JP2002500633A - Edg−1様受容体 - Google Patents

Edg−1様受容体

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、新規なedg−1様受容体(NEDG)及び、NEDGを同定しコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、発現ベクター、宿主細胞、アゴニスト、抗体、及びアンタゴニストを提供する。また本発明は、NEDGの発現に関連する疾病の治療方法を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 EDG−1様受容体技術分野 本発明は、新規なedg−1様受容体の核酸及びアミノ酸配列、及び癌や細胞 の成長及び分化に関連する疾患の診断、予防、及び治療におけるこれらの配列の 使用に関するものである。背景技術 細胞の初期応答遺伝子は、その転写物が細胞が刺激に曝される数分の間に活性 化される、遺伝子のクラスである。静止状態の細胞が刺激されると、初期応答遺 伝子は速やかに誘起される。これらの遺伝子は、細胞外刺激により誘発される短 期シグナルと、長期的な細胞の表現形の変化とを結びつけることによって標的の 遺伝子の発現を変化させる。また、これらの遺伝子は、遺伝子の転写速度を調節 することによって表現形の変化を誘導するタンパク質をコードし、成長及び分化 の調節において重要な役目を果たすことがわかっている(Lau.L.及びNathans.D. (1987)Proc.Natl.Acad.Sci.84:1182-1186)。 初期応答遺伝子を誘起する細胞外刺激には、成長因子、ホルボールエステル、 オカダ酸、タンパク質合成阻害剤、毒素、及び温度、pH、及び酸素の急激な変 化が含まれる。このような刺激は細胞表面受容体を活性化し、初期応答遺伝子の 転写を誘起するシグナル伝達カスケードを開始させる。これらの初期応答遺伝子 には、サイトカインの遺伝子であるfos、myc、jun、edg−1受容体 、及び核受容体が含まれ、これらは全て、細胞の増殖及び分化において或る役割 を果たす。 edg−1受容体は、ラット及びヒトにおいて特性化されてきた最初期応答遺 伝子であり、細胞分化を開始させる刺激によって誘起される。edg−1遺伝子 産物は、そのリガンドが未知であるために孤児受容体 として分類されているGタンパク質結合受容体である。この遺伝子産物は、原形 質膜を貫通し逆平行αヘリックスの束を形成する7つの疎水性ドメインを含む他 の7回膜貫通タンパク質と共通の特徴を有している。アゴニストによってこれら の授与体を刺激すると、受容体が活性化され、細胞内Gタンパク質複合体と相互 作用するようになる。このGタンパク質複合体は、シグナル伝達経路を調節し、 細胞応答を調節するさまざまなセカンドメッセンジャー分子を活性化する(Lee.M .J.等(1996)J.Biol.Chem.271:11272-11279)。 このヒトedg−1受容体は、Hla.T.及びMaciag.T.が、ホルボール12-ミリス テート13-アセテート(PMA)処理した内皮細胞を、細胞分化に関与する、誘 導された初期遺伝子転写物についてスクリーニングしたときにときに初めに同定 された(1990.J.Biol.Chem.265:9308-9313)。内皮細胞の分化は、血管形成の開 始における重要な因子である。このプロセスによって新たな血管網が既存の毛細 血管から形成され、また、このプロセスは成長や組織の再構築、及び創傷の修復 に必要不可欠である。生理学的には、このプロセスは、胚形成、組織及び器官の 発生、排卵、及び黄体の形成に必要不可欠である。更に、このプロセスは、糖尿 病性網膜症、リウマチ性関節炎、閉塞性血管疾患、及び癌のような種々の病的状 態の進行に際して生じ、この場合は、血管形成によって充実性腫瘍の成長のため の栄養分や酸素が供給される。PMAは、in vitroで内皮細胞の成長を変化させ 、その毛細様管への分化を刺激する発癌プロモータである。PMA処理によって 誘導される初期内皮細胞遺伝子の多くは、細胞分化において一定の役目を果たし 、そのようなものとして、細胞の成長及び分化に関連する細胞の事象を決定する 。 新規なedg−1様受容体及びそれをコードするポリヌクレオチドの発見は、 癌や細胞成長及び分化の異常の診断、予防、及び治療において 役立つ新たな物質を提供することにより、当分野における必要性を満たすもので ある。発明の開示 本発明は、ヒトedg−1に類似性を有することを特徴とする、新規なedg −1様受容体(以下NEDGと称する)を提供する。 従って本発明は、配列番号:1に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製され たポリヌクレオチドを提供する。 本発明の或る態様は、NEDGをコードする単離され実質的に精製されたポリ ヌクレオチドを提供する。特定の態様では、このポリヌクレオチドは、配列番号 :2のヌクレオチド配列である。 また本発明は、配列番号:2又はその変異体の相補配列を含むポリヌクレオチ ド配列に関するものである。更に本発明は、配列番号:2の配列と厳密な条件の 下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。 更に本発明は、NEDGをコードするポリヌクレオチドの断片、一部分、又は 相補配列をコードする核酸配列、及び前記ポリヌクレオチドを含む発現ベクター 及び宿主細胞を提供する。また本発明は、NEDGの抗体、及び実質的に精製さ れたNEDGを含む医薬品組成物を提供する。また本発明は、NEDGのアゴニ スト及びアンタゴニストを提供する。また本発明は、NEDGの投与による、N EDGの低下に関連する疾患の治療方法、及びNEDGのアンタゴニストの投与 による、NEDGの上昇に関連する疾患の治療方法を提供する。図面の簡単な説明 第1A図、第1B図、第1C図、第1D図、及び第1E図は、NEDGのアミ ノ酸配列(配列番号:1)及び核酸配列(配列番号:2)を示す。配列のアライ メントは、MacDNASIS PROTMソフトウェア(Hitachi Software Engineering Co.,Ltd.,San Bruno,CA)を用いて作成した。 第2A図及び第2B図は、NEDG(配列番号:1)とヒトedg−1(GI 1 81948;配列番号:3)との間のアミノ酸配列アライメントを示す。配列のアラ イメントは、DNASTARTMソフトウェア(DNASTAR Inc,Madison WI)のマルチシー ケンスアライメントプログラムを用いて作成した。 第3A図及び第3B図はそれぞれ、NEDGとヒトedg−1の疎水性プロッ ト(MacDNASIS PROTMソフトウェアを用いて作成)を示す図であり、X軸は正の 方向にアミノ酸の位置を表し、Y軸は負の方向に疎水性のレベルを表す。発明の実施の形態 本発明のタンパク質、核酸配列、及び方法について説明する前に、本発明は、 ここに開示した特定の方法論、プロトコル、細胞系、ベクター、及び試薬に限定 されず、当然のことながらこれらを変えて実施することができるものと理解され たい。また、ここで用いられる用語法は、特定の実施例のみを説明する目的で用 いられたものであり、請求の範囲のみによって限定される本発明の範囲を限定す ることを意図したものではないということも理解されたい。 本明細書及び請求の範囲において、単数を表す「1つの」及び「その」と形容 されたものは、前後関係でそうでないことが明らかである場合以外は、複数の意 味も含んでいることに注意しなければならない。従って、例えば「宿主細胞」な る表記が表すものには、複数のそのような宿主細胞が含まれ、「抗体」なる表記 は、1またはそれ以上の抗体及び当業者に周知のその等価物等も表している。 本明細書における全ての科学技術専門用語は、別の意味で定義されていない場 合には、本発明の属する技術分野の専門家に一般に理解される のと同じ意味を有する。ここに説明したものと類似のまたは等価な方法や材料を 本発明の実施や試験において用いることができるが、好適な方法、装置、及び材 料はここに説明されている。本明細書に記載された全ての文献は、本発明の関連 において用いられ得る文献で報告された細胞系、ベクター、及び方法論を説明し 開示する目的で引用されたものであり、この引用により本明細書と一体にされる 。 定義 本明細書において「核酸配列」は、一本鎖か二本鎖の、センス鎖又はアンチセ ンス鎖である、ゲノム起源又は合成起源のDNA、RNAや、オリゴヌクレオチ ド、ヌクレオチド、又はポリヌクレオチド、及びその断片又は一部分である。同 様に、本明細書において「アミノ酸配列」は、自然発生の分子または合成分子の 、オリゴペプチド、ペプチド、ポリペプチド若しくはタンパク質配列及びその断 片又は一部分である。 ここでは「アミノ酸配列」は、自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を指す ものとして説明されているが、「アミノ酸配列」や類似の用語、例えば「ポリペ プチド」又は「タンパク質」は、アミノ酸配列を、説明されるタンパク質分子に 関連する完全で元のままのアミノ酸配列に限定する意味で用いられてるのではな い。 本明細書において「ペプチド核酸」は、リジンのようなアミノ酸残基及びアミ ノ基が加えられたオリゴマーを含む分子である。これらの小分子は抗遺伝子剤と も称され、それに対して相補的な核酸の鎖に結合することにより転写物の伸長を 停止させる(Nielsen,P.E.等(1993)Anticancer Drug Des 8:53-63)。 本明細書において、NEDGは、任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、マウス 、ウマ、及び好ましくはヒトを含む哺乳類から得られる、天然の、 合成の、半合成の、又は組換え体を起源とする実質的に精製されたNEDGのア ミノ酸配列である。 本明細書において「コンセンサス」は、再度シークエンシングされて不要な塩 基が分離された核酸配列か、XL-PCRTM(Perkin Elmer,Norwalk,CT)を用いて5 ’方向及び/または3’方向に延長されて、再度シークエンシングされた核酸配 列か、GELVIEWTMFragment Assembly system(GCG,Madison WI)を用いて2以上 のインサイト社クローンの重複した配列を元に組み合わせて構成された核酸配列 か、若しくは延長と組み合わせの双方によって形成された核酸配列の何れかであ る。 本明細書においてNEDGの「変異体」は、1又は2箇所以上のアミノ酸が変 異したアミノ酸配列である。この変異体は「保存的」変化を含むものであり得、 この保存的変化においては、例えばロイシンをイソロイシンで置き換える場合の ように置換されるアミノ酸が類似な構造的及び化学的特性を有する。稀に、変異 体が「非保存的」に変化する場合もあり、この非保存的変化では例えばグリシン がトリプトファンで置換される。類似した小変化には、アミノ酸の欠失か挿入、 若しくはその両方も含まれる。例えばDNASTARソフトウエアのような良く知られ たコンピュータプログラムを用いて、生物学的或いは免疫学的活性を損なわずに 置換、挿入、又は除去できるアミノ酸が何れかということ、及びそのようなアミ ノ酸がいくつかということを決定することができる。 本明細書において「欠失」は、1または2以上のヌクレオチド若しくはアミノ 酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化である。 本明細書において「挿入」或いは「付加」は、自然発生の分子と比較して、そ れぞれ1または2以上のヌクレオチド、アミノ酸残基が加わる ような、ヌクレオチド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。 本明細書において「置換」は、それぞれ1または2以上のヌクレオチド或いは アミノ酸を、異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる 変化である。 本明細書において、用語「生物学的に活性」は、自然発生の分子の構造的機能 、調節機能、又は生化学的機能を有するタンパク質である。同様に「免疫学的に 活性」は、天然の、組換え体の、又は合成のNEDG、若しくはその任意のオリ ゴペプチドが適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗体に 結合する能力である。 本明細書において、用語「アゴニスト」は、NEDGに結合したとき、NED Gの活性を変調するようなNEDGの変化を生じさせる分子である。アゴニスト には、NEDGに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の他の分子が含まれ 得る。 本明細書において、用語「アンタゴニスト」または「インヒビター」は、NE DGに結合したとき、NEDGの活性を阻害する分子である。アンタゴニスト及 びインヒビターには、NEDGに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の他 の分子が含まれ得る。 本明細書において、用語「変調」は、NEDGの生物学的活性の変化又は変質 である。変調は、タンパク質活性の上昇や低下、結合特性の変化、又はNEDG の生物学的、機能的、免疫学的特性の他の変化であり得る。 本明細書において、用語「擬似物」は、NEDGまたはその一部分の構造の知 識からその構造を知ることができ、そのようなものとして、NEDG様分子の作 用の一部または全てに影響を与え得る分子である。 本明細書において、用語「誘導体」は、NEDGをコードする核酸又はコード されたNEDGを化学的に修飾したものを意味する。このよう な修飾の例には、水素からアルキル基、アシル基、又はアミノ基への置換がある 。核酸誘導体は、未修飾NEDGの必須の生物学的特性を保持しているポリペプ チドをコードする。 本明細書において、用語「実質的に精製」は、天然の環境から取り除かれ、天 然にはそれが結合して存在する他の構成要素から単離又は分離されて、その構成 要素が60%以上、好ましくは75%以上、最も好ましくは90%以上除去され た核酸配列又はアミノ酸配列である。 本明細書において「増幅」は、核酸配列の更なる複製物を生成することであり 、通常は当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて行われる(D ieffenbach,C.W.及びG.S.Dveksler(1995)PCR Primer.a Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,NY)。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション(ハイブリッド形成)」は 、核酸の鎖が塩基対合を介して相補鎖と結合する過程である。 本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なG塩 基とC塩基の間及び相補的なA塩基とT塩基の間での水素結合の形成によって、 2つの核酸配列で形成された複合体である。これらの水素結合は、塩基スタッキ ング相互作用(base stacking interaction)により更に安定化され得る。この 2つの相補的核酸配列は水素結合して、逆平行構造をなす。ハイブリダイゼーシ ョン複合体は、溶液中で形成されるか(例えばC0t又はR0t解析)、或いは核 酸は溶液中に存在する一方の核酸と、固定支持体(例えばin situハイブリダイ ゼーションのために細胞が固定されるメンブラン、フィルタ、ピン、またはスラ イドガラス)に固定化された他方の核酸との間で形成され得る。 本明細書において、用語「相補的」または「相補性」は、許容的な塩及び温度 の条件の下での塩基対によるポリヌクレオチド同士の自然の結 合である。例えば、配列「A−G−T」は相補的配列「T−C−A」に結合する 。2つの二本鎖分子間の相補性は、核酸の幾つかのみが結合している「部分的」 なものであるか、若しくは一本鎖分子間に完全な相補性が存在する場合は完全に 相補的であり得る。核酸鎖同士の相補性の程度は、核酸鎖同士のハイブリダイゼ ーションの効率及び強度に有意な影響を与える。このことは、核酸鎖同士の結合 によって左右される増幅反応において特に重要である。 本明細書において、用語「相同性」は、相補性の程度である。部分的な相同性 と、完全な相同性(即ち同一性)の場合があり得る。部分的に相補的な配列は、 同一の配列が標的の核酸とハイブリダイズするのを少なくとも部分的に阻害する ものであり、これを機能的な用語「実質的に相同な」を用いて表す。完全に相補 的な配列と標的配列とのハイブリダイゼーションの阻害は、低い厳密性の条件の 下で、ハイブリダイゼーションアッセイ(サザンブロット法またはノーザンブロ ット法、溶液ハイブリダイゼーション等)を用いて検定することができる。実質 的に相同な配列またはプローブは、低い厳密性の条件の下で標的の配列と、完全 に相同な配列またはプローブとの結合(即ちハイブリッド形成)について競合し 、それを阻害する。これは、低い厳密性の条件が、非特異的な結合を許容するよ うなものであると言っているのではない。低い厳密性の条件では、2つの配列の 相互の結合が特異的(即ち選択的)相互作用であることが必要である。非特異的 結合が存在しないことは、部分的な程度の相補性(即ち約30%未満の同一性) を有していない第2の標的配列を用いることにより試験できる。非特異的結合が 存在しない場合、プローブは第2の非相補的標的配列とハイブリダイズしない。 周知のように、多数の等価な条件を用いて、低い厳密性条件か高い厳密性条件 の何れかを含むようにすることができる。例えば配列の長さ及 び性質(DNA、RNA、塩基構成)、標的の性質(DNA、RNA、塩基構成 、溶液中に存在するか或いは固定化されているか等)、及び塩や他の成分の濃度 (例えばホルムアミド、デキストラン硫酸、及び/またはポリエチレングリコー ルの有無)のような要素を考慮してハイブリダイゼーション溶液を変え、上に列 挙した条件とは異なるが等価である低い厳密性または高い厳密性の何れかの条件 を作り出すことができる。 本明細書において、用語「厳密な条件」は、約(Tm−5)℃(プローブの融 解温度(Tm)より5℃下)からTmの約20〜25℃下まで範囲で生ずる「厳 密性」である。当業者には理解されるように、ハイブリダイゼーションの厳密性 は、同一のポリヌクレオチド配列の同定や検出のためであるか、或いは近縁なポ リヌクレオチド配列の同定や検出のためであるかによって変えることができる。 本明細書において用語「アンチセンス」は、特定のDNAまたはRNA配列に 対して相補的なヌクレオチド配列である。「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖 に対して相補的な核酸鎖の意味で用いられる。アンチセンス分子は、相補的鎖の 合成が可能なウイルスプロモータに、目的の遺伝子を逆方向に結合することによ る合成を含む任意の方法で作り出すことができる。この転写された鎖は、一度細 胞内に導入されると、細胞によって作られた天然の配列と結合して二重鎖を形成 する。次にこれらの二重鎖は更なる転写や翻訳を阻害する。このようにして、変 異体の表現型を作り出すことができる。「ネガティブ」なる表現はアンチセンス 鎖の意味で時折用いられ、「ポジティブ」はセンス鎖の意味で用いられることが ある。 本明細書において、(「指定のタンパク質の一部分」と用いられるような)タ ンパク質に関連する用語「一部分」は、そのタンパク質の断片である。この断片 のサイズは4つのアミノ酸残基から、(全アミノ酸配 列−1)個のアミノ酸の範囲に亘る。従って、「配列番号:1のアミノ酸配列の 少なくとも一部分を含む」タンパク質は、完全長ヒトNEDGとその断片を含む 。 本明細書の定義では、「形質転換」は、外来DNAが入り込みレシピエント細 胞を変化させるプロセスを意味する。このプロセスは、よく知られた種々の方法 を用いた天然または人工の条件の下で生じ得る。形質転換は、外来核酸配列を原 核細胞または真核細胞の宿主細胞に導入するための任意の既知の方法に基づいて いる。この方法は形質転換される宿主細胞によって選択され、以下のものに限定 されないが、ウイルス感染、電気穿孔法、リポフェクション、及び微粒子銃を用 いる方法が含まれ得る。このように「形質転換された」細胞は、その中で挿入さ れたDNAが自律的に複製するプラスミドとして、或いは宿主の染色体の一部と して複製が可能な安定的に形質転換された細胞を含む。またこのような細胞は、 限られた時間だけ導入されたDNAの一過性の発現をする細胞も含む。 本明細書において、用語「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の一部 分(即ちエピトープ)である。タンパク質またはタンパク質の断片を用いてホス トの動物を免疫すると、このタンパク質の種々の領域が、該タンパク質上の所定 の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘発し得る。これらの 領域または構造を抗原決定基と称する。抗原決定基は、抗体への結合について、 そのままの抗原(即ち免疫応答を引き出すために用いられる免疫原)と競合し得 る。 本明細書において、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」は、抗体 及びタンパク質またはペプチドの相互作用が、タンパク質上の特定の構造(即ち 抗原決定基またはエピトープ)の存在に左右されることを意味している。つまり 、この抗体はタンパク質全体ではなく、特定 のタンパク質構造を認識して結合する。例えば、抗体がエピトープ「A」に対し て特異的である場合、標識した「A」及びその抗体を含む反応において、エピト ープA(つまり結合していない、無標識のA)を含むタンパク質が存在すると、 抗体に結合した標識Aの量が低下する。 本明細書において、用語「サンプル」は、その最も広い意味で用いられる。N EDGをコードする核酸またはその断片を含む疑いのある生物学的サンプルは、 細胞、細胞から単離された染色体(例えば中期染色体の展開物)、(溶液中の、 または例えばサザンブロット解析用に固体支持体に結合した)ゲノムのDNA、 (溶液中の、または例えばノーザンブロット解析用に固体支持体に結合した)R NA、(溶液中の、または固体支持体に結合した)cDNA、細胞や組織からの 抽出物、その他を含み得る。 本明細書において、「ポリヌクレオチドの発現と相関性を有する」なる表現は 、ノーザン解析ハイブリダイゼーションアッセイにより、配列番号:2に類似な リボ核酸の存在が検出されることが、サンプル内のNEDGをコードするmRN Aの存在を表しており、従って該タンパク質をコードする遺伝子からの転写物の 発現と相関性を有しているということを表している。 本明細書において、配列番号:2のポリヌクレオチドにおける「変異」は、ハ イブリダイゼーションアッセイを用いて検出され得る欠失、挿入、及び点変異を 含む、NEDGをコードするポリヌクレオチドの配列における変化を含む。この 定義に含まれる変異は、(例えば、配列番号:2とハイブリダイズし得る制限断 片長の多形性のパターンの変化による)NEDGをコードするゲノムのDNA配 列に対する変異の検出、(例えばアレル特異的オリゴヌクレオチドプローブを用 いる)ゲノムDNAのサンプルと配列番号:2の選択された断片とがハイブリダ イズ不可能で あること、及び(例えば中期染色体展開物との蛍光in situハイブリダイゼーシ ョン(FISH)を用いた)NEDGをコードするポリヌクレオチド配列に対する正 常な遺伝子座以外の遺伝子座とのハイブリッド形成のような、不適当な或いは予 期していないハイブリダイゼーションによって検出される。 本明細書において、用語「抗体」は、そのままの抗体分子及び、例えば抗原決 定基と結合し得るFa、F(ab')2、及びFvのようなその断片である。NEDGポリ ペプチドに結合する抗体は、そのままのポリペプチド、或いは免疫化する抗原と しての目的の小型のペプチドを含む断片を用いて調製することができる。動物を 免疫するのに用いられるポリペプチドまたはペプチドは、翻訳されたcDNAま たは化学的合成物を起源とするものであり得、必要ならば担体タンパク質と結合 することができる。ペプチドに化学的に結合する通常用いられる担体には、ウシ 血清アルブミン及びサイログロブリンが含まれる。次にこの結合したペプチドを 用いて動物(例えばマウス、ラット、またはウサギ)を免疫する。 本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力をそのまま保持しつ つ、ヒトの抗体により近づけるために非抗体結合領域においてアミノ酸を置換し た抗体分子である。 発明 本発明は、新規なedg−1様タンパク質(NEDG)の発見、NEDGをコ ードするポリヌクレオチド、及び癌を含むNEDGの発現が関連する疾患の診断 、予防、又は治療のためのこれらの物質の使用に基づくものである。 本発明のヒトNEDGをコードする核酸は、腫瘍cDNAライブラリーTLYMNO R01を起源とするインサイト社クローンNo.144690におい て、アミノ酸配列アライメントのコンピュータ検索によって初めに同定された。 完全なヌクレオチド配列(配列番号:2)は、インサイト社クローンNo.144690 (TLYMNOR01を起源)の延長によって構成されたものである。 或る実施例では、本発明は、第1A図、第1B図、第1C図、第1D図、及び 第1E図に示す配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドを包含する。N EDGは509個のアミノ酸からなる長さを有し、ヒトedg−1(配列番号:3 )と化学的及び構造的相同性を有する。詳述すると、NEDGはヒトedg−1 と34%の配列同一性を共有する。第2A図及び第2B図に示すように、NEDG とヒトedg−1はN(30番)にAsnグリコシル化部位を有し、位置58番、169番 、186番、193番、及び208番に保存的システインを有している。第3A図及び第 3B図に示すように、NEDGとヒトedg−1はかなり類似な疎水性プロット を示す。ノーザン解析の結果から、種々のライブラリーにおけるこの配列の発現 が分かるが、この配列が発現するライブラリーの多くは、癌を含む増殖組織に関 連するものである。 また本発明は、NEDG変異体を包含する。好適なNEDG変異体はNEDG アミノ酸配列(配列番号:1)と80%以上、より好適には90%以上のアミノ 酸配列同一性を有するものである。最も好適なNEDG変異体は、配列番号:1 と95%以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。 また本発明は、NEDGをコードするポリヌクレオチドを包含する。従って、 NEDGアミノ酸配列をコードする任意の核酸配列を用いて、NEDGを発現す る組換え分子を作り出すことができる。特定の実施例では、本発明は、第1A図 、第1B図、第1C図、第1D図、及び第1E図に示すような配列番号:2の核 酸配列を含むポリヌクレオチドを包 含する。 当業者には理解されるように、遺伝暗号の縮重の結果、任意の既知の自然発生 遺伝子のヌクレオチド配列と最小限の相同性しか有していないものも含めて、多 種のNEDGコーディングヌクレオチド配列が作り出され得る。本発明は、可能 なコドン選択に基づく組み合わせを選択することにより作り出され得る、全ての 可能な核酸配列の変異をその範囲に含んでいる。それらの組み合わせは、自然発 生のNEDGのヌクレオチド配列に適用されるような標準的なトリプレット遺伝 暗号に基づいて作り出されるものであり、このような全ての変異は、ここに具体 的に示されたものと考えられたい。 NEDG及びその変異体をコードするヌクレオチド配列は、適切に選択された 厳密性の条件の下で自然発生配列のヌクレオチド配列とハイブリッド形成可能な ものであるのが好ましいが、実質的に異なるコドンの使用頻度を有するNEDG 又はその変異体をコードするヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る 。コドン選択は、特定のコドンが宿主によって使用される頻度に従って、特定の 原核細胞又は真核細胞の発現宿主におけるペプチド発現の発生率を高めるように 選択することができる。NEDG及びその誘導体をコードするヌクレオチド配列 を、コードされるアミノ酸配列を変えないように実質的に変更する理由は、例え ば自然発生配列から作り出される転写物より長い半減期のような、より望ましい 特性を有するRNA転写物を作り出すためである。 本発明の範囲には、NEDG又はその誘導体をコードするDNA配列又はその 一部の、完全な合成ケミストリによる作製も含まれる。作製したこの合成遺伝子 を、この出願時点において周知の試薬を用いて任意の入手可能なDNAベクター 及び細胞系に挿入することができる。更に、合成ケミストリを用いてNEDGを コードする配列又はその任意の一部 分に突然変異を誘発させることができる。 また本発明の範囲に含まれるものとして、種々の厳密性の条件の下で請求項に 記載のヌクレオチド配列、特に配列番号:2のヌクレオチド配列とハイブリダイ ズし得るポリヌクレオチド配列がある。ハイブリダイゼーション条件は、Wahl,G .M.及びS.L.Berger(1987;Methods Enzymol.152:399-407)及びKimmel,A.R.(1987 ;Methods in Enzymol.152:507-511)に記載されているように、核酸結合複合体ま たはプローブの融解温度(Tm)に基づいており、規定の厳密性において用いら れ得る。 本発明の範囲に含まれるNEDGをコードする変異核酸配列は、異なるヌクレ オチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に同一の、または機能的に等 価のNEDGポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとなるものである。コ ードされたタンパク質も、サイレント変化を生ずるアミノ酸残基の欠失、挿入並 びに置換を含み、結果的に機能的に等価なNEDGとなる。意図的な(delibera te)アミノ酸置換は、NEDGの生物学的活性が保持される限りにおいて、残基 の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性並びにまた両親媒性についての類似性に 基づいてなされ得る。例えば負に荷電したアミノ酸にはアスパラギン酸及びグル タミン酸が含まれ、正に荷電したアミノ酸にはリジン及びアルギニンが含まれ、 近い親水性値を持つ荷電していない極性頭基を有するアミノ酸には、ロイシン、 イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、グルタミン、セリ ン、スレオニン、フェニルアラニン並びにチロシンが含まれる。 更に本発明の範囲に含まれるものとして、NEDGのアレルがある。ここで用 いる「アレル」或いは「アレル配列」とは、NEDGの対立形である。アレルは 変異、すなわち核酸配列の変化によって生じ、一般に 変異したmRNA或いはポリペプチドを生成するが、そのmRNA或いはポリペ プチドの構造或いは機能は、変わる場合もあれば変わらない場合もある。遺伝子 によっては、アレル形が存在しないもの、1つ存在するもの、或いは多数存在す るものがある。一般にアレルを生じる変異はアミノ酸の自然な欠失、付加並びに 置換に起因する。このタイプの変化はそれぞれ単独で、或いは他の変化と同時に 、与えられた配列内で1又は2回以上生じ得る。 当業者が一般に利用可能な周知のDNA配列決定のための方法が、本発明の実 施において用いられ得る。この方法では酵素、例えばDNAポ Cleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)、熱安定性T7ポリメラーゼ (Amersham,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Gaithersburg MD)Methods社から市 販されているELONGASE増幅システムのような校正エキソヌクレアーゼと組換え体 ポリメラーゼとの組み合わせのような酵素を使用する。この処理は、Hamilton M icro Lab2200(Hamilton,Reno,NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Res erch,Watertown MA)並びにABI377DNAシーケンサ(Perkin Elmer)のような装置 を用いて自動化するのが好ましい。 NEDGをコードするポリヌクレオチド配列は、部分的なヌクレオチド配列と 、プロモーター及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当業者に は周知の様々な方法とを用いて伸長させることができる。例えば、「制限部位」 PCR法を用いることができる或る方法では、汎用プライマーを用いて既知の座 位に隣接する未知の配列を得る(Sarkar,G.(1993)PCR Methods Applic 2:318-32 2)。詳述すると、まずゲノムDNAを、既知の領域に対して特異的なプライマ ー及びリンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅する。増幅された配列を 、 その同じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に含まれる別の特異的 プライマーを用いてPCRの2巡目にかける。PCRの各回の生成物を、適切な RNAポリメラーゼを用いて転写させ、逆転写酵素を用いて配列決定する。 逆PCR法を用いて、既知領域に基づく多様なプライマーを利用した配列の増 幅、または伸長を行うことができる(Triglia,T.等(1988) Biosciences社,Plymouth MN)や別の適切なプログラムを用いて、長さが22〜 30ヌクレオチドで、50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度 で標的配列にアニールするように設計される。この方法ではいくつかの制限酵素 を用いて遺伝子の既知領域の適当な断片を作り出す。次にこの断片を分子内ライ ゲーションにより環状にし、PCR用の鋳型として使用する。 使用できる別の方法はキャプチャPCR法であり、この方法ではヒト及び酵母 菌人工染色体DNA内の既知の配列に隣接するDNA断片をPCR増幅する(Lag erstrom,M.等(1991)PCR Methods Applic 1:111-19)。この方法では、PCR処理 の前に、DNA分子の未知の部分に、複数の制限酵素による消化及びライゲーシ ョンによって組換え二本鎖配列を配置しておいてもよい。 未知の配列を得るために用いることができる別の方法は、Parker,J.D.等の方 法(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-3060)である。更に、PCR、ネスト化 プライマー、PromoterFinderTMライブラリーを用いて、ゲノムDNA内歩行を行 うことができる(Clontech,Palo Alto CA)。このプロセスは、ライブラリーを スクリーニングする必要がなく、イントロン/エクソン接合部を探し出すのに有 用である。 完全長cDNAをスクリーニングするときに好適なライブラリーは、 サイズ選択された、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダ ムプライミングした(rondom primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流 領域を含む配列をより多く含むという点で好適である。ランダムプライミングし たライブラリーは、オリゴd(T)ライブラリーで完全長cDNAが得られない 場合に特に有用である。またゲノムライブラリーは、5’及び3’非翻訳領域へ の配列の伸長のために役立ち得る。 配列決定やPCRの産物のヌクレオチド配列をサイズ分析したり確認するため には、市販のキャピラリー電気泳動システムを用いることができる。詳述すると 、キャピラリーシークエンシングでは、電気泳動による分離のための流動性ポリ マー、レーザーで活性化される4つの異なる蛍光色素(各ヌクレオチドに対して 1つ)を使用し、CCDカメラにより放射線の波長の検出を行う。出力/光強度 は適切なソフトウエア(例えばPerkin elmer製のGenotyperTM及びSequence Navi gatorTM)を用いて電気信号に変換され、サンプルの負荷からコンピュータ解析 及び電子データ表示までの全過程がコンピュータ制御される。キャピラリー電気 泳動法は、特定のサンプル内に限られた量だけ存在するDNA小片の配列決定に 特に適している。 本発明の別の実施例では、NEDG、融合タンパク質或いはその機能的等価物 をコードするポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのNEDGの発現を 誘導する組換えDNA分子において用いることができる。遺伝暗号固有の縮重の ために、同一か機能的に等価なアミノ酸配列を実質的にコードする他のDNA配 列も、NEDGのクローニングや発現のために用いることができる。 当業者には理解できるように、非自然発生コドンを有するNEDGコードディ ングヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る。特定 の原核細胞或いは真核細胞の宿主において選好されるコドンを選択して、例えば 、NEDG発現率を増大させたり、或いは自然発生配列から生成された転写物よ り長い半減期のような望ましい特性を有する組換えRNA転写物を生成すること ができる。 本発明のヌクレオチド配列は、様々な目的、例えば、以下のものに限定はしな いが遺伝子産物のクローニング、プロセシング及び/又は発現を変えるようにN EDGをコードする配列を改変するために既知の方法を用いて組換えることがで きる。無作為断片によるDNA再編成や遺伝子断片のPCR再会合及び合成オリ ゴヌクレオチドを用いて、ヌクレオチド配列を組換えることができる。例えば、 特定部位突然変異誘発のような当業者には周知の技術を用いて突然変異を誘発さ せることによって、新しい制限部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、コド ン選好の変化、スプライスバリアントの生成等をもたらすことができる。 本発明の別の実施例では、未改変NEDGコーディング配列、変異NEDGコ ーディング配列、又は組換えNEDGコーディング配列を異種の配列に結合して 、融合タンパク質をコードする配列にする。例えば、NEDG活性のインヒビタ ーをペプチドライブラリーからスクリーニングする場合、市販の抗体により認識 される異なるペプチドを発現するキメラNEDGタンパク質をコードすることが 役立つ。融合タンパク質はNEDG配列と異種のタンパク質配列との間の位置に 切断部位を有するように設計することもでき、これによってNEDGを切断して 、ヘテロの部分から分けて精製することが可能となる。 本発明の別の実施例では、当業者によく知られた化学的方法(Caruthers.M.H. 等(1980)Nuc Acids Res Symp Ser 7:215-223;Horn,T.等(1980)Nucl.Acids Res Symp.Ser.225-232参照)を用いて、NEDGコーディング配列の全体、或いは その一部を合成することができ る。別法では、化学的方法を用いてタンパク質自体を作り出して、NEDGアミ ノ酸配列の全体或いはその一部を合成することができる。例えば、種々の固相技 術(Roberge,J.Y.等(1995)Science 269:202-204)でペプチド合成を行うことが でき、合成の自動化は、例えばABI431Aペプチドシンセサイザ(Perkin Elmer) を用いることにより達成することができる。 この新たに合成されたペプチドは、分離用高速液体クロマトグラフィにより実 質的に精製することができる(例えばCreighton T.(1983)Proteins Structure And Molecular Principles ,WH Freeman and Co.,NY参照)。合成されたペプチ ドの構成は、アミノ酸解析或いはシークエンシングにより確認することができる (例えばエドマン分解法;Creighton,上述)。さらにNEDGのアミノ酸配列 或いはその任意の部分を、その直接の合成の際の改変することにより、及び/又 は化学的方法を用いた他のタンパク質或いはその任意の部分に由来する配列との 結合することによって変異体ポリペプチドを作ることができる。 生物学的に活性なNEDGを発現させるために、NEDGコーディングヌクレ オチド配列或いはその機能的等価物を、適切な発現ベクター、すなわち挿入され たコーディング配列の転写及び翻訳に必要な要素を含むベクターに挿入する。 NEDGコーディング配列及び適切な転写や翻訳の調節領域を含む発現ベクタ ーを作製するために当業者に周知の方法が用いられる。これらの方法には、in v itro組換えDNA技術、合成技術、並びにin vivo組換え技術、又は遺伝子組換 え技術が含まれる。このような技術は、Sambrook,J.等(1989)Molecular Cloning ,A Laboratory Manual ,Cold Spring Harbor Press,Planview NY及びAusubel,F.M .等Current Protocol in Molecular Biology,John Wilky &Sons,New York NYに 記 載されている。 種々の発現ベクター/宿主系を、NEDGコーディング配列を保持し、かつ発 現するために利用することができる。このようなものには、以下のものに限定は されないが、組換えバクテリオファージ、プラスミド或いはコスミドDNA発現 ベクターで形質転換した細菌のような微生物や、酵母菌発現ベクターで形質転換 した酵母菌や、ウイルス発現ベクター(例えばバキュロウイルス)を感染させた昆 虫細胞系や、ウイルス発現ベクター(例えばカリフラワーモザイクウイルスCaMV 、タバコモザイクウイルスTMV)をトランスフェクトした、或いは細菌の発現ベ クター(例えばTi、或いはpBR322プラスミド)で形質転換した植物細胞系や、或 いは動物細胞系が含まれる。 これらの系の「調節領域」或いは「制御配列」は、転写及び翻訳を実行するた めに宿主細胞のタンパク質と相互作用するベクターの非翻訳領域、即ちエンハン サー、プロモーター及び3’非翻訳領域である。このようなエレメントの、強さ 及び特異性は様々であり得る。利用されるベクター及び宿主に応じて、構成的及 び誘導的プロモーターを含む任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントを用いる ことができる。例えば、細 (Stratagene,LaJolla CA)のハイブリッドlacZプロモーター及びptrp-lacハイ ブリッド等のような誘導的プロモーターを用いることができる。バキュロウイル スポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞において用いることができる。植物細胞 のゲノムに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例えば熱ショック遺伝子,R UBISCO及び貯蔵タンパク質遺伝子)、若しくは植物ウイルスに由来するプロモー ター或いはエンハンサ(例えばウイルス性プロモータ或いはリーダー配列)を、 ベクターにクローン化してもよい。哺乳動物細胞では、哺乳類遺伝子或いは哺乳 類ウイルス由来のプロモーターが最適である。NEDGをコードする配列の多数 の複製を含む株細胞を作る必要がある場合には、SV40或いはEBVに基づくベクタ ーを適切な選択マーカーと共に用いる。 細菌系では、NEDGの用途に応じて多数の発現ベクターを選択することがで きる。例えば抗体誘発のために大量のNEDGが必要とされる場合は、容易に精 製される融合タンパク質を高レベルで発現できるベクターが望ましい。そのよう なベクターには、以下のものに限定はしない (Stratagene)(このベクターでは、NEDGをコードする配列を、アミノ末端 メチオニン及び後続のβ−ガラクトシダーゼの7残基の配列を備えたフレーム内 においてベクターに結合してハイブリッドタンパク質を生成できる)や、pINベ クター(Van Heeke,G.及びS.M.Schuster(1989)J.Biol.Chem.264:5503-5509) 等が含まれる。またpGEXベクター(Promage、Madison WI)も、グルタチオンS −トランスファーゼ(GST)を有する融合タンパク質として異種ポリペプチドを 発現するため用いることができる。一般に、そのような融合タンパク質は可溶性 であり、グルタチオンアガロースビーズへ吸着させた後、遊離グルタチオンの存 在下で溶出させることにより溶解した細胞から容易に精製できる。その系におい て生成されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン或いはXA因子プロテアーゼ 切断部位を含めて、目的のクローン化ポリペプチドをGST部分から随意に放出さ せることができるように設計される。 酵母菌、サッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)では、α因 子、アルコールオキシダーゼ及びPGHのような構成的或いは誘導的プロモーター を含む多数のベクターを用いることができる。その概要を知るには、Ausubel等 (前出)及びGrant等(1987)Methods Enzymol 153:516-544を参照されたい。 植物発現ベクターを用いる場合には、NEDGをコードする配列の発現は、多 数のプロモーターの何れかで促進される。例えばCaMVの35S及び19Sプロモーター のようなウイルスのプロモーターを、単独で、或いはTMV(Takamatsu,N.等(198 7)EMBO J 6:307-311)由来のオメガリーダー配列と共に用いることができる。 別法として、RUBISCOの小サブユニット、或いは熱ショックプロモーターのよう な植物プロモーターが用いてもよい(Coruzzi,G.等(1984)EMBO J 3:1671-1680 );Broglie,R.等(1984)Science 224:838-843;及びWinter,J.等(1991)Resul ts Probl.Cell Differ.17:85-105)。これらの構成は、直接のDNA形質転換或 いは病原体によるトランスフェクションにより植物細胞内に導入できる。このよ うな技術の種々の一般に入手可能な文献に記載されている(Hobbs,S.又はMurry,L .E.McGraw Hill Yearbook of Science and Technology(1992)McGraw Hill NY, pp191-196を参照されたい)。 昆虫系もNEDGの発現のために用いることができる。例えば、そのような系 の一つでは、Spodoptera frugiperda細胞或いはTrichoplusiaの幼虫において外 来遺伝子を発現するためのベクターとして、Autographa californica核多角体病 ウイルス(AcNPV)が用いられる。NEDGをコードする配列は、ポリヘドリン 遺伝子のようなウイルスの非必須領域にクローニングされ、ポリヘドリンプロモ ーターの制御下に置かれ得る。NEDGコーディング配列の挿入が成功すると、 ポリヘドリン遺伝子が不活性になり、コートタンパク質膜が欠如した変異体ウイ ルスが生成される。次に、この変異体ウイルスを用いて、S.frugiperda細胞或い はTrichoplusiaの幼虫へ感染させ、その中でNEDGが発現される(Engelhard, E.K.等(1994)Proc Nat Acad Sci91:3224-3227)。 哺乳類宿主細胞では、多数のウイルス性発現系を利用することができ る。発現ベクターとしてアデノウイルスが用いられる場合には、NEDGをコー ドする配列は、後期プロモータ及び三連リーダー配列からなるアデノウイルス転 写物/翻訳物複合体内に結合され得る。ウイルスのゲノムの非必須E1又はE3領域 へ挿入することにより、感染した宿主細胞でNEDGを発現できる生ウイルスに なる(Logan,J.及びShenk,T.(1984)Proc Nat Acad Sci 81:3655-3659)。さら に、哺乳類宿主細胞内の発現を増加させるためにラウス肉腫ウイルス(RSV)エ ンハンサのような転写エンハンサを用いることができる。 また、NEDG配列の効率的な翻訳のためには、特定の開始シグナルも必要で ある。これらのシグナルには、ATG開始コドン及び隣接する配列が含まれる。N EDG及びその開始コドン及び上流配列が適切な発現ベクター内に挿入される場 合には、翻訳制御シグナルを加える必要はない。しかしながらコーディング配列 又はその一部のみが挿入される場合には、ATG開始コドンを含む外来の翻訳制御 シグナルを与えなければならない。さらに、全インサートの転写が確実に行われ るようにするために、開始コドンは正しい読み枠に存在しなければならない。外 来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の様々な起源に由来する ものであり得る。発現の効率は、その細胞系に適切なエンハンサーを含めること により高めることができる(Scharf,D.等(1994)Results Probl Cell Differ 2 0:125-162)。 さらに宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節したり、発現したタンパク 質を望ましい形にプロセシングする能力で選択される。このようなポリペプチド の修飾には、以下のものに限定はしないが、アセチル化、カルボキシル化、グリ コシル化、リン酸化、脂質化(lipidation)並びにアシル化が含まれる。またタ ンパク質の「プレプロ」部分を切り離す翻訳後プロセシングも、正しい挿入、折 り畳み、及び/又は機能の発 揮のために重要である。CHO、HeLa、MDCK、293、WI38等のような異なる宿主細胞 は、そのような翻訳後の活動のための特定の細胞装置及び特徴的な機構を有して おり、導入される異種タンパク質の修飾やプロセシングが確実に行われるように 選択され得る。 長期間にわたって変異体タンパク質の高収率の産生を確保するためには安定し た発現が望ましい。例えば、ウイルスの複製起源や内在性発現エレメント及び選 択マーカー遺伝子を含む発現ベクターを用いて、NEDGを安定的に発現する株 細胞を形質転換し得る。ベクターの導入の後、細胞を、選択培地に切り替える前 に濃縮培地内で1〜2日間増殖させる。選択マーカーの目的は、選択のための耐 性を与え、その存在によって導入された配列をうまく発現する細胞を増殖、回収 できるようにすることである。安定的に形質転換された細胞の耐性凝集塊は、そ の細胞型に適した組織培養技術を用いて増殖することができる。 形質転換された株細胞を回収するために任意の数の選択系を用いることができ る。選択系には、以下のものに限定はしないが、単純ヘルペスウイルスチミジン キナーゼ(tk)(Wigler,M.等(1977)Cell 11:223-32)及びアデニンホスホリ ボシルトランスフェラーゼ(aprt)(Lowy,I.等(1980)Cell 22:817-23)遺伝 子が含まれ、それぞれtk及びaprt細胞において用いられる。また代謝拮抗物質、 抗生物質或いは除草剤への耐性を選択の基礎として用いることができる。例えば dhfrはメトトレキセートに対する耐性を与え(Wigler,M.等(1980)Natl Acad Sci 77:3567)、nptはアミノ配糖体のネオマイシン及びG-418に対する耐性を与え(Co lberre-Garapin,F.等(1981)J Mol Biol 150:1)、als或いはpatはクロルスル フロン(chlorsulfuron)、ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼ(p hosphinotricin acetyltransferase)に対する耐性を与える(Murry,前出)。 さらに選択に利用できる遺伝子として、例 えば細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用できるようにするtrpB、 細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノール(histinol)を利用できるようにする hisDが文献に記載されている(Hartman,S.C.及びR.C.Mulligan(1988)Proc Nal t Acad Sci 85:8047-51)。最近になって、形質転換体を特定するためばかりで はなく、特定ベクター系による一過性の或いは安定的なタンパク質発現の量を定 量するために広く用いられる、例えばアントシアニン、β−グルクロニダーゼ及 びその基質、GUS、及びルシフェラーゼ及びその基質、ルシフェリンのような可 視マーカーがよく利用されるようになった(Rhodes,C.A.等(1995)Methods Mol.B iol.55:121-131)。 マーカー遺伝子発現の存在/不存在によって目的の遺伝子の存在も示されるが 、その存在及び発現は確認すべきである。例えばNEDGをコードする配列がマ ーカー遺伝子配列内に挿入された場合は、NEDGをコードする配列を含む組換 え体細胞をマーカー遺伝子の機能の存在により確認できる。別法では、マーカー 遺伝子をNEDGをコードする配列と直列に配置して、両者が単一プロモータの 制御下となるようにすることができる。誘導に応じてのマーカー遺伝子の発現、 つまり選択は、通常直列に配置された配列の発現をも同時に示すことになる。 この他当業者には周知の様々な方法により、NEDGのコーディング配列を含 みNEDGを発現する宿主細胞を識別できる。このような方法には、以下のもの に限定はしないが、DNA-DNA或いはDNA-RNAハイブリダイゼーション及び、核酸及 びタンパク質を検出及び/又は定量するための膜ベース、溶液ベース或いはチッ プベースの技術を含むタンパク質バイオアッセイ或いはイムノアッセイが含まれ る。 NEDGをコードする配列のプローブ、一部、或いは断片を用いるDNA-DNA又 はDNA-RNAハイブリダイゼーション若しくは増幅により、 NEDGポリヌクレオチド配列の存在を検出することができる。核酸増幅に基づ くアッセイでは、NEDGをコードするDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出す るために、核酸配列に基づくオリゴヌクレオチド或いはオリゴマーを用いる。本 明細書において「オリゴヌクレオチド」或いは「オリゴマー」とは、プローブ或 いは、PCRで増幅されるセグメントであるアンプリマーとして用いることがで きる核酸配列であって、長さが約10ヌクレオチド以上、最大60ヌクレオチド 程度、好適には15〜30ヌクレオチド、より好適には20〜25ヌクレオチド であるものを指す。 このタンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいず れかを用いてNEDGポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々のプロ トコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例には、酵素結合免疫 検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表示式細胞分取器法(FACS )を含まれる。NEDGポリペプチド上で2つの非干渉なエピトープに対して反 応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナルベースのイムノアッ セイ(two-site,monoclonal-based immunoassay)が好適であるが、競合的結合 アッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは、他の文献、Ha mpton,R.等(1990;Serologivcal Methods,a Laboratory Manual,APS Press,St P aul MN)及びMaddox,D.E.等(1983,J.Exp.Med.158:1211-1216)に記載されてい る。 さらに多くの標識及び結合技術が当業者には周知であり、種々の核酸及びアミ ノ酸のアッセイにおいて用いることができる。近縁な配列を検出するための、標 識されたハイブリダイゼーションプローブやPCRプローブを作成するための手 段には、オリゴ標識、ニックトランスレーション法、末端標識、或いは標識ヌク レオチドを用いるPCR増幅などが 含まれる。別法としては、NEDGコーディング配列、或いはその任意の部分を 、mRNAプローブの作成のためのベクターにクローン化する。そのようなベク ターは当分野では周知で、市販されており、例えばT7、T3、或いはSP6のような 適切なRNAポリメラーゼ及び標識されたヌクレオチドを加えることにより、in vitroでRNAプローブを合成するために用いることができる。これらの方法は 、種々の市販のキット(Pharmacia Upjohn(Kalamazoo,MI);Promega(Madison WI);US Biochemical Corp(Cleveland OH))を用いて実行することができる 。適切なリポーター分子、すなわち標識には、放射性核種、酵素、フルオレセン ト(蛍光剤)、化学発光剤或いは色素剤や、基質、補助因子、インヒビター、磁 気粒子等が含まれる。 NEDGをコードするヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞を、コード されたタンパク質を細胞培地で発現させ、そこから回収するのに適した条件下で 培養することができる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用いられ る配列及び/またはベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり細胞内に含まれる ようにすることができる。当業者には理解されるように、NEDGをコードする ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを、原核細胞か真核細胞の細胞膜を通して のNEDG分泌を誘導するシグナル配列を含むように設計することができる。他 の組換え体作製物では、NEDGをコードする配列を、可溶性タンパク質の精製 を容易にするポリペプチドドメインをコードするヌクレオチド配列に結合するこ とができる。そのような精製を容易にするドメインには、以下のものに限定はし ないが、固定化金属上での精製を可能にするヒスチジントリプトファンモジュー ルのような金属キレートペプチド、固定化免疫グロブリン上での精製を可能にす るプロテインAドメイン、並びにFLAGS伸長/アフィニティ精製システムにおい て用いられるドメイン (Immunex、Seattle WA)が含まれる。精製ドメインとNEDGの間にXA因子 或いはエンテロキナーゼ(Invitrogen,San Diego CA)に対して特異的な配列の ような切断可能なリンカー配列を含めるのは精製を促進するのに役立つ。NED Gをコードする配列とともに、6個のヒスチジン残基、それに続くチオレドキシ ン及びエンテロキナーゼ切断部位をコードする核酸配列を含むこのような発現ベ クターの1つは、融合タンパク質を発現する。ヒスチジン残基がIMIAC(Porath, J等(1992;Protein Exp.Purif.3:263-281)に記載のような固定化金属イオンア フィニティクロマトグラフィー)精製を促進するとともに、エンテロキナーゼ切 断部位が融合タンパク質からのNEDGの精製のための手段となる。融合タンパ ク質を含むベクターについての解説は、Kroll,D.J.等(1993;DNA Cell Biol 12: 441-453)に記載されている。 組換え体の産生に加えて、NEDGの断片を、固層技術を用いた直接のペプチ ド合成で形成することもできる(Merrifield J.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:2149-2 154参照)。in vitroタンパク質合成は手作業で行えるが、自動化することもで きる。自動的な合成は、例えば、Applied Biosystem 431Aペプチドシンセサイザ (Perkin Elmer)を用いて行うことができる。NEDGの種々の断片を個別に化 学的に合成し、化学的方法を用いて結合して完全長分子を作り出してもよい。 治療 NEDG(配列番号:1)とヒトedg−1(配列番号:3)との間の化学的 及び構造的相同性から考えると、NEDGは初期応答遺伝子として機能し、Gタ ンパク質結合受容体の構造的特徴を有している。NEDGによって、細胞の外部 の刺激に対する応答が可能となり得、成長に変化を与えたり、分化を開始させる ことが可能となる。ノーザン解析の 結果は、NEDGが、癌を含む組織の増殖に関連を有しており、細胞成長及び分 化の調節について一定の役割を果たしていることを示している。 従って、或る実施例では、細胞増殖を刺激するために、NEDG又はその断片 若しくは誘導体を細胞に与え得る。詳述すると、細胞又は細胞群の再生及び分化 を促進するために、リポソーム、ウイルスベースのベクター、若しくはエレクト ロインジェクションのようなデリバリー機構を用いて、in vivoで細胞又は細胞 群にNEDGを与えることができる。更に、自家移植又は異種移植で使用するた めの細胞の増殖の刺激するべく、in vitro又はex vivoで細胞、細胞系、組織又 は器官の培地にNEDGを加えることができる。場合によっては、感染症や癌と 戦う細胞の能力、若しくは鎌状赤血球貧血、β地中海貧血、ハンチントン舞踏病 、嚢胞性線維症等のような疾病における遺伝子欠損を修正する細胞の能力につい て、細胞を選択した。 別の実施例では、異常な細胞成長又は分化の疾病の治療又は予防のために、N EDG又はその断片若しくは誘導体を患者に投与し得る。このような疾病には、 以下に限定されないが、アルツハイマー病、黄体形成異常、変形性関節炎、骨粗 鬆症、無排卵、パーキンソン病、及びリウマチ性関節炎が含まれる。更に、細胞 に障害を生ずるような疾患、例えば心筋梗塞、動脈硬化症、末梢血管疾患、脳卒 中、及び種々のタイプの虚血が含まれる。 別の実施例では、上述のような異常な細胞成長又は分化の疾患の治療又は予防 のために、NEDG又はその断片若しくは誘導体を患者に投与することもできる 。 別の実施例では、上述のような異常な細胞成長又は分化の疾患の治療又は予防 のために、NEDGのアゴニストを患者に投与し得る。 別の実施例では、過剰な細胞増殖の疾患の治療又は予防のために、N EDGのアンタゴニスト又はインヒビターを患者に投与し得る。詳述すうと、こ のような細胞増殖には、癌で生ずるものが含まれる。このようなタイプの癌には 、以下に限定されないが、腺癌、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、奇 形癌腫、特に副腎、膀胱、骨、脳、乳房、子宮頚、食道、胃腸管、心臓、腎臓、 肝臓、肺、卵巣、膵臓、副甲状腺、下垂体、前立腺、唾液腺、脾臓、胃、胸腺、 甲状腺、精巣、及び子宮の癌が含まれる。他の疾病には、以下に限定されないが 、成人呼吸窮迫症候群、アレルギー、強直性脊椎炎、喘息、アテローム性硬化症 、動脈硬化症、気管支炎、皮膚筋炎、糖尿病性網膜症、過好酸球増加症、神経線 維腫症、多発筋炎、及びリウマチ性関節炎が含まれる。 別の実施例では、上述の疾病の治療又は予防のために、NEDGをコードする ポリヌクレオチドの相補配列、つまりアンチセンスを発現するベクターを患者に 投与し得る。或る態様では、NEDGに特異的な抗体を、アンタゴニストとして 直接的に用いたり、或いはNEDGを発現する細胞又は組織に薬物を送達するた めのターゲティング又はデリバリー機構として間接的に用いることができる。 別の実施例では、上述した治療用タンパク質、アンタゴニスト、抗体、アゴニ スト、アンチセンス配列又はベクターの何れかを、他の適切な薬剤と組み合わせ て投与し得る。当業者であれば、併用療法において使用するための適切な薬剤を 、既存の医薬上の原理に基づいて選択することができよう。治療薬を組み合わせ ることにより、上述した種々の疾患の治療又は予防に効果を上げる相乗作用を与 え得る。この方法を用いることにより、より少ない投与量の各薬剤で同じ治療効 果を上げることができ、従って副作用の可能性を減らすことができる。 NEDGのアンタゴニスト又はインヒビターは、周知の方法を用いて製造する ことができる。詳述すると、精製されたNEDGを用いて抗体 を精製したり、或いはNEDGに特異的に結合するものを同定するべく薬物のラ イブラリーをスクリーニングすることができる。 抗体は、周知の方法を用いて作り出すことができる。このような抗体には、以 下に限定されないが、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、 一本鎖抗体、Fabフラグメント、及びFab発現ライブラリーにより産生され たフラグメントが含まれ得る。中和抗体(即ち二量体形成を阻害する抗体)は治 療の用途に特に好適である。 抗体を産生するため、NEDG或いは免疫学的特性を保持するその任意の一部 、断片或いはオリゴペプチドを注射することによって、ヤギ、ウサギ、ラット、 マウス等を含む種々の宿主を免疫することができる。宿主の種に応じて、種々の アジュバントを免疫学的反応を増強するために用いることができる。そのような アジュバントには、以下のものに限定はしないが、フロイントのアジュバント、 水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント、リゾレシチンのような界 面活性物質アジュバント、プルロニックポリオールアジュバント、ポリアニオン アジュバント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュバント、キーホールリン ペットヘモシニアンアジュバント並びにジニトロフェノールアジュバントが含ま れる。BCG(カルメット‐ゲラン杆菌)及びコリネバクテリウム−パルヴム( Corynebacterium parvum)は有用なヒトアジュバントである。 好ましくは、NEDGに対する特異的抗体を誘発するために用いられるペプチ ドは、5個以上のアミノ酸、より好ましくは10個以上のアミノ酸からなるアミ ノ酸配列を有し得る。また好ましくは、これらの配列は、自然タンパク質のアミ ノ酸配列の一部と同一であり、小形の自然発生の分子の全アミノ酸配列を含んで いてもよい。NEDGアミノ酸の短いストレッチを、キーホールリンペットヘモ シアニン及びキメラ分子に 対して産生された抗体のような他のタンパク質の配列に融合してもよい。 NEDGのモノクローナル抗体は、培地内の連続株細胞によって抗体分子を産 生する任意の技術を用いて調製できる。このような技術には、以下のものに限定 はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、及びEBV −ハイブリドーマ技術(Koehler,G.等(1975)Nature 256:495-497;Kozbor,D.等( 1983)Immunol Today 4:72;Cote,R.J.等(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:2026-203 0;Cote,S.P.等(1985)Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R Liss Inc,pp77-96)が含まれる。 さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する分子を得るための「キメラ 抗体」の産生、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子の結合のために開発さ れた技術が用いられる(Morrison,S.L.等(1984)Proc Natl Acad Sci 81:6851- 6855;Neuberger,M.S.等(1984)Nature 312:604-608;Takeda,S.等(1985)Nat ure 314:452-454)。別法として、一本鎖抗体の生成のための周知技術を適用し て、NEDG特異的一本鎖抗体を作り出すことができる。近縁な特異性を有する が、イディオタイプの構成が異なる抗体は、無作為の免疫グロブリン組み合わせ ライブラリーからの鎖再編成(chain shuffing)により生成することができる( Burton D.R.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120-3)。 また抗体は、リンパ球集団でのin vivo産生を誘導することにより、或いは文 献(Orlandi等(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837;Winter,G.等1991,Natu re 349:293-299)に開示されているような高度に特異的な結合試薬のパネルや組 換え免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングすることによっても生成する ことができる。 NEDGに対する特異結合部位を含む抗体フラグメントも生成することができ る。このようなフラグメントには例えば、限定はしないが、抗 体分子のペプシンによる消化で生成することができるF(ab’)2フラグメントや、 F(ab’)2フラグメントのジスルフィド架橋を減らすことにより生成することがで きるFabフラグメントが含まれる。別法として、所望の特異性を有するモノクロ ーナルFabフラグメントを迅速かつ容易に同定できるように、Fab発現ライブラリ ーを作製してもよい(Huse,W.D.等(1989)Science 256:1275-1281)。 所望の特異性を有する抗体を同定するための選別のために種々のイムノアッセ イを用いることができる。確立された特異性を有するモノクローナル抗体或いは ポリクローナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫放射線測 定法の種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。このようなイムノアッ セイでは、NEDGとその特異的抗体との複合体の形成、並びに複合体形成の測 定が行われる。特定のNEDGタンパク質上の2つの互いに非干渉なエピトープ に対して反応するモノクローナル抗体を用いる二部位モノクローナルベースイム ノアッセイが好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる(Maddox(1983), 前出)。 本発明の別の実施例では、NEDGをコードするポリヌクレオチド、またはそ の任意の断片やアンチセンス配列を、治療目的で用いることができる。或る態様 では、このタンパク質の合成を阻害することが望ましいような状況において、N EDGをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンスを用いることができ る。詳述すると、NEDGをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンス 配列で細胞を形質転換することができる。従って、アンチセンス配列を用いて、 NEDG関連の組織損傷を予防したり、遺伝子機能の調節を達成することができ る。このような技術は現在周知となっており、センス又はアンチセンスオリゴマ ー、若しくはより大きな断片を、NEDGコーディング配列のコード領 域や調節領域の種々の位置から設計することができる。 レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイルスに由来 する発現ベクター、或いは種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベクターは、 標的の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために用いられ る。当業者によく知られた方法を用いて、NEDGをコードする配列のアンチセ ンスを発現する組換えベクターを作り出すことができる。これらの技術はSambro ok等(上記)及びAusubel等(上記)に記載されている。 所望のNEDG断片を高レベルで発現する発現ベクターを細胞または組織にト ランスフェクトすることにより、NEDGをコードする遺伝子の機能を停止させ ることができる。このような作製物は、翻訳不可能なセンス配列或いはアンチセ ンス配列で細胞に導入するために用いることができいる。このようなベクターは 、DNAへ組み込まれない場合ですら、全ての複製物が内在性ヌクレアーゼによ り分解されるまで、RNA分子を転写し続ける。このような一過性の発現は、非 複製ベクターでも1ヶ月以上、適当な複製エレメントがベクター系の一部である 場合には更に長い期間継続し得る。 上述のように、NEDGをコードする配列の制御領域、即ちプロモータ、エン ハンサ或いはイントロンに対するアンチセンス分子、DNA、RNAまたはPN Aを設計することにより遺伝子発現を改変することができる。転写開始部位、例 えばリーダー配列の+10〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチドが好 適である。また、転写産物がリボソームへの結合するのを防止することによりm RNAの翻訳を阻止するアンチセンス分子も設計される。同様に、「三重らせん 」塩基対合法を用いて阻害を達成することができる。三重らせん対合は、二重ら せんが十分にほどけないことでポリメラーゼ、転写因子、或いは調節分子が結合 できないようにする。三重らせんDNAを用いた最近の治療法は、文献(Gee,J. E.等(1994)於Huber,B.E.及びB.I.Carr,Molecular and Immunologic Approaches, Futura Publishing Co,Mt Kisco NY)に記載されている。 リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で ある。リボザイムの作用機序では、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列 特異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断 (endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、NEDGのエン ドヌクレアーゼによる切断を特異的かつ効果的に触媒し得る人工合成のハンマー ヘッド型リボザイム分子も含まれている。 任意のRNA標的可能部分内の特異的なリボザイム切断部位を、初めに、配列 GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対する標的分子を調べるこ とによって同定する。一度同定されると、切断部位を含む標的遺伝子の領域に対 応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の短いRNA配列を、そのオリゴヌ クレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴について評価することが可能とな る。候補の標的部分の適切性も、リボヌクレアーゼ保護アッセイを用いて相補的 なオリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成に対する接触性をアッセイすること により評価することができる。 本発明のアンチセンス分子及びリボザイムは、RNA分子を合成するのための 当分野で周知の方法により調製することができる。これらの技術には、固相ホス ホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のようなオリゴヌクレオチドの化学 的合成技術が含まれる。この他、RNA分子を、NEDGをコードするDNA配 列のin vivo及びin vitro転写により生成することができる。このようなDNA 配列は、T7或いはSP6 のような適切なRNAポリメラーゼプロモーターを有する多種のベクターに組み 込むことができる。更に別の方法として、構成的に或いは誘導的にアンチセンス RNAを合成するアンチセンスcDNA作成物を、株細胞、細胞或いは組織内に 導入することができる。 RNA分子は細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾することが できる。可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’末端か3’末端、或 いはその両方へのフランキング配列の付加や、分子のバックボーン内においてホ スホジエステラーゼ結合ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate)或い は2’O−メチルを使用することが含まれる。このコンセプトは、PNA生成固 有のものであり、内在性エンドヌクレアーゼにより容易に認識されないアデニン 、グアニン、シチジン、チミン、及びウリジンの、アセチル−、メチル−、チオ −形態、及び類似の改変形態とともに、イノシン、キュエオシン(queosine)、 及びワイブトシン(Wybutosine)のような従来あまり用いられなかった塩基を含 めることによって、これら全ての分子に拡張することができる。 細胞或いは組織内にベクターを導入するための方法には、上述の方法が含まれ 、これらの方法は、in vivoin vitro、及びex vivoの使用に対しても同様に適 切なものである。ex vivo治療法の場合には、患者から採取された幹細胞にベク ターを導入し、自家移植用のクローンとして増殖して同じ患者に戻す方法がある 。またトランスフェクションによるデリバリー、リポソームによるデリバリーは 、当分野でよく知られている。 上述の治療法の任意のものは、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル 、及び最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、任意の適切な被験体に適用す ることができる。 更に別の実施例は、上述の治療効果のいずれかを発揮させるべく、薬学的に許 容される担体とともに医薬品組成物を投与することに関連する。 このような医薬品組成物は、NEDG、NEDGに対する抗体、NEDGの擬似 物、アゴニスト、アンタゴニスト、又はインヒビターからなるものであり得る。 この医薬品組成物は、単体で、或いは例えば安定剤のような1種以上の他の薬剤 と組み合わせて、任意の無菌の生体適合性製薬用担体に含めて投与される。この ような担体には、限定はしないが、生理食塩水、緩衝食塩水、ブドウ糖或いは水 が含まれる。これらの分子は、患者に対して、単体で、或いは他の薬品やホルモ ンと結合して、賦形剤或いは製薬学的に許容される担体と混合される他の医薬品 組成物に含めて投与され得る。本発明の或る実施例では、製薬学的に許容される 担体とは、製薬学的に不活性なものである。 本発明で用いられる医薬品組成物の投与経路には、以下の経路に限定されない が、経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、髄内投与、くも膜下内投 与、心室内投与、経皮投与、皮下投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、経腸投与、局 所投与、舌下投与、或いは直腸内投与が含まれ得る。 活性成分に加えて、これらの薬品組成物は、薬学的に用いられ得る調合物内へ の活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切な製薬学的に許容 される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は、“Remington's Pharmaceutical Sciences”(Maack Publishing Co,Easton PA)の最新版において 見ることができる。 経口投与用の医薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担 体を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、薬品組成物は、治 療を受ける患者による経口及び鼻腔摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、液 体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁液或いは類似の製剤として処方さ れる。 経口投与するための製剤は、活性化合物と固形の賦形剤とを結合する ことによって得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助剤を添加 した後、得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、錠剤或いは糖衣剤 核を得ることができる。適切な賦形剤は、ラクトース、スクロース、マンニトー ル或いはソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク質充填剤、とうも ろこし、小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセルロース、ヒドロキ シプロピルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロースナトリウムの ようなセルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのようなゴム、並びにゼラ チン或いはコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば、架橋結合したポ リビニルピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなアルギン酸或いはア ルギン酸ナトリウムや、その塩のような、崩壊剤或いは可溶化剤が加えられる。 糖衣剤核は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられるが、溶液はアラビ アゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、ポリエチレングリ コール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機溶剤或いは溶剤混 合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわち活性化合物の量、すなわち投与量 を特徴付けるために染料或いは色素が錠剤或いは糖衣錠皮に加えられてもよい。 経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る 。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤があるなしにかかわらず、脂肪 油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶解或 いは懸濁 される。 非経口投与用の製剤は、水溶性の活性化合物の水溶液を含む。注射用として、 本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンゲル溶液或いは生理 緩衝食塩水のような生理学的に適合性の緩衝液に入れて製剤することができる。 水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール 或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を高める物質を含み得る。更に、活性 成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油性の溶媒 或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグリセリド 或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、所望に応 じて、それにより溶解度を増加し、非常に濃縮された溶液の調製ができるように なる適切な安定剤或いは薬剤を含んでもよい。 局所的投与または経鼻粘膜投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な 浸透剤を用いて調合が行われる。このような浸透剤は、一般に周知である。 本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、顆粒化 処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、封入処理(entrapping)処理或いは凍 結乾燥処理により製造される。 この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸 、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに 形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製 剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝 剤と結合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおけ る凍結乾燥粉末である。 医薬上許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成物は、調製さ れた後、適切な容器内に入れて、さらに提示した疾病状態の治療のためにラベル 付けすることができる。NEDGの投与の場合、このようなラベルには、投与の 量、頻度、方法が表示される。 本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的 を達成するための有効量含む組成物である。有効量の決定は、当業者の能力の範 囲内で十分行うことができる。 任意の化合物について、治療的有効量は、初めに、新生物細胞、或いは通常マ ウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地のアッセイか ら推定される。次いで、このような情報を用いて、ヒトにおける有効量や投与経 路を決定することができる。 治療上の有効量とは、症状や状態を改善するタンパク質、その抗体、アンタゴ ニスト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治療的有 効性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個体群 の50%における治療的有効量、50%有効量)を決定するための、細胞培地或 いは実験動物における標準的な製薬学的方法により決定することができる。毒性 と治療有効性との間の投与量比は治療指数であり、LD50/ED50の比とし て表すことができる。大きな治療指数を示す医薬品組成物が好ましい。これらの 細胞培地のアッセイ及び付加的な動物研究から得られるデータは、ヒトへの使用 に対する投与量の範囲を決める際に用いることができる。そのような化合物の投 与量は、毒性がほとんど或いは全くなく、ED50を達成する循環濃度の範囲内 にあることが望ましい。投与量は、用いられる剤形、患者の感受性並びに投与経 路に応じてこの範囲内で変化する。 正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。 投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性成分を与え、かつ所 定の効果を維持するために調節される。考慮すべき付加的な要因は、疾患状態の 重症度、または患者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時間及び頻度、併用 する薬剤、反応感受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長期的に作用する薬 品組成物は3〜4日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定の処方のクリアラ ンス速度に応じて2週間に1度投与してもよい。 通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大 約1gであり、投与経路に応じて変わってくる。特定の投与量或いは送達の方法 に関する手引きは、当分野の実施者が通常入手できる文献において見出すことが できる。当業者なれば、ヌクレオチドに対しては、タンパク質やインヒビター用 の剤形とは異なる剤形を採用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポ リペプチドの送達方式は、特定の細胞、状態、位置等によって決まってくる。 診断 別の実施例において、NEDGに特異的な抗体は、NEDGの発現を特徴とす る状態や疾病の診断や、NEDGで治療を受けている患者のモニタリングのため のアッセイにおいて役立つ。診断目的で有用な抗体は、上述の治療用のものと同 じように調製することができる。NEDGの診断的測定法には、ヒトの体液、細 胞或いは組織の抽出物においてNEDGを検出するために抗体或いは標識を利用 する方法が含まれる。本発明のポリペプチド及び抗体は、修飾したものでも、修 飾なしでも用いることができ、共有結合、或いは非共有結合かのいずれかでリポ ーター分子と結合することにより標識することができる。種々のリポーター分子 が周知となっており、その幾つかについては上記した。 例えばELISA(酵素結合免疫測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ) 並びにFACS(蛍光表示式細胞分取器法)を含む、NEDGを測定するための種々 のプロトコルが当分野では周知であり、これによってNEDG発現の変化や異常 を診断するための基礎が得られる。NEDGの発現の正常値、つまり標準値は、 哺乳類、好ましくはヒトの正常被験者から得られる体液或いは細胞抽出物とNE DGに対する抗体とを、複合体形成に適した条件の下で結合することによって得 ることができる。標準の複合体形成量は、種々の方法、好ましくは測光手段を用 いることにより定量することができる。被験者、対照標準、及び生検組織からの 患部組織サンプルにおいて発現されたNEDGの量を、標準値と比較する。標準 値と被験者の値との偏差で、疾病診断のパラメータが確立される。 本発明の別の実施例では、NEDGをコードするポリヌクレオチドを、診断目 的で用いることができる。使用できるポリヌクレオチドには、オリゴヌクレオチ ド配列、アンチセンスRNA及びDNA分子、及びペプチド核酸(PNA)が含 まれる。このポリヌクレオチドは、NEDGの発現が疾病と相関性を有する生検 組織における遺伝子発現を検出し、定量するために用いられる。診断的測定は、 NEDGが存在、不存在、及び過剰発現の何れの状態にあるかを区別したり、治 療的介入の際にNEDGレベルの調節をモニタリングするのに役立つ。 或る態様では、NEDGまたは近縁な分子をコードする、ゲノム配列を含むポ リヌクレオチド配列を検出できるハイブリダイゼーションプローブ或いはPCR プローブを用いて、NEDGをコードする核酸配列を同定することができる。そ して、そのプローブの特異性、即ち、そのプローブが非常に高度な保存領域(例 えば5’調節領域における10個の独特のヌクレオチド)と、保存的である度合 いの低い領域(例えば特に3’領域におけるシステイン残基の間の領域)の何れ に由来するのかということ、及びハイブリダイゼーション或いは増幅の(高い、 中程度の 或いは低い)厳密性によって、そのプローブが自然発生NEDGのみを同定する ものであるか、或いはアレル配列や近縁な配列も同定するものであるかというこ とが決まってくる。 プローブは、近縁なインヒビターをコードする配列を検出するためにも用いる ことができ、好ましくは、これらのNEDGをコードする任意の配列から得られ るヌクレオチドを少なくとも50%含むべきである。本発明のハイブリダイゼー ションプローブは、配列番号:2のヌクレオチド配列か、自然発生NEDGのイ ントロン、プロモータ、及びエンハンサーエレメントを含むゲノムの配列に由来 するものであり得る。 NEDGをコードするDNAに対して特異的なハイブリダイゼーションプロー ブの作製のための他の手段には、NEDGやNEDG誘導体をコードする核酸配 列を、mRNAプローブ生成のためのベクターにクローン化する方法がある。こ のようなベクターは周知で市販されており、適切なRNAポリメラーゼや適切な 放射性標識ヌクレオチドを付加することにより、in vitroでのRNAプローブを 合成のために用いることができる。ハイブリダイゼーションプローブは種々のリ ポータ分子により標識することができ、この標識には、32Pや35Sのような放射 性核種、アビジン/ビオチン結合系によりプローブに結合するアルカリホスファ ターゼのような酵素標識等が含まれる。 NEDGをコードするポリヌクレオチド配列を、NEDGに関連する疾病の診 断のために用いることができる。このような状態又は疾病の例には、以下に限定 されないが、腺癌、白血病、リンパ腫、黒色腫、骨髄腫、肉腫、奇形癌腫のよう な癌、特に、副腎、膀胱、骨、脳、乳房、子宮頚、食道、胃腸管、心臓、腎臓、 肝臓、肺、卵巣、膵臓、副甲状腺、下垂体、前立腺、唾液腺、脾臓、胃、胸腺、 甲状腺、精巣、及び子宮の癌;成人呼吸窮迫症候群、アレルギー、強直性脊椎炎 、無排卵、黄体形 成異常、喘息、アテローム性硬化症、動脈硬化症、気管支炎、皮膚筋炎、糖尿病 性網膜症、過好酸球増加症、神経線維腫症、多発筋炎、リウマチ性関節炎、アル ツハイマー病、心発症、変形性関節炎、骨粗鬆症、パーキンソン病、脳卒中、及 び虚血、フリーラジカル、及び毒素によって生ずる心筋のような細胞や神経細胞 の障害;リウマチ性関節炎、創傷治癒が含まれる。NEDGをコードするポリヌ クレオチド配列は、NEDG発現の変化を検出するための生検組織や体液を試験 するための、サザンブロット法或いはノーザンブロット法、ドットブロット法或 いは他の膜ベース技術、PCR技術、ディップスティック試験法(試験紙法)、 ピン或いはチップ技術及びELISAアッセイにおいて用いることができる。このよ うな定性的或いは定量的試験方法は当分野ではよく知られている。 特定の態様では、種々の癌、特に上述の癌の活性化または誘導を検出するアッ セイにおいてNEDGをコードするヌクレオチド配列が役立ち得る。NEDGを コードするヌクレオチド配列を標準的な方法で標識し、ハイブリダイゼーション 複合体の形成に適した条件の下で患者の体液や組織サンプルに加える。適切なイ ンキュベーション時間の経過後、このサンプルを洗浄しシグナルを定量して、標 準値を比較する。生検サンプルまたは抽出サンプルにおけるシグナルの量が、比 較できる対照サンプルのシグナル量と有意に異なっている場合、このヌクレオチ ド配列はサンプルのヌクレオチド配列とハイブリダイズしており、サンプルにお けるNEDGをコードするヌクレオチド配列のレベルの変化が存在することは、 関連疾患の存在を示している。このようなアッセイは、動物実験、臨床試験、ま たは個々の患者の治療のモニタリングにおける特定の治療措置の効果を評価する ために用いることもできる。 NEDGの発現が関係する疾病の診断の基礎を得るために、正常な、或いは標 準の発現プロフィールを確立する。この標準プロフィールは、 動物或いはヒト何れかの正常な被験者から得られる体液或いは細胞抽出物を、ハ イブリダイゼーション或いは増幅に適切な条件下で、NEDGをコードする配列 又はその一部分と結合することにより確立される。標準のハイブリッド形成量は 、既知の量の実質的に精製されたNEDGが用いられる同一の実験で得られる値 と、正常被験者に対して得られる値とを比較することにより定量することができ る。正常なサンプルから得られた標準値は、疾病の症状を示す患者からのサンプ ルから得られる値と比較することができる。標準値と被験者値との偏差を用いて 疾病の存在を確認する。 ひとたび疾患が確認され、治療プロトコルが開始されると、患者での発現レベ ルが正常な患者において観察されるレベルに近づき始めたか否かを評価するため に、このようなアッセイが定期的に繰り返される。継続的なアッセイから得られ る結果を用いて、数日間或いは数ヶ月の期間にわたる治療効果を知ることができ る。 癌については、患者の生検組織において転写物が比較的少ない量存在すること が疾病の発生の素因を示し、つまり実際の臨床的症状が現れる前に疾病を検出す る手段となり得る。この型の一層確定的な診断により、医療従事者が予防的処置 を講じたり、より早期に積極的な治療を開始することが可能となり、疾病の発生 や更なる進行を予防することができるようになり得る。 NEDGをコードするオリゴヌクレオチドの別の診断目的の使用では、PCR を使用することがある。このようなオリゴマーは一般には化学的に合成するが、 酵素を用いて作製したり、或いは組換え体を起源として作り出すこともできる。 オリゴマーは、特定の遺伝子或いは状態を識別するために最適な条件下で用いら れる2つのヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌクレオチド及 びアンチセンス方向(3’← 5’)のヌクレオチドからなる。同一の2つのオリゴマー、入れ子オリゴマーの 組、或いはオリゴマーの縮重プールでさえ、近縁なDNAまたはRNA配列の検 出や定量のためのより厳密性の低い条件の下であっても用いることができる。 さらにNEDGの発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolabelin g)或いはビオチン標識ヌクレオチドの利用、コントロールの核酸の同時増幅(c oamplification)の利用、並びに実験結果を補完して引かれた標準的なグラフ曲 線の利用も含まれる(Melby PC等1993 J Immunol Methods 159:235-44;Duplaa C等1993 Anal Biochem 229-36)。多数のサンプルの定量は、ELISA形式の連続ア ッセイを実行することにより一層迅速に行うことができる。このアッセイでは目 的のオリゴマーが様々な希釈溶液中に存在し、分光光度計を用いる分析或いは比 色分析反応により迅速に定量することができる。 本発明の別の実施例では、NEDGをコードする核酸配列を用いて、自然発生 のゲノム配列マッピングのためのハイブリダイゼーションプローブを生成するこ とができる。この配列を、よく知られた技術を用いて特定の染色体或いはその染 色体の特定領域に対してマッピングすることができる。このような技術には、FI SH、FACSや人工染色体作製物の使用、例えば酵母菌人工染色体、細菌性人工染色 体の細菌性P1作製物、Price,C.M.(1993;Blood Rev 7:127-34)及びTrask,B.J.( 1991;Trends Ganet 7:149-54)に概要が示されている単染色体cDNAライブラ リーの使用が含まれる。 FISH(Verma等(1988)Human Chromosomes:A Manual of Basic Technioue,Per gamon Press,New York”に記載)は、他の染色体マッピング技術及び遺伝子地 図データと関係を有し得る。遺伝子地図データの例は、1994 Genome Issue of S cience(265:1981f)に見ることができ る。物理的染色体地図上でのNEDGをコードする配列の位置と、特定の疾病( または特定の疾病の素因)との相関関係を助けとして、ある遺伝病が関係するD NAの領域の限界決定ができる。本発明のヌクレオチド配列を用いて、正常者と キャリアまたは患者との遺伝子配列の違いを検出することができる。 染色体調製物のin situハイブリダイゼーション及び確定された染色体マーカ ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地図を延長するため に大変重要である。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であって も、マウスのような別の哺乳類種の染色体上の遺伝子配置から、関連するマーカ ーがわかる。新しい配列は、物理的マッピングにより染色体のアーム、或いはそ の一部へ割当てることができる。これは位置クローニング或いは他の遺伝子発見 技術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に貴重な情報を提供する。ひとたび毛 細血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或いは症候群が、特定のゲノム領域へ 、例えばATならば11q22-23(Gatti,R.A.等(1988)Nature 336:577-580)へ、遺伝子 連鎖によって粗い局所化がなされれば、その領域にマッピングされる任意の配列 は、さらなる研究のための関連する遺伝子、或いは調節遺伝子ということになる 。本発明のヌクレオチド配列は、正常者とキャリアまたは患者との間の、転座、 逆位等による染色体位置の違いを検出するために用いることもできる。 本発明の別の実施例では、NEDGや、その触媒作用性または免疫原性フラグ メント或いはオリゴペプチドを、種々の薬物スクリーニング技術において治療用 化合物のスクリーニングのために用いることができる。そのような試験において 用いられるフラグメントは、溶液に遊離した形態か、固体支持体へ付着したもの か、細胞表面へ付着したものか、或いは細胞内に存在するものであり得る。NE DGと試験される薬剤との結 合複合体形成が測定され得る。 NEDGポリペプチドへの適切な結合親和性を有する化合物の高スループット スクリーニングのために用いることができる別の薬物スクリーニング技術が、公 開されたPCT出願WO84/03564に詳細に記載されている。この方法をNEDGに適 用する場合には、多数の異なる小形ペプチドの試験用化合物を、プラスチックピ ン或いは他の表面のような固体基質上で合成する。ポリペプチド試験用化合物を NEDG又はその断片と反応させ、洗浄する。次いで結合NEDGを当分野で周 知の方法により検出する。また、前述の薬物スクリーニング技術において使用す るために、精製NEDGをプレート上に直接コーティングすることもできる。こ の他、ペプチドを捕捉し固体支持体上にペプチドを固定するために非中和抗体を 用いることができる。 別の実施例では、NEDGに結合し得る中和抗体が、NEDGとの結合につい て試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイを使用する ことができる。このように、抗体を用いて、1または2以上のNEDGと共通の エピトープを有する任意のペプチドの存在を検出することができる。 更に別の実施例では、ここに開示するNEDGをコードするヌクレオチド配列 は、その新技術が、以下に限らないが、例えばトリプレット遺伝暗号及び特異的 塩基対合相互作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性に基 づく技術であれば、まだ開発されていない分子生物学的技術においても用いるこ とができる。 以下に示す本発明の実施例は、単なる例示であって、本発明をこの実施例に限 定しようとするものではない。実施例 1 TLYMNOR01 cDNAライブラリーの作製 TLYMNOR01 cDNAライブラリーを、年齢24歳の白人男性から採取した非接 着性末梢血単核細胞から単離したRNAで作製した。この細胞をフィコール−ハ イパーク法で精製し、回収して、GuSCNに溶解し、CsClを通して遠心沈殿させて 、ライブラリー作製のためのRNAを得た。このRNAをオリゴdTでプライミ ングして、mRNAからcDNAを合成した。二本鎖cDNAを平滑末端化し、 EcoRIアダプタにリゲートし、XhoIで消化し、サイズ選択して、ラムダUniZAPベ クター(Stratagene)のXhoI及びEcoRI部位にクローン化した。 2 cDNAクローンの単離及び配列決定 ファージミドに組込まれた個々のDNAクローンは、宿主菌株にラムダライブ ラリーとf1ヘルパーファールを同時感染させるin vivo切除プロセスで得た。 ライブラリーを含むファージとヘルパーファージの両方に由来するタンパク質が 、ラムダDNAにニックを入れ、ラムダ標的DNA上の決まった配列からの新た なDNA合成を開始させ、含む小形の一本鎖環状ファージミドDNAが得られた。このファージミドDNA は細胞から分泌されるが、これを精製して、新たな宿主細胞に再度感染させ、そ こで二本鎖のファージミドDNAが作られる。このファージミドはβラクタマー ゼの遺伝子を有しているため、アンピシリンを含む培地上で新たに形質転換され た細菌を選択することができる。 ファージミドDNAは、QIAwell-8 QIAwell PLUSTM、又はQIAwell ULTRATMDNA Purification System(QIAGEN Inc.Chatsworth CA)を用いて精製した。このD NAは、DNA配列決定及び他の解析操作のために調製済みの精製用レジンから 溶出した。 ライブラリーの無作為な単離で得られたcDNAインサートの部分的 配列決定は、Applied Biosystems 377又は373 DNA Sequencing Systems(Perkin Elmer)及び4つのPeltier Thermal Cyclers(PTC200、MJ Research製Watertown M A)とHamilton Micro Lab 2200(Hamilton,Reno NV)を組み合わせて用いて、San ger F及びAR Coulson(1975;J Mol Biol 94:441f)の方法により行い、読み枠を 決定した。 3 cDNAクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索 配列表のヌクレオチド配列及び、それらから類推されるアミノ酸配列を問い合 わせ配列として用いて、例えばGenBank、SwissProt、BLOCKS、及びPima IIのよ うなデータベースを検索した。これらのデータベースには既に同定された配列が 注釈付きで含められており、BLAST(Basic Local Alignment Toolを表す)を用 いて相同性(類似性)を有する領域をこのデータベースのなかから検索した(Al tschul S.F.(1993)J.Mol.Evol.36:290-300;Altschul.S.F.等(1993)J.Mol.Biol.2 15:403-410)。 BLASTはヌクレオチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを生成して配列 類似性を決定する。そのアライメントの局所性のために、BLASTは厳密な一致、 すなわち原核生物(細菌)や真核生物(動物、菌類、又は植物)を起源とするホ モログを求める際に特に有効である。一次配列パターンや二次構造ギャップペナ ルティを処理する際には、本明細書に一体に引用されたSmith RF及びTF Smith(1 992,Protein Engineering 5:35-51)に記載のもののような他のアルゴリズムを用 いることができる。本明細書に開示された配列の長さは少なくとも49ヌクレオチ ドであり、不必要な塩基は12%以下である(ここで、NはA、C、G、又はT以 外と記録されたものである)。 BLAST法は、本明細書に一体に引用されたKarlin,S及びS.F.Atschul(1993;Pro c.Nat.Acad.Sci.90:5873-7)に詳細に記載されて いるように、問い合わせ配列とデータベースの配列の一致を検索する。BLASTは 発見したあらゆる配列の一致の統計的有意性を評価して、ユーザが選択した有意 性の閾値を満たす一致のみを報告する。本出願での閾値は、ヌクレオチドで10-25 、ペプチドで10-14に設定した。 インサイト社のヌクレオチド配列を、霊長類(pri)、げっ歯類(rod)、及び 他の哺乳類配列(mam)のGenBankデータベースで検索した。次に同じクローンか ら類推されたアミノ酸配列を、GenBankの機能性タンパク質データベース、哺乳 類(mamp)、脊椎動物(vrtp)、及び真核生物(eukp)で、相同性について検索 した。これらのデータベースは特定の一致をGixxx±pという形式で報告した(こ こでxxxはpri;rod等であり、存在の場合はp=ペプチドである)。後に計算式を示 す積スコアを用いて、電子的な厳密性を決定した。正確な一致については、積ス コアを70に設定し、通常の下限は約40に設定する(不要な塩基のために1〜 2%の誤りが生ずる)。 4 ノーザン法による解析 ノーザン解析は、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞型または組織に由 来するRNAが結合したメンブランとのハイブリッド形成を伴う、遺伝子の転写 物の存在を検出するために用いられる実験技術である(Sambrook等、上述)。 BLAST(Altschul,S.F.1993及び1990,上述)を用いる類似のコンピュータ技術 で、GenBankまたはLIFESEQTMデータベース(Incyte,Palo Alto CA)のようなデ ータベースにおける同一のまたは近縁な分子を検索した。この解析は、多くの膜 ベースのハイブリダイゼーションより非常に短時間で行うことができる。更に、 コンピュータ検索の感度を変更して、ある一致が正確な一致か、相同的であるか の分類を決定することができる。 検索の基準値は、積スコアであり、これは以下の式で定義されるものである。 (配列の一致(%)×最大BLASTスコア(%))/100 この積スコアでは、2つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一致の双方 が考慮されている。例えば、積スコアが40の場合は、一致は誤差が1〜2%の 範囲で正確であり、スコアが70の場合は正確に一致している。相同な分子は、 通常積スコアとして15〜40を示すものを選択することにより同定されるが、 スコアの低いものは近縁関係にある分子として同定される。 検索の結果は、完全長配列、又はその部分が存在するライブラリー、配列の存 在量(abundance)、及びパーセント存在量(percent abundance)のリストとし て報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映し、パーセント存 在量は、存在量をライブラリー内で検出された配列の総数で除したものである。 5 NEDGをコードするポリヌクレオチドの延長 完全長NEDGコード化核酸配列(配列番号:2)を用いて、部分的ヌクレオ チド配列を完全長まで伸長させるための、或いはゲノムライブラリーから5’ま たは3’配列を得るためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計することができ る。一方のプライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するために合成 され、他方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために合成さ れる。これらのプライマーにより、周知のNEDG配列を「外側に」延長し、対 象の制御領域の新しい未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを生成できる ようにな Plymouth MN)、或いは他の適切なプログラムを用いて、長さが22〜30ヌク レオチドで50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃ の温度で標的配列にアニールするように設計することができる。アピン構造及び プライマー−プライマー二量体化を生じるような任意のヌクレオチドのストレッ チの延長は回避される。 元の選択されたcDNAライブラリーか、ヒトゲノムライブラリーを用いて配 列を延長する。後者のライブラリーは、5’上流配列を得るために最も役立つ。 必要なら、既知領域をさらに延長するために追加のプライマーの組が設計される 。 XL-PCRキット(Perkin Elmer)の説明書の指示に従って、酵素と反応混合物と を完全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られる。40pmolの各プラ イマーと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分とから増幅を開始する場合 、PCRはPeltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reserch,Watertown MA)を用 いて、以下のパラメータで実行される。 ステップ1 94℃で1分間(初期変性) ステップ2 65℃で1分間 ステップ3 68℃で6分間 ステップ4 94℃で15秒間 ステップ5 65℃で1分間 ステップ6 68℃で7分間 ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復 ステップ8 94℃で15秒間 ステップ9 65℃で1分間 ステップ10 68℃で7分15秒間 ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復 ステップ12 72℃で8分間 ステップ13 4℃(その温度を保持) 反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア ガロースミニゲル上での電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに成 功したか否かを決定する。最も大きな生成物或いはバンドを選択して、ゲルから 切り出した。さらなる精製には、QIAQuickTM(QIAGEN,Chatsworth CA)のような 市販のゲル抽出法を用いる。DNA回収の後、クレノウ酵素を用いて一本鎖ヌク レオチドの延び出しを切り取り、再結合及びクローニングを容易にする平滑末端 を作った。 エタノール沈殿の後、生成物を13μlのリゲーション緩衝液内に再溶解し、 1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチド キナーゼを加えて、その混合物を室温で2〜3時間、或いは16℃で一昼夜イン キュベートする。コンピテントな大腸菌細胞(40μlの適切な溶媒内にある) を、3μlのリゲーション混合物を用いて形質転換し、80μlのSOC培地( Sembrook等、上記)で培養する。37℃で1時間のインキュベーションの後、全 ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertani(LB)寒天(Sembrook等、 上記)上にのせる。後日、いくつかのコロニーを各プレートから無作為に選択し 、適切な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレートの個々のウェル内に入れ られた150μlの液状LB/2xCarb培地で培養する。さらに後日、5μlの各一 昼夜の培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水で1:10に希釈した後、そ れぞれ5μlのサンプルをPCRアレイに移す。 PCR増幅のため、4単位のrTthDNAポリメラーゼを含む18μlの濃 縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加える。増幅は以 下の条件に従って行う。 ステップ1 94℃で60秒間 ステップ2 94℃で20秒間 ステップ3 55℃で30秒間 ステップ4 72℃で90秒間 ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復 ステップ6 72℃で180秒間 ステップ7 4℃(そのまま保持) PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動 させる。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクロ ーンを選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行う。 6 ハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用 配列番号:2の配列に基づくハイブリダイゼーションプローブを用いて、cD NA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングする。約20の塩基対から なるオリゴヌクレオチドの標識について特に記すが、大きなcDNAフラグメン トの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌクレオチドを、50pmolの各 オリゴマーと、250mCiの[γ−32P]アデノシン三リン酸(Amersham)及び T4ポリヌクレオチドキ る。標識されたオリゴヌクレオチドを、SephadexG-25超精細樹脂カラム(Pharma cia)を用いて精製する。毎分107カウントのセンス及びアンチセンスオリゴヌ クレオチドのそれぞれを含む部分を、エンドヌク の1つを用いて切断したヒトゲノムDNAの典型的な膜ベースのハイブリダイゼ ーション解析において用いる。 各消化物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン 膜(Nytran Plus,Schleicher & Schuell,Durham NH)にトラ ンスファーする。ハイブリダイゼーションは40℃で16時間かけて行う。非特 異的シグナルを取り除くため、ブロットを、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水 及び0.5%ドデシル硫酸ナトリウムまで段階的に厳密性が増す条件下で、室温 にて順次洗浄する。XOMAT ARTMフィルム(Kodak,Rochester NY)を、Phosphoima ger cassette(Molecular Dynamics,Sunnyvale CA)においてブロットに数時間 露光した後、ハイブリダイゼーションパターンを視覚的に比較する。 7 相補的ポリヌクレオチド NEDGをコードする配列のアンチセンス分子或いはその任意の一部分は、自 然発生の配列のin vivoまたはin vitro発現を阻害するために用られる。約15 〜約30塩基対からなるオリゴヌクレオチドの使用について特に記すが、より小 さな、或いはより大きな配列断片の場合でも概ね同じ方法を用いることができる 。Oligo4.06ソフトウェアとNEDGをコードする配列(配列番号:1)を用い て、適切なオリゴヌクレオチドを設計する。転写を抑制するために、相補的なオ リゴヌクレオチドを最も独特な5’配列から設計し、これを用いてプロモーター がコーディング配列に結合するのを阻害する。翻訳を阻害するためには、相補的 オリゴヌクレオチドを設計し、これによりNEDGをコードする転写物にリボソ ームが結合するのを妨げる。 8 NEDGの発現 NEDGの発現は、cDNAを適切なベクター内にサブクローニングし、その ベクターを宿主細胞にトランスフェクトすることによって行われる。この場合、 前にcDNAライブラリーの作製の際に用いたクローニング用のpSportベクター を用いて、大腸菌においてNEDGを発現させる。クローニング部位の上流には 、β−ガラクトシダーゼに対するプロモータが存在し、その後ろにはアミノ基末 端Met及びβ−ガラクト シダーゼの7残基が存在する。後続のこれら8つの残基は、転写に役立つバクテ リオファージプロモーターであり、多くの独特の切断部位を含むリンカーである 。 単離されたトランスフェクト菌株を、IPTGを用いて標準的な方法で誘導し、初 めのβガラクトシダーゼの7残基、約5〜15残基のリンカー、及び完全長NE DGからなる融合タンパク質を作り出す。このシグナル配列は菌培地へのNED Gの分泌を誘導し、この培地は後の活性のアッセイにおいて直接用いることがで きる。 9 NEDG活性の確認 孤児Gタンパク質結合7回膜貫通受容体の内部セグメントつまり細胞質内ドメ インは、既知のGタンパク質結合7回膜貫通受容体と交換可能であり得、Gタン パク質及び下流の孤児受容体ドメインにより活性化されるシグナル伝達経路ど同 定するために用いられ得る(Kobilka,B.K.等(1988)Science 240:1310-1316)。 類似の方式で、孤児受容体のドメインを、融合タンパク質の一部としてクローン 化し、特定のGタンパク質との相互作用を確認するための結合アッセイに用いる ことができる。研究の結果、Gタンパク質結合7回膜貫通受容体の第3の細胞内 ループが、Gタンパク質相互作用及びシグナル伝達に重要であることがわかった (Conklin.B.R.等(1993)Cell 73:631-641)。NEDGの第3の細胞内ループに 対応するDNA断片をPCR法で増幅し、pGEX(Pharmacia Biotech)のような 融合ベクターにサブクローニングし得る。作製物を適切な細菌性宿主に形質転換 して誘導し、グルタチオンセファロース4B(Pharmacia)アフィニティクロマ トグラフィーによって細胞の溶解産物から融合タンパク質を精製する。 in vitro結合アッセイのためには、Gタンパク質を含む細胞抽出物を、50mM T ris(pH7.8)、1mM EGTA、5mM MgCl、20mM CHAPS、 20%グリセロール、10μgのアプロチニン及びロイペプチン、及び20μlの50mMフ ェニルメチルスルホニルフッ化物を用いた抽出によって調製する。溶解産物を一 定速度で攪拌しながら、氷冷しつつ45分間インキュベートし、4℃で15分間23000 Gで遠心分離にかけ、上清を回収する。750μgの細胞抽出物を、GST融合タンパク 質ビーズとともに、4℃で2時間インキュベートする。このGSTビーズをリン酸緩 衝食塩水で5回洗浄する。結合したGサブユニットを、百日咳又はコレラ毒素に よる[32P]ADP-リボシル化によって検出する。反応は、SDSサンプルバッファー( 4.6%(w/v)SDS、10%(v/v)-メルカプトエタノール、20%(w/v)グリセロール、95.2m M Tris-HCl,pH6.8、0.01%(w/v)ブロムフェノールブルー)を添加することにより 終結する。[32P]ADP標識したタンパク質を、10% SDS-PAGEゲル上で分離し、オー トラジオグラフィにかける。これらのゲルをニトロセルロースペーパーにトラン スファーし、室温で1時間かけてblotto(5%乾燥脱脂乳、50mM Tris-HCl(pH8.0) 、2mM CaCl、80mM NaCl、0.02% NaN、及び0.2%Nonidet P-40)でブロックした 上で、Gαサブタイプ選択的抗体(1:500;Calbiochem-Novabiochem)とともに1. 5時間インキュベートする。3回洗浄した後、ブロットをセイヨウワサビペルオ キシダーゼ(HRP)結合ヤギ抗ウサギ免疫グロブリン(1:2000,Cappel,Westchest er,PA)とともにインキュベートし、化学ルミネツセンスベースのECL法(Armers ham Corp.)で可視化する。 10 NEDG特異的抗体の産生 標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、PAGE電 気泳動法(Sambrook前出)を用いて実質的に精製されたNEDGを用いる。配列 番号:2から類推されるアミノ酸配列をDNAStarソフトウエア(DNASTAR社)を用 いて解析して免疫抗原性の高い領域 を決定し、対応するオリゴペプチドを当業者には周知の手段により合成して、当 業者に周知の方法で抗体を産生するために用いる。C末端付近の、或いは隣接す る親水性領域内のエピトープのような、適切なエピトープを選択するための解析 法は、Ausubel等(上記)の論文他に記載されている。 通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、Applied Biosystemsのペ プチド合成機Model 431Aを用いてfmoc法のケミストリにより合成し、M−マ レイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS:Ausube l等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペットヘモシニアン(KLH、S igma)に結合する。フロイントの完全アジュバントにおいてオリゴペプチド−K LH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血清の抗ペプチド活性を検査 するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、1%BSAを用いてブロック し、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射性ヨウ素標識されたヤギ抗ウ サギIgGと反応させる。 11 特異的抗体を用いる自然発生NEDGの精製 自然発生NEDG或いは組換えNEDGは、NEDGに特異的な抗体を用いる イムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することができる。イムノア フィニティーカラムは、CnBr-activated Sepharose(Pharmacia Biotech社)の ような活性化クロマトグラフレジンとNEDG抗体とを共有結合させることによ り構築される。結合後、そのレジンを使用説明書の指示に従って、ブロックし洗 浄する。 NEDGを含む培地をイムノアフィニティーカラムに通し、そのカラムをNE DGを優先的に吸着できる条件下で(例えば界面活性剤の存在下において高イオ ン強度バッファで)洗浄する。このカラムを、抗体/NEDG結合を切るような 条件下(例えばpH2〜3のバッファ、或い は高濃度の尿素またはチオシアン酸塩イオンのようなカオトロピックイオン)で 溶出させ、NEDGを回収する。 12 NEDGと相互作用する分子の同定 NEDG又は生物学的に活性なその断片を、125Iボルトンハンター試薬(Bol tonら(1973)Biochem.J.133:529)で標識する。マルチウェルプレートに予め配列 しておいた候補の分子を、標識したNEDGとともにインキュベートし、洗浄し て、標識NEDG複合体を有する任意のウェルをアッセイする。異なる濃度のN EDGを用いて得られたデータを用いて、候補の分子とNEDGの会合、親和性 、数の数値を計算する。 上記のすべての刊行物及び特許明細書は、本明細書と一体に参照されたい。本 発明の記載した方法及びシステムの種々の改変は、本発明の範囲及び精神から逸 脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明は特に好適な実施例に関連し て記載されているが、本発明の請求の範囲は、そのような特定の実施例に不当に 制限されるべきではないことを理解されたい。実際には、本発明を実施するため に記載された方法の種々の改変は、分子生物学或いは関連する分野の専門家には 明らかなように、請求の範囲内に含まれるものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 11/00 A61P 11/06 11/06 19/00 19/00 19/02 19/02 21/00 21/00 29/00 101 29/00 101 35/00 35/00 35/02 35/02 C07H 21/04 B C07H 21/04 C07K 16/28 C07K 16/28 C12N 1/21 C12N 1/21 C12Q 1/68 A 15/09 C12N 15/00 A C12Q 1/68 A61K 37/02 (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR, NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,L S,MW,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ ,BY,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AT ,AU,BR,CA,CH,CN,DE,DK,ES, FI,GB,IL,JP,KR,MX,NO,NZ,R U,SE,SG,US

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1のアミノ酸配列又はその断片を含む実質的に精製されたedg −1様受容体(NEDG)。 2.請求項1のedg−1様受容体をコードする単離され精製されたポリヌクレ オチド配列。 3.請求項2のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 4.配列番号:2又はその変異体を含む単離され精製されたポリヌクレオチド配 列。 5.請求項2のポリヌクレオチド配列又はその変異体に相補的なポリヌクレオチ ド配列。 6.請求項5のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 7.請求項2のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。 8.請求項7のベクターを含む宿主細胞。 9.配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法であって、 (a)前記ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項9の宿主細胞を培養 する過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から前記ポリペプチドを回収する過程とを含むこと を特徴とする配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法。 10.請求項1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたedg−1様受容体 を、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成物。 11.請求項1のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 12.請求項1のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴニスト。 13.請求項1のポリペプチドの活性を阻害する精製されたアンタゴニスト。 14.請求項13のアンタゴニストを、適切な医薬用担体と共に含む医薬品組成 物。 15.細胞増殖を刺激する方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項1のタンパク質を有効量投与する過程 を含む細胞増殖を刺激する方法。 16.異常な細胞成長及び分化の疾病の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項10の医薬品組成物を有効量投与する 過程を含む異常な細胞成長及び分化の疾病の治療方法。 17.過剰な細胞増殖の疾病の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項14の医薬品組成物を有効量投与する 過程を含む過剰な細胞増殖の疾病の治療方法。 18.生物学的サンプルにおけるedg−1様受容体をコードするポリヌクレオ チドの検出方法であって、 (a)請求項6のポリヌクレオチドと生物学的サンプルの核酸材料とをハイブ リダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程とを含むことを特徴 とし、 前記複合体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるedg−1様受容体様タ ンパク質をコードするポリヌクレオチドの存在と相関性を有することを特徴とす る生物学的サンプルにおけるedg−1様受容体をコードするポリヌクレオチド の検出方法。
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