FI121507B - Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA - Google Patents

Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA Download PDF

Info

Publication number
FI121507B
FI121507B FI971203A FI971203A FI121507B FI 121507 B FI121507 B FI 121507B FI 971203 A FI971203 A FI 971203A FI 971203 A FI971203 A FI 971203A FI 121507 B FI121507 B FI 121507B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
hpv6a
dna
nucleotides
seq
protein
Prior art date
Application number
FI971203A
Other languages
English (en)
Swedish (sv)
Other versions
FI971203A0 (fi
FI971203A (fi
Inventor
Kathrin U Jansen
Kathryn J Hoffmann
Original Assignee
Merck Sharp & Dohme
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=23202654&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=FI121507(B) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Merck Sharp & Dohme filed Critical Merck Sharp & Dohme
Publication of FI971203A0 publication Critical patent/FI971203A0/fi
Publication of FI971203A publication Critical patent/FI971203A/fi
Application granted granted Critical
Publication of FI121507B publication Critical patent/FI121507B/fi

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/20Antivirals for DNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011Details
    • C12N2710/20011Papillomaviridae
    • C12N2710/20022New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Description

Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA Viittaus muihin hakemuksiin Tämä on tällä hetkellä vireillä olevan, 22. syys-5 kuuta 1994 jätetyn US-patenttihakemuksen, jonka sarjanumero on 08/310 468, jatkohakemus.
Keksinnön ala
Esillä olevan keksinnön kohteena ovat tyyppiä 6A olevaa puhdasta ihmisen papillomavirusta koodaavat DNA-10 molekyylit ja niiden johdannaiset.
Piirustusten lyhyt kuvaus
Kuvio 1 esittää HPV6a-nukleotidisekvenssiä. Keksinnön tausta
Papillomaviruksen (PV) aiheuttamia infektioita 15 esiintyy lukuisissa eläimissä, kuten ihmisissä, lampaissa, koirissa, kissoissa, kaneissa, apinoissa, käärmeissä ja lehmissä. Papillomavirukset infektoivat epiteelisoluja, ja ne aiheuttavat yleensä hyvänlaatuisia epiteeli- tai fibro-epiteelikasvaimia infektiokohdassa. PV-virukset ovat laji- ·· · • V 20 spesifisiä infektoivia aineita; ihmisen papillomavirus ei • · · ί : infektoi muita eläimiä.
··· :*·.· Papillomavirukset voidaan luokitella selviksi ryh- • · ••••j miksi sen perusteella, minkä isännän ne infektoivat. Ihmi- ί*. sen papillomavirukset (HPV) on luokiteltu edelleen useam- • ·· « ,···. 25 maksi kuin 70 erilaiseksi tyypiksi DNA-sekvenssin homolo- • · · gian perusteella. PV-tyypit näyttävät olevan tyyppispesi- ... f isiä immunogeenejä siinä suhteessa, että yhtä tyyppiä • · ··· olevan papillomaviruksen aiheuttamaa infektiota neutraloi - * va immuniteetti ei aiheuta immuniteettia toista tyyppiä 3O olevaa papillomavirusta vastaan.
• · .***. Eri HPV-tyypit aiheuttavat ihmisissä erilaisia sai- ·· · .* . rauksia. HPV-tyypit 1, 2, 3, 4, 7, 10 sekä 26 - 29 aiheut- • · i *· *| tavat hyvänlaatuisia syyliä sekä normaaleissa yksilöissä että yksilöissä, joiden immuunijärjestelmä on tukahtunut. 35 HPV-tyypit 5, 8, 9, 12, 14, 15, 17, 19 - 25, 36 sekä 46 - 2 50 aiheuttavat laakeita vioittumia yksilöissä, joiden immuunijärjestelmä on tukahtunut. HPV-tyypit 6, 11, 34, 39, 41 - 44 sekä 51 - 55 aiheuttavat hyvänlaatuisia visvasyyliä (kondulooma) sukupuolielinten ja hengityselinten lima-5 kalvolle. HPV-tyypit 16 ja 18 aiheuttavat sukupuolielinten limakalvolla epiteelin kasvuhäiriöitä, ja ne ovat osallisina suurimmassa osassa kohdunkaulan, emättimen, häpyseu-dun ja peräkanavan paikallisista ja kudoksiin tunkeutuvista syöpäsairauksista.
10 Papillomavirukset ovat pieniä (50 - 60 nm) , kote loi tumattomia, kaksikymmentahokkaan muotoisia DNA-viruk-sia, joihin on koodautunut korkeintaan kahdeksan varhaista ja kaksi myöhäistä geeniä. Virusperimän avoimista lukukehyksistä (open reading frame; ORF) käytetään merkintöjä 15 El - E7 sekä LI ja L2, missä "E" tarkoittaa varhaista (early) ja "L" tarkoittaa myöhäistä (late). LI ja L2 koo-daavat viruksen kapsidiproteiinia. Varhaisiin geeneihin (E) liittyyy sellaisia toimintoja kuin viruksen replikaa-tio ja solun transformaatio.
M · ; V 2 0 LI-proteiini on huomattavin kapsidiproteiini ja sen ··· molekyylipaino on 55 - 60 kDa. L2-proteiini on vähäinen kapsidiproteiini, jonka ennustettu molekyylipaino on 55 - • · •j··· 60 kDa ja jonka ilmeinen molekyylipaino on 75 - 100 kDa elektroforeettisesti polyakryyliamidigeelillä määritetty- • 25 nä. Immunologisten tietojen perusteella voidaan päätellä, • · · että suurin osa L2-proteiinista sijaitsee Ll-proteiinin ... sisällä. LI ORF on säilynyt hyvin samanlaisena eri papil- • · lomavirusten keskuudessa. L2-proteiinit ovat säilyneet vähemmän samanlaisina eri papillomavirusten keskuudessa.
•Y: 30 LI- ja L2-geenit on tunnistettu immunologisen en- • · naltaehkäisyn hyviksi kohteiksi. Samoin ollaan osoitettu, ··· .* . että eräät näistä varhaisista geeneistä ovat mahdollisia • · · *· kohteita rokotteita kehitettäessä. Erään kanilajin (cot- * * tontail rabbit) papillomavirukseen (CRPV) ja naudan papil- 35 lomavirukseen (BPV) perustuvilla järjestelmillä toteutetut 3 tutkimukset ovat osoittaneet, että immunointi näillä proteiineilla, jotka on ilmennetty bakteereissa, tai vacci-nia-vektoreita käyttäen suojasi eläimet virusinfektiolta. Papillomaviruksen LI-geenien ilmentäminen bakulovirukseen 5 perustuvissa ilmentämisjärjestelmissä tai vaccinia-vekto-reita käyttäen johti viruksen kaltaisten hiukkasten (vi-rus-like particles; VLP) kerääntymiseen, joiden hiukkasten avulla on aiheutettu virusta neutraloivia suuritiitterisiä vasta-ainevasteita, jotka korreloivat virusaltistusta vas-10 taan saadun suojan kanssa.
HPV6 ja HPV11, jotka osallistuvat vain harvoin pahanlaatuisiin tiloihin, aiheuttavat noin 90 % suipon visvasyylän (condyloma acuminata) tapauksista, joka suippo visvasyylä on hengityselinten ja sukupuolielinten hyvän-15 laatuinen vaurio. HPV6-virus todetaan kolme kertaa useammin näissä vaurioissa kuin HPV11.
HPV6b:n, joka on ensimmäinen HPV6-eriste, täydellinen nukleotidisekvenssi on määritetty (Schwarz, E., et ai., 1983, EMBO J 2:2341-8). Muita HPV6-alatyyppejä on • · · : .· 20 tunnistettu restriktioentsyymeillä tuotettujen pilkkoutu- • · · miskuvioiden perusteella. (Gissmann, L., et ai., 1983, :/.: Proc. Natl. Acad. Sei. USA 80:560-3; Mounts, P., et ai., ·:··: 1982, Proc. Natl. Acad. Sei. USA 79: 5425-9).
♦\# Useat tutkimusryhmät ovat osoittaneet, että HPV6a • .·;·. 25 on se pääasiallinen alatyyppi, joka todetaan yhdysvalta- • · · « laisten ja eurooppalaisten potilaiden visvasyylästä (con- ... dyloma acuminatum) otetuissa kudosnäytteissä. Jokin aika • · ***. sitten julkaistussa tutkimuksessa esitetään, että HPV6a on HPV-prototyyppi (Kitasato, H., et ai., 1994, J. Gen. 30 Virol. 75:1157 - 1162) . Alalla arvioidaan, että pelkästään Yhdysvalloissa noin 1 % kaikista 15 - 49-vuotiaista mie- • · · .* . histä ja naisista käyvät lääkärissä visvasyylän takia.
• · · • ♦· * * Tälle sairaudelle, johon HPV osallistuu, ei ole valitetta vasti olemassa mitään tehokasta hoitoa. Näin ollen rokote 35 olisi hyvin toivottava. Ennalta ehkäisevän tai hoitavan 4 rokotteen kehittämisen kannalta kaikkein yleisimpien HPV-alatyyppien myöhäisten ja varhaisten geenien sekvenssin määrittäminen on kuitenkin ratkaisevan tärkeää.
HPV6a:n rajallinen sekvenssi-informaatio liittyy 5 pitkään säätelyalueeseen (long control region: LCR) sekä lukukehyksiin E6 ja E7 ORF. Esillä olevassa hakemuksessa kuvataan HPV6a:n kloonaaminen visvasyylänäytteestä, sen täydellisen virus-DNA-sekvenssin määritys ja HPV6a:n suurten avoimien lukukehysten (ORF) vastaavat aminohapposek-10 venssit.
Esillä olevan keksinnön kohteena ovat tyyppiä 6a (HPV-tyyppi 6a; HPV6a) olevaa puhdasta ihmisen papilloma-virusta koodaavat DNA-molekyylit ja näiden DNA-molekyylien käyttö.
15 Keksinnön yhteenveto
Esillä olevan keksinnön kohteena ovat tyyppiä 6a (HPV-tyyppi 6a; HPV6a) olevaa puhdasta ihmisen papilloma-virusta koodaavat DNA-molekyylit ja niiden johdannaiset. Keksinnön yksityiskohtainen kuvaus ·· · • V 20 Esillä olevan keksinnön kohteena ovat tyyppiä 6a (HPV-tyyppi 6a; HPV6a) olevaa puhdasta ihmisen papillo- :*·.· mavirusta koodaavat DNA-molekyylit ja niiden johdannai- • · ····’· set. Näistä johdannaisista voidaan mainita tämän DNA:n :·. koodaamat peptidit ja proteiinit, tämän DNA:n vasta-aineet • · · .·;·. 25 tai tämän DNA:n koodaamien proteiinien vasta-aineet, tätä • · · DNA:ta käsittävät rokotteet tai tämän DNA:n koodaamia pro- ... teiineja käsittävät rokotteet, tätä DNA:ta tai tämän DNA:n • · *···| koodaamia proteiineja käsittävät immunologiset koostumuk set, tätä DNA:ta, tästä DNA:sta saatua RNA:ta tai tämän 3 0 DNA:n koodaamia proteiineja käsittävät reagenssipakkauk- • · .***. set, näihin kuitenkaan rajoittumatta.
• · · .· . HPV6 on visvasyylän (condyloma acuminata; hengitys- • · · *· *j elinten ja sukupuolielinten hyvänlaatuinen vaurio) pää- ’ * asiallinen aiheuttaja. HPV6b:n, joka on ensimmäinen HPV6- 35 eriste, täydellinen nukleotidisekvenssi on määritetty.
5
Muita HPV6-alatyyppejä on tunnistettu restriktioentsyy-meillä tuotettujen pilkkoutumiskuvioiden perusteella.
Useat tutkimusryhmät ovat osoittaneet, että HPV6a on se pääasiallinen alatyyppi, joka todetaan yhdysvalta-5 laisten ja eurooppalaisten potilaiden visvasyylästä (condyloma acuminatum) otetuissa kudosnäytteissä. Alalla on arvioitu, että pelkästään Yhdysvalloissa noin 1 % kaikista 15 - 49-vuotiaista miehistä ja naisista käyvät lääkärissä visvasyylän takia. Tälle sairaudelle, johon HPV osallis-10 tuu, ei ole valitettavasti olemassa mitään tehokasta hoitoa. Näin ollen rokote olisi hyvin toivottava. Ennalta ehkäisevän tai hoitavan rokotteen kehittämisen kannalta kaikkein yleisimpien HPV-alatyyppien myöhäisten ja varhaisten geenien sekvenssin määrittäminen on kuitenkin rat-15 kaisevan tärkeää.
HPV6a:n rajallinen sekvenssi-informaatio liittyy pitkään säätelyalueeseen (long control region: LCR) sekä lukukehyksiin E6 ja E7 ORF. Esillä olevassa hakemuksessa kuvataan HPV6a:n kloonaaminen visvasyylänäytteestä, sen ·· · • V 20 täydellisen virus-DNA-sekvenssin määritys ja HPV6a:n suur- • · · ten avoimien lukukehysten (ORF) vastaavat aminohapposek- :*·.· venssit. Esillä olevan keksinnön kohteena ovat tyyppiä 6a • · ·:··· olevaa puhdasta ihmisen papillomavirusta koodaavat DNA- molekyylit ja näiden DNA-molekyylien johdannaiset.
• ,···. 25 Tätä DNArta tai tämän DNA:n koodaamia proteiineja • · · käsittävät, farmaseuttisesti käyttökelpoiset koostumukset ... voidaan valmistaa tunnettujen menetelmien mukaisesti, esi- • » ***. merkiksi sekoittamalla niihin farmaseuttisesti hyväksyttä- . vää kantajaa. Esimerkkejä tällaisista kantajista ja vai- • · 3 0 mistusmenetelmistä on löydettävissä teoksesta Remington's • · ·
Pharmaceutical Sciences. Tehokkaaseen antamiseen sopivan, .·. : farmaseuttisesti hyväksyttävän koostumuksen muodostamisek-
• M
,,.tj si tällaiset koostumukset sisältävät tehokkaan määrän pro- • · teiinia tai VLP-hiukkasia. Nämä koostumukset voivat sisäl- 6 tää proteiineja tai VLP-hiukkasia, jotka ovat peräisin useammasta kuin yhdestä HPV-tyypistä.
Keksinnön mukaisia hoitavia tai diagnostisia koostumuksia annetaan yksilölle määrinä, jotka riittävät PV-5 infektioiden hoitamiseksi tai diagnostoimiseksi. Tämä tehokas määrä voi vaihdella monista eri tekijöistä riippuen, joista tekijöistä voidaan mainita yksilön kunto, paino, sukupuoli ja ikä. Muista tekijöistä voidaan mainita antamistapa. Yleensä näitä koostumuksia annetaan noin alueella 10 1 /ig - 1 mg olevina annoksina.
Näitä farmaseuttisia koostumuksia voidaan antaa yksilölle monella eri tavalla, kuten ihonalaisesti, paikallisesti, suun kautta, limakalvon kautta, laskimonsisäisesti ja lihaksensisäisesti.
15 Keksinnön mukaiset rokotteet käsittävät DNA:ta, RNA:ta tai tämän DNA:n koodaamia proteiineja, jotka sisältävät isännässä neutraloivien vasta-aineiden muodostumiselle välttämättömiä antigeenisiä determinantteja. Tällaiset rokotteet ovat myös niin turvallisia, että niitä voi- ·· · • · i ί .* 20 daan antaa ilman kliinisen infektion vaaraa; niillä ei ole • · · ·...· myrkyllisiä sivuvaikutuksia; niitä voidaan antaa tehokasta • · ϊ/·ϊ reittiä pitkin; ne ovat pysyviä; ja ne sopivat yhteen ro- ·;··: kotekantajien kanssa.
·*·.. Näitä rokotteita voidaan antaa monella eri tavalla, 25 kuten suun kautta, ruuansulatuskanavan ulkopuolisesta, ihonalaisesti, limakalvon kautta, laskimonsisäisesti tai lihaksensisäisesti. Annettava annos voi vaihdella riippuen • · ***. yksilön kunnosta, sukupuolesta, painosta ja iästä; anta- mistavasta; sekä rokotteen PV-tyypistä. Rokotetta voidaan • · ϊ 30 käyttää sellaisina annostelumuotoina kuin kapseleina, sus- :***: pensioina, eliksiireinä tai nestemäisinä liuoksina. Rokot- ··· .*. teeseen voidaan sisällyttää immunologisesti hyväksyttävää • ·· * I kantaj aa.
Rokotteita annetaan terapeuttisesti tehokkaina mää-35 rinä, eli sellaisina määrinä, jotka riittävät tuottamaan 7 immuunologisesti suojaavan vasteen. Tämä terapeuttisesti tehokas määrä voi vaihdella PV-tyypistä riippuen. Rokote voidaan antaa vain yhtenä annoksena tai useina annoksina.
Esillä olevan keksinnön mukaista DNA:ta ja DNA-joh-5 dannaisia voidaan käyttää immunogeenisten koostumusten valmistuksessa. Kun tällaisia koostumuksia annetaan sopivalle isännälle, nämä koostumukset kykenevät saamaan aikaan isännässä immuunivasteen.
Tätä DNA:ta tai sen johdannaisia voidaan käyttää 10 vasta-aineiden tuottamiseksi. Ohessa käytetyllä käsitteellä "vasta-aine" tarkoitetaan sekä polyklonaalisia että monoklonaalisia vasta-aineita että niiden kappaleita, kuten Fv-, Fab-, sekä F(ab)2-kappaleita, jotka kykenevät sitomaan antigeenin tai hapteenin.
15 Esillä olevan keksinnön mukaista DNA:ta ja DNA-joh dannaisia voidaan käyttää HPV-infektion serotyypin selvittämiseksi ja HVP-seulonnassa. Tästä DNA:sta, yhdistelmä-DNA-teknisistä proteiineista, VLP-hiukkasista ja vasta-aineista voidaan muodostaa reagenssipakkauksia, joiden • · · ϊ ·* 20 avulla kyetään ilmaisemaan HPV ja määrittämään sen sero- • · · *...· tyyppi. Tällainen reagenssipakkaus käsittää lokerikon, • · :.*·· jossa vähintään yksi säiliö saadaan pidetyksi paikoillaan.
·:··: Tämä pakkaus voi käsittää lisäksi sellaisia reagensseja, ·*·.. kuten HPV6a DNA: ta, yhdistelmä-DNA-teknistä HPV-proteiinia • ·*ί*. 25 tai VLP-hiukkasia tai anti-HPV-vasta-aineita, joiden avul-
• · · ' J
la kyetään ilmaisemaan erilaisia HPV-tyyppejä. Tämä pak- .···. kaus voi myös sisältää ilmaisuvälineen, kuten leimattuja • · antigeenejä tai entsyymisubstraatteja tai vastaavia.
• · . Tätä DNA:ta ja siitä saatuja proteiineja käytetään • · V.· 30 myös molekyylipainon ja molekyylikoon merkkeinä.
• · · : : Geneettisen koodin deqeneroitumisen seurauksena .·) ; useampi kuin yksi kodoni voi koodata erityistä aminohap- • · · poa, ja näin ollen aminohapposekvenssi voi olla koodautu- • ♦ nut minkä tahansa samankaltaisten DNA-oligonukleotidien 35 joukkoon. Vain yksi tämän joukon jäsen on samanlainen kuin 8 HPV6a-sekvenssi, mutta se kykenee hydridisoitumaan HPV6a DNA:hän silloinkin, kun läsnä on asianmukaisissa olosuhteissa yhteensopimattomia DNA-oligonukleotidejä. Nämä yhteensopimattomat DNA-oligonukleotidit voivat edelleen hyb-5 ridisoitua muutetuissa olosuhteissa HPV6a DNA:han, mikä tekee mahdolliseksi HPV6A:ta koodaavan DNA:n tunnistamisen ja eristämisen.
Keksinnön mukaista puhdistettua HPV6a DNA:ta tai sen kappaleita voidaan käyttää muista lähteistä peräisin 10 olevien HPV6a-homologien ja -kappaleiden eristämiseksi ja puhdistamiseksi. Tätä varten ensimmäinen HPV6a DNA voidaan sekoittaa sopivissa hybridisaation olosuhteissa näytteeseen, joka sisältää HPV6a-homologeja koodaavaa DNA:ta. Hybridisoitunut DNA-kompleksi voidaan eristää ja homolo-15 gista DNA:ta koodaava DNA voidaan puhdistaa siitä.
Tunnettua on, että erityistä aminohappoa koodaavat eri kodonit vaihtelevat olennaisesti. Näin ollen keksinnön kohteena ovat myös ne DNA-sekvenssit, jotka sisältävät vaihtoehtoisia, lopulta luentaa samaksi aminohapoksi koo- • · t ί ·' 20 daavia kodoneja. Tässä kuvauksessa yhden tai useamman kor- ··· vautuneen kodonin käsittävä sekvenssi määritellään dege- • · *.*·· neroituneeksi muunnokseksi. Keksinnön piiriin kuuluvat *:*·: samoin joko DNA-sekvenssissä tai luetussa proteiinissa f*·., esiintyvät mutaatiot, jotka eivät muuta olennaisesti il- • 25 mentyneen proteiinin lopullisia fysikaalisia ominaisuuk- siä. Esimerkiksi leusiinin korvautuminen valiinilla, ly- .···. siinin korvautuminen arginiinilla, tai glutamiinin korvau- * · ***. tuminen asparagiinilla ei aiheuta välttämättä muutoksia • · . polypeptidin toiminnallisuudessa.
• · V.* 30 Tunnettua on, että peptidiä koodaavia DNA-sekvens- »·· i : sejä voidaan muuttaa siten, että ne koodaavat sellaista .·[ ; peptidiä, jonka ominaisuudet eroavat luonnossa esiintyvän • ·· I peptidin ominaisuuksista. Menetelmistä DNA-sekvenssien • · muuttamiseksi voidaan mainita kohdennettu mutageneesi tä-35 hän kuitenkaan rajoittumatta.
9
Ohessa HPV6a:n "toiminnallisella johdannaisella" tarkoitetaan sellaista yhdistettä, jonka biologinen aktiivisuus (joka on joko toiminnallista tai rakenteellista) on olennaisesti samankaltaista kuin HPV6a:n biologinen aktii-5 visuus. Käsitteellä "toiminnalliset johdannaiset" on tarkoitus ymmärtää HPV6a:n "kappaleita", "muunnoksia", "degeneroituneita muunnoksia", "analogeja" sekä "homologeja" tai "kemiallisia johdannaisia". Käsitteellä "kappale" tarkoitetaan mitä tahansa HPV6a:n polypeptidialajoukkoa. Kä-10 sitteellä "muunnos" tarkoitetaan molekyyliä, joka muistuttaa rakenteeltaan ja toiminnaltaan olennaisesti joko koko HPV6a-molekyyliä tai sen kappaletta. Molekyyli "muistuttaa olennaisesti" HPV6a:ta, mikäli näillä kummallakin molekyylillä on olennaisesti samankaltaiset rakenteet tai mikäli 15 kummallakin molekyylillä on samankaltainen biologinen aktiivisuus. Näin ollen, mikäli näillä kahdella molekyylillä on olennaisesti samankaltainen aktiivisuus, niin tällöin ne katsotaan muunnoksiksi silloinkin, kun yhden molekyylin rakennetta ei löydetä toisesta molekyylistä tai kun nämä • · · • ·’ 20 kaksi aminohapposekvenssiä eivät ole samanlaisia. Käsite ··· *...· "toiminnallinen johdannainen" ei sisällä HPVöb-sekvenssiä.
• · *.*·· Käsitteellä "analogi" viitataan molekyyliin, joka *:·*: muistuttaa toiminnaltaan olennaisesti joko koko HPV6a-mo- ·*·.. lekyyliä tai sen kappaletta.
• 25 Monia erilaisia menettelytapoja voidaan käyttää HPV6a DNA:n kloonaamiseksi molekyylitasolla. Näistä mene-telmistä voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, • · ***. HPV6a-geenien suora toiminnallinen ilmentäminen sen jäi- • · , keen, kun on muodostettu HPV6a:n sisältävä cDNA-kirjasto • · 5.^1 30 tai perimä-DNA-kirjasto sopivaan ilmentämisvektorijärjes- telmään. Toinen menetelmä on seuloa bakteriofaagista tai ··· . plasmidista saatuun sukkulavektoriin muodostettu, HPV6a:n • ** ' * sisältävä cDNA-kirjasto tai perimä-DNA-kirjasto leimatulla oligonukleotidikoettimella, joka on toteutettu HPV6a:n 35 aminohapposekvenssin perusteella. Eräässä muussa menetel- 10 mässä seulotaan bakteriofagista tai plasmidista saatuun sukkulavektoriin muodostettu, HPV6a:n sisältävä cDNA-kir-jasto tai perimä-DNA-kirjasto HPV6a:ta koodaavalla osittaisella DNA:11a. Tämä osittainen DNA saadaan spesifi-5 seen polymeraasiketjureaktioon (PCR) perustuvalla HPV6a DNA-kappaleiden monistuksella toteuttamalla puhdistetun HPV6a:n aminohapposekvenssin perusteella degeneroituneita oligonukleotidialukkeita. Eräässä muussa menetelmässä RNA eristetään HPV6a:ta tuottavista soluista ja tämä RNA lue-10 taan proteiiniksi in vitro- tai in vivo -luentajärjestel-män avulla. RNA:n luenta peptidiksi tai proteiiniksi johtaa siihen, että muodostuu vähintään osa HPV6a-proteiinis-ta, joka voidaan tunnistaa esimerkiksi HPV6a-proteiinin aktiivisuuden perusteella tai sen ja anti-HPV6a-vasta-ai-15 neen välisen immunologisen reaktiivisuuden perusteella. Tässä menetelmässä HPV6a:ta tuottavista soluista eristetystä ja yhdistetystä RNA:sta voidaan analysoida sellaisen RNA:n läsnäolo, johon RNA:han on koodautunut vähintään osa HPV6a:sta. Tätä yhdistettyä RNA:ta voidaan jakaa edelleen • · · i *.· 20 fraktioiksi HPV6a-RNA:n puhdistamiseksi muusta kuin HPV6a ♦ *· ·...· RNA:sta. Tällä menetelmällä tuotettu peptidi tai proteiini voidaan analysoida sellaisten aminohapposekvenssien ai- *:··· kaansaamiseksi, joita aminohapposekvenssejä käytetään puo- "· lestaan alukkeiden saamiseksi HPV6a cDNA:n tuotantoa var- • · · 25 ten, tai luentaan käytetty RNA voidaan analysoida HPV6a:ta • · · koodaavien nukleotidisekvenssien aikaansaamiseksi sekä ... koettimien tuottamiseksi HPV6a cDNA-kirj aston seulomista • · • · ***. varten. Nämä menetelmät ovat tunnettuja alalla, ja ne ovat löydettävissä esimerkiksi teoksesta Sambrook, J. , Fritsch, ::: 30 E.F., Maniatis, T., Molecular Cloning: A Laboratory Ma- nual, toinen painos, Cold Spring Harbor Laboratory Press, • · · .* . Cold Spring Harbor, NY, 1989.
• · · • · · * \ On selvää, että myös muuntyyppiset kirjastot sekä muista soluista tai solutyypeistä muodostetut kirjastot 35 saattavat olla käyttökelpoisia HPV6a:ta koodaavan DNA:n 11 eristämiseksi. Näistä muuntyyppisistä kirjastoista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, muista, HPV-tyypin 6a sisältävistä soluista tai solulinjoista peräisin olevat cDNA-kirjastot sekä perimä-DNA-kirjasto.
5 cDNA-kirjastojen valmistus voidaan toteuttaa monel la eri tekniikalla. Tekniikoita cDNA-kirjaston muodostamiseksi on löydettävissä esimerkiksi edellä mainitusta J. Sambrookrin et ai. teoksesta. On ilmeistä, että HPV6a:ta koodaava DNA voidaan eristää myös sopivasta perimä-DNA-10 kirjastosta. Perimä-DNA-kirjaston muodostaminen voi tapahtua erilaisilla tekniikoilla. Tekniikoita perimä-DNA-kir-jaston muodostamiseksi on löydettävissä esimerkiksi edellä mainitusta J. Sambrook:in et ai. teoksesta.
Ohessa kuvatuilla menetelmillä saatu kloonattu 15 HPV6a DNA tai sen kappaleita voidaan ilmaista yhdistelmä-DNA-tekniikalla, molekyylikloonaamalla sopivan promoottorin ja muita asianmukaisia kopioitumista sääteleviä elementtejä sisältävään ilmentämisvektoriin ja siirtämällä prokarioottisiin tai eukarioottisiin isäntäsoluihin yhdis- : ·*: 2 0 telmä-DNA-teknisen HPV6a:n tuottamiseksi. Tekniikoita täi- • · laisten manipulointien toteuttamiseksi on kuvattu yksi- • · · • tyiskohtaisesti edellä mainitussa teoksesa Sambrook, J. et • · ai., ja ne ovat alalla tunnettuja.
• · ·· Ilmentämisvektorit kuvataan ohessa DNA-sekvensseik- • · • · · *... 25 si, joita tarvitaan kloonattujen geenikopioiden kopioimi- • · · * seksi ja niiden mRNA-sekvenssien lukemiseksi sopivassa isännässä. Tällaisia vektoreita voidaan käyttää eukarioot- • · *···* tisten geenien ilmentämiseksi erilaisissa isännissä, kuten ·’*· bakteereissa, viherlevässä, kasvisoluissa, hyönteissoluis- 30 sa, sienisoluissa ja eläinsoluissa. Erityisesti toteutet- • · .···. tujen vektoreiden avulla voidaan toteuttaa DNA:n sukku- • · • lointi isäntien välillä, kuten bakteeri- ja hiivasolujen • · · *. *ϊ tai bakteeri- ja eläinsolujen tai bakteeri- ja sienisolu- *·*’· jen tai bakteeri- ja selkärangattomista saatujen solujen 35 välillä. Sopivalla tavalla muodostetun ilmentämisvektorin 12 tulisi sisältää: replikaation lähtökohdan isäntäsolussa tapahtuvaa autonomista replikaatiota varten, valikoitavia merkkejä, rajallisen lukumäärän käyttökelpoisia restrik-tioentsyymien kohtia, kopioiden suuren lukumäärän mahdol-5 liseksi tekevän ominaisuuden sekä aktiivisia promoottoreita. Promoottori määritellään DNA-sekvenssiksi, joka ohjaa RNA-polymeraasia siten, että se sitoutuu DNA:hän ja että RNA-synteesi käynnistyy. Voimakas promoottori on sellainen, jonka vaikutuksesta mRNA:t aktivoituvat suurella 10 esiintymistiheydellä. Ilmentämisvektoreista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, kloonausvektorit, muokatut kloonausvektorit, erityisellä tavalla toteutetut plasmidit tai virukset.
Erilaisia nisäkkään ilmentämisvektoreita voidaan 15 käyttää HPV6a DNA:n tai sen kappaleiden ilmentämiseksi nisäkässoluissa. Kaupallisesti saatavista nisäkkään ilmentämisvektoreista, jotka soveltuvat HPV6a:n yhdistelmä-DNA-tekniseen ilmentämiseen, voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, pcDNA3 (Invitrogen), pMClneo (Strata- • *.ϊ 20 gene) , pXTl (Stratagene) , pSG5 (Stratagene) , EBO-pSV2-neo ·/”: (ATCC 37593), pBPV-l(8-2) (ATCC 37110), pdBPV-MMTneo(342-
12) (ATCC 37224) , pRSVgpt (ATCC 37199) , pRSVneo (ATCC
• · 37198), pSV2-dhfr (ATCC 37146), pUCTag (ATCC 37460) sekä ;·. lambdaZD35 (ATCC 37565) .
• · · .·· 25 Monia erilaisia bakteereiden ilmentämisvektoreita • · · • · · voidaan käyttää HPV6a DNA:n tai sen kappaleiden ilmentämi- ... seksi bakteerisoluissa. Kaupallisesti saatavista, sopivis- • · ’···] ta bakteereiden ilmentämisvektoreista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, pETlla (Novagen), lambda 30 gtll (Invitrogen) , pcDNAII (Invitrogen) , pKK223-3 (Pharma- • · : : cia).
• · · .* . Monia erilaisia sienisolujen ilmentämisvektoreita • · · • · · • ; voidaan käyttää HPV6a:n tai sen kappaleiden ilmentämiseksi sienisoluissa. Kaupallisesti saatavista, sopivista sienien 35 ilmentämisvektoreista voidaan mainita, näihin kuitenkaan 13 rajoittumatta, pYES2 (Invitrogen) sekä Pichia-ilmentämis-vektori (Invitrogen).
Monia erilaisia hyönteissolujen ilmentämisvektorei-ta voidaan käyttää HPV6a DNA:n tai sen kappaleiden ilmen-5 tämiseksi hyönteissoluissa. Kaupallisesti saatavista, sopivista hyönteissolujen ilmentämisvektoreista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, pBlue Bac III (Invitrogen) .
HPV6a:ta tai sen kappaleita koodaavaa DNA:ta sisäl-10 tävää ilmentämisvektoria voidaan käyttää HPV6a-proteiinien tai HPV6a-proteiinikappaleiden ilmentämiseksi solussa, kudoksissa, elimissä tai eläimissä (ihminen mukaan lukien). Isäntäsolut voivat olla prokarioottisia tai eukariootti-sia, ja niistä voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoit-15 tumatta, bakteerit, kuten E. coli, sienisolut, kuten hiiva, nisäkässolut, joista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, ihmisestä, naudasta, siasta, apinas-ta ja jyrsijöistä saadut soluiinjat, sekä hyönteissolut, joista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, • · · j *.ϊ 20 Drosphilasta ja silkkimadosta saadut solulinjat. Sopivis- ta, nisäkäslajeista saaduista, kaupallisesti saatavista • · · :*·.· solulinjöistä voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittu- • ·
....{ matta, L-Solut L-M (TK’) (ATCC CCL 1.3), L-solut L-M (ATCC
:·. CCL 1.2), 293 (ATCC CRL 1573), Raj i (ATCC CCL 86), CV-1 • · · 25 (ATCC CCL 70) , COS-1 (ATCC CRL 1650) , COS-7 (ATCC CRL 1651) , CHO-K1 (ATCC CCL 61) , 3T3 (ATCC CCL 92) , NIH/3T3 ... (ATCC CRL 1658) , HeLa (ATCC CCL 2) , C1271 (ATCC CRL 1616) , *···* BS-C-1 (ATCC CCL 26) sekä MCR-5 (ATCC CCL 171) .
* * Ilmentämisvektori voidaan viedä isäntäsoluihin yh- 30 dellä monista mahdollisista tekniikoista, joista voidaan • · .·**. mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, transfektio, • · • · · .·. lipofektio, protoplastifuusio sekä sähköporaatio. Näiden • · · *· *! ilmentämisvektorin sisältävien solujen annetaan lisääntyä ** * kloonisesti, ja niistä analysoidaan yksitellen tuottavatko 35 ne HPV6a-proteiinia vai ei. HPV6a:ta ilmentävien isäntäso- 14 lukloonien tunnistaminen voi tapahtua eri tavoilla, joista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, immunologinen reaktiivisuus anti-HPV6a-vasta-aineiden kanssa sekä isäntäsoluun liittyvän HPV6a-aktiivisuuden läsnäolo, 5 kuten HPV6a-spesifiseen ligandiin sitoutuminen tai HPV6a-spesifisten ligandien ja HPV6a:n välisen vuorovaikutuksen välittämäksi vasteeksi määritelty signaalin siirto.
HPV DNA -kappaleiden ilmentäminen voidaan toteuttaa myös käyttäen in vitro -valmistettua synteettistä mRNA:ta 10 tai luonnollista mRNA:ta. Synteettinen mRNA tai HPV6a:ta tuottavista soluista eristetty mRNA voidaan lukea tehokkaasti erilaisissa soluttomissa järjestelmissä, joista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, vehnän-alkiouutteet sekä retikulosyyttiuutteet, ja se voidaan 15 lukea myös tehokkaasti soluihin perustuvissa järjestelmissä, joista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, mikroinjektio sammakon munasoluihin, jolloin mikroin-jektiota sammakon munasoluihin pidetään edullisena.
Sen jälkeen kun HPV6a-proteiinia (-proteiineja) on ·· · • \· 20 ilmentynyt isäntäsolussa, tämä HPV6a-proteiini voidaan ot- taa talteen siten, että saadaan HVP6a:ta puhtaassa muodos- ·*·.; sa. Erilaisia käyttökelpoisia menettelytapoja HPV6a:n puh- • · distamiseksi on saatavilla. Kuten ohessa kuvataan, yhdis-telmä-DNA-tekninen HPV6a-proteiini voidaan puhdistaa solu- • ·· [···' 25 hajotteista ja -uutteista käyttämällä yhdistelminä tai • · · yksitellen seuraavia menetelmiä: fraktiointi suolan avul- ... la, ioninvaihtokromatografia, koon perusteella erottava • · *···[ kromatograf ia, hydroksyyliapatiittiabsorptioon perustuva * * kromatografia ja hydrofobiseen vuorovaikutukseen perustuva 3 O kromatograf ia.
• · .**·. Lisäksi yhdistelmä-DNA-tekninen HPV6a voidaan erot- *·· .· . taa muista soluproteiineista käyttämällä immuuniaffini- • · · *· *| teettipylvästä, joka on tehty käyttäen juuri muodostuneen * * täysipituisen HPV6a:n tai HPV6a:n polypeptidikappaleiden 35 suhteen spesifistä monoklonaalista tai polyklonaalista 15 vasta-ainetta. Monoklonaalisia ja polyklonaalisia vasta-aineita voidaan valmistaa alalla tunnetuilla erilaisilla menetelmillä. Ohessa käytetty monoklonaalinen tai monospe-sifinen vasta-aine määritellään vain yhdeksi vasta-ainela-5 jiksi tai useaksi vasta-ainelajiksi, jolla on homogeenisia sitoutumisominaisuuksia HPV6a:n suhteen. Ohessa käytetyllä käsitteellä homogeeninen sitoutuminen viitataan antibioot-tilajin kykyyn sitoutua erityiseen antigeeniin tai epi-tooppiin.
10 Ilmeistä on, että menetelmiä monospesifisten vas ta-aineiden tuottamiseksi voidaan käyttää myös HPV6a-poly-peptidikappaleiden tai juuri muodostuneen täysipituisen HPV6a-polypeptidin suhteen spesifisten vasta-aineiden tuottamiseksi. Erityisesti on ilmeistä, että täysin toi-15 minnallisen HPV6a:n tai sen kappaleiden suhteen spesifisiä monospesifisiä vasta-aineita voidaan tuottaa.
Esillä olevan keksinnön kohteena ovat myös menetelmät sellaisten yhdisteiden seulomiseksi, jotka yhdisteet muuttavat HPV6a:ta koodaavan DNA:n tai RNA:n ilmentymistä ·· · •’.! 20 sekä HPV6a-proteiini(e)n toimintaa (toimintoja) in vivo.
:***: Nämä aktiivisuuksia muuttavat yhdisteet voivat olla DNA, ·♦· :*·.· RNA, peptidit, proteiinit tai muunlaiset kuin proteiini- • · maiset orgaaniset molekyylit. Yhdisteet voivat muuttaa voimistamalla tai vaimentamalla HVP6a:ta koodaavan DNA:n • ·· 25 tai RNA:n ilmentymistä tai HPV6a-proteiinin toimintaa.
• · ·
Yhdisteet, jotka muuttavat HPV6a:ta koodaavan DNA:n tai ... RNA:n ilmentymistä sekä HPV6a-proteiinin toimintaa, voi- • · *···* daan ilmaista erilaisilla määrityksillä. Tämä määritys voi * * olla yksinkertainen "kyllä/ei"-määritys, jolla määritetään 30 se, muuttuuko ilmentyminen tai toiminta vai ei. Tämä mää- • · .***. ritys voidaan tehdä kvantitatiiviseksi vertaamalla koe- ··· .· . näytteen ilmentymistä tai toimintaa standardinäytteellä • · · *· '1 saavutettuun ilmentymiseen tai toimintaan.
HVP6a DNA: ta, HVP6a DNA:n kappaleita, HVP6a DNA: ta 35 tai HPV6a-proteiinia vastaan vaikuttavia vasta-aineita, 16 HVP6a RNArta tai HPV6a-proteiinia sisältäviä reagenssi-pakkauksia voidaan valmistaa. Näiden reagenssipakkausten avulla voidaan ilmaista DNA, joka hybridisoituu HPV6a DNA:hän, tai niiden avulla voidaan ilmaista HPV6a-proteii-5 ni(e)n tai peptidikappaleiden läsnäolo näytteessä. Tällainen määritys on käyttökelpoinen erilaisissa sovellutuksissa, joista voidaan mainita oikeusanalyysit ja epidemiologiset tutkimukset, näihin kuitenkaan rajoittumatta.
HPV6a:ta koodaavan DNA-sekvenssin täydentävät vas-10 tinnukleotidisekvenssit voidaan syntetisoida "antisense"-hoitoa varten. Nämä vastasuuntaiset molekyylit voivat olla DNA:ta, DNA:n pysyviä johdannaisia, kuten fosforotioaatte-ja tai metyylitosfonaatteja, RNA:ta, RNA:n pysyviä johdannaisia, kuten 2'-O-alkyyliRNA:ta, tai jokin muu HPV6a:n 15 vastasuuntainen oligonukleotidijäljitelmä. Vastasuuntaiset HPV6a-molekyylit voidaan siirtää soluihin mikroinjektiol-la, liposomikapseloinnilla tai ilmentämällä vektoreista, jotka käsittävät tällaisen vastasuuntaisen sekvenssin. HPV6a-"antisense"-hoito voi olla erityisen käyttökelpoinen • · · • V 20 hoidettaessa sairauksia, joissa on edullista heikentää : : HPV6a:n aktiivisuutta.
··· :*·.· Käsitteellä "kemiallinen johdannainen" kuvataan • ♦ ·..·· molekyyliä, joka sisältää sellaisia ylimääräisiä kemialli- siä ryhmiä, joita ei ole normaalisti läsnä perusmolekyy- .···. 25 Iissä. Tällaiset ryhmät voivat parantaa perusmolekyylin ♦ ♦ · liukoisuutta, puoliintumisaikaa, imeytymistä ja muita vas- ... taavia. Vaihtoehtoisesti nämä ryhmät voivat vaimentaa pe- • · ’···[ rusmolekyylin epätoivottuja sivuvaikutuksia tai pienentää perusmolekyylin myrkyllisyyttä. Esimerkkejä tällaisista 30 ryhmistä on kuvattu lukuisissa julkaisuissa, esimerkiksi • · .***. teoksessa Remington's Pharmaceutical Sciences.
.· . Ohessa kuvatuilla menetelmillä tunnistettuja yhdis- • · · *· teitä voidaan käyttää yksinään sopivina, rutiinikokeilla * * määritettävinä annoksina HPV6a:n tai sen aktiivisuuden op- 35 timaaliseksi estämiseksi, samalla kun mahdollinen myrkyl- 17 lisyys saadaan pidetyksi mahdollisimman pienenä. Lisäksi samanaikainen tai peräkkäinen antaminen muiden aineiden kanssa voi olla toivottavaa.
Edullisessa tapauksessa esillä olevan keksinnön 5 mukaisia yhdisteitä voidaan antaa vain yhtenä vuorokausiannoksena tai vuorokaudessa annettava kokonaisannos voidaan antaa moneen osaan jaettuina annoksina. Edelleen esillä olevan keksinnön mukaisia yhdisteitä voidaan antaa eri reittejä, kuten nenänsisäisesti, ihon läpi, suppona, 10 suun kautta ja muilla vastaavilla tavoilla, näihin kuitenkaan rajoittumatta.
Useammalla kuin yhdellä aktiivisella aineella toteutettavassa yhdistelmähoidossa, jossa nämä aktiiviset aineet ovat erillisinä annosteluvalmisteina, näitä aktii-15 visia aineita voidaan antaa samanaikaisesti tai niitä voidaan antaa erikseen eri ajanhetkillä.
Esillä olevan keksinnön mukaisten yhdisteiden annostus valitaan riippuen eri tekijöistä, kuten potilaan tyypistä, lajista, iästä, painosta, sukupuolesta ja lääke- ·· · • *.· 20 tieteellisestä tilasta; hoidettavan tilan vakavuudesta; • · · S i antamisreitistä; potilaan munuaisten ja maksan toiminnas- :*·.· ta; sekä kulloinkin erityisesti käytettävästä yhdisteestä.
• *
Tavanomaisella tavalla pätevä lääkäri voi määrittää hel-posti ja määrätä lääkkeen sen tehokkaan määrän, joka tar- • · · 25 vitaan kyseessä olevan tilan estämiseksi, sitä vastaan • · · vaikuttamiseksi tai sen etenemisen pysäyttämiseksi. Opti- ... maalinen tarkkuus lääkeaineen pitoisuuksien saamiseksi • · *···| alueelle, jossa saavutetaan vaikutusteho ilman myrkylli syyttä, edellyttää annostusta, joka perustuu tavoitelluis-3 0 sa kohteissa lääkeaineen saatavuuden kinetiikkaan. Tähän • · liittyen huomioon otettavia seikkoja ovat lääkeaineen kul- ··· ,· , jetus, tasapaino ja poistuminen.
• · · *· ’· Esillä olevan keksinnön mukaisissa menetelmissä ohessa yksityiskohtaisesti kuvatut yhdisteet voivat toimia 35 aktiivisena aineosana, ja niitä annetaan tyypillisesti 18 seoksena sopivien farmaseuttisten laimentimien, täyteaineiden tai kantajien (joihin viitataan ohessa yhteisellä käsitteellä "kantaja-aineet") kanssa, jotka aineet on valittu sopivalla tavalla tavoitteena olevaa antamismuotoa 5 ajatellen, eli sen mukaan, ovatko kysymyksessä suun kautta annettavat tabletit, kapselit, eliksiirit, siirappi, su-pot, geelit ja vastaavat, ja tavanomaisen farmaseuttisen käytännön mukaisesti.
Esimerkiksi tablettina tai kapselina olevan, suun 10 kautta annettavan muodon tapauksessa aktiivinen lääkeaine-komponentti voidaan yhdistää suun kautta annettavaan, ei-myrkylliseen, farmaseuttisesti aktiiviseen inerttiin kantajaan, kuten etanoliin, glyseroliin, veteen ja vastaavaan. Lisäksi toivottaessa tai tarvittaessa myös sopivia 15 sideaineita, liukastusaineita, hajottavia aineita ja väriaineita voidaan sisällyttää tähän seokseen. Sopivista sideaineista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, tärkkelys, gelatiini, luonnolliset sokerit, kuten glukoosi tai beeta-laktoosi, maissipohjaiset makeutusaineet, • · · i *.· 2 0 luonnolliset ja synteettiset kumit, kuten akaasia, traga- ··· kantti tai natriumalginaatti, karboksimetyyliselluloosa, polyetyleeniglykoli, vahat ja muut vastaavat. Näissä an-·:··· nostusmuodoissa käytetyistä liukastavista aineista voidaan mainita, näihin kuitenkaan rajoittumatta, natriumoleaatti, • 25 natriumstearaatti, magnesiumstearaatti, natriumbentsoaat- » · » ti, natriumasetaatti, natriumkloridi ja muut vastaavat.
... Hajottavista aineista voidaan mainita, näihin kuitenkaan • · ***, rajoittumatta, tärkkelys, metyyli selluloosa, agar, bento- niitti, ksantaanikumi ja muut vastaavat.
I*S 2 30 Nestemäisiä muotoja varten aktiivinen lääkeaine- :***; komponentti voidaan yhdistää sopivaa flavoria käsittävään ··» .* . suspendoivaan tai dispergoivaan aineeseen, kuten synteet- • · · * * tisiin tai luonnonkumeihin, esimerkkeinä tragakantti, akaasia, metyyliselluloosa ja muut vastaavat. Muista käyt-35 tökelpoisista dispergoivista aineista voidaan mainita gly- 19 seriini ja muut vastaavat. Ruuansulatuskanavan ulkopuolista antamista ajatellen toivottavia ovat steriilit suspensiot ja liuokset. Yleensä sopivia säilöntäaineita sisältäviä isotonisia valmisteita käytetään, kun laskimonsisäinen 5 antaminen on toivottavaa.
Aktiivisen lääkeainekomponentin sisältäviin, paikallisesti käytettäviin valmisteisiin voidaan sekoittaa erilaisia, alalla hyvin tunnettuja kantajamateriaaleja, esimerkkeinä alkoholit, aloe vera -geeli, allantoiini, 10 glyseriini, A- ja E-vitamiiniöljyt, mineraaliöljy, PPG2-myristyylipropionaatti ja muut vastaavat, jolloin voidaan muodostaa esimerkiksi alkoholipohjaisia liuoksia, paikallisesti käytettäviä puhdistusaineita, puhdistusvoiteita, ihogeelejä, ihovoiteita sekä hiustenpesuaineita voide- tai 15 geelivalmisteina.
Esillä olevan keksinnön mukaisia yhdisteitä voidaan antaa myös käyttämällä liposomeihin perustuvia kuljetusjärjestelmiä, kuten pieniä yksilamellisia vesikkeleitä, suuria yksilamellisia vesikkeleitä ja monilamellisia ve- # · · j20 sikkeleitä. Liposomeja voidaan muodostaa erilaisista fos- folipideistä, kuten kolesterolista, stearyyliamiinista tai ;*·.· fosf atidyylikoliineista.
• ·
Esillä olevan keksinnön mukaisia yhdisteitä voidaan :·. antaa myös käyttämällä monoklonaalisia vasta-aineita yk~ • · · 25 sittäisinä kantajina, joihin yhdisteen molekyylejä on kyt- • · · ketty. Esillä olevan keksinnön mukaisia yhdisteitä voidaan ... kytkeä myös liukoisiin polymeereihin, jotka toimivat lää- • · '···] keaineen kohdennettavina kantajina. Tällaisista polymee- * * reistä voidaan mainita polyvinyyli-pyrrolidoni, pyraanise- 30 kapolymeeri, polyhydroksipropyylimetakryyli-amidif enoli, • · .*·*. polyhydroksi-etyyliaspartamidifenoli tai polyetyyli-eneok- ··« ,· . sidipolylysiini, jossa on substituentteina palmitoyyli- • · · ’•*| jäännöksiä. Edelleen esillä olevan keksinnön mukaisia yh- ’ ‘ disteitä voidaan kytkeä biologisesti hajoavien polymeerien 35 sellaiseen luokkaan, johon kuuluvien polymeerien avulla 20 päästään lääkeaineen hallittuun vapautumiseen, esimerkkeinä polymaitohappo, polyepsilon-kaprolaktoni, polyhyd-roksi-voihappo, polyortoesterit, polyasetaalit, polydihyd-ropyraanit, polysyanoakrylaatit sekä hydrogeelien silloit-5 tuneet tai amfipaattiset lohkosekapolymeerit.
Seuraavat esimerkit havainnollistavat esillä olevaa keksintöä sitä kuitenkaan rajoittamatta.
Esimerkki 1
Nukleiinihapon eristäminen kudosnäytteestä 10 Häpyseudun suuri visvasyylä saatiin 25-vuotiaasta naispotilaasta synnytyksen jälkeen. Osa tästä syylästä pakastettiin nestemäiseen typpeen, sitten sitä käsiteltiin kalvot poistavalla Braun-merkkisellä laitteella (Braun mikrodismembrator II; B. Braun Instruments, Melsungen, 15 Saksa). Saatu materiaali saatettiin liukoiseen muotoon 0,6 % (p/t) natriumdodekyylisulfaatilla (SDS), käsiteltiin K-proteinaasilla (50 ^g/ml) sekä uutettiin fenolin, kloroformin ja isoamyylialkoholin seoksella. DNA saostettiin etanolilla ja sen määrä määritettiin UV-spektrofotometri-:*·]: 20 sesti. DNA:n, jonka molekyylipaino oli suuri, läsnäolo varmistettiin elektroforeettisesti agaroosigeelillä, mitä • · · : seurasi värjääminen etidiumbromidilla.
• ♦
Esimerkki 2 • · HPV DNA s n tyyppimääritys • ♦ · *... 25 HPV DNA -tyyppi määritettiin käyttämällä nimellä • · · * ViraType Plus (Digene Diagnostics, Beltsville, MD) markkinoitua hybridisieppausmääritystä. Käytetyt HPV-koettimet • · ’···* jaettiin kahdeksi joukoksi, joiden koostumus perustuu kun- *·**’ kin tyypin kykyyn liittyä sukupuolikanavassa esiintyviin 30 pahanlaatuisiin kasvaimiin. Koetinryhmä A sisälsi "pientä • · .···. vaaraa" vastaavia tyyppejä HPV6, 11, 42, 43 ja 44, kun • · · / # taas koetin B sisälsi "suurta vaaraa" vastaavia tyyppejä :·**| 16, 18, 31, 33, 35, 45, 51, 52 ja 56. Koko DNA pilkottiin * * entsyymeillä PstI, BamHI ja Hindlll ja Southern blot -mää- 21 ritys toteutettiin tarkoin rajatuissa olosuhteissa (T -15 °C) HPV-alatyypin määrittämiseksi.
Esimerkki 3 HPV6a-perimän kloonaus 5 HPV6a-positiivisesta kudosnäytteestä uutettu koko- nais-DNA pilkottiin Hindlll-endonukleaasilla. Sen jälkeen kun oli toteutettu fraktiointi koon perusteella käyttäen alhaisessa lämpötilassa sulavaa 0,8-%:ista preparatiivista agaroosigeeliä, noin 8 kiloemäsparin (kbp) kokoista DNA:ta 10 vastaava alue leikattiin irti geelistä ja agaroosi pilkottiin Gelase™-entsyymillä (Epicentre Technologies, Inc., Madison, WI). Näyte ligatoitiin plasmidiin pUC18 (Pharmacia, Inc., Piscataway, NJ), joka oli pilkottu entsyymillä HindiII ja defosforyloitu. Kykeneviksi tehtyihin E. coli 15 DH5 -soluihin (Gibco, BRL, Gaithersburg, MD) siirtämisen jälkeen tämä plasmidikirjasto seulottiin HPV6a-positiivis-ten kloonien suhteen pesäkkeiden hybridisäätiöila käyttäen vastasuuntaista ("antisense") 1 2 3 4 5 6P-leimattua oligonukleoti-diä, joka oli HPV6a Ll-geenin (5'-GAG AGA TCT TAC CTT TTA j’v 20 GTT TTG GCG CGC TTA C-3» ; SEQ ID NO. 1) 3'-pään komple-mentti. 8,1 kbp:n suuruisen HPV6a-perimän sisältävä pUC18- :*·.· plasmidi eristettiin ja sen tunnusomaiset piirteet selvi- • · tettiin restriktioentsyymi- ja Southern blot -analyyseil- ;·. lä. Tälle plasmidille annettiin nimeksi pUC18-HPV6a. Plas- • · · 25 midi-DNA valmistettiin käyttäen Qiagen™ Plasmide Maxi • · · -reagenssipakkausta (Qiagen Inc., Chatsworth, CA). Esimerkki 4 • · · • · *···* pUC18-HPV6a:n sekvenssianalyysi • · · · · * * Täydellisen HPV6a-sekvenssin määrittämiseksi sek- venssin määritykseen sopivat alukkeet syntetisoitiin jul- 2 • · .·**. kaistun HPV6b-sekvenssin perusteella. Täydellisen 8,1 3 • · · 4 #* kbp:n kokoisen HPV6a-perimän kummankin juosteen sekvenssi • · · *· ” määritettiin ketjun päättävällä dideoksimenetelmällä käyt- 5 * * täen PRISM™-reagenssipakkausta sekä yhtiön Applied Biosys- 6 tems (ABI) automaatista instrumenttia (nro 373A) sekvens- 22 sin määrittämiseksi valmistajan ohjeiden mukaan (ABI, Inc., Foster City, CA) . Niissä tapauksissa, joissa myötä- ja vastasuuntainen (sense and antisense) sekvenssi eivät vastanneet toisiaan, ylimääräisiä HPV6a-spesifisiä alukkeita 5 syntetisoitiin sekvenssin määrittämiseksi uudestaan kumpaankin suuntaan kyseessä olevassa alueessa yleispätevän sekvenssin saamiseksi.
Kuviossa 1 on esitetty täydellinen HPV6a-sekvenssi verrattuna julkaistuun HPV6b-sekvenssiin. HPV6a-sekvenssin 10 alapuolella esitetyt emäkset vastaavat HPV6b-sekvenssiä. Todettiin, että HPV6a:n ja HPV6b:n DNA-sekvenssit olivat yli 97-prosenttisesti samanlaisia siten, että yhteensä 229 bp-muutosta todettiin 8 010 emäsparissa. HPV6b-sekvenssiin nähden merkittävimmät erot todettiin LCRrssa (nt 7 205 - nt 15 106). Sen lisäksi, että löydettiin useita yksittäisten nukleotidien (nt) muutoksia HPV6a LCRrssa, 94 emäsparin istute kohdassa nt 7 350 ja toinen 19 emäsparin istute kohdassa nt 7 804 todettiin. Nukleotidin 7 615 kohdalla HPV6a:n perimästä oli hävinnyt kuusi emäsparia.
• · · L
: *.* 20 Esimerkki 5 • · · HFV6a-sekvenssin erilaisuus ORF-kehyksissä HPV6b-sek- : venssiin verrattuna • · *:··; Avoimet lukukehykset määritettiin HPV6a-sekvens- • *.e# sissa ja suuret ORF-kehykset luettiin aminohapposekvens- • 25 seiksi ja niitä verrattiin vastaaviin HPV6b-sekvensseihin.
• · ·
Suuri kapsidiproteiini LI oli ainoa ORF, joka oli ... samanlainen HPV6b-sekvenssissä. Kaikissa muissa ORF-kehyk- *·*. sissä todettiin aminohappomuutoksia, jotka on koottu tau lukkoon 1. Pienessä kapsidiproteiinissa L2 todettiin viisi :V: 30 aminohappomuutosta; E6- ja E7-ORF-kehyksissä todettiin kul- ·***: loinkin yksi aminohappomuutos. Ei-proteiinissa kuusi amino- • · · .* . happoa ja E2-proteiinissa 11 aminohappoa olivat erilaisia.
• · ·
* * E4-proteiinissa todettiin neljä aminohappomuutosta. E5a ORF
käsitti muutoksia neljässä asemassa, ORF E5b seitsemässä 35 asemassa.
23
Taulukko 1
Sekvenssin erilaisuus HPV6a ORF-kehyksissä E6, E7, El, E2, E4, E5 ja L2 HPV6b-sekvenssiin verrattuna Avoin lu- Asema (nuk- Asema Aminohappo- 5 kukehys leotidi) (aminohappo) muutos E6 252 50 His-»GIn E7 792 88 Asp-»Asn 10
El 1535, 1536 235 Leu-^Ala 1670 280 Leu—»Val 1741 303 Glu—»Asp 2208 459 Thr—»Ser 15 2557 575 Asp-»Glu 2654 608 Thr—»Ala E2 2802 27 His-»Asp 2974 94 Arg—»Lys 2 0 3148 142 Asn-»Thr !···. 3153 144 Thr—»Ser ':*·! 3272 193 His-»Gln • · · 3388 222 Leu->Pro ’i": 3405 227 Lys—»Gin 25 3643 307 Arg—»Ly.s 3693 324 Ser-»Pro 3735 338 Asp-»His O 3765 348 Asp-^Asn ·:··: 3794 357 Ser^Arg 30 • · · ':!f E4 3272 6 Ile-»Asn V 3388 60 Gly—>Glu O! 3461 69 Pro—>His ·:·*: 3552 99 Asp-»Glu 35 24 E5a 3935 16 Phe-»Leu 4004 40 Glu-»Asp 4137 84 Tyr—>His 4150 88 Thr—>Asn 5 E5b 4235 25 Met->Val 4297 45 Lys—>Asn 4314 51 Asn->Thr 4323 54 Asp—>Ala io 4343 61 Tyr—>His 4346,4347 62 Thr^Asp 4353 64 Asp-»A la L2 4646,4647 75 GliwGly is 4976 185 Valolle 5021 200 Vai—>Ile 5490 356 Gly—»Asp 5597 392 Leualle ;.φ·. 2 0 Esimerkki 6 • · *..! HPV6a cDNAjix alikloonaus ilmentämisvektoreihin • · • · ***. HPV6a:ta koodaava cDNA alikloonataan useaan vekto- • · · *· riin HPV6a-proteiinin ilmentämiseksi transfektoiduissa isäntäsoluissa sekä kopioimiseksi/lukemiseksi in vitro.
·· : 25 Näistä vektoreista voidaan mainita pBluescript II SK+ ··· · (jossa ilmentymistä ohjaavat T7- tai T3-promoottorit) , pcDNA Ι/Amp [jossa ilmentymistä ohjaa sytomegaloviruksen (CMV) promoottori] , pSZ9016-l [jossa ilmentymistä ohjaa ·;··· HIV:n pitkä päättävä toistuva (long terminal repeat; LTR) .*. 30 -promoottori] sekä bakuloviruksen siirtovektori pVL1393 • · · • · · *.* [jossa ilmentymistä ohjaa polyhedriini (PH) -promoottori] • · ’·;·* HPV6a:ta koodaavan DNA-sekvenssin sisältävän yhdistelmä- • · : DNA-teknisen bakuloviruksen tuottamiseksi.
• · ·;··· a) pBluescript II SK+:HPV6a: täysipituinen HPV6a 35 cDNA-klooni irrotetaan lambda-bakteriofagista rajoitetulla 25
EcoRI-pilkkomisella ja se ligatoidaan EcoRI-leikattuun ClP-käsiteltyyn plasmidiin pBluescript II SK+. Talteen otetaan sellaisia erillisiä aliklooneja, joissa "sense"-suuntautunut HPV6a seurasi joko T7- tai T3-promoottoria.
5 b) pcDNA I/Amp:HPV6a: Suunnatun kloonaamisen helpottamiseksi HPV6a leikataan pBluescript II SK+: HPV6a:sta, jossa HPV6a DNA-sekvenssi sijaitsee T7-promoot-torin jälkeen, saadusta puhdistetusta plasmidipreparaa-tista käyttäen entsyymejä EcoRV ja Xbal. Tuloksena oleva 10 EcoRV, Xbal HPV6a -kappale puhdistetaan ja ligatoidaan EcoRV-leikattuun, Xbal-leikattuun, ClP-käsiteltyyn pcDNA i/Amp-muodosteeseen siten, että HPV6a:ta koodaava DNA sijaitsee CMV-promoottorin jälkeen.
c) PSZ9016-1:HPV6a: HPV6a leikataan pBluescript II
15 SK+:HPV6a -muodosteesta rajoitetulla EcoRI-pilkkomisella, minkä jälkeen 1,5 kb:n kappale puhdistetaan agaroosigee-leiltä. Tuloksena saatu EcoRI HPV6a -kappale ligatoidaan EcoRI - leikattuun, ClP-käsiteltyyn pSZ9016-l-muodosteeseen. Sitten valikoidaan sellaisia aliklooneja, joissa "sense"-:1·1: 2 0 suuntautunut HPV6a seuraa HIV LTR -promoottorin jälkeen.
d) PVL1393 :HPV6a sekä PVL1393 HPV6a HA HPV6a:ta • · · : koodaavan DNA:n suunnattu kloonaaminen bakuloviruksen • · · • · siirtovektoriin pVL1393 toteutetaan leikkaamalla HPV6a • · ..t muodosteesta pcDNA I/Amp:HPV6a entsyymeillä BamHI ja Xbal, • · · 25 minkä jälkeen tuloksena saatu 1,3 kb:n kappale ligatoi- • · · * daan BamHI-leikattuun, Xbal-leikattuun, ClP-käsiteltyyn pVL1393-muodosteeseen, jolloin saadaan pVL1393:HPV6a. Sa- • · *··.1 moin HPV6a:n epitooppi merkittiin muodostamalla T7-merkki *** : HPV6a:n avoimen lukukehyksen 51-aminopäätteeseen sekä 30 FluHA-epitooppi 3 1-karboksipäätteeseen. Tällä tavalla muo- • · .···. kattu HPV6a DNA ligatoidaan pVL13 93-muodosteessa BamHI/ y Xbal-kohtiin, jolloin saadaan pVL1393:T7 HPV6a HA.
• 1 · • · · • · · 26
Esimerkki 7 HPV6a-polypeptidin ilmentäminen in vitro-kopioin-nilla/luennalla sekä transfektiolla isäntäsoluihin HPV DNA -sekvenssejä sisältävien vektoreiden avulla 5 toteutetaan HPV6a-polypeptidin luenta kanin retikulosyyt-tihajotteissa, nisäkkään isäntäsoluissa sekä bakuloviruk-sen infektoimissa hyönteissoluissa. Kokeelliset menettelytavat ovat olennaisesti valmistajien ohjeiden mukaisia.
a) In vitro -kopiointi/luenta: pBluescript III SK+: 10 HPV6a -plasmidin DNA (jossa HPV6a on T7-suuntautunut) tehdään lineaariseksi pilkkomalla entsyymillä BamHI HPV6a -istutteen jälkeen. Tämä lineaariseksi tehty plasmidi puhdistetaan ja sitä käytetään mallineena askeleittain tapahtuvassa kopioinnissa käyttäen T7 RNA-polymeraasia 15 m7G(5')ppp(5')G:n läsnä ollessa. Tuloksena saadut päättävän ryhmän käsittävät HPV6a-kopiot puhdistetaan LiCl-saos-tuksella ja niiden avulla toteutetaan HPV6a:n luenta nuk-leaasilla esikäsitellyssä kanin retikulosyyttihajotteessa
7C
L-[ S]-metioniinin läsnä ollessa.
;*·*: 20 b) Ilmentäminen nisäkässoluissa: HPV6a-proteiini • · ;***; ilmennetään isäntänä toimivissa nisäkässoluissa, sen jäi- ···
.·. : keen kun ne on transfektoitu joko muodosteella pCDNA
• · l/Amp:HPV6a (CMV-promoottorin säätelyn alainen) tai • · pSZ9016-l :HPV6a (HIV LTR-promoottorin säätelyn alainen).
• · · *... 25 Viimeksi mainitussa tapauksessa (pSZ9016-l :HPV6a) solut • · · *** * transfektoidaan lisäksi TAT-ilmentävällä plasmidilla pSZ90161:TAT. Näiden kummankin HPV6a:ta ilmentävän plas- • · · midin tapauksessa transfektoidaan C0S-7-soluja käyttäen ’·**· joko DEAE-dekstraania tai lipofektiota lipofektamiinilla .·*.·. 3 0 (BRL) .
• · · .···. c) Ilmentäminen hyönteissoluissa: HPV6a:n sisältä- • · *·’ vää bakuloviruksen siirtovektoria pVL1393:T7 HPV6a HA on • · • · · *. ” käytetty yhdistelmä-DNA-teknisen bakuloviruksen (Autoqrap- ’·**· ha californica) tuottamiseksi muodostamalla in vivo uusia 35 homologisia yhdistelmiä. Sitten epitooppimerkitty HPV6a 27 ilmennetään Sf9-hyönteissoluissa (Spodoptera frugiperda), joita kasvatetaan suspensioviljelmänä, sen jälkeen kun ne on infektoitu HPV6a:n sisältävällä yhdistelmä-DNA-tekni-sellä bakuloviruksella.
5 Esimerkki 8
Yhdisteitä, joilla on vaikutusta HPV6a-aktiivisuu- teen, voidaan ilmaista erilaisilla menetelmillä. Menetelmä HPV6a:n vaikuttavien yhdisteiden tunnistamiseksi käsittää vaiheet, joissa: 10 (a) testattavaa yhdistettä sekoitetaan HPV6a:ta sisältävään liuokseen seoksen muodostamiseksi; (b) HPV6a-aktiivisuus seoksessa määritetään; ja (c) seoksessa läsnä olevaa HPV6a:ta verrataan standardiin.
15 Yhdisteitä, joilla on vaikutusta HPV6a-aktiivisuu- teen, voidaan sisällyttää farmaseuttisiin koostumuksiin. Tällaisia farmaseuttisia koostumuksia voidaan käyttää sellaisten sairauksien tai tilojen, joiden tunnusomaisena piirteenä on HPV6a-infektio, hoitamiseksi.
: 1 : 2 0 Esimerkki 9 • · ;***: DNA, joka on rakenteellisesti HPV6a:ta koodaavan • · · •\! DNA:n kaltaista, ilmaistaan koettimella. Sopiva koetin • · voidaan saada sellaisesta DNA:sta, joka käsittää kuvion 1 • · ;·. mukaisen nukleotidisekvenssin kokonaisuudessaan tai osan • · · *... 25 siitä, sellaisen DNA:n, joka käsittää kuvion 1 mukaisen • · · • · · * nukleotidisekvenssin kokonaisuudessaan tai osan siitä, koodaamasta RNA:sta tai degeneroituneista oligonukleoti- • · *···1 deistä, jotka ovat peräisin kuvion 1 mukaisen sekvenssin *·**· osasta.
• 1 • · · • · · • · ··· • · • · • · · • · • · · • · · • · · · · · 28
Sekvenssilletaus (1) YLEISET TIEDOT: (i) HAKIJA: Jansen, Kathrin U.
Hofmann, Kathryn J.
(ii) KEKSINNÖN NIMITYS: Tyyppiä 6A olevaa ihmisen
papillomavirusta koodaava DNA
(iii) SEKVENSSIEN LUKUMÄÄRÄ: 2 (iv) KIRJEENVAIHTO-OSOITE: (A) VASTAANOTTAJA: Christine E. Carty (B) KATU: 126 E. Lincoln Avenue, P.O. Box 2000 (C) KAUPUNKI: Rahway
(D) OSAVALTIO TAI LÄÄNI: NJ
(E) MAA: USA
(F) POSTINUMERO: 07065-0907 (v) KONEKOODIMUOTO: (A) VÄLINETYYPPI: Levyke (B) TIETOKONE: IBM PC -yhteensopiva
(C) KÄYTTÖJÄRJESTELMÄ: PC-DOS/MS-DOS
(D) OHJELMISTO: Patentin Release #1.0 Versio "1.25 (vi) NYKYISEN HAKEMUKSEN TIEDOT: (A) HAKEMUSNUMERO: US 08/310 468 (B) JÄTTÖPÄIVÄMÄÄRÄ: 22.9.1994 (C) LUOKITUS: (viii) ASIAMIEHEN TIEDOT: (A) NIMI: Carty, Christine E.
(B) REKISTERINUMERO: 36 099
(C) VIITE/LUETTELONUMERO: 19307 PCT
(ix) TIETOLIIKENNEYHTEYSTIEDOT: (A) PUHELIN: (908) 594-6734 (B) TELEFAX: (908) 594-4720 (2) SEKVENSSIN NRO 1 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 34 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksisäikeinen (D) TOPOLOGIA: lineaarinen
(ii) MOLEKYYLITYYPPI: cDNA
(xi) SEKVENSSIN KUVAUS: SEKVENSSI NRO 1: GAGAGATCTT ACCTTTTAGT TTTGGCGCGC TTAC 34 29 (2) SEKVENSSIN NRO 2 TIEDOT: (i) SEKVENSSIN OMINAISPIIRTEET: (A) PITUUS: 8 010 emäsparia (B) TYYPPI: nukleiinihappo (C) JUOSTEISUUS: yksisäikeinen (D) TOPOLOGIA: lineaarinen
(ii) MOLEKYYLITYYPPI: cDNA
GTTAATAACA ATCTTGGTTT TAAAAAATAG GAGGGACCGA AAACGGTTCA ACCGAAAACG 60 GTTGTATATA AACCAGCCCT AAAATTTAGC AAACGAGGCA TTATGGAAAG TGCAAATGCC 12 0 TCCACGTCTG CAACGACCAT AGACCAGTTG TGCAAGACGT TTAATCTATC TATGCATACG 180 TTGCAAATTA ATTGTGTGTT TTGCAAGAAT GCACTGACCA CTGCAGAGAT TTATTCATAT 240 GCATATAAAC AGCTAAAGGT CCTGTTTCGA GGCGGCTATC CATATGCAGC CTGCGCGTGC 300 TGCCTAGAAT TTCATGGAAA AATCAACCAA TATAGACACT TTGATTATGC TGGATATGCA 360 ACAACTGTTG AAGAAGAAAC TAAACAAGAC ATTTTAGACG TGCTAATTCG GTGCTACCTG 420 TGTCACAAAC CGCTGTGTGA AGTAGAAAAG GTAAAACATA TACTAACCAA GGCGCGGTTT 480 ATAAAGCTAA ATTGTACGTG GAAGGGTCGC TGCCTACACT GCTGGACAAC ATGCATGGAA 540 GACATGTTAC CCTAAAGGAT ATTGTATTAG ACCTGCAACC TCCAGACCCT GTAGGGTTAC 600 ATTGCTATGA GCAATTAGTA GACAGCTCAG AAGATGAGGT GGACGAAGTG GACGGACAAG 660 ATTCACAACC TTTAAAACAA CATTTCCAAA TAGTGACCTG TTGCTGTGGA TGTGACAGCA 720 ACGTTCGACT GGTTGTGCAG TGTACAGAAA CAGACATCAG AGAAGTGCAA CAGCTTCTGT 730 TGGGAACACT AGACATAGTG TGTCCCATCT GCGCACCGAA GAC ATAAC AA CGATGGCGGA 840 CGATTCAGGT ACAGAAAATG AGGGGTCTGG GTGTACAGGA TGGTTTATGG TAGAAGCTAT 900 AGTGCAACAC CCAACAGGTA CACAAATATC AGACGATGAG GATGAGGAGG TGGAGGACAG 960 TGGGTATGAC ATGGTGGACT TTATTGATGA CAGCAATATT ACACACAATT CCTTGGAAGC 1020 ACAGGCATTG TTTAACAGGC AGGAGGCGGA CACCCATTAT GCGACTGTGC AGGACCTAAA 1030 ACGAAAGTAT TTAGGTAGTC CATATGTTAG TCCTATAAAC ACTATAGCCG AGGCAGTGGA 1140 AAGTGAAATA AGTCCACGAT TGGACGCCAT TAAACTTACA AGACAGCCAA AAAAGGTAAA 1200 30 GCGACGGCTG TTTCAAACCA GGGAACTAAC GGACAGTGGA TATGGCTATT CTGAAGTGGA 1260 AGCTGGAACG GGAACGCAGG TAGAGAAACA TGGCGTCCCG GAAAATGGGG GAGATGGTCA 132 0 GGAAAAGGAC ACAGGAAGGG ACATAGAGGG GGAGGAACAT ACAGAGGCGG AAGCGCCCAC 1330 AAACAGTGTA CGGGAGCATG CAGGCACAGC AGGAATATTG GAATTGCTAA AATGTAAAGA 1440 TTTACGGGCA GCATTACTTG GTAAGTTTAA AGAATGCTTT GGGCTGTCTT TTATTGATTT 1500 AATTAGGCCA TTTAAAAGTG ATAAAACAAC ATGTGCAGAC TGGGTGGTAG CAGGATTTGG 1560 TATACATCAT AGCATATCAG AGGCATTTCA AAAATTAATT GAGCCATTAA GTTTATATGC 1620 ACATATACAA TGGCTAACAA ATGCATGGGG AATGGTATTG TTAGTATTAG TAAGATTTAA 1680 AGTAAATAAA AGTAGAAGTA CCGTTGCACG TACACTTGCA ACGCTATTAA ATATACCTGA 1740 CAATCAAATG TTAATAGAGC CACCAAAAAT ACAAAGTGGT GTTGCAGCCC TGTATTGGTT 1300 TCGTACAGGT ATATCAAATG CCAGTACAGT TATAGGGGAA GCACCAGAAT GGATAACACG 1860 CCAAACTGTT ATTGAACATG GGTTGGCAGA CAGTCAGTTT AAATTAACAG AAATGGTGCA 1920 GTGGGCATAT GATAATGACA TATGCGAGGA GAGTGAAATT GCATTTGAAT ATGCACAAAG 1980 GGGAGATTTT GATTCTAATG CACGAGCATT TTTAAATAGC AATATGCAGG CAAAATATGT 2040 GAAAGATTGT GCAACTATGT GTAGACATTA TAAACATGCA GAAATGAGGA AGATGTCTAT 2100 AAAACAATGG ATAAAACATA GGGGTTCTAA AATAGAAGGC ACAGGAAATT GGAAACCAAT 2160 TGTACAATTC CTACGACATC AAAATATAGA ATTTATTCCA TTTTTAAGTA AATTTAAATT 2220 ATGGCTGCAC GGTACGCCAA AAAAAAACTG CATAGCCATA GTAGGCCCTC CAGATACTGG 2280 GAAATCGTAC TTTTGTATGA GTTTAATAAG CTTTTTAGGA GGTACAGTTA TTAGTCATGT 2340 AAATTCCAGC AGCCATTTTT GGTTGCAACC GTTAGTAGAT GCTAAGGTAG CATTGTTAGA 2400 TGATGCAACA CAGCCATGTT GGATATATAT GGATACATAT ATGAGAAATT TGTTAGATGG 2460 TAATCCTATG AGTATTGACA GAAAGCATAA AGC ATTGAC A TTAATTAAAT GTCCACCTCT 2520 GCTAGTAACG TCCAACATAG ATATTACTAA AGAAGAGAAA TATAAGTATT TACATACTAG 2530 AGTAACAACA TTTACATTTC CAAATCCATT CCCTTTTGAC AGAAATGGGA ATGCAGTGTA 2640 TGAACTGTCA AATGCAAACT GGAAATGTTT TTTTGAAAGA CTGTCGTCAA GCCTAGACAT 2700 TCAGGATTCA GAGGACGAGG AAGATGGAAG CAATAGCCAA GCGTTTAGAT GCGTGCCAGG 2760 AACAGTTGTT AGAACTTTAT GAAGAAAACA GTACTGACCT AAACAAACAT GTATTGCATT 2820 GGAAATGCAT GAGACATGAA AGTGTATTAT TATATAAAGC AAAACAAATG GGCCTAAGCC 2880 31 ACATAGGAAT GCAAGTAGTG CCACCATTAA AGGTGTCCGA AGCAAAAGGA CATAATGCCA 2940 TTGAAATGCA AATGCATTTA GAATCATTAT TAAAGACTGA GTATAGTATG GAACCGTGGA 3000 CATTACAAGA AACAAGTTAT GAAATGTGGC AAACACCACC TAAACGCTGT TTTAAAAAAC 3060 GGGGCAAAAC TGTAGAAGTT AAATTTGATG GCTGTGCAAA CAATACAATG GATTATGTGG 3120 TATGGACAGA TGTGTATGTG CAGGACACTG ACTCCTGGGT AAAGGTGCAT AGTATGGTAG 3180 ATGCTAAGGG TATATATTAC ACATGTGGAC AATTTAAAAC ATATTATGTA AACTTTGTAA 3240 AAGAGGCAGA AAAGTATGGG AGCACCAAAC AATGGGAAGT ATGTTATGGC AGCACAGTTA 3300 TATGTTCTCC TGCATCTGTA TCTAGCACTA CACAAGAAGT ATCCATTCCT GAATCTACTA 3360 CATACACCCC CGCACAGACC TCCACCCCTG TGTCCTCAAG CACCCAGGAA GACGCAGTGC 3420 AAACGCCGCC TAGAAAACGA GCACGAGGAG TCCAACAGTC ACCTTGCAAC GCCTTGTGTG 3430 TGGCCCACAT TGGACCCGTG GACAGTGGAA ACCACAACCT CATCACTAAC AATCACGACC 3540 AGCACCAAAG AAGGAACAAC AGTAACAGTT CAGCTACGCC TATAGTGCAA TTTCAAGGTG 3600 AATCTAATTG TTTAAAGTGT TTTAGATATA GGCTAAATGA CAAACACAGA CATTTATTTG 3660 ATTTAATATC ATCAACGTGG CACTGGGCCT CCCCAAAGGC ACCACATAAA CATGCCATTG 3720 TAACTGTAAC ATATCATAGT GAGGAACAAA GGCAACAGTT TTTAAATGTT GTAAAAATAC 3780 CACCTACTAT TAGGCACAAA CTGGGGTTTA TGTCACTGCA CCTATTGTAA TTTGTATATA 3840 TGTAAATGTG TAAATATATG GTATTGGTGT AATACAACTG TACATGTATG GAAGTGGTAC 3900 CTGTACAAAT AGCTGCAGGA ACAACCAGCA CATTAATACT GCCTGTTATA ATTGCATTTG 3960 TTGTATGTTT TGTTAGCATC ATACTTATTG TATGGATATC TGACTTTATT GTGTACACAT 4020 CTGTGCTAGT ACTAACACTG CTTTTATACT TACTATTGTG GCTGCTATTA ACAACCCCCT 4080 TGCAATTTTT CCTACTAACT CTACTTGTGT GTTACTGTCC CGCATTGTAT ATACACCACT 4140 ACATTGTTAA CACACAGCAA TGATGCTAAC ATGTCAATTT .AATGATGGAG ATACATGGCT 4200 GGGTTTGTGG TTGTTATGTG CCTTTATTGT AGGGGTGTTG GGGTTATTAT TAATGCACTA 4260 TAGAGCTGTA CAAGGCGATA AACACACCAA ATGTAACAAG TGTAACAAAC ACACCTGTAA 4320 TGCTGATTAT GTAACTATGC ATCATGATAC TGCTGGTGAT TATATATATA TGAATTAGAG 4380 TAAAACTTTT TTTATATTTG TAACAGTGTA TGTTTTGTAT ACCATGGCAC ATAGTAGGGC 4440 CCGACGACGC AAGCGTGCGT CAGCTACACA GCTATATCAA ACATGTAAAC TTACTGGAAC 4500 ATGCCCCCCA GATGTAATTC CTAAGGTGGA GCACAACACC ATTGCAGATC AAATATTAAA 4560 32 ATGGGGAAGT TTGGGGGTTT TTTTTGGAGG GTTGGGTATA GGCACCGGTT CCGGCACTGG 4620 GGGTCGTACT GGCTATGTTC CCTTAGGAAC TTCTGCAAAA CCTTCTATTA CTAGTGGGCC 4680 TATGGCTCGT CCTCCTGTGG TGGTGGAGCC TGTGGCCCCT TCGGATCCAT CCATTGTGTC 4740 TTTAATTGAA GAATCAGCAA TCATTAACGC AGGGGCGCCT GAAATTGTGC CCCCTGCACA 4800 CGGTGGGTTT ACAATTACAT CCTCTGAAAC AACTACCCCT GCAATATTGG ATGTATCAGT 4860 TACTAGTCAT ACTACTACTA GTATATTTAG AAATCCTGTC TTTACAGAAC CTTCTGTAAC 4920 ACAACCCCAA CCACCCGTGG AGGCTAATGG ACATATATTA ATTTCTGCAC CCACTATAAC 4980 GTCACACCCT ATAGAGGAAA TTCCTTTAGA TACTTTTGTG ATATCCTCTA GTGATAGCGG 5040 TCCTACATCC AGTACCCCTG TTCCTGGTAC TGCACCTAGG CCTCGTGTGG GCCTATATAG 5100 TCGTGCATTG CACCAGGTGC AGGTTACAGA CCCTGCATTT CTTTCCACTC CTCAACGCTT 5160 AATTACATAT GATAACCCTG TATATGAAGG GGAGGATGTT AGTGTACAAT TTAGTCATGA 5220 TTCTATACAC AATGCACCTG ATGAGGCTTT TATGGACATA ATTCGTTTGC ACAGACCTGC 5280 TATTGCGTCC CGACGTGGCC TTGTGCGGTA CAGTCGCATT GGACAACGGG GGTCTATGCA 5340 CACTCGCAGC GGAAAGCACA TAGGGGCCCG CATTCATTAT TTTTATGATA TTTCACCTAT 5400 TGCACAAGCT GCAGAAGAAA TAGAAATGCA CCCTCTTGTG GCTGCACAGG ATGATACATT 5460 TGATATTTAT GCTGAATCTT TTGAACCTGA CATTAACCCT ACCCAACACC CTGTTACAAA 5520 TATATCAGAT ACATATTTAA CTTCCACACC TAATACAGTT ACACAACCGT GGGGTAACAC 5530 CACAGTTCCA TTGTCAATTC CTAATGACCT GTTTTTACAG TCTGGCCCTG ATATAACTTT 5640 TCCTACTGCA CCTATGGGAA CACCCTTTAG TCCTGTAACT CCTGCTTTAC CTACAGGCCC 5700 TGTTTTCATT ACAGGTTCTG GATTTTATTT GCATCCTGCA TGGTATTTTG CACGTAAACG 5760 CCGTAAACGT ATTCCCTTAT TTTTTTCAGA TGTGGCGGCC TAGCGACAGC ACAGTATATG 5320 TGCCTCCTCC TAACCCTGTA TCCAAAGTTG TTGCCACGGA TGCTTATGTT ACTCGCACCA 5330 ACATATTTTA TCATGCCAGC AGTTCTAGAC TTCTTGCAGT GGGTCATCCT TATTTTTCCA 5940 TAAAACGGGC TAACAAAACT GTTGTGCCAA AGGTGTCAGG ATATCAATAC AGAGTATTTA 6000 AGGTGGTGTT ACCAGATCCT AACAAATTTG CATTGCCTGA CTCGTCTCTT TTTGATCCCA 6060 CAACACAACG TTTGGTATGG GCATGCACAG GCCTAGAGGT GGGCCGGGGA CAGCCATTAG 6120 GTGTGGGTGT AAGTGGACAT CCTTTCCTAA ATAAATATGA TGATGTTGAA AATTCAGGGA 6180 GTGGTGGTAA CCCTGGACAG GATAACAGGG TTAATGTAGG TATGGATTAT AAACAAACAC 6240 33 AATTATGCAT GGTTGGATGT GCCCCCCCTT TGGGCGAGCA TTGGGGTAAA GGTAAACAGT 6300 GTACTAATAC ACCTGTACAG GCTGGTGACT GCCCGCCCTT AGAACTTATT ACCAGTGTTA 6360 TACAGGATGG CGATATGGTT GACACAGGCT TTGGTGCTAT GAATTTTGCT GATTTGCAGA 6420 CCAATAAATC AGATGTTCCT ATTGACATAT GTGGCACTAC ATGTAAATAT CCAGATTATT 6480 TACAAATGGC TGCAGACCCA TATGGTGATA GATTATTTTT TTTTCTACGG AAGGAACAAA 6540 TGTTTGCCAG ACATTTTTTT AACAGGGCTG GCGAGGTGGG GGAACCTGTG CCTGATACTC 6600 TTATAATTAA GGGTAGTGGA AATCGCACGT CTGTAGGGAG TAGTATATAT GTTAACACCC 6660 CAAGCGGCTC TTTGGTGTCC TCTGAGGCAC AATTGTTTAA TAAGCCATAT TGGCTACAAA 6720 AAGCCCAGGG ACATAACAAT GGTATTTGTT GGGGTAATCA ACTGTTTGTT ACTGTGGTAG 6730 ATACCACACG CAGTACCAAC ATGACATTAT GTGCATCCGT AACTACATCT TCCACATACA 6840 CCAATTCTGA TTATAAAGAG TACATGCGTC ATGTGGAAGA GTATGATTTA CAATTTATTT 6900 TTCAATTATG TAGCATTACA TTGTCTGCTG AAGTAATGGC CTATATTCAC ACAATGAATC 6960 CCTCTGTTTT GGAAGACTGG AACTTTGGGT TATCGCCTCC CCCAAATGGT ACATTAGAAG 7020 ATACCTATAG GTATGTGCAG TCACAGGCCA TTACCTGTCA AAAGCCCACT CCTGAAAAGG 7080 AAAAGCCAGA TCCCTATAAG AACCTTAGTT TTTGGGAGGT TAATTTAAAA G'AAAAGTTTT 7140 CTAGTGAATT GGATCAGTAT CCTTTGGGAC GCAAGTTTTT GTTACAAAGT GGATATAGGG 7200 GACGGTCCTC TATTCGTACC GGTGTTAAGC GCCCTGCTGT TTCCAAAGCC TCTGCTGCCC 7260 CTAAACGTAA GCGCGCCAAA ACTAAAAGGT AATATATGTG TATATGTACT GTTATATATA 7320 TGTGTGTATG TACTGTTATG TATATGTGTG TATGTACTGT TATATGTATG TGTGTTGTAT 7380 ATATGTGTGT ATATATGTGT ATGTGTGTAT ATGTATATGT ATGTGTTGTG TATATATATG 7440 TGTGTGTGTG TTATGTGTGT AATGTAATTT ATTTGTGTAA TGTGTATGTG TGTTTATGTG 7500 CAATAAACAA TTAACTACAC CCTGTGACTC AGTGGCTGTT GCACGCGTTT TGGTTTGCAC 7560 GCGCCTTACA CACATAAGTA ATATACATGC ACAATATATA TATTTTTGTT ACAATAATAT 7620 ATTTTTATAT TTGCAACCGT TTTCGGTTGC CCTTGGCATA CACTTTCCAC CAATTTGTTA 7630 CAACGTGTTG CCTGTTAATC CTATATATTT TGTGCCAGGT ACACATTGCC CTGCCAAGTT 7740 CATTGCCAAG TGCATCATAT CCTGCCAACC ACACACCTGG CGCCAGGGTG CGGTATTGCC 7300 TTACTCATAT GTTTATTGCC ACTGCAATAA ACCTGTCTTT GTGTTATACT TTTCTGCACT 7860 GTAGCCAACT CTTAAAAGCA TTTTTGGCTT GTAGCAGAAC ATTTTTTTGC TCTTACTGTT 7920 34 TGGTATACAA TAACATAAAA ATGAGTAACC TAAGGTCACA CACCTGCAAC CGGTTTCGGT 7980 TATCCACACC CTACATATTT CCTTCTTATA 8010

Claims (7)

1. Yhtä HPV6a-proteiinia koodaava eristetty DNA, jolloin HPV6a-proteiini valitaan ryhmästä, joka koostuu seu- 5 raavista: HPV6a L2 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleotidit 4380-5804), HPV6a El (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleotidit 717-2781),
10 HPV6a E2 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleoti dit 2697-3829), HPV6a E4 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleotidit 3242-3584), HPV6a E5 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleoti-15 dit 3888-4163), HPV6a E6 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukleotidit 32-554) ja HPV6a E7 (jota koodaavat sekvenssin nro 2 nukeloti-dit 442-826), 20 jolloin DNA on heterologisen promoottorin transkriptionaali- sen kontrollin alaisuudessa.
2. Vektori, joka käsittää DNA:n, joka koodaa yhtä ihmisen papillomavirus 6a (HPV6a) proteiinia, jolloin DNA koostuu sekvenssistä, joka valitaan ryhmästä, joka koostuu 25 seuraavista: HPV6a L2 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 4380-5804), HPV6a El (sekvenssin nro 2 nukleotidit 717-2781), HPV6a E2 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 2697-3829), HPV6a E4 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 3242-3584),
30 HPV6a E5 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 3888-4163), HPV6a Εβ (sekvenssin nro 2 nukleotidit 32-554) ja HPV6a E7 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 442-82 6) .
3. Isäntäsolu, joka käsittää patenttivaatimuksen 2 mukaisen vektorin.
4. Patenttivaatimuksen 3 mukainen isäntäsolu, joka valitaan ryhmästä, joka koostuu seuraavista: hiiva-, hyön- 5 teis- ja nisäkässolut.
5. Patenttivaatimuksen 4 mukainen isäntäsolu, joka on hiivasolu.
6. Menetelmä tyyppiä 6a olevan ihmisen papillomavi-ruksen proteiinin ilmentämiseksi isännässä, joka menetelmä 10 käsittää sen, että a) viedään vektori, joka käsittää yhtä HPV6a-prote-iinia koodaavan DNA:n, joka valitaan ryhmästä, joka koostuu seuraavista: HPV6a L2 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 4380-5804), 15 HPV6a El (sekvenssin nro 2 nukleotidit 717-2781), HPV6a E2 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 2697-3829), HPV6a E4 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 3242-3584), HPV6a E5 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 3888-4163), HPV6a E6 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 32-554) ja
20 HPV6a E7 (sekvenssin nro 2 nukleotidit 442-826) isäntäsoluun ja b) viljellään isäntäsolua olosuhteissa, jotka sallivat HPV6a-proteiinin ekspression vektorista.
7. Patenttivaatimuksen 6 mukainen menetelmä, jol-25 loin isäntäsolu valitaan ryhmästä, joka koostuu seuraavista: hiiva-, hyönteis- ja nisäkässolut.
FI971203A 1994-09-22 1997-03-21 Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA FI121507B (fi)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US31046894A 1994-09-22 1994-09-22
US31046894 1994-09-22
PCT/US1995/011859 WO1996009375A1 (en) 1994-09-22 1995-09-18 Dna encoding human papillomavirus type 6a
US9511859 1995-09-18

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI971203A0 FI971203A0 (fi) 1997-03-21
FI971203A FI971203A (fi) 1997-03-21
FI121507B true FI121507B (fi) 2010-12-15

Family

ID=23202654

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI971203A FI121507B (fi) 1994-09-22 1997-03-21 Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA

Country Status (16)

Country Link
US (1) US6290965B1 (fi)
EP (1) EP0782615A4 (fi)
JP (1) JPH10506014A (fi)
AU (1) AU694269B2 (fi)
BG (1) BG101338A (fi)
BR (1) BR9509076A (fi)
CA (1) CA2200582C (fi)
CZ (1) CZ87597A3 (fi)
FI (1) FI121507B (fi)
HU (1) HUT77337A (fi)
NO (1) NO971347L (fi)
NZ (1) NZ293461A (fi)
PL (1) PL319294A1 (fi)
RU (1) RU2177999C2 (fi)
SK (1) SK35897A3 (fi)
WO (1) WO1996009375A1 (fi)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6962981B1 (en) * 1996-03-25 2005-11-08 Medarex, Inc. Monoclonal antibodies specific for the extracellular domain of prostate-specific membrane antigen
GB9621091D0 (en) 1996-10-09 1996-11-27 Fondation Pour Le Perfectionem Attenuated microorganisms strains and their uses
EA200100236A1 (ru) * 1998-08-14 2001-08-27 Мерк Энд Ко., Инк. Способ очистки вирусных частиц, подобных вирусу папилломы человека
CN1100835C (zh) * 1998-10-30 2003-02-05 中国科学院感光化学研究所 加入纳米无机化合物粒子的钛溶胶-凝胶涂料及其制法和用途
GB0017990D0 (en) * 2000-07-21 2000-09-13 Glaxo Group Ltd Papilloma virus sequences
WO2004081178A2 (en) * 2003-03-06 2004-09-23 Indiana University Research And Technology Corporation Methods and composition for producing infectious hpv stocks
IL156670A0 (en) * 2003-06-26 2004-01-04 Zvi Zolotariov Aloe suppositories
US20080160040A1 (en) * 2004-04-15 2008-07-03 Ghim Shin-Je Plant-produced compositions for treating papillomavirus infection and related methods
EP1819835B1 (en) 2004-12-08 2010-08-04 Gen-Probe Incorporated Detection of nucleic acids from multiple types of human papillomaviruses
US8084207B2 (en) * 2005-03-03 2011-12-27 Ibis Bioscience, Inc. Compositions for use in identification of papillomavirus
US20070031826A1 (en) * 2005-08-05 2007-02-08 My Gene Diagnostic kit for determining the genotype of a human papilloma virus and method of using thereof
WO2007038145A2 (en) * 2005-09-08 2007-04-05 Large Scale Biology Corporation Modified tobacco mosaic virus particles as scaffolds for display of protein antigens for vaccine applications
KR100904844B1 (ko) * 2006-08-28 2009-06-25 성균관대학교산학협력단 인유두종 바이러스(hpv)유전자를 포함하는자궁경부암의 치료 또는 예방용 dna 백신
LT3075858T (lt) * 2007-12-21 2020-04-27 Novartis Ag Žinduolių raiškos vektorius
US9376727B2 (en) 2010-05-25 2016-06-28 Qiagen Gaithersburg, Inc. Fast results hybrid capture assay and associated strategically truncated probes

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE122007000096I1 (de) * 1992-06-25 2008-03-27 Papillomavirus vakzine
CZ336696A3 (en) * 1994-05-16 1997-07-16 Merck & Co Inc Isolated and purified proteins of papillomavirus and process for preparing thereof
AR004464A1 (es) * 1994-11-14 1998-12-16 Merck Sharp & Dohme Un metodo para producir una proteina de capside de papilomavirus
IL117591A0 (en) * 1995-03-30 1996-07-23 Merck & Co Inc Synthetic DNA encoding human papillomavirus type 11 L1 protein

Also Published As

Publication number Publication date
AU694269B2 (en) 1998-07-16
JPH10506014A (ja) 1998-06-16
NO971347D0 (no) 1997-03-21
EP0782615A1 (en) 1997-07-09
CA2200582A1 (en) 1996-03-28
PL319294A1 (en) 1997-08-04
CZ87597A3 (cs) 1998-01-14
FI971203A0 (fi) 1997-03-21
HUT77337A (hu) 1998-03-30
WO1996009375A1 (en) 1996-03-28
NO971347L (no) 1997-05-21
EP0782615A4 (en) 2001-08-22
BG101338A (en) 1997-10-31
FI971203A (fi) 1997-03-21
AU3591895A (en) 1996-04-09
NZ293461A (en) 1998-04-27
BR9509076A (pt) 1998-07-14
US6290965B1 (en) 2001-09-18
CA2200582C (en) 2007-03-27
MX9702209A (es) 1997-07-31
RU2177999C2 (ru) 2002-01-10
SK35897A3 (en) 1998-02-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US5840306A (en) DNA encoding human papillomavirus type 18
US6159729A (en) Synthetic HPV6/11 hybrid L1 DNA encoding human papillomavirus type 11 L1 protein
FI121507B (fi) Tyyppiä 6A olevaa ihmisen papillomavirusta koodaava DNA
US5820870A (en) Recombinant human papillomavirus type 18 vaccine
PT1021547E (pt) Formulações da vacinas com capsomeros do vírus papiloma e métodos de utilização
RU2161651C2 (ru) Очищенные белки вируса папилломы
CA2215834C (en) Dna encoding human papillomavirus type 18
WO1996015247A9 (en) Purified papillomavirus proteins
US6908615B1 (en) DNA encoding human papilloma virus type 18
CA2204266C (en) Purified papillomavirus proteins
MXPA97002209A (en) Dna that codifies for type human papilloma viruses

Legal Events

Date Code Title Description
PC Transfer of assignment of patent

Owner name: MERCK SHARP & DOHME CORP.

Free format text: MERCK SHARP & DOHME CORP.

PC Transfer of assignment of patent

Owner name: MERCK SHARP & DOHME CORP.

MA Patent expired