JP2002098639A - 画像データ取得方法 - Google Patents
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- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/645—Specially adapted constructive features of fluorimeters
- G01N21/6452—Individual samples arranged in a regular 2D-array, e.g. multiwell plates
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- G01N2201/12—Circuits of general importance; Signal processing
- G01N2201/126—Microprocessor processing
Abstract
(57)【要約】
【課題】標本に対する走査から走査画像データから得ら
れる解析データの算出までの時間を最小限に短くする。 【解決手段】ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２
を走査したときの複数のスポット２からの蛍光を受光し
て走査画像データを取得する際に、レーザ光１２の走査
領域が１ストリップに達する毎に、その１ストリップを
走査して得られた各走査画像データを順次記憶媒体２２
に保存する。
れる解析データの算出までの時間を最小限に短くする。 【解決手段】ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２
を走査したときの複数のスポット２からの蛍光を受光し
て走査画像データを取得する際に、レーザ光１２の走査
領域が１ストリップに達する毎に、その１ストリップを
走査して得られた各走査画像データを順次記憶媒体２２
に保存する。
Description
【０００１】
【発明の属する技術分野】本発明は、例えばＤＮＡマイ
クロアレイ（ＤＮＡチップ）のような標本上に光ビーム
を二次元走査し、標本からの反射光、透過光、散乱光又
は蛍光などを測定して走査画像データを取得する画像デ
ータ取得方法に関する。
クロアレイ（ＤＮＡチップ）のような標本上に光ビーム
を二次元走査し、標本からの反射光、透過光、散乱光又
は蛍光などを測定して走査画像データを取得する画像デ
ータ取得方法に関する。
【０００２】
【従来の技術】近年、急速な遺伝子研究の発展に伴っ
て、大量の遺伝子発現解析を短時間で実現する手段とし
てＤＮＡマイクロアレイ技術が登場した。このＤＮＡマ
イクロアレイは、図９に示すようにスライドグラスなど
の基板１上に、遺伝子ＤＮＡを含む溶液を数ｎｌずつ滴
下し、直径数十〜１００μｍ程度のしみ状のスポット２
を形成し、このスポットを１枚の基板１上に数千〜数万
点、規則正しく配列したものである。
て、大量の遺伝子発現解析を短時間で実現する手段とし
てＤＮＡマイクロアレイ技術が登場した。このＤＮＡマ
イクロアレイは、図９に示すようにスライドグラスなど
の基板１上に、遺伝子ＤＮＡを含む溶液を数ｎｌずつ滴
下し、直径数十〜１００μｍ程度のしみ状のスポット２
を形成し、このスポットを１枚の基板１上に数千〜数万
点、規則正しく配列したものである。
【０００３】このようなＤＮＡマイクロアレイ３に、検
体であるＲＮＡを蛍光で標識した後に振り掛け、洗浄
し、各スポット２にレーザ光を照射して生じる蛍光を測
定することで、その蛍光強度により遺伝子発現を解析す
ることができる。
体であるＲＮＡを蛍光で標識した後に振り掛け、洗浄
し、各スポット２にレーザ光を照射して生じる蛍光を測
定することで、その蛍光強度により遺伝子発現を解析す
ることができる。
【０００４】この遺伝子発現解析での蛍光測定に使用さ
れるのがＤＮＡマイクロアレイリーダと呼ばれる走査型
光学測定装置である。この走査型光学測定装置の構成
は、一般的な共焦点レーザ顕微鏡と類似しており、レー
ザ光源から出射されたレーザ光を対物レンズを通してＤ
ＮＡマイクロアレイ３上に照射し、このレーザ光の照射
によって発生した蛍光を共焦点ピンホールを通して光電
子倍増管（ＰＭＴ）などの光電変換素子に導き、この光
電変換素子により蛍光強度を電気信号に変換している。
れるのがＤＮＡマイクロアレイリーダと呼ばれる走査型
光学測定装置である。この走査型光学測定装置の構成
は、一般的な共焦点レーザ顕微鏡と類似しており、レー
ザ光源から出射されたレーザ光を対物レンズを通してＤ
ＮＡマイクロアレイ３上に照射し、このレーザ光の照射
によって発生した蛍光を共焦点ピンホールを通して光電
子倍増管（ＰＭＴ）などの光電変換素子に導き、この光
電変換素子により蛍光強度を電気信号に変換している。
【０００５】このときＤＮＡマイクロアレイ３は、電動
走査ステージ上に載置され、ＸＹ方向に移動される。従
って、レーザ光源から出射されたレーザ光は、ＤＮＡマ
イクロアレイ３上をＸＹ方向に走査され、このときの光
電変換素子から出力される電気信号がコンピュータなど
からなる画像処理装置に送られる。この画像処理装置
は、光電変換素子からの電気信号をＡ／Ｄ変換し、走査
画像データとして取得する。
走査ステージ上に載置され、ＸＹ方向に移動される。従
って、レーザ光源から出射されたレーザ光は、ＤＮＡマ
イクロアレイ３上をＸＹ方向に走査され、このときの光
電変換素子から出力される電気信号がコンピュータなど
からなる画像処理装置に送られる。この画像処理装置
は、光電変換素子からの電気信号をＡ／Ｄ変換し、走査
画像データとして取得する。
【０００６】このように取得された走査画像データは、
測定開始前に設定した所望の領域を全て走査終了後に、
Tagged Image File Format（ＴＩＦＦ）やBit Map
形式などの汎用画像データとして一旦ハードディスクな
どの記憶媒体に保存され、この後、専用の解析ソフトウ
エアにより読み出され、所望のデータ処理がなされるこ
とにより解析データが求められる。
測定開始前に設定した所望の領域を全て走査終了後に、
Tagged Image File Format（ＴＩＦＦ）やBit Map
形式などの汎用画像データとして一旦ハードディスクな
どの記憶媒体に保存され、この後、専用の解析ソフトウ
エアにより読み出され、所望のデータ処理がなされるこ
とにより解析データが求められる。
【０００７】同様な機能を持つ走査型光学測定装置とし
ては、例えばレーザ走査型サイトメータが特開平８−１
１４５４０号公報に開示されている。このレーザ走査型
サイトメータは、スライドガラス上にランダムに点在す
る細胞集団をレーザ光で走査し、このときの細胞集団か
らの反射光、透過光、散乱光又は蛍光などの信号光を測
定して走査画像データを取得し、この走査画像データか
ら細胞集団の免疫学的特性、遺伝学的特性などを示す統
計データを算出するものである。
ては、例えばレーザ走査型サイトメータが特開平８−１
１４５４０号公報に開示されている。このレーザ走査型
サイトメータは、スライドガラス上にランダムに点在す
る細胞集団をレーザ光で走査し、このときの細胞集団か
らの反射光、透過光、散乱光又は蛍光などの信号光を測
定して走査画像データを取得し、この走査画像データか
ら細胞集団の免疫学的特性、遺伝学的特性などを示す統
計データを算出するものである。
【０００８】このレーザ走査型サイトメータの構成は、
上記ＤＮＡマイクロアレイリーダと呼ばれる走査型光学
測定装置に対し、主走査がガルバノミラーなどを利用し
て光学的に行われることを除きほぼ同一構成である。
上記ＤＮＡマイクロアレイリーダと呼ばれる走査型光学
測定装置に対し、主走査がガルバノミラーなどを利用し
て光学的に行われることを除きほぼ同一構成である。
【０００９】一方、走査画像データの収集方法は、所定
の領域サイズ（以下、ストリップと称する）の走査画像
を１枚取得する毎に、その走査画像に対する画像処理を
行って１ストリップ毎に取り込まれた細胞を認識し、個
々の細胞についてその面積、蛍光輝度、総蛍光量などの
解析データを順次算出する。
の領域サイズ（以下、ストリップと称する）の走査画像
を１枚取得する毎に、その走査画像に対する画像処理を
行って１ストリップ毎に取り込まれた細胞を認識し、個
々の細胞についてその面積、蛍光輝度、総蛍光量などの
解析データを順次算出する。
【００１０】所定の全範囲の走査が終了すると、得られ
た全細胞の解析データから統計データが算出される。走
査画像データは、上記解析データを算出するためのもの
であり、データ解析が終了すると直ぐに破棄される。こ
の点で上記ＤＮＡマイクロアレイリーダとは異なってい
る。
た全細胞の解析データから統計データが算出される。走
査画像データは、上記解析データを算出するためのもの
であり、データ解析が終了すると直ぐに破棄される。こ
の点で上記ＤＮＡマイクロアレイリーダとは異なってい
る。
【００１１】又、スライドグラス上の細胞集団などの広
範囲な標本を画像化する装置としては、例えばレーザ走
査型顕微鏡を利用した方法が特開平１０−３３３０５６
号公報に開示されている。このレーザ走査型顕微鏡は、
上記ＤＮＡマイクロアレイリーダの装置構成に対して、
２次元走査をガルバノミラーなどを用いて光学的に行う
点が異なっている。又、レーザ走査型サイトメータに対
しては、副走査が光学的に行えることと、共焦点光学系
になっている、２点が異なっている。
範囲な標本を画像化する装置としては、例えばレーザ走
査型顕微鏡を利用した方法が特開平１０−３３３０５６
号公報に開示されている。このレーザ走査型顕微鏡は、
上記ＤＮＡマイクロアレイリーダの装置構成に対して、
２次元走査をガルバノミラーなどを用いて光学的に行う
点が異なっている。又、レーザ走査型サイトメータに対
しては、副走査が光学的に行えることと、共焦点光学系
になっている、２点が異なっている。
【００１２】走査画像データの収集方法は、光学的２次
元走査により一視野内の走査画像データを取得すると、
電動走査ステージを移動して隣接する領域に移り、さら
に光学的２次元走査により一視野内の走査画像データを
取得する。これを繰り返すことによって複数の部分走査
画像データを所望の領域に対して取得し、この後、それ
ぞれの部分走査画像データを繋ぎ合わせて１枚の全領域
の走査画像データを取得して記憶媒体に保存する。
元走査により一視野内の走査画像データを取得すると、
電動走査ステージを移動して隣接する領域に移り、さら
に光学的２次元走査により一視野内の走査画像データを
取得する。これを繰り返すことによって複数の部分走査
画像データを所望の領域に対して取得し、この後、それ
ぞれの部分走査画像データを繋ぎ合わせて１枚の全領域
の走査画像データを取得して記憶媒体に保存する。
【００１３】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、上記走
査画像データの収集方法のうちＤＮＡマイクロアレイリ
ーダでは、２次元走査を電動走査ステージにより行うの
で、広い範囲を走査可能であるが、走査速度が他の光学
的走査方法に比較して数十倍程度遅い。このため、数十
ｍｍ角の領域を全て走査するまでに数分から十数分の時
間がかかり、走査開始から終了するまで走査画像データ
が得られず、解析データを実時間で得ることができな
い。
査画像データの収集方法のうちＤＮＡマイクロアレイリ
ーダでは、２次元走査を電動走査ステージにより行うの
で、広い範囲を走査可能であるが、走査速度が他の光学
的走査方法に比較して数十倍程度遅い。このため、数十
ｍｍ角の領域を全て走査するまでに数分から十数分の時
間がかかり、走査開始から終了するまで走査画像データ
が得られず、解析データを実時間で得ることができな
い。
【００１４】レーザ走査型サイトメータでは、各ストリ
ップを走査する毎に、１枚の走査画像データを取得し、
順次画像処理を行うので、ＤＮＡマイクロアレイリーダ
で問題となった解析データの実時間性が解決できるが、
走査画像データは、画像処理を行って解析データを算出
すると破棄するため、各ストリップの走査画像データや
全走査領域の走査画像データを取得、保存することがで
きない。
ップを走査する毎に、１枚の走査画像データを取得し、
順次画像処理を行うので、ＤＮＡマイクロアレイリーダ
で問題となった解析データの実時間性が解決できるが、
走査画像データは、画像処理を行って解析データを算出
すると破棄するため、各ストリップの走査画像データや
全走査領域の走査画像データを取得、保存することがで
きない。
【００１５】又、レーザ走査型サイトメータでは、測定
対象物である細胞がストリップの境界に跨って存在する
場合、正確に解析処理を行うことが出来ない、又は細胞
として認識できなくなってしまう。同様の方法でＤＮＡ
マイクロアレイを測定した場合、図９に示すスポット２
の位置は規則的に配列されているが、その精度はスポッ
トの作成装置によりまちまちであり、１ストリップの端
部に位置するスポット２が走査領域から出てしまう可能
性がある。
対象物である細胞がストリップの境界に跨って存在する
場合、正確に解析処理を行うことが出来ない、又は細胞
として認識できなくなってしまう。同様の方法でＤＮＡ
マイクロアレイを測定した場合、図９に示すスポット２
の位置は規則的に配列されているが、その精度はスポッ
トの作成装置によりまちまちであり、１ストリップの端
部に位置するスポット２が走査領域から出てしまう可能
性がある。
【００１６】走査型レーザ顕微鏡を利用した例では、順
次部分画像が取得され、最終的に全走査領域の走査画像
データが取得されるが、部分画像データを他のタスクや
プログラムと共有することを前提にしておらず、最終的
な全領域の走査画像データとして記憶媒体に保存される
まで解析処理が行えない。さらに、各部分画像データは
サイズが固定されており、レーザ走査型サイトメータの
ときと同様に、部分画像データの境界部分に測定対象が
跨る可能性があり、部分画像データのみを解析すると正
確な結果が得られない。
次部分画像が取得され、最終的に全走査領域の走査画像
データが取得されるが、部分画像データを他のタスクや
プログラムと共有することを前提にしておらず、最終的
な全領域の走査画像データとして記憶媒体に保存される
まで解析処理が行えない。さらに、各部分画像データは
サイズが固定されており、レーザ走査型サイトメータの
ときと同様に、部分画像データの境界部分に測定対象が
跨る可能性があり、部分画像データのみを解析すると正
確な結果が得られない。
【００１７】そこで本発明は、標本に対する走査と、標
本に対する走査から走査画像データを解析してその解析
データが算出までの時間を最小限に短くできる画像デー
タ取得方法を提供することを目的とする。
本に対する走査から走査画像データを解析してその解析
データが算出までの時間を最小限に短くできる画像デー
タ取得方法を提供することを目的とする。
【００１８】
【課題を解決するための手段】請求項１記載による本発
明は、標本に対して光を走査し、前記各標本からの光を
受光して走査画像データを取得する画像データ取得方法
において、前記光の走査領域が所定サイズに達する毎
に、この所定サイズの領域を走査して得られた走査画像
データを順次保存することを特徴とする画像データ取得
方法である。
明は、標本に対して光を走査し、前記各標本からの光を
受光して走査画像データを取得する画像データ取得方法
において、前記光の走査領域が所定サイズに達する毎
に、この所定サイズの領域を走査して得られた走査画像
データを順次保存することを特徴とする画像データ取得
方法である。
【００１９】請求項２記載による本発明は、請求項１記
載の画像データ取得方法において、前記の標本内に測定
対象物が複数配列されている場合、その配列位置に応じ
て前記光を走査する前記領域のサイズを適宜変更するも
のである。
載の画像データ取得方法において、前記の標本内に測定
対象物が複数配列されている場合、その配列位置に応じ
て前記光を走査する前記領域のサイズを適宜変更するも
のである。
【００２０】請求項３記載よる本発明は、請求項１およ
び２記載の画像データ取得方法において、順次保存され
る前記各走査画像データに対してそれぞれ走査位置情報
を付加するものである。
び２記載の画像データ取得方法において、順次保存され
る前記各走査画像データに対してそれぞれ走査位置情報
を付加するものである。
【００２１】請求項４記載による本発明は、請求項１、
２、および３記載の画像データ取得方法において、前記
走査画像データの保存と共に、前記走査画像データに対
する解析処理を実行するものである。
２、および３記載の画像データ取得方法において、前記
走査画像データの保存と共に、前記走査画像データに対
する解析処理を実行するものである。
【００２２】
【発明の実施の形態】（１）以下、本発明の第１の実施
の形態について図面を参照して説明する。
の形態について図面を参照して説明する。
【００２３】図１は本発明の画像データ取得方法を適用
した走査型光学測定装置の構成図である。電動ＸＹ走査
ステージ１０上には、図９に示すＤＮＡマイクロアレイ
３が載置されている。
した走査型光学測定装置の構成図である。電動ＸＹ走査
ステージ１０上には、図９に示すＤＮＡマイクロアレイ
３が載置されている。
【００２４】レーザ光源１１から出力されるレーザ光１
２の光路上には、コリメータレンズ１３、ダイクロイッ
クミラーなどからなる光路分割素子１４が配置されてい
る。この光路分割素子１４は、レーザ光源１１から出力
されるレーザ光１２を反射し、かつＤＮＡマイクロアレ
イ３で発生した蛍光を透過する性質を有している。この
光路分割素子１４の反射光路上には、レンズ１５を介し
て対物レンズ１６が配置され、かつＤＮＡマイクロアレ
イ３からの蛍光の透過光路上には、レンズ１７を介して
光電子増倍管（ＰＭＴ）を用いた光電変換素子１８が配
置されている。この光電変換素子１８は、入射する蛍光
をその光強度に応じた電気信号に変換してデータ処理装
置１９に送るようになっている。
２の光路上には、コリメータレンズ１３、ダイクロイッ
クミラーなどからなる光路分割素子１４が配置されてい
る。この光路分割素子１４は、レーザ光源１１から出力
されるレーザ光１２を反射し、かつＤＮＡマイクロアレ
イ３で発生した蛍光を透過する性質を有している。この
光路分割素子１４の反射光路上には、レンズ１５を介し
て対物レンズ１６が配置され、かつＤＮＡマイクロアレ
イ３からの蛍光の透過光路上には、レンズ１７を介して
光電子増倍管（ＰＭＴ）を用いた光電変換素子１８が配
置されている。この光電変換素子１８は、入射する蛍光
をその光強度に応じた電気信号に変換してデータ処理装
置１９に送るようになっている。
【００２５】なお、ガルバノミラーなどの光学スキャナ
を対物レンズ１６からレンズ１５、光路分割素子１４、
までの光路上に挿入し、レーザ光１２の主走査を電動Ｘ
Ｙ走査ステージ１０でなく光学的に行ってもよい。又、
多様な標識色素に対応できるように複数のレーザ光源、
光電変換素子を用いるようにしてもよい。
を対物レンズ１６からレンズ１５、光路分割素子１４、
までの光路上に挿入し、レーザ光１２の主走査を電動Ｘ
Ｙ走査ステージ１０でなく光学的に行ってもよい。又、
多様な標識色素に対応できるように複数のレーザ光源、
光電変換素子を用いるようにしてもよい。
【００２６】図２はデータ処理装置１９の構成図であ
る。このデータ処理装置１９は、ＣＰＵ２０と、システ
ムメモリ２１と、記憶媒体２２と、Ａ／Ｄ変換ボード２
３と、機器制御用ボード２４とから構成されている。シ
ステムメモリ２１は、本発明の画像データ取得方法を利
用したデータ収集ソフトウエアが記憶され、かつＡ／Ｄ
変換ボード２３から取り込んで収集されたデータ（光電
変換素子１８からのディジタル電気信号）を一時記憶す
るための非共有メモリが形成されている。
る。このデータ処理装置１９は、ＣＰＵ２０と、システ
ムメモリ２１と、記憶媒体２２と、Ａ／Ｄ変換ボード２
３と、機器制御用ボード２４とから構成されている。シ
ステムメモリ２１は、本発明の画像データ取得方法を利
用したデータ収集ソフトウエアが記憶され、かつＡ／Ｄ
変換ボード２３から取り込んで収集されたデータ（光電
変換素子１８からのディジタル電気信号）を一時記憶す
るための非共有メモリが形成されている。
【００２７】記憶媒体２２は、システムメモリ２１にお
ける非共有メモリに記憶されたディジタル電気信号をフ
ァイル化して走査画像データとして記憶するためのハー
ドディスク等からなるものである。
ける非共有メモリに記憶されたディジタル電気信号をフ
ァイル化して走査画像データとして記憶するためのハー
ドディスク等からなるものである。
【００２８】Ａ／Ｄ変換ボード２３は、光電変換素子１
８からの電気信号をディジタル化するものである。
８からの電気信号をディジタル化するものである。
【００２９】機器制御用ボード２４は、電動ＸＹ走査ス
テージ１０に対してＸＹ走査制御信号を送出するための
ものである。
テージ１０に対してＸＹ走査制御信号を送出するための
ものである。
【００３０】なお、このデータ処理装置１９には、ネッ
トワーク２５を介して他のコンピュータ２６が接続可能
となっている。このコンピュータ２６は、記憶媒体２２
に記憶された走査画像データを解析処理するためのもの
で、データ処理装置１９内のＣＰＵ２０の負荷を軽減す
るメリットがある。
トワーク２５を介して他のコンピュータ２６が接続可能
となっている。このコンピュータ２６は、記憶媒体２２
に記憶された走査画像データを解析処理するためのもの
で、データ処理装置１９内のＣＰＵ２０の負荷を軽減す
るメリットがある。
【００３１】上記ＣＰＵ２０は、システムメモリ２１に
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、機器制御用ボード２４を通して電動ＸＹ走査ス
テージ１０にＸＹ走査制御信号を送出して、図３に示す
ように遺伝子ＤＮＡを含む溶液を数ｎｌずつ滴下又は塗
布して形成した直径数十〜１００μｍ程度のしみ状のス
ポット２を数千〜数万点、規則正しく配列してあるＤＮ
Ａマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走査制御する機
能を有するものとなる。このレーザ光１２の走査は、Ｙ
方向を主走査、Ｘ方向が副走査となる。
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、機器制御用ボード２４を通して電動ＸＹ走査ス
テージ１０にＸＹ走査制御信号を送出して、図３に示す
ように遺伝子ＤＮＡを含む溶液を数ｎｌずつ滴下又は塗
布して形成した直径数十〜１００μｍ程度のしみ状のス
ポット２を数千〜数万点、規則正しく配列してあるＤＮ
Ａマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走査制御する機
能を有するものとなる。このレーザ光１２の走査は、Ｙ
方向を主走査、Ｘ方向が副走査となる。
【００３２】又、ＣＰＵ２０は、システムメモリ２１に
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走
査したときの複数のスポット２からの蛍光を受光して走
査画像データを取得する際に、レーザ光１２の走査領域
が所定サイズの領域、例えば１ストリップに達する毎、
すなわち第１ストリップ、第２ストリップ、第３ストリ
ップ、…毎に、これら１ストリップを走査して得られた
各走査画像データを順次記憶媒体２２に保存する機能を
有するものとなる。
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走
査したときの複数のスポット２からの蛍光を受光して走
査画像データを取得する際に、レーザ光１２の走査領域
が所定サイズの領域、例えば１ストリップに達する毎、
すなわち第１ストリップ、第２ストリップ、第３ストリ
ップ、…毎に、これら１ストリップを走査して得られた
各走査画像データを順次記憶媒体２２に保存する機能を
有するものとなる。
【００３３】次に、上記の如く構成された装置の作用に
ついて説明する。
ついて説明する。
【００３４】レーザ光源１１から出力されたレーザ光１
２は、コリメータレンズ１３を通して光路分割素子１４
に入射し、この光路分割素子１４で反射されてレンズ１
５から対物レンズ１６を通してＤＮＡマイクロアレイ３
に照射される。
２は、コリメータレンズ１３を通して光路分割素子１４
に入射し、この光路分割素子１４で反射されてレンズ１
５から対物レンズ１６を通してＤＮＡマイクロアレイ３
に照射される。
【００３５】このとき、ＣＰＵ２０は、システムメモリ
２１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行す
ることにより、機器制御用ボード２４を通して電動ＸＹ
走査ステージ１０にＸＹ走査制御信号を送出し、図３に
示すようにレーザ光１２を、ＤＮＡマイクロアレイ３上
にＹ方向を主走査、Ｘ方向を副走査として走査制御す
る。
２１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行す
ることにより、機器制御用ボード２４を通して電動ＸＹ
走査ステージ１０にＸＹ走査制御信号を送出し、図３に
示すようにレーザ光１２を、ＤＮＡマイクロアレイ３上
にＹ方向を主走査、Ｘ方向を副走査として走査制御す
る。
【００３６】このようにレーザ光１２をＤＮＡマイクロ
アレイ３上に走査したとき、ＤＮＡマイクロアレイ３で
発生した蛍光は、対物レンズ１６からレンズ１５、光路
分割素子１４を透過し、レンズ１７により光電変換素子
１８に結像される。
アレイ３上に走査したとき、ＤＮＡマイクロアレイ３で
発生した蛍光は、対物レンズ１６からレンズ１５、光路
分割素子１４を透過し、レンズ１７により光電変換素子
１８に結像される。
【００３７】この光電変換素子１８は、入射する蛍光を
その光強度に応じた電気信号に変換してデータ処理装置
１９に送る。
その光強度に応じた電気信号に変換してデータ処理装置
１９に送る。
【００３８】ＣＰＵ２０は、レーザ光１２をＤＮＡマイ
クロアレイ３上にＹ方向を主走査、Ｘ方向を副走査とし
て走査制御する場合、予め設定された走査開始点Ｓ１か
らレーザ光１２の走査を開始し、点Ｓ２に到達すると、
１ストリップを終了する。
クロアレイ３上にＹ方向を主走査、Ｘ方向を副走査とし
て走査制御する場合、予め設定された走査開始点Ｓ１か
らレーザ光１２の走査を開始し、点Ｓ２に到達すると、
１ストリップを終了する。
【００３９】この走査開始点Ｓ１から点Ｓ２までの第１
ストリップの走査線数ｎは、１ストリップ内のスポット
２の取込列数ｓと、各スポット２の間隔Ｄと、走査間隔
ｄとにより決定され、 ｎ＝ｓ・Ｄ／ｄ …(1) となる。例えば、２００μｍ間隔で配列されたスポット
２を５μｍ間隔でレーザ光１２を走査し、１ストリップ
内に１０列取り込む場合の走査線数は、４００本とな
る。
ストリップの走査線数ｎは、１ストリップ内のスポット
２の取込列数ｓと、各スポット２の間隔Ｄと、走査間隔
ｄとにより決定され、 ｎ＝ｓ・Ｄ／ｄ …(1) となる。例えば、２００μｍ間隔で配列されたスポット
２を５μｍ間隔でレーザ光１２を走査し、１ストリップ
内に１０列取り込む場合の走査線数は、４００本とな
る。
【００４０】従って、ＣＰＵ２０は、Ａ／Ｄ変換ボード
２３から取り込んで収集されたデータ（光電変換素子１
８からのディジタル電気信号）をシステムメモリ２１内
の非共有メモリに一時記憶し、図３に示す第１ストリッ
プ分の走査線数分のデータを収集すると、非共有メモリ
に記憶されたディジタル電気信号をファイル化して走査
画像データとして記憶媒体２２に記憶する。
２３から取り込んで収集されたデータ（光電変換素子１
８からのディジタル電気信号）をシステムメモリ２１内
の非共有メモリに一時記憶し、図３に示す第１ストリッ
プ分の走査線数分のデータを収集すると、非共有メモリ
に記憶されたディジタル電気信号をファイル化して走査
画像データとして記憶媒体２２に記憶する。
【００４１】次に、ＣＰＵ２０は、点Ｓ３からレーザ光
１２の走査を開始し、点Ｓ４に到達するまで光電変換素
子１８からのディジタル電気信号をシステムメモリ２１
内の非共有メモリに一時記憶し、レーザ光１２の走査が
点Ｓ４に到達して図３に示す第２ストリップ分の走査線
数分のデータを収集すると、非共有メモリに記憶された
ディジタル電気信号をファイル化して新たな走査画像デ
ータとして記憶媒体２２に記憶する。
１２の走査を開始し、点Ｓ４に到達するまで光電変換素
子１８からのディジタル電気信号をシステムメモリ２１
内の非共有メモリに一時記憶し、レーザ光１２の走査が
点Ｓ４に到達して図３に示す第２ストリップ分の走査線
数分のデータを収集すると、非共有メモリに記憶された
ディジタル電気信号をファイル化して新たな走査画像デ
ータとして記憶媒体２２に記憶する。
【００４２】これ以降、上記同様に図３に示す第２スト
リップ、第３ストリップ、…といった各ストリップごと
の各走査画像データが記憶媒体２２に記憶される。そし
て、レーザ光１２の走査が点Ｓ１２に到達すると、ＣＰ
Ｕ２０は、ＤＮＡマイクロアレイ３に対する全領域に対
する走査を終了する。
リップ、第３ストリップ、…といった各ストリップごと
の各走査画像データが記憶媒体２２に記憶される。そし
て、レーザ光１２の走査が点Ｓ１２に到達すると、ＣＰ
Ｕ２０は、ＤＮＡマイクロアレイ３に対する全領域に対
する走査を終了する。
【００４３】一方、ＣＰＵ２０は、第１ストリップ、第
２ストリップ、第３ストリップ、…といった各ストリッ
プごとの各走査画像データを記憶媒体２２に保存すると
共に、これら走査画像データに対する解析処理を実行す
る。
２ストリップ、第３ストリップ、…といった各ストリッ
プごとの各走査画像データを記憶媒体２２に保存すると
共に、これら走査画像データに対する解析処理を実行す
る。
【００４４】このように上記第１の実施の形態において
は、ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走査し
たときの複数のスポット２からの蛍光を受光して走査画
像データを取得する際に、レーザ光１２の走査領域が１
ストリップに達する毎に、その１ストリップを走査して
得られた各走査画像データを順次記憶媒体２２に保存す
るようにしたので、データ処理装置１９にマルチタスク
対応のオペレーションシステムを使用し、データ収集ソ
フトウエアと共に画像処理ソフトウエアを起動し、指定
のディレクトリに新規の走査画像データが作成される毎
に画像処理ソフトウエアが動作するように設定しておけ
ば、第１ストリップ、第２ストリップ、第３ストリッ
プ、…といった各ストリップの各走査画像データが作成
される毎に順次解析データを得ることができる。
は、ＤＮＡマイクロアレイ３上にレーザ光１２を走査し
たときの複数のスポット２からの蛍光を受光して走査画
像データを取得する際に、レーザ光１２の走査領域が１
ストリップに達する毎に、その１ストリップを走査して
得られた各走査画像データを順次記憶媒体２２に保存す
るようにしたので、データ処理装置１９にマルチタスク
対応のオペレーションシステムを使用し、データ収集ソ
フトウエアと共に画像処理ソフトウエアを起動し、指定
のディレクトリに新規の走査画像データが作成される毎
に画像処理ソフトウエアが動作するように設定しておけ
ば、第１ストリップ、第２ストリップ、第３ストリッ
プ、…といった各ストリップの各走査画像データが作成
される毎に順次解析データを得ることができる。
【００４５】従って、ＤＮＡマイクロアレイ３上の各ス
ポット２に対する走査と、これらスポット２に対する走
査から走査画像データを解析してその解析データが算出
までの時間を最小限に短くできる。
ポット２に対する走査と、これらスポット２に対する走
査から走査画像データを解析してその解析データが算出
までの時間を最小限に短くできる。
【００４６】（２）次に、本発明の第２の実施の形態に
ついて図面を参照して説明する。なお、本発明の画像デ
ータ取得方法を適用した走査型光学測定装置の構成は、
上記図１及び図２に示す構成と同一であり、その異なる
部分について説明する。
ついて図面を参照して説明する。なお、本発明の画像デ
ータ取得方法を適用した走査型光学測定装置の構成は、
上記図１及び図２に示す構成と同一であり、その異なる
部分について説明する。
【００４７】上記ＣＰＵ２０は、システムメモリ２１に
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数のスポット２
の配列位置に応じてレーザ光１２を走査する１ストリッ
プのサイズを変更する機能を有するものとなる。
記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行すること
により、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数のスポット２
の配列位置に応じてレーザ光１２を走査する１ストリッ
プのサイズを変更する機能を有するものとなる。
【００４８】又、上記ＣＰＵ２０は、システムメモリ２
１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行する
ことにより、順次記憶媒体２２に保存される各走査画像
データに対してそれぞれ走査位置情報を付加する機能を
有するものとなる。
１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行する
ことにより、順次記憶媒体２２に保存される各走査画像
データに対してそれぞれ走査位置情報を付加する機能を
有するものとなる。
【００４９】又、上記ＣＰＵ２０は、システムメモリ２
１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行する
ことにより、走査画像データの保存と共に、走査画像デ
ータに対する解析処理を実行する機能を有するものとな
る。
１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを実行する
ことにより、走査画像データの保存と共に、走査画像デ
ータに対する解析処理を実行する機能を有するものとな
る。
【００５０】ところで、ＤＮＡマイクロアレイ３は、上
記の如く遺伝子ＤＮＡを含んだ溶液を、下地処理された
スライドガラスなどの基板１上に滴下して作成される。
このため、各スポット２は、必ずしも真円ではなく、場
合によってはスポット２の列から大きくはみ出すことも
ある。又、スポット２の位置と走査開始位置との間にず
れが生じたり、スポット間隔が一定でない場合もある。
このような場合、各ストリップの境界にスポット２がか
かってしまう。
記の如く遺伝子ＤＮＡを含んだ溶液を、下地処理された
スライドガラスなどの基板１上に滴下して作成される。
このため、各スポット２は、必ずしも真円ではなく、場
合によってはスポット２の列から大きくはみ出すことも
ある。又、スポット２の位置と走査開始位置との間にず
れが生じたり、スポット間隔が一定でない場合もある。
このような場合、各ストリップの境界にスポット２がか
かってしまう。
【００５１】図４はかかる場合のＤＮＡマイクロアレイ
３の外観図である。第１ストリップと第２ストリップと
の境界部は、スポット列の間隔内に収まり、スポット２
がストリップ内に跨ることなく取り込まれている。とこ
ろが、第２ストリップと第３ストリップとの境界部が図
５(a)に示すようにスポット列がストリップ境界部に跨
ったり、又、第３ストリップと第４ストリップとの境界
部が図６(a)に示すように一部のスポット２がストリッ
プ間に跨ることが発生する。
３の外観図である。第１ストリップと第２ストリップと
の境界部は、スポット列の間隔内に収まり、スポット２
がストリップ内に跨ることなく取り込まれている。とこ
ろが、第２ストリップと第３ストリップとの境界部が図
５(a)に示すようにスポット列がストリップ境界部に跨
ったり、又、第３ストリップと第４ストリップとの境界
部が図６(a)に示すように一部のスポット２がストリッ
プ間に跨ることが発生する。
【００５２】このような場合、ＣＰＵ２０は、システム
メモリ２１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを
実行することにより、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数
のスポット２の配列位置に応じて、ストリップ境界部に
よりスポット２が分断されないように適宜レーザ光１２
の走査線の本数を調節し、レーザ光１２を走査する１ス
トリップのサイズを変更、すなわち適当な画像サイズで
走査画像データを取得し、記憶媒体２２に保存するとと
もに、走査は引き続き行われ、前で保存した走査画像デ
ータに連続するように次の走査画像データの取得を行
う。
メモリ２１に記憶されているデータ収集ソフトウエアを
実行することにより、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数
のスポット２の配列位置に応じて、ストリップ境界部に
よりスポット２が分断されないように適宜レーザ光１２
の走査線の本数を調節し、レーザ光１２を走査する１ス
トリップのサイズを変更、すなわち適当な画像サイズで
走査画像データを取得し、記憶媒体２２に保存するとと
もに、走査は引き続き行われ、前で保存した走査画像デ
ータに連続するように次の走査画像データの取得を行
う。
【００５３】具体的な処理について説明する。
【００５４】(a)先ず、上記図５(a)に示すように第２ス
トリップと第３ストリップとの境界部（図４に示すＱ１
部）のようにスポット列がストリップ境界部に跨る場合 ＣＰＵ２０は、１ストリップに対して設定された走査線
数を取り込み、１ストリップ分のデータの取込を終了す
る。この時点で、最後の走査線の位置Ｌ１は、図５(a)
に示すようにスポット列のほぼ中央部にある。この最後
の走査線上における蛍光輝度Ｉを求めると、図７に示す
ように各スポット２毎に輝度が高くなるような分布ｆ１
となる。なお、縦軸に蛍光輝度Ｉ、横軸に主走査方向
（Ｙ方向）をとってある。
トリップと第３ストリップとの境界部（図４に示すＱ１
部）のようにスポット列がストリップ境界部に跨る場合 ＣＰＵ２０は、１ストリップに対して設定された走査線
数を取り込み、１ストリップ分のデータの取込を終了す
る。この時点で、最後の走査線の位置Ｌ１は、図５(a)
に示すようにスポット列のほぼ中央部にある。この最後
の走査線上における蛍光輝度Ｉを求めると、図７に示す
ように各スポット２毎に輝度が高くなるような分布ｆ１
となる。なお、縦軸に蛍光輝度Ｉ、横軸に主走査方向
（Ｙ方向）をとってある。
【００５５】ＣＰＵ２０は、予め閾値Ｉthを設定し、全
ての画素で閾値Ｉthを下回るまで、走査線の位置Ｌ１を
図５(b)に示すように副走査方向（Ｘ方向）に沿って戻
す。そうすると、最後の走査線の位置Ｌ２は、図５(b)
に示すようにスポット列の間に移動し、蛍光輝度Ｉは、
図７に示すように分布ｆ２となる。
ての画素で閾値Ｉthを下回るまで、走査線の位置Ｌ１を
図５(b)に示すように副走査方向（Ｘ方向）に沿って戻
す。そうすると、最後の走査線の位置Ｌ２は、図５(b)
に示すようにスポット列の間に移動し、蛍光輝度Ｉは、
図７に示すように分布ｆ２となる。
【００５６】ここで、ＣＰＵ２０は、図５(b)に示すよ
うに最後の走査線の位置を、移動後の走査線の位置Ｌ２
とし、この位置Ｌ２を第２ストリップと第３ストリップ
との境界部として認識し、予め設定された走査線数より
も少ない走査線数で走査画像データを記憶媒体２２に保
存する。
うに最後の走査線の位置を、移動後の走査線の位置Ｌ２
とし、この位置Ｌ２を第２ストリップと第３ストリップ
との境界部として認識し、予め設定された走査線数より
も少ない走査線数で走査画像データを記憶媒体２２に保
存する。
【００５７】この際、ＣＰＵ２０は、走査画像データに
対してそれぞれ走査位置情報、例えば第２ストリップ内
の走査線数、この第２ストリップの開始及び終了した位
置座標、一番始めの走査線から累積走査線番号などを走
査画像データのヘッダ部分に付加して記憶媒体２２に保
存する。
対してそれぞれ走査位置情報、例えば第２ストリップ内
の走査線数、この第２ストリップの開始及び終了した位
置座標、一番始めの走査線から累積走査線番号などを走
査画像データのヘッダ部分に付加して記憶媒体２２に保
存する。
【００５８】(b)次に、上記図６(a)に示すように第３ス
トリップと第４ストリップとの境界部（図４に示すＱ２
部）のように一部のスポット２がストリップ間に跨る場
合 ＣＰＵ２０は、１ストリップに対して設定された走査線
数を取り込み、１ストリップ分のデータの取込を終了す
る。この時点で、最後の走査線の位置Ｌ１は、図６(a)
に示すように一部のスポット２が第３ストリップと第４
ストリップとの境界部に跨ってある。この最後の走査線
上における蛍光輝度Ｉを求めると、図８に示すようにス
トリップ間に跨っているスポット２の部分の輝度が高く
なるような分布ｆ３となる。
トリップと第４ストリップとの境界部（図４に示すＱ２
部）のように一部のスポット２がストリップ間に跨る場
合 ＣＰＵ２０は、１ストリップに対して設定された走査線
数を取り込み、１ストリップ分のデータの取込を終了す
る。この時点で、最後の走査線の位置Ｌ１は、図６(a)
に示すように一部のスポット２が第３ストリップと第４
ストリップとの境界部に跨ってある。この最後の走査線
上における蛍光輝度Ｉを求めると、図８に示すようにス
トリップ間に跨っているスポット２の部分の輝度が高く
なるような分布ｆ３となる。
【００５９】ＣＰＵ２０は、予め閾値Ｉthを設定し、全
ての画素で閾値Ｉthを下回るまで、走査線の位置Ｌ１を
図６(b)に示すように副走査方向（Ｘ方向）に沿って戻
す。そうすると、最後の走査線の位置Ｌ２は、図６(b)
に示すようにストリップ間に跨っているスポット２を通
らない位置に移動し、蛍光輝度Ｉは、図８に示すように
分布ｆ４となる。
ての画素で閾値Ｉthを下回るまで、走査線の位置Ｌ１を
図６(b)に示すように副走査方向（Ｘ方向）に沿って戻
す。そうすると、最後の走査線の位置Ｌ２は、図６(b)
に示すようにストリップ間に跨っているスポット２を通
らない位置に移動し、蛍光輝度Ｉは、図８に示すように
分布ｆ４となる。
【００６０】ここで、ＣＰＵ２０は、図６(b)に示すよ
うに最後の走査線の位置を、移動後の走査線の位置Ｌ２
とし、この位置Ｌ２を第３ストリップと第４ストリップ
との境界部として認識し、予め設定された走査線数より
も少ない走査線数で走査画像データを記憶媒体２２に保
存する。
うに最後の走査線の位置を、移動後の走査線の位置Ｌ２
とし、この位置Ｌ２を第３ストリップと第４ストリップ
との境界部として認識し、予め設定された走査線数より
も少ない走査線数で走査画像データを記憶媒体２２に保
存する。
【００６１】この際、ＣＰＵ２０は、走査画像データに
対してそれぞれ走査位置情報、例えば第３ストリップ内
の走査線数、この第３ストリップの開始及び終了した位
置座標、一番始めの走査線から累積走査線番号などを走
査画像データのヘッダ部分に付加して記憶媒体２２に保
存する。
対してそれぞれ走査位置情報、例えば第３ストリップ内
の走査線数、この第３ストリップの開始及び終了した位
置座標、一番始めの走査線から累積走査線番号などを走
査画像データのヘッダ部分に付加して記憶媒体２２に保
存する。
【００６２】このように上記第２の実施の形態において
は、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数のスポット２の配
列位置に応じてレーザ光１２を走査する１ストリップの
サイズを変更するようにしたので、上記第１の実施の形
態の効果に加えて、スポット２が必ずしも真円ではな
く、場合によってはスポット２の列から大きくはみ出し
たり、又、スポット２の位置と走査開始位置との間にず
れが生じたり、スポット間隔が一定でなく、ストリップ
の境界にスポット２がかかってしまう場合でも、スポッ
ト２を分断することなく走査画像データを保存すること
ができる。
は、ＤＮＡマイクロアレイ３上の複数のスポット２の配
列位置に応じてレーザ光１２を走査する１ストリップの
サイズを変更するようにしたので、上記第１の実施の形
態の効果に加えて、スポット２が必ずしも真円ではな
く、場合によってはスポット２の列から大きくはみ出し
たり、又、スポット２の位置と走査開始位置との間にず
れが生じたり、スポット間隔が一定でなく、ストリップ
の境界にスポット２がかかってしまう場合でも、スポッ
ト２を分断することなく走査画像データを保存すること
ができる。
【００６３】又、上記ＣＰＵ２０は、記憶媒体２２に保
存される走査画像データに対して走査位置情報を付加す
るようにしたので、各スポット２のＤＮＡマイクロアレ
イ３上での絶対位置を求めることができる。
存される走査画像データに対して走査位置情報を付加す
るようにしたので、各スポット２のＤＮＡマイクロアレ
イ３上での絶対位置を求めることができる。
【００６４】又、上述した実施の形態では、ＤＮＡマイ
クロアレイリーダーに本発明の画像データ取得方法を適
用した例で説明したが、これに限られるものではなく、
例えば、レーザ走査型顕微鏡にも適用することができ
る。
クロアレイリーダーに本発明の画像データ取得方法を適
用した例で説明したが、これに限られるものではなく、
例えば、レーザ走査型顕微鏡にも適用することができ
る。
【００６５】
【発明の効果】以上詳記したように本発明によれば、標
本に対する走査と、標本に対する走査から走査画像デー
タを解析してその解析データが算出までの時間を最小限
に短くできる画像データ取得方法を提供できる。
本に対する走査と、標本に対する走査から走査画像デー
タを解析してその解析データが算出までの時間を最小限
に短くできる画像データ取得方法を提供できる。
【図１】本発明に係わる画像データ取得方法の第１の実
施の形態を適用した走査型光学測定装置を示す構成図。
施の形態を適用した走査型光学測定装置を示す構成図。
【図２】本発明に係わる画像データ取得方法の第１の実
施の形態を適用した走査型光学測定装置におけるデータ
処理装置の構成図。
施の形態を適用した走査型光学測定装置におけるデータ
処理装置の構成図。
【図３】本発明に係わる画像データ取得方法の第１の実
施の形態を適用した走査型光学測定装置におけるＤＮＡ
マイクロアレイ上におけるレーザ光走査及び１ストリッ
プを示す図。
施の形態を適用した走査型光学測定装置におけるＤＮＡ
マイクロアレイ上におけるレーザ光走査及び１ストリッ
プを示す図。
【図４】本発明に係わる画像データ取得方法の第２の実
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイの外観図。
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイの外観図。
【図５】本発明に係わる画像データ取得方法の第２の実
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイ上のスポット
列がストリップ境界部に跨った場合の拡大図。
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイ上のスポット
列がストリップ境界部に跨った場合の拡大図。
【図６】本発明に係わる画像データ取得方法の第２の実
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイ上の一部のス
ポットがストリップ間に跨った場合の拡大図。
施の形態で測定するＤＮＡマイクロアレイ上の一部のス
ポットがストリップ間に跨った場合の拡大図。
【図７】本発明に係わる画像データ取得方法の第２の実
施の形態におけるストリップの境界部にスポット列が跨
る場合のデータ取得を説明するための図。
施の形態におけるストリップの境界部にスポット列が跨
る場合のデータ取得を説明するための図。
【図８】本発明に係わる画像データ取得方法の第２の実
施の形態における一部のスポットがストリップの境界部
に跨ってある場合のデータ取得を説明するための図。
施の形態における一部のスポットがストリップの境界部
に跨ってある場合のデータ取得を説明するための図。
【図９】ＤＮＡマイクロアレイの外観図。
１：基板 ２：スポット ３：ＤＮＡマイクロアレイ １０：電動ＸＹ走査ステージ １１：レーザ光源 １３：コリメータレンズ １４：光路分割素子 １５：レンズ １６：対物レンズ １７：レンズ １８：光電変換素子 １９：データ処理装置 ２０：ＣＰＵ ２１：システムメモリ ２２：記憶媒体 ２３：Ａ／Ｄ変換ボード ２４：機器制御用ボード ２５：ネットワーク ２６：他のコンピュータ
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き Ｆターム(参考） 2G043 AA03 BA16 CA03 DA06 EA01 FA01 FA02 GA08 GA21 GB21 HA01 HA09 KA09 LA02 2G059 AA05 BB12 EE01 EE02 EE07 FF01 FF03 GG01 JJ07 JJ11 JJ15 KK02 MM05 MM09 MM10 2H052 AA07 AA09 AF14 AF25
Claims (4)
- 【請求項１】 標本に対して光を走査し、前記各標本か
らの光を受光して走査画像データを取得する画像データ
取得方法において、 前記光の走査領域が所定サイズに達する毎に、この所定
サイズの領域を走査して得られた走査画像データを順次
保存することを特徴とする画像データ取得方法。 - 【請求項２】 前記標本内に測定対象物が複数配列され
ている場合、その配列位置に応じて前記光を走査する前
記領域のサイズを適宜変更することを特徴とする請求項
１記載の画像データ取得方法。 - 【請求項３】 順次保存される前記各走査画像データに
対してそれぞれ走査位置情報を付加することを特徴とす
る請求項１および２記載の画像データ取得方法。 - 【請求項４】 前記走査画像データの保存と共に、前記
走査画像データに対する解析処理を実行することを特徴
とする請求項１、２、および３記載の画像データ取得方
法。
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2000287618A JP2002098639A (ja) | 2000-09-21 | 2000-09-21 | 画像データ取得方法 |
| US09/955,858 US20020062202A1 (en) | 2000-09-21 | 2001-09-19 | Image data acquisition method |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2000287618A JP2002098639A (ja) | 2000-09-21 | 2000-09-21 | 画像データ取得方法 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2002098639A true JP2002098639A (ja) | 2002-04-05 |
Family
ID=18771337
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2000287618A Withdrawn JP2002098639A (ja) | 2000-09-21 | 2000-09-21 | 画像データ取得方法 |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US20020062202A1 (ja) |
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Cited By (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2004138947A (ja) * | 2002-10-21 | 2004-05-13 | Keyence Corp | 走査モード選択可能な共焦点顕微鏡システム |
| JP2005524069A (ja) * | 2002-04-24 | 2005-08-11 | インペリアル カレッジ イノベーションズ リミテッド | 励起光源として発光ダイオードを有する蛍光検出装置及び方法 |
| WO2006128321A1 (en) * | 2005-06-02 | 2006-12-07 | Capitalbio Corporation | Laser confocal microarray scanner |
| US7706419B2 (en) | 2005-06-03 | 2010-04-27 | Capitalbio Corporation | Optical systems for microarray scanning |
| WO2010137543A1 (ja) * | 2009-05-27 | 2010-12-02 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 核酸分析用デバイス、核酸分析装置、及び核酸分析方法 |
| US7928357B2 (en) | 2005-06-02 | 2011-04-19 | Capitalbio Corporation | High speed scanning platform for microarray scanner |
| JP2012083621A (ja) * | 2010-10-13 | 2012-04-26 | Olympus Corp | 走査型レーザ顕微鏡 |
| JP2015010910A (ja) * | 2013-06-28 | 2015-01-19 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップ |
| JP2015017940A (ja) * | 2013-07-12 | 2015-01-29 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップ |
| JP2015034707A (ja) * | 2013-08-07 | 2015-02-19 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法及びスクリーニング装置 |
Families Citing this family (11)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20060014151A1 (en) * | 2002-12-25 | 2006-01-19 | Jun Ogura | Optical dna sensor, dna reading apparatus, identification method of dna and manufacturing method of optical dna sensor |
| US7858382B2 (en) * | 2005-05-27 | 2010-12-28 | Vidar Systems Corporation | Sensing apparatus having rotating optical assembly |
| US7528374B2 (en) * | 2006-03-03 | 2009-05-05 | Vidar Systems Corporation | Sensing apparatus having optical assembly that collimates emitted light for detection |
| JP4914142B2 (ja) * | 2006-08-04 | 2012-04-11 | キヤノン株式会社 | 検査装置 |
| EP2972264A4 (en) | 2013-03-14 | 2016-12-07 | Sano Intelligence Inc | ON THE BODY BORN MICROSENSOR FOR BIO SURVEILLANCE |
| US10820860B2 (en) | 2013-03-14 | 2020-11-03 | One Drop Biosensor Technologies, Llc | On-body microsensor for biomonitoring |
| EP3116397A4 (en) | 2014-03-13 | 2017-11-01 | Sano Intelligence, Inc. | System for monitoring body chemistry |
| US10595754B2 (en) | 2014-03-13 | 2020-03-24 | Sano Intelligence, Inc. | System for monitoring body chemistry |
| US11141064B2 (en) * | 2017-07-19 | 2021-10-12 | Perkinelmer Health Sciences, Inc. | Systems and methods for rapid wide field illumination scanning for in vivo small animal fluorescence tomographic imaging |
| USD988882S1 (en) | 2021-04-21 | 2023-06-13 | Informed Data Systems Inc. | Sensor assembly |
| CN115063286B (zh) * | 2022-08-08 | 2022-11-25 | 江苏时代新能源科技有限公司 | 一种检测系统及图像处理方法 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4471386A (en) * | 1982-04-28 | 1984-09-11 | Xerox Corporation | Method and apparatus for composing documents for scanning |
| US5710880A (en) * | 1994-11-03 | 1998-01-20 | Microsoft Corporation | Method and system for creating a graphic image with geometric descriptors |
| US5845018A (en) * | 1996-01-30 | 1998-12-01 | Sunrise Imaging, Inc. | Method and apparatus for transferring multiple scanned images from a first medium to a second medium |
-
2000
- 2000-09-21 JP JP2000287618A patent/JP2002098639A/ja not_active Withdrawn
-
2001
- 2001-09-19 US US09/955,858 patent/US20020062202A1/en not_active Abandoned
Cited By (12)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2005524069A (ja) * | 2002-04-24 | 2005-08-11 | インペリアル カレッジ イノベーションズ リミテッド | 励起光源として発光ダイオードを有する蛍光検出装置及び方法 |
| JP2004138947A (ja) * | 2002-10-21 | 2004-05-13 | Keyence Corp | 走査モード選択可能な共焦点顕微鏡システム |
| WO2006128321A1 (en) * | 2005-06-02 | 2006-12-07 | Capitalbio Corporation | Laser confocal microarray scanner |
| US7615758B2 (en) | 2005-06-02 | 2009-11-10 | Capitalbio Corporation | Laser confocal microarray scanner |
| US7928357B2 (en) | 2005-06-02 | 2011-04-19 | Capitalbio Corporation | High speed scanning platform for microarray scanner |
| US7706419B2 (en) | 2005-06-03 | 2010-04-27 | Capitalbio Corporation | Optical systems for microarray scanning |
| WO2010137543A1 (ja) * | 2009-05-27 | 2010-12-02 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 核酸分析用デバイス、核酸分析装置、及び核酸分析方法 |
| JPWO2010137543A1 (ja) * | 2009-05-27 | 2012-11-15 | 株式会社日立ハイテクノロジーズ | 核酸分析用デバイス、核酸分析装置、及び核酸分析方法 |
| JP2012083621A (ja) * | 2010-10-13 | 2012-04-26 | Olympus Corp | 走査型レーザ顕微鏡 |
| JP2015010910A (ja) * | 2013-06-28 | 2015-01-19 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップ |
| JP2015017940A (ja) * | 2013-07-12 | 2015-01-29 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法、スクリーニング装置及びバイオチップ |
| JP2015034707A (ja) * | 2013-08-07 | 2015-02-19 | 株式会社ニコン | 検出方法、検出装置、バイオチップのスクリーニング方法及びスクリーニング装置 |
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