgt ttaaccagga gagttaacat tgacattgat agaagtaagg gtgaacttag 120 atggggagcc cattcataat tgatttttgt tttttcactt gcatgcatag tagtcaaaca 180 atatagaaaa gtattcagtg aaagtctctc tctcgatcta tctctcatct atgcccagtc 240 ccctccttgg agaggatcac tgttaccagt gtctgctaca tccttcctga gaggctgtaa 300 gctaggggtc ggccaactgt gacccatggg ccacatccag cccactacct aattttgcgt 360 gacccttaag ctaagaatgg ggtttatatt tggtgccc 398
【0156】 <210> 43 <211> 424 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 2 <223> n is a or c or g or t. <400> 43 cnaatagacc ttgtgcattc tactgctgcc cacgctgctc caactcagtg cccactggaa 60 cctaaatgaa atcccacatc ctaaccacgt gcaactggcc tttgccatct ctctcacccc 120 aacttcttcc aatccccatt ttattcatta tctccagcca tgctggactt tcttctaccc 180 ctttcttcta tgttgaattt atctctctca ggcctttgca ttgttcttct ttctgcgtgg 240 aatgttttga agatcctggc taaaagcagt acctctcgca caaatcattc tgccatgtta 300 ctcgagttta tctttgtcac agccctatga gagcttattt gtgtttactg tctatttatc 360 cccattagaa tataagttcc aaggggttat cttactgact gctgtacccc cgtgcctgta 420 tcga 424
【0157】 <210> 44 <211> 788 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 44 gttctaggtt aatctgagca atctcttcac ttttgtctgt gatgtatttt agcagtgaat 60 tactcctcct ggctaagagc ttcacatctt cagtgttaat tgtggttctt ttcgcatgtc 120 ttgcaaacat ttcaaggtct ttggcaaaat tttcacactg tcggaaagtc agctccgaaa 180 tggccgcaat ggtctgtttg ctgaacttgc atctctttgt ccaatgcaac tttcctcgca 240 aagacaaccc acagtatagt gaactgctgc ctttagcctc gtgttcttgc aacttttctg 300 aaggtttgaa cttctcaaaa gacaaggggc agggtagaca gctgctgcag tgtaactttg 360 tagagaggaa actcccgcgt ctggagctca ttcccgcgtt tcttcagtcc gtcctcttta 420 aggtcgccac tccgggtctt gcttttaagc ctcttcacgg caacgttctc agcctctgac 480 gccccatatg cccggcgctg atgaaaggaa cgaatgggat gcccgcagct accctgacaa 540 gtgattattc ttatgacgat tttgcagaga agaaaattgc gtctgggccc gagtcgatac 600 gatcacaagt tgggcggggc agagattcga acccacatct aaggacgagc tctgggcctg 660 actggtccgc accgcgtccc tgcatcagta acgaggggtc gacgcctcca gggccagcgt 720 tccagagctt cggcccgaac cgcccaccgc gtacgggcgt cacctggaat gtctaatgcc 780 gacgtttg 788
【0158】 <210> 45 <211> 831 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 45 tttttttttt ccccaggaga ggggagacag gaaatctgta tctgctactt ttcataagtc 60 accagcaaat atttttaact ccttttttct ctcaatcttc aaatccaatc aatttccaag 120 acctttagat tccacttttg cagtttctct tcatcacatc accttctttc caatccctct 180 acaattatca agatttcctt tcttcttcag taaccccacc caccaataac ttcttctcat 240 gccaggtctc tcccttactc aatctatcct ataattagca ccaagttatt aggttacaat 300 tccctcatgt gtaacatgga gatagaaatt actgtacagt actgatttga ggattaaaca 360 tgattatatt aaccatctaa catagttctt aacatatagt aggaactcaa taaatgtcac 420 ttctcttttt cttactctct gtgaaatcaa aacagtgacc tggcattcag gggcctctgc 480 aatctaccca gttccctagc tctgtccatc aaatattccc ctagctgtat ggtgcacgtt 540 ccaaccaaac tcatactgtg tgcagtattc tttgacttgg cctggcattt ttatgcagac 600 agatcactgc tcatgctttc catccttaca ttttgagtga cctttccttc catcttccgc 660 ctaagtctta ctgaccctca aaggtttatt atctcaatag ctgctgcctc agaaggcctt 720 tcttaagtgc ttcatacaag tgagaccttc ccctctctct caatcccctg aaaccaatgg 780 actacgctga cagagccttt tggtcagtct ataaatatgt gcctgtatcg a 831
【0159】 <210> 46 <211> 866 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 859 <223> n is a or c or g or t. <400> 46 tcgatacagg gcaaactgag ttgatctgca tgagagagtt aacaggcatt tgggggctgg 60 aagctgacag accagagacc gggaaagtct cggaaaaggt tagcagcaga gtgagaggtc 120 aagaagagag cacaagtcag atcctggtta ggaagctccc atagtggcaa atgaccaagg 180 cgtttctagg acagtaatgc ctcatgtcca gccttaaatt gctacctagg ttatgctgtg 240 gtgtcgcctt ttgttaccat caaacctcca ataaaactgc ataacacggc cgggtgcggt 300 ggctcacgcc tgtaatccca gcactttggg aggctgagga gggcagatca cttcaggtca 360 ggagttcaag accagcctgg ccagcatggc gaaaccctgt ctctactaaa aatgcaaaat 420 tagctgggtg tggtggcaca tgcctgtagt cccagctact caggaggctg aggcgggaga 480 attgcttaaa gccaggaagc agaggtggca gtaggccgag atcgcgccac tacattccag 540 cctggacaac agagcaagac tccatctcaa aacaaaagca aaggctgggt gcagtggctc 600 acgcctgtaa tctcataact ttgggtggct gaagcaggcg gatcacatga ggtcaggagt 660 tcgaaaccag cttggccatc atggtgaaac cccttctcta ctaaaaatac aaaaaattag 720 ctgggcatgg tggtgcacgc ctgtagtccc agctacttga gagactgagg caagagaatt 780 gcttgaacct gggagtcaga ggttgcggtg agccgaggtt gtgccattgc actccagcct 840 gggcaacaag agcgagatnc catccg 866
【0160】 <210> 47 <211> 495 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 47 cgaaattcag gcgatttatt gtaaacagga taaccctagc actccaccat actggctgtg 60 tcacatgctc cctctttcac atcaactggt caaaaaagaa gactttctta agaagcctca 120 ggtaactaat aacttagttc cacaaatctc atttactaag cactgcgtaa actgcagtat 180 ctggggtagt ctgttattgc tcatggactg cagcttggac ccatctaaat gaatccatta 240 gtatgcctga gtgatcaaca gcagctctag atccaacctg gaaattggaa aatgctgacg 300 cataccaaac aattgcaggt tcatggaaga ctacatgaga ttgctctcag atctcttcat 360 gtgtcattct cataaaaaag acacttaaat ttcacccatt ttttaaaaaa gagctaaaag 420 ttactcaata gcacataatt ttccacataa aaggtaggtg gatttttatt tactagtaca 480 gtggtggatc gcaac 495
【0161】 <210> 48 <211> 360 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 48 cgggacgtgc agtgacccca cttggcagca gacactcatt tctgatattt ttgtatgcca 60 agtcttgggt aaaacaacta agtgatctct taaggaccca ggttcctttt ttgtccctgt 120 tccttgcccc tcaccaccac tttttccatg tgccaccctc tcataagaac tcagaagccc 180 agggtggagt caaaggggtc ttttaaatcc cctagtggca tatgaaattc tggatgtttg 240 tgaattttcc tggggaaagg gtctatgtgt gccattagat tctggaaggg gtgtgtgacc 300 tcaaaaaaag gttaagaccc actggaccga gtcctcttta aatggaagtg catggatcag 360
【0162】 <210> 49 <211> 468 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 49 ctgatccatg tgatagaaac tagggcagct tatcaatttc atgtggcgta agttagcagt 60 gggtgggctg gagctgaagg atccagtatg gccttgcttt gatgtctggt gcctcaactt 120 ggatgcttca gtcatctggg ggctggcttg agaaggctgg tcctcattca tgactgtaac 180 acttgatagg aggagttgtt ggtagccagc tttgtagcca aactaccaga gctcttaaac 240 aaatcgtaca tcagggagaa agcttaaatc ttgattttaa atgactgttt tgggcattac 300 tttcagaata attattagaa gtgccttgat taaacttaga taactaacgt taaaatatac 360 gaaatcagat agtaaagtgt ttcttgggaa atggttgaag taaccagttt tgatattatg 420 tttgataggt gcaaaaatta gtatttcgcc aggggcggtg gctcacgg 468
【0163】 <210> 50 <211> 404 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 50 cggcagagct ctgttacaga tatgaaaaca aaatgtgaca caatgaagaa gctgcataaa 60 aatactgaaa cctaaggtat ctgtagtata taggatgtac cctggcttac catagaaaag 120 tctttagata gtaaatagca ctaagtctaa aagcaaggag ataagatttc atgttggata 180 ctgtttcaag aactgtattt ggaatattaa aggaaatcct tatgttagta agtttaaaaa 240 accaaacatc atatacaaaa taaaatttta gtatgataaa acctagcttt tcttattttt 300 taaaaggaca tcaaactata taattgctca agagcaaagt ttagtgtttt ggtgagctgt 360 atttcacgtt acttgtagca attatatttg gtgacatgga tcag 404
【0164】 <210> 51 <211> 731 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 51 ctgatccatg accgggtaaa aaatgtcttg aaatcacatc aggctcatca aagacattta 60 tatgatgaga gagacctaga gaaagatgat gaactggaac tgaaaagaag tcttttatgt 120 agagactctg cctatgacag tgaccccgag tatagcactg ttcacaggag caaagtcttg 180 gaaccaaccc aaatgcccat caacgataga ctggatacag aaatgtggaa tgcaccatat 240 gtcctcatct gaaagtctct gcaggatggt ctgactcacg cgagtggttt tgagataagt 300 tgtgttatac ctcaagttag gtaaagtcga gagatgaact aacttaaaaa gtagtgatgt 360 ttacatagaa tctaaattgg aaaagacaat aatatcagca ttagaaagtt tgcctttaag 420 taaaaaaaat tattagccat aataggtttt acattcttcg taatagaata tcctaaagca 480 ataaaacctc cactatgtga actctaagtt ctgaatatcc gaatttttca aatagttctg 540 agttatattt aatttgttct ttactgacta gaacacttcc taatttatca catcattttt 600 aacctcctca aacatactga atatattttt tccaggttta ttgaggtata attgacaaac 660 aaaaattgtg tatgtaaggt gtacaatgtg atgttttgat atgtgaatac atttgatgat 720 tctggcttcc g 731
【0165】 <210> 52 <211> 676 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 52 cgtccagggt tctttatttt tgtctgctgc caatgtcgtc tcgcatgcct gcaccctcgc 60 atgcacgctg cccgcatgcc acgtgccacg ctgtagccac agaccccttg ctcgggcctc 120 acccaaggcc aaactccaaa cacaatcaga accagccaaa gaagcacttc ctgggcacgg 180 ccaccagctc tcccgcctcc agtgtgggcc ggctcctgca gggtccgagg gctgcatctc 240 taccagccag cccagggctc ttcccagggt ctcgcattca agggcaatta cattttaaaa 300 agaaaaacag aaaaaggtta atcacaaaac caaccctcac ttcacagggt ctgtaagtca 360 ctcatagaac tttgctcttc ccgagacagg gtcccttccc cagctcaggc acaacagagt 420 ctggcaggct ctggcaccct gggcctcctc cgggagcctc ccatttgggc agtggagcca 480 taaacgggga tccgagaaga gagtatccac ttttttttta caggaagaag ggactcacag 540 cataaacggg ggtggggggg atcctgattt tgaaaataat ctatttgtag cttctcttct 600 atcaaaacca acacatcctc ttctttctgc caatcctctc ccccacggga cacctctctg 660 gttcgggacc aatcca 676
【0166】 <210> 53 <211> 280 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 53 cgaatgtagg ttgttttatt gtaaatgtca tcaaaatcca gaacagcaga aacatattaa 60 tcagtttgaa attttagaaa tcctttagca cttgaaaaag agtattacaa atgcatctat 120 atcacataga aagtcagcga atacaaacta gacaagcagg acatagttct tttctggcat 180 tccaggataa taagaatatt tatcaattaa aaggtcaata tctgtcttcc tgaaataact 240 ccaaacctga gtcaacacac attcttttcg gattggttcc 280
【0167】 <210> 54 <211> 282 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 54 ggctagtcaa gtgaagcaac aggaatgtag aagaacaaat aaatctgtaa gtagctgtga 60 tcaattagtt gtaaacagca ccgcacttgg accagcctgt ggtcaccctt aacatctatc 120 caaaagctga tgaaagcagc agcctgaagg catcacgtgg tacaagagga gcaggtaggc 180 ctgaaagagc accccacccc aacttcccct ttctttctta ttctctacta tttctcacat 240 ttctttctac tgcctcactg gttcttacac aggattggtt cc 282
【0168】 <210> 55 <211> 317 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 55 ggaaccaatc ccagtgtcca gcaagagggg taaagttaag taaattatgg aagattcaca 60 tggtaaaaca gcatgaagcc attaaaagta ctatttctga agagttcata acatgaaaac 120 atggttatgt gaaaaatggg gcacaacagt ttatatactg tatgaagata aatataaaat 180 atgcggccgg gtgcggtggc tcacgcctgt aatcccagca ctttgggagg ccgaggcggg 240 cggatcacga ggtcaggagg tcgagaccat cctggctaac acggtgaaac cccgtctcta 300 ctaaaaatac aaaaaaa 317
【0169】 <210> 56 <211> 453 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 56 cgagacaggg tctcactctg ttgcccaggc tagagtgcag tggcactatc atggctcact 60 gcaaccttga cttctcaggc taaggtgacc ctcctacctc aacctcttga gtagctggga 120 ctataggtgc acaccactat gcccagctaa tttttgtatc ttttgtagag acagagtttc 180 accacgttgc tcaggctggt ctcgaactcc tgggctcaag tgatccacac acttggtctc 240 ccaaagtgct agaatttcag gtgtgagcca ccacacctgg ccaataccta cttttctttc 300 atgtctccaa ggaggtatca tttccttatg gaaatctttc ctaaccactc aagactcggt 360 taagtgcctc tcctatgtgc ccctgcagca ccattaatga atttccccta tcacagtatg 420 gttatccctc agtatttgtt ggggattggt tcc 453
【0170】 <210> 57 <211> 491 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 57 ggaacccaat ccaaatgtcc gtcaatgata gactggatta agaaaatgtg gcacatatac 60 accatggaat actatgcagc cataaaaaag gatgagttca tgtcctttgt agggacatgg 120 atgaagctgg aaagcatcat tctaagcaaa ctctcgagga cagaaaacca aacactgctt 180 gttctcactc ataggtggga gttgaacaat gagaacactt ggacacaggg tggggaacat 240 cacacagtgg ggcctgtcgt cgggtcgggg gctaggtgag ggatagcatt aggagaaata 300 cctaatgtaa atgacgagtt aatgggtgca acaaaccaac atggcacatg tatacctatg 360 taacaaacct gcacgttgtg cacatgtacc ctagaactta aggtataaaa aaaaacaaca 420 aaacttgggt ctcagtactt agaaaatagt taaccatgat caataaaata tttgccaatt 480 ccttcaactc g 491
【0171】 <210> 58 <211> 255 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 58 atggcccaca aatattcctt ttgaaaatga acccaaatat aaacttaata tgcacagagc 60 aggcacagac atccgcgaaa tgtcactctc gaggatgaac atatacatac tatacacaaa 120 gcaatcaatc atgacgacag agattcaacc aaatctaagt taactgtcga agaaaggtaa 180 agatggtttt attagcttca ttaaactagt aactgcaact agagttatcc tcagtattct 240 aaggggaatg ggttc 255
【0172】 <210> 59 <211> 403 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 59 aatgttcatt actttaaaag cttacattta ggaaactcaa gctttgcttt tctataatgg 60 ttaacttttc catattatca taagaatcaa ctttctgatt aatatttctc ccttttttct 120 taagaagtca atagttcttc atatccacag tcatgagtca tttttgagga catgccagaa 180 ttaccaatgt aactgtgagg caggaaaagt acactcccag ggaagtcaga gtaagcctgt 240 ttccaccgca gcacagcagt gagcacagct aggcagaatt ccagcagagt gcaaatcagc 300 atcagagaga gagttcccag ggcagacaga gcactcagaa tgcttccaac caggctgcta 360 tgcaccaaaa gcttggttaa ccttttctct gtggcgattg atc 403
【0173】 <210> 60 <211> 523 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 60 cgtagagatg gggtttcact tgttggccag gctggtctca aactcctgag ctcaagcgat 60 ccgcccgcct cggcctccca cagtactggg attacaggtg tgagccactg tgcccagcct 120 aaaggtttta attacagaaa atctcaatct tctgcattta aaagatcagt ttgactgttc 180 tgtaaaaagt aagaaaagga cagagaaata ctttaggaag ctattgtagc agtccagaat 240 gagataataa tttgaactac agttcttgat atactttggg tatctgtccc cacccaagtc 300 tcatgttgaa ttagaatctc tagtgctgaa ggtggggcct ggtgggaggt gcctgcatct 360 ggattatggg ggcagatccc tcatggcttg gtgcagtctt cacgatagtg agttcttgtg 420 agatctggtc atttgatagt atgtggcaca ttccccgccc cgccttactc ctgctttcac 480 catgtgatgt gcttgctccc cctttgcctt ccactatgac cga 523
【0174】 <210> 61 <211> 465 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 61 cgaggaaaga tggggtttca ccatgttggc caggatggtc tcgatctctt gaccttgtga 60 tccacccacc tcggcccccc aaagtgctgg gattacaggc gtgagccacc gcgcctggtg 120 taagtctgta tttgtattct aaatgaaatc ttaggacact gaattaaatt tagtaaaagg 180 ctttgaggag ggtaccaatg gggatccaga actcgctaat gctctttaca aagctgacat 240 caggaaagta ggcatacaca ctaggtgtta actatgtaat aatgtaaaat tatttgaaat 300 ggattaatga cactaaattt gaagcaaacc aatatagttt aatgggtttt tttatatttt 360 cataaatatt ttaaaggttt tattgatcat gtttcatgtt gcttctttga cttgtgagta 420 gcatggagag taaagtttgt ggagtaatca agtggctatg accga 465
【0175】 <210> 62 <211> 417 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 62 cgttcaaagt agctaacatt gcctttggtc ttttaataaa tgattctgaa ttgttgagga 60 attctggttt ttttcttctt gttgttgttt tgtttttttt agatagggtc tcaccctgtc 120 acccaggctg gagtacaatg gcacgatccc agcttactgc aacctccgcc tcccaggttc 180 aagcgatcct cccacctcag tctctcgatt gcaggtgtga gccactgtgc cttgctggaa 240 tgctactctt aatataaaac aaatactatg tttactaacc acattcattc ttgggttcac 300 tgtatccttt ttgtcccact agagtctacc ttctgattct ccccttccaa gcaaagagaa 360 tcttgatcct ttactgtcag tcttgattcg agtgaatgag tactggccta tgaccga 417
【0176】 <210> 63 <211> 403 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 63 tcggtcatag gctctctgca gggggaagca catcacacgc tgttggctca ttctggcagt 60 ccaacctggc attgtcttta cacaatcctg catgcaactt tgtattcaca ataatcagga 120 gcatttcatc ttttattccg tagcaatagt ttcagggggt ctgcctacaa tgattattgt 180 aaaaattcaa ataaaacaaa atttttatct tagaaactga aagttcccct gtcatctgaa 240 ccttaaagac aactattgtt aatatattat tatttcaaaa attgtgggcc agcagtggct 300 cacgcctgtg atcccagcac tttgggaagc tgaggtgggc ggatcacttg aggtcgggag 360 ttcgagacca gcctggccaa catggtgaaa ccccgtctct acg 403
【0177】 <210> 64 <211> 400 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 64 cgtcaatagc atttctttcc atttatggta caaacattgt cattaaatac atttataact 60 ctttccataa aggtcctata tttcctggtt cacattactg taaggtctca tattttcatt 120 gtttttgtga aaggtatctc tattttttaa gttgtatctt ttaatttttt tatgatggaa 180 aatttcaaac atacacaaaa gtagagagaa cagtacaatg acccctaggt accatcagca 240 gattcacagc ttatcaattt agagccagtc tcttctattt agggttgcca gataaaatac 300 atgttcttgt ttctgggccc cctactcctt tctctaagtt tatctgtcta cctttgttgt 360 gctagttcaa ctctgtctca atcagtaccc ctatgaccga 400
【0178】 <210> 65 <211> 390 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 65 tcggtcatag caaagaaaga tgagggatag taggacagag gtatattttg tacatagaca 60 atcaaaacaa agataaaagt catgagtatg attacaggcg tggtggctca cgcctgtaat 120 cccagcactt tgggaggccg aggcaggtga atcacctgag gtcaggagtt cgagaccagc 180 ctgactaaca tggtgaaacc ccgtttctac taaaaataca aaaaattagc cagatgtggt 240 ggcgcacgcc tgtcattcca gctacttggg aggctgaggc aggagaattg cttgaatccg 300 ggaagcggag gttgcagtaa gccaagatcg caccattgca ctccagcttg ggcaacaaga 360 gcgaaactcc gtctctaaaa aagaaaaccg 390
【0179】 <210> 66 <211> 307 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 66 tcggtcatag tcacatatgg aattttgaga aaataaagca tgctgtcttt aggaattttt 60 atacttcttt gtctttcttc cttaatattt gcttctagct gctcttggca atgatgaatt 120 gttatgtatg cattaatgtt ttgcagccca aaagttgttc acatttttcc tatataagat 180 ctgtggagtg tgtgtttcaa agagagaact acagaaatgt taaagcagga aaacctgaat 240 gtgatgtgca cattttcatc ccacatggac aatgtatgtg ttttaataaa tggaattttc 300 agattcg 307
【0180】 <210> 67 <211> 678 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 651, 674 <223> n is a or c or g or t. <400> 67 tcggtcatag agtgaagaag ttaatgggta aataatctga cactgataac cagtatgaaa 60 ataatagtgt taacagtact ttaaaaatgg cagtggaagc aacccaagtg tccatggatg 120 gatgaatgga ttaacaaaat gtggtatgta catatagtag aatattattt agccttaagg 180 aaggagtctg acataatgct acagtatgaa tgaccttgaa gatactattc taagtgaaat 240 aagccagtca caaaagtata aatactatat gatttcattt atatgaggta cctatctata 300 gaagtcaaat tcagagagaa gtaaagtaga atggtagttg ctaggggttg aaggagaagg 360 ggtaggaaat ttgtatttga agagaacaaa gtttcatttg aggaagatga aaaaattctg 420 gggatggatg gtggtagttg cacaacagtg tgaaaatatt taatacccta gaactgtcac 480 ttaaaatggg taaaatggta aattttatgc tatgtatatt catggccagt aaaagtaata 540 gcaaaaactg cagttacttt tacaccaacc ctaataagca caataaaaag aatttaaaag 600 ggcctggtgt ggttgctcac acctatagtc ccagcacttt gggaggctta ngtgggagga 660 ttgcttgagc ccangaat 678
【0181】 <210> 68 <211> 873 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 68 cgtagagaca gggtcccact atgtcaccca agctggtctc caactcctgg gctcaagcaa 60 ttatctcgtc tcagcctccc aaagtgctga gattacagat gtgagtcacc atgcccagcc 120 ctataacaaa agtttagaga tattagtgat cttctaaatc ctatgataaa cgcccttgaa 180 caaatcaata aaataccaaa tatgaactgt tggcagtttt aaattgcatt ttcaaaatgc 240 agaaactgtt acgttttaag aaggaaatgt tctgcaacct ccttttatca cttgactttt 300 tatatttggc agacagtccc agtaggcaaa gtctggcttc cagaacacag actgttggca 360 tttggatctc ttttatcaaa ggagggcaat ggatgtccat tacaatttag attggaattt 420 cctacaggat tctttgcaac tccttcctgc ttcccagcta gctttgaggg agagcttagc 480 tagaaagtga aatttttgga tggaattctt atctacaagc aagataaaag agtaattagg 540 tagtcctttc atattttagt ggggacatag aaaatgacaa gtcatcttgt aaatcaaaaa 600 caaaaataaa tatgcacagg ataatggaac ttgaatctac ctgacaatat gaaggcacct 660 tgtttgtata aattttgaga taacttaatc cagtaccatg tgctgataaa tcttggataa 720 agagactctt gggaggcaat aggctccgta tttcttaatg ctacatgaca tctattagaa 780 gcttttggtc ttgggaaatt gtggccaatt ttattttcta cagatggcca cacagtatct 840 ccaatcccat agattcttat gcactatgac cga 873
【0182】 <210> 69 <211> 620 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 69 tcgggtcata ggcatgtttc agtacttgat agcaggagat tacctggaag aagtcagaga 60 gccatcttga atgactgtgg agttagctgg ttttattata ctcttgggtg acatttccag 120 ctaataaaat tagaattaaa attataatct tagaagcaag cctctgggaa atatgtaatt 180 aaccttttgg aatttaacaa gcattgtgtg tacctccagt acctatattt aagatgcttt 240 aacctagcat ttgaattgat gccaagatgt gcaagacata gtctctgccc tcaaaggcta 300 ttaagagaca gactatatgt acacagattt ttttaaatta tttaggttta attcataaaa 360 accctagaag aaaacctagg caataccatt caggccattg gcatgggcaa ggacttcatg 420 actaaaacgc caaaagcaat ggcaacaaaa gccaaaatag acaaatggga tctaattaaa 480 ctaaagaggt tctgcacggc agaagaaact accatcagag tgaacaggca acctacggaa 540 tgggaggaaa tttttgcaat ctgctcatct gacaaaggac taatatccag aatccacaaa 600 gaacttaaag aaatttaccg 620
【0183】 <210> 70 <211> 545 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 70 aggagtgcta gggctttatt acaaatggag ttgactgcta gagaggccct tctccaatct 60 ttcttctgta ccttcttccc tcccaaagac atccctctag gggaggtcag taggccatta 120 ggtaggagga aatctggaga gtgaaaaggg gccttgcttt tgtcaaagtc ctctgaaaca 180 accactgagt ctgaaggctg gctccagttg agaatcttct agtggaagag gtttagctct 240 catcttcaag gtccttcatt tctacatcct ggggggcttt tgtcttcttt tgccttttga 300 gctgtggttc actagtcctg gctggctttg aaggggcttc cacttccatg gctgtcttct 360 ctttctgggc aagccggatc tgctggagga gttttctgcg cttcttccct gacagtgtaa 420 tgttggcacg tgcactggac gcccgcttct tgaggtggtg ccgcgtgatc agcccttggt 480 ctatcacagc cccgaccacc cggtgcctca gacgccgctc ccgactcaac acccgccgac 540 gtttg 545
【0184】 <210> 71 <211> 575 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 71 cggtctaaat gatcagttta ttgaatttta gtaatgtaag ttgagatcat gaaacataca 60 atctaattca aaagaagaat cataggtacc aattcaacac cattagcact actttcacaa 120 tagtgacacc ccacttataa cactcttttt tgggtctctg actgtgaaca agattgtgga 180 aggttggttg aggttaggcc taggcattac ggttaagaaa taacagatgc taattagtta 240 gtggggaagt gaagctcatg tttaggcctt ttcataatgt ctttatgcta aataaattaa 300 atgaagtaaa cagccatggc tattgaacta cagaatacat aaaaatacat tctgtgattc 360 acctataaac aaaagagtaa agcagaatgt gtcaaatttt ccatagcagg taaagcatag 420 aaaaaaaatc tagctgatat agttgttatg tttcaacaac ataaaatgaa atgtttctag 480 gatagaagaa attggtacca ttaacatttg gatggttatg gtaccataac attttgatat 540 aatatgcaaa atgccgcctc cccaactatg accga 575
【0185】 <210> 72 <211> 546 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 72 tcggtcatag cactggaaag aaagaagcag ccttaattct cctaacattg ccgtttagat 60 tagttggaga caaattcatt ttccattaag tcttttattc attccacaaa tatttcatga 120 gcatcaaatg ttatgtccaa agcaccatat taagtgtgga gtgtaggcaa agtaaataaa 180 taaataatac cgaaatgata ccaaaaacaa accccccacc accaacaaaa accaaagcag 240 aacaaaccca tttataatag catcaaaaag aatacttagg aataaactta accaaggagg 300 tggaaaactt gtacaaaaag tataaaacat tgctaaaaga aatcaaaggt accaataaat 360 ggaaagatac cctatgtaca tagattggaa aatttaatac tgttaaaatg tcaatactac 420 ccaaaacaat ctataaatct atgtaatctt gatcaaaatc tcagtggcaa ttttgcagaa 480 atagaaaaag ctattctaaa gttcatgtgg aatctcaagg aaccctgaat agtccaaaca 540 atctcg 546
【0186】 <210> 73 <211> 516 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 73 cgcagagatg gggtttcacc atgttggcca ggctggtctc gaactcctga cctctagcta 60 ggttttaatt actaactggc ataactacca tgagcctctc ccacgtttct agcacttaaa 120 aactccagat ttttccctta gaaaactact cagaaaaaaa gtttagctaa ttagttttcc 180 cttgcttgtg aagtaacaaa tgcagtcttt atattttttg tagttctggt ggtcttcgtt 240 ctattccctg ccaatgctag gacctggggg tggagcaggg gtaagggaga agcacccccg 300 acagctggaa gtacctggct gccaccggcg aggctgtggt gtcccctggt gaacacaaac 360 aagttcacag ggttaagatc agatgaggac tcaccatgac tgcgctggaa caggatgaaa 420 gccaatcagc ggccatgcct gaacagaggt cttctttttt aaaagggctc tatatgacca 480 caaaaatgaa caaatgtccc tctcccctat gaccga 516
【0187】 <210> 74 <211> 452 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 74 cgacttgaac aattggttta tttctaaaaa gggtgacatt tataagttgg gctagataag 60 taacaacata gaaaaattat ttcctccgtt aacaagagct aaaacatgtc aaacatatca 120 catacaattc ttctattata tagctatcca gttggaagtt ttttttaaca cttatgtaca 180 gggcactgat ctaaccattt atgtgaatca atttacttaa tcattaataa taacatgagg 240 aatatgtttc aataatgcag aataccagaa aattatagtt ttagcataaa aaaatttttt 300 tttttgagac ggagtctcgc tctgtctccc aggctgaagt gcagtggcgt gatctcggct 360 cactgcaagc tccgcctccc gggttttatg ccattctcct gcctcagctt cccaagtagc 420 tgggactaca gacatgcacc acctatgacc ga 452
【0188】 <210> 75 <211> 419 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 75 tcggtcatag caccccaaaa tgtttttggt tatatgggtt tatatctata gatactagtt 60 tagaaattaa agctgagaat ttaaaaaata cattggagtt tttgggattg ctttttaatg 120 aattaaataa gccaataagt attaacataa ataacatctt ctgaaaaatg actttttcaa 180 aacaaaataa tgagtggcat tgttttacat ttttgcacat cacttcgtgt ctgttaatag 240 gagatagtgg gttttcatgt ctcctttgaa ttcagtgtgt tgcggagttt attcagagat 300 cctttagctg ggcatggtgg agtgtgtctg tagtcccaaa tactcaggaa gctaatgctg 360 gatcgcttga gcccaggagt tcaagagcag cctgggtgac ataatgagac cccatctcg 419
【0189】 <210> 76 <211> 390 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 76 cgtagagatg atgttggcca ggctggtctc aaactcctgg gctcaagcca tctgaccgcc 60 tcagcctccc aaagtgctgg gattacaggt gtaagccacc acgcccagca caagtggact 120 tatttttaac agattcccaa tgcctccagg ataaaatccc aaattctaag cctgtgactc 180 cagatatcac acgagctgat ccttctgcct ccttccctta caattgaatt tattattttt 240 gcactaagag tccttcatga atagcttcca ctttcccttc atgtctgctc aagctgattc 300 accttccctt tcctttcctt tttctctaca tttatctaac ttcctttctt ccttctgggc 360 accgttcaaa ctggatctgc ctatgaccga 390
【0190】 <210> 77 <211> 321 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 77 cgcttattgt tttgtttgtt ttctgtagag atggggtctc accacattgc ccaggctgga 60 ggcttcattt ctaatctttc tatcccctct tcattggctt tgagataccc ctgctgcttc 120 gggctcctga gggccttcag ggccccacat taatgaggca gccacctagc aagtctgaca 180 tggctgtcag tgacccactg ttccagtctc tctccatgtt gcattccacc caacgggaag 240 cagaagacac cgtccggcag ttggaggtgc tctccacata aagcgacttc ccctggtgct 300 tcccagccac cctatgaccg a 321
【0191】 <210> 78 <211> 319 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 78 cgtagaggca gggttttgcc atgttggcca ggttggtctc gaactcctga cctcaggtga 60 tccacccacc tcagcctccc aaaatgttgg gattataagc gtgagccacc acgcccggcc 120 ttatttggta attattttcc ttacggatgc attacttact gccttttata ctttgtttca 180 gcttttttaa aaagttaaag taattactgt atctcaattt caaaaggggg gcaggggtgg 240 ttgtgaaagg aaggtatgta tggctttgac atttggtttt ataaacttac atattgtttg 300 gattctttac tatgaccga 319
【0192】 <210> 79 <211> 772 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 79 cgcaagagtg aaagacacct atttaatggc aaaatagtga tggaaagcag cagaagtaaa 60 accctcattt ttcctataac agacaaatcg cttgaaaatc cagtttaata aaatcccatg 120 atccctctga acaccagctt cctgatcctc atctctaccg atggcttcat tcatattcct 180 tttccatctc atttcctgtt tttttcgttt ctcctatttc tccaaattgt gtttttccca 240 gctcttctgg ctctcttctg cccacttctg aaagtttctt tagttcttct ggttcctgtc 300 tgctgaattc tcctgagagt ctttgctcta attctcccga aggcctccta taaatttctc 360 ttgactctct tctgccagct tctagtagct tcctgcctgt ttctcctgat cttgtgccta 420 attctcctga caggcccttg gcaactgctc ccaaatcgct tctggctttt cctgcttcca 480 cactctgctt tccgcttgct gggctctgca aagcttcccc aaaagcctca tcgtcctcat 540 ctgtctcttt ctcatcctca ctatggtccc actgcttcac caccttctcg ggctcatctc 600 tcactctcct catgtccttc tctcttgtta ttattctatc ttcatacagt gaagcttctc 660 cctcgctttt ttctttgaga ttctccacgt agttggtttt cctcagttct ctgatgatac 720 ccttgttggc atcgtccaag gcactgatga tggcctgctg cgcctcgttg ta 772
【0193】 <210> 80 <211> 474 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 80 acaccacgcc cagccatctc ctctagaatt cttttcatgt cttttgaatc tcctctctct 60 ctcttccata ttcttgcctt tttttttgtt tttatctctt tatcatctcc tctgagtttt 120 gaaacaattc aaacttgtct gttaattcac caatttggca ttttgcagag tttaaattgg 180 ctgttactgc attcactgtg ttttaaaatc tggaactatg ttttgcactt ctaagctatc 240 tttcctgaac acaaatggtt cccttttaga actgctgaca aattaccatg atacaacatc 300 ttaccaaaac tttaagcaaa aattacaaat taaaaatgtt ctaagttttg cttgcctgtt 360 tcttgcagca gctttaacaa ggagacttta ttctgatttt tcagattggt cccttgtctt 420 tataacagct ggctgttcat aaatgtttgg tgaatcttct gtttcctcgt tgta 474
【0194】 <210> 81 <211> 277 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 81 gtagagatgg ggttttgcca tattggctgg gctgggttgg ccaggctggt ctcgaactcc 60 tgacctcaag tgatccgccc accttggccg cccaaagtgc tgggattata ggcgtgagct 120 actgcgcgca gcctggttca tttatacttg acataaatcc aaaagaaggc cacccctgca 180 cgatctccaa gagcctctgt ggaaagctct agtttaaccc taggaaggag aacagctcac 240 ctctggcatg atctcgatct tctcgtaccg acgtttg 277
【0195】 <210> 82 <211> 305 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 82 ggtgatgcag atttcaacag taactctgga aaactgtgaa aaatgttatt taaaaatata 60 tatgtatatg ctactgcaca gtttcaaaga tgtgattcat aaataatgtt ggctgcactg 120 attaatttta taacaattac tgcacttcca agttgatgcg aacacgcagt gactcatact 180 caatattagg cactagtaat atccttcagg cgtactacag ttttatgtta gctgtattgt 240 acatatatat ttttaaatgt atgcatttat acaaactgtg tatattatgt atggggtgtc 300 agatc 305
【0196】 <210> 83 <211> 457 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 83 gatctgacac tggaaggcaa cccactcgca tgtggatgct gaagggcact ttattttgta 60 tcctgaaaag ggcctacaga ggccagtaca aaactctcaa acaaaaggaa gttgactctg 120 ctttgagggg aaggtggcat gccagcacta gcttaaaaag ggaagtgcta gccgggcgtg 180 gtggctcacg cctgcaatcc cagcactttg ggaggccgag gcgggtggat cacgaggtca 240 ggagtttgag accagcctgg ccaacatggt gaaaccccgt atctactaaa aatacgaaaa 300 aaaaattagc cgggtgtggt ggcgggagcc tgtaatccca gctattcagg aggccaaggc 360 aggagaatcg cttgaacctg ggaaggcaga ggttgcagtg agccaagatc gcaccactgc 420 actccagcct gggcaacaag agcgagactc catctcg 457
【0197】 <210> 84 <211> 222 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 84 cgcctctttt acccatcagt ttccacagct accatgctgt cttttagaat catactaatg 60 tcgccaagtc tggcaaaacc atggatatat tctcacacgc agatgtgatg tcaaatctgt 120 ctatcctctg cccccaaact ctccacataa tgaacacttt tcctctgcaa acatgtattt 180 tggtttgtgg aggaactcaa gtcattaatg aggtgtcaga tc 222
【0198】 <210> 85 <211> 217 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 85 gatctgacac taattctatg gctggagcac atcccttaac ctctccgaga ctccattttc 60 tttattataa aattagaatt tggaccagtt ggcctctaaa tgtcttccat ctttgactct 120 ttgtcttttc tgtgcacata aacatcagat ctaatccttg ttagtggcat tattttgaaa 180 acatgggaca gaaacatagg aacaatattc tttatct 217
【0199】 <210> 86 <211> 740 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 86 cgtaaacaat agaaatttat tggccgagca tctcagcctc ccaaagtgct aggattacag 60 gcgtgagcca ccgtacccgg ctggatttac agactttatc tttatttttt caattataaa 120 attattcacc cacttagaac agaaagcaat atggaaaaag gaggaaagaa aggtcttctg 180 tacttggatg gggccaggtt ggggcaagga actggcactg tggagcttag tgcttgctta 240 caggaccagc aggctatgag gcaactgaca tgccccaggg aaagtcatct tgagttgctt 300 cttgatagtg agtgggatac gggtccaagc tgcaaacttc ttaagtcatt ctctaaaaca 360 tccacacttc aggactgcta ttgggtgcta tgttccagta gattgggtga ctcagacctc 420 agcatcacac aatatatcca tgtaacgacc ctgcgcacgt acccctggaa tctttatcct 480 gtcaagccgt cgctttatgg ctcgactgtt tttatctagc tcctctaaca tcttataggg 540 gttgaaggaa agcggtttct cgtggtccac aaagttttcc cagcagtcag caaactctga 600 gagggaagag ggaaaccagc caggccccag gggcagcagc tgcagtgcca ggagctcttg 660 cttcctttcc cctctcttct cttcctctcc ctggacattg ctctgtccgg ggaattctcc 720 ctcccgggtg gtgtcagatc 740
【0200】 <210> 87 <211> 327 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 87 agggtaagat aggtatttgg accacatctg agatagttga cctgggctct atggaacccc 60 ccatcctgcc accagtctca tcgtccatgg atggatttca aggagttggc aaactaaacc 120 tgtaccacct gtggaacaca tgcacttttc taagcaggag gttcagagac aatatcagaa 180 ttttaaagaa gtctgtgata aaaaattatt gacaacaaac aaatgaataa aattagaata 240 tactgcctaa taaataccta ggatcaagta tttttaggat taaatgtggt tatgtaacaa 300 gaaaagctcc ttgcccagtg tcagatc 327
【0201】 <210> 88 <211> 503 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 88 gatctgacac tggagctaac actcataaaa agtgagacag tactttcagt ctgaacctaa 60 gtggattaat ttcctggtaa aacaaacaaa caaacaaaca tttttcagat gatttttaac 120 aggattcaga gtctcacaac atattaaaaa atccaggata caattcaaat ttactcaata 180 tcaaaacaac ctggaaaatc taaacagtac tcaaaggaaa agacaattca ataggcagta 240 acactgaaat gacttagatc gtgaaattat tagacaaata aagtaggtat gaccattctc 300 cactcttgaa attagaaagt tcttgaaatt aggaaagata gaagttctca gcagagaact 360 agaaactgca gaataatcag atagaaattt tagacctgaa aagatgatat gggcccagta 420 gcggaataaa tataacagag aaaagagtca gtgaacctga aggtagatca atagaaagta 480 tacacaatga aatatacatt acg 503
【0202】 <210> 89 <211> 714 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 89 gatctgacac caaaatcact gcctattaaa gaaaaaaatc atagtttgga ctttaccaaa 60 attgaaaata tttgctcttc aaaagtcacc attaagaaaa ataaaaatac aggcacacat 120 gagagatact gcaggtttgg ttttagaaag ccacaataaa gtgaacatgt cagtaaagca 180 agtcacatga atttctggtt tcccagtgct tataaaagtt acgtttacat gacatgtgtg 240 caacagtgtt atgtctaaaa actatgtgtc tgaattaaaa gtgctttact gctaaaagct 300 gcttacacag acgcttgaag tgagcacaca ctgcggggaa aatggcgccg acatacttgc 360 ttgaccaggg tcaccacaaa ccctcaattt gtgaaaaaac acagtatctg tgaagtgcag 420 taaagcaaag cacaataaag ccaggtgttc attcctgtgc aagccacagg caaacaaaat 480 attttcaagt cttagactga tgtccggaat acacaaagac acaaagagct ttcaaagtgc 540 aattgtaaaa aaacaacaaa caaacaaaaa cataaacaaa cagaaaaccc agtttttcaa 600 atgggcaaga gggctggaca caatgggaag cacctataat ctcagtgctt tgggaggcca 660 agcaagagga ttgcttgagg ccaggagttc aagaccagcc tgagcatctc tacg 714
【0203】 <210> 90 <211> 499 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 90 cggagaagga gtttcgctct tattgcacag gctggactgc aatggcgtgt tatcagctca 60 ccgcaacctc tgccactcgg gtccaagaga ttctcctgcc tcagcctccc aagtagctgg 120 gattataggc atgtgccacc atgcccagct aatttttttt ttttttttgt atttttagta 180 gagggagttt cttcatgttc atcaggctgg tctcaaactc ccgacctcag gtgatccact 240 cgcctcagcc taccaaagtg tggggattac aggagtgagc caccgtgcct ggtctgacaa 300 attcattttc tgtttggttt ggtctgctct gtttccaaca agagcctact tcattatctc 360 cccaatatat ctacctagtc catagactgg ctcagagcag gcctttgaca atatttaatt 420 ttatcccaca atggcatttc aattcctttg tcattctgag aaaaatacta acagcatggg 480 aatttggtgc atggatcag 499
【0204】 <210> 91 <211> 499 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 91 cgtgagcaat aaagcttttt aatcacctgg gtgcaggcag actgagtcca aaaaaggagt 60 cagcaaaggg agatggggtg gggcagtttt ataggatttg ggttggtagt gggaaattac 120 ggccaaagtg ggttattctc tagcgggcag gggcgggggt cacaaggtgc tctggtgggg 180 agctcctgag tctaattgtc caggagaagg aatgtcacaa ggctaattga tcagttaagg 240 tggggcagga acaaatcaca gtggtggaat gtcatcagtt aaggcaggaa ttggttattt 300 tcacttcttt tgtggttctt cagttgcttc aggccatctg gatgtatacg tgcaggcttg 360 ggctcagaga cctgacagct ccctaatttg cttctaaata ttctaaggga gaaggaagag 420 ctgtgagaat tgtctttgag aggaatcatt ctctctggag taaatgagac aaatcttctg 480 tgttgtggtc atggatcaa 499
【0205】 <210> 92 <211> 485 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 92 cggagtgctt tcttcttatt gagttttgag agatctttta ctattctgga ttcaggccct 60 ttatcagatt tgtgatttga aaataacatt tcccagactg tcacttggcc tttcattctc 120 ctaagagtat ctcttgaaga acagaagttc ctaattttga tgaagtctaa attataattt 180 ttaaaaatgt ggattgctct ttgcctaaac caaggtcaca gtttctccta tgttttcttc 240 tagggcttct atagttttag gttttatatt cagatatatg atccactttg agttaatttt 300 tacatatggt gtgagatatg gttcaaagtt tatattctga atatatgaat attggattgt 360 tacagaacca tttgttgcaa aggctgtcct tttctcactg cattatcttt gcatgtttgt 420 ggaaaaccat ggaactgtct ttgcatgtga gtagaaaatt aattggctgc ctatgcatgg 480 atcag 485
【0206】 <210> 93 <211> 600 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 93 cgtagagacg gggtttcacc gtgttagcca agatggtctc gatctcctga cctcgtgatc 60 cgcccgtcgt ggcctcccaa agtgctggga ttacaggcgt gagccaccgc gcccggccgg 120 cttacattct tttaaagtca gaagaaaaaa atgaactttt aggtcagaga aaatattttg 180 ttatataata ttgatacgtc atgtttatat caatgcagtt gtaaaatatg ttaaatattt 240 atacatatat ttaacttaca tgtgtgtgaa atatatgtgt gtgtgtaatg tacaagccac 300 aaggcaaaag tgctcagggt ccaagaaagt caaaacgtgc ccctgcaccc gaaaagcacg 360 aaaccttctg gggcagtgat tatggcagag caagttggaa gatggcaggt ggtagacaaa 420 ttgtgaaaaa tatcacattt ctctcaccct gtcaaaggca accccaaagt gaagtcaaaa 480 tagagatgaa atgcagggtc acttcctagc tgcgtgatct tggacaagag agttgaccaa 540 cctgagcctc agtttctcca tggatacaat gggggatgcg ttgcctttcc gaacgtttgc 600
【0207】 <210> 94 <211> 306 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 94 ggtcagctgg agaaagttat gtttttctaa gaatttgtcc acatcatata aatttcaaac 60 gtattgccct atagttattc attagttttt cacttaacat ttgaatgtct acaagaaaag 120 tgatatgttt ccggtttcct gccaaagatt tcaaggttgg cttttacttc tctgagtata 180 gtaagcatgg ttgctttata gtatacgccc ggtaattcca atatttgaag aatctgcgaa 240 gtccatttct tttatttcta gtcacttaca ttcatggaat ctcatatctt catgtgcatg 300 gatcag 306
【0208】 <210> 95 <211> 295 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 95 cgtagagaca gggtttcacc atgtcggcca ggctggtccc gaactcctga cctcaggtaa 60 tcccccacct cggcctccca aagtgctggg attacaggcg tgagccatcg cgcccagtcc 120 tatttcaatt ctttttagtg tgtcaataag tgaaatgagt tttttttaat atgtagaggt 180 tatttcagac tatataatat tttcttttgt ctcttttacc ctactggggc cagaggaagt 240 tcattatcta gaattacagt taagaaagaa gtccagcgat aactgcatgg atcag 295
【0209】 <210> 96 <211> 295 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 96 cgatttcaag gcaaggcacg taatgtggac attatatctt cgtgcaaatt aggattactg 60 gaaagagtat ttttaattaa aattttaaga gacatagagg caaaatgtgt ctgcccatgc 120 acactatgga tctgtcaata caagaaattt gttgaacaag gctaatgtct gaaagcacca 180 tgcaagtttt cagcaccctg attacatttg ttttctcaag agtgcgtttt tatatcctac 240 accctggcgt tcccagtttg taaactgtaa gctttaccct tgtgacatgg atcag 295
【0210】 <210> 97 <211> 254 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 97 acaatggctt ttgtacattt tctcctctcg ataaacctca gaatggtatc catcatacct 60 tctggcagat gaccgtgtct cctttttaga gtaaatggaa gttgccagac agaaacttcc 120 ttgatttcct tccataaaaa tgagaaattt acccacatgg atgccctttt tggggggtct 180 ctcctgctat tgcattgaaa gaagtggccc tcttctttat ccaaggtcaa tccctccacc 240 tgtgcatgga tcag 254
【0211】 <210> 98 <211> 553 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 98 ctttcgtatg ttacaaatat tttcctactc tgccctttaa ttttgtggtg cttaataaag 60 tggaccacat ataaacaaag tttcagtaca ttaaaatttt cctttgtgat ttttacctct 120 tgatgtatga tcactttttt tataatttta tagatttctt ttgagtcatg ctcatatgta 180 agtagcttca agctaattta gaaaattaaa ctatatacag ttaatcatct gccaggaaca 240 aatgtcacag aattctggct tctgttttcc ctaactaaaa tttactggca gaatgtcaac 300 aaaactaaaa tgagagaaga aacacatgcc ccttagcaag tgacatccag tattgctatt 360 caaatgaact ggggtaattc cactagcctg aatgaatttg aagtcagtag tttatacctt 420 ttaactttaa ttcctcacat tgccacactt ctgaatatct tgggcaaagg actttcctgt 480 tcatcattgc aatgttcaat ttgacactgt gagataggaa aggcaggtat catctccctt 540 tgcatggatc aac 553
【0212】 <210> 99 <211> 473 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 5 <223> n is a or c or g or t. <400> 99 ggtanagatg gggtttcacc atcttagcca ggatggtctc gatctcctga cctcgtgatc 60 cgcctgcctc tgcctcccaa agtgctggga ttacaggtgt gagccaccac gcccagctaa 120 attattcttt tataaagata aaggatgctg gattccatga tttgcaaaat cacttctagt 180 tctaaaactg taactcaatg aatatctgca atctgaagga tacttgtatt agtgtaagta 240 cctatttcag cagcaaaaga gcaggacatt caaagatttt aatgcccaaa gccactgaaa 300 tatacttgga ccagatctat ttacaggaca ggggctgggt cacacaacta gcatctttaa 360 gccacagact cttagatgta aaatggtcct ttacttttat gggttaccta agtgaacatc 420 cctgtcccaa ttttatgaag tcatccttcc ctagctccat atggaccaat cca 473
【0213】 <210> 100 <211> 386 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 100 cgtagagatg gggcttctcc atgttggcca ggctggtctt gaactcctga ccttaggtga 60 tccacctgcc tcagcctccc aaactgctgg gattacaggc attgagccac agcgcctggc 120 ctacagttga ctttttcaat ttttggatgg gactcagatt atttctgcaa gagtagtgca 180 gttttgctac tgctttatta agaactacat ctctgtaaac acaagcatat ttaaaaatca 240 taatattgtt ttccttaaga aagaaaaact tttaataaga ctgatcagca agaatcacaa 300 catcaaatag gactgattaa tattctctac cagtagttcc taaacctggg tagcttttta 360 aacatataca ctactggacc aatcca 386
【0214】 <210> 101 <211> 610 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 101 cgaattttaa atttttatta aaaatcacag tttttaaaaa tgtccagtga cacaatgtag 60 ctcttctgaa atgaatggaa aacacaacac actgctaacc agtggaggga gctctctgca 120 gggctgggag acctgacaat gcagctgtag cctctgcaag tgaaaatcca ggccgacttg 180 cagtcattgg actgatgtcc aagtgcaatc accatacagc agctacaggc agggctggct 240 gatagggagt atgggagaag gacacgctca gatgaaaaca tgcatgcaac gattttcacc 300 actgaacaca ctgttttctg tgatagaaac tgtcggccct gctgggggac aagatattca 360 cggcctcact agccagtgtg atgccaccag ggcagcctgc ccctgatgct cctttgttac 420 ctgctaaaga aggaccataa ggtaaaaggc accttacctt atggagtgag cccagacccc 480 agggaaaagc ttgggtagaa caatccaagg ggcagcctgg atgtgagaat ccagcccaag 540 ctagctgctc tagaagcctg gaggcctttc ccagcttccc aaatgtagcc cttttcacat 600 gaccaatcca
【0215】 <210> 102 <211> 479 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 102 caaacgtcgg ggctacatga gtatctgtgt tgaatgcggt ctgaaatgat cctatggatt 60 ttcccggctg gttgccacta ctgtacaaca ttcagtgccc acatccatct gtgccattaa 120 gcttttttga gacatgagag atgcctcttc cctgctgtat gacatgcatt tgagaagttg 180 gaaagaaatg acaaaatcag ggagaaaaca tccaagcttc ttacctgtag atagaatcag 240 ccctcacttg gtgcttatta ccagttattc aagaacaata acaacaacaa aattagtaga 300 catccaagaa gcacatatta ggaccaaaga tagcatcaac tgtatttgaa ggaactgtag 360 tttgcgcatt ttatgacatt tttataaagt actgtaattc tttcattgag gggctatgtg 420 atggagacag actaactcat tttgttattt gcattaaaat tattttgggt ctctgttcg 479
【0216】 <210> 103 <211> 279 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 103 tggattggtc cagtgggaag tggagagcaa caagagagaa tggaactccc agccgcaatg 60 aagatttgca gagtgaaagc tgccttcaac gtatcatgaa gccggcgcac catgaggaac 120 actttcaaaa gtcagtaata aatatctcaa atgcacatat tttattgcac ctttaaaatg 180 catacaaaag tgcatttgat tcgttttaaa tacaattatc ttaactcttt tttaacgcca 240 ggattaagcc aattctactc cataaggctt ttgataccg 279
【0217】 <210> 104 <211> 254 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 104 cgctcatcag ccattattag tgttagtgta ttttatgtgt ggcccaagac aattcttctt 60 ccactgtggc ccagagaagc caaaaaagtt ggacactgta gcatgagtgt tttgcacact 120 tagaaacatg catcacctgc acccttttgt ccagacaatt tctggacaat tcgtacaaat 180 gatgtgactt acaacgaacc cccgattttc ttccggggtt ctgtagcctc ctgtgtgcct 240 atgggaccaa tcca 254
【0218】 <210> 105 <211> 465 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 105 cgtttgcatg tattccttct cttttagata attcttcttc ataaaagata cttttctttt 60 ccaaatcagt ctttagtttg gttatctctt gctgatgttc tatgctgcat actcctggtg 120 agtaactaat ttgtttttgc ttcagtccct ccaattcatt ttccagttgc ttagaatagt 180 gctcactctg ttcacgtagc ttcctgtctt tagatgcttc agcagctaga gcttctgtat 240 gaacttccag ctcttttttg gctctttctg ttctgcgcag ttcttgcctt aagctttcaa 300 ctttttgcat caccaggtcc acctcttctt ccttatctcg gacatggcga gcaagtttct 360 gtttttgggt gtgcaattct gttagccgct cattgatctc catgaattcc tgcatggcca 420 gtttcctctg acagtgtgcg tctttcagct ctttggattg gttcc 465
【0219】 <210> 106 <211> 212 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 106 cgctgcagac cacactcttg atctaacact ttaatattac ctcagaggaa tgtcacaagt 60 agactagact ttaaagagac atttgatgaa gtgtctcatt atgttcttgt gaatgaaaga 120 gacacatgag ctgggtaata ctacagtatg tggatttata ttttttctat ctactatacc 180 aaaagaataa taattgactg atgattggtt cc 212
【0220】 <210> 107 <211> 509 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 107 gggaaccaat cccccacaga taccaaggaa caactgcatt gtttttaaag ctaaaaatgt 60 tttcagagtg agttccattt tgcctaccag ataatcaaga tctaatataa agctttagta 120 attgagaaaa tgtggtttgg tgtaacagaa cagaataatg aaaacagacc tacaatacat 180 gacaaagctg actttgtagg ccagttagaa gaaaacagag gagactatca ctatgaccat 240 gaggtaggga agaattttgc atataagaca caaaggatgt agttcttaag gataatcatt 300 aattaatatg actgcactaa aattaagaag ctcttaaagc tcttaaaggt aaaacccaaa 360 tgtccattga aaatataggt cgggcatggt ggctcacgcc tgtaatccca gcactttggg 420 aggccaaggc gggaggatca cgaggtcagg agatcgagac catcctggct aacacgatga 480 aaccccatct ctactaaaaa tacaaaaac 509
【0221】 <210> 108 <211> 427 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 108 ctgcttgatg accggtgaaa catttacttc tcccaccatg ggcgagacct tggatgtgtc 60 ctttacctct ctctttgtca cttctgtcct gaactgccca tgagtgacca ggggcttccg 120 acagaagtgt ctcacaatcc aaccacacag cagaaaggca ttttcctttg gatttgagct 180 ttgtccctgc actgactttt tgtgtcatct cctcttcatt caatgtgaga tactcacctt 240 gattcataga atgttttctc attccaggtt tgtatttttt taatcaccaa aagaagcact 300 tatcataaaa gactgtgatg atgtataact gtgtatttag tttgaaaatc ttcaccttat 360 agaagcaata aacaatattt aggtgtatta tcctgtgaaa tttttataaa tataagactt 420 tattacg 427
【0222】 <210> 109 <211> 326 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 109 cgtacaggat aatgggttgg ctgggtatat atttaataat tctatatgca ggctcaaggc 60 attttccctt aaccctctga agacattatt ccataggctt ctgttgtttc tgcctctttg 120 tgctcttctc ttcctcttca gagttctgca attgcaatgt taggtcttct ttttatttaa 180 cctgcttggt actcactgtg tttcctgaat ttgaggtttc atgttcttca acaattcaag 240 aaaaaatccc agccattacc cctcaaatat tatctttccc caattctatc tcttctctca 300 ttttgtaatt tggatgcaat gcgatc 326
【0223】 <210> 110 <211> 415 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 110 gatcgcattg cataccttcg gggtacaagt cagtttctac actgggtgct gatccttgca 60 cgcgcccttt ctaccatctc acggtgggga tggccgcagg gctgtgcacc cagaagaaga 120 tggctgttag cgtttcggcc ttcataatgg cctgagactt tctttctgta ggtggtctgg 180 agctgtccgg ctggtggccc cctattttgc catttagcga acaaccacag gaattttaaa 240 aacaaaaaca tcccaagatt ttttcatttc aaaatgcttc aaagtccaca ttagatcaga 300 tactccgctg tcggcacatt cagctgaggt tcattacaat cgagactgca atgtgatcta 360 tgtttcatct tgtttttata ataaaaagct tcagggaaca agcccaaagc cctcg 415
【0224】 <210> 111 <211> 567 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 4 <223> n is a or c or g or t. <400> 111 cggnaggagt cttactcttt ctcccaggct ggagtgcagt ggcatgatac cagctcactg 60 caatctccac ctcccaggtt caagtgattc tcctgcctca gcctcctgag tagctgggat 120 cacaggtgcc tgccaccacg cccggctaat ttttgtattt ttagtagaga cagagtttca 180 ccatgttggc aaggctggtc tcaaacttct gacctcaagc agttcgcccg cttcagcctc 240 ccaaagtgct gggattacag gagtgagcca ccgcacctgg cctgtaccat tatttgatca 300 acatctgtct tcccccctag actggaagct ccaggtgggc agggaccatg tttgtcctca 360 ccaaggtatg caaggcctgg acacggtagg tactttgtaa atatttgttg actagatgga 420 tggacagaaa atgaatggat ggatgggccc taagctaagt tctgtacatt ttttaaaaaa 480 aatcagattt ccaccccact aatgactaaa cttgggactg tagtttctgt gtccttctgt 540 tttgcccctg cacatggcaa tgcgatc 567
【0225】 <210> 112 <211> 574 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 112 cggattttaa aggaaattaa aacattttca taggccccta agtgttatgg gcttggacac 60 tgtaccctgc ccaggtaaga tcactcgtgg gtaagaacat gaggttctca cccgtaaggc 120 aggattttta tagaaggaag gtaggtcttt caacctatgt cctccttctg ttccacaaag 180 tggaaagcca caagccctac aaaagccttg caagtcccag aggctgcagc cgtatttatt 240 cttcaggcca agactctcag gacagagagc acccatgcac cccgcaggct gcaggccatc 300 tccctgcatt tgggactgtc ctgaggatgg cggcttcatt tttgtccctc ctacctctga 360 gtactcccca ttccttatgt gaagctgagc cttaacccgc acccactgta ttagtccgtt 420 ttcaggcagc tgataaagac acacccaaga ctgggcaatt tacaaaagaa agaggtttaa 480 tggactcaca gttccacatg gctggggagg cctcacaatc atggtggaag gctaaaggca 540 cgtctcacag ggtggcagat aagacaatgc gatc 574
【0226】 <210> 113 <211> 283 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 113 gatcaagtcc cactatcaag gataagccag taagtgtggt ttagcataaa atagcttctt 60 gcttttgcct ccattcatct gttatatttg aaaaacccat agacaacttg atgtgtttgg 120 ggtacttaat tgacatgttt gtaagcagac taagtagtct tgttgtgaag ttcttaacat 180 tgacattctg tgtatttgca catctcaatt tgacatcgaa tttttggtta gttgaaatat 240 aattggtaaa tctttatttt taaaagattt cacggctggg cat 283
【0227】 <210> 114 <211> 596 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 114 caaacgtcgg agataaaggt gtagatgcac cagctgaacg tcttgctctg tttcccattt 60 tacgtataag atgggtgatg gcatgctgca ttcagatccc catgggtgta tttgggattt 120 ggggtggggg attgtgtgta gaaggcagga aagattgccc agcaactctc atttgaattg 180 agggtggaag cggttctcgg gcacagtatg ccaaggccca gggcgtccaa gggacagagc 240 agagatcaca gatgctgaac gggtggggaa ggagcactag gcagggcatt tctgatgaga 300 ctttgatttg ggaggtacga aagttgtatg aggaatcttg ataaactgct tagagtgaat 360 ggagatgagt aggaatcacc accattcaca tactggctct gcaagccact cagcacagct 420 ctgcacctgc tcttatggag gagaagacaa gcagaagaga atgttctgat ctagaagagt 480 tcgtgtaaga gcatgaaggc aacagcactt gagatgtggt gcacatgagc aaaatttcag 540 tttatgtgga atttaagatt aacagattaa aaggtaaaat tctctccctg gtaccc 596
【0228】 <210> 115 <211> 861 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 115 gggcttatca gatgcattgt ggtgatgaac tcatcctgct ctctggagga ctgcctttca 60 tacaccacat tgccttgtac aactgctctg catttgagaa tcatacttaa atgtttacgt 120 ttcaattgcc tgaaagcagg gccagtgtct tatgtcacct ctgacctttt acggaagggg 180 acaagtgagg tagtagctca cacctgtaat cccagtgctt tgggaggccg aggtgggagg 240 atcatttgag gccaggagtt caaagaccag cacctttgac ctgaagaccc tctctcctga 300 tcatccagca atccaggctg ttcggctctt gggctcctga gtattctgca ctctttacct 360 ttttttttaa tcagcacaga gaaaggcaat taccctcaca gtacccgatg aaataagtat 420 ttttaggttg gagtgattac ttagtgagtt ccctgtaatc aaaactggtt tcttttttta 480 aggaagattc acatttctca atctattttc ctttcaaaag agagaaatta gcactttatg 540 ttttaagtat acacattctg cctttctccc ttcactttaa aaaaattcaa gtcctggccc 600 ggatgcagtg gctaacacct gtaatcccaa cattttggga ggccaaggcg ggcggttcac 660 gaggtcagga gatggagacc atcttcgcca actggtaaaa tttcatctct actaaaaata 720 caaaaattag ctagacatgg tggcgctcac ctggaatccc agctactcag gaggctgagg 780 caggagagtc gcttgaaccc gggagtcaga ggttgcagtg agctgagatc atgtgtggca 840 acagagcaag actccggtct c 861
【0229】 <210> 116 <211> 289 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 116 cgaaatttga agtgtctgca ttataattta ctggttcagc atccctaaat ccagaaacca 60 aaatctgaaa tgccctaata agcatctcct ttaaatgctg ccagcactca agaagtttca 120 gattttgaag ctcactggat ttcatttttt ggatttggga tgctcaacct acatatcaca 180 acttgctaat tttccagaaa ccacttacca gcttggaaaa aattctttta tatctgtcat 240 ttcttttttc ccttctggga aaagagtgaa atttctatgg tctgagatc 289
【0230】 <210> 117 <211> 363 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 117 gatcaagtcc acaaggtcat ggatgccagg gaaaaacttc cccctgaaag gcgcacaagc 60 aggcggaacc cagccaataa tgtaaataca ttaggatgca accagaaggt acattgcaaa 120 cccactgctt gaaaggtaat aaattcatat tgagctaata atgtgttagg tgaattgata 180 atgaatttat attaagtgaa tcaattaagt aattctgaat tggcttttga aagtctgcga 240 gaggctgggc accatggctc acacctgtaa tcctagcact ttgggaggcc aaggccagag 300 ggttgcttga gctcaggaat ttgagaccag cctgggcaac atggcaaaac tccatctcca 360 ccg 363
【0231】 <210> 118 <211> 752 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 118 cgactctctt ccgcaacctc cagtcctccc cacaacatac ctagccaagt acacttacat 60 gaactaactt agataatacg aaccacttaa acccagagga gaaactcgtc catcttcatt 120 acctgaatta tctggcatgt tgatattctg ttacttatgg agagcagact aggtgtgaaa 180 agcacacccc agcaacctca gacagatagt cttaagtcat tgcctgggat tgttaactac 240 cttctagata gttctagata gttccttcta gcaggaaggg gagttcagcc tgagggatca 300 ggtttcagta agttcttatg taatactctc tccttggtat gtaaagatgg tgtcactcaa 360 ccaataccag cacacatact ttaagtgatt ttctactaat ggcagtgagt ttaattaaac 420 atccttccac atgcctgcct cgtccctctt gtagcagtca ggatgctcta cggggctggc 480 tgggttagtg ccttgagaca gtgtggacat aggagtggtt catgctggtg tcgtgagggt 540 ccaatctcct cttctgcacc acccaggcaa accaggtgtc tggacaagat gggtttcagt 600 gtttccctaa tctgactttg ctgggatgac ccttgactcc tgaaaccata gaatttcttg 660 tagaagcaaa tttttatggt cgtcattcaa tgacaagaaa tgacctttca ggaaagaatc 720 tgatataatt ggcttttcat acctgcgaaa ac 752
【0232】 <210> 119 <211> 282 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 119 gctcctcttc ttttatcttg tctcttttca tctgaatact gtgatgctga cgagagtatc 60 ttatgctttc ttcagcctgt tgcaatctga accgatgatt ttctgtgcac tgatcctttc 120 tactccggag agaggctctt ttggcacaga tcctgccccg tttagactcc agctgctggc 180 actgccttct gagttctttc acttccaaat tcttatcatc ctgcagcccc accacacagt 240 caatgacttt aagttcctct ggattttcac atggatcgca ac 282
【0233】 <210> 120 <211> 303 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 120 gatcaagtcc cagtacactc attagttaag tgtgacggtg gtcaagtgat gttgctttgt 60 gtgtctgttt tctcttaggt ggttcaggta ccctgaaata aatcctaact tatatgtctg 120 ttgctcattc atctctgtgt gtggagaaag tgatttaaag tgtcctttct ttaagaagga 180 aagagccagg gcatagtggc tcgtatctgt aatcctagca ctttgggagg ctgaggcagg 240 aggattgctt cagtcaggag gttgagactg gcctgggcaa catagtgaaa ccatgtctct 300 acg 303
【0234】 <210> 121 <211> 883 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 121 tcgatacagg cacaaaagga agtcagctca acccaatctt catggaatag ggaagtgtag 60 taagggggaa atgaaggaag acttcctgga gaagagaaat cctgaattga gtttgcagaa 120 gagataaagc atttgtcagg aagataagta gaaaaagagt gttccaggag aggagatagg 180 attttcaaag acattgagat gagagaacaa ggtaagttta aggaaataca tgaggttcaa 240 ttcacctgag actcaagaca gcaaataaac ttctgaaaga tgagattaga caaataggca 300 aagtttagat aatggagaat ctttcatgag tttgaacttt atttatttat gaatgcttta 360 gtgttttttt tttcaaaata ttttaagaag tgaggagtga gtggtacaat cagatacaaa 420 ctgattataa atgtttctgg caacactgtt gagaagggaa ttcagtagag tgtgactgga 480 ggaagggaga tgggttaggg agtagtccag gaagtaatcc aagggagagc aataaacaac 540 gatgggcatg gacaaggaga agatgcatat tgatggactg ttaagagtag tagaactaat 600 ttaatgacca agttaatgtg aaaactgcaa aagaggaagt ccagtaaaac ttctgtttcc 660 agtatgagaa agatttgatg gcaccactca ctaagataca ggtagtgcac agattagaga 720 tgagcagaga agagagatct gctgcaaata tgttaaatgc atccacttgg agaggtccga 780 tgggtggctg cttatggaca ttgtggagtt caggcgagag atttaaatta gagatcttca 840 gctctaatct ttgtgaatcc ttaagaatat gtctaactta ccc 883
【0235】 <210> 122 <211> 260 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 122 gtagagatgc atttttgcca tattgtccag gctggtctcc aactcctggg cttaagcgat 60 ccacccacct cgacctccca aaatgttgga attacaggtg tgagccactg cacccaaccc 120 acgcccattt ttaacaaatg aagaaactga ggcttgcaga ggttagatca tttgcccaaa 180 atcacatgct ggatccagaa ctagagcccc cagtcttgtt attctcaaca ctttttcctc 240 cacactacag ggacttgatc 260
【0236】 <210> 123 <211> 964 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 123 gatctgactg cactaaatag acagttttta atctcaattg gacatctgaa gatttctcaa 60 gctgttgttg gcttcagcag aaacaaattt ttctgctttg ttgattaaac cagtggtctc 120 caccattgct tatcggcctg caacgagctg ttctttttaa ttaaaagtga gccaccacga 180 gagagcaatt aacagctagt aattactgtg ctcttcagaa cggcaacatt ttgcctttca 240 ttccaattat ataatggaca agtgggtttt tgatcttcaa attagtgagc tcttgtcctc 300 cttgtttgga ggcagaattg gcaggttaat gatggcctgt gggggcactc tttcctctga 360 ctgatgtgag gcaagaacgc cttaaaggag gcagtgagag cctttcaaga cccgcagttc 420 cacctttatg ataaagacag agaaagagtc tttattttca gagggttttg atgaggagga 480 aagataggct tacatgtggc ctccaaacag tgccatgtgc ttttccttct tcttatcctc 540 cagcaaaagg tgaccaagtt tcaaaacatg gaaaactgaa agtttcagat gtgcaagatg 600 gctaagttct ggagatccag tggacagact gatgactata gttagcaata ttgtattgca 660 tacttgaaat tttcttaaga atgtagatct taaatgttct caccatgtgt gtgcacgtat 720 gcatacacac aaacacacac tcacacaaga ttactatgtt aggtgattat atatgtcaac 780 tagcttgatt gtggtaatca tttcacaata tatatgtata tcaagttatg tacctcaaat 840 atatacagtt tctatttgca aatgtacacc aataaagctg aaataaaccc aaggaaaact 900 ggaattagat tatgtgatgt tttggtatgc ctttggtaag ggcataaaat accacatgtt 960 ggcg 964
【0237】 <210> 124 <211> 516 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 509 <223> n is a or c or g or t. <400> 124 gggacttggg tgtaactgga tcagattttc tggaattcaa gggagaagcc gagatacttc 60 cctcacagaa attgttaata tcaatgctta gctttcttgc cagttcctca tcacttttca 120 gttgttcttc catcgctctt cgcctttttt ctgcctgtct tttttcctct tcttcctcct 180 ctgccaacaa cctctgtatg tattcttcac tggctttgtt ttcttcttcc tcgctggccc 240 gtcgctctgc cgccaccttg cttatttcct cttcatattc tcttctcagt tccccaggtt 300 tactgagcag acgaactggc tgatagtcat cagccacttc ctctgattct tggccagacg 360 ctctaagctt gcactccctg ggatagtgtt tttgaattat cgtccacagt tccacgttga 420 cgaagagaat ttcttcgggt atggtacccg agtccacgac gatacccggc ggcgacagaa 480 gggacagcat aaactcgcct tttcgacgng tcacct 516
【0238】 <210> 125 <211> 297 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 125 cgttctcagg ttcccccttt ggctgctctg cctcactcga agtagcaggt ggagtttcat 60 tctcttgttc ttctacagtg gagacagatt cctctgaact tatgtctggt tctggctttt 120 cttcctcccc ttcagcaagc ttgcttttgg gaggagtttc ccgggtagaa ttcacagttc 180 gacgaatcgg catggtgcta tcttctacct tctaagaaaa gagatggcca taatcaaaca 240 tgcattaaaa aattctcttt tctctctttc tcaaagggcc taactgggtg tcagatc 297
【0239】 <210> 126 <211> 527 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 126 gatcaagtcc cattatagag aatgggttat atggtatttg catataacct acatacatcc 60 tcctgtgtac tttaaatcat ctgaagatga ttacttatac ctaataaaat acctacacat 120 cacttcattt gcatggattc aacatagtgc ttggtgttca gtaaattcaa gttttgcttt 180 tttggaactt tgtggaattt ttctttttct gaatattttt gattggcagt tggttgaagc 240 catggatgca gaacccatgg atatggaggg ctgactgtac ttacttacat atctatctat 300 ctttgagtaa caaactcttt gggggaaaag agggaagtgt attgagcaag agaaggcaaa 360 aaacattaca taatattttg attctgttac cgtgtgtcta tagattgttt cattctaatc 420 aagacctaag aaggtatgat tctgtgactg atttagaatt ctggggtgga aatatcctgg 480 aaccatgttt tttaataaat tctgtctctt ggaaagagtt aacaacg 527
【0240】 <210> 127 <211> 525 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 127 gatcaagtcc ccttatataa aatggcatag tatttgcatg taacctatgc acatcctctc 60 atatacttta aatcatctct aggtgttctt acagtaccta atacaatgta aatgttatgc 120 aatagttgtc atactacatt gggttttttt gttattattt tttatagttt ttcccccaaa 180 tcttttcaat cggcagttgg tagaatccac aaatggagaa cccatggata agcagggttg 240 actgtattaa agtgtttcta acgattttca aatcaaacat tctacggtga tttatttatg 300 ccttgacatc accaggtgat gaaagtctct cacacttctc taccaaatta tctcgtaaag 360 gcaaaagaaa ggaaaaaaac cccataatct aggaggtggt ctaaccataa aaagtaacat 420 ttctataaat tgtatcttga gagttcaagg aaatttgaat tccctctatt ccataatgta 480 tttaaacata aaaatattta cctcttcccc accttcttcc caccg 525
【0241】 <210> 128 <211> 507 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 128 cgtttgggaa gttatttatt tctgaaagtg tcatttatat agtttggatg tcccctccaa 60 ctctcatgtt gagatgtaat acccagtgtt gggggtgggg cctaatggga ggtgtttggg 120 tcatgggagt gggtatccct cgtggcttgg tgttgtccta aaggtagtga gtgaggctct 180 cagaagatct ggtggtttaa agtgtgttca cttcctccat tcttgctctt ccttctgttt 240 tggccatgtg atacgcttgc tttcccttca cattcaagaa gaaaaagttt aattgcttca 300 aagagaataa aatactcagg aatccaactt acaagggacg tgaaggacct cttcaaggag 360 aactacaaac cactgctcag tgaaataaaa taggatacaa acaaatggaa gaacattcca 420 tgctcatgag taggaagaat caatatcgtg aaaatggcca tactgcccaa ggtaatttat 480 agattcaatg ccatccccat caagcag 507
【0242】 <210> 129 <211> 509 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 129 ctgcttgatg agaagaaaga tgtgtgtggc atcccctgag atggtttcct tctcgtttct 60 acaaagtaga taggccttgg tagaaactgc tgtttctcag tagttggacc attttatagc 120 cagattcttc ccactctgga atttggctac aaaaggtagc aaattgttta ccaaggtttg 180 tagcagtatc gcttctcacc agagtgaata aaaaatgaaa gctgtggccg aacatggtgg 240 cttgcgcctg tgatcccagc actttgggag gccaaggtgg gaggattgct tgaggccagg 300 aattcaaaac cagcctgggc aacatagtaa gaccccatct ctacaaaaaa tgaaaaaaat 360 tagccgggta tggtggcgca cacctgtggt cccagctact caggagacta aggtgagagg 420 attgtttgag cccagaagtt caaggctgca gtgagctatg atagtgccac tgtactccag 480 cctgtgtgac tgagcaagaa cctgtctcg 509
【0243】 <210> 130 <211> 501 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 130 cgatcatgag aatcattttt cacttttttt ttttttggag acagagtctt actctgtcat 60 ccagggtgga gtaaagtggc gtgatcttgg ctcactgcaa cctctgcctc ccaggttcaa 120 gcaattttcg cgcctcagcc tcccccgtag ttcagtagtt gggattacag gtgcgcacga 180 ccacccccgg ctaattttta tttatttatt tattttgcat ttttagtaga gacagggctt 240 tgccatgttg cccgggctgg tctcgaactc ctgagctcaa gtgatctacc cgcctcagcc 300 tcccaaagtg ctagaactac aggcatgaac caccgcaccc ggcccatttt tcacttctta 360 agtttttttc cctgaggttt cctatctctt cattagggaa acaatagagc ccaacaggtc 420 agcctacaga cactgttgac aaaaaggact ttagttcaag tcctagttct gccacttgtt 480 agtatatatg acatcaagca g 501
【0244】 <210> 131 <211> 497 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 3 <223> n is a or c or g or t. <400> 131 ggnaggatta cacaaggttt aaatgagata ccacatgtca aaacacttag tatatagcac 60 ataattctaa atagtattta ccataattag ccattattgg ccgaggacac acaaggaata 120 cacgattaag ctgaaatagt aatacaaacc taggtctatt ttttggccct aaagacttcc 180 cctttttgtg tctgtttcat gcacatctga ttagtgaact gaagcctcat ggccagccca 240 gcttcaggtg ggtatagaca ccgagccccc acataataat aagctgagcc taataccttc 300 cccagggatg ttcttttgat ctcctggttt cctgacaatt tcggatcgat gattaatggt 360 tagtttactt gatccatggt ccaatttctt caaagtgtca tacgctaaat aactgtatga 420 accaaatagt tctttttact tcagtaactt tgtagtcact atgtgtattt taacaatgta 480 actgtaccat caagcag 497
【0245】 <210> 132 <211> 413 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 132 cgatttctaa actttatgga aaaagccaat gacaatcaat tagccaaaaa cgagacgcca 60 aatcccatct cactccagcg ccatgccctc ttctcaaacg ctcgccggct ctaggacctc 120 tccaccagca cagttctcag gagtcctgct ggtctcccag tgctgttcta agggtccaca 180 tgaaggcagg tcaggcggga ctccccgggc aagcacttct gtacgcggaa agcacgaggc 240 gcaggagcca tggagagccg gtcctttgga gacaggaata cttaagagga ttggcaaacc 300 ggagaaacgc tgggagaggt gccccgcact gcggtggtaa ggcagagtct cagttctcct 360 cgggcttgtc ggctggcggt ccacaaggct gaagcatctt ttccatcaag cag 413
【0246】 <210> 133 <211> 411 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 133 ctgcttgatg atggtaataa ctaacatgta aatctttaat aaacagtgta cattcttaat 60 ctgtccatca actcggtaca gtcagtattg ttgtccgtat ttcacagatt aagacaccag 120 cctagaggcc gagtgcagtg gctcacgcct gtaatcccag cactttggga ggcccaggcg 180 ggtggatcac cttaggtcag gagtttagga taagcctggc catcatggtg aaaccccacc 240 tctactaaaa atataaaatt agccaggtgt ggtggcacgc acctgtaatc ccagctgctc 300 gggaggctga gagaggagaa tcagttgaac cagggaggct gaggttgcag tgagctgaga 360 tcacacacca ctgcactcca gcctgggcga caagagtaaa actccatctc g 411
【0247】 <210> 134 <211> 893 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 134 gggcgaggca gtctcactct gtcgccaggc tggaatgcag tggcacaatc tcagctcacc 60 acaacctcac gattctcctg gctcagcctc ccgagtagct gggactacag gcgtgtgcca 120 ccatgcccag ctaatttttg catttttagc agagacgggg tttcaccata ttggcaagga 180 tggtctcgat ctcttgacct tgtgatccgc ccgccttggc ctcccaaagt gctgggataa 240 caggcgtggg ccactgtacc tggccttttt tttttttgaa acggagtctt attctgtcat 300 ccaggctgca gtgtggcaat ctcgggctca ctgcaacctc cccctcctgg gttcaagcga 360 ttctcctgcc tcagcctcct gagaagctga gactacaggc acgtgccatt aggcccagct 420 aatttttgta tttttagtag agacggggtt ttgccatgtt ggccagggtg gtcttgaatt 480 catgatctca agtgattcgt ccaccttggc ccaaagtgct gggattacag gtgtgagcca 540 ctgtgtccag ccaagacttc ctaaactttt atgctacaat accctactga ctcttcaggg 600 aaagggcagc acaaatgtga tgagttcctg gccataggtc ttatacttct ccaacctcac 660 gtaccctaag aaatctgtct gacaaattga ttgccattac catccttcac catcacatcc 720 taagataact acttccaaaa ggtagttcag gatttaacta ctaccagtct taggacaagt 780 acaagttcag caagaggtta taatgagacc ttatccatgg cagagacaaa gtgaagaaga 840 atgtaattca ggcaatgcag ggtgagtgga cctttatctt ccccatcaag cag 893
【0248】 <210> 135 <211> 858 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 135 ctgcttgatg tcagtttaac aattttatga accagtttct ttaatagtgt tgtggaaact 60 cttagccaga gcaatggtat aatcttaaag ttataagaaa cctgtacttg ttcagagtct 120 cttccatgaa tctccttgaa gacgaaacac tttaggatta tagttgcatg caaaagcttt 180 caggaaagca tcagagtaaa aattatctct ggatgacagg acttaaaatg gctatgataa 240 gaatttatta tgcaatcgac aaggaaattt tattttttgt gacatcagta ttttaacata 300 aaaatcaaaa ttatgactgg taacatcata acaggacata tcagatttgt aggaatttca 360 taccatttct agaacactca ataacatacc caggcaaata taactcaagg aaagttaaac 420 atcattgctt atttgacagt gcttaccgtg taaatttaac atactgaata aggtagttta 480 acatctctct ttttatgagg agagagaaca gattcttttg agatattcta ggaatcccct 540 ggaaactacc gaagttagtt caaggtgaga aagacctaat ggaggctggg catggtggct 600 catacctgta atcccagcat tttgggaggc caaggcaggc agatgtttgc tgaggcagga 660 agcagcctga ccaacatggt gaaaccctgt ctctactaaa ttaaaaaatt agctggacgt 720 ggtggtgcat gcctgtggtc ccggttactc agaaggctga ggcaggaaaa tcgctcgaac 780 ctgggagatg gaggttgtag tgaaccgaaa tcgcaccatt gcattcaagc ctgggcaaca 840 gagccagact ccgtctcg 858
【0249】 <210> 136 <211> 780 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 136 cgtagagacg gggtttcacc atgttggcca ggctggtctc taactccaga gctcaagtga 60 tccacctacc tcggcctccc aaagtgctag gattataggc atgagccacc gggcccggcc 120 tcagcttgca tttttatatt aaaataacct cacaggctgc ttttagttag caacagcttg 180 ggtatttaat agtgtgtttt caaattatga gtagtgttac ccattttgct cttaaaatag 240 gctcagcgct gactctgaaa ctctgtgcct tggagtagca tggtgttttg tgcactcatc 300 ccggaaataa atgttctaaa cacagagtca aagtcgcaaa gaaacaaaga ggaggctgtg 360 gacaagggag gccaagcagc ctgtattcct acataaccat taaagaacaa tttgcgtggc 420 tatataaaat ctaattttaa aaaatattta gaaattttaa gacaaccatt tcaaaaaaac 480 atttaaaaaa ggcattttcc ttttcttgag taaggggagt cctttcaggc ctttgtttta 540 aatttgtcaa agcaacccat gttcatagta aagtaagaat tcatgtgcaa cacaaagcga 600 aaattccgaa tcctgtatgc gccccacccc tagtataatt actattagtg gtttcttgtg 660 cttacaacaa gaaaaacgcc tttcttaata gaagagggct tgcctggtaa gggggcccat 720 gggtcttctg gcgttgggga tgtacaggtt atgttcatgc catgtcaact catcaagcag 780
【0250】 <210> 137 <211> 560 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 137 ctgcttgatg gcaaaagggg agggtggagg gtgggagagg aaatgtcagg gcatgtgctc 60 tgataaaata aaggcaggga aacaagctga attacttgaa attacttgaa ttttcttgtc 120 ttaaaactga aaaaaaaatg tagttacacg ttaaaatctg caaatggttt ttacacctct 180 gattttaaca tgaacttata ctaatgtttg gaatcttatg tcagaaatat aagcagctat 240 gtacttagaa taggttttga atgggagagg tagaacagag agagaattaa gaagggatct 300 gacttataaa agactagaat gtgattagag tgatagaaca taccaatgtt accaagaaat 360 tgacaagctg ctggctttaa gcttatgcaa gtggtagttg ggaaagtagg aggtgtggaa 420 gagggtttgc attttggatt aattcatgca aaatgaagga ggaagcctgg tctaagaaga 480 tactgtcttt caatagaaat gatttctaaa ctgctacaga ttaagaatag ataatctgat 540 tgctgttgtt ttgtttgttc 560
【0251】 <210> 138 <211> 877 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 138 ctgcttgatg gtattgaaag gtgactataa tgagggaaga aaggaggagg taaagagaga 60 agaatttgtc ccagatctgt ttaaagtttc aaaatttaaa aagggaccca ttaaattatg 120 ggaaaatggc tatagagtgt gagcctcctt tgaccatatg ctcaaagacc gtactctgcc 180 acctgccttc caggtagcta ttctagaaac tcagtccttt gtggaaaccc aactaccttt 240 taaaagtctc tttccagatt ccaaaaggac aagagatcag agagtcacat atacgcctct 300 tgttttattt tcttgctttc accggtatta ttgccaagaa aatcgtaggg aaaaacttta 360 aacttttctt ttcagttgat ccctttgaca tcacctctca tgtttaaaat caggaaaaca 420 cacccctaaa atttgcactc tcttccgttt tgaaaaagaa aacccacaca caaatgcaca 480 ctattaccgt ctttcaccct gcgctatatt tccaaagtgt attataatcc agatattgcc 540 ccatctcaaa catgttaagt cagactgtgc tgaaagactt tccagggacg gtcaacaggg 600 tatatgttca gtggctgccc tgaaatcctg gtggggatga ggatcacgct tcatcatcaa 660 aggggatgcc catcccctga taagctccca gtccttttgg aagatttctt tgaatgttaa 720 ttgcattttc agttttgctc atttcccacc ccaatgtttt gtctgcaaca tcgcttacac 780 tggattcttt ctatttttat tcctatcatt aaatggtagt gctgtaaatt ctgcattctg 840 caattaatgt taaataaact gctttaattc attgacg 877
【0252】 <210> 139 <211> 486 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 139 cggagacaga gtttcactct tgttgcccag gctggaatgc aatggtgcga tttcgactca 60 cggtaacctc tgcctcccag gttcaagcga ttctcctgcc tcaaactcct gagtagctgg 120 gattacaggc atgcaccacc atgcccggct aattttgtat ttttagtaga gacgaggttt 180 ctctatgttg gtcagactgg tctcgaactc ctgacctccg gtgatctgcc tgcctcggcc 240 tcccaaagcg ctgggattac gggcttgagc cactgagccc aacgctgttt gtgattgtta 300 aaggaggtac atcctgctct ttcagtatta tattttctta attgctctta aactttctct 360 tatttttgcc ataaatgaaa acaaaatgca ttattactat tcatatcata caccctcctg 420 tatcctaggt gacaggtcaa aaagtgactc acacacacat tattttctag tattggcatc 480 aagcag 486
【0253】 <210> 140 <211> 397 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 140 cgaattaaag agatgaattt attggtaaat agataaaatt aacacctatt ttaatatatc 60 caaacccctt ccttatatat attaggtaaa ttaaaagaaa aaaattatca aagcaatact 120 acagccagct acatcgccaa tttacaaatg agttagtaag taccataagt ttgtttgaat 180 atcaggtgct tcagagtttt tctcaaacag ttacaaaaga gattaggttc ccaatcagtt 240 cacaaaagct aatttaaaga atgtagctta actacagtac tgaggttgtc acacacttaa 300 ctttcggtct cttgcttatt tattcatatc tgaggttcac tgtttctact aggatacatt 360 ccgcccacac ccacaccttg gtccccacat caagcag 397
【0254】 <210> 141 <211> 397 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 141 ctgcttgatg ttaatcatac tgggactaag aggatagaga atggtaggag ctgggatacc 60 cctaaacatt cacattaaaa caaaaaaaac ccaaagctaa aaaacaactg ggcaggagct 120 aaataaaaat ctaattttga gaggctgtat ctggctcagg cctcctactt tgtaacccat 180 ggaatatgtg aaagcatttg aaaaactata gcactgatct cacatgggca gacacactct 240 cagagagatg tggtgggagc catggcgcag tctgcctagg cagtggcagg agcgcagaag 300 actctgattc ctctcctcgg tcctaagacc gaatgtgtgt caggacatgt ggtcagggaa 360 gagaagctat ttaactgaac cagtaatagt agcaccg 397
【0255】 <210> 142 <211> 652 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 645 <223> n is a or c or g or t. <400> 142 cgtctattat ttctttatgc ttactctgcc atttattaaa ggagggaaaa tgtgaacgat 60 gaaaatattt acttcaaatt ttgactattt aaactttgga aaacttttcc cggagaatga 120 ctttcttggt tgaggtcaat ttcctgaagg actgagatga ggttaattat gaggcacaca 180 gtgaagtctt aatggcttcc ttaagttcac acctatgaat tcctggagtg gccagagaac 240 atgttactac tccagggtca atggtggaag catgttgatg gaagcatgct gatgaaaaca 300 agaaagactt gtggaaatgc ttagcttgct cctcaaaatg gaaaaaaatt caattctgtc 360 ccaatcatac tggaacaata catatgagac ttcaattgta gaaggtcaac aacttcaggt 420 aaataaccat gaagtcaaca ggatagtcac cataacctca cataatccat taactgtaat 480 acactattca ccaggtcttt ggtttcagtg aagaaagtgg ggcttgtagc aaaggaccca 540 gatacaaaca caaataggga actaaaatgg ttcttcaaag acatgcatta gagtgcacat 600 cagagtgcta aaccaccaag tccttttaat ttgcaagtgg acatnaaagc ag 652
【0256】 <210> 143 <211> 659 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 6, 648 <223> n is a or c or g or t. <400> 143 ctgctnaatg ggattggggc caaggagtca gtgcatcgtg gttggtatgg aagatggaat 60 gggaggcaga gcagcttctc ctgttcctta gcctgcgatg tttcagctgt taggaagcaa 120 ttcaggcagg aaagcaagtc tgctccattt aggttagtcc cacatttgct gtttgtttga 180 ctttgagcag gacacagaag tccttcaagc cccacctctc cccctgtgta atgggcagat 240 tttactcgct catccctaac tctccttagc actccagagg cacaggcata aggtacaagt 300 tttgcagctg gaaatgcata aatgtggatc ccagttccag cactttctgg ctgagtagtc 360 ttggatctat cagctcactt ctttgagtat cagcttcttc ctctgctatg tcctggtttc 420 catgttttcc ttgcagagct gcaataaggg tcagagatgc tatagaatgg gtcatagtgc 480 ctagcaggct ggtaaccaat gctagccata ttttcagtct aaagattggg caaatgttgg 540 tctgtccttg gttgaccaac ttcttccttt gagaagcaca tagcatctgt acacacagaa 600 gcgtgtgcat gtgagggatt catacatatc taagaacctt cttgcaangg aagtttacg 659
【0257】 <210> 144 <211> 564 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 144 cgtgttctcc aggtgatttt aggtaggaaa tcagggttga gagtcactgc tttaaaggaa 60 gaaaattaag gagcagtacc ttagaagagg atattaaaca ggggtggagt ttgctctagg 120 acagagtaga acatattctt gttgctctga gatacaagga aacctgacta gatacattta 180 agagatctgg ttgagataca gtggctcttt gctcatagta aaaaagtatt aatgaaatat 240 tttaaaattg ggacttccag caactcagaa ttagttggtc tatgaaaaag taaacacaag 300 gaagacctag aaaatcagta tatagaagtt aagcagtgaa actaaaaggt ttctttttaa 360 atgaatgaat ttgtgttgat atacttgtct tttcttataa ccattattaa agcaattatg 420 aaggctttat ttttaaaaca taaggtaaaa caactgagct aaaatcatga caactctatc 480 agcatttctt tatccacgaa tacacatcac caaaaaatgg cactactgat cgtccgtcca 540 ggggaaataa ttagcatcaa gcag 564
【0258】 <210> 145 <211> 337 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 145 gatccagtac ccagtaaagt gctctcacat gtgttgatag ctggacatct tccataatgc 60 ttctttcact aaaacaaact ccttgcgaat ttaacccata catttgggtt aaattctaca 120 taaaatcatg gaatttaaga gctggaagag ggttggcaat aacctaatct agtctctgtt 180 ttaacaaaga gaaaactaaa ttttaaagat ggtaagtggt caggcgcggt gactcatgcc 240 tgtaatccca gaactttgag aggccaaggt gagtggatca cttgaggtca ggagttcgag 300 accagcttgg ccaacatgat gaaaccccat ctctacg 337
【0259】 <210> 146 <211> 970 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 146 cggtgaaagg aattgaatta gaaagtcaac aatctagaaa cttcaaaatt actgcagcca 60 cctactactt tccaaaaata agcacccatc aaaactagac tctatcattt gttacccatg 120 cgtgttctat tactaatgtt ctcaaatcaa atttgagctt aaaaacagaa aatctacagt 180 ttcgttgacg acccctccca cccccaacta ttccaccctt cagccccatg gcatgttaaa 240 gggaagaaca atgaattctg gttgttacaa gagaatattt ggagcatctg actctttttg 300 ctgtcaacca gggtatcaac ttgaggcatc cataatgact cgactccctg tttgattcct 360 tctctccttt tattctctag aaagcccttc ctggaccctc ttgttggact aaatgacctt 420 tctccacatt cctaaccacc ctgtgcaaac ctctctttga gcacctgcca cattctgttg 480 aaattaagtc ttatcctccc actgtatttt aaagtctttg aggacgatgc ccatttgcaa 540 gtcaccgttg tatgcttggt gcctggcaca aagcaggtga tctgaaattt ctggtggaag 600 tggaagggtc atgtgtatgt tgggcgggtg tgtgtgagaa ggtaaaggac acgtttttca 660 tttgccttta tatagcgacc actcatctta acttcaaccc ctattccaaa tcttcctctg 720 aattgtacaa atttttaatt gttacattct ctgtagatgg gtttggatga cacaggaaac 780 cccttaaagt catctgcaat gttctcagcc ttgagtttga tggattactt ctgtgagtga 840 tggtgagtcg tggcagtaga cagctcatcc aatcccttga gttactgtta cttgagactt 900 tttcgctttc aagaaaaagg aacatgagct aacataagaa aatgcgaaag tcttatatgg 960 gtactggatc 970
【0260】 <210> 147 <211> 317 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 147 gatccagtac ggtcaagcag gcaagatcag attcacaggt aaaacttgct tgatggcact 60 tcaacgtttc ttcctatttc ctgagtggta ttgatgtgtg agagatagaa tgttaaatgg 120 tgaaagaaac tttataagct agtagttcct ttttttggta gtagaacccc agtatatagt 180 acaaaaataa aaaatgtgga tggttgcagt ggctcatacc tgtattcctg gcactttggg 240 aggccaaggc aggcagatca cttgaggtca agagtttgag accagcctgg ccaacatggt 300 gaaatcctgt ctctacg 317
【0261】 <210> 148 <211> 763 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 148 cgatggcagt atttttaatc ttgaaaagaa aaatacaaca cagctcaagg aaggaagaat 60 attctaagac acaccaaatc tagtacttct ctgtgtatga ccaagaaact gttttctgag 120 agtggcttag aagaaaatcc atttactaga accctttctt agaggcagtc atgtgatcca 180 catttgctac ctctgaccta gaggatactg tgtaactggg aacaaaaact tatcagaagg 240 gtttcaaaac tcttttgata ttgctatttt actccctaga gtttagcact tgcaaaaaat 300 gttagtgatt acagagtcag agttgaaaat atatctcaca aggaaagaga catccagcca 360 agaaaacaca aatatttaaa ccatactgaa aaaaagcata acatgttgag attattacca 420 caagataaaa gcccttcttt atagcccaca gtataggaga aatcaacaaa ttctcttggg 480 gaaattatat tccaaagctg accagcagta gtgtaacgca tcacacagca attctcttca 540 aagttctcca gaatatccaa agaagtcatc aagctgtccc aatccaaacg acaaggccct 600 gggcgtatat ggtctattat actatagaca aggtcatcta taacaccctt gggctttgta 660 gagatatcca ttaaattctt ctgagggttt tctccaaaca gttacatctt tcgttttctt 720 agcaactcgc cacttatctt cttcaatgct atggtactgg atc 763
【0262】 <210> 149 <211> 518 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 149 gatccagtac cagcgacaga ctttgcaaac atgcagatgg ttctcacatg tcttccttgt 60 ctcattttca gggcacgtgt cctaggttct ttcgattacg tctctcaagg caaggtttcc 120 agatctctct gtatcctcat gcttcccttt tggatgcacc ttaattttaa aatacctctt 180 tttctcatta attagatcac ttcaagttaa atacaaaaca tggcaagatg gatttaaatt 240 tagagggata taagtataca taagagaaga ccaatctcta cttttaaaaa tgcagttaat 300 taacaataaa gtaaaatata gtgaaggtac tatatgctta tttgaacttt gctgttgtta 360 aggacttgca ttcctctatt aacttttttt aaaaaactcg ttttgaaaac tagcattgga 420 tgtgggtttc caatgatcta gaaacatgta aactacaaca taatcgtttc aagaatttaa 480 aataattttg cagtagagaa tgttaatgtt ttcacccg 518
【0263】 <210> 150 <211> 334 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 150 cgcttagctc catagcccca taaccccatt ttttaactga gtcagaccct aactcaagaa 60 ggatgagtta aatgacttct aaagtttcct tctaatcctt tcacagtttg atttgactcc 120 ttctaataaa gtcagtctgg actgataatg tgacccaccc aatactaccc taggagtcaa 180 tagcacagat gagctaaaac ctggtggtct ctcggctccc agtgtgggac tgtcaccagg 240 actatattct tcaccttttt cacaacccag aactgctgct gggcaagcca agaaagcaga 300 aaaaaatcac ttacttgttt tggccaatgc gatc 334
【0264】 <210> 151 <211> 304 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 151 cgctgtatag ctaacagcat agccaatgcc ctgatcttct agccacactg taatttcttg 60 tccttgcatc acaaccccag ctgtagtcat caaagtggaa aaactgacag cattgtctga 120 aagacacagc ttgggaaaat tgctccttgt agctcccctg tcaatgaata ttatcatatt 180 tttctcatgg ataaggttac tgtgtttttt ttgctgggcc gggggtgggg aggcttctac 240 atacttagct actaagcaca ttaccattcc gtttgtggaa tggactaaac gtgacaatgc 300 gatc 304
【0265】 <210> 152 <211> 304 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 152 cggcatacag gccataattt ccatccatga aaatgaaaaa tggcgatgca agctatactt 60 tgtctacaat caccaactag gtgaattctc agtggtctct ttagagtctc tgaacagtta 120 atctttgtag aaatcaatca aaataatcca tggctcgagt tcagtttggc cagcacacca 180 agagcaggtg gttaaaaaca ttcggactca atgcttttca caatacaaat tcagaggatg 240 aatctttaca caaatcccac tacctctatt ctaacagttc tgacttgttt catccaatgc 300 gatc 304
【0266】 <210> 153 <211> 730 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 2, 10 <223> n is a or c or g or t. <400> 153 tnacacaggn gatcgcactt gtggggaggt gaggccaggc agctgggaca ttctagaaat 60 gcctttttag aattatggca tttctaaaaa ggtacttcca gaacagttgt ttagatggaa 120 ttcaaagtaa agttcagatt agcttttgag gaaaaaggaa tgctaccgta aatgtgaacc 180 ttaatccagt atactccagc catcctttgg ggatgaataa attttcaggt ttacctaagt 240 cttaacaatt tctttactag ccccttaact gttactttag caggtttgat aaaatgtgct 300 aaaaatatgc atttttgagt ttttaacttt agtgggaagt agatgtttca tcaacttctt 360 tggaaaataa agacactggc atataaacta tatttttttg agacaggatc tcactctgtt 420 gtccaagctg gaatgcagta atgcaaacat ggctcactgt agcctcgacc tcgtgggctc 480 aagcaatcct cccacctcag cctcctgact agtggaacca cagacatgag ctgctgcacc 540 cagctaaaat ggagtatttt taatttctgg gtcttttaaa tgcatttgga ggtctttagt 600 tttacctcac tgaaattagg attttaatta taaataatca aagatgtgaa ccttacagac 660 attttaaagc cattatattt tttctataaa ccctgttctc gtttggagga gaaagaaatt 720 ggaattttcg 730
【0267】 <210> 154 <211> 509 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 154 caattgtacc atctagtttt tttaaattat aattaattaa tttgtttttt gagaccaagt 60 ctcactctgt tgcccaggct ggagtccagt ggcatgatct cagctcactg caacctccgc 120 ctcctgggtt caagcaattc tgtgcctcag cctcccatgt agctgggatt acaggtgtga 180 gcaaccacgc ctggctaatt tttgtatttt tagtagagac caggtttcac tatgttggcc 240 aggctggtct cgaactcctg acctcaggta atccgttcgc cttggcctcc caaagtgccg 300 ggattacagg cgtgagccac agtgcccggc caccatctag tttttaaaca gaaaccacaa 360 gcatctagcc cctgctggag gagaaacttt aatttttcct tccatatatg tgtgtgatgg 420 gtctttcctg gtgacatatt aagtgggtag tacttgggga aatccaaaac tattaagttt 480 ggggttttga actctggacc cgacgtttg 509
【0268】 <210> 155 <211> 487 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 155 gatcgcattg ccacaatcca gcctggatga cagagtgaga ccccatctcc agaaaaaaaa 60 aaagaaatta gctggcgcgt gatggtgtgg ctgagggagg ctcaggtggg aggattgctt 120 gagctcaggt gtctgagact acagtgagct aggctctcct cactgcactc cagcctggaa 180 gatagagcaa gaccctgtct cttaaaaaac aggcaaatta ttgattatag ttcagtgggc 240 taaatcctgt ggtagaaaca ttcatgcata gggtggtgca tccacatcag tcttaggtgg 300 gaggagggtc atggaaggca gatttttggt tgcacttgaa ctgaactttg aaggatgatt 360 aggagtaagc tgggtggggg aagggaagaa cctaccaggc agaaggactg gcataagtaa 420 aggcttattt gtaagaagta gcatggcaca ttaagggaag ttgaggttgt tcagtatgac 480 cctaccg 487
【0269】 <210> 156 <211> 333 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 156 cgtcacacca acactgagaa ggtagtattt tcattttttc tgaggctcag agtttaaata 60 gctttcccga gatcacacat tggcatgctg ggatttgaac ccagagagtc tgaatccaga 120 gtctgaactt cgatcctctg cctcagcctc tcaagtagct gggagagaat ttttaaattt 180 tttgtagaaa cagggtctca ctacattgcc cacactggtc ttgaactcct ggcctcaagc 240 aatcctccca ccttggcctc ccaaagggct gggattacag gggtgagtca ctgtgcccag 300 aacagagcct gaacttttaa cgacaatgcg atc 333
【0270】 <210> 157 <211> 763 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 157 gatcgcattg tcacaggctt gtccttagtt ggagggtgat ctgtgttggg aaaccttttt 60 agaagaaatt actcttgagc tgagatttat gccctgttta gtgtgtaatc ccagaattac 120 tagtgaaatg ggttggtaaa tagggtaatt ttttttccct cctgaatttg gtggatcttt 180 tagagttgaa tagacagcac tttctgcaac agatggggat ttagacaggg aggacacttt 240 agttgtgctt agtttcttct accatccgtg gcatggaaat aattaggtat tataatgatt 300 taaaggactt aagttcagtc tttttggttc ttttcttttc ataagattct tattaggtac 360 gataaagcat tgattgcaag tacttcttta accatacatg atgatgtatt ttcgtgaaag 420 tagagctgta aaaatctagc ccattcagct gggctcaggg gctcatgcct gtaatcccag 480 cactttggga ggctgaggca gaaggatcac ttgagatcag gagttcaaga ccagcctaag 540 caacatagca agaccccatc tctacagaaa atttaaaaaa ttagctggac atgcccctgt 600 agtcccactc aggagactga ggtgggagga tcacttgagc ccaggaggtc gaggctacag 660 tgagctgtga ttgtgccact gcactccagc ctgagtgaca gagcaagacc ctgtctcaaa 720 aataaaataa atctgactca ttaaattgat ttttaaatac tcg 763
【0271】 <210> 158 <211> 470 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 158 cttgattgcc cattacaaca actgggaggt tagaaaatat atattgatat taagtccctc 60 cccagacaga ttatattaga gtctccagta ggagctttct ccccagggga cattattttg 120 tagccagggc tgagaatcac tgcattaagg acaaatggac tagggagtaa aaagctcaaa 180 agtgggcttg cagatttaga gttgtagatc acatgctgtt tacctctaaa tttatttaat 240 aatttgaaat atgggaaaaa gataattact tagttcaaaa tttaatttag ataaatttcc 300 gctatagctt aaaatgataa ctagtctatg tctcagaata attaattttg gctgggcgtg 360 gtggctcact cctgtaaatc ccagcaccct gggaggccaa ggtgggtgga tcacttgagg 420 tcaggagttc gagaccagcc tgcccaacat ggtgaaaccc cgtctctacg 470
【0272】 <210> 159 <211> 295 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 159 tggattggtc gggtgtggtg gctcatgcct gtaatcccag cactttggga ggcccaggtg 60 ggtggatcac ctaaggtcag gagttcaaga ccagcctgac caacatggag aaaccccatc 120 tctactaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaagc tgtgcatggt ggtgcatccc tgtaatccca 180 gctcctcggg aggctgaggc aggagaatcg cttaaaccag ggagccagag attgcagtga 240 ccaagatcac atcattgcac tccagcctgg gcaacaagag cgaaactcca tctcg 295
【0273】 <210> 160 <211> 295 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 160 gttgcgatcc cagatactcg ggagggtgag gcgggagaat cacttgaacc tgggaggcgg 60 cggttgcagt gagccgatat catcccaccg cactctggcc tgggcaacag tgagactcgg 120 tctc 124
【0274】 <210> 161 <211> 608 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 161 caaacgtcgg ggcattccgg ataggccgag aaagtgttgt gggaagaaag ttagatttac 60 gccgatgaat atgatagtga aatggatttt ggcgtaggtt tggtctaggg tgtagcctga 120 gaatagggga aatcagtgaa tgaagcctcc tatgatggca aatacagctc ctattgatag 180 gacatagtgg aagtgagcta caacgtagta cgtgtcgtgt agtacgatgt ctagtgatga 240 gtttgctaat acaatgccag tcaggccacc tacggtgaaa agaaagatga atcctagggc 300 tcagagcact gcagcagatc atttcatatt gcttccgtgg agtgtggcga gtcagctaaa 360 tactttgacg ccggtgggga tagcgatgat tatggtagcg gaggtgaaat atgctcgtgt 420 gtctacgtct attcctactg taaatatatg gtgtgctcac acgataaacc ctaggaagcc 480 aattgatatc atagctcaga ccatacctat gtatccaaat ggttcttttt ttccggagta 540 gtaagttaca atatgggaga ttattccgaa gcctggtagg ataagaatat aaacttcagg 600 gtgacccg 608
【0275】 <210> 162 <211> 315 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 162 gatctcagac cacagtggaa taaaactgga aatcaactcc aaaaggaacc ttcaaaacca 60 tgcaaataaa tggaaattaa ataacctcct gaattatcat tgggtcaaca gcaaaatcaa 120 gatggaaatt taaaattgaa ctgaacaata atagtgacac aacctatcaa aacctctggg 180 atacagcaaa ggcaatgcta aggggaaagg tcacagccta aatgcctaca tcaaaaagta 240 tgaaagaaca caaatagaca atctaaggtc acacctcaag gaactagaga aacaagaaca 300 aaccaaaccc agccc 315
【0276】 <210> 163 <211> 666 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 163 ctgatccatg ctataaagtg gacgaacctt gcaaacctta cgtgaaatga aaaaagccaa 60 gacccaagag gtcacctata gtatgagtca acttgtatga aatatccaga atagagaaat 120 ccatagagac agaaagcaga cactggtagt tgccaggggt tggagagagg aaagaatggg 180 aagaagactt acatagtgag taaggggttt tactttggag tgatggaaat gcgttggatc 240 tagatagaag tggcggtttt gcacaacgtt gtgaatggac taaatgccac tgaattgttc 300 actttatgta tttattttat ttttatttat ttatttgtag agacggggtc ttgctgcatt 360 gcccaggctg ctgtcaaact cctaagctca cccaggcgca atggctcatg cttgtaatcc 420 cagcactggg aggccaaggt gggcggatca cctgaggtca ggagttcgag accagcatgg 480 ccaacatggc gaagccccgt ctctactaaa attacaacaa ttagtatggt gtggtggtga 540 acgcctgtag tcccagctac ttaggaggct gaggcaggag aatcgcttga accccggagg 600 ccgaaggttg cagtgagccg agatcacgcc actgcactct agcctgggcg acaagagcaa 660 gactcg 666
【0277】 <210> 164 <211> 201 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 164 caaacgtcgg gtcacatggg aatgtggtaa agcctcatta ctgtagagtt cagacatgat 60 cacttaaaaa gagctttatt gggccgggcg cggtggctta ctcctataat cccagcactt 120 tggggggccg aggcaggcag atcacctgag gtcaggagtt cgggaccagc ctggctaaca 180 tggcaaaacc ctatctcttc c 201
【0278】 <210> 165 <211> 340 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 165 gatcaatcgc ccacatcact cgagacgtaa attatggctg aatcatccgc taccttcacg 60 ccaatggcgc ctcaatattc tttatctgcc ccttcctaca catcggacga ggcctatatt 120 acggatcatt tctctactca gaaacctgaa acatcggcat tatcctcctg cttgcaacta 180 tagcaacagc cttcataggc tatgtcctcc cgtgaggcca aatatcattc tgaggggcca 240 cagtaattac aaacttacta tccgccatcc catacattgg gacagaccta gttcaatgaa 300 tctgaggagg ctactcagta gacagtccca ccctcacacg 340
【0279】 <210> 166 <211> 578 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 166 gatcgcattg ctataaagaa ctatctgaga ctgggtaatt tatgaagaaa aagaggttta 60 attgacttac agttccttag gctgtacaag aagcctggct ggggagattt caggaaattt 120 aaaaccatgg cggaaggcga aggggaagca ggcatgtctt atatgacctg agaaggagga 180 ggagagtgca gggggaggtg ctacacactt ttaaacaacc agatctcgtg agaactcact 240 accacaagaa cagcaaggga caactctgtc cccatgatcc agtcacctct caccagaccc 300 ctccaacact ggggattaca attttacatg agatttgggt gaagacacaa atccaaacca 360 tgtcgccatg gttaagccac acatgactgt atataaccta cttgtatcct tgcatatact 420 ttaaataatc tctagattac acattataat acctaataca ggccgggtgt ggtggcccat 480 gcttgtaatc ccagcacttt cagaggccaa ggcaggtgga tcacgaggtc aggagttcaa 540 gaccagcctg gccaacacag tgaaacccca tctctacg 578
【0280】 <210> 167 <211> 143 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 167 gttttcgcag tcctgaacaa aatactaaca aactgaactc agcaatatat gaaatggatt 60 atatgccatg aaaagtagga tttatttaag gaacggcaag gtcggttctt catacaaaaa 120 tcaatttatt acaccatatt aac 143
【0281】 <210> 168 <211> 637 <212> DNA <213> Homo sapiens <220> <221> variation <222> 39 <223> n is a or c or g or t. <400> 168 gatcgcattg ccaagttaaa tccttaagca aaaaagganc aaagctggag gcatcatgct 60 acctgacttc aaaactatac taccaggctt ccagtaacca aaacagcatg atactggtac 120 caaaacagat atatagacca atggaacaga acagaggcct cagaaataac accacacatc 180 tacaatcatc tgatctttga caaacctgac aaaaacaaga aatggggaaa gaattcccta 240 tttaataaat ggtgttggga aaactggcta gccatatgta gaaagctgaa attggatccc 300 ttccttatac cttatacaaa aattaattca agatggatta aagacttaaa tgttagacct 360 aaaaccataa aaaccctaga agaaaaccta ggcgatacct ttcaggacat aggcatgggc 420 aaggacttca tgactaaaac accaaaagtg atggtaacaa aagccaaaag ccaaaataga 480 caaatgggat ctaattaaac taaagagctt ccgcacagca aaagaaacta tcatcagagt 540 gagcagacaa cctaaagagt gggagaaaat ttttgcaatc tacacatttg acaaagggct 600 aatttccaga atctacaaag aacttaaaca aatttac 637
【0282】 <210> 169 <211> 433 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 169 gatcaatcgc atcatcaccc aagctgtcaa aaatgtgaac attcgtggat ttttttctat 60 ttgcaagcca aaaaatgaag actgtcaact tcatggatat tagaagaagg catgagattc 120 ctaggcctga tgaaaaatat ttgatggttc atcacacaaa tggaagcaag agctccatat 180 ctgtatctgt tccccacgtc cactccaagt gacagggatg atcaaagaga cccaactgga 240 tgctttctgc tcagtagatt ttgatcacag ctgaggaatc tcaaggttaa gaaatcccag 300 tgctttggca gggcacggtg gctcacgcct gtaatcccag cacttttgga ggccgaggcg 360 ggcagatcac gaggtcagga gattgagacc atcctggcta acacggtgaa accccgtctc 420 tactaaaaat acg 433
【0283】 <210> 170 <211> 739 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 170 ctgatccatg accgggtaaa aaatgtcttg aaatcacatc aggctcatca aagacattta 60 tatgatgaga gagacctaga gaaagatgat gacctggaac ctgaaaggaa gtcttttatg 120 tagagactct gcctatgaca gtgaccccga gtatagcact gttcacagga gcaaagtctt 180 ggaaccaacc caaatgccca tcaacgatag actggataca gaaatgtgga atgcaccata 240 tgtcctcatc tgaaagtctc tgcaggatgg tctgactcac gcgagtggtt ttgagataag 300 ttgtgttata cctcaggtta ggtaaagtcg agagatgaac taacttaaaa agtagtgatg 360 tttacataga atctaaattg gaaaagacaa taatatcagc attagaaagt ttgcctttaa 420 gtaaaaaaaa ttattagcca taataggttt tacattcttc gtaatagaat atcctaaagc 480 aataaaacct ccactatgtg aactctaagt tctgaatatc cgaatttttc aaatagttct 540 gagttatatt taatttgttc tttactgact agaacacttc ctaatttatc acatcatttt 600 taacctcctt caaacatact gaatatattt ttttccaggg tttattgagg tataattgac 660 aaacaaaaat tgtgtatgta aggtgtacaa tgtgatgttt tgatatgtga aatacatttg 720 atggattctt gggcttcct 739
【0284】 <210> 171 <211> 380 <212> DNA <213> Homo sapiens <400> 171 gatctgacac caagcacagg caacagaagt gaaaataggc aaatgggact atatcagatg 60 taaaatgttt gtgccttaaa taacacaaca attgacagaa tgcaaagaca acctacggaa 120 taagagaaaa tatttgcaaa tgatacatct gatatgtggt taatattgaa aatatataca 180 gaactacaac aacttaacac caaaaaaatc aaataacaca attcaaaaat gggcaaagag 240 cttgaataga cacgtctcca aagaagatat acaaatgaca aacaagcacg tgaaaaaatg 300 ttcattatta atcattaaag aaaagcaatt tgaaaccgca atgagatacc aactcatacc 360 tatcgggatg gctactatcg 380
【図面の簡単な説明】
【図1】この発明の実施の形態1である遺伝子発現プロ
ファイル解析装置の構成を示すブロック図である。
【図2】遺伝的アルゴリズムにおける遺伝子の組み合わ
せの表現方法を説明した説明図である。
【図3】遺伝的アルゴリズムにおける遺伝子の組み合わ
せの評価関数(予後の存命月数の予測誤差に関する評
価)のグラフの一例を示す説明図である。
【図4】遺伝的アルゴリズムにおける遺伝子の組み合わ
せの評価関数(採用した遺伝子数に関する評価)の説明
図である。
【図5】従来の方法によって予後の存命月数を推定した
結果を示す説明図である。
【図6】この発明の方法によって予後の存命月数を推定
した結果を示す説明図である。
【図7】各遺伝子と予後の存命月数の相関係数の分布を
示した説明図である。
【図8】この発明の実施の形態1である遺伝子発現プロ
ファイル解析方法の処理の流れを示すフローチャートで
ある。
【符号の説明】
1 入力手段 2 データ前処理手段 3 遺伝子組み合わせ手段 4 第1推定手段構築手段 5 第1推定手段 6 遺伝子組み合わせ評価手段 7 組み合わせ制約手段 8 第2推定手段構築手段 9 第2推定手段 10 出力手段 S1 入力ステップ S2 データ前処理ステップ S3 遺伝子組み合わせ候補生成ステップ S4 第1推定方法生成ステップ S5 第1推定ステップ S6 遺伝子組み合わせ評価ステップ S7 遺伝子組み合わせ抽出ステップ S8 遺伝子組み合わせ制約ステップ S9 第2推定方法生成ステップ S10 第2推定ステップ S11 出力ステップ
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G06F 17/30 170 C12N 15/00 ZNAA G06N 3/12 F (72)発明者 峰野 純一 滋賀県大津市瀬田三丁目4番1号 寳酒造 株式会社中央研究所内 (72)発明者 向井 博之 滋賀県大津市瀬田三丁目4番1号 寳酒造 株式会社中央研究所内 (72)発明者 浅田 起代蔵 滋賀県大津市瀬田三丁目4番1号 寳酒造 株式会社中央研究所内 (72)発明者 加藤 郁之進 滋賀県大津市瀬田三丁目4番1号 寳酒造 株式会社中央研究所内 (72)発明者 香川 芳範 兵庫県尼崎市塚口本町五丁目4番36号 三 菱スペース・ソフトウエア株式会社関西事 業部内 (72)発明者 谷嶋 成樹 兵庫県尼崎市塚口本町五丁目4番36号 三 菱スペース・ソフトウエア株式会社関西事 業部内 (72)発明者 永野 隆文 東京都千代田区丸の内二丁目2番3号 三 菱電機株式会社内 (72)発明者 山田 訓 東京都千代田区丸の内二丁目2番3号 三 菱電機株式会社内 Fターム(参考) 4B024 AA11 AA19 AA20 CA04 CA09 CA12 CA20 HA14 4B029 AA23 BB20 CC03 FA15 4B063 QA01 QA05 QA19 QQ02 QQ53 QR32 QR56 QR62 QR82 QS16 QS25 QS34 QS39 5B075 ND20 NK02 PR06 QM08 UU19

Claims (40)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】各試料における遺伝子発現プロファイルデ
    ータと注目する評価指標データとを受け取る入力手段
    と、入力されたデータから評価指標データ推定のための
    遺伝子の組み合わせ候補を生成する遺伝子組み合わせ手
    段と、遺伝子の組み合わせ候補の遺伝子発現プロファイ
    ルデータから評価指標データを推定する手段を構築する
    第1推定手段構築手段と、該第1推定手段構築手段によ
    り構築され遺伝子の組み合わせ候補の遺伝子発現プロフ
    ァイルデータから評価指標データを推定する第1推定手
    段と、前記第1推定手段を用いて前記遺伝子の組み合わ
    せ候補を評価し、予め設定された基準を満たしていれば
    組み合わせ結果を出力手段に出力し、満たしていなけれ
    ば再度前記遺伝子組み合わせ手段に処理を戻す遺伝子組
    み合わせ評価手段と、前記遺伝子の組み合わせ結果と評
    価指標データを推定する推定法を出力する前記出力手段
    とを備え、注目する評価指標と関係の深い遺伝子を抽出
    し、評価指標データを推定する推定法を得ることを特徴
    とする遺伝子発現プロファイル解析装置。
  2. 【請求項2】遺伝子発現プロファイルデータを正規化、
    及び注目する評価指標と相関の低い遺伝子発現データを
    取り除く処理ができるデータ前処理手段を備えたことを
    特徴とする請求項1に記載の遺伝子発現プロファイル解
    析装置。
  3. 【請求項3】遺伝子の組み合わせ結果の遺伝子発現プロ
    ファイルデータから評価指標データを推定する手段を構
    築する第2推定手段構築手段と、該第2推定手段構築手
    段により構築され前記遺伝子の組み合わせ結果の遺伝子
    発現プロファイルデータから評価指標データを推定する
    第2推定手段とを備え、前記遺伝子の組み合わせ結果と
    して抽出された遺伝子発現プロファイルデータを受け取
    り、前記第2推定手段を利用して評価指標データを推定
    できるように構成したことを特徴とする請求項1又は2
    に記載の遺伝子発現プロファイル解析装置。
  4. 【請求項4】遺伝子の組み合わせ手段における組み合わ
    せを制約する組み合わせ制約手段を備え、遺伝子の機
    能、遺伝子同士の関連に関する既知の知識を利用できる
    ことを特徴とする請求項1乃至3のいずれか1項に記載
    の遺伝子発現プロファイル解析装置。
  5. 【請求項5】遺伝子の組み合わせ手段に遺伝的アルゴリ
    ズムを用いることを特徴とする請求項1乃至4のいずれ
    か1項に記載の遺伝子発現プロファイル解析装置。
  6. 【請求項6】遺伝子の組み合わせ手段に用いる遺伝的ア
    ルゴリズムで遺伝子の組み合わせを評価する指標とし
    て、評価指標データの推定誤差と採用する遺伝子数に基
    づく指標を用いることを特徴とする請求項5記載の遺伝
    子発現プロファイル解析装置。
  7. 【請求項7】遺伝子の組み合わせ手段に用いる遺伝的ア
    ルゴリズムにおける遺伝子の組み合わせの変化法とし
    て、遺伝子の採用と非採用を同程度変化させ、採用する
    遺伝子数を大きく変化させないことを特徴とする請求項
    5又は6に記載の遺伝子発現プロファイル解析装置。
  8. 【請求項8】第2推定手段構築手段として、誤差逆伝播
    学習を用いたニューラルネットワークによって推定法を
    学習することを特徴とする請求項4又は7記載の遺伝子
    発現プロファイル解析装置。
  9. 【請求項9】(1) 遺伝子発現プロファイルデータと
    評価指標データを入力するステップ、(2) 入力され
    たデータから遺伝子の組み合わせ候補を生成し、評価指
    標データを推定する方法を生成するステップ、(3)
    (2)で生成された方法で評価指標データを推定するス
    テップ、及び(4) (3)で得られた遺伝子の組み合
    わせ候補の評価指標の推定値を用いて、評価指標と関係
    の深い一つ又は複数の遺伝子を抽出するステップを含
    む、注目する評価指標と関係の深い一つ又は複数の遺伝
    子の組み合わせと、評価指標データを推定する推定法を
    得ることを特徴とする遺伝子発現プロファイル解析方
    法。
  10. 【請求項10】(1) 遺伝子発現プロファイルデータ
    を正規化するステップ、及び(2) 注目する評価指標
    と相関の低い遺伝子発現データを取り除くステップを含
    むデータ前処理ステップを含むことを特徴とする請求項
    9に記載の遺伝子発現プロファイル解析方法。
  11. 【請求項11】請求項9又は10に記載の方法を用いて
    抽出された、遺伝子の組み合わせと評価指標データと評
    価指標データを推定する推定法と遺伝子の組み合わせの
    遺伝子発現プロファイルデータを用いて、(1) 抽出
    された遺伝子組み合わせとその遺伝子発現プロファイル
    データからその評価指標データを推定する推定法を生成
    するステップ、及び(2) (1)で生成された推定法
    で評価指標データを推定するステップを含み、評価指標
    データを推定できることを特徴とする遺伝子発現プロフ
    ァイル解析方法。
  12. 【請求項12】(1) 遺伝子の機能、遺伝子同士の関
    連に関する既知の知識を入力するステップ、及び(2)
    (1)で入力された既知の知識から遺伝子の組み合わ
    せを制約するステップを含む、請求項9乃至11のいず
    れか1項に記載の遺伝子発現プロファイル解析方法。
  13. 【請求項13】遺伝子の組み合わせの生成方法に、遺伝
    的アルゴリズムを用いることを特徴とする請求項9乃至
    12のいずれか1項に記載の遺伝子発現プロファイル解
    析方法。
  14. 【請求項14】遺伝子の組み合わせを評価する指標とし
    て、前記評価指標データの推定誤差と採用する遺伝子の
    数に基づく指標を用いることを特徴とする請求項9乃至
    13のいずれか1項に記載の遺伝子発現プロファイル解
    析方法。
  15. 【請求項15】遺伝的アルゴリズムにおける遺伝子の組
    み合わせの変化法として、遺伝子の採用と非採用を同程
    度変化させ、採用する遺伝子数を大きく変化させないこ
    とを特徴とする請求項9乃至14のいずれか1項に記載
    の遺伝子発現プロファイル解析方法。
  16. 【請求項16】評価指標データを推定する推定法を生成
    する方法として、誤差逆伝播学習を用いたニューラルネ
    ットによって推定法を学習することを特徴とする請求項
    12又は15に記載の遺伝子発現プロファイル解析方
    法。
  17. 【請求項17】試料数nの被検試料における遺伝子発現
    プロファイルデータと、当該試料の評価指標データから
    評価指標データの推定に使用できる遺伝子を選択し、当
    該選択された遺伝子の発現データから各被検試料の評価
    指標データを推定する方法において、評価指標データ推
    定のための遺伝子の組み合わせ候補の数をn未満とし、
    評価指標データを推定する推定手段により得られる評価
    指標データの推定誤差から遺伝子の組み合わせ候補を評
    価する、ことを特徴とする評価指標データの推定方法。
  18. 【請求項18】請求項9乃至17のいずれか1項に記載
    の方法を用いて選択された遺伝子、提供される評価指標
    データの推定法に基づいて被検試料における評価指標デ
    ータを推定する方法であって、(1) 被検試料におけ
    る、選択された遺伝子発現プロファイルデータを得る工
    程、及び(2) 工程1で得られた遺伝子発現プロファ
    イルデータを前記評価指標データの推定法で処理し、被
    検試料の評価指標データを推定する工程を包含すること
    を特徴とする被検試料の評価指標データ推定方法。
  19. 【請求項19】工程(1)において、選択された遺伝子
    発現プロファイルデータが被検試料中の遺伝子由来のm
    RNA量の測定から得られることを特徴とする請求項1
    8に記載の評価指標データ推定方法。
  20. 【請求項20】mRNA量の測定がハイブリダイゼーシ
    ョン法又は核酸増幅法により実施される請求項19に記
    載の評価指標データ推定方法。
  21. 【請求項21】mRNA量の測定がDNAアレイを使用
    したハイブリダイゼーション法により実施される請求項
    20に記載の評価指標データ推定方法。
  22. 【請求項22】被検試料が被験者由来の癌病変部試料で
    あり、評価指標データが前記被験者の予後である請求項
    18乃至21のいずれか1項に記載の評価指標データ推
    定方法。
  23. 【請求項23】請求項9乃至17のいずれか1項に記載
    の方法を用いて選択された遺伝子、又はその断片が担体
    上の予め定められた領域に固定化されていることを特徴
    とするDNAアレイ。
  24. 【請求項24】請求項9乃至17のいずれか1項に記載
    の方法を用いて選択された遺伝子、又はその断片にそれ
    ぞれハイブリダイズ可能なプローブを含有することを特
    徴とするキット。
  25. 【請求項25】請求項9乃至17のいずれか1項に記載
    の方法を用いて選択された遺伝子、又はその断片を核酸
    増幅法によってそれぞれ増幅するための少なくとも1種
    のプライマーを含有することを特徴とするキット。
  26. 【請求項26】被検試料における遺伝子発現プロファイ
    ルデータより当該試料に関する評価指標データを得るた
    めの装置であって、(1) 請求項9乃至17のいずれ
    か1項に記載の方法を用いて選択された前記遺伝子発現
    プロファイルデータを入力する手段、(2) 請求項9
    乃至17のいずれか1項に記載の方法を用いて提供され
    る前記評価指標データの推定法により、前記手段(1)
    で得られた前記遺伝子発現プロファイルデータから被検
    試料における前記評価指標データを推定する手段、及び
    (3)前記手段(2)で得られた評価指標データを出力
    する手段、を包含することを特徴とする評価指標データ
    推定装置。
  27. 【請求項27】手段(1)が、請求項9乃至17のいず
    れか1項に記載の方法を用いて選択された遺伝子の発現
    を測定する手段を備えていることを特徴とする請求項2
    6に記載の評価指標データ推定装置。
  28. 【請求項28】手段(1)が、選択された遺伝子、又は
    その断片が担体上の予め定められた領域に固定化された
    DNAアレイを備えていることを特徴とする請求項27
    に記載の評価指標データ推定装置。
  29. 【請求項29】遺伝子組み合わせの評価に数式 を用いたことを特徴とする請求項1に記載の遺伝子プロ
    ファイル解析装置。
  30. 【請求項30】遺伝子の採用、非採用の決定に数式 を用いたことを特徴とする請求項1に記載の遺伝子プロ
    ファイル解析装置。
  31. 【請求項31】遺伝子組み合わせの評価に数式 を用いたことを特徴とする請求項9に記載の遺伝子プロ
    ファイル解析方法。
  32. 【請求項32】遺伝子の採用、非採用の決定に数式 を用いたことを特徴とする請求項15に記載の遺伝子プ
    ロファイル解析方法。
  33. 【請求項33】請求項1乃至22又は請求項26乃至3
    2のいずれか1項に記載の方法又は装置により抽出され
    た評価指標と関係の深い遺伝子発現プロファイルデータ
    と評価指標データの推定法のデータを蓄積し、それらの
    中の少なくとも1つ以上の遺伝子発現プロファイルデー
    タ及び評価指標データの推定法のデータを用いて被検試
    料の遺伝子発現プロファイルデータを分類する方法。
  34. 【請求項34】請求項1乃至22又は請求項26乃至3
    3のいずれか1項に記載の方法又は装置により抽出され
    た評価指標と関係の深い遺伝子発現プロファイルデータ
    と評価指標データの推定法のデータと遺伝子の組み合わ
    せを蓄積し、それらの中の少なくとも1つ以上の遺伝子
    発現プロファイルデータ及び評価指標データの推定法デ
    ータを用いて被検試料の遺伝子発現プロファイルデータ
    を分類する方法。
  35. 【請求項35】請求項1乃至22又は請求項26乃至3
    3のいずれか1項に記載の方法又は装置を用いて選択さ
    れた遺伝子と提供された評価指標データの推定法を蓄積
    する際に、少なくとも遺伝子と評価指標データと評価指
    標データの推定法を関連付けて蓄積することを特徴とす
    るデータベース。
  36. 【請求項36】遺伝子の組み合わせに対して、評価指標
    データ及び評価指標データの推定法を関連付けて蓄積す
    ることを特徴とする請求項35に記載のデータベース。
  37. 【請求項37】請求項35又は36に記載のデータベー
    スを備えていることを特徴とする請求項1に記載の遺伝
    子プロファイル解析装置。
  38. 【請求項38】請求項35又は36に記載のデータベー
    スを用いることを特徴とする請求項9に記載の遺伝子プ
    ロファイル解析方法。
  39. 【請求項39】評価指標が被検試料を得た被験者の予後
    である、請求項1に記載の遺伝子発現プロファイル解析
    装置。
  40. 【請求項40】評価指標が被検試料を得た被験者の予後
    である、請求項9に記載の遺伝子発現プロファイル解析
    方法。
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Cited By (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007034700A (ja) * 2005-07-27 2007-02-08 Fujitsu Ltd 予測プログラムおよび予測装置
WO2007018282A1 (en) * 2005-08-05 2007-02-15 Canon Kabushiki Kaisha Method of determining a biospecies
JP2007215412A (ja) * 2006-02-14 2007-08-30 Shizuoka Prefecture 悪性転移性胃癌の判定方法
JP2007531500A (ja) * 2003-07-17 2007-11-08 パシフィック エッジ バイオテクノロジー リミティド 胃ガンの検出用マーカー
KR20140037394A (ko) * 2012-09-17 2014-03-27 삼성전자주식회사 급속 온도 변환이 가능한 테스트 핸들러 및 그를 이용한 반도체 소자의 테스트 방법
CN110033041A (zh) * 2019-04-13 2019-07-19 湖南大学 一种基于深度学习的基因表达谱距离度量方法

Cited By (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007531500A (ja) * 2003-07-17 2007-11-08 パシフィック エッジ バイオテクノロジー リミティド 胃ガンの検出用マーカー
JP2011250795A (ja) * 2003-07-17 2011-12-15 Pacific Edge Biotechnology Ltd 胃ガンの検出用マーカー
JP2014236737A (ja) * 2003-07-17 2014-12-18 パシフィック エッジ バイオテクノロジー リミティド 胃ガンの検出用マーカー
JP2007034700A (ja) * 2005-07-27 2007-02-08 Fujitsu Ltd 予測プログラムおよび予測装置
US7668826B2 (en) 2005-07-27 2010-02-23 Fujitsu Limited Predicting apparatus, predicting method, and computer product
WO2007018282A1 (en) * 2005-08-05 2007-02-15 Canon Kabushiki Kaisha Method of determining a biospecies
JP2007215412A (ja) * 2006-02-14 2007-08-30 Shizuoka Prefecture 悪性転移性胃癌の判定方法
KR20140037394A (ko) * 2012-09-17 2014-03-27 삼성전자주식회사 급속 온도 변환이 가능한 테스트 핸들러 및 그를 이용한 반도체 소자의 테스트 방법
CN110033041A (zh) * 2019-04-13 2019-07-19 湖南大学 一种基于深度学习的基因表达谱距离度量方法
CN110033041B (zh) * 2019-04-13 2022-05-03 湖南大学 一种基于深度学习的基因表达谱距离度量方法

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