JP2002511737A - ヒト陰イオンチャネル - Google Patents

ヒト陰イオンチャネル

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JP2002511737A JP53298198A JP53298198A JP2002511737A JP 2002511737 A JP2002511737 A JP 2002511737A JP 53298198 A JP53298198 A JP 53298198A JP 53298198 A JP53298198 A JP 53298198A JP 2002511737 A JP2002511737 A JP 2002511737A
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Abstract

(57)【要約】 本発明は新規なヒト陰イオンチャネル(NANCH)及びNANCHを同定しコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、NANCHをコードする核酸配列を含む遺伝子組換え発現ベクター及び宿主細胞、及びNANCHの製造方法を提供する。また本発明は、NANCHに特異的に結合するアゴニスト、抗体、又はアンタゴニスト、及びNANCHの発現が関係する疾病の予防及び治療におけるこれらの物質の使用方法を提供する。更に本発明は、NANCHの発現が関係する疾病の治療のための、NANCHをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンス分子の使用方法を提供する。また本発明は、該ポリヌクレオチド又はその断片若しくは相補配列及びNANCHに特異的に結合する抗体を利用する診断検査方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 ヒト陰イオンチャネル技術分野 本発明は、新規なヒト陰イオンチャネルの核酸及びアミノ酸配列、及び癌及び 発達障害の診断、予防、及び治療におけるこれらの配列の使用に関するものであ る。背景技術 塩素イオンチャネルは、体内の概ね全ての細胞の原形質膜に認められる。塩素 イオンチャネルは、上皮膜を通したイオンの吸収及び分泌及び膜電位の調節を含 む様々な細胞機能を媒介する。ゴルジ装置及びエンドサイトーシスの小胞の細胞 内膜に存在する塩素イオンチャネルは、オルガネラのpHの調節も行う(Greger ,R.(1988)Annu.Rev.Physiol.50:111-122を参照)。イオンコンダクタンス、電流 −電圧相関、及びモジュレータに対する感受性を含む電気生理学的及び薬理学的 測定値から、筋肉、ニューロン、線維芽細胞、上皮細胞、及びリンパ球において 異なる塩素イオンチャネルが存在することが示唆されている。 哺乳動物の組織及び細胞系からいくつかの塩素イオンチャネルがクローン化さ れた。これらのタンパク質の配列は多種多様であり、γアミノ酪酸受容体ホモロ グ、嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子、及び他のタンパク質と有意な相同 性を有していない高度に酸性のp64タンパク質が含まれる(Barnard,E.A.等(1 987)Trends Neurosci.10:502-509;Riordan,J.R.等(1989)Science 245:1066-1073 :Landry,D.W.等(1993)J.Biol.Chem.268:14948-14955)。このチャネルの多くは 、上皮細胞における塩素イオンチャネル活性を調節する、プロテインキナーゼA 、プロテインキナーゼC、チロシンキナーゼ、及びカゼインキナーゼIIを含む1 又は2以上のプロテインキナーゼによりリン酸化される 部位を有する。 p64タンパク質は、そのインダニルオキシ酢酸(indanyloxyacetic acid) に対する親和性、即ち既知の上皮塩素イオンチャネルのインヒビターに対する親 和性に基づいてウシ腎皮質膜において初めに同定された(Landry等(1989)Scienc e 244:1469-1472)。単離されたp64タンパク質に対して産生される抗体は、 全ての検出可能な塩素イオンチャネルが活性の可溶化された腎臓の膜を無くすこ とができる。従って、p64は、腎の塩素イオンチャネルの機能的な要素である 可能性が高い(Redhead,C.R.等(1992)Proc.Nail.Acad.Sci.89:3716-3720)。 p64クローンをプローブとして用いたノーザンブロット解析により、ウシの 腎皮質、腎髄質、肝臓、副腎、脳、骨格筋、及び心臓において、サイズが〜2k b乃至〜6.5kbの範囲の近縁なmRNAが検出される。これらの組織の多く は、このプローブとハイブリダイズし得る転写物を有する。これらの転写物の多 様性及び相対的な量の多さは組織特異的であって、このことからp64転写物が 選択的にスプライシングされること、及び/又は近縁な遺伝子のファミリーが発 現されることが示唆されている(Landry等、前出)。 p64の配列から、少なくとも2つの膜を貫通しており細胞質側にアミノ末端 を有する酸性で一体型の膜タンパク質が推定される。このタンパク質は、プロテ インキナーゼC、チロシンキナーゼ、及びカゼインキナーゼIIによるリン酸化可 能部位を有し、且つAsp(235番)において1箇所のN結合グリコシル化部位 を有する。 新規なヒト陰イオンチャネルをコードするポリヌクレオチド、及びその分子自 体は、正常な状態及び疾病状態の吸収性又は分泌性上皮を有する組織における、 膜電位、細胞内pH、細胞容積、シグナル伝達、及び経上皮イオン輸送の調節を 研究する手段となる。新規なヒト陰イオンチ ャネルの発見は、癌及び発達障害の診断及び治療において役立つ新たな物質を提 供することにより、当分野における必要性を満たすものである。発明の開示 本発明は、ウシp64塩素イオンチャネル及びヒトP64CLCPに類似性を 有することを特徴とする、新規なヒト陰イオンチャネルタンパタ質(以下NAN CHと称する)を提供する。 従って、本発明は、配列番号:1に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製さ れたNANCHを提供する。 本発明の或る態様は、NANCHをコードする単離され実質的に精製されたポ リヌクレオチドを提供する。特定の態様では、このポリヌクレオチドは、配列番 号:2のヌクレオチド配列である。 また本発明は、配列番号:2又はその変異体に対して相補的な配列を含むポリ ヌクレオチド配列に関するものである。更に本発明は、配列番号:2の配列と厳 密な条件の下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。 更に本発明は、該ポリペプチドをコードする核酸配列、オリゴヌクレオチド、 ペプチド核酸(PNA)、その断片、一部分又はアンチセンス分子、及びNAN CHをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター及び宿主細胞を提供する 。また本発明は、NANCHに特異的に結合する抗体及び実質的に精製されたN ANCHを含む医薬品組成物を提供する。また本発明は、NANCHのアゴニス ト及びアンタゴニストの使用法を提供する。また本発明は、NANCHが関係す る疾病の治療や、NANCHをコードするポリヌクレオチドの検出のための方法 を提供する。図面の簡単な説明 第1A図、第1B図、及び第1C図は、NANCHのアミノ酸配列(配 列番号:1)及び核酸配列(配列番号:2)を示す。配列のアライメントは、Ma cDNASIS PROTMソフトウエア(Hitachi Software Engineering Co.,Ltd.,San Brun o,CA)を用いて作成した。 第2A図、第2B図、及び第2C図は、NANCH(配列番号:1)、ウシp 64塩素イオンチャネル(G289404;配列番号:3)、及びヒトP64CLCP (G895845;配列番号:4)の間のアミノ酸配列アライメントを示す。この配列 アライメントは、DNASTARTMソフトウエアのマルチシーケンスアライメントプロ グラム(DNASTAR Inc,Madison WI)を用いて作成した。 第3A図及び第3B図はそれぞれ、NANCH(配列番号:1)及びウシp6 4塩素イオンチャネル(配列番号:3)の疎水性プロット(MacDNASIS PROソフ トウエアを用いて作成)を示し、X軸はアミノ酸の位置を表しておりY軸は負の 方向に疎水性のレベルを表している。発明の実施の形態 本発明のタンパク質、核酸配列、及び方法について説明する前に、本発明は、 ここに開示した特定の方法論、プロトコル、細胞系、ベクター、及び試薬に限定 されず、実施形態を変更し得るものと理解されたい。また、ここで用いられる用 語法は、特定の実施例のみを説明する目的で用いられたものであり、請求の範囲 のみによって限定されるものである本発明の範囲を限定することを意図したもの ではないということも理解されたい。 本明細書及び請求の範囲において、単数を表す「1つの」及び「その」と形容 された表現(または数を表す表現を付していない場合)は、前後関係でそうでな いことが明らかである場合以外は、複数の意味も含んでいることに注意しなけれ ばならない。従って、例えば「宿主細胞」なる表記が表すものには、複数のその ような宿主細胞が含まれ、「抗体」な る表記は、1またはそれ以上の抗体及び当業者に周知のその等価物等も表してい る。 本明細書における全ての科学技術専門用語は、別の意味で定義されていない場 合には、本発明の属する技術分野の専門家に一般に理解されるのと同じ意味を有 する。ここに説明したものと類似のまたは等価な方法や材料を本発明の実施や試 験において用いることができるが、好適な方法、装置、及び材料はここに説明さ れている。本明細書に記載された全ての文献は、本発明の関連において用いられ 得る文献で報告された細胞系、ベクター、及び方法論を説明し開示する目的で引 用されたものであり、この引用により本明細書と一体にされる。 定義 本明細書において「核酸配列」は、一本鎖か二本鎖の、センス鎖又はアンチセ ンス鎖である、ゲノム起源又は合成起源のDNA、RNAや、オリゴヌクレオチ ド、ヌクレオチド、又はポリヌクレオチド、及びその断片又は一部分である。同 様に、本明細書において「アミノ酸配列」は、自然発生の分子または合成分子の 、オリゴペプチド、ペプチド、ポリペプチド若しくはタンパク質配列及びその断 片又は一部分である。 ここでは「アミノ酸配列」は、自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を指す ものとして説明されているが、「アミノ酸配列」や類似の用語、例えば「ポリペ プチド」又は「タンパク質」は、アミノ酸配列を、説明されるタンパク質分子に 関連する完全で元のままのアミノ酸配列に限定する意味で用いられてるのではな い。 本明細書において「ペプチド核酸」は、リジンのようなアミノ酸残基及びアミ ノ基が加えられたオリゴマーを含む分子である。これらの小分子は抗遺伝子剤と も称され、それに対して相補的な核酸の鎖に結合する ことにより転写物の伸長を停止させる(Nielsen,P.E.等(1993)Anticancer Drug Des.8:53-63)。 本明細書において、NANCHは、任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、マウ ス、ウマ、及び好ましくはヒトを含む哺乳類から得られる、天然の、合成の、半 合成の、又は組換え体の何れかを起源とする実質的に精製されたNANCHのア ミノ酸配列である。 本明細書において「コンセンサス」は、再度シークエンシングされて不要な塩 基が分離された核酸配列か、XL-PCRTM(Perkin Elmer,Norwalk,CT)を用いて5 ’方向及び/または3’方向に延長されて、再度シークエンシングされた核酸配 列か、GELVIEWTM Fragment Assembly system(GCG,Madison WI)を用いて2以上の インサイト社クローンの重複した配列を元に組み合わせて構成された核酸配列か 、若しくは延長と組み合わせの双方によって形成された核酸配列の何れかである 。 本明細書においてNANCHの「変異体」は、1又は2箇所以上のアミノ酸が 変異したアミノ酸配列である。この変異体は「保存的」変化を含むものであり得 、この保存的変化においては、例えばロイシンをイソロイシンで置き換える場合 のように置換されるアミノ酸が類似な構造的及び化学的特性を有する。稀に、変 異体が「非保存的」に変化する場合もあり、この非保存的変化では例えばグリシ ンがトリプトファンで置換される。類似した小変化には、アミノ酸の欠失か挿入 、若しくはその両方も含まれる。例えばDNASTARソフトウエアのような良く知ら れたコンピュータプログラムを用いて、生物学的或いは免疫学的活性を損なわず に置換、挿入、又は除去できるアミノ酸が何れかということ、及びそのようなア ミノ酸がいくつかということを決定することができる。 本明細書において「欠失」は、1または2以上のヌクレオチド若しく はアミノ酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化で ある。 本明細書において「挿入」或いは「付加」は、自然発生の分子と比較して、そ れぞれ1または2以上のヌクレオチド、アミノ酸残基が加わるような、ヌクレオ チド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。 本明細書において「置換」は、それぞれ1または2以上のヌクレオチド或いは アミノ酸を、異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる 変化である。 本明細書において、用語「生物学的に活性」は、自然発生の分子の構造的機能 、調節機能、又は生化学的機能を有するタンパク質である。同様に「免疫学的に 活性」は、天然の、組換え体の、又は合成のNANCH、若しくはその任意のオ リゴペプチドが適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗体 に結合する能力である。 本明細書において、用語「アゴニスト」は、NANCHに結合したとき、NA NCHの活性を変調するようなNANCHの変化を生じさせる分子である。アゴ ニストには、NANCHに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の他の分子 が含まれ得る。 本明細書において、用語「アンタゴニスト」または「インヒビター」は、NA NCHに結合したとき、NANCHの活性を阻害する分子である。アンタゴニス ト及びインヒビターには、NANCHに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任 意の他の分子が含まれ得る。 本明細書において、用語「変調」は、NANCHの生物学的活性の変化又は変 質である。変調は、タンパク質活性の上昇や低下、結合特性の変化、又はNAN CHの生物学的、機能的、免疫学的特性の他の変化であり得る。 本明細書において、用語「擬似物」は、NANCHまたはその一部分 の構造の知識からその構造を知ることができ、そのようなものとして、ウシp6 4様分子の作用の一部または全てに影響を与え得る分子である。 本明細書において、用語「誘導体」は、NANCHをコードする核酸又はコー ドされたNANCHを化学的に修飾したものを意味する。このような修飾の例に は、水素からアルキル基、アシル基、又はアミノ基への置換がある。核酸誘導体 は、未修飾NANCHの必須の生物学的特性を保持しているポリペプチドをコー ドする。 本明細書において、用語「実質的に精製」は、天然の環境から取り除かれ、天 然にはそれが結合して存在する他の構成要素から単離又は分離されて、その構成 要素が60%以上、好ましくは75%以上、最も好ましくは90%以上除去され た核酸配列又はアミノ酸配列である。 本明細書において「増幅」は、核酸配列の更なる複製物を生成することであり 、通常は当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて行われる(D ieffenbach,C.W.及びG.S.Dveksler(1995)PCR Primer.a Laboratorv Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,NY)。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション(ハイブリッド形成)」は 、核酸の鎖が塩基対合を介して相補鎖と結合する過程である。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なG塩 基とC塩基の間及び相補的なA塩基とT塩基の間での水素結合の形成によって、 2つの核酸配列で形成された複合体である。これらの水素結合は、塩基スタッキ ング相互作用(base stacking interaction)により更に安定化され得る。この 2つの相補的核酸配列は水素結合して、逆平行構造をなす。ハイブリダイゼーシ ョン複合体は、溶液中で形成されるか(例えばC0t又はR0t解析)、或いは核 酸は溶液中に存在する一方の核酸と、固定支持体(例えばin situハイブリダイ セーションの ために細胞が固定されるメンブラン、フィルタ、ピン、またはスライドガラス) に固定化された他方の核酸との間で形成され得る。 本明細書において、用語「相補的」または「相補性」は、許容的な塩及び温度 の条件の下での塩基対によるポリヌクレオチド同士の自然の結合である。例えば 、配列「A−G−T」は相補的配列「T−C−A」に結合する。2つの二本鎖分 子間の相補性は、核酸の幾つかのみが結合している「部分的」なものであるか、 若しくは一本鎖分子間に完全な相補性が存在する場合は完全に相補的であり得る 。核酸鎖同士の相補性の程度は、核酸鎖同士のハイブリダイゼーションの効率及 び強度に有意な影響を与える。このことは、核酸鎖同士の結合によって左右され る増幅反応において特に重要である。 本明細書において、用語「相同性」は、相補性の程度である。部分的な相同性 と、完全な相同性(即ち同一性)の場合があり得る。部分的に相補的な配列は、 同一の配列が標的の核酸とハイブリダイズするのを少なくとも部分的に阻害する ものであり、これを機能的な用語「実質的に相同な」を用いて表す。完全に相補 的な配列と標的配列とのハイブリダイゼーションの阻害は、低い厳密性の条件の 下で、ハイブリダイゼーションアッセイ(サザンブロット法またはノーザンブロ ット法、溶液ハイブリダイゼーション等)を用いて検定することができる。実質 的に相同な配列またはプローブは、低い厳密性の条件の下で標的の配列と、完全 に相同な配列またはプローブとの結合(即ちハイブリッド形成)について競合し 、それを阻害する。これは、低い厳密性の条件が、非特異的な結合を許容するよ うなものであると言っているのではない。低い厳密性の条件では、2つの配列の 相互の結合が特異的(即ち選択的)相互作用であることが必要である。非特異的 結合が存在しないことは、部分的な程度の相補性(即ち約30%未満の同一性) を有していない第2の標的 配列を用いることにより試験できる。非特異的結合が存在しない場合、プローブ は第2の非相補的標的配列とハイブリダイズしない。 周知のように、多数の等価な条件を用いて、低い厳密性条件か高い厳密性条件 の何れかを含むようにすることができる。例えば配列の長さ及び性質(DNA、 RNA、塩基構成)、標的の性質(DNA、RNA、塩基構成、溶液中に存在す るか或いは固定化されているか等)、及び塩や他の成分の濃度(例えばホルムア ミド、デキストラン硫酸、及び/またはポリエチレングリコールの有無)のよう な要素を考慮してハイブリダイゼーション溶液を変え、上に列挙した条件とは異 なるが等価である低い厳密性または高い厳密性の何れかの条件を作り出すことが できる。 本明細書において、用語「厳密な条件」は、約(Tm−5)℃(プローブの融 解温度(Tm)より5℃下)からTmの約20〜25℃下まで範囲で生ずる「厳 密性」である。当業者には理解されるように、ハイブリダイゼーションの厳密性 は、同一のポリヌクレオチド配列の同定や検出のためであるか、或いは近縁なポ リヌクレオチド配列の同定や検出のためであるかによって変えることができる。 本明細書において用語「アンチセンス」は、特定のDNAまたはRNA配列に 対して相補的なヌクレオチド配列である。「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖 に対して相補的な核酸鎖の意味で用いられる。アンチセンス分子は、相補的鎖の 合成が可能なウイルスプロモータに、目的の遺伝子を逆方向に結合することによ る合成を含む任意の方法で作り出すことができる。この転写された鎖は、一度細 胞内に導入されると、細胞によって作られた天然の配列と結合して二重鎖を形成 する。次にこれらの二重鎖は更なる転写や翻訳を阻害する。このようにして、変 異体の表現型を作り出すことができる。「ネガティブ」なる表現はアンチセンス 鎖の意味で時折用いられ、「ポジティブ」はセンス鎖の意味で用いられ ることがある。 本明細書において、(「所与のタンパク質の一部分」と用いられるような)タ ンパク質に関連する用語「一部分」は、そのタンパク質の断片である。この断片 のサイズは4つのアミノ酸残基から、(全アミノ酸配列−1)個のアミノ酸の範 囲に亘る。従って、「配列番号:1のアミノ酸配列の少なくとも一部分を含む」 タンパク質は、完全長ヒトNANCHとその断片を含む。 本明細書の定義では、「形質転換」は、外来DNAが入り込みレシピエント細 胞を変化させるプロセスを意味する。このプロセスは、よく知られた種々の方法 を用いた天然または人工の条件の下で生じ得る。形質転換は、外来核酸配列を原 核細胞または真核細胞の宿主細胞に導入するための任意の既知の方法に基づいて いる。この方法は形質転換される宿主細胞によって選択され、以下のものに限定 されないが、ウイルス感染、電気穿孔法、リポフェクション、及び微粒子銃を用 いる方法が含まれ得る。このように「形質転換された」細胞は、その中で挿入さ れたDNAが自律的に複製するプラスミドとして、或いは宿主の染色体の一部と して複製が可能な安定的に形質転換された細胞を含む。またこのような細胞は、 限られた時間だけ導入されたDNAの一過性の発現をする細胞も含む。 本明細書において、用語「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の一部 分(即ちエピトープ)である。タンパク質またはタンパク質の断片を用いてホス トの動物を免疫すると、このタンパク質の種々の領域が、該タンパク質上の所定 の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘発し得る。これらの 領域または構造を抗原決定基と称する。抗原決定基は、抗体への結合について、 そのままの抗原(即ち免疫応答を引き出すために用いられる免疫原)と競合し得 る。 本明細書において、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」は、抗体 及びタンパク質またはペプチドの相互作用が、タンパク質上の特定の構造(即ち 抗原決定基またはエピトープ)の存在に左右されることを意味している。つまり 、この抗体はタンパク質全体ではなく、特定のタンパク質構造を認識して結合す る。例えば、抗体がエピトープ「A」に対して特異的である場合、標識した「A 」及びその抗体を含む反応において、エピトープA(つまり結合していない、無 標識のA)を含むタンパク質が存在すると、抗体に結合した標識Aの量が低下す る。 本明細書において、用語「サンプル」は、その最も広い意味で用いられる。N ANCHをコードする核酸またはその断片を含む疑いのある生物学的サンプルは 、細胞、細胞から単離された染色体(例えば中期染色体の展開物)、(溶液中の 、または例えばサザンブロット解析用に固体支持体に結合した)ゲノムのDNA 、(溶液中の、または例えばノーザンブロット解析用に固体支持体に結合した) RNA、(溶液中の、または固体支持体に結合した)cDNA、細胞や組織から の抽出物、その他を含み得る。 本明細書において、「ポリヌクレオチドの発現と相関性を有する」なる表現は 、ノーザン解析ハイブリダイゼーションアッセイにより、配列番号:2に類似な リボ核酸の存在が検出されることが、サンプル内のNANCHをコードするmR NAの存在を表しており、従って該タンパク質をコードする遺伝子からの転写物 の発現と相関性を有しているということを表している。 本明細書において、配列番号:2のポリヌクレオチドにおける「変異」は、ハ イブリダイゼーションアッセイを用いて検出され得る欠失、挿入、及び点変異を 含む、NANCHをコードするポリヌクレオチドの配列における変化を含む。こ の定義に含まれる変異は、(例えば、配列番号: 2とハイブリダイズし得る制限断片長の多形性のパターンの変化による)NAN CHをコードするゲノムのDNA配列に対する変異の検出、(例えばアレル特異 的オリゴヌクレオチドプローブを用いる)ゲノムDNAのサンプルと配列番号: 2の選択された断片とがハイブリダイズ不可能であること、及び(例えば中期染 色体展開物との蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)を用いた)NAN CHをコードするポリヌクレオチド配列に対する正常な遺伝子座以外の遺伝子座 とのハイブリッド形成のような、不適当な或いは予期していないハイブリダイゼ ーションによって検出される。 本明細書において、用語「抗体」は、そのままの抗体分子及び、例えば抗原決 定基と結合し得るFa、F(ab')2、及びFvのようなその断片である。NANCHポ リペプチドに結合する抗体は、そのままのポリペプチド、或いは免疫化する抗原 としての目的の小型のペプチドを含む断片を用いて調製することができる。動物 を免疫するのに用いられるポリペプチドまたはペプチドは、翻訳されたcDNA または化学的合成物を起源とするものであり得、必要ならば担体タンパク質と結 合することができる。ペプチドに化学的に結合する通常用いられる担体には、ウ シ血清アルブミン及びサイログロブリンが含まれる。次にこの結合したペプチド を用いて動物(例えばマウス、ラット、またはウサギ)を免疫する。 本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力をそのまま保持しつ つ、ヒトの抗体により近づけるために非抗体結合領域においてアミノ酸を置換し た抗体分子である。 発明 本発明は、新規なヒト陰イオンチャネル(NANCH)の発見、NANCHを コードするポリヌクレオチド、及び癌及び発達障害の診断、予 防、又は治療のためのこれらの物質の使用に基づくものである。 本発明のヒトNANCHをコードする核酸配列は、hNT2神経細胞系cDNAラ イブラリー(HNT2RAT01)を起源とするインサイト社クローンNo.259592にお いて、アミノ酸配列アライメントのコンピュータ検索により初めに同定された。 コンセンサス配列の配列番号:2は、以下の重複及び/又は延長された核酸配列 、即ちインサイト社クローンNo.040177(TBLYNOT01を起源);259592(HNT2RAT01 を起源);311528(LUNGNOT02を起源);760901(BRAITUT02を起源);1522436(BLADTU T04を起源);及び2134172(ENDCN0T01を起源)から構成されたものである。 或る実施例では、本発明は、第1A図、第1B図、及び第1C図に示す配列番 号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドを包含する。NANCHは253個の アミノ酸からなる長さを有し、膜貫通可能ドメインを残基19〜54番(2回の膜貫 通に十分な長さである)及び残基187〜201番に有しており、また残基116〜129番 にβシート形成型膜貫通可能ドメインを有している。NANCHのコンセンサス 配列は、S(236番)にプロテインキナーゼC及びカゼインキナーゼIIによる リン酸化可能部位を、Y(244番)にチロシンキナーゼによるリン酸化可能部位 を、且つT(252番)にcAMP依存性プロテインキナーゼによるリン酸化可能 部位を有している。これらのリン酸化可能部位は、全てNANCHのC末端の近 傍に位置している。NANCHはウシp64塩素イオンチャネル(GI289404;配列 番号:3)及びヒトP64CLCP(GI 895845;配列番号:4)と化学的及び構造 的相同性を有している。このことは、NANCHが吸収性又は分泌性上皮を含む 組織における経上皮イオン輸送の調節に関与していることを示唆している。 相同な領域では、NANCHはGI 289404及びGI 895845とそれぞ れ76%及び65%の配列同一性を共有している(第2A図、第2B図、及び第 2C図)。GI 289404はNANCH又はGI 895845より著しく長く、その初めの2 00個のアミノ酸残基は、NANCH又はGI 895845の何れにも有意な対応部分 が存在しない。このことは、種の違い、選択的スプライシング、及び/又は遺伝 子ファミリーの異なるメンバーからの転写を反映していると考えられる。第3A 図及び第3B図に示すように、NANCHとGI 289404は相同な領域において類 似な疎水性プロットを有する。ノーザン解析の結果から、血管内皮細胞及び左心 室、及び胃、肺、腎臓、舌、結腸、大腸、膵臓、副腎、甲状腺、膀胱、及び膵臓 を含む分泌及び吸収に関与する組織を起源とするライブラリーにおけるNANC H配列の発現がわかる。16種のライブラリー(55%)は腫瘍及び胎仔組織を 起源とするものであり、このことはNANCHが細胞成長の調節に関連を有して いることを示唆している。 また本発明は、NANCH変異体を包含する。好適なNANCH変異体は、N ANCHアミノ酸配列(配列番号:1)と80%以上、より好適には90%以上 のアミノ酸配列同一性を有するものである。最も好適なNANCH変異体は、配 列番号:1と95%以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。 また本発明は、NANCHをコードするポリヌクレオチドを包含する。従って 、NANCHのアミノ酸配列をコードする核酸配列を用いて、NANCHを発現 する組換え分子を作りだすことができる。特定の実施例では、本発明は、第1A 図、第1B図、及び第1C図に示すような配列番号:2の核酸配列を含むポリヌ クレオチドを包含する。 当業者には理解されるように、遺伝暗号の縮重の結果、任意の既知の自然発生 遺伝子のヌクレオチド配列と最小限の相同性しか有していないものも含めて、多 種のNANCHコーディングヌクレオチド配列が作り 出され得る。本発明は、可能なコドン選択に基づく組み合わせを選択することに より作り出され得る、全ての可能な核酸配列の変異をその範囲に含んでいる。そ れらの組み合わせは、自然発生のNANCHのヌクレオチド配列に適用されるよ うな標準的なトリプレット遺伝暗号に基づいて作り出されるものであり、このよ うな全ての変異は、ここに具体的に示されたものと考えられたい。 NANCH及びその変異体をコードするヌクレオチド配列は、適切に選択され た厳密性の条件の下で自然発生配列のヌクレオチド配列とハイブリッド形成可能 なものであるのが好ましいが、実質的に異なるコドンの使用頻度を有するNAN CH又はその変異体をコードするヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり 得る。コドン選択は、特定のコドンが宿主によって使用される頻度に従って、特 定の原核細胞又は真核細胞の発現宿主におけるペプチド発現の発生率を高めるよ うに選択することができる。NANCH及びその誘導体をコードするヌクレオチ ド配列を、コードされるアミノ酸配列を変えないように実質的に変更する理由は 、例えば自然発生配列から作り出される転写物より長い半減期のような、より望 ましい特性を有するRNA転写物を作り出すためである。 本発明の範囲には、NANCH又はその誘導体をコードするDNA配列又はそ の一部の、完全な合成ケミストリによる作製も含まれる。作製したこの合成遺伝 子を、この出願時点において周知の試薬を用いて任意の入手可能なDNAベクタ ー及び細胞系に挿入することができる。更に、合成ケミストリを用いてNANC Hをコードする配列又はその任意の一部分に突然変異を誘発させることができる 。 また本発明の範囲に含まれるものとして、種々の厳密性の条件の下で請求項に 記載のヌクレオチド配列、特に配列番号:2のヌクレオチド配列とハイブリダイ ズし得るポリヌクレオチド配列がある。ハイブリダイ ゼーション条件は、Wahl,G.M.及びS.L.Berger(1987:Methods Enzymol.152:399- 407)及びKimmel,A.R.(1987:Methods in Enzymol.152:507-511)に記載されている ように、核酸結合複合体またはプローブの融解温度(Tm)に基づいており、規 定の厳密性において用いられ得る。 本発明の範囲に含まれるNANCHをコードする変異核酸配列は、異なるヌク レオチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に同一の、または機能的に 等価のNANCHポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとなるものである 。コードされたタンパク質も、サイレント変化を生ずるアミノ酸残基の欠失、挿 入並びに置換を含み、結果的に機能的に等価なNANCHとなる。意図的な(de liberate)アミノ酸置換は、NANCHの生物学的活性が保持される限りにおい て、残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性並びにまた両親媒性についての 類似性に基づいてなされ得る。例えば負に荷電したアミノ酸にはアスパラギン酸 及びグルタミン酸が含まれ、正に荷電したアミノ酸にはリジン及びアルギニンが 含まれ、近い親水性値を持つ荷電していない極性頭基を有するアミノ酸には、ロ イシン、イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、グルタミ ン、セリン、スレオニン、フェニルアラニン並びにチロシンが含まれる。 更に本発明の範囲に含まれるものとして、NANCHのアレルがある。ここで 用いる「アレル」或いは「アレル配列」とは、NANCHの対立形である。アレ ルは変異、すなわち核酸配列の変化によって生じ、一般に変異したmRNA或い はポリペプチドを生成するが、そのmRNA或いはポリペプチドの構造或いは機 能は、変わる場合もあれば変わらない場合もある。遺伝子によっては、アレル形 が存在しないもの、1つ存在するもの、或いは多数存在するものがある。一般に アレルを生じる変異 はアミノ酸の自然な欠失、付加並びに置換に起因する。このタイプの変化はそれ ぞれ単独で、或いは他の変化と同時に、与えられた配列内で1又は2回以上生じ 得る。 当業者が一般に利用可能な周知のDNA配列決定のための方法が、本発明の実 施において用いられ得る。この方法では酵素、例えばDNAポ Cleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)、熱安定性T7ポリメラーゼ(A mersham,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Gaithersburg MD)Methods社から市販 されているELONGASE増幅システムのような校正エキソヌクレアーゼと組換え体ポ リメラーゼとの組み合わせのような酵素を使用する。この処理は、Hamilton Mic ro Lab2200(Hamilton,Reno,NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reser ch,Watertown MA)並びにABI377 DNAシーケンサ(Perkin Elmer)のような装置 を用いて自動化するのが好ましい。 NANCHをコードする核酸配列は、部分的なヌクレオチド配列と、プロモー ター及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当業者には周知の様 々な方法とを用いて伸長させることができる。例えば、用いることができる或る 方法、即ち「制限部位」PCR法では、汎用プライマーを用いて既知の座位に隣 接する未知の配列を得る(Sarkar,G.(1993)PCR Methods Applic 2:318-322)。 詳述すると、まずゲノムDNAを、既知の領域に対して特異的なプライマー及び リンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅する。増幅された配列を、その 同じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に含まれる別の特異的プラ イマーを用いてPCRの2巡目にかける。PCRの各回の生成物を、適切なRN Aポリメラーゼを用いて転写させ、逆転写酵素を用いて配列決定する。 逆PCR法を用いて、既知領域に基づく多様なプライマーを利用した配列の増 幅、または伸長を行うことができる(Triglia,T.等(1988)Nucleic Acids Res 16:8186)。プライマーは、OLIGO4.06(NationalBiosciences社,Plymouth MN) や別の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌクレオチドで、50%以 上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的配列にアニールするよう に設計される。この方法ではいくつかの制限酵素を用いて遺伝子の既知領域の適 当な断片を作り出す。次にこの断片を分子内ライゲーションにより環状にし、P CR用の鋳型として使用する。 使用できる別の方法はキャプチャPCR法であり、この方法ではヒト及び酵母 菌人工染色体DNA内の既知の配列に隣接するDNA断片をPCR増幅する(La gerstrom,M.等(1991)PCR Methods Applic 1:111-119)。この方法では、PC R処理の前に、DNA分子の未知の部分に、複数の制限酵素による消化及びライ ゲーションによって組換え二本鎖配列を配置しておいてもよい。 未知の配列を得るために用いることができる別の方法は、Parker,J.D.等の方 法(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-3060)である。更に、PCR、ネスト化 プライマー、PromoterFinderTMライブラリーを用いて、ゲノムDNA内歩行を行 うことができる(Clontech,Palo Alto CA)。このプロセスは、ライブラリーを スクリーニングする必要がなく、イントロン/エクソン接合部を探し出すのに有 用である。 完全長cDNAをスクリーニングするときに好適なライブラリーは、サイズ選 択された、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダムプライ ミングした(rondom primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流領域を含 む配列をより多く含むという点で好適である。ランダムプライミングしたライブ ラリーは、オリゴd(T)ライブラリ ーで完全長cDNAが得られない場合に特に有用である。またゲノムライブラリ ーは、5’及び3’非翻訳領域への配列の伸長のために役立ち得る。 配列決定やPCRの産物のヌクレオチド配列をサイズ分析したり確認するため には、市販のキャピラリー電気泳動システムを用いることができる。詳述すると 、キャピラリーシークエンシングでは、電気泳動による分離のための流動性ポリ マー、レーザーで活性化される4つの異なる蛍光色素(各ヌクレオチドに対して 1つ)を使用し、CCDカメラにより放射線の波長の検出を行う。出力/光強度 は適切なソフトウエア(例えばPerkin elmer製のGenotyperTM及びSequence Navi gatorTM)を用いて電気信号に変換され、サンプルの負荷からコンピュータ解析 及び電子データ表示までの全過程がコンピュータ制御される。キャピラリー電気 泳動法は、特定のサンプル内に限られた量だけ存在するDNA小片の配列決定に 特に適している。 本発明の別の実施例では、NANCH、融合タンパク質或いはその機能的等価 物をコードするポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのNANCHの発 現を誘導する組換えDNA分子において用いることができる。遺伝暗号固有の縮 重のために、同一か機能的に等価なアミノ酸配列を実質的にコードする他のDN A配列も、NANCHのクローニングや発現のために用いることができる。 当業者には理解できるように、非自然発生コドンを有するNANCHコードデ ィングヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る。特定の原核細胞或い は真核細胞の宿主において選好されるコドンを選択して、例えば、NANCH発 現率を増大させたり、或いは自然発生配列から生成された転写物より長い半減期 のような望ましい特性を有する組換えRNA転写物を生成することができる。 本発明のヌクレオチド配列は、様々な目的、例えば、以下のものに限定はしな いが遺伝子産物のクローニング、プロセシング及び/又は発現を変えるようにN ANCHをコードする配列を改変するために既知の方法を用いて組換えることが できる。無作為断片によるDNA再編成や遺伝子断片のPCR再会合及び合成オ リゴヌクレオチドを用いて、ヌクレオチド配列を組換えることができる。例えば 、特定部位突然変異誘発のような当業者には周知の技術を用いて突然変異を誘発 させることによって、新しい制限部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、コ ドン選好の変化、スプライスバリアントの生成等をもたらすことができる。 本発明の別の実施例では、そのままのNANCHコーディング配列、変異NA NCHコーディング配列、又は組換えNANCHコーディング配列を異種の配列 に結合して、融合タンパク質をコードする配列にする。例えば、NANCH活性 のインヒビターをペプチドライブラリーからスクリーニングする場合、市販の抗 体により認識される異なるペプチドを発現するキメラNANCHタンパク質をコ ードすることが役立つ。融合タンパク質はNANCH配列と異種のタンパク質配 列との間の位置に切断部位を有するように設計することもでき、これによってN ANCHを切断して、ヘテロの部分から分けて精製することが可能となる。 本発明の別の実施例では、当業者によく知られた化学的方法(Caruthers.M.H. 等(1980)Nuc Acids Res Symp Ser 7:215-223:Horn,T.等(1980)Nucl.Acids Res Symp.Ser.225-232参照)を用いて、NANCHコーディング配列の全体、或い はその一部を合成することができる。別法では、化学的方法を用いてタンパク質 自体を作り出して、NANCHアミノ酸配列の全体或いはその一部を合成するこ とができる。例えば、種々の固相技術(Roberge,J.Y.等(1995)Science 269:202- 204)でペプチド合成を行うことができ、合成の自動化は、例えばABI 431A ペプチドシンセサイザ(Perkin Elmer)を用いることにより達成することができ る。 この新たに合成されたペプチドは、分離用高速液体クロマトグラフィにより実 質的に精製することができる(例えばCreighton T.(1983)Proteins Structure And Molecular Principles ,WH Freeman and Co.,NY参照)。合成されたペプチ ドの構成は、アミノ酸解析或いはシークエンシングにより確認することができる (例えばエドマン分解法;Creighton,上述)。さらにNANCHのアミノ酸配 列或いはその任意の部分を、その直接の合成の際の改変することにより、及び/ 又は化学的方法を用いた他のタンパク質或いはその任意の部分に由来する配列と の結合することによって変異体ポリペプチドを作ることができる。 生物学的に活性なNANCHを発現させるために、NANCHコーディングヌ クレオチド配列或いはその機能的等価物を、適切な発現ベクター、すなわち挿入 されたコーディング配列の転写及び翻訳に必要な要素を含むベクターに挿入する 。 NANCHコーディング配列及び適切な転写や翻訳の調節領域を含む発現ベク ターを作製するために当業者に周知の方法が用いられる。これらの方法には、in vitro組換えDNA技術、合成技術、並びにin vivo組換え技術、又は遺伝子組 換え技術が含まれる。このような技術は、Sambrook,J.等(1989)Molecular Cloni ng,A Laboratory Manual ,Cold Spring Harbor Press,Planview NY及びAusubel,F .M.等Current Protocol in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York NY に記載されている。 種々の発現ベクター/宿主系を、NANCHコーディング配列を保持し、かつ 発現するために利用することができる。このようなものには、以下のものに限定 はされないが、組換えバクテリオファージ、プラスミ ド或いはコスミドDNA発現ベクターで形質転換した細菌のような微生物や、酵 母菌発現ベクターで形質転換した酵母菌や、ウイルス発現ベクター(例えばバキ ュロウイルス)を感染させた昆虫細胞系や、ウイルス発現ベクター(例えばカリ フラワーモザイクウイルスCaMV、タバコモザイクウイルスTMV)をトランスフェ クトした、或いは細菌の発現ベクター(例えばTi、或いはpBR322プラスミド)で 形質転換した植物細胞系や、或いは動物細胞系が含まれる。 これらの系の「調節領域」或いは「制御配列」は、転写及び翻訳を実行するた めに宿主細胞のタンパク質と相互作用するベクターの非翻訳領域、即ちエンハン サー、プロモーター及び3’非翻訳領域である。このようなエレメントの、強さ 及び特異性は様々であり得る。利用されるベクター及び宿主に応じて、構成的及 び誘導的プロモーターを含む任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントを用いる ことができる。例えば、細 (Stratagene,LaJolla CA)のハイブリッドlacZプロモーター及びptrp-lacハイ ブリッド等のような誘導的プロモーターを用いることができる。バキュロウイル スポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞において用いることができる。植物細胞 のゲノムに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例えば熱ショック遺伝子,R UBISCO及び貯蔵タンパク質遺伝子)、若しくは植物ウイルスに由来するプロモー ター或いはエンハンサ(例えばウイルス性プロモータ或いはリーダー配列)を、 ベクターにクローン化してもよい。哺乳動物細胞では、哺乳類遺伝子或いは哺乳 類ウイルス由来のプロモーターが最適である。NANCHをコードする配列の多 数の複製を含む株細胞を作る必要がある場合には、SV40或いはEBVに基づくベク ターを適切な選択マーカーと共に用いる。 細菌系では、NANCHの用途に応じて多数の発現ベクターを選択す ることができる。例えば抗体誘発のために大量のNANCHが必要とされる場合 は、容易に精製される融合タンパク質を高レベルで発現できるベクターが望まし い。そのようなベクターには、以下のものに限定はしないが、多機能の大腸菌ク ローニング・発現ベクター、例えば する配列を、アミノ末端メチオニン及び後続のβ−ガラクトシダーゼの7残基の 配列を備えたフレーム内においてベクターに結合してハイブリッドタンパク質を 生成できる)や、pINベクター(Van Heeke,G.及びS.M.Schuster(1989)J.Biol. Chem.264:5503-5509)等が含まれる。またpGEXベクター(Promage、Madison WI )も、グルタチオンS−トランスファーゼ(GST)を有する融合タンパク質として 異種ポリペプチドを発現するため用いることができる。一般に、そのような融合 タンパク質は可溶性であり、グルタチオンアガロースビーズへ吸着させた後、遊 離グルタチオンの存在下で溶出させることにより溶解した細胞から容易に精製で きる。その系において生成されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン或いはX A因子プロテアーゼ切断部位を含めて、目的のクローン化ポリペプチドをGST部 分から随意に放出させることができるように設計される。 酵母菌、サッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)では、α因 子、アルコールオキシダーゼ及びPGHのような構成的或いは誘導的プロモーター を含む多数のベクターを用いることができる。その概要を知るには、Ausubel等 (前出)及びGrant等(1987)Methods Enzymol 153:516-544を参照されたい。 植物発現ベクターを用いる場合には、NANCHをコードする配列の発現は、 多数のプロモーターの何れかで促進される。例えばCaMVの35S及び19Sプロモータ ーのようなウイルスのプロモーターを、単独で、 或いはTMV(Takamatsu,N.等(1987)EMBO J 6:307-311)由来のオメガリーダー 配列と共に用いることができる。別法として、RUBISCOの小サブユニット、或い は熱ショックプロモーターのような植物プロモーターが用いてもよい(CoruzzI,G .等(1984)EMBO J 3:1671-1680);Broglie,R.等(1984)Science 224:838-843; 及びWinter,J.等(1991)Results Probl.Cell Differ.17:85-105)。これらの構 成は、直接のDNA形質転換或いは病原体によるトランスフェクションにより植 物細胞内に導入できる。このような技術の種々の一般に入手可能な文献に記載さ れている(Hobbs,S.又はMurry,L.E.McGraw Hill Yearbook of Science and Techn ology (1992)McGraw Hill NY,pp191-196を参照されたい)。 NANCHの発現のために用いることができる別の発現系は昆虫系である。そ のような系の一つでは、Spodoptera frugiperda細胞或いはTrichoplusiaの幼虫 において外来遺伝子を発現するためのベクターとして、Autographa californica 核多角体病ウイルス(AcNPV)が用いられる。NANCHをコードする配列は、 ポリヘドリン遺伝子のようなウイルスの非必須領域にクローニングされ、ポリヘ ドリンプロモーターの制御下に置かれ得る。NANCHコーディング配列の挿入 が成功すると、ポリヘドリン遺伝子が不活性になり、コートタンパク質膜が欠如 した変異体ウイルスが生成される。次に、この変異体ウイルスを用いて、S.frug iperda 細胞或いはTrichoplusiaの幼虫へ感染させ、その中でNANCHが発現さ れる(Engelhard,E.K.等(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.91:3224-3227)。 哺乳類宿主細胞では、多数のウイルス性発現系を利用することができる。発現 ベクターとしてアデノウイルスが用いられる場合には、NANCHをコードする 配列は、後期プロモータ及び三連リーダー配列からなるアデノウイルス転写物/ 翻訳物複合体内に結合され得る。ウイルスの ゲノムの非必須E1又はE3領域へ挿入することにより、感染した宿主細胞でNAN CHを発現できる生ウイルスになる(Logan,J.及びShenk,T.(1984)Proc.Natl.A cad.Sci.81:3655-3659)。さらに、哺乳類宿主細胞内の発現を増加させるために ラウス肉腫ウイルス(RSV)エンハンサのような転写エンハンサを用いることが できる。 また、NANCH配列の効率的な翻訳のためには、特定の開始シグナルも必要 である。これらのシグナルには、ATG開始コドン及び隣接する配列が含まれる。 NANCH及びその開始コドン及び上流配列が適切な発現ベクター内に挿入され る場合には、翻訳制御シグナルを加える必要はない。しかしながらコーディング 配列又はその一部のみが挿入される場合には、ATG開始コドンを含む外来の翻訳 制御シグナルを与えなければならない。さらに、全インサートの転写が確実に行 われるようにするために、開始コドンは正しい読み枠に存在しなければならない 。外来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の様々な起源に由来 するものであり得る。発現の効率は、その細胞系に適切なエンハンサーを含める ことにより高めることができる(Scharf,D.等(1994)Results Probl.Cell Diff er.20:125-162)。 さらに宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節したり、発現したタンパク 質を望ましい形にプロセシングする能力で選択される。このようなポリペプチド の修飾には、以下のものに限定はしないが、アセチル化、カルボキシル化、グリ コシル化、リン酸化、脂質化(lipldation)並びにアシル化が含まれる。またタ ンパク質の「プレプロ」部分を切り離す翻訳後プロセシングも、正しい挿入、折 り畳み、及び/又は機能の発揮のために重要である。CHO、HeLa、MDCK、293、WI 38等のような異なる宿主細胞は、そのような翻訳後の活動のための特定の細胞装 置及び特徴的な機構を有しており、導入される異種タンパク質の修飾やプロ セシングが確実に行われるように選択され得る。 長期間にわたって変異体タンパク質の高収率の産生を確保するためには安定し た発現が望ましい。例えば、ウイルスの複製起源や内在性発現エレメント及び選 択マーカー遺伝子を含む発現ベクターを用いて、NANCHを安定的に発現する 株細胞を形質転換し得る。ベクターの導入の後、細胞を、選択培地に切り替える 前に濃縮培地内で1〜2日間増殖させる。選択マーカーの目的は、選択のための 耐性を与え、その存在によって導入された配列をうまく発現する細胞を増殖、回 収できるようにすることである。安定的に形質転換された細胞の耐性凝集塊は、 その細胞型に適した組織培養技術を用いて増殖することができる。 形質転換された株細胞を回収するために任意の数の選択系を用いることができ る。選択系には、以下のものに限定はしないが、単純ヘルペスウイルスチミジン キナーゼ(tk)(Wigler,M.等(1977)Cell 11:223-32)及びアデニンホスホリ ボシルトランスフェラーゼ(aprt)(Lowy,I.等(1980)Cell22:817-23)遺伝子 が含まれ、それぞれtk及びaprt細胞において用いられる。また代謝拮抗物質、抗 生物質或いは除草剤への耐性を選択の基礎として用いることができる。例えばdh frはメトトレキセートに対する耐性を与え(Wigler,M.等(1980)Natl Acad Sci 77 :3567)、nptはアミノ配糖体のネオマイシン及びG-418に対する耐性を与え(Colb erre-Garapin,F.等(1981)J Mol Biol 150:1)、als或いはpatはクロルスルフ ロン(chlorsulfuron)、ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ(pho sphinotricin acetyltransferase)に対する耐性を与える(Murry,前出)。さ らに選択に利用できる遺伝子として、例えば細胞がトリプトファンの代わりにイ ンドールを利用できるようにするtrpB、細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノー ル(histinol)を利用できるようにするhisDが文献に記載されている(Hartman, S.C.及び R.C.Mulligan(1988)Proc.Natl.Acad.Sci.85:8047-51)。最近になって、形質 転換体を特定するためばかりではなく、特定ベクター系による一過性の或いは安 定的なタンパク質発現の量を定量するために広く用いられる、例えばアントシア ニン、β−グルクロニダーゼ及びその基質、GUS、及びルシフェラーゼ及びその 基質、ルシフェリンのような可視マーカーがよく利用されるようになった(Rhode s,C.A.等(1995)Methods Mol.Biol.55:121-131)。 マーカー遺伝子発現の存在/不存在によって目的の遺伝子の存在も示されるが 、その存在及び発現は確認すべきである。例えばNANCHをコードする配列が マーカー遺伝子配列内に挿入された場合は、NANCHをコードする配列を含む 組換え体細胞をマーカー遺伝子の機能の存在により確認できる。別法では、マー カー遺伝子をNANCHをコードする配列と直列に配置して、両者が単一プロモ ータの制御下となるようにすることができる。誘導に応じてのマーカー遺伝子の 発現、つまり選択は、通常直列に配置された配列の発現をも同時に示すことにな る。 この他当業者には周知の様々な方法により、NANCHのコーディング配列を 含みNANCHを発現する宿主細胞を識別できる。このような方法には、以下の ものに限定はしないが、DNA-DNA或いはDNA-RNAハイブリダイゼーション及び、核 酸及びタンパク質を検出及び/又は定量するための膜ベース、溶液ベース或いは チップベースの技術を含むタンパク質バイオアッセイ或いはイムノアッセイが含 まれる。 NANCHをコードする配列のプローブ、一部、或いは断片を用いるDNA-DNA 又はDNA-RNAハイブリダイゼーション若しくは増幅により、NANCHポリヌク レオチド配列の存在を検出することができる。核酸増幅に基づくアッセイでは、 NANCHをコードするDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出するために、核酸 配列に基づくオリゴヌクレオ チド或いはオリゴマーを用いる。本明細書において「オリゴヌクレオチド」或い は「オリゴマー」とは、プローブ或いは、PCRで増幅されるセグメントである アンプリマーとして用いることができる核酸配列であって、長さが約10ヌクレ オチド以上、最大60ヌクレオチド程度、好適には15〜30ヌクレオチド、よ り好適には20〜25ヌクレオチドであるものを指す。 このタンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいず れかを用いてNANCHポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々のプ ロトコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例には、酵素結合免 疫検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表示式細胞分取器法 (FACS)を含まれる。NANCHポリペプチド上で2つの非干渉なエピトープに 対して反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナルベースイム ノアッセイ(two-site,monoclonal-based immunoassay)が好適であるが、競合 的結合アッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは、他の文 献、Hampton,R.等(1990;Serological Mehods,a Laboratory Manual,APS Press, St.Paul MN)及びMaddox,D.E.等(1983,J.Exp.Med.158:1211-1216)に記載され ている。 さらに多くの標識及び結合技術が当業者には周知であり、種々の核酸及びアミ ノ酸のアッセイにおいて用いることができる。近縁な配列を検出するための、標 識されたハイブリダイゼーションプローブやPCRプローブを作成するための手 段には、オリゴ標識、ニックトランスレーション法、末端標識、或いは標識ヌク レオチドを用いるPCR増幅などが含まれる。別法としては、NANCHコーデ ィング配列、或いはその任意の部分を、mRNAプローブの作成のためのベクタ ーにクローン化する。そのようなベクターは当分野では周知で、市販されており 、例えば T7、T3、或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼ及び標識されたヌクレオ チドを加えることにより、in vitroでRNAプローブを合成するために用いるこ とができる。これらの方法は、種々の市販のキット(Pharmacia Upjohn(Kalama zoo,MI);Promega(Madison WI);及びU.S.Biochemical Corp.(Cleveland OH ))を用いて実行することができる。適切なリポーター分子、すなわち標識には 、放射性核種、酵素、フルオレセント(蛍光剤)、化学発光剤或いは色素剤や、 基質、補助因子、インヒビター、磁気粒子等が含まれる。 NANCHをコードするヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞を、コー ドされたタンパク質を細胞培地で発現させ、そこから回収するのに適した条件下 で培養することができる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用いら れる配列及び/またはベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり細胞内に含まれ るようにすることができる。当業者には理解されるように、NANCHをコード するポリヌクレオチドを含む発現ベクターを、原核細胞か真核細胞の細胞膜を通 してのNANCH分泌を誘導するシグナル配列を含むように設計することができ る。他の組換え体作製物では、NANCHをコードする配列を、可溶性タンパク 質の精製を容易にするポリペプチドドメインをコードするヌクレオチド配列に結 合することができる。そのような精製を容易にするドメインには、以下のものに 限定はしないが、固定化金属上での精製を可能にするヒスチジントリプトファン モジュールのような金属キレートペプチド、固定化免疫グロブリン上での精製を 可能にするプロテインAドメイン、並びにFLAGS伸長/アフィニティ精製システ ムにおいて用いられるドメイン(Immunex Corp.,Seattle WA)が含まれる。精製 ドメインとNANCHの間にXA因子或いはエンテロキナーゼ(Invitrogen,San Diego CA)に対して特異的な配列のような切断可能なリンカー配列を含 めるのは精製を促進するのに役立つ。NANCHをコードする配列とともに、6 個のヒスチジン残基、それに続くチオレドキシン及びエンテロキナーゼ切断部位 をコードする核酸配列を含むこのような発現ベクターの1つは、融合タンパク質 を発現する。ヒスチジン残基がIMIAC(Porath,J等(1992;Protein Exp.Purif.3:2 63-281)に記載のような固定化金属イオンアフィニティクロマトグラフィー)精 製を促進するとともに、工ンテロキナーゼ切断部位が融合タンパク質からのNA NCHの精製のための手段となる。融合タンパク質を含むベクターについての解 説は、Kroll,D.J.等(1993:DNA Cell Biol.12:441-453)に記載されている。 組換え体の産生に加えて、NANCHの断片を、固層技術を用いた直接のペプ チド合成で形成することもできる(Merrifield J.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:2149 -2154参照)。in vitroタンパク質合成は手作業で行えるが、自動化することも できる。自動的な合成は、例えば、Applied Biosystem 431Aペプチドシンセサイ ザ(Perkin Elmer)を用いて行うことができる。NANCHの種々の断片を個別 に化学的に合成し、化学的方法を用いて結合して完全長分子を作り出してもよい 。 治療 NANCH、ウシp64、及びヒトP64CLCPの間に化学的及び構造的相 同性が存在する。この相同性は、そのノーザン解析の結果と共に、NANCHが 発達において一定の役割を果たしていることを示唆している。従って、NANC Hの不足は発達障害と関係を有し得る。 従って、或る実施例では、発達障害の治療のためにNANCH又はその断片若 しくは誘導体を患者に投与し得る。このような疾病には、以下に限定されないが 、心臓、肺、腎臓又は肝臓を含む新生児の器官の発達不全及び先天異常が含まれ 得る。 別の実施例では、上述の発達障害の治療のために、NANCH又はその断片若 しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に投与し得る。 NANCHは、癌の発達においても一定の役割を有しているとみられる。従っ て、或る実施例では、以下に限定されないが、心臓、胃、肺、皮膚、腎臓、舌、 結腸、大腸、肝臓、膵臓、副腎、甲状腺、膀胱、及び膵臓の癌を含む任意の型の 癌の治療又は予防のために、NANCHのアゴニスト又はインヒビターを患者に 投与し得る。或る態様では、NANCHに特異的な抗体を、アンタゴニストとし て直接的に用いたり、或いはNANCHを発現する細胞又は組織に薬物を送達す るためのターゲティング又はデリバリー機構として間接的に用いることができる 。 別の実施例では、限定されないが、上述の癌を含む癌の治療又は予防のために 、NANCHをコードするポリヌクレオチドのアンチセンスを発現するベクター を患者に投与し得る。 別の実施例では、上述の治療用タンパク質、アンタゴニスト、抗体、アゴニス ト、アンチセンス配列又はベクターの何れかを、他の適切な治療薬と組み合わせ て投与し得る。当業者であれば、併用療法において使用するために適切な薬剤を 、従来の薬学の原理に基づいて選択することができよう。治療薬を組み合わせる ことにより、上述の種々の疾患の治療又は予防についての相乗作用を与え得る。 この方法を用いることにより、より低い投与量の各薬剤で同じ治療効果を達成す ることができ、これにより副作用を低下させることができる。 NANCHのアンタゴニスト又はインヒビターは、周知の方法を用いて製造す ることができる。詳述すると、精製されたNANCHを用いて、抗体を製造した り、或いは薬物のライブラリーからNANCHに特異的に結合するものを選別す ることができる。NANCHに対する抗体は、当分野においてよく知られた方法 を用いて製造することができる。この ような抗体には、以下のものに限定されないが、ポリクローナル抗体、モノクロ ーナル抗体、キメラ抗体、一本鎖抗体、Fabフラグメント、及びFab発現ライブラ リーにより生成されたフラグメントが含まれる。中和抗体(即ち二量体形成を阻 害する抗体)は治療的使用には特に好適である。 抗体を産生するため、NANCH或いは免疫学的特性を保持するその任意の一 部、断片或いはオリゴペプチドを注射することによって、ヤギ、ウサギ、ラット 、マウス等を含む種々の宿主を免疫することができる。宿主の種に応じて、種々 のアジュバントを免疫学的反応を増強するために用いることができる。そのよう なアジュバントには、以下のものに限定はしないが、フロイントのアジュバント 、水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント、リゾレシチンのような 界面活性物質アジュバント、プルロニックポリオールアジュバント、ポリアニオ ンアジュバント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュバント、キーホールリ ンペットヘモシニアンアジュバント並びにジニトロフェノールアジュバントが含 まれる。BCG(カルメット‐ゲラン杆菌)及びコリネバクテリウム−パルヴム (Corynebacterium parvu)は有用なヒトアジュバントである。 好ましくは、NANCHに対する特異的抗体を誘発するために用いられるペプ チドは、5個以上のアミノ酸、より好ましくは10個以上のアミノ酸からなるア ミノ酸配列を有し得る。また好ましくは、これらの配列は、自然タンパク質のア ミノ酸配列の一部と同一であり、小形の自然発生の分子の全アミノ酸配列を含ん でいてもよい。NANCHアミノ酸の短いストレッチを、キーホールリンペット ヘモシアニン及びキメラ分子に対して産生された抗体のような他のタンパク質の 配列に融合してもよい。 NANCHのモノクローナル抗体は、培地内の連続株細胞によって抗体分子を 産生する任意の技術を用いて調製できる。このような技術には、以下のものに限 定はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、及びEB V−ハイブリドーマ技術(Kohler,G.等(1975)Nature 256:495-497;Kozbor,D.等 (1983)Immunol Methods 81:31-42;Cote,R.J.等(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:20 26-2030;Cole,S.P.等(1984)Mol.Cell Biol.62:109-120)が含まれる。 さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する分子を得るための「キメラ 抗体」の産生、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子の結合のために開発さ れた技術が用いられる(Morrison,S.L.等(1984)Proc.Natl.Acad.Sci.81:6851-68 55;Neuberger,M.S.等(1984)Nature 312:604-608;Takeda,S.等(1985)Natur e 314:452-454)。別法として、一本鎖抗体の生成のための周知技術を適用して 、NANCH特異的一本鎖抗体を作り出すことができる。近縁な特異性を有する が、イディオタイプの構成が異なる抗体は、無作為の免疫グロブリン組み合わせ ライブラリーからの鎖再編成(chain shuffling)により生成することができる (Burton D.R.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120-3)。 また抗体は、リンパ球集団でのin vivo産生を誘導することにより、或いは文 献(Orlandi,R.等(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837;Winter,G.等1991, Nature 349:293-299)に開示されているような高度に特異的な結合試薬のパネル や組換え免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングすることによっても生成 することができる。 NANCHに対する特異結合部位を含む抗体フラグメントも生成することがで きる。このようなフラグメントには例えば、限定はしないが、抗体分子のペプシ ンによる消化で生成することができるF(ab')2フラグメントや、F(ab')2フラグメ ントのジスルフィド架橋を減らすことによ り生成することができるFabフラグメントが含まれる。別法として、所望の特異 性を有するモノクローナルFabフラグメントを迅速かつ容易に同定できるように 、Fab発現ライブラリーを作製してもよい(Huse,W.D.等(1989)Science 256:127 5-1281)。 所望の特異性を有する抗体を同定するための選別のために種々のイムノアッセ イを用いることができる。確立された特異性を有するモノクローナル抗体或いは ポリクローナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫放射線測 定法の種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。このようなイムノアッ セイでは、NANCHとその特異的抗体との複合体の形成、並びに複合体形成の 測定が行われる。特定のNANCHタンパク質上の2つの互いに非干渉なエピト ープに対して反応するモノクローナル抗体を用いる二部位モノクローナルベース イムノアッセイが好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる(Maddox,前 出)。 本発明の別の実施例では、NANCHをコードするポリヌクレオチド、または その任意の断片やアンチセンス配列を、治療目的で用いることができる。或る態 様では、このタンパク質の合成を阻害することが望ましいような状況において、 NANCHをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンスを用いることが できる。詳述すると、NANCHをコードするポリヌクレオチドに対するアンチ センス配列で細胞を形質転換することができる。従って、アンチセンス配列を用 いて、NANCH関連の組織損傷を予防したり、遺伝子機能の調節を達成するこ とができる。このような技術は現在周知となっており、センス又はアンチセンス オリゴマー、若しくはより大きな断片を、NANCHコーディング配列のコード 領域や調節領域の種々の位置から設計することができる。 レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイル スに由来する発現ベクター、或いは種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベク ターは、標的の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために 用いられる。当業者によく知られた方法を用いて、NANCHをコードする配列 のアンチセンスを発現する組換えベクターを作り出すことができる。これらの技 術はSambrook等(上記)及びAusubel等(上記)に記載されている。 所望のNANCH断片を高レベルで発現する発現ベクターを細胞または組織に トランスフェクトすることにより、NANCHをコードする遺伝子の機能を停止 させることができる。このような作製物は、翻訳不可能なセンス配列或いはアン チセンス配列で細胞に導入するために用いることができいる。このようなベクタ ーは、DNAへ組み込まれない場合ですら、全ての複製物が内在性ヌクレアーゼ により分解されるまで、RNA分子を転写し続ける。このような一過性の発現は 、非複製ベクターでも1ヶ月以上、適当な複製エレメントがベクター系の一部で ある場合には更に長い期間継続し得る。 上述のように、NANCHをコードする配列の制御領域、即ちプロモータ、エ ンハンサ或いはイントロンに対するアンチセンス分子、DNA、RNAまたはP NAを設計することにより遺伝子発現を改変することができる。転写開始部位、 例えばリーダー配列の+10〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチドが 好適である。また、転写産物がリボソームへの結合するのを防止することにより mRNAの翻訳を阻止するアンチセンス分子も設計される。同様に、「三重らせ ん」塩基対合法を用いて阻害を達成することができる。三重らせん対合は、二重 らせんが十分にほどけないことでポリメラーゼ、転写因子、或いは調節分子が結 合できないようにする。三重らせんDNAを用いた最近の治療法は、文献(Gee, J.E.等(1994)In:Huber,B.E及びB.I.Carr,Molecular and Immunologic Approaches ,Futura Publishing Co,Mt Kisco NY)に記載されてい る。 リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で ある。リボザイムの作用機序では、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列 特異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断 (endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、NANCHのエ ンドヌクレアーゼによる切断を特異的かつ効果的に触媒し得る人工合成のハンマ ーヘッド型リボザイム分子も含まれている。 任意のRNA標的可能部分内の特異的なリボザイム切断部位を、初めに、配列 GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対する標的分子を調べるこ とによって同定する。一度同定されると、切断部位を含む標的遺伝子の領域に対 応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の短いRNA配列を、そのオリゴヌ クレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴について評価することが可能とな る。候補の標的部分の適切性も、リボヌクレアーゼ保護アッセイを用いて相補的 なオリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成に対する接触性をアッセイすること により評価することができる。 本発明のアンチセンス分子及びリボザイムは、RNA分子を合成するのための 当分野で周知の方法により調製することができる。これらの技術には、固相ホス ホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のようなオリゴヌクレオチドの化学 的合成技術が含まれる。この他、RNA分子を、NANCHをコードするDNA 配列のin vivo及びin vitro転写により生成することができる。このようなDN A配列は、T7或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼプロモーターを 有する多種のベクターに組み込むことができる。更に別の方法として、構成的に 或いは誘 導的にアンチセンスRNAを合成するアンチセンスcDNA作成物を、株細胞、 細胞或いは組織内に導入することができる。 RNA分子は細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾することが できる。可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’末端か3’末端、或 いはその両方へのフランキング配列の付加や、分子のバックボーン内においてホ スホジエステラーゼ結合ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate)或い は2’O−メチルを使用することが含まれる。このコンセプトは、PNA生成固 有のものであり、内在性エンドヌクレアーゼにより容易に認識されないアデニン 、グアニン、シチジン、チミン、及びウリジンの、アセチル−、メチル−、チオ −形態、及び類似の改変形態とともに、イノシン、キュエオシン(queosine)、 及びワイブトシン(Wybutosine)のような従来あまり用いられなかった塩基を含 めることによって、これら全ての分子に拡張することができる。 細胞或いは組織内にベクターを導入するための方法には、上述の方法が含まれ 、これらの方法は、in vivoin vitro、及びex vivoの使用に対しても同様に適 切なものである。ex vivo治療法の場合には、患者から採取された幹細胞にベク ターを導入し、自家移植用のクローンとして増殖して同じ患者に戻す方法がある 。またトランスフェクションによるデリバリー、リポソームによるデリバリーは 、当分野でよく知られている。 上述の治療法の任意のものは、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル 、及び最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、任意の適切な被験体に適用す ることができる。 本発明の更に別の実施例は、上述の治療効果のいずれかを発揮させるべく、薬 学的に許容される担体とともに医薬品組成物を投与することに関連する。このよ うな医薬品組成物は、NANCH、NANCHに対する抗体、NANCHの擬似 物、アゴニスト、アンタゴニスト、又はイン ヒビターからなるものであり得る。この医薬品組成物は、単体で、或いは例えば 安定剤のような1種以上の他の薬剤と組み合わせて、任意の無菌の生体適合性製 薬用担体に含めて投与される。このような担体には、限定はしないが、生理食塩 水、緩衝食塩水、ブドウ糖或いは水が含まれる。これらの分子は、患者に対して 、単体で、或いは他の薬品やホルモンと結合して、賦形剤或いは製薬学的に許容 される担体と混合される他の医薬品組成物に含めて投与され得る。本発明の或る 実施例では、製薬学的に許容される担体とは、製薬学的に不活性なものである。 本発明で用いられる医薬品組成物の投与経路には、以下の経路に限定されない が、経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、髄内投与、くも膜下内投 与、心室内投与、経皮投与、皮下投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、経腸投与、局 所投与、舌下投与、或いは直腸内投与が含まれ得る。 活性成分に加えて、これらの薬品組成物は、薬学的に用いられ得る調合物内へ の活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切な製薬学的に許容 される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は、“Remington's Pharmaceutical Sciences”(Maack Publishing Co,Easton PA)の最新版において 見ることができる。 経口投与用の医薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担 体を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、薬品組成物は、治 療を受ける患者による経口及び鼻腔摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、液 体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁液或いは類似の製剤として処方さ れる。 経口投与するための製剤は、活性化合物と固形の賦形剤とを結合することによ って得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助剤を添加した後、 得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、 錠剤或いは糖衣剤核を得ることができる。適切な賦形剤は、ラクトース、スクロ ース、マンニトール或いはソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク 質充填剤、とうもろこし、小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセル ロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロ ースナトリウムのようなセルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのような ゴム、並びにゼラチン或いはコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば 、架橋結合したポリビニルピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなア ルギン酸或いはアルギン酸ナトリウムや、その塩のような、崩壊剤或いは可溶化 剤が加えられる。 糖衣剤核は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられるが、溶液はアラビ アゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、ポリエチレングリ コール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機溶剤或いは溶剤混 合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわち活性化合物の量、すなわち投与量 を特徴付けるために染料或いは色素が錠剤或いは糖衣錠皮に加えられてもよい。 経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る 。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤があるなしにかかわらず、脂肪 油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶解或 いは懸濁される。 非経口投与用の製剤は、水溶性の活性化合物の水溶液を含む。注射用 として、本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンゲル溶液或 いは生理緩衝食塩水のような生理学的に適合性の緩衝液に入れて製剤することが できる。水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソル ビトール或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を高める物質を含み得る。更 に、活性成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油 性の溶媒或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグ リセリド或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、 所望に応じて、それにより溶解度を増加し、非常に濃縮された溶液の調製ができ るようになる適切な安定剤或いは薬剤を含んでもよい。 局所的投与または経鼻粘膜投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な 浸透剤を用いて調合が行われる。このような浸透剤は、一般に周知である。 本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、顆粒化 処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、封入処理(entrapping)処理或いは凍 結乾燥処理により製造される。 この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸 、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに 形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製 剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝 剤と結合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおけ る凍結乾燥粉末である。 製薬学的に許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成物は、調 製された後、適切な容器内に入れて、さらに提示した疾病状態 の治療のためにラベル付けすることができる。NANCHの投与の場合、このよ うなラベルには、投与の量、頻度、方法が表示される。 本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的 を達成するための有効量含む組成物である。有効量の決定は、当業者の能力の範 囲内で十分行うことができる。 任意の化合物について、治療的有効量は、初めに、新生物細胞、或いは通常マ ウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地のアッセイか ら推定される。次いで、このような情報を用いて、ヒトにおける有効量や投与経 路を決定することができる。 治療的有効量とは、症状や状態を改善するタンパク質、その抗体、アンタゴニ スト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治療的有効 性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個体群の 50%における治療的有効量、50%有効量)を決定するための、細胞培地或い は実験動物における標準的な製薬学的方法により決定することができる。毒性と 治療有効性との間の投与量比は治療指数であり、LD50/ED50の比として 表すことができる。大きな治療指数を示す医薬品組成物が好ましい。これらの細 胞培地のアッセイ及び付加的な動物研究から得られるデータは、ヒトへの使用に 対する投与量の範囲を決める際に用いることができる。そのような化合物の投与 量は、毒性がほとんど或いは全くなく、ED50を達成する循環濃度の範囲内に あることが望ましい。投与量は、用いられる剤形、患者の感受性並びに投与経路 に応じてこの範囲内で変化する。 正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。 投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性成分を与え、かつ所定の効果を維持す るために調節される。考慮すべき付加的な要因は、疾患状態の重症度、または患 者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時 間及び頻度、併用する薬剤、反応感受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長 期的に作用する薬品組成物は3〜4日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定 の処方のクリアランス速度に応じて2週間に1度投与してもよい。 通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大 約1gであり、投与経路に応じて変わってくる。特定の投与量或いは送達の方法 に関する手引きは、当分野の実施者が通常入手できる文献において見出すことが できる。当業者なれば、ヌクレオチドに対しては、タンパク質やインヒビター用 の剤形とは異なる剤形を採用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポ リペプチドの送達方式は、特定の細胞、状態、位置等によって決まってくる。 診断 別の実施例において、NANCHに特異的な抗体は、NANCHの発現を特徴 とする状態や疾病の診断や、NANCHで治療を受けている患者のモニタリング のためのアッセイにおいて役立つ。診断目的で有用な抗体は、上述の治療用のも のと同じように調製することができる。NANCHの診断的測定法には、ヒトの 体液、細胞或いは組織の抽出物においてNANCHを検出するために抗体或いは 標識を利用する方法が含まれる。本発明のポリペプチド及び抗体は、修飾したも のでも、修飾なしでも用いることができ、共有結合、或いは非共有結合かのいず れかでリポーター分子と結合することにより標識することができる。種々のリポ ーター分子が周知となっており、その幾つかについては上記した。 例えばELISA(酵素結合免疫測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ)並びにFA CS(蛍光表示式細胞分取器法)を含む、NANCHを測定するための種々のプロ トコルが当分野では周知であり、これによってNA NCH発現の変化や異常を診断するための基礎が得られる。NANCHの発現の 正常値、つまり標準値は、哺乳類、好ましくはヒトの正常被験者から得られる体 液或いは細胞抽出物とNANCHに対する抗体とを、複合体形成に適した条件の 下で結合することによって得ることができる。標準の複合体形成量は、種々の方 法、好ましくは測光手段を用いることにより定量することができる。被験者、対 照標準、及び生検組織からの患部組織サンプルにおいて発現されたNANCHの 量を、標準値と比較する。標準値と被験者の値との偏差で、疾病診断のパラメー タが確立される。 本発明の別の実施例では、NANCHをコードするポリヌクレオチドを、診断 目的で用いることができる。使用できるポリヌクレオチドには、オリゴヌクレオ チド配列、アンチセンスRNA及びDNA分子、及びペプチド核酸(PNA)が 含まれる。このポリヌクレオチドは、NANCHの発現が疾病と相関性を有する 生検組織における遺伝子発現を検出し、定量するために用いられる。診断的測定 は、NANCHが存在、不存在、及び過剰発現の何れの状態にあるかを区別した り、治療的介入の際にNANCHレベルの調節をモニタリングするのに役立つ。 或る態様では、NANCHまたは近縁な分子をコードする、ゲノム配列を含む ポリヌクレオチド配列を検出できるハイブリダイゼーションプローブ或いはPC Rプローブを用いて、NANCHをコードする核酸配列を同定することができる 。そして、そのプローブの特異性、即ち、そのプローブが非常に高度な保存領域 (例えば5’調節領域における10個の独特のヌクレオチド)と、保存的である 度合いの低い領域(例えば特に3’領域におけるシステイン残基の間の領域)の 何れに由来するのかということ、及びハイブリダイゼーション或いは増幅の(高 い、中程度の或いは低い)厳密性によって、そのプローブが自然発生NANCH のみを同定するものであるか、或いはアレル配列や近縁な配列も同定するもので あるかということが決まってくる。 プローブは、近縁なインヒビターをコードする配列を検出するためにも用いる ことができ、好ましくは、これらのNANCHをコードする任意の配列から得ら れるヌクレオチドを少なくとも50%含むべきである。本発明のハイブリダイゼ ーションプローブは、配列番号:2のヌクレオチド配列か、自然発生NANCH のイントロン、プロモータ、及びエンハンサーエレメントを含むゲノムの配列に 由来するものであり得る。 NANCHをコードするDNAに対して特異的なハイブリダイゼーションプロ ーブの作製のための他の手段には、NANCHやNANCH誘導体をコードする 核酸配列を、mRNAプローブ生成のためのベクターにクローン化する方法があ る。このようなベクターは周知で市販されており、適切なRNAポリメラーゼや 適切な放射性標識ヌクレオチドを付加することにより、in vitroでのRNAプロ ーブを合成のために用いることができる。ハイブリダイゼーションプローブは種 々のリポータ分子により標識することができ、この標識には、32Pや35Sのよう な放射性核種、アビジン/ビオチン結合系によりプローブに結合するアルカリホ スファターゼのような酵素標識等が含まれる。 NANCHをコードするポリヌクレオチド配列を、NANCHの発現が関係す る状態又は疾病の診断のために用いることができる。このような状態又は疾病の 例には、心臓、胃、肺、皮膚、腎臓、舌、結腸、大腸、肝臓、膵臓、副腎、甲状 腺、膀胱、及び膵臓の癌が含まれる。NANCHをコードするポリヌクレオチド 配列は、NANCH発現の変化を検出するための生検組織や体液を試験するため の、サザンブロット法或いはノーザンブロット法、ドットブロット法或いは他の 膜ベース技術、PCR技術、ディップスティック試験法(試験紙法)、ピン或い はチップ技 術及びELISAアッセイにおいて用いることができる。このような定性的或いは定 量的試験方法は当分野ではよく知られている。 特定の態様では、種々の癌、特に上述の癌の活性化または誘導を検出するアッ セイにおいてNANCHをコードするヌクレオチド配列が役立ち得る。NANC Hをコードするヌクレオチド配列を標準的な方法で標識し、ハイブリダイゼーシ ョン複合体の形成に適した条件の下で患者の体液や組織サンプルに加える。適切 なインキュベーション時間の経過後、このサンプルを洗浄しシグナルを定量して 、標準値を比較する。生検サンプルまたは抽出サンプルにおけるシグナルの量が 、比較できる対照サンプルのシグナル量と有意に異なっている場合、このヌクレ オチド配列はサンプルのヌクレオチド配列とハイブリダイズしており、サンプル におけるNANCHをコードするヌクレオチド配列のレベルの変化が存在するこ とは、関連疾患の存在を示している。このようなアッセイは、動物実験、臨床試 験、または個々の患者の治療のモニタリングにおける特定の治療措置の効果を評 価するために用いることもできる。 NANCHの発現が関係する疾病の診断の基礎を得るために、正常な、或いは 標準の発現プロフィールを確立する。この標準プロフィールは、動物或いはヒト 何れかの正常な被験者から得られる体液或いは細胞抽出物を、ハイブリダイゼー ション或いは増幅に適切な条件下で、NANCHをコードする配列又はその一部 分と結合することにより確立される。標準のハイブリッド形成量は、既知の量の 実質的に精製されたNANCHが用いられる同一の実験で得られる値と、正常被 験者に対して得られる値とを比較することにより定量することができる。正常な サンプルから得られた標準値は、疾病の症状を示す患者からのサンプルから得ら れる値と比較することができる。標準値と被験者値との偏差を用いて疾病の存在 を確認する。 ひとたび疾患が確認され、治療プロトコルが開始されると、患者での発現レベ ルが正常な患者において観察されるレベルに近づき始めたか否かを評価するため に、このようなアッセイが定期的に繰り返される。継続的なアッセイから得られ る結果を用いて、数日間或いは数ヶ月の期間にわたる治療効果を知ることができ る。 癌については、患者の生検組織において転写物が比較的少ない量存在すること が疾病の発生の素因を示し、つまり実際の臨床的症状が現れる前に疾病を検出す る手段となり得る。この型のより確定的な診断により、医療従事者が予防的処置 を講じたり、より早期に積極的な治療を開始することが可能となり、疾病の発生 や更なる進行を予防することができるようになり得る。 NANCHをコードするオリゴヌクレオチドの別の診断目的の使用では、PC Rを使用することがある。このようなオリゴマーは一般には化学的に合成するが 、酵素を用いて作製したり、或いは組換え体を起源として作り出すこともできる 。オリゴマーは、特定の遺伝子或いは状態を識別するために最適な条件下で用い られる2つのヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌクレオチド 及びアンチセンス方向(3’←5’)のヌクレオチドからなる。同一の2つのオ リゴマー、入れ子オリゴマーの組、或いはオリゴマーの縮重プールでさえ、近縁 なDNAまたはRNA配列の検出や定量のためのより厳密性の低い条件の下であ っても用いることができる。 さらにNANCHの発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolabel ing)或いはビオチン標識ヌクレオチドの利用、コントロールの核酸の同時増幅 (coamplification)の利用、並びに実験結果を補完して引かれた標準的なグラ フ曲線の利用も含まれる(Melby,P.C.等1993 J.Immunol Methods,159:235-44;D uplaa,C.等(1993)Anal. Biochem.229-236)。多数のサンプルの定量は、ELISA形式の連続アッセイを実行 することにより一層迅速に行うことができる。このアッセイでは目的のオリゴマ ーが様々な希釈溶液中に存在し、分光光度計を用いる分析或いは比色分析反応に より迅速に定量することができる。 本発明の別の実施例では、NANCHをコードする核酸配列を用いて、自然発 生のゲノム配列マッピングのためのハイブリダイゼーションプローブを生成する ことができる。この配列を、よく知られた技術を用いて特定の染色体或いはその 染色体の特定領域に対してマッピングすることができる。このような技術には、 FISH、FACSや人工染色体作製物の使用、例えば酵母菌人工染色体、細菌性人工染 色体の細菌性P1作製物、Price,C.M.(1993)Blood Rev.7:127-34及びTrask,B.J. (1991)Trends Ganet 7:149-154に概要が示されている単染色体cDNAライブラ リーの使用が含まれる。 FISH(Verma等(1988)Human Chromosomes:A Manual of Basic Technique,Per gamon Press,New York,NY”に記載)は、他の染色体マッピング技術及び遺伝子 地図データと関係を有し得る。遺伝子地図データの例は、1994 Genome Issue of Science(265:1981f)に見ることができる。物理的染色体地図上でのNANCH をコードする配列の位置と、特定の疾病(または特定の疾病の素因)との相関関 係を助けとして、ある遺伝病が関係するDNAの領域の限界決定ができる。本発 明のヌクレオチド配列を用いて、正常者とキャリアまたは患者との遺伝子配列の 違いを検出することができる。 染色体調製物のin situハイブリダイセーション及び確定された染色体マーカ ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地図を延長するため に大変重要である。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であって も、マウスのような別の哺乳類種の染色体上 の遺伝子配置から、関連するマーカーがわかる。新しい配列は、物理的マッピン グにより染色体のアーム、或いはその一部へ割当てることができる。これは位置 クローニング或いは他の遺伝子発見技術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に 貴重な情報を提供する。ひとたび毛細血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或 いは症候群が、特定のゲノム領域へ、例えばATならば11q22-23(Gatti,R.A.等(19 88)Nature 336:577-580)へ、遺伝子連鎖によって粗い局所化がなされれば、その 領域にマッピングされる任意の配列は、さらなる研究のための関連する遺伝子、 或いは調節遺伝子ということになる。本発明のヌクレオチド配列は、正常者とキ ャリアまたは患者との間の、転座、逆位等による染色体位置の違いを検出するた めに用いることもできる。 本発明の別の実施例では、NANCHや、その触媒作用性または免疫原性フラ グメント或いはオリゴペプチドを、種々の薬物スクリーニング技術において治療 用化合物のスクリーニングのために用いることができる。そのような試験におい て用いられるフラグメントは、溶液に遊離した形態か、固体支持体へ付着したも のか、細胞表面へ付着したものか、或いは細胞内に存在するものであり得る。N ANCHと試験される薬剤との結合複合体形成が測定され得る。 NANCHポリペプチドへの適切な結合親和性を有する化合物の高スループッ トスクリーニングのために用いることができる別の薬物スクリーニング技術が、 公開されたPCT出願WO84/03564に詳細に記載されている。この方法をNANCH に適用する場合には、多数の異なる小形ペプチドの試験用化合物を、プラスチッ クピン或いは他の表面のような固体基質上で合成する。ポリペプチド試験用化合 物をNANCH又はその断片と反応させ、洗浄する。次いで結合NANCHを当 分野で周知の方法により検出する。また、前述の薬物スクリーニング技術におい て使 用するために、精製NANCHをプレート上に直接コーティングすることもでき る。この他、ペプチドを捕捉し固体支持体上にペプチドを固定するために非中和 抗体を用いることができる。 別の実施例では、NANCHに結合し得る中和抗体が、NANCHとの結合に ついて試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイを使用 することができる。このように、抗体を用いて、1または2以上のNANCHと 共通のエピトープを有する任意のペプチドの存在を検出することができる。 更に別の実施例では、ここに開示するNANCHをコードするヌクレオチド配 列は、その新技術が、以下に限らないが、例えばトリプレット遺伝暗号及び特異 的塩基対合相互作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性に 基づく技術であれば、まだ開発されていない分子生物学的技術においても用いる ことができる。 以下に示す本発明の実施例は、単なる例示であって、本発明をこの実施例に限 定しようとするものではない。実施例 1 HNT2RAT01 cDNAライブラリーの作製 hNT2細胞系は、発達の初期段階において静止している委任ニューロン前駆 細胞の特性を示す。hNT2細胞系は、Andrews,P.W.(1984;Der.Biol.103:285- 293)に記載のようにレチノイン酸(RA)により分化を誘導することができる 。本発明の目的のため、hNT2細胞を、10%の胎仔ウシ血清+ペニシリン/ ストレプトマイシンを含むダルベッコの改良イーグル媒地(DMEM)に細胞を 懸濁し、且つ10μMのRAで24時間処理することによりRAを用いて誘導し た。誘導した後即座に細胞を回収した。 この処理済みの細胞系から調製されたHNT2RAT01cDNAライブラリーの調製 は、Stratagene社により行われた(Cat.No.937231)。このcDNAライブラリ ーは、概ね以下の手順によって作製された。cDNAを、オリゴd(T)を用い てプライミングし、サイズ分画化して500bpを超える大きさの断片を単離し た。合成アダプターオリゴヌクレオチドをcDNA分子にリゲートし、Uni-ZAPT M ベクターシステム(Stratagene)に挿入できるようにした。DNAプローブを 用いてcDNAライブラリーの質を選別し、次にpBluescriptファージミド(Str atagene)を切除した。次に、このカスタムメイドで作製されたラ 感染させた。 2 cDNAクローンの単離及び配列決定 プラスミドDNAは細胞から放出され、Miniprep Kit(Catalog #77468,Advan ced Genetic Technologies Corporation,Gaithersburg MD)を用いて精製した。 このキットは96穴ブロックからなり、960回の精製のための試薬を備えたも のである。以下の変更点を除いてその推奨プロトコルを採用した。(1)96個 のウエルのそれぞれには、25mg/Lのカルベニンシン及び0.4%のグリセ ロールと共に滅菌terrific broth(Catalog#22711,LIFE TECHNOLOGIESTM,Gaithe rsburg,MD)の1mlのみを充填する。(2)ウェルへの植菌の後、細菌を24 時間培養し、60mlの溶解バッファと共に溶解する。(3)Beckman GS-6Rを 用いた2900rpmで5分間の遠心分離過程を実行した後、ブロックの内容物 を一次濾板(primary filter plate)に加える。(4)イソプロパノールをTRIS バッファに加えるオプションのステップはルーチンで行わなかった。プロトコル の最終ステップの後、サンプルを保管のためBeckman96穴ブロックに移送した 。 プラスミドDNAの精製のための別の方法には、MAGIC MINIPREPSTM DNA Puri fication System(Cat.#A7100;Promega)やQIAwell-8 Plasmid、QIAwell Plus D NA、及びQIAwell Ultra DNA purification systems(QIAGEN,Inc.)を使用する 方法が含まれる。 このcDNAの配列決定は、4つのPeltier Thermal Cyclers(PTC200,MJ Res earch,Watertown,MA)及びApplied Biosystems 377 DNA Sequencing Systems(P erkin Elmer)と組み合わせてHamilton Micro Lab 2200(Hamilton,Reno,NV)を 用いてSanger F.及びCoulsonの方法(1975,J.Mol.Biol.94:441f)により行い、 読み枠を決定した。 3 cDNAクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索 Applied Biosystems社で開発された検索アルゴリズムを、INHERIT670TM配列解 析システムに組み込んで用いて、各cDNAの配列をGenBankの配列と比較した 。このアルゴリズムでは、Pattern Specification Language(TRW社、LosAngele s CA)を用いて相同な領域を決定した。配列の比較をどのように行うかを決定す る3つのパラメータは、ウィンドウサイズ、ウィンドウオフセット、及び誤差許 容度であった。これら3つのパラメータの組を用いて、対象の配列と相同な領域 を含む配列をDNAデータベースから検索し、適切な配列には、初期値とともに スコアが付けられた。次に、これらの相同な領域をドットマトリクスホモロジー ブロット法を用いて検定し、相同な領域と偶然の一致とを区別した。相同性検索 の結果は、Smith-Waterman alignmentsを用いて表示した。 ペプチド及びタンパク質配列の相同性は、INHERIT 670配列解析システムをD NA配列の相同性検索で用いたのと同様に用いて確かめた。Pattern Specificat ion Language及びパラメータウインドウを用いて、 タンパク質データベースから相同性領域を含む配列を検索し、その結果には初期 値とともにスコアが付けられた。ドットマトリクスホモロジーブロット法を用い て検定し、有意な相同性を有する領域と偶然の一致とを区別した。 BLASTは、Basic Local Alignment Search Tool(Altschul SF(1993)J Mol Evol 36:290-300;Altschul,SF等(1990)J Mol Biol215:403-410)の略称であり、これを 用いて局部的な配列アライメントを検索した。BLASTはヌクレオチド及びアミノ 酸配列の両方のアライメントを作成して配列類似性を求める。そのアライメント の局所性のために、BLASTは厳密な一致、すなわちホモログを求める際に特に有 効である。BLASTは間隙を含まない一致を求めるのに役立つ。BLASTアルゴリズム 出力の基本的な単位は、High-scoring Segment Pair(HSP)である。 HSPは2つの配列フラグメントからなり、両フラグメントは任意ではあるが、 そのアライメントが局所的に最大となっている等しい長さものであり、そのアラ イメントスコアはユーザにより設定された閾値すなわちカットオフスコアを満足 、即ち、カットオフスコアを超えている。BLASTアプローチは問い合わせ配列と データベース配列との間のHSPを見つけ出すものであり、見出された任意の一致 の統計的有意性を評価し、そのユーザが設定した有意性の閾値を満足する一致の みを報告するものである。パラメータEはデータベース配列一致を知らせるため の統計的に有意な閾値を確定するパラメータである。Eは全データベース検索の 情況においてHSP(或いはHSPの組)生起の予測頻度の上限として解釈される。そ の一致がEを満足する任意のデータベース配列がプログラム出力において報告さ れる。 4 ノーザン法による解析 ノーザン解析は、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞型または 組織に由来するRNAが結合したメンブランとのハイブリッド形成を伴う、遺伝 子の転写物の存在を検出するために用いられる実験技術である(Sambrook等、上 述)。 BLAST(Altschul,S.F.1993及び1990,上述)を用いる類似のコンピュータ技術 で、GenBankまたはLIFESEQTMデータベース(Incyte,Palo Alto CA)のようなデ ータベースにおける同一のまたは近縁な分子を検索した。この解析は、多くの膜 ベースのハイブリダイゼーションより非常に短時間で行うことができる。更に、 コンピュータ検索の感度を変更して、ある一致が正確な一致か、相同的であるか の分類を決定することができる。 検索の基準値は、積スコアであり、これは以下の式で定義されるものである。 (配列の一致(%)×最大BLASTスコア(%))/100 この積スコアでは、2つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一致の双方 が考慮されている。例えば、積スコアが40の場合は、一致は誤差が1〜2%の 範囲で正確であり、スコアが70の場合は正確に一致している。相同な分子は、 通常積スコアとして15〜40を示すものを選択することにより同定されるが、 スコアの低いものは近縁関係にある分子として同定される。 検索の結果は、完全長配列、又はその部分が存在するライブラリー、配列の存 在量(abundance)、及びパーセント存在量(percent abundance)のリストとし て報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映し、パーセント存 在量は、存在量をライブラリー内で検出された配列の総数で除したものである。 5 NANCHをコードする配列の完全長又は調節エレメントを回復するまでの 伸長 完全長NANCHコード化核酸配列(配列番号:2)を用いて、部分的ヌクレ オチド配列を完全長まで伸長させるための、或いはゲノムライブラリーから5’ または3’配列を得るためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計することがで きる。一方のプライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するために 合成され、他方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために合 成される。これらのプライマーにより、周知のNANCH配列を「外側に」延長 し、対象の制御領域の新しい未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを生成 できるよ 社、Plymouth MN)、或いは他の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30 ヌクレオチドで50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度で標的 配列にアニールするように設計することができる。アピン構造及びプライマー− プライマー二量体化を生じるような任意のヌクレオチドのストレッチの延長は回 避される。 元の選択されたcDNAライブラリーか、ヒトゲノムライブラリーを用いて配 列を延長する。後者のライブラリーは、5’上流配列を得るために最も役立つ。 必要なら、既知領域をさらに延長するために追加のプライマーの組が設計される 。 XL-PCRキット(Perkin Elmer)の説明書の指示に従って、酵素と反応混合物と を完全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られる。40pmolの各プラ イマーと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分とから増幅を開始する場合 、PCRはPeltier Thermal Cycler(PTC200;M.J.Reserch,Watertown MA)を用 いて、以下のパラメータで実行される。 ステップ1 94℃で1分間(初期変性) ステップ2 65℃で1分間 ステップ3 68℃で6分間 ステップ4 94℃で15秒間 ステップ5 65℃で1分間 ステップ6 68℃で7分間 ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復 ステップ8 94℃で15秒間 ステップ9 65℃で1分間 ステップ10 68℃で7分15秒間 ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復 ステップ12 72℃で8分間 ステップ13 4℃(その温度を保持) 反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア ガロースミニゲル上での電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに成 功したか否かを決定する。最も大きな生成物或いはバンドを選択して、ゲルから 切り出した。さらなる精製には、QIAQuickTM(QIAGEN Inc.,Chatsworth,CA)の ような市販のゲル抽出法を用いる。DNA回収の後、クレノウ酵素を用いて一本 鎖ヌクレオチドの延び出しを切り取り、再結合及びクローニングを容易にする平 滑末端を作った。 エタノール沈殿の後、生成物を13μlのリゲーション緩衝液内に再溶解し、 1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチド キナーゼを加えて、その混合物を室温で2〜3時間、或いは16℃で一昼夜イン キュベートする。コンピテントな大腸菌細胞(40μlの適切な溶媒内にある) を、3μlのリゲーション混合物を用いて形質転換し、80μlのSOC培地( Sembrook等、上記)で培養する。37℃で1時間のインキュベーションの後、全 ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertani(LB)寒天(Sembrook等、上 記) 上にのせる。後日、いくつかのコロニーを各プレートから無作為に選択し、適切 な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレートの個々のウェル内に入れられた 150μlの液状LB/2xCarb培地で培養する。さらに後日、5μlの各一昼夜の 培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水で1:10に希釈した後、それぞれ 5μlのサンプルをPCRアレイに移す。 PCR増幅のため、4単位のrTthDNAポリメラーゼを含む18μlの濃 縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加える。増幅は以 下の条件に従って行う。 ステップ1 94℃で60秒間 ステップ2 94℃で20秒間 ステップ3 55℃で30秒間 ステップ4 72℃で90秒間 ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復 ステップ6 72℃で180秒間 ステップ7 4℃(そのまま保持) PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動 させる。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクロ ーンを選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行う。 6 ハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用 配列番号:2の配列に基づくハイブリダイゼーションプローブを用いて、cD NA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングする。約20の塩基対から なるオリゴヌクレオチドの標識について特に記すが、大きなcDNAフラグメン トの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴ ヌクレオチドをOLIGO4.06(National Bioscience)のような最新式のソフトウェ アを用いてデザインし、50pmolの各オリゴマーと、250mCiの[γ-32 P]アデノシン三リン酸(Amersham)及びT4ポ せて用いて標識する。標識されたオリゴヌクレオチドを、SephadexG-25超精細樹 脂カラム(Pharmacia)を用いて精製する。毎分107カウントのセンス及びアン チセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれを含む部分を、エンドヌクレアーゼAseI ,Bgl II,EcoRI,Pst い,Xba1或いは的な膜ベースのハイブリダイゼーション解析において用いる。 各消化物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン 膜(Nytran Plus,Schieicher & Schuell,Durham NH)にトランスファーする。ハ イブリダイゼーションは40℃で16時間かけて行う。非特異的シグナルを取り 除くため、ブロットを、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水及び0.5%ドデシ ル硫酸ナトリウムまで段階的に厳密性が増す条件下で、室温にて順次洗浄する。 XOMAT ARTMフィルム(Kodak,Rochester,NY)を、Phosphoimager cassette(Mole cular Dynamics,Sunnyvale,CA)においてブロットに数時間露光した後、ハイブ リダイゼーションパターンを視覚的に比較する。 7 アンチセンス分子 NANCHをコードする配列或いはその任意の一部分は、自然発生の配列のin vivoまたはin vitro発現を阻害するために用られる。約20塩基対からなるア ンチセンスオリゴヌクレオチドの使用について特に記すが、より大きなcDNA フラグメントの場合でも概ね同じ方法を用いることができる。第1A図、第1B 図、及び第1C図に示すようなNANCHをコードする配列に基づくオリゴヌク レオチド用いて、自然発生 NANCHの発現を阻害することができる。相補的なオリゴヌクレオチドを、第 1A図、第1B図、及び第1C図に示す最も独特な5’配列から設計し、これを 用いてプロモーターが結合するのを阻害することにより転写を抑制したり、リボ ソームが転写物に結合するのを阻害してNANCH転写物の翻訳を抑制すること ができる。配列番号:2の5’配列の適切な部分を用いることにより、効果的な アンチセンスオリゴヌクレオチドが、第1A図、第1B図、及び第1C図に示す ポリペプチドのシグナル配列または5’コーディング配列に翻訳される領域全体 にわたる15〜20個のヌクレオチドを含むようになる。 8 NANCHの発現 NANCHの発現は、cDNAを適切なベクター内にサブクローニングし、そ のベクターを宿主細胞にトランスフェクトすることによって行われる。この場合 、前にcDNAライブラリーの作製の際に用いたクローニング用のpSportベクタ ーを用いて、大腸菌においてNANCHを発現させる。クローニング部位の上流 には、β−ガラクトシダーゼに対するプロモータが存在し、その後ろにはアミノ 基末端Met及びβ−ガラクトシダーゼの7残基が存在する。後続のこれら8つの 残基は、転写に役立つバクテリオファージプロモーターであり、多くの独特の切 断部位を含むリンカーである。 単離されたトランスフェクト菌株を、IPTGを用いて標準的な方法で誘導し、初 めのβガラタトシダーセの7残基、約5〜15残基のリンカー、及び完全長NA NCHからなる融合タンパク質を作り出す。このシグナル配列は菌培地へのNA NCHの分泌を誘導し、この培地は後の活性のアッセイにおいて直接用いること ができる。 9 NANCH活性の確認 NANCHは、NANCHをコードする真核生物の発現ベクターを用 いて、COS7、HeLa、又はCHOのような哺乳類細胞系を形質転換することにより発 現させることができる。真核生物の発現ベクターは市販されており、それを細胞 内に導入するための技術は、当業者にはよく知られている。外来DNAが取り込 まれ発現された細胞を速やかに同定できるようにするため、例えばβガラクトシ ダーゼのような様々なマーカー遺伝子の任意の1つを発現する少量の第2のプラ スミドを細胞に同時形質転換する。形質転換の後、その細胞系に適切な条件の下 でこの細胞を48〜72時間インキュベートし、NANCH及びβガラクトシダ ーゼが発現及び蓄積できるようにする。 当分野においてよく知られた条件の下で培地に適切な比色定量用物質を加える と、βガラクトシダーゼを発現する形質転換された細胞は青に染色される。染色 された細胞を、当分野においてよく知られた電気生理学的技術により、塩素イオ ンによる膜コンダクタンスの違いについて試験する。形質転換されていない細胞 、及び/又はベクター配列のみ、又はβガラクトシダーゼ配列のみの何れかで形 質転換された細胞をコントロールとして用いて、同時並行で試験する。 NANCHを発現する細胞は、コントロールの細胞より高い塩素イオンコンダ クタンスを有する。塩素イオンコンダクタンスに対するNANCHの寄与は、N ANCHに対して特異的な抗体を用いて細胞をインキュベートすることにより確 認できる。NANCH特異的抗体は、NANCHの細胞内の側に結合し、これに よりイオンチャネルにおける細孔を遮断する。 10 NANCH特異的抗体の産生 標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、PAGE電 気泳動法(Sambrook前出)を用いて実質的に精製されたNANCHを用いる。配 列番号:2から類推されるアミノ酸配列をDNAStar ソフトウエア(DNASTAR社)を用いて解析して免疫抗原性の高い領域を決定し、 対応するオリゴペプチドを当業者には周知の手段により合成して、当業者に周知 の方法で抗体を産生するために用いる。C末端付近の、或いは隣接する親水性領 域内のエピトープのような、適切なエピトープを選択するための解析法は、Ausu bel等(上記)の論文他に記載されている。 通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、Applied Biosystemsのペ プチドシンセサイザModel 431Aを用いてfmoc法のケミストリにより合成し、 M−マレイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS: Ausubel等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペットヘモシニアン(K LH、Sigma,St.Louis,MO)に結合する。フロイントの完全アジュバントにおいて オリゴペプチド−KLH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血清の抗 ペプチド活性を検査するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、1%BS Aを用いてブロックし、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射性ヨウ素 標識されたヤギ抗ウサギIgGと反応させる。 11 特異的抗体を用いる自然発生NANCHの精製 自然発生NANCH或いは組換えNANCHは、NANCHに特異的な抗体を 用いるイムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することができる。イ ムノアフィニティーカラムは、CnBr-activated Sepharose(Pharmacia Biotech 社)のような活性化クロマトグラフレジンとNANCH抗体とを共有結合させる ことにより構築される。結合後、そのレジンを使用説明書の指示に従って、ブロ ックし洗浄する。 NANCHを含む培地をイムノアフィニティーカラムに通し、そのカラムをN ANCHを優先的に吸着できる条件下で(例えば界面活性剤の存在下において高 イオン強度バッファで)洗浄する。このカラムを、抗 体/NANCH結合を切るような条件下(例えばpH2〜3のバッファ、或いは 高濃度の尿素またはチオシアン酸塩イオンのようなカオトロピックイオン)で溶 出させ、NANCHを回収する。 12 NANCHと相互作用する分子の同定 NANCH又は生物学的に活性なその断片を、125Iボルトンハンター試薬(B olton,A.E.及びW.M.Hunter(1973)Biochem.J.133:529-38)で標識する。マルチウ ェルプレートに予め配列しておいた候補の分子を、標識したNANCHとともに インキュベートし、洗浄して、標識NANCH複合体を有する任意のウェルをア ッセイする。異なる濃度のNANCHを用いて得られたデータを用いて、候補の 分子とNANCHの会合、親和性、数の数値を計算する。 上記のすべての刊行物及び特許明細書は、本明細書と一体に参照されたい。本 発明の記載した方法及びシステムの種々の改変は、本発明の範囲及び精神から逸 脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明は特に好適な実施例に関連し て記載されているが、本発明の請求の範囲は、そのような特定の実施例に不当に 制限されるべきではないことを理解されたい。実際には、本発明を実施するため に記載された方法の種々の改変は、分子生物学或いは関連する分野の専門家には 明らかなように、請求の範囲内に含まれるものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 1/15 C12N 1/19 1/19 1/21 1/21 C12P 21/02 C 5/10 C12Q 1/68 A C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA C12Q 1/68 5/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,LS,M W,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY ,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AT,AU ,BR,CA,CH,CN,DE,DK,ES,FI, GB,IL,JP,KR,MX,NO,NZ,RO,R U,SE,US

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1のアミノ酸配列又はその断片を含む実質的に精製されたヒト陰 イオンチャネルタンパク質。 2.請求項1のヒト陰イオンチャネルタンパク質をコードする単離され精製され たポリヌクレオチド配列。 3.請求項2のポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズするポ リヌクレオチド配列。 4.請求項2のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 5.配列番号:2又はその変異体を含む単離され精製されたポリヌクレオチド配 列。 6.請求項2の配列又はその変異体に対して相補的なポリヌクレオチド配列。 7.請求項6のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 8.請求項2のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。 9.請求項8のベクターを含む宿主細胞。 10.配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法であって、 (a)該ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項9の宿主細胞を培養す る過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から該ポリペプチドを回収する過程とを含むことを 特徴とする配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法。 11.配列番号:1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたヒト陰イオンチ ャネルタンパク質を適切な製薬用担体と共に含む医薬品組成物。 12.請求項1のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 13.請求項1のポリペプチドに特異的に結合し、その活性を変調する精製され たアゴニスト。 14.請求項1のポリペプチドに特異的に結合し、その活性を変調する精製され たアンタゴニスト。 15.請求項14のアンタゴニストを適切な製薬用担体と共に含む医薬品組成物 。 16.癌の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に請求項15の医薬品組成物を有効量投与する過 程を含む癌の治療方法。 17.生物学的サンプルにおけるヒト陰イオンチャネルタンパク質をコードする ポリヌクレオチドの検出方法であって、 (a)請求項6のポリペプチドと生物学的サンプルの核酸材料とをハイブリダ イズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程とを含むことを特徴 とし、 前記複合体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるヒト陰イオンチャネルタ ンパク質をコードするポリヌクレオチドの存在と相関性を有することを特徴とす る生物学的サンプルにおけるヒト陰イオンチャネルタンパク質をコードするポリ ヌクレオチドの検出方法。
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