JP2002504342A - 一価ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、多価ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、ならびに多量体ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、そしてそれらのための使用 - Google Patents

一価ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、多価ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、ならびに多量体ｍｈｃ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、そしてそれらのための使用

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、免疫学の分野に関する。特に、本発明は、一価主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン融合タンパク質および接合体、多価主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン融合タンパク質および接合体、ならびに多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン融合タンパク質および接合体の設計、産生および使用に関する。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】 （発明の分野） 本発明は、免疫学の分野に関する。特に、本発明は、主要組織適合遺伝子複合
体結合ドメイン融合タンパク質および接合体の設計、産生および使用に関する。
【０００２】 （発明の背景） ＭＨＣ分子は、細胞内プロセシング区画における外来抗原由来のペプチドに結
合することにより、そして抗原提示細胞表面上（ここで、ＭＨＣ分子は、特殊化
されたＴ細胞レセプター（ＴＣＲ）により認識され得る（Ｓｔｒｏｍｉｎｇｅｒ
およびＷｉｌｅｙ、１９９５、に概説される））でこれらのペプチドを提示する
ことによって、Ｔ細胞媒介免疫応答の特異性を決定する高度に多型性の二量体タ
ンパク質である。例えば、ＭＨＣクラスＩＩ ＤＲβ鎖遺伝子（１３７個の公知
のＤＲＢ１対立遺伝子を含む（ＭａｒｓｈおよびＢｏｄｍｅｒ、１９９５））は
、同定された最も多型性のヒト遺伝子である。驚くことではないが、これらのタ
ンパク質の多型性の残基は、Ｔ細胞に対して提示され得るペプチドの大きなレパ
ートリーを規定するペプチド結合ドメインにおいてクラスター形成される（Ｂｊ
ｏｒｋｍａｎら、１９８７；Ｓｔｅｒｎら、１９９４）。Ｔ細胞は、同系のＭＨ
Ｃ分子に提示される自己のペプチドに正常では反応するはずはないが、ＭＨＣ遺
伝子のいくつかの対立遺伝子は、病原性の自己のペプチドの提示を通して自己免
疫疾患に対する感受性を付与すると考えられる。従って、例えば、ＭＨＣクラス
ＩＩ ＨＬＡ−ＤＲ２サブタイプは、多発性硬化症（ＭＳ）の危険性増加を与え
るのに対して、ＨＬＡ−ＤＲ４のサブタイプは、慢性関節リウマチに対する感受
性を付与する（Ｔｏｄｄら、１９８８；ＷｕｃｈｅｒｐｆｅｎｎｉｇおよびＳｔ
ｒｏｍｉｎｇｅｒ、１９９５ｂに概説される）。
【０００３】 可溶性の「空の」ＭＨＣクラスＩＩ分子（すなわち、ＭＨＣクラスＩＩペプチ
ド結合ドメイン内にペプチド結合を有さない分子）の産生は、単一の種のペプチ
ドで「負荷された」ＭＨＣ／ペプチド複合体の均質な調製物を産生する際に非常
に有用である。このような可溶性のＭＨＣ／ペプチド複合体は、いくつかの重要
な研究的および治療的な使用を有する。例えば、可溶性のＭＨＣクラスＩＩ分子
は、単一のＭＨＣ／ペプチド複合体の結晶学的研究のために、および特定のＭＨ
Ｃ／ペプチド複合体のそのコグネイトのＴＣＲとの生化学的相互作用の研究のた
めに必要とされる。ＭＨＣ／ペプチド／ＴＣＲ認識単位の構造的特徴は、ＭＨＣ
分子が自己免疫に対する感受性を付与するその機構に重要な見識を提供する。さ
らに、可溶性ＭＨＣ／ペプチド複合体は、自己免疫疾患の処置に有用である。例
えば、マウスの実験的自己免疫性脳脊髄炎（ＥＡＥ）モデルにおける研究により
、自己免疫疾患が、自己抗原性ペプチドで負荷された可溶性ＭＨＣ／ペプチド複
合体の投与により処置され得ることが実証された（Ｓｈａｒｍａら、１９９１）
。このような複合体は、多発性硬化症（ＭＳ）および慢性関節リウマチ（ＲＡ）
を含む、いくつかのヒト自己免疫疾患の処置に有用であることが予期される。
【０００４】 精製された、可溶性の、空のＭＨＣクラスＩＩ分子を得るために、多くのアプ
ローチが続けられている。例えば、ＭＨＣクラスＩＩ分子は、Ｂ細胞膜の界面活
性剤による可溶化に続くアフィニティークロマトグラフィーにより、哺乳動物細
胞から精製され得る（Ｇｏｒｇａら、１９８７）。しかし、Ｂ細胞株から精製さ
れたＭＨＣ分子は、細胞内ＭＨＣクラスＩＩペプチド負荷区画をすでに通過し、
従って、多様なセットのペプチドですでに負荷されている（Ｃｈｉｃｚら、１９
９２）。さらに、これらのペプチドをＢ細胞由来ＭＨＣ複合体から取り出すこと
（例えば、低ｐＨ処理による）は、非常に困難であり、そして代表的にＭＨＣタ
ンパク質の変性を生じる。別のアプローチにおいて、可溶性の、短縮型のＨＬＡ
−ＤＲ１およびＨＬＡ−ＤＲ４分子は、疎水性の膜貫通ドメインを含まないＤＲ
αおよびＤＲβ細胞外ドメインについてのｃＤＮＡ構築物を使用して、バキュロ
ウイルス／昆虫細胞系において発現されている（ＳｔｅｒｎおよびＷｉｌｅｙ、
１９９２）。これらの分子は、アセンブルされ、そして分泌されるが、高い親和
性のペプチドで負荷されない場合、凝集する傾向を有する。さらに、このアプロ
ーチは、ＨＬＡ−ＤＲ２分子では成功しない。例えば、ＤＲＡ、ＤＲＢ５*０１ ０１遺伝子の産物は、高い親和性ペプチドを添加した場合でさえ、凝集する強い
傾向を示した（ＶｒａｎｏｖｓｋｙおよびＳｔｒｏｍｉｎｇｅｒ、未公開知見）
。さらに、このアプローチは、ＤＲＡおよびＤＲＢ１*１５０１遺伝子産物によ り形成されるＤＲ２分子を用いて試みた場合、ＤＲα鎖およびＤＲβ鎖は、アセ
ンブルすることができなかった（Ｗｕｃｈｅｒｐｆｅｎｎｉｇ、未公開知見）。
さらに別のアプローチにおいて、Ｗｅｔｔｓｔｅｉｎら（１９９１）は、マウス
クラスＩＩヘテロ二量体（Ｅk）を、ホスホリパーゼＣによりＣＨＯ細胞から切 断されて可溶化形態を生じ得るグリカン−ホスファチジル−イノシトール連結キ
メラとして発現したが、この形態は、２〜４倍低いレベルのＴ細胞の刺激を生じ
るために１００倍を超える高いペプチド濃度を必要とした。可溶化マウスＩ−Ａ
分子（Ｉ−ＡuおよびＩ−Ａg7（それぞれＥＡＥおよび糖尿病に対する感受性を 付与する））の発現はまた、困難であった。これらのＭＨＣ分子の細胞外ドメイ
ンを、グリカン−ホスファチジル−イノシトールアンカーで融合し、次いで、ト
ランスフェクトさせた細胞の表面から切断した場合、たとえ、切断前に細胞をＩ
−Ａ結合ペプチドを伴ってインキュベートした場合でも不可逆性の凝集が起こっ
た（Ｌ．ＦｕｇｇｅｒおよびＨ．ＭｃＤｅｖｉｔｔ、個人通信）。短縮型ＭＨＣ
分子でのこれら全ての観察は、これらの全てではないがいくつかのタンパク質に
ついて、ＭＨＣクラスＩＩα鎖およびβ鎖のα−ヘリックス膜貫通領域は、αβ
ヘテロ二量体の正常なアセンブルに必須であることを示唆する（Ｃｏｓｓｏｎお
よびＢｏｎｉｆａｃｉｎｏ、１９９２）。
【０００５】 公知の、安定な二量体タンパク質の「二量体化ドメイン」は、遺伝的に融合タ
ンパク質内へ操作されて、安定な二量体融合タンパク質の形成を促進し得ること
が示唆された。例えば、単離されたＦｏｓおよびＪｕｎロイシンジッパー二量体
化ドメインの合成ペプチドは、Ｎ末端システイン残基および（Ｇｌｙ）2リンカ ーが付加されて、鎖間のジスルフィド架橋によって可溶性ヘテロ二量体としてア
センブルすることが示された（Ｏ’Ｓｈｅａら、１９８９）。人工のロイシンジ
ッパー二量体化ドメインを含む融合タンパク質はまた、鎖内のジスルフィド架橋
を有するＴＣＲ細胞外ドメインのαβヘテロ二量体を発現するために使用された
（Ｃｈａｎｇら、１９９４）。これらのＴＣＲキメラは、ネイティブＴＣＲに対
する抗体により結合されるが、これらは、ＭＨＣ／ペプチド複合体特異性を保持
することは示されなかった。別のアプローチにおいて、Ｇｒｅｇｉｏｒｅら（１
９９１）は、タンパク質の同時発現により、ＴＣＲ細胞外ドメインの可溶性のα
βヘテロ二量体を生成した（ここで、αおよびβのＴＣＲ鎖の可変ドメインなら
びに定常ドメイン（第１エキソンのみ）の各々は、免疫グロブリンκ軽鎖の同じ
定常ドメインに融合された）。さらに、融合ヘテロ二量体は、ネイティブＴＣＲ
に対する抗体により認識されるが、これらの著者は、融合ヘテロ二量体のそのコ
グネイトのＭＨＣ抗原に対する直接的な結合を測定することができず、そして、
融合ヘテロ二量体は、ネイティブＴＣＲを保有するＴ細胞がコグネイトなＭＨＣ
抗原を保有する細胞を認識することを再現的に阻害しないことを見出した。最終
的に、Ｗｅｂｅｒら（１９９２）は、同様のアプローチを使用して、ＴＣＲ融合
ヘテロ二量体の直接的なＭＨＣ結合を検出することに失敗したが、結合競合実験
から低親和性結合を推論した。
【０００６】 （発明の要旨） 本発明は、結合されたＭＨＣ結合ペプチドを有するか、または有さない、一価
のおよび多価の融合タンパク質、ならびにヒト主要組織適合遺伝子複合体結合ド
メインを含む多量体タンパク質接合体に関し、これらは、診断および治療方法、
ならびに実験アッセイに有用である。
【０００７】 １つの局面において、本発明は、ＭＨＣクラスＩＩα鎖タンパク質およびβ鎖
タンパク質のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を提供し、ここで、実質的に全
てのＣ末端膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインは、二量体化ドメインおよび、
必要に応じて、介在リンカー配列により置換されている。
【０００８】 従って、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩα鎖の少なくともＭＨＣクラスＩＩ結
合ドメインと、Ｃ末端方向の二量体化ドメインとの融合体を含む、クラスＩＩＭ
ＨＣ結合ドメイン融合タンパク質が提供される。好ましい実施態様において、Ｍ
ＨＣクラスＩＩ結合ドメインは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖の細胞外ドメインを含み
，好ましくは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖の少なくとも残基５〜１８０、より好まし
くは残基５〜１９０、および最も好ましくは、残基５〜２００を含む。本発明の
融合タンパク質が由来し得るＭＨＣクラスＩＩα鎖としては、ＨＬＡ−ＤＲ１、
ＨＬＡ−ＤＲ２、ＨＬＡ−ＤＲ４、ＨＬＡ−ＤＱ１、ＨＬＡ−ＤＱ２およびＨＬ
Ａ−ＤＱ８のα鎖、ならびに、特にＤＲＡ*０１０１、ＤＲＡ*０１０２、ＤＱＡ
１*０３０１、またはＤＱＡ１*０５０１対立遺伝子にコードされるα鎖が挙げら
れる。
【０００９】 同様に、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩβ鎖の少なくともＭＨＣクラスＩＩ結
合ドメインとＣ末端方向の二量体化ドメインとの融合体を含む、クラスＩＩＭＨ
Ｃ結合ドメイン融合タンパク質が提供される。好ましい実施態様において、ＭＨ
ＣクラスＩＩ結合ドメインは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖の細胞外ドメインを含み，
好ましくは、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖の少なくとも残基５〜１８５、より好ましく
は残基５〜１９５、および最も好ましくは、残基５〜２０５を含む。本発明の融
合タンパク質が由来し得るＭＨＣクラスＩＩβ鎖としては、ＨＬＡ−ＤＲ１、Ｈ
ＬＡ−ＤＲ２、ＨＬＡ−ＤＲ４、ＨＬＡ−ＤＱ１、ＨＬＡ−ＤＱ２およびＨＬＡ
−ＤＱ８のβ鎖、ならびに、特にＤＲＢ１*０１、ＤＲＢ１*１５、ＤＲＢ１*１ ６、ＤＲＢ５*０１、ＤＱＢ１*０３およびＤＱＢ１*０２対立遺伝子にコードさ れるβ鎖が挙げられる。
【００１０】 いくつかの好ましい実施態様において、クラスＩＩＭＨＣ結合ドメイン融合タ
ンパク質の二量体化ドメインは、コイルドコイル二量体化ドメイン（例えば、ロ
イシンジッパードメイン）を含む。好ましくは、ロイシンジッパードメインは、
少なくとも４つのロイシンヘプタッド（ｈｅｐｔａｄ）を含む。１つの好ましい
実施態様において、ロイシンジッパードメインは、ＦｏｓまたはＪｕｎロイシン
ジッパードメインである。
【００１１】 他の実施態様において、二量体化ドメインは、免疫グロブリンＦａｂ定常ドメ
イン（例えば、免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域または免疫グロブリン軽鎖定 常領域）である。
【００１２】 前述の実施態様の各々において、可撓性分子リンカーが、必要に応じて、ＭＨ
ＣクラスＩＩ結合ドメインと二量体化ドメインとの間に、挿入され得、そしてこ
れらを共有結合的に連結する。好ましくは、この可撓性分子リンカーは、１〜１
５アミノ酸残基、より好ましくは、５〜７アミノ酸残基のペプチド配列を含む。
さらに、ポリペプチドリンカーが使用される場合、リンカー中の大部分のアミノ
酸残基が、アラニン、グリシン、セリン、ロイシン、イソロイシンまたはバリン
残基であることが好ましい。
【００１３】 さらに、前述の実施態様の各々において、ＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチドは、
必要に応じて、ＭＨＣクラスＩＩα鎖またはβ鎖結合ドメインのＮ末端に共有結
合的に連結され得、その結果、結合ペプチドは、α鎖またはβ鎖と別の（それぞ
れ、βまたはα）ＭＨＣクラスＩＩ鎖により形成されるＭＨＣクラスＩＩ結合ド
メインに選択的に結合し得る。従って、ＭＨＣ結合ペプチドおよびＭＨＣクラス
ＩＩ結合ドメインは、ＭＨＣ／ペプチド複合体を形成する。好ましくは、ＭＨＣ
結合ペプチドは、β鎖のＮ末端に連結される。本質的に、いずれのＭＨＣ結合ペ
プチドも、それらが天然において選択的に結合するＭＨＣクラスＩＩ鎖のＮ末端
に連結され得る。しかし、多発性硬化症に対する医療上の重要性を伴う特に好ま
しい実施態様において、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインは、ＨＬＡ−ＤＲ２結合
ドメインであり、そして結合ペプチドは、ヒトミエリン塩基性タンパク質の残基
８５〜９９、８４〜１０２および１４８〜１６２から選択される。同様に、尋常
性天疱瘡に対する医療上の重要性を伴う特に好ましい実施態様において、ＭＨＣ
クラスＩＩ結合ドメインは、ＨＬＡ−ＤＲ４またはＨＬＡ−ＤＱ１結合ドメイン
であり、そしてその結合ペプチドは、ヒトデスモグレイン３タンパク質の残基７
８〜９３、９７〜１１１、１９０〜２０４、２０６〜２２０、２５１〜２６５、
５１２〜５２６および７６２〜７８６から選択される。
【００１４】 融合タンパク質において共有結合されたＭＨＣ結合ペプチドを使用する前述の
実施態様の各々において、可撓性分子リンカーは、必要に応じて、ＭＨＣクラス
ＩＩ鎖とＭＨＣ結合ペプチドとの間に挿入され得、そしてこれらを共有結合的に
連結する。好ましくは、リンカーは、１０〜２０アミノ酸残基、より好ましくは
、１２〜１８アミノ酸残基のポリペプチド配列である。ポリペプチドリンカーが
使用される場合、大部分のアミノ酸残基が、アラニン、グリシン、セリン、ロイ
シン、イソロイシンおよびバリン残基であることが好ましい。
【００１５】 別の局面において、本発明は、第１のポリペプチド鎖と第２のポリペプチド鎖
とのヘテロ二量体を含むクラスＩＩＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を提供す
る。ここで、第１のポリペプチド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩα鎖の少
なくともＭＨＣ結合ドメインと、Ｃ末端方向の第１の二量体化ドメインとの融合
体を含み、第２のポリペプチド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩβ鎖の少な
くともＭＨＣ結合ドメインと、Ｃ末端方向の第２の二量体化ドメインとの融合体
を含む。これらの実施態様において、第１の二量体化ドメインと第２の二量体化
ドメインは、生理学的条件で溶液中で会合し、ＭＨＣ結合ペプチドを選択的に結
合し得るヘテロ二量体を形成する。上記のように、二量体化ドメインは、コイル
ドコイル二量体化ドメインであり得、好ましくはロイシンジッパードメインであ
り得る。上記のように、可撓性分子リンカーは、ＭＨＣ鎖と二量体化ドメインと
の間に挿入され得、そしてこれらを共有結合的に連結し得、ＭＨＣ結合ペプチド
は、ＭＨＣ鎖の１つに共有結合的に連結し得る。
【００１６】 別の局面において、第１のポリペプチド鎖と第２のポリペプチド鎖とのヘテロ
二量体を含むクラスＩＩＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質が提供される。ここ
で、第１のポリペプチド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩα鎖の少なくとも
ＭＨＣ結合ドメインと、Ｃ末端方向の免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域との融 合体を含み、そして第２のポリペプチド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩβ
鎖の少なくともＭＨＣ結合ドメインと、Ｃ末端方向の免疫グロブリン軽鎖定常領
域との融合体を含む。これらの実施態様において、免疫グロブリン重鎖ＣH１定 常領域と免疫グロブリン軽鎖定常領域は、生理学的条件で溶液中で二量体化し、
ＭＨＣ結合ペプチドに選択的に結合し得るヘテロ二量体を形成する。あるいは、
第１のポリペプチド鎖と第２のポリペプチド鎖とのヘテロ二量体を含むクラスＩ
ＩＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質が提供される。ここで、第１のポリペプチ
ド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩα鎖の少なくとも細胞外ドメインと、Ｃ
末端方向の免疫グロブリン軽鎖定常領域との融合体を含み、そして第２のポリペ
プチド鎖は、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩβ鎖の少なくとも細胞外ドメインと
、Ｃ末端方向の免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域との融合体を含む。これらの 実施態様において、上記のように、免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域と免疫グ ロブリン軽鎖定常領域は、生理学的条件で溶液中で二量体化し、ＭＨＣ結合ペプ
チドに選択的に結合し得るヘテロ二量体を形成する。これらの実施態様の各々に
おいて、クラスＩＩＭＨＣ融合タンパク質は、免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領 域に共有結合的に連結される免疫グロブリンＦｃ領域をさらに含み得る。このよ
うなＦｃ領域は、ＩｇＥまたはＩｇＭ Ｆｃ領域であり得、そして可撓性分子リ
ンカーは、必要に応じて、免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域と免疫グロブリン Ｆｃ領域との間に挿入され得、そしてこれらを共有結合的に連結する。あるいは
、Ｆｃ領域は、ＩｇＡ、ＩｇＤ、またはＩｇＧ Ｆｃ領域であり得る。既に述べ
たように、可撓性分子リンカーは、必要に応じて、免疫グロブリン重鎖ＣH１定 常領域と免疫グロブリンＦｃ領域との間に挿入され得、そしてこれらを共有結合
的に連結し、そしてこれらの実施態様において、免疫グロブリンヒンジ領域であ
り得る。
【００１７】 特定の好ましい実施態様において、上記のような２つのクラスＩＩ ＭＨＣ結
合ドメイン融合タンパク質を含む、多価クラスＩＩ ＭＨＣ結合ドメイン融合タ
ンパク質が提供される。ここで、Ｆｃ領域は、少なくとも１つのジスルフィド結
合により共有結合的に連結される。最も好ましくは、５対のクラスＩＩ ＭＨＣ
結合ドメイン融合タンパク質を含む、多価クラスＩＩ ＭＨＣ結合ドメイン融合
タンパク質が提供され、ここで、Ｆｃ領域はＩｇＭ領域であり、各対は、各対の
Ｆｃ領域間を少なくとも１つジスルフィド結合により共有結合的に連結される、
そして、その５つの対は、ジスルフィド架橋により共有結合的に連結され環状構
造を形成し、その結果、環内の各隣接する対は、少なくとも１つのジスルフィド
結合により連結される。
【００１８】 前述の実施態様の各々において、クラスＩＩ ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパ
ク質はさらに、その融合タンパク質のＮ末端に共有結合的に連結されるＮ末端分
泌シグナル配列を含み得る。好ましい実施態様において、その分泌シグナル配列
は、酵母のα接合因子分泌シグナルまたはヒトＭＨＣクラスＩＩタンパク質分泌
シグナルを含む。
【００１９】 別の局面において、本発明は、複数のＭＨＣ結合ドメインに接合される（それ
に対するペプチド結合を伴うまたは伴わない）キャリアを含む、多量体ＭＨＣ結
合ドメイン接合体を提供する。
【００２０】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、
１キャリアあたり、約５〜約５００のＭＨＣ結合ドメインを含み、好ましくは、
１キャリアあたり約１０〜約２００のＭＨＣ結合ドメイン、そして最も好ましく
は１キャリアあたり約２０〜約１００ＭＨＣの結合ドメインを含む。
【００２１】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、
キャリアの表面上で、約４×１０-3〜２０のＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の平均 密度、好ましくは、約４×１０-2〜２０のＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の平均密 度、そして最も好ましくは、その表面上で、約０．４〜２０のＭＨＣ結合ドメイ
ン／ｎｍ2の平均密度でのＭＨＣ結合ドメインの存在により特徴付けられる。
【００２２】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、
約５〜約１０００ｎｍの最大直径、好ましくは、約５〜約５００ｎｍの最大直径
、そして最も好ましくは、約５〜約１００ｎｍの最大直径を有するキャリアを含
む。いくつかの実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、約３．
１×１０6ｎｍ2未満、好ましくは７．９×１０5ｎｍ2未満、そしてより好ましく
は、３．１×１０4ｎｍ2未満の最小表面積を規定する。最も好ましい実施態様に
おいて、ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、約７８．５〜５．０×１０3ｎｍ2の最小
表面積を規定する。いくつかの実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接
合体は、約５．２×１０8ｎｍ3未満、好ましくは６．５×１０7ｎｍ3未満、そし
てより好ましくは、５．２×１０5ｎｍ3未満の最小体積を規定する。最も好まし
い実施態様において、ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、６５．４〜３．４×１０4 ｎｍ3の最小体積を規定する。
【００２３】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、
約１００ｋＤａ〜約１０，０００ｋＤａの重さ、好ましくは、約１００ｋＤａ〜
約５，０００ｋＤａの重さ、より好ましくは、約１００ｋＤａ〜約１，０００ｋ
Ｄａの重さ、そして最も好ましくは、約１００ｋＤａ〜約５００ｋＤａの重さの
キャリアを含む。
【００２４】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、
約４００ｋＤａ〜約１０，０００ｋＤａの重さ、好ましくは、約４００ｋＤａ〜
約５，０００ｋＤａの重さ、より好ましくは、約４００ｋＤａ〜約１，０００ｋ
Ｄａの重さ、そして最も好ましくは、約４００ｋＤａ〜約５００ｋＤａの重さで
ある。
【００２５】 いくつかの好ましい実施態様において、多量体ＭＨＣ接合ドメイン接合体は粒
状であり、キャリアは生分解性であり、キャリアは非免疫原性であり、キャリア
は正味の中性電荷または負電荷を有し、および／またはキャリアは蛍光標識され
る。キャリアは、ＭＨＣ結合ドメインに共有結合的にまたは非共有結合的に結合
され得る。
【００２６】 いくつかの実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、実質的に
球状のビーズまたは多孔性ビーズであるキャリアを含む。キャリアがビーズであ
る好ましい実施態様において、ビーズは好ましくは、ガラス、シリカ、ヒドロキ
シカルボン酸のポリエステル、ジカルボン酸のポリ酸無水物、またはヒドロキシ
カルボン酸とジカルボン酸とのコポリマーからなる群より選択される物質を含む
。
【００２７】 いくつかの実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、分岐した
ポリマー（例えば、デンドリマー）であるキャリアを含む。好ましい実施態様に
おいて、このキャリアーがデンドリマーである場合、このデンドリマーは、ポリ
アミドアミン、ポリアミドアルコール、ポリアルキレンイミン、ポリアルキレン
、ポリエーテル、ポリチオエーテル、ポリホスホニウム、ポリシロキサン、ポリ
アミド、およびポリアリールポリマーからなる群より選択される物質を含む。
【００２８】 いくつかの実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、リポソー
ムであるキャリアを含む。これらの実施態様において、リポソームは、好ましく
は以下よりなる群から選択される物質を含む：ホスファチジルコリン、ホスファ
チジルセリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホ
スファチジルエタノールアミン、ホスファチジン酸、ジセチルリン酸、モノシア
ロガングリオシド、ポリエチレングリコール、ステアリルアミン、オボレシチン
およびコレステロール。
【００２９】 前記の各実施態様において、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、ＭＨＣ結合
ドメインに、共有結合的にかまたは非共有結合的のいずれかで連結した複数のＭ
ＨＣ結合ペプチドをさらに含み得る。
【００３０】 前記の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の各実施態様において、各ＭＨＣ結合
ドメインは、好ましくは、少なくともＭＨＣクラスＩα鎖およびＭＨＣクラスＩ
β鎖のペプチド結合ドメインのヘテロ二量体、または少なくともＭＨＣクラスＩ
Ｉα鎖およびＭＨＣクラスＩＩβ鎖のペプチド結合ドメインのヘテロ二量体を含
む。さらに、これらの各実施態様において、ＭＨＣ結合ドメインは、本発明の一
価または多価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の部分を含み得る。
【００３１】 別の局面において、本発明は、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体特異性を有する
Ｔ細胞を検出するための方法を提供する。この方法は、一価、多価または多量体
のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記のような、および規
定のＭＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、Ｔ細胞集団をその融合タ
ンパク質もしくは接合体に接触させる工程、ならびに前記の集団においてその融
合タンパク質もしくは接合体とＴ細胞との結合の存在または非存在を検出する工
程を包含する。規定のＭＨＣ／ペプチド複合体と反応するＴ細胞を、例えば蛍光
活性化セルソーティングの手段によって、Ｔ細胞集団から単離する工程をさらに
包含する方法もまた提供される。
【００３２】 別の局面において、本発明は、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対する養子免
疫を被験体に与える方法を提供する。この方法は、一価、多価または多量体ＭＨ
Ｃ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記のような、および規定のＭ
ＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、Ｔ細胞集団をその融合タンパク
質もしくは接合体に接触させる工程、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体と反応する
Ｔ細胞をＴ細胞集団から単離する工程、ならびに単離されたＴ細胞を、養子免疫
を提供するために被験体に投与する工程を包含する。
【００３３】 別の局面において、本発明は、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応す
るＴ細胞を刺激するかまたは活性化するための方法を提供する。この方法は、一
価、多価または多量体ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記
のような、および規定のＭＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、なら
びにＴ細胞集団を免疫原性量のこの融合タンパク質または接合体と接触させる工
程を包含する。好ましい実施態様において、この融合タンパク質または接合体を
ヒト被験体においてインビボでＴ細胞集団と接触させ、そしてＭＨＣ融合タンパ
ク質または接合体は、被験体に対して同系であるＭＨＣ結合ドメインを含む。
【００３４】 別の局面において、本発明は、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応す
るＴ細胞を選択的に殺傷するための方法を提供する。この方法は、一価、多価ま
たは多量体ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記のような、
および規定のＭＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、ならびにＴ細胞
集団をこの融合タンパク質または接合体と接触させる工程を包含する。この方法
において、この融合タンパク質または接合体は、補体系を活性化するのに有効な
免疫グロブリンのドメインを含み、そしてこの補体系がＴ細胞の殺傷を引き起こ
す。
【００３５】 別の局面において、本発明は、規定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応す
るＴ細胞を選択的に殺傷するための方法を提供する。この方法は、一価、多価ま
たは多量体ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記のような、
および規定のＭＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、ならびにＴ細胞
集団をこの融合タンパク質または接合体と接触させる工程を包含する。この方法
において、この融合タンパク質または接合体は、このタンパク質または接合体と
関連する細胞傷害性物質を含み、そしてこの融合タンパク質または接合体を選択
的に結合するＴ細胞を殺傷し得る。
【００３６】 別の局面において、本発明は、ヒト被験体を規定のＭＨＣ／ペプチド複合体に
対して寛容化するための方法を提供する。この方法は、一価、多価または多量体
ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質もしくは接合体（上記のような、および規定
のＭＨＣ／ペプチド複合体を含む）を提供する工程、ならびに前記のＭＨＣ／ペ
プチド複合体に対して寛容化を誘導するために有効な量の融合タンパク質または
接合体を被験体に投与する工程を包含する。特定の好ましい実施態様において、
ＭＨＣ融合タンパク質または接合体は、その被験体と同系であるＭＨＣ結合ドメ
インを含む。しかし、他の好ましい実施態様において、ＭＨＣ融合タンパク質ま
たは接合体は、被験体に対して同種異系であるＭＨＣ結合ドメインを含む。
【００３７】 別の局面において、本発明は、上記のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質をコ
ードする核酸配列を提供する。
【００３８】 （発明の詳細な説明） （Ｉ．定義） 本願発明の主題を、より明らかにかつ明瞭に記載しそして指摘するために、以
下の定義は、以下の説明および本明細書に添付される特許請求の範囲において使
用される特定の用語について提供される。
【００３９】 本明細書中で使用される、用語「主要組織適合遺伝子複合体」および略語「Ｍ
ＨＣ」は、全ての脊椎動物において見出される遺伝子の複合体を意味する。これ
らは、ペプチドに結合し、そしてそれらをＴ細胞レセプター（ＴＣＲ）による可
能な認識に提示することによって、正常な免疫応答におけるリンパ球と抗原提示
細胞との間のシグナル伝達において機能する。ＭＨＣ分子は、細胞内プロセシン
グ区画においてペプチドを結合し、そしてこれらのぺプチドを、Ｔ細胞に対する
抗原提示細胞の表面上に提示する。ヒトＭＨＣ領域（ＨＬＡとも呼ばれる）は、
第６染色体上に見出され、そしてクラスＩ領域（クラスＩα遺伝子ＨＬＡ−Ａ、
ＨＬＡ−ＢおよびＨＬＡ−Ｃを含む）およびクラスＩＩ領域（クラスＩＩαおよ
びβ遺伝子ＤＰ、ＤＱおよびＤＲを含む）を含む。
【００４０】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩ」または「クラスＩ」とは、
ヒト主要組織適合遺伝子複合体クラスＩタンパク質、結合ペプチド、または遺伝
子をいう。ＨＬＡ−Ａ、ＨＬＡ−ＢおよびＨＬＡ−Ｃ小域は、ＭＨＣクラスＩ領
域内に見出される。本明細書中で使用されるように、用語「ＭＨＣクラスＩ分子
」は、共有結合的に、または非共有結合的に連結したＭＨＣクラスＩα鎖の複合
体およびβ2−ミクログロブリン鎖の複合体を意味する。
【００４１】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩＩ」または「クラスＩＩ」と
は、ヒトの主要組織適合遺伝子複合体クラスＩＩタンパク質、結合ペプチドまた
は遺伝子をいう。クラスＩＩα鎖遺伝子およびβ鎖遺伝子についてのＤＰ、ＤＱ
およびＤＲ小域（すなわち、ＤＰα、ＤＰβ、ＤＱα、ＤＱβ、ＤＲα、および
ＤＲβ）は、ＭＨＣクラスＩＩ領域内に見出される。本明細書中において使用さ
れるように、用語「ＭＨＣクラスＩＩ分子」とは、共有結合的または非共有結合
的に連結したＭＨＣクラスＩＩα鎖の複合体およびＭＨＣクラスＩＩβ鎖の複合
体を意味する。
【００４２】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩα鎖」とは、天然に生じるポ
リペプチドか、または人工的に変異させたα遺伝子によってコードされるポリペ
プチドを意味し、これは、本質的には、ＭＨＣクラスＩα遺伝子（例えば、ＨＬ
Ａ−Ａ遺伝子、ＨＬＡ−Ｂ遺伝子またはＨＬＡ−Ｃ遺伝子）の遺伝子産物の１つ
の、少なくともα1ドメインおよびα2ドメインに対応する。α鎖のＣ末端膜貫通
部分および細胞質部分は、本発明おける膜結合に必要ではないため、生物学的活
性を保持しているかぎり、それらの部分はなくてもよい。さらに用語「ＭＨＣク
ラスＩα鎖」は、α2ドメインの通常のグリコシル化を有する改変体、およびそ れを有さない改変体を含むことが意図される。この用語は特に、クラスＩα遺伝
子の全ての対立遺伝子改変体、ならびに任意の等価物（例えば、天然に生じる改
変体の部位特異的変異誘発によって、合成的にまたは組換え的に生成され得るも
のを含む）を包含することが意図される。ＭＨＣクラスＩα鎖はまた、本明細書
中で「ＭＨＣクラスＩ重鎖」として呼ばれ得る。
【００４３】 本明細書中で使用される、用語「クラスＩβ鎖」または「β2−ミクログロブ リン」は、天然に生じるポリペプチド、または人工的に変異させたβ2−ミクロ グロブリン遺伝子によってコードされるポリペプチドを意味し、これは、本質的
にβ2−ミクログロブリン遺伝子の遺伝子産物に対応する。この用語は、特にβ2 −ミクログロブリンの全ての対立遺伝子改変体、ならびに任意の等価物（例えば
、天然に生じる改変体の部位特異的変異誘発によって、合成的にまたは組換え的
に生成され得るものを含む）を包含することが意図される。用語「ＭＨＣβ鎖」
を、この鎖がクラスＩまたはクラスＩＩのいずれかと特定せずに使用する場合、
この用語は、β2−ミクログロブリンならびにＭＨＣクラスＩＩβ鎖を含むこと が意図される。β2−ミクログロブリンまたはＭＨＣクラスＩβ鎖はまた、本明 細書中で「ＭＨＣクラスＩ軽鎖」とも呼ばれ得る。
【００４４】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩＩα鎖」は、天然に生じるポ
リペプチド、または人工的に変異させたα遺伝子によってコードされるポリペプ
チドを意味し、これは、本質的には、ＭＨＣクラスＩＩα遺伝子（例えば、ＤＰ
α遺伝子、ＤＱα遺伝子またはＤＲα遺伝子）の遺伝子産物の１つの、少なくと
もα1細胞外ドメインおよびα2細胞外ドメインに対応する。α鎖のＣ末端膜貫通
部分および細胞質部分は、本発明における抗原性ペプチド結合に必要でないため
、生物学的活性を保持する限り、それらの部分は省かれ得る。さらに用語「ＭＨ
ＣクラスＩＩα鎖」は、α1ドメインおよびα2ドメインの通常のグリコシル化を
有する改変体、およびそれを有さない改変体を含むことが意図される。この用語
は特に、クラスＩＩα遺伝子の全ての対立遺伝子改変体、ならびに任意の等価物
（例えば、天然に生じる改変体の部位特異的変異誘発によって、合成的にまたは
組換え的に生成され得る）を包含することが意図される。
【００４５】 本明細書中で使用されるように、用語「ＭＨＣクラスＩＩβ鎖」は、天然に生
じるポリペプチド、または人工的に変異させたβ遺伝子によってコードされるポ
リペプチドを意味し、これは、本質的には、ＭＨＣクラスＩＩβ遺伝子（例えば
、ＤＰβ遺伝子、ＤＱβ遺伝子またはＤＲβ遺伝子）の遺伝子産物の１つの、少
なくともβ1細胞外ドメインおよびβ2細胞外ドメインに対応する。β鎖のＣ末端
膜貫通部分および細胞質部分は、本発明における抗原性ペプチド結合に必要でな
いため、生物学的活性を保持する限り、それらの部分は省かれ得る。さらに用語
「ＭＨＣクラスＩＩβ鎖」は、β1ドメインの通常のグリコシル化を有する改変 体、およびそれを有さない改変体を含むことが意図される。この用語は特に、ク
ラスＩＩβ遺伝子の全ての対立遺伝子改変体、ならびに任意の等価物（例えば、
天然に生じる改変体の部位特異的変異誘発によって、合成的にまたは組換え的に
生成され得るもの）を包含することが意図される。
【００４６】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣ結合ドメイン」は、ＭＨＣクラスI結 合ドメインおよび／またはＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを意味する。
【００４７】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩ結合ドメイン」とは、抗原性
ペプチドを結合するために必要なＭＨＣクラスＩ分子の領域をいう。ＭＨＣクラ
スＩ結合ドメインは、主にＭＨＣクラスＩα鎖のα1ドメインおよびα2ドメイン
によって形成される。α鎖のα3ドメインおよびβ2−ミクログロブリンは、結合
ドメインの必須な部分ではなく、それらは、ＭＨＣクラスＩ分子の全体的な構造
の安定化において重要であると考えられる。従って本発明のＭＨＣクラスＩ結合
ドメインは、好ましくはこれらの領域を含む。ＭＨＣクラスＩ結合ドメインはま
た、本質的に、ＭＨＣクラスＩ分子の細胞外ドメインとして規定され得、膜貫通
ドメインおよび細胞質ドメインから識別されるが、その細胞外ドメインのいくつ
かの部分は、生物学的活性を保持している限り、省略され得ることが多い。
【００４８】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメイン」とは、抗原
性ペプチドを結合するために必要なＭＨＣクラスＩＩ分子の領域をいう。ＭＨＣ
クラスＩＩ結合ドメインは、主にＭＨＣクラスＩＩα鎖およびβ鎖のα1ドメイ ンおよびβ1ドメインによって形成され、従って、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメイ ンは、これらの領域を最小限に含む。しかし、これらのタンパク質のα2ドメイ ンおよびβ2ドメインはまた、ＭＨＣ結合間隙の全体的な構造の安定化において 重要であると考えられる。従って、本発明のＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインは、
好ましくはこれらの領域を含む。ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインはまた、基本的
に、ＭＨＣクラスＩＩ分子の細胞外ドメインとして規定され得、膜貫通ドメイン
および細胞質ドメインから識別されるが、その細胞外ドメインのいくつかの部分
は、生物学的活性を保持している限り、省略され得る。
【００４９】 本明細書中で使用される、用語「ＭＨＣ結合ペプチド」または「結合ペプチド
」は、ＭＨＣクラスＩ結合ペプチドおよび／もしくはＭＨＣクラスＩＩ結合ペプ
チドを意味する。
【００５０】 本明細書中で使用される場合、用語「ＭＨＣクラスＩ結合ペプチド」とは、特
定のＭＨＣクラスＩ分子によって形成される結合の裂け目中に選択的に結合して
、クラスＩ ＭＨＣ／ペプチド複合体を形成し得るポリペプチドを意味する。Ｍ
ＨＣクラスＩ結合ペプチドは、プロセシングされたペプチド自体か、またはそれ
自体でないペプチドであってもよいし、あるいは、合成ペプチドであってもよい
。クラスＩ ＭＨＣ／ペプチド複合体について、この結合ペプチドは、代表的に
は、８〜１０アミノ酸残基の長さであるが、より長いペプチド、およびより短い
ペプチドが有効であり得る。
【００５１】 本明細書中で使用される場合、用語「ＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチド」とは、
特定のＭＨＣクラスＩＩ分子のα鎖またはβ鎖によって形成される結合の裂け目
中に選択的に結合し、クラスＩＩ ＭＨＣ／ペプチド複合体を形成し得るポリペ
プチドを意味する。ＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチドは、プロセシングされたペプ
チド自体か、またはそれ自体でないペプチドであってもよいし、あるいは、合成
ペプチドであってもよい。クラスＩＩ ＭＨＣ／ペプチド複合体について、この
結合ペプチドは、代表的には、１０〜２５アミノ酸の長さであり、そしてより代
表的には１３〜１８残基の長さであるが、より長い、またはより短いペプチドが
有効であり得る。
【００５２】 本明細書中で使用される場合、用語「ＭＨＣ／ペプチド複合体」とは、（ａ）
そのＭＨＣクラスＩ結合ドメインに結合する、ＭＨＣクラスＩ分子およびＭＨＣ
クラスＩ結合ペプチドの結合ドメインか、または（ｂ）そのＭＨＣクラスＩＩ結
合ドメインに結合する、ＭＨＣクラスＩＩ分子およびＭＨＣクラスＩＩ結合ペプ
チドの結合ドメイン、のいずれかの、共有結合的あるいは非共有結合的に結合し
た三重複合体を意味する。
【００５３】 本明細書中で使用される場合、用語「多量体の主要組織適合遺伝子複合体結合
ドメイン接合体」、または「多量体のＭＨＣ結合ドメイン接合体」とは、キャリ
アに対して直接的または間接的に連結し、結合し（ｂｏｕｎｄ）（共有結合的に
、または非共有結合的に）、付着し、吸着し、またはさもなくば結合する（ｃｏ
ｎｊｕｇａｔｅｄ）、複数のＭＨＣ結合ドメインの接合体を意味する。このＭＨ
Ｃ結合ドメインは、本発明の一価のＭＨＣ融合タンパク質または多価のＭＨＣ融
合タンパク質の一部であり得るが、必要ではない。
【００５４】 本明細書中で使用される場合、用語「キャリア」とは、多量体のＭＨＣ結合ド
メイン接合体を形成するように、直接的または間接的に、複数のＭＨＣ結合ドメ
インを結合し得る分子、粒子、組成物、または他の微視的物体を意味する。ＭＨ
Ｃ結合ドメインは、本発明の一価のＭＨＣ融合タンパク質または多価のＭＨＣ融
合タンパク質の一部であり得るが、必要ではない。
【００５５】 本明細書中で使用される場合、用語「デンドリマー（ｄｅｎｄｒｉｍｅｒ）」
とは、複数の中心ポリマー分枝が１つの中心または開始分子から外側へ広がる分
枝状ポリマーをいい、各枝がさらに外側に広がるようにさらなる副枝を形成し、
それによって、末端枝の数が、少なくとも２つの因子により中心ポリマー枝の数
を超える構造を形成する。
【００５６】 本明細書中で使用される場合、用語「リポソーム」とは、両親媒性分子（例え
ば、リン脂質）の少なくとも１つの二重層によって封入される水性の区画をいう
。本明細書で使用される場合、用語、リポソームは、単層および多層のリポソー
ムを包含することが意図される。
【００５７】 本明細書中で使用される場合、用語「多孔性」とは、キャリアに関して、互い
に流体伝達し、そしてその結果、低分子量（例えば、５ｋＤａ未満）の化合物の
拡散を許容する上記キャリアの十分な直径内への通過を規定するが、その結果、
より高分子量の化合物のスムーズな運動を許容する不十分な直径である、キャリ
アの表面において複数の開口部が存在することを意味する。
【００５８】 本明細書中で使用される場合、用語「可撓性分子リンカー」、または「リンカ
ー」とは、炭素結合に対して３つの炭素の長さ以上の長さを有し、そして上記の
長さに沿って、少なくとも１つの自由回転性の結合を含む化学的部分を意味する
。好ましくは、可撓性分子リンカーは、１以上のアミノ酸残基から構成されるが
、これは、この場合において必要ではない。特定の好ましい実施態様において、
本発明の可撓性分子リンカーは、少なくとも３つの、およびより好ましくは少な
くとも７つのアミノ酸残基を含む。
【００５９】 本明細書中で使用される場合、用語「接合部分」とは、直接的または間接的に
連結し、接合し（共有結合的に、または非共有結合的に）、付着し、吸着し、ま
たはさもなければＭＨＣ結合ドメイン、またはＭＨＣ結合ドメインを含む融合タ
ンパク質、およびキャリアを結合する化学的部分をいう。
【００６０】 本明細書中で使用される場合、用語「選択的結合」とは、抗原に対する抗体、
またはレセプターに対するリガンドの、電気的および立体特異的様式における結
合能を意味する。ＭＨＣ結合ペプチドに関して、選択的結合は、ＭＨＣ／ペプチ
ド複合体を形成するために、ＭＨＣ結合ドメイン中に存在する結合ポケット内に
、ペプチドの特定の側鎖の非共有結合を伴う（例えば、Ｂｒｏｗｎら、１９９３
；Ｓｔｅｒｎら、１９９４を参照のこと）。
【００６１】 本明細書中で使用される場合、用語「実質的に純粋」とは、本発明の種々のＭ
ＨＣ結合ペプチドおよびＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質に関して、これらの
ペプチドまたはタンパク質が、これらの意図される使用に実用的かつ適切な範囲
で、他の物質を本質的に含まないことをいう。特に、これらのペプチドおよびタ
ンパク質は、例えば、抗体の生成または薬学的調製物の産生において有用である
ように、十分に純粋であり、そして十分にこれらの宿主細胞の他の生物学的構成
要素を含まない。実質的に純粋な、本発明のペプチドまたはタンパク質の調製物
は、全ての他のタンパク質または細胞成分を絶対的に含まない必要はなく、そし
て、投与の目的のために、相対的希釈され得る。当業者は、ＨＰＬＣ、アフィニ
ティークロマトグラフィー、または電気泳動的分離を含むがこれらに限定されな
い周知の方法の適用、または連続した適用によって、このような実質的に純粋な
調製物を生成し得る。本発明の実質的に純粋な調製物はまた、他の活性な成分を
含み得、従って、本発明のＭＨＣ結合ペプチドおよび／または種々のＭＨＣ結合
ドメイン融合タンパク質の重量のパーセンテージは、このような調製物において
減少し得る。
【００６２】 本明細書中で使用される場合、用語「微粒子」は、三次元にわたり、そして最
小の表面積および最小の容量を規定し、ならびに実質的に二次元のアレイ中の複
数のＭＨＣ結合ドメインに結合し得る少なくとも１つの表面を含む構造物を記載
する。用語「粒子」は、一般的に球形（ｓｐｈｅｒｉｃａｌ）、楕円形、桿状体
、球体（ｇｌｏｂｕｌａｒ）、または多面体であるキャリアを包含することが意
図される。
【００６３】 本明細書中で使用される場合、用語「最小表面」とは、キャリアに関して、キ
ャリアを含み得る容量を規定する、最小の連続表面の表面積を意味する。本明細
書中で使用される場合、用語「最小の容量」とは、最小の表面の内部に含まれる
容量を意味する。
【００６４】 （ＩＩ．好ましい実施態様） （Ａ．一価、または多価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質） １つの局面において、本発明は、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインおよびコイル
ドコイルならびに／または免疫グロブリン定常ドメインを含む、融合タンパク質
が組換え的に生成され得、そしてこれらの融合タンパク質が、一価または多価の
融合タンパク質において生物学的に機能的なＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを含
むヘテロ二量体を形成し得るという発見に、一部依存する。特に、（１）以前に
無意味で、可溶性な、安定なヘテロ二量体として生成され得なかった特定のＭＨ
ＣクラスＩＩ分子のドメインを含むヘテロ二量体のＭＨＣクラスＩＩ結合ドメイ
ンが、二量体化ドメインを組み込む融合タンパク質を使用して生成され得、そし
て（２）二量体化ドメインを有するか、または有さないヘテロ二量体のＭＨＣク
ラスＩＩ結合ドメインが、多価の免疫グロブリンまたはリガンド／抗リガンド構
造物の融合としてこれらを組み込むことによる多価の融合タンパク質構築物の形
成において生成され得ることが、開示される。特に重要なことには、これらの融
合タンパク質のＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインが、ＭＨＣ分子のα鎖およびβ鎖
内の、ならびにα鎖とβ鎖との間の高度に特異的な三次構造および四次構造相互
作用のための機能的要求にも関わらず、そしてＭＨＣクラスＩＩタンパク質の天
然の疎水性の膜貫通ドメインについて比較的大きな、比較的親水性の融合ドメイ
ンの置換にも関わらず、生物学的活性を保持するということは驚くべき結果であ
る。
【００６５】 従って、第１のシリーズの実施態様において、本発明は、実質的に全てのＣ末
端膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインがコイルドコイル二量体化ドメイン、お
よび必要に応じてリンカー配列を挿入することによって置換されている、ＭＨＣ
クラスＩＩα鎖タンパク質およびＭＨＣクラスＩＩβ鎖タンパク質の融合タンパ
ク質の産生について提供する。図１は、このような一価のＭＨＣクラスＩＩ結合
ドメイン融合タンパク質を概略的に例示する。ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の少な
くともペプチド結合ドメイン、および好ましくは細胞外ドメイン全体が、第１の
二量体化ドメイン３０に融合され得る（例えば、ロイシンジッパードメインまた
は免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）。同様に、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖２０
の少なくともペプチド結合ドメイン、および好ましくは細胞外ドメイン全体が、
第２の二量体化ドメイン４０に融合され得る（例えば、ロイシンジッパードメイ
ンまたは免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）。この二量体化ドメイン（３０
および４０）は、同起源のＴ細胞レセプターに選択的に結合し得るか、および／
または同起源のＴＣＲを保有するＴ細胞クローンを選択的に活性化し得る、安定
なＭＨＣ／ペプチド複合体を形成するように、ＭＨＣ結合ペプチド１１０に結合
し得るか、またはＭＨＣ結合ペプチド１１０と共に「ロード」され得る、生物学
的に活性なＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを形成するために、ＭＨＣクラスＩＩ
αおよびβ鎖成分（１０および２０）が安定に会合する、ヘテロ二量体の融合タ
ンパク質の形成を促進するために溶液中で会合する。必要に応じて、可撓性分子
リンカーは、二量体化ドメインの間の会合の幾何学がＭＨＣ結合ドメインの会合
の幾何学で束縛されず、または妨げられないように、ＭＨＣ成分とこれらの天然
のＭＨＣ膜貫通ドメインとの間に正常な距離をより良く接近させるように、およ
び／またはＭＨＣ成分と二量体化ドメインとの間に自由な回転を提供するように
、ＭＨＣ成分（１０および２０）と二量体化ドメイン（３０および４０）との間
に挿入され得る。
【００６６】 別の一連の実施態様において、本発明は、実質的に全てのＣ末端膜貫通ドメイ
ンおよび細胞質ドメインが免疫グロブリン定常鎖ドメインによって（そして必要
に応じて、リンカー配列および／またはコイルドコイル二量体化ドメインを挿入
して）置換されるＭＨＣクラスＩＩαおよびβ鎖タンパク質の二価の融合タンパ
ク質の生成を提供する。免疫グロブリン定常ドメインは、２つのＭＨＣクラスＩ
Ｉ結合ドメインを保有する二価の抗体様分子の形成を促進するように、そして必
要に応じて、特定のエフェクター機能（例えば、相補体の活性化、細胞結合）を
促進するように選択される。図２は、このような二価のＭＨＣクラスＩＩ結合ド
メイン融合タンパク質を概略的に例示する。ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の少なく
ともペプチド結合ドメイン、および好ましくは細胞外ドメイン全体が、第１の二
量体化ドメイン３０に融合され得る（例えば、ロイシンジッパードメインまたは
免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）。同様に、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖２０の
少なくともペプチド結合ドメイン、および好ましくは細胞外ドメイン全体が、第
２の二量体化ドメイン４０に融合され得る（例えば、ロイシンジッパードメイン
または免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）。この二量体化ドメイン（３０お
よび４０）は、同起源のＴ細胞レセプターに選択的に結合し得るか、および／ま
たは同起源のＴＣＲを保有するＴ細胞クローンを選択的に活性化し得る安定なＭ
ＨＣ／ペプチド複合体を形成するように、ＭＨＣ結合ペプチド１１０に結合し得
るか、またはＭＨＣ結合ペプチド１１０と共に「ロード」され得る、生物学的に
活性なＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを形成するために、ＭＨＣクラスＩＩαお
よびβ成分（１０および２０）が安定に会合する、ヘテロ二量体の融合タンパク
質の形成を促進するために溶液中で会合する。しかし上記のように、いくつかの
ＭＨＣクラスＩＩ分子（例えば、ＨＬＡ−ＤＲ−１、ＨＬＡ−ＤＲ−４）は、Ｓ
ｔｅｒｎおよびＷｉｌｅｙ（１９９２）の方法によって、これらの膜貫通ドメイ
ンおよび細胞質ドメインを有さない安定な可溶性ヘテロ二量体を発現し得る。こ
のような分子において、コイルドコイル二量体化ドメインは、ヘテロ二量体のＭ
ＨＣ結合ドメインの形成に必要ではなく、従ってこれらの実施態様から全体的に
除外され得、またはＦａｂ定常ドメイン（すなわち、重鎖ＣH１ドメインまたは 軽鎖ＣLドメイン）によって置換され得る。次に、２つのＭＨＣ融合タンパク質 のうちの１つが、Ｆｃ領域に適切な、挿入免疫グロブリンヒンジ領域５０を有す
るかまたは有さない、免疫グロブリンＦｃ領域６０をさらに含む（ＩｇＡ、Ｉｇ
ＤおよびＩｇＧ分子は、ヒンジ領域を含む；ＩｇＥおよびＩｇＭ分子はヒンジ領
域を含まない）。好ましくは、それは、ＭＨＣクラスＩＩα鎖がβ鎖よりも可変
性が低いので、免疫グロブリンの重鎖Ｆｃ領域に融合する、ＭＨＣクラスＩＩα
鎖融合タンパク質であり、従って、このようなα鎖融合タンパク質を多くの異な
るＭＨＣクラスＩＩβ鎖融合タンパク質と共に使用して、異なるＨＬＡ特異性を
有する種々の異なる二価分子を形成し得る。しかし、このβ鎖構築物が免疫グロ
ブリンＦｃ領域を含み得ない理由はないことに注意するべきである。最終的に、
可撓性分子リンカーは、必要に応じて、ＭＨＣ成分とこれらの天然のＭＨＣ膜貫
通ドメインとの間に通常の距離をより良く接近させるように、ならびに／または
、任意の対の二量体成分間の会合の幾何学が、他方の会合もしくは二量体化の幾
何学で束縛されず、または妨げられないように、ＭＨＣ成分、二量体化ドメイン
、および／または免疫グロブリンドメインの間に自由な回転を提供するように、
ＭＨＣ成分（１０および２０）、二量体化ドメイン（３０および４０）、および
／または免疫グロブリン成分（５０および／または６０）の間に挿入され得る。
図２に示されるように、２つのこのようなＭＨＣクラスＩＩ融合タンパク質の免
疫グロブリンの重鎖Ｆｃ領域６０および６０’は、鎖間に１つ以上のジスルフィ
ド結合を有して、天然の抗体の構造に類似する二価の構造を会合および形成する
。
【００６７】 別の一連の実施態様において、本発明は、実質的に全てのＣ末端膜貫通ドメイ
ンおよび細胞質ドメインがＩｇＭ免疫グロブリン定常鎖ドメイン（そして必要に
応じて、リンカー配列および／またはコイルドコイル二量体化ドメインを挿入す
る）によって置換されている、ＭＨＣクラスＩＩαおよびβ鎖タンパク質の十価
の（ｄｅｃａｖａｌｅｎｔ）融合タンパク質の生成を提供する。これらの実施態
様は、（１）免疫グロブリン定常ドメインが、ＩｇＭ鎖であるように特異的に選
択されること（これは、二価のサブユニットを形成し、次いでこれらは十価の五
量体へ会合される）、および（２）これらのＭＨＣ−ＩｇＭ融合物を産生する細
胞が、ＩｇＭ分子の会合および分泌を容易にするためにＪ鎖遺伝子で同時トラン
スフェクトされること（Ｍａｔｓｕｕｃｈｉら、１９８６）、を除いて、上記で
直接記載されるのと本質的に同じである。図３は、例えば、十価のＭＨＣクラス
ＩＩ融合タンパク質を概略的に例示する。以前のように、ＭＨＣクラスＩＩα鎖
１０およびβ鎖２０の少なくともペプチド結合ドメイン、そして好ましくは細胞
外ドメイン全体が、二量体化ドメイン３０および４０に融合され得る（例えば、
ロイシンジッパードメインまたは免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）。この
二量体化ドメイン（３０および４０）は、ＭＨＣ結合ペプチド１１０に結合し得
るか、またはＭＨＣ結合ペプチド１１０と共に「ロード」され得る、生物学的に
活性なＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを形成するために、ＭＨＣクラスＩＩαお
よびβ鎖成分（１０および２０）が安定に会合する、ヘテロ二量体の融合タンパ
ク質の形成を促進するために溶液中で会合する。また、上記のように、いくつか
のＭＨＣクラスＩＩ分子（例えば、ＨＬＡ−ＤＲ１、ＨＬＡ−ＤＲ４）は、Ｓｔ
ｅｒｎおよびＷｉｌｅｙ（１９９２）の方法によって、これらの膜貫通ドメイン
および細胞質ドメインを有さない安定な可溶性ヘテロ二量体として発現し得る。
従って、このような分子に関して、コイルドコイル二量体化ドメインは、全体が
除外され得、またはＦａｂ定常ドメイン（すなわち、重鎖ＣH１ドメインまたは 軽鎖ＣLドメイン）によって置換され得る。次に、上記のように、α鎖構築物か またはβ鎖構築物のいずれかは、この実施態様において、ＩｇＭ Ｆｃ領域（Ｃ H ２、ＣH３、ＣH４）である免疫グロブリンＦｃ領域６０をさらに含む。最終的 に、上記のように、可撓性分子リンカーは、必要に応じて、ＭＨＣ成分とこれら
の天然のＭＨＣ膜貫通ドメインとの間に通常の距離をより良く接近させるように
、ならびに／あるいはＭＨＣ成分、二量体化ドメイン、および／または免疫グロ
ブリンドメインの間に自由な回転を提供するように、ＭＨＣ成分（１０および２
０）、二量体化ドメイン（３０および４０）、および／またはＩｇＭ Ｆｃ成分
（６０）の間に挿入され得る。図３に示されるように、２つのこのようなＭＨＣ
−ＩｇＭ融合タンパク質の免疫グロブリンの重鎖Ｆｃ領域６０および６０’は、
会合して、鎖間に１つ以上のジスルフィド結合を有する二価の構造を形成する。
しかし、これらの二価のサブユニットは、二価のサブユニット間に１つ以上のジ
スルフィド結合９０を有する多量体を形成するために、さらに会合する。Ｊ鎖タ
ンパク質１００の存在下において、ＩｇＭサブユニットは、天然に存在するＩｇ
Ｍ五量体に類似する、図３に示されるような十価の五量体にアセンブリされる。
【００６８】 別の一連の実施態様において、本発明は、実質的に全てのＣ末端膜貫通ドメイ
ンおよび細胞質ドメインが二量体化ドメイン（そして必要に応じて、リンカー配
列を挿入する）によって置換され、そしてＣ末端リガンド「タグ」配列が複数の
ＭＨＣ−タグ融合物を抗リガンドに結合し、そして多価ＭＨＣ結合ドメイン融合
タンパク質複合体を形成することを可能にする、ＭＨＣクラスＩＩαおよびβ鎖
結合ドメインの四価融合タンパク質の生成を提供する。このリガンドタグ配列は
、抗リガンドが利用可能である任意の配列であり得るか、またはリガンドのタグ
への付加を容易にする任意の配列であり得る。例えば、このタグ配列は、ポリ−
Ｈｉｓ配列であり得、これはＮｉ+を保有する抗リガンドに対するリガンドとし て作用し得る。あるいは、このタグ配列は抗体のエピトープであり得、そしてこ
の抗リガンドはこの抗体であり得る。好ましい実施態様において、このタグは、
ビオチンリガーゼによってビオチン化され得る認識配列であり、そしてこの抗リ
ガンドは、アビジンまたはストレプトアビジンであり得る。図４は、ビオチン化
タグがリガンドとして作用し、そしてアビジンまたはストレプトアビジンが抗リ
ガンドとして作用する四価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質複合体を概略的
に例示する。以前の実施態様におけるように、ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０および
β鎖２０の少なくともペプチド結合ドメインならびに好ましくは細胞外ドメイン
全体が、二量体化ドメイン（３０および４０）（例えば、ロイシンジッパードメ
インまたは免疫グロブリンのＦａｂ定常ドメイン）に融合され得る。この二量体
化ドメイン（３０および４０）は、ＭＨＣ結合ペプチド１１０に結合し得るか、
またはＭＨＣ結合ペプチド１１０と共に「ロード」され得る、生物学的に活性な
ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを形成するために、ＭＨＣクラスＩＩαおよびβ
鎖成分（１０および２０）が安定に会合する、ヘテロ二量体の融合タンパク質の
形成を促進するために溶液中で会合する。さらに、ビオチンリガーゼ認識配列、
すなわち「タグ」は、少なくとも１つのＭＨＣ結合ドメイン融合鎖のＣ末端に融
合する。この配列タグは、これらのＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を産生す
る細胞内で酵素によってビオチン化され得るか、またはインビトロで実質的にビ
オチン化され得る。ビオチン化タグ７０を使用して、アビジン（またはストレプ
トアビジン）８０に結合する一価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を生じ得
る。各々のアビジン（またはストレプトアビジン）分子が４つのビオチン部分ま
で結合し得る場合、ＭＨＣ-ビオチン／（ストレプト）アビジン融合タンパク質 複合体は四価（ビオチン：（ストレプト）アビジンのより低いモル比において、
より低い結合価を有する）を生じ得る。以前のように、可撓性分子リンカーは、
必要に応じて、ＭＨＣ成分とこれらの天然のＭＨＣ膜貫通ドメインとの間に通常
の距離をより良く接近させるように、ならびに／あるいはＭＨＣ成分、二量体化
ドメイン、および／またはビオチン化タグの間に自由な回転を提供するように、
ＭＨＣ成分（１０および２０）、二量体化ドメイン（３０および４０）、および
／またはビオチン配列タグの間に挿入され得る。当業者に明らかなように、多く
の種々の他のリガンドタグおよび抗リガンドが、類似の多価のＭＨＣ結合ドメイ
ン融合タンパク質複合体を生成するために、ビオチン／（ストレプト）アビジン
の代わりに使用され得る。
【００６９】 前述の各実施態様において、ＭＨＣ結合ペプチド１１０は、可撓性分子リンカ
ーを用いて、ＭＨＣクラスＩＩαまたはβ成分（１０および２０）のいずれかに
共有結合的に連結され得る（図に示さず）。好ましくは、このような可撓性分子
リンカーは、１０〜２０アミノ酸残基、より好ましくは１２〜１８アミノ酸残基
のポリペプチド配列である。可撓性分子リンカーがポリペプチドである場合、Ｍ
ＨＣ結合ペプチド、リンカーおよびＭＨＣクラスＩＩαまたはβ成分は、単一の
融合タンパク質として全て発現され得、Ｃ末端に向かって二量体ドメインをさら
に含む。
【００７０】 上記の各実施態様に関連して、本発明は、以下を提供する：（ａ）このような
融合タンパク質をコードする、単離された核酸配列；（ｂ）これらの核酸で一過
性にまたは安定に宿主細胞をトランスフェクトするためのベクター；（ｃ）これ
らの配列またはベクターで形質転換された宿主細胞；（ｄ）これらの配列、ベク
ターおよび宿主細胞を使用して融合タンパク質を生成するための方法；および（
ｅ）実質的に精製された融合タンパク質自体。さらに、本発明は、アレルギー性
疾患および自己免疫疾患の処置、規定されたＭＨＣ／ペプチド特異性を有するＴ
細胞の検出および／または単離、ならびに規定されたＭＨＣ／ペプチド特異性を
有するＴ細胞の選択的活性化、アネルギー化（ａｎｅｒｇｉｚａｔｉｏｎ）、ま
たは殺傷を含むがこれらに限定されない、これらの生成物およびプロセスについ
ての多くの利用を提供する。
【００７１】 （１．一価および多価のＭＨＣ融合タンパク質のためのＭＨＣ成分の選択） 本発明の方法および生成物は、任意の哺乳動物のＭＨＣクラスＩＩタンパク質
を用いて実行され得る。しかし最初に、本発明はヒト疾患の診断および処置にお
いてより大きな有用性を有することが予測される。従って、ＭＨＣクラスＩＩタ
ンパク質は、好ましくはヒトＨＬＡクラスＩＩタンパク質である。従って、例え
ば、本発明は、公知のＨＬＡ−ＤＲＡ対立遺伝子（ＤＲＡ*０１０１およびＤＲ Ａ*０１０２）、任意の約１６０の公知のＨＬＡ−ＤＲＢ対立遺伝子（少なくと も１３７の公知のＨＬＡ−ＤＲＢ１対立遺伝子を含む）、任意の約１５の公知の
ＨＬＡ−ＤＱＡ１対立遺伝子、任意の約２５の公知のＨＬＡ−ＤＱＢ１対立遺伝
子、任意の約８の公知のＨＬＡ−ＤＰＡ１対立遺伝子、または任意の約６５の公
知のＨＬＡ−ＤＰＢ１対立遺伝子のいずれかで実行され得る。公知のヒトＨＬＡ
クラスＩＩヌクレオチド配列の収集物は、ＭａｒｓｈおよびＢｏｄｍｅｒ（１９
９５）によって公開され、そして公知のＨＬＡクラスＩＩヌクレオチド配列およ
びアミノ酸配列の収集物は、ＥＭＢＬ Ｄａｔａ Ｌｉｂｒａｒｙ、Ｃａｍｂｒ
ｉｄｇｅ、ＵＫから電気通信を介して利用可能である（電子メールによって、「
ｎｅｔｓｅｒｖ＠ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ」に「ＨＥＬＰ ＨＬＡ」を要求する）。
従って、これらの全ての配列は、本明細書中に複製していない。さらに、本明細
書中に使用される全ての配列用語は、ＭａｒｓｈおよびＢｏｄｍｅｒ（１９９５
）、ならびにＢｏｄｍｅｒら（１９９５）において使用されるものと適合する。
【００７２】 コイルドコイル二量体ドメインを使用する実施態様は、これらの膜貫通ドメイ
ンおよび細胞質ドメインがなければ溶液中で安定なヘテロ二量体を形成しないＭ
ＨＣクラスＩＩ結合ドメインを用いた使用に関して特に好ましい。これらのタン
パク質について、コイルドコイルドメインは、ヘテロ二量体に安定性を加えるが
、一方、可溶性の凝集していないタンパク質の精製を可能にする。これらの中に
は、ＨＬＡ−ＤＲ２血清型（例えば、ＤＲＡおよびＤＲＢ１*１５またはＤＲＢ １*１６対立遺伝子によってコードされる血清型）、ＨＬＡ−ＤＱ８（例えば、 ＤＱＡ１*０３０１およびＤＱＢ１*０３０２対立遺伝子によってコードされる）
、ならびにＨＬＡ−ＤＱ２（例えば、ＤＱＡ１*０５０１およびＤＱＢ１*０２０
１対立遺伝子によってコードされる）が存在する。それにも関わらず、コイルド
コイル二量体ドメインは、膜貫通ドメインを有さない安定な可溶性ヘテロ二量体
（例えば、ＤＲ１およびＤＲ４）として以前に首尾良く発現されているヘテロ二
量体を含む、任意のヒトＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインと共に使用され得る。
【００７３】 （２．ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインのスプライシング部位の選択） 本発明に従って、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメイン融合タンパク質のＭＨＣ成分
についてのスプライシング部位は、ＭＨＣ結合ドメインの適切な形成のために十
分なＮ末端配列を含むように選択されなければならない。そうでなければ、ＭＨ
Ｃ鎖のＣ末端膜貫通ドメインおよび細胞質ドメインをほとんど排除するように選
択されなければならない。当該分野において周知であるように、ＭＨＣクラスＩ
Ｉα鎖およびβ鎖は、２つのＮ末端の、球状の細胞外ドメイン（α１およびα２
、またはβ１およびβ２）によって、次いで短いループまたは連結ペプチド、疎
水性膜貫通ドメイン、ならびにＣ末端の親水性細胞質ドメインによって、各々特
徴付けられる。ＭＨＣクラスＩＩ分子の結合の裂け目は、ヘテロ二量体において
α１とβ１ドメインの相互作用によって主に形成され、従って、これらのドメイ
ンは、本発明の融合タンパク質において最小に含まれなければならない。しかし
、α２およびβ２ドメインはまた、これらがＭＨＣ結合ドメインを安定化し得る
ので、好ましくはまた含まれ、ＭＨＣ鎖の二量体の形成に関与すると考えられ、
そしてＣＤ４レセプター結合に関与すると考えられる。
【００７４】 従って、好ましい実施態様では、ＭＨＣクラスＩＩ融合ペプチドのスプライス
点は、α２またはβ２ドメインの末端と膜貫通ドメインの開始部とのおおよそ間
での領域に位置するように選択される。ほとんどのＭＨＣクラスＩＩα鎖につい
て、これは、およそアミノ酸残基１８０位〜２００位に相当し、そしてほとんど
のβ鎖については、これは、およそアミノ酸残基１８５位〜２０５位に相当する
。例えば、ＤＲＡ対立遺伝子によりコードされるＨＬＡ−ＤＲα鎖（ＤＲＡ*０ １０１またはＤＲＡ*０１０２）、膜貫通ドメインは、本質的には、１９１位の Ｇｌｕ残基または１９２位のＡｓｎ残基の後で開始する。ＤＲ１サブタイプＤＲ
Ｂ１*０１（例えば、ＤＲＢ１*０１０１）対立遺伝子ならびにＤＲ２サブタイプ
ＤＲＢ１*１５およびＤＲＢ１*１６対立遺伝子（例えば、ＤＲＢ１*１５０１） によりコードされるＨＬＡ−ＤＲβ鎖について、膜貫通ドメインは、本質的には
、１９８位のＬｙｓ残基または１９９位のＭｅｔ残基の後で開始する。同様に、
ＤＱ２およびＤＱ８サブタイプについて、ＨＬＡ−ＤＱＡ１膜貫通ドメインは、
本質的には、１９５位のＧｌｕ残基または１９６位のＴｈｒ残基の後で開始し、
そしてＨＬＡ−ＤＱＢ１膜貫通ドメインは、本質的には、２００位のＬｙｓ残基
または２０１位のＭｅｔ残基の後で開始する。当然、いくつかの対立遺伝子改変
体について、これらの部位の前に、残基の番号付けを変更するアミノ酸挿入また
は省略が存在し得る。しかし、ＭＨＣクラスＩＩαおよびβ鎖の連結ペプチドお
よび膜貫通領域は、あまり多型性でなく、そして実際、全ての公知のＤＲＡおよ
びＤＲＢ対立遺伝子について不変であるようである（ＭａｒｓｈおよびＢｏｄｍ
ｅｒ、１９９５を参照のこと）。従って、任意の所定のＭＨＣクラスＩＩαおよ
びβ鎖を用いて行うと、当業者は、上記の対立遺伝子に対する相同性およびそれ
らの本質的な疎水性の性質の両方によってこの膜貫通ドメインを容易に同定し得
る。
【００７５】 好ましくはないが、本発明の融合タンパク質が膜貫通ドメイン由来のいくつか
の残基を含むこと、またはα2またはβ2ドメインのいくつかの残基が省略される
ことは許容可能である。例えば、膜貫通ドメインの１〜５残基の含有は、本発明
において含まれ得、そしてなお可溶性融合タンパク質を生じ得るが、しかし、こ
れは好ましくない。同様に、例えば、α2またはβ2ドメインからの１〜５残基の
省略は、ＭＨＣペプチド結合、ヘテロ二量体形成、またはＴ細胞相互作用を破壊
する構造的変化を生じないこともある。実際、ＭＨＣ分子の全体構造を保存する
適切な残基により置換される場合、α2またはβ2構造ドメインのより大きな部分
は、本発明に従って省略され得る（例えば、クラスＩＩα2またはβ2ドメインの
部分をクラスＩα3またはβ2ミクログロブリンタンパク質の等価な部分と置換す
る）。従って、α2およびβ2ドメインをそれぞれの膜貫通ドメインと天然に連結
する５〜７アミノ酸のループもしくは連結ペプチドの全体または一部を含ませ得
るか、または省略させ得ることをまた認識すると、スプライス点が、α鎖のおよ
そ残基１８０〜２００の位置およびβ鎖のおよそ残基１８５〜２０５のいずれか
の位置にある融合タンパク質を生成し得、適切な置換配列が提供されれば、より
大きなＣ末端省略も行われ得る。最後に、１〜５残基は、ＭＨＣクラスＩＩαま
たはβ鎖結合ドメインのＮ末端で省略され得るか、または置換され得る。しかし
、これは推奨されない。
【００７６】 しかし、好ましい実施態様では、スプライシングの点は、膜貫通ドメインのＮ
末端近辺のループまたは連結ペプチド配列内であるように選択される。最も好ま
しい実施態様では、ＭＨＣクラスＩＩα鎖およびβ鎖の細胞外ドメイン全体が、
本発明のＭＨＣ融合タンパク質に含まれる。
【００７７】 ３．ＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチド融合物 前述の実施態様のいずれかと関連して、結合ペプチドが、所定のＭＨＣクラス
ＩＩα鎖およびβ鎖により形成される結合ドメイン内で選択的に結合し得るよう
に、ＭＨＣ結合ペプチドがαまたはβ鎖のいずれかのＮ末端に共有結合的に連結
される融合タンパク質をまた作製し得る。好ましくは、ＭＨＣ結合ペプチドは、
β鎖のＮ末端に連結される、なぜなら、α鎖およびβ鎖がヘテロ二量体ＭＨＣ分
子を形成するように会合する場合、β鎖のＮ末端が、α鎖のＮ末端よりもより接
近可能であるからである。さらに、ＭＨＣクラスＩＩ分子のβ鎖は、α鎖よりも
より多型性であり、従って、ＭＨＣ結合ドメインの特異性は、β鎖が分子内に含
まれるかにより依存する。
【００７８】 ＭＨＣ結合ペプチドは、好ましくは、以下に記載のように、可撓性分子リンカ
ーを用いてＭＨＣ結合ドメインに連結される。好ましい実施態様では、可撓性分
子リンカーは、およそ１０〜２０アミノ酸残基、より好ましくは１２〜１８アミ
ノ酸残基のポリペプチド配列であり、これは、標準的なポリペプチド連結によっ
て結合ペプチドおよびＭＨＣ結合ドメインを連結し、単一核酸構築物によってコ
ードされ得、そして単一融合タンパク質として発現され得、より大きな融合タン
パク質を形成する。さらに、立体障害の可能性を最少にするために比較的小さい
残基（例えば、アラニン、グリシン、セリン、ロイシン、イソロイシン、バリン
）からアミノ酸が選択されることが好ましい。
【００７９】 上述のように、ＭＨＣ結合ペプチドは、それが付着されるＭＨＣ分子に選択的
に結合し得るように選択される。ＭＨＣ結合ペプチドおよびＭＨＣ分子の何千も
の組み合わせが、当該分野で公知であり、そして標準的な方法によって同定され
得る（例えば、Ｃｈｉｃｚら、１９９３を参照のこと）。疾患（感染および自己
免疫疾患を含む）に関係している、ＭＨＣ結合ペプチドおよびＭＨＣ分子の対が
、特に興味深い。例えば、ヒトミエリン塩基性タンパク質に由来の特異的なＭＨ
Ｃ結合ペプチド（例えば、残基８５〜９９、８４〜１０２、および１４８〜１６
２）および特定のＭＨＣ対立遺伝子（例えば、ＨＬＡ−ＤＲ２もしくはＤＲＡ／
ＤＲＢ１*１５０１）は、多発性硬化症の発症に関係している。従って、１つの 好ましい実施態様では、免疫原ミエリン塩基性タンパク質（ＭＢＰ）ペプチドが
ＨＬＡ−ＤＲＢ１*１５０１タンパク質のペプチド結合ドメインのＮ末端にポリ ペプチドリンカー配列によって共有結合的に連結される一価または多価のＭＨＣ
クラスＩＩ結合ドメイン融合タンパク質が、生成され、そしてこの融合物は、二
量体化ドメインに、介在する可撓性分子リンカーと共にまたはこれを用いずに、
共有結合的に連結される。次いで、このような融合タンパク質は、ＭＢＰペプチ
ドがＭＨＣクラスＩＩαおよびβ鎖結合ドメインの会合により形成される割れ目
中で結合するように、対応するＨＬＡ−ＤＲＡα鎖融合タンパク質と二量体化し
得る。同様に、ヒトデスモグレイン３タンパク質の特定の残基（例えば、残基７
８〜９３、９７〜１１１、１９０〜２０４、２０６〜２２０、２５１〜２６５、
５１２〜５２６、および７６２〜７８２）および特定のＭＨＣ対立遺伝子（例え
ば、ＨＬＡ−ＤＲ４もしくはＤＲＡ／ＤＲＢ１*０４０２およびＨＬＡ−ＤＱ１ もしくはＤＱＡ／ＤＱＢ１*０５０３２）は、尋常天疱瘡の発症に関係している （例えば、ＷＯ９６／２７３８７を参照のこと）。他の自己免疫疾患（慢性関節
リウマチ（ＲＡ）および全身性エリテマトーシス（ＳＬＥ）を含む）について、
特定のＭＨＣクラスＩＩ分子に選択的に結合する免疫優勢自己ペプチドが、同定
され得る。これらのそれぞれについて、ＭＨＣ結合ドメインに共有結合的に連結
された自己免疫原性ＭＨＣ結合ペプチドを有する、一価または多価のＭＨＣクラ
スＩＩ結合ドメイン融合タンパク質が、生成され得、そしてこれらは、さらに以
下に記載するように、自己反応性Ｔ細胞を同定、選別、選択、または標的化する
ことにおいて、または、自己抗原に対する免疫応答を寛容化またはアネルギー化
することにおいて使用され得る。
【００８０】 ４．リンカードメインの選択 本発明に従って、上記のように、（１）ＭＨＣ結合ドメインを二量体化ドメイ
ンに；（２）二量体化ドメインを免疫グロブリンＦｃドメインもしくはリガンド
タグドメインに；または（３）ＭＨＣ結合ペプチドをＭＨＣ結合ドメインに共有
結合的に連結する可撓性分子リンカーを必要に応じて含むＭＨＣ結合ドメイン融
合タンパク質が、生成され得る。適切なリンカーは、組換えＤＮＡ構築物におい
てＭＨＣドメイン、二量体化ドメイン、免疫グロブリンドメイン、および／また
はタグドメインを有するコードされ得る短いポリペプチド鎖を包含するが、これ
に限定されない。しかし、より一般的には、適切なリンカーは、可撓性である比
較的小さな（例えば、＜２ｋＤａ、好ましくは、＜１ｋＤａ）有機化合物部分を
含む。なぜなら、それらは、それらの末端と、自由な回転が存在するその周囲と
の間に位置する少なくとも１つの単結合を含むからである。従って、例えば、低
級アルキル鎖の二官能性分子（例えば、α、ω−ジカルボン酸またはα、ω−ジ
アミン）が利用され得、そしてこのような可撓性分子リンカーは、ＭＨＣ成分の
Ｃ末端およびコイルドコイル成分、免疫グロブリン成分、もしくはリガンドタグ
成分のＮ末端（またはこれらのいずれかのアミノ酸側鎖の反応基）と反応し得る
。当然、多くの他の架橋剤が当該分野で周知であり、そして実質的な等価物とし
て利用され得る。
【００８１】 しかし、好ましくは、本発明の可撓性分子リンカーは、融合遺伝子構築物にお
いてコードされ得る一連のアミノ酸残基を含む。例えば、１〜１５の一般的に小
さなアミノ酸残基（例えば、アラニン、グリシン、セリン、ロイシン、イソロイ
シン、バリン）（必要に応じて、１つ以上の親水性残基（例えば、アスパラギン
酸、グルタミン酸、リジン）を含む）のリンカーが、リンカーとして利用され得
る。ＭＨＣ結合ドメインと二量体化ドメインとの間のリンカーについて、リンカ
ーの長さは、ほぼ、ＭＨＣ結合ドメインとＭＨＣタンパク質の膜貫通ドメインと
の間で天然に見出される間隔を維持するように選択され得、従って、リンカーの
長さは、結合ドメインと膜貫通ドメインとの間の天然に存在するループまたは連
結残基のいくつかまたは全部が含まれているかまたは省略されているかに依存し
得る。さらに、当業者に明らかなように、リンカー配列は、融合タンパク質にお
いて特異的なプロテイナーゼ切断部位を導入するように、または組換えＤＮＡ操
作を容易にするために、組換え構築物に特異的制限エンドヌクレアーゼ部位を導
入するように特に選択され得る。従って、例えば、ＭＨＣ分子の天然に存在する
５〜７アミノ酸のループもしくは連結ペプチドを含み得、そしてまた５〜７アミ
ノ酸リンカーを含み得る。あるいは、ループまたは連結ペプチドの含まれる部分
は変動し得、リンカーの長さは変動し得、またはループペプチドおよび／または
リンカーは全体的に省略され得る。部位指向的変異誘発、または種々の異なるエ
ンドヌクレアーゼを用いる組換え構築物の制限および連結の標準的な技術を使用
して、当業者は、融合タンパク質構築物において多くの改変を容易に生成し得、
そして以下に記載するように、コグネイトのＴＣＲ結合および／またはＴ細胞活
性化についてそれらを迅速に試験し得る。従って、いくつかの現在好ましい実施
態様は、特定のリンカーによって、二量体化ドメイン、免疫グロブリンドメイン
、またはリガンドタグドメインに連結されたＭＨＣ分子の細胞ガイドメイン全体
を使用するが、本発明は、このような実施態様に限定されない。
【００８２】 ５．二量体化ドメインの選択 コイルドコイルは、二量体タンパク質の共通の構造特性である。これは、２つ
のα−へリックスポリペプチド（「コイル」）が互いの周囲でねじれ（「コイル
化され」）、より大きな４次構造または「コイルドコイル」を形成する(例えば 、Ｈｕら、１９９０；ＯａｓおよびＥｎｄｏｗ、１９９４)。実際に、ＨＬＡ− ＤＲα鎖およびβ鎖の膜貫通領域は、細胞膜の疎水性環境内でコイルドコイルと
して組み立てられるαへリックスであると考えられる（ＣｏｓｓｏｎおよびＢｏ
ｎｉｆａｃｉｎｏ、１９９２）。しかし、他のコイルドコイルは、親水性であり
、そして分泌タンパク質、細胞質ゾルタンパク質、および核タンパク質において
見出され得る。例えば、「ロイシンジッパー」は、多数のＤＮＡ結合タンパク質
に存在し、そしてホモ二量体形成またはヘテロ二量体形成のいずれかを媒介し得
るコイルドコイルドメインである（例えば、Ｆｅｒｒｅ−Ｄ’Ａｍａｒｅら、１
９９３；Ｏ’Ｓｈｅａら、１９８９；Ｏ’Ｓｈｅａら、１９９１を参照のこと）
。さらに、いく人かの研究者が、いまや、人工のコイルドコイルドメイン（塩基
性および酸性両親媒性へリックスと人工ロイシンジッパーとの対を含む）を設計
している。このドメインは、組換えホモ二量体およびヘテロ二量体タンパク質に
おいて発現され、そして組み立てられている（例えば、ＰａｃｋおよびＰｌｕｃ
ｋｔｈｕｎ、１９９２；Ｃｈａｎｇら、１９９４を参照のこと）。
【００８３】 本発明の好ましい実施態様では、二量体化ドメインは、ロイシンジッパードメ
インである。これらのロイシンジッパーは、およそ７つ目の残基（ヘプタド反復
）ごとに周期的に間隔を置かれる、少なくとも４つの、および好ましくは少なく
とも５〜７のロイシン残基によって特徴付けられている。各ハプタド反復は、α
へリックスの２ターンを構成する（３．５残基／ターン）。ロイシン残基は、コ
イルドコイル二量体化において特別の機能を有し、そしてコイルドコイル中の２
つのαへリックス間に疎水性の界面の一部を形成するようである。タンパク質Ｆ
ｏｓおよびＪｕｎの４０アミノ酸ロイシンジッパードメインは、ロイシンジッパ
ー二量体化ドメインの好ましい例である。これらのドメインは、各々、介在する
位置に多くの親水性残基と共に、正確に７残基ごとに間隔を置かれた５つのロイ
シン残基を有する（Ｆｏｓ配列は、ヘプタド反復パターンにはまらない、従って
ヘテロ二量体形成に寄与しないと仮定される、３つのさらなるロイシンを含む）
。これらのドメインの改変は、または完全に人工の配列（これらの配列（例えば
、プロリンまたはヘアピンターンを含まない）の全体的なへリックス性質を維持
する、へリックスの全体的な親水性を保持する、およびロイシン残基の大体正確
なヘプタド反復を保持する）でさえ、また、本発明に従って利用され得る。（Ｐ
ａｃｋおよびＰｌｕｃｋｔｈｕｎ（１９９２）のｓｃＨＬＸ両親媒性へリックス
を組換えＨＬＡ−ＤＲ２融合構築物で試験したが、成功したヘテロ二量体形成に
至らなかったことに留意されたい）。
【００８４】 最後に、上述のように、いくつかのＭＨＣクラスＩＩ分子（例えば、ＨＬＡ−
ＤＲ１、ＨＬＡ−ＤＲ４）は、それらの膜貫通ドメインのない可溶性の安定なヘ
テロ二量体として首尾よく生成されている（例えば、ＳｔｅｒｎおよびＷｉｌｅ
ｙ、１９９２を参照のこと）。このような分子、または中程度の安定性で組み合
わされる他の分子について、コイルドコイル二量体化ドメインは、必要でなくて
よい。従って、本発明のいくつかの実施態様では、このようなドメインが全体的
に省略され得るか、または、あるいは、二量体化を促進する他のドメインが置換
され得る。特に、免疫グロブリンのＦａｂフラグメントの定常ドメイン（すなわ
ち、ＣH１およびＣLドメイン）は、ヘテロ二量体形成二量体化ドメインとして利
用され得ることが考慮される。
【００８５】 ６．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質についての免疫グロブリンドメインの
選択 ヒト免疫グロブリンは、５つの広いクラスに分割され（ＩｇＡ、ＩｇＤ、Ｉｇ
Ｅ、ＩｇＧおよびＩｇＭ）、そしてこれらのいずれかが本発明のＭＨＣ−免疫グ
ロブリン構築物において利用され得る。これらの分子の基本構造は、重鎖ヘテロ
二量体と軽鎖ヘテロ二量体の非常に十分に特徴付けられたジスルフィド連結ホモ
二量体である。従って、基本免疫グロブリン単位は、図２のタンパク質に似る。
一対の重鎖（エレメント１０、３０、５０、および６０に相当する）が、互いに
ジスルフィド連結され、そして各重鎖のＮ末端が、軽鎖（エレメント２０および
４０に相当する）と結合されている。軽鎖およびそれと結合している重鎖の部分
（エレメント１０、２０、３０、および４０に相当する）は、Ｆａｂフラグメン
トと呼ばれる。互いに密接に結合した２つの重鎖（６０および６０’）の部分は
、Ｆｃフラグメントと呼ばれる。免疫グロブリンのいくつかのクラス（すなわち
、ＩｇＡ、ＩｇＤ、およびＩｇＧ）では、ＦａｂフラグメントとＦｃフラグメン
トとの間にヒンジ領域５０がある。最終的に、免疫グロブリン軽鎖および重鎖の
両方の内に、非常に可変性である領域および非常に定常性である領域がある。従
って、免疫グロブリン軽鎖は、可変ドメインＶL（本質的に、図２のエレメント ２０に相当する（ただし、大きさどおりではない））、および定常ドメインＣL （本質的に、エレメント４０に相当する（ただし、大きさどおりではない））を
含む。同様に、各重鎖は、Ｎ末端可変ドメインＶH（本質的に、エレメント１０ に相当する（ただし、大きさどおりではない））、および３または４の定常ドメ
イン（ＣH１からＣH４）（本質的に、エレメント３０、５０、および６０に相当
する（ただし、大きさどおりではない））を含む（一般に、Ｋｕｂｙ、１９９４
を参照のこと）。免疫グロブリン定常ドメインは、それらの名称が暗示するよう
に、ヒト集団において比較的不変である。それらの定常領域における差異に基づ
いて、軽鎖は、κまたはλのいずれかとして広く分類され、そしてヒトにおいて
、λ鎖は、４つのサブタイプにさらに分類される。同様に、免疫グロブリン重鎖
の定常領域の差異は、これらの分子を５つの広いクラスに分割する基本である（
それぞれ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、およびＩｇＭにおけるα、δ、ε
、γ、およびμ鎖）。ヒトにおけるアミノ酸配列の重要でない差異に基づいて、
γ鎖は、４つのサブクラスにさらに下位分割されており、そしてα鎖は、２つに
下位分割されている。これらの種々の免疫グロブリン軽鎖および重鎖の定常ドメ
インのアミノ酸配列は、当該分野で長く知られており（例えば、Ｋａｂａｔら、
１９７９を参照のこと）、ここでは再現しない。
【００８６】 いくつかの好ましい実施態様では、本発明のＭＨＣ−免疫グロブリン融合タン
パク質は、ＩｇＧ（サブタイプ１、２、または３）またはＩｇＭのいずれかのＦ
ｃ領域を含む。なぜなら、これらのＦｃドメインは、古典的な補体系を活性化し
得、従って、以下に記載の治療的方法のいくつかにおいてより有用であるからで
ある。しかし、補体活性化が所望されないまたは無関係である有用性について、
免疫グロブリンアイソタイプのいずれかが利用され得る。さらに、図３に示すよ
うに、ＩｇＭアイソタイプは、いくつかの実施態様では好ましい。なぜなら、そ
れらは、二価のＭＨＣ−ＩｇＭ融合タンパク質の五量体を形成し得るからである
。
【００８７】 ７．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質についての発現系 本発明のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質は、所望の分子の適切な折り畳み
および分泌を可能にするか、または封入体から適切に折り畳まれた分子としてそ
れらの回収を可能にする任意の標準的なタンパク質発現系で発現され得る。一般
的事項として、真核生物発現系が好ましい。なぜなら、それらは、高収量の適切
に折り畳まれたグリコシル化されたかつジスルフィド連結された分子を生成する
と最も思われるからである。哺乳動物細胞株、特にタンパク質発現について十分
い特徴付けられた細胞株（例えば、ＣＨＯ細胞、ＣＯＳ細胞）または適切に折り
畳まれたグリコシル化されたかつジスルフィド連結された免疫グロブリンを分泌
することが知られている細胞（例えば、任意のｍＡｂ産生細胞株）が、いくつか
の用途のために好ましいとされ得る。しかし、一般に、これらの細胞株は、治療
的適用および商業的適用についてほとんどタンパク質を発現しない。従って、他
の真核生物発現系（例えば、Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ酵母系（以下に記
載）が好ましいとされ得る。さらに、予備的な結果が、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ
Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞系におけるＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の高レベ
ルの発現を示した。過度の実験なしに、適切または望ましい発現系を選択するこ
とは、十分に当業者の能力および裁量の範囲内である。
【００８８】 同様に、いったん本発明のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質についての設計
（すなわち、一次アミノ酸配列）が選択されると、当業者は、選択された宿主中
のコドン偏り、宿主（例えば、酵母発現のためのα接合因子分泌シグナル）中の
分泌シグナル配列についての必要性、シグナル配列内のプロテイナーゼ切断部位
の導入などのような要因を考慮して、所望のタンパク質をコードする適切な組換
えＤＮＡ構築物を容易に設計し得る。これらの組換えＤＮＡ構築物は、選択した
宿主に適切な多数の発現ベクターのいずれかにインフレームに導入され得る。適
切または好ましい発現ベクターの選択は、再度、十分に当業者の能力および裁量
の範囲内の事項である。好ましくは、当然、発現ベクターは、組換え構築物の発
現を駆動する強力なプロモーターおよび必要に応じて、多数のマーカー遺伝子（
形質転換体の同定および／または選択を簡易化する）を含む。
【００８９】 Ｂ．多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体 別の局面では、本発明は、キャリアに接合体化された複数のＭＨＣ結合ドメイ
ンを含む多量体ＮＨＣ結合ドメイン接合体が生成され得ること、およびこれらの
多量体接合体が一価ＭＨＣ結合ドメイン、または二価もしくは三価のＭＨＣ結合
ドメイン構築物でさえよりも、それらのコグネイトのＴＣＲについてのかなり大
きな結合活性およびかなり大きな生物学的活性を有するという発見に、一部、依
存する。本発明のいかなる特定の理論にも縛られないが、Ｔ細胞結合のの結合活
性の親和力および／または活性化の大きな増大は、ＭＨＣ結合ドメインの実質的
に二次元のアレイが、複数のＴ細胞レセプターを有するＴ細胞膜の領域と接触し
得るように、単一のキャリアに複数のＭＨＣ結合ドメインを提供することにより
、達成され得ると考えられる。
【００９０】 従って、一連の実施態様では、本発明は、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の
産生を提供する。ここで、約５〜５００のＭＨＣ結合ドメイン、好ましくは約１
０〜２００のＭＨＣ結合ドメイン、およびより好ましくは、約２０〜１００のＭ
ＨＣ結合ドメインが、単一のキャリアに接合体化される。キャリアは、最少の表
面積を規定するように、および好ましくは表面上のＭＨＣ結合ドメインの平均密
度が約４×１０-3〜２０ＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の間；より好ましくは約４ ×１０-2〜２０ＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の間；そして最も好ましくは、約０ ．４〜２０ＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の間であるように特徴付けられ得る。
【００９１】 さらに、好ましい実施態様では、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体のサイズお
よび重量は、可溶性を維持するのを補助するために、およびインビボでの凝集に
よって引き起こされる可能な複雑化を避けるために制限される。従って、本発明
のＭＨＣ結合ドメイン接合体の最大断面直径は、約１，０００ｎｍ未満、好まし
くは、約５００ｎｍ未満、そしてより好ましくは約１００ｎｍ未満であることが
好ましい。完全に球形である場合、このような接合体は、それぞれ、およそ３．
１×１０6ｎｍ2、７．９×１０5ｎｍ2、および３．１×１０4ｎｍ2未満の最少表
面積を規定し、そして５．２×１０8ｎｍ3、６．５×１０7ｎｍ3、および５．２
×１０5ｎｍ3の最少体積を規定する。最も好ましい実施態様では、以下に記載す
るように、ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、約５〜４０ｎｍの最大直径を有する。
完全に球形である場合、このような接合体は、およそ７８．５〜５．０×１０3 ｎｍ2の最少表面積を規定し、そして６５．４〜３．４×１０4ｎｍ3の最少体積 を規定する。さらに、ＭＨＣ結合ドメイン接合体の全重量は約１０，０００ｋＤ
ａ未満、好ましくは約５，０００ｋＤａ未満、およびより好ましくは約１，００
０ｋＤａ未満であることが好ましい。最も好ましい実施態様では、以下に記載の
ように、ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、約２００〜５００ｋＤａの重量を有する
。
【００９２】 図５は、キャリアに接合体化された複数のＭＨＣ結合ドメインを含む多量体Ｍ
ＨＣ結合ドメイン接合体の１つの実施態様を模式的に示す。従って、接合体は、
少なくとも結合ドメイン、および、好ましくは、少なくとも結合ドメインと安定
に結合する複数のＭＨＣα鎖１０の細胞外ドメイン全体、および、好ましくは、
ＭＨＣ結合ペプチド１１０と結合し得る、またはこれで「ロード」され得る生物
学的に活性なＭＨＣ結合ドメインを形成するためのＭＨＣβ鎖２０の細胞外ドメ
イン全体を含む。この図において、ＭＨＣα鎖１０は、接合体化部分２００によ
ってキャリア３００に接合体化されるとして示される。しかし、あるいは、ＭＨ
Ｃβ鎖２０は、接合体化部分２００によってキャリア３００に接合体化され得る
。他の実施態様では、接合体化部分２００は省略され得、そしてＭＨＣ鎖（１０
または２０）の一方が、キャリア３００に直接的に接合体化され得る。ＭＨＣ結
合ドメインは、コグネイトのＴ細胞上のＴＣＲとＭＨＣ／ペプチド複合体の相互
作用を可能にする方向でキャリアに接合体化される。図５に示すように、キャリ
ア３００は、実質的に球形の粒子として図示されるが、そうである必要はない。
【００９３】 図６は、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の別の実施態様を模式的に
示す。この図では、接合体は、上述のタンパク質のような、複数のＭＨＣ結合ド
メイン融合タンパク質を含む。従って、この実施態様では、複数のＭＨＣα鎖１
０の少なくともペプチド結合ドメインが、第１の二量体化ドメイン３０に連結さ
れており、複数のＭＨＣβ鎖２０の少なくともペプチド結合ドメインが、第２の
二量体化ドメイン４０に連結されており、そしてこれらの融合タンパク質は、Ｍ
ＨＣ結合ペプチド１１０に結合し得るヘテロ二量体ＭＨＣ結合ドメインを形成す
るように組み立てられている。可撓性分子リンカー（示されていない）は、必要
に応じて、ＭＨＣドメイン（１０、２０）と二量体化ドメイン（３０、４０）と
の間に配置され得る。この図では、第１の二量体化ドメイン３０は、接合体化部
分２００によってキャリア３００に接合体化されるとして示される。しかし、あ
るいは、第２の二量体化ドメイン４０は、接合体化部分２００によってキャリア
３００に接合体化され得る。他の実施態様では、接合体化部分２００は省略され
得、そして二量体化ドメイン（３０または４０）の一方が、キャリア３００に直
接的に接合体化され得る。ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質は、コグネイトの
Ｔ細胞上のＴＣＲとＭＨＣ／ペプチド複合体の相互作用を可能にする方向でキャ
リアに接合体化される。図６に示すように、キャリア３００は、実質的に球形の
分枝状ポリマーまたはデンドリマーとして図示されるが、そうである必要はない
。
【００９４】 図７は、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の別の実施態様を模式的に
示す。この図では、接合体は、上述のタンパク質のような、複数のＭＨＣ結合ド
メイン融合タンパク質を含み、そして番号付けられたエレメント１０、２０、３
０、４０および１１０は、図６に記載した通りである。しかし、この実施態様で
は、図６の接合体化部分２００は、２つのエレメント７０および８０に置き換え
られる。従って、第１の接合体化部分７０が第２の二量体化ドメイン４０に共有
結合的または非共有結合的に結合され、そして第２の接合体化部分８０がキャリ
ア３００に共有結合的または非共有結合的に結合される。例えば、第１の接合体
化部分７０は、上記のようにビオチンタグであり得、そして第２の接合体化部分
８０は、アビジンまたはストレプトアビジンであり得る。あるいは、そして以下
に記載するように、接合体化部分７０および８０は、ＭＨＣ結合ドメインをキャ
リアに接合体化させるように、共有結合的または非共有結合的に互いに結合し得
る分子のいずれかの対であり得る。
【００９５】 他の実施態様では、図１〜７に示す種々のエレメントは交換されても、混合さ
れてもよい。従って、例えば、図１の一価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質、
図２の二価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質、図３の１０価ＭＨＣ結合ドメイ
ン融合タンパク質、または図４の四価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質が、図
５もしくは６におけるように接合体化部分によって、または図７におけるように
第１の接合体化部分および第２の接合体化部分によって、図５もしくは７におけ
るように粒状のキャリアに、または図６におけるように分枝状ポリマーもしくは
デンドリマーキャリアに接合体化され得る。さらに、および本明細書中に記載す
るように、図に示されない他の実施態様は、利用され得る。
【００９６】 １．多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体についてのＭＨＣ成分の選択 以前に記載された一価および多価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質（ここ
で、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインが二量体化ドメインと共に使用され、融合タ
ンパク質の安定かつ可溶性のヘテロ二量体を生成した）と対照的に、本発明の多
量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、クラスＩまたはクラスＩＩのＭＨＣ結合ドメ
インのいずれかを使用し得る。以前のように、本質的に任意の哺乳動物ＭＨＣタ
ンパク質が使用され得るが、本願発明がヒト疾患の診断および処置において最も
大きな有用性を有することが理解されるように、ＭＨＣクラスＩタンパク質およ
びＭＨＣクラスＩＩタンパク質は好ましくはヒトＭＨＣタンパク質である。
【００９７】 従って、ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質における使用について先に記載さ
れた任意のＭＨＣ結合ドメインもまた、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の産生
において使用され得る。同様に、上記の同じＭＨＣスプライス点は、ＭＨＣクラ
スＩＩαおよびβ鎖の完全な細胞外部分、またはＭＨＣ結合ドメインを含むそれ
らの鎖の最小部分のみを得るために使用され得る。
【００９８】 さらに、上記の任意の一価または多価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質が、
多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体中のＭＨＣ成分として使用され得る。従って、
例えば、免疫グロブリンドメインに結合した（介在性コイルドコイル二量体化ド
メインまたは挿入された可撓性分子リンカーを含むまたは含まない）ＭＨＣクラ
スＩＩ分子のＭＨＣ結合ドメインを少なくとも含む二価ＭＨＣ結合ドメイン融合
タンパク質は、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体を生成するためにキャ
リアに結合され得る。同様に、上記の四価および十価ＭＨＣ結合ドメイン融合タ
ンパク質構築物は、多価ＭＨＣ結合ドメイン接合体を生成するためにキャリアに
結合され得る。より簡単には、上記のコイルドコイルまたは他の二量体化ドメイ
ンを使用する一価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質は、多量体ＭＨＣ結合ドメ
イン接合体を生成するためにキャリアに結合され得る。
【００９９】 しかし、さらに、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、外因性コイルドコイル
または二量体化ドメインを含まないＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインを使用して生
成され得る。従って、例えば、ＳｔｅｒｎおよびＷｉｌｅｙ（１９９２）の方法
によって生成され得るもののような、外因性二量体化ドメインを含まない生理学
的条件下で安定であるＭＨＣクラスＩＩ分子の細胞外ドメインまたはペプチド結
合ドメインもまた、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体を生成するために
キャリアに結合され得る。例えば、クラスＩＩ ＨＬＡ−ＤＲ１分子およびＨＬ
Ａ−ＤＲ４分子のＭＨＣ結合ドメインは、短縮形態で生成され得、そしてヘテロ
二量体の安定化を補助する二量体化ドメインなしにキャリアに結合され得る。そ
のような短縮型ＭＨＣクラスＩＩタンパク質についてのスプライス点の選択にお
ける考慮は、ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質について先に記載される考慮と
同じであり、ここで繰り返さない。
【０１００】 さらに、ＭＨＣ結合ドメインが、ＭＨＣクラスＩタンパク質およびＭＨＣクラ
スＩＩタンパク質由来である、多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体が生成され得る
。特に、クラスＩ ＭＨＣ結合ドメインは、二量体化ドメインによる安定化を必
要とはしない。なぜなら、これらの分子（すなわち、β2−ミクログロブリン） の軽鎖は、天然における膜貫通ドメインを欠くが、にもかかわらず生理学的条件
下でクラスＩα鎖と安定に会合し得るからである。従って、ＭＨＣ結合ドメイン
接合体は、キャリアに結合したＭＨＣクラスＩα鎖のペプチド結合ドメインと少
なくとも会合するβ2−ミクログロブリンを使用して生成され得る。ＭＨＣクラ スＩＩα鎖のものと同様に、ＭＨＣクラスＩα鎖についてのスプライス点の選択
は、当業者の能力の範囲内である。しかし、詳細には、スプライス点は、好まし
くは、α３ドメインのＣ末端残基と膜貫通ドメインのＮ末端残基との間（例えば
、成熟ＨＬＡ−Ａ２タンパク質の残基約２７３〜２８３の間、好ましくは２８３
位のＰｒｏ残基または２８４位のＩｌｅ残基の後）で選択される。好ましくは、
ＭＨＣクラスＩα鎖の全細胞外ドメイン全体が使用される。
【０１０１】 ２．ＭＨＣ結合ドメイン接合体のためのキャリアの選択 本発明のＭＨＣ結合ドメイン接合体は、粒子、ビーズ、分枝状ポリマー、デン
ドリマー、またはリポソームを含むがこれらに限定されない非常に種々のキャリ
アのいずれかとともに生成され得る。このキャリアは、多数のＭＨＣ結合ドメイ
ンに直接的または間接的のいずれかで結合され得なくてはならず、従って好まし
くは結合反応において使用され得る表面の近くに多数の反応性基を含む。しかし
、あるいは、このキャリアは、接合部分が化学的結合形成なしに吸着され得る表
面を有し得る。このましくは、このキャリアは粒子であり、形状が、一般に球形
（ｓｐｈｅｒｉｃａｌ）、楕円状、棒形、球状（ｇｌｏｂｕｌａｒ）、または多
面体である。しかし、あるいは、このキャリアは、不規則形状または分枝形状で
あり得る。好ましい実施態様において、このキャリアは、生分解性かつ非免疫原
性である物質から構成される。さらに、このキャリアは、一般に正味負電荷を有
する細胞表面への非特異的結合を低減するために、正味中性電荷または正味負電
荷を有することが好ましい。
【０１０２】 ＭＨＣ結合接合体に関して先に記載されるように、このキャリアの全体のサイ
ズおよび重量は重要な考慮である。好ましくは、このキャリアは、溶解度を増強
するため、およびインビボでの凝集によって引き起こされる可能性のある複雑化
をさけるための両方のために、微視的サイズまたはナノスコープ（ｎａｎｏｓｃ
ｏｐｉｃ）のサイズである。従って、本発明のキャリアの最も大きな断面積の直
径は、約１，０００ｎｍ未満、好ましくは約５００ｎｍ未満、そしてより好まし
くは約１００ｎｍ未満であることが好ましい。最も好ましい実施態様において、
以下に記載されるように、キャリアは、約５〜４０ｎｍの最大直径を有する。同
様に、このキャリアの全重量は、約１０，０００ｋＤａ未満、好ましくは約５，
０００ｋＤａ未満、そしてより好ましくは約１，０００ｋＤａ未満であることが
好ましい。最も好ましい実施態様において、以下に記載されるように、このキャ
リアは、約２００〜５００ｋＤａの重量を有する。
【０１０３】 （ａ）マイクロビーズキャリアまたはナノビーズキャリア 一連の実施態様において、本発明は、多数のＭＨＣ結合ドメインが実質的に球
状のマイクロビーズまたはナノビーズに結合されている、多量体ＭＨＣ結合ドメ
イン接合体の生成を提供する。このビーズは、固形、中空、または多孔性であり
得る。特定のＴＣＲを保有するＴ細胞への、マーカー（例えば、蛍光剤）または
治療剤（例えば、サイトカインまたはリンホカイン）を送達することが所望され
る特定の実施態様について、このビーズは多孔性であることが好ましい。
【０１０４】 キャリアビーズは、広範な物質から形成され得る。例えば、ビーズは、ガラス
、シリカ、ヒドロキシカルボン酸のポリエステル、ジカルボン酸のポリ酸無水物
、またはヒドロキシカルボン酸およびジカルボン酸のコポリマーから構成され得
る。より一般には、このキャリアビーズは、直鎖または分枝の、置換または非置
換、飽和または不飽和、鎖状または架橋の、アルカニル、ハロアルキル、チオア
ルキル、アミノアルキル、アリール、アラルキル、アルケニル、アラルケニル、
ヘテロアリール、またはアルコキシヒドロキシ酸のポリエステル、あるいは直鎖
または分枝の、置換または非置換、飽和または不飽和、鎖状または架橋の、アル
カニル、ハロアルキル、チオアルキル、アミノアルキル、アリール、アラルキル
、アルケニル、アラルケニル、ヘテロアリール、またはアルコキシジカルボン酸
のポリ酸無水物から構成され得る。エステルおよび無水結合の混合物（例えば、
グリコール酸およびセバシン酸のコポリマー）を含むキャリアビーズもまた使用
され得る。従って、例えば、キャリアビーズは、ポリグリコール酸ポリマー（Ｐ
ＧＡ）、ポリ乳酸ポリマー（ＰＬＡ）、ポリセバシン酸ポリマー（ＰＳＡ）、ポ
リ（乳酸−グリコール酸）コポリマー（ＰＬＧＡ）、ポリ（乳酸−セバシン酸）
コポリマー（ＰＬＳＡ）、ポリ（グリコール酸−セバシン酸）コポリマー（ＰＧ
ＳＡ）などを含む物質を含み得る。本発明において有用な他の生体適合性の生分
解性ポリマーには、以下が挙げられる：カプロラクトン（ｃａｐｒｏｌａｃｔｏ
ｎｅ）、カーボネート、アミド、アミノ酸、オルトエステル、アセタール、シア
ノアクリレート、および分解性ウレタンのポリマーまたはコポリマー、ならびに
直鎖または分枝の、置換または非置換の、アルカニル、ハロアルキル、チオアル
キル、アミノアルキル、アルケニル、または芳香族のヒドロキシ酸またはジカル
ボン酸を有するこれらのコポリマー。さらに、反応性側鎖基（例えば、リジン、
アルギニン、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、トレオニン、チロシン、
およびシステインを含む生物学的に重要なアミノ酸、またはそれらのエナンチオ
マーは、ＭＨＣ結合ドメインまたは接合部分に結合するための反応性基を提供す
るために、上述の物質のいずれかとのコポリマー中に含まれ得る。現在のところ
好ましい生分解性物質は、ＰＬＡ、ＰＧＡ、およびＰＬＧＡポリマーを含む。一
般に、米国特許第１，９９５，９７０号；同第２，７０３，３１６号；同第２，
７５８，９８７号；同第２，９５１，８２８号；同第２，６７６，９４５号；同
第２，６８３，１３６号、および同第３，５３１，５６１号を参照のこと。生体
適合性であるが非生分解性である物質もまた、本発明のキャリアビーズにおいて
使用され得る。例えば、アクリレート、エチレン−酢酸ビニル、アシル置換酢酸
セルロース、非分解性ウレタン、スチレン、塩化ビニル、フッ化ビニル、ビニル
イミダゾール、クロロスルホン化オレフィン、エチレンオキシド、ビニルアルコ
ール、ＴＥＦＬＯＮ（登録商標）（ＤｕＰｏｎｔ、Ｗｉｌｍｉｎｇｔｏｎ、ＤＥ
）、およびナイロンの非生分解性ポリマーが使用され得る。一般に、米国特許第
２，６０９，３４７号；同第２，６５３，９１７号；同第２，６５９，９３５号
；同第２，６６４，３６６号；同第２，６６４，３６７号；および同第２，８４
６，４０７号を参照のこと。
【０１０５】 現在のところ好ましい実施態様において、このビーズは、ポリスチレン、シリ
カ、ＰＧＡ、ＰＬＡ、ＰＳＡ、ＰＬＧＡ、ＰＬＳＡ、またはＰＧＳＡから構成さ
れる。現在のところ市販されている適切なビーズは、ＦｌｕｏＳｐｈｅｒｅｓTM （Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ，Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ）のようなポリスチ
レンビーズ、およびＳｐｈｅｒｉｓｏｒｂTM（Ｐｈａｓｅ Ｓｅｐａｒａｔｉｏ
ｎ，Ｎｏｒｔｈ Ｗａｌｅｓ、ＵＫ）のようなシリカビーズを含む。
【０１０６】 現在のところ好ましい実施態様において、約１０〜４００ｎｍ、より好ましく
は約２０〜１００ｎｍ、そして最も好ましくは約４０ｎｍの平均直径を有するキ
ャリアビーズを使用する。
【０１０７】 （ｂ）分枝状ポリマーキャリア 別の一連の実施態様において、本発明は、多数のＭＨＣ結合ドメインが分枝状
ポリマーに結合されている接合体の生成を提供する。分枝状ポリマーは、直鎖ポ
リマーより好ましい。なぜなら、分枝状ポリマーは、官能化され得る多数の鎖末
端を有し、従って多数のＭＨＣ結合ドメインに、直接的に、または接合部分を介
して間接的にのいずれかで結合され得るからである。
【０１０８】 好ましくは、本発明の分枝状ポリマーキャリアは、デンドリマーである。アル
ボロール（ａｒｂｏｒｏｌ）、カスケード分子、デンドリマー、またはフラクタ
ルポリマーとしてもまた公知のデンドリマーは、高度に分枝した高分子であり、
ここで分枝は、中心コアから伸びる。デンドリマー生成の１つの方法において、
デンドリマーは、モノマーの層の連続的な付加によってコア分子から外側に合成
される。デンドリマー合成の最初の回は、単一の層の添加、すなわちコアに対す
るモノマーの「ジェネレーション（ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ）」であり、ここで各
モノマーは、少なくとも１つの遊離の反応性末端を有する。ポリマー化のそれぞ
れのその後の回は、１つの層によるデンドリマーの拡大を生じ、そして遊離の反
応性末端の数を増加させる。このプロセスは、所望の直径または質量のデンドリ
マーを生成するために複数回にわたって反復され得る。分枝の密度が増加するに
つれて、最も外側の分枝は、それら自体を、より低い密度のコアを囲む球状の形
態に配置する。例えば、米国特許第５，３３８，５３２号を参照のこと。さらに
、コア分子の形状を変化させることによって、デンドリマーは、棒形状形態、デ
ィスク様形態、およびコーム様形態で生成され得る。得られたデンドリマーは、
任意の多くの数の遊離の反応性末端を有し得、その末端に、多数のＭＨＣ結合ド
メインは直接的または間接的に結合され得る。図６は、デンドリマーキャリア３
００を含む多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の概略図を提供する。
【０１０９】 好ましい実施態様において、このデンドリマーは、ポリアミドアミン；ポリア
ミドアルコール；ポリアルキレンイミン（例えば、ポリプロピレンイミンまたは
ポリエチレンイミン）；ポリアルキレン（例えば、ポリスチレンまたはポリエチ
レン）；ポリエーテル；ポリチオエーテル；ポリホスホニウム；ポリシロキサン
；ポリアミド；またはポリアリールポリマーを含む。デンドリマーはまた、アミ
ノ酸から調製される（例えば、ポリリジン）。現在市販されている適切なデンド
リマーは、ＳｔａｒｂｕｒｓｔTMデンドリマー（Ｄｅｎｄｒｉｔｅｃｈ、Ｍｉｄ
ｌａｎｄ、ＭＩ）のようなポリアミドアミンデンドリマーを含む。Ｓｔａｒｂｕ
ｒｓｔTMデンドリマーは、さらなる改変をするかまたはさらなる改変をせずに、
そして接合部分を挿入するかまたは挿入せずに、これらのキャリアの表面にＭＨ
Ｃ結合ドメインを結合するために使用され得るアミン基またはカルボキシメチル
基のいずれかで終結する。好ましくは、カルボキシル基または他の負に荷電した
反応性基で終結するデンドリマーが使用される。
【０１１０】 デンドリマーの異なる「ジェネレーション（ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ）」は、末
端の反応性基の重量、サイズ、および数が異なる。例えば、ジェネレーション１
ポリアミドアミンＳｔａｒｂｕｒｓｔTMデンドリマーは、約１．０ｋＤａの分子
量、約１．６ｎｍの直径、および６の末端基を有し；ジェネレーション２は、約
２．４ｋＤａの分子量、約２．２ｎｍの直径、および１２の末端基を有し；ジェ
ネレーション３は、約５．１ｋＤａの分子量、約３．１ｎｍの直径、および２４
の末端基を有し；ジェネレーション４は、約１０．６ｋＤａの分子量、約４．０
ｎｍの直径、および４８の末端基を有し；ジェネレーション５は、約２１．６ｋ
Ｄａの分子量、約５．３ｎｍの直径、および９６の末端基を有し；ジェネレーシ
ョン６は、約４３．５ｋＤａの分子量、約６．７ｎｍの直径、および１９２の末
端基を有し；ジェネレーション７は、約８７．２ｋＤａの分子量、約８．０ｎｍ
の直径、および３８４の末端基を有し；ジェネレーション８は、約１７４．８ｋ
Ｄａの分子量、約９．２ｎｍの直径、および７６８の末端基を有し；ジェネレー
ション９は、約３４９．９ｋＤａの分子量、約１０．５ｎｍの直径、および１５
３６の末端基を有し；ジェネレーション１０は、約７００ｋＤａの分子量、約１
２．４ｎｍの直径、および３０７２の末端基を有する（Ｒｏｂｅｒｔｓら、１９
９６）。
【０１１１】 非デンドリマー分枝状ポリマーもまた本発明において使用され得、そしてデン
ドリマーと同じ一般的な分類の物質から生成され得る。そのような分枝状ポリマ
ーの合成もまた当該分野において周知である。本明細書中において使用される「
分枝状ポリマー」は、炭素および／またはヘテロ原子骨格の分枝によって形成さ
れる少なくとも５の末端、好ましくは少なくとも１０の末端、そしてより好まし
くは２０〜５００の末端を有するポリマーを意味する。
【０１１２】 （ｃ）リポソームキャリア 別の一連の実施態様において、本発明は、多数のＭＨＣ結合ドメインがリポソ
ームの外表面に結合されている多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の生成を提供す
る。脂質小胞とも呼ばれるリポソームは、脂質膜に閉じこめられた水性区画であ
り、そして代表的には水性媒体中に適切な脂質を懸濁させ、混合物を振盪、成形
（ｅｘｔｒｕｉｎｇ）、または超音波処理して小胞の分散を生じることによって
形成される。種々の形態のリポソーム（単層小胞および多層小胞を含む）は、本
発明において使用され得る。
【０１１３】 リポソームは、以下を含むがそれらに限定されない種々の脂質物質から調製さ
れ得る：ホスファチジルコリン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルイノシ
トール、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルエタノールアミン、ホス
ファチジン酸、ジセチルリン酸、モノシアロガングリオシド、ポリエチレングリ
コール、ステアリルアミン、オボレクチン、およびコレステロールの脂質、なら
びに化学量論を変化させる際のこれらの混合物。本明細書中で使用されるリポソ
ームはまた、ポリ（オキシエチレン−ｂ−イソプレン−ｂ−オキシエチレン）な
どのブロックコポリマーのような非脂質両親媒性分子から形成され得る。好まし
い実施態様において、リポソームは、負電荷のリポソーム（例えば、ホスファチ
ジルセリン、ジセチルリン酸、およびジミリストイルホスファチジン酸から生成
されるリポソーム）を形成する脂質から調製される。
【０１１４】 リポソームの表面はまた、免疫原性を低減するために、または結合のための簡
便な反応基を提供するために改変され得る。例えば、シアリン酸または他の炭水
化物、あるいはポリエチレングリコールまたは他のアルキルもしくはアルケニル
ポリマーは、免疫原性を低減するようにリポソーム表面に付着され得る。あるい
は、低モルパーセンテージの例えばビオチン−Ｘ−ジパルミトイルホスファチジ
ルエタノールアミン（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ、Ｅｕｇｅｎｅ，ＯＲ
）をリポソーム中に封入することによって、ビオチンのような接合部分を保有す
るリポソームが生成され得る。
【０１１５】 ３．ＭＨＣ結合ドメインをキャリアに結合する手段 当該分野において周知の非常に種々の手段が、ＭＨＣ結合ドメインをキャリア
に結合し、本発明のＭＨＣ結合ドメイン接合体を生成するために使用され得る。
これらの方法は、ＭＨＣ結合ドメインの生物学的活性を破壊することも厳しく制
限することもせず、そして十分に多くのＭＨＣ結合ドメインが、ＭＨＣ結合ドメ
インとコグネイトＴ細胞レセプターとの相互作用を可能にする方向でキャリアに
結合されるのを可能にする任意の標準的な化学（ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ）を含む。
一般に、ＭＨＣ結合ドメインのＣ末端領域、またはＭＨＣ結合ドメイン融合タン
パク質のＣ末端領域をキャリアに結合する方法が好ましい。当然のことながら、
正確な化学は、キャリア物質の性質、ＭＨＣ結合ドメインに対するＣ末端融合の
存在または非存在、および／または接合部分の存在または非存在に依存する。
【０１１６】 一連の実施態様において、ＭＨＣ結合ドメインは、共有結合的な化学結合を介
してキャリアに結合される。例えば、ＭＨＣαまたはβ鎖のＣ末端付近の反応性
基または部分（例えば、Ｃ末端カルボキシル基、またはアミノ酸側鎖由来のヒド
ロキシル基、チオール基、またはアミン基）は、直接的な化学反応によって、キ
ャリアの表面上の反応性基または部分（例えば、ＰＬＡまたはＰＧＡポリマーの
ヒドロキシル基またはカルボキシル基、デンドリマーの末端アミン基またはカル
ボキシル基、またはリン脂質のヒドロキシル基、カルボキシル基、もしくはリン
酸基）に直接的に結合され得る。あるいは、ＭＨＣ結合ドメインおよびキャリア
の両方に共有結合し、それによってそれらをともに連結する接合部分が存在し得
る。
【０１１７】 いくつかの好ましい実施態様において、キャリアの表面上の反応性カルボキシ
ル基は、ＭＨＣ結合ドメイン、またはＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質上の遊
離のアミン（例えば、Ｌｙｓ残基由来）に、それらを例えば１−エチル−３−［
３，９−ジメチルアミノプロピル］カルボジイミドヒドロクロリド（ＥＤＣ）ま
たはＮ−ヒドロキシスクシンイミドエステル（ＮＨＳ）と反応させることによっ
て結合され得る。同様に、同じ化学を使用して、ＭＨＣ結合ドメイン、またはＭ
ＨＣ結合ドメイン融合タンパク質上の遊離のカルボキシル（例えば、Ｃ末端由来
、またはＡｓｐもしくはＧｌｕ残基由来）と、キャリアの表面上の遊離のアミン
を結合させ得る。あるいは、キャリアの表面上の遊離のアミン基は、Ａｒａｎｏ
ら（１９９１）によって本質的に記載されるスルホ−ＳＩＡＢ化学を使用して、
ＭＨＣ結合ドメインまたはＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質に共有結合され得
る。
【０１１８】 別の一連の実施態様において、ＭＨＣ結合ドメインに結合したリガンドとキャ
リアに結合した抗リガンドとの間の非共有結合は、ＭＨＣ結合ドメインをキャリ
アに結合し得る。例えば、上記のように、ビオチンリガーゼ認識配列タグは、Ｍ
ＨＣα鎖結合ドメインもしくはβ鎖結合ドメインのいずれか（または両方）のＣ
末端に、またはＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のＣ末端に結合され得、そし
てこのタグは、ビオチンリガーゼによってビオチン化され得る。次いで、このビ
オチンは、抗リガンドとしてキャリアの表面に吸着されるか、他の様式で結合さ
れるアビジンまたはストレプトアビジンにＭＨＣ結合ドメインを非共有結合する
リガンドとして作用し得る。あるいは、ＭＨＣ結合ドメインが上記のようにＦｃ
領域を保有する免疫グロブリンドメインに融合される場合、Ｆｃドメインは、リ
ガンドとして作用し得、そしてキャリアの表面に共有結合または非共有結合した
プロテインＡは、キャリアにＭＨＣ結合ドメインを非共有結合する抗リガンドと
して作用し得る。ＭＨＣ結合ドメインをキャリアに非共有結合するために使用さ
れ得る他の手段が当該分野において周知であり、この手段は、金属イオンキレー
ト化技術（例えば、ＭＨＣ結合ドメインまたはＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク
質のＣ末端でのポリＨｉｓタグ、およびＮｉ+コートキャリアを使用する）を含 み、そしてこれらの方法は、本明細書中に記載されるものの代わりに置換され得
る。
【０１１９】 ４．ＭＨＣ結合ドメイン接合体と会合したアクセサリー分子 本発明のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体はまた、特定の利用
に適切である種々のアクセサリー分子または部分と会合（ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ
）または結合（ｂｏｕｎｄ）され得る。例えば、この融合タンパク質または接合
体は、Ｔ細胞を殺傷するためのサイトカイン（例えば、ゲニステイン、リシン、
ジフテリア毒素、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ毒素、Ｆａｓリガンド、および放射性
同位体）を含む分子または部分、またはＴ細胞を活性化もしくはアネルギー化（
ａｎｅｒｇｉｚｉｎｇ）するためのＴ細胞調節分子（例えば、Ｂ７−１、Ｂ７−
２、ＬＦＡ−３、ＣＤ４０、またはＩ−ＣＡＭタンパク質）に会合または結合さ
れ得る。さらに、ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体は、放射性標
識または蛍光標識のような、融合タンパク質または接合体の存在を検出するため
に有用である種々の分子または部分と会合または結合され得る。
【０１２０】 ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質について、そのようなアクセサリー分子ま
たは部分は、好ましくは、融合タンパク質のＣ末端領域、またはそのコグネイト
ＴＣＲ（例えば、Ｆｃドメイン、二量体化ドメイン、または可撓性分子リンカー
に沿って）に結合するその能力を阻害すると予期されないいくつかの他の点にて
結合される。ＭＨＣ結合ドメイン接合体について、アクセサリー分子は、ＭＨＣ
結合ドメインもしくは融合タンパク質成分（例えば、二量体化ドメイン）、可撓
性分子リンカーまたは接合部分、またはキャリアに同様に結合され得る。キャリ
アが中空（例えば、リポソームまたは中空ビーズ）または多孔性（例えば、デン
ドリマーまたは多孔性ビーズ）であるＭＨＣ結合ドメイン接合体について、アク
セサリー分子または部分は、キャリアの内部または孔内に含まれ得る。キャリア
の内部内への封入は、ＭＨＣ結合ドメイン接合体がＴ細胞内にエンドサイトーシ
スを受けた後にそれらの効果を働かせ得る細胞傷害性剤について特に好ましい。
Ｔ細胞調節効果を働かせるアクセサリー分子（例えば、Ｂ７−１、Ｂ７−２、お
よびＣＤ４０、これらは、ネイティブＴ細胞の活性化を補助する同時刺激性分子
である）、またはＴ細胞へのＭＨＣ結合ドメイン接合体の接着を促進し得るアク
セサリー分子（例えば、ＬＦＡ−３またはＩ−ＣＡＭ）について、アクセサリー
分子は、好ましくは、ビーズ、デンドリマー、またはリポソームのようなキャリ
アの外側に結合される。
【０１２１】 アクセサリー分子は、ＭＨＣ結合ドメイン、またはＭＨＣ結合ドメイン融合タ
ンパク質をキャリアに結合させるための上記の技術を含む当該分野において公知
の標準的な化学技術によってＭＨＣ結合ドメイン接合体に結合され得る。アクセ
サリー分子は、当該分野において公知の標準的な技術によって、多孔性キャリア
内に会合され得るか、または中空キャリア内に含まれ得る。
【０１２２】 （ＩＩＩ．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体の使用） １つの局面において、本発明は、規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体特異性の
Ｔ細胞を検出および／または単離する方法を提供し、この方法は、Ｔ細胞の集団
を、上記のように、本発明の一価、多価、もしくは多量体のＭＨＣ結合ドメイン
融合タンパク質または接合体と接触させる工程を包含し、これは、特定のＭＨＣ
結合ペプチドでロードされ、従って特定のＭＨＣ／ペプチド複合体を規定する。
次いで、Ｔ細胞の活性化または増殖を決定し得、そしてＴ細胞増殖が規定された
ＭＨＣ／ペプチド複合体に特異的なＴ細胞を含むか否かの指標として、適切なコ
ントロールとともに、使用し得る。あるいは、規定された特異性を有する、本発
明の一価、多価、もしくは多量体のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接
合体を基板上に固定化し得、そしてＴ細胞の集団を固定化されたＭＨＣ結合ドメ
インと接触させ得る。存在するのであれば、一定の期間にわたって、規定された
ＭＨＣ／ペプチド複合体に対して特異的なＴ細胞を結合させた後、非結合細胞を
洗い流し得、そして結合Ｔ細胞の存在または非存在を、Ｔ細胞集団が規定された
ＭＨＣ／ペプチド複合体に対して特異的なＴ細胞を含むか否かの指標として使用
し得る。別の実施態様において、本発明の一価、多価、もしくは多量体のＭＨＣ
結合ドメイン融合タンパク質および接合体を、Ｔ細胞集団と接触させ得、そして
存在するのであれば、一定期間にわたって、規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体
に対して特異的なＴ細胞のＭＨＣ結合ドメインを結合させた後、非結合融合タン
パク質または接合体を洗い流し得、融合タンパク質または接合体の存在あるいは
非存在を、Ｔ細胞集団が規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対して特異的なＴ
細胞を含むか否かの指標として使用し得る。このような全ての実施態様において
、Ｔ細胞、融合タンパク質もしくは接合体、またはＭＨＣ／ペプチド複合体の反
応性のＴ細胞レセプターとの複合体の標識を、蛍光、放射活性、もしくは他のマ
ーカーで行って、簡単な検出に好ましい。特に、蛍光標識を、ＦＡＣＳ（蛍光活
性化セルソーティング）技術と組み合わせて使用して、規定されたＭＨＣ／ペプ
チド特異性を有するＴ細胞の所望の亜集団を単離し得る。
【０１２３】 特に好ましい実施態様において、特異的な、規定されたＭＨＣ／ペプチド複合
体に反応性であるＴ細胞を検出して、そして上記のように単離し、次いで、養子
免疫治療のために、好ましくは、インビトロの増殖後に使用する。従って、Ｔ細
胞の集団は、宿主（処置された被験体かまたは同系のドナーのいずれか）から得
られ得る。次いで、特定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応性であるＴ細胞
を上記の方法を使用して検出し、そして単離する。次いで、細胞を、好ましくは
、それらの数を増加させるために数回の増殖後に、被験体に投与（例えば、静脈
内、腹腔内）して、養子免疫を付与する。このような手順は、腫瘍関連抗原のよ
うな弱い抗原に対して養子免疫を刺激することにおいて特に有用であり得る。
【０１２４】 別の局面において、本発明は、Ｔ細胞をインビボまたはインビトロで刺激また
は活性化する方法を提供する。上記のように、本発明は、どの可溶性対応物もこ
れまで存在しなかった可溶性クラスＩＩＭＨＣ融合タンパク質の生成、および既
存のものより多価である、多価かつ多量体のクラスＩおよびクラスＩＩ ＭＨＣ
結合ドメインの生成を提供する。従って、これらの一価、多価、および多量体の
ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体（適切なＭＨＣ結合ペプチドと
共にロードされ、そして特定のＭＨＣ／ペプチド複合体を規定する）は、ここで
、インビボまたはインビトロで溶液中のＴ細胞と接触されて、規定されたＭＨＣ
／ペプチド複合体に対して反応性であるＴ細胞を特異的に刺激または活性化し得
る。上記のように、本発明の多価および多量体のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパ
ク質および接合体は、これらの目的のために特に強力であることが予測される。
インビボで行われた場合（例えば、本発明のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質
または接合体が薬学的調製物として投与される場合）、これは、規定されたＭＨ
Ｃ／ペプチド複合体において提示された場合、ＭＨＣ結合ペプチドに対するワク
チン接種の方法として働く。ＭＨＣ結合ペプチドを含む病原体に対して、ワクチ
ン目的で使用される場合、もちろん、融合タンパク質または接合体のＭＨＣ結合
ドメイン成分を選択して、ワクチン接種される被験体に対して同系にする。
【０１２５】 別の局面において、本発明の一価、多価、または多量体のＭＨＣ結合ドメイン
融合タンパク質および接合体を使用して、規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に
対して反応性のＴ細胞を殺傷もしくは無力にし（ａｎｅｒｇｉｚｅ）得るか、ま
たは特定のＭＨＣ／ペプチド複合体に対して個体を寛容性にし得る。例えば、Ｍ
ＨＣ結合ドメイン融合タンパク質は、補体系を活性化するＦｃ領域を含み得、こ
のことによってその融合タンパク質が結合するＴ細胞の破壊を引き起こす。ある
いは、この融合タンパク質は、例えば、Ｃ末端に結合した細胞毒性物質を、また
はコグネイトＴ細胞レセプター（例えば、二量体化ドメイン、Ｆｃドメイン、リ
ガンドタグドメイン、または可撓性分子リンカー）に対するＭＨＣ／ペプチド複
合体の結合を妨害しない、いくらか他の点で細胞毒性物質を含むように設計され
得る。同様に、ＭＨＣ結合ドメイン接合体は、ＭＨＣ結合ドメインに対して、融
合タンパク質成分（例えば、二量体化ドメイン、Ｆｃドメイン、リガンドタグド
メイン）に対して、可撓性分子リンカーもしくは接合体化部分に対して、または
キャリアに対して結合した細胞毒性物質を含むように設計され得る。キャリアが
中空（例えば、リポソームまたは中空ビーズ）または多孔性（例えば、デンドリ
マーまたは多孔性ビーズ）であるＭＨＣ結合ドメイン接合体について、細胞毒性
物質はキャリアの内部または孔内に含まれ得る。これらの実施態様において、有
用な細胞毒性物質としては、例えば、ゲニステイン、リシン、ジフテリア毒素、
シュードモナス毒素、および放射活性同位元素（例えば、125Ｉ）が挙げられる 。高用量の多くの抗原がＴ細胞刺激効果よりむしろ、Ｔ細胞の寛容化効果もしく
は無力化効果を有することは当該分野で公知である。従って、高用量の、本発明
の一価、多価または多量体のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質または接合体の
投与は、より低用量が感作を引き起こす場合（例えば、ワクチン接種または免疫
）ですら、ＭＨＣ／ペプチド複合体に対する寛容化を引き起こし得る。被験体自
身のＭＨＣ分子によって正常に提示される抗原に対して個体を寛容化することが
目的である場合、融合タンパク質または接合体のＭＨＣ結合ドメイン成分は、被
験体と同系であるように選択される。このような場合は、アレルギー反応を引き
起こす抗原、および自己免疫疾患において関係づけられる自己抗原に対する寛容
性を含む。しかし、他の場合において、ＭＨＣ成分は、外来性のＭＨＣ／ペプチ
ド複合体に対して被験体を寛容化するように、特異的に同種異系であり得る。こ
のような場合は、ドナーおよびレシピエントが１つ以上のＭＨＣ対立遺伝子に関
して同一でない器官または組織移植の前または後の外来組織に対する寛容化を含
む。
【０１２６】 用語「有効量」によって、ＭＨＣ／ペプチド複合体に対する個体の寛容化に関
して、Ｔ細胞をＭＨＣ／ペプチド複合体に非応答性にさせるか、そうでなければ
ＭＨＣ／ペプチド複合体に特異的にさせるために十分な量を意味する。非応答性
であるＴ細胞は、それらが特異的である複合体とともに提示された場合、活性化
も増殖もしない。用語「有効量」によって、抗原に対して個体を免疫することに
関して、ＭＨＣ／ペプチド複合体における抗原に対して特異的なＴ細胞の活性化
または増殖を生じる免疫応答を誘導するために十分な量を意味する。投薬量の代
表的な範囲は、１ｎｇ／ｋｇ体重〜１００ｍｇ／ｋｇ体重または５００ｍｇ／ｋ
ｇ体重ですらある。有効量は、年齢、性別および抗原に対する感受性のような因
子に従って変化する。
【０１２７】 ＭＨＣの特定の対立遺伝子は、種々の疾患と関連し、これらの疾患としては、
多発性硬化症（ＭＳ）、慢性関節リウマチ（ＲＡ）、尋常性天疱瘡（ＰＶ）およ
び全身性エリテマトーデス（ＳＬＥ）が挙げられる。そしてこれらの疾患は、少
なくとも一部分は事実上、自己免疫疾患であると仮定される。すなわち、特定の
ＭＨＣタンパク質が、ＭＨＣクラスＩまたはクラスＩＩ分子との複合体の形成に
おいてＴ細胞に提示されるプロセシングされた自己ペプチドを「不適切に」認識
することを示唆する。このことを実証するために、この疾患において関係づけら
れた単一の自己ペプチドを用いてロードされ得る、ＭＨＣ結合ドメイン融合タン
パク質または接合体を使用し得る。例えば、このようなＭＨＣ／ペプチド複合体
を使用して、融合タンパク質または接合体の形態で、ＭＳ患者の病変をプローブ
して、浸潤しつつあるＴ細胞が、特定の同系ＭＨＣ分子に対して結合した、特定
の自己ペプチドに対して反応性であるか否かを決定し得る。より一般的には、本
発明のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体を使用して、（共有結合
もしくは非共有結合された）適切なＭＨＣ結合ペプチドを用いてロードされたＭ
ＨＣ結合ドメイン融合タンパク質または接合体を構築すること、およびＭＨＣ結
合ドメインと接触させたＴ細胞の結合および／または活性化を検出することによ
って、任意の規定された特異性を有するＴ細胞を検出し得る。
【０１２８】 従って、例示としてのみ、本発明の診断的有用性および治療的有用性がＭＳに
関して考慮される。ＭＳの罹りやすさに対するＭＨＣの寄与は、多数の研究にお
いて試験された（ＳｐｉｅｌｍａｎおよびＮａｔｈｅｎｓｏｎ、１９８２；Ｈｉ
ｌｌｅｒｔら、１９９４において総説される）。これらの研究によって、罹りや
すさがＭＨＣクラスＩＩ領域と関連し、かつ特定のＭＨＣクラスＩＩハプロタイ
プが危険性の増加を付与することが示された。最も強力な関連は、ＨＬＡ−ＤＲ
−２ハプロタイプ（ＤＲＢ１*１５０１）とであり；ＭＳ患者の約５０〜６０％ 、および正常被験体の２０％がこのハプロタイプを有する。ＤＲ２ハプロタイプ
は、西欧、米国およびカナダのＭＳ患者に最も共通であり；このハプロタイプは
、全世界のＭＳ患者の中でもまた増加している。他のＭＨＣクラスＩＩハプロタ
イプ（ＤＲ４、ＤＲ６）は、特定の集団（イタリア人、ヨルダンのアラブ人）に
おけるＭＳに対する罹りやすさに関連する；しかし、これらの関連は、ＤＲ２と
の関連ほど強くはない（Ｍａｒｒｏｓｕら、１９８８；Ｋｕｒｄｉら、１９７７
）。
【０１２９】 ＨＬＡ−ＤＲ２（ＤＲＡ、ＤＲＢ１*１５０１遺伝子によってコードされる） は、ヒトミエリン塩基タンパク質の少なくとも２つのペプチド（残基８５〜９９
および１４８〜１６２）をＴ細胞に提示することが示された。ＭＢＰ（８５〜９
９）ペプチドは、精製されたＤＲ２に対して高親和性で結合し、そしてＭＢＰ（
１４８〜１６２）ペプチドの親和性は、より低いが有意である。ＤＲ２トランス
フェクト体（ＤＲＡ、ＤＲＢ１*１５０１）は、Ｔ細胞クローンに対してこれら のＭＢＰペプチドを提示することが見いだされ、このＴ細胞は、ＭＳ患者の血中
リンパ球から生成された（Ｃｈｏｕら、１９８９；Ｐｅｔｔｅら、１９９０；Ｍ
ａｒｔｉｎら、１９９０；Ｏｔａら、１９９０；Ｗｕｃｈｅｒｐｆｅｎｉｎｎｇ
ら、１９９０；Ｖａｌｌｉら、１９９３；Ｗｕｃｈｅｒｐｆｅｎｉｎｎｇら、１
９９４）。これらの研究によって、ＭＢＰおよび他のミエリン抗原に対して特異
的なＴ細胞がＭＳにおける炎症応答に関与するという仮説が支持される。しかし
、ＭＳ病変におけるこのようなＴ細胞の直接的な同定は、この仮説を証明するこ
とを必要し、そしてこのことは、単一のペプチドとの可溶性の安定なＭＨＣ複合
体（例えば、本発明によって提供されるＭＨＣ複合体のような）を必要とする。
さらに、Ｔ細胞を寛容化することによるか、または殺傷することによるかにかか
わらず、治療的介入は、例えば、本発明によって提供される多価および多量体の
ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体のような、特定のＭＨＣ／ペプ
チド複合体に対して特異的なＴ細胞を結合するために高アビディティーを有する
、可溶性の、安定なＭＨＣ複合体を必要とする。
【０１３０】 プローブおよび治療法として可溶性のＭＨＣ／ペプチド複合体を用いる主な困
難性は、ＴＣＲに対する親和性が比較的低いことである。Ｔ細胞は、抗原提示細
胞の表面上でのＭＨＣ／ペプチド複合体との複数のＴＣＲ分子の相互作用によっ
てＭＨＣ／ペプチド複合体に対するＴＣＲの比較的低い親和性を補完する。事実
、ＭＨＣクラスＩＩ分子のこのような二量体化は、Ｔ細胞活性化において重要で
あり得る。なぜなら、ＨＬＡ−ＤＲ１は結晶化した場合、二量体として見いださ
れたからである（Ｂｒｏｗｎら、１９９３）。本発明は、多価および多量体のＭ
ＨＣ融合タンパク質および接合体を提供することによって、この問題と取り組む
。抗体およびそれらのＦ（ａｂ）フラグメントを用いた古典的な研究により、二
価／多価結合が「機能的親和性」（アビディティーとも呼ばれる）の顕著な増加
を生じることが実証された。ＩｇＧ分子およびＦ（ａｂ）フラグメントが溶液中
で等価な親和性で一価抗原を結合する；しかし多価抗原（すなわち、細胞表面抗
原）に対する結合は、ＩｇＧ分子の二価の性質によってより大きく強力にされる
（ＣｒｏｔｈｅｒｓおよびＭｅｔｚｇｅｒら、１９７２；Ｄｏｗｅｒら、１９８
４；ＨｏｒｎｉｃｋおよびＫａｒｕｓｈ、１９７２）。事実、ＩｇＧ抗体の「機
能的親和性」は、一価結合に対するよりも二価結合に対しての方が約１００倍高
いことが見いだされ、そしてこの増強係数はＩｇＭ抗体による多価結合に対して
さらにより高かった（１０3〜１０4の係数）。従って、本発明の多価および多量
体のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体は、標準的な可溶化された
ＭＨＣタンパク質より、それらのコグネイトＴＣＲに対して、はるかに大きなア
ビディティーを有することが予測される。
【０１３１】 （実施例） （Ａ．モノマーＭＨＣ結合ドメイン−コイルドコイル二量体化ドメイン融合タ
ンパク質） （１．モノマーＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のＤＮＡ構築物）ＨＬＡ−
ＤＲ２α鎖（ＤＲＡ*０１０１の残基１〜１９１）およびβ鎖（ＤＲＢ１*１５０
１の残基１〜１９８）の細胞外ドメインを、それぞれ、ＦｏｓまたはＪｕｎの４
０アミノ酸ロイシンジッパー二量体化ドメインを有する融合物として発現した（
ｖａｎ Ｓｔｒａａｔｅｎら、１９８３；Ａｎｇｅｌら、１９８８）。Ｃ末端短
縮化ドメインよりむしろ、細胞外ドメイン全体を、ＤＲαの１９１位のＧｌｕお
よびＤＲβの１９８位のＬｙｓとの間の荷電間相互作用がこれらの分子のアセン
ブリを容易にすると考えられる（ＣｏｓｓｏｎおよびＢｏｎｉｆａｃｉｎｏ、１
９９２）ために、使用した。ＤＲαおよびＤＲβの細胞外ドメインならびにＦｏ
ｓおよびＪｕｎの二量体化ドメインを、ＭＨＣ細胞外ドメインのＣ末端およびＦ
ｏｓまたはＪｕｎロイシンジッパードメインのＮ末端においてＳａｌＩ認識部位
を有する７アミノ酸リンカー（ＶＤＧＧＧＧＧ、配列番号２の残基１９９〜２０
５）を含むように設計されたプライマーを用いてＰＣＲによって生成した。次い
で、ＭＨＣセグメントを、ＳａｌＩ制限部位によってＦｏｓまたはＪｕｎセグメ
ントと連結した。このリンカーは、ＤＲとロイシンジッパーセグメントとの間に
含まれて、（ＳａｌＩ部位によって）クローニングを容易にし、かつ（ポリ−Ｇ
ｌｙ配列によって）鎖のより大きな回転自由度を可能にする。これらの構築物を
ＰＣＲによって再び増幅して、ｐＰＩＣ９のＸｈｏＩ−ＥｃｏＲＩ部位に、α接
合因子分泌シグナルとともにインフレーム融合物としてクローニングを可能にし
た。このベクターへのインフレームクローニングは、ＫＥＸ２遺伝子産物により
α接合分泌シグナルの切断を必要とする（Ｂｒａｋｅ、１９９０）Ｌｙｓ−Ａｒ
ｇ−Ｇｌｕ認識配列（Ａｒｇに対してＣ末端を切断する）を保存した。
【０１３２】 以下のオリゴヌクレオチドを構築物のために使用した：ＤＲα正方向プライマ
ー５’ＧＴＡ ＴＣＴ ＣＴＣ ＧＡＧ ＡＡＡ ＡＧＡ ＧＡＧ ＡＴＣ Ａ
ＡＡ ＧＡＡ ＧＡＡ ＣＡＴ ＧＴＧ ＡＴＣ３’、ＸｈｏＩ部位に下線を付
した（配列番号５）；ＤＲα逆方向プライマー５’ＧＴＣ ＡＴＡ ＧＡＡ Ｔ ＴＣ ＴＣＡ ＡＴＧ ＧＧＣ ＧＧＣ ＣＡＧ ＧＡＴ ＧＡＡ ＣＴＣ Ｃ
ＡＧ ３’、ＥｃｏＲＩ部位に下線を付した（Ｆｏｓセグメントの３’末端、停
止コドン、およびＥｃｏＲＩ制限部位をコードする）（配列番号６）；ＤＲβ正
方向プライマー、５’ＧＴＡ ＴＣＴ ＣＴＣ ＧＡＧ ＡＡＡ ＡＧＡ ＧＡ
Ｇ ＧＧＧ ＧＡＣ ＡＣＣ ＣＧＡ ＣＣＡ ＣＧＴ ＴＴＣ３’、ＸｈｏＩ
部位は下線を付した（配列番号７）；ＤＲβ逆方向プライマー、５’ＧＴＣ Ａ
ＴＡ ＧＡＡ ＴＴＣ ＴＣＡ ＡＴＧ ＧＴＴ ＣＡＴ ＧＡＣ ＴＴＴ Ｃ
ＴＧ ＴＴＴ ＡＡＧ３’、ＥｃｏＲＩ部位は、下線を付した（Ｊｕｎセグメン
トの３’末端、終止コドン、およびＥｃｏＲＩ制限部位をコードする）（配列番
号８）。得られたＰＣＲ産物を配列番号１および配列番号３として開示する。こ
れらのＰＣＲ産物を、ｐＰＩＣ９のＸｈｏＩ−ＥｃｏＲＩ部位にクローニングし
、そして制限マッピングおよびジデオキシ配列決定法によって確認した。
【０１３３】 これらの構築物を、最初にＣＨＯ細胞において（天然のＤＲαおよびβ鎖シグ
ナルペプチドを使用して）試験した。ＣＨＯトランスフェクト体は、ＤＲαβヘ
テロ二量体をアセンブリかつ分泌することを見いだし、このことは、Ｆｏｓ／Ｊ
ｕｎロイシンジッパーがＤＲ２分子の適切なアセンブリを促進することを示す（
データは、示さず）。しかし、以下に示されるように、より高レベルの発現を、
Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓを用いる酵母発現系において得た。最近の研究
では、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞が高レベルのタンパク質
生成（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓの０．３ｍｇ／Ｌと比較して、約１ｍｇ
／Ｌ）を与えることを実証した。
【０１３４】 （２．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質構築物でのＰｉｃｈｉａの形質転換
）タンパク質生成について、ＤＲα−ＦｏｓおよびＤＲβ−Ｊｕｎ構築物をＰｉ
ｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓにおいてアルコールオキシダーゼ（ＡＯＸ１）プロ
モーターの制御下で発現させた。Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓは安定な形質
転換体を迅速に生成しかつ分泌し得るために選択され；さらにいくつかの分泌タ
ンパク質がこの系において非常に高レベルで生成された（Ｃｒｅｇｇら、１９９
３）。
【０１３５】 分泌経路に対する発現を指向するために、ＤＲαおよびβ鎖を、α接合因子分
泌シグナルとともにインフレーム融合物として、Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉ
ｓ発現ベクターｐＰＩＣ９にクローニングした（Ｂｒａｋｅ、１９９０）。α接
合因子分泌シグナルを、ＫＥＸ２遺伝子産物によって、配列Ｌｅｕ−Ｇｌｕ−Ｌ
ｙｓ−Ａｒｇ−Ｇｌｕ（配列番号２および配列番号４の残基３〜７）で、Ａｒｇ
残基に対してＣ末端を切断した。この設計は成熟ＤＲαおよびＤＲβ鎖のＮ末端
に対するグルタミン酸残基の付加を生じるが、これらの鎖のＮ末端は、このさら
なる残基がヘテロ二量体のアセンブリに影響するべきでない様式で位置される。
α接合因子分泌シグナルを有する融合物として発現された分子は効率的に分泌さ
れる一方で、ＰＨＯ１分泌シグナルの使用（ベクターｐＨＩＬ−Ｓ１、Ｉｎｖｉ
ｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）がほとんどまたは全く分泌を生じな
い。形質転換について、ｐＰＩＣ９の発現カセットは、ＢｇｌＩＩフラグメント
として切り出され得；このカセットは、ＡＯＸ１遺伝子座への組み込みを可能に
するＡＯＸ１遺伝子の５’および３’配列を、ならびにヒスチジン欠損培地中で
形質転換体の選択を可能にするＨＩＳ４遺伝子を有する。遺伝子を、相同組換え
によってＡＯＸ１遺伝子座に組み込み；ＡＯＸ１遺伝子の組み込みは遺伝子を破
壊し、そしてメタノールが唯一の炭素源である場合（メタノール利用性欠損表現
型、ＭｕｔS）、遅延した増殖を導く（Ｃｒｅｇｇら、１９８７）。
【０１３６】 従って、ｐＰＩＣ９プラスミドＤＮＡをＣｓＣｌ勾配で精製し、そしてＢｇｌ
ＩＩで消化して、発現カセット（ＡＯＸ１遺伝子の５’末端−ＤＲαまたはＤＲ
β鎖構築物−ポリアデニル化シグナル−ＨＩＳ４遺伝子〜ＡＯＸ１遺伝子の３’
末端）を遊離する。形質転換を、ＧＳ１１５株のスフェロプラスト化によって行
われた（以下の手順は、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡによ
って提供される）。簡潔には、ＧＳ１１５細胞をＹＰＤ培地中、対数増殖期中期
まで増殖させ、そしてスフェロプラストを、ザイモリアーゼ（ｚｙｍｏｌａｓｅ
）による酵母細胞壁の限定消化（ｌｉｍｉｔｅｄ ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ）によっ
て調製した（約７０％のスフェロプラスト化）（Ｃｒｅｇｇら、１９８７）。細
胞を５ｍｇのＤＲαおよびＤＲβプラスミドＤＮＡで形質転換し、そしてＨＩＳ
４遺伝子（ｐＰＩＣ９発現カセットに存在する）を発現したトランスフェクト体
をＨＩＳ-プレート上で選択した。プラスミドのＡＯＸ１遺伝子座への組み込み を、唯一の炭素源としてメタノールまたはデキストロースを含有する最少培地プ
レート上でコロニーのレプリカプレーティングによって確認した。プラスミドＤ
ＮＡをＡＯＸ１遺伝子座へ組み込んだ形質転換体は、アルコールオキシダーゼ遺
伝子の破壊に起因して、メタノールプレート上での増殖をほとんどまたは全く示
さなかった。
【０１３７】 （３．組換えコロニーの同定） Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ系の主要な
利点は、形質転換体が容易に同定され得ることである。ＡＯＸ１遺伝子座への組
み込みは、メタノール利用性欠損（ＭｕｔS）表現型を付与する。この表現型は 、唯一の炭素源としてメタノールまたはデキストロースを含有するプレート上で
二連のコロニーの増殖を比較することによって決定され得る。ＤＲαおよびＤＲ
β鎖構築物を有するプラスミドの同時形質転換後に得られたＭｕｔSコロニーを 、ＤＲαおよびＤＲβ鎖遺伝子の組み込みについてゲノムＤＮＡのＰＣＲ分析に
よって試験した。ＭｕｔS表現型を有する２８コロニーのうち２７コロニーは、 ＤＲαおよび／またはＤＲβ鎖遺伝子を有した；これらのコロニーのうち４つ（
１４．２％）は、両方の遺伝子を組み込んでいた。
【０１３８】 従って、簡潔には、ＤＲαおよびＤＲβ鎖構築物の組み込みを、個々のＭｕｔ S コロニーから単離したゲノムＤＮＡのＰＣＲ分析によって試験した。レプリカ コロニーを、滅菌爪楊枝を用いて２００ｍｌの溶解緩衝液（２．５Ｍ ＬｉＣｌ
、５０ｍＭ Ｔｒｉｓ、ｐＨ８．０、４％ ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００、６２ｍ
Ｍ ＥＤＴＡ）に移した。酸洗浄したカラスビーズおよび等量のフェノール／ク
ロロホルム（１：１）を添加し、そしてサンプルを徹底的にボルテックスした。
遠心分離の後、上相を清潔な試験管に移し、そしてゲノムＤＮＡを２．５容量の
冷ＥｔＯＨを添加して沈澱させた。−２０℃で２０分間インキュベートした後、
ペレットを遠心分離によって回収し、７０％冷ＥｔＯＨで洗浄し、そして風乾し
た。ＤＮＡを４０ｍｌの滅菌水に再懸濁し、そして９４℃で１０分間変性させた
；１０ｍｌのＤＮＡを各ＰＣＲ反応に使用した。ＤＲαおよびＤＲβ鎖を、ＤＮ
Ａ構築物を生成するために使用したオリゴヌクレオチドを用いて、ＰＣＲによっ
て３５サイクルにわたって（９４℃で１分間、５５℃で２分間、７２℃で２分間
）増幅した；ＰＣＲ産物を、１％アガロースゲル上で分離し、エチジウムブロマ
イドで染色した。
【０１３９】 （４．モノマーＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の発現および精製） ＤＲ
αおよびＤＲβ鎖遺伝子の両方を有する４つの形質転換体をＤＲ２結合ドメイン
ヘテロ二量体の発現について試験した。細胞を、唯一の炭素源としてグリセロー
ルを含有する培地中で２日間増殖させ、次いで、０．５％メタノールを含有する
培地に切り替えた。上清および細胞溶解物を、捕獲のためにＤＲαβヘテロ二量
体に特異的なｍＡｂ（ｍＡｂ Ｌ２４３）および検出のためにポリクローナルＤ
Ｒ抗血清（ＣＨＡＭＰ）を用いてサンドイッチＥＬＩＳＡによって試験した。Ｄ
Ｒαβヘテロ二量体を、細胞溶解物およびＤＲαβトランスフェクト体の上清に
おいて検出した。ＤＲαまたはＤＲβ鎖遺伝子のみを有する形質転換体を、コン
トロールとして使用した；細胞溶解物およびこれらの細胞由来の上清は、アッセ
イにおいて陰性であった（図８）。これらの実験によって、ＤＲαβ結合ドメイ
ンヘテロ二量体がアセンブリされ、効率的に分泌されたことが実証された。４つ
のＰｉｃｈｉａクローンは類似の発現レベルを示し；これは、４つの形質転換体
全てがＡＯＸ１遺伝子座に遺伝子を組み込んでいたので、驚くべきことではない
。
【０１４０】 大規模発現について、細胞を高密度発酵槽中で増殖させ、そしてＤＲ２ ＭＨ
Ｃ結合ドメイン融合タンパク質をＬ２４３ ｍＡｂを用いたアフィニティークロ
マトグラフィーにより濃縮化上清から精製した。精製のために使用したｍＡｂ（
Ｌ２４３）は、ＤＲα鎖に結合するが、ＤＲβ鎖と適切にアセンブリされた場合
にのみ結合する。アフィニティー精製によって、培養物１Ｌあたり約３００〜４
００ｍｇのＨＬＡ−ＤＲ２融合タンパク質が得られた。ＳＤＳ−ＰＡＧＥによっ
て２つのバンド、すなわちこれらのバンドの正体（上方のバンドはＤＲα、下方
のバンドはＤＲβ）が示され、そしてα接合因子シグナルペプチドの適切な切断
を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥおよびＰＶＤＦ膜への転写によるＤＲαおよびβ鎖の分離
後のＮ末端配列分析によって確認した。
【０１４１】 １０μｇのＨＬＡ−ＤＲ２融合タンパク質のＨＰＬＣゲル濾過アッセイ（Ｂｉ
ｏ−Ｇｅｌ ＳＥＣ ３００ｍｍ×７．８ｍｍ；流速１ｍｌ／分、ＰＢＳ ｐＨ
６．８）によって、組換え融合タンパク質が単一の対称的なピークとして溶出さ
れ、そしてごくわずかな量のより高分子量の凝集物が検出されたことが実証され
た。対照的に、Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ系において発現されたＨＬＡ−ＤＲ１は
、これらの分子が高親和性ペプチドを用いてロードされなければ凝集することを
見いだした（ＳｔｅｒｎおよびＷｉｌｅｙ、１９９２）。これらのデータは、Ｄ
Ｒ２αβヘテロ二量体が、高親和性ペプチドの非存在下においてすらＰｉｃｈｉ
ａ ｐａｓｔｏｒｉｓ発現系においてアセンブリし、そして分泌したことを実証
する。重要なことには、精製された分子は、たとえそれらが高親和性ペプチドと
ともにロードされなかったとしても、凝集しなかった。
【０１４２】 高密度培養物のインキュベーションを、ｐＨ、溶存Ｏ2、攪拌、温度および通 気（ａｉｒ ｆｌｏｗ）のモニターおよび制御を備えたＩｎｃｅｌｔｅｃｈ Ｌ
Ｈシリーズ発酵槽を用いて行った。１００ｍｌのＹＮＢ−グリセロール一晩培養
物を使用して、発酵槽に接種した。この発酵槽は、４％グリセロール（Ｗ／Ｖ）
および４３．５ｍｌのＰＴＭ１微量塩（２４ｍＭ ＣｕＳＯ4、０．５３ｍＭ ＮａＩ、１９．８７ｍＭ ＭｎＳＯ4、０．８３ｍＭ Ｎａ2ＭｏＯ4、０．３２ ｍＭ ホウ酸、２．１ｍＭ ＣｏＣｌ2、０．１５ｍＭ ＺｎＣｌ2、０．２３ｍ
Ｍ ＦｅＳＯ4、および０．８２ｍＭ ビオチン）を含有する１０Ｌの発酵基本 塩培地（０．９３ｇ／Ｌ 硫酸カルシウム二水和物、１８．２ｇ／Ｌ 硫酸カリ
ウム、１４．９ｇ／Ｌ 硫酸マグネシウム七水和物、および６．５ｇ／Ｌ 水酸
化カリウム）（３０℃）を含有した。溶存Ｏ2を通気および攪拌を調節すること によって２０％より上に維持し、そしてｐＨを２８％（ｖ／ｖ）水酸化アンモニ
ウムの添加によって６．０に維持した。増殖を、グリセロールが使い果たされる
まで続けた（２０時間）。グリセロール流加培養（ｆｅｄ−ｂａｔｃｈ）相を、
５０％（Ｗ／Ｖ）グリセロールおよび１２ｍｌ ＰＭＴ１塩／Ｌグリセロールを
、培養物が湿細胞重量（ｗｃｗ）で２００ｇ／Ｌ（２２時間）に達するまで、１
８．１５ｍｌ／時間／Ｌの初期発酵容量で制限して添加することによって開始し
た。グリセロール流加培養相後、培養物を、メタノール流加培養（ｍｅｔｈａｎ
ｏｌ−ｂａｔｃｈ ｆｅｅｄ）（１２ｍｌ ＰＴＭ１微量塩／Ｌメタノールを含
有する１００％メタノール）（１ｍｌ／ｈｒ／Ｌ）でグリセロール流加培養を置
き換えることにより誘導した。メタノール流加を、３ｍｌ／時間／Ｌの速度まで
、３０分ごとに１０％増加で徐々に増加させ、そして発酵を９６時間にわたって
続けた。
【０１４３】 上清をＹＭ３０メンブレン（Ａｍｉｃｏｎ）の限外濾過により濃縮し、そして
抗ＤＲ（ｍＡｂ Ｌ２４３）アフィニティーカラムに、流速約１０ｍｌ／時間で
通過させた。ＰＢＳで徹底的に洗浄した後、ヘテロ二量体を５０ｍＭ グリシン
、ｐＨ１１．５を用いて溶出した。溶出物を、２Ｍ Ｔｒｉｓ、ｐＨ８．０を添
加してすぐに中和し、ＰＢＳに対して透析し、そして限外濾過によって濃縮した
。タンパク質濃度を、Ｃｏｏｍａｓｓｉｅ Ｐｌｕｓ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ａｓｓ
ａｙ（Ｐｉｅｒｃｅ，Ｒｏｃｋｆｏｌｄ，ＩＬ）によって、標準物質としてウシ
血清アルブミンを用いて決定した。
【０１４４】 （５．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のペプチドのロード）ＭＳ患者由来
のＴ細胞クローンに制限されたＤＲ２によって認識されるヒトミエリン塩基性タ
ンパク質フラグメント（８５〜９９残基）は、Ｌ細胞トランスフェクト体から精
製された界面活性剤可溶性ＤＲ２に高い親和性（４．２ｎＭのＩＣ50）で結合す
ることが以前に示された（Ｗｕｃｈｅｒｐｆｅｎｎｉｎｇら、１９９４および１
９９５ａ）。ビオチン部分とＭＢＰ配列との間でＳＧＳＧリンカーとビオチン化
したペプチド（すなわち、ビオチン−ＳＧＳＧ−ＭＢＰ（８５−９９））を使用
して、組換えＤＲ２融合タンパク質へのペプチド結合の特異性を試験した。ペプ
チド結合は、３７℃にて異なる時間ビオチン化ペプチド（２μＭ）とともにＤＲ
２融合タンパク質（５０−４００μＭ）をインキュベートすることにより評価し
た；非ビオチン化ペプチドを、結合の特異性を実証するための競合物として使用
した（図９）。次いで、ＤＲ２／ペプチド複合体をＬ２４３ｍＡｂを使用してＥ
ＬＩＳＡプレート上に捕獲し、そしてビオチン化ペプチドの結合量を、ペルオキ
シダーゼで標識したストレプトアビジンならびにペルオキシダーゼ基質としてＡ
ＢＴＳを使用して定量化した（４０５ｎｍで検出）。
【０１４５】 ＤＲ２融合タンパク質へのペプチド結合は、ｐＨに強く依存しており（最大で
ｐＨ７からｐＨ８で観察された）；ｐＨ５では、相対的に低い結合が観察された
。同様の最適ｐＨが、界面活性剤可溶性ＤＲ２へのＭＢＰペプチド結合について
以前に観察されている（Ｗｕｃｈｅｒｐｆｅｎｎｉｎｇら、１９９４）。ペプチ
ドの結合は、ＤＲとペプチドの相対的なモル比に依存しており、ＤＲ２の１０倍
の過剰なモルのペプチドで最大の結合を有した（図９）。結合は、特異的である
ことが示された。なぜなら、結合は、過剰な非ビオチン化ＭＢＰ（８５−９９）
ペプチドによりブロックされ得るが、ＭＢＰ（８５−９９）のＰ１アンカー残基
（Ｖａｌ ８９）が、アスパラギン酸により置換された類似のペプチドによって
はブロックされ得ないからである（図９）。
【０１４６】 ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のどの画分が、単一のペプチドをロードし
得るか決定するために、ＤＲ２融合タンパク質およびビオチン化ＭＢＰペプチド
の複合体を、ストレプトアビジンビーズと沈殿させた。沈殿に続いて、ＤＲα鎖
およびβ鎖を、ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分離し、そしてポリクローナルＤＲ抗血清を
使用してウェスタンブロッティングにより検出した。分子の約５０％が、ストレ
プトアビジンビーズと沈殿し、そして５０％が、上清中に残った。コントロール
実験は、コントロールのアガロースビーズ、未標識ＭＢＰペプチドまたはビオチ
ン化ペプチドより過剰な未標識ペプチドを使用した場合、分子が沈殿しなかった
ことから、ＤＲ２／ペプチド複合体の沈殿は特異的であることを実証した；むし
ろＤＲ２融合タンパク質が、非結合画分中に残った。
【０１４７】 免疫沈降実験のために、ＤＲ２融合タンパク質（４００ｎＭ）を、５０ｍｌ溶
量のＰＢＳ、１ｍＭ ＥＤＴＡ、１ｍＭ ＰＭＳＦ、ｐＨ７．２中で、ビオチン
化ペプチド（２μＭ）とともに３７℃にて２４時間インキュベートした。ＤＲ２
ペプチド複合体を、ストレプトアビジン−アガロースビーズと沈殿させた。ビー
ズを、最初にＰＢＳ中３％ウシ血清アルブミンン、０．１％ ＮＰ４０で、４℃
にて１時間ブロックした；次いで、ビーズをペレット化し、そしてＤＲ２／ペプ
チドサンプルを添加した。１時間のインキュベーション後、ビーズをブロッキン
グ緩衝液で３回洗浄した。ＤＲ２−ペプチド複合体を、９４℃にて３分間で、１
×ＳＤＳ−ＰＡＧＥ緩衝液中で加熱することによりストレプトアビジンビーズか
ら溶出させた。サンプルを、１２．５％ＳＤＳ−ＰＡＧＥで分離し、そしてｉｍ
ｍｏｂｉｌｏｎ膜（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ）に移した。ブロットを、５０ｍＭ Ｔ
ｒｉｓ、ｐＨ８．０、１５０ｍＭ ＮａＣｌ、０．２％ Ｔｗｅｅｎ２０（ＴＢ
ＳＴ緩衝液）中の５％乾燥脱脂乳で一晩ブロックした。沈殿したＤＲα鎖および
ＤＲβ鎖融合体をポリクローナルＤＲ抗血清を用いて検出した（ＣＨＡＭＰ、ブ
ロッキング緩衝液中１：５０，０００、９０分間）。ブロットをＴＢＳＴ緩衝液
で洗浄し、そして３０分間、ペルオキシダーゼ結合抗ウサギＩｇＧ抗体（ブロッ
キング緩衝液で１：１０，０００）とともにインキュベートした。ＴＢＳＴでの
広範な洗浄に続いて、バンドを、増強した化学発光（Ａｍｅｒｓｈａｍ、Ａｒｌ
ｉｎｇｔｏｎ Ｈｅｉｇｈｔｓ、ＩＬ）によって検出した。
【０１４８】 実験の別のセットにおいて、組換えＤＲ２融合タンパク質へのペプチド結合を
、固定化ＤＲ抗体を用いて、ＥＬＩＳＡプレートへのＤＲ２融合の捕獲により定
量した。標準的な結合条件は、３７℃にて２４時間のＰＢＳ、ｐＨ７．２、１ｍ
Ｍ ＥＤＴＡ、１ｍＭ ＰＭＳＦであった。ペプチド結合に続いて、結合したペ
プチドをＥＬＩＳＡにより定量した。プレートを、０．１Ｍの炭酸水素塩、ｐＨ
９．６中の精製したＬ２３４ ｍＡｂを２００ｎｇ／ウェルで４℃にて一晩コー
トした。非特異的結合部位をＰＢＳ中の３％ ＢＳＡ、０．０５％ Ｔｗｅｅｎ
２０を用いて２時間ブロックした。サンプルをブロッキング緩衝液で希釈し、そ
してウェルに添加した（１時間）。ＨＬＡ−ＤＲ２結合ビオチン化ペプチドをペ
ルオキシダーゼ基質としてＡＢＴＳを使用してストレプトアビジン−ペルオキシ
ダーゼで定量した；吸光度は、４０５ｎｍで読み取った。
【０１４９】 （６．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質へのペプチド結合の速度論）ＥＢＶ
形質転換Ｂ細胞株（Ｇｏｒｇａら、１９８７）から精製した界面活性剤可溶性Ｄ
Ｒ２によるペプチド結合の速度論と組換えＤＲ２ ＭＨＣ結合ドメイン融合タン
パク質によるペプチド結合の速度論を比較した（図１０）。当モル量の両方のＤ
Ｒ２調製物（２００ｎＭ）を、ビオチン化ＭＢＰペプチド（２μＭ）とともに、
３７℃にて異なる時間インキュベートした；ＤＲ結合ペプチドの量は、捕獲のた
めのＤＲ特異的Ｌ２４３ｍＡｂおよびＤＲ結合ペプチドの検出のためのストレプ
トアビジン−ペルオキシダーゼを用いてＥＬＩＳＡにより試験した。ペプチド結
合の速度論は、著しく異なっていた；本発明の組換えＭＨＣ結合ドメイン融合タ
ンパク質を用いる結合の速度論は、より速く、そしてより大きかった分子の画分
をロードした、（たった３時間後に５０％の最大結合に達し、１８時間後にプラ
トーであった）。対照的に、Ｂ細胞由来のＤＲ２へのペプチド結合の速度論は、
ゆっくりであった；ペプチドをロードした分子の画分は、４８時間までにわたっ
てプラトーに達することなくゆっくりと上昇した（図１０）。これらの結果は、
Ｂ細胞から精製された大多数のＤＲ分子が、ＨＬＡ−ＤＲ１のペプチド溶出研究
および結晶化により実証されたように（Ｃｈｉｃｚら、１９９３；Ｂｒｏｗｎら
、１９９３）、すでに高親和性ペプチドで占められているというこの事実により
説明され得る。対照的に、組換えＤＲ２融合タンパク質の大きな画分のペプチド
結合部位は、存在せず、そして高親和性ペプチドによる結合に容易に利用できる
。
【０１５０】 （７．ＨＬＡ−ＤＯ ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の生成）Ｆｏｓおよ
びＪｕｎのロイシンジッパー二量体化ドメインをまた用いて、ｐｅｍｐｈｉｇｕ
ｓ ｖｕｌｇａｒｉｓ（尋常性天疱瘡）およびインシュリン依存性糖尿病への感
受性にそれぞれ関連するＤＱ１対立遺伝子およびＤＱ８対立遺伝子についての可
溶性ＨＬＡ−ＤＯ ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を発現させた。同じ設計
を、上述のように組換えＤＲ２のために使用した（スプライシング部位を含む）
。安定なトランスフェクト体を、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細
胞を用いて生成し、そして可溶性ＤＱ分子をアフィニティー精製した。以前にＤ
Ｑ１またはＤＱ８への結合が示されたペプチドを用いるペプチド結合研究が、こ
の分子が機能的であることを実証した。
【０１５１】 （Ｂ．二価のＭＨＣ結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質） （１．二価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のためのＤＮＡ構築物）二価
のＨＣＡ−ＤＲ２ ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を、上述のＤＲα−Ｆｏ
ｓ ｃＤＮＡ構築物の３’末端へのＩｇＧ２ａのＦｃ部分の融合により発現させ
た。この設計において、ＤＲα−Ｆｃ鎖は、抗体重鎖に対応し、そしてＤＲβ−
Ｊｕｎ構築物は抗体軽鎖に対応する。ＤＲ２−ＩｇＧの設計を、上昇する結合価
によるＴ細胞レセプターに対する親和性の上昇、およびＩｇＧ２ａのＦｃ領域で
あるエフェクタードメインの結合の両方から選択した。相補的な固定は、Ｔ細胞
レセプターへのＤＲ２−ＩｇＧ分子の結合に続く、標的Ｔ細胞の溶解を生じ得る
。従って、ＤＲ２−ＩｇＧ分子は、自己攻撃的なＴ細胞の選択的な減損に有用で
あり得る。ＤＲ２−ＩｇＧ構築物をコードする核酸配列を、配列番号１１のよう
に開示し、そしてコードされた融合タンパク質を配列番号１２に開示する。
【０１５２】 ＩｇＧ２ａのＦｃ部分を、ＩｇＧ２ａ ｍＡｂを分泌するマウスハイブリドー
マ（Ｌ２４３）からＲＴ−ＰＣＲにより増幅した。ＰＣＲ産物を、インフレーム
でＤＲα−Ｆｏｓ構築物の３’末端と２０ｂｐオーバーラップするＦｃ部分に対
するプライマーを用いて、オーバーラッピングＰＣＲにより、ＤＲα−Ｆｏｓ構
築物と融合した。ＤＲα−ＦｏｓおよびＦｃを別々に増幅し、ゲル精製し、混合
し、そしてＤＲαの５’末端およびＩｇＧ２ａの３’末端を提示するオリゴを用
いて増幅した。構築物をメタロチオネイン（ｍｅｔａｌｏｔｈｉｏｎｅｉｎ）プ
ロモーターの制御下でｐＲｍＨａ−３発現ベクターのＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ部
位にクローニングした。インサートは、制限酵素マッピングおよびジデオキシ配
列決定によりチェックした。
【０１５３】 （２．二価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の発現）ＤＲ２−ＩｇＧ融合
タンパク質を、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞系において発現
させた。Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞系を、以下の理由から
ＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質の発現について選択した：（１）組換え抗体は、
以前から昆虫細胞において発現されており、（２）ｐＲｍＨａ−３発現ベクター
において、遺伝子が強力な誘導性メタロチオネインプロモーターの制御下にあり
、（３）シュナイダー細胞が、血清を含まない培地中で高細胞密度まで増殖し得
、そして（４）安定なトランスフェクト体が、生成されるので、タンパク質のラ
ージスケールでの産生が、別の昆虫細胞系（Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ系）よりも
より簡単である。
【０１５４】 安定なトランスフェクト体を、ＤＲα−ＩｇＧおよびＤＲβ鎖ベクター、なら
びにプラスミドｐＨ８ＣＯとシュナイダー細胞との同時トランスフェクト（ｃｏ
ｎｔｒａｎｓｆｅｃｔ）により生成した。このベクターは、メトトレキサートに
よる選択に対する抵抗性を付与する。トランスフェクト体を、シュナイダー培地
中０．１μＭメトトレキサート、１０％仔ウシ血清で選択した。トランスフェク
ト体を限界希釈によりクローニングし、そしてＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質の
分泌をＩｇＧのＦｃセグメントに特異的な抗体ならびにＤＲαβヘテロ二量体に
特異的な抗体を使用してＥＬＩＳＡにより試験した。
【０１５５】 トランスフェクト体を、約１０×１０6／ｍｌの密度まで増殖させ、そして発 現を最終濃度１ｍＭまでＣｕＳＯ4を加えることにより誘導した。上清を誘導か ら５日後に回収し、そして限外濾過により濃縮した。ＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパ
ク質をＬ２４３ｍＡｂを使用するアフィニティークロマトグラフィーにより精製
した。純度をＳＤＳ−ＰＡＧＥにより試験した；比較のために、精製したマウス
ＩｇＧもまた、ゲルに流した。ポリクローナル抗血清を用いるウェスタンブロッ
ト分析で、二本のバンドの同一性を確認した。ペプチド結合試験は、ＤＲ２−Ｉ
ｇＧ融合タンパク質が、適切に折り畳まれ、かつ機能的であることを実証した。
【０１５６】 （Ｃ．二価のＭＨＣ結合ドメイン−免疫グロブリン融合タンパク質） ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質分子は、１０個のＭＨＣ結合ドメインを含有す
る（ＩｇＭペンタマーあたり５つのＩｇＭモノマー；ＩｇＭモノマーあたり２つ
のＭＨＣ結合ドメイン）。ＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質は、２つのＭＨＣ結合
ドメインのみを有するので、同種のＴ細胞レセプターに対するＤＲ２−ＩｇＭ融
合タンパク質の機能的な親和性は、より高いことが予想される。親和性の有意な
上昇は、免疫組織化学染色に対する感受性ならびにこれらの分子の治療的有効性
を改良する。ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質は、以下の理由から免疫治療に特に
有用であり得る：（１）同種のＴ細胞におけるＴ細胞レセプターについての高い
アビディティ、（２）ＩｇＭのＦｃセグメントによる相補的な固着、および（３
）より長い血清の半減期。
【０１５７】 ＩｇＭのＦｃセグメントは、ＤＲα−ＩｇＧ構築物について前述されたように
、インフレームで、ＤＲα−Ｆｏｓセグメントの３’末端に融合する。ＤＲ２−
ＩｇＭ構築物をコードする核酸配列を配列番号１３として開示し、そしてコード
される融合タンパク質を配列番号１３として開示する。ＤＲα−ＩｇＭ構築物を
、例えば誘導性メタロチオネインプロモーターの制御下のｐＲｍＨａ−３発現ベ
クターのＥｃｏＲＩ−ＢａｍＨＩ部位にクローニングする（Ｂｕｎｃｈら、１９
８８）。ＤＲα−ＩｇＭおよびＤＲβ鎖融合構築物を、Ｊ鎖をコードする遺伝子
に同時トランスフェクトする。Ｊ鎖は哺乳動物細胞によるＩｇＭ分子のアッセン
ブリおよび分泌を促進する（Ｍａｔｓｕｕｃｈｉら、１９８６）。Ｊ鎖を、例え
ばハイグロマイシン耐性を付与する発現ベクターｐＵＣ−ｈｙｇＭＴにクローニ
ングし得る。次いで、安定なトランスフェクト体を、ウシ胎仔血清で試験した１
０％昆虫細胞を補充したシュナイダー細胞培地（Ｓｉｇｍａ）にハイグロマイシ
ンを１００μｇ／ｍｌで使用して選択し得る。トランスフェクト体を限外希釈に
よりクローニングし、そしてＣｕＳＯ4での誘導に続くＤＲ２−ＩｇＭ融合タン パク質の発現について試験する。
【０１５８】 ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質の分泌は、ｍＡｂ Ｌ２４３を用いる免疫沈降
により評価し得、続いてＩｇＭのＦｃセグメントに特異的な抗体を用いるウェス
タンブロット分析を用いて評価し得る。タンパク質の産生のために、トランスフ
ェクト体を無血清培地（ＥｘＣｅｌｌ ４００、ＪＲＨ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ
ｓ）に適応させ得る。
【０１５９】 これらの構築物をまた、ＣＨＯ細胞またはマウスＢ細胞株にトランスフェクト
し得る（Ｍ１２．Ｃ３）。ＣＨＯ細胞は、以前に組換えＩｇＭ抗体を高レベルで
分泌することが示され、そしてＣＤ２−ＩｇＭ融合タンパク質の発現に用いられ
ている（Ｗｏｏｄら、１９９０；Ａｒｕｌａｎａｎｄａｍら、１９９３）。これ
らの細胞株における発現のために、ＤＲα−ＩｇＭおよびＤＲβ鎖構築物を、真
核生物発現ベクターにクローニングする。ＤＲα−ＩｇＭ構築物を、例えばネオ
マイシン耐性遺伝子を有するｐｃＤＮＡ３にクローニングし得、そしてＤＲβ−
Ｊｕｎ構築物を、ｐｃＤＮＡＩベクター（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、Ｓａｎ Ｄｉ
ｅｇｏ、ＣＡ）にクローニングし得る。細胞をエレクトロポレーションによりト
ランスフェクトし得、そして安定なトランスフェクト体をＧ４１８用いて選択し
得る。ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質の分泌は、ｍＡｂ Ｌ２４３を用いる免疫
沈降およびウェスタンブロット分析により評価し得る。
【０１６０】 最初の実験において、ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質は、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌ
ａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞によって分泌されず、それゆえ、ＣＯＳ細胞におけ
る発現を行なった。ＣＯＳ細胞をｃＤＮＡ構築物を用いてトランスフェクトした
場合、ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質が分泌された。
【０１６１】 （Ｄ．多価ＭＨＣ結合ドメイン−リガンド−Ｔａｇ融合タンパク質） （１．ＭＨＣ結合ドメイン−ビオチン−Ｔａｇ融合タンパク質のためのＤＮＡ
構築物）ビオチンリガーゼは、１４アミノ酸認識配列（ＬＧＧＩＦＥＡＭＫＭＥ
ＬＲＤ、配列番号９）（Ｓｈａｔｚ、１９９３）中のリジン残基を特異的にビオ
チン化し、それゆえこの配列をコードするＤＮＡ配列を、ＤＲα−Ｆｏｓ構築物
に付加した。この「ＤＲα−Ｆｏｓ−タグ」構築物を、誘導性メタロチオネイン
プロモーターの制御下のＤｒｏｓｏｐｈｉｌａ発現ベクターｐＲｍＨａ−３のＥ
ｃｏＲＩおよびＳａｌＩ部位にクローニングした。ＤＲα−Ｆｏｓ−タグおよび
ＤＲβ−Ｊｕｎ構築物で安定に同時トランスフェクトしたＤｒｏｓｏｐｈｉｌａ
Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞を上述のようにＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質のため
に生成した。得られた「ＤＲ２−タグ」融合分子は、ＤＲα−Ｆｏｓ構築物のＣ
末端へのビオチン化配列タグの付加によってのみＤＲ２−Ｆｏｓ／Ｊｕｎ融合タ
ンパク質と異なる。ＤＲ２−タグ融合タンパク質を、上述のＬ２４３ ｍＡｂを
用いて上清からアフィニティー精製した。
【０１６２】 これらのＤＲ２−タグ分子の部位特異的ビオチン化は、アビジンまたはストレ
プトアビジン上のＤＲ２−タグ−ビオチンテトラマーのアッセンブリを可能にす
る。なぜなら、ビオチンおよびストレプトアビジンは、４つのビオチン結合部位
を有するからである。従って、テトラマーを、ＤＲ２−タグ−ビオチン分子およ
びストレプトアビジンを４：１のモル比で混合することにより作製する。
【０１６３】 （２．ＭＨＣ結合ドメイン−ビオチン−Ｔａｇ融合タンパク質のビオチン化）
ビオチンリガーゼｃＤＮＡ（Ｓ．Ｌｅｓｌｅｙ、Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒ
ａｔｉｏｎにより提供される）を、Ｔ７プロモーター制御下の原核生物発現ベク
ターｐＥＴ２２ｂ中にＮｄｅＩ−ＸｈｏＩフラグメントとしてクローニングした
。この構築物を、ｌａｃＺプロモーターの制御下のＴ７ ＲＮＡポリメラーゼ遺
伝子について溶原性であるＢＬ２１／ＤＥ３ Ｅ．ｃｏｌｉ株にトランスフェク
トした。タンパク質の発現を、１ｍＭのＩＰＴＧの添加により４時間誘導した。
次いで、細胞を遠心分離により回収し、２０ｍＭ Ｔｒｉｓ、ｐＨ８．０、１０
０ｍＭ ＮａＣｌに再懸濁した。細胞を超音波処理し、そして不溶性物質を遠心
分離により取り除き、１００ｍｌの培養物から５ｍｌの細胞質タンパク質画分を
得た。
【０１６４】 ビオチン化を１００μｌ容量で０．１〜１０μｌの酵素、１ｍＭのＡＴＰおよ
び１〜１０μＭのビオチンとともに３７℃にて行なった。反応後、組換えＤＲ２
−タグ−ビオチン分子をＬ２４３ ｍＡｂでコートした９６ウェルプレートに補
足させ、そしてビオチン化の程度をペルオキシダーゼ結合ストレプトアビジンを
用いて定量した。ウェスタンブロットをポリクローナルＤＲ抗血清およびストレ
プトアビジンペルオキシダーゼを用いて経時的にプローブした。この実験は、ビ
ｓオチンリガーゼによるＤＲα鎖（１４アミノ酸のビオチンリガーゼ認識配列を
有する）の特異的ビオチン化を実証した。
【０１６５】 蛍光標識ストレプトアビジンを用いて、ＤＲ２−タグ−ビオチンテトラマーの
形成を試験した。蛍光は、４９２ｎｍで吸収し、ＨＰＬＣゲル濾過クロマトグラ
フィー（Ｂｉｏ−Ｇｅｌ ＳＥＣ ３００ｍｍ×７．８ｍｍ；流速１ｍｌ／分、
ＰＢＳ ｐＨ６．８）の間の検出を可能にする。ストレプトアビジン（ＭＷ ６
０ｋＤａ）は、ＨＰＬＣゲル濾過カラム上で、８．３分で、単一のピークとして
溶出された。ストレプトアビジン−ＤＲ２−タグ−ビオチン複合体は、５．８分
で溶出された。ストレプトアビジンに結合するＤＲ２融合タンパク質の１、２、
または３つの中間体が、少量のＤＲ２−タグ−ビオチンを複合体形成に用いた場
合に観察された。ＭＷ標準は、ストレプトアビジンおよびストレプトアビジン−
ＤＲ複合体の概算分子量を確認した。
【０１６６】 （３．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質のペプチドローディング）（Ｈｉｓ
）6−タグ化ＭＢＰ（８５−９９）ペプチドを使用して、単一のペプチドをロー ドしたＤＲ２融合タンパク質を、金属アフィニティークロマトグラフィーによっ
て精製した。ＤＲ２−タグ分子を（Ｈｉｓ）6−タグ化ＭＢＰペプチドおよび金 属アフィニティー樹脂（Ｔａｌｏｎ Ｍｅｔａｌ Ａｆｆｉｎｉｔｙ Ｒｅｓｉ
ｎ、Ｃｌｏｎｔｅｃｈ）との沈殿物とともにインキュベートした。ＤＲ２／ペプ
チド複合体を、温和な条件下（１ｍＭ ＥＤＴＡ）で溶出した。溶出したＤＲ２
分子を検出用のポリクローナルＤＲ抗血清を使用して、ウェスタンブロット分析
により分析した。これらの実験は、定義されたＤＲ２／ペプチド複合体が、約５
０％の収量で生成され得ることを実証した。
【０１６７】 （４．ＭＨＣ結合ドメイン−ビオチン−Ｔａｇ融合タンパク質へのＴ細胞の結
合）４価のＭＨＣ結合ドメインビオチン−タグ融合タンパク質へのヒトＴ細胞ク
ローンの表面上のＴ細胞レセプターの結合を試験した。ビオチン化ＤＲ２−タグ
分子をＭＢＰ（８５−９９）ペプチドとともにロードし、そしてストレプトアビ
ジンでコートしたプレート上で捕獲した；蛍光標識Ｔ細胞の固定化ＤＲ２／ペプ
チド複合体への結合を定量した。陽性コントロールとして、ウェルを抗ＣＤ３
ｍＡｂでコートした。
【０１６８】 結合を、ＭＢＰ（８５−９９）に特異的なヒトＤＲ２制限Ｔ細胞クローン（Ｏ
ｂ．１Ａ１２）、およびヒトデスモグレイン（ｄｅｓｍｏｇｌｅｉｎ）３タンパ
ク質の１９０〜２０４残基に特異的なＤＲ４制限コントロールクローン（Ｇｏ．
Ｐ３．１）を用いて試験した。ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９）複合体への特異的
な結合は、ＭＢＰ（８５−９９）特異的Ｔ細胞クローンを用いた場合にのみ観察
された。さらに、空のＤＲ２とではなく、ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９）複合体
とのみ結合が観察された。
【０１６９】 結合を、ストレプトアビジンでコートしたプレート上で、ビオチン化したＤＲ
２−タグ分子を捕獲することにより試験した。非特異的結合部位を、ＰＢＳ中の
１％ＢＳＡでブロックした。Ｔ細胞を、蛍光膜プローブであるＢＣＥＦＣ−ＡＭ
で、３７℃にて３０分間標識し、洗浄し、そして３７℃にて２０分間プレートに
添加した。３回の洗浄に続いて、ＤＲ２／ペプチド複合体または抗ＣＤ３ ｍＡ
ｂに結合するＴ細胞画分を、蛍光プレートリーダーで決定した。
【０１７０】 （Ｅ．ビーズキャリアとのＭＨＣ結合ドメイン接合体） ＤＲ２−ビオチンタグ分子を用いて、抗原特異的Ｔ細胞の特異的染色のために
高度な多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体を生成した。ＤＲ２／ペプチド複合体を
、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅ（Ｅｕｇｅｎｅ、ＯＲ）から購入した、スト
レプトアビジンが接合体化している高度な蛍光微粒子に結合させた。ウイルス粒
子に類似したサイズのポリスチレンビーズ（４０ｎｍ）を、それらの残存する可
溶性能力に基づいて選択した；これらのビーズを、洗浄細胞に用いられる低い重
力ではなく超遠心によりペレット化した。抗原特異的Ｔ細胞の染色を、ＦＡＣＳ
により試験した。ＦＡＣＳ染色について、ＣＤ４（陽性コントロール）およびマ
ウスＭＨＣクラスＩＩ（１０−２．１６）（陰性コントロール）に特異的なビオ
チン化ｍＡｂをコントロールとして用いた。およそ１０6Ｔ細胞を各アッセイに 用いた。Ｔ細胞をペレット化し、そして冷却したＰＢＳ、０．１％アジ化ナトリ
ウム中に再懸濁した。染色を、ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９）特異的Ｔ細胞クロ
ーンおよび多価ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９）ペプチド複合体の両方について観
察した；染色強度は、ＣＤ４ ｍＡｂについて観察されたものと同様であった。
結合は、非常に特異的であった。なぜなら、ＴＣＲ接触残基でのＭＢＰペプチド
の単一のアミノ酸置換が、染色強度を大幅に減少させるからである。他のＭＨＣ
クラスＩＩ／ペプチドの組み合わせに特異的なコントロールＴ細胞クローンでは
染色が観察されなかった。これらのコントロールクローンは、ＨＬＡ−ＤＱ１（
クローンＨＹ．１Ｂ１１）に結合するＭＢＰ（８５−９９）、ＨＬＡ−ＤＲ４（
クローンＧｏ．Ｐ３）に結合するデスモグレイン３ペプチド（１９０−２０４）
、およびＨＬＡ−ＤＲ２ａ（クローンＫｗ−ＴＴ１）に結合する破傷風トキソイ
ドペプチド（８３０−８４３）に特異的であった。
【０１７１】 （Ｆ．共有結合ペプチドを有するＭＨＣ結合ドメイン） ＤＲ２−Ｉｇ融合タンパク質を生成し、標的Ｔ細胞上のＴＣＲへの多価結合を
可能にした（ＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質中の２つのＤＲ２／ペプチドアーム
、ＤＲ２−ＩｇＭ融合タンパク質中の１０のＤＲ２／ペプチドアーム）。これら
の分子の全ての結合部位を保証するために、同じペプチドとともにロードし、Ｄ
Ｒ２分子を共有結合したＭＢＰペプチドとともに発現させた。ＭＢＰ（８５−９
９）配列を、１６アミノ酸リンカー（リンカー配列：ＳＧＧＧＳＬＶＰＲＧＳＧ
ＧＧＧＳ、配列番号１０）を介して成熟ＤＲβ鎖のＮ末端に結合させた。このｃ
ＤＮＡ構築物を用いて、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ Ｓｃｈｎｅｉｄｅｒ細胞中の連
結したＭＢＰペプチドを有するＤＲ２分子およびＤＲ２−ＩｇＧ分子を発現させ
た。
【０１７２】 （Ｇ．ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体についての使用） （１．Ｔ細胞の選択的抑制のためのＤＲ２−Ｉｇ融合タンパク質の使用）ＤＲ
２−Ｉｇ融合タンパク質は、ＤＲ２に結合した自己ペプチドを認識するＴ細胞の
選択的抑制のために有用であり得る。Ｔ細胞レセプターによるＤＲ２−Ｉｇ融合
タンパク質の結合は、標的Ｔ細胞の相補的な固定および溶解を導き得る。多価Ｄ
Ｒ２分子はまた、ゲニステイン（標的細胞による取りこみに続くアポトーシスを
誘導するチロシンキナーゼインヒビター）に接合体化し得る。
【０１７３】 （２．Ｔ細胞レセプターに対する多価ＤＲ２／ペプチド複合体の親和性）多価
ＤＲ２／ペプチド複合体のＴＣＲへの結合を、ヒトＤＲ２抑制Ｔ細胞クローンを
用いて試験する。ＤＲ２分子を、ＭＢＰ（８５−９９）ペプチドとともにロード
し、そして固定化されたクロラミンＴ（Ｉｏｄｏｂｅａｄｓ、Ｐｉｅｒｃｅ）を
用いて［25Ｉ］で標識化する。結合アッセイにおいて、定数のＴ細胞（１×１０ 6 細胞、１ｍｌ）を、ＰＢＳ、１．０％ＢＳＡ、０．０２％ＮａＮ3中の６〜１０
の異なる濃度の放射標識されたＤＲ２／ペプチド複合体とともにインキュベート
する。放射標識された分子は、標的細胞のＴＣＲの小さな画分（１０％未満）の
みが占められる濃度で用いられる。
【０１７４】 最初に、平衡に達するまでに必要とされるインキュベーション時間を決定する
；細胞結合ＤＲ２／ペプチド複合体および非結合ＤＲ２／ペプチド複合体を、８
４％シリコーン（ｄ＝１．０５０）、１６％パラフィンオイル（ｄ＝０．８３８
）の層を通す急速な（１０〜１５秒）遠心分離により分離した。細胞結合放射活
性を、γカウンターで定量し、そしてデータをＫ（解離定数）およびｎ（標的細
胞上のＴＣＲ分子の数）を決定するためにＳｃａｔｃｈａｒｄプロットで分析し
た。いくつかのコントロールは、結合の特異性の実証に含まれる：（１）未関連
のＭＨＣ／ペプチド特異性を伴うＴ細胞クローン、（２）コントロールペプチド
とともにロードされるＤＲ２／ペプチド複合体、および（３）過剰の非標識ＤＲ
２／ペプチド複合体による結合の競合。
【０１７５】 ＴＣＲに対する一価（ＤＲ２）の分子、二価（ＤＲ２−ＩｇＧ）の分子、およ
び多価（ＤＲ２−ＩｇＭ、ＤＲ２−テトラマー）の分子による結合の速度論を決
定することは特に興味深い。「Ｏｎ」速度は、３７℃で異なる時間で放射性標識
リガンドとともに標的細胞をインキュベート（ＴＣＲのインターナリゼーション
を阻害するために０．０２％のアジ化ナトリウムの存在下で）し、それに続いて
反応物の急速に分離することにより決定される。「Ｏｆｆ」速度は、平衡に達す
るまで、Ｔ細胞を標識されたリガンドと共にインキュベートすることにより決定
される。次いで、細胞を洗浄し、異なる時間インキュベートし、そして細胞結合
の放射性活性の量を決定する。Ｏｆｆ速度は、一価リガンド、二価のリガンドお
よび多価のリガンドとの間で有意に異なることが予想される。ＩｇＭ抗体を用い
る古典的な研究は、多価の結合が結合抗体の解離を劇的に遅くすることを示した
（ＣｒｏｔｈｅｒｓおよびＭｅｔｚｇｅｒ、１９７２；ＨｏｒｎｉｃｋおよびＫ
ａｒｕｓｈ、１９７２）。
【０１７６】 （３．ＤＲ２−Ｉｇ融合タンパク質に特異的なＴ細胞の相補体媒介溶解）Ｉｇ
Ｇ２ａのＦｃセグメントを、ＤＲ２−ＩｇＧ融合タンパク質について選択した。
なぜなら、ＩｇＧ２ａを相補体に固定するからである。ＩｇＭをまた相補体に固
定し、評価するための融合タンパク質による標的Ｔ細胞の相補体媒介溶解を可能
にする。Ｔ細胞をＤＲ２−ＩｇＧまたはＤＲ２−ＩｇＭ複合体とともにインキュ
ベートする；次いで、細胞を洗浄し、そして培地で希釈したウサギ血清相補体と
ともにインキュベートする（１：５〜１：２０の希釈）。ウサギ血清相補体を、
Ｃｅｄａｒｌａｎｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓより入手し、そしてそのロット
が、ヒトＴ細胞に対する非特異的細胞傷害性を有さないことを保証するために予
備試験した；相補体を等分し、そして−７０℃で保存する。細胞傷害性をトリパ
ンブルー染色による３７℃でのインキュベ−トの３０分後および６０分後に決定
する（％細胞傷害性＝［死亡細胞数／生存細胞数＋死亡細胞数］×１００）。相
補体を固定するヒトＣＤ３に特異的なｍＡｂ（ＯＫＴ３、ＩｇＧ２ａ）が、陽性
コントロールとして使用される。溶解の特異性を、コントロールＴ細胞クローン
およびコントロールペプチドとともにロードしたＤＲ２分子を用いて評価した。
【０１７７】 （４．アポトーシスを誘導するための毒素に対するＤＲ２／ペプチド複合体の
結合）３つ全ての設計の多価のＤＲ２分子（ＤＲ２−ＩｇＧ、ＤＲ２−ＩｇＭお
よびＤＲ２−テトラマー）を、選択的Ｔ細胞死を媒介する別の手段として毒素部
分に接合体化する。ゲニステイン（チロシンキナーゼインヒビター）は、この目
的のために特に効果的であり得る。最近の研究において、ＣＤ１９ ｍＡｂに結
合されるゲニステインが、ＳＣＩＤマウス由来のヒトＢ細胞白血病の根絶におい
て非常に有効であることが見出された（Ｕｃｋｕｎら、１９９５）。ゲニステイ
ン−ｍＡｂ接合体の２５μｇの１回用量は、Ｂ細胞白血病での致命的なチャレン
ジからの完全な保護を提供した。ＣＤ１９は、Ｂ系統特異的表面分子である；抗
体接合体は、レセプター媒介エンドサイトーシスによるインターナリゼーション
に続くアポトーシスを誘導することを示した。Ｔ細胞レセプターは、ＤＲ２／ペ
プチド複合体の認識に続いて、エンドサイトーシスされる（Ｖａｌｉｔｕｔｔｉ
ら、１９９５）；従って、多価のＤＲ２／ペプチド複合体は、Ｔ細胞レセプター
の結合に続いて、標的のＴ細胞を取りこむようである。
【０１７８】 ゲニステインを、Ｕｃｋｕｎら（１９９５）によって記載されるように、光感
受性１８．２Å長非切断へテロ−二官能価の架橋剤（Ｓｕｌｆｏ−ＳＡＮＰＡＨ
）を用いて光親和性架橋により多価のＤＲ２／ペプチド複合体中で接合体化させ
る。ＤＲ２毒素接合体を、ヒトＤＲ２抑制Ｔ細胞クローンを用いて試験する。Ｔ
細胞を、ＤＲ２毒素接合体とともにインキュベートし、そしてアポトーシスの誘
導をゲノムＤＮＡのアガロースゲル電気泳動により評価する。ＤＮＡのヌクレオ
ソームの断片化を、エチジウムブロマイド染色により試験する。コントロールペ
プチドならびにコントロールＴ細胞クローンとともにロードしたＤＲ２分子を用
いて、アポトーシス誘導の特異性を実証する。
【０１７９】 ＤＲ２毒素接合体によるアポトーシスの誘導を、断片化ＤＮＡ末端の末端標識
に続いて、フローサイトメトリーにより定量する（ＴＵＮＥＬ手順）。核ＤＮＡ
フラグメントの遊離末端を、酵素末端デオキシヌクレオチジルトランスフェラー
ゼ（ＴｄＴ）を用いてジオキシゲニン接合体化ヌクレオチドで標識する。細胞を
固定し、そして７０％のＥｔＯＨを用いる処理により透過化する。核ＤＮＡフラ
グメントの３’−ＯＨ末端を、ジオキシゲニン−ｄＵＴＰ、ジオキシゲニン−ｄ
ＡＴＰおよびＴｄＴを用いて標識し、続いて蛍光標識した抗ジオキシゲニン抗体
（ＡｐｏｐＴａｇ、インサイチュアポトーシス検出キット、Ｏｎｃｏｒ）を用い
て標識したＤＮＡ末端を検出した。ＦＡＣＳ分析を用いて、アポトーシスの生じ
た細胞の画分を決定する。低血清濃度（１％血清）で１２時間増殖した細胞を、
陽性コントロールとして使用する。アポトーシス誘導の特異性を、コントロール
Ｔ細胞クローンおよびコントロールペプチドとロードしたＤＲ２分子の使用によ
り実証する。
【０１８０】 （５．固定化ＤＲ２／ペプチド複合体へのＴ細胞結合）以前の研究が、組換え
可溶性ＤＲ２分子がペプチド特異的に結合することを実証した。組換えＤＲ２／
ペプチド複合体が、Ｔ細胞レセプターにより認識されるかを試験するために、Ｔ
細胞接着アッセイをストレプトアビジンを、コートしたマイクロタイタープレー
ト上に捕獲されたビオチン化ＤＲ２／ペプチド複合体を用いて行なった。ＭＢＰ
（８５−９９）特異的Ｔ細胞クローンおよびコントロールＴ細胞クローンを、蛍
光膜プローブであるＢＣＥＦＣ−ＡＭで標識し、洗浄し、そして固定化ＤＲ２／
ペプチド複合体とともに３７℃で３０分間インキュベートした。洗浄に続いて、
Ｔ細胞に結合した画分を、フルオロメーターにて決定した。ＭＢＰ（８５−９９
）特異的ＤＲ２抑制Ｔ細胞の結合を、ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９）複合体を用
いた場合にのみ観察したが、ＤＲ２分子をコントロールペプチドとともにロード
した場合は観察しなかった。また、ペプチドにおける最初のＴＣＲ接触残基での
単一のアミノ酸置換が、Ｔ細胞結合を無効にした。ＤＲ２／ＭＢＰ（８５−９９
）複合体の結合は、コントロールＴ細胞クローンにおいては観察されなかった。
【０１８１】
【表１】
【配列表】
【図面の簡単な説明】
【図１】 この図は、本発明の一価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質の１つの実施態
様の概略図である。ここで、ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の細胞外ドメインまたは
ペプチド結合ドメインは第１の二量体化ドメイン３０に結合し、ＭＨＣクラスＩ
Ｉβ鎖２０の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメインは、第２の二量体化ド
メイン４０に結合し、そしてこれらの２つの融合構築物が、ＭＨＣクラスＩＩα
鎖およびβ鎖の結合ドメイン（１０および２０）によって形成される間隙におい
て、ＭＨＣ結合ペプチド１１０に結合するヘテロ二量体分子を形成する。必要に
応じて可撓性分子リンカー（示されていない）は、ＭＨＣドメイン（１０、２０
）と二量体ドメイン（３０、４０）との間に置かれる。
【図２】 この図は、本発明の二価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質構築物の一つの
実施態様の概略図である。ここで、ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の細胞外ドメイン
またはペプチド結合ドメインは、第１のコイルドコイルもしくは二量体化ドメイ
ン、または免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域３０のいずれかに結合し、そして ＭＨＣクラスＩＩβ鎖２０の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメインは、第
２のコイルドコイル二量体化ドメインまたは免疫グロブリン軽鎖定常領域４０に
結合する。示されるように、ＭＨＣα鎖ドメイン１０と融合されるドメイン３０
は、さらに免疫グロブリン鎖のヒンジ部位５０（必要に応じて）およびＦｃ領域
６０と融合される。あるいは、（示されていないが）ＭＨＣα鎖ドメイン１０お
よびβ鎖ドメイン２０は、ＭＨＣβ鎖ドメインが免疫グロブリン重鎖ドメイン５
０および６０に融合されるように、転換され得る。二量体化ドメイン３０および
４０は、これら２つの融合構築物のアセンブリが、ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメイ
ンのα鎖およびβ鎖（１０および２０）によって形成される間隙においてＭＨＣ
結合ペプチド１１０を結合するヘテロ二量体構造を形成するように促進する。必
要に応じて、可撓性分子リンカー（示されていない）がＭＨＣドメイン（１０、
２０）と二量体ドメイン（３０、４０）との間に置かれるか、かつ／または二量
体化ドメイン３０と免疫グログリンヒンジ５０またはＦｃ領域６０との間に置か
れている。これら２つのヘテロ二量体ＭＨＣ免疫グロブリン融合タンパク質のＦ
ｃ領域６０およびＦｃ領域６０’は、抗体が二価のＭＨＣ結合ドメイン融合タン
パク質構築物を形成する様式で会合する。Ｆｃ領域６０と６０’との間の水平な
線は、免疫グロブリン重鎖ドメイン間のジスフィルド架橋を示す。
【図３】 この図は、本発明の十価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質構築物の一つの
実施態様の概略図である。ここで、ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の細胞外ドメイン
またはペプチド結合ドメインは、第１のコイルドコイル二量体化ドメインかまた
はＩｇＭ免疫グロブリン重鎖ＣH１（Ｃμｌ）定常ドメイン３０のいずれかに結 合し、ＭＨＣクラスＩＩβ鎖２０の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメイン
は、第２のコイルドコイル二量体化ドメインかまたはＩｇＭ免疫グロブリン軽鎖
定常領域４０のいずれかに結合し、そしてこれら２つの融合構築物は、集合して
ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインのα鎖およびβ鎖（１０および２０）によって形
成される間隙においてＭＨＣ結合ペプチド１１０を結合するヘテロ二量体分子を
形成する。示されるように、ＭＨＣα鎖ドメイン１０に融合されるドメイン３０
は、ＩｇＭ Ｆｃドメイン（ＣH２、ＣH３、ＣH４）６０にさらに融合される。 あるいは、（示されていない）ＭＨＣα鎖ドメインおよびβ鎖ドメイン（１０お
よび２０）は、ＭＨＣβ鎖ドメインが免疫グロブリン重鎖ドメイン６０に融合さ
れるように転換され得る。２つのヘテロ二量体ＭＨＣ免疫グロブリン融合タンパ
ク質のＦｃ領域６０および６０’は、単一のＩｇＭサブユニットの様式で会合し
、ジスルフィルド結合によって結合された二価のＭＨＣ−ＩｇＭ融合構造を形成
する。これらの二価ＭＨＣ−ＩｇＭ融合サブユニットのうちの５つは、集合して
特徴的なＩｇＭペンタマーを形成し、ＩｇＭサブユニット間のジスルフィド結合
９０によって結合され、そしてＪ鎖ペプチド１００を含み、そして十価のＭＨＣ
−ＩｇＭ融合構造を生じる。必要に応じて、可撓性分子リンカー（示されていな
い）は、ＭＨＣドメイン（１０、２０）とコイルドコイルもしくはＩｇＭ二量体
化ドメイン（３０、４０）との間、ならびに／または二量体化ドメイン（３０）
とＩｇＭ Ｆｃドメイン（６０）との間に位置される。
【図４】 この図は、本発明の四価のＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質構築物の一つの
実施態様の概略図である。ここで、ＭＨＣクラスＩＩα鎖１０の細胞外ドメイン
またはペプチド結合ドメインは、第１の二量体化ドメイン３０に結合し、ＭＨＣ
クラスＩＩβ鎖２０の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメインは、第２の二
量体化ドメイン４０に結合し、そしてこれら２つの融合構築物は、集合してＭＨ
ＣクラスＩＩ結合ドメインのα鎖およびβ鎖（１０および２０）によって形成さ
れる間隙においてＭＨＣ結合ペプチド１１０を結合するヘテロ二量体分子を形成
する。示されるように、ＭＨＣα鎖ドメイン１０に融合されるドメイン３０は、
抗リガンド８０に結合するリガンドタグ７０にさらに融合される。あるいは、（
示されていない）ＭＨＣα鎖ドメインおよびβ鎖ドメイン（１０および２０）は
、ＭＨＣβ鎖ドメインがリガンドタグ７０に融合されるように転換され得る。示
されるように、各抗リガンドは、４つのリガンド部分に結合し、そしてＭＨＣ結
合ドメイン融合タンパク質複合体は、四価である。必要に応じて、可撓性分子リ
ンカー（示されていない）は、ＭＨＣドメイン（１０、２０）と二量体化ドメイ
ン（３０、４０）との間、および／または二量体化ドメイン３０およびリガンド
タグ７０との間に位置される。
【図５】 この図は、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン接合体の一つの実施態様の概略
図である。ここで、第１のＭＨＣ鎖（αまたはβ）１０の細胞外ドメインまたは
ペプチド結合ドメインおよび第２のＭＨＣ鎖（βまたはα）２０の細胞外ドメイ
ンまたはペプチド結合ドメインは、集合して、ＭＨＣ結合ドメインのα鎖および
β鎖（１０および２０）によって形成される間隙においてＭＨＣ結合ペプチド１
１０を結合するヘテロ二量体分子を形成する。接合部分２００は、ＭＨＣ鎖１０
の１つをキャリア３００に、共有結合的または非共有結合的に連結する。
【図６】 この図は、本発明の多価のＭＨＣ結合ドメイン接合体の一つの実施態様の概略
図である。ここで、ＭＨＣα鎖１０の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメイ
ンは、第１の二量体化ドメイン３０に結合され、ＭＨＣβ鎖２０の細胞外ドメイ
ンまたはペプチド結合ドメインは、第２の二量体化ドメイン４０に結合され、そ
してこれら２つの融合構築物は、集合してＭＨＣ結合ドメインのα鎖およびβ鎖
（１０および２０）によって形成される間隙においてＭＨＣ結合ペプチド１１０
を結合するヘテロ二量体分子を形成する。示されるように、ＭＨＣα鎖ドメイン
１０に融合されるドメイン３０は、接合部分２００（これは、キャリア３００に
、共有結合的にまたは非共有結合的に連結される）に、共有結合的にまたは非共
有結合的に連結される。ここで、キャリア３００はデンドリマーとして示される
。あるいは、（示されていない）ＭＨＣα鎖ドメインおよびβ鎖ドメイン（１０
および２０）は、ＭＨＣβ鎖ドメインが接合部分２００に結合されるように転換
され得る。必要に応じて、可撓性分子リンカー（示されていない）は、ＭＨＣド
メイン（１０、２０）と二量体化ドメイン（３０、４０）との間に、および／ま
たは二量体化ドメイン３０と接合部分２００との間に、および／または接合部分
２００とキャリア３００との間に位置される。
【図７】 この図は、本発明の多量体ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質構築物の一つの
実施態様の概略図である。ここで、ＭＨＣα鎖１０の細胞外ドメインまたはペプ
チド結合ドメインは、第１の二量体化ドメイン３０に結合され、ＭＨＣβ鎖２０
の細胞外ドメインまたはペプチド結合ドメインは、第２の二量体化ドメイン４０
に結合され、そしてこれら２つの融合構築物は、集合してＭＨＣ結合ドメインの
α鎖およびβ鎖（１０および２０）によって形成される間隙においてＭＨＣ結合
ペプチド１１０を結合するヘテロ二量体分子を形成する。示されるように、ＭＨ
Ｃα鎖ドメイン１０に融合されるドメイン３０は、抗リガンド８０に結合するリ
ガンドタグ７０にさらに融合される。抗リガンド８０は、キャリア３００の表面
に結合される。あるいは、（示されていない）ＭＨＣα鎖ドメインおよびβ鎖ド
メイン（１０および２０）は、ＭＨＣβ鎖ドメインがリガンドタグ７０に融合さ
れるように、転換され得る。必要に応じて、可撓性分子リンカー（示されていな
い）は、ＭＨＣドメイン（１０、２０）と二量体化ドメイン（３０、４０）との
間に位置し、および／または二量体化ドメイン３０とリガンドタグ７０との間、
および／または抗リガンド８０とキャリア３００との間に位置する。
【図８】 この図は、Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓによる組換えＨＬＡ−ＤＲ２融合
タンパク質のアセンブリおよび分泌を実証する実験の結果をグラフで示す。捕捉
のためにＤＲ２αβヘテロ二量体に特異的なｍＡｂ（Ｌ２４３）を、そして検出
のためにポリクローナルＤＲ抗血清を用いて、細胞培養の上清（上のグラフ）ま
たは細胞培養溶解産物（下のグラフ）のサンドイッチＥＬＩＳＡによって、ＤＲ
２融合タンパク質（ＤＲα−ＦｏｓおよびＤＲβ−Ｊｕｎ）の発現を調べた。二
次抗体の結合を、ペルオキシダーゼ結合抗ウサギＩｇＧ抗血清により、ＡＢＴＳ
をペルオキシダーゼ基質として用い、そして４０５ｎｍで検出し、定量した。結
果は、以下を用いてトランスフェクトされた細胞からである：ＤＲα−Ｆｏｓの
み（白抜きの四角）；ＤＲβ−Ｊｕｎのみ（黒塗りの丸）；およびＤＲα−Ｆｏ
ｓとＤＲβ−Ｊｕｎとの両方（白抜きの丸）。
【図９】 この図は、組換えＨＬＡ−ＤＲ２（ｒＤＲ２）融合タンパク質に結合している
ペプチドの特異性を実証する実験の結果を示す。ペプチド結合について、洗浄剤
に可溶なＤＲ２と高親和性で結合することが以前に示されたビオチニル化ＭＢＰ
（８５−９９）ペプチド（「ＭＢＰ」）を使用して試験した。ｒＤＲ２−ＭＢＰ
複合体を、ＤＲ特異的ｍＡｂ（Ｌ２４３）を用いてＥＬＩＳＡプレート上で捕捉
した。そしてＤＲが結合したビオチニル化ＭＢＰを、ＡＢＴＳをペルオキシダー
ゼ基質として、ペルオキシダーゼ標識化ストレプトアビジンを用い、４０５ｎｍ
で検出し、定量した。上のグラフは、以下とのペプチドの結合におけるｒＤＲ２
濃度の効果を示す：２μＭビオチニル化ＭＢＰペプチド（白抜きの丸）；１００
μＭ非ビオチニル化ＭＢＰを競合体として有する２μＭビオチニルＭＢＰペプチ
ド（黒塗りの三角）；およびペプチドなし（黒塗りの四角）。２００ｎＭ ｒＤ
Ｒ２および２μＭビオチニル化ＭＢＰを用いた同じＥＬＩＳＡアッセイを使用し
て、結合特異性を実証した。下のグラフは、競合体のペプチドの濃度変化が、ビ
オチニル化ＭＢＰペプチドのｒＤＲ２融合タンパク質との結合に与える影響を示
す：非ビオチニル化ＭＢＰ競合体（白抜きの四角）；Ｖａｌ８９→Ａｓｐ ＭＢ
Ｐ競合体（黒丸）。
【図１０】 この図は、組換えＨＬＡ−ＤＲ２融合タンパク質（ｒＤＲ２）に対するペプチ
ド結合速度を実証する実験の結果を示す。ペプチド結合速度を、ｒＤＲ２につい
て、およびＥＢＶ形質導入されたＢ細胞株から精製される洗浄剤に可溶なＤＲ２
について比較した。ＤＲ２タンパク質（２００ｎＭ）をビオチニル化ＭＢＰペプ
チド（２μＭ）とともに３７℃で、種々の期間でインキュベートした；ＤＲ結合
ペプチドの量は、捕捉についてはＤＲ特異的抗体を用い、そして結合ペプチドの
定量についてはストレプトアビジンペルオキシダーゼを用いたＥＬＩＳＡ（ＡＢ
ＳＴをペルオキシダーゼ基質として用い、そして４０５ｎｍで検出する）によっ
て試験した。このグラフは、以下について、ビオチニル化ＭＢＰペプチド結合を
経時的に示す：組換えＤＲ２融合物（白抜きの四角）；洗浄剤に可溶したＢ細胞
ＤＲ２分子（黒三角）。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ｃ０７Ｋ 19/00 Ｃ１２Ｑ 1/02 Ｃ１２Ｑ 1/02 Ｇ０１Ｎ 33/53 Ｄ Ｇ０１Ｎ 33/53 Ｃ１２Ｎ 15/00 ＺＮＡＡ (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＺ，ＵＧ，ＺＷ)，ＥＡ(ＡＭ ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ) ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ， ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，Ｄ Ｋ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ，ＧＨ，ＧＭ ，ＨＲ，ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ， ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，Ｌ Ｔ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ， ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，Ｕ Ａ，ＵＧ，ＵＺ，ＶＮ，ＹＵ，ＺＷ (72)発明者 ストロミンガー， ジャック エル． アメリカ合衆国 マサチューセッツ 02421， レキシントン， マサチューセ ッツ アベニュー 2020 (54)【発明の名称】 一価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、多価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質 および接合体、ならびに多量体ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質および接合体、そしてそれら のための使用

Claims (102)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ α鎖の少なくともＭＨＣク
    ラスＩＩ結合ドメインおよびＣ末端方向の二量体化ドメインの融合物を含む、ク
    ラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  2. 【請求項２】 前記ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ
    α鎖の細胞外ドメインを含む、請求項１に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子
    複合体融合タンパク質。
  3. 【請求項３】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖の残基５〜
    １８０を含む、請求項２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タン
    パク質。
  4. 【請求項４】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖の残基５〜
    ２００を含む、請求項２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タン
    パク質。
  5. 【請求項５】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖の残基５〜
    １９０を含む、請求項２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タン
    パク質。
  6. 【請求項６】 前記ＭＨＣクラスＩＩ α鎖が、ＨＬＡ−ＤＲ１ α鎖、Ｈ
    ＬＡ−ＤＲ２ α鎖、ＨＬＡ−ＤＲ４ α鎖、ＨＬＡ−ＤＱ１ α鎖、ＨＬＡ−
    ＤＱ２ α鎖およびＨＬＡ−ＤＱ８ α鎖からなる群から選択される、請求項１
    に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  7. 【請求項７】 前記ＭＨＣクラスＩＩ α鎖が、ＤＲＡ*０１０１対立遺伝 子、ＤＲＡ*０１０２対立遺伝子、ＤＱＡ１*０３０１対立遺伝子およびＤＱＡ１ * ０５０１対立遺伝子からなる群から選択されるＨＬＡ対立遺伝子によってコー ドされる、請求項１に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク
    質。
  8. 【請求項８】 Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ β鎖の少なくともＭＨＣク
    ラスＩＩ結合ドメインおよびＣ末端方向の二量体化ドメインの融合物を含む、ク
    ラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  9. 【請求項９】 前記ＭＨＣクラスＩＩ結合ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ
    β鎖の細胞外ドメインを含む、請求項８に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子
    複合体融合タンパク質。
  10. 【請求項１０】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ β鎖の残基５
    〜１８５を含む、請求項９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タ
    ンパク質。
  11. 【請求項１１】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ β鎖の残基５
    〜２０５を含む、請求項９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タ
    ンパク質。
  12. 【請求項１２】 前記細胞外ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ β鎖の残基５
    〜１９５を含む、請求項９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タ
    ンパク質。
  13. 【請求項１３】 前記ＭＨＣクラスＩＩ β鎖が、ＨＬＡ−ＤＲ１ β鎖、
    ＨＬＡ−ＤＲ２ β鎖、ＨＬＡ−ＤＲ４ β鎖、ＨＬＡ−ＤＱ１ β鎖、ＨＬＡ
    −ＤＱ２ β鎖およびＨＬＡ−ＤＱ８ β鎖からなる群から選択される、請求項
    ８に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  14. 【請求項１４】 前記ＭＨＣクラスＩＩ β鎖が、ＤＲＢ１*０１対立遺伝 子、ＤＲＢ１*１５対立遺伝子、ＤＲＢ１*１６対立遺伝子、ＤＲＢ５*０１対立 遺伝子、ＤＱＢ１*０３対立遺伝子およびＤＱＢ１*０２対立遺伝子からなる群か
    ら選択される対立遺伝子によってコードされる、請求項１３に記載のクラスＩＩ
    主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  15. 【請求項１５】 前記二量体化ドメインが、コイルドコイル二量体化ドメイ
    ンである、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝
    子複合体融合タンパク質。
  16. 【請求項１６】 前記二量体化ドメインが、ロイシンジッパードメインであ
    る、請求項１５に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  17. 【請求項１７】 前記ロイシンジッパードメインが、少なくとも４つのロイ
    シンヘプタッドを含む、請求項１６に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合
    体融合タンパク質。
  18. 【請求項１８】 前記ロイシンジッパードメインが、Ｆｏｓロイシンジッパ
    ードメインおよびＪｕｎロイシンジッパードメインからなる群から選択される、
    請求項１６に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  19. 【請求項１９】 前記二量体化ドメインが、免疫グロブリンＦａｂ定常ドメ
    インである、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺
    伝子複合体融合タンパク質。
  20. 【請求項２０】 前記免疫グロブリンＦａｂ定常ドメインが、免疫グロブリ
    ン重鎖ＣH１定常領域である、請求項１９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝 子複合体融合タンパク質。
  21. 【請求項２１】 前記免疫グロブリンＦａｂ定常ドメインが、免疫グロブリ
    ン軽鎖定常領域である、請求項１９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合
    体融合タンパク質。
  22. 【請求項２２】 前記ＭＨＣクラスＩＩ鎖と前記二量体化ドメインとの間に
    挿入され、そしてこれらを共有結合的に連結する可撓性分子リンカーをさらに含
    む、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合
    体融合タンパク質。
  23. 【請求項２３】 前記可撓性分子リンカーが、１〜１５のアミノ酸残基のペ
    プチド配列を含む、請求項２２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融
    合タンパク質。
  24. 【請求項２４】 前記可撓性分子リンカーが、５〜７のアミノ酸残基のペプ
    チド配列を含む、請求項２３に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合
    タンパク質。
  25. 【請求項２５】 前記アミノ酸残基の大部分が、アラニン残基、グリシン残
    基、セリン残基、ロイシン残基、イソロイシン残基、およびバリン残基からなる
    群から選択される、請求項２３に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融
    合タンパク質。
  26. 【請求項２６】 前記ＭＨＣクラスＩＩ α鎖のＮ末端に共有結合的に連結
    されたＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチドをさらに含み、ここで該結合ペプチドが、
    該α鎖およびＭＨＣクラスＩＩ β鎖を含むＭＨＣクラスＩＩ分子に選択的に結
    合してＭＨＣ／ペプチド複合体を形成し得る、請求項１〜７のいずれか１項に記
    載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  27. 【請求項２７】 前記ＭＨＣクラスＩＩ β鎖のＮ末端に共有結合的に連結
    されたＭＨＣクラスＩＩ結合ペプチドをさらに含み、ここで該結合ペプチドが、
    該β鎖およびＭＨＣクラスＩＩ α鎖を含むＭＨＣクラスＩＩ分子に選択的に結
    合してＭＨＣ／ペプチド複合体を形成し得る、請求項８〜１４のいずれか１項に
    記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  28. 【請求項２８】 前記ＭＨＣクラスＩＩ分子がＨＬＡ−ＤＲ２分子であり、
    そして前記結合ペプチドが、ヒトミエリン塩基性タンパク質の残基８５〜９９、
    残基８４〜１０２および残基１４８〜１６２からなる群から選択される、請求項
    ２７に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  29. 【請求項２９】 前記ＭＨＣクラスＩＩ分子がＨＬＡ−ＤＲ４分子であり、
    そして前記結合ペプチドが、ヒトデスモグレイン３タンパク質の残基７３〜９３
    、残基９７〜１１１、残基１９０〜２０４、残基２０６〜２２０、残基２５１〜
    ２６５、残基５１２〜５２６および残基７６２〜７８６からなる群から選択され
    る、請求項２７に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  30. 【請求項３０】 前記ＭＨＣクラスＩＩ分子がＨＬＡ−ＤＱ１分子であり、
    そして前記結合ペプチドが、ヒトデスモグレイン３タンパク質の残基７８〜９３
    、残基９７〜１１１、残基１９０〜２０４、残基２０６〜２２０、残基２５１〜
    ２６５、残基５１２〜５２６および残基７６２〜７８６からなる群から選択され
    る、請求項２７に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  31. 【請求項３１】 前記ＭＨＣクラスＩＩ鎖と前記ＭＨＣ結合ペプチドとの間
    に挿入され、そしてこれらを共有結合的に連結する可撓性分子リンカーをさらに
    含む、請求項２６〜３０のいずれか１項に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子
    複合体融合タンパク質。
  32. 【請求項３２】 前記可撓性分子リンカーが、１０〜２０のアミノ酸残基の
    ペプチド配列を含む、請求項３１に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体
    融合タンパク質。
  33. 【請求項３３】 前記可撓性分子リンカーが、１２〜１８のアミノ酸残基の
    ペプチド配列を含む、請求項３２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体
    融合タンパク質。
  34. 【請求項３４】 前記アミノ酸残基の大部分が、アラニン残基、グリシン残
    基、セリン残基、ロイシン残基、イソロイシン残基、およびバリン残基からなる
    群から選択される、請求項３２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融
    合タンパク質。
  35. 【請求項３５】 第１のポリペプチド鎖および第２のポリペプチド鎖のヘテ
    ロ二量体を含むクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質であって； ここで該第１のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ α鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の第１の二量体化ドメインの融合物を
    含み； ここで該第２のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ β鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の第２の二量体化ドメインの融合物を
    含み；そして ここで該第１の二量体化ドメインおよび該第２の二量体化ドメインが、生理学
    的条件において溶液中で会合し、ＭＨＣ結合ペプチドを選択的に結合し得るヘテ
    ロ二量体を形成する、 クラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  36. 【請求項３６】 第１のポリペプチド鎖および第２のポリペプチド鎖のヘテ
    ロ二量体を含むクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質であって； ここで該第１のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ α鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域 の融合物を含み； ここで該第２のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ β鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の免疫グロブリン軽鎖定常領域の融合
    物を含み；そして ここで該免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域および該免疫グロブリン軽鎖定常 領域が、生理学的条件において溶液中で二量体化し、ＭＨＣ結合ペプチドを選択
    的に結合し得るヘテロ二量体を形成する、 クラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  37. 【請求項３７】 第１のポリペプチド鎖および第２のポリペプチド鎖のヘテ
    ロ二量体を含むクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質であって； ここで該第１のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ α鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の免疫グロブリン軽鎖定常領域の融合
    物を含み； ここで該第２のポリペプチド鎖が、Ｎ末端方向のＭＨＣクラスＩＩ β鎖の少
    なくとも細胞外ドメインおよびＣ末端方向の免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域 の融合物を含み；そして ここで該免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域および該免疫グロブリン軽鎖定常 領域が、生理学的条件において溶液中で二量体化し、ＭＨＣ結合ペプチドを選択
    的に結合し得るヘテロ二量体を形成する、 クラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  38. 【請求項３８】 前記免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域に共有結合的に連 結された免疫グロブリンＦｃ領域をさらに含む、請求項３６〜３７のいずれか１
    項に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  39. 【請求項３９】 前記免疫グロブリンＦｃ領域が、ＩｇＥ Ｆｃ領域および
    ＩｇＭ Ｆｃ領域からなる群から選択される、請求項３８に記載のクラスＩＩ主
    要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  40. 【請求項４０】 前記免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域と免疫グロブリン Ｆｃ領域との間に挿入され、そしてこれらを共有結合的に連結する可撓性分子リ
    ンカーをさらに含む、請求項３９に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体
    融合タンパク質。
  41. 【請求項４１】 前記免疫グロブリンＦｃ領域が、ＩｇＡ Ｆｃ領域、Ｉｇ
    Ｄ Ｆｃ領域およびＩｇＧ Ｆｃ領域からなる群から選択される、請求項３８に
    記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  42. 【請求項４２】 前記免疫グロブリン重鎖ＣH１定常領域と免疫グロブリン Ｆｃ領域との間に挿入され、そして共有結合的に連結する可撓性分子リンカーを
    さらに含む、請求項４１に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タン
    パク質。
  43. 【請求項４３】 前記可撓性分子リンカーが、免疫グロブリンヒンジ領域で
    ある、請求項４２に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質
    。
  44. 【請求項４４】 請求項３８〜４３のいずれか１項に記載の２つのクラスＩ
    Ｉ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質を含む、多価クラスＩＩ主要組織適
    合遺伝子複合体融合タンパク質であって、前記Ｆｃ領域が、少なくとも１つのジ
    スルフィド結合によって共有結合的に連結される、多価クラスＩＩ主要組織適合
    遺伝子複合体融合タンパク質。
  45. 【請求項４５】 請求項３８〜４３のいずれか１項に記載の５対のクラスＩ
    Ｉ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質を含む、多価クラスＩＩ主要組織適
    合遺伝子複合体融合タンパク質であって、ここで、 前記Ｆｃ領域がＩｇＭ領域であり、各々の該対は、該対のＦｃ領域間を少なく
    とも１つのジスルフィド結合によって共有結合的に連結され、そして該５対はジ
    スルフィド架橋によって共有結合的に連結されて環状構造を形成し、その結果、
    該環における各隣接対が少なくとも１つのジスルフィド結合によって連結される
    、多価クラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  46. 【請求項４６】 前記融合タンパク質のＮ末端に共有結合的に連結されたＮ
    末端分泌シグナル配列をさらに含む、請求項１〜１４のいずれか１項に記載のク
    ラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質。
  47. 【請求項４７】 前記分泌シグナル配列が、酵母のα接合因子分泌シグナル
    を含む、請求項４６に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク
    質。
  48. 【請求項４８】 前記分泌シグナル配列が、ヒトＭＨＣクラスＩＩタンパク
    質分泌シグナルを含む、請求項４６に記載のクラスＩＩ主要組織適合遺伝子複合
    体融合タンパク質。
  49. 【請求項４９】 キャリアおよびそれに結合した複数のＭＨＣ結合ドメイン
    を含む、多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  50. 【請求項５０】 約５〜約５００のＭＨＣ結合ドメインが前記キャリアに接
    合される、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接
    合体。
  51. 【請求項５１】 約１０〜約２００のＭＨＣ結合ドメインが前記キャリアに
    接合される、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン
    接合体。
  52. 【請求項５２】 約２０〜約１００のＭＨＣ結合ドメインが前記キャリアに
    接合される、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン
    接合体。
  53. 【請求項５３】 前記キャリアが最少表面を規定し、そして前記ＭＨＣ結合
    ドメインが、約４×１０-3〜２０のＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の平均密度で該 表面上に存在する、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ド
    メイン接合体。
  54. 【請求項５４】 前記キャリアが最少表面を規定し、そして前記ＭＨＣ結合
    ドメインが、約４×１０-2〜２０のＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の平均密度で該 表面上に存在する、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ド
    メイン接合体。
  55. 【請求項５５】 前記キャリアが最少表面を規定し、そして前記ＭＨＣ結合
    ドメインが、約０．４〜２０のＭＨＣ結合ドメイン／ｎｍ2の平均密度で該表面 上に存在する、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイ
    ン接合体。
  56. 【請求項５６】 前記キャリアが約５〜約１０００ｎｍの最大直径を有する
    、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  57. 【請求項５７】 前記キャリアが約５〜約５００ｎｍの最大直径を有する、
    請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  58. 【請求項５８】 前記キャリアが約５〜約１００ｎｍの最大直径を有する、
    請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  59. 【請求項５９】 前記キャリアが約１００ｋＤａ〜約１０，０００ｋＤａの
    重さである、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン
    接合体。
  60. 【請求項６０】 前記キャリアが約１００ｋＤａ〜約５，０００ｋＤａの重
    さである、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接
    合体。
  61. 【請求項６１】 前記キャリアが約１００ｋＤａ〜約１，０００ｋＤａの重
    さである、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接
    合体。
  62. 【請求項６２】 前記キャリアが約１００ｋＤａ〜約５００ｋＤａの重さで
    ある、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体
    。
  63. 【請求項６３】 前記接合体が約４００ｋＤａ〜約１０，０００ｋＤａの重
    さである、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接
    合体。
  64. 【請求項６４】 前記接合体が約４００ｋＤａ〜約５，０００ｋＤａの重さ
    である、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合
    体。
  65. 【請求項６５】 前記接合体が約４００ｋＤａ〜約１，０００ｋＤａの重さ
    である、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合
    体。
  66. 【請求項６６】 前記接合体が約４００ｋＤａ〜約５００ｋＤａの重さであ
    る、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  67. 【請求項６７】 前記キャリアが粒状である、請求項４９に記載の多量体主
    要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  68. 【請求項６８】 前記キャリアが生分解性である、請求項４９に記載の多量
    体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  69. 【請求項６９】 前記キャリアが非免疫原性である、請求項４９に記載の多
    量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  70. 【請求項７０】 前記キャリアが分枝状ポリマーである、請求項４９に記載
    の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  71. 【請求項７１】 前記キャリアが正味の負電荷を有する、請求項４９に記載
    の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  72. 【請求項７２】 前記キャリアが正味の電荷を有さない、請求項４９に記載
    の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  73. 【請求項７３】 前記キャリアが蛍光標識される、請求項４９に記載の多量
    体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  74. 【請求項７４】 前記キャリアが前記ＭＨＣ結合ドメインに共有結合的に結
    合される、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接
    合体。
  75. 【請求項７５】 前記キャリアが前記ＭＨＣ結合ドメインに非共有結合的に
    結合される、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン
    接合体。
  76. 【請求項７６】 前記キャリアが実質的に球状のビーズである、請求項４９
    に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  77. 【請求項７７】 前記ビーズが多孔性である、請求項７６に記載の多量体主
    要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  78. 【請求項７８】 前記ビーズが、ガラス、シリカ、ヒドロキシカルボン酸の
    ポリエステル、ジカルボン酸のポリ酸無水物、またはヒドロキシカルボン酸とジ
    カルボン酸とのコポリマーからなる群から選択される物質を含む、請求項７６に
    記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  79. 【請求項７９】 前記キャリアが分枝状ポリマーを含む、請求項４９に記載
    の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  80. 【請求項８０】 前記分枝状ポリマーがデンドリマーである、請求項７９に
    記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  81. 【請求項８１】 前記デンドリマーが最少表面を規定し；そして、ここで、
    前記表面が正味の中性電荷または正味の負電荷を有する、請求項８０に記載の多
    量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  82. 【請求項８２】 前記デンドリマーが、ポリアミドアミン、ポリアミドアル
    コール、ポリアルキレンイミン、ポリアルキレン、ポリエーテル、ポリチオエー
    テル、ポリホスホニウム、ポリシロキサン、ポリアミド、およびポリアリールポ
    リマーからなる群から選択される物質を含む、請求項８０に記載の多量体主要組
    織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  83. 【請求項８３】 前記キャリアがリポソームである、請求項４９に記載の多
    量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  84. 【請求項８４】 前記リポソームが、ホスファチジルコリン、ホスファチジ
    ルセリン、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルグリセロール、ホスフ
    ァチジルエタノールアミン、ホスファチジン酸、ジセチルリン酸、モノシアロガ
    ングリオシド、ポリエチレングリコール、ステアリルアミン、オボレシチン、お
    よびコレステロールからなる群から選択される物質を含む、請求項８３に記載の
    多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体。
  85. 【請求項８５】 前記ＭＨＣ結合ドメインに結合した複数のＭＨＣ結合ペプ
    チドをさらに含み、ここで該ＭＨＣ結合ペプチドが、生理学的条件下で該ＭＨＣ
    結合ドメインを特異的に結合する、請求項４９に記載の多量体主要組織適合遺伝
    子複合体結合ドメイン接合体。
  86. 【請求項８６】 前記ＭＨＣ結合ペプチドが、前記ＭＨＣ結合ドメインに共
    有結合的に結合される、請求項８５に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結
    合ドメイン接合体。
  87. 【請求項８７】 前記ＭＨＣ結合ペプチドが、前記ＭＨＣ結合ドメインに非
    共有結合的に結合される、請求項８５に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体
    結合ドメイン接合体。
  88. 【請求項８８】 各ＭＨＣ結合ドメインが、ＭＨＣクラスＩ α鎖およびＭ
    ＨＣクラスＩ β鎖の少なくともペプチド結合ドメインのヘテロ二量体を含む、
    請求項４９〜８７のいずれか１項に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合
    ドメイン接合体。
  89. 【請求項８９】 各ＭＨＣ結合ドメインが、ＭＨＣクラスＩＩ α鎖および
    ＭＨＣクラスＩＩ β鎖の少なくともペプチド結合ドメインのヘテロ二量体を含
    む、請求項４９〜８７のいずれか１項に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体
    結合ドメイン接合体。
  90. 【請求項９０】 各ＭＨＣ結合ドメインが、一価ＭＨＣ結合ドメイン融合タ
    ンパク質または多価ＭＨＣ結合ドメイン融合タンパク質を含む、請求項４９〜８
    ７のいずれか１項に記載の多量体主要組織適合遺伝子複合体結合ドメイン接合体
    。
  91. 【請求項９１】 規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体特異性を有するＴ細胞
    を検出するための方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程； Ｔ細胞の集団を、該融合タンパク質または接合体と接触させる工程；および、 該集団における、該融合タンパク質もしくは接合体とＴ細胞との結合の存在ま
    たは非存在を検出する工程、 を包含する、方法。
  92. 【請求項９２】 前記規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体と反応性であるＴ
    細胞を、前記Ｔ細胞の集団から単離する工程をさらに包含する、請求項９１に記
    載の方法。
  93. 【請求項９３】 前記単離する工程が、蛍光活性化セルソーティングによる
    、請求項９２に記載の方法。
  94. 【請求項９４】 被験体に、規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対する養
    子免疫を付与する方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程； Ｔ細胞の集団を、該融合タンパク質または接合体と接触させる工程； 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体と反応性であるＴ細胞を、該Ｔ細胞の集
    団から単離する工程；および 養子免疫を提供するために、該被験体に該単離されたＴ細胞を投与する工程、 を包含する、方法。
  95. 【請求項９５】 規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応性である
    Ｔ細胞を刺激または活性化するための方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程；および Ｔ細胞の集団を、免疫原性の量の該融合タンパク質または接合体と接触させる
    工程、 を包含する、方法。
  96. 【請求項９６】 ヒト被験体において、前記融合タンパク質または接合体を
    、インビボで前記Ｔ細胞の集団と接触させ、そしてここで前記ＭＨＣ融合タンパ
    ク質または接合体が、該被験体に対して同系であるＭＨＣ結合ドメインを含む、
    請求項９５に記載の方法。
  97. 【請求項９７】 規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応性である
    Ｔ細胞を選択的に殺傷するための方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程；および Ｔ細胞の集団を、該融合タンパク質または接合体と接触させる工程であって；
    ここで該融合タンパク質または接合体が、補体系を活性化し、そして該補体系に
    よって該Ｔ細胞を殺傷させるために有効な免疫グロブリンのドメインを含む、工
    程、 を包含する、方法。
  98. 【請求項９８】 規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対して反応性である
    Ｔ細胞を選択的に殺傷するための方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程；および Ｔ細胞の集団を、該融合タンパク質または接合体と接触させる工程であって；
    ここで、 該融合タンパク質または接合体が、該融合タンパク質または接合体と会合した
    細胞傷害性物質であって、かつ該融合タンパク質または接合体が選択的に結合す
    るＴ細胞を殺傷し得る細胞傷害性物質を含む、工程、 を包含する、方法。
  99. 【請求項９９】 規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体に対してヒト被験体を
    寛容化するための方法であって、該方法は以下の工程、 該規定されたＭＨＣ／ペプチド複合体を含む、請求項３５〜９０のいずれか１
    項に記載の、一価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、多
    価主要組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体、または多量体主要
    組織適合遺伝子複合体融合タンパク質もしくは接合体を提供する工程；および 該被験体に、該ＭＨＣ／ペプチド複合体に対する寛容化を誘導するのに効果的
    な量の該融合タンパク質または接合体を投与する工程、 を包含する、方法。
  100. 【請求項１００】 前記ＭＨＣ融合タンパク質または接合体が、前記被験体
    に対して同系であるＭＨＣ結合ドメインを含む、請求項９９に記載の方法。
  101. 【請求項１０１】 前記ＭＨＣ融合タンパク質または接合体が、前記被験体
    に対して同種異系であるＭＨＣ結合ドメインを含む、請求項９９に記載の方法。
  102. 【請求項１０２】 請求項１〜４５のいずれか１項に記載のＭＨＣ結合ドメ
    イン融合タンパク質をコードする、単離された核酸。
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