JP2002504492A - Gタンパク質共役型受容体Fishboy - Google Patents

Gタンパク質共役型受容体Fishboy

Info

Publication number
JP2002504492A
JP2002504492A JP2000532436A JP2000532436A JP2002504492A JP 2002504492 A JP2002504492 A JP 2002504492A JP 2000532436 A JP2000532436 A JP 2000532436A JP 2000532436 A JP2000532436 A JP 2000532436A JP 2002504492 A JP2002504492 A JP 2002504492A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
polypeptide
seq
identity
amino acid
polynucleotide
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2000532436A
Other languages
English (en)
Inventor
エルスアワーバジー,ナビル
レーン,パメラ,エイ.
ツイ,ピン
ボーター,リサ
Original Assignee
スミスクライン ビーチャム コーポレーション
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by スミスクライン ビーチャム コーポレーション filed Critical スミスクライン ビーチャム コーポレーション
Publication of JP2002504492A publication Critical patent/JP2002504492A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

(57)【要約】 FishboyポリペプチドおよびFishboyポリヌクレオチド、ならびに該ポリペプチドを組換え技術により生産する方法が開示される。さらに、FishboyポリペプチドおよびFishboyポリヌクレオチドを治療に用いる方法、およびそのための診断アッセイも開示される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】 本出願は、1998年2月20日に出願された米国仮特許出願第60/075,626号の利益 を請求するものであり、その内容は参照によりその全体が本明細書に組み入れら
れるものとする。
【0002】発明の分野 本発明は、新たに同定されたポリペプチド、該ポリペプチドをコードするポリ
ヌクレオチド、該ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの治療の際のまたは治療
に有効でありうるアゴニスト、アンタゴニストおよび/またはインヒビターであ
る化合物を同定する際の使用、並びに該ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの
生産方法に関する。
【0003】発明の背景 薬物探索プロセスには目下根本的な大変化が生じている。というのは、それが
「機能性遺伝子科学」(functional genomics)、すなわちハイスループット(高 効率)のゲノムまたは遺伝子ベースの生物学に及んでいるからである。このアプ
ローチは「ポジショナルクローニング」に基づいた比較的初期のアプローチに急
速に取って代わりつつある。表現型、つまり生物学的機能または遺伝病、が同定
され、続いてその遺伝子地図の位置を手がかりとして病因遺伝子が突き止められ
るだろう。
【0004】 機能性遺伝子科学は、現在入手できる多くの分子生物学データベースから興味
のもてそうな遺伝子配列を同定するための生物情報科学(bioinformatics)の様々
なツールに大きく依存している。依然として、まだ未解明の遺伝子およびその関
連ポリペプチド/タンパク質を薬物探索の標的として同定し特性づける必要性が
存在している。
【0005】 多くの医学的に重要な生物学的プロセスが、Gタンパク質を含めたシグナル伝
達経路に関与しているタンパク質および/または第二メッセンジャー(例えばcAM
P)により媒介されるということはよく知られている(Lefkowitz,Nature, 1991,35
1:353−354)。本明細書中では、これらのタンパク質はGタンパク質を含む経路
に関与しているタンパク質つまりPPGタンパク質と称される。これらのタンパ
ク質のいくつかの例としては、アドレナリンアゴニストおよびドーパミンの受容
体( Kobilka, B.K.ら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,1987,84:46−50;Kobilka
, B.K.ら、Science,1987,238:650−656;Bunzow,J.R.ら、Nature,1988,336:
783−787)、Gタンパク質それ自体、エフェクタータンパク質(例えばホスホリパ
ーゼC、アデニルシクラーゼ、およびホスホジエステラーゼ)、アクチュエータ ータンパク質(例えばプロテインキナーゼAおよびプロテインキナーゼC)( Simon,
M.I.ら、Science,1991,252:802−8)の受容体のようなGPC受容体が挙げられる 。
【0006】 例えば、シグナル伝達の一つの形態においては、ホルモンが結合することによ
り細胞内で酵素アデニル酸シクラーゼが活性化される。ホルモンによるこの酵素
の活性化はヌクレオチドGTPの存在に依存する。GTPもまたホルモンの結合に影響
を及ぼす。Gタンパク質はホルモン受容体をアデニル酸シクラーゼと結びつけて
いる。Gタンパク質はホルモン受容体により活性化されると、結合していたGDP をGTPと交換することが示された。このGTP担持形態は次に活性化されたアデニル
酸シクラーゼに結合する。GTPからGDPへの加水分解はGタンパク質自身によって
触媒され、Gタンパク質はその不活性な基底状態に戻る。したがって、Gタンパ
ク質はシグナルを受容体からエフェクターへ引き継ぐ中間物質として、およびシ
グナルの持続時間を制御する時計として機能し、2つの役割を果たしている。
【0007】 Gタンパク質共役型受容体の膜タンパク質遺伝子スーパーファミリーは7つの
推定上の膜貫通ドメインを有すると特徴付けられた。これらのドメインは細胞外
、または細胞質ループにより接続された膜貫通α−ヘリックスに相当すると考え
られる。Gタンパク質共役型受容体には、ホルモンやウイルス、増殖因子および
神経の受容体といった多くの生物学的に活性な受容体が含まれる。
【0008】 Gタンパク質共役型受容体(他には7TM受容体としても知られている)は、少な
くとも8つの異なる親水性ループをつなぐ、約20〜30アミノ酸からなる7つの保
存された疎水性の領域を含むと特徴付けられてきた。Gタンパク質共役型受容体
のファミリーには、精神病および神経障害の治療に用いる神経弛緩薬と結合する
ドーパミン受容体を含む。このファミリーのメンバーの他の例としてはカルシト
ニン、アドレナリン、エンドセリン、cAMP、アデノシン、ムスカリン、アセチル
コリン、セロトニン、ヒスタミン、トロンビン、キニン、濾胞刺激ホルモン、オ
プシン、内皮細胞分化遺伝子−1、ロドプシン、におい物質、およびサイトメガ ロウイルス受容体が含まれるが、これらに限らない。
【0009】 大部分のGタンパク質共役型受容体は、機能性タンパク質の構造を安定化させ
ていると考えられるジスルフィド結合を形成する保存されたシステイン残基を、
最初の2つの細胞外ループの各々において1個有する。7つの膜貫通領域はTM1、
TM2、TM3、TM4、TM5、TM6、およびTM7と称される。TM3はシグナル伝達に関与し ている。
【0010】 システイン残基のリン酸化およびリピド化(パルミトイル化またはファルネシ ル化)はいくつかのGタンパク質共役型受容体のシグナル伝達に影響を及ぼすこ とができる。大部分のGタンパク質共役型受容体はその3番目の細胞質ループお よび/またはカルボキシ末端内にリン酸化部位を含むことが多い。β−アドレナ
リン受容体のような数種のGタンパク質共役型受容体では、プロテインキナーゼ
Aおよび/または特異的な受容体キナーゼによるリン酸化が受容体の脱感作を媒
介する。
【0011】 いくつかの受容体では、Gタンパク質共役型受容体のリガンド結合部位は数個
のGタンパク質共役型受容体膜貫通ドメインにより形成される親水性のソケット
(socket)を含み、このソケットはGタンパク質共役型受容体の疎水性残基に囲ま
れていると考えられている。各々のGタンパク質共役型受容体膜貫通ヘリックス
の親水性の側は内部に面し、極性を持つリガンド結合部位を形成していると仮定
されている。TM3はTM3アスパラギン酸残基のようなリガンド結合部位を有する
ため、一部のGタンパク質共役型受容体におけるリガンドの結合に関与してきた
。TM5のセリン、TM6のアスパラギンおよびTM6またはTM7のフェニルアラニン
またはチロシンもまたリガンド結合に関与している。
【0012】 Gタンパク質共役型受容体は、ヘテロ三量体Gタンパク質により種々の細胞内
酵素、イオンチャンネルおよびトランスポーターに細胞内で結合し得る( Johns
on ら、Endoc.Rev.,1989,10:317−331参照)。個々のGタンパク質のαサブユニ
ットは特定のエフェクターを優先的に刺激して、細胞内の種々の生物学的機能を
モジュレートする。Gタンパク質共役型受容体の細胞質側の残基のリン酸化は、
一部のGタンパク質共役型受容体のGタンパク質の共役を調節するために重要な
機構であるとして同定された。Gタンパク質共役型受容体は、哺乳動物宿主の非
常に多くの部位で見つかっている。過去15年に渡り、7回膜貫通型(7TM)受容 体を標的とする350種類近くの治療薬が市場に出回り成功してきた。
【0013】発明の概要 本発明は、Fishboy、特にFishboyポリペプチドおよびFishboyポリヌクレオチ ド、組換え物質、並びにその生産方法に関する。もう一つの態様において、本発
明は、細菌、真菌、原生動物およびウイルス感染などの感染、特にHIV-1またはH
IV-2により引き起こされる感染、疼痛、癌、糖尿病、肥満、食欲不振、過食症、
喘息、パーキンソン病、急性心不全、低血圧症、高血圧症、尿の停留、骨粗しょ
う症、狭心症、心筋梗塞、卒中、潰瘍、喘息、アレルギー、良性前立腺肥大、偏
頭痛、嘔吐、精神および神経障害(不安、精神分裂病、躁鬱、鬱、せん妄、重度
の精神遅滞など)、ならびにハンチントン病もしくはジルドラトゥレット症候群
(Gilles dela Tourett's syndrome)などの運動障害の治療をはじめとする、前記
ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの使用方法に関する。他の態様では、本発
明は、本発明により提供される物質を用いてアゴニストおよびアンタゴニスト/
インヒビターを同定する方法、並びに同定された化合物を用いてFishboy平衡異 常と関連した症状を治療することに関する。さらに他の態様において、本発明は
不適当なFishboy活性またはFishboyレベルと関連した疾病を検出するための診断
アッセイに関する。
【0014】発明の説明 一つの態様において、本発明はFishboyポリペプチドに関する。この種のペプ チドには、配列番号2の全長にわたる配列番号2のアミノ酸配列に対して少なく
とも70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少
なくとも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好
ましくは少なくとも97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなる単
離されたポリペプチドが含まれる。こうしたポリペプチドとしては配列番号2の
アミノ酸配列を含むものがある。
【0015】 本発明の他のペプチドには、そのアミノ酸配列が配列番号2の全長にわたる配
列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性、好ましくは少なく
とも80%の同一性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに好まし
くは少なくとも95%の同一性、最も好ましくは少なくとも97〜99%の同一
性を有する単離されたポリペプチドが含まれる。こうしたポリペプチドとしては
配列番号2のアミノ酸配列からなるポリペプチドがある。
【0016】 本発明の更なるペプチドには、配列番号1に含まれるヌクレオチド配列を含ん
でなるポリヌクレオチドによりコードされる単離されたポリペプチドが含まれる
【0017】 本発明のポリペプチドはGタンパク質共役7回膜貫通型受容体遺伝子ファミリ ーのメンバーであると考えられる。それゆえ、それらには興味がもてる。なぜな
ら、Gタンパク質共役型受容体は多くのヒトの体内の細胞間情報伝達の基礎であ るからである。それらは、他の遺伝子ファミリーよりも多くの薬剤の作用の基礎
となってきた。これらの特性を以後「Fishboy活性」または「Fishboyポリペプチ
ド活性」または「Fishboyの生物学的活性」という。これらの活性の中には、前 記Fishboyポリペプチドの抗原性および免疫原性活性、特に配列番号2のポリペ プチドの抗原性および免疫原性活性も含まれる。本発明のポリペプチドはFishbo
yの少なくとも1つの生物学的活性を示すことが好ましい。
【0018】 本発明のポリペプチドは「成熟」タンパク質の形であっても、前駆体または融
合タンパク質のような、より大きいタンパク質の一部であってもよい。しばしば
、追加のアミノ酸配列を含めることが有利であり、このようなアミノ酸配列とし
ては、分泌すなわちリーダー配列、プロ配列、多重ヒスチジン残基のような精製
に役立つ配列、または組換え生産の間の安定性を確保する付加的配列などがある
【0019】 また、前記ポリペプチドの変異体、すなわち同類アミノ酸置換(ある残基が性
質の似ている他の残基により置換される)により基準ポリペプチドと相違してい
るポリペプチドも本発明に含まれる。典型的なこうした置換は、Ala, Val, Leu
および Ileの間;Ser とThr の間;酸性残基 AspとGlu の間;Asn とGln の間;
塩基性残基 LysとArg の間;または芳香族残基 PheとTyr の間で起こる。特に、
数個、5〜10個、1〜5個、1〜3個、1〜2個または1個のアミノ酸が任意
の組合せで置換、欠失または付加されている変異体が好適である。
【0020】 本発明のポリペプチドは任意の適当な方法で製造することができる。このよう
なポリペプチドには、単離された天然のポリペプチド、組換え的に生産されたポ
リペプチド、合成的に製造されたポリペプチド、またはこれらの方法の組合せに
より製造されたポリペプチドが含まれる。こうしたポリペプチドを製造するため
の手段は当業界でよく理解されている。
【0021】 本発明の更なる態様において、本発明は、Fishboyポリヌクレオチドに関する 。このようなポリヌクレオチドには、配列番号2の全長にわたる配列番号2のア
ミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の
同一性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに好ましくは少なくと
も95%の同一性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んで
なる単離されたポリヌクレオチドが含まれる。これに関して、少なくとも97%
の同一性を有するポリペプチドが一層好ましいが、少なくとも98〜99%の同
一性を有するものがより一層好ましく、少なくとも99%の同一性を有するポリ
ペプチドが最も好ましいものである。かかるポリヌクレオチドとして、配列番号
2のポリペプチドをコードする配列番号1に含まれるヌクレオチド配列を含んで
なるポリヌクレオチドが挙げられる。
【0022】 本発明の更なるポリヌクレオチドには、配列番号2のポリペプチドをコードす
るヌクレオチド配列に対して、その全コード領域にわたって、少なくとも70%
の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少なくとも9
0%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性を有するヌクレオチ
ド配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチドが含まれる。これに関して、少
なくとも97%の同一性を有するポリヌクレオチドが一層好ましいが、少なくと
も98〜99%の同一性を有するものがより一層好ましく、少なくとも99%の
同一性を有するポリヌクレオチドが最も好ましいものである。
【0023】 本発明の更なるポリヌクレオチドには、配列番号1の全長にわたる配列番号1
のポリヌクレオチドに対して少なくとも70%の同一性、好ましくは少なくとも
80%の同一性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに好ましくは
少なくとも95%の同一性を有するヌクレオチド配列を含んでなる単離されたポ
リヌクレオチドが含まれる。これに関して、少なくとも97%の同一性を有する
ポリヌクレオチドが一層好ましいが、少なくとも98〜99%の同一性を有する
ものがより一層好ましく、少なくとも99%の同一性を有するポリヌクレオチド
が最も好ましいものである。かかるポリヌクレオチドとして、配列番号1のポリ
ヌクレオチドを含んでなるポリヌクレオチドおよび配列番号1のポリヌクレオチ
ドが挙げられる。
【0024】 本発明はまた、上記の全てのポリヌクレオチドに対して相補的なポリヌクレオ
チドを提供する。
【0025】 配列番号1のヌクレオチド配列はロイコトリエンb4受容体(Yokomizo, T., Nat
ure 387(6633), 620-624(1997))との相同性を示す。配列番号1のヌクレオチド 配列はcDNA配列であり、配列番号2のポリペプチドである389個のアミノ酸 のポリペプチドをコードするポリペプチドコード配列(ヌクレオチド番号1〜1170
)を含む。配列番号2のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、配列番 号1に含まれるポリペプチドコード配列と同一であっても、遺伝子コードの重複
性(縮重)のため、やはり配列番号2のポリペプチドをコードする、配列番号1
に含まれる配列以外の配列であってもよい。配列番号2のポリペプチドはGタン パク質共役7回膜貫通型受容体遺伝子ファミリーの他のタンパク質と構造的に関
連しており、ロイコトリエンb4受容体(Yokomizo, T., Nature 387(6633), 620-6
24(1997))との相同性および/または構造類似性を有する。
【0026】 本発明の好適なポリペプチドおよびポリヌクレオチドは、とりわけ、それと相
同なポリペプチドおよびポリヌクレオチドと同様の生物学的機能/性質をもつこ
とが期待される。さらに、本発明の好ましいポリペプチドおよびポリヌクレオチ
ドは少なくとも1つのFishboy活性を有する。
【0027】 また、本発明は、配列番号1および配列番号2の対応する全長配列の決定に先
立って最初に同定された部分的なまたは他のポリヌクレオチドおよびポリペプチ
ドに関する。
【0028】 したがって、更なる態様において、本発明は、 (a) 配列番号3の全長にわたる配列番号3のヌクレオチド配列に対して少なく
とも70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少
なくとも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、もっと
好ましくは少なくとも97〜99%の同一性を有するヌクレオチド配列、 (b) 配列番号3の全長にわたる配列番号3のヌクレオチド配列に対して少なく
とも70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少
なくとも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、もっと
好ましくは少なくとも97〜99%の同一性を有するヌクレオチド配列、 (c) 配列番号3のヌクレオチド、または (d) 配列番号4の全長にわたる配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少なく
とも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、もっと好ま
しくは少なくとも97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプ
チドをコードするヌクレオチド配列、 を含む単離されたポリヌクレオチド、 並びに配列番号3のポリヌクレオチドを提供する。
【0029】 さらに、本発明は、 (a) 配列番号4の全長にわたる配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少なく
とも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好まし
くは少なくとも97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなるポリペ
プチド、 (b) 配列番号4の全長にわたる配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少なく
とも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好まし
くは少なくとも97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を有するポリペプチ
ド、 (c) 配列番号4のアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド、または (d) 配列番号4のアミノ酸配列からなるポリペプチド、 並びに配列番号3に含まれるヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドに
よりコードされるポリペプチド、 を提供する。
【0030】 配列番号3のヌクレオチド配列およびそれによりコードされるペプチド配列は
エクスプレスド・シーケンス・タグ(Expressed Sequence Tag:EST)配列か
ら誘導される。当業者であれば、EST配列中に若干のヌクレオチド配列読み取
り誤差が必然的に存在することを理解するであろう(Adams, M.D.ら, Nature 37
7 (supp)3, 1995を参照のこと)。したがって、配列番号3のヌクレオチド配列 およびそれによりコードされるペプチド配列は配列精度において同一の固有の限
界を受ける。さらに、配列番号3によりコードされるペプチド配列は、最も相同
性または構造類似性が高いタンパク質と同一の領域、または高い相同性および/
または構造類似性(例えば、同類アミノ酸の差異)の領域を含んでいる。
【0031】 本発明のポリヌクレオチドは、標準的なクローニングおよびスクリーニングに
より、ヒト網膜細胞中のmRNAから誘導されたcDNAライブラリーから、発現配列タ
グ(EST)分析(Adams, M.D.ら, Science (1991) 252:1651-1656; Adams, M.D.
ら, Nature (1992) 355:632-634; Adams, M.D.ら, Nature (1995) 377 Supp:3-1
74)を用いて得ることができる。また、本発明のポリヌクレオチドはゲノムDNA ライブラリーのような天然源から得ることができ、商業的に入手可能な公知の技
法を用いて合成することもできる。
【0032】 本発明のポリヌクレオチドを本発明のポリペプチドの組換え体生産のために用
いる場合、そのポリヌクレオチドには、成熟ポリペプチドのコード配列単独、ま
たは他のコード配列(例えば、リーダーもしくは分泌配列、プレ−、プロ−もし
くはプレプロ−タンパク質配列、または他の融合ペプチド部分をコードするもの
)と同じリーディングフレーム内にある成熟ポリペプチドのコード配列が含まれ
る。例えば、融合ポリペプチドの精製を容易にするマーカー配列がコードされ得
る。本発明のこの態様の特定の好ましい具体例においては、マーカー配列は、p
QEベクター(Qiagen, Inc.)により提供されかつ Gentzら, Proc. Natl. Acad.
Sci. USA (1989) 86:821-824に記載されるような、ヘキサ−ヒスチジンペプチド
、またはHAタグである。また、このポリヌクレオチドは5'および3'非コード配
列、例えば、転写されるが翻訳されない配列、スプライシングおよびポリアデニ
ル化シグナル、リボソーム結合部位、およびmRNA安定化配列を含んでいても
よい。
【0033】 本発明の更なる実施態様としては、数個、例えば5〜10個、1〜5個、1〜
3個、1〜2個、または1個のアミノ酸残基が任意の組合せで置換、欠失または
付加されている、配列番号2のアミノ酸配列を含んでなるポリペプチド変異体を
コードするポリヌクレオチドがある。
【0034】 配列番号1に含まれるヌクレオチド配列と同一であるか十分に同一であるポリ
ヌクレオチドは、本発明のポリペプチドをコードする全長cDNAおよびゲノム
クローンを単離するために、また、配列番号1に対して高い配列類似性を有する
他の遺伝子(ヒト以外の種に由来するオーソログ体(orthologs)および相同体(ho
mologs)をコードする遺伝子を含む)のcDNAおよびゲノムクローンを単離す るために、cDNAおよびゲノムDNA用のハイブリダイゼーションプローブと
して、または核酸増幅(PCR)反応用のプライマーとして用いることができる
。典型的には、これらのヌクレオチド配列は基準のヌクレオチド配列と70%、
好ましくは80%、より好ましくは90%、最も好ましくは95%同一である。
一般に、プローブまたはプライマーは15個以上のヌクレオチドを含み、好まし
くは30個以上を含み、50個以上のヌクレオチドを有していてもよい。特に好
ましいプローブは30〜50個の範囲のヌクレオチドを有するものである。
【0035】 本発明のポリペプチド(ヒト以外の種に由来する相同体を含む)をコードする
ポリヌクレオチドは、配列番号1のヌクレオチド配列またはその断片を有する標
識プローブを用いて、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で適当
なライブラリーをスクリーニングし、該ポリヌクレオチド配列を含む全長cDN
Aおよびゲノムクローンを単離する各工程を含んでなる方法により得られる。こ
のようなハイブリダイゼーション技法は当業者に公知である。好ましいストリン
ジェントなハイブリダイゼーション条件は、50% ホルムアミド、5×SSC (150mM
NaCl, 15mM クエン酸三ナトリウム) 、50mMリン酸ナトリウム (pH7.6)、5×De
nhardt溶液、10% デキストラン硫酸および20μg/mlの変性し剪断したサケ精子D
NAを含有する溶液中42℃で一夜インキュベートし、次いでフィルターを 0.1
×SSC 中約65℃で洗浄することを含む。かくして、本発明は、配列番号1のヌ
クレオチド配列またはその断片を有する標識プローブを用いて、ストリンジェン
トなハイブリダイゼーション条件下で適当なライブラリーをスクリーニングする
ことにより得られるポリヌクレオチドをも包含する。
【0036】 当業者には理解されるように、多くの場合、ポリペプチドをコードする領域が
そのcDNAの5'末端で短く切断されることから、単離されたcDNA配列は不
完全であるだろう。それは逆転写酵素のためであり、この酵素はもともと「プロ
セシビティ」(processivity:重合反応中に鋳型に結合した状態でいる該酵素の
能力の尺度)が低く、第一鎖cDNA合成の間にmRNA鋳型のDNAコピーを
完成させることができない。
【0037】 全長cDNAを得るための、または短鎖cDNAを伸長させるための、当業者
に公知で利用可能な方法がいくつかあり、例えば、cDNA末端高速増幅法(R
ACE)に基づいた方法がある(例えば、Frohmanら, PNAS USA 85, 8998-9002,
1988を参照のこと)。例えばMarathonTM技術(Clontech Laboratories Inc.)に より示されるような、上記技法の最近の改良により、より長いcDNAの検索が
大いに簡便化された。MarathonTM技術では、所定の組織より抽出されたmRNA
からcDNAを作製し、各末端に「アダプター」配列を連結する。続いて、遺伝
子特異的およびアダプター特異的なオリゴヌクレオチドプライマーの組合せを用
いて核酸増幅(PCR)を行い、cDNAの「欠失」5'末端を増幅する。次に、
「nested」プライマー、すなわち増幅産物の内部にアニールするように設計され
たプライマー(典型的には、アダプター配列のさらに3'側にアニールするアダプ
ター特異的プライマーおよび既知遺伝子配列のさらに5'側にアニールする遺伝子
特異的プライマー)を用いてPCR反応を繰り返す。その後、この反応の産物を
DNA塩基配列決定により解析し、この産物を既存のcDNAに直接結合するか
、または5'プライマー設計用の新たな配列情報を用いて別の全長PCRを行うこ
とにより、全長cDNAを構築することができる。
【0038】 本発明の組換え体ポリペプチドは、当業界で公知の方法を用いて、発現系を含
有する遺伝子操作された宿主細胞から生産することができる。したがって、更な
る態様において、本発明は、本発明の1以上のポリヌクレオチドを含有する発現
系、該発現系により遺伝子操作された宿主細胞、および組換え法による本発明ポ
リペプチドの生産に関する。本発明のDNA構築物から誘導されたRNAを用い
てこの種のタンパク質を生産するために、無細胞翻訳系を使用することもできる
【0039】 組換え体生産に関しては、本発明のポリヌクレオチドの発現系またはその一部
を組み込むために宿主細胞を遺伝子操作することができる。宿主細胞へのポリヌ
クレオチドの導入は、Davisら, Basic Methods in Molecular Biology (1986) および Sambrookら、Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 第2版、Cold S
pring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)などの多く
の標準的な実験室マニュアルに記載された方法により行うことができる。好適な
こうした方法として、例えば、リン酸カルシウムトランスフェクション、DEA
E−デキストラン媒介トランスフェクション、トランスベクション(transvectio
n)、マイクロインジェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エ
レクトロポレーション、形質導入、スクレープローディング(scrape loading)、
弾丸導入(ballistic introduction)または感染などがある。
【0040】 適当な宿主の代表的な例として、細菌細胞(例:ストレプトコッカス(Strepto
cocci)、スタフィロコッカス(Staphylococci)、大腸菌(E.coli)、ストレプトミ セス(Streptomyces)、枯草菌(Bacillus subtilis))、真菌細胞(例:酵母、ア スペルギルス(Aspergillus))、昆虫細胞(例:ドロソフィラ(Drosophila)S2 、スポドプテラ(Spodoptera)Sf9細胞)、動物細胞(例:CHO、COS、H
eLa、C127、3T3、BHK、HEK293、Bowes メラノーマ細胞)および植
物細胞が挙げられる。
【0041】 多種多様な発現系を使用することができる。こうした発現系として、特に、染
色体、エピソームおよびウイルス由来の系、例えば、細菌プラスミド由来、バク
テリオファージ由来、トランスポゾン由来、酵母エピソーム由来、挿入因子由来
、酵母染色体エレメント由来、ウイルス(例:バキュロウイルス、SV40のよ
うなパポバウイルス、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、鶏痘ウイルス、仮
性狂犬病ウイルス、レトロウイルス)由来のベクター、およびこれらの組合せに
由来するベクター、例えば、コスミドやファージミドのようなプラスミドとバク
テリオファージの遺伝的要素に由来するものがある。これらの発現系は発現を起
こさせるだけでなく発現を調節する制御配列を含んでいてもよい。一般的に、宿
主内でのポリペプチドの産生のためにポリヌクレオチドを維持し、増やし、発現
することができる系またはベクターはどれも使用しうる。Sambrookら, Molecula
r Cloning: A Laboratory Manual (前掲) に記載されるような、日常的に用いら
れる公知の技法のいずれかにより、適当なヌクレオチド配列を発現系に挿入する
ことができる。翻訳されたタンパク質を小胞体の内腔に、細胞周辺腔に、または
細胞外の環境に分泌させるために、適当な分泌シグナルを目的のポリペプチドに
組み込むことができる。これらのシグナルは目的のポリペプチドに対して内因性
であっても、異種シグナルであってもよい。
【0042】 スクリーニングアッセイで使用するために本発明のポリペプチドを発現させよ
うとする場合、一般にそのポリペプチドを細胞の表面に産生させることが好適で
ある。その場合は、スクリーニングアッセイでの使用に先立って細胞を回収する
。該ポリペプチドが培地に分泌される場合は、そのポリペプチドを回収し精製す
るために培地を回収する。細胞内に産生される場合は、その細胞をまず溶解し、
その後にポリペプチドを回収する必要がある。
【0043】 組換え細胞培養物から本発明のポリペプチドを回収し精製するには、硫酸アン
モニウムまたはエタノール沈殿、酸抽出、アニオンまたはカチオン交換クロマト
グラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグ
ラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマ
トグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含めた公知の方法を用いるこ
とができる。最も好ましくは、高速液体クロマトグラフィーが精製に用いられる
。ポリペプチドが単離および/または精製中に変性されるときは、タンパク質を
再生させるための公知の技法を用いて、活性のあるコンフォメーションを復元す
ることが可能である。
【0044】 本発明はまた、診断薬としての本発明のポリヌクレオチドの使用に関する。機
能障害と関連した、配列番号1のポリヌクレオチドにより特徴づけられる遺伝子
の変異型の検出は、該遺伝子の過少発現、過剰発現または変化した発現により生
ずる疾病またはその疾病への罹りやすさの診断に追加しうる、またはその診断を
下しうる診断用ツールを提供するだろう。該遺伝子に突然変異がある個体を、さ
まざまな技法によりDNAレベルで見つけ出すことができる。
【0045】 診断用の核酸は、被験者の細胞、例えば血液、尿、唾液、組織の生検または剖
検材料由来の細胞から得ることができる。検出のためにゲノムDNAを直接使用
してもよいし、分析前にPCRまたは他の増幅法を使ってゲノムDNAを酵素的
に増幅してもよい。同様の方法でRNAまたはcDNAを使用することもできる
。欠失および挿入突然変異は、正常な遺伝子型と比較したときの増幅産物のサイ
ズの変化により検出できる。点突然変異は増幅DNAを標識Fishboyヌクレオチ ド配列とハイブリダイズさせることで同定できる。完全にマッチした配列とミス
マッチの二重鎖とはRNアーゼ消化により、または融解温度の差異により区別で
きる。また、DNA配列の差異は、変性剤を含むもしくは含まないゲルでのDN
A断片の電気泳動の移動度の変化により、または直接DNA塩基配列決定によっ
ても検出できる(例えば、Myersら, Science (1985) 230:1242 を参照のこと) 。特定位置での配列変化はヌクレアーゼプロテクションアッセイ(例えば、RN
アーゼおよびS1プロテクション)または化学的開裂法によっても確認できる(
Cottonら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 85:4397-4401を参照のこと)。
別の実施態様では、例えば、遺伝子変異の効率のよいスクリーニングを行うため
、Fishboyヌクレオチド配列またはその断片を含むオリゴヌクレオチドプローブ のアレイ(array)を構築することができる。アレイ技法は公知で、一般的な適用 可能性を有し、遺伝子発現、遺伝的連鎖および遺伝的変異性を含めた分子遺伝学
のさまざまな問題を解きあかすために用いられている(例えば、M. Cheeら, Sci
ence, Vol.274, pp.610-613 (1996) を参照のこと)。
【0046】 診断アッセイは、前記の方法によりFishboy遺伝子の変異を検出することで、 前記疾患への罹りやすさを診断または判定する方法を提供する。さらに、被験者
から得られたサンプルからポリペプチドまたはmRNAのレベルの異常な低下ま
たは増加を測定する方法により、前記疾患の診断を下すことができる。発現の低
下または増加は、当業界で公知のポリヌクレオチドの定量法、例えば核酸増幅(
例:PCR、RT−PCR)、RNアーゼプロテクション、ノーザンブロッティ
ング、その他のハイブリダイゼーション法のいずれかによりRNAレベルで測定
することができる。宿主から得られたサンプル中の本発明ポリペプチドのような
タンパク質のレベルを測定するアッセイ法は当業者によく知られている。こうし
たアッセイ法として、ラジオイムノアッセイ、競合結合アッセイ、ウエスタンブ
ロット分析、ELISAアッセイなどがある。
【0047】 かくして、もう一つの態様において、本発明は、 (a) 本発明のポリヌクレオチド(好ましくは、配列番号1のヌクレオチド配列
)もしくはその断片、 (b) (a) のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列、 (c) 本発明のポリペプチド(好ましくは、配列番号2のポリペプチド)もしく
はその断片、または (d) 本発明のポリペプチド(好ましくは、配列番号2のポリペプチド)に対す
る抗体、 を含んでなる診断用キットに関する。
【0048】 このようなキットにおいて、(a) 、(b) 、(c) または (d)が実質的な構成成分
であることが理解されよう。かかるキットは疾患または疾患への罹りやすさ、特
に細菌、真菌、原生動物およびウイルス感染などの感染、特にHIV-1またはHIV-2
により引き起こされる感染、疼痛、癌、糖尿病、肥満、食欲不振、過食症、喘息
、パーキンソン病、急性心不全、低血圧症、高血圧症、尿の停留、骨粗しょう症
、狭心症、心筋梗塞、卒中、潰瘍、喘息、アレルギー、良性前立腺肥大、偏頭痛
、嘔吐、精神および神経障害(不安、精神分裂病、躁鬱、鬱、せん妄、重度の精
神遅滞など)、ならびにハンチントン病もしくはジルドラトゥレット症候群(Gil
les dela Tourett's syndrome)を診断するうえで有用である。
【0049】 また、本発明のヌクレオチド配列は染色体の同定にも有用である。この配列は
個々のヒト染色体上の特定の位置をターゲッティングし、その特定位置とハイブ
リダイズすることができる。本発明に従って関連配列の染色体地図を作成するこ
とは、これらの配列と遺伝子関連疾患とを相関させるうえで重要な第一段階であ
る。ひとたび配列が正確な染色体位置にマップされたら、その染色体上のその配
列の物理的位置を遺伝地図データと相関させることができる。この種のデータは
、例えば、V. McKusick, Mendelian Inheritance in Man (Johns Hopkins Unive
rsity Welch Medical Library からオンラインで入手可能) 中に見いだせる。そ
の後、同一の染色体領域にマップされた遺伝子と疾患との関係を連鎖解析(物理
的に隣接した遺伝子の共遺伝)により確認する。
【0050】 罹患個体と非罹患個体とのcDNAまたはゲノム配列の差異も調べることがで
きる。罹患個体の一部または全部に突然変異が観察されるが、どの正常個体にも
観察されない場合は、その突然変異が疾患の原因である可能性がある。
【0051】 本発明のポリペプチド、その断片もしくは類似体、またはそれらを発現する細
胞は、本発明のポリペプチドに免疫特異的な抗体を生産するための免疫原として
も使用することができる。「免疫特異的」とは、その抗体が従来技術における他
の関連ポリペプチドに対するその親和性よりも本発明のポリペプチドに対して実
質的に高い親和性を示すことを意味する。
【0052】 本発明のポリペプチドに対する抗体は、慣用のプロトコールを用いて、動物(
好ましくはヒト以外の動物)に該ポリペプチドまたはエピトープを含む断片、類
似体もしくは細胞を投与することにより得ることができる。モノクローナル抗体
の調製には、連続細胞系の培養物から抗体を産生させる任意の技法を用いること
ができる。例を挙げると、ハイブリドーマ法 (Kohler, G.およびMilstein, C.,
Nature (1975) 256:495-497)、トリオーマ法、ヒトB細胞ハイブリドーマ法 (Ko
zborら, Immunology Today (1983) 4:72) およびEBV−ハイブリドーマ法 (Co
leら, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, pp.77-96, Alan R. Liss,
Inc., 1985) などがある。
【0053】 本発明のポリペプチドに対する一本鎖抗体をつくるために、米国特許第4,946,
778号に記載されるような一本鎖抗体の調製法を適応させることができる。また 、ヒト化抗体を発現させるために、トランスジェニックマウスまたは他の哺乳動
物を含む他の生物を利用することができる。
【0054】 前記の抗体を用いて、そのポリペプチドを発現するクローンを単離・同定した
り、アフィニティークロマトグラフィーでそのポリペプチドを精製することもで
きる。
【0055】 本発明のポリペプチドに対する抗体は、とりわけ、前記疾患の治療に使用でき
る可能性がある。
【0056】 本発明の更なる態様において、本発明は、本発明のポリペプチドまたはその断
片と、各種サブクラス(IgG、IgM、IgA、IgE)の免疫グロブリンの
H鎖またはL鎖の定常領域の様々な部分と、を含んでなる遺伝子工学的に作製さ
れた可溶性融合タンパク質に関する。免疫グロブリンとしてはヒトIgG、特に
IgG1のH鎖の定常部が好ましく、その場合は融合がヒンジ領域で起こる。特
定例では、血液凝固因子Xaで開裂され得る開裂配列を組み込むことで、Fc部
分を簡単に除去できる。さらに、本発明は、これら融合タンパク質の遺伝子工学
的作製方法、並びに薬物スクリーニング、診断および治療におけるそれらの使用
に関する。また、本発明の更なる態様はこのような融合タンパク質をコードする
ポリヌクレオチドに関する。融合タンパク質技術の例は国際特許出願 WO94/2945
8 およびWO94/22914に見いだせる。
【0057】 本発明の更なる態様は哺乳動物において免疫学的応答を引き出す方法に関し、
この方法は、特に前記疾患から該動物を防御するための抗体および/またはT細
胞免疫応答を生ずるのに十分な本発明のポリペプチドを哺乳動物に接種すること
を含んでなる。本発明のさらに別の態様は、哺乳動物を前記疾患から防御する抗
体を産生させるような免疫学的応答を引き出すために、in vivo で本発明のポリ
ペプチドをコードするポリヌクレオチドの発現を指令するベクターを介して該ポ
リペプチドを供給することを含んでなる、哺乳動物において免疫学的応答を引き
出す方法に関する。
【0058】 本発明の更なる態様は、哺乳動物宿主に導入したとき、その哺乳動物において
本発明のポリペプチドに対する免疫学的応答を引き出す免疫学的/ワクチン製剤
(組成物)に関し、この組成物は本発明のポリペプチドまたはポリヌクレオチド
を含有する。ワクチン製剤は適当な担体をさらに含んでいてもよい。ポリペプチ
ドは胃の中で分解される可能性があるので、非経口的に(例えば、皮下、筋肉内
、静脈内または皮内注射により)投与することが好ましい。非経口投与に適した
製剤としては、酸化防止剤、緩衝剤、静菌剤およびこの製剤を受容者の血液と等
張にする溶質を含みうる水性および非水性の無菌注射液、並びに懸濁化剤または
増粘剤を含みうる水性および非水性の無菌懸濁液がある。こうした製剤は1回量
容器または数回量容器(例えば、密閉アンプルおよびバイアル)で提供すること
ができ、また、使用直前に無菌の液状担体を添加するだけでよい凍結乾燥状態で
保管することもできる。ワクチン製剤はこの製剤の免疫原性を増強するためのア
ジュバント系、例えば水中油型のアジュバント系や当業界で公知の他のアジュバ
ント系を含んでいてもよい。投与量はワクチンの比活性により変化するが、ルー
チンな実験操作により簡単に決定できる。
【0059】 本発明のポリペプチドは、多くの病的状態、特に前記疾患を含めて、多くの生
物学的機能に関与している。それゆえ、このポリペプチドの機能を刺激または抑
制する化合物を同定するスクリーニング法を開発することが望ましい。したがっ
て、更なる態様において、本発明は、このポリペプチドの機能を刺激または抑制
する化合物を同定するための化合物のスクリーニング法を提供する。一般的には
、前記疾患の治療および予防目的のためにアゴニストまたはアンタゴニストが使
用される。種々の供給源、例えば、細胞、無細胞調製物、化学物質ライブラリー
および天然産物の混合物から化合物を同定することができる。このように同定さ
れたアゴニスト、アンタゴニストまたはインヒビターは、場合により、該ポリペ
プチドの天然のまたは修飾された基質、リガンド、受容体、酵素などであってよ
く、また、その構造的または機能的なミメティックであってもよい(Coliganら,
Current Protocols in Immunology 1(2): Chapter 5 (1991)を参照のこと)。
【0060】 スクリーニング法では、本発明のポリペプチド、または該ポリペプチドを担持
する細胞もしくは膜、またはその融合タンパク質への候補化合物の結合を、候補
化合物に直接または間接的に結合された標識を用いて簡単に測定できる。あるい
はまた、スクリーニング法では標識した競合物質との競合を用いることもある。
さらに、こうしたスクリーニング法では、候補化合物がポリペプチドの活性化ま
たは抑制により生ずるシグナルを結果的にもたらすか否かを、該ポリペプチドを
担持する細胞に適した検出系を用いて試験することができる。一般的には、既知
のアゴニストの存在下で活性化のインヒビターをアッセイして、アゴニストによ
る活性化に候補化合物の存在が与える影響を調べる。アゴニストまたはインヒビ
ターの不在下で、候補化合物がポリペプチドの活性化を抑制するか否かを調べる
ことによる逆アゴニストまたはインヒビターのスクリーニング法では、構成的に
活性のあるポリペプチドが用いられる。さらに、これらのスクリーニング法は、
候補化合物と本発明のポリペプチドを含む溶液とを混ぜ合わせて混合物をつくり
、この混合物中のFishboy活性を測定し、そしてこの混合物のFishboy活性をスタ
ンダードと比較する各ステップを単に含むだけでよい。本発明のポリペプチドの
アンタゴニストを同定するハイスループットスクリーニングアッセイでは、上記
のようなFc部分とFishboyポリペプチドから作製されるような融合タンパク質 も使用することができる(D. Bennettら, J. Mol. Recognition, 8:52-58 (1995)
およびK. Johansonら, J. Biol. Chem., 270(16):9459-9471 (1995)を参照のこ
と)。
【0061】 あるスクリーニング技術は、受容体の活性化により引き起こされる細胞外のpH
または細胞内カルシウムの変化を測定する系における、本発明の受容体を発現す
る細胞(例えば、トランスフェクトしたCHO細胞)の使用を含む。この技術では 、化合物を本発明の受容体ポリペプチドを発現する細胞と接触させ得る。次に第
2メッセンジャーの応答、例えばシグナル伝達、pH変化、またはカルシウムレベ ルの変化を測定し、その候補化合物が受容体を活性化するか阻害するかを判定す
る。
【0062】 別の方法は、受容体を介したcAMPおよび/またはアデニル酸シクラーゼ蓄積の
抑制または刺激を測定することによる受容体インヒビターのスクリーニングを含
む。そのような方法は、本発明の受容体を用いて真核細胞をトランスフェクトし
、該細胞表面上に該受容体を発現させることを含む。次いで、該細胞を本発明の
受容体の存在下で潜在的なアンタゴニストに曝露する。その後、cAMPの蓄積量を
測定する。潜在的なアンタゴニストが該受容体に結合し、受容体結合を抑制する
ならば、受容体を介したcAMPまたはアデニル酸シクラーゼ活性のレベルは減少す
るかまたは増大するであろう。本発明の受容体に対するアゴニストまたはアンタ
ゴニストを検出するための別の方法は、米国特許第5,482,835号に記載されたよ うな酵母に基づく技術である。
【0063】 また、本発明のポリヌクレオチド、ポリペプチドまたは該ポリペプチドに対す
る抗体を用いて、細胞内でのmRNAまたはポリペプチドの産生に及ぼす添加化
合物の作用を検出するためのスクリーニング法を組み立てることができる。例え
ば、当業界で公知の標準方法によりモノクローナルまたはポリクローナル抗体を
用いて、ポリペプチドの分泌レベルまたは細胞結合レベルを測定するためのEL
ISAアッセイを構築することができ、これは適切に操作された細胞または組織
からのポリペプチドの産生を抑制または増強する物質(それぞれアンタゴニスト
またはアゴニストともいう)の探索に用いることができる。
【0064】 膜に結合した受容体または可溶性の受容体が存在するのであれば、当業界で公
知の標準的な受容体結合法によりこの種の受容体を同定するために本発明のポリ
ペプチドを用いることができる。こうした受容体結合法には、限定するものでは
ないが、リガンド結合アッセイおよび架橋アッセイがあり、これらのアッセイで
は、ポリペプチドを放射性アイソトープ(例:125I)で標識するか、化学的に修
飾(例:ビオチン化)するか、または検出や精製に適したペプチド配列に融合さ
せ、そして推定上の受容体源(細胞、細胞膜、細胞上清、組織抽出物、体液など
)とインキュベートする。その他の方法としては、表面プラズモン共鳴および分
光学のような生物物理的方法がある。これらのスクリーニング法は、該ポリペプ
チドの(存在するのであれば)その受容体への結合と競合する該ポリペプチドの
アゴニストまたはアンタゴニストを同定するために用いることもできる。スクリ
ーニングアッセイを行うための標準的な方法は当業界でよく理解されている。
【0065】 本発明のポリペプチドの潜在的なアンタゴニストの例としては、抗体、ある場
合には、該ポリペプチドのリガンド、基質、受容体、酵素などと密接な関係があ
るオリゴヌクレオチドもしくはタンパク質(例えば、リガンド、基質、受容体、
酵素などの断片)、または本発明のポリペプチドと結合するが応答を誘導しない
(それゆえ該ポリペプチドの活性を妨げる)小分子などがある。
【0066】 かくして、他の態様において、本発明は、本発明のポリペプチドのアゴニスト
、アンタゴニスト、リガンド、受容体、基質、酵素など、またはこの種のポリペ
プチドの産生を低下または増加させる化合物を同定するためのスクリーニングキ
ットに関し、このキットは、 (a) 本発明のポリペプチド、 (b) 本発明のポリペプチドを発現している組換え細胞、 (c) 本発明のポリペプチドを発現している細胞膜、または (d) 本発明のポリペプチドに対する抗体、 を含んでなり、前記ポリペプチドは好ましくは配列番号2のポリペプチドである
。 このようなキットにおいて、(a) 、(b) 、(c) または (d)が実質的な構成成
分であることが理解されよう。
【0067】 当業者であれば、本発明のポリペプチドは、その構造に基づいて該ポリペプチ
ドのアゴニスト、アンタゴニストまたはインヒビターを設計する方法にも使用で
きることが容易に理解されよう。この方法は、 (a) 最初に該ポリペプチドの三次元構造を解析し、 (b) アゴニスト、アンタゴニストまたはインヒビターの確実と思われる反応部
位または結合部位の三次元構造を想定し、 (c) 想定された結合部位または反応部位と結合または反応すると予想される候
補化合物を合成し、そして (d) その候補化合物が実際にアゴニスト、アンタゴニストまたはインヒビター
であるか否かを調べる、 ことを含んでなる。これは通常反復プロセスであることがさらに理解されよう。
【0068】 更なる態様において、本発明は、Fishboyポリペプチド活性の過剰量と不足量 のいずれかに関係した、例えば、細菌、真菌、原生動物およびウイルス感染など
の感染、特にHIV-1またはHIV-2により引き起こされる感染、疼痛、癌、糖尿病、
肥満、食欲不振、過食症、喘息、パーキンソン病、急性心不全、低血圧症、高血
圧症、尿の停留、骨粗しょう症、狭心症、心筋梗塞、卒中、潰瘍、喘息、アレル
ギー、良性前立腺肥大、偏頭痛、嘔吐、精神および神経障害(不安、精神分裂病
、躁鬱、鬱、せん妄、重度の精神遅滞など)、ならびにハンチントン病もしくは
ジルドラトゥレット症候群(Gilles dela Tourett's syndrome)などの運動障害の
異常な状態の治療法を提供する。
【0069】 該ポリペプチドの活性が過剰である場合は、いくつかのアプローチが利用可能
である。一つのアプローチは、例えば、リガンド、基質、受容体、酵素などの結
合をブロックすることにより、または第2のシグナルを抑制することで異常な状
態を軽減することにより、該ポリペプチドの機能を抑制するのに有効な量で、上
記のインヒビター化合物(アンタゴニスト)を場合により製剤学上許容される担
体とともに被験者に投与することを含んでなる。もう一つのアプローチでは、内
因性のポリペプチドとの競合状態でリガンド、基質、酵素、受容体などと結合す
る能力がまだある可溶性形態のポリペプチドを投与することができる。このよう
な競合物質の典型的な例はFishboyポリペプチドの断片である。
【0070】 さらに別のアプローチでは、発現阻止法を使って内因性Fishboyポリペプチド をコードする遺伝子の発現を抑制することができる。こうした公知技術は、体内
で産生されるか外部から投与されるアンチセンス配列の使用を必要とする(例え
ば、Oligodeoxynucleotides as Antisense Inhibitors of Gene Expression (遺
伝子発現のアンチセンスインヒビターとしてのオリゴデオキシヌクレオチド), C
RC Press, Boca Raton, FL (1988) 中のO'Connor, J. Neurochem (1991) 56:560
を参照のこと)。あるいはまた、この遺伝子と共に三重らせんを形成するオリゴ
ヌクレオチドを供給することもできる(例えば、Leeら, Nucleic Acids Res (19
79) 6:3073; Cooneyら, Science (1988) 241:456; Dervanら, Science (1991) 2
51:1360 を参照のこと)。これらのオリゴマーはそれ自体を投与することもでき
るし、関連オリゴマーをin vivo で発現させることもできる。
【0071】 Fishboyおよびその活性の過少発現に関係した異常な状態を治療する場合も、 いくつかのアプローチを取ることができる。一つのアプローチは、治療に有効な
量の本発明ポリペプチドを活性化する化合物(すなわち、前記アゴニスト)を製
剤学上許容される担体とともに被験者に投与して、異常な状態を緩和することを
含んでなる。別法として、被験者の関連細胞においてFishboyを内因的に産生さ せるために遺伝子治療を用いることができる。例えば、上で述べたような複製欠
損レトロウイルスベクターによる発現のために本発明のポリヌクレオチドを遺伝
子操作する。次にレトロウイルス発現構築物を単離し、本発明のポリペプチドを
コードするRNAを含有するレトロウイルスプラスミドベクターで形質導入され
たパッケージング細胞に導入する。その結果、パッケージング細胞は対象の遺伝
子を含有する感染性のウイルス粒子を産生するようになる。in vivo 細胞操作お
よびin vivo ポリペプチド発現のために、これらのプロデューサー細胞を被験者
に投与する。遺伝子治療の概論に関しては、Human Molecular Genetics, T Stra
chan and A P Read, BIOS Scientific Publishers Ltd (1996)中のChapter 20,
Gene Therapy and other Molecular Genetic-based Therapeutic Approaches(お
よびその中の引用文献) を参照のこと。もう一つのアプローチは治療量の本発明
のポリペプチドを適当な製剤学上の担体とともに投与することである。
【0072】 更なる態様において、本発明は、治療に有効な量のポリペプチド(例えば、可
溶性形態の本発明ポリペプチド)、アゴニストもしくはアンタゴニストペプチド
、または小分子化合物を製剤学上許容される担体または賦形剤と共に含有する医
薬組成物を提供する。この種の担体としては、食塩水、生理食塩水、デキストロ
ース、水、グリセロール、エタノール、およびこれらの組合せがあるが、これら
に限らない。本発明はさらに、上記の本発明の組成物の1以上の成分を充填した
1以上の容器を含んでなる医薬パックおよびキットに関する。本発明のポリペプ
チドおよび他の化合物は単独で使用しても、他の化合物、例えば治療用化合物と
一緒に使用してもよい。
【0073】 医薬組成物は投与経路、例えば全身または経口による投与経路に適合させるこ
とができる。全身投与に適した形態は、注入、典型的には静注である。皮下、筋
肉内または腹腔内のような他の注入経路も使用できる。全身投与の別の手段には
、胆汁酸塩、フシジン酸、その他の界面活性剤などの浸透剤を用いた経粘膜およ
び経皮投与がある。さらに、本発明のポリペプチドまたは他の化合物を腸溶剤ま
たはカプセル剤として製剤化し得るのであれば、経口投与も可能である。これら
の化合物を軟膏、ペースト、ゲルなどの剤形で局所に投与しても、かつ/または
局在化させてもよい。
【0074】 必要な投与量範囲は、本発明のペプチドまたは他の化合物の選択、投与経路、
製剤の性質、被験者の状態、そして医師の判断に左右される。しかし、適当な投
与量は被験者の体重1kgあたり0.1〜100μgの範囲である。入手可能な化合物が 多様であること、投与経路の効率が異なることを考慮すれば、必要とされる投与
量は広範に変動することが予測される。例えば、経口投与は静注による投与より
も高い投与量を必要とすると予想されよう。こうした投与量レベルの変動は、当
業界でよく理解されているような、標準的経験的な最適化手順を用いて調整する
ことができる。
【0075】 治療に用いるポリペプチドは、上述したような「遺伝子治療」と称する治療法
において、被験者の体内で産生させることもできる。例えば、被験者由来の細胞
を、ポリペプチドをコードするDNAまたはRNAのようなポリヌクレオチドに
より、例えばレトロウイルスプラスミドベクターを用いて、ex vivo で遺伝子工
学的に操作する。その後、これらの細胞を被験者に導入する。
【0076】 ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの配列は、類似の相同性を有する別の配
列を同定する際の価値ある情報源を提供する。これは、こうした配列をコンピュ
ータ読み取り可能媒体中に保存し、次に保存したデータを用いてGCGなどの公
知の検索ツールにより配列データベースを検索することで最大限促進される。し
たがって、更なる態様において、本発明は、配列番号1の配列を含んでなるポリ
ヌクレオチドおよび/またはそれによりコードされるポリペプチドを保存したコ
ンピュータ読み取り可能媒体を提供する。
【0077】 以下の定義は上記の説明中でしばしば用いられた用語を理解しやすくするため
のものである。
【0078】 本明細書中で用いる「抗体」には、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体
、キメラ抗体、一本鎖抗体、ヒト化抗体、さらにFabまたは他の免疫グロブリ
ン発現ライブラリーの産物を含むFabフラグメントが含まれる。
【0079】 「単離された」とは、天然の状態から「人間の手によって」改変されたことを
意味する。「単離された」組成物または物質が天然に存在するのであれば、それ
はそのもとの環境から変化しているか分離されており、またはその両方である。
例えば、生存している動物の体内に自然界で存在するポリヌクレオチドまたはポ
リペプチドは「単離された」ものではないが、その天然状態の共存物質から分離
されたポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、本明細書中で用いられるように
、「単離された」ものである。
【0080】 「ポリヌクレオチド」とは、一般に任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデ
オキシリボヌクレオチドをさし、これは修飾されていないRNAもしくはDNA
、または修飾されたRNAもしくはDNAであり得る。「ポリヌクレオチド」に
は、制限するものではないが、一本鎖および二本鎖DNA、一本鎖領域と二本鎖
領域が混じり合ったDNA、一本鎖および二本鎖RNA、一本鎖領域と二本鎖領
域が混じり合ったRNA、DNAとRNAを含むハイブリッド分子(一本鎖でも
、またはより典型的には二本鎖でもよく、一本鎖領域と二本鎖領域が混じり合っ
たものでもよい)が含まれる。加えて、「ポリヌクレオチド」はRNAまたはD
NAまたはRNAとDNAの両方からなる三重鎖領域を意味する。「ポリヌクレ
オチド」という用語はまた、1個以上の修飾塩基を含有するDNAまたはRNA
、および安定性または他の理由のために修飾された骨格を有するDNAまたはR
NAも含む。「修飾」塩基としては、例えば、トリチル化された塩基およびイノ
シンのような特殊な塩基がある。DNAおよびRNAに対してさまざまな修飾を
行うことができる。こうして、「ポリヌクレオチド」は、自然界に一般的に存在
するポリヌクレオチドの化学的、酵素的または代謝的に修飾された形態、並びに
ウイルスおよび細胞に特徴的なDNAおよびRNAの化学的形態を包含する。ま
た、「ポリヌクレオチド」は、しばしばオリゴヌクレオチドと称される比較的短
いポリヌクレオチドも包含する。
【0081】 「ポリペプチド」とは、ペプチド結合または修飾されたペプチド結合(すなわ
ち、ペプチドアイソスター)により互いに連結された2個以上のアミノ酸を含む
ペプチドまたはタンパク質を意味する。「ポリペプチド」は短鎖(通常はペプチ
ド、オリゴペプチドまたはオリゴマーという)と長鎖(一般的にはタンパク質と
いう)の両方をさす。ポリペプチドは20種類の遺伝子コード化アミノ酸以外の
アミノ酸を含んでもよい。「ポリペプチド」は、翻訳後プロセシングのような天
然のプロセスで、または当業界で公知の化学的修飾法のいずれかで修飾されたア
ミノ酸配列を含む。このような修飾は基本的な教科書、より詳細な学術論文およ
び研究文献に詳述されている。修飾はペプチド骨格、アミノ酸側鎖、アミノまた
はカルボキシル末端を含めてポリペプチドのどこでも行うことができる。同じタ
イプの修飾が所定のポリペプチドのいくつかの部位に同程度でまたはさまざまに
異なる程度で存在してもよい。また、所定のポリペプチドが多くのタイプの修飾
を含んでいてもよい。ポリペプチドはユビキチン化のために分枝していても、分
枝のある又はない環状であってもよい。環状の、分枝した、または分枝した環状
のポリペプチドは翻訳後の天然プロセスから生じることがあり、また、合成法に
よって製造することもできる。修飾としては、アセチル化、アシル化、ADP−
リボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチ
ドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、ホ
スファチジルイノシトールの共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合の形成、
脱メチル化、共有結合架橋の形成、シスチンの形成、ピログルタメートの形成、
ホルミル化、γ−カルボキシル化、グリコシル化、GPIアンカー形成、ヒドロ
キシル化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質分解プロセ
シング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、アルギニル
化のようなタンパク質へのアミノ酸の転移RNA媒介付加、ユビキチン化などが
ある(例えば、Proteins - Structure and Molecular Properties, 2nd Ed., T.
E. Creighton, W.H. Freeman and Company, New York, 1993; Posttranslationa
l Covalent Modification of Proteins, B.C. Johnson編, Academic Press, New
York, 1983中のWold, F., Post-translational Protein Modifications: Persp
ectives and Prospects, pgs. 1-12; Seifterら, “Analysis for protein modi
fications and nonprotein cofactors", Meth Enzymol (1990) 182:626-646; お
よび Rattanら, “Protein Synthesis: Post-translational Modifications and
Aging", Ann NY Acad Sci (1992) 663:48-62 を参照のこと)。
【0082】 「変異体」とは、基準のポリヌクレオチドまたはポリペプチドと異なるが、不
可欠な性質を保持しているポリヌクレオチドまたはポリペプチドのことである。
典型的なポリヌクレオチドの変異体は基準ポリヌクレオチドとヌクレオチド配列
の点で相違する。この変異体のヌクレオチド配列の変化は、基準ポリヌクレオチ
ドによってコードされるポリペプチドのアミノ酸配列を変更しても、しなくても
よい。ヌクレオチドの変化は、以下で述べるように、基準配列によりコードされ
るポリペプチドのアミノ酸の置換、欠失、付加、融合および末端切断(トランケ
ーション)をもたらしうる。典型的なポリペプチドの変異体は基準ポリペプチド
とアミノ酸配列の点で相違する。一般的には、基準ポリペプチドの配列と変異体
の配列が全般的によく類似しており、多くの領域で同一となるような相違に限ら
れる。変異体と基準ポリペプチドは任意に組み合わせた1以上の置換、欠失、付
加によりアミノ酸配列が相違していてよい。置換または挿入されるアミノ酸残基
は遺伝子コードによりコードされるものであっても、なくてもよい。ポリヌクレ
オチドまたはポリペプチドの変異体はアレル変異体のように天然に存在するもの
でも、天然に存在することが知られていない変異体であってもよい。ポリヌクレ
オチドおよびポリペプチドの天然に存在しない変異体は、突然変異誘発法または
直接合成により作製することができる。
【0083】 当技術分野で知られた「同一性」とは、ポリペプチド配列またはポリヌクレオ
チド配列の比較により決定された、2以上のかかる配列間の関連性のことである
。当技術分野ではまた、「同一性」はポリペプチド配列またはポリヌクレオチド
配列の鎖間のマッチ(match)により決定された、このような配列間の配列関連性 の程度を意味する。「同一性」は公知の方法により難なく算出することができ、
こうした方法として、例えば Computational Molecular Biology, Lesk, A.M.編
, Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and
Genome Projects, Smith, D.W. 編, Academic Press, New York, 1993; Comput
er Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M. and Griffin, H.G. 編
, Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology
, von Heinje, G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer, Gribsk
ov, M. and Devereux, J. 編, M Stockton Press, New York, 1991; および Car
illo, H. and Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988) に記載さ
れた方法があるが、これらに限らない。同一性を決定するための方法は、検討す
る配列間で最大級のマッチが得られるように設計される。さらに、同一性を決定
する方法は一般に入手可能なコンピュータプログラムに編集されている。2配列
間の同一性を決定するコンピュータプログラム法としては、GCGプログラムパ
ッケージ (Devereux, J.ら, Nucleic Acids Research 12(1):387 (1984))、BL
ASTP、BLASTNおよびFASTA (Atschul, S.F.ら, J. Molec. Biol.
215:403-410 (1990)) があるが、これらに限らない。BLAST Xプログラム
はNCBIおよび他のソースから一般に入手可能である (BLAST Manual, Altsch
ul, S.ら, NCBI NLM NIH Bethesda, MD 20894; Altschul, S.ら, J. Mol. Biol.
215: 403-410 (1990))。公知のSmith Watermanアルゴリズムも同一性の決定に 使用することができる。
【0084】 ポリペプチド配列を比較するためのパラメーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman & Wunsch, J. Mol. Biol. 48: 443-453 (1970); 比較マトリックス:BLOSSUM62 、Hentikoff and Hentikoff, Proc. Natl. Aca
d. Sci. USA, 89: 10915-10919 (1992) ギャップペナルティー:12 ギャップ長ペナルティー:4 これらのパラメーターと共に役に立つプログラムは Genetics Computer Group
(Madison WI)から「gap」プログラムとして一般に入手可能である。前記のパ
ラメーターはペプチド比較のためのデフォルトパラメーター(default parameter
) である(末端ギャップのペナルティーは無し)。
【0085】 ポリヌクレオチド配列を比較するためのパラメーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman & Wunsch, J. Mol. Biol. 48: 443-453 (1970); 比較マトリックス:マッチ=+10、ミスマッチ=0 ギャップペナルティー:50 ギャップ長ペナルティー:3 これらのパラメーターと共に役に立つプログラムは Genetics Computer Group
(Madison WI)から「gap」プログラムとして入手可能である。これらのパラメ
ーターは核酸比較のためのデフォルトパラメーターである。
【0086】 ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの「同一性」のための好ましい方法は、
下記の(1)および(2)に提供される。
【0087】 (1) ポリヌクレオチドの具体例は、配列番号1の基準配列に対して少なくとも
50、60、70、80、85、90、95、97または100%の同一性を有するポリヌクレオチ ド配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチドをさらに含む。前記ポリヌクレ
オチド配列は配列番号1の基準配列と同一であっても、該基準配列に対して、あ
る整数個までのヌクレオチド変異を含んでいてもよい。前記変異は少なくとも1
個のヌクレオチドの欠失、置換(トランジションおよびトランスバージョンを含
む)または挿入よりなる群から選択され、こうした変異は基準ヌクレオチド配列
の 5'もしくは 3'末端位置、またはこれらの末端位置の間のどこに存在してもよ
く、基準配列中のヌクレオチドの間に個々に、または基準配列内に1以上の連続
するグループとして介在することができる。ヌクレオチド変異の数は、配列番号
1のヌクレオチドの総数に、それぞれの(100で割った)同一性%値を掛け、そ の積を配列番号1のヌクレオチドの総数から差し引くことにより、すなわち、次
式: nn ≦xn −(xn・y) により求めることができる。式中、nnはヌクレオチド変異の数であり、xnは配
列番号1のヌクレオチドの総数であり、yは50%については0.50、60%について
は0.60、70%については0.70、80%については0.80、85%については0.85、90%
については0.90、95%については0.95、97%については0.97または100%につい ては1.00であり、・は乗法演算子を表す記号であり、xnとyの非整数の積は、 その積をxnから引く前に、最も近似する整数に切り下げる。配列番号2のポリ ペプチドをコードするポリヌクレオチド配列の改変は、そのコード配列にナンセ
ンス、ミスセンスまたはフレームシフト突然変異を生じさせ、それにより、こう
した変異後に該ポリヌクレオチドによりコードされたポリペプチドを改変させる
ことができる。
【0088】 例として、本発明のポリヌクレオチド配列は、配列番号2の基準配列と同一で
ある、すなわち基準配列に対して100%の同一性を有するか、または同一性%が1
00%未満となるように基準配列に対してある整数個までのアミノ酸変異を含むこ
とができる。前記変異は少なくとも1個の核酸の欠失、置換(トランジションお
よびトランスバージョンを含む)または挿入よりなる群から選択され、こうした
変異は基準ポリヌクレオチド配列の 5'もしくは 3'末端位置、またはこれらの末
端位置の間のどこに存在してもよく、基準配列中の核酸の間に個々に、または基
準配列内に1以上の連続するグループとして介在することができる。核酸変異の
数は、配列番号2のアミノ酸の総数に、それぞれの(100で割った)同一性%値 を掛け、その積を配列番号2のアミノ酸の総数から差し引くことにより、すなわ
ち、次式: nn≦xn−(xn・y) により求めることができる。式中、nnはアミノ酸変異の数であり、xnは配列番
号2中のアミノ酸の総数であり、yは例えば70%については0.70、80%について
は0.80、85%については0.85などであり、・は乗法演算子を表す記号であり、x n とyの非整数の積は、その積をxnから引く前に、最も近似する整数に切り下げ
る。
【0089】 (2) ポリペプチドの具体例は、配列番号2の基準配列に対して少なくとも50、
60、70、80、85、90、95、97または100%の同一性を有するポリペプチドを含ん でなる単離されたポリペプチドをさらに含む。前記ポリペプチド配列は配列番号
2の基準配列と同一であっても、該基準配列に対して、ある整数個までのアミノ
酸変異を含んでいてもよい。このような変異は少なくとも1個のアミノ酸の欠失
、置換(保存的および非保存的アミノ酸置換を含む)または挿入よりなる群から
選択され、これらの変異は基準ポリペプチド配列のアミノもしくはカルボキシ末
端位置、またはこれらの末端位置の間のどこに存在してもよく、基準配列中のア
ミノ酸の間に個々に、または基準配列内に1以上の連続したグループとして点在
することができる。アミノ酸変異の数は、配列番号2中のアミノ酸の総数にそれ
ぞれの(100で割った)同一性%の数値を掛け、その積を配列番号2中のアミノ 酸の総数から引くことにより、すなわち次式: na≦xa−(xa・y) により求められる。式中、naはアミノ酸変異の数であり、xaは配列番号2中の
アミノ酸の総数であり、yは50%については0.50、60%については0.60、70%に
ついては0.70、80%については0.80、85%については0.85、90%については0.90
、95%については0.95、97%については0.97または100%については1.00であり 、・は乗法演算子を表す記号であり、xaとyの非整数の積は、その積をxaから
引く前に、最も近似する整数に切り下げる。
【0090】 例として、本発明のポリペプチド配列は、配列番号2の基準配列と同一である
、すなわち基準配列に対して100%の同一性を有するか、または同一性%が100%
未満となるように基準配列に対してある整数個までのアミノ酸変異を含むことが
できる。このような変異は少なくとも1個のアミノ酸の欠失、置換(保存的およ
び非保存的アミノ酸置換を含む)または挿入よりなる群から選択され、これらの
変異は基準ポリペプチド配列のアミノもしくはカルボキシ末端位置、またはこれ
らの末端位置の間のどこに存在してもよく、基準配列中のアミノ酸の間に個々に
、または基準配列内に1以上の連続したグループとして点在することができる。
アミノ酸変異の数は、配列番号2中のアミノ酸の総数にそれぞれの(100で割っ た)同一性%の数値を掛け、その積を配列番号2中のアミノ酸の総数から引くこ
とにより、すなわち次式: na≦xa−(xa・y) により求められる。式中、naはアミノ酸変異の数であり、xaは配列番号2中の
アミノ酸の総数であり、yは例えば70%については0.70、80%については0.80、
85%については0.85等であり、・は乗法演算子を表す記号であり、xaとyの非 整数の積は、その積をxaから引く前に、最も近似する整数に切り下げる。
【0091】 「融合タンパク質」とは、2つの、しばしば無関係の、融合された遺伝子また
はその断片によりコードされるタンパク質のことである。一例として、EP-A-0 4
64には、免疫グロブリン分子の定常領域の様々な部分と他のヒトタンパク質また
はその一部とを含んでなる融合タンパク質が記載されている。多くの場合、治療
および診断における使用には、融合タンパク質の一部として免疫グロブリンFc
領域を使用することが有利であり、これにより例えば薬物速度論的性質が向上す
る(例えば、EP-A- 0232 262を参照のこと)。一方、いくつかの使用にとっては
、その融合タンパク質を発現させ、検出し、精製した後でFc部分を除去するこ
とが望ましいだろう。
【0092】 本明細書中に引用された、特許および特許出願明細書を含めた全ての刊行物は
、あたかも各刊行物が明確にかつ個々に示されているかのように、その全体を参
考としてここに組み入れるものとする。実施例 実施例1:哺乳動物細胞における発現 本発明の受容体を、ヒト胚腎293(HEK293)細胞または付着性dhfr CHO細胞の いずれかにおいて発現させた。受容体の発現を最大にするために、pCDNまたは pCDNA3ベクターへ挿入する前に、一般的には全ての5'および3'非翻訳領域(U
TRs)を受容体cDNAから取り除いた。これらの細胞をリポフェクチンを用いて個 々の受容体cDNAによりトランスフェクトし、400 mg/mlのG418の存在下で選択 した。3週間の選択後に、個々のクローンを拾い、さらなる分析のために増殖さ せた。ベクターのみでトランスフェクトしたHEK293またはCHO細胞を陰性対照と して使用した。個々の受容体を安定して発現している細胞系を単離するために、
一般的に約24個のクローンを選択し、ノーザンブロット分析により分析した。受
容体mRNAは、通常、分析したG418耐性クローンの約50%において検出可能であ った。
【0093】 実施例2:結合アッセイおよび機能アッセイ用のリガンドバンク(bank) 200を越える推定上の受容体リガンドのバンクがスクリーニングのために集成 された。このバンクには以下のものが含まれる。すなわち、ヒトの7回膜貫通型
(7TM)受容体を介して作用することが知られている伝達物質、ホルモンおよびケ モカイン;ヒト7TM受容体の推定上のアゴニストでありうる、天然に存在する化 合物;非哺乳動物の生理活性ペプチド(哺乳動物の対応物は未だ同定されていな い);および天然には見出せないが未知の天然リガンドと共に7TM受容体を活性 化する化合物である。このバンクは結合アッセイと機能(すなわち、カルシウム 、cAMP、ミクロフィジオメーター( microphysiometer )、卵母細胞電気生理学な
ど、以下を参照)アッセイの両方を用いて、既知のリガンドに対する該受容体を 最初にスクリーニングするために使用された。
【0094】 実施例3:リガンド結合アッセイ リガンド結合アッセイは受容体薬理学をつきとめるための直接的な方法を提供
し、また高処理量方式にも適用が可能である。受容体の精製リガンドを結合実験
のために高い比活性( 50−2000 Ci/mmol )で放射性標識した。次に、放射性標 識化のプロセスがその受容体に対するリガンドの活性を低下させないことを確か
めた。緩衝液、イオン、pHおよびヌクレオチドのような他のモジュレーターにつ
いてのアッセイ条件を最適化し、膜および全細胞の両受容体源についての実施可
能な生じうるシグナル対ノイズ比を確立した。これらのアッセイのために、特異
的受容体結合を、全結合放射能から、過剰の未標識競合リガンドの存在下で測定
した放射能を差し引いた値として定義した。可能であれば、2以上の競合リガン
ドを用いて残留する非特異的な結合を確定する。
【0095】 実施例4:アフリカツメガエル卵母細胞における機能アッセイ 本発明の受容体cDNAをコードする線状化プラスミドの鋳型からのキャップした
RNA転写物を、標準的な手法に従い、in vitroでRNAポリメラーゼを使用して合成
した。in vitroでの転写物を最終濃度0.2 mg/mlで水中に懸濁した。卵巣葉(ova
rian lobes)を成熟雌カエルから取り出し、ステージVの脱濾胞化卵母細胞を得て
、RNA転写物(10ng/卵母細胞)を微量注入装置を用いて50nlで単回注入した。2 つの電極電位クランプを用いて、アゴニストへの暴露に応答した個々のアフリカ
ツメガエルの卵母細胞からの電流を測定した。室温でCa2+を含まないバース(Bar
th's)培地中で記録を行なった。このアフリカツメガエル系を使用して、活性化 用リガンドについての既知のリガンドおよび組織/細胞抽出物をスクリーニング
することができる。
【0096】 実施例5:ミクロフィジオメトリックアッセイ 多様な第二メッセンジャー系の活性化により、細胞から少量の酸が放出される
。この酸は主として細胞内のシグナル伝達プロセスを活気づけるために必要な代
謝活性が増強した結果として産出される。この細胞を取り巻く培地におけるpH
の変化は非常に小さいが、サイトセンサー( CYTOSENSOR )ミクロフィジオメータ
ー( Mole cular Devices Ltd., Menlo Park,CA )により検出できる。したがっ
て、このサイトセンサーは本発明のGタンパク質共役型受容体のような、細胞内
シグナル伝達経路を利用するエネルギーに共役する受容体の活性化を検出するこ
とができる。
【0097】 実施例6:抽出物/細胞上清スクリーニング 多くの哺乳動物受容体が存在するが、今のところ同一動物種(cognate)の活性 化用リガンド(アゴニスト)は見つかっていない。したがって、これらの受容体を
活性化するリガンドは、今日までに同定されたリガンドバンクには含まれていな
い可能性がある。よって、本発明の7TM受容体もまた、天然のリガンドを同定す
るために組織抽出物に対して機能的に(カルシウム、cAMP、ミクロフィジオメー ター、卵母細胞電気生理学などの機能スクリーンを使用して)スクリーニングさ れた。陽性の機能的な応答を示す抽出物を、活性化用リガンドが単離され同定さ
れるまで順次サブ分画することができる。
【0098】 実施例7:カルシウムおよびcAMP機能アッセイ HEK293細胞で発現された7TM受容体は、PLCおよびカルシウムの動員活性化 および/またはcAMPの刺激または阻害と機能的に共役することが示された。受容
体トランスフェクト細胞またはベクター対照細胞におけるHEK293細胞中の基礎カ
ルシウムレベルは、正常な100nM〜200nMの範囲で観察された。組換え受容体を発
現しているHEK293細胞を、fura2を添加し、一日で>150個の選択したリガンド または組織/細胞抽出物をアゴニスト誘導カルシウム動員について評価した。同
様に、組換え受容体を発現しているHEK293細胞を標準的なcAMP定量アッセイを用
いて、cAMP産生の刺激または阻害について評価した。一時的にカルシウムを動員
する、またはcAMPの変動を示すアゴニストをベクター対照細胞で試験し、このと
きの応答が受容体を発現しているトランスフェクト細胞に特有なものであるかど
うかを決定した。配列情報 配列番号1
【0099】 配列番号2
【0100】 配列番号3
【0101】 配列番号4
【配列表】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C07K 16/28 C12N 1/15 4C085 C12N 1/15 1/19 4H045 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 C12Q 1/02 15/09 ZNA A61K 37/02 C12P 21/02 C12N 5/00 A C12Q 1/02 15/00 ZNAA (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),JP (72)発明者 レーン,パメラ,エイ. アメリカ合衆国 19401 ペンシルバニア 州,ノリスタウン,コルトン ドライブ 31 (72)発明者 ツイ,ピン アメリカ合衆国 19312 ペンシルバニア 州,ベルウィン, ベルウィン‐パオリ ロード 1237 (72)発明者 ボーター,リサ アメリカ合衆国 18036 ペンシルバニア 州,クーパースバーグ,エバート ロード 1075 Fターム(参考) 4B024 AA01 AA11 BA44 BA63 CA04 DA02 DA05 DA11 EA04 GA03 GA11 HA01 4B063 QA01 QA19 QQ03 QR33 QR77 QR80 QS05 QS36 QX02 4B064 AG20 AG27 CA01 CA10 CA19 CA20 CC24 DA01 DA13 4B065 AA01X AA57X AA87X AB01 AB02 BA02 BA08 CA24 CA25 CA44 CA46 4C084 AA02 AA06 AA07 BA01 BA08 BA22 BA23 MA01 NA14 ZA032 ZA052 ZA082 ZA122 ZA152 ZA182 ZA222 ZA362 ZA392 ZA402 ZA422 ZA432 ZA592 ZA662 ZA682 ZA702 ZA712 ZA812 ZA832 ZA972 ZB132 ZB322 ZB332 ZC352 ZC412 ZC422 ZC552 4C085 AA13 AA14 CC32 EE01 4H045 AA10 AA11 BA10 CA40 DA50 DA76 EA20 EA50 FA72 FA74

Claims (14)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 以下の(i)〜(iii)からなる群より選択される単離されたポリ
    ペプチド; (i) 配列番号2の全長に渡る配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも(a)
    70%の同一性、(b) 80%の同一性、(c) 90%の同一性、または(d) 95%の同一性を有
    する群より選択されるアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド: (ii) 配列番号2のアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド:および (iii) 配列番号2のアミノ酸配列からなる単離されたポリペプチド。
  2. 【請求項2】 以下の(i)〜(vi)からなる群より選択される単離されたポリ ヌクレオチド; (i) 配列番号2の全長に渡る配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも(a)
    70%の同一性、(b) 80%の同一性、(c) 90%の同一性、または(d) 95%の同一性を有
    するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオ
    チド: (ii) 配列番号2のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に対してその全 長に渡って少なくとも(a) 70%の同一性、(b) 80%の同一性、(c) 90%の同一性、 または(d) 95%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレ オチド: (iii) 配列番号1の全長に渡る配列番号1のヌクレオチド配列に対して少なくと
    も(a) 70%の同一性、(b) 80%の同一性、(c) 90%の同一性、または(d) 95%の同一
    性を有するヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチド: (iv) 配列番号2のポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離され たポリヌクレオチド: (v) 配列番号1のポリヌクレオチドである単離されたポリヌクレオチド:および
    (vi)適当なライブラリーを、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下
    で、配列番号1の配列またはその断片を有する標識プローブを用いてスクリーニ
    ングすることにより得られる、単離されたポリヌクレオチド、 または前記の単離されたポリヌクレオチドに相補的なヌクレオチド配列。
  3. 【請求項3】 請求項1に記載のポリペプチドに対して免疫特異的な抗体。
  4. 【請求項4】 被験者の治療のための方法であって、 (i) 請求項1に記載のポリペプチドの増強された活性もしくは発現を必要とする
    被験者の治療のための、 (a) 治療上有効量の前記ポリペプチドに対するアゴニストを被験者に投与する
    こと、および/もしくは (b) 前記ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌ
    クレオチドを、in vivoで前記ポリペプチド活性を産生させるような形態で被験 者に提供すること、 を含む前記方法、または (ii) 請求項1に記載のポリペプチドの活性もしくは発現を抑制する必要がある 被験者の治療のための、 (a) 治療上有効量の前記ポリペプチドに対するアンタゴニストを被験者に投与
    すること、および/もしくは (b) 前記ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の発現を抑制する核酸分
    子を被験者に投与すること、および/もしくは (c) 前記ポリペプチドと、そのリガンド、基質、もしくは受容体について競合
    する治療上有効な量のポリペプチドを被験者に投与すること、 を含む前記方法。
  5. 【請求項5】 被験者における請求項1に記載のポリペプチドの発現または
    活性に関連した疾病または該疾病への罹りやすさを検査する方法であって、 (i) 該被験者のゲノム内の該ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に突
    然変異があるか否かを調べること、および/または (ii) 該被験者から得られたサンプルにおける該ポリペプチド発現の存在また は量を分析すること、 を含む前記方法。
  6. 【請求項6】 請求項1に記載のポリペプチドの機能を刺激または抑制する
    化合物を同定するためのスクリーニング法であって、 (a) 候補化合物と、該ポリペプチド(または該ポリペプチドを担持している細
    胞もしくはその膜)またはその融合タンパク質との結合を、該候補化合物に直接
    的または間接的に結合させた標識により測定すること、 (b) 候補化合物と、該ポリペプチド(または該ポリペプチドを担持している細
    胞もしくはその膜)またはその融合タンパク質との結合を、標識競合物質の存在
    下で測定すること、 (c) 候補化合物が該ポリペプチドの活性化または抑制により生ずるシグナルを
    もたらすか否かを、該ポリペプチドを担持している細胞または細胞膜に適した検
    出系を用いて調べること、 (d) 候補化合物と、請求項1に記載のポリペプチドを含有する溶液とを混合し
    て混合物を調製し、該混合物中の該ポリペプチドの活性を測定し、該混合物の活
    性をスタンダードと比較すること、および (e) 候補化合物が細胞における該ポリペプチドをコードするmRNAおよび該
    ポリペプチドの産生に及ぼす効果を、例えばELISAアッセイを用いて、検出する こと、 よりなる群から選択される方法を含んでなるスクリーニング法。
  7. 【請求項7】 請求項1に記載のポリペプチドのアゴニストまたはアンタゴ
    ニスト。
  8. 【請求項8】 下記発現系が適合性の宿主細胞内に存在するとき請求項1に
    記載のポリペプチドを産生し得るポリヌクレオチドを含有する発現系。
  9. 【請求項9】 組換え宿主細胞が適当な培養条件下で配列番号2の全長に渡
    る配列番号2のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸
    配列を含むポリペプチドを産生するような請求項8に記載の発現系を用いて、細
    胞を形質転換またはトランスフェクトすることを含む組換え宿主細胞の製造方法
  10. 【請求項10】 請求項9に記載の方法により製造された組換え宿主細胞。
  11. 【請求項11】 配列番号2の全長に渡る配列番号2のアミノ酸配列に対し
    て少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチドを発現して
    いる、請求項10に記載の組換え宿主細胞の膜。
  12. 【請求項12】 ポリペプチドを産生させるのに十分な条件下で請求項10
    に記載の宿主細胞を培養する工程、およびこの培養培地から該ポリペプチドを回
    収する工程を含む、該ポリペプチドの生産方法。
  13. 【請求項13】 以下の(a)〜(d)からなる群より選択される単離されたポリ
    ヌクレオチド; (a) 配列番号3の全長に渡る配列番号3に対して少なくとも70%、80%、90%、
    95%、97%の同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチ
    ド: (b) 配列番号3のポリヌクレオチドを含む単離されたポリヌクレオチド: (c) 配列番号3のポリヌクレオチド:および (d) 配列番号4の全長に渡る配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも70%
    、80%、90%、95%、97〜99%の同一性を有するポリペプチドをコードするヌク
    レオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチド。
  14. 【請求項14】 以下の(a)〜(e)からなる群より選択されるポリペプチド;
    (a) 配列番号4の全長に渡る配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも70%
    、80%、90%、95%、97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を含むポリペプチ
    ド: (b) 配列番号4の全長に渡る配列番号4のアミノ酸配列と少なくとも70%、80%
    、90%、95%、97〜99%同一であるアミノ酸配列を有するポリペプチド: (c) 配列番号4のアミノ酸配列を含むポリペプチド: (d) 配列番号4のポリペプチドであるポリペプチド:および (e) 配列番号3に含まれる配列を含むポリヌクレオチドによりコードされるポリ
    ペプチド。
JP2000532436A 1998-02-20 1999-02-16 Gタンパク質共役型受容体Fishboy Pending JP2002504492A (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US7562698P 1998-02-20 1998-02-20
US60/075,626 1998-02-20
US13313298A 1998-08-13 1998-08-13
US09/133,132 1998-08-13
PCT/US1999/003246 WO1999042484A1 (en) 1998-02-20 1999-02-16 Fishboy, a g-protein coupled receptor

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2002504492A true JP2002504492A (ja) 2002-02-12

Family

ID=26757078

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2000532436A Pending JP2002504492A (ja) 1998-02-20 1999-02-16 Gタンパク質共役型受容体Fishboy

Country Status (3)

Country Link
EP (1) EP1054903A4 (ja)
JP (1) JP2002504492A (ja)
WO (1) WO1999042484A1 (ja)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030017528A1 (en) 1998-11-20 2003-01-23 Ruoping Chen Human orphan G protein-coupled receptors
CA2645717A1 (en) * 1998-11-20 2000-06-02 Arena Pharmaceuticals, Inc. Human orphan g protein-coupled receptors
USRE42190E1 (en) 1998-11-20 2011-03-01 Arena Pharmaceuticals, Inc. Method of identifying a compound for inhibiting or stimulating human G protein-coupled receptors
US7816492B2 (en) 1998-11-20 2010-10-19 Arena Pharmaceuticals, Inc. Human G protein-coupled receptors
JP2003225088A (ja) * 1999-09-10 2003-08-12 Meiji Seika Kaisha Ltd ヒト・ロイコトリエンb4第二受容体及びそれをコードするdna
US6465212B1 (en) 1999-09-20 2002-10-15 Schering Corporation Leukotriene receptor
AU1540701A (en) * 1999-12-02 2001-06-12 Glaxo Group Limited Novel protein
US20040091863A1 (en) * 2000-03-17 2004-05-13 Shyam Ramakrishnan Regulation of human leukotriene b4-like g protein-coupled receptor
WO2001070815A1 (fr) * 2000-03-21 2001-09-27 Yamanouchi Pharmaceutical Co., Ltd. Nouveau recepteur du leucotriene b4
AU1169901A (en) * 2000-05-15 2001-11-26 Christer Owman Molecular cloning and identification of a human leukotriene-like receptor ltxr
US8518889B2 (en) * 2007-03-23 2013-08-27 Korea University Research & Business Foundation Method of treating cancer with antibodies against long-form leukotriene B4 receptor BLT2

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2351874A1 (en) * 1998-11-12 2000-05-25 Merck & Co., Inc. G protein-coupled receptor resembling the leukotriene b4 receptor

Also Published As

Publication number Publication date
EP1054903A4 (en) 2002-10-09
EP1054903A1 (en) 2000-11-29
WO1999042484A1 (en) 1999-08-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2002508660A (ja) Hm74a受容体
US6344542B1 (en) Human EDG3sb gene
JP2002512781A (ja) Gタンパク質共役型7tm受容体(axor−1)
EP0897980A2 (en) CXCR4B: A human splice variant of CXCR4 chemokine receptor
JP2002504492A (ja) Gタンパク質共役型受容体Fishboy
JP2002505872A (ja) 7回膜貫通gタンパク質共役受容体ecr673
US20020042385A1 (en) Cloning of a novel 7TM receptor AXOR-2
JP2002517222A (ja) Gpr35a受容体
US6180365B1 (en) Polynucleotide encoding a Mouse 7-transmembrane GPR43 receptor
US6323333B1 (en) Mouse EDG1
JP2002520041A (ja) Gタンパク質共役受容体axor10
JP2002512016A (ja) Edgファミリー遺伝子、ヒトh218
US20010014458A1 (en) Human G-protein coupled receptor GPR6sb
JP2002511388A (ja) ヒトgタンパク質共役受容体(gpr25)
JP2002521020A (ja) ヒトボンベシン受容体サブタイプ3sb
JP2002504331A (ja) Gタンパク質共役型受容体AmMaid
JP2002522044A (ja) 7tm受容体(gpr31a)の分子クローニング
JP2002517217A (ja) hCEPR受容体
WO2000031104A1 (en) A novel g-protein coupled 7tm receptor (axor15)
JP2003525571A (ja) 7TM受容体GABAB−R2a
JP2002504493A (ja) Mucilage、Gタンパク質共役型受容体
JP2002523070A (ja) Gabab1aa受容体
JP2002511261A (ja) Gタンパク質共役型受容体axor4
JP2002514403A (ja) Gprw受容体
JP2002511488A (ja) 新規化合物