FI107167B - Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer - Google Patents

Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer Download PDF

Info

Publication number
FI107167B
FI107167B FI991296A FI991296A FI107167B FI 107167 B FI107167 B FI 107167B FI 991296 A FI991296 A FI 991296A FI 991296 A FI991296 A FI 991296A FI 107167 B FI107167 B FI 107167B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
leu
gly
ala
lys
glu
Prior art date
Application number
FI991296A
Other languages
English (en)
Finnish (fi)
Other versions
FI991296A (sv
FI991296A0 (sv
Inventor
Marko Virta
Esa-Matti Lilius
Original Assignee
Marko Virta
Lilius Esa Matti
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Marko Virta, Lilius Esa Matti filed Critical Marko Virta
Priority to FI991296A priority Critical patent/FI107167B/sv
Publication of FI991296A0 publication Critical patent/FI991296A0/sv
Priority to DE60017407T priority patent/DE60017407T2/de
Priority to US09/980,585 priority patent/US6866995B1/en
Priority to PCT/FI2000/000507 priority patent/WO2000075367A1/en
Priority to EP00935235A priority patent/EP1194586B1/en
Priority to AT00935235T priority patent/ATE286982T1/de
Priority to AU50799/00A priority patent/AU5079900A/en
Publication of FI991296A publication Critical patent/FI991296A/sv
Application granted granted Critical
Publication of FI107167B publication Critical patent/FI107167B/sv

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/04—Determining presence or kind of microorganism; Use of selective media for testing antibiotics or bacteriocides; Compositions containing a chemical indicator therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/66—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving luciferase
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/43504—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from invertebrates
    • G01N2333/43595—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from invertebrates from coelenteratae, e.g. medusae

Claims (5)

1. Ett förfarande för att möjliggöra en uppskattning av tillväxten och dödligheten hos en mikroorganism inom en vald tidsperiod i en miljö av intresse, genoni att introducera i nämnda mikroorganism ätminstone tvä markör gener, vilket förfarande 5 är kännetecknat därav, att a) nämnda reporter gener kodar luminescenta och/eller fluorescenta produkter och att inom nämnda tidsperiod och miljö ätminstone tvä av följande nämnda produkter bildas: i) en väsentligen stabil produkt, som bildats i ett, inom miljön av intresse, 10 väsentligen känt förhällande tili den totala mängden celler av nämnda mikroorganism, vilka är eller har värit vid liv under nämnda valda tidsperiod, ii) en produkt närvarande i nämnda miljö av intresse i ett väsentligen känt förhällande tili mängden av levande celler vid vilken som heist tidpunkt inom nämnda valda tidsperiod, och . 15 iii) en väsentligen stabil produkt, som bildats i ett, inom miljön av intresse, » I 4 ,1.1 väsentligen känt förhällande tili den totala mängden celler av nämnda , k mikroorganism, vilka dött inom nämnda valda tidsperiod, • · • » och att nämnda produkter kan mätäs med hjälp av deras luminescens och/eller • · t fluorescens; • · « . 20 b) nämnda mikroorganism inkuberas i miljön av intresse och nämnda • i .···, luminescens och/eller fluorescens detekteras efter nämnda valda tidsperiod, och att «·· c) tillväxten och dödligheten av nämnda mikroorganism uppskattas med hjälp av • ♦ • · * i" '· ätminstone tvä av följande: • * i) det kända förhällandet mellan luminescens eller fluorescens och mängden • · • · · 1 '· 25 av levande celler efter vilken som heist nämnd vald tidsperiod, 25 107167 ii) det kända förhällandet mellan luminescens eller fluorescens och den totala mängden av celler, som är eller har värit vid liv inom vilken som heist nämnd vald tidsperiod, och iii) det kända förhällandet mellan luminescens eller fluorescens och den totala 5 mängden av celler, som har dött inom vilken som heist nämnd vald tidsperiod.
2. Förfarande enligt patentkrav 1, kännetecknat därav, att nämnda mikroorganism är en gram-negativ bakterie, t.ex. Escherichia coli.
3. Förfarande enligt patentkrav 1 eller 2, kännetecknat därav, att a) en narkör gen, som kodar en luminescent produkt, är luciferas, som används 10 för bestämning av mängden av levande celler vid vilken som heist tidpunkt inom nämnda valda tidsperiod, och b) en annan markör gen, som kodar en fluorescent produkt, är grön fluorescent protein (GFP), som används för bestämning av den totala mängden celler av nämnda mikroorganism, som är eller har värit vid liv inom nämnda valda tidsperiod. 15
4. Förfarande enligt patentkrav 1 eller 2, kännetecknat därav, att nämnda markör . 1. gen introduceras i nämnda mikroorganism i en plasmid.
5. Förfarande enligt patentkrav 3 och 4, kännetecknat därav, att nämnda plasmid är pGFP+luc1 (SEQ ID NO: 1). «·« e · · • · e • • · · • · « • · « • ♦ *·♦ ♦ ·<1 • « · 4 419 * · 9 4 4 4 9 9 9 4 9 9 4% ♦ ♦ • » 1 > 1 • ♦ · • · · • 1 Λ 9 4
FI991296A 1999-06-07 1999-06-07 Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer FI107167B (sv)

Priority Applications (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI991296A FI107167B (sv) 1999-06-07 1999-06-07 Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer
DE60017407T DE60017407T2 (de) 1999-06-07 2000-06-07 Verfahren zur ermöglichung der bewertung des wachstums und des todes eines mikroorganismus
US09/980,585 US6866995B1 (en) 1999-06-07 2000-06-07 Method to enable assessment of growth and death of micro-organisms
PCT/FI2000/000507 WO2000075367A1 (en) 1999-06-07 2000-06-07 A method to enable assessment of growth and death of micro-organisms
EP00935235A EP1194586B1 (en) 1999-06-07 2000-06-07 A method to enable assessment of growth and death of micro-organisms
AT00935235T ATE286982T1 (de) 1999-06-07 2000-06-07 Verfahren um wachstum und tod von mikroorganismen zu bestimmen
AU50799/00A AU5079900A (en) 1999-06-07 2000-06-07 A method to enable assessment of growth and death of micro-organisms

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI991296 1999-06-07
FI991296A FI107167B (sv) 1999-06-07 1999-06-07 Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI991296A0 FI991296A0 (sv) 1999-06-07
FI991296A FI991296A (sv) 2000-12-08
FI107167B true FI107167B (sv) 2001-06-15

Family

ID=8554822

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI991296A FI107167B (sv) 1999-06-07 1999-06-07 Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer

Country Status (7)

Country Link
US (1) US6866995B1 (sv)
EP (1) EP1194586B1 (sv)
AT (1) ATE286982T1 (sv)
AU (1) AU5079900A (sv)
DE (1) DE60017407T2 (sv)
FI (1) FI107167B (sv)
WO (1) WO2000075367A1 (sv)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013084526A1 (ja) * 2011-12-08 2013-06-13 国立大学法人九州大学 ビオチン化合物、ビオチン標識化剤、タンパク質集合体

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5164301A (en) * 1990-06-22 1992-11-17 Difco Laboratories Process and kit for detecting microbial metabolism
DE69618350T2 (de) 1995-01-31 2002-09-19 Bioimage As Soeborg Ein verfahren zum nachweis biologisch aktiver substanzen
DE19517940A1 (de) 1995-05-18 1996-11-21 Merck Patent Gmbh Nachweis von Listerien mittels rekombinanter Bakteriophagen
US5976796A (en) * 1996-10-04 1999-11-02 Loma Linda University Construction and expression of renilla luciferase and green fluorescent protein fusion genes
AU5090498A (en) 1997-01-07 1998-08-03 California Institute Of Technology Optical sensors of cell signaling
JPH11146798A (ja) 1997-11-17 1999-06-02 Railway Technical Res Inst 微生物細胞迅速識別法と微生物細胞用識別キット
US6143502A (en) * 1999-03-31 2000-11-07 University Of Utah Research Foundation Dual-luciferase reporter system

Also Published As

Publication number Publication date
FI991296A (sv) 2000-12-08
US6866995B1 (en) 2005-03-15
WO2000075367A1 (en) 2000-12-14
EP1194586B1 (en) 2005-01-12
FI991296A0 (sv) 1999-06-07
ATE286982T1 (de) 2005-01-15
AU5079900A (en) 2000-12-28
DE60017407T2 (de) 2005-12-22
EP1194586A1 (en) 2002-04-10
DE60017407D1 (de) 2005-02-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Kadurugamuwa et al. Direct continuous method for monitoring biofilm infection in a mouse model
Landete et al. Anaerobic green fluorescent protein as a marker of Bifidobacterium strains
Kim et al. Swarming populations of Salmonella represent a unique physiological state coupled to multiple mechanisms of antibiotic resistance
PL181380B1 (pl) zmutowana karboksylaze, zrekombinowany DNA, mikroorganizm zawierajacy DNA kodujacy zmutowana karboksylaze, sposób wytwarzania aminokwasu, sposób selekcji E. coli, oraz sposób wytwarzania zmutowanej karboksylazy PL PL PL PL PL PL
AU743007B2 (en) Screening methods using microbial strain pools
WO1997048822A9 (en) Screening methods using microbial strain pools
CN110066829A (zh) 一种CRISPR/Cas9基因编辑系统及其应用
CN102094037B (zh) 一种内参内置型双荧光素酶报告载体及其应用
DK2468861T3 (en) A method for constructing carrier for gene transport
FI107167B (sv) Förfarande för att analysera tillväxten och döden av mikroorganismer
JP2002503447A (ja) 発現可能なアンチセンス配列を用いる条件発現変異細胞の取得方法
CN111534578A (zh) 一种高通量筛选真核生物细胞与农药互作的靶点基因的方法
CN109971789A (zh) 一种基因编辑系统及其在新金色分枝杆菌中的应用
CN111534544A (zh) 一种高通量筛选真核生物细胞与病毒互作靶点基因的方法
CN109161545A (zh) 抑制鸡Sirt1基因表达的microRNA及其重组过表质粒以及LMH细胞系
JP2002500875A (ja) 病原体中の遺伝子の不可欠性の測定方法
CN111793639B (zh) 一种利用与RNAi工程菌混配提高Bt杀虫活性的方法
CN111298129A (zh) 二甲双胍介导核酸纳米材料自组装方法及采用该方法制备的纳米制剂和应用
US20050095643A1 (en) Method of generating conditionally expressed mutant cells using expressible antisense sequences
CN111549061A (zh) 一种高通量筛选真核生物细胞响应环境极端pH的靶点基因的方法
CN112195190B (zh) 来源于贝莱斯芽孢杆菌质粒的复制元件及其应用
US20060035365A1 (en) Method for identifying cellular growth inhibitors
KR101050669B1 (ko) 이분자 형광 상보 기법을 이용하여 단백질의 수모화를 분석하는 방법 및 그에 사용되는 벡터들
TW201139669A (en) Nucleic acid structure containing a pyripyropene biosynthesis gene cluster and a marker gene
CN111549063A (zh) 一种高通量筛选细胞响应环境极端温度靶点基因的方法

Legal Events

Date Code Title Description
MA Patent expired