FR2758822A1 - Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus - Google Patents

Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus Download PDF

Info

Publication number
FR2758822A1
FR2758822A1 FR9711166A FR9711166A FR2758822A1 FR 2758822 A1 FR2758822 A1 FR 2758822A1 FR 9711166 A FR9711166 A FR 9711166A FR 9711166 A FR9711166 A FR 9711166A FR 2758822 A1 FR2758822 A1 FR 2758822A1
Authority
FR
France
Prior art keywords
sequence
seq
adenovirus
cell
ligand
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
FR9711166A
Other languages
English (en)
Other versions
FR2758822B1 (fr
Inventor
Pierre Boulanger
Saw See Hong
Lucie Karayan
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Original Assignee
Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FR9701005A external-priority patent/FR2758821B1/fr
Application filed by Centre National de la Recherche Scientifique CNRS filed Critical Centre National de la Recherche Scientifique CNRS
Priority to FR9711166A priority Critical patent/FR2758822B1/fr
Priority to US09/155,613 priority patent/US6420120B1/en
Priority to PCT/FR1998/000184 priority patent/WO1998033929A2/fr
Priority to EP98905474A priority patent/EP0900280A2/fr
Priority to JP10532596A priority patent/JP2000510708A/ja
Priority to CA002251036A priority patent/CA2251036A1/fr
Priority to AU61046/98A priority patent/AU731911B2/en
Publication of FR2758822A1 publication Critical patent/FR2758822A1/fr
Publication of FR2758822B1 publication Critical patent/FR2758822B1/fr
Application granted granted Critical
Priority to US10/156,820 priority patent/US20020150558A1/en
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/70539MHC-molecules, e.g. HLA-molecules
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/78Connective tissue peptides, e.g. collagen, elastin, laminin, fibronectin, vitronectin, cold insoluble globulin [CIG]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/10011Adenoviridae
    • C12N2710/10311Mastadenovirus, e.g. human or simian adenoviruses
    • C12N2710/10341Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2710/10343Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/10011Adenoviridae
    • C12N2710/10311Mastadenovirus, e.g. human or simian adenoviruses
    • C12N2710/10341Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2710/10345Special targeting system for viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2810/00Vectors comprising a targeting moiety
    • C12N2810/40Vectors comprising a peptide as targeting moiety, e.g. a synthetic peptide, from undefined source
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2810/00Vectors comprising a targeting moiety
    • C12N2810/50Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein
    • C12N2810/80Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein from vertebrates
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2810/00Vectors comprising a targeting moiety
    • C12N2810/50Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein
    • C12N2810/80Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein from vertebrates
    • C12N2810/85Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein from vertebrates mammalian
    • C12N2810/859Vectors comprising as targeting moiety peptide derived from defined protein from vertebrates mammalian from immunoglobulins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2830/00Vector systems having a special element relevant for transcription
    • C12N2830/60Vector systems having a special element relevant for transcription from viruses

Abstract

La présente invention a pour objet l'utilisation d'un polypeptide comprenant au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée dans les identificateurs de séquence 1 à 5 à titres de récepteur et/ou co-récepteur des adénovirus. Elle concerne également l'utilisation d'une cellule capable d'exprimer un tel polypeptide ainsi que celle d'un ligand capable d'influencer l'attachement d'un adénovirus à une cellule hôte et/ou son entrée au sein de ladite cellule hôte. Enfin, elle a également trait à un récepteur cellulaire ainsi qu'à l'utilisation d'un ligand bifonctionnel pour cibler un adénovirus vers une cellule hôte portant à sa surface une protéine de surface autre que le récepteur cellulaire naturel dudit adénovirus.par.

Description

La présente invention a pour objet l'utilisation de tout ou partie d'un antigène du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I et/ou d'un module de type III de la fibronectine pour permettre ou faciliter l'attachement d'un adénovinis sur une cellule hôte et/ou son entrée au sein de celle-ci. L'invention vise également l'utilisation d'un ligand capable de moduler l'infectîvité d'un adénovirus vis à vis d'une cellule hôte, médiée par l'un ou l'autre des polypeptides cités ci-dessus. Enfin,
I'invention concerne une méthode de biorpaillage pour identifier ou sélectionner un récepteur cellulaire d'un adénovirus ou un de ces ligands, notamment d'origine virale.
Les adénovirus sont des virus à ADN d'un large spectre d'hôte. Ils ont été mis en évidence dans de nombreuses espèces animales et peuvent infecter divers types cellulaires. De nombreux sérotypes ont été caractérisés au sein de chaque espèce qui présentent une organisation génomique et un cycle infectieux comparables. D'une manière générale, le génome adénoviral est constitué d'une molécule d'ADN linéaire, bicaténaire et d'environ 36kb contenant les gènes codant pour les protéines virales et à ses extrémités deux répétitions inversées (désignées
ITR) intervenant dans la réplication et la région d'encapsidation.
Les adénovirus se répliquent dans les noyaux des cellules infectées. Le cycle infectieux se déroule en 2 étapes. La phase précoce précède l'initiation de la réplication et permet de produire les protéines précoces régulant la réplication et la transcription de l'ADN viral. Ces étapes sont suivies de la phase tardive au cours de laquelle sont synthétisées les protéines structurales qui constituent les particules virales. L'assemblage des nouveaux virions prend place dans le noyau. Dans un premier temps, les protéines virales s'assemblent de manière à former des capsides vides de structure icosaédrique, dans lesquelles l'ADN adénoviral est encapsidé. Les particules virales sont libérées et susceptibles d'infecter d'autres cellules permissives.
A cet égard, la fibre et le penton base présents à la surface des capsides jouent un rôle critique dans l'attachement cellulaire des virions et leur internalisation.
L'adénovirus se lie à la surface des cellules permissives par l'intermédiaire de la fibre trimérique et d'un récepteur cellulaire jusqu'à présent, non identifié. Puis, la particule est internalisée par endocytose par liaison du penton base aux intégrines cellulaires avss3 et avss5(Belin et Boulanger, 1993, J. Gen. Virol. 7sot, 1485-1497,
Mathias et al., 1994, J. Virol. 68, 6811-6814 , Nemerow et al , 1994, Trends Cell.
Biol. 4, 52-55 , Wickham et al., 1993, Cell 73,309-319, Wickham et al., 1994, J.
Cell Biol. 127, 257-264). La fibre d'Ad2 comporte 580 acides aminés (aa) dont la séquence est divulguée dans Herissé et al. (1981, Nucleic Acid Res. 9, 4023-4042).
Celle d'Ad 5 présente 582 acides aminés (Chroboczek et Jacrot, 1987, Virology 161, 549-554). Sa masse moléculaire est de 62 kDa, mais la fibre native se comporte comme une molécule de 160-180 kDa confirmant son assemblage sous forme d'un trimère.
La fibre est composée de 3 domaines (Chroboczek et al., 1995, Current Top.
Microbiol. Immunol. 199, 165-200) (1) En N-terminal, la "queue" très conservée d'un sérotype à l'autre, interagit avec
le penton base et assure l'ancrage de la molécule dans la capside.
(2) La "tige" est une structure en bâtonnet de longueur variable selon les
sérotypes Par exemple, la tige de la fibre d'AdS contient 22 répétitions d'un
motifde 15 résidus qui pourraient adopter une conformation en feuillet p. Le
nombre de ces répétitions diffère d'un sérotype à l'autre, ce qui explique les
variations de longueur.
(3) Enfin, à l'extrémité distale de la tige, la "tête" ou sphéricle terminale est une
structure globulaire contenant les signaux de trimérisation (Hong et Engler,
1996, J. Virol 70, 7071-7078 Novelli et Boulanger, 1991, J. Biol. Chem.
266, 9299-9303 , Novelli et Boulanger, 1991, Virology /S5, 365-376). La
plupart des données expérimentales montrent que c'est le domaine de la tête
qui est responsable de la liaison aux cellules permissives.
La complexité de l'attachement adénoviral laisse supposer qu'il serait sérotype dépendant et que plusieurs protéines cellulaires pourraient y participer. En ce qui concerne l'Ad2, Hong et Boulanger (1995, EMBO J. 14, 4714-4727) ont identifié un certain nombre de motifs peptidiques trouvés dans plusieurs protéines cellulaires de surface susceptibles d'interagir avec les protéines capsidaires (penton base et fibre), en particulier les modules de type III 5 et 14 de la fibronectine humaine. Les auteurs ont opéré par immobilisation sur un support inerte du penton base ou de la fibre (ligand) sur laquelle ils ont fait réagir une bibliothèque de phages exprimant des hexapeptides aléatoires (désignés phagotopes). Les phages adsorbés, qui en théorie expriment des phagotopes interagissant avec un motif porté par la protéine adénovirale, sont ensuite élués soit classiquement à pH acide ou par compétition avec l'autre partenaire capsidaire non immobilisé (éluant) Cependant, le récepteur cellulaire des adénovirus et la région de la tête précisément iinpliquée dans la liaison au récepteur n'ont à ce jour pas encore été clairement identifiés.
On a maintenant procédé à une nouvelle technique de "biorpaillage" (pour biopanning en anglais) dans laquelle le ligand immobilisé est constitué par le domaine de la tête de la fibre d'AdS et l'éluant par un anticorps neutralisant dirigé contre cette dernière et isolé deux classes de phagotopes selon l'anticorps mis en oeuvre. La première correspond à une séquence conservée au sein du domaine a-2 des antigènes du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I (a-2 MHC-I) et la seconde à une séquence retrouvée dans les modules III de la fibronectine humaine (FNIII). Les données reportées dans les exemples qui suivent, soutiennent l'hypothèse que le a-2 MHC-I constitue le récepteur primaire des adénovirus de sérotypes C et confirment la participation des FNIII à titre de co-récepteur ou cofacteur. On a également mis en évidence les régions de ces deux récepteurs et de la fibre interagissant l'une avec l'autre. En outre, on a généré un peptide antagoniste reproduisant le motif du domaine a-2 MHC-I qui neutralise l'attachement des adénovirus et un peptide agoniste reproduisant les motifs FNIII qui stimule l'attachement.
C'est pourquoi la présente invention a pour objet l'utilisation d'un polypeptide comprenant une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée (a) dans la SEQ ID NO: 1 commençant avec le résidu leucine en position 1 et
finissant avec le résidu glutamine en position 25, (b) dans la SEQ ID NO: 2 commençant avec le résidu asparagine en position I et
finissant avec le résidu asparagine en position 26, (c) dans la SEQ ID NO 3 commençant avec le résidu valine en position 1 et
finissant avec le résidu asparagine en position 25, (d) dans la SEQ ID NO: 4 commençant avec le résidu sérine en position I et
finissant avec le résidu arginine en position 25, et/ou (e) dans la SEQ ID NO: 5 commençant avec le résidu asparagine en position 1 et
finissant avec le résidu sérine en position 25 pour permettre ou faciliter l'attachement d'un adénovirus à une cellule hôte et/ou l'entrée dudit adénovirus au sein de ladite cellule hôte.
Aux termes de la présente invention, on entend par "polypeptide" toute molécule constituée par un enchaînement d'au moins 6 et, de préférence d'au moins 8, acides aminés. Le terme polypeptide comprend aussi bien des molécules peptidiques de courte longueur (de 6 à quelques dizaines de résidus) que des molécules de longueur plus importante (jusqu'à plusieurs centaines de résidus), à la condition toutefois de permettre l'utilisation envisagée. On précise qu'un polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention peut dériver d'un polypeptide natif tel que trouvé dans la nature, en particulier chez l'homme, ou d'une partie de celui-ci.
Il peut également être chimère et comprendre des résidus supplémentaires d'une origine quelconque fusionnés en N et/ou C-terminal et/ou insérés de manière à former un cadre de lecture ouvert. On peut également mettre en oeuvre un mutant obtenu par mutation, délétion, insertion et/ou substitution d'un ou plusieurs acides aminés par rapport aux séquences divulguées dans les identificateurs de séquence (SEQ ID)
Un polypeptide préféré dans le cadre de la présente invention comprend en outre des éléments appropriés pour assurer son ancrage dans une membrane cellulaire ou sa présentation à la surface d'une cellule De tels éléments sont connus de l'homme de l'art. A titre indicatif, on mentionne la présence d'un peptide signal généralement associé en position N-terminale et d'une région transmembranaire présentant un degré d'hydrophobicité élevé. Mais on peut également avoir recours à d'autres techniques, par exemple chimiques, pour ancrer ou lier un polypeptide à une membrane ou une surface cellulaire.
Par "séquence d'acides aminés homologue", on entend une séquence présentant un degré d'homologie d'au moins 70 %, de manière avantageuse, d'au moins 80 %, de manière préférée, d'au moins 90 % avec au moins 6 acides aminés continus d'une des séquences citées. Le terme identique fait référence à 100 % d'homologie.
L'homme du métier connaît les règles générales qui permettent de calculer le degré d'homologie entre deux séquences. On procède généralement par alignement des séquences éventuellement à l'aide de programmes d'ordinateur spécialisés. Il peut être nécessaire d'introduire artificiellement des emplacements vacants. Une fois que l'alignement optimal est réalisé, le degré d'homologie est établi en comptabilisant toutes les positions dans lesquelles les acides aminés des deux séquences se retrouvent à l'identique, par rapport au nombre total de positions.
Par "attachement d'un adénovirus à une cellule hôte", on entend la liaison de la particule virale à la cellule. Par "entrée d'un adénovirus au sein d'une cellule hôte", on désigne la pénétration du virus à l'intérieur de la cellule hôte. L'attachement et/ou l'entrée sont de préférence médié(s) au moinsuen partie par le(s) polypeptide(s) en usage dans le cadre de la présente invention par interaction avec la capside adénovirale. Bien entendu, d'autres molécules polypeptidiques ou non peuvent également participer à ces processus reconnus dans le domaine de l'art comme complexes et multifactoriels. Ils peuvent être évalués par toute technique de l'art, telles que celles décrites ci-après mettant en oeuvre une lignée cellulaire permissive et des particules marquées radioactivement ou exprimant un gène reporter par exemple le gène de la luciférase. A 0 C, seul l'attachement peut avoir lieu, la pénétration virale nécessitant une température de 37"C.
Aux fins de la présente invention, un adénovirus peut etre d'origine humaine ou animale (canine, aviaire, bovine. .) ou hybride comprenant des fragments de génome. Ces virus et leur génome sont décrits dans la littérature (voir par exemple
Graham et Prevec, Methods in Molecular Biology, Vol 7 , Gene Transfer and
Expression Protocols, Ed E.J. Murray, 1991, The Human Press Inc, Clinton, NJ).
On préfère mettre en oeuvre un adénovirus recombinant défectif pour la réplication et exprimant notamment un gène d'intérêt thérapeutique. Avantageusement, le génome adénoviral est modifié par délétion ou mutation de séquences essentielles à la réplication et, en particulier, comprises dans les régions El, E2, E4 et/ou L1-L5 (voir par exemple la demande internationale WO 94/28152).
Selon une première variante, la présente invention a pour objet l'utilisation d'un polypeptide comprenant une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée dans la SEQ ID
NO: 1 commençant avec le résidu leucine en position 1 et finissant avec le résidu glutamine en position 25.
De manière avantageuse, un polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention comprend une séquence en acide aminé homologue ou identique à tout ou partie d'un antigène du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I (MHC-I) et, de préférence, de la chaîne lourde de ce dernier.
Toutes les cellules d'un organisme présentent sur leur membrane des molécules appelées antigènes d'histocompatibilité qui définissent chaque individu. Les gènes correspondants, plus d'une dizaine, sont localisés sur le chromosome 6 chez l'homme et présentent un polymorphisme important, ce qui permet d'assurer une grande variabilité de ces marqueurs d'identité. Il existe deux catégories différentes de ces antigènes d'histocompatibilité, respectivement de classe I et II, dont la structure et les fonctions sont distinctes. Les molécules de classe I, appelées HLA (pour Human
Leukocyte Antigen en anglais) interviennent pour présenter les peptides antigéniques à la surface cellulaire et jouent un rôle essentiel dans les réponses immunitaires antivirales exercées par les lymphocytes T cytotoxiques.
Les molécules MHC-I sont des hétérodimères composés d'une chaîne légère non MHC désignée ss2-microglobuline (ss2m) et d'une chaîne lourde codée par les gènes MHC, liées de manière non covalente. La chaîne lourde est une protéine membranaire dont la partie N-terminale est orientée à l'extérieur de la cellule alors que la portion C-terminale est cytoplasmique. La première comprend 3 domaines désignés al, a2 et a3 d'environ 90 acides aminés chacun. Elle est suivie d'une région transmembranaire d'environ 25 acides aminés puis de la région C-terminale d'une trentaine d'acides aminés. La plupart des variations entre les produits des différents allèles sont localisées dans les domaines al et a2, le domaine a3 étant relativement conservé et la ss2m invariable (pour une revue et la comparaison de séquence entre les membres des MHC-i, voir Bjorkman et Parham, 1990, Annu. Rev. Biochem. 59, 253-288).
Parmi les polypeptides convenant aux fins de la présente invention, on peut citer plus particulièrement les antigènes HLA A, B, C, D, E et F ou des polypeptides en dérivant.
D'une manière particulièrement avantageuse, le polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention comprend une séquence homologue ou identique à tout ou partie de la région C-terminale du domaine a2 de la chaîne lourde des MHC
I et, plus particulièrement, à la partie centrée sur le résidu tryptophane en position 167, notamment celle s'étendant des résidus 156 à 180 (SEQ ID NO: 1). La numérotation à laquelle il est fait référence est conforme à celle utilisée par exemple dans Bjorkman et Parham (1990, szipra).
Selon une autre variante, un polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée - dans la SEQ ID NO: 2 commençant avec le résidu asparagine en position I et
finissant avec le résidu asparagine en position 26, - dans la SEQ ID NO: 3 commençant avec le résidu valine en position 1 et
finissant avec le résidu asparagine en position 25, - dans la SEQ ID NO: 4 commençant avec le résidu sérine en position I et
finissant avec le résidu arginine en position 25, et/ou - dans la SEQ ID NO: 5 commençant avec le résidu asparagine en position 1 et
finissant avec le résidu sérine en position 25.
Un polypeptide préféré comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à la fibronectine et, en particulier, à l'un au moins de ses modules de type III et, notamment, aux modules FNIII 1, 4, 5 et/ou 14. Bien entendu, il peut en comprendre plusieurs. On peut également envisager l'utilisation de la fibronectine humaine ou d'un peptide en dérivant, par exemple par mutation ou fragmentation.
A titre d'information, la fibronectine codée par un gène unique est une molécule intervenant dans les phénomènes d'adhésion et de contact cellulaire. Sa séquence et ses caractéristiques sont décrites dans la littérature accessible à l'homme du métier (voir en particulier Bork et Doolittle, 1992, Proc. Natl Acad. Sci USA 89, 89908994 et Dickinson et api., 1994, 236, 1079-1092). Elle est composée de 14 modules dits de type III (numérotés de I à 14) dont la séquence primaire peut varier mais dont la conformation en feuillet p est conservée.
Selon un mode de réalisation particulièrement avantageux, un polypeptide tel que défini ci-dessus est plus particulièrement destiné à permettre ou faciliter l'attachement d'un adénovirus de sérotype C à une cellule hôte et/ou son entrée dans cette dernière. Parmi les adénovirus envisageables, on peut citer plus particulièrement les sérotypes 2 et 5.
La présente invention concerne également une cellule hôte capable d'exprimer un polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention et son utilisation pour permettre ou faciliter l'attachement d'un adénovirus à sa surface et/ou l'entrée dudit adénovirus. Divers types de cellules hôtes peuvent être considérés. II peut s'agir de cellules d'une origine quelconque, par exemple de microorganismes, levures, insectes, plantes, animales. On préférera notamment une cellule de mammifère et, en particulier, une cellule humaine de type primaire, tumorale ou issue d'une lignée cultivable in vitro. Elle peut avoir une origine hématopoiétique (cellule souche totipotente, leucocyte, lymphocyte, monocyte, macrophage. .), hépatique, rénale, du système nerveux central, fibroblaste, épithéliale, pulmonaire ou musculaire (myocyte, myoblaste, cellule satellite, cardiomyocyte...). Une cellule particulièrement préférée est ou dérive de la lignée 293 établie à partir de cellules de rein embryonnaire par intégration de la région adénovirale El (Graham et al., 1977, J. Gen. Virol. 36, 5972) On indique que l'expression d'un ou plusieurs polypeptides en usage dans le cadre de la présente invention à la surface d'une cellule hôte n'exprimant pas habituellement les MHC-I et/ou la fibronectine devrait permettre son infectivité par un adénovirus. Elle pourrait être utilisée comme nouvelle cellule productrice de vecteurs adénoviraux. On peut également envisager le cas d'une surexpression dans une cellule exprimant naturellement ledit polypeptide. Une lignée de surexpression dérivant de la lignée 293 devrait permettre d'améliorer les rendements de production d'un adénovirus d'intérêt. Bien entendu, le polypeptide en usage dans le cadre de la présente invention peut être associé à la cellule par des moyens chimiques ou par l'intermédiaire d'un ligand reconnaissant une protéine de surface cellulaire. Mais, on peut également envisager une expression par les techniques de l'ADN recombinant.
Un tel mode de réalisation est à la portée de l'homme de l'art. A titre indicatif la séquence nucléotidique codant pour le polypeptide en question peut être isolée (par les techniques standards de PCR ou clonage) ou synthétisée chimiquement avant d'être insérée dans un vecteur d'expression conventionnel sous le contrôle d'éléments de régulation appropriés, le vecteur étant introduit dans la cellule hôte par toute technique de l'art. La cellule hôte en usage dans le cadre de la présente invention peut également être modifiée de manière à complémenter un adénovirus défectif par transfection de fragment(s) approprié(s) de génome adénoviral.
La présente invention a également pour objet l'utilisation d'un ligand capable d'influencer l'attachement d'un adénovirus à une cellule hôte et/ou son entrée au sein de cette dernière médiés par un polypeptide tel que défini ci-dessus. Le ligand en usage dans l'invention peut être de nature quelconque. On peut citer par exemple les peptides, les hormones, les anticorps ou leurs dérivés et, notamment, les anticorps simple chaîne de type scFv (pour single chain fragment variable en anglais) et les récepteurs solubles dépourvus de leur région transmembranaire. En particulier, un tel ligand peut dériver d'un polypeptide en usage dans la présente invention.
Conformément aux buts poursuivis par la présente invention, le ligand peut avoir une influence négative (antagoniste) ou positive (agoniste). De préférence, un ligand préféré présente une constante de dissociation à l'égard de l'adénovirus comprise entre 0,01 et 100 nM, avantageusement entre 0,1 et 50 nM et, de manière tout à fait préférée, entre 0,5 et 10 nM
Dans le cas d'un antagoniste, l'interaction du ligand avec la fibre permettra de diminuer ou inhiber les processus d'attachement et/ou d'entrée d'un adénovirus. Dans ce contexte, un ligand particulièrement préféré est basé sur un polypeptide tel que défini dans la SEQ ID NO: 1. A titre d'exemple, on peut citer un polypeptide comprenant une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus compris dans la séquence telle que montrée dans la SEQ ID
NO 6 commençant avec le résidu arginine en position 1 et finissant avec le résidu arginine en position 20. On préférera avoir recours au peptide désigné MH20 dans les exemples qui suivent.
Dans le cas d'une influence positive, le ligand en usage dans le cadre de la présente invention est utilisé pour permettre ou stimuler l'attachement et/ou l'entrée des adénovirus. Un ligand convenant aux fins de l'invention comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée dans la SEQ ID NO: 7 commençant avec le résidu arginine en position 1 et finissant avec le résidu sérine en position 20. Un exemple préféré consiste en le peptide désigné ci-après FN20.
La présente invention a également trait à un ligand comprenant une séquence en acides aminés homogue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée dans la SEQ ID NO: 6 ou 7.
Mais, il peut également s'agir d'un ligand d'origine adénovirale. Selon ce mode de réalisation, un ligand préféré dérive de la fibre d'un adénovirus, en particulier, de la partie de la tête interagissant avec les polypeptides précités. Un motif peptidique choisi dans cette région devrait donc influencer l'infectivité des adénovirus à l'égard d'une cellule hôte exprimant le polypeptide. Avantageusement, on a recours à un ligand recouvrant les résidus 438 à 486 de la fibre d'un adénovirus. Plus particulièrement, un ligand d'un polypeptide tel que défini par la SEQ ID NO: 1 dérive de préférence d'un Ad5 et comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus de la séquence telle que montrée dans la SEQ ID NO: 8, débutant à l'acide aminé leucine en position 1 et se terminant à l'acide aminé acide aspartique en position 18. Un ligand également envisageable peut dériver de la fibre d'un adénovirus de sérotype 2 et comprendre une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés de la séquence telle que montrée dans la SEQ ID NO: 9 débutant au résidu thréonine en position 1 et se terminant au résidu valine en position 16.
Le ligand d'un polypeptide tel que défini par les SEQ ID NO: 2 à 5 est plus particulièrement caractérisé par une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés de la séquence telle que montrée dans la SEQ
ID NO: 10 débutant au résidu leucine en position 1 et se terminant au résidu thréonine en position 14 (Ad5) ou dans la SEQ ID NO Il débutant au résidu asparagine en position 1 et se terminant au résidu asparagine en position 13 (Ad2).
La présente invention a également pour objet l'utilisation d'un ligand selon l'invention, pour la préparation d'un médicament destiné à inhiber ou diminuer une infection par un adénovirus. Dans ce contexte, on préférera l'usage d'un ligand antagoniste dans un but thérapeutique ou prophylactique. L'utilisation d'un ligand selon l'invention, de préférence agoniste, convient à la préparation d'un médicament destiné à favoriser ou faciliter une infection par un adénovirus, et, en particulier, d'un adénovirus recombinant porteur d'un gène thérapeutique à visée de thérapie génique (curative) ou anti-virale (SIDA) ou anti-cancéreuse. Un tel médicament trouve son utilité par exemple en association avec les traitements de thérapie génique afin d'améliorer l'infection virale chez un patient traité par un adénovirus recombinant.
On peut envisager une voie d'administration parentérale, orale ou encore par aérosol.
L'administration peut avoir lieu en dose unique ou répétée une ou plusieurs fois après un certain délai d'intervalle. Le dosage et la formulation appropriés varient en fonction de différents paramètres, par exemple de l'individu, de la maladie à traiter, de l'effet désiré, de la voie d'administration ou encore de l'adénovirus en cause.
La présente invention concerne également une méthode pour sélectionner ou identifier un récepteur cellulaire d'un virus dans un échantillon approprié, comprenant (a) I'immobilisation sur un support inerte d'un réactif d'origine virale comprenant
tout ou partie d'une protéine de surface dudit virus déterminant son
attachement au récepteur cellulaire, (b) I'incubation pendant un temps déterminé avec l'échantillon, (c) I'élution de l'échantillon retenu à l'étape (b) avec tout ou partie d'un anticorps
dirigé contre ledit réactif d'origine virale, et (d) I'analyse de l'échantillon élué à l'étape (c).
Le support inerte peut être sans limitation sous une forme quelconque (cône, tube, puits, billes ou analogues) et d'un matériau quelconque (naturel, de synthèse tels que les polymères, modifié chimiquement ou non...). La fixation du réactif sur le support inerte peut être réalisée de manière directe ou indirecte. De manière directe, on procédera de préférence par adsorption c'est à dire de manière non covalente bien que l'établissement de liaisons covalentes puisse également être considéré. De manière indirecte, on peut fixer préalablement un composé anti-réactif capable d'interagir avec le réactif de façon à immobiliser l'ensemble sur le support inerte. Selon un mode de réalisation avantageux, l'échantillon est constitué par une bibliothèque dite aléatoire et, en particulier d'expression (fragments génomiques, cADN) ou peptidique ou, de manière préférée, de phages exprimant des motifs peptidiques (phagotopes). De telles bibliothèques sont décrites dans la littérature ou accessibles commercialement. Dans le but de sélectionner ou identifier un récepteur cellulaire d'un adénovirus, on met de préférence en oeuvre à titre de réactif d'origine virale, tout ou partie de la fibre et, notamment, de la tête d'un adénovirus et, à titre d'éluant, un anticorps anti-fibre neutralisant (inhibiteur de l'attachement du virus à la surface de la cellule hôte). La fibre ou ses fragments peuvent être produits par voie recombinante et les anticorps par la technique d'hybridome ou par génie génétique (production d'anticorps simple chaîne scFv, Fab. ). On indique que la plupart des anticorps anti-fibre sont neutralisants. L'analyse est réalisée par comparaison de la séquence de l'échantillon élué avec les banques de données. Une telle analyse est à la portée de l'homme de l'art.
Enfin, la présente invention vise également une méthode pour sélectionner ou identifier la partie d'une protéine virale déterminant l'attachement d'un virus à un récepteur cellulaire dans un échantillon approprié, comprenant (a) I'immobilisation sur un support inerte de tout ou partie d'un anticorps dirigé
contre ladite protéine virale, (b) I'incubation pendant un temps déterminé avec ledit échantillon, (c) I'élution de l'échantillon retenu à l'étape (b) avec un réactif d'origine virale
comprenant tout ou partie de ladite protéine virale, et (d) I'analyse de l'échantillon élué à l'étape (c).
Les modes de réalisation spécifiques cités précédemment peuvent également s'appliquer dans ce contexte.
La présente invention a également pour objet l'utilisation d'un ligand bifonctionnel pour le ciblage d'un adénovirus vers une protéine de surface cellulaire autre que le récepteur cellulaire naturel dudit adénovirus, ledit ligand bifonctionnel comportant une première partie ligand capable d'interagir avec la fibre dudit adénovirus, une deuxième partie ligand capable d'interagir avec ladite protéine de surface cellulaire et, éventuellement, un espaceur entre lesdites première et deuxième parties ligand.
Au sens de la présente invention, un ligand bifonctionnel est capable d'interagir avec deux entités différentes l'une de préférence située à la surface d'un adénovirus et l'autre à la surface d'une cellule hôte, au niveau d'une protéine de surface cellulaire autre que le récepteur cellulaire naturel dudit adénovirus. Par ailleurs, les deux parties ligands peuvent être éventuellement séparées par un espaceur comprenant de I à une quinzaine d'acides aminés, de préférences non chargés L'utilisation d'un tel ligand bifonctionnel permet de cibler un adénovirus vers une cellule hôte d'intérêt, par exemple une cellule tumorale, une cellule infectée, un type cellulaire particulier ou une catégorie de cellules portant un marqueur de surface spécifique.
De préférence, la partie ligand interagissant avec la fibre adénovirale comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à au moins 6 acides aminés continus compris dans la SEQ. ID No: 6. De manière encore plus préférée, elle est constituée par le peptide MH20 (SEQ ID No: 6).
Pour ce qui est de la partie ligand interagissant avec la protéine de surface cellulaire, celle-ci est adaptée à la cellule hôte que l'on désire cibler. S'agissant d'une cellule infectée par le virus HIV (Human Immunodeficiency Virus), le ligand peut être un fragment d'anticorps contre la fusine, le récepteur CD4 ou contre une protéine virale exposée (glycoprotéine d'enveloppe) ou encore la partie de la protéine TAT du virus HIV s'étendant des résidus 37 à 72 , (Fawell et al. 1994,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 664-668). S'agissant d'une cellule tumorale, le choix se portera sur un ligand reconnaissant un antigène spécifique de tumeur (MUC-l dans le cas du cancer du sein, antigènes du papilloma virus HPV etc) ou surexprimé (récepteur à l'IL-2 surexprimé dans certaines tumeurs lymphoïdes). Si l'on désire cibler les lymphocytes T, on peut employer un ligand du récepteur de cellule T. Par ailleurs, la transferrine est un bon candidat pour un ciblage hépatique.
On peut également citer le peptide EGF (abréviation de Epidermal Growth Factor) permettant le ciblage vers les cellules exprimant le récepteur à l'EGF ou le peptide
GRP (pour Gastrin Releasing Peptide) de séquence GNHWAVGHLM CMichael et al, > 1995, Gene Ther. 2, 660-668) se liant au récepteur cellulaire GRP. D'une manière générale, les ligands qui peuvent être utilisés dans le contexte de l'invention sont largement décrits dans la littérature.
Un ligand bifonctionnel en usage dans le cadre de la présente invention peut être obtenu par les techniques de l'ADN recombinant, par synthèse ou par couplage chimique des deux parties ligands en question. De préférence, l'adénovirus à cibler est recombinant et porte un gène cytotoxîque ou capable d'induire l'apoptose cellulaire. De tels gènes sont parfaitement connus. On peut citer en particulier le géne codant pour la thymidine kinase du virus HSV- I (Virus de l'herpès simplex de type 1).
La présente invention est illustrée par référence aux figures suivantes
La Figure I présente les phagotopes obtenus après biorpaillage utilisant l'anticorps lu6.3 (a) ou 7A2.7 (b) à titre de ligand. Les motifs peptidiques des phagotopes sont alignés par rapport à la séquence de la tête d'AdS (le résidu méthionine initiateur de la fibre représentant le +1. Les régions formant des structures feuillets (Xia et al., 1994, s1mpra) sont soulignées et indiquées par (D), (E) et (F). Les résidus identiques ou conservés dans les séquences sont indiqués en gras.
La Figure 2 présente les phagotopes obtenus après biorpaillage utilisant (a)
I'anticorps 7A2.7 ou (c) 1D6.3 à titre d'éluant, (b) et (d) les séquences consensus déterminées à partir des phagotopes (a) et (c) respectivement ainsi que les séquences homologues trouvées par analyse de la banque de données SWISS PROT. Les résidus conservés à des positions analogues sont indiqués en gras.
La Figure 3 illustre l'expression du gène luciférase dans les cellules HeLa infectées avec le virus Ad5Luc3 à une MOI constante (0,16 fou/105 cellules) (O) l'Ad5Luc3 est ajouté aux cellules refroidies à 0 C en présence de molarités croissantes de peptide (a) FN20 (0 à 500 ,uM) ou (b) MH20 (0 à 50 I1M). Les témoins correspondent à l'incubation des peptides après l'attachement de l'Ad5Luc3 () ou après l'endocytose (o).
La Figure 4 illustre l'expression du gène luciférase dans les cellules Daudi
HLA- () ou Daudi-HLA+ ( ) infectées avec des concentrations croissantes d'AdSLuc3 (0,3 à 150 flù/l0 cellules). L'AdSLuc3 est mis en contact des cellules pré-refroidies à 0 C pendant 1 h afin de permettre l'attachement viral mais pas l'entrée. L'activité luciférase est évaluée après 18 h de culture à 37"C. Les valeurs
RLU représentent la moyenne de trois expériences séparées
EXEMPLES
Les cellules HeLa (ATCC CCL2) sont cultivées en monocouches selon les
techniques de l'art. On utilise de préférence un milieu DMEM (Dulbecco's Modified
Eagle's Medium > Gibco) contenant 10 % de sérum de veau foetal (FCS) inactivé
à la chaleur, de la L-glutamine et des antibiotiques habituels. Les cellules Daudi
HLA- (ATCC CCL213) et HLA+ (Quillet et al., 1988, J. Immunol. 141, 17-20)
sont maintenues dans du milieu RPMI 1640 (Gibco) supplémenté avec 15 % de
FCS.
L'Ad5 sauvage et 1'AdSLuc3 recombinant sont propagés dans les cellules
HeLa par les techniques standards. A titre vindicatif, Ad5Luc3 est un adénovirus
compétent pour la réplication qui contient le gène luciférase placé sous le contrôle
du promoteur précoce du virus SV40 (Virus simien 40) inséré dans la région E3
du génome adénoviral (Mittal et al., 1993, Virus Research 28, 67-90).
EXEMPLE 1 Production d'anticorps monoclonaux (mAb! capable d'inhiber
l'attachement de l'Ad5 aux cellules permissives.
Les mAbs murins 1D6.3 et 7A2.7 ont été générés par les techniques
classiques en injectant la tête de la fibre d'Ad5 produite dans les bactéries par voie
recombinante (Henry et al., 1994, J. Virol. 68, 5239-5246) à des souris Balb/C. La
fusion et l'obtention de clones d'hybridomes sont des techniques conventionnelles
à la portée de l'homme de l'art. Les clones sécretant sont selectionnés par leur
reconnaissance de l'antigène qui a servi à l'immunisation en ELISA. On indique
qu'ils présentent une activité neutralisante à l'égard des virions (Michael et al., en
préparation) .
Séro-réactivité des anticorps monoclonaux 1D6. 3 et 7A 2. 7.
La réactivité des anticorps est testée à l'égard du domaine de la tête de la fibre
de 3 sérotypes différents (Ad2, Ad5 et Ad3) préparé par voie recombinante. Les séquences correspondantes sont isolées par PCR (Polymérase Chain Reaction) à partir d'ADN génomique viral puis introduites dans le virus AcNPV (Aittographa califorszica Nuclear Polyhedrosis Virus) sous le contrôle du promoteur polyhedrine (Luckow et Summer, 1989, Virology 170, 31-39). Les protéines recombinantes sont exprimées dans les cellules d'insecte Sf9 (Spodoptera fr-rrgiperda). La technologie générale est détaillée dans Karayan et al. (1994, Virology 202, 782796) et Novelli et Boulanger (1991, Virology 185, 365-376). Plus précisément, les séquences Ad5 portant le dernier motif répété de la tige suivi de la tête de la fibre, sont clonées à l'aide des amorces représentées aux SEQ ID NO - 12 et 13. L'amorce sens correspond aux nucléotides 32164 à 32205 du génome Ad5 (Chroboczek et
Jacrot, 1987, Virology 161, 549-554), inclut 4 mismatch de manière à créer un site BamHl et à remplacer la thréonine en position 388 de la fibre native par un codon
ATG initiateur. L'amorce antisens correspond aux nucléotides 32919 à 32883 du génome Ad5 et permet de créer un site KpnI pour faciliter les étapes ultérieures de clonage. La protéine recombinante récoltée dans les surnageants de cellules Sf9 est désignée F5-AT386. La tête de l'Ad2 est produite à partir du vecteur baculovirus décrit dans Louis et al. (1994, J. Virol. 68, 4104-4106). Le produit d'expression désigné F2-AT388 débute en position 388 (par remplacement de l'Ala de la séquence native par une Met) et porte, outre le domaine de la tete, le dernier motif répété de la tige. Enfin, pour les séquences correspondantes de l'Ad3, on utilise une amorce sens (SEQ ID NO: 14) conçue pour introduire un site de clonage NcoI et remplacer les codons Asn et Ser en position 124 et 125 par des codons Met et Ala respectivement. L'amorce antisens (SEQ ID NO- 15) introduit un site KpnI. Le produit d'expression est désigné F3-AT124.
Les cupules d'une plaque ELISA sont recouvertes par la protéine recombinante F5-AT386, F2-AT388 ou F3-AT124 sur laquelle on fait réagir le mAb 1D6.3 ou 7A2.7 puis un anticorps anti-souris marqué (par exemple à la phosphatase ou la péroxidase). Une réaction positive est observée à l'égard de la protéine recombinante F5-AT386 native Aucune réaction n'est détectée dans les puits contenant la protéine F5-AT386 dénaturée au SDS ni ceux contenant les produits F2-AT388 et F3-AT124 natifs ou dénaturés. Ces données suggèrent que ces anticorps reconnaissent un épitope conformationnel spécifique du sérotype C.
Effet inhibitel/r des anticorps rnonocloeîaîx 1d6.3 et 7A2.7 sitr I'attachenîetit celil/laire de lAdS.
On procède à un test de microliaison sur cellules HeLa en culture à l'aide de virions Ad5 marqués à la valine [14C] (activité spécifique de 2200 à 2500 cpm/ 108 virions) suivi d'une autoradiographie in situ (Silver et Anderson, 1988, Virology /6S,377-387). Pour ce faire, les cellules à l'état de semi confluence sont mises en présence d'une quantité constante de virions radioactifs (103 cpm pour 5x 104 cellules) à une multiplicité d'infection (MOI) de 1000 virions par cellule pendant 1 h à 0 C en présence de mAb 1D6.3 ou 7A2.7 (dilutions au 1:10, 1:8, 1:4 et 1:2 des surnageants d'hybridomes respectifs dont la concentration en mAb est estimée à 0 > 1-0,2 lig/ml, ce qui correspond à un excès en mAb par rapport aux virions présents dans l'innoculum de 100, 250, 500 et 1000 respectivement). Les cellules sont ensuite lavées en présence de PBS, fixées par 0,1 % de paraformaldéhyde dans du PBS, séchées et recouvertes par l'émulsion K4 sous forme de gel (Ilford Nuclear
Research). Après une exposition d'une semaine et développement (agent de développement D19B, Kodak), les échantillons sont colorés brièvement par 0,5 % de bleu de toluidine repris dans H2O et examinés sous microscope. La densité des grains d'argent réduit autour du contour des cellules est représentatif du nombre de virions [14C] liés à la surface cellulaire.
En l'absence de mAb anti-tête ou à une concentration faible (dilution 1:10), un halo sombre de grains d'argent réduit est visible autour des cellules indiquant une adsorption des virions à leur surface. Une réduction du halo dépendante de la concentration en mAb est observée pour les dilutions 1:8, 1:4 et 1 :2. Ces résultats traduisent un blocage de la liaison de la tête adénovirale au récepteur cellulaire primaire dû aux mAb 1D6.3 et 7A2.7 dirigés contre cette partie de la fibre. Une comparaison de la surface des halos pour les mêmes dilutions montre que l'anticorps 1D6.3 est plus inhibiteur de l'attachement de l'Ad5 au récepteur cellulaire des HeLa que le mAb 7A2.7.
EXEMPLE 2 Identification des épitopes des mAb 1D6.3 et 7A2.7.
Les épitopes de la fibre étant présumés être conformationnels (Fender et al., 1995, Virology 214, 110-I 17), la méthode classique d'identification des épitopes par balayage de peptides n'est pas appropriée. On procède selon une technique de biorpaillage dérivée de celles décrites par Smith et Scott (1993, Methods Enzymol.
217, 228-257) et Hong et Boulanger (1995, EMBO J. 14, 4714-4727). Dans ce cas, le mAb in6.3 ou 7A2.7 est adsorbé une nuit à 40C sur une plaque de microtitration (Nunc Immunomodule MaxiSorp F8) à une concentration de I lig/puits dans un tampon carbonate de sodium 0,1 M pH9,6. Les anticorps immobilisés sont mis en contact d'une bibliothèque de phages exprimant des hexapeptides (phages fUSES > Scott et Smith, 1990, Science 249, 386-390). Dans une seconde étape les phages retenus sont élués soit par un tampon d'élution acide conventionnel soit, plus sélectivement, par compétition en présence d'un excès de protéine recombinante F5-AT386. Les motifs hexapeptîdiques (phagotopes) portés par les phages élués sont déterminés par séquençage de la protéine pili fUSES par la méthode de Sanger et al (1977, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 7d, 5463-5467).
Les homologies de séquences avec les phagotopes sont recherchées dans la banque de données Swiss Prot et le programme FASTA 1.6 (Pearson et Lipman, 1988,
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, 2444-2448) et les alignements de séquences réalisées en utilisant la version W(1;4) du programme Clustal (Higgins et Sharp, 1988, Gene 73, 237-244).
Comme le montre la Figure 1, le mAb 1D6.3 retient différents phagotopes dont les séquences se chevauchent, et sont homologues à la tête d'AdS s'étendant entre les résidus Val en position 438 et Asp en position 462. En dépit d'un certain degré de dégénération et de dispersion, on a pu déterminer un motif central de séquence LAPISGTVQSAHLIIRFD correspondant aux acides aminés en positions 445 à 462 (SEQ ID NO: 8). Ce motif est centré sur le résidu His en position 456, ce qui corrobore la présence d'histidine dans plusieurs phagotopes indépendants.
De plus, trois phagotopes contiennent une histidine proche d'une sérine (GISHTG et GASHTV) et une séquence homologue est trouvée dans la tête (453QSAHLI458).
Du côté N-terminal, la séquence LAPIS est représentée dans plusieurs phagotopes sous la forme L-P, VAP-S et LIPFNS.
Les analyses de séquence des 15 phagotopes retenus par le mAb 7A2.7, ont mises en évidence la présence d'une proline à 4 reprises, de tryptophane et histidine 8 fois et l'association dans le même phagotope de deux résidus aromatiques est trouvée 5 fois. Il semble donc que 1'épitope du mAb 7A2.7 contienne un résidu proline, tel que celui en position 475 de la fibre, à proximité d'un groupe de résidus aromatiques, tel que 477yWNF480 En outre, deux phagotopes FWLAVR et
WALFRS sont homologues au motif 477YWNFR481 Sur la base de ces données,
I'épitope du mAb 7A2.7 a été cartographié entre les résidus 473 et 486 de la fibre Ad5 (SEQ ID NO: 10).
En résumé, les mAb in6.3 et 7A2.7 reconnaissent des segments adjacents de 15 à 20 aa dans la séquence linéaire de la tête d'AdS, les résidus s'étendant des positions 445 à 462 et 473 à 486 respectivement. Selon le modèle tridimensionnel de la tête proposé par Xia et al. (1994, Curr. Biol. Structure 2, 1259-1270), les deux épitopes occupent des régions continues d'un point de vue spatial. L'épitope du mAb In6.3 recouvre une partie de la boucle CD et du feuillet ss D, alors que l'epitope du mAb 7A2.7 est localisé au niveau du segment adjacent DE et des deux feuillets ss E et F. L'épitope 1D6 3 se situe à l'intérieur d'un feuillet R alors que l'épitope 7A2.7 est orienté plus latéralement par rapport au feuillet R.
EXEMPLE 3 Identification des récepteurs cellulaires de l1AdS par la
technique de biorpaillage réverse.
Cette technique est dite réverse par rapport à la précédente puisqu'on utilise la fibre comme ligand et le mAb comme éluant. On procède donc par immobilisation de la tête de la fibre de 1'AdS sur laquelle on fait réagir la bibliothèque de phages exprimant des phagotopes hexapeptidiques. Les phages adsorbés peuvent être élués soit par un tampon acide conventionnel soit par le mAb 1D6.3 ou 7A2.7 et la protéine plil recombinante portant leurs phagotopes respectifs est séquencée. La recherche dans les banques de données est effectuée comme ci-dessus. Les motifs hexapeptidiques identifiés sont présentés à la Figure 2.
Les phagotopes produits par compétition avec le mAb 7A2.7 sont présentés à la Figure 2a. Leur analyse permet de dériver une séquence consensus (Figure 2b) qui présente une homologie avec les motifs 1, 3, 5 et 14 du module de type III de la fibronectine humaine (SEQ ID NO: 2 à 5) (Main et al., 1992, Cell 71, 671-678).
Ces derniers se situent au niveau du feuillet ss B et de la boucle adjacente BC du module FNIIJ (Dickinson et al., 1994, J. Mol. Biol. 236, 1079-1092).
Les phagotopes élués après action du mAb lu6.3 sont décrits à la Figure 2c.
L'ensemble des séquences se chevauchent et permettent de déterminer également une séquence consensus (Figure 2d). La recherche d'homologie avec les séquences répertoriées dans les banques de données révèle une homologie avec la région Cterminale du domaine a-2 de la chaîne lourde des molécules MHC de classe I (MHC-Ia-2) (position 156 à 180) (SEQ ID NO: 1).
EXEMPLE 4 : Interactions de la fibre adénovirale avec le module FNIII et le
domaine MHC-Ia-2
L'interaction est étudiée in vilro à l'aide d'une protéine chimère issue de la fusion C-terminale de la protéine GST (Glutathion S-transférase) à un pentadécapeptide RHILWTPANTPAMGY reproduisant la séquence consensus homologue au feuillet ss B et la boucle BC de FNIII (voir exemple précédent et
Figure 2b) Pour ce faire, les oligonucléotides présentés aux identificateurs de séquences 16 et 17 sont hybridées et introduits dans le site )(7iol du plasmide pGEX
KG (Guan et Dixon, 1991, Anal. Biochem. 192, 262-267) 11 est à noter que les oligonucléotides une fois réhybridés génèrent un site X/7{,1 à l'extrémité 5' si l'insert est cloné dans l'orientation correcte. Ceci permet d'intégrer une seule copie ou de multiples copies en tandem au niveau du site )7ion reconstitué. La séquence du produit de fusion comprenant une copie du pentadécapeptide (désigné GST-FNxl) peut être schématisée de la manière suivante GST- (site de clivage par la thrombine-PGIS-GGGGG-LDSMGRLE-RHII,W I PANTPAMGY(V)-ELKLNS- stop. Les constructions GST-FNx2 et GST-FNx3 comportent respectivement 2 et 3 répétitions du pentadécapeptide entre les résidus LE et EL de la cassette de clonage.
Les oligonucléotides sens et antisens (SEQ ID NO: 18 et 19) codant pour la séquence consensus obtenue par compétition avec le mAb 1 D6.3 (Figure 2d) sont insérés selon la même stratégie que précédemment à l'extrémité C-terminale de la
GST pour donner les constructions GST-MHCxl, GST-MHCx2 et GST-MHCx3 selon le nombre de motifs présents. Les protéines chimères GST-FN et GST-MHC sont produites dans L. coli, extraites et purifiées par affinité sur des billes d'agarose-glutathion (Sigma) selon les méthodes conventionnelles (Smith et
Johnson, 1988, Gene 67, 31-40)
En parallèle, les fibres complètes des sérotypes 2, 3 et 5 sont produites par voie recombinante selon la technologie baculovirus/cellules 519 déjà employée. La construction F2-FL582 portant le gène de la fibre Ad2 est décrite dans Novelli et
Boulanger (1991,Virology 185, 365-376). Les séquences codant pour les fibres
AdS et Ad3 sont isolées par PCR en utilisant I'ADN viral à titre de matrice et des amorces sens et antisens appropriées telles que celles reportées aux SEQ ID NO. 20 et 13 et 21 et 15. Le segment amplifié est introduit dans un vecteur baculovirus sous le contrôle du promoteur polyhédrine et le produit d'expression récupéré dans les surnageants de culture. On obtient FS-FL581 et F3-FL320 correspondant aux fibres Ad5 et Ad3 respectivement.
La capacité du module FNIII et du domaine a-2 MHC-I recombinant à lier la fibre adénovirale est évaluée par immunotransfert après incubation in vitro des protéines de fusion GST-FN et GST-MHC et des fibres recombinantes F2-FL582,
F5-FL581 et F3-FL320. Les complexes formés sont isolés sur billes d'agarose glutathion dans les conditions décrites par Johnson et al (1995, J. Biol. Chem. 270, 24352-24360) puis analysés sur gel de polyacrylamide de 12,5 % (SDS-PAGE) en utilisant un système de tampon discontinu (Laemmli, 1970, Nature 227, 680-685).
Les protéines sont transférées sur membrane de nitrocellulose (0,8 mA/cm2 système Cambridge Electrophoresis , UK) dans un tampon Tris-HC1 25 mM, glycine 192 mM, pH8,3 contenant 20 % de méthanol. Après traitement avec une solution de blocage (lait écrémé 5 /O, sérum de veau 1 % dans du tampon TBS-T
20 mM Tris-HCI pH7,8, 0,15 M NaC1, 0,05 % Tween 20), la membrane est mise en contact avec l'anticorps 4D2.5 (Hong et Engler, 1991,Virology 185, 758-767) puis un conjugué anti IgG marqué à la péroxydase de raifort. La révélation par le substrat chimiluminescent peroxydase (SuperSignal, Pierce Chemicals) est réalisée selon Carrière et al. (1995, J. Virol. 69, 2366-2377) et les luminogrammes (Hyperfilm ss-max, Amersham) sont analysés à 610 nm à l'aide d'un densitomètre automatique (REP-EDC, Helena Laboratories, Beaumont, TX). A titre indicatif,
I'anticorps 4D2.5 reconnaît lépitope FNPVYP du domaine de la queue conservé chez la plupart des adénovirus mammifères.
GST-FNxl, GST-FNx2 et GST-FNx3 se lient à F5-AT386 et F2-AT388 avec une grande efficacité alors que F3-AT124 est retenu à un moindre niveau. Un comportement similaire est observé avec les protéines chimères GST-MHCxl,
GST-MHCx2 et GST-MHCx3 qui retiennent F5-AT386 et F2-AT388 avec une efficacité supérieure à F3-AT124.
La fibre Ad5 se lie aux protéines de fusion GST-FN et GST-MHC et ceci avec une affinité 2 à 3 fois supérieure par rapport à la fibre Ad2 et 10 à 15 fois supérieure par rapport à la fibre Ad3. De plus, I'efficacité de liaison n'est pas dépendante du nombre de motifs présents dans la protéine de fusion, I'intensité étant comparable et même parfois plus faible entre GST-FNxl et GST-FNx3 et
GST-MHCx 1 et GST-MHCx3. Ceci peut être expliqué par le fait que les motifs en tandem peuvent adopter une conformation qui nuit à la liaison.
EXEMPLE 5 Influence des peptides synthétiques dérivés de FNIII et MHC
la2 sur l'attachement des virus à la surface cellulaire
Deux peptides synthétiques reproduisant les motifs FNIII et MHC-la2 ont été synthétisés chimiquement et purifiés selon les techniques de l'art. FN20 (SEQ
ID NO: 7) reproduit la séquence consensus des phagotopes élués par l'anticorps 7A2.7 et MH20 (SEQ ID NO: 6) correspond à celle des phagotopes élués par le mAb 1D6.3.
Les peptides FN20 et MH20 sont testés vis à vis de l'attachement de l'adénovirus rapporteur AdSLuc3 à des cellules HeLa cultivées ni vitro. Le test est réalisé en partie à 0 C, une température qui permet l'attachement des virus à la surface des cellules permissives mais, en revanche, bloque l'entrée des virus et le recyclage des récepteurs. L'AdSLuc3 (MOI 0,16 pou/105 cellules) est préalablement incubé avec des quantités croissantes de peptides (0,01 à 500 nM) à température ambiante pendant 2 heures puis le mélange est ajouté à une culture cellulaire placée sur glace. Après I h à OOC, les virus non adsorbés et les peptides sont éliminés par lavage et la culture est poursuivie pendant 18 h à 37"C après ajout d'un milieu préchauffé. Les lysats cellulaires sont préparés de manière conventionnelle et l'activité luciférase exprimée en RLU (pour Relative Light Units en anglais) est déterminée (substrat Promega, Madison, Wl , luminomêtre Lumat LB-9501,
Brethold Bioanalytical, Wildbad, Allemagne).
Les résultats de compétition avec le peptide FN20 sont présentés à la Figure 3a. Aucun effet significatif n'est obtenu jusqu'à une molarité de 10 1M puis une augmentation progressive de l'activité luciférase apparaît au delà de 25 ,uM. En particulier, I'activité croît d'un facteur 100 entre 25 et 100 ,uM. Le peptide FN20 a donc un effet stimulateur de l'attachement viral. Il ne confère aucune cytotoxicité apparente et n'a pas d'effet négatif sur l'expression du gène luciférase une fois le virus préattaché (peptide ajouté à la culture cellulaire après l'étape d'attachement viral à 0 C) ou préendocytosé (peptide ajouté à la culture cellulaire après l'étape d'attachement et de pénétration du virus).
Dans le cas du peptide MH20 (Figure 3b), on observe une légère augmentation de l'expression du gène luciférase pour les molarités comprises entre 0,05 et 2,5 1M (activité S à 6 fois plus élevée à 2,5 ,uM) Ce phénomène est suivi d'une diminution rapide des niveaux de luciférase lorsque les molarités utilisées sont supérieures à S ,uM, avec une diminution d'un facteur 100 par rapport au contrôle à 25 ,1M et de presque quatre ordres de magnitude à 50 I1M, montrant que lié au virus, il bloque la fixation au récepteur cellulaire. Comme précédemment, le peptide MH20 à des concentrations de 50 HM ne présente aucun effet cytotoxique et n'influence pas l'expression du gène reporter après le préattachement ou la préendocytose de l'AdSLuc3. L'inhibition presque totale de l'activité luciférase en présence de 50 pM de MH20 est le reflet d'une neutralisation complète du virus.
EXEMPLE 6 Séro-spécificité de la neutralisation virale par les peptides
synthétiques
Les adénovirus sauvages Ad5, Ad2 Ad3 sont préincubés pendant 2 h à température ambiante avec le peptide inhibiteur MH20 à une molarité constante (25 ptM), la MOI variant de 0,2 à 2 pfu/cellule. Le mélange est mis en présence des cellules HeLa pendant 1 h à 0 C et la culture poursuivie à 37"C après élimination des virus non adsorbés dans les memes conditions que celles décrites ci-dessus. Le niveau de synthèse de l'hexon, de la radioactivement (marquage à la [35S] méthionine et la [35S] cystéine , activité spécifique de 50000 à 65000 cpm/g de protéine). La fibre adsorbée sur l'un ou l'autre des peptides est éluée avec une solution adéquate (urée I M, NaOH I M et
SDS I %) puis précipitée en présence d'acide trichloroacétique. La radioactivité contenue dans le précipité récupéré sur filtre GF/C est comptée à l'aide d'un spectromètre à scintillation liquide (Beckman LS-6500) et les constantes de dissociation (Kd) déterminées selon Scatchard (1949, Annls NY Acad. Sci. 51, 660-672).
Le Kd de la fibre AdS marquée à l'égard du peptide MH20 est évalué à 3,out 0,6 nM et celui trouvé pour le peptide FN20 est de 8,0 t 1,9 nM (n=3 dans les deux cas)
EXEMPLE 8 L'infectivité de l'Ad5 est dépendante de l'expression des
MHC-I à la surface des cellules permissives
La lignée Daudi de lymphoblastoides B, établie à partir d'un lymphome de
Burkitt, est naturellement déficiente en l'expression de la p-2 microglobuline et, de ce fait, ne possède pas à sa surface les molécules HLA de classe I (Daudi HLA-).
La lignée cellulaire E8. I dérivée des Daudi a été générée par transfection d'un gène codant pour la p-2 microglobuline afin de restaurer l'expression de molécules HLA de classe là leur surface (Daudi-HLA+ , Quillet et al., 1988, J. Immunol. 141, 1720).
Les expériences d'attachement de l'Ad5Luc3 à 0 C ont été menées sur les cellules Daudi HLA- et Daudi-HLA+ avec une MOI de trois ordres de magnitude plus forte que celle employée dans le cas des cellules ldeLa (0,3 à 150 pou/105 cellules). L'activité luciférase mesurée dans les lysats cellulaires 18 h post-infection est représentée à la Figure 4. Lorsque l'infection concerne les cellules Daudi
HLA+, l'activité luciférase augmente régulièrement d'une manière MOI dépendante jusqu'à atteindre un plateau au delà de 5 pou/105 cellules. Pour ce qui est des cellules Daudi HLA-, le signal luminescent est très faible (3 à 4 ordres de magnitude) par rapport à celui observé avec les cellules pourvues de molécules
HLA fonctionnelles à leur surface. Ces expériences montrent que l'expression du
MHC-I à la surface cellulaire est nécessaire à l'infection Ad5
LISTE DE SEQUENCES (1) INFORMATION GENERALE:
(i) DEPOSANT:
(A) NOM: Centre National de la Recherche Scientifique
(CNRS)
(B) RUE: 3 rue Michel Ange
(C) VILLE: Paris
(E) PAYS: France
(F) CODE POSTAL: 75794 Cedex 16
(G) TELEPHONE: (33) 01 44 96 40 00
(H) TELECOPIE: (33) 01 44 96 50 00
(ii) TITRE DE L' INVENTION: Récepteurs cellulaires des adénovirus.
(iii) NOMBRE DE SEQUENCES: 21
(iv) FORME LISIBLE PAR ORDINATEUR:
(A) TYPE DE SUPPORT: Floppy disk
(B) ORDINATEUR: IBM PC compatible
(C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS
(D) LOGICIEL: PatentIn Release #1.0, Version #1.25 (OEB) (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 25 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: domaine alpha 2 des antigenes MHC-I
(positions 156 a 180)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
Leu Arg Ala Tyr Leu Glu Gly Thr Cys Val Glu Trp Leu Arg Arg Tyr
1 5 10 15
Leu Glu Asn Gly Lys Glu Thr Leu Gln
20 25 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 26 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: module de type III 1 de la
fibronectine humaine
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
Asn Ser His Pro Ile Gln Trp Asn Ala Pro Gln Pro Ser His Ile Ser
1 5 10 15
Lys Tyr Ile Leu Arg Trp Arg Pro Lys Asn
20 25 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 3:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 25 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: module de type III 4 de la
fibronectine humaine
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:
Val Lys Val Thr Ile Met Trp Thr Pro Pro Glu Ser Ala Val Thr Gly
1 5 10 15
Tyr Arg Val Asp Val Ile Pro Val Asn
20 25 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 4:
(l) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 25 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: module de type III 5 de la
fibronectine humaine
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
Ser Thr Val Leu Val Arg Trp Thr Pro Pro Arg Ala Gln Ile Thr Gly 5 5 10 15
Tyr Arg Leu Thr Val Gly Leu Thr Arg
20 25 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 5:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 25 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: module de type III 14 de la
fibronectine humaine
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 5:
Asn Ser Leu Leu Val Ser Trp Gln Pro Pro Arg Ala Arg Ile Thr Gly
1 5 10 15
Tyr Ile Ile Lys Tyr Glu Lys Pro Ser
20 25 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 6:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 20 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: peptide de synthese MH20
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 6:
Arg Ala Ile Val Gly Phe Arg Val Gln Trp Leu Arg Arg Tyr Phe Val
1 5 10 15
Asn Gly Ser Arg
20 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 7:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 20 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: peptide de synthese FN20
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 7:
Arg His Ile Leu Trp Thr Pro Ala Asn Thr Pro Ala Met Gly Tyr Leu 5 5 10 15
Ala Arg Val Ser
20 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 8:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 18 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(C) INDIVIDUEL ISOLE: serotype 5
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 8:
Leu Ala Pro Ile Ser Gly Thr Val Gln Ser Ala His Leu Ile Ile Arg
1 5 10 15
Phe Asp (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 9:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 16 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(il) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(C) INDIVIDUEL ISOLE: serotype 2
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 9:
Thr Val Ala Ser Val Ser Ile Phe Leu Arg Phe Asp Gln Asn Gly Val
1 5 10 15 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 10:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 14 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(C) INDIVIDUEL ISOLE: serotype 5
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 10:
Leu Asp Pro Glu Tyr Trp Asn Phe Arg Asn Gly Asp Leu Thr 5 5 10 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 11:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 13 acides aminés
(B) TYPE: acide aminé
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: peptide
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(v) TYPE DU FRAGMENT: interne
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 2
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 11:
Asn Ser Ser Leu Lys Lys His Tyr Trp Asn Phe Arg Asn 5 5 10 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 12:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 42 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 5
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (nt32164
32205 Ad5)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 12:
CCTAAACTAG GATCCGGCCT TAGTTTTGAC AGCATGGGTG CC 42 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 13:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 37 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: OUI
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 5
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (nt
32919 32883 Ad5)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 13: CTGTGAGTTT GATTAAGGTA CCGTGATCTG TATAAGC 37 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 14:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 36 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 3
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (Ad3)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 14:
GGTCTTACAT TTGACTCTTC CATGGCTATT GCACTG 36 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 15:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 35 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: OUI
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 3
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (Ad3)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 15:
CAATAAAAAA TGTGGTACCT TATTTTTGTT GTCAG 35 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 16:
(l) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 51 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese
(sequence consensus FNIII)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 16:
TCGAGAGGCA TATACTTTGG ACTCCTGCTA ATACACCGGC AATGGGGTAT G 51 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 17:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 51 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: OUI
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese
(sequence consensus FNIII)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 17:
TCGACATACC CCATTGCCGG TGTATTAGCA GGAGTCCAAA GTATATGCCT C 51 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 18:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 65 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese codant
pour la séquence consensus MHC-I
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 18:
TCGAGAGGGC TATAGTTGGG TTTAGGGTGC AATGGCTTAG GCGGTATTTT GTGAATGGGT 60
CGAGG 65
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 19:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 65 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: OUI
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: homo sapiens
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese codant
pour aa 157-176 du MHC-I
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 19:
TCGACCTCGA CCCATTCACA AAATACCGCC TAAGCCATTG CACCCTAAAC CCAACTATAG 60
CCCTC 65 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 20:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 30 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 5
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (nt
31021-31050 Ad5)
(X1) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 20:
CCATCCGCAC CCACTATGAT CACGTTGTTG 30 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 21:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 27 paires de bases
(B) TYPE: acide nucléique
(C) NOMBRE DE BRINS: simple
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Mastadenovirus
(B) SOUCHE: serotype 3
(C) INDIVIDUEL ISOLE: oligonucleotide de synthese (Ad3)
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 21:
CTTCATTTCT TTATCCCCCC ATGGCCA 27

Claims (3)

  1. ligands.
    éventuellement, un espaceur entre lesdites première et deuxième parties
    capable d'interagir avec ladite protéine de surface cellulaire et,
    capable d'interagir avec la fibre dudit adénovirus, une deuxième partie ligand
    adénovirus, ledit ligand bifonctionnel comportant une première partie ligand
    protéine de surface cellulaire autre que le récepteur cellulaire naturel dudit
    Revendications 1. Utilisation d'un ligand bifonctionnel pour le ciblage d'un adénovirus vers une
  2. 2. Utilisation selon la revendication 1, selon laquelle ladite première partie
    ligand comprend une séquence en acides aminés homologue ou identique à
    au moins 6 acides aminés continus compris dans la SEQ ID NO: 6.
  3. 3. Utilisation selon la revendication 2, selon laquelle ladite première partie
    ligand est un peptide ayant une séquence en acides aminés identique à la SEQ
    ID NO: 6 commençant avec le résidu arginine en position 1 et finissant avec le
    résidu arginine en position 20.
FR9711166A 1997-01-30 1997-09-09 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus Expired - Fee Related FR2758822B1 (fr)

Priority Applications (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9711166A FR2758822B1 (fr) 1997-01-30 1997-09-09 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
JP10532596A JP2000510708A (ja) 1997-01-30 1998-01-30 アデノウイルスの細胞レセプターとしてのポリペプチドの使用
PCT/FR1998/000184 WO1998033929A2 (fr) 1997-01-30 1998-01-30 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
EP98905474A EP0900280A2 (fr) 1997-01-30 1998-01-30 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
US09/155,613 US6420120B1 (en) 1997-01-30 1998-01-30 Use of a polypeptide as cell receptor for adenoviruses
CA002251036A CA2251036A1 (fr) 1997-01-30 1998-01-30 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
AU61046/98A AU731911B2 (en) 1997-01-30 1998-01-30 Use of a polypeptide as cellular receptor for adenoviruses
US10/156,820 US20020150558A1 (en) 1997-01-30 2002-05-30 Use of a polypeptide as cellular receptor for adenoviruses

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9701005A FR2758821B1 (fr) 1997-01-30 1997-01-30 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
FR9711166A FR2758822B1 (fr) 1997-01-30 1997-09-09 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus

Publications (2)

Publication Number Publication Date
FR2758822A1 true FR2758822A1 (fr) 1998-07-31
FR2758822B1 FR2758822B1 (fr) 1999-07-02

Family

ID=26233288

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FR9711166A Expired - Fee Related FR2758822B1 (fr) 1997-01-30 1997-09-09 Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus

Country Status (7)

Country Link
US (2) US6420120B1 (fr)
EP (1) EP0900280A2 (fr)
JP (1) JP2000510708A (fr)
AU (1) AU731911B2 (fr)
CA (1) CA2251036A1 (fr)
FR (1) FR2758822B1 (fr)
WO (1) WO1998033929A2 (fr)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU4070499A (en) 1998-04-30 1999-11-16 Cornell Research Foundation Inc. Adenoviral vectors with tandem fiber proteins
AU767975B2 (en) 1998-09-11 2003-11-27 Genvec, Inc. Alternatively targeted adenovirus
EP1020529B1 (fr) * 1998-11-20 2005-06-01 Crucell Holland B.V. Vecteurs d'apport de gènes munis d'un tropisme pour les cellules des muscles lisses et/ou les cellules endothéliales
IL133032A (en) * 1998-11-20 2007-06-03 Introgene Bv Adenoviral gene delivery vectors provided with a tissue tropism for smooth muscle cells and /or endothelial cells
WO2002029003A2 (fr) 2000-10-06 2002-04-11 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Methode d'analyse massivement parallele destinee a decoder l'adn et l'arn
US7026164B2 (en) * 2003-07-03 2006-04-11 Cell Genesys, Inc. Adenovirus packaging cell lines
CA2567156A1 (fr) * 2004-05-17 2006-07-20 Cambrios Technology Corp. Biofabrication de transistors y compris des transistors a effet de champ

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1995005189A1 (fr) * 1993-08-12 1995-02-23 The Regents Of The University Of California Modulation des antigenes de classe i du complexe majeur d'histocompatibilite (cmh) de l'activite d'un recepteur de surface

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5385888A (en) * 1987-03-20 1995-01-31 The Regents Of The University Of California Class I MHC modulation or surface receptor activity
US5719064A (en) * 1992-08-31 1998-02-17 Oklahoma Medical Research Foundation Peptide diagnostics and therapeutics for spondyloarthropathies
US5846782A (en) * 1995-11-28 1998-12-08 Genvec, Inc. Targeting adenovirus with use of constrained peptide motifs
GB9514368D0 (en) * 1995-07-13 1995-09-13 Medical Res Council Improvements in or relating to binding assays

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1995005189A1 (fr) * 1993-08-12 1995-02-23 The Regents Of The University Of California Modulation des antigenes de classe i du complexe majeur d'histocompatibilite (cmh) de l'activite d'un recepteur de surface

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DOUGLAS J T ET AL: "TARGETED GENE DELIVERY BY TROPISM-MODIFIED ADENOVIRAL VECTORS", BIO/TECHNOLOGY, vol. 14, November 1996 (1996-11-01), pages 1574 - 1578, XP002030944 *
HONG, S.S. & BOULANGER, P.: "Protein ligands of the human adenovirus type 2 outer capsid identified by biopanning of a phage-displayed peptide library on separate domains of wild-type and mutant penton capsomers", EMBO JOURNAL., vol. 14, no. 19, 1995, EYNSHAM, OXFORD GB, pages 4714 - 4727, XP002051922 *
HONG, S.S. ET AL.: "Adenovirus type 5 fiber knob binds to MHC class I alpha 2 domain at the surface of the human epithelial and B lymphoblastoid cells", EMBO JOURNAL., vol. 16, no. 9, 1 May 1997 (1997-05-01), EYNSHAM, OXFORD GB, pages 2294 - 2306, XP002051924 *
ROGERS, B.E. ET AL.: "Use of a novel cross-linking method to modify adenovirus tropism", GENE THERAPY, vol. 4, no. 12, December 1997 (1997-12-01), pages 1387 - 1392, XP002069405 *

Also Published As

Publication number Publication date
AU6104698A (en) 1998-08-25
JP2000510708A (ja) 2000-08-22
CA2251036A1 (fr) 1998-08-06
FR2758822B1 (fr) 1999-07-02
WO1998033929A3 (fr) 1998-11-19
US6420120B1 (en) 2002-07-16
AU731911B2 (en) 2001-04-05
WO1998033929A2 (fr) 1998-08-06
EP0900280A2 (fr) 1999-03-10
US20020150558A1 (en) 2002-10-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0510079B1 (fr) Proteines produites par les lymphocytes humains, sequence d'adn codant pour ces proteines et applications pharmaceutiques et biologiques
JP3696232B2 (ja) レセプターキメラ体による細胞性免疫の再設定
TWI328456B (en) Binding agents which inhibit myostatin
EP0345242A2 (fr) Expression de protéines gag de rétrovirus dans les cellules eucaryotes
JPH11513883A (ja) ヒト血管内皮増殖因子2
JPH09512421A (ja) キメラcd4レセプターを有する細胞によるhiv感染細胞を標的とする細胞傷害
FR2761689A1 (fr) Fibre adenovirale modifiee et adenovirus cibles
EP0703980B1 (fr) Proteines intracellulaires de liaison (pil) et leurs utilisations
FR2758822A1 (fr) Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
EP0870040A2 (fr) Ligands de ciblage de vehicules pour l'apport de genes
CA2331151A1 (fr) Anticorps monoclonaux diriges contre la proteine g3bp, et leurs utilisations
EP0842282B1 (fr) Proteines hetero-multimeriques recombinantes du type alpha-beta c4bp
CA2383877C (fr) Procede de detection de l'expression d'une proteine d'enveloppe d'un retrovirus endogene humain et utilisations d'un gene codant pour cette proteine
FR2758821A1 (fr) Utilisation d'un polypeptide a titre de recepteur cellulaire des adenovirus
JPWO2002033094A1 (ja) Vplfの活性を阻害する抗体
FR2758885A1 (fr) Methode pour selectionner ou identifier un recepteur cellulaire d'un virus dans un echantillon approprie
EP1981904B1 (fr) Domaine peptidique necessaire a l'interaction entre l'enveloppe d'un virus appartenant au groupe d'interference de herv-w et un recepteur hasct
CA2184988A1 (fr) Nouvelle methode d'expression-clonage pour caracteriser les proteines cibles pour tyrosines-kinases eucaryotes; nouvelles proteines cibles
JPH06510208A (ja) 多量体形態のヒトライノウイルスレセプタ蛋白質
EP1446484B1 (fr) Sequence nucleotidique codant pour une proteine d interet modifié; vecteur d expression et procede d obtention
FR2850384A1 (fr) Antigenes mimant les domaines extracellulaires de proteines membranaires de type iii issues de microorganismes intracellulaires pathogenes, anticorps conformationnels derives, et leurs applications
CA2344207A1 (fr) Materiel biologique pour la preparation de compositions pharmaceutiques destinees au traitement de mammiferes
CA2392272A1 (fr) Fibre adenovirable modifiee et utilisations
FR2804435A1 (fr) COMPLEXE ISOLE COMPRENANT UNE PROTEINE NNT-1 ET EN OUTRE AU MOINS UNE PROTEINE CLF-1 ET/OU UNE PROTEINE sCNTFRalpha
FR2779432A1 (fr) Sequence nucleique du recepteur rii du tgfb, peptide code, et utilisations

Legal Events

Date Code Title Description
ST Notification of lapse