JP2002502264A - サイクリン関連タンパク質 - Google Patents

サイクリン関連タンパク質

Info

Publication number
JP2002502264A
JP2002502264A JP50298899A JP50298899A JP2002502264A JP 2002502264 A JP2002502264 A JP 2002502264A JP 50298899 A JP50298899 A JP 50298899A JP 50298899 A JP50298899 A JP 50298899A JP 2002502264 A JP2002502264 A JP 2002502264A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
sequence
hcrp
seq
polynucleotide
fragment
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP50298899A
Other languages
English (en)
Inventor
ヒルマン、ジェニファー・エル
コーレイ、ニール・シー
ゲグラー、カーン・ジェイ
コックス、ベンジャミン・グリーム
シャー、パルビ
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Incyte Corp
Original Assignee
Incyte Pharmaceuticals Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Incyte Pharmaceuticals Inc filed Critical Incyte Pharmaceuticals Inc
Publication of JP2002502264A publication Critical patent/JP2002502264A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/93Ligases (6)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C07K14/4701Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
    • C07K14/4738Cell cycle regulated proteins, e.g. cyclin, CDC, INK-CCR
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

(57)【要約】 本発明は、ヒトサイクリン関連タンパク質(HCRP)及びHCRPを同定しコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、発現ベクター、宿主細胞、アゴニスト、抗体、及びアンタゴニストを提供する。また本発明は、HCRPの発現に関連する疾病の治療方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 サイクリン関連タンパク質技術分野 本発明は、2種類のサイクリン関連タンパク質の核酸及びアミノ酸配列、及び 癌、免疫疾患、及び発達障害の診断、予防、及び治療におけるこれらの配列の利 用に関するものである。発明の背景 細胞分裂は、全ての生物の成長や生殖がこれによって行われる基礎的なプロセ スである。酵母菌や細菌のような単細胞生物では、1回の細胞分裂により生物の 数が2倍に増加し、多細胞生物では、新たな組織や器官を作り出したり、摩耗や プログラムされた細胞死によって失われた細胞を新たな細胞に置き換えるために 多数回の細胞分裂が必要である。細胞分裂周期は、詳細な点では様々に異なって いることもあるが、基本的なプロセスは3つの主な事象からなる。第1の事象で ある静止期では、細胞分裂の準備が行われ、DNAが複製され、必須タンパク質 が生成される。第2の事象である有糸分裂では、核の物質が分かれて、細胞の両 側に集まる。最後の事象である細胞質分裂では、細胞質が分割し分裂する。これ らの細胞周期事象の順番及びタイミングは、種々のチェックポイントにおいてこ のプロセスを調節する細胞周期制御系の制御の下にある。過去20年間に渡って 、これらの事象を調節する様々なタンパク質の構造や機能について多くの研究が なされてきた。 細胞が有糸分裂期に入ったりそれを脱したりすることは、サイクリンと称する 活性化タンパク質のファミリーの合成と破壊により調節される。サイクリンは、 サイクリン依存性タンパク質キナーゼの群に結合し、それを活性化することによ って作用する。このサイクリン依存性プロテインキナーゼは、有糸分裂プロセス に関与する選択されたタンパク質をリ ン酸化し、活性化する。サイクリンには様々なタイプが存在する(Ciechanover, A.(1994)Cell 79:13-2)。主要な2つのタイプは、細胞が有糸分裂期に入ること を調節する有糸分裂サイクリンであるサイクリンBと、細胞が有糸分裂期から脱 するのを誘導する事象を調節するG1サイクリンである。サイクリンは、「サイ クリンボックス」と称する約180アミノ酸からなる長さの大きな共通の相同領 域をその特徴とする(Chapman,D.L.及びWolgemuth,D.J.(1993)Development I18 :229-40)。更にサイクリンは、「破壊ボックス(destruction box)」と呼ばれる 分子のN末端領域におけるアミノ酸配列を含む(Hunt,T.(1991)Nature 349:100- 101)。この配列は、RXXLXXIXNなる保存的モチーフを有し、サイクリンBのユビ キチン依存性分解を生じさせる認識コードであると考えられている(後述の説明 を参照)。 サイクリンの分解はユビキチン結合系(UCS)を介してなされる。このUC Sは、真核細胞及び幾つかの細菌における細胞のタンパク質の分解のための主要 な経路である。UCSは、異常なタンパク質の除去を媒介したり、遺伝子の転写 や細胞周期の進行のような細胞プロセスを調節する重要な調節性タンパク質の半 減期を調節する。UCSは、有糸分裂サイクリンキナーゼ(mitotic cyclic kin ase)、腫瘍性タンパク質、p53のような癌抑制遺伝子、ウイルスタンパク質 、シグナル伝達に関連する細胞表面受容体、転写制御因子、及び変異した或いは 損傷を受けたタンパク質の分解に関与する(Ciechanover,前出)。 ユビキチン結合及びタンパク分解のプロセスは、4つの主要なステップで生ず る(Jentsch,S.(1992)Annu.Rev.Genet.26:179-207)。第1ステップは、小型の 熱安定性タンパク質(76アミノ酸)であるユビキチン(Ub)が、ATP依存 性反応におけるユビキチン活性化酵素(E1)によって活性化される。このAT P依存性反応では、UbのC末端 が、E1の内部のシステイン残基のチオール基に結合する。第2ステップでは、 活性化されたUbが、幾つかのUb結合酵素(E2)の1つに移送される。異な るユビキチン依存性タンパク分解経路は、構造的に類似しているが異なるユビキ チン結合酵素を利用する。このユビキチン結合酵素は、認識サブユニットに結合 し、それを特定の分解シグナルを有するタンパク質に誘導する。次にE2がUb 分子を、そのC末端グリシンを介して標的タンパク質の内部のリジン(アクセプ タリジン)に結合する。別のUb分子が加わって多Ub鎖構造を形成することも ある。次にユビキチンが結合したタンパク質を、大型の多サブユニットタンパク 分解酵素複合体であるプロテアーゼが認識し、分解して、Ubは再利用のために 放出される。 E2(Ub結合)酵素は、異なるUCS経路における基質特異性に関して重要 な酵素である。全てのE2は、UBCドメインと称する約16kDaの保存的ド メインを有し、このUBCドメインは、全てのE2の間で35%以上の配列同一 性を有し、ユビキチンー酵素チオールエステル形成のために必要な中央に位置す るシステイン残基を有する(Jentsch,前出)。良く保存されたプロリンを多く 含むエレメントが活性システイン残基のN末端に位置している。この保存的ドメ インの先の構造的な相違を、E2酵素の分類のために使用する。クラスIのE2 は、概ね保存的UBCドメインのみからなる。クラスIIのE2は、基質特異性 や細胞局在化の原因となる様々な近縁でないC末端延長部を有している。クラス IIIのE2は、酵素の調節や基質特異性に関与すると考えられる独特のN末端 延長部を有している。 最近になって、有糸分裂サイクリンに対して選択的な新規なタイプのE2が発 見された(Aris tarkhov,A.et al.(1996)Proc.Natl.Acad.Sci.93:4294-99)。サ イクリン特異的E2、つまりE2−Cは、保存的UB Cドメインと、他のE2では見られない30アミノ酸からなるN末端延長部と、 この延長部に隣接する独特の配列TLLMSGDをその特徴とする。これらの特徴は、 E2−Cのサイクリンに対する高い親和性と相俟って、このE2が新たなクラス のE2であることを示している。 新規なサイクリン関連タンパク質及びそれをコードするポリヌクレオチドの発 見により、癌、免疫疾患、及び発達障害の診断、予防及び治療において役立つ新 たな物質が提供されて当分野における必要性が満たされることになる。発明の要約 本発明は、配列番号:1に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製されたポリ ペプチド、即ちサイクリン関連タンパク質HCRP−1、またはその断片を提供 する。 更に本発明は、配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする 単離され実質的に精製されたポリヌクレオチド配列又はその断片及び前記ポリヌ クレオチド配列を含む組成物を提供する。また本発明は、配列番号:1のアミノ 酸配列をコードするポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズす るポリヌクレオチド配列、又は前記ポリヌクレオチド配列の断片を提供する。更 に本発明は、配列番号:1のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド配列の 相補配列を含むポリヌクレオチド配列、又は前記ポリヌクレオチド配列の断片若 しくは変異配列を提供する。 また本発明は、配列番号:2の配列を含む単離され精製された配列又はその変 異配列を提供する。更に本発明は、配列番号:2のポリヌクレオチド配列に厳密 な条件の下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。別の実施態 様では、本発明は、配列番号:2の相補配列を含む単離され精製されたポリヌク レオチド配列又はその断片若しくは 変異配列を含む組成物を提供する。また本発明は、配列番号:2の相補配列を含 むポリヌクレオチド配列を提供する。 更に本発明は、開示されたポリヌクレオチド配列の何れかの少なくとも断片を 含む発現ベクターを提供する。別の実施態様では、該ポリヌクレオチド配列を含 む発現ベクターは宿主細胞に含められる。 また本発明は、配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片 を製造する方法であって、(a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で、 HCRP−1をコードするポリヌクレオチドの少なくとも断片を含む発現ベクタ ーを含む宿主細胞を培養する過程と、(b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペ プチドを回収する過程とを含む配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチド 又はその断片を製造する方法を提供する。 また本発明は、配列番号:1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたHC RP−1を、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成物を提供する。 更に本発明は、配列番号:1のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴ ニストを提供する。 また本発明は、癌の治療又は予防方法であって、そのような治療が必要な患者 に、精製されたHCRP−1を含む医薬品組成物を有効な量投与する過程を含む 癌の治療又は予防方法を提供する。 また本発明は、免疫疾患の治療又は予防方法であって、そのような治療が必要 な患者に、精製されたHCRP−1を含む医薬品組成物を有効な量投与する過程 を含む免疫疾患の治療又は予防方法を提供する。 また本発明は、生物学的サンプルにおけるHCRP−1をコードするポリヌク レオチドの検出方法であって、(a)HCRP−1(配列番号:1)に相補的な ポリヌクレオチド配列と、生物学的サンプルの核酸材料 とをハイブリダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、( b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程であって、前記複合体の 存在が、前記生物学的サンプルにおけるHCRP−1をコードするポリヌクレオ チドの存在と相関性を有する、該過程とを含む生物学的サンプルにおけるHCR P−1をコードするポリヌクレオチドの検出方法を提供する。好適な実施例では 、ハイブリダイゼーションの前に、前記生物学的サンプルの前記核酸材料を、P CR法により増幅する。 また本発明は、配列番号:3に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製された ポリペプチド、即ちサイクリン関連タンパク質HCRP−2、又はその断片を提 供する。 更に本発明は、配列番号:3のアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードする 単離され実質的に精製されたポリヌクレオチド配列又はその断片、及び前記ポリ ヌクレオチド配列を含む組成物を提供する。また本発明は、配列番号:3のアミ ノ酸配列をコードするポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズ するポリヌクレオチド配列、又は前記ポリヌクレオチド配列の断片を提供する。 更に本発明は、配列番号:3のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド配列 の相補配列を含むポリヌクレオチド配列、又は前記ポリヌクレオチド配列の断片 又は変異配列を提供する。 また本発明は、配列番号:4の配列を含む単離され精製された配列、又はその 変異配列を提供する。更に本発明は、配列番号:4のポリヌクレオチド配列と厳 密な条件の下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。別の実施 態様では、本発明は、配列番号:4の相補配列を含む単離され精製されたポリヌ クレオチド配列、又はその断片若しくは変異配列を含む組成物を提供する。また 本発明は、配列番号:4の 相補配列を含むポリヌクレオチド配列を提供する。 更に本発明は、開示されたポリヌクレオチド配列の何れかの少なくとも断片を 含む発現ベクターを提供する。別の実施態様では、前記ポリヌクレオチド配列を 含む発現ベクターが宿主細胞に含められる。 また本発明は、配列番号:3のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片 の製造方法であって、(a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で、HC RP−2をコードするポリヌクレオチド配列の少なくとも断片を含む発現ベクタ ーを含む宿主細胞を培養する過程と、(b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペ プチドを回収する過程とを含む配列番号:3のアミノ酸配列を含むポリペプチド 又はその断片の製造方法を提供する。 また本発明は、配列番号:3のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたHC RP−2を、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成物を提供する。 更に本発明は、配列番号:3のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴ ニストを提供する。 また本発明は、配列番号:3のポリペプチドの活性を低下させる精製されたア ンタゴニストを提供する。或る態様では、本発明は、配列番号:3のアミノ酸配 列の少なくとも断片を含むポリペプチドに結合する精製された抗体を提供する。 また本発明は、発達障害の治療又は予防方法であって、そのような治療が必要 な患者に、精製されたHCRP−2を含む医薬品組成物を有効な量投与する過程 を含む発達障害の治療又は予防方法を提供する。 また本発明は、癌の治療又は予防方法であって、そのような治療が必要な患者 に、HCRP−2の精製されたアンタゴニストを有効な量投与する過程を含む癌 の治療又は予防方法を提供する。 また本発明は、生物学的サンプルにおけるHCRP−2をコードするポリヌク レオチドの検出方法であって、(a)HCRP−2(配列番号:3)に相補的な ポリヌクレオチド配列と、生物学的サンプルの核酸材料とをハイブリダイズさせ 、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、(b)前記ハイブリダイゼ ーション複合体を検出する過程であって、前記複合体の存在が、前記生物学的サ ンプルにおけるHCRP−2をコードするポリヌクレオチドの存在と相関性を有 する、該過程とを含む生物学的サンプルにおけるHCRP−2をコードするポリ ヌクレオチドの検出方法を提供する。好適な実施例では、ハイブリダイゼーショ ンの前に、前記生物学的サンプルの前記核酸材料を、PCR法により増幅する。図面の簡単な説明 第1A図、第1B図、及び第1C図は、HCRP−1のアミノ酸配列(配列番 号:1)及び核酸配列(配列番号:2)を示す。配列アライメントは、MacDNASI S PROTMソフトウェア(Hitachi Software Engineering Co.,Ltd.,San Bruno,CA )を用いて作成した。 第2A図、第2B図、第2C図、第2D図、第2E図、及び第2F図は、HC RP−2のアミノ酸配列(配列番号:3)及び核酸配列(配列番号:4)を示す 。配列アライメントは、MacDNASIS PROTMソフトウェアを用いて作成した。 第3図は、HCRP−1(配列番号:1)、atlantic clam由来のシステイン 特異的ユビキチンキャリアタンパク質E2−C(GI 1493838;配列番号:5)、 及び酵母菌を起源とするユビキチンキャリアタンパク質E2−18KD(GI 171 866;配列番号:6)の間のアミノ酸配列アライメントを示す。この配列アライ メントは、DNASTARTMソフトウェア(DNASTAR Inc,Madison WI)のマルチシーケ ンスアライメントプロ グラムを用いて作成した。 第4A図及び第4B図は、HCRP−2(配列番号:3)、及びマウスを起源 とするサイクリンB(GI 50613;配列番号:7)及びヒトを起源とするサイクリ ンB(GI 105763;配列番号:8)の間のアミノ酸配列アライメントを示す。こ の配列アライメントは、DNASTARTMソフトウェアのマルチシーケンスアライメン トプログラムを用いて作成した。 第5A図及び第5B図は、それぞれHCRP−1(配列番号:1)とatlantic clamを起源とするサイクリン特異的ユビキチンキャリアタンパク質E2−C( 配列番号:5)の疎水性プロットを示す。X軸は正の方向にアミノ酸の位置を表 し、Y軸は負の方向に疎水性のレベルを表す(MacDNASIS PROTMソフトウェアで 作成)。 第6A図及び第6B図は、それぞれHCRP−2(配列番号:3)及びマウス を起源とするサイクリンB(配列番号:7)の疎水性プロットを示す。X軸は正 の方向にアミノ酸の位置を表し、Y軸は負の方向に疎水性のレベルを表す(MacD NASIS PROTMソフトウェアを用いて作成)。発明の実施の形態 本発明のタンパク質、核酸配列、及び方法について説明する前に、本発明は、 ここに開示した特定の方法論、プロトコル、細胞系、ベクター、及び試薬に限定 されず、その実施形態を変えて実施できることを理解されたい。また、ここで用 いられる用語法は、特定の実施例のみを説明する目的で用いられたものであり、 請求の範囲のみによって限定される本発明の範囲を限定することを意図したもの ではないということも理解されたい。 本明細書及び請求の範囲において、単数を表す「或る」及び「その」と形容さ れたものは、前後関係でそうでないことが明らかである場合以外は、複数の意味 も含んでいることに注意しなければならない。従って、 例えば「宿主細胞」なる表記が表すものには、複数のそのような宿主細胞が含ま れ、「抗体」なる表記は、1またはそれ以上の抗体及び当業者に周知のその等価 物等も表している。 本明細書における全ての科学技術専門用語は、特別に定義されていない場合に は、本発明の属する技術分野の専門家に一般に理解されるのと同じ意味を有する 。ここに説明したものと類似のまたは等価な方法や材料を本発明の実施や試験に おいて用いることができるが、好適な方法、装置、及び材料はここに説明されて いる。本明細書に記載された全ての文献は、本発明の関連において用いられ得る 文献で報告された細胞系、ベクター、及び方法論を説明し開示する目的で引用さ れたものであり、この引用により本明細書の一部とする。この引用の記載は、本 発明には許容されない、従来発明によって先行開示されたそのような開示内容に 先行することを本発明に許容するためのものと解釈してはならない。 定義 本明細書において、HCRPは、任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、マウス 、ウマ、及び好ましくはヒトを含む哺乳動物から得られる天然の、合成の、半合 成の、又は組換え体を起源とする実質的に精製されたHCRPのアミノ酸配列で ある。 本明細書において、用語「アゴニスト」は、HCRPに結合したとき、HCR Pの効果を強めたり、その効果の持続時間を長くさせる分子である。アゴニスト には、HCRPに結合し、その効果を変調するタンパク質、核酸、糖質や、任意 の他の分子が含まれ得る。 本明細書において「アレル」或いは「アレル配列」とは、HCRPの対立形で ある。アレルは変異、すなわち核酸配列の変化によって生じ、一般に変異したm RNA或いはポリペプチドを生成するが、そのmRN A或いはポリペプチドの構造或いは機能は、変わる場合もあれば変わらない場合 もある。遺伝子によっては、アレル形が存在しないもの、1つ存在するもの、或 いは多数存在するものがある。一般にアレルを生じる変異はアミノ酸の自然な欠 失、付加並びに置換に起因する。このタイプの変化はそれぞれ単独で、或いは他 の変化と同時に、所定の配列内で1又は2回以上生じ得る。 本明細書において、HCRPをコードする「変異」核酸配列とは、異なるヌク レオチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に同一の、または機能的に 等価なHCRPをコードするポリヌクレオチドとなるものである。この定義には 、HCRPをコードするポリヌクレオチド配列の正常な染色体上の遺伝子座以外 の位置における、アレルとの不適切又は予期されないハイブリダイゼーション、 及びHCRPをコードするポリヌクレオチドの特定のオリゴヌクレオチドプロー ブを用いて容易に検出可能な、或いは検出が困難な多形性が含まれている。コー ドされたタンパク質も同様に「変異」したものであり、サイレント変化を生ずる アミノ酸残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に機能的に等価なHCRP となるものであり得る。意図的な(deliberate)アミノ酸置換は、HCRPの生 物学的活性が保持される限りにおいて、残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親 水性並びにまた両親媒性についての類似性に基づいてなされ得る。例えば負に荷 電したアミノ酸にはアスパラギン酸及びグルタミン酸が含まれ、正に荷電したア ミノ酸にはリジン及びアルギニンが含まれ、近い親水性値を持つ荷電していない 極性頭基を有するアミノ酸には、ロイシン、イソロイシン、バリン、グリシン、 アラニン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、フェニルアラニン 並びにチロシンが含まれる。 本明細書において「アミノ酸配列」は、オリゴペプチド、ペプチド、 ポリペプチド、又はタンパク質の配列及びその断片であり、自然発生又は合成の 分子である。HCRPの断片は、好ましくは約5〜約15のアミノ酸からなる長 さを有し、HCRPの生物学的活性又は免疫学的活性を保持しているものである 。ここでは「アミノ酸配列」が、自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を指す ものとして用いられているが、「アミノ酸配列」や類似の用語は、アミノ酸配列 を、説明されるタンパク質分子に関連する完全で元のままのアミノ酸配列に限定 する意味で用いられるわけではない。 本明細書において「増幅」は、核酸配列の更なる複製物を生成することであり 、通常は当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて行われる(D ieffenbach,C.W.及びG.S.Dveksler(1995)PCR Primer.a Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,NY)。 本明細書において、用語「アンタゴニスト」は、HCRPに結合したとき、H CRPの生物学的又は免疫学的作用の大きさを低下させたり、持続時間を短縮さ せる分子である。アンタゴニストには、HCRPの作用を低下させるタンパク質 、核酸、糖質や、任意の他の分子が含まれ得る。 本明細書において、用語「抗体」は、そのままの抗体分子及び、例えば抗原決 定基と結合し得るFa、F(ab')2、及びFvのようなその断片である。HCRPポリ ペプチドに結合する抗体は、そのままのポリペプチド、或いは免疫化する抗原と しての目的の小型のペプチドを含む断片を用いて調製することができる。動物を 免疫するのに用いられるポリペプチドまたはペプチドは、翻訳されたcDNAま たは化学的合成物を起源とするものであり得、必要ならば担体タンパク質と結合 することができる。ペプチドに化学的に結合する通常用いられる担体には、ウシ 血清アルブ ミン及びサイログロブリンが含まれる。次にこの結合したペプチドを用いて動物 (例えばマウス、ラット、またはウサギ)を免疫化する。 本明細書において、用語「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の一部 分(即ちエピトープ)である。タンパク質またはタンパク質の断片を用いてホス トの動物を免疫すると、このタンパク質の種々の領域が、該タンパク質上の所定 の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘発し得る。このよう な領域または構造を抗原決定基と称する。抗原決定基は、抗体への結合について 、元の抗原(即ち免疫応答を引き出すために用いられる免疫原)と競合し得る。 本明細書において用語「アンチセンス」は、特定のDNAまたはRNA配列に 対して相補的なヌクレオチド配列である。「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖 に対して相補的な核酸鎖の意味で用いられる。アンチセンス分子はペプチド核酸 を含み、合成や転写を含む任意の方法で作ることができる。この相補的ヌクレオ チドは、一度細胞内に導入されると、細胞によって作られた天然の配列と結合し て二重鎖を形成し、この二重鎖は更なる転写や翻訳を阻害する。表記「ネガティ ブ(−)」はアンチセンス鎖の意味で時折用いられ、「ポジティブ(+)」はセ ンス鎖の意味で用いられることがある。 本明細書において、用語「生物学的に活性」は、自然発生の分子の構造的機能 、調節機能、又は生化学的機能を有するタンパク質である。同様に「免疫学的に 活性」は、天然の、組換え体の、又は合成のHCRP、若しくはその任意のオリ ゴペプチドが適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗体に 結合する能力を指す。 本明細書において、用語「相補的」または「相補性」は、許容的な塩及び温度 の条件の下での塩基対によるポリヌタレオチド同士の自然の結合である。例えば 、配列「A−G−T」は相補的配列「T−C−A」に 結合する。2つの二本鎖分子間の相補性は、幾つかの核酸のみが結合している「 部分的」なものであるか、若しくは一本鎖分子間に完全な相補性が存在する場合 は完全に相補的なものであり得る。核酸鎖同士の相補性の程度は、核酸鎖同士の ハイブリダイゼーションの効率及び強度に有意な影響を与える。このことは、核 酸鎖同士の結合によって左右される増幅反応や、PNA分子の設計及び使用にお いて特に重要である。 本明細書において「所定のポリヌクレオチド配列を含む組成物」とは、広く所 定のポリヌクレオチド配列を含む任意の物質をさす。この組成物は、乾燥した製 剤又は水溶液を含み得る。HCRP(配列番号:1又は配列番号:3)をコード するポリヌクレオチド配列又はその断片(例えば配列番号:2又は配列番号:4 又はその断片)を含む組成物は、ハイブリダイゼーションプローブとして利用す ることができる。このプローブは凍結乾燥した形態で保存することができ、糖質 のような安定化剤と結合させることができる。ハイブリダイゼーションにおいて 、このプローブは、塩(例えばNaCl)、界面活性剤(例えばSDS)及び他 の物質(例えばデンハート液、乾燥ミルク、サケの精子DNA等)に展開するこ とができる。 本明細書において「コンセンサス」は、再度シークエンシングされて不要な塩 基が分離された核酸配列か、XL-PCRTM(Perkin Elmer,Norwalk,CT)を用いて5 ’方向及び/または3’方向に延長されて、再度シークエンシングされた核酸配 列か、GELVIEWTM Fragment Assembly system(GCG,Madison WI)を用いて2以上 のインサイト社クローンの重複した配列を元に組み立てられた核酸配列か、若し くは延長と組み立ての双方によって形成された核酸配列の何れかである。 本明細書において、「ポリヌクレオチドの発現と相関性を有する」なる表現は 、ノーザン解析ハイブリダイゼーションアッセイにより、配列 番号:2又は配列番号:4に類似なリボ核酸の存在が検出されることが、サンプ ル内のHCRPをコードするmRNAの存在を表しており、従って該タンパク質 をコードする遺伝子からの転写物の発現と相関性を有しているということを表し ている。 本明細書において「欠失」は、1または2以上のヌクレオチド若しくはアミノ 酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化である。 本明細書において、用語「誘導体」は、HCRP或いはその相補配列をコード する核酸、又はコードされたHCRPを化学的に修飾したものを意味する。この ような修飾の例には、水素からアルキル基、アシル基、又はアミノ基への置換が ある。核酸誘導体は、未修飾のHCRPの生物学的又は免疫学的機能を保持して いるポリペプチドをコードする。誘導体ポリペプチドは、元のポリペプチドの生 物学的又は免疫学的機能を保持している、グリコシル化、ポリエチレングリコー ル化、又は他の任意のプロセスで修飾されたものである。 本明細書において、用語「相同性」は、相補性の程度を意味する。部分的な相 同性と、完全な相同性(即ち同一性)の場合があり得る。部分的に相補的な配列 は、同一の配列が標的の核酸とハイブリダイズするのを少なくとも部分的に阻害 するものであり、これを機能的な用語「実質的に相同な」を用いて表す。完全に 相補的な配列と標的配列とのハイブリダイゼーションの阻害は、低い厳密性の条 件の下で、ハイブリダイゼーションアッセイ(サザンブロット法またはノーザン ブロット法、溶液ハイブリダイゼーション等)を用いて検定することができる。 実質的に相同な配列またはプローブは、低い厳密性の条件の下で標的の配列と、 完全に相同な配列またはプローブとの結合(即ちハイブリッド形成)について競 合し、それを阻害する。これは、低い厳密性の条件が、非特異 的な結合を許容するようなものであるということを意味するのではない。低い厳 密性の条件では、2つの配列の相互の結合が特異的(即ち選択的)相互作用である ことが必要である。非特異的結合が存在しないことは、部分的な程度の相補性( 即ち約30%未満の同一性)を有していない第2の標的配列を用いることにより 試験できる。非特異的結合が存在しない場合、プローブは第2の非相補的標的配 列とハイブリダイズしない。 ヒト人工染色体(HAC)は10K〜10MのサイズのDNA配列を含み得、 安定した分裂染色体分離及び維持に必要な全ての要素を含む直鎖状の小染色体で ある(Harrington,J.J.等(1997)Nat Genet.15:345-355)。 本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力をそのまま保持しつ つ、非抗体結合領域においてアミノ酸を置換してヒトの抗体により近づけた抗体 分子である。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション(ハイブリッド形成)」は 、核酸の鎖が塩基対合を介して相補鎖と結合する過程である。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なG塩 基とC塩基の間及び相補的なA塩基とT塩基の間での水素結合の形成によって、 2つの核酸配列で形成された複合体である。これらの水素結合は、塩基スタッキ ング相互作用(base stacking interaction)により更に安定化し得る。この2 つの相補的核酸配列は水素結合して、逆平行構造をなす。ハイブリダイゼーショ ン複合体は、溶液中で形成されるか(例えばC0t又はR0t解析)、或いは核酸 は溶液中に存在する一方の核酸と、固定支持体(例えばin situハイブリダイゼ ーションのために細胞が固定される紙、メンブラン、フィルタ、ピン、またはス ライドガラス)に固定化された他方の核酸との間で形成され得る。 本明細書において「挿入」或いは「付加」は、自然発生の分子と比較 して、1または2以上のヌクレオチド、アミノ酸残基がそれぞれ加わるような、 ヌクレオチド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。 「マイクロアレイ」とは、基板上に、合成された個々のポリヌクレオチド又は オリゴヌクレオチドを配列したものである。基板には例えば紙、ナイロン又は他 のタイプのメンブラン、濾紙、チップ、スライドガラス、又は他の任意の適切な 固形支持体が用いられる。 本明細書において、用語「変調」は、HCRPの活性の変化である。例えば、 変調によって、タンパク質活性の上昇や低下、結合特性の変化、又はHCRPの 生物学的、機能的、免疫学的特性の他の変化がもたらされる。 本明細書において「核酸配列」は、一本鎖か二本鎖の、センス鎖又はアンチセ ンス鎖である、ゲノム起源又は合成起源のDNA、RNAや、オリゴヌクレオチ ド、ヌクレオチド、又はポリヌクレオチド、及びその断片又は一部分である。「 断片(フラグメント)」は、長さが60ヌクレオチド以上の核酸配列であり、最 も好ましくは、長さが100ヌクレオチド以上又は1000ヌクレオチド以上、 及び10000ヌクレオチド以上の断片を含む。 本明細書において「オリゴヌクレオチド」は、PCR増幅又はハイブリダイセ ーションアッセイ、若しくはマイクロアレイで用いることができる核酸配列であ って、長さが約6ヌクレオチド以上、最大60ヌクレオチド程度、好適には15 〜30ヌクレオチド、より好適には20〜25ヌクレオチドであるものを指す。 本明細書において、オリゴヌクレオチドは、当分野において一般に定義されてい る用語「アンブリマー」、「プライマー」、「オリゴマー」、及び「プローブ」 と実質的に等価である。 本明細書において「ペプチド核酸」PNAは、末端がリジンであるア ミノ酸残基のペプチドバックボーンに結合した5ヌクレオチド以上の長さのオリ ゴヌクレオチドを含むアンチセンス分子又は抗遺伝子剤を意味する。末端のリジ ンがこの物質に安定性を与えている。PNAをポリエチレングリコール化して細 胞におけるPNAの寿命を延ばすことができる。このような細胞では、PNAが 相補的な一本鎖DNAやRNAに優先的に結合して、転写物の伸長を止める。( Nielsen,P.E.等(1993)Anticancer Drug Des.8:53-63)。 本明細書において、(「所定のタンパク質の一部分」と用いられるような)タ ンパク質に関連する用語「一部分」は、そのタンパク質の断片である。この断片 のサイズは5つのアミノ酸残基から、(全アミノ酸配列−1)個のアミノ酸の範 囲に亘る。従って、「配列番号:1又は配列番号:3のアミノ酸配列の少なくと も一部分を含む」タンパク質は、完全長ヒトHCRPとその断片を含む。 本明細書において、用語「サンプル」は、その最も広い意味で用いられる。H CRPをコードする核酸またはその断片またはHCRP自体を含む疑いのある生 物学的サンプルは、体液や、細胞から単離された染色体、細胞小器官、又は細胞 膜からの抽出物や、細胞や、(溶液中の、または例えばサザンブロット解析用に 固体支持体に結合した)ゲノムのDNA、RNA、またはcDNAや、組織や、 組織プリントその他を含み得る。 本明細書において、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」は、抗体 及びタンパク質またはペプチドの相互作用が、タンパク質上の特定の構造(即ち 抗原決定基、つまりエピトープ)の存在に左右されることを意味している。つま り、この抗体はタンパク質全体ではなく、特定のタンパク質構造を認識して結合 する。例えば、抗体がエピトープ「A」に対して特異的である場合、標識した「 A」及びその抗体を含む反応に おいて、エピトープA(つまり結合していない、無標識のA)を含むタンパク質 が存在すると、抗体に結合した標識Aの量が低下する。 本明細書において、用語「厳密な条件」又は「厳密性」は、核酸、塩、及び温 度によって定義されるようなハイブリダイゼーションの条件をさす。これらの条 件は当分野でよく知られており、同一のポリヌクレオチド配列の同定や検出のた めであるか、或いは近縁なポリヌクレオチド配列の同定や検出のためであるかに よって変えることができる。低い厳密性条件か高い厳密性条件の何れかを含む名 目上の等価な条件は、例えば配列の長さ及び性質(DNA、RNA、塩基構成) 、標的の性質(DNA、RNA、塩基構成)、環境(溶液中に存在するか或いは 固定化されているか等)、塩や他の成分の濃度(例えばホルムアミド、デキスト ラン硫酸、及び/またはポリエチレングリコールの有無)、及び反応の温度(プ ローブの融解温度(Tm)より5℃下からTmの約20〜25℃下までの範囲内 )のような要素によってきます。1又は2以上の因子を変更することによって、 上に列挙した条件とは異なるが等価である低い厳密性または高い厳密性の何れか の条件を作り出すことができる。 本明細書において、用語「実質的に精製」は、天然の環境から取り除かれ、天 然にはそれが結合して存在する他の構成要素から単離又は分離されて、その構成 要素が60%以上、好ましくは75%以上、最も好ましくは90%以上除去され た核酸配列又はアミノ酸配列である。 本明細書において「置換」は、それぞれ1または2以上のヌクレオチド或いは アミノ酸を、異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる 変化である。 本明細書の定義では、「形質転換」は、外来DNAが入り込みレシピエント細 胞を変化させるプロセスを意味する。このプロセスは、よく知られた種々の方法 を用いた天然または人工の条件の下で生じ得る。形質 転換は、外来核酸配列を原核細胞または真核細胞の宿主細胞に導入するための任 意の既知の方法に基づいている。この方法は形質転換される宿主細胞によって選 択され、以下のものに限定されないが、ウイルス感染、電気穿孔法、リポフェク ション、及び微粒子銃を用いる方法が含まれ得る。このように「形質転換された 」細胞は、その中で挿入されたDNAが自律的に複製するプラスミドとして、或 いは宿主の染色体の一部として複製が可能な安定的に形質転換された細胞を含む 。またこのような細胞は、限られた時間だけ導入されたDNAの一過性の発現を する細胞も含む。 本明細書においてHCRPの「変異体」は、1又は2箇所以上のアミノ酸が変 異したアミノ酸配列である。この変異体は「保存的」変化を含むものであり得、 この保存的変化の場合は、例えばロイシンをイソロイシンで置き換える場合のよ うに置換されるアミノ酸が類似な構造的及び化学的特性を有する。稀に、変異体 が「非保存的」に変化する場合もあり、この非保存的変化の場合は、例えばグリ シンがトリプトファンで置換される。類似した小変化には、アミノ酸の欠失か挿 入、若しくはその両方も含まれる。例えばDNASTARソフトウエアのような良く知 られたコンピュータプログラムを用いて、何れのアミノ酸が生物学的或いは免疫 学的活性を損なわずに置換、挿入、又は除去できるものであるかということ、及 びそのようなアミノ酸がいくつかということを決定することができる。 発明 本発明は、新規なヒトサイクリン関連タンパク質(以下HCRPと称する)の 発見、HCRPをコードするポリヌクレオチド、及び癌、免疫疾患、及び発達障 害の診断、予防、及び治療のためのこれらの物質の使 用に基づくものである。 或る実施例では、本発明は、第1図に示すような配列番号:1のアミノ酸配列 を含む精製されたヒトサイクリン関連タンパク質(HCRP−1)を包含する。 HCRP−1は179個のアミノ酸からなる長さを有し、残基G(19番)にミリ ストイル化可能部位を有する。カゼインキナーゼにリン酸化可能部位はT(72番 )に、プロテインキナーゼCリン酸化可能部位はT(95番)に存在する。ロイシ ンジッパーモチーフは、L(118番)から始まり、規則的な間隔でL(118番)、 L(125番)、L(132番)、及びL(139番)から反復するロイシン残基からな る。第3図に示すように、HCRP−1は、atlantic clamを起源とするサイク リン特異的ユビキチンキャリアタンパク質E2−C(GI 1493838;配列番号:5 )及び酵母菌を起源とするユビキチンキャリアタンパク質E2−18KD(GI 1 71866;配列番号:6)と化学的及び構造的相同性を有する。詳述すると、HC RP−1は、E2−C及びE2−18KDとそれぞれ61%及び53%の配列同 一性を共有している。Ub結合酵素の活性部位のシステイン残基は、HCRP− 1においてC(114番)に存在し、E2−C及びE2−18KDの双方で保存さ れている。この活性部位を取り囲むUBCドメインは、概ねY(103番)からL (118番)まで延びており、他のE2においても高度に保存されている。プロリ ンを豊富に含む領域は、HCRP−1では活性システイン残基のN末端側に存在 する。HCRP−1においてP(86番)、P(90番)、P(94番)、P(101番 )、及びP(105番)に位置するプロリン残基は、他のE2でも保存されている 。HCRP−1は、残基A(14番)からA(27番)にわたる、クラスIIIのE 2の特徴である独特なN末端延長部を有する。第5A図及び第5B図に示すよう に、HCRP−1とE2−Cはかなり類似した疎水性プロットを示す。ノーザン 解析の結果から 種々のライブラリーにおけるこの配列の発現が分かるが、この配列を発現するラ イブラリーの51%以上は不死化又は癌性のものであり、24%以上は、炎症及 び免疫応答に関連するものである。特に注目すべきは、膀胱癌及び膵臓癌におけ るHCRP−1の発現、脳及び肺の転移性腫瘍におけるHCRP−1の発現及び リウマチ性関節炎に関連する炎症組織におけるHCRP−1の発現である。 本発明のHCRP−1をコードする核酸は、胎仔結腸cDNAライブラリー(C OLNFET02)を起源とするインサイト社クローンNo.1308478において、アミノ酸配 列アライメントのコンピュータ検索によって初めに同定された。コンセンサス配 列の配列番号:2は、以下の重複及び又は延長された核酸配列、即ちインサイト 社クローンNo.993201(COLNNOT11を起源)、1308478(COLNFET02を起源)、及び2342 963(TESTTUT02を起源)から構成されたものである。 別の実施例では、本発明は、第2A図に示すような配列番号:3のアミノ酸配 列を含む精製されたサイクリン関連タンパク質(HCRP−2)を包含する。HC RP−2は398個のアミノ酸からなる長さを有し、M(165番)からS(313番 )にわたる180個のアミノ酸からなる典型的な「サイクリンボックス」サイン 配列を有する。推定上の「破壊ボックス」配列は、R(32番)から始まる(RTVL EEIGN)である。第4図に示すように、HCRP−2はマウスを起源とするサイ クリンB(GI 50613;配列番号:7)及びヒトを起源とするサイクリンB(GI 10576 3;配列番号:8)と化学的及び構造的相同性を有する。詳述すると、HCRP− 2は、それぞれマウス及びヒトのサイクリンBと89%及び54%の配列同一性 を共有している。HCRP−2における「サイクリンボックス」の領域は、マウ スサイクリンB及びヒトサイクリンBの双方で良く保存されている。ユビキチン 媒介分解のための「破壊ボックス」 も、マウス及びヒトのサイクリンで良く保存されている。第6A図及び第6B図 に示すように、HCRP−2とマウスのサイクリンBはかなり類似した疎水性プ ロットを示す。ノーザン解析の結果から種々のライブラリーにおけるこの配列の 発現が分かる。この配列を発現するライブラリーの70%以上は不死化細胞系又 は癌性のものであり、20%は胎仔組織関連である。 本発明のHCRP−2をコードする核酸は、ヒト・マスト細胞系cDNAライ ブラリー(HMC1NOT01)を起源とするインサイト社クローンNo.7755において、ア ミノ酸配列アラーイメントのコンピュータ検索によって初めに同定された。コン センサス配列の配列番号:4は、以下の重複及び又は延長された核酸配列、即ち インサイト社クローンNo.7755(HMC1NOT01を起源)、256850及び484361(HNT2RAT 01を起源)、及び441496(MPHGNOT03を起源)から構成されたものである。 また本発明は、HCRP変異体を包含する。好適なHCRP変異体は、HCR Pアミノ酸配列(配列番号:1又は配列番号:3)と80%以上、より好適には 90%以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。最も好適なHCRP変異 体は、配列番号:1又は配列番号:3と95%以上のアミノ酸配列同一性を有す るものである。 また本発明は、HCRPをコードするポリヌクレオチドを包含する。従って、 HCRPのアミノ酸配列をコードする核酸配列を用いて、HCRPを発現する組 換え分子を作り出すことができる。具体的な実施例では、本発明は、それぞれ第 1図又は第3図に示すような配列番号:2又は配列番号:4の核酸配列を含むポ リヌクレオチドを包含する。 当業者には理解されるように、遺伝暗号の縮重の結果、任意の既知の自然発生 遺伝子のヌクレオチド配列と最小限の相同性しか有していないものも含めて、多 種のHCRPコーディングヌクレオチド配列が作り出 され得る。従って本発明は、可能なコドン選択に基づく組み合わせを選択するこ とにより作り出され得る、全ての可能な核酸配列の変異をその範囲に含んでいる 。それらの組み合わせは、自然発生のHCRPのヌクレオチド配列に適用される ような標準的なトリプレット遺伝暗号に基づいて作り出されるものであり、この ような全ての変異は、ここに具体的に示されたものと考えられたい。 HCRP及びその変異体をコードするヌクレオチド配列は、適切に選択された 厳密性の条件の下で自然発生配列のヌクレオチド配列とハイブリッド形成可能な ものであるのが好ましいが、実質的に異なるコドンの使用頻度を有するHCRP 又はその変異体をコードするヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る 。コドン選択では、特定のコドンが宿主によって使用される頻度に従って、特定 の原核細胞又は真核細胞の発現宿主におけるペプチド発現の発生率を高めるよう に選択することができる。HCRP及びその誘導体をコードするヌクレオチド配 列を、コードされるアミノ酸配列を変えないように実質的に変更する理由は、例 えば自然発生配列から作り出される転写物より長い半減期のような、より望まし い特性を有するRNA転写物を作り出すためである。 本発明の範囲には、HCRP又はその誘導体をコードするDNA配列又はその 一部の、完全な合成ケミストリによる作製も含まれる。作製したこの合成遺伝子 を、この出願時点において周知の試薬を用いて任意の入手可能なDNAベクター 及び細胞系に挿入することができる。更に、合成ケミストリを用いてHCRPを コードする配列又はその任意の一部分に突然変異を誘発させることができる。 また本発明の範囲に含まれるものとして、種々の厳密性の条件の下で請求項に 記載のヌクレオチド配列、特に配列番号:2又は配列番号:4のヌクレオチド配 列とハイブリダイズし得るポリヌクレオチド配列があ る。ハイブリダイゼーション条件は、Wahl,G.M.及びS.L.Berger(1987;Methods Enzymol.152:399-407)及びKimmel,A.R.(1987;Methods in Enzymol.152:507-511) に記載されている。 当業者が一般に利用可能な周知のDNA配列決定のための方法を、本発明の実 施において用いることができる。この方法では酵素、例えばD Cleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)、熱安定性T7ポリメラーゼ (Amersham,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Gaithersburg MD)社から市販さ れているELONGASE増幅システムのような校正エキソヌクレアーゼと組換え体ポリ メラーゼとの組み合わせを使用する。この処理は、Hamilton Micro Lab2200(Ham ilton,Reno,NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reserch,Watertown MA)並 びにABI377 DNAシーケンサ(Perkin Elmer)のような装置を用いて自動化するの が好ましい。 HCRPをコードする核酸配列は、部分的なヌクレオチド配列と、プロモータ ー及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当業者には周知の様々 な方法とを用いて伸長させることができる。例えば、用いることができる或る方 法、即ち「制限部位」PCR法では、汎用プライマーを用いて既知の座位に隣接 する未知の配列を得る(Sarkar,G.(1993)PCR Methods Applic 2:318-322)。詳 述すると、まずゲノムDNAを、既知の領域に対して特異的なプライマー及びリ ンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅する。増幅された配列を、その同 じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に含まれる別の特異的プライ マーを用いてPCRの2巡目にかける。PCRの各回の生成物を、適切なRNA ポリメラーゼを用いて転写させ、逆転写酵素を用いて配列決定する。 逆PCR法を用いて、既知領域に基づく多様なプライマーを利用した配列の増 幅、または伸長を行うことができる(Triglia,T.等(1988)Nucleic Acids Res 16:8186)。プライマーは、OLIGO 4.06(National Biosciences社,Plymouth MN )や別の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌクレオチドで、50% 以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配列にアニールするよ うに設計される。この方法ではいくつかの制限酵素を用いて遺伝子の既知領域の 適当な断片を作り出す。次にこの断片を分子内ライゲーションにより環状にし、 PCR用の鋳型として使用する。 使用できる別の方法にはキャプチャPCR法があり、この方法ではヒト及び酵 母菌人工染色体DNA内の既知の配列に隣接するDNA断片をPCR増幅する( Lagerstrom,M.等(1991)PCR Methods Applic 1:111-119)。この方法では、P CR処理の前に、DNA分子の未知の部分に、複数の制限酵素による消化及びラ イゲーションによって組換え二本鎖配列を配置しておいてもよい。 未知の配列を得るために用いることができる別の方法は、Parker,J.D.等の方 法(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-3060)である。更に、PCR、ネスト化 プライマー、PromoterFinderTMライブラリーを用いて、ゲノムDNA内歩行を行 うことができる(Clontech,Palo Alto CA)。このプロセスは、ライブラリーを スクリーニングする必要がなく、イントロン/エクソン接合部を探し出すのに有 用である。完全長cDNAをスクリーニングするときに好適なライブラリーは、 サイズ選択された、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダ ムプライミングした(rondom primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流領 域を含む配列をより多く含むという点で好適である。ランダムプライミングした ライブラリーは、オリゴd(T)ライブラリーで完全長cDNA が得られない場合に特に有用である。またゲノムライブラリーは、5’及び3’非 翻訳領域への配列の伸長のために役立つことがある。 配列決定やPCRの産物のヌクレオチド配列をサイズ分析したり確認するため には、市販のキャピラリー電気泳動システムを用いることができる。特に、キャ ピラリーシークエンシングでは、電気泳動による分離のための流動性ポリマー、 レーザーで活性化される4つの異なる蛍光色素(各ヌクレオチドに対して1つ) を使用し、CCDカメラにより放射線の波長の検出を行う。出力/光強度は適切 なソフトウエア(例えばPerkin elmer製のGenotyperTM及びSequence NavigatorT M )を用いで電気信号に変換され、サンプルの負荷からコンピュータ解析及び電 子データ表示までの全過程がコンピュータ制御される。キャピラリー電気泳動法 は、特定のサンプル内に限られた量だけ存在するDNA小片の配列決定に特に適 している。 本発明の別の実施例では、HCRP、融合タンパク質或いはその機能的等価物 をコードするポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのHCRPの発現を 誘導する組換えDNA分子において用いることができる。遺伝暗号固有の縮重の ために、同一か機能的に等価なアミノ酸配列を実質的にコードする他のDNA配 列も、HCRPのクローニングや発現のために用いることができる。 当業者には理解できるように、非自然発生コドンを有するHCRPコードディ ングヌクレオチド配列を作り出すことが有益なことがある。特定の原核細胞或い は真核細胞の宿主において選好されるコドンを選択して、例えば、HCRP発現 率を増大させたり、或いは自然発生配列から生成された転写物より長い半減期の ような望ましい特性を有する組換えRNA転写物を生成することができる。 本発明のヌクレオチド配列は、様々な理由でHCRPをコードする配 列を変更するために周知の方法を用いて組換えることができる。このような配列 変更には、限定するものではないが、例えば遺伝子産物のクローニング、プロセ シング及び/又は発現を変えるような変更が含まれる。無作為断片によるDNA 再編成や遺伝子断片のPCR再会合及び合成オリゴヌクレオチドを用いて、ヌク レオチド配列を組換えることができる。例えば、特定部位突然変異誘発のような 当業者には周知の技術を用いて突然変異を誘発させることによって、新しい制限 部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、コドン選好の変化、スプライスバリ アントの生成等をもたらし得る。 本発明の別の実施例では、未改変HCRPコーディング配列、変異HCRPコ ーディング配列、又は組換えHCRPコーディング配列を異種の配列に結合して 、融合タンパク質をコードする配列にする。例えば、HCRP活性のインヒビタ ーをペプチドライブラリーからスクリーニングする場合、市販の抗体により認識 される異なるペプチドを発現するキメラHCRPタンパク質をコードすることが 役立つ。融合タンパク質はHCRP配列と異種のタンパク質配列との間の位置に 切断部位を有するように設計することもでき、これによってHCRPを切断して 、ヘテロの部分から分けて精製することが可能となる。 本発明の別の実施例では、当業者によく知られた化学的方法 (Caruthers.M.H.等(1980)Nuc Acids Res Symp Ser 7:215-223;Horn,T.等(1980 )Nucl.Acids Res Symp.Ser.225-232参照)を用いて、HCRPコーディング配列 の全体、或いはその一部を合成することができる。別法では、化学的方法を用い てタンパク質自体を作り出して、HCRPアミノ酸配列の全体或いはその一部を 合成することができる。例えば、種々の固相技術(Roberge,J.Y.等(1995)Scienc e 269:202-204)でペプチド合成を行うことができ、合成の自動化は、例えばABI 431Aペ プチドシンセサイザ(Perkin Elmer)を用いることにより達成することができる 。 この新たに合成されたペプチドは、分離用高速液体クロマトグラフィにより実 質的に精製することができる(例えばCreighton T.(1983)Proteins Structure And Molecular Principles ,WH Freeman and Co.,NY参照)。合成されたペプチド の構成は、アミノ酸解析或いはシークエンシングにより確認することができる( 例えばエドマン分解法;Creighton,上述)。さらにHCRPのアミノ酸配列或 いはその任意の部分を、その直接の合成の際の改変することにより、及び/又は 化学的方法を用いて他のタンパク質或いはその任意の部分に由来する配列との結 合することによって変異体ポリペプチドを作ることができる。 生物学的に活性なHCRPを発現させるために、HCRPコーディングヌクレ オチド配列或いはその機能的等価物を、適切な発現ベクター、すなわち挿入され たコーディング配列の転写及び翻訳に必要なエレメントを含むベクターに挿入す る。 HCRPコーディング配列及び適切な転写や翻訳の調節領域を含む発現ベクタ ーを作製するために当業者に周知の方法が用いられる。これらの方法には、in v itro組換えDNA技術、合成技術、並びにin vivo組換え技術、又は遺伝子組換 え技術が含まれる。このような技術は、Sambrook,J.等(1989)Molecular Cloning ,A Laboratory Manual ,Cold Spring Harbor Press,Planview NY及びAusubel,F.M .等Current Protocol in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York NYに 記載されている。 種々の発現ベクター/宿主系を、HCRPコーディング配列を保持させ、かつ 発現させるために利用することができる。このようなものには、以下のものに限 定はしないが、組換えバクテリオファージ、プラスミド 或いはコスミドDNA発現ベクターで形質転換した細菌のような微生物や、酵母 菌発現ベクターで形質転換した酵母菌や、ウイルス発現ベクター(例えばバキュ ロウイルス)を感染させた昆虫細胞系や、ウイルス発現ベクター(例えばカリフ ラワーモザイクウイルスCaMV、タバコモザイクウイルスTMV)をトランスフェク トした、或いは細菌の発現ベクター(例えばTi、或いはpBR322プラスミド)で形 質転換した植物細胞系や、或いは動物細胞系が含まれる。 これらの系の「調節領域」或いは「制御配列」は、転写及び翻訳を実行するた めに宿主細胞のタンパク質と相互作用するベクターの非翻訳領域、即ちエンハン サー、プロモーター及び3’非翻訳領域である。このようなエレメントの、強さ 及び特異性は様々であり得る。利用されるベクター及び宿主に応じて、構成的及 び誘導的プロモーターを含む任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントを用いる ことができる。例えば、細 (Stratagene,LaJolla CA)のハイブリッド lacZ プロモーター及びptrp-lacハ イブリッド等のような誘導的プロモーターを用いることができる。バキュロウイ ルスポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞において用いることができる。植物細 胞のゲノムに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例えば熱ショック遺伝子 ,RUBISCO及び貯蔵タンパク質遺伝子)、若しくは植物ウイルスに由来するプロモ ーター或いはエンハンサ(例えばウイルス性プロモータ或いはリーダー配列)を 、ベクターにクローン化してもよい。哺乳動物細胞では、哺乳類遺伝子或いは哺 乳類ウイルス由来のプロモーターが最適である。HCRPをコードする配列の多 数の複製を含む株細胞を作る必要がある場合には、SV40或いはEBVに基づくベク ターを適切な選択マーカーと共に用いる。 細菌系では、HCRPの用途に応じて多数の発現ベクターを選択する ことができる。例えば抗体誘発のために大量のHCRPが必要とされる場合は、 容易に精製される融合タンパク質を高レベルで発現できるベクターが望ましい。 そのようなベクターには、以下のものに限定はしない (Stratagene)(このベクターでは、HCRPをコードする配列を、アミノ末端 メチオニン及び後続のβ−ガラタトシダーゼの7残基の配列を備えたフレーム内 においてベクターに結合してハイブリッドタンパク質を生成できる)や、pINベ クター(Van Heeke,G.及びS.M.Schuster(1989)J.Biol.Chem.264:5503-5509) 等が含まれる。またpGEXベクター(Promage、Madison WI)も、グルタチオン S −トランスファーゼ(GST)を有する融合タンパク質として異種ポリペプチドを 発現するため用いることができる。一般に、そのような融合タンパク質は可溶性 であり、グルタチオンアガロースビーズへ吸着させた後、遊離グルタチオンの存 在下で溶出させることにより溶解した細胞から容易に精製できる。その系におい て生成されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン或いはXA因子プロテアーゼ 切断部位を含めて、目的のクローン化ポリペプチドをGST部分から随意に放出さ せることができるように設計される。 酵母菌、サッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)では、α因 子、アルコールオキシダーゼ及びPGHのような構成的或いは誘導的プロモーター を含む多数のベクターを用いることができる。その概要を知るには、Ausubel等 (前出)及びGrant等(1987)Methods Enzymol 153:516-544を参照されたい。 植物発現ベクターを用いる場合には、HCRPをコードする配列の発現は、多 数のプロモーターの何れかで促進される。例えばCaMVの35S及び19Sプロモーター のようなウイルスのプロモーターを、単独で、或 いはTMV(Takamatsu,N.等(1987)EMBO J 6:307-311)由来のオメガリーダー配 列と共に用いることができる。別法として、RUBISCOの小サブユニット、或いは 熱ショックプロモーターのような植物プロモーターが用いてもよい(Coruzzi,G. 等(1984)EMBO J 3:1671-1680);Broglie,R.等(1984)Science 224:838-843; 及びWinter,J.等(1991)Results Probl.Cell Differ.17:85-105)。これらの構 成は、直接のDNA形質転換或いは病原体によるトランスフェクションにより植 物細胞内に導入できる。このような技術の種々の一般に入手可能な文献に記載さ れている(Hobbs,S.又はMurry,L.E.McGraw Hill Yearbok of Science and Techno logy (1992)McGraw Hill NY,pp191-196を参照されたい)。 HCRPの発現のために用いることができる別の発現系に、昆虫系がある。例 えば、そのような系の一つでは、Spodoptera frugiperda細胞或いはTrichoplusi a の幼虫において外来遺伝子を発現するためのベクターとして、Autographa cali fornica 核多角体病ウイルス(AcNPV)が用いられる。HCRPをコードする配列 は、ポリヘドリン遺伝子のようなウイルスの非必須領域にクローニングされ、ポ リヘドリンプロモーターの制御下に置かれ得る。HCRPコーディング配列の挿 入が成功すると、ポリヘドリン遺伝子が不活性になり、コートタンパク質膜が欠 如した変異体ウイルスが生成される。次に、この変異体ウイルスを用いて、S.fr ugiperda 細胞或いはTrivhoplusiaの幼虫へ感染させ、その中でHCRPが発現さ れる(Engelhard,E.K.等(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.91:3224-3227)。 哺乳動物の宿主細胞では、多数のウイルス性発現系を利用することができる。 発現ベクターとしてアデノウイルスが用いられる場合には、HCRPをコードす る配列は、後期プロモータ及び三連リーダー配列からなるアデノウイルス転写物 /翻訳物複合体内に結合され得る。ウイルス のゲノムの非必須E1又はE3領域へ挿入することにより、感染した宿主細胞でHC RPを発現できる生ウイルスになる(Logan,J.及びShenk,T.(1984)Proc.Natl.A cad.Sci.81:3655-3659)。さらに、哺乳動物宿主細胞内の発現を増加させるため にラウス肉腫ウイルス(RSV)エンハンサのような転写エンハンサを用いること ができる。 また、ヒト人工染色体(HAC)を用いることにより、プラスミドに含められ て発現され得るものより大きいDNAの断片を供給することもできる。治療の目 的で、従来のデリバリー方法(リポソーム、ポリカチオンのアミノポリマー、又 は小胞)を用いて6〜10MのHACを構築し、供給することができる。 また、HCRP配列の効率的な翻訳のためには、特定の開始シグナルも必要で ある。これらのシグナルには、ATG開始コドン及び隣接する配列が含まれる。H CRP及びその開始コドン及び上流配列が適切な発現ベクター内に挿入される場 合には、翻訳制御シグナルを加える必要はない。しかしながらコーディング配列 又はその一部のみが挿入される場合には、ATG開始コドンを含む外来の翻訳制御 シグナルを与えなければならない。さらに、全インサートの転写が確実に行われ るようにするために、開始コドンは正しい読み枠に存在しなければならない。外 来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の様々な起源に由来する ものであり得る。例えば文献(Scharf,D.等(1994)ResultsProbl.Cell Differ. 20:125-162)に記載されているもののような、その細胞系に適切なエンハンサー を含めることにより、発現の効率を高めることができる。 さらに宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節したり、発現したタンパク 質を望ましい形にプロセシングする能力で選択される。このようなポリペプチド の修飾には、以下のものに限定はしないが、アセチル化、カルボキシル化、グリ コシル化、リン酸化、脂質化(lipidation)並 びにアシル化が含まれる。またタンパク質の「プレプロ」部分を切り離す翻訳後 プロセシングも、正しい挿入、折り畳み、及び/又は機能の発揮のために重要で ある。そのような翻訳後の作用のための特定の細胞装置及び特徴的な機構を有し ている異なる宿主細胞(例えばCHO、HeLa、MDCK、293、WI38)はAmerican Type C ulture Collection(ATCC;Bethesda,MD)より市販されており、導入される外来 タンパク質の正しい修飾やプロセシングが確実に行われるようにするために、こ れを選択することができる。 長期間にわたって組換えタンパク質の高収率の産生を確保するためには安定し た発現が望ましい。例えば、ウイルスの複製起源及び/または内在性発現エレメ ント及び選択マーカー遺伝子を、同一のベクター上、或いは別のベクター上に含 む発現ベクターを用いて、HCRPを安定的に発現する株細胞を形質転換するこ とができる。ベクターの導入の後、細胞を、選択培地に切り替える前に濃縮培地 内で1〜2日間増殖させる。選択マーカーの目的は、選択のための耐性を与え、 その存在によって導入された配列をうまく発現する細胞を増殖、回収できるよう にすることである。安定的に形質転換された細胞の耐性クローンは、その細胞の 型に適した組織培養技術を用いて増殖することができる。 形質転換された細胞系を回収するために任意の数の選択系を用いることができ る。選択系には、以下のものに限定はしないが、単純ヘルペスウイルスチミジン キナーゼ(tk)(Wigler,M.等(1977)Cell 11:223-32)及びアデニンホスホリボ シルトランスフェラーゼ(aprt)(Lowy,I.等(1980)Cell 22:817-23)遺伝子が 含まれ、それぞれtk-及びaprt-細胞において用いられる。また代謝拮抗物質、抗 生物質或いは除草剤への耐性を選択の基礎として用いることができる。例えばdh frはメトトレキセートに対する耐性を与え(Wigler,M.等(1980)Natl Acad Sci 77:3567)、nptはアミノ配糖体のネオマイシン及びG-418に対する耐性を与え(C olberre-Garapin,F.等(1981)J Mol Biol 150:1)、als或いはpatはクロルスル フロン(chlorsulfuron)、ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ(p hosphinotricin acetyltransferase)に対する耐性を与える(Murry,前出)。 さらに選択に利用できる遺伝子として、例えば細胞がトリプトファンの代わりに インドールを利用できるようにするtrpB、細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノ ール(histinol)を利用できるようにするhisDが文献に記載されている(Hartman ,S.C.及びR.C.Mulligan(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85:8047-51)。最近になっ て、形質転換体を特定するためばかりではなく、特定ベクター系による一過性の 或いは安定的なタンパク質発現の量を定量するために広く用いられる、例えばア ントシアニン、β−グルクロニダーゼ及びその基質、GUS、及びルシフェラーゼ 及びその基質、ルシフェリンのような可視マーカーがよく利用されるようになっ た(Rhodes,C.A.等(1995)Methods Mol.Biol.55:121-131)。 マーカー遺伝子発現の存在/不存在によって目的の遺伝子の存在も示されるが 、その存在及び発現は確認すべきである。例えばHCRPをコードする配列がマ ーカー遺伝子配列内に挿入された場合は、HCRPをコードする配列を含む組換 え体細胞をマーカー遺伝子の機能の存在により確認できる。別法では、マーカー 遺伝子をHCRPをコードする配列と直列に配置して、両者が単一プロモータの 制御下となるようにすることができる。誘導に応じてのマーカー遺伝子の発現、 つまり選択は、通常直列に配置された配列の発現をも同時に示すことになる。 或いは、当業者には周知の様々な方法により、HCRPのコーディング配列を 含みHCRPを発現する宿主細胞を識別できる。このような方法には、以下のも のに限定はしないが、DNA-DNA或いはDNA-RNAハ イブリダイゼーション及び、核酸及びタンパク質を検出及び/又は定量するため の膜ベース、溶液ベース或いはチップベースの技術を含むタンパク質バイオアッ セイ或いはイムノアッセイが含まれる。 HCRPをコードする配列のプローブ、一部、或いは断片を用いるDNA-DNA又 はDNA-RNAハイブリダイゼーション若しくは増幅により、HCRPポリヌクレオ チド配列の存在を検出することができる。核酸増幅に基づくアッセイでは、HC RPをコードするDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出するために、核酸配列に 基づくオリゴヌクレオチド或いはオリゴマーを用いる。 このタンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいず れかを用いる、HCRPポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々のプ ロトコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例には、酵素結合免 疫検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表示式細胞分取器法 (FACS)を含まれる。HCRPポリペプチド上で2つの非干渉なエピトープに対 して反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナルベースイムノ アッセイ(two-site,monoclonal-based immunoassay)が好適であるが、競合的 結合アッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは、他の文献 、Hampton,R.等(1990;Serlogical Methods,a Laboratory Manual,APS Press,St. Paul MN)及びMaddox,D.E.等(1983,J.Exp.Med.158:1211-1216)に記載されてい る。 他にも様々な標識及び結合技術が当業者には周知であり、種々の核酸及びアミ ノ酸のアッセイにおいて用いることができる。近縁な配列を検出するための、標 識されたハイブリダイゼーションプローブやPCRプローブを作成するための手 段には、オリゴ標識、ニックトランスレーション法、末端標識、或いは標識ヌク レオチドを用いるPCR増幅などが 含まれる。別法では、HCRPコーディング配列、或いはその任意の部分を、m RNAプローブの作成のためのベクターにクローン化する。そのようなベクター は当分野では周知で、市販されており、例えばT7、T3、或いはSP6のような適切 なRNAポリメラーゼ及び標識されたヌクレオチドを加えることにより、in vit roでRNAプローブを合成するために用いることができる。これらの方法は、種 々の市販のキット(Pharmacia Upjohn(Kalamazoo,MI);Promega(Madison WI );及びU.S.Biochemical Corp.(Cleveland OH))を用いて実行することができ る。適切なリポーター分子、すなわち標識には、放射性核種、酵素、フルオレセ ント(蛍光剤)、化学発光剤或いは色素剤や、基質、補助因子、インヒビター、 磁気粒子等が含まれる。 HCRPをコードするヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞を、コード されたタンパク質を細胞培地で発現させ、そこから回収するのに適した条件下で 培養することができる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用いられ る配列及び/またはベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり細胞内に含まれる ようにすることができる。当業者には理解されるように、HCRPをコードする ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを、原核細胞か真核細胞の細胞膜を通して のHCRP分泌を誘導するシグナル配列を含むように設計することができる。ま た他の作製物を用いて、HCRPをコードする配列を、可溶性タンパク質の精製 を容易にするポリペプチドドメインをコードするヌクレオチド配列に結合するこ とができる。そのような精製を容易にするドメインには、以下のものに限定はし ないが、固定化金属上での精製を可能にするヒスチジントリプトファンモジュー ルのような金属キレートペプチド、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にす るプロテインAドメイン、並びにFLAGS伸長/アフィニティ精製システムにおい て用いられるドメイン (Immunex Corp.,Seattle WA)が含まれる。精製ドメインとHCRPの間にXA 因子或いはエンテロキナーゼ(Invitrogen,San Diego CA)に対して特異的な配 列のような切断可能なリンカー配列を含めるのは精製を促進するのに役立つ。H CRPをコードする配列とともに、6個のヒスチジン残基、それに続くチオレド キシン及びエンテロキナーゼ切断部位をコードする核酸配列を含むこのような発 現ベクターの1つは、融合タンパク質を発現する。ヒスチジン残基がIMIAC(Pora th,J等(1992;Protein Exp.Purif.3:263-281)に記載のような固定化金属イオンア フィニティクロマトグラフィー)精製を促進するとともに、エンテロキナーゼ切 断部位が融合タンパク質からのHCRPの精製のための手段となる。融合タンパ ク質を含むベクターについての解説は、Kroll,D.J.等(1993;DNA Cell Biol.12: 441-453)に記載されている。 組換え体の産生に加えて、HCRPの断片を、固層技術を用いた直接のペプチ ド合成で形成することもできる(Merrifield J.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:2149-2 154参照)。in vitroタンパク質合成は手作業で行えるが、自動化することもで きる。自動的な合成は、例えば、Applied Biosystem 431Aペプチドシンセサイザ (Perkin Elmer)を用いて行うことができる。HCRPの種々の断片を個別に化 学的に合成し、化学的方法を用いて結合して完全長分子を作り出してもよい。 治療 HCRP−1とatlantic clamを起源とするサイクリン特異的ユビキチンキャ リアタンパク質E2−C(GI 1493838)及び酵母菌を起源とするユビキチンキャ リアタンパク質E2−18KD(GI 171866)の間に化学的及び構造的相同性が 存在する。更に、HCRPは炎症及び免疫応答に関連する組織及び癌性組織にお いて発現される。従って、HCRP −1は、癌及び免疫疾患において一定の役割を果たしていると考えられる。詳述 すると、HCRP−1の濃度又は活性の低下は、癌又は免疫疾患の発生と関連を 有すると考えられる。 従って、或る実施例では、癌の予防又は治療のために、HCRP−1又はその 断片若しくは誘導体を患者に投与し得る。癌には、以下に限定されないが、腺癌 、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、及び奇形癌が含まれ、具体的には 、副腎、膀胱、骨、骨髄、脳、乳房、子宮頚、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、腎 臓、肝臓、肺、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺、唾液腺、皮膚、脾 臓、精巣、胸腺、甲状腺、及び子宮の癌が含まれ得る。 別の実施例では、上述の癌を含む癌の予防又は治療のために、HCRP−1又 はその断片若しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に投与することもできる 。 更に別の実施例では、上述のような癌の予防又は治療のために、HCRP−1 の活性を変調するアゴニストを患者に投与することもできる。 別の実施例では、免疫疾患の予防又は治療のために、HCRP−1又はその断 片若しくは誘導体を患者に投与し得る。このような疾患には、以下に限定されな いが、AIDS、アジソン病、成人呼吸窮迫症候群、アレルギー、貧血症、喘息 、アテローム性動脈硬化症、気管支炎、胆嚢炎、クローン病、潰瘍性大腸炎、ア トピー性皮膚炎、皮膚筋炎、糖尿病、肺気腫、萎縮性胃炎、腎炎、痛風、グレー ブス病、過好酸球増加症、過敏性腸症候群、エリテマトーデス、多発性硬化症、 重症筋無力症、心筋又は心膜の炎症、変形性関節炎、骨粗鬆症、膵炎、多発性筋 炎、リウマチ性関節炎、強皮症、シェーグレン症候群、及び自己免疫性甲状腺炎 ;癌と血液透析と体外循環の合併症;ウイルス、細菌、真菌、寄生虫、原虫、及 び蠕虫の感染症、及び外傷が含まれ得る。 別の実施例では、上述したものを含む免疫疾患の予防又は治療のために、HC RP−1又はその断片若しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に投与するこ ともできる。 更に別の実施例では、上述したもののような免疫疾患の予防又は治療のために 、HCRP−1の活性を変調するアゴニストを患者に投与することもできる。 HCRP−2とマウスを起源とするサイクリンB(GI 506137)及びヒトを起 源とするサイクリンB(GI 105763)の間に化学的及び構造的相同性が存在する 。更に、HCRP−2は、癌性組織や胎仔の組織で発現される。従って、HCR P−2は、癌や発達障害において一定の役割を果たすと考えられる。詳述すると 、HCRP−2の濃度又は活性の上昇は癌と関連を有し、HCRP−2の濃度又 は活性の低下は発達障害と関連を有すると考えられる。 従って、別の実施例では、発達障害の予防又は治療のために、HCRP−2又 はその断片若しくは誘導体を患者に投与し得る。用語「発達障害」は、患者の器 官又は器官系、即ち副腎、骨格系、生殖系等の発達に関連するあらゆる障害であ る。このような障害には、以下に限定されないが、尿細管性アシドーシス、貧血 症、クッシング症候群、軟骨形成不全性小人症、てんかん、性腺形成異常症、シ ャルコー−マリー−ツース病や神経線維腫症のような遺伝性神経病、甲状腺機能 低下症、水頭症、シドナム舞踏病や脳性麻痺のような発作障害、2分脊椎、及び 先天性緑内障、白内障、又は感覚神経性聴力損失が含まれる。 別の実施例では、上述のものを含む発達障害の予防又は治療のために、HCR P−2又はその断片若しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に投与すること もできる。 更に別の実施例では、上述したものを含む発達障害の予防又は治療の ために、HCRP−2の活性を変調するアゴニストを患者に投与することもでき る。 別の実施例では、癌の予防又は治療のために、HCRP−2の活性を低下させ るアンタゴニストを患者に投与することができる。癌には、以下に限定されない が、腺癌、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、及び奇形癌、具体的には 、副腎、膀胱、骨、骨髄、脳、乳房、子宮頚、胆嚢、神経節、胃腸管、心臓、腎 臓、肝臓、肺、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺、唾液腺、皮膚、脾 臓、精巣、胸腺、甲状腺、及び子宮の癌が含まれ得る。或る実施態様では、HC RP−2に特異的に結合する抗体を、アンタゴニストとして直接的に用いたり、 或いはHCRP−2を発現する細胞又は組織に薬物を送達するためのターゲティ ング又はデリバリー機構として間接的に用いることができる。 別の実施例では、上述したものを含む癌の治療又は予防のために、HCRP− 2をコードするポリヌクレオチドの相補配列を発現するベクターを患者に投与す ることができる。 別の実施例では、本発明のタンパタ質、アンタゴニスト、抗体、アゴニスト、 相補配列、又はベクターの何れかを、他の適切な薬剤と組み合わせて投与するこ とができる。当業者は、従来の医薬上の原理に基づいて、併用療法において使用 するために適切な薬剤を選択することができるであろう。治療薬を組み合わせる ことにより、上述の種々の疾患の治療又は予防に効果をあげる相乗作用を与え得 る。この方法を用いることにより、より低い容量の各薬剤で同じ治療効果を達成 することができ、従って副作用の可能性を低下させることができる。 HCRPのアンタゴニスト又は抗体は、当分野において周知の方法を用いて製 造することができる。詳述すると、精製されたHCRPを用いて抗体を作り出し たり、或いはHCRPに特異的に結合するものを同定 するべく薬物のライブラリーをスクリーニングすることができる。 HCRPに対する抗体は、当分野において周知の方法を用いて作り出すことが できる。このような抗体には、以下に限定されないが、ポリクローナル抗体、モ ノクローナル抗体、キメラ抗体、一本鎖抗体、Fabフラグメント、及びFab 発現ライブラリーによって作られたフラグメントが含まれ得る。中和抗体(即ち 二量体形成を阻害するもの)は、治療上の用途に特に好適である。 抗体を産生するため、HCRP或いは免疫学的特性を保持するその任意の一部 、断片或いはオリゴペプチドを注射することによって、ヤギ、ウサギ、ラット、 マウス等を含む種々の宿主を免疫することができる。宿主の種に応じて、種々の アジュバントを免疫学的反応を増強するために用いることができる。そのような アジュバントには、以下のものに限定はしないが、フロイントのアジュバント、 水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント、リゾレシチンのような界 面活性物質アジュバント、プルロニックポリオールアジュバント、ポリアニオン アジュバント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュバント、キーホールリン ペットヘモシニアンアジュバント並びにジニトロフェノールアジュバントが含ま れる。ヒトで使用するアジュバントのなかで、BCG(カルメット‐ゲラン杆菌 )及びコリネバクテリウム−パルヴム(Corynebacterium parvum)は特に好適で ある。 HCRPに対する特異的抗体を誘発するために用いられるペプチドは、5個以 上のアミノ酸、より好ましくは10個以上のアミノ酸からなるアミノ酸配列を有 するものであるのが好ましい。またこれらの配列は、自然タンパク質のアミノ酸 配列の一部と同一であり、小形の自然発生の分子の全アミノ酸配列を含んでいる のが好ましい。HCRPアミノ酸の短いストレッチを、キーホールリンペットヘ モシアニン及びキメラ分子に 対して産生された抗体のような他のタンパク質の配列に融合してもよい。 HCRPのモノクローナル抗体は、培地内の連続株細胞によって抗体分子を産 生する任意の技術を用いて調製できる。このような技術には、以下のものに限定 はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、及びEBV −ハイブリドーマ技術(Kohler,G.等(1975)Nature 256:495-497;Kozbor,D.等(1 983)Immunol Methods 81:31-42;Cote,R.J.等(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:202 6-2030;Cole,S.P.等(1984)Mol.Cell Biol.62:109-120)が含まれる。 さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する分子を得るための「キメラ 抗体」の産生、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子の結合のために開発さ れた技術が用いられる(Morrison,S.L.等(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.81:6851-68 55;Neuberger,M.S.等(1984)Nature 312:604-608;Takeda,S.等(1985)Natur e 314:452-454)。或いは、一本鎖抗体の生成のための周知技術を適用して、H CRP特異的一本鎖抗体を作り出すことができる。関連する特異性を有するがイ ディオタイプの構成が異なる抗体は、無作為の免疫グロブリン組み合わせライブ ラリーからの鎖再編成(chain shuming)によって作り出すことができる(Burto n D.R.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120-3)。 また抗体は、文献(Orlandi,R.等(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837; Winter,G.等1991,Nature 349:293-299)に開示されているように高度に特異的な 結合試薬のパネルや組換え免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングするこ とにより、或いはリンパ球集団でのin vivo産生を誘導することにより作り出す こともできる。 HCRPに対する特異結合部位を含む抗体フラグメントも生成することができ る。このようなフラグメントには例えば、限定はしないが、抗体分子のペプシン による消化で生成することができるF(ab’)2フラグメ ントや、F(ab’)2フラグメントのジスルフィド架橋を減らすことにより生成する ことができるFabフラグメントが含まれる。別法として、所望の特異性を有する モノクローナルFabフラグメントを迅速かつ容易に同定できるように、Fab発現ラ イブラリーを作製してもよい(Huse,W.D.等(1989)Science 256:1275-1281)。 種々のイムノアッセイを、所望の特異性を有する抗体を同定するためのスクリ ーニングに利用することができる。確立された特異性を有するモノクローナル抗 体或いはポリクローナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫 放射線測定法の種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。このようなイ ムノアッセイでは、HCRPとその特異的抗体との複合体の形成、並びに複合体 形成の測定が行われる。特定のHCRPタンパク質上の2つの互いに非干渉なエ ピトープに対して反応するモノクローナル抗体を用いる二部位モノクローナルベ ースイムノアッセイが好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる(Maddox, 前出)。 本発明の別の実施例では、HCRPをコードするポリヌクレオチド、またはそ の任意の断片やアンチセンス配列を、治療目的で用いることができる。或る態様 では、このタンパク質の合成を阻害することが望ましいような状況において、H CRPをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンスを用いることができ る。詳述すると、HCRPをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンス 配列で細胞を形質転換することができる。従って、アンチセンス配列を用いて、 HCRP関連の組織損傷を予防したり、遺伝子機能の調節を達成することができ る。このような技術は現在周知となっており、センス又はアンチセンスオリゴマ ー、若しくはより大きな断片を、HCRPコーディング配列のコード領域や調節 領域の種々の位置から設計することができる。 レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイルス由来の 発現ベクター、或いは種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベクターは、標的 の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために用いられる。 当業者によく知られた方法を用いて、HCRPをコードする配列のアンチセンス を発現する組換えベクターを作り出すことができる。これらの技術はSambrook等 (前出)及びAusubel等(前出)に記載されている。 所望のHCRP断片を高レベルで発現する発現ベクターを細胞または組織にト ランスフェクトすることにより、HCRPをコードする遺伝子の機能を停止させ ることができる。このような作製物は、翻訳不可能なセンス配列或いはアンチセ ンス配列で細胞に導入するために用いることができいる。このようなベクターは 、DNAへ組み込まれない場合ですら、全ての複製物が内在性ヌクレアーゼによ り分解されるまで、RNA分子を転写し続ける。このような一過性の発現は、非 複製ベクターでも1ヶ月以上、適当な複製エレメントがベクター系の一部である 場合には更に長い期間継続し得る。 上述のように、HCRPをコードする遺伝子の制御、5’、又は調節領域(シ グナル配列、プロモータ、エンハンサ、及びイントロン)に対する相補配列、つ まりアンチセンス分子(DNA、RNAまたはPNA)を設計することにより遺 伝子発現を変化させることができる。転写開始部位、例えばリーダー配列の+1 0〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチドが好適である。同様に、「三 重らせん」塩基対合法を用いて阻害を達成することができる。三重らせん対合が 有用なのは、それが、ポリメラーゼ、転写因子、或いは調節分子が結合するため に二重らせんが十分にほどける能力を阻害するからである。三重らせんDNAを 用いた最近の治療法の進歩については、文献(Gee,J.E.等(1994)In:Huber, B.E.及びB.I.Carr,Molecular and Immunologic Approaches,Futura Publishing Co,Mt Kisco NY)に記載されている。 リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で ある。リボザイムの作用機序では、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列 特異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断 (endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、HCRPのエン ドヌクレアーゼによる切断を特異的かつ効果的に触媒し得る人工合成のハンマー ヘッド型リボザイム分子も含まれている。 任意のRNA標的可能部分内の特異的なリボザイム切断部位を、初めに、配列 GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対する標的分子を調べるこ とによって同定する。ひとたびその同定がなされると、切断部位を含む標的遺伝 子の領域に対応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の短いRNA配列を、 そのオリゴヌクレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴について評価するこ とが可能となる。候補の標的部分の適切性も、リボヌクレアーゼ保護アッセイを 用いて相補的なオリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成に対する接触性(acce ssibility)をアッセイすることにより評価することができる。 本発明の相補的リボ核酸分子及びリボザイムは、RNA分子を合成するのため の当分野で周知の方法により作製することができる。これらの技術には、固相ホ スホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のようなオリゴヌクレオチドの化 学的合成技術が含まれる。或いは、RNA分子を、HCRPをコードするDNA 配列のin vivo及びin vitro転写により生成することができる。このようなDN A配列は、T7或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼプロモーターを 有する多種のベクターに組み込むことができる。或いは、構成的に或いは誘導的 にアンチ センスRNAを合成するアンチセンスcDNA作成物を、株細胞、細胞或いは組 織内に導入することができる。 RNA分子はその細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾するこ とができる。可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’末端か3’末端 、或いはその両方へのフランキング配列の付加や、分子のバックボーン内におい てホスホジエステラーゼ結合ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate) 或いは2’O−メチルを使用することが含まれる。このコンセプトは、PNA生 成固有のものであり、内在性エンドヌクレアーゼにより容易に認識されないアデ ニン、グアニン、シチジン、チミン、及びウリジンの、アセチル−、メチル−、 チオ−形態、及び類似の改変形態とともに、イノシン、キュエオシン(queosine )、及びワイブトシン(Wybutosine)のような従来あまり用いられなかった塩基 を含めることによって、これら全ての分子に拡張することができる。 細胞或いは組織内にベクターを導入するための多くの方法が利用可能であり、in vivoin vitro、及びex vivoの使用に対しても同様に適切なものである。ex vivo治療法の場合には、患者から採取された幹細胞にベクターを導入し、自家 移植用のクローンとして増殖して同じ患者に戻す方法がある。またトランスフェ クションによるデリバリー、リポソーム注入またはポリカチオンアミノポリマー によるデリバリー(Goldman,C.K.等(1997)Nature Biotechnology 15:462-66;引 用により本明細書の一部とする)は、当分野でよく知られた方法を用いて実施す ることができる。 上述の治療法の何れも、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル、及び 最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、任意の適切な被験体に適用すること ができる。 本発明の更に別の実施例では、上述の治療効果のいずれかをあげるた めに、医薬品組成物を薬学的に許容される担体とともに投与する。このような医 薬品組成物は、HCRP、HCRPに対する抗体、HCRPの擬似物、アゴニス ト、アンタゴニスト、又はインヒビターからなるものであり得る。この医薬品組 成物は、単体で、或いは例えば安定剤のような1種以上の他の薬剤と組み合わせ て、任意の滅菌した生体適合性の医薬用担体に含めて投与される。このような担 体には、限定はしないが、生理食塩水、緩衝食塩水、ブドウ糖或いは水が含まれ る。これらの分子は、患者に対して、単体で、或いは他の薬品やホルモンと結合 して投与され得る。 本発明で用いられる医薬品組成物の投与経路には、以下の経路に限定されない が、経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、髄内投与、くも膜下内投 与、心室内投与、経皮投与、皮下投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、経腸投与、局 所投与、舌下投与、或いは直腸内投与が含まれ得る。 これらの医薬品組成物は、活性成分に加えて、薬学的に用いられ得、調合物内 への活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切な製薬学的に許 容される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は、“Remington' s Pharmaceutical Sciences”(Maack Publishing Co,Easton PA)の最新版にお いて見ることができる。 経口投与用の医薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担 体を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、医薬品組成物は、 治療を受ける患者による経口及び鼻腔摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、 液体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁液或いは類似の製剤として処方 される。 経口投与するための製剤は、活性化合物と固形の賦形剤とを結合することによ って得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助 剤を添加した後、得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、錠剤或い は糖衣剤核を得ることができる。適切な賦形剤は、ラクトース、スクロース、マ ンニトール或いはソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク質充填剤 、とうもろこし、小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセルロース、 ヒドロキシプロピルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロースナト リウムのようなセルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのようなゴム、並 びにゼラチン或いはコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば、架橋結 合したポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなアルギン酸 或いはアルギン酸ナトリウムや、その塩のような、崩壊剤或いは可溶化剤が加え られる。 糖衣剤核(dragee core)は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられる が、溶液はアラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、 ポリエチレングリコール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機 溶剤或いは溶剤混合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわち活性化合物の量 、すなわち投与量を特徴付けるために染料或いは色素が錠剤或いは糖衣錠皮に加 えられてもよい。 経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る 。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤とともに或いは安定剤なしで、 脂肪油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶 解或いは懸濁される。 非経口投与用の製剤は、水溶性の活性化合物の水溶液を含む。注射用として、 本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンゲル溶液或いは生理 緩衝食塩水のような生理学的に適合性の緩衝液に入れて製剤することができる。 水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール 或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を高める物質を含み得る。更に、活性 成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油性の溶媒 或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグリセリド 或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、所望に応 じて、溶解度を増加し濃縮度の高い溶液の調製を可能にする適切な安定剤或いは 薬剤を含んでもよい。 局所的投与または経鼻粘膜投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な 浸透剤を用いて調合が行われる。このような浸透剤は、当技術分野において周知 である。 本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、顆粒化 処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、封入処理(entrappineg)処理或いは 凍結乾燥処理により製造される。 この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸 、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに 形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製 剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝 剤と結合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおけ る凍結乾燥粉末である。 製薬学的に許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成 物は、調製された後、適切な容器内に入れて、さらに提示した疾病状態の治療の ためにラベル付けすることができる。HCRPの投与の場合、このようなラベル には、投与の量、頻度、方法が表示される。 本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的 を達成するための有効量含む組成物である。有効量の決定は、当業者の能力の範 囲内で十分行うことができる。 任意の化合物について、治療的有効量は、初めに、新生物細胞、或いは通常マ ウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地のアッセイか ら推定される。次に、このような情報を利用して、ヒトにおける有効量や投与経 路を決定することができる。 治療上の有効な量とは、症状や状態を改善するタンパク質、その抗体、アンタ ゴニスト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治療上 の有効性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個 体群の50%における治療上の有効量、50%有効量)を決定するための、細胞 培地或いは実験動物における標準的な製薬学的方法により決定することができる 。毒性と治療有効性との間の投与量比は治療指数であり、LD50/ED50の 比として表すことができる。大きな治療指数を示す医薬品組成物が好ましい。こ れらの細胞培地のアッセイ及び付加的な動物研究から得られるデータは、ヒトへ の使用に対する投与量の範囲を決める際に用いることができる。そのような化合 物の投与量は、毒性がほとんど或いは全くなく、ED50を達成する循環濃度の 範囲内にあることが望ましい。投与量は、用いられる剤形、患者の感受性並びに 投与経路に応じてこの範囲内で変化する。 正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。 投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性成分を与え、かつ所定の効果を維持す るために調節される。考慮すべき付加的な要因は、疾 患状態の重症度、または患者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時間及び頻 度、併用する薬剤、反応感受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長期的に作 用する薬品組成物は3〜4日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定の処方の クリアランス速度に応じて2週間に1度投与してもよい。 通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大 約1gであり、投与経路に応じて変わってくる。特定の投与量或いは送達の方法 に関する手引きは、当分野の実施者が通常入手できる文献において見出すことが できる。当業者なれば、ヌクレオチドに対しては、タンパク質やインヒビター用 の剤形とは異なる剤形を採用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポ リペプチドの送達方式は、特定の細胞、状態、位置等によって決まってくる。 診断 別の実施例において、HCRPに特異的に結合する抗体を、HCRPの発現を 特徴とする状態や疾病の診断や、HCRPで治療を受けている患者のモニタリン グのためのアッセイにおいて用いることができる。診断目的で有用な抗体は、上 述の治療用のものと同一の方法で調製することができる。HCRPの診断検査法 には、ヒトの体液、細胞或いは組織の抽出物においてHCRPを検出するために 抗体或いは標識を利用する方法が含まれる。本発明のポリペプチド及び抗体は、 修飾したものでも、修飾なしでも用いることができ、共有結合、或いは非共有結 合かのいずれかでリポーター分子と結合することにより標識することができる。 種々のリポーター分子が周知となっており、その幾つかについては上記した。 例えばELISA(酵素結合免疫測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ) 並びにFACS(蛍光表示式細胞分取器法)を含む、HCRPを測定するための種々 のプロトコルが当分野では周知であり、これによってHCRP発現の変化や異常 を診断するための基礎が得られる。HCRPの発現の正常値、つまり標準値は、 哺乳類、好ましくはヒトの正常被験者から得られる体液或いは細胞抽出物とHC RPに対する抗体とを、複合体形成に適した条件の下で結合することによって得 ることができる。標準の複合体形成量は、種々の方法、好ましくは測光手段を用 いることにより定量することができる。被験者、対照標準、及び生検組織からの 患部組織サンプルにおいて発現されたHCRPの量を、標準値と比較する。標準 値と被験者の値との偏差で、疾病診断のパラメータが確立される。 本発明の別の実施例では、HCRPをコードするポリヌクレオチドを、診断目 的で用いることができる。使用できるポリヌクレオチドには、オリゴヌクレオチ ド配列、アンチセンスRNA及びDNA分子、及びペプチド核酸(PNA)が含 まれる。このポリヌクレオチドは、HCRPの発現が疾病と相関性を有する生検 組織における遺伝子発現を検出し、定量するために用いられる。診断アッセイは 、HCRPが存在、不存在、及び過剰発現の何れの状態にあるかを区別したり、 治療的介入の際にHCRPレベルの調節をモニタリングするのに役立つ。 或る実施態様では、HCRPまたは近縁な分子をコードする、ゲノム配列を含 むポリヌクレオチド配列を検出できるハイブリダイゼーションプローブ或いはP CRプローブを用いて、HCRPをコードする核酸配列を同定することができる 。そして、そのプローブの特異性、即ち、そのプローブが非常に高度な保存領域 (例えば5’調節領域における10個の独特のヌクレオチド)と、保存的である 度合いの低い領域(例えば特に3’領域におけるシステイン残基の間の領域)の 何れに由来するのかということ、及びハイブリダイゼーション或いは増幅の(高 い、中程 度の或いは低い)厳密性によって、そのプローブが自然発生HCRPのみを同定 するものであるか、或いはアレル配列や近縁な配列も同定するものであるかとい うことが決まってくる。 プローブは、近縁なインヒビターをコードする配列を検出するためにも用いる ことができ、好ましくは、これらのHCRPをコードする任意の配列から得られ るヌクレオチドを少なくとも50%含むべきである。本発明のハイブリダイゼー ションプローブは、配列番号:2又は配列番号:4のヌクレオチド配列か、自然 発生HCRPのイントロン、プロモータ、及びエンハンサーエレメントを含むゲ ノムの配列に由来するものであり得る。 HCRPをコードするDNAに対して特異的なハイブリダイゼーションプロー ブの作製のための他の手段には、HCRPやHCRP誘導体をコードする核酸配 列を、mRNAプローブ生成のためのベクターにクローン化する方法がある。こ のようなベクターは周知で市販されており、適切なRNAポリメラーゼや適切な 放射性標識ヌクレオチドを付加することにより、in vitroでのRNAプローブを 合成のために用いることができる。ハイブリダイゼーションプローブは種々のリ ポータ分子により標識することができ、この標識には、32Pや35Sのような放射 性核種、アビジン/ビオチン結合系によりプローブに結合するアルカリホスファ ターゼのような酵素標識等が含まれる。 HCRPをコードするポリヌクレオチド配列を、HCRPの発言に関連する状 態、疾患、又は疾病の診断のために用いることができる。このような状態または 疾病の例には、例えば副腎、膀胱、骨、骨髄、脳、乳房、子宮頚、胆嚢、神経節 、胃腸管、心臓、腎臓、肝臓、肺、筋肉、卵巣、膵臓、副甲状腺、陰茎、前立腺 、唾液腺、皮膚、脾臓、精巣、胸腺、甲状腺、及び子宮の癌;例えばAIDS、 アジソン病、成人呼吸窮迫症 候群、アレルギー、貧血症、喘息、アテローム性動脈硬化症、気管支炎、胆嚢炎 、クローン病、潰瘍性大腸炎、アトピー性皮膚炎、皮膚筋炎、糖尿病、肺気腫、 萎縮性胃炎、腎炎、痛風、グレーブス病、過好酸球増加症、過敏性腸症候群、エ リテマトーデス、多発性硬化症、重症筋無力症、心筋又は心膜の炎症、変形性関 節炎、骨粗鬆症、膵炎、多発性筋炎、リウマチ性関節炎、強皮症、シェーグレン 症候群、及び自己免疫性甲状腺炎;癌と血液透析と体外循環の合併症;ウイルス 、細菌、真菌、寄生虫、原虫、及び蠕虫の感染症、及び外傷のような免疫疾患; 及び例えば尿細管性アシドーシス、貧血症、クッシング症候群、軟骨形成不全性 小人症、てんかん、性腺形成異常症、シャルコー−マリー−ツース病や神経線維 腫症のような遺伝性神経病、甲状腺機能低下症、水頭症、シドナム舞踏病や脳性 麻痺のような発作障害、2分脊椎、及び先天性緑内障、白内障、又は感覚神経性 聴力損失のような発達障害が含まれる。HCRPをコードするポリヌクレオチド 配列は、HCRP発現の変化を検出するための生検組織や体液を試験するための 、サザンブロット法或いはノーザンブロット法、ドットブロット法或いは他の膜 ベース技術、PCR技術、ディップスティック試験法(試験紙法)、ピン或いはチ ップ技術及びELISAアッセイにおいて用いることができる。このような定性的或 いは定量的試験方法は当分野ではよく知られている。 具体的な実施態様では、種々の癌、特に上述の癌の活性化または誘導を検出す るアッセイにおいてHCRPをコードするヌクレオチド配列が役立つことがある 。HCRPをコードするヌクレオチド配列を標準的な方法で標識し、ハイブリダ イゼーション複合体の形成に適した条件の下で患者の体液や組織サンプルに加え る。適切なインキュベーション時間の経過後、このサンプルを洗浄しシグナルを 定量して、標準値を比較する。生検サンプルまたは抽出サンプルにおけるシグナ ルの量が、比較で きる対照サンプルのシグナル量と有意に異なっている場合、このヌクレオチド配 列はサンプルのヌクレオチド配列とハイブリダイズしており、サンプルにおける HCRPをコードするヌクレオチド配列のレベルの変化が存在することは、関連 疾患の存在を示している。このようなアッセイは、動物実験、臨床試験、または 個々の患者の治療のモニタリングにおける特定の治療措置の効果を評価するため に用いることもできる。 HCRPの発現が関係する疾病の診断の基礎を得るために、正常な、或いは標 準の発現プロフィールを確立する。この標準プロフイールは、動物或いはヒト何 れかの正常な被験者から得られる体液或いは細胞抽出物を、ハイブリダイセーシ ョン或いは増幅に適切な条件下で、HCRPをコードする配列又はその一部分と 結合することにより確立される。標準のハイブリッド形成量は、既知の量の実質 的に精製されたHCRPが用いられる同一の実験で得られる値と、正常被験者に 対して得られる値とを比較することにより定量することができる。正常なサンプ ルから得られた標準値は、疾病の症状を示す患者からのサンプルから得られる値 と比較することができる。標準値と被験者値との偏差を用いて疾病の存在を確認 する。 ひとたび疾患が確認され、治療プロトコルが開始されると、患者での発現レベ ルが正常な患者において観察されるレベルに近づき始めたか否かを評価するため に、このようなアッセイが定期的に繰り返される。継続的なアッセイから得られ る結果を用いて、数日間或いは数ヶ月の期間にわたる治療効果を知ることができ る。 癌については、患者の生検組織において転写物が比較的少ない量存在すること が疾病の発生の素因を示し、つまり実際の臨床的症状が現れる前に疾病を検出す る手段となり得る。この型の一層確定的な診断により、医療従事者が予防的処置 を講じたり、より早期に積極的な治療を開始す ることが可能となり、癌の発生や更なる進行を予防することができるようになり 得る。 HCRPをコードするオリゴヌクレオチドの別の診断目的の使用では、PCR を使用することがある。このようなオリゴマーは一般には化学的に合成するが、 酵素を用いて作製したり、或いはin vitroで作り出すこともできる。オリゴマー は、特定の遺伝子或いは状態を識別するために最適な条件下で用いられる2つの ヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌクレオチド及びアンチセ ンス方向(3’←5’)のヌクレオチドからなる。同一の2つのオリゴマー、入 れ子オリゴマーの組、或いはオリゴマーの縮重プールでさえ、近縁なDNAまた はRNA配列の検出や定量のためのより厳密性の低い条件の下であっても用いる ことができる。 さらにHCRPの発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolabelin g)或いはビオチン標識ヌクレオチドの利用、コントロールの核酸の同時増幅(c oamplification)の利用、並びに実験結果を補完して引かれた標準的なグラフ曲 線の利用も含まれる(Melby,P.C.等1993 J.Immunol Methods,159:235-44;Dupla a,C.等(1993)Anal.Biochem.229-236)。多数のサンプルの定量は、ELISA形式の 連続アッセイを実行することにより一層迅速に行うことができる。このアッセイ では目的のオリゴマーが様々な希釈溶液中に存在し、分光光度計を用いる分析或 いは比色分析反応により迅速に定量することができる。 別の実施例では、ここに開示する任意のポリヌクレオチド配列を起源とするオ リゴヌクレオチドをマイクロアレイにおける標的として用い得る。マイクロアレ イを用いることにより、多くの遺伝子の発現レベルを同時にモニタし(転写物イ メージを生成する)、また遺伝子の変異体、変異及び多形性を同定することがで きる。この情報は、遺伝子の機能の 決定や、疾病の遺伝的な基礎の理解、疾病の診断、及び治療薬の開発や活性のモ ニタリングにおいて役立つ(Heller,R.等.(1997)Proc.Natl.Acad.Sci.94:2150- 55)。 或る実施例では、PCT出願WO 95/11995(Chee等.)、Lockhart,D.J.等.(19 96;Nat.Biotech.14:1675-1680)及びSchena,M.等.(1996;Proc.Natl.Acad.Sci.93 :10614-10619に記載の方法によりマイクロアレイを準備し、利用する。上記の文 献はここに引用することにより本明細書の一部とする。 マイクロアレイは、好ましくは、固体支持体に固定された、通常は合成アンチ センスオリゴヌクレオチドかcDNAの断片の何れかである、数多くの独特で一 本鎖の核酸配列からなる。マイクロアレイは、既知の5’又は3’配列をカバー するオリゴヌクレオチド、完全長配列をカバーする連続的なオリゴヌクレオチド 、又は配列の長さに沿った特定の領域から選択された独特のオリゴヌクレオチド を含み得る。マイクロアレイにおいて用いられるポリヌクレオチドは、特定の細 胞の型、発達又は疾病の状態について共通な1又は2以上の未同定cDNAに特 異的な、或いは少なくとも配列の断片が既知である標的の遺伝子又は遺伝子群に 特異的なオリゴヌクレオチドであり得る。 マイクロアレイ用に既知の配列に対するオリゴヌクレオチドを製造するために 、ヌクレオチド配列の5’又は又はより好ましくは3’末端からコンピュータア ルゴリズムを用いて目的の遺伝子を検定する。このアルゴリズムは、その遺伝子 に独特な、ハイブリダイゼーションに適した範囲内のGC含量を有し、且つハイ ブリダイゼーションを妨げ得る推定2次構造を有していない決まった長さのオリ ゴマーを同定する。このオリゴヌクレオチドは、光照射化学プロセスを用いて基 板上の所定の領域において合成される。この基板は、紙、ナイロン、又は他のタ イプのメ ンブラン、濾紙、チップ、スライドガラス、又は他の任意の適切な固形支持体で あり得る。 別の実施態様では、オリゴヌクレオチドが、PCT出願WO 95/251116(Bald eschweiler等.)に記載のように化学結合プロシージャ及びインクジェット装置 を用いることによって基板の表面上で合成され得る。上記PCT出願はここに引 用することにより本明細書の一部とする。別の態様では、ドットブロット(又は スロットブロット)に類似した「格子型」アレイを用いて、真空システム、熱、 UV、機械的又は化学的結合プロシージャを用いてcDNA断片又はオリゴヌク レオチドを基板の表面上に配置し結合することができる。上述のようなアレイは 、手で製作するか、或いは市販の装置(スロットブロット又はドットブロット装 置)、材料(任意の適切な固形支持体)、及び機械(ロボット装置を含む)を用 いることにより製作することができ、8ドット、24ドット、96ドット、38 4ドット、1536ドット、又は6144ドット、若しくは市販の器具で有効に 使用できるような他のドット数の格子を有する。 マイクロアレイを用いるサンプル解析を行うために、生物学的サンプルからの RNA又はDNAをハイブリダイゼーションプローブにする。このmRNAは単 離され、cDNAが作られて、アンチセンスRNA(aRNA)を作るためのテン プレートとして用いられる。aRNAは蛍光ヌクレオチドの存在のもとで増幅さ れ、標識されたプローブはマイクロアレイと共にインキュベートされて、プロー ブ配列がマイクロアレイの相補的なオリゴヌクレオチドとハイブリダイズする。 インキュベーション条件は、ハイブリダイゼーションが正確な相補的な一致又は 様様なレベルのより低い相補性をもってハイブリダイゼーションが発生するよう に調節される。ハイブリダイズしたかったプローブを除去した後、スキャナーを 用いて、蛍光のレベル及びパターンを求める。スキャンされた イメージを調べて、マイクロアレイ上の各オリゴヌクレオチド配列の相補性の程 度及び相対的な量を求める。生物学的サンプルは、体液(例えば血液、尿、唾液 、痰、胃液等)、培養された細胞、生検組織、又は他の組織調製物から得ること ができる。検出システムを用いることにより、全ての個別の配列について同時に ハイブリダイゼーションの不存在、存在、及び量を測定することができる。この データは、サンプルにおける配列、突然変異、変異、又は多形体についてのラー ジスケールの相関性の研究のために用いることができる。 本発明の別の実施例では、HCRPをコードする核酸配列を用いて、自然発生 のゲノム配列マッピングのためのハイブリダイゼーションプローブを作り出すこ ともできる。この配列を、特定の染色体、染色体の特定の領域、又は人工染色体 作成物にマッピングすることができる。前記人工染色体作成物には、例えばヒト 人工染色体(HAC)、酵母菌人工染色体(YAC)、細菌人工染色体(BAC )、細菌性P1作成物又は一本鎖染色体cDNAライブラリーがあり、Price,C. M.(1993)Blood Rev.7:127-134,及びTrask,B.J.(1991)Trends Genet.7:149-154 にその概要が記載されている。 蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH、Verma等(1988)Human Chromosomes :A Manual of Basic Technique ,Pergamon Press,New York,NY”に記載)は、他の 染色体マッピング技術及び遺伝子地図データと関係を有し得る。遺伝子地図デー タの例は、種々の科学誌や、Online Mendelian Inheritance in Man(OMIM)に 見ることができる。物理的染色体地図上でのHCRPをコードする配列の位置と 、特定の疾病(または特定の疾病の素因)との相関関係を助けとして、ある遺伝 病が関係するDNAの領域の限界決定ができる。本発明のヌクレオチド配列を用 いて、正常者とキャリアまたは患者との遺伝子配列の違いを検出するこ とができる。 染色体調製物のin situハイブリダイゼーション及び確定された染色体マーカ ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地図を延長するため に大変重要である。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であって も、マウスのような別の哺乳類種の染色体上の遺伝子配置から、関連するマーカ ーがわかる。新しい配列は、物理的マッピングにより染色体のアーム、或いはそ の一部へ割当てることができる。これは位置クローニング或いは他の遺伝子発見 技術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に貴重な情報を提供する。ひとたび毛 細血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或いは症候群が、特定のゲノム領域へ 、例えばATならば11q22-23(Gatti,R.A.等(1988)Nature 336:577-580)へ、遺伝子 連鎖によって粗い局所化がなされれば、その領域にマッピングされる任意の配列 は、さらなる研究のための関連する遺伝子、或いは調節遺伝子ということになる 。本発明のヌクレオチド配列は、正常者とキャリアまたは患者との間の、転座、 逆位等による染色体位置の違いを検出するために用いることもできる。 本発明の別の実施例では、HCRPや、その触媒作用性または免疫原性フラグ メント或いはオリゴペプチドを、種々の薬物スクリーニング技術において治療用 化合物のスクリーニングのために用いることができる。そのような試験において 用いられるフラグメントは、溶液に遊離した形態か、固体支持体へ付着したもの か、細胞表面へ付着したものか、或いは細胞内に存在するものであり得る。HC RPと試験される薬剤との結合複合体形成を測定することができる。 HCRPポリペプチドへの適切な結合親和性を有する化合物の高スループット スクリーニングのために用いることができる別の薬物スクリーニング技術が、公 開されたPCT出願WO84/03564に詳細に記載されで いる。この方法をHCRPに適用する場合には、多数の異なる小形ペプチドの試 験用化合物を、プラスチックピン或いは他の表面のような固体基質上で合成する 。ポリペプチド試験用化合物をHCRP又はその断片と反応させ、洗浄する。次 いで結合HCRPを当分野で周知の方法により検出する。また、前述の薬物スク リーニング技術において使用するために、精製HCRPをプレート上に直接コー ティングすることもできる。この他、ペプチドを捕捉し固体支持体上にペプチド を固定するために非中和抗体を用いることができる。 別の実施例では、HCRPに結合し得る中和抗体が、HCRPとの結合につい て試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイを使用する ことができる。このように、抗体を用いて、1または2以上のHCRPと共通の エピトープを有する任意のペプチドの存在を検出することができる。 更に別の実施例では、ここに開示するHCRPをコードするヌクレオチド配列 は、その新技術が、以下に限らないが、例えばトリプレット遺伝暗号及び特異的 塩基対合相互作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性に基 づく技術であれば、まだ開発されていない分子生物学的技術においても用いるこ とができる。 以下に示す本発明の実施例は、単なる例示であって、本発明をこの実施例に限 定しようとするものではない。実施例 1 cDNAライブラリーの作製 COLNFET02 COLNFET02 cDNAライブラリーを、20週目の白人女子胎児から得た結腸 組織から作製した。妊娠中の母親は、第1三半期において7 日間、気管支炎のためにエリスロマイシンを投薬されていた(specimen#RU95-10 -0739;HAM,Exton,PA)。 冷凍組織を、Brinkmann Homogenizer Polytron PT-3000(Brinkmann Instrume nts,Westbury,NJ)を用いて、グアニジウムイソチオシアネート溶液の中でホモ ジナイズし溶解した。この溶解産物を、Beckman L81-70M Ultracentrifugeにお いてBeckman SW28 rotor(Beckman Instruments)を用いて、5.7Mの塩化セシウ ムクッションを通して、室温で18時間、一分当たり25,000回転で遠心分離した。 酸性フェノールpH4.7を用いてRNAを抽出し、0.3Mの酢酸ナトリウム及び2.5倍 量のエタノールを用いて沈殿させ、RNアーゼの無い水に再懸濁し、37℃でDN アーゼ処理した。このRNAの抽出と沈殿を前回と同様に反復した。次にこのm RNAを、Qiagen Oligotex kit(QIAGEN,Inc.,Chatsworth,CA)を用いて単 離し、cDNAライブラリーの作製に用いた。 このmRNAは、SuperScript Plasmid System for cDNA Synthesis and Plas mid Cloning(Cat.#18248-013,Gibco/BRL)の推奨プロトコルに従って取り扱っ た。CONUTUT01 cDNAはSepharose CL4Bカラム(Cat.#275105-01,Pharmacia )で分画化し、400bpを越えるcDNAをpSportIにリゲートした。次にこ のプラスミドpSportIをDH5aTMコンピテント細胞(Cat.#18258-012,Gibco/B RL )に入れて形質転換させた。 HMCINOT01 ヒトマスト細胞HMCINOT01 cDNAライブラリーを、Stratagene社(Stratage ne,La Jolla,CA 92037)に依頼し、カスタム品として、培養したHMC−1細胞 から精製されたmRNAを用いて作製した。このライブラリーは、Stratagene社 が概ね以下に説明するように作製した。 ヒトマスト細胞(HMC−1)cDNAライブラリーは、ヒトマスト細胞からポ リ(A+)RNA(mRNA)を精製し、次にmRNAの二本鎖相補的DNA( cDNA)複製を酵素を用いて合成することによって作製した。合成アダプター オリゴヌクレオチドをcDNAの末端に連結して、このcDNAをラムダベクタ ーに挿入できるようにした。HMC−1ライブラリーは、Uni-ZAPTMベクターシ ステム(Stratagene)を用いて作製した。 HMC−1のcDNAライブラリーは、DNAプローブか抗体プロー ージミド(Stratagene)はin vivoで速やかに切除することができる。 (Stratagene)に感染させた。この他の一方向性ベクターには、以下に限定され ないが、pcDNAI(Invitrogen.San Diego,CA)やpSHlox-1(Novagen,Madison WI )が含まれるであろう。 2 cDNAクローンの単離及び配列決定 ファージミドに組込まれた形態の個々のcDNAクローンを、in vivo切除プ ロセスによって得た。このプロセスでは、宿主菌株にλライブラリーファージと f1ヘルパーファージを同時感染させる。ライブラリーを含むファージとヘルパ ーファージの双方に由来するタンパク質がλDNAにニックを入れ、ラムダ標的 DNA上の決まった配列から新たなDNA合成を開始させ、小形の一本鎖環状フ ァージミドDNA分子を作っ DNA配列とcDNAインサートを含んでいた。ファージミドDNAを細胞から 放出させ精製して、新たな宿主細胞に再感染するのに用いた。この宿主細胞で二 本鎖のファージミドDNAが作られた。このファージミドはβラクタマーゼの遺 伝子を有しているため、新たに形質転換され た細菌は、アンピシリンを含む培地で選択される。 ファージミドDNAは、Magic MiniprepsTM DNA Purification System(catal ogue#A7100.Promega Corp:,Madison,WI 53711)を用いて精製した。このDNA は精製用レジンから溶出され、DNAシークエンシング及び他の解析操作のため に調製された。 Purification System(QIAGEN Inc,Chatsworth,CA)を用いても精製することが できる。このDNAは、精製用レジンから溶出され、DNAシークエンシング及 び他の解析操作のために調製された。 ファージミドDNAを精製するための別の方法では、Advanced Genetic Techn ologies Corp.(Gaithersburg,Maryland,Catalog No.77468)から市販されている Miniprep Kitを利用する。このキットは、96穴形式で、960回の精製のため に十分な試薬が備えられたものである。各キットは、推奨プロトコルを有するが 、以下の変更点を除いてこのプロトコルを採用した。初めに、96個をウェルを 、それぞれ25mg/Lのカルベニシリン及び0.4%のグリセロールと共に1mlの滅 菌Terrific Broth(Catalog#22711)で満たす。ウェルに植菌した後、最近を24 時間インキュベートし、60μlの溶解バッファーに溶解する。遠心分離(1分当 たり2900回転で5分間)にかけた後、ブロックの内容物を一次濾板(primary fil ter plate)に加える。イソプロパノールをTRISバッファーに加えるオプションの ステップは行わない。プロトコルの最終ステップの後、サンプルを保管のために 96穴ブロックに移す。 ファージミドDNAを精製するための別の方法では、REAL Prep 96 Plasmid K it(Catalog#26173,QIAGEN,Inc.)を用いる。このキットでは、マルチチャネル 試薬ディスペンサを用いて96穴ブロックにおいて96のサンプルを同時に精製する ことができる。推奨プロトコルを用いた が、以下の点を変更した。(1)25mg/Lのカルベニシリン及び0.4%のグリセロ ールと共に1mlの滅菌Terrific Broth(Catalog#22711,Gibco/BRL)において細菌 を培養した。(2)植菌の後、培地を19時間インキュベートし、インキュベーシ ョンの終わりに、細胞を0.3mlの溶解バッファに溶解した。(3)イソプロパノ ール沈殿の後、プラスミドDNAペレットを0.1mlの蒸留水に再懸濁した。プロ トコルの最終ステップの後、サンプルを96穴ブロックに移し4℃で保管した。 このcDNAの配列決定は、Peltier Thermal Cyclers(PTC200 from MJ Rese arch,Watertown,MA)及びApplied Biosystems 377 DNA Sequencing Systemsと組 み合わせてHamilton Micro Lab 2200(Hamilton,Reno,NV)を用いてSangerらの 方法(1975,J.Mol.Biol.94:441f)により行い、読み枠を決定した。 3 cDNAクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索COLNFET0 2 配列表のヌクレオチド配列及び、それらから類推されるアミノ酸配列を問い合 わせ配列として用いて、例えばGenBank,SwissProt、BLOCKS、及びPima IIのよう なデータベースを検索した。これらのデータベースには既に同定された配列が注 釈付きで含められており、BLAST(Basic Local Alignment Toolを表す)を用い て相同性(類似性)を有する領域をこのデータベースのなかから検索した(Alts chul S.F.(1993)J.Mol.Evol.36:290-300;Altschul.S.F.等(1993)J.Mol.Biol.215 :403-410)。 BLASTはヌクレオチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを生成して配列 類似性を決定する。そのアライメントの局所性のために、BLASTは厳密な一致、 すなわち原核生物(細菌)や真核生物(動物、菌類、又は植物)を起源とするホ モログを求める際に特に有効である。一次配列パターンや二次構造ギャップペナ ルティを処理する際には、本 明細書に一体に引用されたSmith等(1992,Protein Engineering 5:35-51)に記載 のもののような他のアルゴリズムを用いることができる。本明細書に開示された 配列の長さは少なくとも49ヌクレオチドであり、不必要な塩基は12%以下である (ここで、NはA、C、G、又はT以外と記録されたものである)。 BLAST法は、本明細書に一体に引用されたKarlin等(前出)に詳細に記載され ているように、問い合わせ配列とデータベースの配列の一致を検索する。BLAST は発見したあらゆる配列の一致の統計的有意性を評価して、ユーザが選択した有 意性の閾値を満たす一致のみを報告する。本出願での閾値は、ヌクレオチドで1 0-25、ペプチドで10-14に設定した。 インサイト社のヌクレオチド配列を、霊長類(pri)、げっ歯類(rod)、及び 他の哺乳類配列(mam)のGenBankデータベースで検索した。次に同じクローンか ら類推されたアミノ酸配列を、GenBankの機能性タンパク質データベース、哺乳 類(mamp)、脊椎動物(vrtp)、及び真核生物(eukp)で、相同性について検索 した。これらのデータベースは特定の一致をGixxx±pという形式で報告した(こ こでxxxはpri;rod等であり、存在の場合はp=ペプチドである)。 HMCINOT01 Applied Biosystems社で開発された検索アルゴリズムを、INHERIT 670TM配列 解析システムに組み込んで用いて、各cDNAの配列をGenBankの配列と比較し た。このアルゴリズムでは、Pattern Specification Language(TRW社、LosAnge les CA)を用いて相同な領域を決定した。配列の比較をどのように行うかを決定 する3つのパラメータは、ウィンドウサイズ、ウィンドウオフセット、及び誤差 許容度であった。これら3つのパラメータの組を用いて、対象の配列と相同な領 域を含む配列をDNAデータベースから検索し、適切な配列には、初期値ととも にスコアが付けられた。次に、これらの相同な領域をドットマトリクスホモロジ ーブロット法を用いて検定し、相同な領域と偶然の一致とを区別した。相同性検 索の結果は、Smith-Waterman alignmentsを用いて表示した。 ペプチド及びタンパク質配列の相同性は、INHERIT 670配列解析システムをD NA配列の相同性検索で用いたのと同様に用いて確かめた。Pattern Specificat ion Language及びパラメータウィンドウを用いて、タンパク質データベースから 相同性領域を含む配列を検索し、その結果には初期値とともにスコアが付けられ た。ドットマトリクスホモロジーブロット法を用いて検定し、有意な相同性を有 する領域と偶然の一致とを区別した。 BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool(Altschul,S.F.(1993)J.Mol.E vol.36:290-300;Altschul,SF等(1990)J Mol Biol215:403-410)の略称であり、 これを用いて局部的な配列アライメントを検索した。BLASTはヌクレオチド及び アミノ酸配列の両方のアライメントを作成して配列類似性を求める。そのアライ メントの局所性のために、BLASTは厳密な一致、すなわちホモログを求める際に 特に有効である。BLASTは間隙を含まない一致を求めるのに役立つ。BLASTアルゴ リズム出力の基本的な単位は、High-scoring Segment Pair(HSP)である。 HSPは2つの配列フラグメントからなり、両フラグメントは任意ではあるが、 そのアライメントが局所的に最大となっている等しい長さものであり、そのアラ イメントスコアはユーザにより設定された閾値であるカットオフスコアを満足し ている、即ち、カットオフスコアを超えている。BLASTアプローチは問い合わせ 配列とデータベース配列との間の HSPを見つけ出すものであり、見出された任意の一致の統計的有意性を評価し、 そのユーザが設定した有意性の閾値を満足する一致のみを報告するものである。 パラメータEはデータベース配列一致を知らせるための統計的に有意な閾値を確 定するパラメータである。Eは全データベース検索の情況においてHSP(或いはH SPの組)生起の予測頻度の上限として解釈される。その一致がEを満足する任意 のデータベース内の配列がプログラム出力において報告される。 4 ノーザン法による解析 ノーザン解析は、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞型または組織に由 来するRNAが結合したメンブランとのハイブリッド形成を伴う、遺伝子の転写 物の存在を検出するために用いられる実験技術である(Sambrook等、上述)。 BLAST(Altschul,S.F.1993及び1990,上述)を用いる類似のコンピュータ技術 で、GenBankまたはLIFESEQTMデータベース(Incyte,PaloAlto CA)のようなデー タベースにおける同一のまたは近縁な分子を検索した。この解析は、多くの膜ベ ースのハイブリダイゼーションより非常に短時間で行うことができる。更に、コ ンピュータ検索の感度を変更して、ある一致が正確な一致か、相同的であるかの 分類を決定することができる。 検索の基準値は、積スコア(product score)であり、これは以下の式で定義 されるものである。 (配列の一致(%)×最大BLASTスコア(%))/100 この積スコアでは、2つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一致の双方 が考慮されている。例えば、積スコアが40の場合は、一致は誤差が1〜2%の 範囲で正確であり、スコアが70の場合は正確に一致している。相同な分子は、 通常積スコアとして15〜40を示すものを 選択することにより同定されるが、スコアの低いものは近縁関係にある分子とし て同定される。 検索の結果は、完全長配列、又はその部分が存在するライブラリー、配列の存 在量(abundance)、及びパーセント存在量(percent abundance)のリストとし て報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映し、パーセント存 在量は、存在量をライブラリー内で検出された配列の総数で除したものである。 5 HCRPをコードする配列の延長 インサイト社クローンNo.7755及び1308478の核酸配列を用いて、部分的ヌクレ オチド配列を完全長まで伸長させるためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計 した。一方のプライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するために 合成し、他方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために合成 した。これらのプライマーを用いて、周知のHCRP配列を「外側に」延長し、 対象の制御領域の新しい未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを生成した 。初めのプライマーは、OLIGO 4.06(National Biosciences社)、或いは他の適 切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌクレオチドで50%以上のGC含 量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配列にアニールするように設計した 。ヘアピン構造及びプライマー−プライマー二量体化を生じるような任意のヌク レオチドのストレッチの延長は避けた。 選択されたヒトcDNAライブラリー(Gibco/BRL)を用いて配列を延長した 。2以上の延長が必要な場合は、既知領域をさらに延長するために追加のプライ マーの組を設計する。 XL-PCRキット(Perkin Elmer)の説明書の指示に従って、酵素と反応混合物と を完全に混合することにより、高い忠実度の増幅がなされる。40pmolの各プラ イマーと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分 とから増幅を開始する場合、Peltier Thermal Cycler(PTC200;M.J.Reserch,Wa tertown MA)を用いて、以下のパラメータでPCRを行った。 ステップ1 94℃で1分間(初期変性) ステップ2 65℃で1分間 ステップ3 68℃で6分間 ステップ4 94℃で15秒間 ステップ5 65℃で1分間 ステップ6 68℃で7分間 ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復 ステップ8 94℃で15秒間 ステップ9 65℃で1分間 ステップ10 68℃で7分15秒間 ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復 ステップ12 72℃で8分間 ステップ13 4℃(その温度を保持) 反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア ガロースミニゲル上での電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに成 功したか否かを決定した。最も大きな生成物或いはバンドを選択して、ゲルから 切り出し、QIAQuickTM(QIAGEN Inc.,Chatsworth,CA)を用いて精製し、クレノ ウ酵素を用いて一本鎖ヌクレオチドの延び出しを切り取って再結合及びクローニ ングを容易にする平滑末端を作った。 エタノール沈殿の後、生成物を13μlのライゲーション緩衝液内に再溶解し 、1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチ ドキナーゼを加えて、その混合物を室温で2〜3時間、 或いは16℃で一昼夜インキュベートした。コンピテントな大腸菌細胞(40μ lの適切な溶媒内にある)を、3μlのライゲーション混合物を用いて形質転換 し、80μlのSOC培地(Sembrook等、上記)で培養した。37℃で1時間の インキュベーションの後、全ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertan i(LB)寒天(Sembrook等、上記)上にのせた。後日、いくつかのコロニーを各 プレートから無作為に選択し、適切な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレ ートの個々のウェル内に入れられた150μlの液状LB/2xCarb培地で培養した 。さらに後日、5μlの各一昼夜の培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水 で1:10に希釈した後、それぞれ5μlのサンプルをPCRアレイに移した。 PCR増幅のため、4単位のrTthDNAポリメラーゼを含む18μlの濃 縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加えた。増幅は以 下の条件に従って行った。 ステップ1 94℃で60秒間 ステップ2 94℃で20秒間 ステップ3 55℃で30秒間 ステップ4 72℃で90秒間 ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復 ステップ6 72℃で180秒間 ステップ7 4℃(そのまま保持) PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動 させた。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクロ ーンを選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行った。 同様に配列番号:2又は配列番号:4のヌクレオチド配列を用いて、上述の手 順を用いて5’調節配列を得たり、5’延長のために設計されたオリゴヌクレオ チドを得たり、及び適切なゲノムライブラリーを得ることができる。 6 ハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用 配列番号:2又は配列番号:4の配列に基づくハイブリダイゼーションプロー ブを用いて、cDNA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングする。約 20の塩基対からなるオリゴヌクレオチドの標識について特に記すが、大きなc DNAフラグメントの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌクレオチドをOL IGO4.06(National Bioscience)のような最新式のソフトウェアを用いてデザイ ンし、50pmolの各オリゴマーと、250mCiの[γ‐32P]アデノシン三 リン酸 Boston MA)とを組み合わせて用いて標識する。標識されたオリゴヌクレオチド を、SephadexG-25超精細樹脂カラム(Pharmacia)を用いで精製する。毎分107 カウントのセンス及びアンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれを含む部分を 、エンドヌクレアーゼAseI,BglII, したヒトゲノムDNAの典型的な膜べースのハイブリダイゼーション解析におい て用いる。 各切断物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン 膜(Nytran Plus,Schleicher & Schuell,Durham NH)にトランスファーする。ハ イブリダイゼーションは40℃で16時間かけて行う。非特異的シグナルを取り 除くため、ブロットを、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水及び0.5%ドデシ ル硫酸ナトリウムまで段階的に厳密性が増す条件下で、室温にて順次洗浄する。 XOMAT ARTMフィルム (Kodak,Rochester,NY)を、Phosphoimager cassette(Molecular Dynamics,S unnyvale,CA)においてブロットに数時間露光した後、ハイブリダイセーション パターンを視覚的に比較する。 7 マイクロアレイ マイクロアレイ用のオリゴヌクレオチドを作るために、ここに開示したヌクレ オチド配列を、ヌクレオチド配列の3’末端からコンピュータアルゴリズムを用 いて調べる。このアルゴリズムは、その遺伝子に独特な、ハイブリダイゼーショ ンに適した範囲内のGC含量を有し、且つハイブリダイゼーションを妨げるよう な推定される2次構造が存在しない、決まった長さの各オリゴマーを同定する。 このアルゴリズムは、長さ20ヌクレオチドの20個の配列特異的オリゴヌクレ オチド(20量体)を同定する。各配列の中央の1個のヌクレオチドだけが変化し ている点を除いて一致しているオリゴヌクレオチドの組が作り出される。このプ ロセスはマイクロアレイにおける各遺伝子について反復され、20個の二十量体 が2組、光照射化学プロセスを用いてシリコンチップの表面上で合成され配列さ れる(Chee,M.等,PCT/WO95/11995、この引用により本明細書の一部とする) 。 或いは、化学結合プロシージャ及びインクジェット装置を用いて、基板の表面 上でオリゴマーを合成する(Baldeschweiler,J.D.等,PCT/WO95/25116、この 引用により本明細書の一部とする)。更に別の形態では、ドットブロット法(ス ロットブロット法)に類似した「格子型」アレイを用いて、真空システム、熱、 UV、機械的又は化学的結合プロシージャを利用してcDNA断片又はオリゴヌ クレオチドを基板の表面に配置し結合させる。アレイは、手を用いることにより 、又は市販の材料及び機械を用いることによって製造され得、8ドット、24ド ット、94ドット、384ドット、1536ドット、又は6144ドット の格子を有している。ハイブリダイゼーションの後、マイクロアレイを洗浄して ハイブリダイズしていないプローブを取り除き、スキャナーを用いて蛍光のレベ ル及びパターンを求める。スキャンされた画像を調べて、マイクロアレイ上の各 オリゴヌクレオチド配列の相補性の程度及び相対的な量を求める。 8 相補的ポリヌクレオチド HCRPをコードする配列或いはその任意の一部分に対して相補的な配列は、 自然発生のHCRPの発現を低下又は阻害するために用られる。約15〜約30 塩基対からなるアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用について特に記すが、よ り小さな或いはより大きなcDNAフラグメントの場合でも概ね同じ方法を用い ることができる。Oligo4.06ソフトウェア及びHCRPのコーディング配列(配 列番号:1)を用いて、適切なオリゴヌクレオチドを設計することができる。転 写を抑制するためには、最も独特な5’配列から相補的なオリゴヌクレオチドを 設計し、これを用いてプロモーターが結合するのを阻害する。翻訳を阻害するた めには、相補的なオリゴヌクレオチドを設計して、リボソームがHCRPをコー ドする転写物に結合するのを阻害する。 9 HCRPの発現 HCRPの発現は、cDNAを適切なベクター内にサブクローニングし、その ベクターを宿主細胞にトランスフェクトすることによって行われる。この場合、 前にcDNAライブラリーの作製の際に用いたクローニングベクターを用いて、 大腸菌においてHCRPを発現させる。クローニング部位の上流には、β−ガラ クトシダーゼに対するプロモータが存在し、その後ろにはアミノ基末端Met及び β−ガラクトシダーゼの7残基が存在する。後続のこれら8つの残基は、転写に 役立つバクテリオファージプロモーターであり、多くの独特の切断部位を含むリ ンカーで ある。 単離されたトランスフェクト菌株を、IPTGを用いて標準的な方法で誘導し、初 めのβガラクトシダーセの7残基、約5〜15残基のリンカー、及び完全長HC RPからなる融合タンパク質を作り出す。このシグナル配列は菌培地へのHCR Pの分泌を誘導し、この培地は後の活性のアッセイにおいて直接用いることがで きる。 10 HCRP活性の確認 HCRP−1 HCRP−1の活性を、サイクリン−ユビキチン結合アッセイによって測定す る(Aristarkhov等,前出)。反応混合物10μlの量には、40mMのTrisHCl(pH7.6) 、5mMのMgCl2、0.5mMのATP、10mMのホスホクレアチン、1ml当たり50μgのクレ アチンホスホキナーゼ、1mM当たり1mgの還元されたカルボキシメチル化ウシ血清 アルブミン、50μMのユビキチン、1μMのユビキチンアルデヒド、1〜2pmolの1 25 I標識したサイクリンB、1pmolのE1、1μMのオカダ酸、10μgのM期分 画1Aのタンパク質(活性E3−C及び概ね遊離したE2−Cを含む)、及び様 々な量のHCRP−1が含まれている。この反応混合物を、18℃で60分間ィンキ ュベートする。次にサンプルをSDS/12%ポリアクリルアミドゲル上で電気泳動に より分離する。PhosphorImagerによる解析により形成された125I−サイクリン −ユビキチンを定量する。サイクリン−ユビキチン形成の量は、この反応におけ るHCRP−1の量に比例する。 HCRP−2 HCRP−2の活性を、上述したものと同様のアッセイで測定する。この場合 は、固定量の125I標識したサイクリンBを用いる代わりに、可変量の125I標識 したHCRP−2を用い、固定量の精製したE2− Cを、可変量のHCRP−1の代わりに用いる。このような条件の下で、ユビキ チン−HCRP−2の形成量はこの反応におけるHCRP−2の量に比例する。 11 HCRP特異的抗体の産生 標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、PAGE電 気泳動法(Sambrook前出)を用いて実質的に精製されたHCRPを用いる。配列 番号:2から類推されるアミノ酸配列をDNAStarソフトウエア(DNASTAR社)を用 いて解析して免疫抗原性の高い領域を決定し、対応するオリゴペプチドを当業者 には周知の手段により合成して、当業者に周知の方法で抗体を産生するために用 いる。C末端付近の、或いは隣接する親水性領域内のエピトープのような、適切 なエピトープを選択するための解析法は、Ausubel等(上記)の論文他に記載さ れている。 通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、Applied Biosystemsのペ プチドシンセサイザModel 431Aを用いてfmoc法のケミストリにより合成し、 M−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS: Ausubel等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペットヘモシニアン(K LH、Sigma,St.Louls,MO)に結合する。フロイントの完全アジュバントにおい てオリゴペプチド−KLH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血清の 抗ペプチド活性を検査するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、1% BSAを用いてブロックし、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射性ヨウ 素標識されたヤギ抗ウサギIgGと反応させる。 12 特異的抗体を用いる自然発生HCRPの精製 自然発生HCRP或いは組換えHCRPは、HCRPに特異的な抗体を用いる イムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することが できる。イムノアフィニティーカラムは、CnBr-activated Sepharose(Pharmaci a Biotech社)のような活性化クロマトグラフレジンとHCRP抗体とを共有結 合させることにより構築される。結合後、そのレジンを使用説明書の指示に従っ て、ブロックし洗浄する。 HCRPを含む培地をイムノアフィニティーカラムに通し、そのカラムをHC RPを優先的に吸着できる条件下で(例えば界面活性剤の存在下において高イオ ン強度バッファで)洗浄する。このカラムを、抗体/HCRP結合を切るような 条件下(例えばpH2〜3のバッファ、或いは高濃度の尿素またはチオシアン酸 塩イオンのようなカオトロピックイオン)で溶出させ、HCRPを回収する。 13 HCRPと相互作用する分子の同定 HCRP又は生物学的に活性なその断片を、125Iボルトンハンター試薬(Bol ton,A.E.及びW.M.Hunter(1973)Biochem.J.133:529-38)で標識する。マルチウェ ルプレートに予め配列しておいた候補の分子を、標識したHCRPとともにイン キュベートし、洗浄して、標識HCRP複合体を有する任意のウェルをアッセイ する。異なる濃度のHCRPを用いて得られたデータを用いて、候補の分子とH CRPの会合、親和性、数の数値を計算する。 上記のすべての刊行物及び特許明細書は、引用により本明細書の一部とする。 本発明の記載した方法及びシステムの種々の改変は、本発明の範囲及び精神から 逸脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明は特に好適な実施例に関連 して記載されているが、本発明の請求の範囲は、そのような特定の実施例に不当 に制限されるべきではないことを理解されたい。実際には、本発明を実施するた めに記載された方法の種々の改変は、分子生物学或いは関連する分野の専門家に は明らかなように、 請求の範囲内に含まれるものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 43/00 C07K 16/18 111 C12N 1/15 C07K 14/47 1/19 16/18 1/21 C12N 1/15 C12P 21/02 C 1/19 C12Q 1/68 A 1/21 C12N 15/00 ZNAA 5/10 5/00 A C12P 21/02 A61K 37/02 C12Q 1/68 37/48 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR, NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,L S,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AT ,AU,BR,CA,CH,CN,DE,DK,ES, FI,GB,IL,JP,KR,MX,NO,NZ,R U,SE,SG,US (72)発明者 ゲグラー、カーン・ジェイ アメリカ合衆国カリフォルニア州94025・ メンロパーク・オークランドアベニュー 1048 (72)発明者 コックス、ベンジャミン・グリーム アメリカ合衆国カリフォルニア州94306・ パロアルト・ウィルキウェイ 4292―ディ ー (72)発明者 シャー、パルビ アメリカ合衆国カリフォルニア州94087・ サニーベイル・クイーンシャルロットドラ イブ 1608

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1のアミノ酸配列を含む実質的に精製されたサイクリン関連タン パク質又はその断片。 2.請求項1のサイクリン関連タンパク質をコードする単離され精製されたポリ ヌクレオチド配列又は前記ポリヌクレオチド配列の断片又は変異配列。 3.請求項2のポリヌクレオチド配列を含む組成物。 4.請求項2のポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズするポ リヌクレオチド配列。 5.請求項2のポリヌクレオチド配列に相補的なポリヌクレオチド配列又はその 断片若しくは変異配列。 6.配列番号:2の配列を含む単離され精製されたポリヌクレオチド配列又はそ の断片若しくは変異配列。 7.請求項6のポリヌクレオチド配列を含む組成物。 8.請求項6のポリヌクレオチド配列に相補的なポリヌクレオチド配列。 9.請求項2のポリヌクレオチド配列の少なくとも断片を含む発現ベクター。 10.請求項9のベクターを宿主細胞。 11.配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片の製造方法 であって、 (a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項10の宿主細胞を培 養する過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペプチドを回収する過程とを含むこと を特徴とする配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片の製 造方法。 12.配列番号:1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたサイク リン関連タンパク質を、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成物。 13.請求項1のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 14.請求項1のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴニスト。 15.癌の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項12の医薬品組成物を有効な量投与す る過程を含む癌の治療方法。 16.免疫疾患の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項12の医薬品組成物を有効な量投与する 過程を含む免疫疾患の治療方法。 17.生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質をコードするポリヌ クレオチドの検出方法であって、 (a)請求項8のポリヌクレオチドと、生物学的サンプルの核酸材料とをハイ ブリダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程であって、前記複合 体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質をコード するポリヌクレオチドの存在と相関性を有する、該過程とを含むことを特徴とす る生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質コードするポリヌクレオ チドの検出方法。 18.前記核酸材料がPCR法により増幅されることを特徴とする請求項17に 記載の方法。 19.配列番号:3のアミノ酸配列を含む実質的に精製されたサイクリン関連タ ンパク質又はその断片。 20.請求項19のサイクリン関連タンパク質をコードする単離され精製された ポリヌクレオチド又は前記ポリヌクレオチド配列の断片若しくは変異配列。 21.請求項20のポリヌクレオチド配列を含む組成物。 22.請求項20のポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズす るポリヌクレオチド配列。 23.請求項20のポリヌクレオチド配列に相補的なポリヌクレオチド配列又は その断片若しくは変異配列。 24.配列番号:4の配列を含む単離され精製されたポリヌクレオチド配列又は その断片若しくは変異配列。 25.請求項24のポリヌクレオチド配列を含む組成物。 26.請求項24のポリヌクレオチド配列に相補的なポリヌクレオチド配列。 27.請求項20のポリヌクレオチド配列の少なくとも断片を含む発現ベクター 。 28.請求項27のベクターを含む宿主細胞。 29.配列番号:3のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片の製造方法 であって、 (a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で、請求項28の宿主細胞を 培養する過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペプチドを回収すること含むことを特 徴とする配列番号:3のアミノ酸配列を含むポリペプチド又はその断片の製造方 法。 30.配列番号:3のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたサイクリン関連 タンパク質を、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成物。 31.請求項19のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 32.請求項19のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴニスト。 33.請求項19のポリペプチドの効果を低下させる精製されたアンタ ゴニスト。 34.発達障害の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項30の医薬品組成物を有効な量投与す る過程を含む発達障害の治療方法。 35.免疫疾患の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項33の精製されたアンタゴニストを有 効な量投与する過程を含む免疫疾患の治療方法。 36.生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質をコードするポリヌ クレオチドの検出方法であって、 (a)請求項26のポリヌクレオチドと、生物学的サンプルの核酸材料とをハ イブリダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程であって、前記複合 体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質をコード するポリヌクレオチドの存在と相関性を有する、該過程とを含むことを特徴とす る生物学的サンプルにおけるサイクリン関連タンパク質をコードするポリヌクレ オチドの検出方法。 37.前記核酸材料が、PCR法により増幅されることを特徴とする請求項36 に記載の方法。
JP50298899A 1997-06-05 1998-06-05 サイクリン関連タンパク質 Pending JP2002502264A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US87014397A 1997-06-05 1997-06-05
US08/870,143 1997-06-05
PCT/US1998/011735 WO1998055510A2 (en) 1997-06-05 1998-06-05 Human ubiquitin carrier protein e2-like protein and cyclin b-like protein

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2002502264A true JP2002502264A (ja) 2002-01-22

Family

ID=25354862

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP50298899A Pending JP2002502264A (ja) 1997-06-05 1998-06-05 サイクリン関連タンパク質

Country Status (5)

Country Link
EP (1) EP1003880A2 (ja)
JP (1) JP2002502264A (ja)
AU (1) AU7954998A (ja)
CA (1) CA2292643A1 (ja)
WO (1) WO1998055510A2 (ja)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6262249B1 (en) 1998-06-23 2001-07-17 Chiron Corporation Pancreatic cancer genes
CN1328059A (zh) * 2000-06-14 2001-12-26 上海博德基因开发有限公司 一种新的多肽——人细胞周期蛋白g29.13和编码这种多肽的多核苷酸
US20040142325A1 (en) 2001-09-14 2004-07-22 Liat Mintz Methods and systems for annotating biomolecular sequences
WO2004063355A2 (en) * 2003-01-10 2004-07-29 Protein Design Labs, Inc. Novel methods of diagnosis of metastatic cancer, compositions and methods of screening for modulators of matastatic cancer
US20050186600A1 (en) * 2004-01-13 2005-08-25 Osnat Sella-Tavor Polynucleotides encoding novel UbcH10 polypeptides and kits and methods using same

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR9710415A (pt) * 1996-04-01 1999-08-17 Harvard College Novos polipeptideos transportadores de ubiquitina ciclina seletiva

Also Published As

Publication number Publication date
WO1998055510A2 (en) 1998-12-10
EP1003880A2 (en) 2000-05-31
CA2292643A1 (en) 1998-12-10
AU7954998A (en) 1998-12-21
WO1998055510A3 (en) 1999-03-18

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5849528A (en) Polynucleotides encoding a human S100 protein
US6015702A (en) Human ubiquitin-conjugating enzymes
US5888792A (en) ATP-dependent RNA helicase protein
JP2002507124A (ja) ヒト細胞外基質タンパク質
JP2001509026A (ja) 新規なヒトメタロチオネイン
JP2002502242A (ja) ユビキチン結合タンパク質
JP2001514657A (ja) 成長因子受容体結合タンパク質
JP2001526914A (ja) ヒト・調節タンパク質
JP2002503109A (ja) 新規なヒトリボヌクレアーゼ
US6348576B1 (en) Human cornichon molecule
JP2001509018A (ja) P53応答マウス遺伝子ei124に類似なdnaがコードするヒトアポトーシス関連タンパク質
US5892012A (en) Rab Proteins
JP2001508312A (ja) サイトカインシグナリングのサプレッサ
JP2002511737A (ja) ヒト陰イオンチャネル
JP2001511645A (ja) ヒトC5a様受容体
JP2001503621A (ja) ヒトP▲下2x▼プリン受容体
JP2001525675A (ja) 腫瘍関連抗原
JP2002502264A (ja) サイクリン関連タンパク質
US5932420A (en) Polynucleotides encoding a human integral membrane protein
JP2001508664A (ja) ヒト由来のホスファチジルイノシトール4,5−二リン酸5−ホスファターゼ
US6001593A (en) Human myosin heavy chain-like proteins
US5871971A (en) Human developmentally regulated GTP-binding protein
US20020081604A1 (en) Human reticulocalbin isoforms
US5849556A (en) Human growth-related CDC10 homolog
JP2002527028A (ja) ヒトアポトーシス調節タンパク質