JP2001507241A - ワクシニアトポイソメラーゼにより触媒されるrna鎖に対するdna鎖の共有結合 - Google Patents
ワクシニアトポイソメラーゼにより触媒されるrna鎖に対するdna鎖の共有結合Info
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Abstract
Description
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.DNA鎖をRNA鎖に共有結合せしめる方法であって、 (a) トポイソメラーゼ切断部位を具備するDNA切断基質と、該部位に対して 特異的なトポイソメラーゼとをインキュベートすることによって、一以 上の5'一本鎖尾部を有するトポイソメラーゼ−DNA中間体を形成するこ とと、 (b) トポイソメラーゼ−DNA中間体の共有結合したDNA鎖が、RNAアクセプタ ー鎖に連結することができ、且つトポイソメラーゼが解離し得る条件下 において、前記トポイソメラーゼ−DNA中間体に、前記5'一本鎖尾部に 相補的なアクセプターRNA鎖を添加することにより、DNA鎖をRNA鎖に共 有結合せしめること とを具備する方法。 2.請求項1の方法であって、トポイソメラーゼ切断部位を有するDNA鎖を相 補的DNA鎖にハイブリダイズすることによって、DNA切断基質を作出し、それによ りトポイソメラーゼ切断部位及び切断容易な結合の3'に位置するオリゴヌクレオ チド脱離基を有するDNA切断基質を形成する方法。 3.請求項1の方法であって、DNA切断基質が、トポイソメラーゼ切断部位を 具備するプラスミドベクターである方法。 4.請求項1の方法であって、トポイソメラーゼ切断部位がCCCTTを具備する 配列である方法。 5.請求項1の方法であって、トポイソメラーゼがワクシニアトポイソメラー ゼ酵素である方法。 6.請求項1の方法であって、トポイソメラーゼ切断部位を具備するDNA鎖が 放射性ラベルされている方法。 7.請求項6の方法であって、放射性ラベルが、32P又は放射性ハロゲンであ る方法。 8 請求項1の方法であって、トポイソメラーゼ切断部泣を有するDNA鎖が、 ビオチン部分でラベルされている方法。 9 請求項1の方法であって、トポイソメラーゼ結合DNA中間体とアクセプタ ーRNA鎖がインビトロで連結される方法。 10.一以上の5'一不鎖尾部を具備するトポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 11.請求項10のトポイソメラーゼ−DNA中間体分子であって、5'一本鎖尾 部が特異的な配列を具備するトポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 12.請求項1の方法のステップ(a)によって生じた5'一本鎖尾郎を具備する トポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 13.5'一本鎖尾部が特異的な配列を具備する、請求項1の方法のステップ(a )によって生じた5'一本鎖尾部を具備するトポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 14.DNA鎖が放射性ラベルされている、請求項1の方法のステップ(a)によっ て生じた5'一本鎖尾部を具備するトポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 15.放射性ラベルが32P又は放射性ハロゲンである請求項13のトポイソメ ラーゼ−DNA中間体分子。 16.DNA鎖がアフィニティーラベルされている、請求項1の方法のステップ( a)によって生じた5'一本鎖尾部を具備するトポイソメラーゼ−DNA中間体分子。 17.アフィニティーラベルがビオチン部分、キチン結合ドメイン、又はグル タチオン-S-トランスフェラーゼ部分である請求項16のトポイソメラーゼ−DNA 中間体分子。 18.トポイソメラーゼ触媒によって共有結合されたDNA-RNA分子。 19.請求項1の方法によって共有結合されたDNA-RNA分子。 20.5'末端ラベルを有する、請求項19の共有結合されたDNA-RNA分子。 21.5'末端ラベルが32P又は放射性ハロゲンである請求項20の共有結合さ れたDNA-RNA分子。 22.5'末端ラベルがビオチン部分、キチン結合ドメイン、又はグルタチオン -S-トランスフェラーゼ部分である請求項20の共有結合されたDNA-RNA分子。 23.ラベルされた5'末端を有する共有結合されたDNA-RNA分子。 24.5'末端ラベルが32P又は放射性ハロゲンである請求項23の共有結合さ れたDNA-RNA分子。 25.5'末端ラベルがビオチン部分、キチン結合ドメイン、又はグルタチオン -S−トランスフェラーゼ部分である請求項23の共有結合されたDNA-RNA分子。 26.RNA分子の5'末端にタグ付加する方法であって、 (a) トポイソメラーゼ切断部位を具備するDNA切断基質と、該部位に対して 特異的なトポイソメラーゼとをインキュベートすることによって、一以 上の5'一本鎖尾部を有するトポイソメラーゼ−DNA中間体を形成するこ とと、 (b) トポイソメラーゼ−DNA中間体の共有結合したDNAが、RNA分子に連結す ることができ、且つトポイソメラーゼが解離し得る条件下において、前 記トポイソメラーゼ−DNA中間体に、前記5'一本鎖尾部に相補的な5'ヒ ドロキシル末端化されたRNA分子を添加することにより、5'末端タグ付 加DNA-RNA連結産物を形成すること とを具備する方法。 27.5'ヒドロキシル末端化されたRNA分子が、インビトロ合成の産物又は細 胞若しくは組織から単離した産物である請求項26の方法。 28.合成又は単離後に、RNA分子が脱リン酸化される請求項27の方法。 29.RNA分子をアルカリホスファターゼで処理することによって、脱リン酸 化が達成される請求項28の方法。 30.請求項26の方法であって、トポイソメラーゼ切断卸位を有するDNA鎖 を相補的DNA鎖にハイブリダイズすることによって、DNA切断基質を作出し、それ によりトポイソメラーゼ切断部位及び切断容易な結合の3'に位置するオリゴヌク レオチド脱離基を有するDNA切断基質を形成する方法。 31.トポイソメラーゼがワクシニアトポイソメラーゼ酵素である請求項26 の方法。 32.切断部位がCCCTTを具備する請求項26の方法。 33.DNAが5'末端ラベルを具備する請求項26の方法。 34.請求項33の方法であって、5'末端ラベルがビオチン部分、キチン結合 ドメイン、又はグルタチオン-S-トランスフェラーゼ部分である請求項33の方 法 35.5'ヒドロキシル末端化されたRNA分子の添加に先立って、5'末端ラベル されたDNAを固相支持体上に固定化することをさらに具備する請求項33の方法 。 36.固相支持体がストレプトアビジン、アビジン、キチン、又はグルタチオ ンを具備する請求項35の方法。 37.未修飾のRNAを具備する液相から5'末端ラベルされたDNA-RNA連結産物が 固定化されている固相支持体を分離することにより、ビオチン化された5'末端タ グ付加DNA-RNA連結産物を精製することをさらに具備する請求項35の方法。 38.5'末端タグ付加RNA分子。 39.タグがDNA配列である請求項38の5'末端タグ付加RNA分子。 40.さらに5'末端ラベルを具備する請求項39の5'末端タグ付加RNA分子。 41.ラベルが32P又は放射性ハロゲンである請求項41の5'末端タグ付加RNA 分子。 42.ラベルがビオチン部分、キチン結合ドメイン、又はグルタチオン-S-ト ランスフェラーゼ部分である請求項43の5'末端タグ付加RNA分子。 43.請求項26の方法によって作成された5'末端タグ付加RNA分子。 44.トポイソメラーゼを用いることによってインビトロで結合したDNA-RNA 分子。 45.(a)完全長のmRNAを単離することと; (b)該単離したmRNAにDNAタグ配列を付着することと; (c)タグ付加したmRNAをテンプレートとして用いてcDNAを合成すること とを具備する完全長の遺伝子配列を得る方法。 46.アフィニティー精製材料を利用することによって、mRNAを単離する請求 項45の方法。 47.単離されるmRNAが、アフィニティー精製タグ付加キャップ構造を具備す る請求項46の方法。 48.アフィニティー精製タグがビオチン部分、キチン結合ドメイン、又はグ ルタチオン-S-トランスフェラーゼ部分である請求項46の方法。 49.アフィニティー精製材料が、フェニルボロン酸、ストレプトアビジン、 アビジン、キチン、又はグルタチオンと複合体を形成した固相支持体を具備する 請求項46の方法。 50.固相支持体が磁気ビーズ又はセファロースである請求項49の方法。 51.mRNAが植物細胞又は動物細胞から単離される請求項45の方法。 52.動物細胞が哺乳類細胞又は昆虫細胞である請求項51の方法。 53.単離した後にmRNAがデキャッピングされ、且つ脱リン酸化される請求項 45の方法。 54.酵素的に又は化学的処理によって、mRNAがデキャッピングされる請求項 53の方法。 55.酵素がピロホスファターゼである請求項54の方法。 56.化学処理が過ヨウ素酸酸化又はβ脱離である請求項54の方法。 57.mRNAがアルカリホスファターゼを用いて脱リン酸化される請求項53の 方法。 58.DNAタグ配列がI型トポイソメラーゼに対する認識部位を具備する請求 項45の方法。 59.DNAタグ配列が部位特異的制限エンドヌクレアーゼに対する認識部位を さらに具備する請求項58の方法。 60.I型トポイソメラーゼがワクシニアDNAトポイソメラーゼである請求項 58の方法。 61.DNAタグ配列が図11に示されている二本鎖配列を具備し、Nがアデノ シン部分、グアノシン部分、シトシン部分、又はチミジン部分を表している請求 項58の方法。 62.Nが1〜4ヌクレオチド塩基である請求項61の方法。 63.ワクシニアDNAトポイソメラーゼが二本鎖タグ配列に共有結合している 請求項61の方法。 64.増幅用プライマーがタグ配列(5')と遺伝子特異的配列(3')のアンチコー ド配列を具備する、合成したcDNAを増幅することをさらに具備する請求項45の 方法。 65.増幅されたcDNAを発現ベクター中に挿入することをさらに具備する請求 項64の方法。 66.DNAタグ配列が直鎖状にされた発現ベクターである請求項45の方法。 67.請求項45の方法によって調製した単離された完全長の遺伝子配列。 68.請求項45の方法の調製した単離された完全長の遺伝子配列及び発現ベ クターを具備する核酸構築物。 69.発現ベクターが、プロモーター−エンハンサー配列、選択マーカー配列 、複製起点、エピトープタグをコードする配列、又はアフィニティー精製タグを コードする配列から選択される1以上の要素を具備する請求項68の核酸構築物 70.プロモーター−エンハンサー配列が、T7プロモーター、gallプロモータ ー、メタロチオネインプロモーター、AraCプロモーター、又はCMVプロモーター −エンハンサーである請求項69の核酸構築物。 71.選択マーカー配列が、抗生物質耐性遺伝子をコードする請求項69の核 酸構築物。 72.エピトープタグ配列が、V5、ペプチドPhe-His-His-Thr-Thr、ヘマグル チニン、又はグルタチオン-S-トランスフェラーゼをコードする請求項69の核 酸構築物。 73.アフィニティー精製タグ配列がポリアミノ酸又はポリペプチドをコード する請求項69の核酸構築物。 74.前記ポリアミノ酸配列がポリヒスチジンである請求項73の核酸構築物 。 75.前記ポリペプチドがキチン結合ドメイン又はグルタチオン-S-トランス フェラーゼである請求項73の核酸構築物。 76.前記ポリペプチドをコードする配列が、インテインをコードする配列を 含んでいる請求項73の核酸構築物。 77.発現ベクターが、真核生物発現ベクター又は原核生物発現ベクターであ る請求項68の核酸構築物。 78.真核生物発現ベクターが、pYES2、pMT、pIND、又はpcDNA3.1.である請 求項77の核酸構築物。 79.完全長遺伝子配列を得る方法であって、 (a)アフィニティー精製材科を利用することによって完全長のmRNAを単離する ことと: (b)単離されたmRNAをデキャッピングし、脱リン酸化することと; (c)該デキャッピングし、脱リン酸化したmRNAに、図11に示されている配列 を 具備し、且つワクシニアDNAトポイソメラーゼが付着しているDNAタグ配列を 付着せしめることと: (d)テンプレートとしてタグ付加されたmRNAを用いてcDNAを合成することと; (e)合成されたcDNAを増幅し、ここで増幅プライマーがタグ配列(5')のアンチ コ−ド配列と遺伝子特異的配列(3')を具備していることと; (f)発現ベクター中に増幅されたcDNAを挿入すること とを具備する方法。
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---|---|---|---|---|
US5766891A (en) | 1994-12-19 | 1998-06-16 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method for molecular cloning and polynucleotide synthesis using vaccinia DNA topoisomerase |
AU746657B2 (en) * | 1997-06-12 | 2002-05-02 | Invitrogen Corporation | Covalent joining of DNA strands to RNA strands catalyzed by vaccinia topoisomerase |
EP1141275B1 (en) * | 1999-01-05 | 2009-08-12 | Trustees Of Boston University | Improved nucleic acid cloning |
US6358712B1 (en) | 1999-01-05 | 2002-03-19 | Trustee Of Boston University | Ordered gene assembly |
JP2002539784A (ja) * | 1999-03-19 | 2002-11-26 | インヴィトロゲン・コーポレーション | 大腸菌トポイソメラーゼiii及びその相同体を使用して全長核酸配列を得る方法 |
DE19916227A1 (de) * | 1999-04-10 | 2000-11-02 | Merlin Mikrobiolog Diag Gmbh | Verfahren zur genotypischen Klassifizierung |
EP1504119A4 (en) * | 2000-02-25 | 2005-02-09 | Stratagene California | METHOD FOR LIGATURE OF NUCLEIC ACIDS AND MOLECULAR CLONING |
JP2003524422A (ja) * | 2000-02-25 | 2003-08-19 | インヴィトロジェン コーポレーション | トポイソメラーゼリンカー介在型増幅法 |
US7517688B2 (en) | 2000-02-25 | 2009-04-14 | Stratagene California | Method for ligating nucleic acids and molecular cloning |
US7198924B2 (en) | 2000-12-11 | 2007-04-03 | Invitrogen Corporation | Methods and compositions for synthesis of nucleic acid molecules using multiple recognition sites |
AU8835601A (en) * | 2000-08-21 | 2002-03-04 | Invitrogen Corp | Methods and reagents for molecular cloning |
EP1325118B1 (en) * | 2000-10-05 | 2016-05-25 | Riken | Oligonucleotide linkers comprising a variable cohesive portion and method for the preparation of polynucleotide libraries by using said linkers. |
CA2430886A1 (en) * | 2000-12-08 | 2002-08-08 | Invitrogen Corporation | Compositions and methods for rapidly generating recombinant nucleic acid molecules |
US20060008817A1 (en) * | 2000-12-08 | 2006-01-12 | Invitrogen Corporation | Methods and compositions for generating recombinant nucleic acid molecules |
WO2005014796A2 (en) | 2003-08-08 | 2005-02-17 | Invitrogen Corporation | Methods and compositions for seamless cloning of nucleic acid molecules |
US20050106602A1 (en) * | 2003-11-17 | 2005-05-19 | Hashem Akhavan-Tafti | Simplified methods for isolating nucleic acids from cellular materials |
EP1697534B1 (en) | 2003-12-01 | 2010-06-02 | Life Technologies Corporation | Nucleic acid molecules containing recombination sites and methods of using the same |
US7707707B2 (en) * | 2005-01-04 | 2010-05-04 | Hitachi Global Storage Technologies Netherlands B.V. | Method for providing a temporary deep shunt on wafer structures for electrostatic discharge protection during processing |
US7881933B2 (en) * | 2007-03-23 | 2011-02-01 | Verizon Patent And Licensing Inc. | Age determination using speech |
US8323930B2 (en) * | 2007-07-28 | 2012-12-04 | Dna Twopointo, Inc. | Methods, compositions and kits for one-step DNA cloning using DNA topoisomerase |
CN101424640B (zh) | 2007-11-02 | 2012-07-25 | 江苏命码生物科技有限公司 | 血清中微小核糖核酸的检测方法和用于检测的试剂盒、生物芯片及其制作和应用方法 |
WO2011006136A2 (en) | 2009-07-09 | 2011-01-13 | Verdezyne, Inc. | Engineered microorganisms with enhanced fermentation activity |
US8889394B2 (en) | 2009-09-07 | 2014-11-18 | Empire Technology Development Llc | Multiple domain proteins |
US20110294996A1 (en) * | 2010-05-31 | 2011-12-01 | Scheiber Lane Bernard | Quantum unit of inheritance |
CA3051939C (en) | 2011-07-06 | 2023-08-01 | Verdezyne, Inc. | Genetically modified yeast with increased alcohol dehydrogenase activity for preparing a fatty dicarboxylic acid |
US9465519B2 (en) | 2011-12-21 | 2016-10-11 | Life Technologies Corporation | Methods and systems for in silico experimental designing and performing a biological workflow |
US9695416B2 (en) | 2012-07-18 | 2017-07-04 | Siemens Healthcare Diagnostics Inc. | Method of normalizing biological samples |
EP2935564A2 (en) | 2012-12-19 | 2015-10-28 | Verdezyne, Inc. | Biological methods for preparing a fatty dicarboxylic acid |
SG11201504837WA (en) | 2012-12-19 | 2015-07-30 | Verdezyne Inc | Biological methods for preparing a fatty dicarboxylic acid |
US9677984B2 (en) * | 2014-01-31 | 2017-06-13 | University Of Maryland | Pulsed-field differential mobility analyzer system and method for separating particles and measuring shape parameters for non-spherical particles |
US11274333B2 (en) | 2015-05-29 | 2022-03-15 | Molecular Cloning Laboratories (MCLAB) LLC | Compositions and methods for preparing sequencing libraries |
US10438662B2 (en) | 2016-02-29 | 2019-10-08 | Iridia, Inc. | Methods, compositions, and devices for information storage |
KR20180123062A (ko) * | 2016-02-29 | 2018-11-14 | 이리디아, 인크. | 정보 저장을 위한 방법, 조성물, 및 장치 |
US10859562B2 (en) | 2016-02-29 | 2020-12-08 | Iridia, Inc. | Methods, compositions, and devices for information storage |
US10640822B2 (en) | 2016-02-29 | 2020-05-05 | Iridia, Inc. | Systems and methods for writing, reading, and controlling data stored in a polymer |
CN106434719A (zh) * | 2016-09-27 | 2017-02-22 | 北京擎科新业生物技术有限公司 | 基于牛痘拓扑异构酶i的零背景载体构建方法 |
WO2020060948A1 (en) | 2018-09-17 | 2020-03-26 | Levadura Biotechnology, Inc. | Production of cannabinoids in yeast using a fatty acid feedstock |
US11655465B1 (en) | 2019-05-02 | 2023-05-23 | Iridia, Inc. | Enzymes and systems for synthesizing DNA |
US11837302B1 (en) | 2020-08-07 | 2023-12-05 | Iridia, Inc. | Systems and methods for writing and reading data stored in a polymer using nano-channels |
CN112562800A (zh) * | 2020-12-15 | 2021-03-26 | 长安大学 | 一种可寻址的dna多面体拓扑结构的图染色及重组方法 |
Family Cites Families (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4661450A (en) * | 1983-05-03 | 1987-04-28 | Molecular Genetics Research And Development Limited Partnership | Molecular cloning of RNA using RNA ligase and synthetic oligonucleotides |
EP0178314A1 (en) | 1984-04-26 | 1986-04-23 | The Australian National University | An improved method of cloning double-stranded rna, and its use in the production of viral gene clones |
US4800159A (en) * | 1986-02-07 | 1989-01-24 | Cetus Corporation | Process for amplifying, detecting, and/or cloning nucleic acid sequences |
DE3788914T2 (de) * | 1986-09-08 | 1994-08-25 | Ajinomoto Kk | Verbindungen zur Spaltung von RNS an eine spezifische Position, Oligomere, verwendet bei der Herstellung dieser Verbindungen und Ausgangsprodukte für die Synthese dieser Oligomere. |
CA2005252C (en) | 1988-12-13 | 2001-07-17 | Nahum Sonenberg | Isolation of full-length cdna clones and capped mrna |
JP2994010B2 (ja) * | 1989-10-31 | 1999-12-27 | 財団法人相模中央化学研究所 | クローニングベクタープラスミド、それから誘導されるベクタープライマー及びそれを用いたcDNAバンクの作製方法 |
JP3337748B2 (ja) * | 1992-09-25 | 2002-10-21 | 財団法人神奈川科学技術アカデミー | 完全長cDNAの合成方法、その中間体の製造方法及び完全長cDNAを含む組換えベクターの製造方法 |
DE4319468C1 (de) * | 1993-06-11 | 1994-11-17 | Mueller Manfred W | Verfahren zum Herstellen eines zu einem Ribonukleinsäure (RNA)-Molekül komplementären Desoxyribonukleinsäure(DNA)-Stranges (cDNA-Stranges), sowie die Verwendung des Verfahrens zur Analyse von RNA-Molekülen |
US5766891A (en) | 1994-12-19 | 1998-06-16 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method for molecular cloning and polynucleotide synthesis using vaccinia DNA topoisomerase |
FR2733762B1 (fr) | 1995-05-02 | 1997-08-01 | Genset Sa | Methode de couplage specifique de la coiffe de l'extremite 5' d'un fragment d'arnm et preparation d'arnm et d'adnc complet |
US6238884B1 (en) | 1995-12-07 | 2001-05-29 | Diversa Corporation | End selection in directed evolution |
US5962271A (en) | 1996-01-03 | 1999-10-05 | Cloutech Laboratories, Inc. | Methods and compositions for generating full-length cDNA having arbitrary nucleotide sequence at the 3'-end |
US5746997A (en) | 1996-10-02 | 1998-05-05 | Epoch Pharmaceuticals, Inc. | Radiohalogenation of oligonucleotides via trialkylstannylaryl conjugates |
JP3441899B2 (ja) | 1996-11-01 | 2003-09-02 | 理化学研究所 | 完全長cDNAライブラリーの作成方法 |
US5942422A (en) | 1996-11-14 | 1999-08-24 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Method for generating a directed, recombinant fusion nucleic acid |
WO1998055502A1 (en) | 1997-06-04 | 1998-12-10 | Smithkline Beecham Corporation | METHODS FOR RAPID CLONING OF FULL LENGTH cDNAs |
AU746657B2 (en) | 1997-06-12 | 2002-05-02 | Invitrogen Corporation | Covalent joining of DNA strands to RNA strands catalyzed by vaccinia topoisomerase |
EP1114148A4 (en) | 1998-08-28 | 2004-12-22 | Invitrogen Corp | SYSTEM FOR RAPID HANDLING OF NUCLEIC ACID SEQUENCES |
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AU4032300A (en) | 1999-03-24 | 2000-10-09 | Gene Therapy Systems, Inc. | Method for generating transcriptionally active dna fragments |
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