JP2001514489A - ヒト・マゴナシタンパク質 - Google Patents
ヒト・マゴナシタンパク質Info
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、ヒト・マゴナシタンパク質(HUMAGO)及びHUMAGOをコードするポリヌクレオチドを提供する。また本発明は、遺伝子組換えベクター及び宿主細胞、及びHUMAGOの製造方法を提供する。また本発明は、HUMAGOのアゴニスト、アンチセンス分子、抗体、又はアンタゴニストと、HUMAGOの発現が関係する疾病の予防及び治療のためのそれらの使用方法とを提供する。また本発明は、該ポリヌクレオチド又はその断片若しくは相補配列や、HUMAGOに特異的に結合する抗体を利用する診断検査方法を提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
ヒト・マゴナシタンパク質技術分野
本発明は、新規なヒト・マゴナシタンパク質の核酸及びアミノ酸配列、及び癌
及び発達障害の診断、予防、及び治療におけるこれらの配列の使用に関するもの
である。背景技術
昆虫及び脊椎動物における胚発達は、保存された遺伝子の組の空間的及び時間
的調節によって織り成される(Corte,G.等(1993)Cancer Derect.Prev.17:261-26
6)。これらの遺伝子は細胞増殖、プログラムされた細胞死、細胞移動(cell mi
gration)、及び分化を含む重要な発達上の機能を調節する。これらの遺伝子の
多くは、成体の生物体においても機能し、そのいくつかは例えば癌のようなヒト
の疾病の発生の原因となっていると考えられる(Blazsek,I.(1992)Biomed.Pharm
acother.46:219-235)。
ショウジョウバエの一種であるキイロショウジョウバエでは、所定の割球の発
達上の運命が、それが遺伝する細胞質の領域と相関関係を有する。実験の結果、
発達上の運命を誘導し得る細胞質に因子が存在することが分かった。例えば、キ
イロショウジョウバエの卵及び胚の後極における顆粒は、そこに移動する核が胚
細胞に発達できるようにする決定因子を含む。顕微鏡によって観察される顆粒、
つまり極細胞質は、タンパタ質及びRNAからなり、例えば蠕虫及び両生類のよ
うな多くの生物体において認められる。Frohnhofer H.G.等(1986,J.Embryol.Ex
pl Morph.97 Suppl.:169-179)は、キイロショウジョウバエの胚の後極を起源と
する細胞質を除去する実験によって、この顆粒が腹節形成(abdominal segmenta
tion)の発達プロセスにも関与していることを発
見した。
顆粒除去の胚細胞欠損及び分節化を模した遺伝子突然変異が発見された。実際
に、後群母性効果変異として知られるこれらの突然変異を有するメスは、顆粒を
欠く胚をつくり出す。マゴナシ(日本語で「孫がない」ことを意味する)はこの
ような突然変異の一種である。(Boswell R.E.等(1991)Development 113:373-38
4)
キイロショウジョウバエマゴナシは既知のタンパク質と相同性を有していない
147個のアミノ酸からなるタンパク質である。このタンパク質のカルボキシ末
端はわずかに疎水性を帯びており、膜貫通ドメインとして機能し得る。マゴナシ
における突然変異は、生殖質の成分、オスカー(oskar)mRNA及びスタウフ
ェンタンパク質(staufen protein)の極性限局化(polar localization)も損
なう(Newmark P.A.等(1994)Development 120:1303-1313)。マゴナシのmRN
Aは、ハエの生活環全体に渡って発現され、幼生、成体のオス、及び成体のメス
の何れにおいても類似のレベルで発生する。胚形成の先の発達段階におけるマゴ
ナシの発現及び特定のマゴナシ変異体の解析によって、この遺伝子産物が成体の
ハエにおいて重要な機能を果たすことが示唆されている。更に、いくつかの種を
起源とする発現された配列のタグは、キイロショウジョウバエマゴナシに対して
相同性を示すタンパク質断片をコードしている。従って、マゴナシは大きな進化
距離に渡って保存されており、多くの種において重要な機能を果たしている可能
性がある(Newmark等、前出)。
キイロショウジョウバエマゴナシに近縁なタンパク質及びそれをコードするポ
リヌクレオチドの発見は、癌及び発達障害の診断、予防、及び治療において役立
つ新たな物質を提供することにより、当分野における必要性を満たすものである
。発明の開示
本発明は、キイロショウジョウバエマゴナシタンパク質に類似性を有すること
を特徴とする、新規なヒト・マゴナシタンパク質(以下HUMAGOと称する)
を提供する。
従って本発明は、配列番号:1に示すアミノ酸配列を有する実質的に精製され
たHUMAGOを提供する。
本発明の或る態様は、HUMAGOをコードする単離され実質的に精製された
ポリヌクレオチドを提供する。特定の態様では、このポリヌクレオチドは配列番
号:2のヌクレオチド配列である。
また本発明は、配列番号:2の配列又はその変異体に相補的な配列を含むポリ
ヌクレオチド配列に関連する。更に本発明は、配列番号:2の配列と厳密な条件
の下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を提供する。
更に本発明は、該ポリペプチドをコードする核酸配列、オリゴヌクレオチド、
ペプチド核酸(PNA)、その断片、一部分又はアンチセンス分子や、HUMA
GOをコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター及び宿主細胞を提供する
。また本発明は、HUMAGOに特異的に結合する抗体や、実質的に精製された
HUMAGOを含む医薬品組成物を提供する。また本発明は、HUMAGOのア
ゴニスト及びアンタゴニストを提供する。また本発明は、HUMAGOの製造方
法や、HUMAGO又はHUMAGOに対するアゴニストを投与することによる
発達障害の治療方法を提供する。更に本発明は、HUMAGOのアンタゴニスト
を投与することによる癌の治療方法を提供する。図面の簡単な説明
第1A図及び第1B図は、HUMAGOのアミノ酸配列(配列番号:1)及び
核酸配列(配列番号:2)を示す。配列のアライメントは、MacDNASISPROTMソフ
トウエア(Hitachi Software Engineering Co.,
Ltd.,San Bruno,CA)を用いて作成した。
第2図は、HUMAGO(配列番号:1)とキイロショウジョウバエマゴナシ
(GI 476103;配列番号:3)との間のアミノ酸配列アライメントを示す。この
配列のアライメントは、DNASTARTMソフトウェアのマルチシーケンスアライメン
トプログラム(DNASTAR Inc,Madison WI)を用いて作成した。
第3図は、HUMAGO(配列番号:1)の疎水性プロット(MacDNASIS PRO
ソフトウエアを用いて作成)を示しており、X軸は正の方向にアミノ酸の位置を
表し、Y軸は負の方向に疎水性のレベルを表す。
第4図は、キイロショウジョウバエマゴナシ(配列番号:3)の疎水性プロッ
トを示す。発明の実施の形態
本発明のタンパク質、核酸配列、及び方法について説明する前に、本発明は、
ここに開示した特定の方法論、プロトコル、細胞系、ベクター、及び試薬に限定
されず、当然のことながらこれらを変えて実施することができるものと理解され
たい。また、ここで用いられる用語法は、特定の実施例のみを説明する目的で用
いられたものであり、請求の範囲のみによって限定される本発明の範囲を限定す
ることを意図したものではないということも理解されたい。
本明細書及び請求の範囲において、単数を表す「1つの」及び「その」と形容
されたものは、前後関係でそうでないことが明らかである場合以外は、複数の意
味も含んでいることに注意しなければならない。従って、例えば「宿主細胞」な
る表記が表すものには、複数のそのような宿主細胞が含まれ、「抗体」なる表記
は、1またはそれ以上の抗体及び当業者に周知のその等価物等も表している。
本明細書における全ての科学技術専門用語は、別の意味で定義されていない場
合には、本発明の属する技術分野の専門家に一般に理解されるのと同じ意味を有
する。ここに説明したものと類似のまたは等価な方法や材料を本発明の実施や試
験において用いることができるが、好適な方法、装置、及び材料はここに説明さ
れている。本明細書に記載された全ての文献は、本発明の関連において用いられ
得る文献で報告された細胞系、ベクター、及び方法論を説明し開示する目的で引
用されたものであり、この引用により本明細書と一体にされる。
定義
本明細書において「核酸配列」は、一本鎖か二本鎖の、センス鎖又はアンチセ
ンス鎖である、ゲノム起源又は合成起源のDNA、RNAや、オリゴヌクレオチ
ド、ヌクレオチド、又はポリヌクレオチド、及びその断片又は一部分である。同
様に、本明細書において「アミノ酸配列」は、自然発生の分子または合成分子の
、オリゴペプチド、ペプチド、ポリペプチド若しくはタンパク質配列及びその断
片又は一部分である。
ここでは「アミノ酸配列」は、自然発生タンパク質分子のアミノ酸配列を指す
ものとして説明されているが、「アミノ酸配列」や類似の用語、例えば「ポリペ
プチド」又は「タンパク質」は、アミノ酸配列を、説明されるタンパク質分子に
関連する完全で元のままのアミノ酸配列に限定する意味で用いられてるのではな
い。
本明細書において「ペプチド核酸」は、リジンのようなアミノ酸残基及びアミ
ノ基が加えられたオリゴマーを含む分子である。これらの小分子は抗遺伝子剤と
も称され、それに対して相補的な核酸の鎖に結合することにより転写物の伸長を
停止させる(Nielsen,P.E.等(1993)Anticancer Drug Des 8:53-63)。
本明細書において、HUMAGOは、任意の種、特にウシ、ヒツジ、ブタ、マ
ウス、ウマ、及び好ましくはヒトを含む哺乳類から得られる、天然の、合成の、
半合成の、又は組換え体を起源とする実質的に精製されたHUMAGOのアミノ
酸配列である。
本明細書において「コンセンサス」は、再度シークエンシングされて不要な塩
基が分離された核酸配列か、XL-PCRTM(Perkin Elmer,Norwalk,CT)を用いて5
’方向及び/または3’方向に延長されて、再度シークエンシングされた核酸配
列か、GELVIEWTMFragment Assembly system(GCG,Madison WI)を用いて2以上
のインサイト社クローンの重複した配列を元に組み合わせて構成された核酸配列
か、若しくは延長と組み合わせの双方によって形成された核酸配列の何れかであ
る。
本明細書においてHUMAGOの「変異体」は、1又は2箇所以上のアミノ酸
が変異したアミノ酸配列である。この変異体は「保存的」変化を含むものであり
得、この保存的変化においては、例えばロイシンをイソロイシンで置き換える場
合のように置換されるアミノ酸が類似な構造的及び化学的特性を有する。稀に、
変異体が「非保存的」に変化する場合もあり、この非保存的変化では例えばグリ
シンがトリプトファンで置換される。類似した小変化には、アミノ酸の欠失か挿
入、若しくはその両方も含まれる。例えばDNASTARソフトウエアのような良く知
られたコンピュータプログラムを用いて、生物学的或いは免疫学的活性を損なわ
ずに置換、挿入、又は除去できるアミノ酸が何れかということ、及びそのような
アミノ酸がいくつかということを決定することができる。
本明細書において「欠失」は、1または2以上のヌクレオチド若しくはアミノ
酸残基が欠ける、ヌクレオチド配列またはアミノ酸配列における変化である。
本明細書において「挿入」或いは「付加」は、自然発生の分子と比較して、そ
れぞれ1または2以上のヌクレオチド、アミノ酸残基が加わるような、ヌクレオ
チド配列或いはアミノ酸配列の変化を指す。
本明細書において「置換」は、それぞれ1または2以上のヌクレオチド或いは
アミノ酸を、異なるヌクレオチド或いはアミノ酸に置換することによって生ずる
変化である。
本明細書において、用語「生物学的に活性」は、自然発生の分子の構造的機能
、調節機能、又は生化学的機能を有するタンパク質である。同様に「免疫学的に
活性」は、天然の、組換え体の、又は合成のHUMAGO、若しくはその任意の
オリゴペプチドが適当な動物や細胞における特定の免疫応答を誘発し、特定の抗
体に結合する能力である。
本明細書において、用語「アゴニスト」は、HUMAGOに結合したとき、H
UMAGOの活性を変調するようなHUMAGOの変化を生じさせる分子である
。アゴニストには、HUMAGOに結合するタンパク質、核酸、糖質や、任意の
他の分子が含まれ得る。
本明細書において、用語「アンタゴニスト」または「インヒビター」は、HU
MAGOに結合したとき、HUMAGOの活性を阻害する分子である。アンタゴ
ニスト及びインヒビターには、HUMAGOに結合するタンパク質、核酸、糖質
や、任意の他の分子が含まれ得る。
本明細書において、用語「変調」は、HUMAGOの生物学的活性の変化又は
変質である。変調は、タンパク質活性の上昇や低下、結合特性の変化、又はHU
MAGOの生物学的、機能的、免疫学的特性の他の変化であり得る。
本明細書において、用語「擬似物」は、HUMAGOまたはその一部分の構造
の知識からその構造を知ることができ、そのようなものとして、マゴナシタンパ
ク質様分子の作用の一部または全てに影響を与え得る分
子である。
本明細書において、用語「誘導体」は、HUMAGOをコードする核酸又はコ
ードされたHUMAGOを化学的に修飾したものを意味する。このような修飾の
例には、水素からアルキル基、アシル基、又はアミノ基への置換がある。核酸誘
導体は、未修飾HUMAGOの必須の生物学的特性を保持しているポリペプチド
をコードする。
本明細書において、用語「実質的に精製」は、天然の環境から取り除かれ、天
然にはそれが結合して存在する他の構成要素から単離又は分離されて、その構成
要素が60%以上、好ましくは75%以上、最も好ましくは90%以上除去され
た核酸配列又はアミノ酸配列である。
本明細書において「増幅」は、核酸配列の更なる複製物を生成することであり
、通常は当業者に周知のポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を用いて行われる(D
ieffenbach,C.W.及びG.S.Dveksler(1995)PCR Primer.a Laboratory Manual,Cold
Spring Harbor Press,Plainview,NY)。
本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション(ハイブリッド形成)」は
、核酸の鎖が塩基対合を介して相補鎖と結合する過程である。
本明細書において、用語「ハイブリダイゼーション複合体」は、相補的なG塩
基とC塩基の間及び相補的なA塩基とT塩基の間での水素結合の形成によって、
2つの核酸配列で形成された複合体である。これらの水素結合は、塩基スタッキ
ング相互作用(base stacking interaction)により更に安定化され得る。この
2つの相補的核酸配列は水素結合して、逆平行構造をなす。ハイブリダイゼーシ
ョン複合体は、溶液中で形成されるか(例えばC0t又はR0t解析)、或いは核酸
は溶液中に存在する一方の核酸と、固定支持体(例えばin situハイブリダイゼ
ーションのために細胞が固定されるメンブラン、フィルタ、ピン、またはスライ
ド
ガラス)に固定化された他方の核酸との間で形成され得る。
本明細書において、用語「相補的」または「相補性」は、許容的な塩及び温度
の条件の下での塩基対によるポリヌクレオチド同士の自然の結合である。例えば
、配列「A−G−T」は相補的配列「T−C−A」に結合する。2つの二本鎖分
子間の相補性は、核酸の幾つかのみが結合している「部分的」なものであるか、
若しくは一本鎖分子間に完全な相補性が存在する場合は完全に相補的であり得る
。核酸鎖同士の相補性の程度は、核酸鎖同士のハイブリダイゼーションの効率及
び強度に有意な影響を与える。このことは、核酸鎖同士の結合によって左右され
る増幅反応において特に重要である。
本明細書において、用語「相同性」は、相補性の程度である。部分的な相同性
と、完全な相同性(即ち同一性)の場合があり得る。部分的に相補的な配列は、
同一の配列が標的の核酸とハイブリダイズするのを少なくとも部分的に阻害する
ものであり、これを機能的な用語「実質的に相同な」を用いて表す。完全に相補
的な配列と標的配列とのハイブリダイゼーションの阻害は、低い厳密性の条件の
下で、ハイブリダイゼーションアッセイ(サザンブロット法またはノーザンブロ
ット法、溶液ハイブリダイゼーション等)を用いて検定することができる。実質
的に相同な配列またはプローブは、低い厳密性の条件の下で標的の配列と、完全
に相同な配列またはプローブとの結合(即ちハイブリッド形成)について競合し
、それを阻害する。これは、低い厳密性の条件が、非特異的な結合を許容するよ
うなものであると言っているのではない。低い厳密性の条件では、2つの配列の
相互の結合が特異的(即ち選択的)相互作用であることが必要である。非特異的
結合が存在しないことは、部分的な程度の相補性(即ち約30%未満の同一性)
を有していない第2の標的配列を用いることにより試験できる。非特異的結合が
存在しない場合、
プローブは第2の非相補的標的配列とハイブリダイズしない。
周知のように、多数の等価な条件を用いて、低い厳密性条件か高い厳密性条件
の何れかを含むようにすることができる。例えば配列の長さ及び性質(DNA、
RNA、塩基構成)、標的の性質(DNA、RNA、塩基構成、溶液中に存在す
るか或いは固定化されているか等)、及び塩や他の成分の濃度(例えばホルムア
ミド、デキストラン硫酸、及び/またはポリエチレングリコールの有無)のよう
な要素を考慮してハイブリダイゼーション溶液を変え、上に列挙した条件とは異
なるが等価である低い厳密性または高い厳密性の何れかの条件を作り出すことが
できる。
本明細書において、用語「厳密性条件」は、約(Tm−5)℃(プローブの融
解温度(Tm)より5℃下)からTmの約20〜25℃下まで範囲で生ずる「厳
密性」である。当業者には理解されるように、ハイブリダイゼーションの厳密性
は、同一のポリヌクレオチド配列の同定や検出のためであるか、或いは近縁なポ
リヌクレオチド配列の同定や検出のためであるかによって変えることができる。
本明細書において用語「アンチセンス」は、特定のDNAまたはRNA配列に
対して相補的なヌクレオチド配列である。「アンチセンス鎖」は、「センス」鎖
に対して相補的な核酸鎖の意味で用いられる。アンチセンス分子は、相補的鎖の
合成が可能なウイルスプロモータに、目的の遺伝子を逆方向に結合することによ
る合成を含む任意の方法で作り出すことができる。この転写された鎖は、一度細
胞内に導入されると、細胞によって作られた天然の配列と結合して二重鎖を形成
する。次にこれらの二重鎖は更なる転写や翻訳を阻害する。このようにして、変
異体の表現型を作り出すことができる。「ネガティブ」なる表現はアンチセンス
鎖の意味で時折用いられ、「ポジティブ」はセンス鎖の意味で用いられることが
ある。
本明細書において、(「指定のタンパク質の一部分」と用いられるような)タ
ンパク質に関連する用語「一部分」は、そのタンパク質の断片である。この断片
のサイズは4つのアミノ酸残基から、(全アミノ酸配列−1)個のアミノ酸の範
囲に亘る。従って、「配列番号:1のアミノ酸配列の少なくとも一部分を含む」
タンパク質は、完全長ヒトHUMAGOとその断片を含む。
本明細書の定義では、「形質転換」は、外来DNAが入り込みレシピエント細
胞を変化させるプロセスを意味する。このプロセスは、よく知られた種々の方法
を用いた天然または人工の条件の下で生じ得る。形質転換は、外来核酸配列を原
核細胞または真核細胞の宿主細胞に導入するための任意の既知の方法に基づいて
いる。この方法は形質転換される宿主細胞によって選択され、以下のものに限定
されないが、ウイルス感染、電気穿孔法、リポフェクション、及び微粒子銃を用
いる方法が含まれ得る。このように「形質転換された」細胞は、その中で挿入さ
れたDNAが自律的に複製するプラスミドとして、或いは宿主の染色体の一部と
して複製が可能な安定的に形質転換された細胞を含む。またこのような細胞は、
限られた時間だけ導入されたDNAの一過性の発現をする細胞も含む。
本明細書において、用語「抗原決定基」は、特定の抗体と接触する分子の一部
分(即ちエピトープ)である。タンパク質またはタンパク質の断片を用いてホス
トの動物を免疫すると、このタンパク質の種々の領域が、該タンパク質上の所定
の領域または三次元構造に特異的に結合する抗体の産生を誘発し得る。これらの
領域または構造を抗原決定基と称する。抗原決定基は、抗体への結合について、
そのままの抗原(即ち免疫応答を引き出すために用いられる免疫原)と競合し得
る。
本明細書において、用語「特異的結合」または「特異的に結合する」
は、抗体及びタンパク質またはペプチドの相互作用が、タンパク質上の特定の構
造(即ち抗原決定基またはエピトープ)の存在に左右されることを意味している
。つまり、この抗体はタンパク質全体ではなく、特定のタンパク質構造を認識し
て結合する。例えば、抗体がエピトープ「A」に対して特異的である場合、標識
した「A」及びその抗体を含む反応において、エピトープA(つまり結合してい
ない、無標識のA)を含むタンパク質が存在すると、抗体に結合した標識Aの量
が低下する。
本明細書において、用語「サンプル」は、その最も広い意味で用いられる。H
UMAGOをコードする核酸またはその断片を含む疑いのある生物学的サンプル
は、細胞、細胞から単離された染色体(例えば中期染色体の展開物)、(溶液中
の、または例えばサザンブロット解析用に固体支持体に結合した)ゲノムのDN
A、(溶液中の、または例えばノーザンブロット解析用に固体支持体に結合した
)RNA、(溶液中の、または固体支持体に結合した)cDNA、細胞や組織か
らの抽出物、その他を含み得る。
本明細書において、「ポリヌクレオチドの発現と相関性を有する」なる表現は
、ノーザン解析ハイブリダイゼーションアッセイにより、配列番号:2に類似な
リボ核酸の存在が検出されることが、サンプル内のHUMAGOをコードするm
RNAの存在を表しており、従って該タンパク質をコードする遺伝子からの転写
物の発現と相関性を有しているということを表している。
本明細書において、配列番号:2のポリヌクレオチドにおける「変異」は、ハ
イブリダイゼーションアッセイを用いて検出され得る欠失、挿入、及び点変異を
含む、HUMAGOをコードするポリヌクレオチドの配列における変化を含む。
この定義に含まれる変異は、(例えば、配列番号:2とハイブリダイズし得る制
限断片長の多形性のパターンの変化によ
る)HUMAGOをコードするゲノムのDNA配列に対する変異の検出、(例え
ばアレル特異的オリゴヌクレオチドプローブを用いる)ゲノムDNAのサンプル
と配列番号:2の選択された断片とがハイブリダイズ不可能であること、及び(
例えば中期染色体展開物との蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)を用
いた)HUMAGOをコードするポリヌクレオチド配列に対する正常な遺伝子座
以外の遺伝子座とのハイブリッド形成のような、不適当な或いは予期していない
ハイブリダイゼーションによって検出される。
本明細書において、用語「抗体」は、そのままの抗体分子及び、例えば抗原決
定基と結合し得るFa、F(ab')2、及びFvのようなその断片である。HUMAGO
ポリペプチドに結台する抗体は、そのままのポリペプチド、或いは免疫化する抗
原としての目的の小型のペプチドを含む断片を用いて調製することができる。動
物を免疫するのに用いられるポリペプチドまたはペプチドは、翻訳されたcDN
Aまたは化学的合成物を起源とするものであり得、必要ならば担体タンパク質と
結合することができる。ペプチドに化学的に結合する通常用いられる担体には、
ウシ血清アルブミン及びサイログロブリンが含まれる。次にこの結合したペプチ
ドを用いて動物(例えばマウス、ラット、またはウサギ)を免疫する。
本明細書において、用語「ヒト化抗体」は、元の結合能力をそのまま保持しつ
つ、ヒトの抗体により近づけるために非抗体結合領域においてアミノ酸を置換し
た抗体分子である。
発明
本発明は、新規なヒト・マゴナシタンパク質(HUMAGO)の発見、HUM
AGOをコードするポリヌクレオチド、及び癌及び発達障害の診断、予防、又は
治療のためのこれらの物質の使用に基づくものである。
本発明のヒトHUMAGOをコードする核酸は、規格化前立腺組織cDNAラ
イブラリー(PROSNON01)を起源とするインサイト社クローンNo.2278920にお
いて、アミノ酸配列アライメントのコンピュータ検索によって初めに同定された
。コンセンス配列の配列番号:2は、以下の重複及び/又は延長された核酸配列
、即ちインサイト社クローンNo.2278920、1492969(PROSNON01)、及び53661
(FIBRNOT01)から編成されたものである。
或る実施例では、本発明は、第1A図及び第1B図に示す配列番号:1のアミ
ノ酸配列を含むポリペプチドを包含する。HUMAGOは148個のアミノ酸か
らなる長さを有し、113番目のアスパラギン残基において保存的Nグリコシル化
可能部位を有する。HUMAGOはキイロショウジョウバエマゴナシ(G1476103
;配列番号:3)と化学的及び構造的相同性を有する。詳述すると、HUMAG
Oとキイロショウジョウバエマゴナシとは90%の同一性を共有している。第3
図及び第4図に示すように、HUMAGOとキイロショウジョウバエマゴナシは
かなり類似した疎水性プロットを示す。両タンパク質は、それらのカルボキシ末
端に膜貫通可能ドメインを有する。ノーザン解析の結果から、種々のライブラリ
ーにおけるHUMAGOの発現が分かる。これらのライブラリーの多くは胎児組
織及び癌性細胞を起源とするものである。
また本発明はHUMAGO変異体を包含する。好適なHUMAGO変異体は、
HUMAGOアミノ酸配列(配列番号:1)と80%以上、より好適には90%
以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。最も好適なHUMAGO変異体
は、配列番号:1と95%以上のアミノ酸配列同一性を有するものである。
また本発明は、HUMAGOをコードするポリヌクレオチドを包含する。従っ
て、HUMAGOのアミノ酸配列をコードする任意の核酸配列
を用いて、HUMAGOを発現する組換え分子をつくり出すことができる。特定
の実施例では、本発明は第1A図及び第1B図に示す配列番号:1の核酸配列を
含むポリヌクレオチドを包含する。
当業者には理解されるように、遺伝暗号の縮重の結果、任意の既知の自然発生
遺伝子のヌクレオチド配列と最小限の相同性しか有していないものも含めて、多
種のHUMAGOコーディングヌクレオチド配列が作り出され得る。本発明は、
可能なコドン選択に基づく組み合わせを選択することにより作り出され得る、全
ての可能な核酸配列の変異をその範囲に含んでいる。それらの組み合わせは、自
然発生のHUMAGOのヌクレオチド配列に適用されるような標準的なトリプレ
ット遺伝暗号に基づいて作り出されるものであり、このような全ての変異は、こ
こに具体的に示されたものと考えられたい。
HUMAGO及びその変異体をコードするヌクレオチド配列は、適切に選択さ
れた厳密性の条件の下で自然発生配列のヌクレオチド配列とハイブリッド形成可
能なものであるのが好ましいが、実質的に異なるコドンの使用頻度を有するHU
MAGO又はその変異体をコードするヌクレオチド配列を作り出すことは有益で
あり得る。コドン選択は、特定のコドンが宿主によって使用される頻度に従って
、特定の原核細胞又は真核細胞の発現宿主におけるペプチド発現の発生率を高め
るように選択することができる。HUMAGO及びその誘導体をコードするヌク
レオチド配列を、コードされるアミノ酸配列を変えないように実質的に変更する
理由は、例えば自然発生配列から作り出される転写物より長い半減期のような、
より望ましい特性を有するRNA転写物を作り出すためである。
本発明の範囲には、HUMAGO又はその誘導体をコードするDNA配列又は
その一部の、完全な合成ケミストリによる作製も含まれる。作製したこの合成遺
伝子を、この出願時点において周知の試薬を用いて任
意の入手可能なDNAベクター及び細胞系に挿入することができる。更に、合成
ケミストリを用いてHUMAGOをコードする配列又はその任意の一部分に突然
変異を誘発させることができる。
また本発明の範囲に含まれるものとして、種々の厳密性の条件の下で請求項に
記載のヌクレオチド配列、特に配列番号:2のヌクレオチド配列とハイブリダイ
ズし得るポリヌクレオチド配列がある。ハイブリダイゼーション条件は、Wahl,G
.M.及びS.L.Berger(1987;Methods Enzymol.152:399-407)及びKimmel,A.R.(1987
;Methods in Enzymol.152:507-511)に記載されているように、核酸結合複合体ま
たはプローブの融解温度(Tm)に基づいており、規定の厳密性において用いら
れ得る。
本発明の範囲に含まれるHUMAGOをコードする変異核酸配列は、異なるヌ
クレオチド残基の欠失、挿入並びに置換を含み、結果的に同一の、または機能的
に等価のHUMAGOポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとなるもので
ある。コードされたタンパク質も、サイレント変化を生ずるアミノ酸残基の欠失
、挿入並びに置換を含み、結果的に機能的に等価なHUMAGOとなる。意図的
な(deliberate)アミノ酸置換は、HUMAGOの生物学的活性が保持される限
りにおいて、残基の極性、電荷、溶解度、疎水性、親水性並びにまた両親媒性に
ついての類似性に基づいてなされ得る。例えば負に荷電したアミノ酸にはアスパ
ラギン酸及びグルタミン酸が含まれ、正に荷電したアミノ酸にはリジン及びアル
ギニンが含まれ、近い親水性値を持つ荷電していない極性頭基を有するアミノ酸
には、ロイシン、イソロイシン、バリン、グリシン、アラニン、アスパラギン、
グルタミン、セリン、スレオニン、フェニルアラニン並びにチロシンが含まれる
。
更に本発明の範囲に含まれるものとして、HUMAGOのアレルがあ
る。ここで用いる「アレル」或いは「アレル配列」とは、HUMAGOの対立形
である。アレルは変異、すなわち核酸配列の変化によって生じ、一般に変異した
mRNA或いはポリペプチドを生成するが、そのmRNA或いはポリペプチドの
構造或いは機能は、変わる場合もあれば変わらない場合もある。遺伝子によって
は、アレル形が存在しないもの、1つ存在するもの、或いは多数存在するものが
ある。一般にアレルを生じる変異はアミノ酸の自然な欠失、付加並びに置換に起
因する。このタイプの変化はそれぞれ単独で、或いは他の変化と同時に、与えら
れた配列内で1又は2回以上生じ得る。
当業者が一般に利用可能な周知のDNA配列決定のための方法が、本発明の実
施において用いられ得る。この方法では酵素、例えばDNAポCleveland OH)、Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)、熱安定性T7ポリメラーゼ
(Amersham,Chicago IL)、或いはGibco BRL(Galthersburg MD)Methods社から市
販されているELONGASE増幅システムのような校正エキソヌクレアーゼと組換え体
ポリメラーゼとの組み合わせのような酵素を使用する。この処理は、Hamilton M
icro Lab2200(Hamilton,Reno,NV)、Peltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Res
erch,Watertown MA)並びにABI377DNAシーケンサ(Perkin Elmer)のような装置
を用いて自動化するのが好ましい。
HUMAGOをコードするポリヌクレオチド配列は、部分的なヌクレオチド配
列と、プロモーター及び調節エレメントのような上流配列を検出するための当業
者には周知の様々な方法とを用いて伸長させることができる。例えば、「制限部
位」ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法を用いることができる或る方法では、汎
用プライマーを用いて既知の座位に隣接する未知の配列を得る(Sarkar,G.(199
3)PCR Methods Applic
2:318-322)。詳述すると、まずゲノムDNAを、既知の領域に対して特異的な
プライマー及びリンカー配列に対するプライマーの存在下で増幅する。増幅され
た配列を、その同じリンカープライマー及び最初のプライマーの内部に含まれる
別の特異的プライマーを用いてPCRの2巡目にかける。PCRの各回の生成物
を、適切なRNAポリメラーゼを用いて転写させ、逆転写酵素を用いて配列決定
する。
逆PCR法を用いて、既知領域に基づく多様なプライマーを利用した配列の増
幅、または伸長を行うことができる(Triglla,T.等(1988)
Biosciences社,Plymouth MN)や別の適切なプログラムを用いて、長さが22〜
30ヌクレオチドで、50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の温度
で標的配列にアニールするように設計される。この方法ではいくつかの制限酵素
を用いて遺伝子の既知領域の適当な断片を作り出す。次にこの断片を分子内ライ
ゲーションにより環状にし、PCR用の鋳型として使用する。
使用できる別の方法はキャプチャPCR法であり、この方法ではヒト及び酵母
菌人工染色体DNA内の既知の配列に隣接するDNA断片をPCR増幅する(Lag
erstrom,M.等(1991)PCR Methods Applic 1:111-19)。この方法では、PCR処理
の前に、DNA分子の未知の部分に、複数の制限酵素による消化及びライゲーシ
ョンによって組換え二本鎖配列を配置しておいてもよい。
未知の配列を得るために用いることができる別の方法は、Parker,J.D.等の方
法(1991;Nucleic Acids Res 19:3055-3060)である。更に、PCR、ネスト化
プライマー、PromoterFinderTMライブラリーを用いて、ゲノムDNA内歩行を行
うことができる(Clontech,Palo Alto CA)。このプロセスは、ライブラリーを
スクリーニングする必要がなく、イント
ロン/エクソン接合部を探し出すのに有用である。
完全長cDNAをスクリーニングするときに好適なライブラリーは、サイズ選
択された、より大きなcDNAを含むライブラリーである。またランダムプライ
ミングした(rondom primed)ライブラリーは、遺伝子の5’及び上流領域を含む
配列をより多く含むという点で好適である。ランダムプライミングしたライブラ
リーは、オリゴd(T)ライブラリーで完全長cDNAが得られない場合に特に
有用である。またゲノムライブラリーは、5’及び3’非翻訳領域への配列の伸
長のために役立ち得る。
配列決定やPCRの産物のヌクレオチド配列をサイズ分析したり確認するため
には、市販のキャピラリー電気泳動システムを用いることができる。詳述すると
、キャピラリーシークエンシングでは、電気泳動による分離のための流動性ポリ
マー、レーザーで活性化される4つの異なる蛍光色素(各ヌクレオチドに対して
1つ)を使用し、CCDカメラにより放射線の波長の検出を行う。出力/光強度
は適切なソフトウエア(例えばPerkin elmer製のGenotyperTM及びSequence Navi
gatorTM)を用いて電気信号に変換され、サンプルの負荷からコンピュータ解析
及び電子データ表示までの全過程がコンピュータ制御される。キャピラリー電気
泳動法は、特定のサンプル内に限られた量だけ存在するDNA小片の配列決定に
特に適している。
本発明の別の実施例では、HUMAGO、融合タンパク質或いはその機能的等
価物をコードするポリヌクレオチド配列を、適切な宿主細胞内でのHUMAGO
の発現を誘導する組換えDNA分子において用いることができる。遺伝暗号固有
の縮重のために、同一か機能的に等価なアミノ酸配列を実質的にコードする他の
DNA配列も、HUMAGOのクローニングや発現のために用いることができる
。
当業者には理解できるように、非自然発生コドンを有するHUMAGOコード
ディングヌクレオチド配列を作り出すことは有益であり得る。特定の原核細胞或
いは真核細胞の宿主において選好されるコドンを選択して、例えば、HUMAG
O発現率を増大させたり、或いは自然発生配列から生成された転写物より長い半
減期のような望ましい特性を有する組換えRNA転写物を生成することができる
。
本発明のヌクレオチド配列は、様々な目的、例えば、以下のものに限定はしな
いが遺伝子産物のクローニング、プロセシング及び/又は発現を変えるようにH
UMAGOをコードする配列を改変するために既知の方法を用いて組換えること
ができる。無作為断片によるDNA再編成や遺伝子断片のPCR再会合及び合成
オリゴヌクレオチドを用いて、ヌクレオチド配列を組換えることができる。例え
ば、特定部位突然変異誘発のような当業者には周知の技術を用いて突然変異を誘
発させることによって、新しい制限部位の挿入、グリコシル化パターンの変更、
コドン選好の変化、スプライスバリアントの生成等をもたらすことができる。
本発明の別の実施例では、未改変HUMAGOコーディング配列、変異HUM
AGOコーディング配列、又は組換えHUMAGOコーディング配列を異種の配
列に結合して、融合タンパク質をコードする配列にする。例えば、HUMAGO
活性のインヒビターをペプチドライブラリーからスクリーニングする場合、市販
の抗体により認識される異なるペプチドを発現するキメラHUMAGOタンパク
質をコードすることが役立つ。融合タンパク質はHUMAGO配列と異種のタン
パク質配列との間の位置に切断部位を有するように設計することもでき、これに
よってHUMAGOを切断して、ヘテロの部分から分けて精製することが可能と
なる。
本発明の別の実施例では、当業者によく知られた化学的方法
(Caruthers.M.H.等(1980)Nuc Acids Res Symp Ser 7:215-223;Horn,T.等(1980
)Nucl.Acids Res Symp.Ser.225-232参照)を用いて、HUMAGOコーディン
グ配列の全体、或いはその一部を合成することができる。別法では、化学的方法
を用いてタンパク質自体を作り出して、HUMAGOアミノ酸配列の全体或いは
その一部を合成することができる。例えば、種々の固相技術(Roberge,J.Y.等(1
995)Science 269:202-204)でペプチド合成を行うことができ、合成の自動化は
、例えばABI431Aペプチドシンセサイザ(Perkin Elmer)を用いることにより達
成することができる。
この新たに合成されたペプチドは、分離用高速液体クロマトグラフィにより実
質的に精製することができる(例えばCreighton T.(1983)Protein Structure And Molecular Principles
,WH Freeman and Co.,NY参照)。合成されたペプチド
の構成は、アミノ酸解析或いはシークエンシングにより確認することができる(
例えばエドマン分解法;Creighton,上述)。さらにHUMAGOのアミノ酸配
列或いはその任意の部分を、その直接の合成の際の改変することにより、及び/
又は化学的方法を用いた他のタンパク質或いはその任意の部分に由来する配列と
の結合することによって変異体ポリペプチドを作ることができる。
生物学的に活性なHUMAGOを発現させるために、HUMAGOコーディン
グヌクレオチド配列或いはその機能的等価物を、適切な発現ベクター、すなわち
挿入されたコーディング配列の転写及び翻訳に必要な要素を含むベクターに挿入
する。
HUMAGOコーディング配列及び適切な転写や翻訳の調節領域を含む発現ベ
クターを作製するために当業者に周知の方法が用いられる。これらの方法には、
in vitro組換えDNA技術、合成技術、並びにin vivo組換え技術、又は遺伝子
組換え技術が含まれる。このような技術は、
Sambrook,J.等(1989)Molecular Cloning.A Laboratory Manual,Cold Spring Har
bor Press,Planview NY及びAusubel,F.M.等Current Protocolin Molecular Biol ogy
,John Wilky & Sons,New York NYに記載されている。
種々の発現ベクター/宿主系を、HUMAGOコーディング配列を保持し、か
つ発現するために利用することができる。このようなものには、以下のものに限
定はされないが、組換えバクテリオファージ、プラスミド或いはコスミドDNA
発現ベクターで形質転換した細菌のような微生物や、酵母菌発現ベクターで形質
転換した酵母菌や、ウイルス発現ベクター(例えばバキュロウイルス)を感染さ
せた昆虫細胞系や、ウイルス発現ベクター(例えばカリフラワーモザイクウイル
スCaMV、タバコモザイクウイルスTMV)をトランスフェクトした、或いは細菌の
発現ベクター(例えばTi、或いはpBR322プラスミド)で形質転換した植物細胞系
や、或いは動物細胞系が含まれる。
これらの系の「調節領域」或いは「制御配列」は、転写及び翻訳を実行するた
めに宿主細胞のタンパク質と相互作用するベクターの非翻訳領域、即ちエンハン
サー、プロモーター及び3’非翻訳領域である。このようなエレメントの、強さ
及び特異性は様々であり得る。利用されるベクター及び宿主に応じて、構成的及
び誘導的プロモーターを含む任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントを用いる
ことができる。例えば、細
(Stratagene,LaJolla CA)のハイブリッドlacZプロモーター及びptrp-lacハイ
ブリッド等のような誘導的プロモーターを用いることができる。バキュロウイル
スポリヘドリンプロモーターは昆虫細胞において用いることができる。植物細胞
のゲノムに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例えば熱ショック遺伝子,R
UBISCO及び貯蔵タンパク質
遺伝子)、若しくは植物ウイルスに由来するプロモーター或いはエンハンサ(例
えばウイルス性プロモータ或いはリーダー配列)を、ベクターにクローン化して
もよい。哺乳動物細胞では、哺乳類遺伝子或いは哺乳類ウイルス由来のプロモー
ターが最適である。HUMAGOをコードする配列の多数の複製を含む株細胞を
作る必要がある場合には、SV40或いはEBVに基づくベクターを適切な選択マーカ
ーと共に用いる。
細菌系では、HUMAGOの用途に応じて多数の発現ベクターを選択すること
ができる。例えば抗体誘発のために大量のHUMAGOが必要とされる場合は、
容易に精製される融合タンパク質を高レベルで発現できるベクターが望ましい。
そのようなベクターには、以下のものに限定はしないが、多機能の大腸菌クロー
ニング・発現ベクター、例えば
ドする配列を、アミノ末端メチオニン及び後続のβ−ガラクトシダーゼの7残基
の配列を備えたフレーム内においてベクターに結合してハイブリッドタンパク質
を生成できる)や、pINベクター(Van Heeke,G.及びS.M.Schuster(1989)J.Bio
l.Chem.264:5503-5509)等が含まれる。またpGEXベクター(Promage、Madison W
I)も、グルタチオンS−トランスファーゼ(GST)を有する融合タンパク質とし
て異種ポリペプチドを発現するため用いることができる。一般に、そのような融
合タンパク質は可溶性であり、グルタチオンアガロースビーズへ吸着させた後、
遊離グルタチオンの存在下で溶出させることにより溶解した細胞から容易に精製
できる。その系において生成されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン或いは
XA因子プロテアーゼ切断部位を含めて、目的のクローン化ポリペプチドをGST
部分から随意に放出させることができるように設計される。
酵母菌、サッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)で
は、α因子、アルコールオキシダーゼ及びPGHのような構成的或いは誘導的プロ
モーターを含む多数のベクターを用いることができる。その概要を知るには、Au
subel等(前出)及びGrant等(1987)Methods Enzymol 153:516-544を参照され
たい。
植物発現ベクターを用いる場合には、HUMAGOをコードする配列の発現は
、多数のプロモーターの何れかで促進される。例えばCaMVの35S及び19Sプロモー
ターのようなウイルスのプロモーターを、単独で、或いはTMV(Takamatsu,N.等
(1987)EMBO J 6:307-311)由来のオメガリーダー配列と共に用いることができ
る。別法として、RUBISCOの小サブユニット、或いは熱ショックプロモーターの
ような植物プロモーターが用いてもよい(Coruzzi,G.等(1984)EMBO J 3:1671-
1680);Broglie,R.等(1984)Science 224:838-843;及びWinter,J.等(1991)Re
sults Probl.Cell Dlffer.17:85-105)。これらの構成は、直接のDNA形質転
換或いは病原体によるトランスフェクションにより植物細胞内に導入できる。こ
のような技術の種々の一般に入手可能な文献に記載されている(Hobbs,S.又はMur
ry,L.E.McGraw Hill Yearbook of Science and Technology(1992)McGraw Hill
NY,pp191-196を参照されたい)。
HUMAGOの発現のために用いることができる別の発現系は昆虫系である。
そのような系の一つでは、Spodoptera frugiperda細胞或いはTrichopDlusiaの幼
虫において外来遺伝子を発現するためのベクターとして、Autographa californi ca
核多角体病ウイルス(AcNPV)が用いられる。HUMAGOをコードする配列
は、ポリヘドリン遺伝子のようなウイルスの非必須領域にクローニングされ、ポ
リヘドリンプロモーターの制御下に置かれ得る。HUMAGOコーディング配列
の挿入が成功すると、ポリヘドリン遺伝子が不活性になり、コートタンパク質膜
が欠如した変異体ウイルスが生成される。次に、この変異体ウイルスを用いて、
S.frugiperda細胞或いはTrichoplusiaの幼虫へ感染させ、その中でHUMAGO
が発現される(Engelhard,E.K.等(1994)Proc Nat Acad Sci 91:3224-3227)。
哺乳類宿主細胞では、多数のウイルス性発現系を利用することができる。発現
ベクターとしてアデノウイルスが用いられる場合には、HUMAGOをコードす
る配列は、後期プロモータ及び三連リーダー配列からなるアデノウイルス転写物
/翻訳物複合体内に結合され得る。ウイルスのゲノムの非必須E1又はE3領域へ挿
入することにより、感染した宿主細胞でHUMAGOを発現できる生ウイルスに
なる(Logan,J.及びShenk,T.(1984)Proc Nat Acad Sci 81:3655-3659)。さら
に、哺乳類宿主細胞内の発現を増加させるためにラウス肉腫ウイルス(RSV)エ
ンハンサのような転写エンハンサを用いることができる。
また、HUMAGO配列の効率的な翻訳のためには、特定の開始シグナルも必
要である。これらのシグナルには、ATG開始コドン及び隣接する配列が含まれる
。HUMAGO及びその開始コドン及び上流配列が適切な発現ベクター内に挿入
される場合には、翻訳制御シグナルを加える必要はない。しかしながらコーディ
ング配列又はその一部のみが挿入される場合には、ATG開始コドンを含む外来の
翻訳制御シグナルを与えなければならない。さらに、全インサートの転写が確実
に行われるようにするために、開始コドンは正しい読み枠に存在しなければなら
ない。外来転写エレメント及び開始コドンは、自然及び合成両方の様々な起源に
由来するものであり得る。発現の効率は、その細胞系に適切なエンハンサーを含
めることにより高めることができる(Scharf,D.等(1994)Results Probl Cell
Differ 20:125-162)。
さらに宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節したり、発現したタンパク
質を望ましい形にプロセシングする能力で選択される。このよ
うなポリペプチドの修飾には、以下のものに限定はしないが、アセチル化、カル
ボキシル化、グリコシル化、リン酸化、脂質化(lipidation)並びにアシル化が
含まれる。またタンパク質の「プレプロ」部分を切り離す翻訳後プロセシングも
、正しい挿入、折り畳み、及び/又は機能の発揮のために重要である。CHO、HeL
a、MDCK、293、WI38等のような異なる宿主細胞は、そのような翻訳後の活動のた
めの特定の細胞装置及び特徴的な機構を有しており、導入される異種タンパク質
の修飾やプロセシングが確実に行われるように選択され得る。
長期間にわたって変異体タンパク質の高収率の産生を確保するためには安定し
た発現が望ましい。例えば、ウイルスの複製起源や内在性発現エレメント及び選
択マーカー遺伝子を含む発現ベクターを用いて、HUMAGOを安定的に発現す
る株細胞を形質転換し得る。ベクターの導入の後、細胞を、選択培地に切り替え
る前に濃縮培地内で1〜2日間増殖させる。選択マーカーの目的は、選択のため
の耐性を与え、その存在によって導入された配列をうまく発現する細胞を増殖、
回収できるようにすることである。安定的に形質転換された細胞の耐性凝集塊は
、その細胞型に適した組織培養技術を用いて増殖することができる。
形質転換された株細胞を回収するために任意の数の選択系を用いることができ
る。選択系には、以下のものに限定はしないが、単純ヘルペスウイルスチミジン
キナーゼ(tk)(Wigler,M.等(1977)Cell 11:223-32)及びアデニンホスホリ
ボシルトランスフェラーゼ(aprt)(Lowy,I.等(1980)Cell 22:817-23)遺伝子
が含まれ、それぞれtk及びaprt細胞において用いられる。また代謝拮抗物質、抗
生物質或いは除草剤への耐性を選択の基礎として用いることができる。例えばdh
frはメトトレキセートに対する耐性を与え(Wigler,M.等(1980)Natl Acad Sci 77
:3567)、nptはアミノ配糖体のネオマイシン及びG-418に対する耐性を与え
(Colberre-Garapin,F.等(1981)J Mol Biol 150:1)、als或いはpatはクロル
スルフロン(chlorsulfuron)、ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラー
ゼ(phosphinotricin acetyltransferase)に対する耐性を与える(Murry,前出
)。さらに選択に利用できる遺伝子として、例えば細胞がトリプトファンの代わ
りにインドールを利用できるようにするtrpB、細胞がヒスチジンの代わりにヒス
チノール(histinol)を利用できるようにするhisDが文献に記載されている(Ha
rtman,S.C.及びR.C.Mulligan(1988)Proc Nalt Acad Sci 85:8047-51)。最近
になって、形質転換体を特定するためばかりではなく、特定ベクター系による一
過性の或いは安定的なタンパク質発現の量を定量するために広く用いられる、例
えばアントシアニン、β−グルクロニダーゼ及びその基質、GUS、及びルシフェ
ラーゼ及びその基質、ルシフェリンのような可視マーカーがよく利用されるよう
になった(Rhodes,C.A.等(1995)Methods Mol.Biol.55:121-131)。
マーカー遺伝子発現の存在/不存在によって目的の遺伝子の存在も示されるが
、その存在及び発現は確認すべきである。例えばHUMAGOをコードする配列
がマーカー遺伝子配列内に挿入された場合は、HUMAGOをコードする配列を
含む組換え体細胞をマーカー遺伝子の機能の存在により確認できる。別法では、
マーカー遺伝子をHUMAGOをコードする配列と直列に配置して、両者が単一
プロモータの制御下となるようにすることができる。誘導に応じてのマーカー遺
伝子の発現、つまり選択は、通常直列に配置された配列の発現をも同時に示すこ
とになる。
この他当業者には周知の様々な方法により、HUMAGOのコーディング配列
を含みHUMAGOを発現する宿主細胞を識別できる。このような方法には、以
下のものに限定はしないが、DNA-DNA或いはDNA-RNAハイブリダイゼーション及び
、核酸及びタンパク質を検出及び/又
は定量するための膜ベース、溶液ベース或いはチップベースの技術を含むタンパ
ク質バイオアッセイ或いはイムノアッセイが含まれる。
HUMAGOをコードする配列のプローブ、一部、或いは断片を用いるDNA-DN
A又はDNA-RNAハイブリダイゼーション若しくは増幅により、HUMAGOポリヌ
クレオチド配列の存在を検出することができる。核酸増幅に基づくアッセイでは
、HUMAGOをコードするDNA或いはRNAを含む形質転換体を検出するために、
核酸配列に基づくオリゴヌクレオチド或いはオリゴマーを用いる。本明細書にお
いて「オリゴヌクレオチド」或いは「オリゴマー」とは、プローブ或いは、PC
Rで増幅されるセグメントであるアンプリマーとして用いることができる核酸配
列であって、長さが約10ヌクレオチド以上、最大60ヌクレオチド程度、好適
には15〜30ヌクレオチド、より好適には20〜25ヌクレオチドであるもの
を指す。
このタンパク質に特異的なポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体のいず
れかを用いてHUMAGOポリペプチドの発現を検出し、測定するための種々の
プロトコルが当業者には周知である。このようなプロトコルの例には、酵素結合
免疫検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)及び蛍光表示式細胞分取器
法(FACS)を含まれる。HUMAGOポリペプチド上で2つの非干渉なエピトー
プに対して反応するモノクローナル抗体を利用する二部位モノクローナルベース
イムノアッセイ(two-site,monoclonal-based immunoassay)が好適であるが、
競合的結合アッセイも用いられる。これらアッセイの並びに他のアッセイは、他
の文献、Hampton,R.等(1990;Serologivcal Methods,a Laboratory Manual,APS
Press,St Paul MN)及びMaddox,D.E.等(1983,J.Exp.Med.158:1211-1216)に記
載されている。
さらに多くの標識及び結合技術が当業者には周知であり、種々の核酸
及びアミノ酸のアッセイにおいて用いることができる。近縁な配列を検出するた
めの、標識されたハイブリダイゼーションプローブやPCRプローブを作成する
ための手段には、オリゴ標識、ニックトランスレーション法、末端標識、或いは
標識ヌクレオチドを用いるPCR増幅などが含まれる。別法としては、HUMA
GOコーディング配列、或いはその任意の部分を、mRNAプローブの作成のた
めのベクターにクローン化する。そのようなベクターは当分野では周知で、市販
されており、例えばT7、T3、或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼ及び
標識されたヌクレオチドを加えることにより、in vitroでRNAプローブを合成
するために用いることができる。これらの方法は、種々の市販のキット(Pharma
cia Upjohn(Kalamazoo,MI);Promega(MadisonWI);US Biochemical Corp(Cleve
land OH))を用いて実行することができる。適切なリポーター分子、すなわち
標識には、放射性核種、酵素、フルオレセント(蛍光剤)、化学発光剤或いは色
素剤や、基質、補助因子、インヒビター、磁気粒子等が含まれる。
HUMAGOをコードするヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞を、コ
ードされたタンパク質を細胞培地で発現させ、そこから回収するのに適した条件
下で培養することができる。組換え体細胞により生成されるタンパク質は、用い
られる配列及び/またはベクターに応じて、細胞内に分泌、つまり細胞内に含ま
れるようにすることができる。当業者には理解されるように、HUMAGOをコ
ードするポリヌクレオチドを含む発現ベクターを、原核細胞か真核細胞の細胞膜
を通してのHUMAGO分泌を誘導するシグナル配列を含むように設計すること
ができる。他の組換え体作製物では、HUMAGOをコードする配列を、可溶性
タンパク質の精製を容易にするポリペプチドドメインをコードするヌクレオチド
配列に結合することができる。そのような精製を容易にするドメ
インには、以下のものに限定はしないが、固定化金属上での精製を可能にするヒ
スチジントリプトファンモジュールのような金属キレートペプチド、固定化免疫
グロブリン上での精製を可能にするプロテインAドメイン、並びにFLAGS伸長/
アフィニティ精製システムにおいて用いられるドメイン(Immunex、Seattle WA
)が含まれる。精製ドメインとHUMAGOの間にXA因子或いはエンテロキナ
ーゼ(Invitrogen,San Diego CA)に対して特異的な配列のような切断可能なリ
ンカー配列を含めるのは精製を促進するのに役立つ。HUMAGOをコードする
配列とともに、6個のヒスチジン残基、それに続くチオレドキシン及びエンテロ
キナーゼ切断部位をコードする核酸配列を含むこのような発現ベクターの1つは
、融合タンパク質を発現する。ヒスチジン残基がIMIAC(Porath,J等(1992;Prot
ein Exp.Purif.3:263-281)に記載のような固定化金属イオンアフィニティクロ
マトグラフィー)精製を促進するとともに、エンテロキナーゼ切断部位が融合タ
ンパク質からのHUMAGOの精製のための手段となる。融合タンパク質を含む
ベクターについての解説は、Kroll,D.J.等(1993;DNA Cell Biol 12:441-453)
に記載されている。
組換え体の産生に加えて、HUMAGOの断片を、固層技術を用いた直接のペ
プチド合成で形成することもできる(Merrifield J.(1963)J.Am.Chem.Soc.85:21
49-2154参照)。in vitroタンパク質合成は手作業で行えるが、自動化すること
もできる。自動的な合成は、例えば、Applied Biosystem 431Aペプチドシンセサ
イザ(Perkin Elmer)を用いて行うことができる。HUMAGOの種々の断片を
個別に化学的に合成し、化学的方法を用いて結合して完全長分子を作り出しても
よい。
治療
HUMAGOとキイロショウジョウバエマゴナシの間の化学的及び構造的相同
性、及び胎児及び癌性組織におけるHUMAGOの発現に基づき、HUMAGO
は癌及び発達障害と関連を有すると考えられる。
キイロショウジョウバエマゴナシタンパク質のように、HUMAGOは例えば
体制プランの編成や胚細胞の突然変異のような重要な発生上の変化を刺激し得る
。従って、或る実施例では、以下に限定されないが、不完全な器官の発達、精神
発達遅滞、不妊症、脊椎披裂、免疫不全疾患、小人症、神経管奇形、多発性関節
拘縮、及び筋骨格奇形を含む発達障害の治療のために、HUMAGO又はその断
片若しくは誘導体を患者に投与し得る。
別の実施例では、上述の発達障害の治療のために、HUMAGOのアゴニスト
を患者に投与することもできる。
別の実施例では、上述の発達障害の治療のために、HUMAGO又はその断片
若しくは誘導体を発現し得るベクターを患者に投与し得る。
HUMAGOのアンタゴニスト又はインヒビターを用いて、過剰な細胞増殖を
抑制することができる。或る実施例では、以下に限定されないが、前立腺、精巣
、陰茎、傍神経節、肺、膵臓、及び脳の癌を含む癌の治療又は予防のために、H
UMAGOのアンタゴニスト又はインヒビターを患者に投与し得る。
或る態様では、HUMAGOに特異的な抗体を、アンタゴニストとして直接的
に用いたり、或いはHUMAGOを発現する細胞又は組織へ薬物を送達するため
のターゲティング又はデリバリー機構として間接的に用いることができる。
別の実施例では、限定されないが、上述の癌を含む癌の治療又は予防のために
、HUMAGOをコードするポリヌクレオチドのアンチセンスを発現するベクタ
ーを患者に投与し得る。
別の実施例では、上述の治療用タンパク質、アンタゴニスト、抗体、アゴニス
ト、アンチセンス配列又はベクターの何れかを他の適切な治療薬と組み合わせて
投与し得る。当業者であれば、併用療法において使用するために適切な薬剤を、
従来の薬学の原理に基づいて選択することができよう。治療薬を組み合わせるこ
とにより、上述の種々の疾患の治療又は予防についての相乗作用を与え得る。こ
の方法を用いることにより、より低い投与量の各薬剤で同じ治療効果を上げるこ
とができ、これにより副作用を低下させることができる。
HUMAGOのアンタゴニスト又はインヒビターは、周知の方法を用いて製造
することができる。詳述すると、精製されたHUMAGOを用いて、抗体を製造
したり、或いは薬物のライブラリーからHUMAGOに特異的に結合するものを
選別することができる。
抗体は、当業者に周知の方法によって生成することができる。このような抗体
には、限定はしないが、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体
、一本鎖、Fabフラグメント、及びFab発現ライブラリーにより生成されるフラグ
メントが含まれる。中和抗体(すなわち二量体形成を阻害する抗体)は、治療的
使用のために特に好適である。
抗体を産生するため、HUMAGO或いは免疫学的特性を保持するその任意の
一部、断片或いはオリゴペプチドを注射することによって、ヤギ、ウサギ、ラッ
ト、マウス等を含む種々の宿主を免疫することができる。宿主の種に応じて、種
々のアジュバントを免疫学的反応を増強するために用いることができる。そのよ
うなアジュバントには、以下のものに限定はしないが、フロイントのアジュバン
ト、水酸化アルミニウムのような無機質ゲルアジュバント、リゾレシチンのよう
な界面活性物質アジュバント、プルロニックポリオールアジュバント、ポリアニ
オンアジュバント、ペプチドアジュバント、油性乳剤アジュバント、キーホール
リンペットヘモシニアンアジュバント並びにジニトロフェノールアジュバントが
含まれる。BCG(カルメット-ゲラン杆菌)及びコリネバクテリウム−パルヴ
ム(Corynebacterium parvum)は有用なヒトアジュバントである。
好ましくは、HUMAGOに対する特異的抗体を誘発するために用いられるペ
プチドは、5個以上のアミノ酸、より好ましくは10個以上のアミノ酸からなる
アミノ酸配列を有し得る。また好ましくは、これらの配列は、自然タンパク質の
アミノ酸配列の一部と同一であり、小形の自然発生の分子の全アミノ酸配列を含
んでいてもよい。HUMAGOアミノ酸の短いストレッチを、キーホールリンペ
ットヘモシアニン及びキメラ分子に対して産生された抗体のような他のタンパク
質の配列に融合してもよい。
HUMAGOのモノクローナル抗体は、培地内の連続株細胞によって抗体分子
を産生する任意の技術を用いて調製できる。このような技術には、以下のものに
限定はしないが、ハイブリドーマ技術、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術、及びE
BV−ハイブリドーマ技術(Koehler,G.等(1975)Nature 256:495-497;Kozbor,D
.等(1983)Immunol Today 4:72:Cote,R.J.等(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.80:2026-
2030:Cote,S.P.等(1985)Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R Li
ss Inc,pp77-96)が含まれる。
さらに、適切な抗原特異性並びに生物活性を有する分子を得るための「キメラ
抗体」の産生、即ちヒト抗体遺伝子へのマウス抗体遺伝子の結合のために開発さ
れた技術が用いられる(Morrison,S.L.等(1984)Proc Natl Acad Sci 81:6851-68
55;Neuberger,M.S.等(1984)Nature 312:604-608;Takeda,S.等(1985)Natur
e 314:452-454)。別法として、一本鎖抗体の生成のための周知技術を適用して
、HUMAGO特異
的一本鎖抗体を作り出すことができる。近縁な特異性を有するが、イディオタイ
プの構成が異なる抗体は、無作為の免疫グロブリン組み合わせライブラリーから
の鎖再編成(chain shuming)により生成することができる(Burton D.R.(1991)
Proc.Natl.Acad.Sci.88:11120-3)。
また抗体は、リンパ球集団でのin vivo産生を誘導することにより、或いは文
献(Orlandi等(1989),Proc.Natl.Acad.Sci.86:3833-3837;Winter,G.等1991,Natu
re349:293-299)に開示されているような高度に特異的な結合試薬のパネルや組
換え免疫グロブリンライブラリーをスクリーニングすることによっても生成する
ことができる。
HUMAGOに対する特異結合部位を含む抗体フラグメントも生成することが
できる。このようなフラグメントには例えば、限定はしないが、抗体分子のペプ
シンによる消化で生成することができるF(ab')2フラグメントや、F(ab')2フラグ
メントのジスルフィド架橋を減らすことにより生成することができるFabフラグ
メントが含まれる。別法として、所望の特異性を有するモノクローナルFabフラ
グメントを迅速かつ容易に同定できるように、Fab発現ライブラリーを作製して
もよい(Huse,W.D.等(1989)Science 256:1275-1281)。
所望の特異性を有する抗体を同定するための選別のために種々のイムノアッセ
イを利用することができる。確立された特異性を有するモノクローナル抗体或い
はポリクローナル抗体のいずれかを用いる競合的結合アッセイ或いは免疫放射線
測定法の種々のプロトコルが当分野ではよく知られている。このようなイムノア
ッセイでは、HUMAGOとその特異的抗体との複合体の形成、並びに複合体形
成の測定が行われる。特定のHUMAGOタンパク質上の2つの互いに非干渉な
エピトープに対して反応するモノクローナル抗体を用いる二部位モノクローナル
ベースイムノアッセイが好適であるが、競合的結合アッセイも用いられる
(Maddox(1983),前出)。
本発明の別の実施例では、HUMAGOをコードするポリヌクレオチド、または
その任意の断片やアンチセンス配列を、治療目的で用いることができる。或る態
様では、このタンパク質の合成を阻害することが望ましいような状況において、
HUMAGOをコードするポリヌクレオチドに対するアンチセンスを用いること
ができる。詳述すると、HUMAGOをコードするポリヌクレオチドに対するア
ンチセンス配列で細胞を形質転換することができる。従って、アンチセンス配列
を用いて、HUMAGO関連の組織損傷を予防したり、遺伝子機能の調節を達成
することができる。このような技術は現在周知となっており、センス又はアンチ
センスオリゴマー、若しくはより大きな断片を、HUMAGOコーディング配列
のコード領域や調節領域の種々の位置から設計することができる。
レトロウイルス、アデノウイルス、ヘルペス或いはワクシニアウイルスに由来
する発現ベクター、或いは種々の細菌性プラスミドに由来する発現ベクターは、
標的の器官、組織、または細胞群へのヌクレオチド配列の送達のために用いられ
る。当業者によく知られた方法を用いて、HUMAGOをコードする配列のアン
チセンスを発現する組換えベクターを作り出すことができる。これらの技術はSa
mbrook等(上記)及びAusubel等(上記)に記載されている。
所望のHUMAGO断片を高レベルで発現する発現ベクターを細胞または組織
にトランスフェクトすることにより、HUMAGOをコードする遺伝子の機能を
停止させることができる。このような作製物は、翻訳不可能なセンス配列或いは
アンチセンス配列で細胞に導入するために用いることができいる。このようなベ
クターは、DNAへ組み込まれない場合ですら、全ての複製物が内在性ヌクレア
ーゼにより分解されるまで、
RNA分子を転写し続ける。このような一過性の発現は、非複製ベクターでも1
ヶ月以上、適当な複製エレメントがベクター系の一部である場合には更に長い期
間継続し得る。
上述のように、HUMAGOをコードする配列の制御領域、即ちプロモータ、
エンハンサ或いはイントロンに対するアンチセンス分子、DNA、RNAまたは
PNAを設計することにより遺伝子発現を改変することができる。転写開始部位
、例えばリーダー配列の+10〜−10領域の間に由来するオリゴヌクレオチド
が好適である。また、転写産物がリボソームへの結合するのを防止することによ
りmRNAの翻訳を阻止するアンチセンス分子も設計される。同様に、「三重ら
せん」塩基対合法を用いて阻害を達成することができる。三重らせん対合は、二
重らせんが十分にほどけないことでポリメラーゼ、転写因子、或いは調節分子が
結合できないようにする。三重らせんDNAを用いた最近の治療法は、文献(Ge
e,J.E.等(1994)於Huber,B.E.及びB.I.Carr,Molecular and Immunologic Approac hes
,Futura Publishing Co,MtKisco NY)に記載されている。
リボザイムはRNAの特異的切断を触媒することができる酵素性RNA分子で
ある。リボザイムの作用機序では、相補的標的RNAへのリボザイム分子の配列
特異的ハイブリダイゼーションが行われ、その後エンドヌクレアーゼによる切断
(endonucleolytic cleavage)がなされる。発明の範囲内には、HUMAGOの
エンドヌクレアーゼによる切断を特異的かつ効果的に触媒し得る人工合成のハン
マーヘッド型リボザイム分子も含まれている。
任意のRNA標的可能部分内の特異的なリボザイム切断部位を、初めに、配列
GUA、GUU並びにGUCが後続するリボザイム切断部位に対する標的分子を調べるこ
とによって同定する。一度同定されると、切断
部位を含む標的遺伝子の領域に対応する15〜20個のリボヌクレオチドの間の
短いRNA配列を、そのオリゴヌクレオチドの機能を停止させる2次構造の特徴
について評価することが可能となる。候補の標的部分の適切性も、リボヌクレア
ーゼ保護アッセイを用いて相補的なオリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成に
対する接触性をアッセイすることにより評価することができる。
本発明のアンチセンス分子及びリボザイムは、RNA分子を合成するのための
当分野で周知の方法により調製することができる。これらの技術には、固相ホス
ホラミダイト(phosphoramidite)化学合成のようなオリゴヌクレオチドの化学
的合成技術が含まれる。この他、RNA分子を、HUMAGOをコードするDN
A配列のin vivo及びin vitro転写により生成することができる。このようなD
NA配列は、T7或いはSP6のような適切なRNAポリメラーゼプロモーター
を有する多種のベクターに組み込むことができる。更に別の方法として、構成的
に或いは誘導的にアンチセンスRNAを合成するアンチセンスcDNA作成物を
、株細胞、細胞或いは組織内に導入することができる。
RNA分子は細胞内安定性を高め及び半減期を長くするために修飾することが
できる。可能な修飾には、限定はしないが、その分子の5’末端か3’末端、或
いはその両方へのフランキング配列の付加や、分子のバックボーン内においてホ
スホジエステラーゼ結合ではなくホスホロチオネート(phosphorothioate)或い
は2’O−メチルを使用することが含まれる。このコンセプトは、PNA生成固
有のものであり、内在性エンドヌクレアーゼにより容易に認識されないアデニン
、グアニン、シチジン、チミン、及びウリジンの、アセチル−、メチル−、チオ
−形態、及び類似の改変形態とともに、イノシン、キュエオシン(queosine)、
及びワイブトシン(Wybutosine)のような従来あまり用いられなかった
塩基を含めることによって、これら全ての分子に拡張することができる。
細胞或いは組織内にベクターを導入するための方法には、上述の方法が含まれ
、これらの方法は、in vivo、in vitro、及びex vivoの使用に対しても同様に適
切なものである。ex vivo治療法の場合には、患者から採取された幹細胞にベク
ターを導入し、自家移植用のクローンとして増殖して同じ患者に戻す方法がある
。またトランスフェクションによるデリバリー、リポソームによるデリバリーは
、当分野でよく知られている。
上述の治療法の任意のものは、例えばイヌ、ネコ、ウシ、ウマ、ウサギ、サル
、及び最も好ましくはヒトのような哺乳類を含む、任意の適切な被験体に適用す
ることができる。
本発明の更に別の実施例は、上述の治療効果のいずれかを発揮させるべく、薬
学的に許容される担体とともに医薬品組成物を投与することに関連する。このよ
うな医薬品組成物は、HUMAGO、HUMAGOに対する抗体、HUMAGO
の擬似物、アゴニスト、アンタゴニスト、又はインヒビターからなるものであり
得る。この医薬品組成物は、単体で、或いは例えば安定剤のような1種以上の他
の薬剤と組み合わせて、任意の無菌の生体適合性製薬用担体に含めて投与される
。このような担体には、限定はしないが、生理食塩水、緩衝食塩水、ブドウ糖或
いは水が含まれる。これらの分子は、患者に対して、単体で、或いは他の薬品や
ホルモンと組み合わせて投与され得る。
本発明で用いられる医薬品組成物の投与経路には、以下の経路に限定されない
が、経口投与、静脈内投与、筋肉内投与、動脈内投与、髄内投与、くも膜下内投
与、心室内投与、経皮投与、皮下投与、腹腔内投与、鼻腔内投与、経腸投与、局
所投与、舌下投与、或いは直腸内投与が含まれ得る。
活性成分に加えて、これらの薬品組成物は、薬学的に用いられ得る調
合物内への活性化合物の処理を容易にする賦形剤及び補助剤を含む適切な製薬学
的に許容される担体を含み得る。調合或いは投与に関する技術の詳細は、“Remi
ngton's Pharmaceutical Sciences”(Maack Publishing Co,Easton PA)の最新版
において見ることができる。
経口投与用の医薬品組成物は、当分野でよく知られる製薬学的に許容される担
体を用いて適切な剤形に製剤される。このような担体により、薬品組成物は、治
療を受ける患者による経口及び鼻腔摂取のための、錠剤、丸剤、カプセル剤、液
体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁液或いは類似の製剤として処方さ
れる。
経口投与するための医薬品調製物は、活性化合物と固形の賦形剤とを結合する
ことによって得ることができるが、所望に応じて、必要なら適切な補助剤を添加
した後、得られた混合物を粉砕し、顆粒の混合物を処理して、錠剤或いは糖衣剤
核を得ることができる。適切な賦形剤は、ラクトース、スクロース、マンニトー
ル或いはソルビトールを含む砂糖のような糖質或いはタンパク質充填剤、とうも
ろこし、小麦、米、じゃがいも等からのでんぷん、メチルセルロース、ヒドロキ
シプロピルメチルセルロース或いはカルボキシルメチルセルロースナトリウムの
ようなセルロース、アラビアゴム或いはトラガカントのようなゴム、並びにゼラ
チン或いはコラーゲンのようなタンパク質である。必要ならば、架橋結合したポ
リビニルピロリドン、寒天、アルギン酸ナトリウムのようなアルギン酸或いはア
ルギン酸ナトリウムや、その塩のような、崩壊剤或いは可溶化剤が加えられる。
糖衣剤核は、濃縮砂糖溶液のような適切な錠皮を与えられるが、溶液はアラビ
アゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポルゲル剤、ポリエチレングリ
コール並びにまた二酸化チタン、ラッカー溶液及び適切な有機溶剤或いは溶剤混
合物が含み得る。錠剤の識別のため、すなわ
ち活性化合物の量、すなわち投与量を特徴付けるために染料或いは色素が錠剤或
いは糖衣錠皮に加えられてもよい。
経口投与可能な製剤は、ゼラチンからなるプッシュフィットカプセル及びゼラ
チンからなる柔らかい、密封されたカプセル、並びにグリセロール或いはソルビ
トールのような錠皮を含む。プッシュフィットカプセルは、ラクトース或いはで
んぷんのような充填剤或いは結合剤、タルク或いはステアリン酸マグネシウムの
ような潤滑剤、並びに付加的には安定剤と混合された活性処方組成物を含み得る
。柔らかいカプセルでは、活性化合物は、安定剤があるなしにかかわらず、脂肪
油、液体パラフィン、液体ポリエチレングリコールのような適切な液体に溶解或
いは懸濁される。
非経口投与用の製剤は、水溶性の活性化合物の水溶液を含む。注射用として、
本発明の薬品組成物を水溶液、好適にはハンクの溶液、リンゲル溶液或いは生理
緩衝食塩水のような生理学的に適台性の緩衝液に入れて製剤することができる。
水性の注入懸濁剤は、カルボキシルメチルセルロースナトリウム、ソルビトール
或いはデキストランのような懸濁剤の粘性を高める物質を含み得る。更に、活性
成分の懸濁液は、適切な油性注入懸濁剤として調製される。適切な親油性の溶媒
或いは媒介物は、胡麻油のような脂肪油や、オレイン酸エチル、トリグリセリド
或いはリポソームのような合成脂肪酸エステルを含む。また懸濁剤は、所望に応
じて、それにより溶解度を増加し、非常に濃縮された溶液の調製ができるように
なる適切な安定剤或いは薬剤を含んでもよい。
局所的投与または経鼻粘膜投与用には、浸透される特定の障壁に対して適切な
浸透剤を用いて調合が行われる。このような浸透剤は、一般に周知である。
本発明の薬品組成物は周知の方法、例えば従来の混合処理、溶解処理、
顆粒化処理、糖衣形成処理、研和処理、乳化処理、封入処理(entrapping)処理或
いは凍結乾燥処理により製造される。
この医薬品組成物は塩類として提供されることもあり、限定はしないが、塩酸
、硫酸、酢酸、乳酸、酒石酸、リンゴ酸、コハク酸等を含む、多くの酸とともに
形成することができる。塩は、対応する遊離塩基形態である水性或いはプロトニ
ック溶剤において、より可溶性が高くなる傾向がある。他の場合には、好適な製
剤は、1mM〜50mMのヒスチジン、0.1%〜2%のショ糖、使用前に緩衝
剤と結合させたpH範囲4.5〜5.5にある2%〜7%のマンニトールにおけ
る凍結乾燥粉末である。
製薬学的に許容される担体内に製剤された本発明の化合物を含む組成物は、調
製された後、適切な容器内に入れて、さらに提示した疾病状態の治療のためにラ
ベル付けすることができる。HUMAGOの投与の場合、このようなラベルには
、投与の量、頻度、方法が表示される。
本発明において使用するために適切な医薬品組成物は、活性成分を所望の目的
を達成するための有効量含む組成物である。有効量の決定は、当業者の能力の範
囲内で十分行うことができる。
任意の化合物について、治療的有効量は、初めに、新生物細胞、或いは通常マ
ウス、ウサギ、イヌ、ブタのような動物モデルの何れかの細胞培地のアッセイか
ら推定される。次いで、このような情報を用いて、ヒトにおける有効量や投与経
路を決定することができる。
治療的有効量とは、症状や状態を改善するタンパク質、その抗体、アンタゴニ
スト、またはインヒビターの量である。そのような化合物の毒性及び治療的有効
性は、例えばLD50(個体群の50%の致死投与量)及びED50(個体群の
50%における治療的有効量、50%有効量)を決定するための、細胞培地或い
は実験動物における標準的な製薬学的
方法により決定することができる。毒性と治療有効性との間の投与量比は治療指
数であり、LD50/ED50の比として表すことができる。大きな治療指数を
示す医薬品組成物が好ましい。これらの細胞培地のアッセイ及び付加的な動物研
究から得られるデータは、ヒトへの使用に対する投与量の範囲を決める際に用い
ることができる。そのような化合物の投与量は、毒性がほとんど或いは全くなく
、ED50を達成する循環濃度の範囲内にあることが望ましい。投与量は、用い
られる剤形、患者の感受性並びに投与経路に応じてこの範囲内で変化する。
正確な投与量は治療されるべき患者を考慮して個々の医師により選択される。
投与量及び投薬量は、十分なレベルの活性成分を与え、かつ所定の効果を維持す
るために調節される。考慮すべき付加的な要因は、疾患状態の重症度、または患
者の年齢、体重並びに性別、食事、投与の時間及び頻度、併用する薬剤、反応感
受性、並びに治療への耐性/反応を含む。長期的に作用する薬品組成物は3〜4
日毎に、1週間毎に、或いは半減期及び特定の処方のクリアランス速度に応じて
2週間に1度投与してもよい。
通常の投与量は0.1〜100,000μgの範囲にあって、全投与量は最大
約1gであり、投与経路に応じて変わってくる。特定の投与量或いは送達の方法
に関する手引きは、当分野の実施者が通常入手できる文献において見出すことが
できる。当業者なれば、ヌクレオチドに対しては、タンパク質やインヒビター用
の剤形とは異なる剤形を採用するであろう。同様に、ポリヌクレオチドまたはポ
リペプチドの送達方式は、特定の細胞、状態、位置等によって決まってくる。
診断
別の実施例において、HUMAGOに特異的な抗体は、HUMAGO
の発現を特徴とする状態や疾病の診断や、HUMAGOで治療を受けている患者
のモニタリングのためのアッセイにおいて役立つ。診断目的で有用な抗体は、上
述の治療用のものと同じように調製することができる。HUMAGOの診断的測
定法には、ヒトの体液、細胞或いは組織の抽出物においてHUMAGOを検出す
るために抗体或いは標識を利用する方法が含まれる。本発明のポリペプチド及び
抗体は、修飾したものでも、修飾なしでも用いることができ、共有結合、或いは
非共有結合かのいずれかでリポーター分子と結合することにより標識することが
できる。種々のリポーター分子が周知となっており、その幾つかについては上記
した。
例えばELISA(酵素結合免疫測定法)、RIA(ラジオイムノアッセイ)並びにFACS(
蛍光表示式細胞分取器法)を含む、HUMAGOを測定するための種々のプロト
コルが当分野では周知であり、これによってHUMAGO発現の変化や異常を診
断するための基礎が得られる。HUMAGOの発現の正常値、つまり標準値は、
哺乳類、好ましくはヒトの正常被験者から得られる体液或いは細胞抽出物とHU
MAGOに対する抗体とを、複合体形成に適した条件の下で結合することによっ
て得ることができる。標準の複合体形成量は、種々の方法、好ましくは測光手段
を用いることにより定量することができる。被験者、対照標準、及び生検組織か
らの患部組織サンプルにおいて発現されたHUMAGOの量を、標準値と比較す
る。標準値と被験者の値との偏差で、疾病診断のパラメータが確立される。
本発明の別の実施例では、HUMAGOをコードするポリヌクレオチドを、診
断目的で用いることができる。使用できるポリヌクレオチドには、オリゴヌクレ
オチド配列、アンチセンスRNA及びDNA分子、及びペプチド核酸(PNA)
が含まれる。このポリヌクレオチドは、HU
MAGOの発現が疾病と相関性を有する生検組織における遺伝子発現を検出し、
定量するために用いられる。診断的測定は、HUMAGOが存在、不存在、及び
過剰発現の何れの状態にあるかを区別したり、治療的介入の際にHUMAGOレ
ベルの調節をモニタリングするのに役立つ。
或る態様では、HUMAGOまたは近縁な分子をコードする、ゲノム配列を含
むポリヌクレオチド配列を検出できるハイブリダイゼーションプローブ或いはP
CRプローブを用いて、HUMAGOをコードする核酸配列を同定することがで
きる。そして、そのプローブの特異性、即ち、そのプローブが非常に高度な保存
領域(例えば5’調節領域における10個の独特のヌクレオチド)と、保存的で
ある度合いの低い領域(例えば特に3’領域におけるシステイン残基の間の領域
)の何れに由来するのかということ、及びハイブリダイゼーション或いは増幅の
(高い、中程度の或いは低い)厳密性によって、そのプローブが自然発生HUM
AGOのみを同定するものであるか、或いはアレル配列や近縁な配列も同定する
ものであるかということが決まってくる。
プローブは、近縁なインヒビターをコードする配列を検出するためにも用いる
ことができ、好ましくは、これらのHUMAGOをコードする任意の配列から得
られるヌクレオチドを少なくとも50%含むべきである。本発明のハイブリダイ
ゼーションプローブは、配列番号:2のヌクレオチド配列か、自然発生HUMA
GOのイントロン、プロモータ、及びエンハンサーエレメントを含むゲノムの配
列に由来するものであり得る。
HUMAGOをコードするDNAに対して特異的なハイブリダイゼーションプ
ローブの作製のための他の手段には、HUMAGOやHUMAGO誘導体をコー
ドする核酸配列を、mRNAプローブ生成のためのベクターにクローン化する方
法がある。このようなベクターは周知で市販
されており、適切なRNAポリメラーゼや適切な放射性標識ヌクレオチドを付加
することにより、in vitroでのRNAプローブを合成のために用いることができ
る。ハイブリダイゼーションプローブは種々のリポータ分子により標識すること
ができ、この標識には、32Pや35Sのような放射性核種、アビジン/ビオチン結
合系によりプローブに結合するアルカリホスフアターゼのような酵素標識等が含
まれる。
HUMAGOをコードするポリヌクレオチド配列を、HUMAGOの発現が関
係する状態又は疾病の診断のために用いることができる。このような状態又は疾
病の例には、前立腺、精巣、陰茎、傍神経節、肺、膵臓、及び脳の癌が含まれる
。HUMAGOをコードするポリヌクレオチド配列は、HUMAGO発現の変化
を検出するための生検組織や体液を試験するための、サザンブロット法或いはノ
ーザンブロット法、ドットブロット法或いは他の膜ベース技術、PCR技術、デ
ィップスティック試験法(試験紙法)、ピン或いはチップ技術及びELISAアッセ
イにおいて用いることができる。このような定性的或いは定量的試験方法は当分
野ではよく知られている。
特定の態様では、種々の癌、特に上述の癌の活性化または誘導を検出するアッ
セイにおいてHUMAGOをコードするヌクレオチド配列が役立ち得る。HUM
AGOをコードするヌクレオチド配列を標準的な方法で標識し、ハイブリダイゼ
ーション複合体の形成に適した条件の下で患者の体液や組織サンプルに加える。
適切なインキュベーション時間の経過後、このサンプルを洗浄しシグナルを定量
して、標準値を比較する。生検サンプルまたは抽出サンプルにおけるシグナルの
量が、比較できる対照サンプルのシグナル量と有意に異なっている場合、このヌ
クレオチド配列はサンプルのヌクレオチド配列とハイブリダイズしており、サン
プルにおけるHUMAGOをコードするヌクレオチド配列のレベルの変
化が存在することは、関連疾患の存在を示している。このようなアッセイは、動
物実験、臨床試験、または個々の患者の治療のモニタリングにおける特定の治療
措置の効果を評価するために用いることもできる。
HUMAGOの発現が関係する疾病の診断の基礎を得るために、正常な、或い
は標準の発現プロフィールを確立する。この標準プロフィールは、動物或いはヒ
ト何れかの正常な被験者から得られる体液或いは細胞抽出物を、ハイブリダイゼ
ーション或いは増幅に適切な条件下で、HUMAGOをコードする配列又はその
一部分と結合することにより確立される。標準のハイブリッド形成量は、既知の
量の実質的に精製されたHUMAGOが用いられる同一の実験で得られる値と、
正常被験者に対して得られる値とを比較することにより定量することができる。
正常なサンプルから得られた標準値は、疾病の症状を示す患者からのサンプルか
ら得られる値と比較することができる。標準値と被験者値との偏差を用いて疾病
の存在を確認する。
ひとたび疾患が確認され、治療プロトコルが開始されると、患者での発現レベ
ルが正常な患者において観察されるレベルに近づき始めたか否かを評価するため
に、このようなアッセイが定期的に繰り返される。継続的なアッセイから得られ
る結果を用いて、数日間或いは数ヶ月の期間にわたる治療効果を知ることができ
る。
癌については、患者の生検組織において転写物が比較的少ない量存在すること
が疾病の発生の素因を示し、つまり実際の臨床的症状が現れる前に疾病を検出す
る手段となり得る。この型の一層確定的な診断により、医療従事者が予防的処置
を講じたり、より早期に積極的な治療を開始することが可能となり、疾病の発生
や更なる進行を予防することができるようになり得る。
HUMAGOをコードするオリゴヌクレオチドの別の診断目的の使用
では、PCRを使用することがある。このようなオリゴマーは一般には化学的に
台成するが、酵素を用いて作製したり、或いは組換え体を起源として作り出すこ
ともできる。オリゴマーは、特定の遺伝子或いは状態を識別するために最適な条
件下で用いられる2つのヌクレオチド配列、即ちセンス方向(5’→3’)のヌ
クレオチド及びアンチセンス方向(3’←5’)のヌクレオチドからなる。同一
の2つのオリゴマー、入れ子オリゴマーの組、或いはオリゴマーの縮重プールで
さえ、近縁なDNAまたはRNA配列の検出や定量のためのより厳密性の低い条
件の下であっても用いることができる。
さらにHUMAGOの発現を定量するための方法には、放射性標識(radiolab
eling)或いはビオチン標識ヌクレオチドの利用、コントロールの核酸の同時増
幅(coamplification)の利用、並びに実験結果を補完して引かれた標準的なグ
ラフ曲線の利用も含まれる(Melby PC等1993 J Immunol Methods 159:235-44;D
uplaa C等1993 Anal Biochem 229-36)。多数のサンプルの定量は、ELISA形式の
連続アッセイを実行することにより一層迅速に行うことができる。このアッセイ
では目的のオリゴマーが様々な希釈溶液中に存在し、分光光度計を用いる分析或
いは比色分析反応により迅速に定量することができる。
本発明の別の実施例では、HUMAGOをコードする核酸配列を用いて、自然
発生のゲノム配列マッピングのためのハイブリダイゼーションプローブを生成す
ることができる。この配列を、よく知られた技術を用いて特定の染色体或いはそ
の染色体の特定領域に対してマッピングすることができる。このような技術には
、FISH、FACSや人工染色体作製物の使用、例えば酵母菌人工染色体、細菌性人工
染色体の細菌性P1作製物、Price,C.M.(1993;Blood Rev 7:127-34)及びTrask
,B.J.(1991;Trends Ganet 7:149-54)に概要が示されている単染色体cDN
Aライブラリーの使用が含まれる。
FISH(Verma等(1988)Human Chromosomes:A Manual of Basic Technique,Per
gamon Press,New York”に記載)は、他の染色体マッピング技術及び遺伝子地
図データと関係を有し得る。遺伝子地図データの例は、1994 Genome Issue of S
cience(265:1981f)に見ることができる。物理的染色体地図上でのHUMAGO
をコードする配列の位置と、特定の疾病(または特定の疾病の素因)との相関関
係を助けとして、ある遺伝病が関係するDNAの領域の限界決定ができる。本発
明のヌクレオチド配列を用いて、正常者とキャリアまたは患者との遺伝子配列の
違いを検出することができる。
染色体調製物のin situハイブリダイゼーション及び確定された染色体マーカ
ーを用いる連鎖解析のような物理的地図作成技術は、遺伝子地を延長するために
大変重要である。多くの場合、特定のヒト染色体の数或いは腕が未知であっても
、マウスのような別の哺乳類種の染色体上の遺伝子配置から、関連するマーカー
がわかる。新しい配列は、物理的マッピングにより染色体のアーム、或いはその
一部へ割当てることができる。これは位置クローニング或いは他の遺伝子発見技
術を用いて疾患遺伝子を調査する研究者に貴重な情報を提供する。ひとたび毛細
血管拡張性運動失調(AT)のような疾患或いは症候群が、特定のゲノム領域へ、
例えばATならば11q22-23(Gatti,R.A.等(1988)Nature 336:577-580)へ、遺伝子連
鎖によって粗い局所化がなされれば、その領域にマッピングされる任意の配列は
、さらなる研究のための関連する遺伝子、或いは調節遺伝子ということになる。
本発明のヌクレオチド配列は、正常者とキャリアまたは患者との間の、転座、逆
位等による染色体位置の違いを検出するために用いることもできる。
本発明の別の実施例では、HUMAGOや、その触媒作用性または免
疫原性フラグメント或いはオリゴペプチドを、種々の薬物スクリーニング技術に
おいて治療用化合物のスクリーニングのために用いることができる。そのような
試験において用いられるフラグメントは、溶液に遊離した形態か、固体支持体へ
付着したものか、細胞表面へ付着したものか、或いは細胞内に存在するものであ
り得る。HUMAGOと試験される薬剤との結合複合体形成が測定され得る。
HUMAGOポリペプチドへの適切な結合親和性を有する化合物の高スループ
ットスクリーニングのために用いることができる別の薬物スクリーニング技術が
、公開されたPCT出願WO84/03564に詳細に記載されている。この方法をHUMA
GOに適用する場合には、多数の異なる小形ペプチドの試験用化合物を、プラス
チックピン或いは他の表面のような固体基質上で合成する。ポリペプチド試験用
化合物をHUMAGO又はその断片と反応させ、洗浄する。次いで結合HUMA
GOを当分野で周知の方法により検出する。また、前述の薬物スクリーニング技
術において使用するために、精製HUMAGOをプレート上に直接コーティング
することもできる。この他、ペプチドを捕捉し固体支持体上にペプチドを固定す
るために非中和抗体を用いることができる。
別の実施例では、HUMAGOに結合し得る中和抗体が、HUMAGOとの結
合について試験化合物と特異的に競合する競合的薬物スクリーニングアッセイを
使用することができる。このように、抗体を用いて、1または2以上のHUMA
GOと共通のエピトープを有する任意のペプチドの存在を検出することができる
。
更に別の実施例では、ここに開示するHUMAGOをコードするヌクレオチド
配列は、その新技術が、以下に限らないが、例えばトリプレット遺伝暗号及び特
異的塩基対合相互作用のような特性を含む、現在周知のヌクレオチド配列の特性
に基づく技術であれば、まだ開発されていな
い分子生物学的技術においても用いることができる。
以下に示す本発明の実施例は、単なる例示であって、本発明をこの実施例に限
定しようとするものではない。実施例
1 PROSNOT01 cDNAライブラリーの作製
PROSNON01の規格化cDNAライブラリーを、自らに発砲することにより死亡
した年齢28歳の白人男性(specimen #RA95-09-0667;International Institute
for the Advancement of Medicine,Exton,PA)から得られた、顕微鏡検査で正
常な前立腺組織から作製した。この患者の病歴には、アルコール及びタバコの乱
用が含まれていた。
冷凍組織を、Brinkmann Homogenizer Polytron PT-3000(Brinkmann Instrume
nts,Westbury,NJ)を用いて、グアニジウムイソチオシアネート溶液の中でホモ
ジナイズし溶解した。この溶解産物を、Beckman L81-70M Ultracentrifugeにお
いてBeckman SW28 rotor(Beckman Instruments)を用いて、5.7Mの塩化セ
シウムクッションを通して、外界温度で18時間、25,000rpmで遠心分
離した。pH4.7の酸性フェノールを用いてRNAを抽出し、0.3Mの酢酸
ナトリウム及び2.5倍量のエタノールを用いて沈殿させ、無RNアーゼ水に再
懸濁し、37℃でDNアーゼ処理した。このRNAの抽出をpH4.7の酸性フ
ェノールを用いて反復し、前回と同様に酢酸ナトリウム及びエタノールで沈殿さ
せた。次にmRNAを、Qiagen Oligotex kit(QIAGEN,Inc.,Chatsworth,CA)を
用いて単離し、cDNAライブラリの作製に用いた。
このRNAは、SuperScript Plasmid System for cDNA Synthesis and Plasmi
d Cloning(Cat.#18248-013,Gibco/BRL)の推奨プロトコル
に従って取り扱った。cDNAはSepharose CL4Bカラム(Cat.#275105-01,Pharm
acia)で分画化し、400bpを越えるcDNAをpSportIにリゲートした。次
にこのプラスミドpSportIをDH5aTMコンピテント細胞(Cat.#18258-012,Gibco/BR
L)に入れて形質転換させた。
2 cDNAクローンの単離及び配列決定
プラスミドDNAは細胞から放出され、REAL Prep 96 Plasmid Kit for Rapid
Extraction Alkaline Lysis Plasmid Minipreps(Catalog #26173,QIAGEN,Inc.
)を用いて精製した。このキットは、マルチチャネル試薬ディスペンサーを用い
て96穴のブロックにおける96個のサンプルの同時精製が可能である。推奨プ
ロトコルを用いたが、以下の点を変更した。(1)25mg/Lのカルベニシリン及
び0.4%のグリセロールと共に1mlの滅菌Terrific Broth(Catalog#22711,Li
fe Technologies)において細菌を培養した。(2)植菌の後、培地を19時間
インキュベートし、インキュベーションの終わりに、細胞を0.3mlの溶解バ
ッファに溶解した。(3)イソプロパノール沈殿の後、プラスミドDNAペレッ
トを0.1mlの蒸留水に再懸濁した。プロトコルの最終ステップの後、サンプ
ルを96穴ブロックに移し4℃で保管した。
このcDNAの配列決定は、Peltler Thermal Cyclers(PTC200 from MJ Rese
arch,Watertown,MA)及びApplied Biosystems 377 DNA Sequencing Systemsと組
み合わせてHamilton Micro Lab 2200(Hamilton,Reno,NV)を用いてSangerらの
方法(1975,J.Mol.Biol.94:441f)により行い、読み枠を決定した。
3 cDNAクローン及びそれらの類推されるタンパク質の相同性検索
配列表のヌクレオチド配列及び、それらから類推されるアミノ酸配列を問い合
わせ配列として用いて、例えばGenBank、SwissProt、BLOCKS、
及びPima IIのようなデータベースを検索した。これらのデータベースには既に
同定された配列が注釈付きで含められており、BLAST(Basic Local Alignment T
oolを表す)を用いて相同性(類似性)を有する領域をこのデータベースのなか
から検索した(Altschul(1993)前出,Altschul(1990)前出)。
BLASTはヌクレオチド及びアミノ酸配列の両方のアライメントを生成して配列
類似性を決定する。そのアライメントの局所性のために、BLASTは厳密な一致、
すなわち原核生物(細菌)や真核生物(動物、菌類、又は植物)を起源とするホ
モログを求める際に特に有効である。一次配列パターンや二次構造ギャップペナ
ルティを処理する際には、本明細書に一体に引用されたSmith等(1992,Protein E ngineering
5:35-51)に記載のもののような他のアルゴリズムを用いることがで
きる。本明細書に開示された配列の長さは少なくとも49ヌクレオチドであり、不
必要な塩基は12%以下である(ここで、NはA、C、G、又はT以外と記録され
たものである)。
BLAST法は、本明細書に一体に引用されたKarlin等(前出)に詳細に記載され
ているように、問い合わせ配列とデータベースの配列の一致を検索する。BLAST
は発見したあらゆる配列の一致の統計的有意性を評価して、ユーザが選択した有
意性の閾値を満たす一致のみを報告する。本出願での閾値は、ヌクレオチドで1
0-25、ペプチドで10-14に設定した。
インサイト社のヌクレオチド配列を、霊長類(pri)、げっ歯類(rod)、及び
他の哺乳類配列(mam)のGenBankデータベースで検索した。次に同じクローンか
ら類推されたアミノ酸配列を、GenBankの機能性タンパク質データベース、哺乳
類(mamp)、脊椎動物(vrtp)、及び真核生物(eukp)で、相同性について検索
した。これらのデータベースは
特定の一致をGixxx±pという形式で報告した(ここでxxxはpri;rod等であり、存
在の場合はp=ペプチドである)。積スコアは次のように計算される。即ちBLAST
におけるヌクレオチド又はアミノ酸の(問い合わせ配列と参照配列との間の)一
致度(%)に、(問い合わせ配列及び参照配列の長さに基づく)最大可能BLAST
スコア(%)を乗じて100で除す。インサイト社のクローンが幾つかの配列と
相同であった場合には、最大5つの一致がそのスコアとともに提示される。研究
室で利用されるハイブリダイゼーション法に類似して、正確な一致に対する電子
的厳密性は70に設定し、正確な一致の下限は控えめに約40(不必要な塩基の
存在のために1〜2%の誤差が含まれる)に設定した。
4 ノーザン法による解析
ノーザン解析は、標識されたヌクレオチド配列と特定の細胞型または組織に由
来するRNAが結合したメンブランとのハイブリッド形成を伴う、遺伝予の転写
物の存在を検出するために用いられる実験技術である(Sambrook等、上述)。
BLAST(Altschul,S.F.1993及び1990,上述)を用いる類似のコンピュータ技術
で、GenBankまたはLIFESEQTMデータベース(Incyte,Palo Alto CA)のようなデ
ータベースにおける同一のまたは近縁な分子を検索した。この解析は、多くの膜
ベースのハイブリダイゼーションより非常に短時間で行うことができる。更に、
コンピュータ検索の感度を変更して、ある一致が正確な一致か、相同的であるか
の分類を決定することができる。
検索の基準値は、積スコアであり、これは以下の式で定義されるものである。
(配列の一致(%)×最大BLASTスコア(%))/100
この積スコアでは、2つの配列間の類似性の程度、及び配列の長さの一
致の双方が考慮されている。例えば、積スコアが40の場合は、一致は誤差が1
〜2%の範囲で正確であり、スコアが70の場合は正確に一致している。相同な
分子は、通常積スコアとして15〜40を示すものを選択することにより同定さ
れるが、スコアの低いものは近縁関係にある分子として同定される。
検索の結果は、完全長配列、又はその部分が存在するライブラリー、配列の存
在量(abundance)、及びパーセント存在量(percent abundance)のリストとし
て報告される。存在量は、特定の転写物の検出回数を直接反映し、パーセント存
在量は、存在量をライブラリー内で検出された配列の総数で除したものである。
5 HUMAGOをコードする配列の完全長又は調節エレメントを回復するまで
の伸長
完全長HUMAGOコード化核酸配列(配列番号:2)を用いて、部分的ヌク
レオチド配列を完全長まで伸長させるための、或いはゲノムライブラリーから5
’または3’配列を得るためのオリゴヌクレオチドプライマーを設計することが
できる。一方のプライマーはアンチセンス方向(XLR)の延長を開始するため
に合成され、他方のプライマーはセンス方向(XLF)に配列を延長するために
合成される。これらのプライマーにより、周知のHUMAGO配列を「外側に」
延長し、対象の制御領域の新しい未知のヌクレオチド配列を含むアンプリコンを
生成でき
Biosciences社、Plymouth MN)、或いは他の適切なプログラムを用いて、長さが
22〜30ヌクレオチドで50%以上のGC含量を有し、かつ約68〜72℃の
温度で標的配列にアニールするように設計することができる。アピン構造及びプ
ライマー−プライマー二量体化を生じるような任意のヌクレオチドのストレッチ
の延長は回避される。
元の選択されたcDNAライブラリーか、ヒトゲノムライブラリーを用いて配
列を延長する。後者のライブラリーは、5’上流配列を得るために最も役立つ。
必要なら、既知領域をさらに延長するために追加のプライマーの組が設計される
。
XL-PCRキット(Perkin Elmer)の説明書の指示に従って、酵素と反応混合物と
を完全に混合することにより、高い忠実度の増幅が得られる。40pmolの各プラ
イマーと、推奨された濃度のキットの他の全ての成分とから増幅を開始する場合
、PCRはPeltier Thermal Cycler(PTC200;MJ Reserch,Watertown MA)を用
いて、以下のパラメータで実行される。
ステップ1 94℃で1分間(初期変性)
ステップ2 65℃で1分間
ステップ3 68℃で6分間
ステップ4 94℃で15秒間
ステップ5 65℃で1分間
ステップ6 68℃で7分間
ステップ7 ステップ4〜6をさらに15サイクル反復
ステップ8 94℃で15秒間
ステップ9 65℃で1分間
ステップ10 68℃で7分15秒間
ステップ11 ステップ8〜10を12サイクル反復
ステップ12 72℃で8分間
ステップ13 4℃(その温度を保持)
反応混合物の5〜10μlのアリコットを、低濃度(約0.6〜0.8%)ア
ガロースミニゲル上での電気泳動で解析して、反応物が配列を延長することに成
功したか否かを決定する。最も大きな生成物或いはバ
ンドを選択して、ゲルから切り出した。さらなる精製には、QIAQuickTM(QIAGEN
,Chatsworth CA)のような市販のゲル抽出法を用いる。DNA回収の後、クレ
ノウ酵素を用いて一本鎖ヌクレオチドの延び出しを切り取り、再結合及びクロー
ニングを容易にする平滑末端を作った。
エタノール沈殿の後、生成物を13μlのリゲーション緩衝液内に再溶解し、
1μlのT4−DNAリガーゼ(15単位)及び1μlのT4ポリヌクレオチド
キナーゼを加えて、その混合物を室温で2〜3時間、或いは16℃で一昼夜イン
キュベートする。コンピテントな大腸菌細胞(40μlの適切な溶媒内にある)
を、3μlのリゲーション混合物を用いて形質転換し、80μlのSOC培地(
Sembrook等、上記)で培養する。37℃で1時間のインキュベーションの後、全
ての形質転換混合物を、2xCarbを含むLuria Bertani(LB)寒天(Sembrook等、上
記)上にのせる。後日、いくつかのコロニーを各プレートから無作為に選択し、
適切な市販の無菌の96穴マイクロタイタープレートの個々のウェル内に入れら
れた150μlの液状LB/2xCarb培地で培養する。さらに後日、5μlの各一昼
夜の培養物を非無菌96穴プレート内に移し、水で1:10に希釈した後、それ
ぞれ5μlのサンプルをPCRアレイに移す。
PCR増幅のため、4単位のrTthDNAポリメラーゼを含む18μlの濃
縮PCR反応混合物(3.3x)、ベクタープライマー、並びに延長反応に用い
られる遺伝子特異的プライマーの一方或いは両方を各ウェルに加える。増幅は以
下の条件に従って行う。
ステップ1 94℃で60秒間
ステップ2 94℃で20秒間
ステップ3 55℃で30秒間
ステップ4 72℃で90秒間
ステップ5 ステップ2〜4をさらに29サイクル反復
ステップ6 72℃で180秒間
ステップ7 4℃(そのまま保持)
PCR反応物のアリコットを、分子量マーカーと共にアガロースゲル上で移動
させる。PCR生成物のサイズを元の部分的なcDNAと比較して、適切なクロ
ーンを選択し、プラスミドに結合して、配列決定を行う。
6 ハイブリダイゼーションプローブの標識及び使用
配列番号:2の配列に基づくハイブリダイゼーションプローブを用いて、cD
NA、mRNA並びにゲノムDNAをスクリーニングする。約20の塩基対から
なるオリゴヌクレオチドの標識について特に記すが、大きなcDNAフラグメン
トの場合でも概ね同じ手順を用いる。オリゴヌクレオチドを、50pmolの各
オリゴマーと、250mCiの[γ-32P]アデノシン三リン酸(Amersham)及び
T4ポリヌクレオチドキる。標識されたオリゴヌクレオチドを、SephadexG-25超精細樹脂カラム(Pharma
cia)を用いて精製する。毎分107カウントのセンス及びアンチセンスオリゴヌ
クレオチドのそれぞれを含む部分を、エンドヌク
の1つを用いて切断したヒトゲノムDNAの典型的な膜ベースのハイブリダイゼ
ーション解析において用いる。
各消化物からのDNAを、0.7%アガロースゲル上で分画化して、ナイロン
膜(Nytran Plus,Schleicher & Schuell,Durham NH)にトランスファーする。ハ
イブリダイゼーションは40℃で16時間かけて行う。非特異的シグナルを取り
除くため、ブロットを、0.1xクエン酸ナトリウム食塩水及び0.5%ドデシ
ル硫酸ナトリウムまで段階的に厳
密性が増す条件下で、室温にて順次洗浄する。XOMAT ARTMフィルム(Kodak,Roc
hester NY)を、Phosphoimager cassette(Molecular Dynamics,Sunnyvale CA
)においてブロットに数時間露光した後、ハイブリダイゼーションパターンを視
覚的に比較する。
7 アンチセンス分子
HUMAGOをコードする配列或いはその任意の一部分は、自然発生の配列の
in vivoまたはin vitro発現を阻害するために用られる。約20塩基対からなる
アンチセンスオリゴヌクレオチドの使用について特に記すが、より大きなcDN
Aフラグメントの場合でも概ね同じ方法を用いることができる。第1A図及び第
1B図に示すようなHUMAGOをコードする配列に基づくオリゴヌクレオチド
用いて、自然発生HUMAGOの発現を阻害することができる。相補的なオリゴ
ヌクレオチドを、第1A図及び第1B図に示す最も独特な5’配列から設計し、
これを用いてプロモーターが結合するのを阻害することにより転写を抑制したり
、リボソームが転写物に結合するのを阻害してHUMAGO転写物の翻訳を抑制
することができる。配列番号:2の5’配列の適切な部分を用いることにより、
効果的なアンチセンスオリゴヌクレオチドが、第1A図及び第1B図に示すポリ
ペプチドのシグナル配列または5’コーディング配列に翻訳される領域全体にわ
たる15〜20個のヌクレオチドを含むようになる。
8 HUMAGOの発現
HUMAGOの発現は、cDNAを適切なベクター内にサブクローニングし、
そのベクターを宿主細胞にトランスフェクトすることによって行われる。この場
合、前にcDNAライブラリーの作製の際に用いたクローニング用のpSportベク
ターを用いて、大腸菌においてHUMAGOを発現させる。クローニング部位の
上流には、β−ガラクトシダーゼ
に対するプロモータが存在し、その後ろにはアミノ基末端Met及びβ−ガラクト
シダーゼの7残基が存在する。後続のこれら8つの残基は、転写に役立つバクテ
リオファージプロモーターであり、多くの独特の切断部位を含むリンカーである
。
単離されたトランスフェクト菌株を、IPTGを用いて標準的な方法で誘導し、初
めのβガラクトシダーゼの7残基、約5〜15残基のリンカー、及び完全長HU
MAGOからなる融合タンパク質を作り出す。このシグナル配列は菌培地へのH
UMAGOの分泌を誘導し、この培地は後の活性のアッセイにおいて直接用いる
ことができる。
9 HUMAGO活性の確認
HUMAGOは、Newmark等(前出)によって記述されたPエレメント媒介ト
ランスフォーメーション技術によってキイロショウジョウバエマゴナシの突然変
異体と少なくとも部分的に相補的であり得ることがわかる。HUMAGOのコー
ディング配列をキイロショウジョウバエマゴナシ遺伝子のプロモータ領域と融合
し、作製物を形質転換ベクターpCaSpeR4にクローン化する。次にこの作製物をp
π:25.7wcヘルパーファージミドとともに、Df(1)w,yw67c23胚に同時注入する。
次にΔ2-3をトランスポザーゼのゲノム起源として用いて挿入部分を固定化し、
X染色体上にインサートを有しているハエを得る。子孫の発達及び又は繁殖性が
、キイロショウジョウバエマゴナシ遺伝子における突然変異の相補性を証明する
ことになる。
10 HUMAGO特異的抗体の産生
標準的なプロトコルを用いたウサギの免疫化及び抗体の産生には、PAGE電
気泳動法(Sambrook前出)を用いて実質的に精製されたHUMAGOを用いる。
配列番号:2から類推されるアミノ酸配列をDNAStarソフトウエア(DNASTAR社)
を用いて解析して免疫抗原性
の高い領域を決定し、対応するオリゴペプチドを当業者には周知の手段により合
成して、当業者に周知の方法で抗体を産生するために用いる。C末端付近の、或
いは隣接する親水性領域内のエピトープのような、適切なエピトープを選択する
ための解析法は、Ausubel等(上記)の論文他に記載されている。
通常、約15残基の長さを有するオリゴペプチドを、Applied Biosystemsのペ
プチド合成機Model 431Aを用いてfmoc法のケミストリにより合成し、M−マ
レイミドベンゾイル−N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(MBS:Ausube
l等、上記)を用いた反応によりキーホールリンペットヘモシニアン(KLH、S
igma)に結合する。フロイントの完全アジュバントにおいてオリゴペプチド−K
LH複合体を用いてウサギを免疫する。得られた抗血清の抗ペプチド活性を検査
するには、例えばペプチドをプラスチックに結合し、1%BSAを用いてブロック
し、ウサギ抗血清と反応させて洗浄し、さらに放射性ヨウ素標識されたヤギ抗ウ
サギIgGと反応させる。
11 特異的抗体を用いる自然発生HUMAGOの精製
自然発生HUMAGO或いは組換えHUMAGOは、HUMAGOに特異的な
抗体を用いるイムノアフィニティークロマトグラフィにより精製することができ
る。イムノアフィニティーカラムは、CnBr-activated Sepharose(Pharmacia Bi
otech社)のような活性化クロマトグラフレジンとHUMAGO抗体とを共有結
合させることにより構築される。結合後、そのレジンを使用説明書の指示に従っ
て、ブロックし洗浄する。
HUMAGOを含む培地をイムノアフィニティーカラムに通し、そのカラムを
HUMAGOを優先的に吸着できる条件下で(例えば界面活性剤の存在下におい
て高イオン強度バッファで)洗浄する。このカラムを、抗体/HUMAGO結合
を切るような条件下(例えばpH2〜3のバッ
ファ、或いは高濃度の尿素またはチオシアン酸塩イオンのようなカオトロピック
イオン)で溶出させ、HUMAGOを回収する。
12 HUMAGOと相互作用する分子の同定
HUMAGO又は生物学的に活性なその断片を、125Iボルトンハンター試薬
(Boltonら(1973)Biochem.J.133:529)で標識する。マルチウェルプレートに予
め配列しておいた候補の分子を、標識したHUMAGOとともにインキュベート
し、洗浄して、標識HUMAGO複合体を有する任意のウエルをアッセイする。
異なる濃度のHUMAGOを用いて得られたデータを用いて、候補の分子とHU
MAGOの会合、親和性、数の数値を計算する。
上記のすべての刊行物及び特許明細書は、本明細書と一体に参照されたい。本
発明の記載した方法及びシステムの種々の改変は、本発明の範囲及び精神から逸
脱しないことは当業者には明らかであろう。本発明は特に好適な実施例に関連し
て記載されているが、本発明の請求の範囲は、そのような特定の実施例に不当に
制限されるべきではないことを理解されたい。実際には、本発明を実施するため
に記載された方法の種々の改変は、分子生物学或いは関連する分野の専門家には
明らかなように、請求の範囲内に含まれるものである。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
A61P 35/00 A61P 43/00 101
37/04 C07K 14/47
43/00 101 16/18
C07K 14/47 C12N 1/21
16/18 C12Q 1/68 A
C12N 1/21 G01N 33/53 D
C12Q 1/68 C12N 15/00 ZNAA
G01N 33/53 A61K 37/02
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(GH,GM,KE,LS,M
W,SD,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY
,KG,KZ,MD,RU,TJ,TM),AT,AU
,BR,CA,CH,CN,DE,DK,ES,FI,
GB,IL,JP,KR,MX,NO,NZ,RU,S
E,SG,US
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.配列番号:1のアミノ酸配列又はその断片を含む実質的に精製されたヒト・ マゴナシタンパク質。 2.請求項1のヒト・マゴナシタンパク質をコードする単離され精製されたポリ ヌクレオチド配列。 3.請求項2のポリヌクレオチド配列と厳密な条件の下でハイブリダイズするポ リヌクレオチド配列。 4.請求項2のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 5.配列番号:2の配列又はその変異体を含む単離され精製されたポリヌクレオ チド配列。 6.請求項2のポリヌクレオチド配列又はその変異体に相補的なポリヌクレオチ ド配列。 7.請求項6のポリヌクレオチド配列を含むハイブリダイゼーションプローブ。 8.請求項2のポリヌクレオチド配列を含む発現ベクター。 9.請求項8のベクターを含む宿主細胞。 10.配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法であって、 (a)該ポリペプチドの発現に適した条件の下で請求項9の宿主細胞を培養す る過程と、 (b)前記宿主細胞の培地から該ポリペプチドを回収する過程とを含むことを 特徴とする配列番号:1のアミノ酸配列を含むポリペプチドの製造方法。 11.配列番号:1のアミノ酸配列を有する実質的に精製されたヒト・マゴナシ タンパク質を適切な製薬用担体とともに含む医薬品組成物。 12.請求項1のポリペプチドに特異的に結合する精製された抗体。 13.請求項1のポリペプチドに特異的に結合し、その活性を変調する精製され たアゴニスト。 14.請求項1のポリペプチドの活性を変調する精製されたアゴニスト。 15.発達障害の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項11の医薬品組成物を有効量投与する 過程を含む発達障害の治療方法。 16.癌の治療方法であって、 そのような治療が必要な患者に、請求項14のアンタゴニストを有効量投与す る過程を含む癌の治療方法。 17.生物学的サンプルにおけるヒト・マゴナシタンパク質をコードするポリヌ クレオチドの検出方法であって、 (a)請求項6のポリヌクレオチドと生物学的サンプルの核酸材料とをハイブ リダイズさせ、ハイブリダイゼーション複合体を形成する過程と、 (b)前記ハイブリダイゼーション複合体を検出する過程とを含むことを特徴 とし、 前記複合体の存在が、前記生物学的サンプルにおけるヒト・マゴナシタンパク 質をコードするポリヌクレオチドの存在と相関性を有することを特徴とする生物 学的サンプルにおけるヒト・マゴナシタンパク質をコードするポリヌクレオチド の検出方法。
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