HUT67739A - Production of proteins using fb2 protein - Google Patents
Production of proteins using fb2 protein Download PDFInfo
- Publication number
- HUT67739A HUT67739A HU9401604A HU9401604A HUT67739A HU T67739 A HUT67739 A HU T67739A HU 9401604 A HU9401604 A HU 9401604A HU 9401604 A HU9401604 A HU 9401604A HU T67739 A HUT67739 A HU T67739A
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- cell
- protein
- polypeptide
- precursor
- transformed
- Prior art date
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 284
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 226
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 37
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 54
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 claims abstract description 29
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 28
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 claims abstract description 14
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 claims abstract description 14
- 101000783526 Homo sapiens Neuroendocrine protein 7B2 Proteins 0.000 claims description 246
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 173
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 66
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 64
- 230000000975 bioactive effect Effects 0.000 claims description 58
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 42
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 41
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 31
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 claims description 30
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 29
- 102000045342 human SCG5 Human genes 0.000 claims description 25
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 24
- 108090000723 Insulin-Like Growth Factor I Proteins 0.000 claims description 22
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 20
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 17
- 108090000189 Neuropeptides Proteins 0.000 claims description 14
- 239000000813 peptide hormone Substances 0.000 claims description 13
- 210000003890 endocrine cell Anatomy 0.000 claims description 10
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 claims description 10
- 230000009962 secretion pathway Effects 0.000 claims description 7
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 claims description 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 5
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 claims description 5
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 5
- 108010039209 Blood Coagulation Factors Proteins 0.000 claims description 3
- 102000015081 Blood Coagulation Factors Human genes 0.000 claims description 3
- 239000003114 blood coagulation factor Substances 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 101000599951 Homo sapiens Insulin-like growth factor I Proteins 0.000 claims description 2
- 102000003797 Neuropeptides Human genes 0.000 claims 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 4
- 102000004218 Insulin-Like Growth Factor I Human genes 0.000 claims 1
- 102100037852 Insulin-like growth factor I Human genes 0.000 claims 1
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 abstract description 11
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 abstract description 3
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 3
- 108010006519 Molecular Chaperones Proteins 0.000 abstract 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 52
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 52
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 46
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 43
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 41
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 41
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 41
- 108010069820 Pro-Opiomelanocortin Proteins 0.000 description 40
- 102100027467 Pro-opiomelanocortin Human genes 0.000 description 39
- 239000000683 Pro-Opiomelanocortin Substances 0.000 description 38
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 37
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 28
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 22
- 102000014429 Insulin-like growth factor Human genes 0.000 description 20
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 18
- 239000000047 product Substances 0.000 description 17
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 14
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 14
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 14
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 13
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 13
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 13
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 12
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 12
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 12
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 11
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 10
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 10
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 10
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 10
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 10
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 10
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 9
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 9
- 230000006870 function Effects 0.000 description 9
- 101150014136 SUC2 gene Proteins 0.000 description 8
- 108010051210 beta-Fructofuranosidase Proteins 0.000 description 8
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 8
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 8
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 8
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 8
- 239000001573 invertase Substances 0.000 description 8
- 235000011073 invertase Nutrition 0.000 description 8
- 230000001817 pituitary effect Effects 0.000 description 8
- 102400000739 Corticotropin Human genes 0.000 description 7
- 101800000414 Corticotropin Proteins 0.000 description 7
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 7
- 230000004186 co-expression Effects 0.000 description 7
- IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N corticotropin Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO)C1=CC=C(O)C=C1 IDLFZVILOHSSID-OVLDLUHVSA-N 0.000 description 7
- 229960000258 corticotropin Drugs 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- 210000002472 endoplasmic reticulum Anatomy 0.000 description 7
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- 239000000275 Adrenocorticotropic Hormone Substances 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 6
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 6
- 102000040739 Secretory proteins Human genes 0.000 description 6
- 108091058545 Secretory proteins Proteins 0.000 description 6
- 108090000190 Thrombin Proteins 0.000 description 6
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 6
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 6
- 229960004072 thrombin Drugs 0.000 description 6
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 6
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 6
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 5
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 5
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 5
- 241000714474 Rous sarcoma virus Species 0.000 description 5
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 5
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 5
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 5
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 4
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 4
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 4
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 4
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 4
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 4
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 4
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 4
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 4
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 4
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 4
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- 239000008187 granular material Substances 0.000 description 4
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 4
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 4
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 4
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 4
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 4
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 4
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101150091578 CYP1 gene Proteins 0.000 description 3
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 3
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 101000609762 Gallus gallus Ovalbumin Proteins 0.000 description 3
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 3
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 description 3
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 description 3
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000002812 Heat-Shock Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108010004889 Heat-Shock Proteins Proteins 0.000 description 3
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 3
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 3
- 229920012196 Polyoxymethylene Copolymer Polymers 0.000 description 3
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 3
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 3
- 101150050575 URA3 gene Proteins 0.000 description 3
- 241000269370 Xenopus <genus> Species 0.000 description 3
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 3
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 3
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 3
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 3
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 3
- 229940071106 ethylenediaminetetraacetate Drugs 0.000 description 3
- 210000002288 golgi apparatus Anatomy 0.000 description 3
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 3
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 3
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 3
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 3
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 3
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 3
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 238000012807 shake-flask culturing Methods 0.000 description 3
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 3
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 3
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 3
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 3
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 2
- OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 3-phospho-D-glyceric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)COP(O)(O)=O OSJPPGNTCRNQQC-UWTATZPHSA-N 0.000 description 2
- 102100038222 60 kDa heat shock protein, mitochondrial Human genes 0.000 description 2
- DVKQVRZMKBDMDH-UUOKFMHZSA-N 8-Br-cAMP Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=CN=C2N)=C2N=C1Br DVKQVRZMKBDMDH-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N Ala-Ala-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN FJVAQLJNTSUQPY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 2
- ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N Arg-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)O ZJBUILVYSXQNSW-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 2
- CTWCFPWFIGRAEP-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O CTWCFPWFIGRAEP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 2
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 2
- 102000055006 Calcitonin Human genes 0.000 description 2
- 108060001064 Calcitonin Proteins 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- 108010058432 Chaperonin 60 Proteins 0.000 description 2
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 2
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 2
- 208000001976 Endocrine Gland Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 108050009340 Endothelin Proteins 0.000 description 2
- 102000005731 Glucose-6-phosphate isomerase Human genes 0.000 description 2
- 108010070600 Glucose-6-phosphate isomerase Proteins 0.000 description 2
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 2
- 101100246753 Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) pyrF gene Proteins 0.000 description 2
- 108091005904 Hemoglobin subunit beta Proteins 0.000 description 2
- YKZAMJXNJUWFIK-JBDRJPRFSA-N Ile-Ser-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N YKZAMJXNJUWFIK-JBDRJPRFSA-N 0.000 description 2
- 108090001117 Insulin-Like Growth Factor II Proteins 0.000 description 2
- 239000000637 Melanocyte-Stimulating Hormone Substances 0.000 description 2
- 108010007013 Melanocyte-Stimulating Hormones Proteins 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 102000003946 Prolactin Human genes 0.000 description 2
- 108010057464 Prolactin Proteins 0.000 description 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 description 2
- LOUPRKONTZGTKE-WZBLMQSHSA-N Quinine Chemical compound C([C@H]([C@H](C1)C=C)C2)C[N@@]1[C@@H]2[C@H](O)C1=CC=NC2=CC=C(OC)C=C21 LOUPRKONTZGTKE-WZBLMQSHSA-N 0.000 description 2
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 2
- 108010056088 Somatostatin Proteins 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 102000007362 alpha-Crystallins Human genes 0.000 description 2
- 108010007908 alpha-Crystallins Proteins 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 229960004015 calcitonin Drugs 0.000 description 2
- BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N calcitonin Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(N)=O)C(C)C)C(=O)[C@@H]1CSSC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1 BBBFJLBPOGFECG-VJVYQDLKSA-N 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 230000001112 coagulating effect Effects 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 2
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 2
- 201000011523 endocrine gland cancer Diseases 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 230000028023 exocytosis Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- -1 i.e. Proteins 0.000 description 2
- 230000002608 insulinlike Effects 0.000 description 2
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 230000001802 melanotrophic effect Effects 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 208000014500 neuronal tumor Diseases 0.000 description 2
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 2
- 229940097325 prolactin Drugs 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 210000002955 secretory cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000004739 secretory vesicle Anatomy 0.000 description 2
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- SFVVQRJOGUKCEG-OPQSFPLASA-N β-MSH Chemical compound C1C[C@@H](O)[C@H]2C(COC(=O)[C@@](O)([C@@H](C)O)C(C)C)=CCN21 SFVVQRJOGUKCEG-OPQSFPLASA-N 0.000 description 2
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WPANETAWYGDRLL-UHFFFAOYSA-N 4-aminobenzenecarboximidamide Chemical compound NC(=N)C1=CC=C(N)C=C1 WPANETAWYGDRLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100023818 ADP-ribosylation factor 3 Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N Ala-Gly-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QHASENCZLDHBGX-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- ZBLQIYPCUWZSRZ-QEJZJMRPSA-N Ala-Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CC1=CC=CC=C1 ZBLQIYPCUWZSRZ-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- 108090001067 Angiotensinogen Proteins 0.000 description 1
- SKTGPBFTMNLIHQ-KKUMJFAQSA-N Arg-Glu-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SKTGPBFTMNLIHQ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YKZJPIPFKGYHKY-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKZJPIPFKGYHKY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N Arg-Lys-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O FSNVAJOPUDVQAR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N Asn-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LTZIRYMWOJHRCH-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 1
- OSZBYGVKAFZWKC-FXQIFTODSA-N Asn-Pro-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O OSZBYGVKAFZWKC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SUIJFTJDTJKSRK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N Asn-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O WUQXMTITJLFXAU-JIOCBJNQSA-N 0.000 description 1
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Asp-Ile Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Pro Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 BKOIIURTQAJHAT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- VHUKCUHLFMRHOD-MELADBBJSA-N Asp-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O VHUKCUHLFMRHOD-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 101150076489 B gene Proteins 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 102100029516 Basic salivary proline-rich protein 1 Human genes 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010051479 Bombesin Proteins 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- YNXLOPYTAAFMTN-SBUIBGKBSA-N C([C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(N)=O)C1=CC=C(O)C=C1 Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(N)=O)C1=CC=C(O)C=C1 YNXLOPYTAAFMTN-SBUIBGKBSA-N 0.000 description 1
- 101100497948 Caenorhabditis elegans cyn-1 gene Proteins 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 1
- 102100025841 Cholecystokinin Human genes 0.000 description 1
- 235000001258 Cinchona calisaya Nutrition 0.000 description 1
- 102000008186 Collagen Human genes 0.000 description 1
- 108010035532 Collagen Proteins 0.000 description 1
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 108010068682 Cyclophilins Proteins 0.000 description 1
- 108091028710 DLEU2 Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 229920002491 Diethylaminoethyl-dextran Polymers 0.000 description 1
- 108010065372 Dynorphins Proteins 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 102000002045 Endothelin Human genes 0.000 description 1
- 108010092674 Enkephalins Proteins 0.000 description 1
- 241000991587 Enterovirus C Species 0.000 description 1
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 1
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- 244000228957 Ferula foetida Species 0.000 description 1
- 101150066516 GST gene Proteins 0.000 description 1
- 102000030782 GTP binding Human genes 0.000 description 1
- 108091000058 GTP-Binding Proteins 0.000 description 1
- 101800002068 Galanin Proteins 0.000 description 1
- 101150112014 Gapdh gene Proteins 0.000 description 1
- 102400000921 Gastrin Human genes 0.000 description 1
- 108010052343 Gastrins Proteins 0.000 description 1
- 108700028146 Genetic Enhancer Elements Proteins 0.000 description 1
- 241000193385 Geobacillus stearothermophilus Species 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FGSGPLRPQCZBSQ-AVGNSLFASA-N Glu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FGSGPLRPQCZBSQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KXRORHJIRAOQPG-SOUVJXGZSA-N Glu-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O KXRORHJIRAOQPG-SOUVJXGZSA-N 0.000 description 1
- 108060003199 Glucagon Proteins 0.000 description 1
- 108010021582 Glucokinase Proteins 0.000 description 1
- 108010056771 Glucosidases Proteins 0.000 description 1
- 102000004366 Glucosidases Human genes 0.000 description 1
- DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N Gly-Glu-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N DHDOADIPGZTAHT-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N Gly-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CN UHPAZODVFFYEEL-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N Gly-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN FXGRXIATVXUAHO-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N Gly-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)CN)C(=O)O LYZYGGWCBLBDMC-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 108010086677 Gonadotropins Proteins 0.000 description 1
- 102000006771 Gonadotropins Human genes 0.000 description 1
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 1
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150009006 HIS3 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100021519 Hemoglobin subunit beta Human genes 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- ZSKJIISDJXJQPV-BZSNNMDCSA-N His-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 ZSKJIISDJXJQPV-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 101000684275 Homo sapiens ADP-ribosylation factor 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001125486 Homo sapiens Basic salivary proline-rich protein 1 Proteins 0.000 description 1
- 101100452299 Homo sapiens IGF1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101001130437 Homo sapiens Ras-related protein Rap-2b Proteins 0.000 description 1
- 241000701109 Human adenovirus 2 Species 0.000 description 1
- 241000701044 Human gammaherpesvirus 4 Species 0.000 description 1
- 206010062767 Hypophysitis Diseases 0.000 description 1
- 101150017040 I gene Proteins 0.000 description 1
- 101150062179 II gene Proteins 0.000 description 1
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 102000048143 Insulin-Like Growth Factor II Human genes 0.000 description 1
- 102000036770 Islet Amyloid Polypeptide Human genes 0.000 description 1
- 108010041872 Islet Amyloid Polypeptide Proteins 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N Leu-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN APFJUBGRZGMQFF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N Lys-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AIRZWUMAHCDDHR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YDDDRTIPNTWGIG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N Manganese Chemical compound [Mn] PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101800002739 Melanin-concentrating hormone Proteins 0.000 description 1
- 101710151321 Melanostatin Proteins 0.000 description 1
- YNOVBMBQSQTLFM-DCAQKATOSA-N Met-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YNOVBMBQSQTLFM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N Met-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N Met-Leu-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DBXMFHGGHMXYHY-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AXHNAGAYRGCDLG-UWVGGRQHSA-N Met-Lys-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O AXHNAGAYRGCDLG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000713862 Moloney murine sarcoma virus Species 0.000 description 1
- 101800002372 Motilin Proteins 0.000 description 1
- 241000428199 Mustelinae Species 0.000 description 1
- 102000003505 Myosin Human genes 0.000 description 1
- 108060008487 Myosin Proteins 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N N-L-tyrosyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 108010087066 N2-tryptophyllysine Proteins 0.000 description 1
- 101800001639 Neuromedin-B Proteins 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101800001814 Neurotensin Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102400000050 Oxytocin Human genes 0.000 description 1
- 101800000989 Oxytocin Proteins 0.000 description 1
- XNOPRXBHLZRZKH-UHFFFAOYSA-N Oxytocin Natural products N1C(=O)C(N)CSSCC(C(=O)N2C(CCC2)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C1CC1=CC=C(O)C=C1 XNOPRXBHLZRZKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150012394 PHO5 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150093308 POMC gene Proteins 0.000 description 1
- 241001631646 Papillomaviridae Species 0.000 description 1
- 108010088847 Peptide YY Proteins 0.000 description 1
- 102100029909 Peptide YY Human genes 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 YTILBRIUASDGBL-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- AOKZOUGUMLBPSS-PMVMPFDFSA-N Phe-Trp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AOKZOUGUMLBPSS-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- 102000001105 Phosphofructokinases Human genes 0.000 description 1
- 108010069341 Phosphofructokinases Proteins 0.000 description 1
- 102000012288 Phosphopyruvate Hydratase Human genes 0.000 description 1
- 108010022181 Phosphopyruvate Hydratase Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 241000224486 Physarum polycephalum Species 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VPFGPKIWSDVTOY-SRVKXCTJSA-N Pro-Glu-His Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O VPFGPKIWSDVTOY-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XQHGISDMVBTGAL-ULQDDVLXSA-N Pro-His-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)[O-])NC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H]1[NH2+]CCC1)C1=CC=CC=C1 XQHGISDMVBTGAL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- AJBQTGZIZQXBLT-STQMWFEESA-N Pro-Phe-Gly Chemical compound C([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 AJBQTGZIZQXBLT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 108010011939 Pyruvate Decarboxylase Proteins 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 108090000103 Relaxin Proteins 0.000 description 1
- 101100394989 Rhodopseudomonas palustris (strain ATCC BAA-98 / CGA009) hisI gene Proteins 0.000 description 1
- 108010003581 Ribulose-bisphosphate carboxylase Proteins 0.000 description 1
- 239000012722 SDS sample buffer Substances 0.000 description 1
- 241000277331 Salmonidae Species 0.000 description 1
- 241000242677 Schistosoma japonicum Species 0.000 description 1
- 108010086019 Secretin Proteins 0.000 description 1
- FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N Ser-Asp-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FTVRVZNYIYWJGB-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N Ser-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BXLYSRPHVMCOPS-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 101000983124 Sus scrofa Pancreatic prohormone precursor Proteins 0.000 description 1
- 239000004098 Tetracycline Substances 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N Titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N Trp-Asn-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- ZZDFLJFVSNQINX-HWHUXHBOSA-N Trp-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)O ZZDFLJFVSNQINX-HWHUXHBOSA-N 0.000 description 1
- 102100033254 Tumor suppressor ARF Human genes 0.000 description 1
- 101710102803 Tumor suppressor ARF Proteins 0.000 description 1
- SLCSPPCQWUHPPO-JYJNAYRXSA-N Tyr-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 SLCSPPCQWUHPPO-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- RWOKVQUCENPXGE-IHRRRGAJSA-N Tyr-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O RWOKVQUCENPXGE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SYFHQHYTNCQCCN-MELADBBJSA-N Tyr-Ser-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)C(=O)O SYFHQHYTNCQCCN-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- 108010003205 Vasoactive Intestinal Peptide Proteins 0.000 description 1
- 108010004977 Vasopressins Proteins 0.000 description 1
- IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N WHWLQLKPGQPMY Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C1=CNC=N1 IXKSXJFAGXLQOQ-XISFHERQSA-N 0.000 description 1
- 241000269368 Xenopus laevis Species 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 102000030621 adenylate cyclase Human genes 0.000 description 1
- 108060000200 adenylate cyclase Proteins 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000004931 aggregating effect Effects 0.000 description 1
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000001746 atrial effect Effects 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000004649 carbonic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000000747 cardiac effect Effects 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 239000000919 ceramic Substances 0.000 description 1
- AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N chembl413654 Chemical compound C([C@H](C(=O)NCC(=O)N[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@H](CCSC)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC=1C=CC=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 AOXOCDRNSPFDPE-UKEONUMOSA-N 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- LOUPRKONTZGTKE-UHFFFAOYSA-N cinchonine Natural products C1C(C(C2)C=C)CCN2C1C(O)C1=CC=NC2=CC=C(OC)C=C21 LOUPRKONTZGTKE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001436 collagen Polymers 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N dimethyl 2-(3-ethyl-3-methylpentyl)propanedioate Chemical class CCC(C)(CC)CCC(C(=O)OC)C(=O)OC AIUDWMLXCFRVDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000118 dimethyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000002900 effect on cell Effects 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 1
- ZUBDGKVDJUIMQQ-UBFCDGJISA-N endothelin-1 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1NC(=O)[C@H](CC=2C=CC=CC=2)NC(=O)[C@@H](CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H]2CSSC[C@@H](C(N[C@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N2)=O)NC(=O)[C@@H](CO)NC(=O)[C@H](N)CSSC1)C1=CNC=N1 ZUBDGKVDJUIMQQ-UBFCDGJISA-N 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 210000000571 excretory cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 239000012467 final product Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 102000006602 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 1
- 239000002622 gonadotropin Substances 0.000 description 1
- 239000011544 gradient gel Substances 0.000 description 1
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 1
- 239000007952 growth promoter Substances 0.000 description 1
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 239000012510 hollow fiber Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 101150023479 hsdS gene Proteins 0.000 description 1
- 102000044162 human IGF1 Human genes 0.000 description 1
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 239000008176 lyophilized powder Substances 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011572 manganese Substances 0.000 description 1
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 239000003094 microcapsule Substances 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 239000007758 minimum essential medium Substances 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 229940127240 opiate Drugs 0.000 description 1
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- XNOPRXBHLZRZKH-DSZYJQQASA-N oxytocin Chemical compound C([C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](N)C(=O)N1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(N)=O)=O)[C@@H](C)CC)C1=CC=C(O)C=C1 XNOPRXBHLZRZKH-DSZYJQQASA-N 0.000 description 1
- 229960001723 oxytocin Drugs 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 229940066779 peptones Drugs 0.000 description 1
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 1
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 210000003635 pituitary gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000005373 porous glass Substances 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000004845 protein aggregation Effects 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 229960000948 quinine Drugs 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 1
- 101150079601 recA gene Proteins 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000008844 regulatory mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000003488 releasing hormone Substances 0.000 description 1
- 239000007320 rich medium Substances 0.000 description 1
- 101150116497 sacm1l gene Proteins 0.000 description 1
- 230000018448 secretion by cell Effects 0.000 description 1
- 239000006152 selective media Substances 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000000021 stimulant Substances 0.000 description 1
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000004114 suspension culture Methods 0.000 description 1
- 229960002180 tetracycline Drugs 0.000 description 1
- 229930101283 tetracycline Natural products 0.000 description 1
- 235000019364 tetracycline Nutrition 0.000 description 1
- 150000003522 tetracyclines Chemical class 0.000 description 1
- 229910052719 titanium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010936 titanium Substances 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011573 trace mineral Substances 0.000 description 1
- 235000013619 trace mineral Nutrition 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical compound OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 1
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 108010000998 wheylin-2 peptide Proteins 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
- 108010078692 yeast proteinase B Proteins 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
- C07K1/107—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides
- C07K1/113—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure
- C07K1/1133—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides without change of the primary structure by redox-reactions involving cystein/cystin side chains
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4722—G-proteins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/65—Insulin-like growth factors, i.e. somatomedins, e.g. IGF-1, IGF-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/665—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans derived from pro-opiomelanocortin, pro-enkephalin or pro-dynorphin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/67—General methods for enhancing the expression
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/80—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
- C12N15/81—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2799/00—Uses of viruses
- C12N2799/02—Uses of viruses as vector
- C12N2799/021—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid
- C12N2799/023—Uses of viruses as vector for the expression of a heterologous nucleic acid where the vector is derived from a poxvirus
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Endocrinology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
A találmány a génsebészet területére vonatkozik, speciálisan pedig a 7B2 kísérőként való alkalmazásával foglalkozik in vivő vagy in vitro körülmények között. A találmány ennek megfelelően eljárást mutat be valamely kívánt fehéije előállítására in vivő 7B2-t kifejezni, valamint az említett kívánt fehérjét kifejezni és kiválasztani képes rekombináns sejtek segítségével. A találmány egy más szempontja szerint egy in vitro eljárás a fehéije dezaggregálására vagy aggregálódásának megakadályozására a fehéije 7B2-vel való kezelésével.
Az alábbiakban bemutatjuk a technika állását
A szekréciós fehérjék szállítására sokféle mechanizmus létezik az eukarióta sejtekben. Mindegyik szekréciós sejt képes szekréciós fehéijék kiválasztására fehéijeszintézis útján az endoplazmatikus retikulumban (ER), amelyen keresztül a fehérjék a Golgi készülékbe kerülnek, majd innen az úgynevezett szállító szemcsékbe. A szállító szemcse membránja egyesül a plazma membránnal, majd a szekréciós fehéijék exocitózis útján elhagyhatják a sejtet. Mialatt a szekréciós fehéijék készülnek, rögtön ki is bocsátódnak, tehát a fehéijekibocsátásnak nincs szabályozó mechanizmusa. Ez a fehéije szállítás következésképpen kijelöli a kiválasztódás konstitutív útvonalát is és jelen van minden eukarióta sejtben, ide értve az élesztőt is. A prokarióta sejteknek szintén van egy nem szabályozott, tehát konstitutív fehéijekiválasztási útvonala.
Különböző szekréciós fehéijék kibocsátásáról úgy tudjuk, hogy magasabb fejlettségű eukarióta sejtek egy szűk csoportjában szabályozva vannak. Ezek közé a sejtek közé tartoznak neuronok és endokrin sejtek, tehát a bioaktív fehéijék prekurzorait előállító sejtek. Ezekben a sejtekben a szintézis az ER-ben történik, a szállítás az ER felől a Golgi felé folyik, ahogyan a konstitutív sejtekben is, de utána a Golgitól továbbmegy a szekréciós szemcsék felé. Ezekben a szekréciós szemcsékben a környezet megfelel a prekurzorok speciális poszt-transzlációs módosulatai számára. A fehéije szállítás ezen útját nevezzük szabályozott úrnak. A bioaktív fehéijék exocitózisa csak akkor következik be, ha a sejtet megfelelő külső inger éri. Az ilyen típusú sejtet szabályozott szekréciós sejtnek nevezzük.
Valamely sejt által termelt fehérjék helyes hajtogatását molekuláris kísérő fehéijék biztosítják, amelyek nélkülözhetetlenek a sejt helyes működéséhez, mivel biztosítják, hogy a sejt által termelt fehéijék a kellő módon legyenek hajtogatva. A helyes hajtogatás szükséges ahhoz, hogy a fehéijék a sejten belül a kellő irányba szállítódjanak. így a kísérők nemcsak a helyes fehéije hajtogatáshoz szükségesek, hanem a helyes fehéijeszáUításhoz is. A speciális kísérő fehéijéket például a sejt citoplazmából a sejt organellumokba - mint amilyen a mitokondrium, a kloroplaszt, a sejtmag és az ER - történő szállításnál írták le. E fehéijék közül soknak a termelése olyan sejtekben indukálódik, amelyek hősokknak vannak kitéve, ezért a kísérő fehéijéket gyakran hősokk-fehéijék-nek nevezzük.
A rekombináns bio aktív fehéijék termelése a rekombináns DNS technológia területén elért fejlődés révén vált lehetővé, ezt a gyakorlatban azonban gyakran nem sikerül végrehajtani, mivel az előállítandó heterológ fehéijék gyakori hajtogatása és/vagy szekréciója nem a helyes módon történik vagy nem hatékony. Ilyen probléma általában akkor merül fel, amikor a heterológ fehéijék intenzív kifejeződése olyan sejtben történik, amely nem rendelkezik kellő képességgel a helyes hajtogatáshoz, valamint egy olyan fehéije tetszés szerinti szekréciójához, amely nagy mennyiségben termelődik. A probléma abból adódik, hogy a rekombináns fehérjék olyan nagy mennyiségben termelődnek prokarióta vagy eukarióta sejtekben, hogy a sejtben lévő hajtogató fehéijék tevékenysége nem kielégítő ilyen nagy mennyiségű idegen fehéije hajtogatásához. További problémát jelent, ha rekombináns fehéijét kívánunk előállítani és kiválasztani, de a gazdasejt csak egy nem kielégítő mértékű fehéij eszállító utat tartalmaz. Ezen felül, ha olyan előfehéijéket, mint a neuropeptidek prohormonjai vagy prekurzorai, kívánunk előállítani magasabb fejlettségű eukariótákban úgy, hogy az előfehéijéket a sejten belül kívánjuk bioaktív fehéijévé alakítani, problémák merülnek fel, ha olyan sejteket használunk, amelyek nem tartalmaznak szabályozott szekréciós utat, vagy ilyen utat csak nem kielégítő mértékben tartalmaznak. Az ilyen fehéijék ennek következtében nem mennek át a kellő poszttranszlációs módosulásokon, amelyek ahhoz szükségesek, hogy teljes mértékben biológiailag aktív fehéreként működhessenek. Ez a helyzet különösen olyan rekombináns fehérjék esetében, amelyek a természetben termelődnek és szabályozott fehéije transzporton keresztül bocsátódnak ki.
» ·
További probléma, hogy a fehérjék gyakran hajlamosak aggregálódni oldatban. Az aggregátumok képződése ezután a biológiailag aktív fehérjék aktivitásának csökkenését okozza, illetve megakadályozza a nem hajtogatott vagy rosszul hajtogatott fehérjék helyes hajtogatását in vitro újrahajtogató eljárások során.
Az alábbiakban röviden ismertetjük a találmány tárgyát.
A jelen találmány megoldást ad az ilyen problémákra, amennyiben eljárást nyújt a 7B2 alkalmazására kísérőként in vitro vagy in vivő. A 7B2 kísérőként való alkalmazása lehetővé teszi transzformált gazdasejtekben a fehérjék kellő mértékű termelését, amennyiben a 7B2 a kívánt fehérével együtt fejeződik ki úgy, hogy az utóbbi a gazdasejtben in vivő kezelhető, vagy a fehérjét a 7B2-vel együtt kezelhetjük in vitro.
A 7B2 csak a természetben van jelen és olyan szabályozott sejtekben aktív, mint a neuronok és az endokrin sejtek. A korábbbi szakirodalmakban a 7B2-t úgy igák le, mint lehetséges GTPkötő fehérjét, amely sok más kis GTP-kötő fehéréhez hasonlóan a sejten belül két organellum membrán fúziójában, vagy valamely organellum membrán sejtmembránnal való fúziójában lehet érdekelt.
A jelen találmány azon a meglepő tényen alapul, hogy a 7B2-nek kísérő funkciója van, amely in vitro vagy in vivő használható. In vitro a fehérjék, előnyösen monomer fehérjék dezaggregációjára vagy aggregálódásának megelőzésére, in vivő pedig a rekombináns fehérje gazdasejtből való hatékony termelésére, amennyiben a 7B2 és a rekombináns fehérje együtt fejeződik ki a sejtben.
Az alábbiakban röviden összefoglaljuk a találmányt,
A jelen találmány fehérjeelőállítási eljárásra vonatkozik, amelyet azzal jellemezhetünk, hogy a fehérjét in vivő vagy in vitro 7B2-vel kezeljük. Ennek megfelelően a találmány egy fehérjeelőállítási módszert foglal magában gazdasejt, előnyösen eukarióta gazdasejt segítségével. Ezt a gazdasejtet olyan polipeptidet kódoló genetikai információval transzformáljuk, amely egy bioaktív fehérje vagy annak prekurzora aminosavszekvenciáját ·
tartalmazza. A gazdasejtnek képesnek kell lennie kifejezni ezt a polipeptidet vagy prekurzort. Az eljárást az jellemzi, hogy a sejtet olyan genetikai információval is transzformáljuk, amely lehetővé teszi, hogy a 7B2 az említett polipeptiddel vagy prekurzorral in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid vagy prekurzor dezaggregálódását vagy megfelelő hajtogatással elősegítsük, vagy hogy a polipeptid vagy prekurzor -kívánt esetben a sejt stimulálásával jobb kibocsátásra nagyobb mennyiségben választódjék ki, mint amikor 7B2 nincs jelen.
A találmány egy előnyös kiviteli módja eljárás, amelyben olyan eukarióta gazdasejtet alkalmazunk, amelyben a fehérjeszekréció egy szabályozott útja található. Még inkább előnyös neuronális vagy endokrin sejt alkalmazása. Szintén előnyös egy olyan eljárás, amelyben a polipeptidet vagy prekurzort in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid, miután a sejtet kvánt esetben stimuláltuk felszabadításra, kiválasztódjék. Még előnyösebb kiviteli módban a kiválasztott polipeptid bioaktív fehérje.
Egy másik előnyös kivitek módja eljárás, amelyben élesztősejtet alkalmazunk gazdasejtként. Még előnyösebben az élesztősejtet olyan DNS szekvenciával transzformáljuk, amely egy bioaktív fehérje aminosav-szekvenciájával rendelkező polipeptidet képes kifejezni. Egy még előnyösebb kivitek módban ilyen pohpeptidet választunk ki. Egy még előnyösebb kivitek módban a kiválasztott pokpeptid az IGF-1 aminosav-szekvenciával rendelkezik.
A jelen találmány egy eljárását alkalmazhatjuk olyan pokpeptid előállítására, amely egy olyan bioaktív fehérje aminosav szekvenciájával rendelkezik. Ilyenek pl. a peptid hormonok, neuropeptidek, növekedési faktorok és koaguláló faktorok, előnyösen peptid hormonok vagy neuropeptidek.
A 7B2 jelentését a későbbiekben adjuk meg. Egy igen előnyös kivitek módban a 7B2 humán eredetű.
A találmány vonatkozik ezenkívül egy olyan transzformált gazdasejtre, amely alkalmazható a jelen találmányban. E szerint a találmány magában foglal egy transzformált gazdasejtet, előnyösen eukarióta gazdasejtet. Ez a gazdasejt olyan pohpeptidet kódoló genetikai információval van transzformálva, amely egy bio aktív fehérje vagy ennek prekurzora • · · • · aminosavszekvenciáját tartalmazza. A gazdasejtnek képesnek kell lennie kifejezni ezt a polipeptidet vagy prekurzort. Az eljárást az jellemzi, hogy a sejt olyan genetikai információval van transzformálva, amely lehetővé teszi, hogy a 7B2 az említett polipeptiddel vagy prekurzorral együtt fejeződjék ki, és a polipeptidet vagy prekurzort in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid vagy prekurzor dezaggregálódását vagy megfelelő hajtogatását elősegítsük, és/vagy hogy a polipeptid vagy prekurzor - kívánt esetekben a sejt stimulálásával jobb kibocsátásra - nagyobb mennyiségben választódjék ki, mint amikor 7B2 nincs jelen.
Előnyös gazdasejt egy transzformált eukarióta sejt, amely szabályozott fehérjekiválasztási úttal rendelkezik, előnyösebben neuronális vagy endokrin sejt. Előnyös gazdasejt egy transzformált élesztősejt is.
Egy találmány szerinti transzformált sejtet előnyösen úgy jellemezhetünk, hogy genetikai információval transzformált, amely képessé teszi humán 7B2 kifejezésére.
Egy találmány szerinti transzformált sejt szintén előnyösen jellemezhető azzal, hogy olyan DNS-sel transzformált, amely valamely bioaktív fehéijét kódol. Ezek lehetnek peptid hormonok, neuropeptidek, növekedési faktorok és koaguláló faktorok, előnyösebben peptid hormonok vagy neuropeptidek. A sejtek lehetnek transzformálva olyan DNS-sel, amely egy ilyen bioaktív fehérje prekurzorát kódolja.
Egy találmány szerinti transzformált sejt, különösen egy transzformált élesztősejt legelőnyösebben úgy jellemezhető, hogy IGF-l-t kódoló DNS-sel transzformált.
A találmány előnyösen vonatkozik még fehéije in vitro dezaggregációjára vagy aggregációjának megelőzésére szolgáló eljárásra, amelyet azzal jellemezhetünk, hogy a fehéije vagy aggregátumai 7B2-vel kezeltek.
A találmány vonatkozik 7B2 előállítására szolgáló eljárásra is transzformált sejtben, előnyösen E.coli-ban vagy élesztősejtben.
• 4
Az alábbiakban részletesen ismertetjük a találmányt
A jelen találmány fehérje-előállítási eljárásra vonatkozik, amely azzal jellemezhető, hogy a fehégét 7B2-vel kezeljük in vitro vagy in vivő. Ezen belül a találmány vonatkozik (a) rekombináns fehége előállításának javítására szolgáló eljárásra in vivő, valamint (b) fehérje, előnyösen monomer fehége dezaggregációjára, vagy aggregációjának megelőzésére szolgáló eljárásra, 7B2 alkalmazásával in vitro.
A 7B2 jelen van a szabályozott sejtek, mint például neuronok és endokrin sejtek szabályozott kiválasztási folyamatában, ennek következtében feltehetőleg speciális kölcsönhatásban van az ilyen sejtek által termelt bioaktív fehégék , mint például neuropeptidek vagy peptid hormonok prekurzoraival. Jellemző a kiválasztott bioaktív fehégék, mint például a neuropeptidek vagy peptid hormonok előállítására, hogy a sejten belül elkülönülnek a többi (konstitutív) kiválasztott fehégétől és olyan folyamaton mennek keresztül, amely végül a szabályozott szemcsékhez vezet. A 7B2-re szükség van ehhez az elkülönülési folyamathoz és úgy tűnik, hogy a 7B2 kísérő fehége, amely a kísérők azon csoportjához tartozik, amely felelős a kiválasztott fehégék szabályszerű szállításáért az ER-től a Golgi készüléken keresztül a sejt kiválasztó szemcséiig, valamint a 7B2 szükséges a fehége szállítás szabályozott útjának megfelelő működéséhez a szabályozott sejteken, mint például a neuronális és endokrin sejteken belül. A 7B2 fajlagosan köti bioaktív fehégék prekurzorait és elszállítja őket a fehégeszállítás szabályozott folyamatába. Ilyen kísérőt eddig még nem írtak le. Ezen felül a 7B2 az egyetlen kísérő funkcióval rendelkező fehége, amely egyben kiválasztott fehége (ezáltal képes elhagyni a sejtet).
A jelen találmány első szempontja így azon az új és meglepő felfedezésen alapul, hogy az ismert 7B2 fehége a molekuláris kísérő fehérjék közé tartozik és nyilvánvalóan szerepet játszik bizonyos kiválasztott fehégék szállításában az ER-től a Golgi készüléken keresztül a sejt kiválasztó szemcséiig. A helyes útvonal követése különösen nagy jelentőségű a bioaktív fehégék prekurzorai számára, mivel ezeknek meg kell érkezniük a sejten belül a megfelelő mikrokömyezetbe (tehát a szabályozott útvonal kiválasztó szemcséibe), hogy a speciális poszttranszlációs módosulásokon a megfelelő módon menjenek keresztül. A találmány egy következő szempontja, hogy a 7B2 kísérő funkciója nemcsak szabályozott kiválasztó • · · · • · • · · • · • 4 · «
• ·· • ♦ ···· ·♦ ··· folyamattal rendelkező sejten belüli fehérjék javított termelésében alkalmazható. A 7B2 szubsztrátjaiként szolgáló fehéqék könnyebben állíthatók elő szabályozott kiválasztó folyamattal nem rendelkező prokarióta vagy eukarióta sejtekben is, mivel a 7B2 segíti az említett fehéqék dezaggregációját vagy hajtogatását. Ezáltal a 7B2-vel együtt kifejeződés elősegíti a sejten belüli fehéqék, valamint konstitutív és szabályozott folyamatokban kiválasztott fehéqék termelését. A találmány egy további szempontjában a 7B2 kísérő funkciója alkalmazható in vitro a helyes hajtogatás, valamint előnyösen a fehérjék dezaggregációja, vagy az aggregáció megelőzése elősegítésére.
In vivő alkalmazásban a 7B2-t kódoló DNS a gazdasejtben a kívánt fehérjét kódoló génnel együtt fejeződik ki. Alkalmas gazdasejt például egy prokarióta sejt, mint az E.coli vagy egy eukarióta sejt, előnyösen élesztősejt vagy előnyösen egy szabályozott fehérje kiválasztási folyamattal rendelkező sejt, például neuronális vagy endokrin sejt. A kívánt fehérje 7B2-vel együtt való kifejeződése különösen előnyös, mivel a 7B2 segít megelőzni vagy csökkenteni a hajtogatási problémákat a túltermelő sejtekben; másszóval azokban az esetekben, amikor sejt önmaga nem rendelkezik elegendő kapacitással a (túl)termelt fehérje megfelelő módon való hajtogatásához, például prokarióta sejtben, mint az E.coli, vagy előnyösen élesztősejtben, vagy még előnyösebben olyan sejtben, amelyben a sejt szabályozott útvonallal rendelkezik a szabályozott szemcsékhez való helyes szállításhoz.
Azokat a fehérjéket, amelyek alkalmasak arra, hogy a 7B2 működés alanyaivá váljanak in vivő vagy in vitro, a következőkben írjuk le.
A találmány 7B2 funkciójához kötötten olyan fehéqék találhatók, amelyek a 7B2-töl természetes úton is függenek a megfelelő szállítás érdekében; ilyenek pl. a bioaktív fehérjék, mint például a peptid hormonok és neuropeptidek prekurzorai. Olyan fehérjékről van szó, amelyek szállítódnak, majd elhagyják a sejtet a fehérjeszállítás szabályozott útvonalán keresztül, amely idegsejtekben és endokrin sejtekben van jelen. A 7B2 in vivő vagy in vitro működéséhez alifás alfa-hélixszel rendelkező fehéqék is alkalmas szubsztrátok, például azok, amelyek aminosav száma 10 és 15 között van. Azokban az esetekben, amikor a szerkezet a prekurzor feldolgozása során nem törik szét és ezáltal jelen van a végtermékben, tehát a a ·
bioaktív fehéqében is, a fehérje a 7B2 alkalmas szubsztrátja. A 7B2 in vivő vagy in vitro működéséhez alkalmas szubsztrátok azok a fehéqék is, amelyek oldatban hajlamosak az aggregálódásra.
Lehetséges, hogy a bioaktív fehéqék prekurzorai, mint például a neuropeptidek vagy peptid hormonok speciális doménnel rendelkeznek szerkezetükön belül, amelyet a 7B2 felismer és amelyek részt vesznek a kölcsönhatásban. A prohormonok [tehát olyan nagy fehéqék, amelyek biológiai úton aktív fehéqékké hasíthatok a sejt kiválasztó szemcséin belül, ilyen például a proopiomelanokortin (POMC), amely különböző bioaktív fehéqékké hasítható, például mint az adrenokortikotróp hormon (ACTH), az opiát-szerű B-endorfin peptid és a melanofórastimuláló hormon (MSH)J, szerkezetén belül konszenzus szekvenciát találunk amely jelzőként alkalmazható a kiválasztó fehéqék kiválasztásában a szabályozott kibocsátási útvonalhoz, valamint 7B2-vel való kölcsönhatáshoz (Egy motívumot találtunk proproteinekben és prohormonokban, amely a kiválasztó vezikulumok felé irányítja őket, Biochem. Biophys, Rés. Commun. 174, 586-592, 1991).
A prekurzorok a jelen találmány szövegösszefüggésében olyan proproteineket jelentenek, amelyek biológiailag aktív fehéqékké hasadnak szét; ilyen például a POMC prohormon.
Az új felfedezés, miszerint a 7B2 kísérőként működik, jól alkalmazható, amikor a fehéqék hajtogatása és/vagy kiválasztása nem megfelelő, vagy nem elég hatékonyan vesz részt heterológ fehéqék termelésében rekombináns gazdasejtben. A 7B2 együtt kifejeződése a 7B2 szubsztrát fehéqék in vivő hajtogatási problémái számának csökkenését eredményezi mind prokarióta, mind eukarióta sejtekben. A 7B2 in vivő alkalmazása eukarióta sejtekben előnyös. Különösen előnyös egy 7B2 gén és egy bioaktív fehéqe vagy prekurzorát kódoló gén együttes kifejeződése valamely élesztősejtben, vagy egy egy 7B2 gén és egy bioaktív fehéqe prekurzorát kódoló gén együttes kifejezése valamely, szabályozott fehéqeszállítással rendelkező eukarióta sejtben.
Amennyiben egy fejlettebb eukarióta sejtben történő kifejeződésről van szó, a kívánt végtermékeket, például a bioaktív fehéqéket előnyösen a természetes prekurzor sejten belüli • · előállításával és feldolgozásával állítjuk elő. Ezáltal a találmány egy előnyös kivitek módjában prekurzort állítunk elő és dolgozunk fel megfelelő módon egy rekombináns fejlettebb eukarióta sejtben, ahol a 7B2-nek a bioaktív fehéije prekurzorával együtt való kifejeződése biztosítja, hogy a fehéije a szabályozott kiválasztási útvonalat követi. Egy másik előnyös kivitek módban élesztősejtet használunk, és a bioaktív fehéije előákítására szolgáló eljárások közé tartozik vagy olyan prekurzorok előákítása, amelyek in vitro feldolgozhatok vagy egy fehéije közvetlen termelése, amely a kívánt bioaktív fehéije aminosav szekvenciájával rendelkezik, ez pedig kívánt esetben in vitro újra hajtogatható a bioaktív forma előákítása érdekében.
A következőkben olyan géneket mutatunk be példaként, amelyek termékei a 7B2 szubsztrátjaiként alkalmazhatók a jelen találmányban:
A neuropeptid géncsaládok tagjainak termékei, például az opioid család, különösen az enkefalin gén termékei, a dinorfin gén vagy a pro-opiomelanokortin gén, a hátsó hipofízis termékcsalád, különösen vazopresszin gén vagy az oxitocin gén termékei, a cck/gasztrin család, különösen a gasztrin gén vagy a kolecisztokinin gén termékei, a szomatosztatin család, különösen szomatosztatin gén, a neuropeptid Y gén, a peptid YY gén vagy a pankreász polipeptid gén termékei, a kalcitonin gén család, különösen kalcitonin I gén, a kalcitonin II gén vagy a szigetecske amiloid polipeptid gén termékei, a nátriumürítő faktor géncsalád, különösen a szívpitvari nátriumürítő faktor gén, az agyi nátriumürítő faktor gén vagy C-típusú nátriumürítő faktor gén termékei, a bombezin géncsalád, különösen a gasztrin kibocsátó gén vagy a neuromedin B gén termékei, az endotelin géncsalád, különösen az endotelin 1,2 vagy 3 gén termékei, a szekretin géncsalád, különösen a szekretin gén, a glukagon gén, a vazoaktív intesztinális peptid gén termékei, a gasztrikus inhibitor peptid gén, a növekedési hormon kibocsátó gén vagy a hipofízis adenilát cikláz aktiváló peptid gén termékei, a kinin géncsalád, különösen a tahikinin A vagy B gén, a K-kininogén gén, a neurotenzin gén vagy az angiotenzinogén gén termékei. Más gének termékei, amelyek a jelen találmány szerint állíthatók elő, az inzulin-szerű géncsalád tagjai, különösen az IGF-1 gén, az IGF-2 gén, a relaxin gén vagy az inzulin gén, vagy különböző más gének, különösen a motilin gén, a galanin gén, a kortikotropin kibocsátó gén, a triotropin kibocsátó faktor gén, a gonadotropin kibocsátó ·«· ···· 99 • · « ··• >
♦ * ·· >· · · · «· t faktor gén vagy a melaninkoncentráló hormon gén tagjai. Előnyös termékek az inzulin-szerű géncsalád tagjai, előnyösen az IGF-1 vagy az IGF-2, még előnyösebben az IGF-1. Szintén előnyösek a prolaktin gén és a POMC gén termékei, még előnyösebben a prolaktin illetve az ACTH. Jelen találmány alkalmazható növekedési faktorok (például TGF, NGF és hasonlók),koagulációs faktorok és más vérfehérjék (például VHI faktor, tPA, van Willebrands faktor és hasonlók) termelésére is.
Magasabbrendű eukarióta sejtek a jelen találmánnyal kapcsolatban állati vagy növényi sejtek, előnyösen állati sejtek, még előnyösebben szabályozott fehérje szállítási útvonallal rendelkező sejtek, még előnyösebben endokrin vagy neuronális sejtek lehetnek, beleértve az endokrin vagy neuronális tumor sejtekből származó sejtvonalakat is.
A 7B2 megnevezés jelen találmánnyal kapcsolatban legelőnyösebben humán 7B2-t jelent, ahogyan azt az EP-A 0 315 254 számú európai szabadalmi közrebocsátási irat leírja. A 7B2 megnevezés ugyanakkor nem korlátozódik a humán molekulára, hanem magában foglalja más szervezetek megfelelő fehérjéit is. A humán 7B2 mellett az egér, a szarvasmarha, a pisztráng és Xenopus laevis béka 7B2 fehérje struktúráit írták le, és ezek használhatók a jelen találmányban. Más megfelelő 7B2 fehérjék azonosíthatók az aminosav szekvencia és az ismert 7B2 fehérjék szekvenciájának összehasonlításával, mivel különösen a 7B2 NH2 terminális része erősen konzervált és mivel minden 7B2 fehérje tartalmaz további konvertált szekvenciákat, amelyek hasonlóságot mutatnak minden fajban. A 7B2 kifejezés magában foglalja a természetben előforduló 7B2 fehérjék azon származékait, amelyek 7B2 aktivitással bírnak. Ilyen származékok lehetnek fúziós fehérjék, konjugátumok és különösen fragmentumok, például azok amelyek megfelelnek a humán 7B2 első 137, 149 vagy 170 aminosavjának, előnyösebben az említett humán fragmentumok.
Meglepő, hogy a 7B2 nemcsak olyan sejtekben működik, amelyek szabályozott fehérje előállítási és kiválasztási útvonallal rendelkeznek, hanem prokarióta sejtekből és más eukarióta sejtekből, mint például szabályozott kiválasztási folyamattal nem rendelkező, vagy gomba sejtekből, különösen élesztősejtekből származó heterológ fehérje elkészítésében is működik. Prekurzort kódoló gének, vagy akár fehérje szekvenciákat kódoló gének termékei, ahogyan a természetben egy bioaktív fehérje prekurzorának feldolgozása során megjelennek, tehát a prekurzorok köztes vagy végtermékei a természetben előforduló kiválasztó folyamatokban, nagyobb mennyiségben termelhetők ilyen sejtekben, amennyiben a 7B2-vel együtt fejeződnek ki. A helyes hajtogatásra gyakorolt előnyös hatás hasznos az intracellulárisan tárolt fehérjék termelésénél, különösen ha prokarióta sejtet, például E, coli-t használunk. Még nagyobb előnnyel jár a 7B2 alkalmazása a kiválasztott fehérjék, tehát azon fehérjék, amelyek a sejtben preproteinként termelődnek és jelző szekvenciájuk van, termelésében. A jelen találmánnyal kapcsolatban látható, hogy minden fehérje, amelyet majdan kiválaszt a sejt, funkcionális kapcsolatban termelődik egy jelző szekvenciával, amely lehasad a sejten belül. A prekurzor kifejezés ugyanakkor a jelen találmány vonatkozásában nem azt jelenti jelző szekvenciával rendelkező fehérje (például preprotein), hanem pro-proteint jelent, amely biológiailag aktív fehérjévé dolgozódik fel, ilyen pl. a prohormon POMC. Az mRNS transzlációja után ezek a pro-proteinek kapcsolódhatnak egy jelző szekvenciához is, amennyiben a pro-protein természetes feldolgozási termékét vagy a proproteint magát kívánjuk kiválasztani. Amennyiben egy kiválasztott terméket kívánunk előállítani, a 7B2-nek is kell egy jelző szekvencia, hogy ugyanazon az útvonalon lehessen szállítani, mint a szubsztrát fehérjét.
A jelen találmány ennek megfelelően egy fehérje előállítására vonatkozik, azzal jellemezhetően, hogy a fehérjét in vivő vagy in vitro 7B2-vel kezeljük. így a jelen találmány eljárást tartalmaz fehérje előállítására gazdasejt, előnyösen eukarióta gazdasejt segítségével. Ezt a gazdasejtet olyan polipeptidet kódoló genetikai információval transzformáljuk, amely egy bioaktív fehérje vagy annak prekurzora aminosavszekvenciáját tartalmazza. A gazdasejtnek képesnek kell lennie kifejezni ezt a polipeptidet vagy prekurzort. Az eljárást az jellemzi, hogy a sejtet olyan genetikai információval is transzformáljuk, amely lehetővé teszi, hogy a 7B2 az említett polipeptiddel vagy prekurzorral in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid vagy prekurzor dezaggregálódását vagy megfelelő hajtogatással elősegítsük, vagy hogy a polipeptid vagy prekurzor -kívánt esetben a sejt stimulálásával jobb kibocsátásra - nagyobb mennyiségben választódjék ki, mint amikor 7B2 nincs jelen.
A találmány ennek megfelelően eljárást nyújt bioaktív fehérje előállítására rekombináns eukarióta sejt, előnyösen magasabbrendű eukarióta sejt segítségével, még előnyösebben olyan sejt segítségével, amely szabályozott fehéijekiválasztási útvonallal rendelkezik. Ezek olyan genetikai információval vannak ellátva, amely kívánt bioaktív fehérje, vagy előnyösen egy bioaktív fehérje prekurzor aminosav szekvenciájával rendelkező fehérjét kódol, ezenkívül olyan genetikai információval is el van látva, amely 7B2-t kódol. A sejt képes az említett fehérjét vagy prekurzort a 7B2-vel együtt kifejezni és az említett fehérjét vagy prekurzort olyan módon kezelni, hogy a kívánt bioaktív fehérje - kívánt esetben a sejt kibocsátásra való stimulációja után - kiválasztódjon.
A találmány egy rekombináns eukarióta sejtet, előnyösen magasabbrendű eukarióta sejtet is nyújt, még előnyösebben olyan sejtet, amely szabályozott fehérjekiválasztási útvonallal rendelkezik. Ez olyan genetikai információvan ellátva, amely a kívánt bioaktív fehérje, vagy előnyösen a bioaktív fehérje prekurzorának aminosav szekvenciájával rendelkező fehérjét kódol. Ezenkívül olyan genetikai információval is el van látva, amely 7B2-t kódol, és képes az említett fehérjét vagy prekurzort a 7B2-vel együtt kifejezni, és az említett fehérjét vagy prekurzort olyan módon kezeli, hogy a kívánt bioaktív fehérje - kívánt esetben a sejt kibocsátásra való stimulációja után - kiválasztódjon.
Kívánatos lehet, hogy a bioaktív fehérje sejt általi kiválasztását stimuláljuk. Az, hogy milyen anyagokat használunk a stimulációhoz, bizonyos mértékig az előállításhoz használt sejt típusától függ. Meglehetősen általánosan használható anyag a szekréció stimulálására, különösen a szabályozott típusú eukarióta sejtek esetében, a cAMP, vagy annak származéka, mint például a 8-Br-cAMP.
A taláhnány eljárást szolgáltat még olyan fehérje előállítására, amely egy bioaktív fehéije prekurzorának aminosav szekvenciájával, vagy előnyösen maga a bioaktív fehérje aminosav szekvenciájával rendelkezik, prokarióta vagy eukarióta sejtben, előnyösen élesztősejtben, amelyet olyan genetikai információval van ellátva, hogy egy bioaktív fehéije kívánt prekurzora, vagy előnyösen maga a bioaktív fehérje aminosav szekvenciájával rendelkező fehérjét kódol. Ezenkívül a sejt olyan genetikai információval is el van látva, amely 7B2-t kódol, és a sejt képes az említett fehérjét vagy prekurzort és a 7B2-t együtt kifejezni. A bioaktív fehéije vagy prekurzorának aminosav szekvenciájával rendelkező fehéije a sejten belül úgy kezelődik, hogy elősegítse a dezaggregációt vagy helyes hajtogatást, vagy előnyösen és még előnyösebben az élesztősejtekkel kapcsolatban úgy, hogy kiválasztódjék és visszanyerhető legyen a felülúszóból.
A találmány nyújt még egy rekombináns prokarióta vagy eukarióta sejtet, előnyösen élesztősejtet, amely olyan genetikai információval van ellátva, amely egy bioaktív fehéije kívánt prekurzora, vagy előnyösen maga a bioaktív fehéije aminosav szekvenciájával rendelkező fehérjét kódol. El van látva olyan genetikai információval is, amely a 7B2-t kódolja. A sejt képes az említett fehérjét vagy prekurzort és a 7B2-t együtt kifejezni. A bioaktív fehéije vagy prekurzorának aminosav szekvenciájával rendelkező fehéije a sejten belül úgy kezelődik, hogy a dezaggregáció vagy helyes hajtogatás elő legyen segítve, vagy előnyösen és még előnyösebben az élesztősejtekkel kapcsolatban úgy, hogy kiválasztódjék és visszanyerhető legyen a felülúszóból.
A találmány szerinti eljárás, amely tartalmazza a 7B2 és a heterológ fehéije együtt kifejeződését genetikailag manipulált, szabályozott típusú eukarióta gazdasejtben önmagában ismert eljárás keretében végezhető el, például a rubisco nevű növényi kísérőre leírt eljárás szerint. Hasonlóan a találmány szerinti eljárás, amely tartalmazza egy 7B2 gén és egy bioaktív fehéijét vagy prekurzorát kódoló gén együtt kifejeződését genetikailag manipulált élesztősejtben, önmagában ismert eljárás keretében végezhető el. Mindkét esetben a sejt tartalmaz egy kifejező kazettát a 7B2 kifejezésére és egy kifejező kazettát egy fehéije részére, amelyet az előzőekben írtunk le, és amelyet elő kívánunk állítani. A kifejező kazetta kifejezés egy DNS szekvenciát jelent, amely képes egy polipeptidet kifejezni és tartalmaz egy promotert, ha szükséges, egy jelző szekvenciát, továbbá egy strukturgént, ha szükséges, egy transzkripciós terminátort és kívánt esetben egy transzkripciós erősítőt, riboszóma kötő helyet és/vagy további szabályozó szekvenciákat.
A 7B2 vagy a kívánt fehérje vagy annak prekurzora kifejezésére alkalmas vektorok megalkotásához alkamas eszközök a szakterületen ismert és rendelkezésre álló vektorok és szabályozó szekvenciák. A kifejező vektorok a megszokott technikákkal állíthatók elő. Az • · · · alkalmas vektorokat és szabályozó szekvenciákat a következőkben példákban mutatjuk be a 7B2 termelésére szolgáló 7B2 gén kifejezésénél. Ugyanezen vektorok és szabályozó szekvenciák hasonló módon alkalmazhatók a 7B2 és a kívánt rekombináns fehérje együtt kifejezésére is.
A találmány vonatkozik a 7B2 termelésére önmagában fehérjék in vitro kezelésében való alkalmazásra a fehége dezaggregációjának vagy aggregációja megelőzésének érdekében. A 7B2-t olyan eljárással állítjuk elő, amely egy gazdasejt, előnyösen egy E.coli sejt vagy egy élesztősejt transzformálását foglalja magában olyan hibrid vektorral, amely tartalmaz egy 7B2 előállítására szolgáló kifejező kazettát.
A promoter szekvenciák széles skálája alkalmazható, a gazdasejt természetétől függően. A promoterrre példák a λ Pl, λ Pr, E.coli lac, trp, tac, élesztő TRP1-, ADHI-, ADHII-, PH03-, PH05-, vagy glikolitikus promoterek, mint például az enoláz, gliceraldehid-3-foszfát dehidrogenáz, 3-foszfoglicerát kináz (PGK), hexokináz, piruvát dekarboxiláz, foszfofruktokináz, glukóz-6-foszfát izomeráz, 3-foszfoglicerát mutáz, piruvát kináz, triózfoszfát izomeráz, foszfoglukóz izomeráz és glukokináz gének promotere, vagy eukarióta vírusokból nyert promoterek, pl. SV40, Rous sarcoma vírus, adenovírus 2, szarvasmarha papilloma vírus, papovavírus, citomegalovírusból nyert promoterek vagy emlőssejtből nyert promoterek, mint pl. az aktin, kollagén , miozin vagy β-globin gén promoterei. Az eukarióta promoterek kombinálhatok erősítő szekvenciákkal, mint például az élesztő upstream aktiváló szekvenciák (UAS), vagy vírus vagy sejt erősítőkkel, mint amilyen a cytomegalovírus IE erősítők, S V40 erősítők, immunoglobulin gén erősítők vagy mások.
Az erősítők transzkripció-stimuláló DNS szekvenciák, pl. olyanok, amelyek vírusból származnak, mint amilyen a Simian vírus, a polióma vírus, a szarvasmarha papilloma vírus vagy a Moloney szarkóma vírus, vagy pedig genom eredetűek. Egy erősítő szekvencia származhat a Physarum polycephalum extrakromoszómális riboszóma DNS-éből (PCT/EP 8500278) vagy lehet az upstream aktiváló oldal a PH05 savas foszfatáz génnek (EP Appl. No. 86 111 820.6), vagy a PH05, trp, PH05-GAPDH hibridből (EP Appl. No. 86 111 820.6), vagy a hasonló promotorból.
• « · · • ·
A jelző szekvenciák lehet például egy, a polipeptid szekréciót vezérlő preszekvencia vagy kiválasztó vezető vagy ehhez hasonló. Az élesztősejtben végbemenő kiválasztáshoz alkalmas jelző szekvencia lehet például az SUC2 jelző szekvencia vagy az élesztő alfa-faktor jelző szekvenciája. További jelző szekvenciák ismertek a szakirodalombók pl. azok, amelyeket von Heijne, G. írt le a Nucleic Acid Rés.-ben, 14, 4683 (1986).
A találmány egy előnyös kiviteli módjában a 7B2 gén funkcionálisan kötött az élesztőben funkcionális jelző szekvenciához, például a az SUC2 jelző szekvenciához, vagy a homológ 7B2 szekvenciához. Szintén előnyös egy konstitutív élesztő promoter alkalmazása. A 7B2 kifejező kazetta egy élesztő vektorhoz kötött, az élesztősejteta vektor transzformálja. A 7B2 a felülúszóba választódik ki és a hagyományos eljárásokkal vonható ki, ha szükséges.
A találmány egy másik előnyös kiviteli módjában egy 7B2 gén, vagy még előnyösebben egy heterológ fehérjéhez, előnyösen E.coli fehérjéhez, még előnyösebben a 7B2 izolációját pl. úgy elősegítő fehéréhez, hogy affinitás kromatográfiában használatos ligandhoz fejez ki affinitást, kapcsolt 7B2 kódoló szekvenciát tartalmazó fúziós gén fejeződik ki egy prokarióta sejtben, előnyösen E.coli-ban. valamely promoter ellenőrzése alatt, amely funkcionális az említett sejtben, és a 7B2-t a sejtből kinyeljük. Előnyös, ha a fúziós fehérjét elhasítjuk egy enzimmel úgy, hogy a 7B2 kiszabaduljon a fúziós fehérjéből.
A találmány vonatkozik még egy hibrid vektorra a 7B2 kifejezéséhez élesztő vagy prokarióta sejtben; az említett hibrid vektor tartalmaz egy kifejező kazettát a 7B2 gén kifejezésére.
A jelen találmányban használható hibrid vektorok bármely, a génsebészet területén alkalmazott vektorból nyerhetők, úgy mint vírusokból, fágokból, kozmidokból, plazmidokból vagy kromoszomális DNS-ből, mint amilyen például az SV40, Herpes-vírusok, Papilloma vírusok, Retrovírusok, Baculovírusok, lambda fágok, mint pl. NM 989 vagy EMBL4, vagy M13 fágok, mint például BamHI emésztéssel linearizált M13mp8 fág DNS, bakteriális plazmidok, pl. pBR322, pUC18, vagy élesztő plazmidok, mint például 2μ plazmid, vagy segítő vírus, fág vagy plazmid jelenlétében lévő defektív vírus, fág vagy plazmid, amely segíti a vírus, fág vagy plazmid replikációját, pl. M13(+)KS vektor M14K07 segítő fág jelenlétében, származékai.
«
A találmány hibrid vektorai biztosítják a kívánt DNS replikációját és kívánt esetben kifejeződését alkalmas gazdasejtben, vagy úgy mint extrakromoszomális elem, vagy a gazdakromoszómába való integráció útján. Sokféle lehetséges vektorrendszer áll rendelkezésre a találmány szerinti klónozott DNS integrációjára és kifejezésére. Elvben minden vektor, amely replikái, vagy replikái és kifejez egy kívánt polipeptid gént és egy találmány szerinti kifejező kazettában található a kiválasztott gazdasejtben, alkalmas. A vektort a transzformációra kiszemelt gazdasejt függvényében választjuk ki. Elvben a találmány szerinti hibrid vektorok tartalmazzák a kívánt kifejező kazettát, amint azt korábban említettük, egy replikációs origót vagy egy önmagától replikálódó szekvenciát, domináns marker szekvenciákat, kívánt esetben kifejezést ellenőrző kontroll szekvenciákat, amelyek nélkülözhetetlenek a kívánt DNS transzkripciójához és transzlációjához, és kívánt esetben a kívánt termék kiválasztásához és kívánt esetben további restrikciós helyeket.
A replikációs origót vagy egy önmagától replikálódó szekvenciát (DNS darab, amely átviszi az önmagától való replikálódás képességét extrakromoszomális részekbe) vagy a vektor olyan megszerkesztése biztosítja, hogy exogén origót tartalmazzon, amely például Simian vírusból (SV 40), vagy más vírusforrásból származik, vagy a gazdasejt kromoszómális mechanizmusa.
Egy találmány szerinti hibrid vektor tartalmazhat szelektív markereket a transzformálandó, szelektálandó vagy klónozandó gazdaszervezettől függően. Bármely marker gén használható, amely lehetővé teszi a transzformánsok szelektálását a marker fenotípusos kifejeződésének megfelelően. Megfelelő markerek különösen azok, amelyek antibiotikus rezisztenciát fejeznek ki, pl. tetraciklinnel vagy ampicillinnel szemben, vagy auxotróf gomba mutánsok esetében olyan gének, amelyek a gazda hiányosságainak pótlására szolgálnak. A megfelelő gének például rezisztenciát adnak át ciklohemixid antibiotikumokba, vagy prototrófíát biztosítanak egy auxotrofíkus élesztő mutánsban, ilyenek például az ura3, leu2, his3 vagy trpl gének. Szintén lehetséges markerekként alkalmazni struktúrális géneket, amelyek önmagától replikálódó szegmensekhez kapcsolódnak, feltéve, hogy a transzformálandó gazda auxotróf a marker által kifejezett termékre nézve.
• · • 4
A találmány vonatkozik továbbá egy transzformált gazdasejtre a találmány szerinti rekombináns DNS molekulák erősítésére, vagy különösen egy kifejező kazetta kifejezésére, amelyet valamely találmány szerinti DNS molekula tartalmaz, vagy 7B2 és a kívánt fehéije együtt kifejezése céljából, vagy a 7B2 önmagában való termelésére.
Az alkalmas, különösen a találmány szerinti rekombináns DNS molekulák erősítésére vonatkozóan alkalmas gazdaszervezetekre példák az olyan mikroorganizmusok, amelyeknek nincs restrikciós enzimjük, vagy modifikációs enzimjük, vagy csak kevés van belőlük, mint amilyenek például bizonyos baktériumok, különösen az Escherichia coli különböző törzsei, például az E.coli X1776, E.coli Y1090, E.coli W3110, E.coli HB101/LM1035, E.coli JA221, E.coli DH5alfa, vagy előnyösen E.coli DH5alfaF', JM109, MH1 vagy HB101, vagy az E.coli K12 törzs, Bacillus subtilis, Bacillus stearothermophilus. Pseudomonas. Haemophylus, Streptococcus és mások, valamint élesztők, például Saccharomyces cerevisiae, mint amilyen a S.cerevisiae GRF 18. További alkalmas gazdasejtek fejlettebb szervezetek sejtjei, különösen folytonossá lett humán vagy állati sejtvonalak, pl. L132 humán embrionális tüdő fibroblasztok, Bowes humán rosszindulatú melanóma sejtek, HeLa sejtek, COS-7 afrikai zöld majom SV40 vírussal transzformált vesesejtjei, vagy kínai hörcsög petesejtjei (CHO). Különös jelentőséggel bírnak a 7B2 és a bioaktív fehéije prekurzorának együtt kifejezésével előállított bioaktív fehéije előállítása szempontjából azok a sejtvonalak, amelyek neuronális vagy endokrin tumor sejtekből származnak.
A találmány vonatkozik az ilyen transzformánsok előállítására szolgáló eljárásra is, amely áll egy alkalmas gazdasejt transzformáló körülmények közötti kezeléséből a jelen találmány szerinti rekombináns DNS molekulával, különösen valamely találmány szerinti hibrid vektorral, kívánt esetben egy szelekciós marker génnel együtt, valamint tetszés szerint szelektálva a transzformánsokat.
A mikroorganizmusok transzformációját a szakirodalomban leírtaknak megfelelően hagyományos eljárásokkal végezzük, pl. S.cerevisiae-nél (A.Hinnen és társai., Proc.Natl.Acad.Sci. USA, 75, 1929, 1978), B.subtilis-nél (Anagnostopoulos és társai,
J.Bacteriol.81, 741, 1961), és E.coh-nál (M.Mandel és társai, J.Mol.Biol. 53, 159, 1970).
* · · « * «
Ennek megfelelően az E.coli sejtek transzformációs eljárása tartalmazza például a sejtek Ca^+ előkezelését, hogy ezáltal lehetővé tegyük a DNS felvételt, valamint a hibrid vektorral való inkubációt. A transzformált sejt ezt követő szelekciója megvalósítható például a a sejt átvitelével egy szelektív növesztő tápközegbe, amely lehetővé teszi a transzformált sejtek elválasztását a szülő sejtektől, a vektor DNS marker szekvenciája természetétől függően· Előnyösen olyan növesztő tápközeget használunk, amely nem engedi növekedni azon sejteket, amelyek nem tartalmazzák a vektort. Az élesztő transzformációja áll például a sejtfal glukozidázokkal való enzimatikus eltávolításából, a kapott szferoplasztok vektorral való kezeléséből polietilén glikol és Ca^+ ionok jelenlétében, majd a sejtfal regenerációjából a szferoplasztok agarba való ágyazása által. A regeneráló agart előnyösen úgy készítjük, hogy lehetővé tegye a transzformált sejtek regenerációját és szelekcióját a fent leírtaknak megfelelően, egy időben.
A magasabbrendú eukarióta eredetű sejtek, mint például emlős sejtvonalak transzformációja előnyösen transzfekcióval történik. A transzfekciót hagyományos módszerekkel végezzük, mint például kalcium foszfátos kicsapatás, mikroinjektálás, protoplaszt fúzió, elektroporáció, tehát a DNS bevezetése rövid elektromos impulzus segítségével, amely átmenetileg megnöveli a sejtmembrán permeabilitását, vagy segítő vegyületek, például dietil-amino-etil-dextrán, dimetil szulfoxid, glicerin vagy polietilén glikol és hasonlók jelenlétében. A transzfekciós eljárás után a transzfektált sejtet azonosítjuk és szelektáljuk, például a szelekciós marker természetének megfelelően választott szelektív közegben való tenyésztéssel, amilyenek például a standard tenyészközegek, mint a Dulbecco-féle módosított Eagle közeg (DMEM), a minimális esszenciális tápközeg, az RPMI 1640 tápközeg és hasonlók, amelyek tartalmazzák pl. a megfelelő antibiotikumot.
A transzformált gazdasejteket a szakterületen ismert eljárásokkal tenyésztjük folyékony tápközegben, amely asszimilálható szénforrásokat tartalmaz, mint például szénhidrátokat, mint a glükóz vagy laktóz, nitrogént, például aminosavakat, peptideket, fehéreket, vagy ezek lebontási termékeit, mint például peptonokat, ammóniumsókat vagy hasonlókat, és szervetlen sókat, például nátrium, kálium, magnézium és kalcium szulfátjait, foszfátjait és/vagy • · 4 · · · 4 « k « « 4 •· »44 «4 karbonátjait. A közegek tartalmaznak még például növekedés-serkentő anyagokat, valamint nyomelemeket, például cinket, mangánt és hasonlókat.
A tápközeget előnyösen úgy választjuk, hogy szelekciós nyomást fejtsen ki és akadályozza meg azon sejtek növekedését, amelyek nem transzformálódtak vagy elvesztették a hibrid vektort, így például antibiotikumot adunk a közeghez, ha a hibrid vektor antibiotikum rezisztencia gént, mint markert tartalmaz. Ha például olyan gazdasejtet alkalmazunk, amely létfontosságú aminosavban auxotróf, míg a hibrid vektor olyan gént tartalmaz, amely egy enzimet kódol, amely kijavítja a gazdaszervezet hibáit, az említett aminosavból hiányos minimális tápközeget alkalmazunk a transzformált sejt tenyésztésére.
Magasabbrendű eukarióta eredetű sejteket, mint például emlős sejteket tenyésztünk a szövettenyészetnek megfelelő körülmények között, kereskedelemben beszerezhető tápközeg, például Dulbecco-féle módosított Eagle tápközeg (DMEM), minimum essential közeg, RPMI 1640 tápközeg és hasonlók alkalmazásával, ahogy fentebb említettük, tetszés szerint kiegészítve növekedés-serkentő anyagokkal és/vagy emlős szérumokkal. A szövettenyészeten folyó sejttenyésztés technológiája jól ismert a szakterületen, ide tartoznak a homogén szuszpenziós tenyészetek, pl. levegőemelő reaktorban, vagy állandó keverésű reaktorban, vagy immobilizált, vagy befogott tenyészetek, mint pl. üreges szálakban, mikrokapszulákban, agaróz mikrogyöngyökön, porózus üvegágyakon, kerámia gyertyákon vagy más mikrohordozókon.
A tenyésztést a szakterületen ismert módon végezzük. A tenyésztés körülményeit, mint a közeg hőmérsékletét, pH értékét és a fermentációs időt úgy választjuk meg, hogy a találmány szerinti polipeptid vagy származéka maximális titerjét kapjuk.
Annak érdekében, hogy lehetővé tegyük a transzformált sejtek különválogatását a nem transzformált sejtektől, a találmány szerinti DNS molekulák egy szelekciós markert hordoznak, vagy pedig a sejteket egy ilyen markert tartalmazó vektorral együtt transzformáljuk. Mivel más rendszerekben az ilyen szelekciós marker kifejezhető struktúrális gén, ennek polipeptidje (egy enzim) rezisztenciát nyújt az olyan vegyületek ellen, amelyek toxikusak a fogadó szervezetre,
4*4«
4 vagy kiegészíti az olyan mutáns enzimrendszerét, amelyben az ilyen létfontosságú polipeptidböl hiány van.
A 7B2 in vivő előnyein túl, meglepő módon dezaggregáló ágensként is szolgál in vitro, tehát képes a fehéije, előnyösen monomer fehéije inaktív oldott aggregátumait biológiailag aktív fehérjékké transzformálni, illetve megakadályozni a fehéije, előnyösen monomer fehérje aggregációját inaktív aggregátumokká.
A találmány így eljárást nyújt fehéije, előnyösen monomer fehéije dezaggregációjára vagy aggregációjának megelőzésére, ami áll a fehérje inaktív aggregátumainak, ide értve oldható inaktív aggregátumokat is, 7B2-vel való kezeléséből dezaggregált fehéijék, előnyösen monomer fehéijék előállítása céljából. All az eljárás még a dezaggregált fehéijék, előnyösen monomer fehéijék 7B2-vel való kezeléséből, ezek aggregációjának megelőzése céljából. A fehéijék dezaggregációja vagy aggregációjának megelőzése fontos, mivel az aggregáció inaktiválja a biológiailag aktív fehéijéket, illetve mivel a dezaggregált fehéijék újrahajtogatódhatnak aktív fehéijékké, míg az aggregátumok nem hajtogathatok újra.
A találmány szerinti ezen eljárás különösen jól jellemezhető azzal, hogy a fehéijét, előnyösen monomer fehéijét 7B2-vel kezeljük az aggregáció megelőzése érdekében, vagy azzal, hogy a fehéije, előnyösen monomer fehéije aggregátumait 7B2-vel kezeljük a fehéije dezaggregációja érdekében. A kezelés alkalmas puffer oldatokban végezhető, pl. foszfát vagy trisz pufferben, vagy például akár olyan sejtek felülúszóiban, amelyek kiválasztották a fehéijét. Dezaggregáció céljából a kezelendő fehéijét és a 7B2-t összekeverjük és néhány perctől néhány óráig terjedő időtartamban inkubáljuk, például 30 perc és 1 óra között, 4°C és 30°C közötti hőmérsékleten, kívánt esetben ATP jelenlétében, amely alkalmazása esetén előnyösen 1 és 10 mM közötti koncentrációban alkalmazandó. Az aggregáció megelőzésére a 7B2-t és az aggregációjában megakadályozandó fehérjét összekeveijük és a fehérjét 7B2 jelenlétében a szokott körülmények között tartjuk. A 7B2 adható még például élesztősejt-tenyészethez is, amely kiválasztja a fehérjét, amelynek nem szabad aggregálódnia.
·· « · ·« ·
In vitro alkalmazás céljára a 7B2-t genetikai úton állítjuk elő pro- vagy eukarióta sejtekben, például E.coli-ban vagy élesztősejtekben, a sejtekből izolálva, vagy, amennyiben az elkészült 7B2 kiválasztódik, a felülúszóból izolálva, és hozzáadjuk a fehérjéhez, amelyet dezaggregálni kívánunk, vagy amelynek aggregációját meg kívánjuk előzni.
A jelen találmány legelőnyösebb kiviteli módjait a kiviteli példákban írjuk le. A találmány ugyanakkor a példákban leírt egyes kiviteli módok lehetséges variánsait és megfelelőit is.
A példák illusztrálni hivatottak a találmányt. A találmány oltalmi körét ugyanakkor nem korlátozzák.
Az alábbiakban röviden ismertetjük az ábrákat
Az 1. ábra mutatja be a pGEX-2T-7B2 klón megalkotását. A pGEX-2T vektor MCS-ében lévő BamEH helyet Klenow polimeráz alkalmazásával töltjük be, majd a h7B2-cDNS (a pAB 1-ből) egy EcoRV-EcoRI fragmentumát a Smal/EcoRI helyekbe klónozzuk. A fúziós fehérje aminosav szekvenciájában az Sj26 és 7B2 között lévő átmeneti területen trombin felismerő hely van.
A 2. ábra mutatja be a pGEX-KG prokarióta kifejezési vektor megalkotását, amelyet a pGEX2T vektorból kapunk egy, többszörös klónozó helyeket bíró kapcsoló EcoRI helybe való beiktatásával.
Kivitek példák
1. példa: Rekombináns humán 7B2 előállítása E.coh-ban (pGEX-2T/7B2 klón)
A pGEX-2T prokarióta kifejező vektor (Amrad Corporation Limited, Melbourne, Victoria, Ausztráha) hordozza a Schistosoma japonicum glutation S-transzferáz (GST) génjét, egy tacpromoterhez képest lefelé. Annak érdekében, hogy ezt a vektort alkalmassá tegyük a 7B2, mint a GST-vel való fúziós vektor kifejezésére Escherichia cok-ban, egy leolvasókeretet elcsúszást kék a sokszoros klónozó helybe juttatnunk a GST gén 3' végénél. Ennek érdekében a pGEX2T vektort BamHI-vel emésztjük és a bemélyedő 3' végeket a DNS polimeráz I Klenow • · < ·* ··«« ·· • « · 9 »· • 4 ♦ · · ··· · • · · · · 44 ·« ···· ·* ··· ·· 23 fragmentumával töltjük be. A kapott tompa végek ligálása egy módosított pGEX-2T vektort eredményez 4 hozzáadott bázispárral, amelyek alternatív leolvasókeretet képeznek. Ezt a vektort Smal-vel és EcoRI-vel emésztjük és egy 1.0 kb-s EcoRV-EcoRI cDNS fragmentumot - amely a humán 7B2 14-185 aminosavait kódolja (a 7B2 szekvenciát lásd EP-A-0 315 254) ligálunk a módosított vektor Sma/EcoRI helyeibe. A kapott plazmidot Escherichia coli törzs JM101 hsdS recA-ba transzformáljuk, amely így tartalmazza a pGEX-2T/7B2 kiónt.
pGEX-2T/7B2 plazmidot (pGEX-2T/7B2 klón) tartalmazó, egy éjszakán át tenyésztett baktérium tenyészetet 20-szorosan hígítunk 200 ml, ampicillint (70 pg/ml) is tartalmazó LB tápközegben és egy órán keresztül 37 °C-on növesztjük. A fúziós fehérje kifejezésének indukálására IPTG-t (izopropil β-D-tiogalaktopiranozid; Sigma) adunk 0.5 mM végső koncentrációig, majd a tenyészetet további 3 órán keresztül növesztjük. A sejteket centrifugálással nyerjük ki (5 perc, 5000 fordulat/perc), majd ultrahanggal lizáljuk (10-szer, mindegyik 20 mp) 3 ml lizáló pufferban, amely 50 mM Tris-t, pH 7.5; 50 mM NaCl-t; 1% (térfogat/térfogat) Triton Χ-100-at; 250 mM guanidin hidrokloridot; 1 mM etilén-diamin-tetraacetátot (EDTA), 10 mM ditiotreitol-t (DTT) és 1 mM fenil-metil-szulfonil-fluoridot (PMSF) tartalmaz. A lizátumot 5000 fordulat/perc fordulatszámmal, 10 percen keresztül 4 °C-on centrifugáljuk és a fúziós fehérjét a felülúszóból izoláljuk affinitás kromatográfiával, glutation agarózzal (Sigma, G4510). Ehhez a felülúszót 500 ml 50%-os (térfogat/térfogat) glutation agarózzal keveijük össze, amely a lízis pufferben egyenlítődik ki. A keverék 20 perces inkubálása után, a minta állandó, 4 °C-on való kevertetése mellett, a keveréket centrifugáljuk (30 perc, 5000 fordulat/perc), a gyöngyöket háromszor mossuk 3 ml lizáló pufferral és ötször 30 ml trombin hasító pufferral (50 mM Tris, pH 5,5; 150 mM NaCl; 2,5 mM CaC12). Az utolsó mosás után a gyöngyöket 2 pg trombint (humán plazmából nyert, liofilizált por; Sigma, T6759) tartalmazó 500 μΐ trombin hasító pufferban szuszpendáljuk és a keveréket 10 percig szobahőmérsékleten rázzuk. A hasító reakciót PMSF (1 mM végső koncentráció) hozzáadásával és a minta jégre való helyezésével állítjuk meg.
A kapott 7B2-ben nincs meg a felnőtt humán 7B2 jelző peptidje és első 13 aminosava, viszont néggyel több N-terminális aminosavat tartalmaz.
Ml ·· «« · » ···« * · · 4 4 · • <44 4·· • 4 · ·· • »4·· ··**4
A trombin eltávolítása érdekében 200 μΐ 50%-os (térfogat/térfogat) p-aminobenzamidin-agaróz (Sigma A 7155) szuszpenziót adunk a felülúszóhoz, hogy eltávolítsuk a fúziós fehérje esetleges maradékait. 10 perc inkubáció (4 °C) után eltávolítjuk az agaróz gyöngyöket és a tisztított 7B2-t -80 °C-on tároljuk vagy liofilizálás után -20 °C-on tároljuk. A kinyert tisztított (tisztaság>95%) rekombináns 7B2 mennyisége 0.5 pg/μΐ. Hasonló eredményeket kapunk, amikor a pGEX-2T/7B2 konstrukciót más E.coli törzsekbe, mint RR1, HB101, C600 vagy DH5alfa transzformáljuk.
A fehéije mintákat 12,5% SDS-poliakrilamid gél elektroforézis (SDS-PAGE) segítségével analizáljuk (Laemmli, 1970), amelyet vagy a gél festése követ 0,2% Coomassie Brilliant Blue R250 oldattal (50% metanol, 7,5% ecetsav) vagy pedig Western foltképzést alkalmazunk. A Western folt analízishez a fehéijék szétválasztása után az SDS-gélt foltképző pufferban (150 mM glicin, 20 mM tris, 20% metanol) 15 percig kiegyensúlyozzuk. A fehéijék elektroforetikus átvitelét nitrocellulózba foltképző pufferban visszük végbe 16 órán keresztül 100 mA-n. A foltokat foszfáttal pufferolt fiziológiás sóoldatban (PBS, 50 mM NaHPC>4, pH 7,3; 120 mM NaCl) öblítjük le és egy órán keresztül blokkoló pufferban (3% tyúktojás albumin (CEA), 1% normál kecskeszérum (NGS) és 3% triton PBS-ben) blokkoljuk. Az antitest inkubációt szobahőmérsékleten végezzük a MON-102 és MON-104 (tenyészet felülúszók) anti-7B2 monoklonális antitestek alkalmazásával [van Duijnhoven, H.L.P. és társai, J. Immunoi. Methods, 142:187-198(1991)], majd 1:500 arányban, blokkoló pufferban felhígítjuk. Két óra múlva a meg nem kötött anyagot a folt 3-szori öblítő pufferral (PBS 0,5% CEA-val, 0,2% NGS-sel és 0,3% tritonnal) való öblítésével eltávolítjuk. A nitrocellulóz szűrőt ezután 2 órán keresztül ebben a pufferban inkubáljuk, amely peroxidázzal jelzett kecske-anti-egér antitesteket (GAM/PO, 1:1000) is tartalmaz.
···« ·4 ·· ···· ·· ····«« · · « · ♦ ♦ ♦·· ··· • * · · · « · ·· ··»· ·-« · ♦· ··
2,példa: Rekombináns 7B2 gének előállítása eukarióta sejtekben való kifejezés céliából
2a példa: Amino-terminális 7B2 jelző peptidet és a teljes humán fehérjét kódoló 7B2 gén előállítása
A fenti gén élesztő kifejező vektorban való kényelmes klónozása céljából polimeráz láncreakciót (PCR) végzünk a teljes humán cDNS-en, amely PEC7B2 plazmidban van kódolva [Martens, FEBS Letts., 234:160-164 (1988); a humán 7B2 cDNS-ének DNS szekvenciáját az EP-A-0 315 254 írja le], két dezoxi-oligoribonukleotid, mint primer alkalmazásával (lásd SEQ ID NO: 1 és 2). A humán cDNS-t 30 ciklus PCR segítségével erősítjük. Egy 54 bázispár hosszúságú 7B2 jelző szekvenciát (SEQ ID No:3) tartalmazó EcoRI-Sphl fragmentumot, a 7B2 gén 555 bázispár hosszúságú kódoló régióját, valamint egy stop kodont (SEQ ID No:4) Egálunk a pUC19 plazmidba [Boehringer Mannheim GmbH, Németország], amelyet teljesen emésztünk EcoRI-vel és SphI-vel. A ligációs keverék egy alikvotját kalciummal kezelt, transzformáció-kompetens E.coli HB101 sejtekhez [Invitrogen, San Diego, USA] adjuk. Hat ampicillin-rezisztens E.coli transzformánst tenyésztünk 100 mg/1 ampicillin jelenlétében. Plazmid DNS-t állítunk elő és elemezzük EcoRI/SphI-vel, EcoRI/Pstlvel, SacI/KpnI-vel, EcoRI/BamHI-vel és Xbal/HindlII-vel való emésztéssel. Egy, a várt restrikciós fragmentumokkal rendelkező kiónt kiválasztunk és pUC19/EcoRI-SphI/7B2ss-7B2nek nevezzük el [ahol a 7B2ss jelzi a humán 7B2 18 aminosavból álló jelző szekvenciáját],
2b példa: Csonkított 7B2 gén előállítása, amely a humán fehége amino-terminális 7B2 jelző peptidjét és első 137 aminosavját kódolja
A fenti gén előállítása céljából PCR-t végzünk a teljes humán cDNS-en (mint a 2a példában) két dezoxi-oligoribonukleotid alkalmazásával (lásd SEQ ID No:l és 5) primerként. A humán cDNS-t a 2a példában leírtaknak megfelelően erősítjük. Egy, a 18 aminosavas 7B2 jelző peptidet (lásd a 2a példát), a humán 7B2 137 aminosavját és egy stop kodont kódoló mintegy 480 bázispár hosszúságú EcoRI-Sphl fragmentumot ligálunk a pUC19 plazmidhoz, mint a 2a példában. Plazmid DNS-t készítünk a transzformánsokból, és elemezzük EcoRI/SphI-vel, EcoRI/Pstl-vel, SacI/KpnI-vel és Xbal/HindlII-vel végzett emésztéssel. Egy, a várt restrikciós *♦·> ·« ·· ···· ·· • 9 ·« «9 · · • · · 9 »99 999 *’·· *”* **·* ··* fragmentumokkal rendelkező kiónt kiválasztunk és pUC19ZEcoRI-SphI/7B2ss-7BA 1-nek nevezzük el.
2c példa: Csonkított 7B2 gén előállítása, amely a humán fehérje amino-termjnális 7B2 jelző peptidiét és első 149 aminosaviát kódolja
A fenti gén előállítása céljából PCR-t végzünk a teljes humán cDNS-en (mint a 2a példában) két deoxi-oligoribonukleotid alkalmazásával (lásd SEQ ID No: 1 és 6). A humán a cDNS-t a 2a példában leírtaknak megfelelően erősítjük. Egy, a 18 aminosavas 7B2 jelző peptidet (lásd a 2a példát), a humán 7B2 149 aminosavját és egy stop kodont kódoló mintegy 515 bázispár hosszúságú EcoRI-Sphl fragmentumot ligálunk a pUC19 plazmidhoz, amelyet EcoRI-vel és HindIII-al teljesen emésztünk. Plazmid DNS-t készítünk a transzformánsokból és elemezzük EcoRI/HindlII-al, EcoRI/Pstl-vel, SacI/KpnI-vel és Xbal/HrndlII-vel végzett emésztéssel. Egy, a várt restrikciós fragmentumokkal rendelkező kiónt kiválasztunk és pUC19/EcoRIHrndHI/7B2ss-7B2A2-nek nevezzük el.
2d példa: Csonkított 7B2 gén előállítása, amely a humán fehérje amino-terminális 7B2 jelző peptidiét és első 170 aminosaviát kódolja
A fenti gén előállítása céljából PCR-t végzünk a teljes humán cDNS-en (mint a 2a példában) két deoxi-oligoribonukleotid alkalmazásával (lásd SEQ ID No: 1 és 7). A humán a cDNS-t a 2a példában leírtaknak megfelelően erősítjük. Egy, a 18 aminosavas 7B2 jelző peptidet (lásd a 2a példát), a humán 7B2 170 aminosavját és egy stop kodont kódoló mintegy 580 bázispár hosszúságú EcoRI-Sphl fragmentumot ligálunk a pUC19 plazmidhoz, mint a 2c példában. Plazmid DNS-t készítünk a transzformánsokból és elemezzük EcoRI/HindlII-al, EcoRI/Pstlvel, SacI/KpnI-vel és Xbal/HindlII-vel végzett emésztéssel. Egy, a várt restrikciós fragmentumokkal rendelkező egy kiónt kiválasztunk és pUC19/EcoRI-HindIII/7B2ss-7B2A3nak nevezzük el.
• «
3. példa: 7B2 előállítása élesztőseitekben
3a példa: Az élesztő SUC2 gén-bői származó amino-terminális ielzőpeptidet és a teljes humán 7B2-t kódoló gén megalkotása
A pUC19/BamHI-XhoI/GAPDH-IT plazmid tartalmazza a S.cerevisiae GAPDH gén 400 bázispár hosszúságú promoter régióját, valamint a S.cerevisiae SUC2 gén [a továbbiakban invertáz jelző szekvenciának vagy csak Invss-nek (SEQ ID No:8) hívjuk] kémiailag szintetizált jelző szekvenciájának 57 bázispáiját. A promoter és a jelző egy EcoRI hellyel kapcsolódik egymáshoz. A plazmidot Xhol-vel teljesen emésztjük és a ragadós véget T4‘ polimerázzal töltjük be. Ncol kapcsolókat adunk a tompa végű DNS-hez. BamHI-gyel és Ncol-gyel végzett emésztés után egy mintegy 465 bp-s BamHI-NcoI fragmentumot izolálunk.
A PEC7B2 plazmidot (lásd a 2a példa) teljesen emésztjük EcoRI-gyel és a tapadós végeket T4 polimerázzal. Ncol kapcsolókat adunk a tompa végű DNS-hez. Sacl-gyel és Ncol-gyel történő emésztés után egy, a 7B2 gén 5' végét tartalmazó mintegy 270 bázispár hosszúságú NcoI-SacI fragmentumot izolálunk.
Az izolált mintegy 465 bázispár hosszúságú BamHI-NcoI és a mintegy 270 bázispár hosszúságú NcoI-SacI fragmentumokat a pUC19 plazmidba szubklónozzuk, amelyet BamHISacl-vel teljesen emésztünk. Az E.coli HB101-be való transzformáció után 6 transzformánsból nyert DNS-t BamHI/SacI-el és BamEH/HindlII-al elemzünk. Egy helyes klónt pUC19/BamHISacI/GAPDH-Invss-7B2-nek nevezünk (nem egzakt konstrukció). Ebben a konstrukcióban az invertáz jelző szekvencia kódoló régiója nincs egy keretben a 7B2-ével.
Az invertáz jelző szekvenciát a 7B2 kódoló régióval egy keretben tartalmazó egzakt konstrukciót PCR-rel álltjuk elő, három dezoxi-oligoribonukleotid primer (lásd SEQ ID No:9, 10 és 11) alkalmazásával. A helyre irányuló deléciós mutagenezis létrehozásához alkalmazott templát a pUC19/BamHI-SacI/GAPDH-Invss-7B2 (nem egzakt konstrukció). A SEQ ID No:9 és 10 primereket a PCR első fordulójában alkalmazzuk, hogy mintegy 180 bázispár hosszúságú, az invertáz jelző szekvencia egy részét a 7B2 génnel egy keretben kódoló fragmentumot kapjunk. A PCR második fordulójában a mintegy 180 bázispár hosszúságú, a • ·
PCR első fordulójában kapott denaturált fragmentumot és a SEQ ID No: 11 primeijét alkalmazzuk, hogy mintegy 220 bázispár hosszúságú EcoRI-SacI fragmentumot kapjunk, amely a teljes invertáz jelző szekvenciát a 7B2 gén egy részével (a gén 5' vége) egy keretben kódolja. Ezt a fragmentumot pUC 19-be szubklónozzuk, majd teljesen emésztjük EcoRI-el és Sacl-el. Hat E.coli HB101 transzformánsból DNS-t kapunk. Az elemzés megmutatja, hogy mindegyik klón helyes. Ezen kiónok egyikét pUC19/EcoRI-SacI/Invss-7B2Sac-nak nevezzük (egzakt konstrukció).
Mintegy 220 bázispár hosszúságú, a teljes invertáz jelző szekvenciát a 7B2 egy részével egy keretben kódoló EcoRI-SacI fragmentumot izolálunk a pUC19/EcoRI-SacI/Invss-7B2Sac (egzakt konstrukció) plazmidból.
Egy mintegy 410 bázispár hosszúságú, a 7B2 3' szegmentumát és egy stop kodont kódoló SacI-HindHI fragmentummot izolálunk a pUC19/EcoRI-SphI/7B2ss-7B2 plazmidból (lásd a 2a példa).
Az EcoRI-SacI és a SacI-HindlH fragmentumokat a pUC 19-hez Egáljuk, amelyet EcoRI-vel és HindlII-al teljesen emésztünk. Egy helyes kiónt pUC19/EcoRI-HindIH/Invss-7B2-nek nevezünk. A plazmid kódolja a teljes invertáz jelző szekvenciát (57 aminosav) a teljes humán 7B2-vel (185 aminosav) és egy stop kodonnal egy keretben.
3b példa: Promoter előállítása az élesztő citoplazmás ciklofilin génből
Az élesztő c-ciklofilinből [ez a S.cerevisiae CYP1 gén; Haendler, B., Keller, K, Hiestand,
P.C., Kocher, HP., Wegmann, G., Mowa, N.R., Gene 83:39-46 (1989)] származó promotert PCR-rel izoláljuk. A PCR-t, ahogyan a 2a példában is tettük, S288C élesztőtörzsből származó genomikus DNS, mint templát, valamint két dezoxi-oligoribonukleotid, mint primer (lásd a SEQ ID No: 12 és 13-at) alkalmazásával hajtjuk végre. Egy mintegy 545 bázispár hosszúságú BamHI-EcoRI fragmentumot izolálunk és szubklónozunk pUC 18-ba, amelyet teljesen elemésztünk BamHI-el és EcoRI-el. 6 transzformánsból nyert DNS-t restrikciós enzimekkel és DNS szekvenálással elemzünk. Egy helyes kiónt pUC19/BamEH-EcoRI/CYPlp-nek nevezünk.
···«·· ·· « ♦ · · ♦♦· ♦·· • « · · « * · ·· «·»« ·· ··· ·· c példa: Alkalmas transzkripciós terminátor fragmentum megalkotása élesztő PH05 génből
A PH05 génből származó mintegy 377 bázispár hosszúságú SphI-PstI fragmentumot [Sphl kapcsolókat adunk a túlnyúló Sau3A helyhez a PH05 gén 3' végén; Meyhack, B., Bajwa, W., Rudoph, H., Hinnen, A., EMBO J., 6, 3455-3463, (1982)], amely hatékony transzkripciós terminátorként működik közre heterológ gének kifejezésében, pUC 19-be szubklónozzuk, amelyet teljesen emésztünk SphI-el és Pstl-el. A transzformánsok elemzése után egy megfelelő kiónt pUC19/SphI-PstI/PHO5T-nek nevezünk.
3d példa: Élesztő kifejező vektor előállítása a teljes 7B2 kiválasztására 7B2 jelző szekvencia alkalmazásával
Egy mintegy 545 bázispár hosszúságú BamHI-EcoRI CYPlp fragmentumot izolálunk a pUC19/BamHI-EcoRI/CYPlp-ből (lásd 3b példát).
A 18 aminosavas 7B2 jelző peptidet, a humán 7B2 185 aminosavját és egy stop kodont kódoló mintegy 620 bázispár hosszúságú EcoRI-HindlII fragmentumot izolálunk a pUC19/EcoRISphI/7B2ss-7B2-ből (lásd a 2a ábrát).
Egy mintegy 385 bázispár hosszúságú HindlII-SalI PHO5T fragmentumot izolálunk a pUC19/SphI-PstI/PHO5T-ből (lásd a 3c példát).
A BamHI-EcoRI, az EcoRI-HindlII és a HindlH-SalI fragmentumokat a pDP34 vektorhoz ligáljuk, amelyet teljesen emésztünk BamHI-el és Saü-el.A pDP34 plazmid egy E.coliS.cerevisiae ingázó vektor, amely tartalmazza a teljes S.cerevisiae 2 mikronos plazmidot és kódolja a S.cerevisiae URA3 és dLEU2 géneket, mint élesztő szelekciós markereket. Az E.coli HB 101-be történt transzformáció után DNS-t készítünk 24 transzformánsból. BamHI/SalI-vel végzett elemzéssel győződünk meg a kiónok helyességéről. Egy kiónt pDP34/BamHISaII/CYPlp-7B2ss-7B2-PHO5T-nek nevezünk.
·· · ·*·· »· ♦ ♦ ·»♦♦ • · · · · · · · · · ··· • · · » « ·
3e példa: Élesztő kifejező vektorok előállítása a csonkított 7B2 kiválasztására 7B2 jelző szekvencia alkalmazásával
A pDP34/Bamffl-SaII/CYPlp-7B2ss-7B2Ál-PHO5T pDP34/BamHI-San/CYPlp-7B2ss-7B2A2-PHO5T pDP34/BamHI-SaII/CYPlp-7B2ss-7B2A3-PHO5T
V néven hivatkozott plazmidokat pontosan a 3d példában leírtaknak megfelelően állítjuk elő. A 7B2 jelző szekvenciát, a csonka humán 7B2 gén kódoló régióját és egy stop kodont tartalmazó EcoRI-HindlII fragmentumokat izolálunk a megfelelő plazmidokból (lásd a 2b-d példákat).
3f példa: Élesztő kifejező vektor előállítása a teljes 7B2 kiválasztására élesztő SUC2 jelző szekvencia alkalmazásával
A pUC19/BamHI-EcoRI/CYPlp-ből (lásd 3b példa) származó mintegy 545 bázispár hosszúságú BamHI-EcoRI CYPlp fragmentumot és a pUC19/EcoRI-SacI/Invss-7B2-ből [(egzakt konstrukció); lásd 3a példa] származó mintegy 220 bázispár hosszúságú EcoRI-SacI fragmentumot pUC 19-be szubklónozzuk, amelyet teljesen emésztünk BamHI-el és Sacl-el, mint a 3a példában. Az egyik helyes klónból származó DNS-t pUC19/BamHI-SacI/CYPlpInvss-7B2 (5' vég)-nek nevezzük.
Egy, a CYP1 promotert, az invertáz szignáál szekvenciát és a pUC19/BamHI-SacI/CYPlpInvss-7B2 (5' vég)-ből származó humán 7B2 gén 5' végét tartalmazó mintegy 765 bp-os BamHI-SacI fragmentumot, egy mintegy 410 bázispár hosszúságú, a humán 7B2 gén 3' végét a pUC19/EcoRI-SphI/7B2ss-7B2 (lásd a 2a példát) plazmidból származó stop kodont tartalmazó SacI-HindlII fragmentumot, és a pUC19/SphI-PstI/PHO5T (lásd a 3c példát) plazmidból származó mintegy 377 bázispár hosszúságú HindlII-Sall fragmentumot ligálunk a pDP34 vektorhoz, amelyet teljesen emésztünk BamHI-el és SalI-el. Az E.coli HBlOl-be történő transzformáció után DNS-t készítünk 24 transzformánsból. BamHI/SaII-el és BamHT/HindTTT31 ··«· ·· ·· ···-* ·· ···«·· ·· • ·· · ··· ··· • · · · · · · ·· · · ·· ·· · ·· ·· al végzett elemzéssel igazoljuk a helyes kiónokat. Egy ilyen kiónt pDP34/BamHI-SaII/CYPlpInvss-7B2-PHO5T-nek nevezünk.
3g példa: Élesztő kifejező vektorok előállítása a csonkított 7B2 kiválasztására 7B2 jelző szekvencia alkalmazásával
A pDP34/BamHI-SaII/CYP lp-Invss-7B2A 1-PH05T pDP34/BamHI-San/CYP lp-Invss-7B2A2-PHO5T pDP34/BamHLSaII/CYPlp-Invss-7B2A3-PHO5T néven hivatkozott plazmidokat pontosan a 3f példában leírtaknak megfelelően állítjuk elő. A csonkított humán 7B2 gének kódoló régiójának 3' végét tartalmazó SacI-HindHI fragmentumokat izoláljuk a megfelelő plazmidokból (lásd a 2b-d példákat).
3h példa: pDP33/BamHI-San/CYPlp-Invss-7B2-PHO5T pDP33/BamHI-San/CYPlp-Invss-7B2Al-PHO5T pDP33/BamHI-San/CYPlp-Invss-7B2A2-PHO5T pDP33/BamHI-San/CYPlp-Invss-7B2A3-PHO5T előállítása
A fenti plazmidokat pontosan a 3f és g példákban leírtaknak megfelelően állítjuk elő. A megfelelő fragmentumokat ligáljuk a pDP33-hoz, amely csaknem azonos a pDP34-gyel, az egyetlen különbség, hogy pDP33-ból hiányzik az S.cerevisiae URA3 gén, amely a pDP34 plazmidban élesztő szelekciós markerként van jelen. A dLEU2 által kódolt hiányos promoter, amely a pDP33 plazmidban van jelen, hozzájárulhat a fenti plazmid konstrukciók másolatai számának emeléséhez a LEU2 alléi nem funkcionális genomiális másolatával rendelkező élesztősejtben.
• ·
3i példa: Az AB110 prbl- S.cerevisiae törzs transzformációja a humán 7B2 gént kódoló plazmidokkal
Az élesztő transzformációt a következő irodalmakban leírtaknak megfelelően végezzük: Klebe és társai, Gene 25:333-341 (1983) és Hinnen és társai, Proc.Natl.Acad.Sci. USA 75:1929(1978).
A S.cerevisiae AB 110 prb~-t [lásd a 4b példát; a PRB1 kódolja az élesztő proteáz B gént], vagy bármely más élesztőtörzset, amely el van szakítva az A és B élesztő proteázoktól, az alább felsorolt plazmidokkal transzformálunk, a transzformánsokat a leírtaknak' megfelelően nevezzük el:
Plazmidok | Transzformánsok nevei |
pDP34/BamHI-Sa 1I/CYP lp-7B2ss-7B2-PHO5T | yHBl |
pDP34/BamHI-SalI/CYPlp-7B2ss-7B2Ál-PHO5T | yHB2 |
pDP34/BamHI-SalI/CYPlp-7B2ss-7B2A2-PHO5T | yHB3 |
PDP34/BamHI-SalI/CYPlp-7B2ss-7B2A3-PHO5T | yHB4 |
pDP3 4/B amHI-S a 11/C YP lp-Invss-7B2-PHO5 T | yHB5 |
pDP34/BamHI-SalI/CYPlp-Invss-7B2Al-PHO5T | yHB6 |
pDP34/Bamffl-SalI/CYPlp-Invss-7B2A2-PHO5T | yHB7 |
pDP34/BamHI-SalI/CYPlp-Invss-7B2A3-PHO5T | yHB8 |
pDP33/BamHI-SalI/CYPlp-Invss-7B2-PHO5T | yHB9 |
PDP33/BamHI-SalI/CYPlp-Invss-7B2Al-PHO5T | yHBIO |
pDP33/BamHI-Sa 1I/CYP lp-Invss-7B2A2-PHO5T | yHBll |
pDP3 3 /B amHl-Sa 11/C YP 1 p-Invss-7B2A3-PHO5 T | yHB12 |
·4·« «· ·« «««4 ·· ·»···» · ♦ • * · · »·· *·· • · · · ♦ · · ·· «··· ·♦ · ·· ··
Mindegyik transzformánsból három telepet kiválasztunk és egy további számmal jelölünk meg (pl. yHBl-1, yHBl-2, yHBl-3).
3j példa: 7B2 élesztő transzformánsok tenyésztése rázólombik-tenvészetekben
Az AB 110 S.cerevisiae törzset (Matalfa. his 4-580. Ieu2, ura3-52, pep4-3. [cir0]) mások leírták [Barr, P.J. és társai, J.Biol.Chem. 263, 16471-16478 (1988)]. Egy 8,4 g/1 aminosav nélküli élesztő nitrogén bázist (Difco), 10 g/1 L-aszparagint, 1 g/1 hisztidint és 20 g/1 glukózt tartalmazó minimális tápközeget használunk előtenyészetként. Ehhez a tápközeghez adunk 1 g/1 leucint vagy 1 g/1 uracilt attól függően, hogy a pDP34-et vagy a pDP33-t kívánjuk-e szelektálni. A 7B2-t a fotenyészetben fejezzük ki, amely 30 g/1 glukózzal kiegészített 1,7 g/1 élesztő nitrogén bázist, 8,5 g/1 kazaminosavat és a szükséges aminosavakat tartalmazza. Az élesztő transzformánsokat (lásd 3i példa) 30°C-on tenyésztjük körkörös rázón, 180 fordulat/percen 48 órán keresztül 10 ml mennyiségű előtenyészet tápközegben, és 48 órán keresztül 60 ml mennyiségű fő tenyészetben.
A sejtek alikvotjait összegyűjtjük és a kiválasztott 7B2-t 10-50-szeresen sűrítjük Centricon-10 szűrők (Amicon) alkalmazásával. A koncentrált felülúszót inkubációra használjuk IGF-l-et tartalmazó élesztő tenyészközeggel. Az intracelluláris és a kiválasztott 7B2 kvalitatív becslését Western foltképzéssel végezzük tisztított 7B2 alkalmazásával, amelyet a 7B2 E.coli-ban való kifejeződéséből (lásd az 1. példát) nyerünk. A 7B2 antitestek felismerésére MON-102 monoklonális antitestet alkalmazunk (lásd az 1. példát).
4. példa: Az IGF-1 előállításának javítása 7B2 in vitro vagy in vivő alkalmazásával
4a példa: S.cerevisiae transzformációja a humán IGF-l-et kódoló plazmiddal
A S.cerevisiae AB 110 törzset, tehát egy olyan törzset, amely képes a humán inzulin-szerű növekedési faktort (IGF-1) kiválasztani, a pDP34/GAPDHp-alfaFL-IGFl-alfaFL-IGFl-alfaFT plazmiddal [Steube, K. és társai, Eur.J.Biochem., 198:651-657 (1991)] transzformáljuk. A pDP34/GAPDHp-alfaFL-IGFl-alfaFT-ban jelen lévő IGF-1 kifejezési kazettát tartalmazó ·· 9 ·« ·« • · · b ··· • « · e « · «
..........* stabil pFBY66 2 mikronos plazmidot [91810124.7 számú európai szabadalmi bejelentés] szintén AB 110-be transzformáljuk. A transzformánsokat általánosan yIGF-nek nevezzük.
4b példa: S.cerevisiae együtt-transzformálása a humán IGF-1 gént kódoló és a humán 7B2 gént kódoló plazmidokkal.
A S.cerevisiae AB 110 prbl~-t. tehát azt a törzset, amely el van szakítva az A és B élesztő proteázoktól, a pFBY66 plazmiddal (lásd a 4a példát), illetve az alábbi plazmidok bármelyikével együtt-transzformáljuk.
pDP33ZBamHI-San/CYPlp-Invss-7B2-PHO5T pDP33/BamHI-SaII/CYPlp-Invss-7B2Al-PHO5T pDP33/'BamHI-SaII/CYP Ip-Invss-7B2A2-PHO5T pDP33/BamHI-SaII/CYP lp-Invss-7B2A3-PHO5T (lásd a 3h példát). A transzformánsokat általánosan yIGF/7B2-nek nevezzük.
4c példa: ylGF növesztése rázólombikos tenyészetben, valamint az IGF-1 fehérje kvantitatív meghatározása nagyteljesítményű folyadékkromatográfiával (HPLC)
6,5 g/1 élesztőkivonatot, 4,5 g/1 kazaminosavat és 20 g/Ί glukózt tartalmazó dús tápközegben tenyésztjük az ylGF élesztő transzformánsokat; ez a tápközeg nem szelektív előtenyészet közeg. Az IGF-1-et a fő tenyésztő közegben fejezzük ki, amely azonos a 7B2 kifejezésére használt közeggel (lásd a 4a példát).
A sejtek alikvotjait összegyűjtjük és a kiválasztott, a tenyésztőközegben lévő aktív monomer IGF-1 molekulát HPLC-vel és ELISA-val mérjük [Steube, K. és társai, Eur.J.Biochem., 198:651-657(1991)].
λ··Φ ·♦ ··»*·· ·····* · *· • · φ φ ····♦» • a · « k 9· ·· ««φ* »· »♦··*
4d példa: vIGF/7B2 növesztése rázólombikos tenyészetekben, valamint az IGF-1 fehéije meghatározása Western foltképzéssel yIGF/7B2 élesztő transzformánsokat (lásd a 4b példát) tenyésztünk a 4c példának megfelelően. A sejtek alikvotjait összegyűjtjük és a monomer IGF-l-et Western foltképzéssel becsüljük fel. Eredményül azt kapjuk, hogy az yIGF/7B2-ből kapott redukált monomer IGF-1 mennyisége több, mint amit az yIGF-ből kaptunk (lásd a 4a példát).
4e példa: 7B2 hatásai aktív, monomer IGF-1 titeneire
7B2 koncentrált felülúszóit (lásd a 4b példát) az IGF-l-et tartalmazó élesztőtenyészet felülúszóval inkubáljuk (lásd a 3j példát), ATP jelenlétében vagy hiányában (a végső koncentráció 1-10 mM), 30°C-on, 1 órán keresztül. Az aktív monomer IGF-1 titeijeit HPLCvel méijük. Ugyanezen tenyészet felülúszóit 30°C-on inkubáljuk 7B2 távollétében, de ATP jelenlétében, valamint mind ATP, mind 7B2 távollétében is. A HPLC értékek összehasonlítása megmutatja, hogy a tenyészet felülúszók 7B2-vel való inkubációja után ATP jelenlétében az IGF-1 titerek jelentős növekedése tapasztalható.
Tipikusan 60 μΐ élesztőtenyészet felülúszót (amely 2,5 pg aktív IGF-1 monomert és 20 pg inaktív molekulát tartalmaz) 60 pl 20-szorosan koncentrált 7B2 felülúszóval (amely 5pg csonkított 7B2-t tartalmaz), amely yHB6-ból, yHB7-ből, yHB 10-ből és yHB 11-ből választódott ki, inkubálunk 6pl 200 mM ATP jelenlétében 1 órán át 30°C-on, amelyet EDTA hozzáadása követ (a végső koncentráció 2 mM). E keverék 100 pl-ét HPLC-vel elemezzük.
5.példa: POMC előállításának javítása 7B2 segítségével
5a példa: Tiszta POMC fehéije előállítása és in vitro dezaggregáció
A rekombináns POMC fehéijét standard molekuláris biológiai technológiákkal állítjuk elő. Hasonlóan a tiszta POMC-t a POMC cDNS pGEX-KG vektorba való klónozásával kapjuk. A pGEX-KG vektor egy módosított változata a pGEX-2T vektornak, amelybe egy kapcsoló is van beépülve, amely többszörös klónozó helyeket tartalmaz (3. ábra). Ezt a vektort úgy tesszük alkalmazhatóvá, hogy egy hipofízis könyvtárból izolált, POMC cDNS-t tartalmazó
9··· 99 99 999999 • 9 9 9 9 9 99
9 9 9 999999 ···· 9 ·· • 9 ···· ♦· 999·· pBluescript kiónt tenyésztünk, majd a POMC cDNS-t eltávolítjuk EcRI-el és Xhol-el való emésztéssel. Ezt az 1 kb-s EcoRI-XhoI fragmentumot a pGEX-KG vektor EcoRI és Xhol helyeibe klónozzuk. Ezt a kiónt pGEX-KG-POMC-nek nevezzük. E klón kifejezéséből tiszta GST-POMC fúziós fehérjét, majd trombinnal való hasítás után tiszta POMC-t nyerünk. Az aggregált POMC rekombináns 150 μΐ, 50 mM trisz-HCl-ben, amely 150 mM NaCl-t és 2,5 mM CaCb-t is tartalmaz, együtt inkubáljuk rekombináns 7B2-vel és a nélkül 45 percig jégen inkubáljuk. A natív gél elektroforézis megmutatja, hogy a 7B2 hozzáadása a dezaggregált POMC mennyiségének jelentős növekedését eredményezi.
5b példa: Radiokatívan jelzett. újonnan szintetizált aggregált POMC in vitro dezaggregációja
A 7B2 képességét arra, hogy dezaggregálja a proopiomelanokortin prohormont (POMC) úgy teszteljük, hogy a 7B2-t újonnan szintetizált POMC-vel inkubáljuk. A POMC fehérje, amely több mint 90%-a a Xenopus köztes hipofízis sejtek által szövettenyészetben termelt, újonnan szintetizált összes fehérjéknek. A 7B2 kölcsönhatását aggregált POMC-vel natív poliakrilamid géleken és HPLC-vel elemezzük.
Az újonnan szintetizált POMC-t a fekete-adaptált Xenopus neurointermediáris lebenyei (köztes hipofízis sejtek) termelik a lebenyek 1 órás inkubációja során 5mCi/ml [3\S]-metionint is tartalmazó tápközegben. A fehérjéket IN HCl-lel vonjuk ki,fagyasztva szárítjuk, majd újra oldjuk 150μ1, 150 mM NaCl-t, 2,5 mM CaC12-t, és 50 mM trisz-HCl-t tartalmazó tápközegben, pH 7,5. A radioaktívan jelzett fehérjék 30 μΐ alikvotjaihoz (amelyek mintegy 1 pg POMC-t tartalmaznak) 5pg-ot adunk vagy rekombináns 7B2-ből (amelyet az 1. példában leírtak szerint készítünk el), GroEL-ből és BSA-ból (Sigma), vagy alfa-krisztallinból, majd a mintákat 45 percig jégen inkubáljuk.
A mintákat velük megegyező mennyiségű gél terhelőpufferrel keverjük össze és 6-25% akrilamid, 0,2-0,15% bisz-akrilamid, nem denaturáló gradiens gélen elektroforézisnek vetjük alá 100 V-on 3 órán át, amelyet fixálás követ, majd a gél szárítása autoradiográfiához. A radioaktívan nem jelzett fehérjéket Coomassie kékkel való festéssel mutatjuk ki. Annak igazolására, hogy a natív gélen található csíkokban lévő összes radioaktivitás az újonnan • « · · ··· ·♦· • · · · · « * ·· ···· 4»· ·♦· ·· szintetizált POMC-nek tulajdonítható, a csíkokat kimetszük a szárított gélből, majd újra nedvesítjük 1 M trisz-HCl-lel való fedéssel, pH 8,0, egy órán keresztül. Ezután a trisz puffért SDS minta pufferral helyettesítjük, majd a mintákat felforraljuk és 12,5% SDS-poliakrilamid gébé helyezzük.
A savas extrakciós eljárás, amelyet radioaktívan jelzett fehéijék Xenopus köztes hipofízis sejtekből való készítésére alkalmazunk, denaturált (aggregált) POMC sejteket eredményez, amely nem kerül be natív gélekbe és nem hajtogatódik újra spontánul az alkalmazott körülmények között és a kísérletek időkeretén belül. Az aggregált POMC rekombináns 7B2vei (amelyet az 1. példában leírtak szerint készítünk el) való inkubációja azonban a legtöbb aggregátum mintegy 120 K-s radioaktívan jelzett csíkká való konverzióját eredményezi a natív gélben, míg a GroEL-lel való inkubáció az aggregátumok csak egy részének mintegy 50K-s csíkká való konverziójához vezet. A szarvasmarha szérum albumin mezofilikus fehérével, vagy az alfa-krisztallin oligomer fehéijével történő inkubációnak nincs hatása. A radioaktívan jelzett szalagok natív gélből való kimetszése, amelyet SDS-PAGE követ, megmutatja, hogy a csíkok monomer 37K POMC-ből állnak.
Denaturált radioaktívan jelzett POMC-t és 7B2-vel kezelt radioaktívan jelzett POMC-t szintén HPLC-vel (SP8750 modell, Spectra Physics) elemezzük UltraSherogel oszlopon (SEC 2000, Beckman) 100 mM KH2PO4-el, 100 mM Na2SC>4-el (pH 7,0), mint oszlop elúciós pufferekkel 1 ml/perc átfolyással. A radioaktív frakciókat β-számlálóval számláljuk meg. Ugyanezzel az észlelési eljárással a monomer POMC jelentős növekedését tapasztaljuk 7B2-vel való inkubáció után.
5c példa: 7B2 in vivő működése: 7B2 és POMC együtt kifejeződése magasabbrendű eukarióta sejtekben, amelyek a fehéijekiválasztódás szabályozott útvonalával bírnak
7B2 és POMC termeléséhez eukarióta sejtekben a pECV5-Xho eukarióta kifejező vektort alkalmazzuk. Ezt a 6,8 kb hosszúságú vektor a pECV5 vektorból származik, amelyet Az Epstein-Barr vírusból eredő cDNS kifejező vektor előállítása és tulajdonságai humán sejtekben ···· ·· ·· #··♦ ·· • tf···· · · • · · » ··· ··· • · · · · · · ·· ···· ·» ··· ·· című cikk ír le, P.B.G.M. Beit és társai, Gene 84. 407-417 (1989). A pECV5 klónozó helyében lévő SstI restrikciós helyet Xhol restrikciós hellyel cseréljük fel a pECV-Xho vektorban.
A pECV5-Xho vektor tartalmazza a Rous Sarcoma Vírus (RSV) promotert, amelyet klónozó helyek, majd egy β-globin intron és egy poliadenilációs jel követ a hatékony poliadenilezés érdekében. Az RSV promoter általában igen aktív és ez bizonyára így van az alkalmazott AtT20 sejtekben is. A pECV5-Xho vektor rezisztenciát nyújt a sejteknek transzfekció után a higromicin antibiotikum ellen, mivel szerkezetében higromicin rezisztencia gént tartalmaz.
Egy, az érett 7B2 fehéijét kódoló mintegy 0,8 kb humán 7B2 fragmentumot kihasítunk a 7B2 cDNS-t tartalmazó pABl vektorból KpnI-gyel és Xhol-gyel való emésztéssel, majd a pECV5Xho vektor KpnI-XhoI helyeibe ligáljuk. Ennek eredményeképp a pECV5-Xho-7B2 kiónt kapjuk. Hasonló módon egy 1,1 kb-s, az érett POMC fehéijét kódoló EcoRI-EcoRI POMC cDNS fragmentumot megfelelő irányultságban a vektor EcoRI helyébe, az RSV promoter után építjük be. A pECV5-Xho-7B2 és pECV5-Xho-POMC plazmidokat AtT20 sejtekbe transzferáljuk 2-15 pg DNS elektroporációjával. Az AtT20 egy tumor sejt, amely egér hipofízis elülső lebenyéből származik. Egy nappal a transzfekció után elkezdjük a szelekciót a sejtek higromicint tartalmazó (80 pg/ml) tenyészközegben való inkubációjával. Két héttel később egyedi kiónok izolálhatok és ezek stabil transzfektált AtT20 sejtvonalakká fejlődnek.
Northem folt analízis és monoklonális és poliklonális antitestekkel való immunprecipitáció segítségével meghatározható, hogy a 7B2 és a POMC túltermelése, tehát mind az RNS-, mind a fehéije-szint 20-, 30-szoros növekedése következett be ezekben a sejtekben. Ezen konstrukciók transzfekciójának nincs hatása a sejt növekedésének mértékére. Mint vártuk, a 7B2 erőteljesebb növekedése következik be a 7B2 cDNS-sel transzfektált sejtekben, ami azt mutatja, hogy több 7B2 ment végig a szabályozott útvonalon; ez a 7B2 tehát csak akkor hagyja el a sejtet, ha a sejt kiválasztási tevékenységét stimuláljuk. Ez be is bizonyosodik, mintán a sejtet 5mM 8-Br-cAMP-vel stimuláljuk.
···· ·· «· ···· ·· ····«· · · • · · · ··♦ ··· • · * · · · · ·· ···· ·· ··· ··
A mind POMC-vel, mind 7B2-vel transzfektált sejtekkel való ACTH termelés ACTH radioimmun-vizssgálattal összehasonlítható a csak POMC-vel transzfektált sejtek ACTH termelésével.
A hipofízis pars intermedia melanotróp sejtjei olyan sejtek, amelyek a POMC prohormont 7B2vel koordinálva fejezik ki, tehát amikor a POMC kifejezés megnövekszik, a 7B2 termelése is növekszik. Azon eshetőség tanulmányozására, miszerint a 7B2 hősokk-fehérje, Xeopus laevis béka hipofízisének melanotróp sejtjeit ezen sejtek normál inkubációs hőmérsékletén (21 °C) inkubáljuk és ugyanezen mennyiségű sejtet inkubálunk 30 °C-on (hősokk) egy órán keresztül, PH]-lizin jelenlétében is. A termelt POMC mennyisége körülbelül ugyanakkora mindkét sejtben, míg a hősokk-sejtekben lényegesen több (kb. ötszörös mennyiségű) 7B2 termelődik; a termelt 7B2-t 7B2-ellenes monoklonális antitestekkel vizsgáljuk. Ez azt mutatja, hogy a 7B2 valóban hősokk-fehéije.
Egy ismert szintézis technológia segítségével a 7B2 mRNS (vagyis 7B2 antisense oligonukleotid) fehérjekódoló részének nukleotid szekvenciája ellen irányuló szintetikus egyszálú DNS részeit állítjuk elő. Ezek az antisense ohgonukleotidok alkalmazhatók a 7B2 mRNS 7B2-vé való transzlációjának blokkolására a sejtben: mivel az antisense ohgonukleotidok kötődnek az mRNS-hez, a fehérje nem olvasható le, vagy az RNS-t a sejten belül speciális RNS-ázok elbontják. Ezért a 7B2 termelése ilyetén blokkolásának hatása a biológiailag aktív vegyületekre tanulmányozható. Ezek a kísérletek hasonló módon kiteljeszthetők a 7B2 antisense oligonukleotidokkal kezelt AtT20 sejtekre is.
• · · · · · ·· · · 4 · · « • · ·· ·· ·· • · · ···· ·· · • · · · · · · ·· · · · · ·· ··* · ·
Szekvencia lista
SEQ ED No. 1
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 26 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részleges humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 9-26 pozíció: a humán 7B2 1-6 aminosavai jelző szekvenciájának sense szála; 3-9 pozíció: Eco Rí hely
ATGAATTCAT GCTATCTGGC CTACTG 26
SEQ ED No.2
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 26 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részben humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 12-26 pozíció: a humán 7B2 kódoló szekvenciájának antisense szála; 3-8 pozíció:
Sphlhely; 9-11 pozíció: stop kodon
TAGCATGCTT ACTCTGGATC CTTATC 26
SEQ ED No.3
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 54 bázis
Száltípus: kettős
Topológia: lineáris
Közvetlen kísérleti forrás: PEC7B2
Jellemzők: a humán 7B2 gén által kódolt 18 aminosavas jelző peptid
ATG CTA TCT GGC CTA CTG TTT TGG CTG GCA TCT GGA36
Met Leu Ser Gly Leu Leu Phe Trp Leu Alá Ser Gly
510
TGG ACT CCA GCA TTT GCT
Trp Thr Pro Alá Phe Alá
SEQ ID No.4
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 558 bázis
Száltípus: kettős
Topológia: lineáris
Közvetlen kísérleti forrás: PEC7B2
Jellemzők: 185 aminosavas humán 7B2
TAC AGC | CCC Pro | CGG ACC CCT Arg Thr Pro 5 | GAC Asp | CGG GTC | TCA GAA GCA | 36 | ||||||
Tyr | Ser | Arg | Val | Ser 10 | Glu | Alá | ||||||
GAT | ATC | CAG | AGG | CTG | CTT | CAT | GGT | GTT | ATG | GAG | CAA | 72 |
Asp | Ile | Gin | Arg | Leu | Leu | His | Gly | Val | Met | Glu | Gin | |
15 | 20 | |||||||||||
TTG | GGC | ATT | GCC | AGG | CCC | CGA | GTG | GAA | TAT | CCA | GCT | 108 |
Leu | Gly | Ile | Alá | Arg | Pro | Arg | Val | Glu | Tyr | Pro | Alá | |
25 | - | 30 | 35 | |||||||||
CAC | CAG | GCC | ATG | AAT | CTT | GTG | GGC | CCC | CAG | AGC | ATT | 144 |
His | Gin | Alá | Met | Asn | Leu | Val | Gly | Pro | Gin | Ser | Ile | |
40 | 45 |
GAA Glu | GGT Gly 50 | GGA GCT | CAT His | GAA Glu | GGA Gly 55 | CTT Leu | CAG Gin | CAT His | TTG Leu | GGT Gly 60 | 180 | |
Gly | Alá | |||||||||||
CCT | TTT | GGC | AAC | ATC | CCC | AAC | ATC | GTG | GCA | GAG | TTG | 216 |
Pro | Phe | Gly | Asn | Ile | Pro | Asn | Ile | Val | Alá | Glu | Leu |
70
ACT Thr | GGA Gly | GAC Asp 75 | AAC Asn | ATT Ile | CCT Pro | AAG GAC | TTT Phe | AGT Ser | GAG Glu | GAT Asp | |
Lys | Asp 80 | ||||||||||
CAG | GGG | TAC | CCA | GAC | CCT | CCA | AAT | CCC | TGT | CCT | GTT |
Gin | Gly | Tyr | Pro | Asp | Pro | Pro | Asn | Pro | Cys | Pro | Val |
85 | 90 | 95 |
252
288 • ·
• · * · · « ·· ···· ·· ··· · ·
GGA AAA ACA GAT | GAT Asp | GGA Gly | TGT Cys | CTA GAA AAC ACC CCT | 324 | |||||||
Gly | Lys | Thr | Asp 100 | Leu | Glu 105 | Asn | Thr Pro | |||||
GAC | ACT | GCA | GAG | TTC | AGT | CGA | GAG | TTC | CAG | TTG | CAC | 360 |
Asp | Thr | Alá | Glu | Phe | Ser | Arg | Glu | Phe | Gin | Leu | His | |
110 | 115 | 120 | ||||||||||
CAG | CAT | CTC | TTT | GAT | CCG | GAA | CAT | GAC | TAT | CCA | GGC | 396 |
Gin | His | Leu | Phe | Asp | Pro | Glu | His | Asp | Tyr | Pro | Gly | |
125 | 130 | |||||||||||
TTG | GGC | AAG | TGG | AAC | AAG | AAA | CTC | CTT | TAC | GAG | AAG | 432 |
Leu | Gly | Lys | Trp | Asn | Lys | Lys | Leu | Leu | Tyr | Glu | Lys | |
135 | 140 | |||||||||||
ATG | AAG | GGA | GGA | GAG | AGA | CGA | AAG | CGG | AGG | AGT | GTC | 468 |
Met | Lys | Gly | Gly | Glu | Arg | Arg | Lys | Arg | Arg | Ser | Val | |
145 | 150 | 155 | ||||||||||
AAT | CCA | TAT | CTA | CAA | GGA | CAG | AGA | CTG | GAT | AAT | GTT | 504 |
Asn | Pro | Tyr | Leu | Gin | Gly | Gin | Arg | Leu | Asp | Asn | Val | |
160 | 165 | |||||||||||
GTT | GCA | AAG | AAG | TCT | GTC | CCC | CAT | TTT | TCA | GAT | GAG | 540 |
Val | Alá | Lys | Lys | Ser | Val | Pro | His | Phe | Ser | Asp | Glu | |
170 | 175 | 180 | ||||||||||
GAT | AAG | GAT | CCA | GAG | TAA | 558 | ||||||
Asp | Lys | Asp | Pro | Glu |
185
SEQ ID No. 5 Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 29 bázis
V ·
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részben humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 12-29 pozíció: a humán 7B2 kódoló szekvenciájának antisense szála; 3-8 pozíció:
Sphl hely; 9-11 pozíció: stop kodon
TAGCATGCTT AGTTCCACTT GCCCAAGCC 29
SEQ ED No.6
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 29 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részben humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 12-29 pozíció: a humán 7B2 kódoló szekvenciájának antisense szála; 3-8 pozíció:
Hindin hely; 9-11 pozíció: stop kodon ataagctttt actctcctcc cttcatctt ♦ · · · • «
SEQ Π) No. 7
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 29 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részben humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 12-29 pozíció: a humán 7B2 kódoló szekvenciájának antisense szála; 3-8 pozíció:
HindUI hely; 9-11 pozíció: stop kodon
ATAAGCTTTT ATGCAACAAC ATTATCCAG
SEQ ID No. 8
Szekvencia típusa: DNS a hozzátartozó pepiiddel
Szekvencia hosszúsága: 69 bázis
Száltípus: kettős
Topológia: lineáris
Eredeti kísérleti forrás: pUC19/BamHI-XhoI/GAPDH-IT
Jellemzők: 77-63 pozíció: élesztő SUC2 gén által kódolt 19 aminosavas jelző peptid kódoló régiója; 1-6 pozíció: EcoRI hely; 64-69 pozíció: Xhol hely • · · · · ···· • · · · · · • · · ··« • · · 4 ·
GAATTC | ATG | CTT | TTG | CAA | GCT | TTC | CTT | TTC | CTT | TTG | 36 |
Met | Leu | Leu | Gin | Ala | Phe | Leu | Phe | Leu | Leu | ||
5 | 10 | ||||||||||
GCT GGT | TTT | GCA | GCC | AAA | ATA | TCT | GCA | CTCGAG | 63 | ||
Ala Gly | Phe | Ala | Ala | Lys | Ile | Ser | Ala |
SEQ ID No.9
Szekvencia típusa: DNS a hozzátartozó peptiddel
Szekvencia hosszúsága: 36 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: S.cerevisiae és humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 1-18 pozíció: a S.cerevisiae SUC2 génje (Alal4-Alal9) jelző peptidjének sense szála
GCA GCC AAA ATA TCT GCA. TAC AGC CCC CGG ACC CCT 36
Ala Ala Lys Ile Ser Ala Tyr Ser Pro Arg Thr Pro ' 5 10
SEQ ID No. 10
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 20 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris ···· ♦· ·· ·«·· ·· • · · · · · · • · · ···« ··
- _ ······ ' · · .... .· ... ..
Forrás: humán genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: a humán 7B2 kódoló régiójának antisense szála
ATGAGCTCCA CCTTCAATGC 20
SEQIDNo.il
Szekvencia típusa: DNS a hozzátartozó pepiiddel
Szekvencia hosszúsága: 21 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: részben S.cerevisiae genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 9-20 pozíció: a jelző peptid 1-4 aminosavaihoz tartozó S.cerevisiae SUC2 jelző peptidjének sense szála
TAGAATTC ATG CTT TTG CAA G 21
Met Leu Leu Gin
SEQ ED No. 12
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 30 bázis
Száltípus: egyes * · • ··« ·· · • · · · · ♦··· ·· ··· ··
Topológia: lineáris
Forrás: élesztő genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 11-30 pozíció: a S.cerevísiae CYP1 gén promoter régiójának 5' vége; 5-10 pozíció:
BamHI hely
ATATGGATCC TCTAGAACCT TTCATCATCT 30
SEQ ED No. 13
Szekvencia típusa: DNS
Szekvencia hosszúsága: 30 bázis
Száltípus: egyes
Topológia: lineáris
Forrás: élesztő genom DNS
Közvetlen kísérleti forrás: szintetikus
Jellemzők: 11-30 pozíció: a S.cerevísiae CYP1 gén promoter régiójának 3' vége; 5-10 pozíció:
Claims (24)
1. Eljárás fehéije előállítására azzal jellemezve, hogy a fehéijét in vivő vagy in vitro 7B2-vel kezeljük.
2. Az 1. igénypont szerinti eljárás fehéije előállítására valamely bioaktív fehéije vagy prekurzor aminosavszekvenciájával bíró polipeptidet kódoló genetikai információval transzformált, és ezt a polipeptidet vagy prekurzort kifejezni képes gazdasejt segítségével azzal jellemezve, hogy a sejtet transzformáljuk további olyab genetikai információval is, amely lehetővé teszi, hogy 7B2 fejeződjék ki az említett polipeptiddel vagy prekurzorral együtt, és a polipeptidet vagy prekurzort in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid vagy prekurzor dezaggregációját vagy helyes hajtogatását elősegítsük, vagy úgy, hogy a polipeptid vagy prekurzor kívánt esetben a sejt kiválasztásra késztetése után, kiválasztódjék.
3. A 2. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy eukarióta gazdasejtet alkalmazunk.
4. A 3. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy olyan eukarióta sejtet alkalmazunk, amely szabályozott fehéijeszállítási és kiválasztási útvonallal rendelkezik.
5. A 4. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a polipeptidet vagy prekurzort in vivő úgy kezeljük, hogy a polipeptid, kívánt esetben azután, hogy a sejtet kibocsátásra késztettük, kiválasztódjék.
6. Az 5. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a prekurzort olyan módon fejezzük ki, és kezeljük, hogy a kiválasztott polipeptid bioaktív fehéije legyen.
7. A 4. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy neuronális vagy endokrin sejtet alkalmazunk.
8. A 3. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy gazdasejtként élesztősejtet alkalmazunk.
·· * ···
9. A 8. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a sejtet olyan DNS szekvenciával transzformáljuk, amely képes egy bioaktív fehéije aminosav szekvenciájával rendelkező polipeptidet kifejezni.
10. A 9. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehéije aminosav szekvenciájával rendelkező polipeptidet kiválasztjuk.
11. A 9. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehéije az IGF-1.
12. A 2. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehéije peptid hormon, neuropeptid, növekedési faktor vagy koagulációs faktor.
13. A 12. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehéije valamely peptid hormon vagy neuropeptid.
14. Az 1. igénypont szerinti eljárás azzal jellemezve, hogy a 7B2 humán 7B2.
15. Az 1. igénypont szerinti eljárás a fehéije dezaggregációjára vagy aggregációjának megakadályozására in vitro, azzal jellemezve, hogy a fehéijét vagy aggregátumait 7B2-vel kezeljük.
16. Transzformált gazdasejt, amely valamely bioaktív fehéije vagy prekurzora aminosavszekvenciájával bíró polipeptidet kódoló genetikai információval van ellátva, és képes kifejezni ezt a polipeptidet vagy prekurzort azzal jellemezve, hogy a sejt transzformálva van továbbá olyan genetikai információval is, amely lehetővé teszi, hogy 7B2 fejeződjék ki az említett polipeptiddel vagy prekurzorral együtt, és a polipeptid vagy prekurzor úgy legyen kezelhető in vivő, hogy a polipeptid vagy prekurzor, kívánt esetben a sejt kiválasztásra késztetése után, kiválasztódjék.
17. A 16. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a sejt eukarióta sejt.
18. A 17. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a sejt eukarióta sejt, amely szabályozott fehéijeszáilítási és kiválasztási útvonallal rendelkezik.
• ·
19. A 17. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a sejt élesztősejt.
20. A 16. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a sejtet olyan genetikai információval van transzformálva, amely képessé teszi, hogy humán 7B2-t fejezzen ki.
21. A 16. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehérje valamely peptid hormon, neuropeptid, növekedési faktor vagy koagulációs faktor.
22. A 21. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehérje valamely peptid hormon vagy neuropeptid.
23. A 16. igénypont szerinti transzformált sejt azzal jellemezve, hogy a bioaktív fehérje az IGF1.
24. Eljárás 7B2 transzformált sejtben való előállítására azzal jellemezve, hogy a 7B2-t kódoló genetikai információval transzformált gazdasejtet tenyésztünk.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
NL9102009A NL9102009A (nl) | 1991-11-29 | 1991-11-29 | Produktie van bioactieve peptiden met recombinante cellen. |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HU9401604D0 HU9401604D0 (en) | 1994-09-28 |
HUT67739A true HUT67739A (en) | 1995-04-28 |
Family
ID=19859984
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9401604A HUT67739A (en) | 1991-11-29 | 1992-11-27 | Production of proteins using fb2 protein |
Country Status (11)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US5708140A (hu) |
EP (1) | EP0614490B1 (hu) |
JP (1) | JPH07501448A (hu) |
AT (1) | ATE174629T1 (hu) |
AU (1) | AU675919B2 (hu) |
CA (1) | CA2123567A1 (hu) |
DE (1) | DE69227921D1 (hu) |
FI (1) | FI942442A (hu) |
HU (1) | HUT67739A (hu) |
NL (1) | NL9102009A (hu) |
WO (1) | WO1993011248A1 (hu) |
Families Citing this family (14)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1993025681A1 (en) * | 1992-06-11 | 1993-12-23 | New York University | A cytoplasmic chaperonin and methods of making and using it |
US5474914A (en) * | 1992-07-29 | 1995-12-12 | Chiron Corporation | Method of producing secreted CMV glycoprotein H |
DE69329202T2 (de) * | 1992-10-02 | 2001-03-29 | Research Corp. Technologies, Inc. | Methoden der erhöhung der sekretion von überexpremierten proteinen |
GB9223816D0 (en) | 1992-11-13 | 1993-01-06 | Medical Res Council | Heat shock proteins and the treatment of tumours |
US5688651A (en) * | 1994-12-16 | 1997-11-18 | Ramot University Authority For Applied Research And Development Ltd. | Prevention of protein aggregation |
JPH09173078A (ja) * | 1995-09-14 | 1997-07-08 | Tadayuki Imanaka | 分子シャペロンを用いる蛋白質の製造方法 |
JP2000508178A (ja) * | 1996-05-14 | 2000-07-04 | スミスクライン・ビーチャム・コーポレイション | 新規化合物 |
US7569660B1 (en) | 1999-06-09 | 2009-08-04 | The University Of Chicago | Recombinant prion-like proteins and materials comprising same |
US6861403B2 (en) * | 2000-05-03 | 2005-03-01 | Expressive Constructs, Inc. | Method and device for improving protein stability and solubility |
JP4528460B2 (ja) * | 2000-06-30 | 2010-08-18 | 株式会社東芝 | 半導体素子 |
US20040138116A1 (en) * | 2002-08-30 | 2004-07-15 | Vincent Geenen | Tolerogenic approach for type 1 diabetes |
EP1624886A2 (en) * | 2003-05-12 | 2006-02-15 | Expressive Constructs, Inc. | Methods for increasing cell and tissue viability |
US20050261475A1 (en) * | 2004-02-13 | 2005-11-24 | Harvard Medical School | Solid-phase capture-release-tag methods for phosphoproteomic analyses |
FR3008713B1 (fr) * | 2013-07-18 | 2016-11-25 | Commissariat Energie Atomique | Procede d'extraction et de purification d'acides nucleiques et tampons mis en œuvre |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
NL8702590A (nl) * | 1987-10-30 | 1989-05-16 | Stichting Katholieke Univ | Eiwit 7b2 alsmede recombinant dna en cdna, mrna, en antilichamen voor 7b2 en werkwijze voor het detecteren van 7b2. |
CA1340740C (en) * | 1987-12-08 | 1999-09-14 | Eileen R. Mulvihill | Co-expression in eukaryotic cells |
-
1991
- 1991-11-29 NL NL9102009A patent/NL9102009A/nl not_active Application Discontinuation
-
1992
- 1992-11-27 HU HU9401604A patent/HUT67739A/hu unknown
- 1992-11-27 DE DE69227921T patent/DE69227921D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1992-11-27 EP EP92923809A patent/EP0614490B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1992-11-27 CA CA002123567A patent/CA2123567A1/en not_active Abandoned
- 1992-11-27 US US08/244,492 patent/US5708140A/en not_active Expired - Fee Related
- 1992-11-27 JP JP5509807A patent/JPH07501448A/ja active Pending
- 1992-11-27 WO PCT/EP1992/002740 patent/WO1993011248A1/en active IP Right Grant
- 1992-11-27 AU AU29461/92A patent/AU675919B2/en not_active Ceased
- 1992-11-27 AT AT92923809T patent/ATE174629T1/de not_active IP Right Cessation
-
1994
- 1994-05-25 FI FI942442A patent/FI942442A/fi unknown
-
1996
- 1996-09-09 US US08/709,915 patent/US5804417A/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
ATE174629T1 (de) | 1999-01-15 |
WO1993011248A1 (en) | 1993-06-10 |
AU675919B2 (en) | 1997-02-27 |
FI942442A (fi) | 1994-07-25 |
US5804417A (en) | 1998-09-08 |
EP0614490A1 (en) | 1994-09-14 |
CA2123567A1 (en) | 1993-06-10 |
EP0614490B1 (en) | 1998-12-16 |
JPH07501448A (ja) | 1995-02-16 |
HU9401604D0 (en) | 1994-09-28 |
US5708140A (en) | 1998-01-13 |
AU2946192A (en) | 1993-06-28 |
NL9102009A (nl) | 1993-06-16 |
FI942442A0 (fi) | 1994-05-25 |
DE69227921D1 (de) | 1999-01-28 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CA2168429C (en) | Expression of fusion polypeptides transported out of cytoplasm without leader sequences | |
JP2686090B2 (ja) | 新規融合蛋白質およびその精製方法 | |
RU2232192C2 (ru) | Слитый белок с увеличенной эритропоэтиновой активностью, нуклеиновая кислота, кодирующая слитый белок, и способ получения слитого белка | |
KR100758755B1 (ko) | Glp-1 유사체 융합 단백질 | |
HUT67739A (en) | Production of proteins using fb2 protein | |
NZ224808A (en) | Recombinant dna sequences coding for human proapolipoprotein a-i | |
JP2008119008A (ja) | 酵母での異種タンパク質の発現の方法 | |
US20060234352A1 (en) | Homogeneity and secretion of recombinant proteins in mammalian systems | |
EP0802983B1 (en) | Expression of urokinase plasminogen activator inhibitors | |
JP2001008697A (ja) | E.コリでの非融合タンパク質の調製方法 | |
CN113811606A (zh) | Asx特异性蛋白质连接酶及其用途 | |
EP1042467B1 (en) | Non-identical genes and their application in improved molecular adjuvants | |
US7344856B1 (en) | Method of controlling cleavage by OmpT protease | |
US20030044896A1 (en) | Expression of proteolytically-sensitive peptides | |
JP2990162B2 (ja) | ヒト酸性線維芽細胞成長因子の組成物、その製法、dna構築物および酵母宿主細胞 | |
WO1986003779A1 (en) | Polypeptide secretion-causing vector, microorganisms transformed by said vector, and process for preparing polypeptide using said microorganisms | |
AU2004276687B2 (en) | Method of cleaving polypeptide by using OmpT protease mutant | |
JPH04229188A (ja) | 融合タンパク質の試験管内プロセシング | |
JPH07274970A (ja) | 組換えベクターと、この組換えベクターを保持する形 質転換体、およびこの形質転換体による抗菌性ペプチ ドの製造方法 | |
AU720755B2 (en) | Ubiquitin conjugating enzymes having transcriptional repressor activity | |
KR20050062659A (ko) | 전사 및 전사 후 단계 양쪽에서의 유전자 발현 조절 방법 | |
JP2574146B2 (ja) | ポリペプチド発現ベクタ−、該ベクタ−で形質転換した宿主及び該宿主によるポリペプチドの製造法 | |
KR20160017313A (ko) | 피부투과성이 향상된 펩타이드 및 이를 포함하는 융합단백질 | |
Cui et al. | Monomeric destetrapeptide human insulin from a precursor expressed in Saccharomyces cerevisiae | |
WO1998037910A1 (en) | Peptide inhbitors of propeptide/prohormone convertases |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
DGB9 | Succession in title of applicant |
Owner name: NOVARTIS AG, CH |
|
DFC4 | Cancellation of temporary protection due to refusal |